View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10942_low_1 (Length: 710)

Name: NF10942_low_1
Description: NF10942
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10942_low_1
NF10942_low_1
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (1-691)||(6431220-6431930)
chr7 (1-691)||(4508915-4509616)
chr7 (1-691)||(4510757-4511458)
chr7 (256-691)||(4512599-4513034)
chr7 (322-691)||(34310925-34311296)
chr7 (384-691)||(2389934-2390241)
chr7 (381-691)||(29608390-29608695)
chr7 (364-691)||(2361181-2361507)
chr7 (366-691)||(48599543-48599858)
chr7 (364-689)||(6360123-6360448)
chr7 (384-691)||(3258647-3258953)
chr7 (363-689)||(22269605-22269929)
chr7 (369-691)||(22328607-22328931)
chr7 (381-547)||(32358189-32358355)
chr7 (512-691)||(8359526-8359706)
chr7 (312-472)||(30814344-30814505)
chr7 (388-649)||(5116290-5116551)
chr7 (440-556)||(22552782-22552897)
chr7 (473-648)||(43363667-43363839)
chr7 (575-690)||(1360364-1360479)
chr7 (152-228)||(44011265-44011341)
chr7 (205-255)||(4513054-4513104)
chr7 (576-689)||(23794039-23794149)
chr7 (157-205)||(26214625-26214673)
chr7 (149-205)||(38395931-38395986)
chr7 (300-338)||(2761647-2761685)
chr7 (300-338)||(14070178-14070216)
chr7 (300-338)||(14380206-14380244)
chr7 (151-205)||(48491124-48491178)
chr7 (610-690)||(37545121-37545199)
[»] chr1 (41 HSPs)
chr1 (1-686)||(19753760-19754448)
chr1 (249-684)||(19752202-19752637)
chr1 (363-691)||(11348329-11348657)
chr1 (364-691)||(29135880-29136206)
chr1 (327-691)||(34603170-34603534)
chr1 (316-691)||(42298184-42298560)
chr1 (364-691)||(193244-193570)
chr1 (364-691)||(13547298-13547625)
chr1 (364-691)||(13549209-13549536)
chr1 (327-683)||(34602557-34602913)
chr1 (383-691)||(37167948-37168256)
chr1 (364-691)||(37879120-37879447)
chr1 (327-691)||(7482441-7482805)
chr1 (379-691)||(37033282-37033590)
chr1 (363-691)||(47255549-47255871)
chr1 (385-691)||(47114825-47115130)
chr1 (385-691)||(28242041-28242347)
chr1 (2-270)||(13547793-13548063)
chr1 (337-686)||(41135424-41135773)
chr1 (1-209)||(31928443-31928651)
chr1 (379-686)||(6808093-6808399)
chr1 (515-680)||(31925926-31926091)
chr1 (297-500)||(31928208-31928405)
chr1 (384-621)||(9109680-9109918)
chr1 (385-690)||(22078995-22079278)
chr1 (9-177)||(41141405-41141572)
chr1 (427-689)||(16216709-16216966)
chr1 (137-225)||(50167718-50167806)
chr1 (143-230)||(776784-776871)
chr1 (443-686)||(3331255-3331505)
chr1 (490-657)||(12318725-12318890)
chr1 (578-691)||(25651931-25652044)
chr1 (402-562)||(6068287-6068448)
chr1 (515-591)||(4535783-4535860)
chr1 (206-255)||(19752140-19752189)
chr1 (435-548)||(28318110-28318225)
chr1 (295-338)||(28220571-28220614)
chr1 (471-561)||(38747055-38747144)
chr1 (300-338)||(30476793-30476831)
chr1 (147-213)||(41360468-41360533)
chr1 (297-338)||(49918131-49918172)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (295-691)||(1631941-1632338)
chr2 (327-691)||(42288319-42288682)
chr2 (363-691)||(45726561-45726888)
chr2 (363-691)||(35447093-35447421)
chr2 (363-686)||(17450222-17450544)
chr2 (244-590)||(7450812-7451158)
chr2 (381-682)||(33647817-33648118)
chr2 (381-691)||(24397713-24398012)
chr2 (364-686)||(42261826-42262146)
chr2 (378-686)||(30218250-30218556)
chr2 (390-538)||(40935542-40935690)
chr2 (205-264)||(7450754-7450813)
chr2 (476-537)||(24197643-24197703)
chr2 (575-680)||(43730991-43731093)
chr2 (135-210)||(37048021-37048096)
chr2 (11-107)||(6396189-6396282)
chr2 (150-207)||(13828836-13828893)
chr2 (379-412)||(44750240-44750273)
chr2 (147-213)||(31056685-31056751)
chr2 (16-213)||(35892740-35892936)
[»] chr4 (48 HSPs)
chr4 (316-691)||(8664989-8665366)
chr4 (363-689)||(26363896-26364222)
chr4 (364-691)||(6655588-6655915)
chr4 (381-691)||(12073042-12073351)
chr4 (364-691)||(54882652-54882979)
chr4 (364-691)||(55085574-55085902)
chr4 (364-691)||(50674055-50674382)
chr4 (385-691)||(50262907-50263213)
chr4 (385-691)||(41964069-41964373)
chr4 (384-691)||(35662094-35662399)
chr4 (383-691)||(46703152-46703458)
chr4 (382-691)||(379028-379337)
chr4 (300-691)||(27417170-27417552)
chr4 (364-626)||(40630616-40630878)
chr4 (364-691)||(2209340-2209672)
chr4 (381-687)||(33989511-33989816)
chr4 (455-687)||(8647861-8648093)
chr4 (363-630)||(46569816-46570083)
chr4 (316-513)||(8653182-8653381)
chr4 (295-523)||(10071446-10071676)
chr4 (366-689)||(22882964-22883287)
chr4 (366-689)||(22934628-22934951)
chr4 (415-686)||(33089582-33089841)
chr4 (364-686)||(35370553-35370874)
chr4 (381-691)||(26699655-26699967)
chr4 (364-678)||(3785722-3786034)
chr4 (473-691)||(12119281-12119496)
chr4 (389-574)||(38811405-38811590)
chr4 (379-690)||(35369652-35369956)
chr4 (424-526)||(10071963-10072065)
chr4 (435-690)||(41961110-41961368)
chr4 (434-659)||(34112314-34112538)
chr4 (379-513)||(47514888-47515023)
chr4 (364-512)||(25723604-25723752)
chr4 (621-691)||(40632334-40632404)
chr4 (390-498)||(22629290-22629399)
chr4 (385-487)||(32091222-32091326)
chr4 (143-199)||(54882355-54882411)
chr4 (36-211)||(35371079-35371254)
chr4 (577-690)||(32091324-32091435)
chr4 (435-531)||(6719289-6719384)
chr4 (152-228)||(36770955-36771031)
chr4 (152-227)||(29055908-29055983)
chr4 (651-691)||(41639345-41639385)
chr4 (1-39)||(54882287-54882325)
chr4 (300-338)||(34570759-34570797)
chr4 (152-213)||(3792432-3792493)
chr4 (305-338)||(37740416-37740449)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (237-691)||(44353295-44353751)
chr8 (364-691)||(42435200-42435527)
chr8 (367-691)||(11383621-11383945)
chr8 (364-691)||(40221376-40221704)
chr8 (429-691)||(40328476-40328738)
chr8 (364-691)||(4283178-4283483)
chr8 (1-228)||(40220186-40220413)
chr8 (366-588)||(22976168-22976389)
chr8 (1-205)||(42435799-42436003)
chr8 (384-597)||(2999823-3000037)
chr8 (364-678)||(40585356-40585669)
chr8 (577-691)||(18655246-18655359)
chr8 (20-210)||(20686787-20686976)
chr8 (378-514)||(20686443-20686579)
chr8 (400-690)||(3846032-3846318)
chr8 (442-686)||(10020150-10020398)
chr8 (418-595)||(40535538-40535713)
chr8 (428-621)||(9633816-9634007)
chr8 (143-229)||(10014676-10014762)
chr8 (394-592)||(3817641-3817840)
chr8 (576-689)||(33655516-33655628)
chr8 (434-580)||(11136843-11136989)
chr8 (471-535)||(10101525-10101588)
chr8 (157-213)||(15949126-15949182)
chr8 (476-546)||(28461305-28461375)
chr8 (512-690)||(10239940-10240113)
chr8 (147-213)||(19492248-19492313)
chr8 (147-213)||(26268777-26268843)
chr8 (300-338)||(43036208-43036246)
chr8 (152-209)||(26402624-26402681)
[»] chr5 (26 HSPs)
chr5 (297-691)||(213031-213424)
chr5 (363-691)||(40146892-40147220)
chr5 (364-691)||(38746637-38746964)
chr5 (378-691)||(27015178-27015491)
chr5 (382-691)||(5057698-5058006)
chr5 (380-691)||(28277963-28278275)
chr5 (327-691)||(27637823-27638188)
chr5 (386-690)||(316419-316720)
chr5 (379-689)||(35615818-35616125)
