View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10912_low_11 (Length: 418)

Name: NF10912_low_11
Description: NF10912
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10912_low_11
NF10912_low_11
[»] chr3 (156 HSPs)
chr3 (1-395)||(48361653-48362047)
chr3 (2-400)||(10956010-10956409)
chr3 (1-371)||(1313313-1313684)
chr3 (1-400)||(45882814-45883215)
chr3 (2-400)||(10958306-10958705)
chr3 (1-395)||(18099152-18099547)
chr3 (2-400)||(11170279-11170678)
chr3 (1-400)||(24979582-24979983)
chr3 (1-346)||(4308263-4308609)
chr3 (1-350)||(43423445-43423795)
chr3 (1-350)||(51943296-51943645)
chr3 (1-400)||(18096882-18097283)
chr3 (2-397)||(3859406-3859801)
chr3 (1-400)||(18162539-18162938)
chr3 (1-351)||(43421397-43421748)
chr3 (1-350)||(53917646-53917996)
chr3 (2-400)||(22114288-22114687)
chr3 (2-379)||(38889935-38890314)
chr3 (1-350)||(28101984-28102334)
chr3 (1-393)||(12267957-12268341)
chr3 (1-371)||(53915478-53915850)
chr3 (2-400)||(5191528-5191925)
chr3 (1-350)||(1626665-1627015)
chr3 (2-400)||(10084372-10084775)
chr3 (1-400)||(32264020-32264425)
chr3 (2-346)||(51726990-51727334)
chr3 (1-350)||(3314609-3314960)
chr3 (1-346)||(43228220-43228566)
chr3 (1-346)||(27101163-27101513)
chr3 (1-350)||(880433-880784)
chr3 (2-400)||(26720423-26720821)
chr3 (1-311)||(42990268-42990579)
chr3 (2-375)||(4103879-4104257)
chr3 (1-350)||(5926747-5927096)
chr3 (1-395)||(32218975-32219360)
chr3 (1-311)||(30005805-30006116)
chr3 (1-388)||(15780747-15781154)
chr3 (2-375)||(25533333-25533716)
chr3 (11-346)||(43226015-43226350)
chr3 (2-400)||(5522610-5522997)
chr3 (2-391)||(6065779-6066170)
chr3 (1-346)||(9604589-9604940)
chr3 (14-400)||(10191305-10191695)
chr3 (2-375)||(746650-747031)
chr3 (1-350)||(53468435-53468787)
chr3 (1-374)||(28761409-28761784)
chr3 (2-273)||(1321482-1321753)
chr3 (2-379)||(6063429-6063809)
chr3 (1-350)||(36011752-36012102)
chr3 (2-375)||(458179-458558)
chr3 (111-400)||(35777296-35777587)
chr3 (1-350)||(47148877-47149232)
chr3 (2-379)||(50493895-50494273)
chr3 (4-350)||(54691559-54691905)
chr3 (2-375)||(455802-456181)
chr3 (99-345)||(6561740-6561987)
chr3 (2-297)||(25388884-25389179)
chr3 (1-350)||(39715395-39715740)
chr3 (1-263)||(6484372-6484635)
chr3 (2-375)||(10621513-10621900)
chr3 (1-351)||(51674748-51675088)
chr3 (25-350)||(889779-890103)
chr3 (2-378)||(38210265-38210644)
chr3 (2-254)||(7606571-7606822)
chr3 (1-370)||(42992186-42992545)
chr3 (19-346)||(35917944-35918277)
chr3 (121-350)||(28100143-28100373)
chr3 (2-278)||(28413014-28413291)
chr3 (1-377)||(23633357-23633728)
chr3 (55-311)||(29956650-29956907)
chr3 (208-400)||(11163025-11163218)
chr3 (1-225)||(25688142-25688367)
chr3 (1-269)||(17795269-17795534)
chr3 (1-269)||(19103709-19103974)
chr3 (113-350)||(28180949-28181185)
chr3 (1-215)||(5899734-5899946)
chr3 (1-255)||(4666535-4666789)
chr3 (1-215)||(5886261-5886473)
chr3 (1-154)||(27635640-27635793)
chr3 (1-350)||(31151272-31151620)
chr3 (17-350)||(53591120-53591442)
chr3 (1-228)||(6231849-6232075)
chr3 (128-350)||(28137415-28137627)
chr3 (179-400)||(24177154-24177373)
chr3 (2-212)||(11168165-11168375)
chr3 (14-400)||(561769-562144)
chr3 (184-375)||(41849041-41849244)
chr3 (41-269)||(13420208-13420432)
chr3 (41-395)||(53597120-53597472)
chr3 (99-355)||(23636947-23637200)
chr3 (14-269)||(25635391-25635644)
chr3 (1-198)||(3306839-3307035)
chr3 (1-148)||(47701653-47701800)
chr3 (222-351)||(27635830-27635960)
chr3 (64-350)||(54884082-54884367)
chr3 (223-350)||(6231374-6231502)
chr3 (276-400)||(1321316-1321441)
chr3 (222-350)||(47701798-47701927)
chr3 (14-270)||(36871295-36871550)
chr3 (1-92)||(41849243-41849334)
chr3 (14-270)||(1673981-1674227)
chr3 (2-83)||(35919098-35919179)
chr3 (136-232)||(4560401-4560497)
chr3 (1-132)||(25634031-25634162)
chr3 (233-351)||(3306723-3306842)
chr3 (14-170)||(24181486-24181644)
chr3 (2-67)||(53894040-53894105)
chr3 (41-214)||(1620483-1620657)
chr3 (179-269)||(25633930-25634017)
chr3 (158-270)||(13419890-13419997)
chr3 (323-381)||(13893287-13893345)
chr3 (58-214)||(14634480-14634638)
chr3 (303-379)||(6719396-6719472)
chr3 (41-127)||(11007545-11007632)
chr3 (321-380)||(46966938-46966997)
chr3 (1-55)||(42992607-42992661)
chr3 (321-400)||(26762839-26762919)
chr3 (299-379)||(53896477-53896557)
chr3 (320-379)||(5886181-5886240)
chr3 (320-379)||(5899656-5899715)
chr3 (288-350)||(6484310-6484372)
chr3 (263-355)||(4560509-4560602)
chr3 (187-232)||(7606828-7606873)
chr3 (322-379)||(25388794-25388851)
chr3 (323-375)||(42990181-42990234)
chr3 (321-377)||(7768474-7768530)
chr3 (17-61)||(40913417-40913461)
chr3 (17-61)||(44331669-44331713)
chr3 (11-82)||(48390296-48390368)
chr3 (321-376)||(16996705-16996760)
chr3 (17-67)||(1736338-1736388)
chr3 (11-82)||(10612772-10612844)
chr3 (17-67)||(18552916-18552966)
chr3 (17-67)||(26298992-26299042)
chr3 (11-61)||(30236249-30236299)
chr3 (17-67)||(30709823-30709873)
chr3 (17-67)||(37466295-37466345)
chr3 (17-62)||(1417528-1417573)
chr3 (317-350)||(4663844-4663877)
chr3 (17-62)||(8370524-8370569)
chr3 (17-62)||(21711227-21711272)
chr3 (17-62)||(27974990-27975035)
chr3 (17-62)||(27986484-27986529)
chr3 (323-395)||(31021452-31021525)
chr3 (1-33)||(8183116-8183148)
chr3 (17-61)||(9666466-9666510)
chr3 (17-61)||(16499153-16499197)
chr3 (17-61)||(23391909-23391953)
chr3 (17-61)||(29196386-29196430)
chr3 (17-61)||(29810992-29811036)
chr3 (17-57)||(32744436-32744476)
chr3 (17-61)||(39153361-39153405)
chr3 (17-61)||(40734622-40734666)
chr3 (21-61)||(40735507-40735547)
chr3 (11-82)||(47878165-47878237)
chr3 (17-61)||(51398938-51398982)
[»] chr4 (134 HSPs)
chr4 (4-400)||(48486268-48486665)
chr4 (2-400)||(22802719-22803117)
chr4 (1-400)||(24878938-24879339)
chr4 (1-400)||(24880400-24880801)
chr4 (1-400)||(22800846-22801245)
chr4 (2-400)||(5198369-5198768)
chr4 (4-400)||(24888745-24889142)
chr4 (1-395)||(36919568-36919966)
chr4 (2-400)||(47274676-47275073)
chr4 (1-400)||(36921477-36921879)
chr4 (1-396)||(40091399-40091795)
chr4 (1-350)||(38928161-38928512)
chr4 (1-346)||(40637077-40637423)
chr4 (2-400)||(37089357-37089758)
chr4 (2-400)||(9148201-9148600)
chr4 (2-400)||(11434904-11435302)
chr4 (2-381)||(22044376-22044755)
chr4 (2-381)||(22046671-22047050)
chr4 (1-400)||(619432-619831)
chr4 (1-350)||(19095881-19096232)
chr4 (2-400)||(51015195-51015593)
chr4 (2-346)||(14633323-14633666)
chr4 (21-370)||(56030422-56030770)
chr4 (11-371)||(14787423-14787789)
chr4 (2-400)||(38409148-38409552)
chr4 (1-374)||(33415472-33415845)
chr4 (2-400)||(7941268-7941671)
chr4 (2-400)||(31849584-31849983)
chr4 (2-346)||(8631404-8631753)
chr4 (1-350)||(12395829-12396179)
chr4 (2-375)||(24348187-24348566)
chr4 (2-379)||(18847123-18847500)
chr4 (1-350)||(12400791-12401141)
chr4 (1-395)||(36378246-36378642)
chr4 (4-346)||(47868404-47868747)
chr4 (2-346)||(6764842-6765192)
chr4 (2-400)||(11006222-11006625)
chr4 (76-400)||(5637524-5637852)
chr4 (2-400)||(9174131-9174530)
chr4 (2-375)||(44599823-44600198)
chr4 (2-346)||(2484858-2485203)
chr4 (1-375)||(17662229-17662598)
chr4 (76-400)||(3824629-3824957)
chr4 (1-350)||(16453308-16453659)
chr4 (1-351)||(37313049-37313401)
chr4 (2-379)||(16934128-16934506)
chr4 (2-277)||(26085962-26086236)
chr4 (4-349)||(9176461-9176807)
chr4 (2-379)||(11008553-11008933)
chr4 (2-379)||(16931774-16932152)
chr4 (1-345)||(19322701-19323044)
chr4 (2-375)||(18709149-18709531)
chr4 (37-351)||(13543952-13544272)
chr4 (14-375)||(22132389-22132759)
chr4 (14-347)||(41997494-41997828)
chr4 (2-311)||(22780358-22780668)
chr4 (1-272)||(36380427-36380699)
chr4 (98-400)||(52942540-52942831)
chr4 (2-311)||(22782723-22783033)
chr4 (11-237)||(16455354-16455581)
chr4 (21-375)||(47210756-47211106)
chr4 (1-400)||(8756235-8756634)
chr4 (2-375)||(53405100-53405481)
chr4 (14-350)||(18409344-18409680)
chr4 (14-374)||(18537470-18537829)
chr4 (14-311)||(22134615-22134909)
chr4 (122-350)||(3937314-3937542)
chr4 (1-173)||(4215483-4215655)
chr4 (1-202)||(13547302-13547503)
chr4 (1-267)||(27499128-27499391)
chr4 (134-350)||(6132872-6133088)
chr4 (1-204)||(2891437-2891641)
chr4 (14-350)||(18534828-18535163)
chr4 (1-262)||(30136640-30136899)
chr4 (14-270)||(38890221-38890476)
chr4 (2-153)||(5635461-5635612)
chr4 (189-350)||(24446756-24446913)
chr4 (189-350)||(38270158-38270320)
chr4 (214-371)||(5100974-5101133)
chr4 (14-377)||(28453658-28454020)
chr4 (41-377)||(15032572-15032898)
chr4 (2-153)||(11437560-11437710)
chr4 (1-148)||(5101131-5101277)
chr4 (14-215)||(12102221-12102425)
chr4 (85-377)||(40999018-40999308)
chr4 (233-350)||(2891315-2891434)
chr4 (1-102)||(47563009-47563110)
chr4 (10-125)||(49088794-49088911)
chr4 (14-199)||(16185831-16186018)
chr4 (1-214)||(25357772-25357992)
chr4 (1-82)||(6133105-6133186)
chr4 (11-82)||(14789422-14789495)
chr4 (138-344)||(10112876-10113080)
chr4 (1-56)||(52942472-52942527)
chr4 (41-200)||(3982200-3982362)
chr4 (14-270)||(9863791-9864049)
chr4 (1-272)||(47150877-47151145)
chr4 (54-215)||(31983564-31983727)
chr4 (1-59)||(3937258-3937316)
chr4 (1-114)||(24446638-24446738)
chr4 (303-392)||(25357593-25357683)
chr4 (157-270)||(10114412-10114520)
chr4 (299-377)||(16186120-16186199)
chr4 (321-377)||(52043735-52043791)
chr4 (299-377)||(12102061-12102140)
chr4 (1-34)||(3824594-3824627)
chr4 (323-375)||(22134937-22134990)
chr4 (11-82)||(4556054-4556126)
chr4 (17-61)||(12739550-12739594)
chr4 (17-61)||(26175636-26175680)
chr4 (17-61)||(36463389-36463433)
chr4 (17-61)||(48893638-48893682)
chr4 (325-376)||(26557563-26557614)
chr4 (11-82)||(4884990-4885062)
chr4 (11-82)||(8529383-8529455)
chr4 (17-67)||(10047383-10047433)
chr4 (17-67)||(39245998-39246048)
chr4 (100-200)||(54906737-54906839)
chr4 (7-55)||(4874469-4874518)
chr4 (17-62)||(16623341-16623386)
chr4 (321-377)||(4569924-4569980)
chr4 (17-61)||(5429803-5429847)
chr4 (17-61)||(5871944-5871988)
chr4 (17-61)||(9927458-9927502)
chr4 (17-61)||(12743925-12743969)
chr4 (17-61)||(12745314-12745358)
chr4 (321-381)||(16638652-16638712)
chr4 (17-61)||(27416965-27417009)
chr4 (18-62)||(36315277-36315321)
chr4 (18-62)||(36329486-36329530)
chr4 (306-350)||(36380373-36380417)
chr4 (17-61)||(46147391-46147435)
chr4 (17-61)||(47038411-47038455)
chr4 (17-61)||(52467354-52467398)
[»] chr1 (126 HSPs)
chr1 (2-400)||(10399815-10400214)
chr1 (2-400)||(51749934-51750333)
chr1 (1-400)||(28207054-28207452)
chr1 (1-400)||(41646815-41647215)
chr1 (1-400)||(14097955-14098355)
chr1 (7-400)||(13214976-13215375)
chr1 (4-391)||(6822919-6823306)
chr1 (1-391)||(38925467-38925855)
chr1 (1-400)||(39462413-39462814)
chr1 (1-371)||(28998239-28998611)
chr1 (1-371)||(29003955-29004327)
chr1 (1-400)||(15823441-15823841)
chr1 (19-400)||(47451543-47451919)
chr1 (2-400)||(28840573-28840973)
chr1 (1-371)||(6995686-6996058)
chr1 (1-371)||(17324622-17324994)
chr1 (2-400)||(20302354-20302752)
chr1 (1-350)||(12302491-12302846)
chr1 (2-400)||(13761732-13762130)
chr1 (1-375)||(47906183-47906565)
chr1 (2-400)||(28842388-28842788)
chr1 (1-350)||(50307531-50307883)
chr1 (4-398)||(3579606-3580002)
chr1 (1-371)||(2949218-2949589)
chr1 (2-400)||(51752260-51752657)
chr1 (1-350)||(11457461-11457811)
chr1 (1-353)||(18307051-18307404)
chr1 (1-395)||(9241071-9241467)
chr1 (2-375)||(2510312-2510690)
chr1 (1-351)||(25251260-25251612)
chr1 (5-375)||(24325575-24325954)
chr1 (2-375)||(31735508-31735887)
chr1 (1-350)||(50076658-50077008)
chr1 (1-378)||(16428569-16428949)
chr1 (4-346)||(2617465-2617808)
chr1 (2-311)||(15294821-15295131)
chr1 (1-350)||(31489860-31490207)
chr1 (2-371)||(39931994-39932368)
chr1 (1-350)||(50078806-50079157)
chr1 (1-350)||(50248556-50248908)
chr1 (1-350)||(17186113-17186464)
chr1 (1-311)||(25127856-25128168)
chr1 (1-350)||(18839532-18839883)
chr1 (1-375)||(27336926-27337304)
chr1 (2-377)||(16226085-16226461)
chr1 (1-374)||(17318814-17319182)
chr1 (2-350)||(20291402-20291750)
chr1 (1-375)||(27339117-27339496)
chr1 (98-400)||(6823779-6824090)
chr1 (1-330)||(31425001-31425335)
chr1 (2-375)||(9463231-9463612)
chr1 (1-350)||(6756472-6756823)
chr1 (2-303)||(46431693-46431996)
chr1 (1-311)||(4131361-4131676)
chr1 (2-375)||(9459404-9459785)
chr1 (1-350)||(40133880-40134240)
chr1 (53-371)||(21948226-21948549)
chr1 (70-375)||(48665090-48665404)
chr1 (11-350)||(17324010-17324349)
chr1 (1-350)||(14183576-14183922)
chr1 (2-350)||(47179654-47180006)
chr1 (6-388)||(31422851-31423248)
chr1 (2-350)||(47177303-47177655)
chr1 (4-229)||(25248540-25248766)
chr1 (14-400)||(42922128-42922514)
chr1 (1-250)||(16432440-16432691)
chr1 (1-204)||(16429049-16429253)
chr1 (41-378)||(8347298-8347634)
chr1 (1-355)||(15669378-15669732)
chr1 (43-355)||(18800600-18800910)
chr1 (11-355)||(49495206-49495540)
chr1 (1-216)||(6115088-6115304)
chr1 (1-378)||(8349037-8349414)
chr1 (2-229)||(16231630-16231856)
chr1 (14-200)||(23785935-23786121)
chr1 (2-204)||(51757623-51757824)
chr1 (1-153)||(23816029-23816181)
chr1 (69-345)||(13125511-13125787)
chr1 (301-400)||(30790681-30790780)
chr1 (1-214)||(26613225-26613440)
chr1 (137-371)||(26520236-26520475)
chr1 (2-83)||(13358786-13358867)
chr1 (85-272)||(28279293-28279477)
chr1 (256-379)||(16231517-16231641)
chr1 (257-351)||(25248756-25248851)
chr1 (339-400)||(49687435-49687496)
chr1 (14-270)||(27916525-27916780)
chr1 (41-214)||(30738653-30738830)
chr1 (14-124)||(15916562-15916674)
chr1 (39-214)||(155788-155963)
chr1 (14-217)||(16561545-16561751)
chr1 (221-345)||(13127837-13127959)
chr1 (2-43)||(13447260-13447301)
chr1 (303-375)||(46432017-46432090)
chr1 (317-400)||(43104053-43104137)
chr1 (321-395)||(2393578-2393653)
chr1 (308-354)||(15295142-15295188)
chr1 (179-272)||(26332726-26332814)
chr1 (17-61)||(834167-834211)
chr1 (321-377)||(26613547-26613603)
chr1 (17-61)||(28220226-28220270)
chr1 (17-61)||(28265554-28265598)
chr1 (69-210)||(43104245-43104389)
chr1 (321-395)||(2401492-2401567)
chr1 (137-214)||(14353047-14353126)
chr1 (300-378)||(16431017-16431096)
chr1 (321-376)||(49958963-49959018)
chr1 (17-67)||(13598402-13598452)
chr1 (323-377)||(27916415-27916469)
chr1 (17-59)||(45644354-45644396)
chr1 (17-71)||(47102880-47102934)
chr1 (17-66)||(775676-775725)
chr1 (17-62)||(19072932-19072977)
chr1 (17-62)||(19120822-19120867)
chr1 (17-62)||(21536617-21536662)
chr1 (157-214)||(26332631-26332688)
chr1 (17-62)||(26644945-26644990)
chr1 (17-62)||(37069774-37069819)
chr1 (321-381)||(46782966-46783029)
chr1 (17-62)||(47703984-47704029)
chr1 (17-61)||(3156989-3157033)
chr1 (17-61)||(4552637-4552681)
chr1 (17-61)||(13659336-13659380)
chr1 (11-62)||(21353342-21353394)
chr1 (17-61)||(28223421-28223465)
chr1 (17-61)||(31659362-31659406)
[»] chr5 (105 HSPs)
chr5 (1-400)||(2818319-2818720)
chr5 (2-400)||(25921458-25921857)
chr5 (1-400)||(21947922-21948321)
chr5 (2-400)||(38882000-38882399)
chr5 (9-346)||(10529091-10529429)
chr5 (1-400)||(36402312-36402711)
chr5 (2-400)||(2174814-2175212)
chr5 (2-400)||(4236525-4236922)
chr5 (1-371)||(18511196-18511570)
chr5 (1-400)||(12555907-12556307)
chr5 (1-350)||(40221467-40221818)
chr5 (1-354)||(18509302-18509657)
chr5 (1-400)||(16776052-16776452)
chr5 (8-350)||(17072828-17073172)
chr5 (1-350)||(25904048-25904398)
chr5 (1-346)||(39854433-39854778)
chr5 (1-371)||(26097656-26098026)
chr5 (2-375)||(25803935-25804318)
chr5 (1-400)||(6756389-6756787)
chr5 (1-350)||(24126801-24127151)
chr5 (2-375)||(18466599-18466978)
chr5 (1-348)||(10474307-10474655)
chr5 (11-350)||(37705774-37706114)
chr5 (1-350)||(31472596-31472947)
chr5 (3-371)||(18596570-18596939)
chr5 (2-375)||(27910364-27910744)
chr5 (1-350)||(1189591-1189948)
chr5 (1-398)||(31465973-31466360)
chr5 (2-379)||(31544996-31545374)
chr5 (2-400)||(21684437-21684845)
chr5 (1-311)||(6745053-6745363)
chr5 (2-375)||(18468926-18469303)
chr5 (2-379)||(31542651-31543028)
chr5 (2-375)||(27912449-27912830)
chr5 (1-349)||(16092183-16092537)
chr5 (1-350)||(39397977-39398326)
chr5 (1-272)||(658340-658608)
chr5 (1-344)||(17818476-17818817)
chr5 (14-350)||(31179368-31179705)
chr5 (2-311)||(34477038-34477349)
chr5 (1-346)||(6747253-6747599)
chr5 (2-311)||(34479403-34479714)
chr5 (1-350)||(695834-696173)
chr5 (1-343)||(2954368-2954711)
chr5 (1-344)||(21288715-21289056)
chr5 (2-375)||(15552154-15552539)
chr5 (85-350)||(34530734-34531000)
chr5 (1-229)||(41585728-41585956)
chr5 (1-218)||(20505827-20506042)
chr5 (2-375)||(10586758-10587126)
chr5 (157-350)||(20042995-20043189)
chr5 (14-346)||(6661181-6661512)
chr5 (1-239)||(2723959-2724188)
chr5 (133-350)||(20044955-20045173)
chr5 (156-350)||(26098390-26098585)
chr5 (2-217)||(39798126-39798341)
chr5 (1-374)||(9020143-9020515)
chr5 (2-229)||(4410090-4410316)
chr5 (214-400)||(20507659-20507846)
chr5 (10-200)||(10749796-10749986)
chr5 (2-200)||(15354560-15354757)
chr5 (2-200)||(15356836-15357033)
chr5 (2-200)||(23665140-23665337)
chr5 (2-200)||(23793250-23793447)
chr5 (2-200)||(3373122-3373320)
chr5 (10-200)||(10757273-10757462)
chr5 (7-215)||(36208656-36208865)
chr5 (1-308)||(20053834-20054132)
chr5 (2-193)||(23741844-23742034)
chr5 (2-200)||(38960117-38960314)
chr5 (49-270)||(17413198-17413416)
chr5 (1-107)||(26098272-26098379)
chr5 (1-80)||(20043206-20043285)
chr5 (317-400)||(39797983-39798066)
chr5 (256-346)||(4410006-4410101)
chr5 (14-214)||(15143547-15143750)
chr5 (138-378)||(42770690-42770924)
chr5 (299-350)||(36208525-36208576)
chr5 (257-350)||(41585946-41586040)
chr5 (321-376)||(29748260-29748315)
chr5 (321-400)||(2144897-2144978)
chr5 (307-375)||(3373332-3373401)
chr5 (85-170)||(42770936-42771021)
chr5 (301-350)||(2723912-2723961)
chr5 (158-214)||(32520518-32520575)
chr5 (322-379)||(34477378-34477435)
chr5 (158-270)||(2144706-2144815)
chr5 (3-196)||(4897828-4898023)
chr5 (17-61)||(19806487-19806531)
chr5 (17-61)||(32636948-32636992)
chr5 (157-267)||(4754187-4754292)
chr5 (308-350)||(23665083-23665125)
chr5 (308-350)||(23793462-23793504)
chr5 (11-82)||(42238376-42238448)
chr5 (17-62)||(9353380-9353425)
chr5 (17-62)||(17004008-17004053)
chr5 (323-400)||(25837914-25837991)
chr5 (17-62)||(31300644-31300689)
chr5 (158-245)||(34033711-34033797)
chr5 (322-379)||(34479739-34479796)
chr5 (17-62)||(36932398-36932443)
chr5 (17-61)||(533893-533937)
chr5 (13-101)||(23667513-23667601)
chr5 (158-270)||(29748377-29748485)
chr5 (17-61)||(42428430-42428474)
[»] chr7 (124 HSPs)
chr7 (11-400)||(27306224-27306613)
chr7 (2-400)||(44469-44868)
chr7 (1-373)||(31435030-31435404)
chr7 (2-395)||(35539-35933)
chr7 (4-400)||(1049283-1049679)
chr7 (1-371)||(13099458-13099832)
chr7 (1-371)||(42330981-42331355)
chr7 (1-350)||(44724534-44724884)
chr7 (1-350)||(4295918-4296270)
chr7 (2-388)||(40836728-40837114)
chr7 (2-375)||(7471965-7472344)
chr7 (2-375)||(38393911-38394290)
chr7 (1-371)||(443528-443901)
chr7 (1-371)||(21990084-21990455)
chr7 (1-350)||(20137093-20137443)
chr7 (2-400)||(3878477-3878881)
chr7 (2-375)||(20299383-20299764)
chr7 (1-350)||(42223111-42223463)
chr7 (2-346)||(48457608-48457957)
chr7 (1-330)||(21592127-21592457)
chr7 (1-371)||(37412109-37412484)
chr7 (2-371)||(7470007-7470382)
chr7 (1-350)||(11355213-11355563)
chr7 (2-375)||(20297287-20297666)
chr7 (1-371)||(20625967-20626343)
chr7 (1-371)||(20629858-20630234)
chr7 (1-371)||(20642277-20642653)
chr7 (1-350)||(9680769-9681125)
chr7 (3-375)||(3035646-3036027)
chr7 (1-350)||(24748549-24748900)
chr7 (1-350)||(39145970-39146321)
chr7 (2-375)||(18345466-18345845)
chr7 (4-388)||(25542448-25542830)
chr7 (1-350)||(21679982-21680335)
chr7 (4-375)||(28485491-28485867)
chr7 (2-375)||(28487478-28487857)
chr7 (2-311)||(1849975-1850285)
chr7 (4-351)||(9679008-9679361)
chr7 (11-350)||(21678021-21678361)
chr7 (2-375)||(31155896-31156271)
chr7 (2-346)||(40946283-40946632)
chr7 (2-375)||(43253502-43253884)
chr7 (4-311)||(1046912-1047219)
chr7 (2-375)||(7351637-7352018)
chr7 (76-375)||(11757153-11757460)
chr7 (116-400)||(26804479-26804762)
chr7 (1-345)||(24258423-24258773)
chr7 (2-236)||(7092198-7092431)
chr7 (2-375)||(7349262-7349639)
chr7 (1-350)||(25276096-25276435)
chr7 (33-350)||(27832648-27832968)
chr7 (2-236)||(7094445-7094678)
chr7 (57-400)||(22828672-22829018)
chr7 (188-373)||(18567545-18567731)
chr7 (104-367)||(22251637-22251893)
chr7 (41-400)||(7188447-7188805)
chr7 (41-349)||(24817377-24817682)
chr7 (50-377)||(20091580-20091903)
chr7 (1-270)||(24813482-24813748)
chr7 (2-228)||(38396713-38396938)
chr7 (159-400)||(22392378-22392608)
chr7 (14-353)||(24465500-24465829)
chr7 (2-200)||(22137184-22137381)
chr7 (2-200)||(40552211-40552408)
chr7 (14-200)||(2935374-2935560)
chr7 (2-200)||(22108173-22108370)
chr7 (2-200)||(40549933-40550130)
chr7 (1-148)||(22393880-22394028)
chr7 (14-200)||(1606486-1606671)
chr7 (14-200)||(9027191-9027376)
chr7 (11-153)||(26295600-26295743)
chr7 (1-277)||(11081540-11081815)
chr7 (14-244)||(6332283-6332514)
chr7 (2-62)||(11759371-11759431)
chr7 (257-371)||(7094662-7094782)
chr7 (325-400)||(45366451-45366526)
chr7 (1-54)||(26804762-26804815)
chr7 (257-371)||(7092414-7092535)
chr7 (14-214)||(16297018-16297222)
chr7 (303-375)||(1606399-1606472)
chr7 (137-245)||(11084438-11084544)
chr7 (245-305)||(38396316-38396377)
chr7 (300-371)||(3677213-3677285)
chr7 (137-350)||(26210501-26210710)
chr7 (293-355)||(30906327-30906389)
chr7 (322-375)||(38396215-38396269)
chr7 (20-61)||(2360975-2361016)
chr7 (2-82)||(6067183-6067264)
chr7 (85-170)||(6348918-6349003)
chr7 (17-62)||(9190056-9190101)
chr7 (2-34)||(22251570-22251602)
chr7 (17-61)||(27347941-27347985)
chr7 (116-211)||(40281476-40281572)
chr7 (17-61)||(41317434-41317478)
chr7 (221-345)||(6348778-6348903)
chr7 (156-199)||(21369642-21369685)
chr7 (325-400)||(42006471-42006545)
chr7 (11-82)||(2075231-2075303)
chr7 (17-67)||(20284093-20284143)
chr7 (308-350)||(22108116-22108158)
chr7 (308-350)||(22137127-22137169)
chr7 (11-82)||(25410246-25410318)
chr7 (11-82)||(34546874-34546946)
chr7 (17-67)||(35960820-35960870)
chr7 (308-350)||(40549876-40549918)
chr7 (308-350)||(40552154-40552196)
chr7 (327-375)||(1849894-1849943)
chr7 (17-62)||(2580394-2580439)
chr7 (157-271)||(6048909-6049019)
chr7 (17-62)||(9185213-9185258)
chr7 (158-199)||(12310157-12310198)
chr7 (17-62)||(21983288-21983333)
chr7 (17-62)||(44848732-44848777)
chr7 (299-355)||(6332176-6332231)
chr7 (17-61)||(8153466-8153510)
chr7 (17-61)||(12097867-12097911)
chr7 (17-61)||(14069833-14069877)
chr7 (17-61)||(14379861-14379905)
chr7 (17-61)||(18126768-18126812)
chr7 (17-61)||(30814560-30814604)
chr7 (17-61)||(31732969-31733013)
chr7 (17-61)||(41649011-41649055)
chr7 (17-61)||(43864368-43864412)
chr7 (17-61)||(48489555-48489599)
[»] chr6 (74 HSPs)
chr6 (1-400)||(9019857-9020256)
chr6 (1-400)||(11983013-11983413)
chr6 (2-400)||(14507161-14507559)
chr6 (1-350)||(13057174-13057525)
chr6 (4-400)||(30728811-30729212)
chr6 (1-395)||(15541124-15541519)
chr6 (2-346)||(1230234-1230579)
chr6 (1-400)||(32279927-32280327)
chr6 (2-346)||(28241306-28241651)
chr6 (9-395)||(15532674-15533060)
chr6 (64-395)||(15530170-15530501)
chr6 (2-344)||(14458752-14459093)
chr6 (1-350)||(3629849-3630198)
chr6 (1-355)||(3390354-3390710)
chr6 (1-350)||(13039734-13040085)
chr6 (1-350)||(25477254-25477612)
chr6 (1-350)||(3233709-3234064)
chr6 (4-349)||(3631926-3632271)
chr6 (2-375)||(30967152-30967530)
chr6 (2-375)||(2628871-2629250)
chr6 (4-375)||(30034590-30034967)
chr6 (2-311)||(4816216-4816526)
chr6 (2-346)||(19704552-19704905)
chr6 (2-375)||(12195500-12195875)
chr6 (12-379)||(20915351-20915721)
chr6 (1-311)||(26065005-26065311)
chr6 (1-311)||(26084974-26085280)
chr6 (127-388)||(19227518-19227780)
chr6 (4-350)||(24338435-24338782)
chr6 (2-311)||(26932546-26932857)
chr6 (1-350)||(12161542-12161888)
chr6 (207-400)||(1072067-1072261)
chr6 (1-350)||(14466313-14466654)
chr6 (41-356)||(3027876-3028190)
chr6 (85-350)||(22490619-22490886)
chr6 (14-232)||(5273213-5273431)
chr6 (1-211)||(1069702-1069913)
chr6 (232-400)||(8995410-8995578)
chr6 (14-269)||(15719708-15719961)
chr6 (85-345)||(17012029-17012286)
chr6 (14-392)||(16455421-16455800)
chr6 (1-265)||(15367101-15367361)
chr6 (2-200)||(29754694-29754892)
chr6 (1-215)||(12186055-12186271)
chr6 (2-200)||(26066109-26066307)
chr6 (206-350)||(32447504-32447650)
chr6 (2-200)||(26068380-26068578)
chr6 (2-200)||(33308988-33309185)
chr6 (2-200)||(33311257-33311454)
chr6 (223-371)||(17852500-17852650)
chr6 (14-143)||(15346535-15346664)
chr6 (206-344)||(13870611-13870749)
chr6 (14-265)||(19696508-19696759)
chr6 (14-216)||(26945258-26945463)
chr6 (186-374)||(15346347-15346524)
chr6 (1-82)||(10584245-10584326)
chr6 (14-270)||(22857949-22858203)
chr6 (239-350)||(10584106-10584213)
chr6 (139-214)||(11138423-11138499)
chr6 (14-213)||(28037722-28037927)
chr6 (137-270)||(20526871-20526999)
chr6 (322-379)||(4816551-4816608)
chr6 (321-400)||(15366965-15367045)
chr6 (307-379)||(26068590-26068662)
chr6 (17-61)||(33211185-33211229)
chr6 (307-350)||(26066319-26066362)
chr6 (293-377)||(12186345-12186431)
chr6 (11-82)||(25941785-25941857)
chr6 (17-62)||(5757526-5757571)
chr6 (17-61)||(603088-603132)
chr6 (158-214)||(7542525-7542581)
chr6 (42-82)||(12911471-12911511)
chr6 (17-61)||(16569146-16569190)
chr6 (325-377)||(19696394-19696446)
[»] chr2 (88 HSPs)
chr2 (1-400)||(40032037-40032442)
chr2 (1-400)||(21520677-21521079)
chr2 (1-400)||(6264132-6264529)
chr2 (2-400)||(13910030-13910428)
chr2 (2-400)||(27104670-27105067)
chr2 (1-400)||(6258801-6259199)
chr2 (1-400)||(22287320-22287720)
chr2 (2-400)||(19501996-19502395)
chr2 (2-389)||(19504331-19504718)
chr2 (2-400)||(42064386-42064785)
chr2 (1-350)||(28196558-28196906)
chr2 (1-371)||(42923493-42923867)
chr2 (1-350)||(19007561-19007911)
chr2 (1-400)||(43623564-43623951)
chr2 (2-395)||(24162208-24162591)
chr2 (2-346)||(45279969-45280315)
chr2 (2-375)||(23452222-23452601)
chr2 (2-375)||(42452678-42453050)
chr2 (1-350)||(17848366-17848711)
chr2 (1-350)||(11739543-11739894)
chr2 (1-350)||(14837194-14837539)
chr2 (1-350)||(44289051-44289402)
chr2 (1-343)||(34979561-34979906)
chr2 (1-348)||(3022086-3022443)
chr2 (1-350)||(17849038-17849388)
chr2 (1-400)||(18800297-18800686)
chr2 (2-375)||(35215571-35215956)
chr2 (98-350)||(15539556-15539809)
chr2 (40-311)||(45239000-45239271)
chr2 (13-350)||(31732772-31733099)
chr2 (2-311)||(35217948-35218258)
chr2 (199-400)||(22407591-22407793)
chr2 (1-222)||(5375330-5375550)
chr2 (14-350)||(11578104-11578438)
chr2 (1-395)||(22874018-22874402)
chr2 (1-262)||(28459174-28459435)
chr2 (187-350)||(22163117-22163281)
chr2 (1-153)||(22407438-22407590)
chr2 (14-355)||(20146604-20146946)
chr2 (2-200)||(36558849-36559047)
chr2 (2-200)||(36561126-36561324)
chr2 (1-400)||(35107171-35107567)
chr2 (179-311)||(38020162-38020295)
chr2 (14-355)||(17897242-17897581)
chr2 (2-200)||(45332166-45332364)
chr2 (1-106)||(22163006-22163111)
chr2 (20-146)||(7462950-7463077)
chr2 (1-132)||(22707735-22707868)
chr2 (217-346)||(5377629-5377763)
chr2 (41-216)||(40699429-40699606)
chr2 (1-137)||(23870951-23871087)
chr2 (87-262)||(27136195-27136368)
chr2 (134-229)||(38414198-38414291)
chr2 (290-400)||(12342684-12342794)
chr2 (14-355)||(37962938-37963266)
chr2 (258-351)||(38020063-38020157)
chr2 (139-377)||(35028473-35028707)
chr2 (321-381)||(28462591-28462651)
chr2 (137-270)||(43139381-43139509)
chr2 (323-400)||(45156922-45156999)
chr2 (14-134)||(13828338-13828460)
chr2 (1-41)||(15539513-15539553)
chr2 (17-61)||(17057369-17057413)
chr2 (17-61)||(17085352-17085396)
chr2 (69-199)||(20589763-20589895)
chr2 (157-213)||(27583479-27583535)
chr2 (303-390)||(40699190-40699278)
chr2 (308-390)||(20147040-20147123)
chr2 (139-215)||(26345661-26345738)
chr2 (17-61)||(723744-723788)
chr2 (137-200)||(17921769-17921833)
chr2 (17-61)||(34139770-34139814)
chr2 (17-61)||(39284960-39285004)
chr2 (11-62)||(1345589-1345640)
chr2 (11-62)||(2838078-2838129)
chr2 (17-60)||(11151591-11151634)
chr2 (17-67)||(14699050-14699100)
chr2 (137-199)||(28458949-28459011)
chr2 (17-62)||(8390198-8390243)
chr2 (17-62)||(13569332-13569377)
chr2 (17-62)||(20522224-20522269)
chr2 (321-350)||(20589582-20589611)
chr2 (17-66)||(34388862-34388911)
chr2 (17-61)||(11067429-11067473)
chr2 (17-61)||(14633825-14633869)
chr2 (325-377)||(33603818-33603870)
chr2 (17-61)||(36773686-36773730)
chr2 (17-61)||(38312364-38312408)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (2-400)||(3901-4298)
[»] chr8 (78 HSPs)
chr8 (1-400)||(14807703-14808112)
chr8 (2-395)||(4423974-4424368)
chr8 (1-400)||(15072661-15073062)
chr8 (1-400)||(28251551-28251950)
chr8 (2-400)||(27829248-27829646)
chr8 (3-400)||(15067932-15068330)
chr8 (1-371)||(41384724-41385095)
chr8 (1-350)||(30480487-30480837)
chr8 (2-400)||(27826937-27827335)
chr8 (2-375)||(32339280-32339659)
chr8 (1-350)||(1225167-1225518)
chr8 (1-374)||(14419174-14419549)
chr8 (2-379)||(18810680-18811057)
chr8 (2-375)||(28283206-28283585)
chr8 (1-371)||(41382652-41383013)
chr8 (4-350)||(27106884-27107231)
chr8 (1-399)||(13858469-13858868)
chr8 (1-355)||(27911011-27911364)
chr8 (1-355)||(27957430-27957783)
chr8 (2-375)||(3873981-3874360)
chr8 (2-351)||(36865537-36865887)
chr8 (2-375)||(15809190-15809568)
chr8 (9-311)||(608774-609077)
chr8 (1-350)||(33541394-33541722)
chr8 (2-379)||(44720815-44721193)
chr8 (2-346)||(22684638-22684996)
chr8 (2-350)||(5372161-5372511)
chr8 (1-350)||(25952522-25952872)
chr8 (2-311)||(43082013-43082323)
chr8 (2-379)||(18812865-18813231)
chr8 (14-375)||(24873178-24873547)
chr8 (2-303)||(43079650-43079952)
chr8 (2-375)||(43530099-43530465)
chr8 (117-350)||(14477277-14477511)
chr8 (1-400)||(15185698-15186095)
chr8 (14-350)||(21482323-21482649)
chr8 (1-262)||(15956051-15956309)
chr8 (23-269)||(21480589-21480832)
chr8 (156-374)||(5622877-5623096)
chr8 (14-377)||(31162186-31162551)
chr8 (179-350)||(26775202-26775374)
chr8 (189-350)||(35872555-35872712)
chr8 (252-388)||(3886153-3886290)
chr8 (241-400)||(12517248-12517410)
chr8 (11-269)||(3005624-3005880)
chr8 (179-400)||(2468268-2468482)
chr8 (180-392)||(31035027-31035238)
chr8 (133-264)||(37214316-37214438)
chr8 (52-229)||(181622-181799)
chr8 (257-371)||(181516-181632)
chr8 (2-83)||(14477519-14477601)
chr8 (14-217)||(31035252-31035459)
chr8 (85-270)||(31573794-31573975)
chr8 (4-72)||(37214251-37214319)
chr8 (14-214)||(31578273-31578476)
chr8 (14-146)||(2468126-2468259)
chr8 (321-378)||(17847501-17847558)
chr8 (1-114)||(35872437-35872537)
chr8 (308-355)||(6375985-6376032)
chr8 (11-61)||(10930193-10930243)
chr8 (11-82)||(23179555-23179627)
chr8 (1-33)||(181798-181830)
chr8 (17-61)||(15212910-15212954)
chr8 (17-61)||(27811402-27811446)
chr8 (17-61)||(33352274-33352318)
chr8 (17-61)||(40321204-40321248)
chr8 (18-61)||(4733830-4733873)
chr8 (137-199)||(30423212-30423274)
chr8 (17-62)||(9765867-9765912)
chr8 (17-62)||(26403278-26403323)
chr8 (265-313)||(37214458-37214507)
chr8 (20-61)||(40221869-40221910)
chr8 (17-61)||(4743214-4743258)
chr8 (17-61)||(5689395-5689439)
chr8 (17-61)||(6599096-6599140)
chr8 (17-61)||(6674549-6674593)
chr8 (17-61)||(12702634-12702678)
chr8 (17-61)||(43036547-43036591)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (2-387)||(69277-69666)
scaffold0025 (201-387)||(73207-73398)
scaffold0025 (190-238)||(73160-73208)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (11-400)||(14923-15313)
scaffold0131 (11-339)||(14376-14707)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (2-346)||(41468-41813)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (2-346)||(183626-183969)
scaffold0005 (11-371)||(51941-52307)
scaffold0005 (11-82)||(50235-50308)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (2-400)||(2784-3182)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-349)||(79140-79489)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (1-371)||(11457-11829)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-350)||(79813-80163)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (2-400)||(29065-29473)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (2-350)||(6153-6502)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (2-311)||(34-344)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (1-350)||(85185-85535)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (2-238)||(1438-1673)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (14-400)||(15817-16203)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (53-371)||(1968-2293)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (14-355)||(16646-16986)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (127-350)||(35594-35817)
scaffold0011 (1-82)||(35817-35898)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (14-342)||(1638-1958)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (2-200)||(22221-22418)
scaffold0140 (2-200)||(24496-24693)
scaffold0140 (17-62)||(8467-8512)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (184-346)||(993-1161)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (99-345)||(4773-5016)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (4-67)||(4666-4729)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (5-51)||(1439-1485)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (17-61)||(20415-20459)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (17-67)||(5687-5737)
scaffold0006 (17-61)||(149097-149141)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (17-62)||(45257-45302)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (41-125)||(57452-57537)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 156)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 48361653 - 48362047
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48361653 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttttactatattatgagtaacgttgcaa 48361752  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  48361753 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagccccaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttc 48361852  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaaccttgtttcaacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  48361853 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtttttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccttgtttcagcc 48361952  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 395  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48361953 ccctgtatctcaaagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcatccaaaaatacgttt 48362047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 10956010 - 10956409
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  10956010 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggtggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 10956109  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  10956110 agagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttcc 10956209  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  10956210 caaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcc 10956309  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10956310 ccctctatcttcatgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaaaattgcttaaaatttggaacaaatctgcacctaaaaatacgtttatgtt 10956409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1313684 - 1313313
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  1313684 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 1313585  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  1313584 aagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttc 1313485  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaaccttgtttcaacc 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  1313484 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattgtaaaccttgtttcagcc 1313385  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  1313384 ccctctatctcaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 1313313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 45883215 - 45882814
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtct-gggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  45883215 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttaca 45883116  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  45883115 aaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 45883016  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  45883015 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccttattgtttgttccaaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 45882916  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 398  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  45882915 ccccctctatctcatagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaattttcaacaaatctgcacccaaaaataggtttctg 45882816  T
Q  399 tt 400  Q
    ||    
T  45882815 tt 45882814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 10958306 - 10958705
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | |||||||||| ||||    
T  10958306 agaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgaagagtaacgttacaaa 10958405  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10958406 agagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtgtcagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 10958505  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  10958506 caaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcc 10958605  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  10958606 ccctctatctttatgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaaaattgcttaaaatttggaacaaatctgcacctaaaaatacgtttctgtt 10958705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 18099152 - 18099547
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| ||| |||    
T  18099152 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccatattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaatgttacaa 18099251  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18099252 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 18099351  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  18099352 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagc 18099451  T
Q  300 cccctctatctc-aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 395  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099452 cccctctatctctcaagtttactctgatacaaggtctata-ttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 18099547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11170678 - 11170279
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  11170678 agaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 11170579  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  11170578 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcc 11170479  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  11170478 caaggtgaatcaatccgcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 11170379  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11170378 ccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtt 11170279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24979983 - 24979582
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttg-ca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  24979983 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgtttaca 24979884  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    ||| |||| | |||  |||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  24979883 aaaaagatattaatttgttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtattt 24979784  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||     
T  24979783 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcag 24979684  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 398  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24979683 ccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtatatatttatagtgaaagtattacttaaaatttggaacaaatctgcaccaaaaaatatgtttatg 24979584  T
Q  399 tt 400  Q
    ||    
T  24979583 tt 24979582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 4308263 - 4308609
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  4308263 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaa 4308362  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4308363 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 4308462  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  4308463 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 4308562  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  4308563 cccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 4308609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 43423445 - 43423795
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||  || |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  43423445 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctcagggagagagcagctctcagtttcactatatgatgagtaacgttacaa 43423544  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  43423545 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 43423644  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  43423645 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 43423744  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||| |||||| | ||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43423745 cccctctttctcaaggtttacagtgatacaatgtctatatttatagtaaaa 43423795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 51943645 - 51943296
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  51943645 gagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 51943546  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  51943545 aagagacgtcaatgagttacaagaaaa-gtctcccgcctaattctacctaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 51943447  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |    
T  51943446 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagc 51943347  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
     ||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51943346 accctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaa 51943296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 18096882 - 18097283
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  18096882 gagaacacaaaagaattcgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaa 18096981  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||| ||  |||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18096982 aagggaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 18097081  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |    
T  18097082 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttgagc 18097181  T
Q  300 cccctctatctc-aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 398  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18097182 cccctctatctctcaagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttgaaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctg 18097281  T
Q  399 tt 400  Q
    ||    
T  18097282 tt 18097283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 3859801 - 3859406
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || | |||||||| |||||||  ||| ||||    
T  3859801 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctacgatccactatatgatgagtattgttacaaa 3859702  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3859701 -gagaaatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 3859603  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  3859602 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 3859503  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttat 397  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859502 ccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttgaaacaaatctgcacccaaaaatacgtttat 3859406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18162938 - 18162539
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttg-ca 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  18162938 gagaacacaaaaaaatttgttgacacagttcg-tccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgtttaca 18162840  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    ||| | || |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18162839 aaataaatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 18162740  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  18162739 cccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgttcaaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca- 18162641  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactc-tgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttat 397  Q
      ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18162640 -tccctctatctccaagtttactcatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttct 18162542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 43421397 - 43421748
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  43421397 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 43421496  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  43421497 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaatccccaatcttttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttc 43421596  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  43421597 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaac 43421696  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaa 351  Q
    ||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43421697 cccttctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaaa 43421748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 53917646 - 53917996
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  53917646 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaa 53917745  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  53917746 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 53917845  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |    
T  53917846 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccattgtttcagc 53917945  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53917946 cccctccatctcaaggtttaatctgattcaaggtctatatttatagtaaaa 53917996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 22114288 - 22114687
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | || |||||||||||  | || |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22114288 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttactttgtttgggggagagatcatccctccgattcattatatgatgagtaacgttacaaa 22114387  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||   |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22114388 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 22114487  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  22114488 caaggtgaatcaacccacaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcctttctaaacccttgtttcagcc 22114587  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    || |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22114588 ccttctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 22114687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 38890314 - 38889935
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  38890314 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 38890215  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  38890214 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 38890115  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  38890114 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 38890015  T
Q  301 ccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    |||||||    |||||||| || ||   |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  38890014 ccctctatctctctcaaagtttgct---atacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 38889935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 28101984 - 28102334
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| || |||    
T  28101984 gagaacacaaaagaatttgttgacctagtttggtccaaattgacctagctttggggagagagcagccatccgttccactatatgataagtaactttacaa 28102083  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  28102084 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttc 28102183  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  28102184 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 28102283  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  28102284 cccctctatctcaagggttactctaatacaacgcttatatttatagtaaaa 28102334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 393
Target Start/End: Original strand, 12267957 - 12268341
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  12267957 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 12268056  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||           ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12268057 aagag-----------ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 12268145  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccctag-ttttgtagttgccattctaaac-cttgtttca 297  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||    
T  12268146 cgaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagtttttgttgttgtctttctaaactcttgtttca 12268245  T
Q  298 accccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgt 393  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  12268246 gctccctctatctcaaagtttactctgatacaagttctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatttgcactgaaaaatacgt 12268341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 53915478 - 53915850
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| || |||    
T  53915478 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtcaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactaaatgatgagtaacattacaa 53915577  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  53915578 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttc 53915677  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
     ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |    
T  53915678 acaaggtaaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgtcatcctaaacccttgtttcagc 53915777  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    ||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  53915778 cccctctatcttaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 53915850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 5191925 - 5191528
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| || | | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  5191925 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagaacagccctctgatccactatatgatgagtatcgttacaaa 5191827  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5191826 -gagaaatcaatgggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 5191728  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  5191727 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 5191628  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  5191627 ccctctatctccaagtttgcttagatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtt 5191528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 1626665 - 1627015
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  1626665 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatcgacctagtctgggcgagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaa 1626764  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  1626765 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 1626864  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  1626865 ccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 1626964  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1626965 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 1627015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 10084372 - 10084775
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  10084372 agaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 10084471  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||| | |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  10084472 agagaaatcaacgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcc 10084571  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| || ||    
T  10084572 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttgttccagcc 10084671  T
Q  301 ccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttta 396  Q
    |||||||    |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  10084672 ccctctatctctctcaaagtttgctccgatacaaggtctatatttatagtaaaagcatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttc 10084771  T
Q  397 tgtt 400  Q
    ||||    
T  10084772 tgtt 10084775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 32264020 - 32264425
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||| || ||    
T  32264020 gagaacacaaaagaatt-gttgatccagtttggtccaaatagacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttaca 32264118  T
Q  100 aaa-gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  32264119 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagttccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtt 32264218  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttca 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  32264219 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttga 32264318  T
Q  298 accccctctatctcaaag----cttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgt 393  Q
     |||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  32264319 gccccctctatctcaaagttaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttgaaacaaatctgcacccaaaaatatgt 32264418  T
Q  394 ttatgtt 400  Q
    || ||||    
T  32264419 ttctgtt 32264425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 346
Target Start/End: Original strand, 51726990 - 51727334
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  51726990 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 51727089  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  51727090 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttaccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 51727189  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  51727190 caaggtgaatcaaccctcaaaccc-agtgtttgttccaaagagacaaactctatacataccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 51727288  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  51727289 ccctttatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 51727334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3314960 - 3314609
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||| |||  || ||    
T  3314960 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataattttaca 3314861  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  3314860 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3314761  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||| |||||     
T  3314760 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttatttcag 3314661  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3314660 ccccctctatctcaaggtttacactgatacaatatctatatttatagtaaaa 3314609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 43228566 - 43228220
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||    
T  43228566 gagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa 43228467  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  43228466 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 43228367  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |    
T  43228366 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacgctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagc 43228267  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43228266 cccctctatctccaagtttgctctgatacaatgtctatatttatagt 43228220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 27101163 - 27101513
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27101163 gagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctattctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttgcaa 27101262  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27101263 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccattctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 27101362  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  27101363 ccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 27101462  T
Q  300 cccctctatctcaa----agcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    | |||||||||| |    |  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27101463 ctcctctatctctatctcaatttgctctgatacaaggtctatatttatagt 27101513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 880433 - 880784
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||||||| || |||    
T  880433 gagaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccattttactatatgatgagtaactttacaa 880532  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  880533 aagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgtctaattctacccaaagccccaatctctttccgtaaccaagagactcaatgctaatagtgtttc 880632  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttgtttcaa 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  880633 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacgaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaactcttgtttcag 880732  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
     |||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  880733 acccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 880784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26720821 - 26720423
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  26720821 agaacacaaaagaatttggtgacccagttcggtccaaattgacctaatctaggggagagagcagtcatccgttccactatatgatgagtatcgttacaaa 26720722  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||| | |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |  ||    
T  26720721 agagaaatcaaagggttaaaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagt-taacc 26720623  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| ||    
T  26720622 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagcc 26720523  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  26720522 ccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttggaacaaatctgcactaaaaaatatgtttctgtt 26720423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42990579 - 42990268
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||| |||||||||||| |||    
T  42990579 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcaccatatgatgagtaacgttacaa 42990480  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  42990479 aagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 42990380  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  42990379 ccaaggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 42990280  T
Q  300 cccctctatctc 311  Q
    ||||||||||||    
T  42990279 cccctctatctc 42990268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Original strand, 4103879 - 4104257
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  4103879 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa 4103978  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4103979 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 4104077  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  4104078 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaagctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 4104177  T
Q  301 ccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  4104178 ccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 4104257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 5926747 - 5927096
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| || |||    
T  5926747 gagaacacaaa-gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagtcatccgtttcattatatgatgagtaaccttacaa 5926845  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||| || | |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5926846 aagatatataaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 5926945  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |    
T  5926946 ccaaggcgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagc 5927045  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    || ||||||||||| | |||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  5927046 cctctctatctcaaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagtaaaa 5927096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 32219360 - 32218975
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttg-ca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  32219360 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggagagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgtttaca 32219261  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    ||| |||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||    
T  32219260 aaaaagatatcaatgggttacaaaaataagtcttccgcctaattctgcccaaagtcccaatctcttcccgcaaccaagagactcaatcctgatagtgttt 32219161  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattct-aaaccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||           |||||||||| |||||| |||| || ||||||||||     
T  32219160 cccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttacaaagagacaaact-----------ctagttttgttgttgcctttctgaacccttgtttcag 32219072  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 395  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32219071 ccccctctatctcaaagtttagtcagatacaaggtctatatttatactgaaagtattacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 32218975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30006116 - 30005805
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  30006116 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctaatctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaa 30006017  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  30006016 aagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttc 30005917  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  30005916 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 30005817  T
Q  300 cccctctatctc 311  Q
    ||||||||||||    
T  30005816 cccctctatctc 30005805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15781154 - 15780747
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtag---ccatccgtttcactatatt-atgagtaacgtt 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||   || | |||| ||||||| | || | |||| ||    
T  15781154 gagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcaggcgcccttcgttccactataatgataaataacttt 15781055  T
Q  97 gcaaaagaga----tgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaat 192  Q
     |||||||||    | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  15781054 acaaaagagaaatatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccgaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcgtaat 15780955  T
Q  193 agtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaact-----------ctatacaaaccctagttttgtagttgccat 281  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||           ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15780954 agtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccat 15780855  T
Q  282 tctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgca 380  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15780854 tctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgca 15780755  T
Q  381 cccaaaaa 388  Q
    ||||||||    
T  15780754 cccaaaaa 15780747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25533716 - 25533333
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  25533716 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 25533617  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  25533616 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcc 25533517  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  25533516 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 25533417  T
Q  301 ccctcta--------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||        |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||    
T  25533416 ccctctatctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttagaacaaat 25533333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 43226350 - 43226015
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||    
T  43226350 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 43226251  T
Q  111 aatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 210  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43226250 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 43226151  T
Q  211 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatc 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  43226150 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaacgagacaaactctatacaaa-cgtagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 43226052  T
Q  310 tcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    || ||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43226051 tccaagtttgctctgatacaatgtctatatttatagt 43226015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 5522610 - 5522997
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  5522610 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa 5522709  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5522710 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 5522808  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||           ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  5522809 caaggtaaatcaacccacaaacccgagtgtttgttccgaagag-----------acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 5522897  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  5522898 ccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttgaaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtt 5522997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 6065779 - 6066170
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  6065779 agaacacaaagaaatttgttgacccagttctgtccaatctgacctagtctaggggagagagcagccatccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 6065878  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  6065879 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 6065977  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttca-a 298  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||      
T  6065978 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 6066077  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatac 391  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  6066078 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctgtaacaaatctgctcccaaaaatac 6066170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 9604589 - 9604940
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||    
T  9604589 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa 9604688  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9604689 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 9604788  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaaccttgtttcaacc 300  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9604789 ccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttctttcaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaaccttgtttcagcc 9604888  T
Q  301 ccctcta------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    |||||||      ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9604889 ccctctatctctctctcagagttttctctaatacaaggtctatatttatagt 9604940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 400
Target Start/End: Original strand, 10191305 - 10191695
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||     
T  10191305 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatgaac 10191404  T
Q  114 gagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatca 213  Q
    | |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10191405 gggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaag-tccagcctcttcctgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 10191503  T
Q  214 accctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccc----tctat 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| || |||||    ||| |    
T  10191504 acccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctataaaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttgttccagccccctttatctct 10191603  T
Q  309 ctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  10191604 ctcaaagtttgctccgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatttgcactcaaaaatatgtttctgtt 10191695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 747031 - 746650
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  747031 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 746932  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  746931 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 746833  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |    
T  746832 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagc 746733  T
Q  300 cccctcta------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||||||||      |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  746732 cccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 746650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 53468435 - 53468787
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagt--ctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttg 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||     
T  53468435 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtctggggggtagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaacctta 53468534  T
Q  98 caaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgt 197  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  53468535 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgt 53468634  T
Q  198 ttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttc 296  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  53468635 ttcccaaggtgaatcaatgctcaaaccctagtgtttcttccaaagagacaaactctatacaaa-cctggttttgttgttgccattctaaacccttgtttc 53468733  T
Q  297 aaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    | |||||| ||||| || | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53468734 agccccctttatctaaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 53468787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 28761409 - 28761784
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaa-ttgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgc 98  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| | ||||||||| || |    
T  28761409 gagaaaacaaaagaatttgtttacccagttcgatccaaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactataatgatgagtaactttac 28761508  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||   |||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28761509 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacctaaagtctcaatatcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 28761608  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttca 297  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||    
T  28761609 ttccaaggtgaatcaactctcaaacccttgtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttca 28761707  T
Q  298 accccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaa 374  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || | || ||||||||||    
T  28761708 accccctctatctcaaggtttactctgatgcaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaattggaacaaa 28761784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1321753 - 1321482
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  1321753 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 1321654  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1321653 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 1321554  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgta 273  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1321553 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacccgagttttgta 1321482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 379
Target Start/End: Original strand, 6063429 - 6063809
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  6063429 agaacacaaagaaatttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 6063528  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  6063529 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 6063627  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  6063628 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 6063727  T
Q  300 cccctcta--tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    ||||||||  |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| || |||||||||||    
T  6063728 cccctctatctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 6063809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36012102 - 36011752
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  | |||||| |||| || ||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  36012102 gagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgaagaagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaa 36012003  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  36012002 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccaactaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagatattcaatcctaatagtgtttc 36011903  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | ||||||| |||||||||| |    
T  36011902 ccaacgtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccttagtttcgttgttgtctttctaaatccttgtttcagc 36011803  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||| |||||||| | |||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  36011802 cccctttatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaa 36011752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 458558 - 458179
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  458558 agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 458459  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  458458 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 458360  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |    
T  458359 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 458260  T
Q  300 cccctctatctc----aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||||||||||||    || | |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  458259 cccctctatctctctcaaggtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 458179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 111 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 35777587 - 35777296
Alignment:
Q  111 aatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttcccaatgtga 209  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  35777587 aatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 35777488  T
Q  210 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctat 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  35777487 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctat 35777388  T
Q  309 ctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| | |  |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35777387 ctcaaagtttgctttgatacaatgtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttatgtt 35777296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 47148877 - 47149232
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| || | || |||||||||||| |||||||||| | |||    
T  47148877 gagaacacagaataatttgttgacctagttcgggccaaattgacatagtctgggggagagagcagtcctctgtttcactatatgatgagtaacgatacaa 47148976  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||     
T  47148977 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt- 47149075  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttg-ttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  47149076 ccaaggtgaatcaaccatcaaatcccagtgtttgtttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 47149175  T
Q  299 ccccctctat----ctcaaagcttac-tctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149176 ccccctctatctccctcaaggcctacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 47149232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 50494273 - 50493895
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  50494273 agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 50494174  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  50494173 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatcccttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 50494075  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |    
T  50494074 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagc 50493975  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    ||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||| ||| |    |||||||| || |||||||||||    
T  50493974 cccctctatctctcagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtgaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 50493895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 350
Target Start/End: Original strand, 54691559 - 54691905
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaag 103  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  54691559 aacataaaagaatttgtcgacctagttcagttcaaattgacatagtctaggggagagagcagccctccgtttaactatatgatgggtaacgttacaaaag 54691658  T
Q  104 agatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttccca 203  Q
    |||| |||||||  |||||||| |||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||| ||||| |   | ||||||||||||||||||||||    
T  54691659 agatatcaatgaaatacaagaataagtctcccgcctaattcaactcaaagccctaatctcttcccataaccaaaaaattcaatcctaatagtgtttccca 54691758  T
Q  204 atgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattct-aaaccttgtttcaacccc 302  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||  |||||    
T  54691759 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtcgcctttctaaaaccttgttt-tacccc 54691857  T
