View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10921_low_8 (Length: 260)

Name: NF10921_low_8
Description: NF10921
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10921_low_8
NF10921_low_8
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (11-245)||(31948036-31948270)
chr4 (19-96)||(40547768-40547845)
chr4 (19-89)||(47108691-47108761)
chr4 (19-99)||(41139943-41140023)
chr4 (19-98)||(46242620-46242699)
chr4 (19-101)||(42775775-42775857)
chr4 (19-96)||(2126309-2126386)
chr4 (19-96)||(19461266-19461343)
chr4 (19-100)||(28751740-28751821)
chr4 (19-96)||(35470595-35470672)
chr4 (21-96)||(30303593-30303668)
chr4 (19-66)||(52294627-52294674)
chr4 (40-99)||(3803718-3803777)
chr4 (19-66)||(26534959-26535006)
chr4 (36-98)||(10633181-10633243)
chr4 (19-89)||(42776556-42776626)
chr4 (6-70)||(17727504-17727568)
chr4 (19-99)||(24705801-24705881)
chr4 (19-95)||(27284221-27284297)
chr4 (21-96)||(21782446-21782521)
chr4 (11-81)||(5579666-5579736)
chr4 (19-81)||(16299792-16299854)
chr4 (19-100)||(56118165-56118246)
chr4 (36-96)||(31473999-31474059)
chr4 (19-99)||(54566645-54566725)
chr4 (36-98)||(21012437-21012499)
chr4 (19-95)||(13318216-13318291)
chr4 (24-96)||(16516644-16516716)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (19-104)||(41761736-41761821)
chr5 (19-99)||(32249646-32249726)
chr5 (19-96)||(12480372-12480449)
chr5 (19-99)||(22304731-22304811)
chr5 (11-96)||(15579998-15580084)
chr5 (19-89)||(22304655-22304725)
chr5 (19-100)||(28490378-28490460)
chr5 (21-99)||(33995441-33995519)
chr5 (19-96)||(6771823-6771900)
chr5 (36-101)||(12064313-12064378)
chr5 (19-96)||(17541884-17541961)
chr5 (23-88)||(38178813-38178878)
chr5 (23-88)||(38206037-38206102)
chr5 (19-95)||(37091059-37091135)
chr5 (19-98)||(927773-927852)
chr5 (21-100)||(15270413-15270492)
chr5 (19-94)||(28489934-28490009)
chr5 (24-89)||(8255434-8255499)
chr5 (21-78)||(14835265-14835322)
chr5 (36-96)||(20320529-20320589)
chr5 (19-66)||(1209138-1209185)
chr5 (33-96)||(13390962-13391025)
chr5 (19-66)||(30519427-30519473)
chr5 (19-66)||(30559767-30559813)
chr5 (38-100)||(25935147-25935209)
chr5 (22-96)||(33146556-33146630)
chr5 (33-101)||(40089407-40089475)
chr5 (19-66)||(8264918-8264965)
chr5 (19-66)||(13064479-13064526)
chr5 (36-99)||(19533764-19533827)
chr5 (19-89)||(31316595-31316665)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (19-100)||(28181794-28181875)
chr3 (19-100)||(43863482-43863563)
chr3 (18-89)||(34396151-34396222)
chr3 (19-89)||(48824641-48824711)
chr3 (19-99)||(671185-671265)
chr3 (19-99)||(34089048-34089128)
chr3 (19-98)||(21731391-21731470)
chr3 (19-105)||(24241702-24241788)
chr3 (21-99)||(38506481-38506559)
chr3 (19-89)||(48948054-48948124)
chr3 (19-96)||(36397511-36397588)
chr3 (19-96)||(53469951-53470028)
chr3 (21-97)||(21307110-21307186)
chr3 (19-98)||(7977023-7977102)
chr3 (19-98)||(35279468-35279547)
chr3 (19-89)||(13339098-13339168)
chr3 (19-106)||(44288014-44288101)
chr3 (19-98)||(52527482-52527561)
chr3 (19-81)||(13176206-13176268)
chr3 (19-89)||(28092136-28092205)
chr3 (21-66)||(6836590-6836635)
chr3 (19-88)||(53129434-53129503)
chr3 (36-96)||(8762276-8762336)
chr3 (36-96)||(19475966-19476026)
chr3 (36-100)||(47714426-47714490)
chr3 (19-98)||(2105202-2105281)
chr3 (36-99)||(54761423-54761486)
chr3 (36-98)||(33871762-33871824)
chr3 (19-89)||(34936451-34936521)
chr3 (25-66)||(44329524-44329565)
chr3 (19-66)||(47283830-47283877)
chr3 (19-66)||(55460738-55460785)
chr3 (19-89)||(645742-645812)
chr3 (19-100)||(42005469-42005550)
chr3 (11-52)||(46636313-46636354)
chr3 (19-96)||(50168191-50168268)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (19-96)||(29256913-29256990)
chr8 (19-96)||(29611795-29611872)
chr8 (19-100)||(33376825-33376906)
chr8 (19-89)||(40733642-40733712)
chr8 (19-104)||(33986469-33986554)
chr8 (11-96)||(35978592-35978677)
chr8 (19-96)||(44346221-44346298)
chr8 (19-99)||(14710-14790)
chr8 (19-95)||(31980047-31980123)
chr8 (19-99)||(43185452-43185532)
chr8 (17-94)||(13145054-13145131)
chr8 (21-78)||(26520000-26520057)
chr8 (19-96)||(29482341-29482418)
chr8 (19-88)||(31976673-31976742)
chr8 (19-99)||(1087843-1087923)
chr8 (19-95)||(10593545-10593620)
chr8 (36-100)||(30444802-30444866)
chr8 (22-96)||(34009164-34009238)
chr8 (36-94)||(36103250-36103308)
chr8 (19-66)||(10605993-10606040)
chr8 (24-94)||(15719406-15719476)
chr8 (19-96)||(9983120-9983197)
chr8 (20-60)||(6460532-6460572)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (19-96)||(28538677-28538754)
chr7 (19-99)||(39342157-39342237)
chr7 (19-96)||(43791494-43791571)
chr7 (19-99)||(14602768-14602848)
chr7 (19-98)||(2411784-2411863)
chr7 (19-89)||(30587437-30587507)
chr7 (19-96)||(23548119-23548196)
chr7 (19-96)||(35456277-35456354)
chr7 (19-96)||(36328328-36328405)
chr7 (19-100)||(40496191-40496272)
chr7 (19-94)||(9784455-9784531)
chr7 (19-96)||(42816995-42817072)
chr7 (19-96)||(45984806-45984883)
chr7 (19-96)||(45989166-45989243)
chr7 (19-91)||(30629532-30629604)
chr7 (22-96)||(35488688-35488761)
chr7 (33-96)||(14790554-14790617)
chr7 (19-66)||(38320751-38320798)
chr7 (19-66)||(45967521-45967568)
chr7 (38-96)||(26161987-26162045)
chr7 (19-81)||(30080323-30080385)
chr7 (19-97)||(40495672-40495750)
chr7 (19-96)||(32650996-32651073)
chr7 (19-66)||(18926202-18926249)
chr7 (25-88)||(37460478-37460541)
chr7 (19-81)||(26416393-26416455)
chr7 (36-100)||(29639059-29639124)
chr7 (19-96)||(41442603-41442680)
chr7 (39-87)||(1580381-1580429)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (19-100)||(15615916-15615997)
chr6 (19-98)||(6357823-6357902)
chr6 (19-96)||(1368948-1369025)
chr6 (19-97)||(8475601-8475679)
chr6 (19-98)||(1195776-1195855)
chr6 (36-99)||(34364894-34364957)
chr6 (36-96)||(34244843-34244903)
chr6 (21-96)||(10105480-10105555)
chr6 (19-98)||(28918629-28918708)
chr6 (36-96)||(13487425-13487485)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (19-100)||(39630698-39630779)
chr2 (19-98)||(769504-769583)
chr2 (19-98)||(33188787-33188866)
chr2 (19-96)||(35047201-35047278)
chr2 (19-99)||(1583329-1583409)
chr2 (19-98)||(3092718-3092797)
chr2 (19-98)||(7309434-7309513)
chr2 (21-99)||(2925125-2925203)
chr2 (19-89)||(44256106-44256176)
chr2 (19-96)||(8735965-8736042)
chr2 (19-96)||(32839188-32839265)
chr2 (19-98)||(19231015-19231093)
chr2 (19-88)||(2274318-2274386)
chr2 (19-96)||(13018217-13018294)
chr2 (19-100)||(17906114-17906195)
chr2 (19-94)||(21504922-21504997)
chr2 (19-98)||(41585192-41585271)
chr2 (19-89)||(19193750-19193820)
chr2 (14-96)||(31941423-31941505)
chr2 (19-103)||(31703916-31704000)
chr2 (19-94)||(11141777-11141852)
chr2 (21-96)||(14306364-14306439)
chr2 (36-98)||(10480269-10480331)
chr2 (21-99)||(19072305-19072383)
chr2 (19-66)||(7611449-7611496)
chr2 (19-66)||(11595277-11595324)
chr2 (19-66)||(11607179-11607226)
chr2 (19-85)||(11799265-11799329)
chr2 (21-96)||(28021706-28021781)
chr2 (36-98)||(7684594-7684656)
chr2 (36-98)||(11532112-11532174)
chr2 (36-96)||(11794045-11794105)
[»] chr1 (28 HSPs)
chr1 (17-105)||(32128554-32128642)
chr1 (19-96)||(946852-946929)
chr1 (19-96)||(15467486-15467563)
chr1 (21-80)||(10166969-10167028)
chr1 (19-100)||(28632122-28632203)
chr1 (11-96)||(35499513-35499598)
chr1 (19-103)||(21267339-21267423)
chr1 (21-96)||(220627-220702)
chr1 (19-66)||(50472188-50472235)
chr1 (19-88)||(23955987-23956056)
chr1 (19-99)||(39887538-39887618)
chr1 (19-98)||(37447424-37447503)
chr1 (19-96)||(6470228-6470306)
chr1 (19-81)||(32647765-32647827)
chr1 (36-94)||(47165077-47165135)
chr1 (36-98)||(47541849-47541911)
chr1 (19-100)||(37036500-37036581)
chr1 (19-96)||(41480954-41481031)
chr1 (19-98)||(37446881-37446960)
chr1 (19-66)||(44571150-44571197)
chr1 (19-94)||(44571663-44571738)
chr1 (38-96)||(24273084-24273142)
chr1 (19-89)||(48954017-48954087)
chr1 (19-96)||(8225245-8225322)
chr1 (38-99)||(12293019-12293080)
chr1 (36-89)||(26500949-26501002)
chr1 (19-51)||(41577842-41577874)
chr1 (21-89)||(41822080-41822148)
[»] scaffold0129 (1 HSPs)
scaffold0129 (19-66)||(19337-19384)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (19-81)||(7624-7686)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (21-99)||(4493-4571)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (19-88)||(3329-3398)
[»] scaffold0337 (2 HSPs)
scaffold0337 (11-81)||(15501-15571)
scaffold0337 (19-66)||(15967-16014)
[»] scaffold0065 (2 HSPs)
scaffold0065 (11-81)||(2543-2613)
scaffold0065 (19-66)||(3009-3056)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (19-81)||(130720-130782)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (36-95)||(11319-11378)
[»] scaffold0417 (1 HSPs)
scaffold0417 (19-89)||(11503-11573)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 31948036 - 31948270
Alignment:
Q  11 atgaatggaatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaaggtttttggaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  31948036 atgaatggaatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagtttccaattacctcgtccaaacgcactgtaaggtttttgaaat 31948135  T