chr5 (382-691)||(4160284-4160590)
chr5 (363-567)||(16642211-16642414)
chr5 (366-690)||(14689622-14689942)
chr5 (383-573)||(30802592-30802782)
chr5 (437-642)||(33906288-33906491)
chr5 (364-566)||(30792872-30793073)
chr5 (379-566)||(10055040-10055228)
chr5 (476-680)||(21205873-21206076)
chr5 (577-691)||(16641150-16641263)
chr5 (381-453)||(33906578-33906650)
chr5 (23-102)||(520631-520710)
chr5 (45-211)||(8037910-8038075)
chr5 (16-106)||(34700950-34701040)
chr5 (300-338)||(533554-533592)
chr5 (151-205)||(13487743-13487797)
chr5 (300-338)||(28751001-28751039)
chr5 (608-689)||(8019464-8019542)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (295-691)||(30235686-30236084)
chr3 (364-691)||(49199679-49200007)
chr3 (381-691)||(34490862-34491172)
chr3 (381-691)||(6095808-6096118)
chr3 (316-689)||(47303834-47304208)
chr3 (363-691)||(54593335-54593663)
chr3 (364-691)||(4569583-4569910)
chr3 (363-691)||(55302174-55302502)
chr3 (364-691)||(40912969-40913298)
chr3 (364-658)||(43403975-43404269)
chr3 (364-691)||(36018482-36018810)
chr3 (364-658)||(43402032-43402326)
chr3 (382-691)||(46860120-46860431)
chr3 (381-691)||(41819733-41820040)
chr3 (363-604)||(28074248-28074488)
chr3 (379-691)||(5434087-5434400)
chr3 (428-686)||(1683184-1683440)
chr3 (1-205)||(43402599-43402803)
chr3 (378-684)||(34795515-34795819)
chr3 (364-691)||(35138917-35139250)
chr3 (379-592)||(26323821-26324034)
chr3 (18-211)||(1686348-1686541)
chr3 (379-690)||(39127206-39127503)
chr3 (590-690)||(26323286-26323385)
chr3 (364-440)||(31340501-31340577)
chr3 (513-690)||(20937438-20937613)
chr3 (390-626)||(36796064-36796306)
chr3 (473-528)||(31340448-31340503)
chr3 (150-210)||(4386445-4386505)
chr3 (204-243)||(34490591-34490630)
chr3 (628-686)||(36796692-36796749)
chr3 (576-634)||(50432840-50432898)
chr3 (442-515)||(50432935-50433006)
chr3 (644-691)||(31340410-31340457)
chr3 (300-338)||(29810653-29810691)
chr3 (143-205)||(44331085-44331147)
chr3 (297-338)||(30709464-30709505)
chr3 (435-547)||(41509960-41510072)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (203-691)||(18212-18697)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (364-691)||(6960-7286)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (327-691)||(5043222-5043586)
chr6 (366-691)||(21593300-21593623)
chr6 (364-691)||(3808918-3809245)
chr6 (329-691)||(2973148-2973512)
chr6 (367-691)||(17762622-17762948)
chr6 (363-691)||(26830333-26830661)
chr6 (430-691)||(603289-603550)
chr6 (380-691)||(22425037-22425346)
chr6 (439-643)||(17757789-17757995)
chr6 (399-596)||(26800437-26800634)
chr6 (4-211)||(17759114-17759321)
chr6 (379-624)||(25072832-25073076)
chr6 (570-690)||(5741001-5741120)
chr6 (628-690)||(25073463-25073525)
chr6 (576-689)||(11660452-11660562)
chr6 (147-203)||(28038258-28038314)
chr6 (145-205)||(5406749-5406809)
chr6 (145-205)||(5411074-5411134)
chr6 (152-210)||(30517571-30517629)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (364-686)||(11190-11512)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (384-691)||(80492-80799)
scaffold0014 (1-211)||(81083-81294)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (364-686)||(490661-490981)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (364-689)||(1609-1942)
[»] scaffold0491 (1 HSPs)
scaffold0491 (295-332)||(11608-11645)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (16-61)||(17021-17066)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 613; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 613; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 691
Target Start/End: Original strand, 6431220 - 6431930
Alignment:
Q  1 tggatgcaaggaataagacttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6431220 tggatgcaaggaataagacttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttgg 6431319  T
Q  101 acttgattggttttgtcttgagggattgttcaaggcaaggataaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6431320 acttgattggttttgtcttgagggattgttcaaggcaaggataaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtgg 6431419  T
Q  201 agaattgttgaaatgtggctcaaaaatgaaaattgagaaagtgttggaatcgtgacacgatttt-------------------caaggccgtgaatgggt 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||||    
T  6431420 agaattgttgagatgtggctcaaaaatgaaaattgagaaagtgttggaatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgattttcaaggccgtgaatgggt 6431519  T
Q  282 gtgctctggaattcaaatcgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgcta-atgacccatttattaggt 380  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  6431520 gtgctctggaagccaaatcgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgctccatgacccatttattgggt 6431619  T
Q  381 aagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtg 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6431620 aagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtg 6431719  T
Q  481 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgt 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6431720 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtgtagagtcttttgt 6431819  T
Q  581 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgg 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6431820 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgg 6431919  T
Q  681 gaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||    
T  6431920 gaaacaattgt 6431930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 4509616 - 4508915
Alignment:
Q  1 tggatgcaaggaataagacttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttgg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  4509616 tggatgcaaggaataggacttgaaagcttgtggaattaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcagattgtggatcaaggttcaagcggggctttgg 4509517  T
Q  101 acttgattggttttgtcttgagggattgttcaaggcaaggataaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4509516 acttgattggttttgtcttgagggattgttcaaggcaaggataaggagaatggtggttgatggttaaattaacatcatcatcattttagagtcaaggtgg 4509417  T
Q  201 agaattgttgaaatgtggctcaaaaatgaaaattgagaaagtgttggaatcgtgacacga-------------------ttttcaaggccgtgaatgggt 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||    
T  4509416 agaattgttgagatgtggctcaaaaatgaaaattgagaaagtgttggaatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgattttcaaggccgtgaatgggt 4509317  T
Q  282 gtgctctggaattcaaatcgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgct-aatgacccatttattaggt 380  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||    
T  4509316 gtgctctagaagccaaatcgtgacacgatgtgggaaaacatgacacgaatttgacagatctgaaacacgttttaagcactctatgacccatttgttgggt 4509217  T
Q  381 aagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtg 480  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4509216 aagcttggttaatctcatggaaaccaaaggatggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtttttgggtgaggttcaaagcttcaagatgt- 4509118  T