Q  303 ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||| || | |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  54691858 ctctatcttaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaa 54691905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 456181 - 455802
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  456181 agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacccgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 456082  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  456081 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 455983  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |    
T  455982 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 455883  T
Q  300 cccctctatctc----aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||||||||||||    || | |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  455882 cccctctatctctctcaaggtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 455802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 99 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6561987 - 6561740
Alignment:
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6561987 aaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 6561888  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttca 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  6561887 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 6561788  T
Q  298 accccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatag 345  Q
     ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561787 gccccctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatag 6561740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25389179 - 25388884
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  25389179 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 25389080  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  25389079 -gagaaatcaatgggttacaagaatatgtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 25388981  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttca 297  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  25388980 c-aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttca 25388884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 39715740 - 39715395
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||||| ||||||||||   | ||||| ||||||||||   ||||||||| || |||    
T  39715740 gagaacacaaaagaatttgttgacctagtttggtccaaaatgatctagtatgggggagagc--aaccatctgtttcactatg--atgagtaactttacaa 39715645  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39715644 aagagatatcaatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 39715545  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||| |||| |     
T  39715544 tcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcaaatagacaaactctatacaaaccctagttttggtgttgcctctctaaacccttatttc-ag 39715446  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39715445 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaa 39715395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6484635 - 6484372
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  6484635 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaa 6484536  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    || |||| |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  6484535 aaaagatatcaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaacctaatagtgtttc 6484436  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccc 263  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  || |||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  6484435 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccccggtatttgttgccgaagagacaaactctacacaaaccc 6484372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Original strand, 10621513 - 10621900
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  10621513 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa 10621612  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  10621613 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10621711  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |    
T  10621712 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagc 10621811  T
Q  300 cccctcta------------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
     |||||||            |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  10621812 accctctatctctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 10621900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 51674748 - 51675088
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||| || |||    
T  51674748 gagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctggtatgggggagagagcagccctccatttcagtatatgatgagtaacattacaa 51674847  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattcta-ccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  51674848 aagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaatc-ccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 51674946  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |           ||||||| ||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||     
T  51674947 tccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaaggg-----------acaaaccttagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcag 51675035  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaa 351  Q
    ||||||||||||||| | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51675036 ccccctctatctcaacgtttacattgatacaacgtctatatttatagtaaaaa 51675088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 889779 - 890103
Alignment:
Q  25 ccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaaga 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| || |||||||||    
T  889779 ccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagaaatcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaaga 889878  T
Q  125 aaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaacc 224  Q
    | || ||| | ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  889879 ataactctcctgcctaattctacccaaagccccaa-ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaacc 889977  T
Q  225 ctagtgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactc 322  Q
    | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| | |||| |    
T  889978 ccagtgtttgttgccaaatagacaaactctatacaaaccctaggtt--ttgttgccattctaaacccttgtttcagcttcctctatctcaaggtttacac 890075  T
Q  323 tgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  890076 tgatacaatatctatatttatagtaaaa 890103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 38210644 - 38210265
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| |||  |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  38210644 agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 38210545  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  38210544 -gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 38210446  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |    
T  38210445 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagc 38210346  T
Q  300 cccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctg 378  Q
    ||||||||    |||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | |  |||||||| || ||||||||||    
T  38210345 cccctctatctctctcaaa--atagcctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctg 38210265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 254
Target Start/End: Original strand, 7606571 - 7606822
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| | |||||||||| ||||    
T  7606571 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgacgagtaacgttacaaa 7606670  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
      |||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7606671 t-agaaatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 7606769  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactcta 254  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7606770 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 7606822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 42992545 - 42992186
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| |||| ||||||| |||    
T  42992545 gagaacacaaaaaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgattcactatatgatgactaacgttacaa 42992446  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||               ||||| |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  42992445 aagagaaatcaatgagttacaagaataa---------------ctacccaaag-tccactctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 42992362  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
     ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||| |    
T  42992361 tcaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagc 42992262  T
Q  300 cccctctatctc----aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaa 370  Q
    ||||||||||||    |||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||    
T  42992261 cccctctatctctcttaaagtttagcatgatacaaggtatatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaa 42992186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 346
Target Start/End: Original strand, 35917944 - 35918277
Alignment:
Q  19 gttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagtt 118  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||| |||    
T  35917944 gttgatccagttcggtctaaattgacc-agtctgagggagagagcagctctccgttccactatataatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtt 35918042  T
Q  119 acaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccct 218  Q
    ||||||| |||||| || |||| ||||||| |||   ||| ||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  35918043 acaagaataagtctccctcctatttctacccaaattcccagtctcttctcgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcgcaaggtgaatcaaccct 35918142  T
Q  219 caaacccta------gtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctc 311  Q
    ||||| |||      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  35918143 caaactctagtgtttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 35918242  T
Q  312 aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    |||  || || ||||||||||||||||||||||||    
T  35918243 aaaatttgctatgatacaaggtctatatttatagt 35918277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 28100143 - 28100373
Alignment:
Q  121 aagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctca 220  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  28100143 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagcgttttccaaggtgaatcaaccctca 28100242  T
Q  221 aaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagctta 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  28100243 aaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaagggtta 28100342  T
Q  320 ctctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  28100343 ctctgatacaacgcttatatttatagtaaaa 28100373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 278
Target Start/End: Original strand, 28413014 - 28413291
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaa-tttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| |||    
T  28413014 agaacacaaaagaaatttgttgacctaattcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaa 28413113  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgttt 199  Q
    | ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  28413114 a-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgttt 28413212  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgc 278  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28413213 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 28413291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23633728 - 23633357
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||| || ||    
T  23633728 gagaacacaaaagaatttgtttacccatttcggtctaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccttttcactataatgatgagtaactttaca 23633630  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    || ||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  23633629 aa-gagatatcatcgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 23633531  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    |||   || ||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| |||||||| |     
T  23633530 ccc--ggtaaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaacactatacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaatccttgttttag 23633437  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaatct 377  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||    
T  23633436 ccctctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatct 23633357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 55 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29956907 - 29956650
Alignment:
Q  55 ggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagc 154  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||     
T  29956907 ggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 29956808  T
Q  155 tccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactcta 254  Q
     |||  |||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  29956807 cccagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaactcta 29956708  T
Q  255 tacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctc 311  Q
    ||||||||||| |||||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29956707 tacaaaccctaattttgttgttgaatttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 29956650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 208 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11163218 - 11163025
Alignment:
Q  208 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctct 306  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11163218 gaatcaatccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 11163119  T
Q  307 atctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11163118 atctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatcgtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 11163025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 25688142 - 25688367
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttg-ca 99  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||    
T  25688142 gagaacacaaaagaactttttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttaca 25688241  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  25688242 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25688341  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccc 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25688342 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 25688367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17795534 - 17795269
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||||||| || ||    
T  17795534 gagaacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcattataatgatgagtaactttaca 17795435  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  17795434 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagttttt 17795335  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttt 269  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| || |||||||    
T  17795334 cccaaagtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacagactctagttt 17795269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19103974 - 19103709
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||||||| || ||    
T  19103974 gagaacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcattataatgatgagtaactttaca 19103875  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  19103874 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagttttt 19103775  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttt 269  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| || |||||||    
T  19103774 cccaaagtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacagactctagttt 19103709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 113 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28181185 - 28180949
Alignment:
Q  113 tgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatc 212  Q
    ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28181185 tgagttataagaatacgtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatggtgtttcccaaagtgaatc 28181086  T
Q  213 aaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaaccttgtttcaaccccctctatctca 312  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  28181085 aaccctcaaatcccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacc-tatttcagccccctctatctca 28180987  T
Q  313 aagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    | | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28180986 aggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 28180949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5899946 - 5899734
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||||| |    
T  5899946 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttgc-a 5899848  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||     
T  5899847 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcacttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt- 5899749  T
Q  201 ccaatgtgaatcaac 215  Q
    |||| ||||||||||    
T  5899748 ccaaggtgaatcaac 5899734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4666789 - 4666535
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  4666789 gagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggg---agagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttaca 4666693  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaag--tcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgt 197  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  4666692 aaagagatatcaatggattacaagaataaggatctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaacctagagactcaatcataatagtgt 4666593  T
Q  198 ttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctat 255  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||    
T  4666592 ttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtctgttgtcaagagacaaaccctat 4666535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5886473 - 5886261
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| | |    
T  5886473 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtttc-a 5886375  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||| |  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||     
T  5886374 aagacaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt- 5886276  T
Q  201 ccaatgtgaatcaac 215  Q
    |||| ||||||||||    
T  5886275 ccaaggtgaatcaac 5886261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 27635640 - 27635793
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  27635640 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 27635739  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagc 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  27635740 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattttacccaaagc 27635793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31151620 - 31151272
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatta-tgagtaacgttgc 98  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||| |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  | |||||||| || |    
T  31151620 gagaacacatgagaatttgtttacccagttcagcccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataacaatgagtaactttac 31151521  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    ||||||||| |||  | |||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  31151520 aaaagagatatca--gggttacaagaataagtcacccgcctaattctacccaaagtcccaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtt 31151423  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttg-tttc 296  Q
    |||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||||||| ||||| ||||    
T  31151422 tcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctggtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg-atttctaaacccttgttttc 31151327  T
Q  297 aaccccctctatctcaaagcttac-tctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    | ||||||||||||| | | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31151326 agccccctctatctcgaggtttacatctgatacaaagtctatatttatagtaaaa 31151272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 53591442 - 53591120
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgag 116  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||      
T  53591442 ttgttgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggg-agagagcatcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaatgagatatcaatgga 53591344  T
Q  117 ttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaacc 216  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||   | ||||| ||| ||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  53591343 ttagaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatccaaatctattctcgtaaccaagagactcaattcgaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 53591244  T
Q  217 ctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttgtttcaaccccctctatctcaaag 315  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||           ||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |    
T  53591243 ctcaaaccctagtgtttgttctaaagagac-----------aaaccctagttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagcctcctctatctcaagg 53591155  T
Q  316 cttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
     |||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  53591154 tttacacttatacaatgtctatatttatagtaaaa 53591120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6232075 - 6231849
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| |||| || | ||||||| | || ||    
T  6232075 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatcggggggagacagcagccctccgtt-cactgtaatgatgagtagctttaca 6231977  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||    
T  6231976 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaatc-ccaatctcttcccgtaaccaagagactcaacactaatagtgttt 6231878  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctag 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6231877 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 6231849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 128 - 350
Target Start/End: Original strand, 28137415 - 28137627
Alignment:
Q  128 agtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaacccta 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28137415 agtcttccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttcatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaacccta 28137514  T
Q  228 gtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||           |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28137515 gtgtttgttcccaagagacaaact-----------ctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgat 28137603  T
Q  327 acaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||| |  ||||||||||||||||    
T  28137604 acaacgcatatatttatagtaaaa 28137627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24177373 - 24177154
Alignment:
Q  179 gactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgc 278  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  24177373 gactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccc--aaccttagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttga 24177277  T
Q  279 cattctaaac-cttgttt-caaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatc 376  Q
    ||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24177276 cat-ctaaactcttgttttcagccccctctagctcaatgtttactatgatacaaggtctatatttataataaaagtatcccttaaaatttggaacaaatc 24177178  T
Q  377 tgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    |||||  |||||||||||||||||    
T  24177177 tgcacttaaaaatacgtttatgtt 24177154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11168375 - 11168165
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| || ||||||||| ||||    
T  11168375 agaacacaaaagaatttgttgaccaagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccaatatatgataagtaacgttacaaa 11168276  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||   |||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  11168275 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaattcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcc 11168176  T
Q  202 caatgtgaatc 212  Q
    ||| |||||||    
T  11168175 caaggtgaatc 11168165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 400
Target Start/End: Original strand, 561769 - 562144
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgg-gggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtc 110  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||||||| | ||||||||| || ||||| |||| ||    
T  561769 aatttgtttacccggttcggtccaaaactgacctagtctggagggagagagcagcccttcgttccactataatgatgagtaactttacaaaaaagatatc 561868  T
Q  111 aatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 210  Q
    ||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||   |||||||||| ||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  561869 aatgacttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 561968  T
Q  211 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatc 309  Q
    ||||||    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| | ||||||| ||||||||||||||||| |       
T  561969 tcaacc--tgaaccctagtgtttgttgccaagaga-aaactctatacaaaccctagtttcat-gttgac-ttctaaacccttgtttcaacccccttt--- 562060  T
Q  310 tcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
           ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||    
T  562061 -------ttactctaatacaaagtctatatttatagtaaaattatcccttataaaaatggaacaaatctg-gcccgaaaatacgtttctgtt 562144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 184 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41849244 - 41849041
Alignment:
Q  184 aatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattc 283  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  41849244 aatcctaatagagtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgttattc 41849145  T
Q  284 taaa-ccttgtttcaaccccctcta----------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    |||| |||||||||| |||||||||          |||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  41849144 taaacccttgtttcagccccctctatctatctctctctcaaagtttagcctgatacaatgtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 41849045  T
Q  372 aaat 375  Q
    ||||    
T  41849044 aaat 41849041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 269
Target Start/End: Original strand, 13420208 - 13420432
Alignment:
Q  41 tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatta-tgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcct 139  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||  |||||| || |||| || |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13420208 tgacctagtctggtg-agagagcagctctccgttccattataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcct 13420306  T
Q  140 aattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccc 239  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||| ||    
T  13420307 aattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactc---aaccctagtgtttgttgcc 13420403  T
Q  240 aagagacaaactctatacaaaccctagttt 269  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13420404 tagaga-aaactctatacaaaccctagttt 13420432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 53597472 - 53597120
Alignment:
Q  41 tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcct 139  Q
    ||||||||| || ||||||||| | || ||| || ||||||| | ||||||||| || ||||||| || |||| | |||||||||| ||||||   ||||    
T  53597472 tgacctagtttgtgggagagagcaaccctccattccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaacgggttacaagaataagtctcttgcct 53597373  T
Q  140 aattctac-caaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcc 238  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||| ||| | | ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||| |    
T  53597372 aattctactcaaaatctc-aatctattctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac--ttcaaccctagtgtttgttgc 53597276  T
Q  239 caagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctat 337  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| | || |||||| |||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  53597275 caagaga-aaactctatacaacccctagttttcttgttgac-ttataaacccttgtttcatcccc-tctatctcaaggtttactctgatacaaggtctat 53597179  T
Q  338 atttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 395  Q
    ||||||||||||| |||| || | ||| |||||||| || |   |||||||||||||||    
T  53597178 atttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacatatttcagcccaaaaatacgttt 53597120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 99 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23637200 - 23636947
Alignment:
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||| | | | || ||||||||||||||||||||    
T  23637200 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatatcttcccatgaacaagagactcaatcctaatagtgtt 23637101  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttca 297  Q
    || ||| || ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| |||||||| |    
T  23637100 tctcaaggtaaatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaagag-cagactctatacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaacccttgtttta 23637005  T
Q  298 accccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatc 355  Q
     || |||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||    
T  23637004 gcctcctctatctcaaggtttactctgatacaaagtatatatttatattaaaattatc 23636947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 25635644 - 25635391
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaa 112  Q
    |||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| |  |||||||||| | || || ||||||| ||| | ||||||||| || ||||| |||| ||||    
T  25635644 aatttgtttacgcagtttggtccaaattggcctagccgaggggagagagcaaccctctgtttcaccataatgatgagtaactttacaaaatagatatcaa 25635545  T
Q  113 tgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatc 212  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  25635544 tgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaacc 25635445  T
Q  213 aaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttt 269  Q
    || |  | |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25635444 aatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaaccctagttt 25635391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3307035 - 3306839
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| | |||||| |||||||||| | ||||||||| || ||    
T  3307035 gagaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctagg--agagagcaaccatccttttcactataatgatgagtaactttaca 3306938  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  3306937 aaagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaaactccaatatctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 3306839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 47701653 - 47701800
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  47701653 gagaacgcaaaagaatttgttgatccagttcgatccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaa 47701752  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctacc 148  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  47701753 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacc 47701800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 222 - 351
Target Start/End: Original strand, 27635830 - 27635960
Alignment:
Q  222 accctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttac 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  27635830 accctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtttgcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttac 27635929  T
Q  321 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaa 351  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  27635930 tctaattcaaggtctatatttgtagtaaaaa 27635960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 54884367 - 54884082
Alignment:
Q  64 agccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatct 162  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||||   |||||| || |||||| || ||||||||||   |||| | ||||||    
T  54884367 agccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatagattacaa-aataagtctccctcctaattctattcaaagtttcaatct 54884269  T
Q  163 cttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacc 262  Q
    ||| | |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||      
T  54884268 ctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaagatgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagaaacaaactc--tacaaatt 54884171  T
Q  263 ctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||  | | ||||||||||||| | ||||  |||| ||| || ||||||||| ||||||    
T  54884170 ctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttcgagctccctctatctcaaggtttacaatgatccaatgtttatatttatggtaaaa 54884082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 223 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6231502 - 6231374
Alignment:
Q  223 ccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttact 321  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||   ||||     
T  6231502 ccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagcccgctctatctcaagatttaca 6231403  T
Q  322 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6231402 ctgatacaatgtctatatttatagtaaaa 6231374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 276 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 1321441 - 1321316
Alignment:
Q  276 tgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaa 374  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1321441 tgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaa 1321342  T
Q  375 tctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||    
T  1321341 tctgcactcaaaaatatgtttctgtt 1321316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 222 - 350
Target Start/End: Original strand, 47701798 - 47701927
Alignment:
Q  222 accctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttac 320  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||| | ||||    
T  47701798 accctggtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaggtttac 47701897  T
Q  321 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47701898 actgatacaatgtctatatttatagtaaaa 47701927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 36871295 - 36871550
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| | |||| |||| || |||| |||||  ||    
T  36871295 aattcgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgattaactttacaaa-gagataaca 36871393  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 210  Q
    | | ||| |||||| ||||||||   |||||||||||| ||||  |||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||    
T  36871394 aagggttgcaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcttaacagtgttttccaaggtgaa 36871493  T
Q  211 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttt 270  Q
    |||| |||  |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  36871494 tcaatcct--aaccctggtgtttgttgccaagag-caaactctatacaagccctagtttt 36871550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 41849334 - 41849243
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaa 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||    
T  41849334 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaa 41849243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1674227 - 1673981
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||  || | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |        ||||| || ||||||| || ||||    
T  1674227 aatttgtttacccagttcggtctaatactgacctagtctggtggagagagcagccatccgttccaaaa--------gtaactttacaaaagacatatcaa 1674136  T
Q  113 tgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatc 212  Q
     | |||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1674135 agggttacacgaataagtctcccgtctatttctacccaaagtcccaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccatggtgaatc 1674036  T
Q  213 aaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttt 270  Q
    || |||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  1674035 aatcct--aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaacactagtttt 1673981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 83
Target Start/End: Original strand, 35919098 - 35919179
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatat 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  35919098 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatat 35919179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 232
Target Start/End: Original strand, 4560401 - 4560497
Alignment:
Q  136 gcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 232  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4560401 gcctaattctacccaaagctccaatctcttccggtaaccaacaggctcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 4560497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25634162 - 25634031
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactat-attatgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| || ||    
T  25634162 gagaacacacaa-aatttgtttacctagttcggtgcaaattgtcctagtctggtggagagagcagccattcgtttcactataatgatgagtaactttaca 25634064  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtct 132  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||    
T  25634063 aaagagatatcaatggattacaagaataagtct 25634031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 233 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3306842 - 3306723
Alignment:
Q  233 tgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaag 331  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||| |||||| |||||| | | |||| |||||||||     
T  3306842 tgttccaaagagacaaactctattcaaatcctagttttgttgttgtatttctaaacccttgtttcagccccctatatctctaggtttacactgatacaat 3306743  T
Q  332 gtctatatttatagtaaaaa 351  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3306742 gtctatatttatagtaaaaa 3306723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24181644 - 24181486
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||| | ||||||||| || ||||||| || |||    
T  24181644 aatttgtttacccaattcggtccaaaactgacctagtttggaggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatca 24181545  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgt 170  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||    
T  24181544 atgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccaatcttttcccgt 24181486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 53894040 - 53894105
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagcc 67  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53894040 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 53894105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Original strand, 1620483 - 1620657
Alignment:
Q  41 tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccg-cc 138  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||  || |||| ||||| |||| | ||||||||||  || ||||   ||    
T  1620483 tgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaagtttacaaa-gagatatcaaagggttacaagaactagccttcaaacc 1620581  T
Q  139 taattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaa 214  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| |  |||  |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1620582 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagacctaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 1620657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 25634017 - 25633930
Alignment:
Q  179 gactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttt 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||   | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25634017 gactcaatcctaataatgtctcccaaggtgaatcaatccc--agccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttt 25633930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 13419997 - 13419890
Alignment:
Q  158 aatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatac 257  Q
    |||||||| |||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||    
T  13419997 aatctctttccgtgaccaagagacttgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tac 13419903  T
Q  258 aaaccctagtttt 270  Q
    |||||||||||||    
T  13419902 aaaccctagtttt 13419890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 13893345 - 13893287
Alignment:
Q  323 tgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcac 381  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  13893345 tgatacaatgtctatatttatagtaaaagtaacccttaaaatttggaacaaatctgcac 13893287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 214
Target Start/End: Original strand, 14634480 - 14634638
Alignment:
Q  58 gagagtagccatccgtttcactat-attatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagct 155  Q
    |||| |||||||||||| |||||| || ||||||||| || |||||||||| |||| |  |||||||||  |||||||   |||||| ||||| ||||      
T  14634480 gagattagccatccgttccactattatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggtttacaagaatcagtcttcaaacctaatgctacccaaagtc 14634579  T
Q  156 ccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaa 214  Q
     |||||||||| ||| ||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14634580 tcaatctcttctcgtgactaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 14634638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 379
Target Start/End: Original strand, 6719396 - 6719472
Alignment:
Q  303 ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| || |||||||||||    
T  6719396 ctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 6719472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 127
Target Start/End: Original strand, 11007545 - 11007632
Alignment:
Q  41 tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaa 127  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  || || ||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11007545 tgacctagtctaggggagagaggagccccccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatgtcaaagagttacaagaaaa 11007632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 380
Target Start/End: Original strand, 46966938 - 46966997
Alignment:
Q  321 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgca 380  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  46966938 tctgatacaatgtttatatttatagtaaaagtaacccttaaaatttggaacaaatctgca 46966997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 42992661 - 42992607
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggg 55  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42992661 gagaatacaaaagaattttttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggg 42992607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26762919 - 26762839
Alignment:
Q  321 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcaccc-aaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  26762919 tctgatacaaggtttatatttatagtaaaagcatccctaaaaaattggaacaaatctaagcccaaaaaatacgtttatgtt 26762839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 379
Target Start/End: Original strand, 53896477 - 53896557
Alignment:
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||| |    |||||||| || |||||||||||    
T  53896477 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtgaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 53896557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5886240 - 5886181
Alignment:
Q  320 ctctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||||    
T  5886240 ctctgataaaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatctgtaacaaatctgc 5886181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5899715 - 5899656
Alignment:
Q  320 ctctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||||    
T  5899715 ctctgataaaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatctgtaacaaatctgc 5899656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6484372 - 6484310
Alignment:
Q  288 ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  6484372 ccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgcctatatttatagcaaaa 6484310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 263 - 355
Target Start/End: Original strand, 4560509 - 4560602
Alignment:
Q  263 ctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatc 355  Q
    |||||||||| ||| || || |||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  4560509 ctagttttgttgttacctttataaaccattgtttcagccccctctatctcaatgtttactatgatacatagtctatacttatagtgaaagtatc 4560602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 232
Target Start/End: Original strand, 7606828 - 7606873
Alignment:
Q  187 cctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7606828 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctactgtt 7606873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 322 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25388851 - 25388794
Alignment:
Q  322 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| || |||||||||||    
T  25388851 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 25388794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42990234 - 42990181
Alignment:
Q  323 tgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  42990234 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 42990181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7768530 - 7768474
Alignment:
Q  321 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatct 377  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||    
T  7768530 tctgatacaaggcttatatttatagtaaaaacatccctaaaaaattggaacaaatct 7768474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 40913461 - 40913417
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  40913461 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 40913417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 44331713 - 44331669
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  44331713 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 44331669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 48390296 - 48390368
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata 82  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  48390296 aagaatttgtttacccagttcggtttaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 48390368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16996760 - 16996705
Alignment:
Q  321 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatc 376  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||    
T  16996760 tctgatacaaggtttatatttatattaaaaccatccctaaaaatttggaacaaatc 16996705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 1736388 - 1736338
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagcc 67  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1736388 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 1736338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 10612772 - 10612844
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaat--tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  10612772 aagaatttgtttacccagttcggt-ctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 10612844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 18552966 - 18552916
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagcc 67  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18552966 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 18552916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 26298992 - 26299042
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagcc 67  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||    
T  26298992 ttgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagcc 26299042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 30236299 - 30236249
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  30236299 aagaaattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 30236249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 30709873 - 30709823
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagcc 67  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30709873 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 30709823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 37466295 - 37466345
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagcc 67  Q
    |||||||| ||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  37466295 ttgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagcc 37466345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 1417573 - 1417528
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  1417573 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 1417528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4663877 - 4663844
Alignment:
Q  317 ttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4663877 ttactctgatacaatgtctatatttatagtaaaa 4663844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 8370569 - 8370524
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  8370569 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 8370524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 21711227 - 21711272
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  21711227 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 21711272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 27975035 - 27974990
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  27975035 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 27974990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 27986529 - 27986484
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  27986529 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 27986484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 395
Target Start/End: Original strand, 31021452 - 31021525
Alignment:
Q  323 tgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaa-atttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||| | |||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  31021452 tgatacaaggtctatatttatagtaaaaccatctctcaaataattggaacaaatctcagcccaaaaatatgttt 31021525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 8183116 - 8183148
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgg 33  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8183116 gagaacacaaaagaatttgttgacccaattcgg 8183148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 9666466 - 9666510
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||    
T  9666466 ttgttgacccagttcggtccaactttacctaatctgggggagaga 9666510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 16499197 - 16499153
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||    
T  16499197 ttgttgacccagttcggtccaacttaacctactctgggggagaga 16499153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 23391909 - 23391953
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  23391909 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 23391953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 29196386 - 29196430
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  29196386 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 29196430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 29811036 - 29810992
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  29811036 ttgttgacccaattcggtttaacttgacctaatctgggggagaga 29810992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Original strand, 32744436 - 32744476
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggggga 57  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  32744436 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggggga 32744476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 39153361 - 39153405
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||    
T  39153361 ttgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 39153405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 40734666 - 40734622
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  40734666 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 40734622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 40735547 - 40735507
Alignment:
Q  21 tgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  40735547 tgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 40735507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 47878165 - 47878237
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata 82  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  || | ||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||    
T  47878165 aagaatttgtttacccagttcggtctaataatgacctagtctggaggagagagcagctctccgttccactata 47878237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 51398982 - 51398938
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  51398982 ttgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 51398938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 134)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 4 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 48486665 - 48486268
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaag 103  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  48486665 aacacaaaataatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaag 48486566  T
Q  104 agatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttccca 203  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  48486565 agatttcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 48486466  T
Q  204 atgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacccc 302  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  48486465 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcccc 48486366  T
Q  303 ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48486365 ctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 48486268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 22802719 - 22803117
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||||||| || ||||    
T  22802719 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagaaaccctccgttccactatatgatgagtaacattacaaa 22802818  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22802819 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 22802918  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  22802919 caaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcc 22803018  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  22803019 ccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactc-aaaatacgtttttgtt 22803117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24879339 - 24878938
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttg-ca 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||    
T  24879339 gagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgtgtatcgtttaca 24879240  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24879239 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 24879140  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||||     
T  24879139 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctggtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccctagtttcag 24879040  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 398  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  24879039 ccccctctatctccaagtttactcggatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatatgcacccaaaaatacgtttctg 24878940  T
Q  399 tt 400  Q
    ||    
T  24878939 tt 24878938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24880801 - 24880400
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttg-ca 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||    
T  24880801 gagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttaca 24880702  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24880701 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 24880602  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||       
T  24880601 cccaaggtgaaccaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctagtttacg 24880502  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 398  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  24880501 ccccctctatctccaagtttactccgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcatccaaaaatacgtttctg 24880402  T
Q  399 tt 400  Q
    ||    
T  24880401 tt 24880400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 22800846 - 22801245
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  22800846 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaa 22800945  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||     
T  22800946 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttt 22801045  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |    
T  22801046 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagc 22801145  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgt 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  22801146 cccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttgaaacaaatctgcactc-aaaatacgtttctgt 22801244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 5198768 - 5198369
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  5198768 agaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa 5198669  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  5198668 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacacaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcc 5198569  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  5198568 caaagtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 5198469  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  5198468 ccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtt 5198369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 4 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24889142 - 24888745
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||| ||||||    
T  24889142 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgataagtaacgttacaaaag 24889043  T
Q  104 agatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttccca 203  Q
    |||| |||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24889042 agatatcaatgggttacatgaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 24888943  T
Q  204 atgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacccc 302  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  24888942 aggtgaatcaaccctcaaagcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaatccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 24888843  T
Q  303 ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  24888842 ctctatctctaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtt 24888745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 36919568 - 36919966
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||||| |||| ||||||| |||    
T  36919568 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccatctattccactatatgatgaataacgttacaa 36919667  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36919668 aagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 36919767  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  36919768 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactttatccaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 36919867  T
Q  299 ccccctctatc--tcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 395  Q
    |||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919868 ccccctatatctatcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 36919966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 47275073 - 47274676
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  47275073 agaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaa 47274975  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  47274974 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 47274875  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaacc 300  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  47274874 caagatgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 47274776  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47274775 ccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttgaaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 47274676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 36921477 - 36921879
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  36921477 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttaactagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaa 36921576  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36921577 aagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 36921676  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaa-accttgtttcaa 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||| |    
T  36921677 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactatatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcccttgtttc-a 36921775  T
Q  299 ccccctcta--tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttta 396  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  36921776 ccccctctatctctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttattgtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcatccaaaaatacgtttc 36921875  T
Q  397 tgtt 400  Q
    ||||    
T  36921876 tgtt 36921879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 40091399 - 40091795
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| || |||    
T  40091399 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacattacaa 40091498  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  40091499 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 40091598  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| |    
T  40091599 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttccaaagagacaaactctaaacaatccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagc 40091698  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttta 396  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  40091699 cccctctatctcaaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatatgcactgaaaaatacgttta 40091795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 38928161 - 38928512
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  38928161 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactatatgatgagtaacgttacaa 38928260  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  38928261 aagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 38928360  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttgtttcaa 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||     
T  38928361 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcag 38928460  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  38928461 ccccctctatctcaaggtttactctaatacaaagcctatatttatagtaaaa 38928512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40637423 - 40637077
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  40637423 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaa 40637324  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  40637323 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttc 40637224  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  40637223 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 40637124  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  40637123 cccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 40637077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 37089357 - 37089758
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  37089357 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 37089456  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  37089457 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcc 37089555  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  37089556 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcc 37089655  T
Q  301 ccctctatctc---aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttat 397  Q
    |||||||||||    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  37089656 ccctctatctctctcaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagttttgcttaaaatttggaacaaatctgcacctaaaaatacgtttct 37089755  T
Q  398 gtt 400  Q
    |||    
T  37089756 gtt 37089758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 9148600 - 9148201
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  9148600 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 9148501  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9148500 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 9148402  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||    
T  9148401 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgcttcagcc 9148302  T
Q  301 ccctcta--tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 398  Q
    |||||||  |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  9148301 ccctctatctctcaaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcaccc-aaaatacgtttctg 9148203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11435302 - 11434904
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  11435302 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 11435203  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  | |  ||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  11435202 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagactcttccggtaaccaggagactcaatcctaatagtgtttcc 11435104  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  11435103 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 11435004  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  11435003 ccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtt 11434904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 381
Target Start/End: Original strand, 22044376 - 22044755
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  22044376 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 22044475  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22044476 -gagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 22044574  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  22044575 caaggggaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 22044674  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcac 381  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22044675 ccctctatctccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcac 22044755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 381
Target Start/End: Original strand, 22046671 - 22047050
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  22046671 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 22046770  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22046771 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 22046869  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  22046870 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 22046969  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcac 381  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22046970 ccctctatctccaagtttgctccgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcac 22047050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 619432 - 619831
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  619432 gagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt-taggggagagagcagtcatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 619530  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || | | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  619531 aagagatatcaatgggttataagaataattttcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccttaaccaagacagtcaatcctaatagtgtttc 619630  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | || |||| |||||||||| |    
T  619631 ccaaggtaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaaccctagttttgttgttgtctttataaacccttgtttcagc 619730  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgt 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||    
T  619731 cccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgtttaaaatttggaaaaaatctctacccaaaaatatgtttctgt 619830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19096232 - 19095881
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  19096232 gagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgataagtaacgttacaa 19096133  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19096132 aagagatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 19096033  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||     
T  19096032 acaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag 19095933  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19095932 ccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 19095881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 51015593 - 51015195
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||| | |||||||| |||||||  ||| ||||    
T  51015593 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagacctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa 51015494  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  51015493 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 51015395  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  51015394 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 51015295  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  51015294 ccctctatctccaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactgaaaaatatgtttctgtt 51015195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 2 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14633666 - 14633323
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  14633666 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaa 14633567  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14633566 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt-ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 14633468  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |    
T  14633467 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttc-agc 14633369  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633368 ccttctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagt 14633323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 56030770 - 56030422
Alignment:
Q  21 tgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttac 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||   ||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  56030770 tgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttca---tatgatgaataacgttacaaaagaaatgtcaatgagttac 56030674  T
Q  121 aagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctca 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  56030673 aagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctca 56030574  T
Q  221 aaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagctta 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| | |||    
T  56030573 aaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccttctatctcaaggttta 56030474  T
Q  320 ctctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaa 370  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  56030473 ctctgatacaaagcctatatttatagtaaaaatataactcataaatttggaa 56030422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 371
Target Start/End: Original strand, 14787423 - 14787789
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagt--agccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatg 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14787423 aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatg 14787522  T
Q  109 tcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14787523 tcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 14787622  T
Q  209 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctcta 307  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14787623 aatcaatcctcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctcta 14787722  T
Q  308 --tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
      |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  14787723 tctctcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 14787789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 38409552 - 38409148
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  38409552 agaactcaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa 38409453  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  38409452 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 38409354  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||| ||    
T  38409353 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaaccattgtttcagcc 38409254  T
Q  301 ccctcta------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 394  Q
    |||||||      |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  38409253 ccctctatctccctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtt 38409154  T
Q  395 tatgtt 400  Q
    | ||||    
T  38409153 tctgtt 38409148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 33415472 - 33415845
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  33415472 gagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagcctgagggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaa 33415571  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||    
T  33415572 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcgatcttaatagtgtttc 33415671  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||| |    
T  33415672 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtt-ccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagc 33415770  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaa 374  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||| || | || ||||||||||    
T  33415771 cccctctatctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttgtagtaaaaaaatccctcataaattggaacaaa 33415845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7941671 - 7941268
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  7941671 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa 7941572  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7941571 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 7941472  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtg--tttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  7941471 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcatttgctcgtaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 7941372  T
Q  299 ccccctcta--tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttta 396  Q
    |||||||||  ||||   | || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7941371 ccccctctatctctcccggtttgctctgatacaacgtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttc 7941272  T
Q  397 tgtt 400  Q
    ||||    
T  7941271 tgtt 7941268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 31849584 - 31849983
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| |||| | ||    
T  31849584 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttac-aa 31849682  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||   ||  |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  31849683 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaagcaagagactcaatcctaatagtgtttcc 31849782  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctc-aaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  31849783 caaggtgaatcaacccacaaaaccttagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 31849882  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgt 399  Q
    ||||||||||||  || || ||||||||||||  |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  31849883 cccctctatctcctagtttgctctgatacaagacctatatttctagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgt 31849982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 346
Target Start/End: Original strand, 8631404 - 8631753
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  8631404 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 8631503  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8631504 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 8631603  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  8631604 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 8631703  T
Q  301 ccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    |||||||    |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  8631704 ccctctatctctctcaaagtttgctttgatacaaagtctatatttatagt 8631753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 12395829 - 12396179
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  12395829 gagaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaaccttacaa 12395928  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12395929 aagagatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 12396028  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  12396029 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttggctagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagc 12396128  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||| |||||||||| | ||||  | |||||| |||||||||||||||||||    
T  12396129 cccatctatctcaaggtttacatttatacaatgtctatatttatagtaaaa 12396179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24348566 - 24348187
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24348566 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 24348467  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24348466 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 24348367  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  24348366 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 24348267  T
Q  301 ccctctatctc----aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||||||    |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  24348266 ccctctatctctctcaaagtttagcttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 24348187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18847500 - 18847123