Q  111 gtgaaaattactttgctgcccttctgttcatacaccatgtcttgccattacttggttaccaagttgctaattttgcatggaagatcagcctagagaactg 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31948136 gtgaaaattactttggtgcccttctgttcatacactatgtcttgccattacttggttaccaagttgctacttttgcatggaagatcagcctagagaactg 31948235  T
Q  211 agcacacattttgtcgatataggcatcatgatgct 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31948236 agcacacattttgtcgatataggcatcatgatgct 31948270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 40547845 - 40547768
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  40547845 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattttaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactct 40547768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 47108691 - 47108761
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaac 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  47108691 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaattttccaattacctcatccaaac 47108761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 41139943 - 41140023
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||| |||||||||    
T  41139943 aatttaattgaatcatttaaattgcttagaattttaaattctttaaaatttctcaattacttcttccaaacacactctaag 41140023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 46242699 - 46242620
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  46242699 aatttaattcaatcatttaaattgcttagaattataaattctttaaaatttcccaattacctcatccaaacacactctaa 46242620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 42775857 - 42775775
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaaggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  42775857 aatttaattgaatcatttaaatttcctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactcttaggt 42775775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 2126309 - 2126386
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||||||| ||||||    
T  2126309 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttctcaattaccccatccaaacacactct 2126386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 19461343 - 19461266
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||| | ||||| ||||||    
T  19461343 aatttaattgaatcatctaaattgcctaaaattttaaattctttaaaaaattctaattacctcattcaaacacactct 19461266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 28751821 - 28751740
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||  |||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  28751821 aatttaattgaatcatttaaattgcctataattctaaattttttaaaatttctcaattatctcatccaaacacactctaagg 28751740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 35470595 - 35470672
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||| ||||||    
T  35470595 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacatcatccaaacacactct 35470672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 96
Target Start/End: Original strand, 30303593 - 30303668
Alignment:
Q  21 tttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  30303593 tttaattgaatcatttgaattgcctagaattttaaattctttaaaatttctcaattatctcatccaaacacactct 30303668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 52294674 - 52294627
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52294674 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattcattaaaa 52294627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 99
Target Start/End: Original strand, 3803718 - 3803777
Alignment:
Q  40 ttgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  3803718 ttgcctaaaattttaaattctttaaaattttcaaattacctcatccaaacacactctaag 3803777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Original strand, 26534959 - 26535006
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26534959 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaa 26535006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 98
Target Start/End: Original strand, 10633181 - 10633243
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10633181 taaattgcctagaattttaaattctttaaaatttccaaattacctcatccaaacacactctaa 10633243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 42776556 - 42776626
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  42776556 aattgaattgaatcatttaaattgcttaggattctaaattctttaaaattttccaattacctcatccaaac 42776626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 70
Target Start/End: Original strand, 17727504 - 17727568
Alignment:
Q  6 gtgagatgaatggaatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagtta 70  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  17727504 gtgaaatgaaagtaatttaattgaatcatttaaattaccctaaattctaaattctttaaaagtta 17727568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 24705801 - 24705881
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||| | ||||||| |||||||||    
T  24705801 aattgaattgaatcatttgaattccctaaaattctaaattcttcaaaatttttcaattaccccatccaaacacactctaag 24705881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 27284297 - 27284221
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactc 95  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || | |||||  || ||||||| |||||    
T  27284297 aatttaattgaaccatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaattttcaaattatatcatccaaacacactc 27284221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 96
Target Start/End: Original strand, 21782446 - 21782521
Alignment:
Q  21 tttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  21782446 tttaatggaatcatttgaattgtctagaattctaaattctttaaaatttcacaattacctcatccaaacacactct 21782521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 5579736 - 5579666
Alignment:
Q  11 atgaatggaatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctc 81  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||| || | |||||||||    
T  5579736 atgaaaggaatttaattgaatcatttaaattgtttggaattttaaattcttcaaaattttctaattacctc 5579666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 16299854 - 16299792
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctc 81  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| | || |||||||||||    
T  16299854 aatttaattgaatcatttaaattaactagaattttaaattctctaatattttccaattacctc 16299792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 56118246 - 56118165
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaagg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | |||| ||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  56118246 aatttaattaaatcatttaaattgcctagaattctgagttctctaaaatttgtcaattacctcatccaaacacactcgaagg 56118165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 96
Target Start/End: Original strand, 31473999 - 31474059
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  31473999 taaattgtctagaattttaaattctttaaaatttccaaattacctcatccaaacacactct 31474059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 54566645 - 54566725
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||| ||  |||||||| | ||||||| |||||||||    
T  54566645 aattgaattgaatcatttgaattcccttgaattttaaattcattaaaatttctcaattaccccatccaaacacactctaag 54566725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 21012499 - 21012437
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21012499 taaattgtctagaattttaaattctttaaaatttttaaattacctcatccaaacacactctaa 21012437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 13318291 - 13318216
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactc 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||| || ||||||| |||||    
T  13318291 aatttaattgaatcatttaaattccataaaa-tctaaattctttaaaatttctcaaatacatcatccaaacacactc 13318216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 96
Target Start/End: Original strand, 16516644 - 16516716
Alignment:
Q  24 aattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||||| |||| || | |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  16516644 aattgaatcatttgaattaccaagaattctaaattcttcaaaatttctcaattacctcatccaaacacactct 16516716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 41761821 - 41761736
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaaggtttt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41761821 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactctaaggtttt 41761736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 32249726 - 32249646
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  32249726 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaattttcaaattacctcatccaaacacactctaag 32249646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 12480372 - 12480449
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12480372 aatttaattgaatcatttaaattgcttagaattctaaattctttaaaattttccaattacctcatccaaacacactct 12480449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22304811 - 22304731
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||  |||||||||    
T  22304811 aatttaattgaatcatttaaattgcctaggattctaaattctttaaaatttcccaattacctcatcaaaatacactctaag 22304731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15580084 - 15579998
Alignment:
Q  11 atgaatggaatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaatta-cctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || | ||||| |||| ||||||| ||||||    
T  15580084 atgaaaggaatttaattgaatcatttaaattgtctagaattttaaattttttaaaatttcctaattaccctcatccaaacacactct 15579998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 22304655 - 22304725
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaac 89  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  22304655 aatttaattgaatcatttaaattgtctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaac 22304725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Original strand, 28490378 - 28490460
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattcttt-aaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  |  |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28490378 aatttaattgaatcatttaaattgccttgaattttaaattctttaaaaaaatttcaattacctcatccaaacacactctaagg 28490460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 33995519 - 33995441
Alignment:
Q  21 tttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||| || ||||||| |||||||||    
T  33995519 tttaattgaatcatttgaattgcctaaaattctaatttctttaaaatttgtcaattacatcatccaaacacactctaag 33995441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 6771900 - 6771823
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  6771900 aatttaattgaatcatttgaattgcatagaattctaaattctttaaaatttcccaattaactcatccaaacacactct 6771823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12064378 - 12064313
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaaggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12064378 taaattgcctagaattttaaattctttaaaatttccaaattacctcatccaaacacactctaaggt 12064313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 17541961 - 17541884
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  17541961 aatttaattgaatcatttaaattgtctaggattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactct 17541884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 38178878 - 38178813
Alignment:
Q  23 taattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaa 88  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  38178878 taattgattcatttaaattgcctataattctaaattctttaaaattttccaattacctcatccaaa 38178813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 38206102 - 38206037
Alignment:
Q  23 taattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaa 88  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  38206102 taattgattcatttaaattgcctataattctaaattctttaaaattttccaattacctcatccaaa 38206037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 95
Target Start/End: Original strand, 37091059 - 37091135
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactc 95  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| | || |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  37091059 aatttaattgaatcattttaattacctagagttctaaattctttaagatttaccaattacctcatccaaacacactc 37091135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Original strand, 927773 - 927852
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||| ||||||||    
T  927773 aatttaattaaatcatttaaattgtctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcattcaaacacactctaa 927852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 15270492 - 15270413
Alignment:
Q  21 tttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaagg 100  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| || |||||||    
T  15270492 tttaattgaatcatttcaattacctagaattctaaattctttaaaattttccaattacctcattcaaacacattctaagg 15270413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 94
Target Start/End: Original strand, 28489934 - 28490009
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcact 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| || | ||||||||| ||||||| ||||    
T  28489934 aatttaattgaatcatttaaattgcctaggattctaaattccttaaaattttctaattacctcatccaaacacact 28490009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 89
Target Start/End: Original strand, 8255434 - 8255499
Alignment:
Q  24 aattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaac 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||| ||| |||||||    
T  8255434 aattgaatcatttaaattgcctaaaattataaattcttcaaaatttctcaattatctcatccaaac 8255499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 78
Target Start/End: Original strand, 14835265 - 14835322
Alignment:
Q  21 tttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattac 78  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||||||    
T  14835265 tttaattgaatcatttaaattacctaaacttctaaattctttaaaatttcccaattac 14835322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 20320589 - 20320529
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  20320589 taaattgcctagaattttaaattctttaaaattttcaaattacctcatccaaacacactct 20320529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Original strand, 1209138 - 1209185
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  1209138 aatttaattgaatcatttaaattgtctaaatttctaaattctttaaaa 1209185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 13391025 - 13390962
Alignment:
Q  33 atttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13391025 atttaaattgcttagaattctaaattctttaaaatttcccaattacctcatccaaacacactct 13390962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Original strand, 30519427 - 30519473
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30519427 aatttaatcgaatcatttaaattgcctaaaa-tttaaattctttaaaa 30519473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Original strand, 30559767 - 30559813
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30559767 aatttaatcgaatcatttaaattgcctaaaa-tttaaattctttaaaa 30559813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 25935209 - 25935147
Alignment:
Q  38 aattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaagg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25935209 aattgcctagaattttaaattctttaaaatttctaaattacctcatccaaacacactctaagg 25935147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Original strand, 33146556 - 33146630
Alignment:
Q  22 ttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||  ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  33146556 ttaattgaattatttaaattgcctaagattctaaattctttgaaatttctcaactacctcatccaaacacactct 33146630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 40089475 - 40089407
Alignment:
Q  33 atttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaaggt 101  Q
    ||||||||||||||  | | |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  40089475 atttaaattgcctaggaatctaaattctttaaaatttcctaattacctcatccaaacacactctaaggt 40089407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Original strand, 8264918 - 8264965
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||    
T  8264918 aatttaattgaatcatttaaattgcttagaatataaaattctttaaaa 8264965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 13064526 - 13064479
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  13064526 aatttaattgaatcatttgaatggcctaaaactttaatttctttaaaa 13064479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19533827 - 19533764
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  19533827 taaattgcctagaattttaaattctttaaaatttccaaattacctcattcaaacacactataag 19533764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 31316595 - 31316665
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaac 89  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || |||| |||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||||    
T  31316595 aatttaattgaattatttaaattgtttagaattctaaattctataaaaatttccaattaactcatccaaac 31316665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 28181875 - 28181794
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28181875 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaattttccaattacctcgtccaaacacactataagg 28181794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 43863563 - 43863482
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43863563 aatttaattgaatcatttaaattacctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcgtccaaacacactctaagg 43863482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 34396222 - 34396151
Alignment:
Q  18 gaatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaac 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  34396222 gaatttaattgaatcatttaaattgcctagaattttaaactctttaaaattttccaattacctcatccaaac 34396151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 48824711 - 48824641
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaac 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||||||    
T  48824711 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattctaaattctttaaaattttccaattaccttatccaaac 48824641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 671265 - 671185
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  671265 aatttaattgaatcatttaaattgtctataattttatattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactctaag 671185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 34089048 - 34089128
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||| |||||||||    