Q  481 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgt 580  Q
           |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||    
T  4509117 -------gagaaccaaaagagggagctctt-gggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgt 4509026  T
Q  581 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgg 680  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4509025 gagcaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaagataagatccttagtgaaatcaaaggctaaggattggttctcttttatgggttagattctagagttgg 4508926  T
Q  681 gaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||    
T  4508925 gaaacaattgt 4508915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 4511458 - 4510757
Alignment:
Q  1 tggatgcaaggaataagacttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttgg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  4511458 tggatgcaaggaataggacttgaaagcttgtggaattaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcagattgtggatcaaggttcaagcggggctttgg 4511359  T
Q  101 acttgattggttttgtcttgagggattgttcaaggcaaggataaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4511358 acttgattggttttgtcttgagggattgttcaaggcaaggataaggagaatggtggttgatggttaaattaacatcatcatcattttagagtcaaggtgg 4511259  T
Q  201 agaattgttgaaatgtggctcaaaaatgaaaattgagaaagtgttggaatcgtgacacga-------------------ttttcaaggccgtgaatgggt 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||    
T  4511258 agaattgttgagatgtggctcaaaaatgaaaattgagaaagtgttggaatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgattttcaaggccgtgaatgggt 4511159  T
Q  282 gtgctctggaattcaaatcgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgct-aatgacccatttattaggt 380  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||    
T  4511158 gtgctctagaagccaaatcgtgacacgatgtgggaaaacatgacacgaatttgacagatctgaaacacgttttaagcactctatgacccatttgttgggt 4511059  T
Q  381 aagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtg 480  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4511058 aagcttggttaatctcatggaaaccaaaggatggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtttttgggtgaggttcaaagcttcaagatgt- 4510960  T
Q  481 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgt 580  Q
           |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||    
T  4510959 -------gagaaccaaaagagggagctctt-gggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgt 4510868  T
Q  581 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgg 680  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4510867 gagcaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaacgattggttctcttttatgggttagattctagagttgg 4510768  T
Q  681 gaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||    
T  4510767 gaaacaattgt 4510757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 256 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 4513034 - 4512599
Alignment:
Q  256 cacgattttcaaggccgtgaatgggtgtgctctggaattcaaatcgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgtttta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4513034 cacgattttcaaggccgtgaatgggtgtgctctagaagccaaatcgtgacacgatttggaaaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgtttta 4512935  T
Q  356 agcgcta-atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttg 454  Q
    ||| ||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4512934 agcactccatgacccatttaatgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagattctaaaggttgagggtctttg 4512835  T
Q  455 ggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgga 554  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  4512834 ggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttgg 4512736  T
Q  555 aaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctc 654  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4512735 aaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttagttctc 4512636  T
Q  655 ttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4512635 ttttgggggttatattctagagttgggaaacaattgt 4512599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 322 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 34311296 - 34310925
Alignment:
Q  322 tgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgcta-atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttt 420  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  34311296 tgacacgattttcacagatctgaaacacgttttaagtactccatgaccaattttttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaaggaacttt 34311197  T
Q  421 tagggttt-tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagg 519  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34311196 tagggtatgtagatactaaaggttgagggtccttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagg 34311097  T
Q  520 gttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaaga 619  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34311096 gttggtgccttttggggaaggttcatggggatggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaaga 34310997  T
Q  620 tccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34310996 tccttagtgaaatcaaaggctaaaggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaataattgt 34310925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 384 - 691
Target Start/End: Original strand, 2389934 - 2390241
Alignment:
Q  384 cttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaat 483  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2389934 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaat 2390033  T
Q  484 cttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgag 583  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  2390034 cttggaaaaccaaaagagggggctattgcgaaaagggttggtggcttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggatagtcttttgtgag 2390133  T
Q  584 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaa 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2390134 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaa 2390233  T
Q  684 acaattgt 691  Q
    ||||||||    
T  2390234 acaattgt 2390241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 381 - 691
Target Start/End: Original strand, 29608390 - 29608695
Alignment:
Q  381 aagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtg 480  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29608390 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtg 29608489  T
Q  481 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgt 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29608490 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttg-----gattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgt 29608584  T
Q  581 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgg 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29608585 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaatagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgg 29608684  T