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||  | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  18847500 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa 18847402  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||    
T  18847401 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatgctaatagtgtttc 18847303  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18847302 ccaaggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaac 18847203  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| || |||||||||||    
T  18847202 cccctctatctcaaagtttgttttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 18847123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 12400791 - 12401141
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  12400791 gagaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaaccttacaa 12400890  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  12400891 aagagatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttc 12400990  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  12400991 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttggccagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagc 12401090  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||| |||||||||| | ||||  | |||||| |||||||||||||||||||    
T  12401091 cccatctatctcaaggtttacatttatacaatgtctatatttatagtaaaa 12401141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 36378642 - 36378246
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||| |  ||    
T  36378642 gagaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaacttcaca 36378543  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  36378542 agagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttaatcctaatagtgttt 36378443  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  36378442 tccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 36378343  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 395  Q
    |||| |||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || | || | ||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  36378342 ccccgtctatctcaaggtttattctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtaaccctcataaaattgtaacaaatctg-gcccaaaaatacgttt 36378246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 47868747 - 47868404
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaag 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  47868747 aacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaag 47868648  T
Q  104 agatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttccca 203  Q
    |||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  47868647 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcca 47868548  T
Q  204 atgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacccc 302  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| |||     
T  47868547 aggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttctttcagccct 47868448  T
Q  303 ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  47868447 ctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 47868404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6765192 - 6764842
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  6765192 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaacgttacaaa 6765093  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||  |||  |||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  6765092 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaacagtgtttcc 6764993  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcc-----caagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgttt 295  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  6764992 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaactaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 6764893  T
Q  296 caaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    || |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  6764892 cagccccttctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 6764842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 11006222 - 11006625
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| | || ||||    
T  11006222 agaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaccattacaaa 11006321  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  11006322 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 11006420  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  11006421 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 11006520  T
Q  300 cccctcta------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgt 393  Q
    ||||||||      |||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  11006521 cccctctatctctctctcaaa--atagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgt 11006618  T
Q  394 ttatgtt 400  Q
    || ||||    
T  11006619 ttctgtt 11006625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 76 - 400
Target Start/End: Original strand, 5637524 - 5637852
Alignment:
Q  76 cactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccg 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||     
T  5637524 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 5637623  T
Q  176 agtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagt 275  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5637624 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgt 5637723  T
Q  276 tgccattctaaac-cttgtttcaaccccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaa 370  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  5637724 tgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctcttatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaa 5637823  T
Q  371 caaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5637824 caaatctgcaccc-aaaatacgtttctgtt 5637852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 9174131 - 9174530
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||  | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  9174131 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggcagagaacagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa 9174230  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  9174231 -gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttc 9174329  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |    
T  9174330 ccaaggtgaatcaactcacgaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagc 9174429  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgt 399  Q
    |||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||  || |||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  9174430 cccctctatctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaaactgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgt 9174529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Original strand, 44599823 - 44600198
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  44599823 agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 44599922  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  44599923 -gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 44600021  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |    
T  44600022 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagc 44600121  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||    
T  44600122 cccctctatctcaaagtttgctttaatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttgaaacaaat 44600198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 346
Target Start/End: Original strand, 2484858 - 2485203
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  2484858 agaacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 2484957  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| |||||||  |||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2484958 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctatctctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 2485056  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | ||    
T  2485057 caaggtgaatcaacccagaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagcc 2485156  T
Q  301 ccc-tctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  2485157 cccttctagctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 2485203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 17662229 - 17662598
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||    
T  17662229 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa 17662328  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17662329 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 17662428  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||           ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  17662429 ccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagag-----------acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 17662517  T
Q  300 cccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||||||||    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  17662518 cccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 17662598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 76 - 400
Target Start/End: Original strand, 3824629 - 3824957
Alignment:
Q  76 cactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccg 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||     
T  3824629 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 3824728  T
Q  176 agtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagt 275  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3824729 atagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgt 3824828  T
Q  276 tgccattctaaaccttgtttcaaccccctcta----tctcaaag-cttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaa 370  Q
    |||  ||||||||| ||||||| |||||||||    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  3824829 tgcttttctaaacc-tgtttcagccccctctatctctctcaaagaaatactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttggaa 3824927  T
Q  371 caaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3824928 caaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 3824957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16453659 - 16453308
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  16453659 gagaacacaaaagaattttttggcgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaaccttaca 16453560  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16453559 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaatactacccaaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16453460  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||||     
T  16453459 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttgtacaaactctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcag 16453360  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||||||   | || ||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  16453359 ccccctctatctctcggtttgctctgatacaaagcctatatttatagcaaaa 16453308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 37313049 - 37313401
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||| || ||    
T  37313049 gagaaaacaaaagaatttgttgatccaatttggtccaaattgacatagtctgggggaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttaca 37313148  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||   |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37313149 aaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 37313248  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  37313249 ctcaaggtgaatcaactctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 37313348  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaa 351  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  37313349 ccccctctatctcaaggtttactttgatacaaaacctatatttatagtaaaaa 37313401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 379
Target Start/End: Original strand, 16934128 - 16934506
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  16934128 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 16934227  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  16934228 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 16934326  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||| |    
T  16934327 tcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtatcagc 16934426  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||||||    
T  16934427 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 16934506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Original strand, 26085962 - 26086236
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  26085962 agaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccttccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa 26086061  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||   ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  26086062 -gagaaaacaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 26086160  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttg 277  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26086161 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 26086236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 349
Target Start/End: Original strand, 9176461 - 9176807
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaag 103  Q
    ||||||||  ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||| |||| |||| |    
T  9176461 aacacaaagaaatttgttgactctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-g 9176559  T
Q  104 agatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttccc 202  Q
    |||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  9176560 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttccc 9176659  T
Q  203 aatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccc 301  Q
    || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |||    
T  9176660 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccc 9176759  T
Q  302 cctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 349  Q
    |||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  9176760 cctctatctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 9176807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 379
Target Start/End: Original strand, 11008553 - 11008933
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||| | || ||||    
T  11008553 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccattacaaa 11008652  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
       ||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  11008653 ---gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 11008749  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  11008750 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 11008849  T
Q  300 cccctcta------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    ||||||||      |||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| || |||||||||||    
T  11008850 cccctctatctctctctcaaa--atagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 11008933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 379
Target Start/End: Original strand, 16931774 - 16932152
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  16931774 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 16931873  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  16931874 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 16931972  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||| |    
T  16931973 tcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacagactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtatcagc 16932072  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||||||    
T  16932073 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtttatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 16932152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19323044 - 19322701
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgc 98  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||| | ||||||||| || |    
T  19323044 gagaacactaaagaatttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcatccctccgttccactataatgatgagtaactttac 19322945  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  19322944 aaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtt 19322845  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttca 297  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||||    
T  19322844 tcccaaggtgaatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttca 19322749  T
Q  298 accccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatag 345  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19322748 tccccctctatctcaaggtttactctgatacaagatctatatttatag 19322701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Original strand, 18709149 - 18709531
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || | |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  18709149 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 18709248  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  18709249 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgtttcc 18709347  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  18709348 caaggtgaatcaactcacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 18709447  T
Q  301 ccctcta--------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||        |||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  18709448 ccctctatctctctctctcaaagtttagcctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 18709531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 37 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13544272 - 13543952
Alignment:
Q  37 aaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccg 136  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  13544272 aaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccg 13544173  T
Q  137 cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 236  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13544172 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaa-cctagtgtttgtt 13544074  T
Q  237 -cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattcta-aaccttgtttcaaccccctcta----tctcaaagcttac-tctgataca 329  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||| |||||||||    |||||||| |||| |||||||||    
T  13544073 gccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctagatccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttacatctgataca 13543974  T
Q  330 aggtctatatttatagtaaaaa 351  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  13543973 agatctatatttatagtaaaaa 13543952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 375
Target Start/End: Original strand, 22132389 - 22132759
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||| |||| |||| ||||  |||||    
T  22132389 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaat 22132487  T
Q  114 gagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatca 213  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22132488 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 22132587  T
Q  214 accctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacccc---------c 303  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||         |    
T  22132588 acccacaaaccctagtgtttgtt-cgaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccctctatctctc 22132686  T
Q  304 tctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  22132687 tctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 22132759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41997828 - 41997494
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactat-attatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaa 112  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||| | ||    
T  41997828 aatttgtttatccagttcggtccaaattaacctagtctgggg-agagagcggccctccgtttcactatgatgatgagtaactttacaaaagagatattaa 41997730  T
Q  113 tgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctacc-aaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaat 211  Q
     | |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  41997729 agggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaaatctc-aatcttttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaat 41997631  T
Q  212 caaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttgtttcaaccccctctatct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||| ||| ||||||||| |||||| |||||    
T  41997630 caaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgtttcctttctgaacacttgtttcagccccctttatct 41997531  T
Q  311 caaagcttactctgatacaaggtctatatttatagta 347  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41997530 caaggtttactctgatacaaagtctatatttatagta 41997494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 311
Target Start/End: Original strand, 22780358 - 22780668
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  22780358 agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa 22780457  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  22780458 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttc 22780556  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||||| |    
T  22780557 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagc 22780656  T
Q  300 cccctctatctc 311  Q
    ||||||||||||    
T  22780657 cccctctatctc 22780668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36380699 - 36380427
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||| | ||||||||| || ||    
T  36380699 gagaacacaaaagaatttgtttacccagttcgctccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactcagttccactataatgatgagtaactttaca 36380600  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  36380599 aaagatatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttccggtaaccaagatactcaatcctaatagtgttt 36380500  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgt 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36380499 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatggtttttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgt 36380427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 98 - 400
Target Start/End: Original strand, 52942540 - 52942831
Alignment:
Q  98 caaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgt 197  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||             ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  52942540 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa-------------cccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 52942626  T
Q  198 ttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttc 296  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  52942627 ttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 52942726  T
Q  297 aaccccctctatctcaaagcttactctg--atacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 394  Q
     | |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  52942727 -agcccctctatctcaaagtttagtctgatatacaaggtctatatttatagtgaaagtattacttaaaatttggaacaaatctgcaccaaaaaatatgtt 52942825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 311
Target Start/End: Original strand, 22782723 - 22783033
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  22782723 agaacacaaagatatttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa 22782822  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  22782823 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttc 22782921  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||||| |    
T  22782922 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagc 22783021  T
Q  300 cccctctatctc 311  Q
    ||||||||||||    
T  22783022 cccctctatctc 22783033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16455581 - 16455354
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | | ||||||| || |||||||||| |    
T  16455581 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactataatgacgagtaaccttacaaaagagatat 16455482  T
Q  110 caatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtga 209  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16455481 caatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 16455382  T
Q  210 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttc 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16455381 atcaaccatcaaaccctagtgtttgttc 16455354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 375
Target Start/End: Original strand, 47210756 - 47211106
Alignment:
Q  21 tgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttac 120  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||    
T  47210756 tgactcagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttac 47210855  T
Q  121 aagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctca 220  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||            | ||    
T  47210856 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa------------caca 47210943  T
Q  221 aaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctcta------tctcaa 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||      ||||||    
T  47210944 aaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccctctcaa 47211043  T
Q  314 agcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  47211044 agtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 47211106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 8756235 - 8756634
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaatt-gacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgc 98  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||| | ||||   |||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| | || |||||| || |    
T  8756235 gagaacacacaa-aatttgtttacccagttcgctccaaaaccgacctagtctggaggagagagcaaccatccgttccactataatgattagtaactttac 8756333  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccga-gtgactcaatcctaatagtgt 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  ||||   |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||    
T  8756334 aaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaagagactcaatcctagtagtgt 8756433  T
Q  198 ttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgttt- 295  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |||| | ||||||||| ||||||     
T  8756434 ttcccaaggtgaatcaacccc--aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaatcctaattttcttgttgac-ttctaaacccttgtttt 8756529  T
Q  296 caaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 395  Q
    || |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  8756530 cagccccttctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgtttataatttggaacaaatctgcaccgagaaatatgttt 8756629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 53405481 - 53405100
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||  || ||| |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  53405481 agaacaaaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagc--agctctctgttccactatatgatgagtatcgtttcaaa 53405384  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaag------tcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagt 195  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||      ||| |||| |||||||||| ||||   ||  ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||    
T  53405383 agagaaatcaatgggttacaagaataagaataagtctcccgcttaattctacctaaagtctcagcctctttccgtaaccaagagactcaatcttaatagt 53405284  T
Q  196 gtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtt 294  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  53405283 gtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaacctagt-tttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 53405185  T
Q  295 tcaacccc---ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||| ||||    ||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  53405184 tcagcccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 53405100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 350
Target Start/End: Original strand, 18409344 - 18409680
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaa 112  Q
    |||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| | |  || ||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||| ||||    
T  18409344 aatttgtttacccagttcaatccaaattgacctagtctgagggagagagcaactctctgtttcactataatgatgggtaac-ttacaaaagagatatcaa 18409442  T
Q  113 tgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatc 212  Q
    || |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| || || || ||||    
T  18409443 tgggttacaagaataaatctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcctataactaagagactcaatcctaatagtgttcccgaaggttaatc 18409542  T
Q  213 aaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | || |||||||||    
T  18409543 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagtgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc-agcctctctatctc 18409641  T
Q  312 aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |  | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18409642 attgtttacactgatacaaattctatatttatagtaaaa 18409680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 374
Target Start/End: Original strand, 18537470 - 18537829
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||  ||||||| | |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||    
T  18537470 aatttgtttacccagttcggtcaaaaaatgacctattatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 18537569  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaat 211  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18537570 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaat 18537669  T
Q  212 caaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttg-tttcaaccccctctatc 309  Q
    |||||  | |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||   ||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  18537670 caacc--ccaaccctagtggttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagtttgttgtttg--tttctaaacccttgttttcagccccctctatc 18537764  T
Q  310 tcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaa 374  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||    
T  18537765 tcaatgtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagcatcactcataaattggaacaaa 18537829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 22134615 - 22134909
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||  | |||||||| ||||||| |||| |||| ||||  |||||    
T  22134615 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaat 22134712  T
Q  114 gagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatca 213  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |  |||  || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22134713 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaatgtcccagccttttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 22134812  T
Q  214 accctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctc 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  22134813 acccacaaaccctagtgtttgtt-tgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc-agcccctctatctc 22134909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 122 - 350
Target Start/End: Original strand, 3937314 - 3937542
Alignment:
Q  122 agaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaa 221  Q
    |||| |||||| || |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| || |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3937314 agaataagtctcccacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaattccaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaa 3937413  T
Q  222 accctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttac 320  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | ||||    
T  3937414 accctagtgtttgttcccaagaaacaaactctatacaaactctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctctatctcaaggtttac 3937513  T
Q  321 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3937514 tctgata-aaagtctatatttatagtaaaa 3937542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4215655 - 4215483
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  4215655 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaa 4215556  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaac 173  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||    
T  4215555 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcacaacctcttcccgtaac 4215483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13547503 - 13547302
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||| || |||    
T  13547503 gagaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaactttacaa 13547404  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13547403 aagatatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 13547304  T
Q  201 cc 202  Q
    ||    
T  13547303 cc 13547302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27499391 - 27499128
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||| |||| | ||||||||| || ||    
T  27499391 gagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggggaa-agagcagcccttcgtttcaatataatgatgagtaaccttaca 27499293  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| | |    ||||||| || |||||| |||||||||| |||| |||||  |||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  27499292 aaagagatattag---gttacaaaaataagtctcccgcctaattatacccaaagcctcaatctcttatcgtaaccaatagactcaatcctaatagtgttt 27499196  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagt 267  Q
    | ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27499195 ctcaggatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagt 27499128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 134 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6133088 - 6132872
Alignment:
Q  134 ccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 233  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6133088 ccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccagggtgactcaaccctcaaaccctagtgttt 6132989  T
Q  234 gttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaaccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggt 333  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||| |  |||| || |||||||||||| | |||| | ||||||| ||    
T  6132988 gttgccaatagacaaactctatacaagccctagttttgttgttgcctttctgaacccttgttcagcctcctctatctcaatgtttacaccgatacaatgt 6132889  T
Q  334 ctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||||||||||    
T  6132888 ctatatttatagtaaaa 6132872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2891641 - 2891437
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  2891641 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaagttgtactagtctgggggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaaccttaca 2891542  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2891541 aaagagatatcaatgggttacaagaacaagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2891442  T
Q  200 cccaa 204  Q
    |||||    
T  2891441 cccaa 2891437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 350
Target Start/End: Original strand, 18534828 - 18535163
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata-ttatgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||| |||||||||   || |||||||||| |||    
T  18534828 aatttgtttaccctgttcggtccaaaacttacctagtctgggggggagagcacccctccgttccactataattatgagtagttttacaaaagagatatca 18534927  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaat 211  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18534928 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaat 18535027  T
Q  212 caaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttg-tttcaaccccctctatc 309  Q
    |||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||   || ||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  18535028 caacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagtttgttgtttg--tttttaaacacttgttttcagccccctctatc 18535122  T
Q  310 tcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||| | |||||||||  | |||||||||||||| ||||||    
T  18535123 tcaaggtttactctgaatcgaggtctatatttattgtaaaa 18535163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30136899 - 30136640
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||| || ||    
T  30136899 gagaacacaaaagaatttgtttatccaattcggtccaaattgacctagtattgaggagagagcagccatctgtttcactataatgatgattaactttaca 30136800  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||| ||| ||| || ||| ||||| || ||||||||    
T  30136799 aaagagatatcgatgagtcacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcacaatttcttctcgtgaccaagagacccaatcatagtagtgttt 30136700  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacc 262  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  30136699 cccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-taaactctatacaaacc 30136640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 38890221 - 38890476
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||| |||||||||| |||| || ||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||    
T  38890221 aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctaatcttggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 38890320  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaat 211  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||| ||||   |||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38890321 atgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatatgaat 38890420  T
Q  212 caaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttt 270  Q
    |||||  | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38890421 caacc--ccaaccctaatgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagtttt 38890476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Original strand, 5635461 - 5635612
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  5635461 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 5635560  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaag 153  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5635561 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 5635612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 189 - 350
Target Start/End: Original strand, 24446756 - 24446913
Alignment:
Q  189 taatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa- 287  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| |||||||     
T  24446756 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaaccctagtt-----gttgcctttctaaac 24446850  T
Q  288 ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24446851 ccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 24446913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 189 - 350
Target Start/End: Original strand, 38270158 - 38270320
Alignment:
Q  189 taatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa- 287  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  38270158 taatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaaagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaac 38270257  T
Q  288 ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||| || | |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38270258 ccttgtttcagcctcttctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 38270320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 214 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5101133 - 5100974
Alignment:
Q  214 accctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  5101133 accctcaaaccctagtgtttgttccaaagtgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacctttgtttcagtcccctctatctca 5101034  T
Q  313 aagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    | | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  5101033 aggtttaccctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 5100974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28454020 - 28453658
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||    
T  28454020 aatttgtttacccagttcggtccaatactaacctagtctgggggagagagtagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 28453921  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaat 211  Q
    |    |||||||||  |||||||  |||||||||||| || |  | ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  28453920 aaagtttacaagaattagtcttcaacctaattctacccaaggtccaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaat 28453821  T
Q  212 caaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatct 310  Q
    ||| |  | ||||||||||||| || ||||||| |||||||  | ||||||||||||||   |||| | ||||||| ||||||||  |  | ||||| ||    
T  28453820 caatc--ccaaccctagtgtttcttgccaagag-caaactc--tgcaaaccctagttttagtgttggc-ttctaaacccttgttttcagactctctacct 28453727  T
Q  311 caaagcttac-tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaa-atttggaacaaatct 377  Q
    ||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||    
T  28453726 caaggttcacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatccctcaaataattggaacaaatct 28453658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 377
Target Start/End: Original strand, 15032572 - 15032898
Alignment:
Q  41 tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcct 139  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||  | |||| |||| || | ||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||| || ||| ||||||    
T  15032572 tgacctagtttgggggagagagcagctcttcgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcct 15032671  T
Q  140 aattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccc 239  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||| |||  || || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||          |||||| |     
T  15032672 aattctaccaaaagtccaaatcttttctcgtgtccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaatatgaatcaa-cctca----------tttgttgca 15032760  T
Q  240 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctata 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| |||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| ||| | |||||||    
T  15032761 aagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaggtttactctggtaccaagtctata 15032858  T
Q  339 tttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaatct 377  Q
    |||||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||    
T  15032859 tttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatct 15032898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11437710 - 11437560
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  11437710 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aa 11437612  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaag 153  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11437611 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 11437560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 5101277 - 5101131
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||| ||||||||  || |||    
T  5101277 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagatagcagccctccgttttactatatgatgagtaaatttacaa 5101179  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctacc 148  Q
    |||| || |||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||||||    
T  5101178 aagacatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaagtctacc 5101131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12102425 - 12102221
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||    
T  12102425 aatttgtttacctagttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 12102326  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 210  Q
     || |||||||||| |||||| |   |||||||||||| |||| |||||||| ||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12102325 gtgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagttccaatcttttcccatgaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 12102226  T
Q  211 tcaac 215  Q
    |||||    
T  12102225 tcaac 12102221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 377
Target Start/End: Original strand, 40999018 - 40999308
Alignment:
Q  85 atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc 183  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||| | ||||||| | | ||||| |   |||||||||||| ||||   | |||||||||||| ||| || |||||    
T  40999018 atgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaaaacacagtctccaaacctaattctacccaaagtctcgatctcttcccgtgaccaagagactc 40999117  T
Q  184 aatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattc 283  Q
    |||||||||| ||||| || | ||||||||| | |||| || |||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||| | | |    
T  40999118 aatcctaataatgttttcctaggtgaatcaatc-tcaatcc-tagtgtttgttgtcaagag-caaactctatacaacccctagttttcttgttgacgt-c 40999213  T
Q  284 taaacc-ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatct 377  Q
    |||||| ||||||  |  | ||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40999214 taaacccttgttttcagactctctacctcaaggtttactctgatataaggtttatatttatagtaaaaataacccttaaaatttggaacaaatct 40999308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 233 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2891434 - 2891315
Alignment:
Q  233 tgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctga-tacaa 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| || | |||| |||| |||||    
T  2891434 tgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatcttaaggtttacactgattacaa 2891335  T
Q  331 ggtctatatttatagtaaaa 350  Q
     |||||||||||||||||||    
T  2891334 tgtctatatttatagtaaaa 2891315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 47563110 - 47563009
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| || |||    
T  47563110 gagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcaaggggagagagcagccctccgtttcactataagatgagtaaccttacaa 47563011  T
Q  101 aa 102  Q
    ||    
T  47563010 aa 47563009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 49088911 - 49088794
Alignment:
Q  10 aaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctg-ggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaag-agat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||| |||| |||| || |||||| ||||    
T  49088911 aaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctggggggagagagtagttctctgtttcactatatgatgactaacattacaaaagaagat 49088812  T
Q  108 gtcaatgagttacaagaa 125  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49088811 gtcaatgagttacaagaa 49088794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Original strand, 16185831 - 16186018
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| | ||||||||| || |||| || || |||    
T  16185831 aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gatatatca 16185929  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    | | ||| |||||| ||||||||   |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||    
T  16185930 aagggttgcaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16186018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25357992 - 25357772
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactat-attatgagtaacgttgc 98  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| ||| ||| | ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  ||||| || ||||||||| || |    
T  25357992 gagaacacacaaaaatttgtttacccagttaggtccaatactgacctagtctaggggagagagcagctatccgttctactataatgatgagtaactttac 25357893  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttc-cgcctaattc----taccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaata 193  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||   | ||||||    || | ||||  ||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||    
T  25357892 aaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacttaattctatatatccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaata 25357793  T
Q  194 gtgtttcccaatgtgaatcaa 214  Q
    || |||||||| |||||||||    
T  25357792 gtatttcccaaggtgaatcaa 25357772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 6133186 - 6133105
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||    
T  6133186 gagaacacaaaagaatttgttgacccaattcgatccaaattgacctagtctgggtgagagagcagtcatccgttccactata 6133105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 14789422 - 14789495
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggg--gagagagtagccatccgtttcactata 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14789422 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata 14789495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10113080 - 10112876
Alignment:
Q  138 ctaattctaccaaaagctccaatctcttccc-gtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 236  Q
    ||||||||||| ||||  | ||||||||||| || ||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  10113080 ctaattctacccaaagtcctaatctcttccccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgtt 10112983  T
Q  237 cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttg-tttcaaccccctctatctcaaagcttac-tctgatacaaggt 333  Q
     ||||||| |||||||  ||||||||||||||||   |||| | ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| | | |||| |||||||||| ||    
T  10112982 gccaagag-caaactc--tacaaaccctagtttttgtgttggc-ttctaaacccttgttttcaactccctctctctcgaggtttacatctgatacaatgt 10112887  T
Q  334 ctatatttata 344  Q
    |||||||||||    
T  10112886 ctatatttata 10112876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 52942472 - 52942527
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggggg 56  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52942472 gagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggg 52942527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 200
Target Start/End: Original strand, 3982200 - 3982362
Alignment:
Q  41 tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcct 139  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||   ||    
T  3982200 tgacctagtatgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagtgttacaagaatcagtcttcaaact 3982299  T
Q  140 -aattctaccaaaagctccaa-tctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  3982300 taattctacccaaagtcccaaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaatagtgtttc 3982362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9864049 - 9863791
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctggggg--agagagtagccatccgtttcactatatt----atgagtaacgttgcaaaagaga 106  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | |||| |||||||||||  |||||| |||  |||||| ||||||| |    ||||||||| || |||| ||||    
T  9864049 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacttagtctgggggggagagagcagctctccgttccactataatgatgatgagtaactttacaaa-gaga 9863951  T
Q  107 tgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcct-aattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaat 205  Q
    | ||||   ||||||||||  |||||||   || ||||||||| ||||   |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||     
T  9863950 tatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacttaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaaagactcaatcctaatagggtttcccaag 9863851  T
Q  206 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttt 270  Q
    ||||||||| |  | |||| ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  9863850 gtgaatcaaac--ccaaccttagtgtttgttgccaaga-acaaactc--tacaaaccctagtttt 9863791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 47150877 - 47151145
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgc 98  Q
    |||||||||| | |||| ||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |  | | ||| ||| ||||||| | ||||| ||| ||      
T  47150877 gagaacacaaga-aattagtttacccaattcggtccaatattgacctagtctaggggagataacatctatctgttccactataatgatgagcaactttag 47150975  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgt 197  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||    ||||||||||  || ||| || ||||||||||||| |||||    
T  47150976 aaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaattctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaacagtgt 47151075  T
Q  198 ttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgt 272  Q
    ||||||| |||||||||   |  |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
T  47151076 ttcccaaggtgaatcaa--tttcaaccctagtgttggttaccaagag-caaactctat--aaaccttagttttgt 47151145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 215
Target Start/End: Original strand, 31983564 - 31983727
Alignment:
Q  54 gggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaa 151  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||  || ||||| |||| |||| | ||||||| || ||||||||   |||||||||||| ||    
T  31983564 gggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaaaagatatcaaagggttacaaaaataagtcttcaaacctaattctacccaa 31983663  T
Q  152 agctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaac 215  Q
    ||   |||||||||||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31983664 agtctcaatctcttcccatgaccaagagacttaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 31983727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 3937258 - 3937316
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggaga 59  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  3937258 gagaacacaaatgaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtctgagggaga 3937316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 24446638 - 24446738
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||             ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  24446638 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-------------gggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatgttacaa 24446724  T
Q  101 aagagatgtcaatg 114  Q
    ||||||| ||||||    
T  24446725 aagagatatcaatg 24446738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25357683 - 25357593
Alignment:
Q  303 ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcact--taaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacg 392  Q
    |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25357683 ctctctctcaaggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcgtaaaa-ttggaacaaatctgagcccaaaaatacg 25357593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10114520 - 10114412
Alignment:
Q  157 caatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctata 256  Q
    |||||||||  ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||    
T  10114520 caatctcttatcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaagtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-cagactc--ta 10114426  T
Q  257 caaaccctagtttt 270  Q
    ||||||||||||||    
T  10114425 caaaccctagtttt 10114412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 377
Target Start/End: Original strand, 16186120 - 16186199
Alignment:
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcact--taaaatttggaacaaatct 377  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  16186120 ccccctctctctcaaggtttactctgatacaaggtttatatttatagtaaaagtatccctcctaaaa-ttggaacaaatct 16186199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 377
Target Start/End: Original strand, 52043735 - 52043791
Alignment:
Q  321 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||    
T  52043735 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagcatccctaaaaaattggaacaaatct 52043791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12102140 - 12102061
Alignment:
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa-atatcacttaaaatttggaacaaatct 377  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||    
T  12102140 ccccctctatctcaaggttttatctgatacaagatctatatttatagtaaaagaaatccctaaaaaattggaacaaatct 12102061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 3824594 - 3824627
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggt 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824594 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggt 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 375
Target Start/End: Original strand, 22134937 - 22134990
Alignment:
Q  323 tgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  22134937 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 22134990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 4556054 - 4556126
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata 82  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  4556054 aagaatttgtttacccagttcggtttaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 4556126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 12739550 - 12739594
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  12739550 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 12739594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 26175636 - 26175680
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  26175636 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 26175680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 36463389 - 36463433
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  36463389 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 36463433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 48893638 - 48893682
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  48893638 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 48893682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 325 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26557614 - 26557563
Alignment:
Q  325 atacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatc 376  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  26557614 atacaaggtttatatttatagtaaaattatccctcaaaaattggaacaaatc 26557563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 4885062 - 4884990
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaat--tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  4885062 aagaatttgtttacccagttcggt-ctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 4884990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 8529455 - 8529383
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaat--tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  8529455 aagaatttgtttacccagttcggt-ctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 8529383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 10047383 - 10047433
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagcc 67  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10047383 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 10047433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 39245998 - 39246048
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagcc 67  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39245998 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 39246048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 54906839 - 54906737
Alignment:
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaag-ctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgt 197  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||  |||||||   |||||||||||| |||| ||  |||||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||    
T  54906839 aaagagatatcaaagagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacctaaagtcttgaatctcttccagtgaccaagagactcaattctaatagtgt 54906740  T
Q  198 ttc 200  Q
    |||    
T  54906739 ttc 54906737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 55
Target Start/End: Original strand, 4874469 - 4874518
Alignment:
Q  7 acaaaagaatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggg 55  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  4874469 acaaaagaatttgtttacccagttcagttcaatattgacctactctgggg 4874518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 16623386 - 16623341
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  16623386 ttgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagag 16623341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 4569980 - 4569924
Alignment:
Q  321 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatct 377  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||    
T  4569980 tctgatacaaggcttatatttatagtgaaagtaacccttaaaatatggaacaaatct 4569924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 5429847 - 5429803
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||    
T  5429847 ttgttgacccagttcggtccaacttaacctaatctgggggagaga 5429803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 5871988 - 5871944
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||    
T  5871988 ttgttgacccagttcggtcaaacttgacctaatctgggggagaga 5871944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 9927458 - 9927502
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  9927458 ttgttgactcagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 9927502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 12743925 - 12743969
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  12743925 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 12743969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 12745314 - 12745358
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  12745314 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 12745358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 16638712 - 16638652
Alignment:
Q  321 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcac 381  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| || | || | |||||||||||||||||| ||||||    
T  16638712 tctgatacaaggtttatatttttagaaagagtaacccttaaaatttggaacaaacctgcac 16638652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 27416965 - 27417009
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  27416965 ttgttgactcagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 27417009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 36315321 - 36315277
Alignment:
Q  18 tgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  36315321 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 36315277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 36329530 - 36329486
Alignment:
Q  18 tgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  36329530 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 36329486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36380417 - 36380373
Alignment:
Q  306 tatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36380417 tatctcaaggtttactctgatacaaagtccatatttatagtaaaa 36380373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 46147391 - 46147435
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  46147391 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 46147435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 47038411 - 47038455
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||    
T  47038411 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttactctgggggagaga 47038455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 52467354 - 52467398
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||    
T  52467354 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctcggggagaga 52467398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 126)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 10399815 - 10400214
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  10399815 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 10399914  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10399915 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 10400014  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  10400015 caaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcc 10400114  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400115 ccctctatctcccagtttgctctgatacaaggtctatatttatagaaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 10400214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 51750333 - 51749934
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  51750333 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 51750234  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  51750233 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 51750134  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  51750133 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 51750034  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51750033 ccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 51749934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 28207054 - 28207452
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   |||||||||||| |||    
T  28207054 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatg--atgagtaacgttacaa 28207151  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||   ||||| |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  28207152 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcgtaattatattcaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagacacaatcctaatagtgtttc 28207251  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| |    
T  28207252 ccaaggtgaataaactctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttacacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagc 28207351  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgt 399  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28207352 cccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaaaacgtttatgt 28207451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 41647215 - 41646815
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  41647215 gagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgatggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 41647116  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41647115 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttc 41647016  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| |    
T  41647015 ccaaggtgaatcaaccataaaaaccaagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagc 41646916  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgt 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  41646915 cccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcatccaaaaatatgtttctgt 41646816  T
Q  400 t 400  Q
    |    
T  41646815 t 41646815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 14097955 - 14098355
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttg-ca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  14097955 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgtgggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgtttaca 14098054  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14098055 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 14098154  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaa 298  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||     
T  14098155 tccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgcctttttaaaccattgtttcag 14098254  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 398  Q
     |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14098255 tcccctctatctcaaagtttagtttgatacaaggtctatatttatagtgaaagtattacttaaaatttggaac-aatctgcacccaaaaatacgtttatg 14098353  T
Q  399 tt 400  Q
    ||    
T  14098354 tt 14098355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13215375 - 13214976
Alignment:
Q  7 acaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagag 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||  || ||||||||    
T  13215375 acaaaagaatttgttgacgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaaatttacaaaagag 13215276  T
Q  106 a----tgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |    | |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  13215275 aaaaatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 13215176  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  13215175 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 13215076  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13215075 ccctctatctcaaaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttttgtt 13214976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 6823306 - 6822919
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  6823306 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaag 6823207  T
Q  104 agatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttccca 203  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  6823206 agaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtatttccca 6823107  T
Q  204 atgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacccc 302  Q
    | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  6823106 aggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 6823008  T
Q  303 ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatac 391  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823007 ctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatataaatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatac 6822919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Original strand, 38925467 - 38925855
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||   |||||||||||| |||    
T  38925467 gagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgttttactatg--atgagtaacgttacaa 38925563  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  38925564 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 38925663  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||| |    
T  38925664 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctgaactcttgtttcagc 38925763  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatac 391  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38925764 cccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaataaatctgcacccaaaaatac 38925855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 39462814 - 39462413
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||| || |||    
T  39462814 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgatgaataacttttcaa 39462715  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||| | |||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39462714 aagagatatcaaagggttacaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 39462615  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| |||||||| |    
T  39462614 ccaaggtgaatcaaccctaaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcatttctaaacctttgtttcagc 39462515  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcaccc-aaaaatacgtttatg 398  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  39462514 cttctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtattacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaaatacgtttctg 39462415  T
Q  399 tt 400  Q
    ||    
T  39462414 tt 39462413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 28998239 - 28998611
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || || ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28998239 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccatatgatgagtaacgttgcaa 28998338  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28998339 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 28998438  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |    
T  28998439 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagc 28998538  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  28998539 ctcctctatctcaaagtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 28998611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 29003955 - 29004327
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || || ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29003955 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccatatgatgagtaacgttgcaa 29004054  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  29004055 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 29004154  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |    
T  29004155 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagc 29004254  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  29004255 ctcctctatctcaaagtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 29004327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15823841 - 15823441
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  15823841 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaa 15823742  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
     |||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  15823741 tagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatattaatagtgtttc 15823642  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  15823641 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 15823542  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgt 399  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  15823541 cccctttatctctaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcatccaaaaatatgtttctgt 15823442  T
Q  400 t 400  Q
    |    
T  15823441 t 15823441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 19 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 47451919 - 47451543
Alignment:
Q  19 gttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagtt 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47451919 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcattcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagtt 47451820  T
Q  119 acaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccct 218  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||         | ||||||||||||||||    
T  47451819 acaagaaaaagtttcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaaaca------ctaatgtgaatcaaccct 47451726  T
Q  219 caaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctcaaagct 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| |    
T  47451725 caaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattccaaacccttgtttaagccccctctatctcaaagtt 47451626  T
Q  318 tactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  47451625 tactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaatatttggaacaaatctgcaccaaaaaatacgtttctgtt 47451543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28840973 - 28840573
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  28840973 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 28840874  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28840873 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 28840775  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||| ||    
T  28840774 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtttcctttctaaacccttgtttcatcc 28840675  T
Q  301 ccctcta--tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 398  Q
    |||| ||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  28840674 ccctgtatctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctg 28840575  T
Q  399 tt 400  Q
    ||    
T  28840574 tt 28840573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 6995686 - 6996058
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  6995686 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttataa 6995785  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  6995786 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtatcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttc 6995885  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |    
T  6995886 ccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccgttgtttcggc 6995985  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  6995986 cccctctatctcaagatttactctgattcaaggtctatatttataataaaagtataactcataaatttggaac 6996058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 17324622 - 17324994
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  17324622 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 17324721  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17324722 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 17324821  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |    
T  17324822 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccatagagacaaactctatacaaaccccagttttgttgttgccattctaaacccttgttttagc 17324921  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    ||||| |||||  | | |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  17324922 cccctgtatcttcaggtttactctggttcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 17324994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 20302752 - 20302354
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||| | ||||||| |||| ||||    
T  20302752 agaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagtagtcctccgatccactatctgatgagtatcgttacaaa 20302653  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20302652 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 20302554  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  20302553 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 20302454  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  20302453 ccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttataataaaagtttcacttaaaatttggaacaaatatgcacccaaaaatatgtttctgtt 20302354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 12302491 - 12302846
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  12302491 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 12302590  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12302591 aagagatgtcaatgagttataagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 12302690  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||| |    
T  12302691 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagc 12302790  T
Q  300 cccctctatctc----aaagcttac-tctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||    || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302791 cccctctatctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 12302846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13762130 - 13761732