T  34089048 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacatcatccaaacacactctaag 34089128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Original strand, 21731391 - 21731470
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21731391 aatttaattgaattatttaaattgcctagaattttaaattctcttaaatttatcaattacctcatccaaacacactctaa 21731470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 24241788 - 24241702
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaaggttttt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  24241788 aatttaattgaatcatttaaattgtctaggattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactcttaggttttt 24241702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 38506559 - 38506481
Alignment:
Q  21 tttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || | ||||| |||||||||    
T  38506559 tttaaatgaatcatttaaattgcctaaaattctaaattctttaaaattttccaattacttcattcaaacacactctaag 38506481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 48948054 - 48948124
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaac 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  48948054 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttttcaattacctcatccaaac 48948124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 36397588 - 36397511
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  36397588 aatttaattgaatcatttaaattgtctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactct 36397511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 53470028 - 53469951
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  53470028 aatttaattgaatcatttaaattacctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactct 53469951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 21307186 - 21307110
Alignment:
Q  21 tttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactcta 97  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21307186 tttaattgaatcatttcaattatctaaaattctaaattctttaaaatttcccaattacctcatccaaacacactcta 21307110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Original strand, 7977023 - 7977102
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7977023 aattgaattgaatcatttaaattgcctaggattcgaaattctttaaaatttcccaattacctcatccaaacacactctaa 7977102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 35279547 - 35279468
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  35279547 aatttaattgaatcatttaaattacttagaattctaaattctttaaaatttcccaattgcctcatccaaacacactctaa 35279468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 13339168 - 13339098
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaac 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||  ||||||||| |||||    
T  13339168 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattctaaattcttcaaaattttccgtttacctcgtacaaac 13339098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 44288101 - 44288014
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaaggtttttg 106  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| || |||| || | ||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  44288101 aatttaattgaatcttttgaattgtctaaaattataaatttttcaaaatttcctaattacctcgtccaaacacactcttaagtttttg 44288014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Original strand, 52527482 - 52527561
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||| |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  52527482 aatttaattgaatcatttaaattttttagaattctaaattttttaaaattttccaattacctcatccaaacacactctaa 52527561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 13176268 - 13176206
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctc 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||| |||||||    
T  13176268 aatttaattgaatcatttaaattggctaaaattctaaattcttcaaaattttccatttacctc 13176206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 28092136 - 28092205
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaac 89  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||    
T  28092136 aatttaattgaatcatataaattgcctagaa-tttaaattctttaaaattttccaattagctcatccaaac 28092205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 6836635 - 6836590
Alignment:
Q  21 tttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6836635 tttaattgaatcatttgaattgcctaaaattctaaattctttaaaa 6836590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 53129503 - 53129434
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||     |||||||||||||||||    
T  53129503 aatttaattgaatcatttaaattgccttaaattctaaattccttaaaaaaattcaattacctcgtccaaa 53129434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 96
Target Start/End: Original strand, 8762276 - 8762336
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  8762276 taaattgcctagaattttaaattctttaaaattttcaaattacctcatccaaacacactct 8762336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 96
Target Start/End: Original strand, 19475966 - 19476026
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  19475966 taaattgcctagaattttaaattctttaaaatttccaaattacctcatccaaacacactct 19476026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 100
Target Start/End: Original strand, 47714426 - 47714490
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaagg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  47714426 taaattgcctagaatttgaaattctttaaaatttccaaattacctcatccaaacacactctaagg 47714490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Original strand, 2105202 - 2105281
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||  |||||||  | ||||||| ||||||||    
T  2105202 aatttaattgaatcatttaaattacctagaattataaattcttcaaaatttctcaattactccatccaaacacactctaa 2105281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 54761486 - 54761423
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  54761486 taaattgtctaaaattttaaattctgtaaaattttcaaattacctcatccaaacacactctaag 54761423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 33871824 - 33871762
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||| || ||||||||    
T  33871824 taaattgcctagaattttaaattctttaaaatttccaaattacctcatccacacacactctaa 33871762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 34936521 - 34936451
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaac 89  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||  |  |||||||||||| |||||    
T  34936521 aatttaattgaatcatttgaattgcttaaaattttaaatttttcaaaaaatttcaattacctcgttcaaac 34936451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 66
Target Start/End: Original strand, 44329524 - 44329565
Alignment:
Q  25 attgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  44329524 attgaatcatttaaatggcttaaaattttaaattctttaaaa 44329565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 47283877 - 47283830
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  47283877 aatttaaatgaatcatttaaattacttaaaattttaaattcttcaaaa 47283830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Original strand, 55460738 - 55460785
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  55460738 aatttaattgaaacatttgaattgcctaaaattctaaattcttaaaaa 55460785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 645812 - 645742
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaac 89  Q
    |||||||| ||||||||| |||| | |  |||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  645812 aatttaatcgaatcatttgaattacttggaattctaaattctttaaaattttccaattacctcatccaaac 645742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 42005550 - 42005469
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| |||| ||  ||| |||  | ||||||| ||||||||||    
T  42005550 aatttaattgaatcatttgaattacctagaattctaaattcttcaaaatttctcaaatactccatccaaacacactctaagg 42005469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Original strand, 46636313 - 46636354
Alignment:
Q  11 atgaatggaatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattt 52  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  46636313 atgaatgcaatttaattgaatcatttgaattgcctagaattt 46636354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 50168268 - 50168191
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | |||| |  ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  50168268 aatttaattgaagtatttaaattgccaagaattctcgattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactct 50168191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 29256990 - 29256913
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  29256990 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcgtccaaacacactct 29256913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 29611795 - 29611872
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  29611795 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattctaaattctttaaaattttccaattaccacatccaaacacactct 29611872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 33376906 - 33376825
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33376906 aatttaattgaatcatttaaattacctagaattctaaattctttaaaatttatcaattacctcatccaaacacactctaagg 33376825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 40733712 - 40733642