Q  681 gaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||    
T  29608685 gaaacaattgt 29608695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 2361507 - 2361181
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||||||||| || || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2361507 tgacccatttgttgggcaagcttagtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttaggattttagatactaaagattgagggtctttgggtgagatt 2361408  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  2361407 caatccttcaagatgtgaatcttgaagaatcaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatg 2361308  T
Q  564 agtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgaggg 663  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2361307 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttga-gg 2361209  T
Q  664 ttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2361208 ttagattctagagttgggaaacaattgt 2361181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 366 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 48599858 - 48599543
Alignment:
Q  366 acccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttca 465  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48599858 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttca 48599759  T
Q  466 aaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgag 565  Q
    || ||||||||||||||          ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  48599758 aagcttcaagatgtgaa----------ccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaaaacatgag 48599669  T
Q  566 tgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggtt 665  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  48599668 tagagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggtt 48599569  T
Q  666 agattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  48599568 atattctagagttgggaaacaattgt 48599543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 364 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 6360448 - 6360123
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6360448 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatattaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 6360349  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  6360348 aaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgagaaaaggaatggtgccttttgaagaagattcatggagttgaaaaacacatg 6360249  T
Q  564 agtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgaggg 663  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  6360248 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 6360149  T
Q  664 ttagattctagagttgggaaacaatt 689  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6360148 ttagattctagagttgggaaacaatt 6360123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 384 - 691
Target Start/End: Original strand, 3258647 - 3258953
Alignment:
Q  384 cttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaa 482  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3258647 cttggtgaatctcatggaaaccagaggagggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtgaa 3258746  T
Q  483 tcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtga 582  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||| | |    
T  3258747 tcttggagaacaaaaagatggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatgggaaacatatgagtggagagtcttttatta 3258846  T
Q  583 gcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttggga 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3258847 gcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa-cctaagggttggttctcatttgggggttagattctagagttggga 3258944  T
Q  683 aacaattgt 691  Q
    |||||||||    
T  3258945 aacaattgt 3258953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 363 - 689
Target Start/End: Original strand, 22269605 - 22269929
Alignment:
Q  363 atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagggtctttgggtgagg 461  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22269605 atgacccatttgttgggcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacatttagggtatgtagatactaaagtttgagggtctttgggtgagg 22269704  T
Q  462 ttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacaca 561  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  22269705 ttcaaagctacaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggg-ctcttggg-aaagagttggtgccttttggggaagattcatggggaggggaaacaca 22269802  T
Q  562 cgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgag 661  Q
     ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |    
T  22269803 tgagtggagagtctattgagagaaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaatagaagatccttagtgaaatcataggctatgggttggttctcttttggg 22269902  T
Q  662 ggttagattctagagttgggaaacaatt 689  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22269903 ggttagattctagagtt-ggaaacaatt 22269929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 369 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 22328931 - 22328607
Alignment:
Q  369 catttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaa 467  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||    
T  22328931 catttgttaagtaagcttagtgaatctcatggaaaccaaaggagaaaacttttagggtatttagatactaaaggttgaggatctttggtggaggttaaaa 22328832  T
Q  468 acttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagt 566  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| ||||    
T  22328831 gcttcaagatgtaaatcttggagaaccaaaagagggggctcttaggaaaagagttggtgccttttggggagagattcatagggttgggaaaaacatgagt 22328732  T
Q  567 gaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctctttt-gagggtt 665  Q
      |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  22328731 agagagtcatttgtgagcaacttgggtgaatcttgggaaactaaaagagaatatcctta-tgtaatcaaaagctaagggttggttctcttttggggggtt 22328633  T
Q  666 agattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||    
T  22328632 agatcctaaagttgggaaacaattgt 22328607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 381 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 32358355 - 32358189
Alignment:
Q  381 aagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtg 480  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32358355 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtg 32358256  T
Q  481 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatgg 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32358255 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaaaattcatgg 32358189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 512 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 8359706 - 8359526
Alignment:
Q  512 gggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaa 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8359706 gggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttggatgagtcttgtgaaaccaaa 8359607  T