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  13762130 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagaagccctccggtccactatatgatgagtaacgttacaaa 13762031  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  13762030 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagactcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttc 13761932  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  13761931 caagttgaatcaacccccaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttatgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 13761832  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    | ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13761831 ctctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 13761732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47906565 - 47906183
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  47906565 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccaagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaa 47906466  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  47906465 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 47906366  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
     ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  47906365 tcaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagc 47906266  T
Q  300 cccctcta------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||||||||      |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  47906265 cccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 47906183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28842788 - 28842388
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  28842788 agaacacaatagaatttgttgacctagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagattagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 28842689  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  28842688 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttcc 28842590  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  28842589 caatgtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 28842490  T
Q  301 ccctcta--tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 398  Q
    |||||||  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  28842489 ccctctatctctcaaagtttgctctgatacaaggtttatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatttgcactcaaaaatatgtttctg 28842390  T
Q  399 tt 400  Q
    ||    
T  28842389 tt 28842388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 50307531 - 50307883
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaa-gaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  50307531 gagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttaca 50307630  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  50307631 aaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 50307730  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttca 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||    
T  50307731 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttttttca 50307830  T
Q  298 accccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
     |||| | |||||||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  50307831 gccccatatatctcaaggtttactttgatacaaagcttatatttatagtaaaa 50307883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 398
Target Start/End: Original strand, 3579606 - 3580002
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||    
T  3579606 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcaatcatccgtttcacta-atgatgagtaactttacaaaag 3579704  T
Q  104 agatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttccca 203  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| | || |||||||||||||| |||||||| |    
T  3579705 agatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctctttccgtaatcaagagactcaatcctaattgtgtttccta 3579804  T
Q  204 atgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattct-aaaccttgtttca--acc 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| || ||||||||||   ||    
T  3579805 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgctgcctttctgaacccttgtttcagcccc 3579904  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 398  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  3579905 ccctctatctcaaattttacgctgatacaaggtctatatttaaagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatttgcactctaaaatacgtttatg 3580002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 2949218 - 2949589
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  2949218 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc-gggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 2949316  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  2949317 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctattctcgtaaacaagagactcaatcctaatagtgtttc 2949416  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |    
T  2949417 ccaaggtgaatcaaccatcaacccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagc 2949516  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    |||||||||||||| | || ||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  2949517 cccctctatctcaaggttttctcggattcaatatctatatttattgtaaaagtataactcataaatttggaac 2949589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 51752657 - 51752260
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||  |||||| |||| ||||    
T  51752657 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatggtgagtatcgttacaaa 51752558  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||     
T  51752557 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatc-taatagtgtttca 51752460  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| || |||||||| ||||||||| ||    
T  51752459 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaagccctaattttgttgttacctttctaaactcttgtttcagcc 51752360  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752359 ccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 51752260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 11457461 - 11457811
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  11457461 gagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagacatccgtttcactatatgatgagtaactttacaa 11457560  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  11457561 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaacccccaatctcttcgcgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 11457660  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| |    
T  11457661 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtaattgttgccaagaatcaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccattgtttcagc 11457760  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11457761 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 11457811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18307404 - 18307051
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  18307404 gagaacacaaaagaatttgttgactccgttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttaca 18307306  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| || ||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18307305 aaagagatatcaatgcgtcacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 18307206  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  18307205 cccgaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 18307106  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaata 353  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18307105 ccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaaata 18307051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 9241071 - 9241467
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||| || ||    
T  9241071 gagaacaaaaaagaatttgtttccccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttaca 9241170  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  9241171 aaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaataatgttt 9241270  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaaccttgtttca-a 298  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||      
T  9241271 tccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccttgtttcagc 9241370  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 395  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| | ||||||||||||||||| || | |  | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9241371 ccccctctatcttaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaagtaacccccataaaattggaacaaatctg-acccaaaaatacgttt 9241467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Original strand, 2510312 - 2510690
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||     
T  2510312 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaactttacaag 2510411  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  2510412 agagaaatcaatgggttacaagaataagtct-ctgcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcc 2510510  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||| ||    
T  2510511 aaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtggttgcctttataaacccttgtttcagcc 2510610  T
Q  301 ccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  2510611 ccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 2510690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 25251260 - 25251612
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | || || ||||||||||| | || |||||| || ||    
T  25251260 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtattggggagagagcaaccctctgtttcactataatgataagtaaccttaca 25251359  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25251360 aaagatatatcaatgggttacaagaataagttttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgttt 25251459  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaa 298  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||     
T  25251460 cctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaacgttatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacctttgtttcag 25251559  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaa 351  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25251560 ccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaaa 25251612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24325954 - 24325575
Alignment:
Q  5 acacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  24325954 acacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacttagtctgggggagagagcagccattcgattcactatatgatgagtaacattacaaaaga 24325855  T
Q  105 gatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaa 204  Q
    ||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24325854 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaa 24325755  T
Q  205 tgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaaccttgtttcaaccccct 304  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  24325754 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaacccttgtttcagccccct 24325655  T
Q  305 cta--------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||        |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  24325654 ctatctctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 24325575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Original strand, 31735508 - 31735887
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  31735508 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa 31735607  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||    
T  31735608 agagaaatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaaccttaatagtgtttcc 31735707  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| | ||    
T  31735708 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagcc 31735807  T
Q  301 ccctctatctca----aagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||||||||||||    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  31735808 ccctctatctcattcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 31735887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 50076658 - 50077008
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| ||||||| | ||||||||| || ||    
T  50076658 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgggg-agagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttaca 50076756  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  50076757 aaagagatatcaatggattacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 50076856  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||     
T  50076857 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaatccttgtttcag 50076956  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||  |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50076957 ccctttctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 50077008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16428949 - 16428569
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||| || ||    
T  16428949 gagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactaaaatgatgagtaaccttaca 16428850  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16428849 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16428750  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  16428749 tccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 16428650  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaatctg 378  Q
    |||||||||||| |  | || |||||||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||| ||| || |||||||||||    
T  16428649 ccccctctatctaatggtttgctctgatataaaacctatatttatagtaaaagtatcccttataaaattcgaacaaatctg 16428569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 2617808 - 2617465
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaag 103  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2617808 aacacaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaag 2617709  T
Q  104 agatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttccca 203  Q
    |||  |||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  2617708 agaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 2617609  T
Q  204 atgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacccc 302  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| || |    
T  2617608 aggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcctc 2617509  T
Q  303 ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  2617508 ctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 2617465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 311
Target Start/End: Original strand, 15294821 - 15295131
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15294821 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaa 15294920  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| || ||| || |||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15294921 agagaaatcaatgggttacaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 15295020  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  15295021 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 15295120  T
Q  301 ccctctatctc 311  Q
    | |||||||||    
T  15295121 ctctctatctc 15295131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31490207 - 31489860
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||| || |||    
T  31490207 gagaacacaaaagaatttgttgatctagttcagtccaaattgacctagtctggggg-gagagcagccctccgtttcaccatatgatgaataaccttacaa 31490109  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  31490108 aagagatatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagaaattcaatcctaatagtgtttc 31490009  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||    
T  31490008 ccaaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaa--ctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcaac 31489911  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||||||| | |||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  31489910 cccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaa 31489860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 39932368 - 39931994
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggggga-gagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |||| |||    
T  39932368 agaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtatgggggaagagagcagccctccgttccactatatgatgagtatcgttacaa 39932269  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||   || ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  39932268 aagagaaatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagtctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttc 39932169  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  39932168 ccaaggttaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 39932069  T
Q  300 cccctcta--tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    ||||||||  |||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  39932068 cccctctatctctcaaagttttgtctcatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaac 39931994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 50078806 - 50079157
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || ||    
T  50078806 gagaacacaaaagaatttgtttaccaaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgttccactataatgatgaataactttaca 50078905  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  50078906 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgttt 50079005  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | ||||||| ||||||||||     
T  50079006 tccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatgcaaaccctagttttgttgctgtctttctaaacccttgtttcag 50079105  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||| | |||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  50079106 ccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaa 50079157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 50248556 - 50248908
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtag--ccatccgtttcactatattatgagtaacgttgc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| |||||||||||| ||||||||| || |    
T  50248556 gagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggaccaaattgacctagtctaggggagagagaacaaccatctgtttcactatatgatgagtaaccttac 50248655  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||   | ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  50248656 aaaagagatgtcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcgatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 50248755  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||| | || |||||| ||||||||    
T  50248756 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatataaatcatagttttgttgttgtctttttaaacctttgtttca 50248855  T
Q  298 accccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
     | ||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50248856 gctccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 50248908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 17186113 - 17186464
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| || |||| | ||||||||| || ||    
T  17186113 gagaacacaaaagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactccgttccattataatgatgagtaactttaca 17186212  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  17186213 aaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagttcaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgttt 17186312  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||     
T  17186313 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcag 17186412  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  17186413 ccccctctatctcaaggtttgctctgatacaaaatctatatttatattaaaa 17186464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25128168 - 25127856
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||||||| || ||    
T  25128168 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcctaattgacctagtatgggagagagagcagccctccgtttcaatataatgatgagtaaccttaca 25128069  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  25128068 aaagagatatcaatgaattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccaaatagtgttt 25127969  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  25127968 cacaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagacacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 25127869  T
Q  299 ccccctctatctc 311  Q
     ||||||||||||    
T  25127868 gcccctctatctc 25127856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18839883 - 18839532
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  18839883 gagaacacgaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaaccttaca 18839784  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   || ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18839783 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcattctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 18839684  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||     
T  18839683 cccaaggtgaatcaaccctaaaaccctactgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctatctaaacccttgtttcag 18839584  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||  | ||||  | |||||| |||||||||||||||||||    
T  18839583 ccccctctatctcatggtttacaataatacaatgtctatatttatagtaaaa 18839532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 27336926 - 27337304
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||    
T  27336926 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa 27337025  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    | ||||  |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||   ||  |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  27337026 a-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagacccaatcctaatagtgtttc 27337124  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |    
T  27337125 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaa-tctataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 27337223  T
Q  300 cccctctatctc----aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||||||||||||    |||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||    
T  27337224 cccctctatctctctcaaagtttagcctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtataacgcataaatttggaacaaat 27337304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16226461 - 16226085
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  16226461 agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 16226362  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  16226361 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 16226263  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| |      
T  16226262 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttttaga 16226163  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatct 377  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| || |||||||||    
T  16226162 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatct 16226085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17319182 - 17318814
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||| |  ||    
T  17319182 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggg-agagagcagccctccgttttactataatgatgagtaacttaaca 17319084  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||      |||||    
T  17319083 aaagagatatcaataagttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctgttcccgtaaccaagagactcaatcc------tgttt 17318990  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  17318989 cccaaggtgaatcaaccttccaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctaaacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 17318890  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaa 374  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||| || | || ||||||||||    
T  17318889 ccccctctatctcaaggtttactatgatacaaaacctatatttatagtaaaaaaatccctcataaattggaacaaa 17318814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20291750 - 20291402
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | || |||| | |||||||| ||||| | |||| ||||    
T  20291750 agaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtgtgggggagagaacaaccctccgatccactatatgatgagaatcgttacaaa 20291651  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20291650 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 20291552  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |     
T  20291551 caaggtgaatcaaccctcaaaacttagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatct 20291452  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20291451 ccctctatctcaaaatttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaa 20291402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 27339117 - 27339496
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||    
T  27339117 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagatcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa 27339216  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    | ||||  |||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||  || ||||||||| ||||||| ||||    
T  27339217 a-gagaaatcaatgggttacaagaataagtcgcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaactaagagactcaatcgtaatagtatttc 27339315  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| || |||||||| |    
T  27339316 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcctttctaagcccttgtttcagc 27339415  T
Q  300 cccctctatctc----aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||||||||||||    |||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  27339416 cccctctatctctctcaaagtttagcctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 27339496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 98 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 6824090 - 6823779
Alignment:
Q  98 caaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccg-------agtgactcaatccta 190  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||        || || |||||| ||    
T  6824090 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctgccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaacccgtaaccaagagattcaatcgta 6823991  T
Q  191 atagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-cc 289  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  6823990 atagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 6823891  T
Q  290 ttgtttca-accccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaa 388  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823890 ttgtttcagcccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatataaatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaa 6823791  T
Q  389 tacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||||    
T  6823790 tacgtttatgtt 6823779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 31425001 - 31425335
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  31425001 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggg-agagagcagccttccgtttcactataatgatgagtaaccttaca 31425099  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgag---tgactcaatcctaatagtg 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| ||   | |||||||||||||||||    
T  31425100 aaagagatatcaatgagttacaagaataagcctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagatcactcaatcctaatagtg 31425199  T
Q  197 tttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtt 294  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  31425200 ttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagatacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 31425299  T
Q  295 tcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaa 330  Q
    ||| |||||| |||||||| | ||||  ||||||||    
T  31425300 tcagccccctttatctcaaggtttacattgatacaa 31425335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Original strand, 9463231 - 9463612
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  9463231 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa 9463330  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  9463331 -gagaaatcaatgggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttc 9463429  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  9463430 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttttctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 9463529  T
Q  300 cccctcta------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||||||||      |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  9463530 cccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 9463612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6756823 - 6756472
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggggg-agagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||| | ||||||||| || |    
T  6756823 gagaacagaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaactgacctagtctggggggagagagcagtcttccgtttcactataatgatgagtaactttac 6756724  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||    
T  6756723 aaaagagatatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatcaag--actcaatcctaatagtgtt 6756626  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaa-accttgtttc 296  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||    
T  6756625 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcccttgtttc 6756526  T
Q  297 aaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |  ||||||||| |||| | |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6756525 agtcccctctatttcaaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagcaaaa 6756472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 303
Target Start/End: Original strand, 46431693 - 46431996
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggggg--agagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| |||| ||    
T  46431693 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttaca 46431792  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    || ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  46431793 aa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccatcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 46431891  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  46431892 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctacttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 46431991  T
Q  299 ccccc 303  Q
    |||||    
T  46431992 ccccc 46431996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 4131361 - 4131676
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||| || ||    
T  4131361 gagaacacaaaagaatttgttgacatagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttaca 4131460  T
Q  100 aaagaga----tgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagt 195  Q
    |||||||    | |||||| |||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  4131461 aaagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtttctcgcctaattctacccaaag-tccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagt 4131559  T
Q  196 gtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtt 294  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4131560 gtttcccaaggtaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaatccttgtt 4131659  T
Q  295 tcaaccccctctatctc 311  Q
    ||| |||||||||||||    
T  4131660 tcagccccctctatctc 4131676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Original strand, 9459404 - 9459785
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  9459404 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa 9459503  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  9459504 -gagaaatcaatgggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttc 9459602  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| |    
T  9459603 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttttctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgactttctaaacccttgtttcagc 9459702  T
Q  300 cccctcta------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||||||||      |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  9459703 cccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 9459785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40134240 - 40133880
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  40134240 gagaacacaaaagaatttgtttacctagtccggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttaca 40134141  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||| |  |||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| |||    
T  40134140 aaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaaacctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctagtagtattt 40134041  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttca- 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||     
T  40134040 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaattctatacaaaccttcgttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag 40133941  T
Q  298 --------accccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
            | ||||| ||||||||   |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  40133940 cccctttcagcccctatatctcaagatttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaa 40133880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 53 - 371
Target Start/End: Original strand, 21948226 - 21948549
Alignment:
Q  53 ggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaa 152  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  21948226 ggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 21948325  T
Q  153 gctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactc 252  Q
    |  |||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21948326 gtcccagcgtcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc-aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactc 21948424  T
Q  253 tatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagta 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21948425 tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagta 21948524  T
Q  348 aaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    || |||| ||| | |||||||||||    
T  21948525 aacatataactcataaatttggaac 21948549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 70 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48665404 - 48665090
Alignment:
Q  70 ccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccg 169  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||    
T  48665404 ccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccg 48665305  T
Q  170 -taaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtt 268  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48665304 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatataaaccctagtt 48665205  T
Q  269 ttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa------ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta- 360  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||      |||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |     
T  48665204 ttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctccccctctatcttaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcat 48665105  T
Q  361 aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||||||||||    
T  48665104 aaatttggaacaaat 48665090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17324349 - 17324010
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||| |||||||||||||| | |||| |||| || |||||||||| |    
T  17324349 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtcatggggagagaccagccttccgtttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatat 17324250  T
Q  110 caatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtga 209  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17324249 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagttccaatctcttcccatattcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 17324150  T
Q  210 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattct-aaaccttgtttcaaccccctctat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| || ||| |||| || |||||||| | ||| ||||||    
T  17324149 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctataaaaatc--agttttgttgtggcctttctgaacccttgttttagccctctctat 17324052  T
Q  309 ctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  17324051 ctcaaggtttactctaatacaaagtctatatttataataaaa 17324010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 14183576 - 14183922
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgc 98  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| || |    
T  14183576 gagaccacaaaaaaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttac 14183675  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||    
T  14183676 aaaagagatatcaatgggttgcaagaataagtcttccgcctaattctacccaaaattctaatctcttcccgtaaccaagagactcaattataatagtgtt 14183775  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttca 297  Q
    | |||| |||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  14183776 ttccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caacctctatacaaaccctag-tttgt-gttg-cattctaaacccttgtttca 14183869  T
Q  298 accccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
     ||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14183870 gccctctctatctcaaggtttactctgatacatggtctatatttatagtaaaa 14183922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 47180006 - 47179654
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  47180006 agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggg-agagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 47179908  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  47179907 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 47179809  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |    
T  47179808 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagc 47179709  T
Q  300 cccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179708 cccctctatctctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 47179654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 388
Target Start/End: Original strand, 31422851 - 31423248
Alignment:
Q  6 cacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcac------------tatatt-atgagtaa 92  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||            |||| | ||||||||    
T  31422851 cacaaaagaatttgttcacccagctcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctctgtttcaccctctctttcactataatgatgagtaa 31422950  T
Q  93 cgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaat 192  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  31422951 ccttacaaaagagatgtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaattctaat 31423050  T
Q  193 agtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt-gttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-cct 290  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  31423051 agtgtttcccaaggtgaatcaactttcaaaccctagtgtttaatgccaaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 31423150  T
Q  291 tgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaa 388  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| |  | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31423151 tgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgcttatatttatagtaaaagtatctcccataaaattggaacaaatctg-acccaaaaa 31423248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 47177655 - 47177303
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| |||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  47177655 agaacacaaagatatttgttgacccagttcgatccaatctgacctagtctgggg-agagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 47177557  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactca-atcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  47177556 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcccatcctaatagtgtttc 47177458  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |    
T  47177457 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagc 47177358  T
Q  300 cccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47177357 cccctctatctctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 47177303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 25248540 - 25248766
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata-ttatgagtaacgttgcaaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  25248540 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagggagcagtcctccgtttcactataattatgagtaaccttacaaaa 25248639  T
Q  103 gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttccc 202  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  25248640 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcctgtaaccgagagacttaatcctaatagtgttttcc 25248739  T
Q  203 aatgtgaatcaaccctcaaaccctagt 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  25248740 aaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 25248766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 42922514 - 42922128
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||| |||| |||||| || | |||||| |||| || | ||||||||| || |||||||||| |||    
T  42922514 aatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatca 42922415  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaat 211  Q
    ||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  42922414 atgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcgcaaggtgaat 42922315  T
Q  212 caaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatct 310  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42922314 caa-cctc-aaccctagtgtttgttgctaggag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttatttcaaccccctctatct 42922219  T
Q  311 caaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
     || | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||    
T  42922218 taaggtttactctgatacaaaatctatatttatagtaaaagtatccctcataaatttggaacaaatctcagcccaaaaatatgattatgtt 42922128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16432691 - 16432440
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtct-gggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||| | ||||||||| || |    
T  16432691 gagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagtccgccgtttcactataatgatgagtaacattac 16432592  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| || | | |||| |||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| || || |||||||||||| ||||    
T  16432591 aaaagagatatcaatgggttacaagaataattgtcccgcataattctacccaaagtttcaatctcttcccataaccaagagattcaatcctaataatgtt 16432492  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaac 250  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16432491 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtcgccaagagacaaac 16432440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16429253 - 16429049
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||| || ||    
T  16429253 gagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcgctataatgatgagtaaccttaca 16429154  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  16429153 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgttt 16429054  T
Q  200 cccaa 204  Q
    |||||    
T  16429053 cccaa 16429049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 378
Target Start/End: Original strand, 8347298 - 8347634
Alignment:
Q  41 tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatta-tgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcct 139  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | || |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  8347298 tgacctagtctaggggaaagagcatccctccgttccactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 8347397  T
Q  140 aattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccc 239  Q
    ||||||||  ||||   |||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  |||| | ||||||||| ||    
T  8347398 aattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaaccct--aaccttggtgtttgttgcc 8347495  T
Q  240 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttac-tctgatacaaggtctat 337  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  8347496 aagag-caatctctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcaaccccctctatctcaaggtttacatctgatacaaggtctat 8347593  T
Q  338 atttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaatctg 378  Q
     |||||||||||| || | || | ||| ||||||||||||||    
T  8347594 -tttatagtaaaagtacccctcataaaattggaacaaatctg 8347634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 15669378 - 15669732
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggt-tcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgc 98  Q
    |||||||||| | |||||||| || |||||| || | ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| | || |    
T  15669378 gagaacacaacaaaatttgtttacacagttcagtctaaaactgacctagtctcggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtagctttac 15669477  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
     | |||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  15669478 gagagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtt 15669577  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaaccttg-tttca 297  Q
    |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| | ||||   | || ||| | |||||    
T  15669578 tcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctacttttgt-gctgcctcccaaaccctagttttca 15669673  T
Q  298 accccctctatctcaaagcttac-tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatc 355  Q
     ||||||||||| ||| | |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15669674 gccccctctatcccaatgtttacatctgctacaaggtctgtatttatagtaaaagtatc 15669732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 355
Target Start/End: Original strand, 18800600 - 18800910
Alignment:
Q  43 acctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaa 141  Q
    ||||||| |||||||||||| ||   |||| ||||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||||| |||| | ||||||||    
T  18800600 acctagtttgggggagagagcagttctccgcttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggatacaagaataagtgtcccgcctaa 18800699  T
Q  142 ttctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaa 241  Q
    ||||||| |||| || ||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  | ||||||||| |||||  ||||    
T  18800700 ttctacccaaagttcaaatctctacccgtgacctagagactcaatcctaatagtgtttctcagggtgaatcaacc--ccaaccctagtatttgtggccaa 18800797  T
Q  242 gagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatt 340  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||| |||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18800798 gag-caaactctatacaaaccgtagttttcttgttgac-ttctaaacctttgtttcagccccttgtatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatt 18800895  T
Q  341 tatagtaaaaatatc 355  Q
    |||||||||| ||||    
T  18800896 tatagtaaaagtatc 18800910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 355
Target Start/End: Original strand, 49495206 - 49495540
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgt 109  Q
    |||||||| || ||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| |    
T  49495206 aagaatttctttacctagttcggtctaaattgacatagtcttggggagagataagcccttcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatat 49495305  T
Q  110 caatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtga 209  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |  ||||||||  || ||||||||||||| ||||    
T  49495306 caatgggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttaccgtgaccaaaagactcaattttattagtgtttcccaaggtga 49495405  T
Q  210 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctat 308  Q
    |||||| |   |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||  |        || |||| |||||||||| ||||||||||    
T  49495406 atcaactc---aaccatagtgtttgttgccaagag-caaactatatgcaaaccctagtttgat--------ttataaacccttgtttcagccccctctat 49495493  T
Q  309 ctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatc 355  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  49495494 ctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatc 49495540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 6115088 - 6115304
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactat-attatgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||||  || ||    
T  6115088 gagaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaattttaca 6115187  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||   ||||||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||    
T  6115188 aaagagatatcaattggttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 6115287  T
Q  200 cccaatgtgaatcaacc 216  Q
      ||| |||||||||||    
T  6115288 ttcaaggtgaatcaacc 6115304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 8349037 - 8349414
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggt-tcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgc 98  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||  | || ||  || ||||||| | ||||||||| |  |    
T  8349037 gagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtctaaaactgacatagtcttggggagagaacaaccctctattccactataatgatgagtaacttaac 8349135  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||    
T  8349136 aaaagagataccaatgagttacaagaataagtcacccgcctaattctacctaaagtcctaatctcttcccgtgaccatcaaactcaatcctaatagtgtt 8349235  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttca 297  Q
    |||||| |||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||| | |||| | ||||||| ||||||||||    
T  8349236 tcccaaggtgaataaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccttaattttcttgttgac-ttctaaacccttgtttca 8349331  T
Q  298 accccctctatctcaaagcttac-tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaatctg 378  Q
     ||| ||||||||||| | || | ||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| || | ||| ||||||||||||||    
T  8349332 gccctctctatctcaaggtttgcatctaatacaagatctatatttataataaaattatccctcataaaattggaacaaatctg 8349414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16231856 - 16231630
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  16231856 agaacacaaagatatttgttgacc-agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 16231758  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  16231757 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaggctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 16231659  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagt 229  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16231658 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 16231630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23786121 - 23785935
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | |||||||  |||||    
T  23786121 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaat 23786023  T
Q  114 gagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  23786022 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23785935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 51757824 - 51757623
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||  |||||| |||| | ||    
T  51757824 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatggtgagtatcgttac-aa 51757726  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  || ||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  51757725 agagaaatcgataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 51757626  T
Q  202 caa 204  Q
    |||    
T  51757625 caa 51757623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23816181 - 23816029
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || |||| | || ||||| |||||||||||| |||    
T  23816181 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcatccctccgatccattatatgatgagtaacgttacaa 23816082  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaag 153  Q
    ||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23816081 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 23816029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 345
Target Start/End: Original strand, 13125511 - 13125787
Alignment:
Q  69 tccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttc 166  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13125511 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttc 13125610  T
Q  167 ccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctata-caaacccta 265  Q
    || | ||| || | ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13125611 ccttgaccaagagcctcaatcctaacagcgtttcccaatgtgaatcaa-cctc-aaccctagtgtttgtcgccaagag-caaactctataccaaacccta 13125707  T
Q  266 gttttgtagttgccattctaaaccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatag 345  Q
    ||||  | |||| | |  ||| |||||||||| |||||| | ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  13125708 gtttccttgttggcttcttaacccttgtttcagccccctttctctcaagttttactctgatacaaggtttctatttatag 13125787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 301 - 400
Target Start/End: Original strand, 30790681 - 30790780
Alignment:
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30790681 ccctctatctcaaggtttactctgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactgaaaaatacgtttatgtt 30790780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 26613225 - 26613440
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaat--tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttg 97  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| |||  || ||| ||||||| | || |||||| ||     
T  26613225 gagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggt-caaatactgacctaatctgggggagagagaagctctctgttccactataatgattagtaactttc 26613322  T
Q  98 caaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtg 196  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||  ||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||    
T  26613323 caaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtgaccaagtgactcaatccgaatagtg 26613422  T
Q  197 tttcccaatgtgaatcaa 214  Q
    |||||||| |||||||||    
T  26613423 tttcccaaggtgaatcaa 26613440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 137 - 371
Target Start/End: Original strand, 26520236 - 26520475
Alignment:
Q  137 cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccg------agtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtg 230  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || |      || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || | |||||    
T  26520236 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgactgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa-cctc-aatcttagtg 26520333  T
Q  231 tttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaa--ccccctctatctcaaagcttactctgata 327  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||| | ||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26520334 tttgttgccaagag-caaactctatagaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaaccgttgttttcagcccccctctatctcaaggtttactctgata 26520431  T
Q  328 caaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  26520432 caaagtctatatttatag-agaaatataacttataaatttggaac 26520475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 13358867 - 13358786
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatat 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||    
T  13358867 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatat 13358786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28279477 - 28279293
Alignment:
Q  85 atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc 183  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||   |||    
T  28279477 atgagtaactttacaaaagagatgccaatgagttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagaagctc 28279378  T
Q  184 aatcctaatagtgtttc-ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgt 272  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||| |  | ||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||    
T  28279377 aatcctaatagtgtttctccaaggggaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgtcaagag-caaactc--tacaaaccctaattttgt 28279293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16231641 - 16231517
Alignment:
Q  256 acaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatat 354  Q
    ||||||||||||||| | |||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  16231641 acaaaccctagttttcttgttgcttttctagacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtct 16231542  T
Q  355 cacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
      |||||||| || |||||||||||    
T  16231541 tgcttaaaatctgtaacaaatctgc 16231517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 257 - 351
Target Start/End: Original strand, 25248756 - 25248851
Alignment:
Q  257 caaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaa 351  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  25248756 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttctagaaaaaa 25248851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 339 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 49687496 - 49687435
Alignment:
Q  339 tttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49687496 tttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 49687435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27916780 - 27916525
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||   ||||||||| || |||| ||||| |||    
T  27916780 aatttgtttacccaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataacgatgagtaactttacaaa-gagatatca 27916682  T
Q  112 atga--gttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtg 208  Q
    | ||  |||| |||||  |||||||   |||||||| ||| ||||   ||||||||||  || ||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  27916681 aagaaggttaaaagaattagtcttcaaacctaattccacccaaagtcacaatctcttcatgtgaccaagagactcaattctaatagtgttttccaaggtg 27916582  T
Q  209 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttt 270  Q
    ||||||   || |||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  27916581 aatcaa--ttccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaaaccctagtttt 27916525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Original strand, 30738653 - 30738830
Alignment:
Q  41 tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatga---gtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccg- 136  Q
    ||||||||| |||| ||||||| | || |||||||||||||| |||||   ||||| || |||||||||  |||| | |||||||||| ||||||||       
T  30738653 tgacctagtatgggtgagagagcatccctccgtttcactataatatgatgagtaactttacaaaagagacatcaaagggttacaagaataagtcttcaaa 30738752  T
Q  137 cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaa 214  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  30738753 cctaattctacccaaaatcccaatctcttcctatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 30738830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 15916674 - 15916562
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaa-ttgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactat-attatgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| || | ||||||| ||  ||||||||| |||    
T  15916674 aatttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgacgagtaactttataaaagagatatca 15916575  T
Q  112 atgagttacaaga 124  Q
    ||| |||||||||    
T  15916574 atgggttacaaga 15916562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 155963 - 155788
Alignment:
Q  39 attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccg- 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| || |||| |||||  |||   ||||||||||  | |||||       
T  155963 attgacctagtttgggg-agagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagataacaaaaggttacaagaattactcttcaaa 155866  T
Q  137 cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaa 214  Q
    |||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  155865 cctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 155788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16561751 - 16561545
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| || ||||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||| | || |  ||| |||| || | ||||||||| || |||||||||| |||    
T  16561751 aatttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctatgggagagagcaaccctttgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatca 16561652  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 210  Q
    | | |||||||||| ||||||||   |||| ||||||| ||||   |||||| || ||||  || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16561651 aagggttacaagaataagtcttcaaacctatttctacccaaagtctcaatctatttccgtggccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 16561552  T
Q  211 tcaaccc 217  Q
    |||||||    
T  16561551 tcaaccc 16561545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 345
Target Start/End: Original strand, 13127837 - 13127959
Alignment:
Q  221 aaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctcaaagctta 319  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||| |||| | |||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || | |||    
T  13127837 aaccctagtgtttgttgccaaaagg-aaactctatataaaccctacttttcttgttggc-ttctaaacccttgtttcaacccc-tctctctaaaggttta 13127933  T
Q  320 ctctgatacaaggtctatatttatag 345  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||    
T  13127934 ctccgatacaaggtttatatttatag 13127959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 43
Target Start/End: Original strand, 13447260 - 13447301
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattga 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13447260 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 13447301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Original strand, 46432017 - 46432090
Alignment:
Q  303 ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  46432017 ctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 46432090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 43104137 - 43104053
Alignment:
Q  317 ttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcact-taaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||  ||||||||||||   |||||||||| |||| ||||    
T  43104137 ttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcaaaaaactggaacaaatctaagcccaaaaatatgtttctgtt 43104053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 395
Target Start/End: Original strand, 2393578 - 2393653
Alignment:
Q  321 tctgatacaaggtctatatttatagta-aaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 395  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  2393578 tctgatacaaggcttatatttatagtggaaaatatcccttaaaatatggaacaaatcttcactgaaaaatacgttt 2393653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 354
Target Start/End: Original strand, 15295142 - 15295188
Alignment:
Q  308 tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatat 354  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15295142 tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaacatat 15295188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 272
Target Start/End: Original strand, 26332726 - 26332814
Alignment:
Q  179 gactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgt 272  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||    
T  26332726 gactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaaacc-caaa-cctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaaaccctatttttgt 26332814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 834167 - 834211
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  834167 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagaga 834211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 377
Target Start/End: Original strand, 26613547 - 26613603
Alignment:
Q  321 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| || |||| |||||||||||||    
T  26613547 tctgatacaaggtctatatttatagcaaaagaatccctcaaaaattggaacaaatct 26613603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 28220226 - 28220270
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  28220226 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 28220270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 28265554 - 28265598
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  28265554 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 28265598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 43104389 - 43104245
Alignment:
Q  69 tccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaag-tcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctctt 165  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||| | |||||||||||||  |||||   |||||||||||| |||| | |||| ||||    
T  43104389 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaaaaaaatcttcaaacctaattctacccaaagtttcaatgtctt 43104290  T
Q  166 cccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 210  Q
    || || ||| |  |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  43104289 cctgtgaccaaaagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaa 43104245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 395
Target Start/End: Original strand, 2401492 - 2401567
Alignment:
Q  321 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaa-tatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 395  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  2401492 tctgatacaaggcttatatttatagtggaaagtatcccttaaaatatggaacaaatcttcactgaaaaatacgttt 2401567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14353126 - 14353047
Alignment:
Q  137 cctaattctaccaaaag-ctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc-ccaatgtgaatcaa 214  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14353126 cctaattctacccaaagtctcgaatctctttccgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 14353047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 300 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16431096 - 16431017
Alignment:
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaatctg 378  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||   ||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||||||||||||    
T  16431096 cccctctatctcaaggtttgctctgatacaaaacctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatctg 16431017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 49959018 - 49958963
Alignment:
Q  321 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||||    
T  49959018 tctgatacaaggtctatatttatagcaaaagcatcccacaaaatttggaacaaatc 49958963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 13598402 - 13598452
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagcc 67  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13598402 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 13598452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27916469 - 27916415
Alignment:
Q  323 tgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatct 377  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||    
T  27916469 tgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatccctccaaaattggaacaaatct 27916415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 59
Target Start/End: Original strand, 45644354 - 45644396
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggaga 59  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  45644354 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 45644396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 47102934 - 47102880
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatcc 71  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  47102934 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatcc 47102880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Original strand, 775676 - 775725
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagc 66  Q
    ||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  775676 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagc 775725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 19072932 - 19072977
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  19072932 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 19072977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 19120822 - 19120867
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  19120822 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 19120867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 21536662 - 21536617
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21536662 ttgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagag 21536617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 214
Target Start/End: Original strand, 26332631 - 26332688
Alignment:
Q  157 caatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaa 214  Q
    |||||||||| ||| ||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  26332631 caatctcttctcgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaa 26332688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 26644990 - 26644945
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  26644990 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 26644945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 37069774 - 37069819
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  37069774 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 37069819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 46783029 - 46782966
Alignment:
Q  321 tctgatacaaggtctatatt---tatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcac 381  Q
    ||||||||||||| ||||||   |||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||    
T  46783029 tctgatacaaggtttatattatttatagtaaaagtaacccttaaaatttggaacaaatatgcac 46782966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 47704029 - 47703984
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  47704029 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 47703984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 3157033 - 3156989
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  3157033 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 3156989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 4552637 - 4552681
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  4552637 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgagggagaga 4552681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 13659336 - 13659380
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||    
T  13659336 ttgttgacccagttcggtccaacttaacctactctgggggagaga 13659380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 62
Target Start/End: Original strand, 21353342 - 21353394
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagag 62  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||    
T  21353342 aagaatttgtttacccagttcggtctaaagatgacctagtctgggggagagag 21353394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 28223421 - 28223465
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  28223421 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 28223465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 31659406 - 31659362
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  31659406 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgagggagaga 31659362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 105)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 2818319 - 2818720
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  2818319 gagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 2818418  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||  || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||     
T  2818419 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagccttttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttt 2818518  T
Q  201 ccaatgtgaatc-aaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||     
T  2818519 ccaaggtgaatcaaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcag 2818618  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2818619 ccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccgaaaatacgtttttg 2818718  T
Q  399 tt 400  Q
    ||    
T  2818719 tt 2818720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 25921458 - 25921857
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  25921458 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 25921557  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  25921558 agagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccagagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttca 25921657  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  25921658 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcc 25921757  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25921758 ccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 25921857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21948321 - 21947922
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  21948321 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 21948222  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||  |||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21948221 aagagatatcaaggggttacaagaataagtctcccgcctaattccacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 21948122  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| |     
T  21948121 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttc-ag 21948023  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgt 399  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  21948022 cccctctatctcaaaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgt 21947923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 38882399 - 38882000
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  38882399 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 38882300  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  38882299 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 38882201  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttca-ac 299  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |    
T  38882200 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 38882101  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgt 399  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38882100 cccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgt 38882001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 10529091 - 10529429
Alignment:
Q  9 aaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||      
T  10529091 aaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaa 10529190  T
Q  109 tcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtg 208  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10529191 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 10529290  T
Q  209 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctcta 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10529291 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctataaaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaacccactcta 10529390  T
Q  308 tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10529391 tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 10529429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 36402312 - 36402711
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  36402312 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcgatctaaattgacctagtctgggggagagagcagacatctgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 36402411  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| ||||||  |||||| || |||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| |||     
T  36402412 aagagatatcaatggattacaataataagtctccagcctaattttacccaaagttccaatctcctcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtatttt 36402511  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||| |    
T  36402512 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagtttcgtgattgtcattctaaacccttgtttcagc 36402611  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgt 399  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36402612 cccctctatctcaacgtttactctgatataaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaattt-gaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgt 36402710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2175212 - 2174814
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| || ||||||||| ||||    
T  2175212 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgataagtaacgttacaaa 2175113  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  2175112 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 2175014  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  2175013 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 2174914  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  2174913 ccctctatctccaagtttgctctgatacaaggcctgtatttatagtaaaagcatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtt 2174814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4236922 - 4236525
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  4236922 agaacacaaaagaatttattgacc-agttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 4236824  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  4236823 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttc 4236724  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  4236723 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagcc 4236624  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  4236623 ccctttatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactc-aaaatacgtttctgtt 4236525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 18511196 - 18511570
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  18511196 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaa 18511295  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18511296 aagagatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 18511395  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |    
T  18511396 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagc 18511495  T
Q  300 cccctcta--tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    ||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||||    
T  18511496 cccctctatctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatattaaacatataactcataaatttggaac 18511570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 12555907 - 12556307
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||| || ||  |||||||||||| |||    