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaac 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  40733712 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattttaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaac 40733642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 104
Target Start/End: Original strand, 33986469 - 33986554
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaaggtttt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33986469 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattccgaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactctaaggtttt 33986554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 35978677 - 35978592
Alignment:
Q  11 atgaatggaatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||| ||||||    
T  35978677 atgaaaggaatttaattgaatcatttaaattgactagaattttaaattctttaaaatttctcaattgcctcatccaaacacactct 35978592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 44346298 - 44346221
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  44346298 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactct 44346221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 14710 - 14790
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  14710 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttctcaatttcctcatccaaacacactctaag 14790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 31980123 - 31980047
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactc 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||    
T  31980123 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactc 31980047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 43185452 - 43185532
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43185452 aatttaattgaatcatttaaattgtctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactctaag 43185532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 94
Target Start/End: Original strand, 13145054 - 13145131
Alignment:
Q  17 ggaatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcact 94  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  |||||| ||||    
T  13145054 ggaatttaattaaatcatttaaattgcctagaattttaaattctttaaattttcccaattacctcacccaaacacact 13145131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 26520057 - 26520000
Alignment:
Q  21 tttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattac 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26520057 tttaattgaatcatttaaattgcctagaattttaaattctttaaaatttatcaattac 26520000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 29482418 - 29482341
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  29482418 aatttaattgaatcatttaaatttcctataattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactct 29482341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 31976742 - 31976673
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  31976742 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaa 31976673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1087923 - 1087843
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||  ||||||||    
T  1087923 aatttaattgaatcatttaaatttcctaaaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcattcaaacatactctaag 1087843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 95
Target Start/End: Original strand, 10593545 - 10593620
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactc 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||    
T  10593545 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattttaaatt-tttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactc 10593620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 30444866 - 30444802
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaagg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| || ||||||| ||||||||||    
T  30444866 taaattgcctagaattttaaattctttaaaatttccaaattacttcatccaaacacactctaagg 30444802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Original strand, 34009164 - 34009238
Alignment:
Q  22 ttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||  ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  34009164 ttaattgaattatttaaattgcctaagattctaaattctttgaaatttctcaactacctcatccaaacacactct 34009238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 94
Target Start/End: Original strand, 36103250 - 36103308
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcact 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||    
T  36103250 taaattgcctagaattttaaattctttaaaatttccaaattacctcatccaaacacact 36103308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Original strand, 10605993 - 10606040
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  10605993 aatttaattgaatcatttgaattgactaaaattctaaattcttcaaaa 10606040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 94
Target Start/End: Original strand, 15719406 - 15719476
Alignment:
Q  24 aattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcact 94  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| || ||||| ||||    
T  15719406 aattgaatagtttgaattgcctaaaattttaaattttttaaaatttctcaattaccttgttcaaacacact 15719476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 9983120 - 9983197
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  || |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  9983120 aattcaattgaatcatttgaattgattagaattctaaattcttcaaaatttctcaattacctcatccaaacacactct 9983197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 6460572 - 6460532
Alignment:
Q  20 atttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattct 60  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6460572 atttgattgaatcatttgaatttcctaaaattttaaattct 6460532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 28538754 - 28538677
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  28538754 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactct 28538677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 39342237 - 39342157
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  39342237 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactctaag 39342157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 43791494 - 43791571
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43791494 aatttaattgaatcatttaaattgccaagaattctaaattctttaaaattttccaattacctcatccaaacacactct 43791571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 14602848 - 14602768
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14602848 aatttaattgaattatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttttcaattacctcatccaaacacactctaag 14602768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Original strand, 2411784 - 2411863
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| | ||||||    
T  2411784 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacactctctaa 2411863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 30587507 - 30587437
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaac 89  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  30587507 aatttaattgaatcttttaaattgcctagaattctaaattctctaaaattttccaattacctcgtccaaac 30587437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 23548196 - 23548119
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  23548196 aatttaattgaatcatttaaatttcctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactct 23548119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 35456277 - 35456354
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  35456277 aatttaattgaattatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaaattttcaattacctcatccaaacacactct 35456354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 36328405 - 36328328
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  36328405 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattttttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactct 36328328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Original strand, 40496191 - 40496272
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||  |||||||||    
T  40496191 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattataaattctttaaaatttcttaattacctcatccaaacatactctaagg 40496272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 9784531 - 9784455
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattc-tttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcact 94  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  9784531 aatttaattgaatcatctaaattgcctaaaattttaaattcttttaaaatttctcaattacttcgtccaaacacact 9784455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 42816995 - 42817072
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||| ||||||    
T  42816995 aattcaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatcctaacacactct 42817072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 45984806 - 45984883
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | |||||| | ||||||| ||||||    
T  45984806 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttctctattaccccatccaaacacactct 45984883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 45989166 - 45989243