T  12555907 gagaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgaactagtatgggggagatagcagccctccgtttcgctttaagatgagtaacgttacaa 12556006  T
Q  101 aa-gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||    
T  12556007 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcttgtctaattctaccaaaa-ctccaatctcttcccgtagccaagagacacaatcctaatagtgttt 12556105  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||     
T  12556106 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttatttcag 12556205  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||| || ||||||||| ||| ||    
T  12556206 ccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaattttgaaacaaatctgtacacaaaaatacatttctg 12556305  T
Q  399 tt 400  Q
    ||    
T  12556306 tt 12556307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40221818 - 40221467
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| || ||    
T  40221818 gagagcacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttaca 40221719  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40221718 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 40221619  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  40221618 tccaaggtgaatcaaccctcaaatcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcag 40221519  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  40221518 ccccctctatctcaaggtttactctgagtcaatgtctatatttatagtaaaa 40221467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 18509302 - 18509657
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  18509302 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcccaccgtttcactatatgatgagtaactttacaa 18509401  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    || |||| |||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18509402 aatagatatcaacgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccattctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 18509501  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |    
T  18509502 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagc 18509601  T
Q  300 ccc-ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatat 354  Q
    ||| || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18509602 ccctctatctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatat 18509657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16776452 - 16776052
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || |||| |||| | |||||||| || ||||||||| |||    
T  16776452 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgataagtaacgttacaa 16776353  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16776352 aagagaaatcaatg-gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 16776254  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||| |    
T  16776253 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttattccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttgtaaacccttgtttcagc 16776154  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctata-tttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 398  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||    
T  16776153 cccctctatctcaaagtttgctcagatacaaggtctatattttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatcttcactcaaaaatatgtttctg 16776054  T
Q  399 tt 400  Q
    ||    
T  16776053 tt 16776052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17073172 - 17072828
Alignment:
Q  8 caaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagaga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||| || |||||||||    
T  17073172 caaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccgagtctgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagaga 17073073  T
Q  107 tgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatg 206  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  17073072 tatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatcgaaagccccaatctcttcccctaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagg 17072973  T
Q  207 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| |||||||    
T  17072972 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctc 17072873  T
Q  306 tatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17072872 tatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 17072828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25904398 - 25904048
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  25904398 gagaacacaaaataatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactatatgataagtaacgttacaa 25904299  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
     |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25904298 tagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattatactcaaagccctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 25904199  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| |    
T  25904198 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaatccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagc 25904099  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25904098 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 25904048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 39854778 - 39854433
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| |||| |||    
T  39854778 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtagcgttacaa 39854679  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  39854678 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccatgagactcaatcctaatagtgtttc 39854579  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |     
T  39854578 ccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc-ag 39854480  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  39854479 cccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 39854433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26098026 - 26097656
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  26098026 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggaggagagagcagcc-tctgttccactatatgatgagtaacgttacaa 26097928  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||   | ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  26097927 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcattttcccgtaaccaagagactcattcctaatagtgtttc 26097828  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaac 299  Q
    | || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |    
T  26097827 c-aaggtgaatcaaccctctaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatccaaaccctagttttgttgttgccattctaaacctttatttcagc 26097729  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  26097728 cccctctatctcaaagtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 26097656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25804318 - 25803935
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  25804318 agaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 25804220  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25804219 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 25804120  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||    
T  25804119 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttgagcc 25804020  T
Q  301 ccctctatctc---------aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||||||          ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  25804019 ccctctatctctctctctctcaaatttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 25803935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 6756787 - 6756389
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||| | ||| ||||| || ||    
T  6756787 gagaacacaaaagattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctc-gtttcactataatgatgtgtaaccttaca 6756689  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    ||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  6756688 aaaaagatatcaatg--ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgttt 6756591  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaa 298  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||     
T  6756590 cccaaggagaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaaccattgtttcag 6756491  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 398  Q
    | ||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  6756490 ctccctctatctcaaagtttaatatgatacaagatctatattaatagtaaaagtataacttaaaatttggaataaatctgcaccaaaaaatacgtttctg 6756391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24127151 - 24126801
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  24127151 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaa 24127052  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  24127051 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctatcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttc 24126952  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttgtttcaac 299  Q
    |||| || |||||| | |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| |    
T  24126951 ccaaggtcaatcaatcttcaaaccctagtatttgttgacaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagc 24126852  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||| |||||||||| | |||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  24126851 cccatctatctcaaggtttacactgatataatgtctatatttatagtaaaa 24126801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18466978 - 18466599
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| || ||||| ||||||| |||| ||||    
T  18466978 agaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccattatatgatgagtatcgttacaaa 18466879  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18466878 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 18466779  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  18466778 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatccaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 18466679  T
Q  301 ccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18466678 ccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatataactcataaatttggaacaaat 18466599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 10474307 - 10474655
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||    
T  10474307 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttagaa 10474406  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  10474407 aagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagattcaatcttaatagtgtttc 10474506  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  10474507 ccaaggtgtatcaaccctcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagc 10474606  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaa 348  Q
    ||||||||| |||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10474607 cccctctatttcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaa 10474655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 350
Target Start/End: Original strand, 37705774 - 37706114
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtc 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||    
T  37705774 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaatagccattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatc 37705873  T
Q  111 aatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 210  Q
    |||| |||||||||| |||||| || |||||||||| | ||| | | ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37705874 aatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 37705973  T
Q  211 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  37705974 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaagtctatacaaaccctagatttgtcgttgcctttctaaacctttatttcagccccctctatc 37706073  T
Q  310 tcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37706074 tcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaa 37706114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 31472596 - 31472947
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  31472596 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttaca 31472695  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  31472696 aaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 31472795  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |     
T  31472796 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttag 31472895  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||| | |||| || |||||| ||| |||||||||||||||    
T  31472896 ccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaa 31472947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18596939 - 18596570
Alignment:
Q  3 gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| || ||||    
T  18596939 gaacacaaaagaatctgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 18596840  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |    
T  18596839 agagatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgttttc 18596740  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaaccttgtttcaaccc 301  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || | | |||||||||| |||    
T  18596739 caaggtgaatcaaccctcaaaccatattgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttat-acccttgtttcagccc 18596641  T
Q  302 cctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    |||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  18596640 cctctatcccaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 18596570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27910744 - 27910364
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| || ||||| ||||||| |||| ||||    
T  27910744 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctccgttccattatatgatgagtatcgttacaaa 27910645  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  27910644 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcc 27910545  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaaccttgtttcaaccc 301  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||    
T  27910544 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaaccttgtttcagccc 27910445  T
Q  302 c------ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |      |||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  27910444 ccgctatctctctctcaaagtttaacctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 27910364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 1189591 - 1189948
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggg-ggagagagtagccatccgtttcactata-ttatgagtaacgttgc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| ||||||| ||||||||||| || |    
T  1189591 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggaggagagagcatccctccgttccactataattatgagtaaccttac 1189690  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  1189691 aaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcataatagtgtt 1189790  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttgtttca 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  1189791 tcccaaagtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccgtagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttca 1189890  T
Q  298 accccctctatctc----aaagcttac-tctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
     |||||||||||||    || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189891 gccccctctatctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 1189948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 31465973 - 31466360
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||          |||||| ||||||||| || |||    
T  31465973 gagaatacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgaactagtctgggggtgagagcagcc----------ctatatgatgagtaactttacaa 31466062  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    || |||| |||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  31466063 aatagatatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatactgtttc 31466161  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaac 299  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||||| |||||||| |    
T  31466162 tcaaggtgaatcaaccgtcaaaccctggtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtcgttacttttttaaacctttgtttcagc 31466261  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 398  Q
    ||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31466262 cccttttatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtgtcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacatttatg 31466360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31545374 - 31544996
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| |||||||  ||| ||||    
T  31545374 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttacaaa 31545275  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  31545274 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatttcttcccgtaaccaagagactctaatcctaatagtgtttc 31545176  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  31545175 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 31545076  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    ||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| || |||||||||||    
T  31545075 cccctttatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 31544996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 21684437 - 21684845
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||  ||| ||||    
T  21684437 agaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa 21684536  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  21684537 -gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcc 21684635  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||| ||    
T  21684636 caaggcgaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagcc 21684735  T
Q  301 ccctcta----------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaata 390  Q
    |||||||          |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21684736 ccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagttttgcttaaaatttgtaacaaatctgcactcaaaaata 21684835  T
Q  391 cgtttatgtt 400  Q
     |||| ||||    
T  21684836 tgtttctgtt 21684845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6745363 - 6745053
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||    
T  6745363 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa 6745264  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6745263 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 6745164  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| |    
T  6745163 ccaaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacacttgtttcagc 6745065  T
Q  300 cccctctatctc 311  Q
    ||||| ||||||    
T  6745064 cccctttatctc 6745053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18469303 - 18468926
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||  | |||| ||||| || ||||||| |||| ||||    
T  18469303 agaacgcaaaagaatttgttaatccagttcggtccaaattgacctagtctggg--agagagcagctcttcgttccactagatgatgagtatcgttacaaa 18469206  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18469205 agagaaatcaatgggttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 18469106  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  18469105 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 18469006  T
Q  301 ccctctatctc----aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||||||    |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  18469005 ccctctatctctctcaaagtttatcatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 18468926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31543028 - 31542651
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| |||||||  ||| ||||    
T  31543028 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttacaaa 31542929  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| ||| | |||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  31542928 -gagaaatcaatgggtt-cgagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 31542831  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  31542830 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 31542731  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| || |||||||||||    
T  31542730 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 31542651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27912830 - 27912449
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||| |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  27912830 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagttctctgttccactatatgatgagtatcgttacaaa 27912731  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27912730 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 27912631  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |     
T  27912630 caaggtgaatcaaccctcaaaacctattatttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagca 27912531  T
Q  301 ccctcta------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||      |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  27912530 ccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 27912449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 16092183 - 16092537
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  16092183 gagaacacaaaagaatttgttgatccagttcagtctaaattgacctagtctagaggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttaca 16092282  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16092283 aaagagatctcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16092382  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  16092383 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcaaagagacagactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaa 16092482  T
Q  299 ccccctctatctc---aaagcttac-tctgatacaaggtctatatttatagtaaa 349  Q
    |||||||||||||    ||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16092483 ccccctctatctctcacaagtttacatctgatacaaagtctatatttctagtaaa 16092537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 39397977 - 39398326
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  |||||||  |||    
T  39397977 gagaacacaaaagaatgttttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcagccatccgttttactatataattggtaacgtcacaa 39398076  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39398077 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctactgcctaattctacccaaagttccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 39398176  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |    
T  39398177 ccaaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc-a 39398274  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
     |||||||||||||| | |||| | | ||||| || ||||||||||||||||    
T  39398275 gcccctctatctcaaggtttacaccggtacaatgtttatatttatagtaaaa 39398326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 658340 - 658608
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  658340 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg---agagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 658436  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  658437 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttc 658536  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgt 272  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658537 tcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgt 658608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 17818476 - 17818817
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||| |||| ||| ||||||||| || |||    
T  17818476 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagaga--agccctctgttccactgtatgatgagtaactttacaa 17818573  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||    
T  17818574 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcagtcttaatagtgtttc 17818673  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttgtttcaac 299  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |     
T  17818674 ccaaggtaaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagagacgaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttc-ag 17818772  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttata 344  Q
    ||||||| |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17818773 cccctctttctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttata 17818817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 350
Target Start/End: Original strand, 31179368 - 31179705
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| |||| ||||  | |||    
T  31179368 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatgaat 31179466  T
Q  114 gagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttcccaatgtgaatc 212  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31179467 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 31179566  T
Q  213 aaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctc 311  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  31179567 aacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctctatctc 31179666  T
Q  312 aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||| || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31179667 aaagtttgctttgatacaatgtctatatttatagtaaaa 31179705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 311
Target Start/End: Original strand, 34477038 - 34477349
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  34477038 agaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 34477137  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgttt 199  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| |   |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  34477138 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcataatagtgttt 34477236  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  34477237 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 34477336  T
Q  299 ccccctctatctc 311  Q
    |||||||||||||    
T  34477337 ccccctctatctc 34477349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6747599 - 6747253
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| | |||||||| | |||||||||| |||    
T  6747599 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagagagagagcagccctccgatccactatatgacgagtaacgttacaa 6747500  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    || |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6747499 aa-agaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 6747401  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |    
T  6747400 ccaaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgtttcaaagagacaaattttatacaaactctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagc 6747302  T
Q  300 cccctctatctc--aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    ||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||    
T  6747301 cccctctatctctttctctttgctctgatacaaggtctatatttatagt 6747253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 311
Target Start/End: Original strand, 34479403 - 34479714
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  34479403 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 34479502  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgttt 199  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| |   |||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  34479503 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactccaatcataatagtgttt 34479601  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  34479602 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 34479701  T
Q  299 ccccctctatctc 311  Q
    |||||||||||||    
T  34479702 ccccctctatctc 34479714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 696173 - 695834
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||| |||| || ||    
T  696173 gagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataactttaca 696074  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  696073 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 695974  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  695973 -ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaag-----------atacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcat 695886  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||| |||||||| | |||| || |||||| ||||||||| |||||||||    
T  695885 ccccctttatctcaaggtttacactcatacaatgtctatattcatagtaaaa 695834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2954711 - 2954368
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||||||| ||||||||| || |||    
T  2954711 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacctagtttgggggagagagcatccctccgcttcactatatgatgagtaactttacaa 2954612  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    | ||||| |||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||     
T  2954611 a-gagatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttt 2954513  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||||||||| | || | ||||||| ||||||||||     
T  2954512 ccaaagtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaattatacacaaaccctagttttgttgctgtctttctaaacccttgtttcat 2954413  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttat 343  Q
     | |||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  2954412 actcctctatctcaaagtttacactgatacaaagcctatatttat 2954368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21289056 - 21288715
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  21289056 gagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataagatgagtaacgttacaa 21288957  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||        |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||  | ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||     
T  21288956 aaga--------tgagttacaagaaaaaatctcccgcttaattctatccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttt 21288865  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaacccta------gtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgt 293  Q
    | || ||||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| |||| |    
T  21288864 c-aaggtgaatcaaccctcaaaccctaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctatttttattgttgctattctaaacccttat 21288766  T
Q  294 ttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttata 344  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||    
T  21288765 ttcaaccccctctatctcaaggtttactctaattcaaggtctatatttata 21288715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15552539 - 15552154
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  15552539 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 15552440  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||    
T  15552439 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactccaatcctaatagtgtttc 15552341  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||      
T  15552340 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagt 15552241  T
Q  300 cccctcta----------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||||||||          |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  15552240 cccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 15552154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Original strand, 34530734 - 34531000
Alignment:
Q  85 atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactca 184  Q
    ||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||  | |||||||||||||| || || ||||||    
T  34530734 atgagcaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataaatctcccgcctaattctactcaaagtcctaatctcttcccgtagccaagagactca 34530833  T
Q  185 atcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattct 284  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  34530834 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatttct 34530933  T
Q  285 aaac-cttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  34530934 aaacacttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgattcaaagtctatatttacagtaaaa 34531000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 41585728 - 41585956
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  41585728 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaa 41585827  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || |||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  41585828 aagagatatcaatgacttacaaaaataagtctcctgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtagccaagagactcaatcctactagtgtttc 41585927  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagt 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41585928 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 41585956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 20505827 - 20506042
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  20505827 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagc--agccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 20505924  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  20505925 aagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 20506024  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccct 218  Q
    |||| |||||||||||||    
T  20506025 ccaaggtgaatcaaccct 20506042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10587126 - 10586758
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggggg-agagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||    
T  10587126 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa 10587027  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    | ||||  |||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||| | || |||| |||||||||||||||||    
T  10587026 a-gagaaatcaatgggttaaaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaagcaagagactgaatcctaatagtgtttc 10586928  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccc-aagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||           |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  10586927 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctatcgtttgttcccaaagagacaaact-----------ctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcag 10586839  T
Q  299 cccc---ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||||    ||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  10586838 cccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 10586758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 157 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20043189 - 20042995
Alignment:
Q  157 caatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctata 256  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20043189 caatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctata 20043090  T
Q  257 caaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | || || |||||||| | |||||||||||||||||    
T  20043089 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacacttgtttcagccccctctatctcaaggtttgctatgatacaaagcctatatttatagtaaaa 20042995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Original strand, 6661181 - 6661512
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata-ttatgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||    
T  6661181 aatttgtttatccagttcggtccaaatctgacctagtctgagggagagagcagtcatccgttccactataattatgagcaactttacaaaagagatatca 6661280  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctacc-aaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 210  Q
    ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  6661281 atgggttacaagaataagtctcctgcctaattgtacccaaaatctc-aatttcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccatggtgaa 6661379  T
Q  211 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatc 309  Q
    |||||||   ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6661380 tcaacccc--aactctagtgtttgttgccaaga-acaaactctatacataccctaattttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcaaccctctctatc 6661475  T
Q  310 tcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6661476 tcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagt 6661512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2724188 - 2723959
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  || |||    
T  2724188 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatcttacaa 2724089  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| || ||  |||||||||||||         ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  2724088 aagagatatcaatgggttacaagaataaatcacccgcctaattcta---------ccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttc 2723998  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccc 239  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  2723997 ccaaggtgaatcatccctcaaaccctagtgtttgctccc 2723959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 133 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20045173 - 20044955
Alignment:
Q  133 tccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 232  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20045173 tccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 20045074  T
Q  233 tgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaag 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||||||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||     
T  20045073 tgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctttcctaaacccttgtttcagccccctctgtctcaaggtttgctctgatacaaa 20044974  T
Q  332 gtctatatttatagtaaaa 350  Q
    | |||||||||||||||||    
T  20044973 gcctatatttatagtaaaa 20044955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 156 - 350
Target Start/End: Original strand, 26098390 - 26098585
Alignment:
Q  156 ccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctat 255  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26098390 ccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttgtcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctat 26098489  T
Q  256 acaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26098490 acaaaccctagtcttcttgttgccattctaaacccttatttcagccccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaa 26098585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 39798341 - 39798126
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||  ||||||| | ||  |||    
T  39798341 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatacgatgagtatcattataaa 39798242  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  39798241 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 39798142  T
Q  202 caatgtgaatcaaccc 217  Q
    ||| ||||||||||||    
T  39798141 caaggtgaatcaaccc 39798126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9020515 - 9020143
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaatt-gacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||   |||||| | ||| |||||||| ||||||||| | ||||||| | ||||||||  || |    
T  9020515 gagaacacaaaagaattggtttatccagttcggtccaaaacagacctaatttggaggagagagcagccatccgatccactataatgatgagtaattttac 9020416  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  9020415 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcttaatagtgtt 9020316  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaaccttg-tttca 297  Q
    | |||| |||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||   | || ||||| |||||    
T  9020315 ttccaaggtgaatcaa--cttcaaccctagtgtttgttgccaagag--caactctatacaaaccctacttttgt-gttgcctcccaaacccttgttttca 9020221  T
Q  298 accccctctatctcaaagcttac-tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaa 374  Q
     | ||||||| | ||| | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| || | || ||||||||||    
T  9020220 gctccctctagcacaaggtttacatctgatacaaggtatgtatttatagtaaaaacatctctcataaattggaacaaa 9020143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4410316 - 4410090
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||  |||  | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  4410316 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa 4410217  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4410216 -gagaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 4410118  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagt 229  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4410117 caaggtgaatcaacccacaaaccctagt 4410090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 214 - 400
Target Start/End: Original strand, 20507659 - 20507846
Alignment:
Q  214 accctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctca 312  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20507659 acccttaaacccttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttaatttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 20507758  T
Q  313 aagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  20507759 aagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagtatcgcttaaatcttggaacaaatctgctcccaaaaatatgtttctgtt 20507846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 10749986 - 10749796
Alignment:
Q  10 aaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | |||||||  |    
T  10749986 aaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaat 10749888  T
Q  110 caatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  10749887 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10749796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 15354560 - 15354757
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  15354560 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttac-aa 15354658  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  15354659 agagaaatcaatgggttacaag-aatagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15354757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 15356836 - 15357033
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  15356836 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtccgggggagagagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttac-aa 15356934  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  15356935 agagaaatcaatgggttacaag-aatagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15357033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23665337 - 23665140
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  23665337 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 23665239  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  23665238 agagaaatcaatgggttacaag-aatagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23665140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 23793250 - 23793447
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  23793250 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 23793348  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  23793349 agagaaatcaatgggttacaag-aatagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23793447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 3373122 - 3373320
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| | || |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  3373122 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 3373221  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgac-tcaatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||    
T  3373222 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttcaatcctaatagtgtttc 3373320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 10757462 - 10757273
Alignment:
Q  10 aaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  |    
T  10757462 aaagaatttgttgacccagttcggtctaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagaaaaat 10757364  T
Q  110 caatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  10757363 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt-ccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10757273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36208865 - 36208656
Alignment:
Q  7 acaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactat-attatgagtaacgttgcaaaagag 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||| ||||  |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  36208865 acaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtat-ggggaaagagcagcccgccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagag 36208767  T
Q  106 atgtcaatgagttacaagaaaaagtcttc-cgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaa 204  Q
    || |||||| |||||||||| |||||| |   |||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||| || ||||||||| || || ||||||||||    
T  36208766 atatcaatgggttacaagaataagtctacaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgttaccaagagactcaatcttagtaatgtttcccaa 36208667  T
Q  205 tgtgaatcaac 215  Q
     ||||||||||    
T  36208666 ggtgaatcaac 36208656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20054132 - 20053834
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgc 98  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||  ||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||  |||||| | ||||||||| || |    
T  20054132 gagaacacaaaagaatttgtttacgcagttcggtccaaaactgacctagtatggaggagagagcagccttccgttctactataatgatgagtaactttac 20054033  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    ||||||||| ||   | |||||||||| |||||| || |||||||||||  ||||  ||||||||       |||| || ||||||||||||||||||||    
T  20054032 aaaagagatatc---gggttacaagaataagtctcccacctaattctacttaaagtcccaatctcca-----aaccaagagactcaatcctaatagtgtt 20053941  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttca 297  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| ||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||    
T  20053940 tcccaaggtgaatcaa-cctc-aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatataaactctagtttttgtgttgcc-ttctaaacccttgtttca 20053845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Original strand, 23741844 - 23742034
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  23741844 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 23741942  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaata 193  Q
    |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| | || |||| |||||||||||    
T  23741943 agagaaatcaatgggttacaag-aatagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatcaagagactccaatcctaata 23742034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 38960117 - 38960314
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  38960117 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 38960215  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||  |||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  38960216 agagaaatcaatgggttacaag-aatagtctcccgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 38960314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 270
Target Start/End: Original strand, 17413198 - 17413416
Alignment:
Q  49 tctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattcta 146  Q
    |||||||||||||| | || || ||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||| | |||||||||| |||| |||   ||||||||||    
T  17413198 tctgggggagagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagttttcaaacctaattcta 17413297  T
Q  147 ccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagac 246  Q
    || ||||   |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||| |    
T  17413298 cctaaagtctcaatctcttcccttgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-c 17413394  T
Q  247 aaactctatacaaaccctagtttt 270  Q
    ||||||  |||||||| |||||||    
T  17413395 aaactc--tacaaaccatagtttt 17413416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 26098272 - 26098379
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtct-gggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  26098272 gagaacataaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtatggggggagagagcagccctccgtttcaccatatgatgagtaacgttaca 26098371  T
Q  100 aaagagat 107  Q
    ||||||||    
T  26098372 aaagagat 26098379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20043285 - 20043206
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcacta 80  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||    
T  20043285 gagaacacaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcaaccattcgtttcacta 20043206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 317 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 39798066 - 39797983
Alignment:
Q  317 ttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  39798066 ttactctaatacaaggtctatatttatagtaaaagttttgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtt 39797983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 4410101 - 4410006
Alignment:
Q  256 acaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctc----aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  4410101 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 4410006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15143750 - 15143547
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaat--tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtc 110  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||||| ||||||| || |||   ||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||| ||    
T  15143750 aatttgtttacccatttcggt-caaatactgacctagtctaggggagaaagcagctccccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatc 15143652  T
Q  111 aatgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtga 209  Q
    || | |||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||   | ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| || ||||    
T  15143651 aaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaaatccaaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgcttccaaaggtga 15143552  T
Q  210 atcaa 214  Q
    |||||    
T  15143551 atcaa 15143547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42770924 - 42770690
Alignment:
Q  138 ctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttc 237  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||  ||||||||  |||||| ||||  | |||| |||||||||||     
T  42770924 ctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcagtcctaata--gtttcccatggtgaatgaacc--ccaaccttagtgtttgttg 42770829  T
Q  238 ccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaaccttg-tttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtcta 336  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| |||| |||||| |||||| | | || ||||| |||||  |||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||    
T  42770828 ccaagag-caaattctatataaa-cctaattttgt-gttgccttccaaacccttgttttcagtcccctctatctcaaggtttactc-gatacaaagttta 42770733  T
Q  337 tatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaatctg 378  Q
    |||||||||||||| |||| || | ||| ||||||||||||||    
T  42770732 tatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatctg 42770690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 299 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36208576 - 36208525
Alignment:
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36208576 ccccctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 36208525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 350
Target Start/End: Original strand, 41585946 - 41586040
Alignment:
Q  257 caaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||||||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  41585946 caaaccctagttttgttcttgttattctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaggtttactctgatacaaaacctatatttatagtaaaa 41586040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 29748315 - 29748260
Alignment:
Q  321 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||    
T  29748315 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagcatccctcaaaatttggaacaaatc 29748260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 400
Target Start/End: Original strand, 2144897 - 2144978
Alignment:
Q  321 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaa-atttggaacaaatctgcaccca-aaaatacgtttatgtt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  2144897 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcaaataattggaacaaatctcggcccagaaaatacgtttatgtt 2144978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 375
Target Start/End: Original strand, 3373332 - 3373401
Alignment:
Q  307 atctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  3373332 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 3373401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 42771021 - 42770936
Alignment:
Q  85 atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgt 170  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  42771021 atgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgt 42770936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2723961 - 2723912
Alignment:
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2723961 ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 2723912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32520575 - 32520518
Alignment:
Q  158 aatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc-ccaatgtgaatcaa 214  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  32520575 aatctcttcccgtaatcgagagactcaatcttaatagtgtttctcgaatgtgaatcaa 32520518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 322 - 379
Target Start/End: Original strand, 34477378 - 34477435
Alignment:
Q  322 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| || |||||||||||    
T  34477378 ctgatacaaggtctatttttatagtaaaagtctcgcttaaaatctgtaacaaatctgc 34477435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 270
Target Start/End: Original strand, 2144706 - 2144815
Alignment:
Q  158 aatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc-ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgt-ttgttcccaagagacaaactctat 255  Q
    ||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |  | ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |    
T  2144706 aatctcttcccgcgaccaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtgttgttgccaagag-caaactc--t 2144800  T
Q  256 acaaaccctagtttt 270  Q
    |||||||||||||||    
T  2144801 acaaaccctagtttt 2144815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4898023 - 4897828
Alignment:
Q  3 gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||  || | ||||||||| ||||||||| || ||||  | ||| | ||||| | ||||||||| || |||    
T  4898023 gaacacaaaa-aatttgtttacccagttcagtcgaatactgacctagtatgggggagaaagcagcccactgttccgctataatgatgagtaactttacaa 4897925  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttcc-gcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtg 196  Q
     |||||| ||||   ||||||||||  |||||||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||| ||  |||||||||||| ||||    
T  4897924 tagagatatcaaatggttacaagaatcagtcttcaagcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagatactcaatcctaacagtg 4897828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 19806531 - 19806487
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  19806531 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 19806487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 32636992 - 32636948
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  32636992 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 32636948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4754292 - 4754187
Alignment:
Q  157 caatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctata 256  Q
    ||||||||||| || ||| || | |||||| ||||||||||||  ||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||    
T  4754292 caatctcttccagtgaccaagaggctcaattctaatagtgtttttcaaggtgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactc--ta 4754198  T
Q  257 caaaccctagt 267  Q
    |||||||||||    
T  4754197 caaaccctagt 4754187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23665125 - 23665083
Alignment:
Q  308 tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23665125 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 23665083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 350
Target Start/End: Original strand, 23793462 - 23793504
Alignment:
Q  308 tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23793462 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 23793504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 42238448 - 42238376
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaat--tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  42238448 aagaatttgtttacccagttcggt-ctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 42238376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 9353425 - 9353380
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  9353425 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 9353380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 17004053 - 17004008
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  17004053 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 17004008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25837991 - 25837914
Alignment:
Q  323 tgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    |||||||| || || ||||||| |||||  ||| || |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  25837991 tgatacaaagtttaaatttatattaaaagcatccctaaaaaattggaacaaatccagacccaaaaatacgtttatgtt 25837914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 31300689 - 31300644
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||    
T  31300689 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagag 31300644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 245
Target Start/End: Original strand, 34033711 - 34033797
Alignment:
Q  158 aatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc-ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagaga 245  Q
    ||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |  | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  34033711 aatctcttcccgcgaccaagagactcaatcctaatagtgtttctccaaggtaaatcaatc--ccaacgctagtgtttgttgccaagaga 34033797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 379
Target Start/End: Original strand, 34479739 - 34479796
Alignment:
Q  322 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | || |||||||| || |||||||||||    
T  34479739 ctgatacaaggtctatttttatagtaaaggtctcgcttaaaatctgtaacaaatctgc 34479796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 36932443 - 36932398
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  36932443 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 36932398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 533937 - 533893
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  533937 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 533893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 23667601 - 23667513
Alignment:
Q  13 gaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||| |||||| |||| |||| | || ||| | |||||| ||||| ||||    
T  23667601 gaatttgttggcccagttcggtccaatctgtcctagtctggggaagagagcagccctccgatccattatttgatgagtgacgttacaaa 23667513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 29748485 - 29748377
Alignment:
Q  158 aatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc-ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctata 256  Q
    ||||| ||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||| |||  ||||||| |||||||| |||||||   || ||| ||    
T  29748485 aatctattcccgtgaccaagagactcaatcctattagtgtttctccaagacgaatcaatcct--aaccctactgtttgttgccaagag---aattctcta 29748391  T
Q  257 caaaccctagtttt 270  Q
    ||||||||||||||    
T  29748390 caaaccctagtttt 29748377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 42428430 - 42428474
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  42428430 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 42428474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 124)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 400
Target Start/End: Original strand, 27306224 - 27306613
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtc 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  27306224 aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatc 27306323  T
Q  111 aatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 210  Q
    |||| ||| |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27306324 aatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 27306423  T
Q  211 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatc 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27306424 tcaaccctcaaaccctagtttttgttccaaagagacaaactctata-aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 27306522  T
Q  310 tcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27306523 tcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 27306613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 44868 - 44469
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  44868 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaagcagctatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 44769  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| || | |||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||    
T  44768 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacataattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaaaagactcaatcataatagtgtttcc 44669  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  44668 taaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 44569  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44568 ccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggtacaaatctgcacccaaaaatatgtttatgtt 44469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Original strand, 31435030 - 31435404
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||| || ||    
T  31435030 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttaca 31435129  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31435130 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 31435229  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  31435230 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 31435329  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaa 373  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31435330 ccccttctatctcaaagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaa 31435404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 2 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 35933 - 35539
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  35933 agaacacaaaaaaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaaagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 35834  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  35833 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 35734  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattct-aaaccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| || |||||||||| ||    
T  35733 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgtctttctgaacccttgtttcagcc 35634  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 395  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35633 ccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 35539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 4 - 400
Target Start/End: Original strand, 1049283 - 1049679
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||| |||| |||| |    
T  1049283 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-g 1049381  T
Q  104 agatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttccca 203  Q
    |||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  1049382 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttccca 1049481  T
Q  204 atgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacccc 302  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  1049482 aggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttattccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 1049581  T
Q  303 ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1049582 ctctatctcaaagtttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgtt 1049679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 13099458 - 13099832
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  13099458 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttaca 13099557  T
Q  100 aaa-gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  13099558 aaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtt 13099657  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttca 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13099658 tcccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttca 13099757  T
Q  298 accccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  13099758 accccctctatctcaaggtttactttgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 13099832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 42330981 - 42331355
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  42330981 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagaatagccctccgtttcactatataatgagtaactttacaa 42331080  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttccc--gtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  42331081 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 42331180  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttca 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  42331181 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttca 42331280  T
Q  298 accccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  42331281 gccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 42331355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 44724884 - 44724534
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  44724884 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaa 44724785  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  44724784 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 44724685  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  44724684 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 44724585  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||| |||||| | | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44724584 cccctatatctccaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 44724534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 4295918 - 4296270
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| || |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  4295918 gagaacacaaaagaatttgttcacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagatagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 4296017  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4296018 aagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 4296117  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||     
T  4296118 ccaaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag 4296217  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatac-aaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4296218 ccccctctatctcaaggtttacactgatacaaatgtctatatttatagtaaaa 4296270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 388
Target Start/End: Original strand, 40836728 - 40837114
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  40836728 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa 40836827  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40836828 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 40836926  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| ||    
T  40836927 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttctttcagcc 40837026  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaa 388  Q
    ||||| ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40837027 ccctcaatctccaaatttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaa 40837114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Original strand, 7471965 - 7472344
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  7471965 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 7472064  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7472065 agagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 7472164  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| ||    
T  7472165 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagcc 7472264  T
Q  301 ccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||    
T  7472265 ccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 7472344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38394290 - 38393911
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  38394290 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 38394191  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  38394190 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 38394091  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  38394090 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 38393991  T
Q  301 ccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  38393990 ccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 38393911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 443901 - 443528
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggggg-agagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  443901 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggggggagagagcagcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttata 443802  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  443801 aaagagatatcaatggattacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgttt 443702  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |     
T  443701 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaaccattgttttag 443602  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  443601 ctccctctatctcaaggtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 443528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21990455 - 21990084
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  21990455 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaa 21990356  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  21990355 aagagatatcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctactcaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttc 21990256  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |     
T  21990255 tcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcatagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttc-ag 21990157  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    |||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  21990156 cccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaattataactcataaatttggaac 21990084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 20137093 - 20137443
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  20137093 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttaca 20137191  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||    
T  20137192 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatcttaatagtgttt 20137291  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  20137292 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 20137391  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  20137392 ccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagccaatatttatagtaaaa 20137443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 3878881 - 3878477
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  3878881 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacatagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 3878782  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  3878781 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttac 3878682  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  3878681 caaggtgaatcaacccacaagccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcc 3878582  T
Q  301 ccctcta--tctcaaagcttactctgatacaaggtctat----atttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 394  Q
    |||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3878581 ccctctatctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatattaatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcaccc-aaaatacgtt 3878483  T
Q  395 tatgtt 400  Q
    | ||||    
T  3878482 tctgtt 3878477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20299764 - 20299383
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  20299764 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 20299665  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20299664 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 20299565  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctc-aaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa--ccttgtttcaa 298  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||     
T  20299564 caaggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccccttgtttcag 20299465  T
Q  299 ccccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||||    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| ||||||||||    
T  20299464 ccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatatggaacaaat 20299383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42223463 - 42223111
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  42223463 gagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcgatcaaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccatttcactatatgatgagtaacgttacaa 42223364  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||  ||| |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  42223363 aagagatatcaataggtttcaagaataagttttccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 42223264  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  42223263 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcat 42223164  T
Q  299 ccc-cctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||| | |||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  42223163 cccacatctatctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaa 42223111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 48457957 - 48457608
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  48457957 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 48457858  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  48457857 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 48457758  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  48457757 ctaggtgaatgaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 48457658  T
Q  301 ccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    |||||||    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  48457657 ccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagt 48457608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 21592127 - 21592457
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  21592127 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 21592226  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||     
T  21592227 aagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcgcgtaaccaagagactaaatcctaatagtgcttg 21592326  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||| |    
T  21592327 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctacttttgttgttgcatttctaaacctttgtttcagc 21592426  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaa 330  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21592427 cccctctatctcaaagtttacactgatacaa 21592457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 37412109 - 37412484
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| || ||    
T  37412109 gagaacacaaaagaatttattgatccagttcggtccaaattgacccagtctaggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaaccttaca 37412208  T
Q  100 aaa-gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  37412209 aaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 37412308  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttc 296  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  37412309 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttc 37412408  T
Q  297 aaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    | |||||| |||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  37412409 agccccctatatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaaatataactcataaatttggaac 37412484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 371
Target Start/End: Original strand, 7470007 - 7470382
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  7470007 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagggagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 7470106  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  7470107 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttca 7470206  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  7470207 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 7470306  T
Q  301 ccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    |||||||    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  7470307 ccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaac 7470382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11355563 - 11355213
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||  || ||| |||||||| ||||| |||||| |||    
T  11355563 gagaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctaggggagagagcagctctctgttccactatatgatgagaaacgttacaa 11355464  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    || |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11355463 aaaagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 11355364  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  11355363 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 11355264  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11355263 cccctctatctcaaggtttacactgatacaaagcctatatttatagtaaaa 11355213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20297666 - 20297287
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  20297666 agaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa 20297567  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20297566 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctatttctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 20297467  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  20297466 caaggtgaatcaaccctcaaaccctactgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgccattctaaacccttgtttcagcc 20297367  T