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | |||||| | ||||||| ||||||    
T  45989166 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttctctattaccccatccaaacacactct 45989243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Original strand, 30629532 - 30629604
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgc 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||   | |||||||||| |||||||||    
T  30629532 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattttaaaaaaaaaatcaattacctcatccaaacgc 30629604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Original strand, 35488688 - 35488761
Alignment:
Q  22 ttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||| ||||||    
T  35488688 ttaattgaatcatttaaataggctaaaattttaaattctttaaaa-ttttcaattacatcatccaaacacactct 35488761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Original strand, 14790554 - 14790617
Alignment:
Q  33 atttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14790554 atttaaattgcctaggattctaaattctttaaaattttccaattacctcatccaaacacactct 14790617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Original strand, 38320751 - 38320798
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38320751 aatttaattgtatcatttgaattgcctagaattttaaattctttaaaa 38320798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Original strand, 45967521 - 45967568
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45967521 aatttaattaaattatttaaattgcttaaaattttaaattctttaaaa 45967568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 26162045 - 26161987
Alignment:
Q  38 aattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  26162045 aattgcctagaattttaaattctttaaaatttccaaattacctcatccaaacacactct 26161987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 30080385 - 30080323
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctc 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||    
T  30080385 aatttaattgaatcatttaaattgcttagaattctaaattcttcaaaatttctcaattacctc 30080323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 97
Target Start/End: Original strand, 40495672 - 40495750
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactcta 97  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||| |||||||    
T  40495672 aattgaattgaatcatttgaattccctataattctaaattcttcaaaatttctcaattacctcatccaaacacactcta 40495750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 32650996 - 32651073
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||  ||| | |||||||||| | || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  32650996 aatttaattacatcatttaaattgcctaggattctgaattctttaagatttcccaattacctcatccaaactcactct 32651073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 18926249 - 18926202
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||    
T  18926249 aatttaattgaatcatttaaattggctataattcaaaattctttaaaa 18926202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 37460541 - 37460478
Alignment:
Q  25 attgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaa 88  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  37460541 attgaattatttgaattgtctagaattttaaattctttaaaaattttcaattacctcatccaaa 37460478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 81
Target Start/End: Original strand, 26416393 - 26416455
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctc 81  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||    
T  26416393 aatttaattgaattatttagattgcctagaattctaaattcttcaaaatttctcaattacctc 26416455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 29639124 - 29639059
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaa-ttctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaagg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29639124 taaattgcctagaatttaaaaattctttaaaattttcaaattacctcatccaaacacactctaagg 29639059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 41442680 - 41442603
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| |||| ||  ||||||||   ||||||| ||||||    
T  41442680 aatttaattgaatcatttgaattacctagaattctaaattcttcaaaatttctcaattacccaatccaaacacactct 41442603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 87
Target Start/End: Original strand, 1580381 - 1580429
Alignment:
Q  39 attgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaa 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||    
T  1580381 attgcctaaaattttaaattctttaaaaaatttcaattacctcatccaa 1580429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 15615997 - 15615916
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaagg 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15615997 aatttaattgattcatttgaattgcctaatattttaaattctttaaaatttatcaattacctcatccaaacacactctaagg 15615916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 6357902 - 6357823
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6357902 aatttaattgaatcatttaaattacttaaaattctaaattcttcaaaatttcccaattacctcgtccaaacacactctaa 6357823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 1368948 - 1369025
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  1368948 aatttaattgaatcatttaaattacctagaattttaaattctttataatttctcaattacctcgtccaaacacactct 1369025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 97
Target Start/End: Original strand, 8475601 - 8475679
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactcta 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| || |||| |||||||    
T  8475601 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatctaaacacactcta 8475679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Original strand, 1195776 - 1195855
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||| | ||||| ||||||||    
T  1195776 aatttaattgaattatttaaattgcctagaatttcaaattctctaaaatttctcaattacctcattcaaacacactctaa 1195855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 99
Target Start/End: Original strand, 34364894 - 34364957
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34364894 taaattgcctagaattttaaattctttaaaattttcaaattacctcatccaaacacactctaag 34364957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 34244903 - 34244843
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  34244903 taaattgcctagaattttaaattctttaaaatttccaaattacctcatccaaacacactct 34244843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 96
Target Start/End: Original strand, 10105480 - 10105555
Alignment:
Q  21 tttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| || | |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  10105480 tttaattgaatcattggaattgcctacaagtctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactct 10105555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Original strand, 28918629 - 28918708
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| || ||  ||||||| | ||| |||| ||||||||    
T  28918629 aatttaattgaatcatttaaattgcatagaattttaaattatttataatttctcaattactttgtctaaacacactctaa 28918708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 96
Target Start/End: Original strand, 13487425 - 13487485
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  13487425 taaattgtctagaattttaaattctttaaaatttccaaattacctcatccaaacacactct 13487485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Original strand, 39630698 - 39630779
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  39630698 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattttaaattttttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactctaagg 39630779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Original strand, 769504 - 769583
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  769504 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactctaa 769583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 33188866 - 33188787
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33188866 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactctaa 33188787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 35047278 - 35047201
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||| | ||||||| ||||||    
T  35047278 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattttaaattctttaaaatttctcaattaccccatccaaacacactct 35047201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1583409 - 1583329
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1583409 aatttaatggaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactctaag 1583329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Original strand, 3092718 - 3092797
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3092718 aatttaattgaatcatttaaatttcctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactctaa 3092797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 7309513 - 7309434
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7309513 aatttaattgaatcatttaaattgcttagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactctaa 7309434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Original strand, 2925125 - 2925203
Alignment:
Q  21 tttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||||||    
T  2925125 tttaaatgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttcccaattacttcatccaaacacactctaag 2925203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 44256106 - 44256176
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaac 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  44256106 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaac 44256176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 8736042 - 8735965
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  8736042 aatttaattgaatcatttaaattgcttaggattctaaattctttaaaatttcccaattacctcatccaaacacactct 8735965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 32839265 - 32839188
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||| ||||||    
T  32839265 aatttaattgaatcatttgaattgcctagaattttaaattctttaaaatttctcaattacctcatctaaacacactct 32839188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 19231093 - 19231015
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19231093 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattct-aattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactctaa 19231015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 2274386 - 2274318
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || |||||||||| |||||||    
T  2274386 aatttaattgaatcatttaaattgtctaaaattataaattatttaaaa-tttccaattacctagtccaaa 2274318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 13018217 - 13018294
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  13018217 aatttaattgaattatttaaattacctagaattttaaattctttataatttctcaattacctcatccaaacacactct 13018294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Original strand, 17906114 - 17906195
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaagg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17906114 aatttaattgaattatttaaattatctataattttaaattctttataatttttcaattacctcatccaaacacactctaagg 17906195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 94
Target Start/End: Original strand, 21504922 - 21504997
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcact 94  Q
    ||||||||| || |||||||||||| || |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  21504922 aatttaattaaaacatttaaattgcttagaattctaaattctttaaaatttcccaattacctcatccaaacacact 21504997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 41585271 - 41585192
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||    
T  41585271 aatttaaatgaatcatttaaattgtcaagaattctaaattctttaaaatttatcaattacctcatccaaagacactctaa 41585192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 19193820 - 19193750
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaac 89  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  19193820 aatttaatcaaaacatttaaattgcctaaaattttaatttttttaaaattttccaattacctcatccaaac 19193750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 96
Target Start/End: Original strand, 31941423 - 31941505
Alignment:
Q  14 aatggaatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  31941423 aatgcaatttaattgaataatttgaattgtctataattctaaattcttgaaaatttatcaattacctcgtcaaaacacactct 31941505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 31704000 - 31703916
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaaggttt 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| | ||||| || ||||||||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  31704000 aatttaattgaatcatttgaattgactagaattctaaattatctaaaattttccaattacctcattcaaacacactctaaagttt 31703916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 94
Target Start/End: Original strand, 11141777 - 11141852
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcact 94  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  11141777 aatttaatggaatcatttaaattgtctaggattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacact 11141852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 14306439 - 14306364
Alignment:
Q  21 tttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  14306439 tttaattgaaccattttaattgtctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactct 14306364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 98
Target Start/End: Original strand, 10480269 - 10480331
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  10480269 taaattgcctagaattttaaattctttaaaattttcaaattacctcatccaagcacactctaa 10480331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Original strand, 19072305 - 19072383
Alignment:
Q  21 tttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  19072305 tttacttgaatcatttaaattacctaggattctaaattctttaaaatttctcaattatctcatccaaacacactctaag 19072383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 7611496 - 7611449
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  7611496 aatttaattgaatcatttgaattacctagaattttaaattcttcaaaa 7611449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Original strand, 11595277 - 11595324
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  11595277 aatttaattgaatcatttaaattacttagaattctaaattctttaaaa 11595324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Original strand, 11607179 - 11607226
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  11607179 aatttaattgaatcatttaaattacttagaattctaaattctttaaaa 11607226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Original strand, 11799265 - 11799329
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtcc 85  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  11799265 aatttacttgaatcatttaaattg--taaaattttatattctctaaaatttatcaattacttcgtcc 11799329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 28021781 - 28021706
Alignment:
Q  21 tttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||| ||||| | | |||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  28021781 tttaattgaatcatttgaattgtcaagaattctaaattctttaaaatttctcaattagctcatccaaacacactct 28021706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 98
Target Start/End: Original strand, 7684594 - 7684656
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  7684594 taaatggcctaaaattttaaattctttaaaatttttaaattaccttatccaaacacactctaa 7684656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 11532174 - 11532112
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||| || |||||    
T  11532174 taaattgcctagaattttaaattctttaaaacttccaaattatctcatccaaacacattctaa 11532112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 96
Target Start/End: Original strand, 11794045 - 11794105
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||  ||||||| ||||||    
T  11794045 taaattgtctagaattttaaattctttaaaattttcaaattacctaatccaaacacactct 11794105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Original strand, 32128554 - 32128642
Alignment:
Q  17 ggaatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaaggttttt 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| |||||| || |||||    
T  32128554 ggaatttaattgaatcattaaaattacctaaaattttaaattctttaaaatttctcaattacctcgttcaaacacactcttagtttttt 32128642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 946852 - 946929
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  946852 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaacacactct 946929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15467563 - 15467486
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||||    
T  15467563 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttcttaattacctcatccaaacacactct 15467486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 80
Target Start/End: Original strand, 10166969 - 10167028
Alignment:
Q  21 tttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacct 80  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10166969 tttaattgaatcatttgaattgcctagaattttaaattctttaaaatttatcaattacct 10167028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 28632203 - 28632122
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| || ||  |||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  28632203 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattttttataatttctcaattatctcatccaaacacactctaagg 28632122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 35499513 - 35499598
Alignment:
Q  11 atgaatggaatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| || | |||||| || ||||||| ||||||    
T  35499513 atgaatgtaatttaattgaatcatttaaattatctagaattctaaattctttaaaattttcaaattacttcatccaaacacactct 35499598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 21267423 - 21267339
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaaggttt 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||| |||||| ||||||    
T  21267423 aatttaattgaatcatctaaattgcctataattcgaaattctttaaaatttctcaattatctcatccaaacacactcttaggttt 21267339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 96
Target Start/End: Original strand, 220627 - 220702
Alignment:
Q  21 tttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || || ||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  220627 tttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctctataatttttcaattacctcatccaaacacactct 220702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Original strand, 50472188 - 50472235