Q  301 ccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcact-taaaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||    |||||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||   |||||||||||||||    
T  20297366 ccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtccatatttttagtaaaagtataactcgtaaatttggaacaaat 20297287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20626343 - 20625967
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||    
T  20626343 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa 20626244  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  |||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  20626243 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 20626144  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  20626143 ccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 20626044  T
Q  300 cccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    ||||||||    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||||    
T  20626043 cccctctatctctctcaaagtttagtctgatagaaggtctatatttataataaacatataactcataaatttggaac 20625967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20630234 - 20629858
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||    
T  20630234 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa 20630135  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  |||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  20630134 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 20630035  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  20630034 ccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 20629935  T
Q  300 cccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    ||||||||    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||||    
T  20629934 cccctctatctctctcaaagtttagtctgatagaaggtctatatttataataaacatataactcataaatttggaac 20629858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20642653 - 20642277
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||    
T  20642653 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa 20642554  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  |||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  20642553 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 20642454  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  20642453 ccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 20642354  T
Q  300 cccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    ||||||||    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||||    
T  20642353 cccctctatctctctcaaagtttagtctgatagaaggtctatatttataataaacatataactcataaatttggaac 20642277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9681125 - 9680769
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||| || |||    
T  9681125 gagaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaactttacaa 9681026  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9681025 aagatatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 9680926  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaa-gagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaa 298  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  9680925 ccgaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgcccttctaaacccttgtttcaa 9680826  T
Q  299 ccccctctatctc----aaagcttac-tctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||||||    || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9680825 ccccctctatctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 9680769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3036027 - 3035646
Alignment:
Q  3 gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3036027 gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttgcaaaa 3035928  T
Q  103 gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatc---tcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    ||||  |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||  |||  |   ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  3035927 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3035828  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  3035827 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 3035728  T
Q  299 ccccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||||    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  3035727 ccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 3035646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24748900 - 24748549
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  24748900 gagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctaatctggaggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttaca 24748801  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||    
T  24748800 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcgtaatagtgttt 24748701  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||||     
T  24748700 cccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgtctttctaaacccttgtttcag 24748601  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||  |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24748600 ccccctctaagtcaaagtttacactgatacaatgtctatatttataataaaa 24748549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 39145970 - 39146321
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | |||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  39145970 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttagggaaaagagcagccccccgtttcactataatgatgagtaaccttaca 39146069  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  39146070 aaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 39146169  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||     
T  39146170 tccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctatctaaacccttgtttcag 39146269  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||| ||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39146270 ccccctccatctcaaggtttacactgatacagtgtctatatttatagtaaaa 39146321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18345845 - 18345466
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  18345845 agaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa 18345746  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18345745 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 18345646  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18345645 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtatttgttgcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaacc 18345546  T
Q  301 ccctctat----ctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||||||||    ||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  18345545 ccctctatctccctcaaagttcagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 18345466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25542830 - 25542448
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||| | |||||||| |||||||||||| |||| |    
T  25542830 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-g 25542732  T
Q  104 agatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttccca 203  Q
    |||  |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |    
T  25542731 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtctttcc-a 25542633  T
Q  204 atgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaacccc 302  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| | |||    
T  25542632 aggtgaatcaacccacaaaccctagtgttttttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacctttgtttc-agccc 25542534  T
Q  303 ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaa 388  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  25542533 ctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaataaatctacactcaaaaa 25542448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21680335 - 21679982
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccag---ttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttg 97  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||| ||||||||| ||     
T  21680335 gagaacaaaaaagtatttgttgacccagcagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagctctctgtttcactatatgatgagtaacctta 21680236  T
Q  98 caaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgt 197  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  21680235 caaaagagatatcattgggttacaagaataaatctcccgtctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 21680136  T
Q  198 ttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttc 296  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  21680135 ttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 21680036  T
Q  297 aaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    | ||||||||||||||| | |||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  21680035 agccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaa 21679982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28485867 - 28485491
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| | || || | |||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  28485867 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagg-agagagcaaccctctgattcattatatgatgagtaacgttacaaaag 28485769  T
Q  104 agatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttccca 203  Q
    |||  ||||||  ||||||||| || ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  28485768 agaaatcaatggattacaagaataaatctcccgcctaattatactcaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccaa 28485669  T
Q  204 atgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacccc 302  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28485668 aggtgaatcaacccgcaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaacccc 28485569  T
Q  303 ctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
     ||||    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  28485568 ttctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 28485491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28487857 - 28487478
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || || | |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28487857 agaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctctgattcactatatgatgagtaacgttacaaa 28487758  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28487757 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 28487658  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
     || |||||||||||| | |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||| |||||||||| ||    
T  28487657 aaaggtgaatcaacccacgaaccctagtgttagtttcgaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagcc 28487558  T
Q  301 ccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||    |||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||| ||||||||    
T  28487557 ccctctatctctctcaaagtttagcctgatacatggtctatatttataggaaaagtataactcataaatttagaacaaat 28487478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1850285 - 1849975
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  1850285 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 1850186  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||  |||  |||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| |    
T  1850185 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccagcctcttcccgtaagcaagaaactcaatcctaatagtgttttc 1850086  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  1850085 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 1849986  T
Q  301 ccctctatctc 311  Q
    |||||||||||    
T  1849985 ccctctatctc 1849975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 9679361 - 9679008
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  9679361 aacacaaaagaatttgttgacccagtctggtccaaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaag 9679262  T
Q  104 agatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttccca 203  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9679261 agatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 9679162  T
Q  204 atgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattcta-aaccttgtttcaaccc 301  Q
    | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||| |||    
T  9679161 aggtgaatcaatcctcaaa-cctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctagatccttgtttcagccc 9679063  T
Q  302 cctcta----tctcaaagcttac-tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaa 351  Q
    ||||||    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9679062 cctctatctctctcaaagtttacatctgatacaagatctatatttatagtaaaaa 9679008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21678361 - 21678021
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtc 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||  | |||||||||||| || |||||| || ||||||| || ||    
T  21678361 aagaatttgttgtcccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagcccactgtttcactatatgataagtaaccttacaaaagatatatc 21678262  T
Q  111 aatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 210  Q
    |||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21678261 aatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatgctacccaaagtcccaatatcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 21678162  T
Q  211 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  21678161 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgatgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 21678062  T
Q  310 tcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21678061 tcaaggtttacattgatacaatatctatatttatagtaaaa 21678021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Original strand, 31155896 - 31156271
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||  ||||||| |||| ||||    
T  31155896 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataggatgagtaccgttacaaa 31155995  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||    
T  31155996 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtacccaagagactccaatcctaatagtgtttc 31156094  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  31156095 ccaaggtgaatcaacccacaaatcctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 31156194  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||||||||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||| |||  || | |||||||||||||||    
T  31156195 cccctctatctcaaagtttgccttgatacaagctctatatttatagtaaaagtatagctcataaatttggaacaaat 31156271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40946632 - 40946283
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  40946632 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 40946533  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |    
T  40946532 agagaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttc 40946433  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  40946432 caaagtaaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 40946333  T
Q  301 ccctct----atctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    ||||||     |||||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||    
T  40946332 ccctctgtccctctcaaagtttgctatgaaacaaggtttatatttatagt 40946283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Original strand, 43253502 - 43253884
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||| || | | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  43253502 agaacacaaaagaatttattgacccagttcggtctaaattgacctagtctgagggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 43253601  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||   ||  ||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  43253602 agagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctctttccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcc 43253701  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattct-aaaccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  43253702 caaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaaccttgtttcagcc 43253800  T
Q  301 --------ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
            | |||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  43253801 ctctttctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 43253884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 311
Target Start/End: Original strand, 1046912 - 1047219
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||| |||| |||| |    
T  1046912 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-g 1047010  T
Q  104 agatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttccca 203  Q
    |||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1047011 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 1047110  T
Q  204 atgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacccc 302  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||||| ||||    
T  1047111 aggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagcccc 1047210  T
Q  303 ctctatctc 311  Q
    |||||||||    
T  1047211 ctctatctc 1047219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Original strand, 7351637 - 7352018
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  7351637 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 7351736  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  7351737 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 7351835  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  7351836 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaagcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 7351935  T
Q  300 cccctcta------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||||||||      |||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  7351936 cccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtttatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 7352018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 76 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11757460 - 11757153
Alignment:
Q  76 cactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccg 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||     
T  11757460 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 11757361  T
Q  176 agtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctc-aaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtag 274  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11757360 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 11757261  T
Q  275 ttgccattctaaa--ccttgtttcaaccccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttg 367  Q
    ||| |||||||||  |||||||||| |||||||||    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||    
T  11757260 ttgtcattctaaaccccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttg 11757161  T
Q  368 gaacaaat 375  Q
    ||||||||    
T  11757160 gaacaaat 11757153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 116 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26804762 - 26804479
Alignment:
Q  116 gttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaac 215  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26804762 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 26804663  T
Q  216 cctcaaacccta---gtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctc 311  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26804662 cctcaaaccctactagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 26804563  T
Q  312 aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    |||| ||||||    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26804562 aaagtttactc----acaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcaccc-aaaatacgtttctgtt 26804479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24258773 - 24258423
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaattt-gttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatta----tgagtaacgt 95  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | | |||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||| ||||||| ||    |||||||| |    
T  24258773 gagaacacaaaagaattttgttcatctaattcggtccaaattgacctagtctgaaagagagagcagccctccgttccactataataatgatgagtaactt 24258674  T
Q  96 tgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagt 195  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||   |||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  24258673 tacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagttttccgcctaattctatccaaagtctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagt 24258574  T
Q  196 gtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtt 294  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  24258573 gttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtt 24258474  T
Q  295 tcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatag 345  Q
    ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  24258473 tcagccccctctatctcaatgtttactctgatacaaaacctatatttatag 24258423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 7092198 - 7092431
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| || ||||    
T  7092198 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacattacaaa 7092296  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  7092297 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttcc 7092396  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 236  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092397 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 7092431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Original strand, 7349262 - 7349639
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  |||||||||||    |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  7349262 agaacacaaagaaatttgttgac----ttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 7349357  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  7349358 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 7349456  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| |    
T  7349457 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccctgtttcagc 7349556  T
Q  300 cccctcta------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||||||||      |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  7349557 cccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 7349639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25276435 - 25276096
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||||||||            | ||||| ||||||| | ||||||||| || ||    
T  25276435 gagaacacaaaagaatttgtttaaccagttcggtccatattgacttagtctgggg------------agccgttccactataatgatgagtaactttaca 25276348  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  25276347 aaagagatatcaatggtttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25276248  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||| |     
T  25276247 cccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaattattgttttag 25276148  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  25276147 ccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagcatatatttatagtaaaa 25276096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 33 - 350
Target Start/End: Original strand, 27832648 - 27832968
Alignment:
Q  33 gttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtc 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||| || || ||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  27832648 gttcaaattgacctagtctgggggagagagaagccctccatttcactataatgatgagtaactttacagaagagatatcaatgggttacaagaataagtc 27832747  T
Q  132 ttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgt 231  Q
    | |||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27832748 tcccgcctaattttacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt 27832847  T
Q  232 ttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac-cccctctatctcaaagcttactctgataca 329  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| || |||| |||||||||| | || ||||||| ||| | || ||||||||||    
T  27832848 atgttgccaagagacaaactctatacaaaccttagttctgttgttgcctttttaaacccttgtttcagctccactctatcacaaggtttgctctgataca 27832947  T
Q  330 aggtctatatttatagtaaaa 350  Q
        |||||||||||||||||    
T  27832948 caacctatatttatagtaaaa 27832968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 7094445 - 7094678
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| || ||||    
T  7094445 agaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacattacaaa 7094544  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  7094545 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaattaagagactcaatcctaatagtgtttcc 7094644  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 236  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7094645 caaggtgaatcaaccctcaaacccta-tgtttgtt 7094678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 57 - 400
Target Start/End: Original strand, 22828672 - 22829018
Alignment:
Q  57 agagagtagccatccgtttcactatatta-tgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagct 155  Q
    |||||| |||| || ||||||||||| || |||||||  || |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||      
T  22828672 agagagcagccctctgtttcactataataatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 22828771  T
Q  156 ccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctat 255  Q
     |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  22828772 tcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttctaatctgaatcaaccatcaaactctagtgtttgttttcaagagataaactctat 22828871  T
Q  256 acaaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatat 354  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  22828872 acaaaccttagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctcaaggtttactcggatacaaagcctatatttatagtaaaagtat 22828971  T
Q  355 cactta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    | || | |||  ||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||    
T  22828972 ccctcataaaactggaacaaatctaggcccgaaaatacgtttctgtt 22829018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 188 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18567731 - 18567545
Alignment:
Q  188 ctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa 287  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18567731 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa 18567632  T
Q  288 -ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaa 373  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18567631 cccttgtttcagccccttctatctcaaagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaa 18567545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 104 - 367
Target Start/End: Original strand, 22251637 - 22251893
Alignment:
Q  104 agatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttccca 203  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||        |||||    
T  22251637 agatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccta--------tccca 22251728  T
Q  204 atgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttgtttcaacccc 302  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| || |    
T  22251729 aggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagcctc 22251828  T
Q  303 ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttg 367  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  22251829 ctctatctcaaagtttactctgattcaaggtttatatttatagtaaaagtgtcgcttaaaatttg 22251893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7188805 - 7188447
Alignment:
Q  41 tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcct 139  Q
    |||| ||| |||||| |||||| |||| |||||| ||||||| | |||| |||| || ||||||| || |||||| |||| || || |||||| |||| |    
T  7188805 tgacatagactggggaagagagcagccttccgttccactataatgatgaataactttacaaaagaaatatcaatgggttataaaaataagtctcccgctt 7188706  T
Q  140 aattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccc 239  Q
    ||||||||| ||||   |||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||||| ||    
T  7188705 aattctacccaaagtctcaatctattcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgcc 7188608  T
Q  240 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctata 338  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  7188607 aagag-caaaccctatacaaaccctatttttattgttgac-ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctata 7188510  T
Q  339 tttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    |||||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  7188509 tttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatctcagcccaaaaatacgtttatgtt 7188447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 349
Target Start/End: Original strand, 24817377 - 24817682
Alignment:
Q  41 tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcct 139  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24817377 tgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagacatcaatgagttacaagaataagtctcccgcct 24817476  T
Q  140 aattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccc 239  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |     
T  24817477 aattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatactgctttccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgca 24817573  T
Q  240 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttac-tctgatacaaggtctat 337  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| | ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  24817574 aagag-caaactctatacaaaccctagttctcttgttgac-ttctaaacccttgtttc-agcccctctatctcaaggtttacatctgatacaaggtctat 24817670  T
Q  338 atttatagtaaa 349  Q
    ||||||| ||||    
T  24817671 atttatattaaa 24817682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 377
Target Start/End: Original strand, 20091580 - 20091903
Alignment:
Q  50 ctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctacca 149  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||   ||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  20091580 ctgggggagagagcagccctccgttccactatg--atgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 20091677  T
Q  150 aaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaa 249  Q
    ||||   |||||||||||||| ||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||| | |||||| |||| || ||||    
T  20091678 aaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagatttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctaatctttgttgccaatag-caaa 20091774  T
Q  250 ctctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttg-tttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagta 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20091775 ctctatacaaaccctagttttgt-gttgcc-tccgaaacccttgttttcagccccctctatctcaaggtttactctgataaaaagtctatatttatagta 20091872  T
Q  348 aaaatatcactta-aaatttggaacaaatct 377  Q
    ||| |||| || | ||| |||||||||||||    
T  20091873 aaagtatccctcataaaattggaacaaatct 20091903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 24813482 - 24813748
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgc 98  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||| | ||||||||| || |    
T  24813482 gagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagaaagcagccatccgctccactataatgatgagtaactttac 24813580  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    ||| ||||| | |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| |    
T  24813581 aaaggagatataaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatcacttcccgtcaccaagagactcaatcctaatagtgct 24813680  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttt 270  Q
    |||||| ||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24813681 tcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttcttgccaagag-caaactctatacaaaccctagtttt 24813748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38396938 - 38396713
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  38396938 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagaagccctccgatccactatatgatgagtaaagttac-aa 38396840  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||    
T  38396839 agagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaacagtgtttcc 38396740  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctag 228  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||    
T  38396739 caaggtgaatcaacccacaaaacctag 38396713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 159 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22392608 - 22392378
Alignment:
Q  159 atctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctataca 258  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||    
T  22392608 atctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaatag-caaattctataca 22392513  T
Q  259 aaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcac 357  Q
    |||||||||||  |        || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  22392512 aaccctagtttgat--------ttataaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgc 22392421  T
Q  358 ttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  22392420 ttacaatttggaacaaatctgcactgaaaaatacatttctgtt 22392378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24465829 - 24465500
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaa 112  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||| | ||||||| | || ||||||| || ||||    
T  24465829 aatttgtttactcagttcggttcatattgatctagtctgggggagagagcagtcacccgtttcattataatgatgagta-ctttacaaaagacatatcaa 24465731  T
Q  113 tgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatc 212  Q
    ||||||| ||||| || ||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24465730 tgagttaaaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatc 24465631  T
Q  213 aaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctc 311  Q
    ||   |  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |        ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  24465630 aa---ttcaaccctagtgtttgttgccaagag-caaacgctatacaaaccctagtttgat--------ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 24465543  T
Q  312 aaagcttac-tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaata 353  Q
    || | |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24465542 aaggtttacatctgatacaaagtctatatctatagtaaaaata 24465500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22137381 - 22137184
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  22137381 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 22137283  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  22137282 agagaaatcaatgggttacaag-aatagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22137184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40552408 - 40552211
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  40552408 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 40552310  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  40552309 agagaaatcaatgggttacaag-aatagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40552211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2935560 - 2935374
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | |||||||  |||||    
T  2935560 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaat 2935462  T
Q  114 gagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  2935461 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 2935374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22108370 - 22108173
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  22108370 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 22108272  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  22108271 agagaaatcaatgggttacaag-aatagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22108173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40550130 - 40549933
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  40550130 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 40550032  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  40550031 agagaaatcaatgggttacaag-aatagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40549933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22394028 - 22393880
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactat-attatgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  | || ||||||||||||| || ||||||||| || ||    
T  22394028 gagaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagaacaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttaca 22393929  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctacc 148  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22393928 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacc 22393880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1606671 - 1606486
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | |||||||  |||||    
T  1606671 aatttgttgacccagttcggtccaatctgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaat 1606573  T
Q  114 gagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    | |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  1606572 gggttacaag-aatagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 1606486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Original strand, 9027191 - 9027376
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||| | |||||||||||| | |||||||  |||||    
T  9027191 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaat 9027289  T
Q  114 gagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    | |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  9027290 gggttacaag-aatagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 9027376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26295743 - 26295600
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactat-attatgagtaacgttgcaaaagagatgt 109  Q
    ||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||| || ||||||||| || |||||||||| |    
T  26295743 aagaatttgtttatccagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatat 26295644  T
Q  110 caatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaag 153  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  26295643 caatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaag 26295600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11081815 - 11081540
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgc 98  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || | ||   ||||||||| || |    
T  11081815 gagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatattgacctagtctgggggagagagcaaccatccgttccattttaaagatgagtaactttac 11081717  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgag--ttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctac-caaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatag 194  Q
    | ||||||| ||||  ||  |||||||||  |||||||   ||||||| ||| ||||| | | ||||||||||||| | | || ||||||||||||||||    
T  11081716 acaagagatatcaaaaagggttacaagaattagtcttcaaacctaattttacacaaaatc-ctaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatag 11081618  T
Q  195 tgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttg 277  Q
    |||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||   || ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  11081617 tgtttcccaaagtgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgttgccaagag---aattctctacaaaccctagttttgttgttg 11081540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6332514 - 6332283
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  || | |||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||| | |    
T  6332514 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctaggggagagaacagtcttccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatta 6332415  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttcc-gcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 210  Q
    | | |||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||  || ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  6332414 aagggttacaagaataagtcttcaagcctaattctacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttttccaaactgaa 6332315  T
Q  211 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagag 244  Q
    ||||  ||| || ||||||||||||| |||||||    
T  6332314 tcaa-tctc-aatcctagtgtttgttgccaagag 6332283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 11759431 - 11759371
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11759431 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 11759371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 257 - 371
Target Start/End: Original strand, 7094662 - 7094782
Alignment:
Q  257 caaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctc----aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaa 351  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  7094662 caaaccctatgtttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttataataaaca 7094761  T
Q  352 tatcactta-aaatttggaac 371  Q
    ||| ||| | |||||||||||    
T  7094762 tataactcataaatttggaac 7094782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 45366526 - 45366451
Alignment:
Q  325 atacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  45366526 atacaaggtttatatttatagtaaaagtaacccttaaaatttggaacaaatctgcactgaaaaatacgtttctgtt 45366451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 26804815 - 26804762
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggg 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26804815 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctggg 26804762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 371
Target Start/End: Original strand, 7092414 - 7092535
Alignment:
Q  257 caaaccctagt-tttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctc----aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7092414 caaaccctagtgtttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctccatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaac 7092513  T
Q  351 atatcactta-aaatttggaac 371  Q
    |||| ||| | |||||||||||    
T  7092514 atataactcataaatttggaac 7092535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Original strand, 16297018 - 16297222
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| || ||||||||| ||| | |||| |||||| |||||||||| |||  ||||||  |||||| | ||||||||| ||||||||||||| | |    
T  16297018 aatttgtttacacagttcggtccaatactgacatagtctaggggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaactttgcaaaagagatatta 16297117  T
Q  112 at-gagttacaagaaaaagtcttccgc-ctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtga 209  Q
    |  | ||||||||||  | |||||    ||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16297118 aaagggttacaagaatcaatcttcaaatctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtga 16297217  T
Q  210 atcaa 214  Q
    |||||    
T  16297218 atcaa 16297222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1606472 - 1606399
Alignment:
Q  303 ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  1606472 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 1606399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11084544 - 11084438
Alignment:
Q  137 cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 236  Q
    ||||||| |||| |||| || ||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||| ||||||||    
T  11084544 cctaattttacccaaagttcgaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaa-tctc-aaccctattgtttgtt 11084447  T
Q  237 cccaagaga 245  Q
     ||||||||    
T  11084446 gccaagaga 11084438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 38396377 - 38396316
Alignment:
Q  245 acaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctc 305  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  38396377 acaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 38396316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 3677285 - 3677213
Alignment:
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||    
T  3677285 cccctctatctccaagtttactctgattcaagatctatatttatagtaaaaacataactcataaatttggaac 3677213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26210710 - 26210501
Alignment:
Q  137 cctaattctaccaaaagctcc-aatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc-ccaatgtgaatcaaccctca-aaccctagtgttt 233  Q
    |||||||||||| ||||  || |||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  26210710 cctaattctaccgaaagtcccgaatctctttccgttaccaagagactcaatcctaatagtatttctccaaggtgaatcaa---tcacaaccctagtg-tt 26210615  T
Q  234 gttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattct-aaaccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttac-tctgatacaag 331  Q
    ||| |||||||   || ||| |||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||| | |||| | |||||||||    
T  26210614 gttgccaagag---aattctctacaaaccctagttttgaggttg-gattctaaaaccttgtttcctccccc-ctctctcaaggtttacatttgatacaag 26210520  T
Q  332 gtctatatttatagtaaaa 350  Q
     |||||||||||| |||||    
T  26210519 ttctatatttatactaaaa 26210501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 355
Target Start/End: Original strand, 30906327 - 30906389
Alignment:
Q  293 tttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatc 355  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30906327 tttcagccccctctatctcaagatttactcttatacaaggtctatatttatagcaaaagtatc 30906389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38396269 - 38396215
Alignment:
Q  322 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  38396269 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 38396215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Original strand, 2360975 - 2361016
Alignment:
Q  20 ttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2360975 ttgacccagttcggttcaacttgacctaatctgggggagaga 2361016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 82
Target Start/End: Original strand, 6067183 - 6067264
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata 82  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||| |||| ||| | ||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  6067183 agaacacgagagaatttgtttacccagtccggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagctctccgtttcactata 6067264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 6349003 - 6348918
Alignment:
Q  85 atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgt 170  Q
    ||||||||  || |||||||||| |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||| |||||||    
T  6349003 atgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatcttttcccgt 6348918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 9190101 - 9190056
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  9190101 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagag 9190056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 34
Target Start/End: Original strand, 22251570 - 22251602
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggt 34  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251570 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggt 22251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 27347985 - 27347941
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  27347985 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 27347941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 211
Target Start/End: Original strand, 40281476 - 40281572
Alignment:
Q  116 gttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaat 211  Q
    |||||||||| ||||||||   |||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  40281476 gttacaagaataagtcttcaaacctaattccaccaaaagtctcaatctcttcccgtgaccaacagactcaatcctaacggtgtttcccaaggtgaat 40281572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 41317434 - 41317478
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  41317434 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 41317478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6348903 - 6348778
Alignment:
Q  221 aaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttg-tttcaaccccctctatctcaaagctt 318  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  ||  | ||||||| ||||| |||||  || ||||||||||| | ||    
T  6348903 aaccctaatgtttgttgccaagag-caaactcgatacaaaccctagttttcttttttac-ttctaaacccttgttttcagtcctctctatctcaatgttt 6348806  T
Q  319 ac-tctgatacaaggtctatatttatag 345  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||    
T  6348805 acatctgatacaaggtttatatttatag 6348778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21369685 - 21369642
Alignment:
Q  156 ccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21369685 ccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 21369642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 325 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 42006545 - 42006471
Alignment:
Q  325 atacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||||||||    
T  42006545 atacacggtttatatttatagtaaaagtaacccttaaaatatggaacaaatcttca-ctgaaaatacgtttatgtt 42006471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 2075303 - 2075231
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaat--tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  2075303 aagaatttgtttacccagttcggt-ctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctttccgttccactata 2075231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 20284093 - 20284143
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagcc 67  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20284093 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 20284143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22108158 - 22108116
Alignment:
Q  308 tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108158 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 22108116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22137169 - 22137127
Alignment:
Q  308 tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137169 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 22137127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 25410318 - 25410246
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaat--tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  25410318 aagaatttgtttacccagttcggt-ctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 25410246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 34546874 - 34546946
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaat--tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  34546874 aagaatttgtttacccagttcggt-ctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 34546946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 35960820 - 35960870
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagcc 67  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  35960820 ttgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 35960870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40549918 - 40549876
Alignment:
Q  308 tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40549918 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 40549876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40552196 - 40552154
Alignment:
Q  308 tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40552196 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 40552154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1849943 - 1849894
Alignment:
Q  327 acaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  1849943 acaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 1849894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 2580394 - 2580439
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  2580394 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagag 2580439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6049019 - 6048909
Alignment:
Q  157 caatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc-ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctat 255  Q
    |||| ||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||   || ||| |    
T  6049019 caatatcttctcgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaatcc-caaa-cctagtgtttgttgccaagag---aattcttt 6048925  T
Q  256 acaaaccctagttttg 271  Q
    ||||||||||||||||    
T  6048924 acaaaccctagttttg 6048909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 9185258 - 9185213
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||    
T  9185258 ttgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagag 9185213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 199
Target Start/End: Original strand, 12310157 - 12310198
Alignment:
Q  158 aatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  12310157 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 12310198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 21983288 - 21983333
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  21983288 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 21983333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 44848777 - 44848732
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  44848777 ttgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagag 44848732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 299 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6332231 - 6332176
Alignment:
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatc 355  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  6332231 ccccctctctctcaagg-ttactctgatacaagttttatatttatagtaaaagtatc 6332176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 8153510 - 8153466
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||    
T  8153510 ttgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 8153466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 12097867 - 12097911
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  12097867 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 12097911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 14069833 - 14069877
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||    
T  14069833 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatcttggggagaga 14069877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 14379861 - 14379905
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||    
T  14379861 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagaga 14379905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 18126812 - 18126768
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  18126812 ttgttgacccaggtcggtcaaacttgacctagtctgggggagaga 18126768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 30814604 - 30814560
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  30814604 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 30814560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 31732969 - 31733013
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  31732969 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 31733013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 41649011 - 41649055
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  41649011 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 41649055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 43864412 - 43864368
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  43864412 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggagagaga 43864368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 48489599 - 48489555
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  48489599 ttgtttacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 48489555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 74)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 9020256 - 9019857
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  9020256 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaactttacaa 9020157  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9020156 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 9020057  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | |    
T  9020056 ccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgattgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagc 9019957  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgt 399  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  9019956 cccctctatctctcagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcaccc-aaaatacgtttctgt 9019858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 11983013 - 11983413
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||    
T  11983013 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa 11983112  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11983113 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 11983212  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||| |    
T  11983213 ccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcctttgtttcagc 11983312  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgt 399  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  11983313 cccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgtttaaaatttgaaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgt 11983412  T
Q  400 t 400  Q
    |    
T  11983413 t 11983413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 14507161 - 14507559
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || |||| |||| ||||    
T  14507161 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgataagtatcgttacaaa 14507260  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14507261 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 14507359  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | ||    
T  14507360 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagcc 14507459  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  14507460 ccctctatctcaaagtttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctacactcaaaaatatgtttctgtt 14507559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13057525 - 13057174
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  13057525 gagaacacaaaagaatttgttgaccgagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagtagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttaca 13057426  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  13057425 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgttt 13057326  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||     
T  13057325 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttcttgcctttctaaacccttgtttcag 13057226  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13057225 ccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 13057174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 4 - 400
Target Start/End: Original strand, 30728811 - 30729212
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| || ||||||    
T  30728811 aacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccttccgttccactataatatgagtaactttacaaaag 30728910  T
Q  104 aga----tgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||    | |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  30728911 agaaagatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccagcctcttcccgtaaccaagagagtcaatcctaatagtgttt 30729010  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattcta-aaccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||| | | ||||||||||     
T  30729011 cccaaggtgaatcaaccctcaaatcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttgttgtctttcgatacccttgtttcag 30729110  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 398  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30729111 ccccctctatctcaaggtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagtaccgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttctg 30729210  T
Q  399 tt 400  Q
    ||    
T  30729211 tt 30729212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 15541124 - 15541519
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| |||  || |||||||||||| |||| |||| || |||    
T  15541124 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattaacctagtctggaggagagagcagctttctgtttcactatatgatgaataactttacaa 15541223  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||||    
T  15541224 aagagatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatcctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaattctaatagtgtttc 15541323  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| |    
T  15541324 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcctttctaaacccttgtttcagc 15541423  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 395  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15541424 cccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtgtaacttaaaatttggaacaaatctgcacctaaaaatatgttt 15541519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 346
Target Start/End: Original strand, 1230234 - 1230579
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  1230234 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 1230333  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  1230334 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccaataaccaagagagtcaatcctaatagtgtttcc 1230433  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1230434 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaacc 1230533  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  1230534 ctctctatctcaaagtttgctatgatacaaggtctatatttatagt 1230579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 32280327 - 32279927
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||   ||||||||| || ||    
T  32280327 gagaacacaagagaattttttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactataacgatgagtaactttaca 32280228  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  32280227 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctgaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 32280128  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||||||| |    
T  32280127 cccaaggtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttttaaacccttgtttc-a 32280029  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 398  Q
     |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32280028 gcccctctatctccaagtttactatgatacaaggtctatatatataggaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatacatttatg 32279929  T
Q  399 tt 400  Q
    ||    
T  32279928 tt 32279927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 2 - 346
Target Start/End: Original strand, 28241306 - 28241651
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28241306 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaa 28241405  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28241406 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 28241505  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  28241506 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 28241605  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28241606 ccctctatctctaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 28241651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 395
Target Start/End: Original strand, 15532674 - 15533060
Alignment:
Q  9 aaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatg 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||| | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||     
T  15532674 aaaagaatttgttgacctagttcagtcaaaattgacctagtctaggg-atagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagata 15532772  T
Q  109 tcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtg 208  Q
    |||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  15532773 tcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtg 15532872  T
Q  209 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctcta 307  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15532873 aatcaaccctcaaaccctattgtttgttccaaagaaacaaactttatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctcta 15532972  T
Q  308 tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 395  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15532973 tctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataacttaaaatttggaacaaatctgcacctaaaaatatgttt 15533060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 64 - 395
Target Start/End: Original strand, 15530170 - 15530501
Alignment:
Q  64 agccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctc 163  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||  |||||||    
T  15530170 agccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg-gttacaagaataagtctcccgcctaattcaacccaaagcctcaatctc 15530268  T
Q  164 ttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccc 263  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530269 ttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccc 15530368  T
Q  264 tagttttgtagttgccattctaa-accttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaa 362  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15530369 tagttttgttgttgccattctaagcccttgcttcagccccctctatctcccagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaa 15530468  T
Q  363 atttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 395  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15530469 atttggaacaaacctgcacccaaaaatatgttt 15530501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 344
Target Start/End: Original strand, 14458752 - 14459093
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  14458752 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 14458851  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14458852 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 14458951  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| ||    
T  14458952 caa--ggaatcagccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagcc 14459049  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttata 344  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14459050 ccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttata 14459093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 3629849 - 3630198
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||||||||| |||||| || |||    
T  3629849 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggg-agagagcagccctcagtttcactatattattagtaactttacaa 3629947  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  3629948 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttc 3630047  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| |    
T  3630048 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccgatgtttcagc 3630147  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  3630148 cccctctatctcaagttttacattgatacaatgtctatatttatagtaaaa 3630198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3390710 - 3390354
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || | ||||||||| || ||    
T  3390710 gagatcacaaaagaatttgttgacccaatttggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactgtaatgatgagtaactttaca 3390611  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  3390610 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3390511  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  3390510 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagaaaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 3390411  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatc 355  Q
    |||| |||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3390410 ccccgtctatctcaaggtttatactgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatc 3390354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13040085 - 13039734
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  13040085 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttaca 13039986  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  13039985 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacgcaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgttt 13039886  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||     
T  13039885 tccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttcttgcctttctaaacccttgtttcag 13039786  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    || ||| |||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13039785 cctcctatatctcaaggtttacactgatacaatatctatatttatagtaaaa 13039734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25477612 - 25477254
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt--------atgagtaa 92  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||| |        | ||||||    
T  25477612 gagaatacaaaagaatttgttgacccatttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaacgagtaa 25477513  T
Q  93 cgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaat 192  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||    
T  25477512 cgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaat 25477413  T
Q  193 agtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-cctt 291  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  25477412 agtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 25477313  T
Q  292 gtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25477312 gtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttacagtaaaa 25477254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 3233709 - 3234064
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttc-----aaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||||    
T  3233709 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagttcggtcaaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccgtttcactatacggtgagtaacgt 3233808  T
Q  96 tgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagt 195  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3233809 tacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 3233908  T
Q  196 gtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgt 293  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  3233909 gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaaagagacaaactatatacaaaccttagttttgttgttgtctttctaaatccttgt 3234008  T
Q  294 ttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||| |||||||||||| || | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3234009 ttcagccccctctatcttaaggtttacactgatacaa-gtctatatttatagtaaaa 3234064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 349
Target Start/End: Original strand, 3631926 - 3632271
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| || |||||    
T  3631926 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg--acagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 3632023  T
Q  103 gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttccc 202  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  3632024 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaacaaagagactcaatcctaatagtgtttccc 3632123  T
Q  203 aatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccc 301  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  3632124 aagatgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaactc 3632223  T
Q  302 cctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 349  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3632224 cctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 3632271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30967530 - 30967152
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  30967530 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 30967431  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| | ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30967430 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtttcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 30967331  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  30967330 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcc 30967231  T
Q  301 ccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||    |||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  30967230 ccctctatctctctcaaagtttagcct-atacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 30967152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Original strand, 2628871 - 2629250
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  2628871 agaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaccgttacaaa 2628970  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| || |  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2628971 -gagaaatcaatgggttacaagaataaattctccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 2629069  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  2629070 caaggtgaatcaacccttaaaacctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 2629169  T
Q  301 cc-----ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||     |||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  2629170 cctctatctctctctcaaagtttaacatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactaataaatttggaacaaat 2629250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 375
Target Start/End: Original strand, 30034590 - 30034967
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| | | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  30034590 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacccagtctgggggagagagcagccctccgatccgctatatgatgagtaacgttacaaaag 30034689  T
Q  104 agatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttccca 203  Q
    |||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  30034690 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccttaaccaattgactcaatcctaatagtgtttccca 30034789  T
Q  204 atgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacccc 302  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||||||| | | ||    
T  30034790 aggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaactctaattttgttgttgcctttctaaacccttgttttagctcc 30034889  T
Q  303 ctctatctc----aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||||    |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  30034890 ctctatctctcttaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 30034967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 311
Target Start/End: Original strand, 4816216 - 4816526
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  4816216 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa 4816315  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  4816316 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttc 4816415  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  4816416 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 4816515  T
Q  301 ccctctatctc 311  Q
    |||||||||||    
T  4816516 ccctctatctc 4816526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 346
Target Start/End: Original strand, 19704552 - 19704905
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  19704552 agaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa 19704651  T
Q  102 -agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgttt 199  Q
     |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  19704652 gagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgttt 19704751  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  19704752 cccaaggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 19704851  T
Q  299 cccc------ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    ||||      |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19704852 ccccctccatctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 19704905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Original strand, 12195500 - 12195875
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  12195500 agaacacaaagaaacttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 12195599  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| |||  |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  12195600 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgattaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 12195698  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |    
T  12195699 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagc 12195798  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  12195799 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 12195875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Original strand, 20915351 - 20915721
Alignment:
Q  12 agaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||| |||| |||| ||||  |||    
T  20915351 agaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatca 20915449  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 210  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20915450 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccgaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 20915549  T
Q  211 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctcta-- 307  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||      
T  20915550 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 20915649  T
Q  308 tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    ||||  |  |||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| || |||||||||||    
T  20915650 tctctcaatttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 20915721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26065311 - 26065005
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| | |||||||| | |||||||||| |||    
T  26065311 gagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatataacgagtaacgttacaa 26065213  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    | |||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26065212 a-gagaagtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 26065114  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  26065113 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt---ttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagc 26065017  T
Q  300 cccctctatctc 311  Q
    ||||||||||||    
T  26065016 cccctctatctc 26065005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26085280 - 26084974
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| | |||||||| | |||||||||| |||    
T  26085280 gagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatataacgagtaacgttacaa 26085182  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    | |||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26085181 a-gagaagtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 26085083  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  26085082 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt---ttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagc 26084986  T
Q  300 cccctctatctc 311  Q
    ||||||||||||    
T  26084985 cccctctatctc 26084974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 127 - 388
Target Start/End: Original strand, 19227518 - 19227780
Alignment:
Q  127 aagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccct 226  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19227518 aagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 19227617  T
Q  227 agtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctga 325  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| || ||||||    
T  19227618 agtgtttgatccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttgagccccctttatctcaaagtttgctctga 19227717  T
Q  326 tacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaa 388  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227718 tacaagatctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaa 19227780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 350
Target Start/End: Original strand, 24338435 - 24338782
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaa 102  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||| |||||||||||||| | ||||||||| || |||||    
T  24338435 aacacaaaaatatttgtttacctagttcggtccaaattgacatagtctgggggagagc--agccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 24338532  T
Q  103 gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttccc 202  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||    |||||||| || ||||| |  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  24338533 gagatatcaatgggttacaagaataagtcttctgactaattctacccaaagtcttaatctctttccataaccaaaagactcaatcttaatagtgttttcc 24338632  T
Q  203 aatgtgaatcaaccctcaaaccc-tagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaacc 300  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  24338633 aaggtaaatcaaccctcaaacccctagtgtttgttgctaagacacaaactttatgcaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 24338732  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24338733 ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 24338782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 311
Target Start/End: Original strand, 26932546 - 26932857
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaa-tttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| | || |||  | |||||||| ||||||  |||| |||    
T  26932546 agaacacaaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaa 26932645  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgttt 199  Q
    | ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  26932646 a-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgttt 26932744  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaa-accttgtttcaa 298  Q
    | ||| |||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||  |||||||||||    
T  26932745 ctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgcttctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcttttctaagcccttgtttcaa 26932844  T
Q  299 ccccctctatctc 311  Q
    |||||||||||||    
T  26932845 ccccctctatctc 26932857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 12161542 - 12161888
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| | ||| |||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||    
T  12161542 gagaacacaaaataatttgttgattcagttcggtccaaattaacctagtttaggg-agagaacagccatccattttactatatgatgagtaaccttacaa 12161640  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| || ||| || | ||||| |||| ||||   |||||||||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||    
T  12161641 aagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccacttaattatacctaaagtctcaatctcttcccgtaaccaatagactcgatcttaatagtgtttc 12161740  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||| |     
T  12161741 ccaacgtgaaacaaccctcaaaccctagtgtttgttcc--agagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttc-ag 12161837  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||| |||||||| | ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12161838 cccctttatctcaaggtttacaatgatacaatgtctatatttaaagtaaaa 12161888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 207 - 400
Target Start/End: Original strand, 1072067 - 1072261
Alignment:
Q  207 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctc 305  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | || ||    
T  1072067 tgaatcaactcacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacactagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccttc 1072166  T
Q  306 tatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1072167 tatctcaaagtttactctgatacaatgtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 1072261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14466654 - 14466313
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactat-attatgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || || |||||| |||||||| || |||| |||| || ||    
T  14466654 gagaacacaagagaatttgctgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaacagcagtcatccggttcactataatgatgaataaccttaca 14466555  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||  |||   |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14466554 aaagagatatcaatgagttacaagaatatgtctctcgcctaattctactcaaactcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 14466455  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctc-aaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttgtttca 297  Q
    |||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||           |||||||||  |||| | |||||||| |||||||||    
T  14466454 cccaagatgaatcaatcctcaaaaccctagtgtttgttgccaatagacaaact-----------ctagttttgctgttgtctttctaaactcttgtttca 14466366  T
Q  298 accccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||| ||||||||||| | ||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  14466365 accctctctatctcaaggtttattctaatacaaagtctatatctatagtaaaa 14466313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 356
Target Start/End: Original strand, 3027876 - 3028190
Alignment:
Q  41 tgacctagtctggggg-agagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcc 138  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| || || ||| | |||    
T  3027876 tgacctagtctggggggaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataaatctccagcc 3027975  T
Q  139 taattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcc 238  Q
    |||||||||  ||||   |||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||| |    
T  3027976 taattctactcaaagtctcaatctcttcacgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgc 3028073  T
Q  239 caagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaaccttg-tttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctat 337  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | || ||||| ||||| |||| | |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  3028074 caagag-caaactctatacaaaccctagttttgt-gttgccttccaaacccttgttttcagccccttttatctcatggtttactttgatacaaggtctat 3028171  T
Q  338 atttatagtaaaaatatca 356  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  3028172 atttatagtaaaagtatca 3028190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22490886 - 22490619
Alignment:
Q  85 atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactca 184  Q
    ||||||||  || |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| || ||||||    
T  22490886 atgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcataattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactca 22490787  T
Q  185 atcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattct 284  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  22490786 atcctaatagtgtttcgcaaggtgtatacctcctcaaaccctagtgtttgttccaaagaggcaaactatatacaaaccctagttttgttgttgcctttca 22490687  T
Q  285 aaa--ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||| || || ||| |||||||||||| ||||||    
T  22490686 aaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactaattcaatgtctatatttatggtaaaa 22490619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 5273213 - 5273431
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||  ||||||  |||| | |||||||  |||||    
T  5273213 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataagatgagtttcgttac-aaagagaaatcaat 5273311  T
Q  114 gagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttcccaatgtgaatc 212  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5273312 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 5273411  T
Q  213 aaccctcaaaccctagtgtt 232  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  5273412 aacccacaaaccctagtgtt 5273431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 1069702 - 1069913
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||| || ||    
T  1069702 gagaacataaaagaatttgttgattcagttcggtccaaattgacctagtatggggaagagagcagccctccgtttctctataatgatgagtaaccttaca 1069801  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1069802 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 1069901  T
Q  200 cccaatgtgaat 211  Q
    ||||| ||||||    
T  1069902 cccaaggtgaat 1069913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 232 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 8995578 - 8995410
Alignment:
Q  232 ttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaa 330  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  8995578 ttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctctcagtttactctgatacaa 8995479  T
Q  331 ggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8995478 gatctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcaccc-aaaatacgtttctgtt 8995410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15719961 - 15719708
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggggg-agagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | |||| | |  || ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||    
T  15719961 aatttgtttaccaagttcggtccaaattgacctagtatggggggaaagagcaactctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 15719862  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaat 211  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15719861 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaat 15719762  T
Q  212 caaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttt 269  Q
    |||| |   |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15719761 caactc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacaaaccctagttt 15719708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17012286 - 17012029
Alignment:
Q  85 atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactca 184  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||| || ||||||    
T  17012286 atgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcatcaatctcttctcgtgaccaagagactca 17012187  T
Q  185 atcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattct 284  Q
    ||||||||| ||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  | ||||    
T  17012186 atcctaatattgtttcagaaggtgaatcaa-cctc-aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctag-tttgttgtttac-ttct 17012092  T
Q  285 aaacc--ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatag 345  Q
    |||||  ||  ||||  |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17012091 aaacccttttattcagacccctctatctcaaggtttactccgatacaaggtctatatttatag 17012029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 392
Target Start/End: Original strand, 16455421 - 16455800
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| || ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||  || |||||||||| |||    
T  16455421 aatttgtttactcagttcggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatca 16455520  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaat 211  Q
    | | |||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| | | || |||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16455521 aagggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgagcaagagacttaatcctaacagtgtttcccaaggtgaat 16455620  T
Q  212 caaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctcta--t 308  Q
    |||||    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||| | ||||||| ||||||||  |  | |||||  |    
T  16455621 caacc--acaaccctagtgttcgttgccaagaga-aaactctgtacaaaccctagtttttgtgttgac-ttctaaacccttgttttcagactctctacct 16455716  T
Q  309 ctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacg 392  Q
    ||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16455717 ctcaaggtttacaccgatacaaggtatatatttatagtaaaggtatccctgaaaaattggaacaaatctgagcccaaaaatacg 16455800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15367361 - 15367101
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggg-gagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| || ||    
T  15367361 gagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagagcagccttccgtttcactatatgatgaataactttaca 15367263  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    | |||||| | |||| |||||||||| |||||| |||  ||||| |||| |||| | |||||||||||||  ||  || ||||||||||||| |||||||    
T  15367262 atagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgattaattttacccaaagtttcaatctcttcccgcgacgaagagactcaatcctaagagtgttt 15367163  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacccta 265  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||    
T  15367162 cccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaacacaatacaaccccta 15367101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 29754694 - 29754892
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  29754694 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 29754792  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  29754793 agagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacctaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 29754892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 12186055 - 12186271
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactat-attatgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| |||||| |||||| || ||||||||| || ||    
T  12186055 gagaacacaaaataatttgtttacccagttcggttcaaattgacctagtccgaggcagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttaca 12186154  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttc-cgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |   ||||||| |||| ||||   |||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||    
T  12186155 aaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattgtacccaaagtctcaatctcttcccgtgaacaagagactcaatcctaatagtgtt 12186254  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaac 215  Q
    |||||| ||||||||||    
T  12186255 tcccaaggtgaatcaac 12186271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 26066109 - 26066307
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| | |||||| | || ||||||||| | ||    
T  26066109 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatttgataagtaacgttac-aa 26066207  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  26066208 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 26066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 206 - 350
Target Start/End: Original strand, 32447504 - 32447650
Alignment:
Q  206 gtgaatcaaccctcaaacc-ctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccc 303  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  32447504 gtgaatcaaccctcaaaactctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 32447603  T
Q  304 tctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  32447604 tctatctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaa 32447650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 26068380 - 26068578
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| | |||||| | ||||| |||||| | ||    
T  26068380 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagcaacgttac-aa 26068478  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||    
T  26068479 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaagcaagagactccaatcctaatagtgtttc 26068578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 33309185 - 33308988
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  33309185 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 33309087  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||  |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  33309086 agagaaatcaatgggttacaag-aatagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33308988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 33311454 - 33311257
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| || |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  33311454 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaaagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 33311356  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||  |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  33311355 agagaaatcaatgggttacaag-aatagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33311257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 223 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17852650 - 17852500
Alignment:
Q  223 ccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttact 321  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  17852650 ccctagtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttact 17852551  T
Q  322 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  17852550 ctgattcaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 17852500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15346664 - 15346535
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaat 113  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||| || ||| |||||| |||||    
T  15346664 aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctttccgtttcactatatgatgaataactttacaatagagatatcaat 15346565  T
Q  114 gagttacaagaaaaagtcttccgcctaatt 143  Q
    | |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15346564 gggttacaagaataagtcttccgcttaatt 15346535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 206 - 344
Target Start/End: Original strand, 13870611 - 13870749
Alignment:
Q  206 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccct 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||| | |||||    
T  13870611 gtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaagagacaaactttatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttc-agcccct 13870709  T
Q  305 ctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttata 344  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| | |||||||||||    
T  13870710 ctatctcaaggtttgctctgatacaaagcctatatttata 13870749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19696759 - 19696508
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||| | |||| |||| || |||||||||| |||    
T  19696759 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggagagagagcagctatctgttccactataatgatgaataactttacaaaagagatatca 19696660  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 210  Q
    | |  ||||||||| ||||||||   |||||||||| | ||||   ||||||||| | || ||  || ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19696659 aaggattacaagaataagtcttcaaacctaattctaaccaaagtctcaatctctttcagtgacaaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaa 19696560  T
Q  211 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacccta 265  Q
    ||||   |  |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19696559 tcaa--tttgaaccctagtgattgttgccaagag-caaactctatacaaacccta 19696508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26945463 - 26945258
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  |||| || |||||||| |||||  ||| | ||||  |||||| | ||||||||| || |||||||||| |||    
T  26945463 aatttgtttacccagttcggtccaaacctgacataatctgggggggagagctgcccttcgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 26945364  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 210  Q
    ||||||||||| || |||||| |   |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  26945363 atgagttacaaaaataagtctacaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgac 26945264  T
Q  211 tcaacc 216  Q
    ||||||    
T  26945263 tcaacc 26945258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 186 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15346524 - 15346347
Alignment:
Q  186 tcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattcta 285  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||          ||||||    
T  15346524 tcctaagagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaattttatacaaaccctagtttga--------attcta 15346437  T
Q  286 aacc-ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaa 374  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | || ||||||||||    
T  15346436 aacccttggttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatccctcataaattggaacaaa 15346347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 10584326 - 10584245
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata 82  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10584326 gagaacacaaaaaaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactata 10584245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 22857949 - 22858203
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| || ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| || |||| || || |||    
T  22857949 aatttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gatatatca 22858047  T
Q  112 at-gagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtga 209  Q
    |  | ||||||||||  |||||||   ||||| |||||| ||||   ||||||||||  || ||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22858048 aaagggttacaagaattagtcttcaaacctaaatctacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtga 22858147  T
Q  210 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttt 270  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  22858148 atcaa-tctc-aaccctagtgtttgttaccaagaga-aaattc--tacaaaccctagtttt 22858203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10584213 - 10584106
Alignment:
Q  239 caagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctat 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||| ||||||     ||||||||||||| | |||| ||||||||| || |||    
T  10584213 caagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcttttataaacctttgttt-----ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtttat 10584119  T
Q  338 atttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||||||    
T  10584118 atttatagtaaaa 10584106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11138499 - 11138423
Alignment:
Q  139 taattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc-ccaatgtgaatcaa 214  Q
    |||||||||| ||||  || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11138499 taattctacctaaagtccccatctcttcccgtgaccaagtgactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 11138423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 28037722 - 28037927
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagagtagccatccgt---ttcactat-attatgagtaacgttgcaaaagagatg 108  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| |||| | |||   | |||||| || ||||||||| || ||||||||||     
T  28037722 aatttgtttacccagctcggtccaaaactgacctagactgggggagagagcagcctttcgtccgtccactattatgatgagtaactttacaaaagagata 28037821  T
Q  109 tcaatgagttacaagaaaaag-tcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgt 207  Q
    |||| | |||||||||| ||| | ||   |||||||||||| ||||   |||||| || |||| | | || ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  28037822 tcaaagggttacaagaataagattttaaacctaattctacccaaagtctcaatctatttccgtgaacaagggactcaatcctaacagtgtttcccaaggt 28037921  T
Q  208 gaatca 213  Q
    ||||||    
T  28037922 gaatca 28037927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20526999 - 20526871
Alignment:
Q  137 cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 236  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  20526999 cctaattctaccaaaagtcttaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgtt 20526902  T
Q  237 cccaagagacaaactctatacaaaccctagtttt 270  Q
      |||||| |||||||  ||||| ||||||||||    
T  20526901 gtcaagag-caaactc--tacaacccctagtttt 20526871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 322 - 379
Target Start/End: Original strand, 4816551 - 4816608
Alignment:
Q  322 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| || |||||||||||    
T  4816551 ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 4816608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15367045 - 15366965
Alignment:
Q  321 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgca-cccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | || ||||||||||    || ||||||||||||||||||||    
T  15367045 tctgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatccctcataaattggaacaaaatatcagcccaaaaatacgtttatgtt 15366965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 379
Target Start/End: Original strand, 26068590 - 26068662
Alignment:
Q  307 atctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||||||    
T  26068590 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgc 26068662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 33211185 - 33211229
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  33211185 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagaga 33211229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 307 - 350
Target Start/End: Original strand, 26066319 - 26066362
Alignment:
Q  307 atctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066319 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 26066362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 293 - 377
Target Start/End: Original strand, 12186345 - 12186431
Alignment:
Q  293 tttcaaccccctctatctcaaagcttac-tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaat-atcacttaaaatttggaacaaatct 377  Q
    ||||| |||| |||||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||    
T  12186345 tttcagccccttctatctcaaggtttacatgtgatacaaggtttatatttatagtaaaagtaatcgctaaaaaattggaacaaatct 12186431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 25941857 - 25941785
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaat--tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  25941857 aagaatttgtttacccagttcggt-ctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 25941785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 5757571 - 5757526
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  5757571 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 5757526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 603088 - 603132
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||    
T  603088 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatcttggggagaga 603132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 214
Target Start/End: Original strand, 7542525 - 7542581
Alignment:
Q  158 aatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaa 214  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||| | | |||||||||    
T  7542525 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttctccaagtgaatcaa 7542581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 82
Target Start/End: Original strand, 12911471 - 12911511
Alignment:
Q  42 gacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata 82  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  12911471 gacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 12911511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 16569190 - 16569146
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16569190 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggaggagaga 16569146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19696446 - 19696394
Alignment:
Q  325 atacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||  | |||| |||||||||||||    
T  19696446 atacaaggtctatatttatagtaaaagaatccttcaaaaattggaacaaatct 19696394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 88)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 40032037 - 40032442
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  40032037 gagaatacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcggccctccgtttcactataatgatgagtaactttgca 40032136  T
Q  100 aaagaga----tgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagt 195  Q
    |||||||    | |||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||  | || ||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  40032137 aaagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtctcacgcctaattctacccaaagtcctaacctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagt 40032236  T
Q  196 gtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtt 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  40032237 gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 40032336  T
Q  295 tcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 394  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032337 tcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaacttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtt 40032436  T
Q  395 tatgtt 400  Q
    | ||||    
T  40032437 tctgtt 40032442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 21520677 - 21521079
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  21520677 gagaacacaaaagaatttgttgacaaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 21520776  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||  | |  ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21520777 aagagatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 21520876  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  21520877 ctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaagccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 21520976  T
Q  300 cccctcta--tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttat 397  Q
    ||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21520977 cccatctatctctcaaagtttagtctgatacaaggtttatatttatagtaaaagtatcgcttaaattttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttat 21521076  T
Q  398 gtt 400  Q
    |||    
T  21521077 gtt 21521079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 6264132 - 6264529
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  6264132 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttaca 6264231  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||| ||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  6264232 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctatccaaagccccaatcttttatcgtaaccaagagacttaatcctaatagtgttt 6264331  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaa 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||     
T  6264332 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtaccaaagagacaaactctatacaaaccc----tttgttgttgcctttctaaacctttgtttcag 6264427  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 398  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  6264428 ccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctg 6264527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 13910030 - 13910428
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||  ||| ||||    
T  13910030 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgatccactatatgatgagtattgttacaaa 13910129  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  13910130 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttcc 13910228  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  13910229 caaggtgaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 13910328  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  13910329 ccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtt 13910428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27105067 - 27104670
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||| ||| ||||    
T  27105067 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaatgttacaaa 27104968  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27104967 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 27104869  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||| ||    
T  27104868 caaggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctgaacccttgtttcagcc 27104770  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27104769 ccctctatctcaaagttttctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttatgtt 27104670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 6258801 - 6259199
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatta-tgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||| || ||    
T  6258801 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggg-agagagcagccctccgtttcactataataatgagtaactttaca 6258899  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  6258900 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagccccaatct--tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 6258997  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttgtttcaa 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||     
T  6258998 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcctttctaaactcttgtttcat 6259097  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 398  Q
    || |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  6259098 cctcctctatctcaaagtttagtctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaagtctgcacccaaaaatatgtttctg 6259197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 22287320 - 22287720
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22287320 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaacgttacaa 22287419  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||| | |||||||||| |||||| ||||| |||||||||  |||   |||||||||||||||||  || |||||||||||||||  |||||    
T  22287420 aagagatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcccaattctacccgaagtgtcaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaataccgtttc 22287519  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  22287520 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgttccaaagagacagactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 22287619  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgt 399  Q
    ||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||    
T  22287620 cccctatatctcaaagtttactttaatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatatgcacccaaacatacatttttgt 22287719  T
Q  400 t 400  Q
    |    
T  22287720 t 22287720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Original strand, 19501996 - 19502395
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  19501996 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactatatgatgagtatcgttacaaa 19502095  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19502096 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 19502195  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  19502196 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagcc 19502295  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  19502296 ccctttatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaattttcccttaaaatttggatcaaatctgcaaccaaaaatatgtttctgtt 19502395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 389
Target Start/End: Original strand, 19504331 - 19504718
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  19504331 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa 19504430  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19504431 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctt-ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 19504529  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  19504530 caaggtgaatcaaccaacaaacccttgtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 19504629  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaat 389  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19504630 ccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgcacctaaaaat 19504718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 42064785 - 42064386
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaatt-gacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||  ||| |||    
T  42064785 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaa 42064686  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    | ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  42064685 a-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 42064587  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  42064586 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 42064487  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgt 399  Q
     ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||    
T  42064486 tccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactaaaaaatatgtttctgt 42064387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28196906 - 28196558
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  28196906 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtc--aattgacctagtctgggggagagagcagccattcgtttcactatatgatgagtaatgttacaa 28196809  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28196808 aagagatatcaatgggttacaagaataaatcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 28196709  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |    
T  28196708 ccaaggtgaatcaacccttaaaccctaatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagc 28196609  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  28196608 cccctctatctcaatgtttactctgatacaaagcatatatttatagtaaaa 28196558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 42923493 - 42923867
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| || |||    
T  42923493 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgtttcactatatgacgagtaactttacaa 42923592  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||     
T  42923593 aagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 42923692  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  42923693 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagc 42923792  T
Q  300 cccctcta--tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    | ||||||  |||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  42923793 ctcctctatctctcaaggtttactatgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 42923867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19007911 - 19007561
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  19007911 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 19007812  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  19007811 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagaaactcaattctaatagtgtttc 19007712  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  19007711 ccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccataattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 19007612  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  19007611 cccctctatctcaaggtttactatgatacaaagcctatatttatagtaaaa 19007561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 43623564 - 43623951
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  43623564 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaa 43623663  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  43623664 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttc 43623763  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |    
T  43623764 ccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagt------------gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccattgtttcacc 43623851  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgt 399  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43623852 cccctctatctcccagtttactctgatacaaggtctatttttatagtaaaagtattgcttaaaatttggaacaaatctgcaccc-aaaatacgtttatgt 43623950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 395
Target Start/End: Original strand, 24162208 - 24162591
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||| | || ||||    
T  24162208 agaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtccgggggagagagcagccatccaatccactatatgatgagtagcattacaaa 24162307  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||          | |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  24162308 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca----------gcaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcc 24162396  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  24162397 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 24162496  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 395  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24162497 ccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttgaaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 24162591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 346
Target Start/End: Original strand, 45279969 - 45280315
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  45279969 agaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 45280068  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  45280069 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcc 45280168  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgc-cattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| |||||||||| |    
T  45280169 caaggtgaatcaaccctctaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctttttctaaacccttgtttcagc 45280268  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  45280269 cccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtatatatttatagt 45280315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Original strand, 23452222 - 23452601
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  23452222 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa 23452321  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||| | ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  23452322 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttct 23452421  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  23452422 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 23452521  T
Q  301 ccc----tctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||    ||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  23452522 ccctctgtctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 23452601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42453050 - 42452678
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  42453050 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 42452952  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  42452951 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 42452852  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  42452851 caaggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgttac--agagacaaactttatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 42452754  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  42452753 ccctctatctccaagtttgctctgatacaatgtctatatttataataaaagtataactcataaatttggaacaaat 42452678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17848711 - 17848366
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  17848711 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 17848612  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||   ||||||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17848611 aagagatatcaatg-gttacaagaataagtctcccgcc---ttctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 17848516  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| |||| |     
T  17848515 ccaaagtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccctcgtttgag 17848416  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||| | |||  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17848415 ccccctctatctcaaggatta--ctgatacaaagcctatatttatagtaaaa 17848366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 11739543 - 11739894
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | ||||||||| || ||    
T  11739543 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaacctttca 11739642  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| ||||||  || |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  11739643 aaagagatatcaatggattccaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagaatcaatcctaatagtgttt 11739742  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| | ||||||| ||||||| ||     
T  11739743 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactccatacaaaccctaattttgttgttgtctttctaaacccttgttccag 11739842  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||| | |||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  11739843 ccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaa 11739894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14837539 - 14837194
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  14837539 gagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcatccatccgtttcactataatgatgagtaaccttaca 14837440  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||   ||||||||||||       || |||||||||||||||||||||    
T  14837439 aaagagatatcaatgagttacaagaataagtcccccgcctaattctacttaaagtctcaatctcttccca------agagactcaatcctaatagtgttt 14837346  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttg-ccattctaaaccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |  || ||| ||||||||||     
T  14837345 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactatgtacaaaccctagttttgttgttgtcttttttaacccttgtttcag 14837246  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    | ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14837245 ctccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttacagtaaaa 14837194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 44289051 - 44289402
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||  || ||    
T  44289051 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggaaagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaatcttaca 44289150  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||| | |||||||||| |||| |||| | ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44289151 aaagagatatcaacgggttacaagaataagttttccacttaattctaccctaagtcccaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgttt 44289250  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| |||||| |     
T  44289251 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacagactctatacaaactctagttttgttgttgccttcctaaacctttgttttag 44289350  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
     ||||||||| |||| | || || ||||||||   |||||||||||||||||    
T  44289351 tcccctctatatcaaggtttgctatgatacaaaacctatatttatagtaaaa 44289402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 34979561 - 34979906
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggag-agagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| | ||||||||| | |||| ||||||| | ||||| ||| || |    
T  34979561 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttggggggggagagtagcccttcgttccactataatgatgaggaaccttac 34979660  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    ||||||||| | ||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  34979661 aaaagagatataaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtccgaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtt 34979760  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttgtttca 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||    
T  34979761 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagtttttttgttacctttctaaacgcttgtttca 34979860  T
Q  298 accccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttat 343  Q
     ||||||||||||||| | |||| || |||||| ||||||||||||    
T  34979861 gccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttat 34979906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3022443 - 3022086
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata----------ttatgagt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||          | ||||||    
T  3022443 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcattataacgatgataatgatgagt 3022344  T
Q  91 aacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatccta 190  Q
    ||| ||  ||| ||||| | |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  3022343 aactttataaa-gagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaaacctcaatctcttccggtaaccaagagactcaatccta 3022245  T
Q  191 atagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-cc 289  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||    
T  3022244 atagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccgtagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttataaaccc 3022145  T
Q  290 ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaa 348  Q
    |||||||| || ||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3022144 ttgtttcagcctcctatatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaa 3022086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17849388 - 17849038
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||| || ||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  17849388 gagaacacaaaagaatttgttgacccagtcttgtccaaattgacctagtatgtgggagagagcagccc-ccgtttcactataatgatgagtaaccttaca 17849290  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  17849289 aaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttaccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgttt 17849190  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||  | ||||||| ||||||||||     
T  17849189 ctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttcttccaaagaggcaaactctatacgaactctagttttgttgttatctttctaaacccttgtttcag 17849090  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17849089 ccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtttatatttatagtaaaa 17849038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 18800297 - 18800686
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgc 98  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| || |    
T  18800297 gagaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaaactgacctggtctgggg-agagagtagccctccgtttcactataatgacgagtaactttac 18800395  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||    
T  18800396 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtt 18800495  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttca 297  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||  |        ||||||| ||||||||||    
T  18800496 tcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caacctctatacaaaccctagcttgat--------ttctaaacccttgtttca 18800583  T
Q  298 accccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttat 397  Q
     |||||| |||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |    
T  18800584 gccccctatatctccatgtttaccctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgtttaaaatttggaacaaatctgcacttaaaaatatgtttct 18800683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Original strand, 35215571 - 35215956
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  35215571 agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 35215670  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  35215671 -gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaaactcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 35215769  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |    
T  35215770 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagc 35215869  T
Q  300 cccctcta----------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    ||||||||          |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  35215870 cccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 35215956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 98 - 350
Target Start/End: Original strand, 15539556 - 15539809
Alignment:
Q  98 caaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgt 197  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  15539556 caaaagatatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagaatcaatcctaatagtgt 15539655  T
Q  198 ttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttc 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  15539656 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttc 15539755  T
Q  297 aaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||| |||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15539756 aaccccctatatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 15539809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 311
Target Start/End: Original strand, 45239000 - 45239271
Alignment:
Q  40 ttgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcct 139  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||| |||| | |||| |    
T  45239000 ttgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgctt 45239099  T
Q  140 aattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccc 239  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45239100 aattctaccaaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc 45239199  T
Q  240 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctc 311  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  45239200 aa-agagaaagtctatacaaaccctagttttgtttttgtctttctaaatcattgtttcagccccctctatctc 45239271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 350
Target Start/End: Original strand, 31732772 - 31733099
Alignment:
Q  13 gaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||| | ||||||||| || |||||||||| |||    
T  31732772 gaatttgtttacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcacaataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 31732871  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaat 211  Q
    ||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||  ||||            ||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  31732872 atgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaa------------accaagagactcaatcctaacagtgtttcccaacgtgaat 31732959  T
Q  212 caaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatct 310  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31732960 caaccctcaaaccttagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 31733059  T
Q  311 caaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31733060 caatgtttactctgttacaaagtctatatttatagtaaaa 31733099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 311
Target Start/End: Original strand, 35217948 - 35218258
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  35217948 agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 35218047  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||| | |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  35218048 -gagaaatcaacgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 35218146  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |    
T  35218147 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagc 35218246  T
Q  300 cccctctatctc 311  Q
    ||||||||||||    
T  35218247 cccctctatctc 35218258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 199 - 400
Target Start/End: Original strand, 22407591 - 22407793
Alignment:
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttca 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  22407591 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 22407690  T
Q  298 accccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttat 397  Q
     | |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22407691 gcaccctatatctcacagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaattttgaacaaatctgcacccaaaaatacgtttct 22407790  T
Q  398 gtt 400  Q
    |||    
T  22407791 gtt 22407793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 5375330 - 5375550
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| ||| |||    
T  5375330 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaatgttacaa 5375429  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5375430 aagagatatcaatgggttacaagaataagtc-tccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 5375528  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaa 222  Q
    | || |||||||||||||||||    
T  5375529 ctaaggtgaatcaaccctcaaa 5375550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 350
Target Start/End: Original strand, 11578104 - 11578438
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggt-tcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| ||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||| | ||||||||| || |||||||||| |||    
T  11578104 aatttgtttacctagttcggtctaaaactgatctagtctgggggaaagagcagccctccgttcgactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 11578203  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaat 211  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11578204 atgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaat 11578303  T
Q  212 caaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatct 310  Q
    |||||  | |||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  11578304 caacc--ccaacccta--gtttgttgccaagagaaaaattctatacaaaccctagtttttttgttgac-ttctaaacccttgtttcagcccactctatct 11578398  T
Q  311 caaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11578399 caagatttaccctgatataaggtctatatttatagtaaaa 11578438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22874402 - 22874018
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||  || ||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  22874402 gagaacacaagagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcagctctcagtttcactataatgatgagtaactttaca 22874303  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| ||||||| || |||||| || |||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| |||||    
T  22874302 aaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccacctaattctaccgaaagcctcaatctcttcccgtgactaagagactcaatcctaatactgttt 22874203  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
     |||| ||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |        ||||||| ||||||||||     
T  22874202 tccaaggtgaatcaaccc---aaccatagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagtttgat--------ttctaaacccttgtttcag 22874115  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 395  Q
    ||||||||||||| | | || ||||||||||| | || ||||||||| |||| || | || | ||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  22874114 ccccctctatctccaggtttgctctgatacaaagcctgtatttatagcaaaagtaaccctcataaaattgaaacaaatctg-gcccaaaaatacgttt 22874018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 28459174 - 28459435
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||| | |||||||||||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||  |    
T  28459174 gagaacacaaaagaatttgtttatctagttcgatccaaattgacctagtctaggt-agagagaagccctccgtttcactataatgatgagtaactttaaa 28459272  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| || ||||||| ||||  |||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  28459273 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattatacctgaagccccaaactcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28459372  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacc 262  Q
     |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28459373 gccaaggtgaatccaccctcaaatcctagtttttgttgccaagagacaagctctatacaaacc 28459435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 187 - 350
Target Start/End: Original strand, 22163117 - 22163281
Alignment:
Q  187 cctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaa 286  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  22163117 cctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagtgttgttgttgcctttctaa 22163216  T
Q  287 a-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22163217 atccttgtttcagccccctctatctcaaagtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 22163281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 22407438 - 22407590
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22407438 gagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 22407537  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaag 153  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  22407538 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccccctaattctaccaaaag 22407590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 20146604 - 20146946
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||    
T  20146604 aattcgtttacccagttcggtccaatactgacttagtctgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 20146703  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattcta-ccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 210  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||| ||| || |||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  20146704 aagagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatct-caatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctactattgtttcccaaggtgaa 20146802  T
Q  211 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctcta-- 307  Q
    |||| |  | |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||  |  | |||||      
T  20146803 tcaatc--ccaaccatagtgtttgttgccaag-ggcaaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgttttcaaactctctacc 20146898  T
Q  308 tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatc 355  Q
    ||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20146899 tcttaaggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatc 20146946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 36558849 - 36559047
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  36558849 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 36558947  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  36558948 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36559047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 36561126 - 36561324
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  36561126 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 36561224  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  36561225 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36561324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 35107567 - 35107171
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgc 98  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| | |||||| ||| | ||||||||||||||  |||||  | ||||||||| ||||||| | ||||||||| || |    
T  35107567 gagaacacaaaaatatttgtttacctatttcggtccaatactgacctagtctgggaaagagaacaaccatccgttccactataatgatgagtaacattac 35107468  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgc--ctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtg 196  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||     ||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||    
T  35107467 aaaagagataacaaag-gttacaagaataagtcttcaaaatctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatg 35107369  T
Q  197 tttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaac-cttgttt 295  Q
    |||| ||| ||||||||| ||   ||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||| |||| ||    
T  35107368 tttctcaaggtgaatcaatccc--aaccct---gtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaactcttggtt 35107276  T
Q  296 caaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 395  Q
      |  | ||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||    
T  35107275 ttagactctctacctcaaggtttactatgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatcccttaaaatttggaacaaatctgcattgaaaaatacgatt 35107176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 38020295 - 38020162
Alignment:
Q  179 gactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgc 278  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38020295 gactcaatcctaatagtgtttaccatggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgc 38020196  T
Q  279 cattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctc 311  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  38020195 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 38020162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 17897242 - 17897581
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| | ||||||||| || ||||| |||| |||    
T  17897242 aatttgtttacccagttcggaccaatactgacctagtctgggg-agagagcagccatccgttctactataatgatgagtaactttacaaaatagatatca 17897340  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctac-caaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 210  Q
    | | |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | | ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17897341 aagggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaaatctc-aatcttttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 17897439  T
Q  211 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatc 309  Q
    ||||  |||||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| |||||||   |  | ||||| |    
T  17897440 tcaa-tctcaa--cctagtgtttgttgcgaagag-caaactctatacaaaccctagttttattgttgac-ttctaaacccttgttctcagactctctacc 17897534  T
Q  310 tcaaagcttac-tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatc 355  Q
    ||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17897535 tcaagttttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatc 17897581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 45332166 - 45332364
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||| | || | ||    
T  45332166 agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaattcactatatgatgagtacctttac-aa 45332264  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||  |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  45332265 agagaaatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 45332364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 22163006 - 22163111
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22163006 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 22163105  T
Q  101 aagaga 106  Q
    ||||||    
T  22163106 aagaga 22163111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 146
Target Start/End: Original strand, 7462950 - 7463077
Alignment:
Q  20 ttgacccagttcggttcaaa-ttgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagtt 118  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||| |||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  7462950 ttgacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatataatgggtaacgttacaaaagagaaatcaatgagtt 7463049  T
Q  119 acaagaaaaagtcttccgcctaattcta 146  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7463050 acaagaataagtctcccgcctaattcta 7463077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 22707735 - 22707868
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctg--ggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  || ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| || |    
T  22707735 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaaccttac 22707834  T
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtct 132  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  22707835 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtct 22707868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 217 - 346
Target Start/End: Original strand, 5377629 - 5377763
Alignment:
Q  217 ctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctcta----tctc 311  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||    ||||    
T  5377629 ctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagtcccctctatctctctc 5377728  T
Q  312 aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5377729 aaagtttgctctgaaacaaggtctatatttatagt 5377763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40699606 - 40699429
Alignment:
Q  41 tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccg-cc 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || || ||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||| |  |||||| || ||||||||   ||    
T  40699606 tgacctagtctgggggaaagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggattacaaaaataagtcttcaaacc 40699507  T
Q  139 taattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaacc 216  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40699506 taattctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 40699429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23871087 - 23870951
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| |||  ||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||| || | |    
T  23871087 gagaactcaaaagaatttgttgacctagtttgatccaaattgacctaatctaagggagagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacta 23870988  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgc 137  Q
    ||||||| | |||| |||||||||| |||||| ||||    
T  23870987 aagagatattaatgggttacaagaataagtctgccgc 23870951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 262
Target Start/End: Original strand, 27136195 - 27136368
Alignment:
Q  87 gagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttc-cgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaa 185  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||  ||||  ||||| |||| |||| ||| || || ||||    
T  27136195 gagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattctactcaaagtcccaatttctttccgtgaccaagagattcaa 27136294  T
Q  186 tcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacc 262  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  27136295 tcctaatagtgttttccaagatgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caagctctatataaacc 27136368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 229
Target Start/End: Original strand, 38414198 - 38414291
Alignment:
Q  134 ccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagt 229  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  38414198 ccgcctaattctaccaaaagtcccaatcttttcc-gtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa-cctcaaaccctagt 38414291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 290 - 400
Target Start/End: Original strand, 12342684 - 12342794
Alignment:
Q  290 ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaat 389  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  12342684 ttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaatgtgtatatttatagtaaaagtatcctaaaaaaattggaacaaatctgaccccaaaaat 12342783  T
Q  390 acgtttatgtt 400  Q
    | | |||||||    
T  12342784 atgattatgtt 12342794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 37962938 - 37963266
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||  || |  | ||||||||||| | |||| |||| || ||||| |    ||||    
T  37962938 aatttgtttacccagttcggtccaaattaacctagtgtgggagagagatcagtccactgtttcactataatgatgaataactttacaaaaaaa---tcaa 37963034  T
Q  113 tgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatc 212  Q
    ||  ||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||  ||||||||||  || ||| || |||||||||  |||| ||||| | || | |||||    
T  37963035 tggattacaagaataagtctctcgtctaattctacccaaagcctcaatctcttcaggtgaccaagagactcaatctcaataatgttttctaaggggaatc 37963134  T
Q  213 aaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctc 311  Q
    ||| |   |||| | |||||||||  |||||| |||||| || ||||||||||||||  |        ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37963135 aacac---aaccatggtgtttgttgtcaagag-caaactatacacaaaccctagtttgat--------ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 37963222  T
Q  312 aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatc 355  Q
    || | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37963223 aaggtttactcttatacaaagtctatatttatagtaaaagtatc 37963266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 38020157 - 38020063
Alignment:
Q  258 aaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaa 351  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38020157 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttccaaccccctctatctccaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagtaaaaa 38020063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35028707 - 35028473
Alignment:
Q  139 taattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcc 238  Q
    |||||||||| ||||   |||||||||| ||| | | || ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |    
T  35028707 taattctacccaaagtgtcaatctcttctcgtgatcaagagactcaatcataatagtgttttccaatgcgaatcaatc-tcaa-ccctagtgtttgttac 35028610  T
Q  239 caagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaaccttgtttcaacccc-ctctatctcaaagcttac-tctgatacaaggtcta 336  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| | |||| | ||||  |||||||||| |||||   |  | |||||  |||| | |||| |||||||||| |||||    
T  35028609 caagag-caaactcta--caaacccaaattttattgttgg-attctaaaccctgtttttccggctctctaattcaaggtttacatctgatacaatgtcta 35028514  T
Q  337 tatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatct 377  Q
    |||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||    
T  35028513 tatttatagtaaaagtatccctaaaaaattggaacaaatct 35028473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 321 - 381
Target Start/End: Original strand, 28462591 - 28462651
Alignment:
Q  321 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcac 381  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  28462591 tctgatacaaggtttatatttatagtaaaagtaacccttaaaatttggaacaaatctgcac 28462651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 43139509 - 43139381
Alignment:
Q  137 cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 236  Q
    |||||||||||| ||||   |||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  43139509 cctaattctacctaaagtctcaatatcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttcccaagatgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgtt 43139412  T
Q  237 cccaagagacaaactctatacaaaccctagtttt 270  Q
     ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  43139411 gccaagag-caaactc--tacaaacccaagtttt 43139381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 45156999 - 45156922
Alignment:
Q  323 tgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  45156999 tgatataaggtctatatttatagtaaaagcatccctcaaaatttggaacaaatccacgcctaaaaatacgtttatgtt 45156922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 13828338 - 13828460
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttca-aattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactat-attatgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| | |||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| | | ||| |||||| |||||||||||  || |||||||||| |||    
T  13828338 aatttgtttatccagttcggtccagaactgacctagtctaggggagagagtagctaactgttccactataattatgagtaattttacaaaagagatatca 13828437  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttc 134  Q
    | | | |||||||| ||||||||    
T  13828438 aagggctacaagaataagtcttc 13828460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 15539513 - 15539553
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaatt 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15539513 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 17057369 - 17057413
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17057369 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17057413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 17085352 - 17085396
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17085352 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17085396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20589895 - 20589763
Alignment:
Q  69 tccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttc 166  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||| |  |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| |   |||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  20589895 tccgttacactataatgatgagtaacttcacaaaagagatatcaatgggttaaaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttc 20589796  T
Q  167 ccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||| ||| || ||||||||||||| |||||||    
T  20589795 ccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 20589763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Original strand, 27583479 - 27583535
Alignment:
Q  157 caatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatca 213  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27583479 caatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatca 27583535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 40699278 - 40699190
Alignment:
Q  303 ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaata 390  Q
    |||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  40699278 ctctctctcaaggtttactctgatgcaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcagaaaattggaacaaatctcagcccaaaaata 40699190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 390
Target Start/End: Original strand, 20147040 - 20147123
Alignment:
Q  308 tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaata 390  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  20147040 tctcaaggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaaatattcctcataaaattggaacaaatttgagcccaaaaata 20147123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26345738 - 26345661
Alignment:
Q  139 taattctaccaaaag-ctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaac 215  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  26345738 taattctacccaaagtctcgaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttgctaaggtgaatcaac 26345661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 723744 - 723788
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  723744 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 723788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17921833 - 17921769