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50472188 aatttaattgaataatttaaattgcctaaaattctaaattctttaaaa 50472235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 23956056 - 23955987
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || | |||| |||| ||||||    
T  23956056 aatttaattgaatcatttaaattgactaaaattctaaattttttaaaatttcctaattgcctcttccaaa 23955987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 39887538 - 39887618
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||  | ||||||| |||||||||    
T  39887538 aatttaattgaatcatttgaattacctaaaattctaaattcttcaaaatttctcaattactccatccaaacacactctaag 39887618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 37447503 - 37447424
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||  ||| ||| || ||||||| ||||||||    
T  37447503 aatttaattgaatcatttaaattacctagaattctaaattcttcaaaatttctcaaatacttcatccaaacacactctaa 37447424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 6470306 - 6470228
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttac-caattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| || | ||||| |||| ||||||| ||||||    
T  6470306 aatttaattaaatcatttaaattacctagaattctaaattctttaaaaatttctcaattgcctcatccaaacacactct 6470228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 81
Target Start/End: Original strand, 32647765 - 32647827
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctc 81  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  32647765 aatttaattgaatcatttaaattttctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctc 32647827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 47165135 - 47165077
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcact 94  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||    
T  47165135 taaattacctaaaattttaaattctttaaaattttcaaattacctcatccaaacacact 47165077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 47541911 - 47541849
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47541911 taaattgcctagaattttaaattctttaaaatttctaaattacctcatccaaacacactctaa 47541849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 37036581 - 37036500
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| |||| ||   ||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  37036581 aatttaattgaatcatttgaattacctagaattctaaattcttcaaaatttcttaattaccccatccaaacacactctaagg 37036500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 41481031 - 41480954
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||  |   ||||||||| ||||||| ||||||    
T  41481031 aatttaattgaataatttgaactgcctaaaattttaaatgctttaaaaaatttaaattacctcatccaaacacactct 41480954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 37446960 - 37446881
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaa 98  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| |||| ||   ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  37446960 aatttaattgaatcatttgaattacctagaattataaattcttcaaaatttcttaattaccccatccaaacacactctaa 37446881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Original strand, 44571150 - 44571197
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  44571150 aatttaattgaatcatttgaattacctagaattttaaattcttcaaaa 44571197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 94
Target Start/End: Original strand, 44571663 - 44571738
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcact 94  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||| || || ||||||||||| || |||| ||||    
T  44571663 aatttaattgaatcgtttaaattacctaggattctaaattctttataatttcccaattacctcatcgaaacacact 44571738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 24273142 - 24273084
Alignment:
Q  38 aattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  24273142 aattgcgtagaattttaaattctttaaaatttccaaattacctcatccaaacacactct 24273084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 48954017 - 48954087
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaac 89  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| |||| ||  |||||| ||| |||||||    
T  48954017 aatttaattgaatcatttagatagcctaaaactctaaattcttcaaaatttctcaattagctcatccaaac 48954087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 8225245 - 8225322
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactct 96  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||  | ||||||| ||||||    
T  8225245 aatttaattgattcatttgaattacctaaaattctaaattcttcaaaatttctcaattactccatccaaacacactct 8225322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 12293080 - 12293019
Alignment:
Q  38 aattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | | || ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12293080 aattgcctagaattctaaattctttgagatttcccaattacctcatccaaacacactctaag 12293019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 26501002 - 26500949
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaac 89  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||    
T  26501002 taaattacctagaattttaaattctttaaaattttcaaattacctcatccaaac 26500949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 41577874 - 41577842
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaatt 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41577874 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaatt 41577842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 41822148 - 41822080
Alignment:
Q  21 tttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaac 89  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||  ||||||| || |||||||    
T  41822148 tttaaatgaattatttaaattgcctagaattctaaattctgtaaaatttctcaattacttcatccaaac 41822080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0129 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0129
Description:

Target: scaffold0129; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 19384 - 19337
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19384 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattctaaattctttaaaa 19337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 81
Target Start/End: Original strand, 7624 - 7686
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctc 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  7624 aatttaattgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttctcaattacctc 7686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Original strand, 4493 - 4571
Alignment:
Q  21 tttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactctaag 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||  || ||||||| |||||||||    
T  4493 tttaaatgaatcatttaaattgcctagaattctaaattctttaaaatttcccaattagttcatccaaacacactctaag 4571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 88
Target Start/End: Original strand, 3329 - 3398
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  3329 aatttaattgaatcatttaaattaactaaaattctaaattctttaaaatttctcaattacctcatccaaa 3398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15571 - 15501
Alignment:
Q  11 atgaatggaatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctc 81  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  15571 atgaaaggaattttattgaatcatttaaatagtctagaattttaaattctttaaaatttcacaattacctc 15501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 16014 - 15967
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  16014 aatttaattgaatcatttaaattacctagaattctaaattcttcaaaa 15967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 2613 - 2543
Alignment:
Q  11 atgaatggaatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctc 81  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  2613 atgaaaggaattttattgaatcatttaaatagtctagaattttaaattctttaaaatttcacaattacctc 2543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 3056 - 3009
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaa 66  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  3056 aatttaattgaatcatttaaattacctagaattctaaattcttcaaaa 3009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 81
Target Start/End: Original strand, 130720 - 130782
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctc 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||| |||||||    
T  130720 aatttaattgaatcatttaaattggctaaaattctaaattcttcaaaattttccatttacctc 130782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 95
Target Start/End: Original strand, 11319 - 11378
Alignment:
Q  36 taaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaacgcactc 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| ||||||| |||||    
T  11319 taaattgcctaaaattttaaattctttacaatttccaaattacctcatccaaacacactc 11378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0417 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0417
Description:

Target: scaffold0417; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 11573 - 11503
Alignment:
Q  19 aatttaattgaatcatttaaattgcctaaaattttaaattctttaaaagttaccaattacctcgtccaaac 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  11573 aatttaattaaatcatttaaattacttagaattctaaattctttaaaattttccaaatacctcatccaaac 11503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University