Alignment:
Q  137 cctaattctaccaaaagctcc-aatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||||||||| ||||  || |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17921833 cctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 17921769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 34139770 - 34139814
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  34139770 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 34139814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 39285004 - 39284960
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  39285004 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 39284960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 1345640 - 1345589
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  1345640 aagaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagag 1345589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 2838129 - 2838078
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  2838129 aagaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagag 2838078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 11151591 - 11151634
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagag 60  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  11151591 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagag 11151634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 14699100 - 14699050
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagcc 67  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14699100 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 14699050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 199
Target Start/End: Original strand, 28458949 - 28459011
Alignment:
Q  137 cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| |||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  28458949 cctaattctacccaaagtcccaatatctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28459011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 8390243 - 8390198
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  8390243 ttgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagag 8390198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 13569332 - 13569377
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  13569332 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 13569377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 20522224 - 20522269
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  20522224 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 20522269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20589611 - 20589582
Alignment:
Q  321 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20589611 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 20589582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Original strand, 34388862 - 34388911
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagc 66  Q
    ||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34388862 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagc 34388911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 11067473 - 11067429
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  11067473 ttgttgaccgagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 11067429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 14633825 - 14633869
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  14633825 ttgttgactcagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 14633869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 33603870 - 33603818
Alignment:
Q  325 atacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatct 377  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| || | || |||||||||||||    
T  33603870 atacaaggtttatatttatagtaaaagtatccctaacaaattggaacaaatct 33603818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 36773730 - 36773686
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||    
T  36773730 ttgttgacccagttcggtccaacttgacataatctgggggagaga 36773686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 38312408 - 38312364
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||    
T  38312408 ttgttgacccagttcggtccaacttgacataatctgggggagaga 38312364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4298 - 3901
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  4298 agaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaa 4200  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4199 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 4100  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaacc 300  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  4099 caagatgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 4001  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4000 ccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttgaaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 3901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 78)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 14808112 - 14807703
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagt----------agccatccgtttcactatattatgagt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  14808112 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagt 14808013  T
Q  91 aacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatccta 190  Q
    |||||| |||||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14808012 aacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatccta 14807913  T
Q  191 atagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-cc 289  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  14807912 atagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 14807813  T
Q  290 ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaat 389  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  14807812 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactc-aaaat 14807714  T
Q  390 acgtttatgtt 400  Q
    |||||||||||    
T  14807713 acgtttatgtt 14807703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 2 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 4424368 - 4423974
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | | |||||||| |||||||| ||| ||||    
T  4424368 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaatgttacaaa 4424269  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    ||| |  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4424268 agataaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 4424169  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  4424168 cacggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagcgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagcc 4424069  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 395  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4424068 ccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctgtatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgttt 4423974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15073062 - 15072661
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||||| |||    
T  15073062 gagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactgtatgatgagtaacgttacaa 15072963  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaa-tctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||  |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15072962 aagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaaccctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 15072863  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  15072862 tccaaggtgaatcaaccctaaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 15072763  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatg 398  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  15072762 ccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatttgcacccaaaaatacgtttctg 15072663  T
Q  399 tt 400  Q
    ||    
T  15072662 tt 15072661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 28251551 - 28251950
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||||| || |||    
T  28251551 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacattacaa 28251650  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28251651 aagagaaatcaatgggttataagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 28251750  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28251751 ccaaggtgaatcaacccacaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcaac 28251850  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgt 399  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  28251851 ccactctatctcaaagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactc-aaaatacgtttctgt 28251949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27829646 - 27829248
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||  ||| ||||    
T  27829646 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa 27829547  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27829546 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 27829448  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  27829447 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 27829348  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27829347 ccctctatctccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttttgtt 27829248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15068330 - 15067932
Alignment:
Q  3 gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||    
T  15068330 gaacacaaaagaatttgttggcccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccattatatgatgagtaacgttacaaaa 15068231  T
Q  103 gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttccc 202  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  15068230 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtatttccc 15068131  T
Q  203 aatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccc 301  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  15068130 aaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctggttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 15068031  T
Q  302 cctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    | |||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15068030 cttctatctcaaagtttaggttgatacaaggtttatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttttgtt 15067932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 41385095 - 41384724
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  41385095 gagaacagaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 41384996  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  41384995 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaattctcccacctaattctacctaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttc 41384896  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| |     
T  41384895 ccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttc-ag 41384797  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    ||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  41384796 cccctctatctcaatttttactttgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 41384724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 30480487 - 30480837
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  30480487 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccatttcactatatgatgactaacgttacaa 30480586  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30480587 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 30480686  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  30480687 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaac 30480786  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||| |||||||||| | |||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  30480787 cccttctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaa 30480837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27827335 - 27826937
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||  ||| ||||    
T  27827335 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa 27827236  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |  |||  ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27827235 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 27827137  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  27827136 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 27827037  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27827036 ccctctatctccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcactcaaaaatatgtttttgtt 27826937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32339659 - 32339280
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  32339659 agaacacaaaagaatttgttaacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa 32339560  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  32339559 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttac 32339460  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  32339459 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 32339360  T
Q  301 ccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  32339359 ccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 32339280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1225518 - 1225167
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  1225518 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcggccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 1225419  T
Q  101 aa-gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1225418 aaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 1225319  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||     
T  1225318 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccgtagtgtttgttccaaagagacaaactctttacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcag 1225219  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1225218 ccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgcctatatttatagtaaaa 1225167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 14419174 - 14419549
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  14419174 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactataatgatgagtaaccttaca 14419273  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    ||||| || | |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  14419274 aaagacatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgttt 14419373  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||     
T  14419374 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccccaatgtttgctcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcag 14419473  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaa 374  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||    
T  14419474 ccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatcactcataaattggaacaaa 14419549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18811057 - 18810680
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||  | |||||||| |||||||  ||| ||||    
T  18811057 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtattgttacaaa 18810958  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18810957 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctattcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 18810859  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  18810858 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 18810759  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||    
T  18810758 ccctctatctccaagtttgctctgatacaagatctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttgtaacaaatctgc 18810680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Original strand, 28283206 - 28283585
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  28283206 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 28283304  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| ||| |||||| |||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  28283305 -gagaaatcaatgggttgcaagaataagtctaccacctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcc 28283403  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  28283404 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagtcaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcc 28283503  T
Q  301 ccctcta------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||      |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  28283504 ccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 28283585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 41383013 - 41382652
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  41383013 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 41382914  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||          
T  41382913 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatag------ 41382820  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||| | |    
T  41382819 -----gtgaaacaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaattctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgttttagc 41382725  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  41382724 cccatctatctcaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 41382652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 350
Target Start/End: Original strand, 27106884 - 27107231
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaag 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||  | ||||||    
T  27106884 aacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggaggagatagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccctacaaaag 27106983  T
Q  104 agatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttccca 203  Q
    |||| || ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27106984 agatatctatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 27107083  T
Q  204 atgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacccc 302  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  27107084 aggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 27107183  T
Q  303 ctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27107184 ctctatctcaaggtttatactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 27107231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 13858469 - 13858868
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  13858469 gagaacacaaa-gaatttgtttacccagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttaca 13858567  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| | |||| | | |||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  13858568 aaagagatat-aatgggctgcaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgttt 13858666  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  13858667 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcat 13858766  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaac-aaatctgcacccaaaaatacgtttat 397  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | || ||||||| ||||||   |||||||||| ||||||    
T  13858767 ccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaattggaacaaaatctcagcccaaaaatatgtttat 13858866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27911364 - 27911011
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  27911364 gagagcacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggg-agagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaa 27911266  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
     |||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27911265 tagagatatcaatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 27911166  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  27911165 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc-ttctaaacccttgtttcagc 27911067  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatc 355  Q
    |||||||||||||| | ||||  |||||||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  27911066 cccctctatctcaaggtttacattgatacaatgtcaatatttattgtaaaagtatc 27911011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27957783 - 27957430
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  27957783 gagagcacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggg-agagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaa 27957685  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
     |||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27957684 tagagatatcaatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 27957585  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  27957584 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc-ttctaaacccttgtttcagc 27957486  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatc 355  Q
    |||||||||||||| | ||||  |||||||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  27957485 cccctctatctcaaggtttacattgatacaatgtcaatatttattgtaaaagtatc 27957430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3874360 - 3873981
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  3874360 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 3874261  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  3874260 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcc 3874161  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  3874160 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcc 3874061  T
Q  301 ccc----tctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||    ||| |||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  3874060 cccgctatctctctcaaagtttagcctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 3873981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 36865887 - 36865537
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtct-gggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  36865887 agaacacaagagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaactttaca 36865788  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||    
T  36865787 aaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtga---agagactcaatcctaatagtgttt 36865691  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  36865690 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 36865591  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttac-tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaa 351  Q
    |||||||||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36865590 ccccctctatcttaaggtttacatctgatacaatgtctatatttatagtaaaaa 36865537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15809568 - 15809190
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  15809568 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 15809469  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  | | | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  15809468 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttc 15809369  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  15809368 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 15809270  T
Q  301 ccc----tctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||    ||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  15809269 ccctttatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 15809190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 609077 - 608774
Alignment:
Q  9 aaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||      
T  609077 aaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaa 608978  T
Q  109 tcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtg 208  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  608977 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtg 608878  T
Q  209 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctcta 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  608877 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagccccctcta 608778  T
Q  308 tctc 311  Q
    ||||    
T  608777 tctc 608774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 33541394 - 33541722
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  33541394 gagaacacaaaagaaatttttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgtttcactatatgatgagtaaccttacaa 33541493  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||| ||||||                      |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  33541494 aagagatatcaatg----------------------cctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttc 33541571  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  33541572 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 33541671  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33541672 cccctctatctcaatgtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 33541722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 44721193 - 44720815
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||  | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  44721193 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa 44721094  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt-c 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  44721093 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttc 44720995  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  44720994 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacagactctatacaaaacatagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 44720895  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||| | |  |||||||| || |||||||||||    
T  44720894 cccctctatctcaaagtttgctttgatataaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 44720815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 346
Target Start/End: Original strand, 22684638 - 22684996
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||     
T  22684638 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaat 22684737  T
Q  102 agagatgtcaat---gagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    |||||  |||||   | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22684738 agagaaatcaatattgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 22684837  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttca 297  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||    
T  22684838 tcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttca 22684937  T
Q  298 accccctcta----------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
     || ||||||          |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22684938 gcctcctctatctctctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 22684996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 350
Target Start/End: Original strand, 5372161 - 5372511
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggggg-agagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  5372161 agaacagaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagtaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttaca 5372260  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||  ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5372261 aaaaagatatcaatgagttacaagaataagtctgccgcctaattatactcaaagtcccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttt 5372360  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||| |    
T  5372361 cccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctatataaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttc-a 5372459  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
     ||||||||||||||   |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5372460 gcccctctatctcaagatttacactgatacaatgtctataattatagtaaaa 5372511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25952872 - 25952522
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||  || ||    
T  25952872 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatttacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttaca 25952773  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |   |||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  25952772 aaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttctgcctaattctacccaatgtctcaatttcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatattgttt 25952673  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | |||||| ||||||| ||||||||||     
T  25952672 tccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactatatac-aaccctaattttattgttgcctttctaaacccttgtttcag 25952574  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  25952573 ccccctctatctcaaggtttcctctgatacaaagcttatatttatagtaaaa 25952522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43082323 - 43082013
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  43082323 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 43082224  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||    
T  43082223 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctgatagtgtttc 43082125  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |    
T  43082124 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagc 43082025  T
Q  300 cccctctatctc 311  Q
    ||||||||||||    
T  43082024 cccctctatctc 43082013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18813231 - 18812865
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| |||  | |||||||| |||||||  ||| ||||    
T  18813231 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctaatatgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtattgttacaaa 18813132  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  18813131 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtacccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 18813033  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||           |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  18813032 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaact-----------ctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 18812944  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgc 379  Q
     |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||    
T  18812943 tcctctatctccaagtttgctctgatacaagatctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttgtaacaaatctgc 18812865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 375
Target Start/End: Original strand, 24873178 - 24873547
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaat 113  Q
    ||||||||||| || |||||| |||  ||||||||| |||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| |||| ||||  |||||    
T  24873178 aatttgttgactcaattcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 24873276  T
Q  114 gagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttcccaatgtgaatc 212  Q
      |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  24873277 cggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatc 24873376  T
Q  213 aaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctcta---- 307  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||        
T  24873377 aacccacaaaccctagtgtttgctcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 24873476  T
Q  308 --tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
      |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  24873477 tctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaat 24873547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 43079952 - 43079650
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  43079952 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 43079853  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  43079852 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 43079754  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |    
T  43079753 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagc 43079654  T
Q  300 cccc 303  Q
    ||||    
T  43079653 cccc 43079650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43530465 - 43530099
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||| |||| | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  43530465 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggagagacagcagccctccgatccactatatgatgagtagcgttacaaa 43530366  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43530365 agagaaatcaatgggttacaggaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttcc 43530266  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||             || |||||  ||||||| |||||||||| ||    
T  43530265 caaggtgaatcaaccttcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacac-------------gttgttgcttttctaaacccttgtttcagcc 43530179  T
Q  301 ccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaat 375  Q
    |||||||    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||| ||||    
T  43530178 ccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaataaat 43530099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 117 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14477511 - 14477277
Alignment:
Q  117 ttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaacc 216  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14477511 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcccaaggtgaatcaacc 14477412  T
Q  217 ctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaag 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14477411 ctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctctatctcaagg 14477312  T
Q  316 cttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
     || ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14477311 tttgctctgatacaaagcctatatttatagtaaaa 14477277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 15185698 - 15186095
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || | |||||||||||||| | ||||||||| ||  |    
T  15185698 gagaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagaacagtcctccgtttcactataatgatgagtaaccttaaa 15185797  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaacc--gagtgactcaatcctaatagtgt 197  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| | ||||  |||||||||||||| |||       |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||    
T  15185798 aaagagatatcaatgggttacaagaataggtctctcgcctaattctacccaaa-------tctcttcccgtaaccaagagagactcaattctaatagtgt 15185890  T
Q  198 ttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttc 296  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  ||  | ||||||| |||||||||    
T  15185891 tttacaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttatataaaccatagttttgttattttctttctaaacccttgtttc 15185990  T
Q  297 aaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgttt 395  Q
    |  | ||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||   ||| |||||||||||    
T  15185991 agtcacctttatctcaaggtttactctgatacaaagtttatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatctaggcccgaaaatacgttt 15186090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21482649 - 21482323
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  |||| | ||||||||| || |||||||||| ||||    
T  21482649 aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttctttataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 21482550  T
Q  113 tgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatc 212  Q
    || |||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  21482549 tgggttacaagaataagtcactcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgactc 21482450  T
Q  213 aaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctc 311  Q
    |||||   |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||  |        ||||||| ||||||||||  || |||||||||    
T  21482449 aaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctagtttgat--------ttctaaacccttgtttcagtccactctatctc 21482362  T
Q  312 aaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21482361 aaagtttactctgatacaaattctatatttatagtaaaa 21482323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15956309 - 15956051
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| | || |||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  15956309 gagaatacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctaatctgagggagagagaaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttaca 15956210  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| |  || |||||||||| |||||||    
T  15956209 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagattcaatcctaacagtgttt 15956110  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacc 262  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15956109 cccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaacc 15956051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21480832 - 21480589
Alignment:
Q  23 acccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttaca 121  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||    
T  21480832 acccagttcgttccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttaca 21480733  T
Q  122 agaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaa 221  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  21480732 agaataagtcacccgcctaattctaccaaaaaccccaatatcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---a 21480636  T
Q  222 accctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttt 269  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21480635 aacctagtgtttgttgccaagag-caaactccatacaaaccctagttt 21480589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 156 - 374
Target Start/End: Original strand, 5622877 - 5623096
Alignment:
Q  156 ccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctat 255  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5622877 ccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatccaaataatgtttccaaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaatagacaaactctat 5622976  T
Q  256 acaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatat 354  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||   |||||||||||||||||  ||    
T  5622977 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttattctgatacaaaacctatatttatagtaaaagaat 5623076  T
Q  355 cacttaaaatttggaacaaa 374  Q
    |||| | || ||||||||||    
T  5623077 cactcataaattggaacaaa 5623096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31162551 - 31162186
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctggggg--agagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||| |||| || ||| ||||||| | ||||||||  || |||||||||| |    
T  31162551 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatat 31162452  T
Q  110 caatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtga 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31162451 caatgagttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 31162352  T
Q  210 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacctt--gtttcaaccccctcta 307  Q
    |||||||||  |||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||  |  |||   |||||||||||   ||| | ||||||||     
T  31162351 atcaaccct--aacgttagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaacactaatttgttgcttg--tttctaaacctttgtttttagccccctctt 31162257  T
Q  308 tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaatct 377  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||    
T  31162256 tctcaaggtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatct 31162186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26775374 - 26775202
Alignment:
Q  179 gactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgc 278  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  26775374 gactcaattctaatagtgttttccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactatatacaaaccctagtattgttgttgc 26775275  T
Q  279 cattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26775274 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttgctctgatacaaagcctatatttatagtaaaa 26775202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 189 - 350
Target Start/End: Original strand, 35872555 - 35872712
Alignment:
Q  189 taatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa- 287  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| |||||||     
T  35872555 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaaccctagtt-----gttgcctttctaaac 35872649  T
Q  288 ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35872650 ccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 35872712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 252 - 388
Target Start/End: Original strand, 3886153 - 3886290
Alignment:
Q  252 ctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3886153 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaa 3886252  T
Q  351 atatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaa 388  Q
     |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3886253 gtatcgcttaaaatttggaacaaatatgcacccaaaaa 3886290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 241 - 400
Target Start/End: Original strand, 12517248 - 12517410
Alignment:
Q  241 agagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctc--aaagcttactctgatacaaggtctat 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||||| |||    
T  12517248 agagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctcaaagtttgctctgatacaaggtatat 12517347  T
Q  338 atttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  12517348 atatatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatttgcactcaaaaatatgtttctgtt 12517410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Original strand, 3005624 - 3005880
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatg 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||||||| | ||||| ||| || ||||||||||     
T  3005624 aagaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagagcacccctccgttccactataatgatgagcaactttacaaaagagata 3005723  T
Q  109 tcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtg 208  Q
    ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  3005724 tcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatgctaatagtgttttccaaagtg 3005823  T
Q  209 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttt 269  Q
    ||||||   || ||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3005824 aatcaa---tccaaccctattgtttgttgttaagag-caaactctatacaaactctagttt 3005880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 179 - 400
Target Start/End: Original strand, 2468268 - 2468482
Alignment:
Q  179 gactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctata----caaaccctagttttgtag 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    |||||| ||||||  |      
T  2468268 gactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtatttgttgccaagag-caaactctatatatacaaaccgtagtttgat-- 2468361  T
Q  275 ttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaa 373  Q
          ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  2468362 ------ttctaaatccttgtttcagctccctctatctcaaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaacatttggaacaa 2468455  T
Q  374 atctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  2468456 atctgcactaaaaaatacgtttctgtt 2468482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 180 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31035238 - 31035027
Alignment:
Q  180 actcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgcc 279  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |    
T  31035238 actcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac 31035142  T
Q  280 attctaaacc-ttgtttcaaccccctcta--tctcaaagcttac-tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaat 375  Q
     ||||||||| ||||||  |  | |||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  31035141 -ttctaaaccattgttttcagactctctacctctcaaagtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatc-ctaaaaaattggaacaaat 31035044  T
Q  376 ctgcacccaaaaatacg 392  Q
    |||  ||||||||||||    
T  31035043 ctgagcccaaaaatacg 31035027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 264
Target Start/End: Original strand, 37214316 - 37214438
Alignment:
Q  133 tccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 232  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||         ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37214316 tccgcctaattctacccaaagttccaatcgcttcccgtaaccaagagactcaat---------gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 37214406  T
Q  233 tgttcccaagagacaaactctatacaaaccct 264  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37214407 tgttccaaagagacaaactctatacaaaccct 37214438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 181799 - 181622
Alignment:
Q  52 gggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaa 151  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||   ||||||||| || |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  181799 gggggagagagcagtcatctgtttcactatg--atgagtaactttacaaa-gagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaa 181703  T
Q  152 agctccaatctcttcc--cgtaaccgagtgactcaatcct-aatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagt 229  Q
    ||  ||| ||||||||  ||||||  || |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  181702 agtcccattctcttcccgcgtaactaagagacttaatcctaaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagt 181622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 257 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 181632 - 181516
Alignment:
Q  257 caaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatc 355  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  181632 caaaccctagttttattgttgccattctaagcccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtata 181533  T
Q  356 actta-aaatttggaac 371  Q
    ||| | |||||||||||    
T  181532 actcataaatttggaac 181516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 14477601 - 14477519
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacc-cagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatat 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14477601 agaacacaaaagaatttgttgaccgcagttcgatccaaattgacctagtctggggtaaagagtagccatccgtttcactatat 14477519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31035459 - 31035252
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaa-attgaccta--gtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||| || |||| ||||| |    
T  31035459 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctatagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatat 31035361  T
Q  110 caatgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtg 208  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||   ||||||||||| || ||| || ||||||||| |||  ||||||||||| |||    
T  31035360 caaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacctaaagtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcataacggtgtttcccaaggtg 31035261  T
Q  209 aatcaaccc 217  Q
    |||||||||    
T  31035260 aatcaaccc 31035252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 270
Target Start/End: Original strand, 31573794 - 31573975
Alignment:
Q  85 atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc 183  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||  |||||||   |||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||| || |||||    
T  31573794 atgagtaactttacaaaagagatatcaaagaattacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc 31573893  T
Q  184 aatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttt 270  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| |  | |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||| |||||||||    
T  31573894 aatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccatagtgtttgttgccaagaga-aaactc--tacaaatcctagtttt 31573975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 37214251 - 37214319
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccg 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  37214251 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccatccg 37214319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Original strand, 31578273 - 31578476
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||||| ||   |||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||    
T  31578273 aatttgtttacccagttcggtcctatactgacctagtctaggggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 31578372  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccg-cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 210  Q
    |   ||||||||||  |||||||   |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| || ||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  31578373 aaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcataacagtgtttcccaaggtgaa 31578472  T
Q  211 tcaa 214  Q
    ||||    
T  31578473 tcaa 31578476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Original strand, 2468126 - 2468259
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactat-attatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaa 112  Q
    |||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||  ||||||||| || ||||||||| || |||||||||| ||||    
T  2468126 aatttgtttacctagttctgtccaaattgacctaatctgggagagagagcagccctctatttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 2468225  T
Q  113 tgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattcta 146  Q
    || | |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  2468226 tgggctacaagaataagtctcccgtctaattcta 2468259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17847558 - 17847501
Alignment:
Q  321 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  17847558 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcaaaatttggaacaaatctg 17847501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 35872437 - 35872537
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||             ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  35872437 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-------------gggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatgttacaa 35872523  T
Q  101 aagagatgtcaatg 114  Q
    ||||||| ||||||    
T  35872524 aagagatatcaatg 35872537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6376032 - 6375985
Alignment:
Q  308 tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatc 355  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6376032 tctcaatgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatc 6375985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Original strand, 10930193 - 10930243
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  10930193 aagaaattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 10930243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 23179555 - 23179627
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaat--tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  23179555 aagaatttgtttacccagttcggt-ctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctatccgttccactata 23179627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 181830 - 181798
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgg 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  181830 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgg 181798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15212954 - 15212910
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  15212954 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 15212910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 27811446 - 27811402
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  27811446 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 27811402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 33352318 - 33352274
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  33352318 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 33352274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 40321248 - 40321204
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  40321248 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 40321204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 4733873 - 4733830
Alignment:
Q  18 tgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  4733873 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 4733830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 30423274 - 30423212
Alignment:
Q  137 cctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||||    
T  30423274 cctaattctatccaaagttccaatctcttcccgcgaccaagagactcaatcctaaaagtgttt 30423212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 9765912 - 9765867
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  9765912 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 9765867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 26403323 - 26403278
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  26403323 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 26403278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 313
Target Start/End: Original strand, 37214458 - 37214507
Alignment:
Q  265 agttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctcaa 313  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  37214458 agttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 37214507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 40221910 - 40221869
Alignment:
Q  20 ttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  40221910 ttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 40221869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 4743214 - 4743258
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  4743214 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactttgggggagaga 4743258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 5689439 - 5689395
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||    
T  5689439 ttgttgacccagttcggtccaacttgaccaaatctgggggagaga 5689395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 6599140 - 6599096
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  6599140 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 6599096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 6674593 - 6674549
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  6674593 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 6674549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 12702634 - 12702678
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||    
T  12702634 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagaga 12702678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 43036591 - 43036547
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  43036591 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggaggagaga 43036547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 387
Target Start/End: Original strand, 69277 - 69666
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  69277 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 69376  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  69377 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 69475  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  69476 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 69575  T
Q  301 ccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaa 387  Q
    |||||||    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69576 ccctctatctctctcaaagtttgctctgatataaggtctatatttattgtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaa 69666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 201 - 387
Target Start/End: Original strand, 73207 - 73398
Alignment:
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  73207 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 73306  T
Q  300 cccctcta----tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaa 387  Q
    ||||||||    |||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73307 cccctctatctctctcaaagtttcctttgatacacggtctatatttatagtaaaagtatctcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaa 73398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Original strand, 73160 - 73208
Alignment:
Q  190 aatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcc 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  73160 aatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttttttcc 73208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15313 - 14923
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtc 110  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||    
T  15313 aagaatttgttgagtcagttcggtccaaattgacctagcatgggggagacagcagccttccgttccactatatgatgagtaactttacaaaagagatatc 15214  T
Q  111 aatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 210  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15213 aatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtctgaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 15114  T
Q  211 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatc 309  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  15113 tcaaccctcaaactctagtgtttgttccaaagagacaaactttataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatcattgtttcagccccctctatc 15014  T
Q  310 tcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15013 tcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtt 14923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 339
Target Start/End: Original strand, 14376 - 14707
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  14376 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatc 14475  T
Q  111 aatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 210  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14476 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 14575  T
Q  211 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaaccccctcta-- 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| |||||||||      
T  14576 tcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccattgtttcatccccctctatc 14675  T
Q  308 tctcaaagcttactctgatacaaggtctatat 339  Q
    |||||||| || |||| | |||||||||||||    
T  14676 tctcaaagtttgctctaaaacaaggtctatat 14707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 2 - 346
Target Start/End: Original strand, 41468 - 41813
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41468 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaa 41567  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41568 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 41667  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  41668 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 41767  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  41768 ccctctatctctaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 41813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 2 - 346
Target Start/End: Original strand, 183626 - 183969
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  183626 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaa 183725  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  183726 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt-ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 183824  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaacc-ttgtttcaacc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |    
T  183825 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttc-agc 183923  T
Q  301 ccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183924 ccttctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagt 183969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 52307 - 51941
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagt--agccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatg 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  52307 aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatg 52208  T
Q  109 tcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52207 tcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 52108  T
Q  209 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctcta 307  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  52107 aatcaatcctcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctcta 52008  T
Q  308 --tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
      |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  52007 tctctcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 51941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 50308 - 50235
Alignment:
Q  11 aagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggag--agagtagccatccgtttcactata 82  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||    
T  50308 aagaatttgttgacccagttaggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata 50235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 3182 - 2784
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  3182 agaacacaaaatattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctcggggagatagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 3083  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatc-tcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||     
T  3082 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag-tccaagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 2985  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  2984 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 2885  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgt 399  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2884 cccctctatctcaaagtttgctctgatacaagttctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgt 2785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 79489 - 79140
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  79489 gagaacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaa 79390  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  79389 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaattctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 79290  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | |    
T  79289 ccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagc 79190  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 349  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  79189 cccctctatctcaagttttactctgattcaaggtctatatttatagtaaa 79140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 11457 - 11829
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  | |||||||| |||||||||||| |||    
T  11457 gagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtaacgttacaa 11556  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||  |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11557 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 11656  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||| |    
T  11657 ccaaggaaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaatccctgtttcagc 11756  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    |||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  11757 cccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 11829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 80163 - 79813
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  80163 gagatcacaaaagaatttgttgacccagttcaatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaa 80064  T
Q  101 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  80063 aagagatgtcaatgagttacaggaataagtctcctgcctaa-tctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttc 79965  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||||     
T  79964 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatttttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgtctttctaaacccttgtttcag 79865  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||   |||||||||||||||||    
T  79864 ccccctctatctcaaggtttacactgatacaaaaactatatttatagtaaaa 79813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 29473 - 29065
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||  ||| ||||    
T  29473 agaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa 29374  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  29373 -gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcc 29275  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaacc 300  Q
    ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||| ||    
T  29274 caaggcgaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagcc 29175  T
Q  301 ccctcta----------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcacttaaaatttggaacaaatctgcacccaaaaata 390  Q
    |||||||          |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29174 ccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagttttgcttaaaatttgtaacaaatctgcactcaaaaata 29075  T
Q  391 cgtttatgtt 400  Q
     |||| ||||    
T  29074 tgtttctgtt 29065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6502 - 6153
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| ||||    
T  6502 agaacacaaagaaatttgttgactcagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa 6403  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  6402 -gagaaatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttc 6304  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| |    
T  6303 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcttttctaaacccttgtttcagc 6204  T
Q  300 cccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6203 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 6153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 344 - 34
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||||  |||| ||||    
T  344 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa 245  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactc-aatcctaatagtgtttc 200  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  244 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 146  T
Q  201 ccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaac 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |    
T  145 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagc 46  T
Q  300 cccctctatctc 311  Q
    ||||||||||||    
T  45 cccctctatctc 34  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 85535 - 85185
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | ||||||||| || |     
T  85535 gagaacacaaaagaatttgtttacctggttcagttcaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacg 85436  T
Q  100 aaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgttt 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||| || |||||||  ||||   |||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||||    
T  85435 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctgattctactcaaagtcacaatctcttctcgtaaccaaaagactcaatcctagtagtgttt 85336  T
Q  200 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaa 298  Q
     |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||| |||||||||      
T  85335 tccaaggtgaatcaaccctcaaactttagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttttaaatccttgtttc-t 85237  T
Q  299 ccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    || | |||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  85236 cctcttctatctcaaggtttactttgatacaaagcctatatttatagtaaaa 85185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Original strand, 1438 - 1673
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  1438 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa 1537  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcc 201  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1538 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 1636  T
Q  202 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcc 238  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1637 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcc 1673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 400
Target Start/End: Original strand, 15817 - 16203
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaa-attgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||| |||| |||||| || | |||||| |||| || | ||||||||| || |||||||||| |||    
T  15817 aatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatca 15916  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaat 211  Q
    ||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  15917 atgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcgcaaggtgaat 16016  T
Q  212 caaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatct 310  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16017 caa-cctc-aaccctagtgtttgttgctaggag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttatttcaaccccctctatct 16112  T
Q  311 caaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcactta-aaatttggaacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgtt 400  Q
     || | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||    
T  16113 taaggtttactctgatacaaaatctatatttatagtaaaagtatccctcataaatttggaacaaatctcagcccaaaaatatgattatgtt 16203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 53 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2293 - 1968
Alignment:
Q  53 ggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaa 152  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||  | |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||    
T  2293 ggggagagagtagccctccgattcactatatgatgaggaacgttacaaaagagaaattaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaa 2194  T
Q  153 gctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactc 252  Q
    |  |||  || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  2193 gtcccagccttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttattccgaagagacaaactc 2095  T
Q  253 tatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctcta------tctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatag 345  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||      |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  2094 tgtacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctatatctttctctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatag 1995  T
Q  346 taaaaatatcactta-aaatttggaac 371  Q
    | ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  1994 tgaaagtataacttataaatttggaac 1968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 16646 - 16986
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||  | || |  ||  ||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||    
T  16646 aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagataaaccctttgtcccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 16745  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaat 211  Q
    ||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16746 atgggttacaagaataagtctctggcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtcaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaat 16845  T
Q  212 caaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaaccttg-tttcaaccccctctatct 310  Q
    ||| |  | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  16846 caatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttgt-gttgtctttcaaacccttgttttcagcctcctctatct 16941  T
Q  311 caaagcttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatc 355  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  16942 caaggtttactctgatacaaggtttatatttatattaaaattatc 16986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 127 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35817 - 35594
Alignment:
Q  127 aagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccct 226  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  35817 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttccctaggtgaattaaccctcaaaccct 35718  T
Q  227 agtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctga 325  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | | |||||||| |   | ||   ||||    
T  35717 agtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc-agcgcctctatcacccggtttgtactga 35619  T
Q  326 tacaaggtctatatttatagtaaaa 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  35618 tacaatgtctatatttatagtaaaa 35594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 35898 - 35817
Alignment:
Q  1 gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactata 82  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||| |||||| |||||||    
T  35898 gagaacacaaaataatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctaaggaagagagcagccctccgttccactata 35817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Original strand, 1638 - 1958
Alignment:
Q  14 aatttgttgacccagttcggttcaaat-tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtca 111  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||    
T  1638 aatttgtttacccagttcggtcaaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctacgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 1737  T
Q  112 atgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaat 211  Q
    ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1738 atgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaattgtgtttcccaaggtgaat 1837  T
Q  212 caaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa-ccttgtttcaaccccctctatct 310  Q
    |||||    ||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  1838 caacc--acaaccctagtgtttgtt---------gaaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcagccacctctatct 1925  T
Q  311 caaagcttac-tctgatacaaggtctatattta 342  Q
    | | | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1926 ctaggtttacatctgatacaaggtctatattta 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22418 - 22221
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  22418 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 22320  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  22319 agagaaatcaatgagttacaag-aatagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24693 - 24496
Alignment:
Q  2 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatattatgagtaacgttgcaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| | |||||||||||| | ||    
T  24693 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 24595  T
Q  102 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgact-caatcctaatagtgtttc 200  Q
    |||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  24594 agagaaatcaatgagttacaag-aatagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 24496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 8512 - 8467
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  8512 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 8467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 184 - 346
Target Start/End: Original strand, 993 - 1161
Alignment:
Q  184 aatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaa-----gagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgc 278  Q
    |||||||| ||| |||| ||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  993 aatcctaaaagtatttcgcaaggtggatcaaccctccaaacgtagtgtttgttccaaactaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 1092  T
Q  279 cattctaaacc-ttgtttcaaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatagt 346  Q
    | ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  1093 ctttctaaacccttgtttcagccccttctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 1161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5016 - 4773
Alignment:
Q  99 aaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagctccaatctcttcccgtaaccgagtgactcaatcctaatagtgtt 198  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||| || ||||||||||||||||||||    
T  5016 aaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcttcaatctcttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtt 4917  T
Q  199 tcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgccattctaaa--ccttgtttc 296  Q
    ||||||  ||||||||  ||| ||| |||||||||||| |  ||||| |||| ||||| ||||||||||||  |  || |  |||||||  | || ||||    
T  4916 tcccaacatgaatcaa-actc-aactctagtgtttgttgctgagaga-aaacgctatataaaccctagtttgttgcttac--ttctaaatcctttttttc 4822  T
Q  297 aaccccctctatctcaaagcttactctgatacaaggtctatatttatag 345  Q
    |  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4821 agacccctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatag 4773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 4666 - 4729
Alignment:
Q  4 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagcc 67  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4666 aacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 4729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 51
Target Start/End: Original strand, 1439 - 1485
Alignment:
Q  5 acacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtct 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1439 acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 20415 - 20459
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  20415 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 20459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 5687 - 5737
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagtagcc 67  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5687 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 5737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 149097 - 149141
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagaga 61  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||    
T  149097 ttgttgacccagttcggtccaacttaacctactctgggggagaga 149141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 45257 - 45302
Alignment:
Q  17 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagag 62  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  45257 ttgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagag 45302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 125
Target Start/End: Original strand, 57452 - 57537
Alignment:
Q  41 tgacctagtctgggggagagagtagccatccgtttcactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaa 125  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  || ||| || |||||| ||||||||| || ||||| |||| |||| | ||||||||||    
T  57452 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgttccattatattaatgagtaactttacaaaatagatatcaaagggttacaagaa 57537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University