Q  612 agagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgaggg-ttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8359606 agagaaaatccttagtgaaatcaaaggctaagagttggttattttttgggggtttagattcttgagttggaaaacaattgt 8359526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 312 - 472
Target Start/End: Original strand, 30814344 - 30814505
Alignment:
Q  312 tgggaaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgctaat-gacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaagg 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30814344 tgggaaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagcattctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaagg 30814443  T
Q  411 agggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttc 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30814444 agggaacttttagggttttagatacttaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttc 30814505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 388 - 649
Target Start/End: Original strand, 5116290 - 5116551
Alignment:
Q  388 gtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatctt 486  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5116290 gtgaatctcatggataccaaaggaggggacttttagggtatttaaatactaaaggttgagggtctttaggtgatgttcaaaacttcaagatgtgaatctt 5116389  T
Q  487 ggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacac-acgagtgaagagtcttttgtgagc 584  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || |||||||| || |||| ||||||  | | || || ||| |||||||      
T  5116390 tgagaaccaaaagagggggctctt-gggagagggtcggtgccttttggagagagattcattggattggtaaacacttcaaatg-agggtcatttgtgata 5116487  T
Q  585 aacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttgg 649  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||    
T  5116488 aacttaggtgagtcttgggtaaccaaaagagaagatcctcag-gaaatcaaaggttaagagttgg 5116551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 440 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 22552897 - 22552782
Alignment:
Q  440 ggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggg-gaa 538  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||    
T  22552897 ggttgagggtctttgggtgagatttaaagggtcaaaatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctctt--ggaaacggttggtgccttttgggaaaa 22552800  T
Q  539 gattcatggggttggaaa 556  Q
    |||||||||  |||||||    
T  22552799 gattcatggctttggaaa 22552782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 473 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 43363839 - 43363667
Alignment:
Q  473 aagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaaga 571  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |  |||||| ||||||||| | ||||||| ||| |||  ||||||| |||   |||    
T  43363839 aagatgtgtatcttggagaactaaaagagggagctcttggg-acattgttggttccttttgggaagagattcaaggg-ttgagaaacacatgagatgaga 43363742  T
Q  572 gtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttg 648  Q
    ||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  43363741 gtcctt-gtgagcaatttgggtgaatcttgagagaccaaaagagaagatctttag-gaaattaaatgctaagggttg 43363667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 575 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 1360479 - 1360364
Alignment:
Q  575 ttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctctttt-gagggttagattcta 673  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||  || | ||||||||| | || || ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1360479 ttttgcgagcaacttgagtgagtcttggaaaaccaaaagagaatat-ttttgggaaatcaaaggatatggattggttctcttttggggggttagattcta 1360381  T
Q  674 gagttgggaaacaattg 690  Q
    ||||||  |||||||||    
T  1360380 gagttgaaaaacaattg 1360364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44011341 - 44011265
Alignment:
Q  152 ggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgttgaaatgtggctcaaaaatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  44011341 ggtgattgatggttaaattgacatcatcactattttagagtcaaggtggagaattattgaaaagtgactcaaaaatg 44011265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4513104 - 4513054
Alignment:
Q  205 ttgttgaaatgtggctcaaaaatgaaaattgagaaagtgttggaatcgtga 255  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4513104 ttgttgagatgtgactcaaaaatgaatattgagaaagtgttggaatcgtga 4513054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 576 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 23794149 - 23794039
Alignment:
Q  576 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctaga 675  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  || |||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  23794149 tttgtgagcaatttgggtgaatcgtaagagaccaaaagaggagatccttag-aaaatcaaaggctaatggttggttc-attttg-tggttagattctaga 23794053  T
Q  676 gttgggaaacaatt 689  Q
    ||||  ||||||||    
T  23794052 gttgaaaaacaatt 23794039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 205
Target Start/End: Original strand, 26214625 - 26214673
Alignment:
Q  157 ttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaat 205  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  26214625 ttgatggttaaattggcatcattatcaatttagagtcaaggtggagaat 26214673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 205
Target Start/End: Original strand, 38395931 - 38395986
Alignment:
Q  149 aatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaat 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  38395931 aatggtggttgatg-ttaaattagcatcatcactaatttagagtcaaggtggagaat 38395986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2761685 - 2761647
Alignment:
Q  300 cgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacag 338  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2761685 cgtgtcacgatttgggaaaacgtgacacgattttgacag 2761647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14070216 - 14070178
Alignment:
Q  300 cgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacag 338  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14070216 cgtgtcacgatttgggaaaacgtgacacgattttgacag 14070178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14380244 - 14380206
Alignment:
Q  300 cgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacag 338  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14380244 cgtgtcacgatttgggaaaacgtgacacgattttgacag 14380206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 48491124 - 48491178
Alignment:
Q  151 tggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaat 205  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  48491124 tggtggttgatggttaaagtggcatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 48491178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 37545199 - 37545121
Alignment:
Q  610 aaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattg 690  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||| ||||   |||||||||  |||||| |||||||||||    
T  37545199 aaagagaagatccttacaaaaatcaaaggctaagagttggttctttttt--aggttagattacagagttaggaaacaattg 37545121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 686
Target Start/End: Original strand, 19753760 - 19754448
Alignment:
Q  1 tggatgcaaggaataagacttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19753760 tggatgcaaggaataagacttggaagcttgtggaacaattgagggtgatttgatgcaaatggaggtcggagtgtggatcaaggttcaaacggggctttgg 19753859  T
Q  101 acttgattggttttgtcttgagggattgttcaaggcaaggataaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  19753860 acttgattggttttgtcttgagggattgtttaaggcaaggataaggagaatggtggttgatggttaaattaggatcatcatcattttatagtcaaggtga 19753959  T
Q  201 agaattgttgaaatgtggctcaaaaatgaaaattgagaaagtgttggaatcgtgacacg-------------------attttcaaggccgtgaatgggt 281  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||| ||||||||||    
T  19753960 agaattgttgagatgtggctaaaaaacgaaaattgagaaagtgttggaatcgtgacacgattttgggatcgtggcacgattttcaaggctgtgaatgggt 19754059  T
Q  282 gtgctctggaattcaaatcgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgct-aatgacccatttattaggt 380  Q
    |||||||||||  |||||||||||                    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||    
T  19754060 gtgctctggaagccaaatcgtgac--------------------acgattttgacagatctaaaacacgttttaagcactccatgacccatttgttgggt 19754139  T
Q  381 aagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtg 480  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    
T  19754140 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttctagatactaaaggttaagggtctttgggtgaggttcaaagcaccatgatttg 19754239  T
Q  481 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgt 580  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19754240 aatcttggaaaaccaagagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgt 19754339  T
Q  581 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctt---agtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagt 677  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19754340 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaaaatccttataagtgaaatcaaaggataatggttggttctcttttgggggttagattctagagt 19754439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 249 - 684
Target Start/End: Original strand, 19752202 - 19752637
Alignment:
Q  249 atcgtgacacgattttcaaggccgtgaatgggtgtgctctggaattcaaatcgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacagatctgaaaca 348  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19752202 atcgtggcacgattttcaaggtcgtgaatgggtgtgctctggaagccaaatcgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacggatctgaaaca 19752301  T
Q  349 cgttttaagcgcta-atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagg 447  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19752302 cgttttaagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatgaaaaccaaatgagggaatttttagggttttagatactaaaggttgaag 19752401  T
Q  448 gtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatgg 547  Q
    ||||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  19752402 gtctttgggtgaggttctaagcgtcataatgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttatgaaaagg-ttggtgccttttggggaagattcattg 19752500  T
Q  548 ggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggtt 647  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  19752501 agttgggaaacacatgagtggagagtattttgtgagcaacttagatgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaatgatt 19752600  T
Q  648 ggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaa 684  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19752601 ggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaa 19752637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 363 - 691
Target Start/End: Original strand, 11348329 - 11348657
Alignment:
Q  363 atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11348329 atgacccatttgttgggtaagcttagtgaatctcatggaaaccaaaggatggaacttttagggttttagatactaagggttgagggtctttgggtgaggt 11348428  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacac 562  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  11348429 tcaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaaggtctggtgccttttggagaagattcatggggttggaaaacacat 11348528  T
Q  563 gagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagg 662  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  11348529 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggg 11348628  T
Q  663 gttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348629 gttagattctagagttgggaaacaattgt 11348657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Original strand, 29135880 - 29136206
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29135880 tgacccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgagtgaggtt 29135979  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  29135980 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggactcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaa-acatg 29136078  T
Q  564 agtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgaggg 663  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  29136079 agtggagagttttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttagttctcttttggggg 29136178  T
Q  664 ttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29136179 ttagattctagagttgtgaaacaattgt 29136206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 327 - 691
Target Start/End: Original strand, 34603170 - 34603534
Alignment:
Q  327 cgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgcta-atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttaggg 425  Q
    ||||||||||||||||   ||||  ||||||| ||  ||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34603170 cgattttgacagatctatcacactatttaagcactctatgacccatttgttggaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttaggg 34603269  T
Q  426 ttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggt 525  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  34603270 ttttagatattaaaggttgaaggtctttgggtgatgttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaagggttggt 34603369  T
Q  526 gccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctta 625  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34603370 gccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtgaaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctta 34603469  T
Q  626 gtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34603470 g-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggaggttagattctagagttgggaaacaattgt 34603534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 316 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 42298560 - 42298184
Alignment:
Q  316 aaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgctaa-tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggaggg 414  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||   ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |     
T  42298560 aaaatgtgacacgattttgacagatctgaaacatgttttaaacactccctgatccatttgttgggtaagcttggtgaatcccataacaaccaaaggatga 42298461  T
Q  415 aacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggg 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  42298460 aacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtga 42298361  T
Q  515 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 614  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42298360 aaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgcgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 42298261  T
Q  615 gaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42298260 gaagatcctaagtgaaatcaaaggctaagagttggttctcttttgggggttagattctagagttgtgaaacaattgt 42298184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Original strand, 193244 - 193570
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  193244 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagataacttttagggttttagatattaaaggttgagggtctttcggtgaggtt 193343  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  193344 caaagcttcatgatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaaaggttggtgccttttggg-aagattcatggggttgggaaacacatg 193442  T
Q  564 agtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgaggg 663  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  193443 tgtgaagagtcttttgtgagcaacttggatgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 193542  T
Q  664 ttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  193543 ttagattctagagttgggaaacaattgt 193570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 13547625 - 13547298
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547625 tgacccatttgtttggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagagttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 13547526  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  13547525 caaagcttcaagatgtgaatcttggataaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggtcggtgccttttgaggaaaattcatggggttggaaaacacatg 13547426  T
Q  564 agtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgaggg 663  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  13547425 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgaatcttgtgaaaccaaaagagaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 13547326  T
Q  664 ttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  13547325 ttagattctagatttgggaaacaattgt 13547298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 13549536 - 13549209
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13549536 tgacccatttgtttggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagagttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 13549437  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  13549436 caaagcttcaagatgtgaatcttggataaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggtcggtgccttttgaggaaaattcatggggttggaaaacacatg 13549337  T
Q  564 agtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgaggg 663  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  13549336 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgaatcttgtgaaaccaaaagagaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 13549237  T
Q  664 ttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  13549236 ttagattctagatttgggaaacaattgt 13549209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 327 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 34602913 - 34602557
Alignment:
Q  327 cgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgcta-atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttaggg 425  Q
    ||||||||||||||||   ||||  ||||||| ||  ||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34602913 cgattttgacagatctatcacactatttaagcactctatgacccatttgttggaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttaggg 34602814  T
Q  426 ttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggt 525  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  34602813 ttttagatattaaaggttgaaggtctttgggtgatgttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttggtaaaagggttggt 34602714  T
Q  526 gccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctta 625  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34602713 gccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtgaaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctta 34602614  T
Q  626 gtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaa 683  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34602613 g-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggaggttagattctagagttgggaa 34602557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 383 - 691
Target Start/End: Original strand, 37167948 - 37168256
Alignment:
Q  383 gcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaa 482  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37167948 gcttggggaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttacagttttagatactaaaggttgagggtttttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaa 37168047  T
Q  483 tcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtga 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37168048 tcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtga 37168147  T
Q  583 gcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttggga 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37168148 gcaacttgggtgagtcttgtgaaactaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttgattctcttttgggggttagattctagagttggga 37168247  T
Q  683 aacaattgt 691  Q
    |||||||||    
T  37168248 aacaattgt 37168256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 37879447 - 37879120
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  37879447 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaatcaaaggaaggaactgttagggttttagatactaaatgttgaggatctttgggtgaggtt 37879348  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  37879347 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttgtgaaaaaggttggtgccttttggggaaaattcatggggttgggaaacacatg 37879248  T
Q  564 agtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgaggg 663  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  37879247 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaggattggttctcttttggggg 37879148  T
Q  664 ttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37879147 ttagattctagagttgggaaacaattgt 37879120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 327 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 7482805 - 7482441
Alignment:
Q  327 cgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgcta-atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttaggg 425  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||| |   |||||||||||| |   |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7482805 cgattttgacagatctgtcacactatttaagcacactatgacccatttagtgaataagtttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttaggg 7482706  T
Q  426 ttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagag-ggggctcttggggaaagggttgg 524  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7482705 ttttagatactaacggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgggaaaagggttgg 7482606  T
Q  525 tgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctt 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7482605 tgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagagaagatcctt 7482506  T
Q  625 agtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7482505 ag-gaaatcaaa-gctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaagcaattgt 7482441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 379 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 37033590 - 37033282
Alignment:
Q  379 gtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatg 478  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37033590 gtaagctgggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtttta----ctaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatg 37033495  T
Q  479 tgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtctttt 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| |||    
T  37033494 tgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttgaggaagattcatgaggttgggaaacacatgagtggagagtcattt 37033395  T
Q  579 gtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagtt 678  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37033394 gtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctctttttggggttagattctagagtt 37033295  T
Q  679 gggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||||    
T  37033294 gggaaacaattgt 37033282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 363 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 47255871 - 47255549
Alignment:
Q  363 atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47255871 atgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 47255772  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacac 562  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  47255771 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttgggaaaa----tggtgccttttggggaagattcat-gggttgggaaacacat 47255677  T
Q  563 gagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagg 662  Q
    || || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  47255676 gattggagagtcttttgtgagcaactt-agtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggg 47255578  T
Q  663 gttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47255577 gttagattctagagttgggaaataattgt 47255549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 385 - 691
Target Start/End: Original strand, 47114825 - 47115130
Alignment:
Q  385 ttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatc 484  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47114825 ttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttaaggctttagatattaaagattgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagctgtgaatc 47114924  T
Q  485 ttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagc 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||    
T  47114925 ttggagaaccaaaagagggggctcttgggaacagggttggtaccttttggg-aagattcatggggttgggaaacacatgaatggagagtcttttgtgagc 47115023  T
Q  585 aacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaa 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47115024 aacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttaatgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaa 47115123  T
Q  685 caattgt 691  Q
    |||||||    
T  47115124 caattgt 47115130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 385 - 691
Target Start/End: Original strand, 28242041 - 28242347
Alignment:
Q  385 ttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaat 483  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28242041 ttggtgaatctcatgaaaaccaaaggagggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaaaatgtgaat 28242140  T
Q  484 cttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgag 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  28242141 cttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggg-aagattcataaggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgag 28242239  T
Q  584 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaa 683  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  28242240 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaatatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctcttttaggggttagattctagagttggaaa 28242339  T
Q  684 acaattgt 691  Q
    ||||||||    
T  28242340 acaattgt 28242347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 13548063 - 13547793
Alignment:
Q  2 ggatgcaaggaataagacttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttgga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13548063 ggatgcaaggaataagacttggaagcttgtggaactaccgagggtgtttggatgcaagtggaggttggtgtgtggatcaaggttcaagcggtgctttgga 13547964  T
Q  102 cttgattggttttgtcttgagggattgttcaaggcaaggataaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtgga 201  Q
    || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13547963 ctagattggctttgtcttgaggtactgttcaaggcaaggttaaggagaatggtggttgatggttaaattagcatcatcatcattttagagtcaatgtgga 13547864  T
Q  202 gaattgttga-aatgtggctcaaaaatga-aaattgagaaagtgttggaatcgtgacacgattttcaaggc 270  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |    ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13547863 gaattgttgagaatgtgactcaaaaattagtgttttggaaaatgttggaatcgtggcacgattttcaaggc 13547793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 337 - 686
Target Start/End: Original strand, 41135424 - 41135773
Alignment:
Q  337 agatctgaaacacgttttaagcgctaat-gacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagata 434  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||| ||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||    
T  41135424 agatctgaaacactatttaagcgctgcttgacccatttgttgaataagcttggttaatctcatggaaaccaaaggagggaaattttaatgtatttagata 41135523  T
Q  435 ctaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgg 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | | || |||| |||||||||||||||| |    
T  41135524 ctaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaccttcaagatgtggatcttggagaaccaaaagaggaagat-tttgggagagggttggtgccttttag 41135622  T
Q  535 gga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatc 633  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||  |  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | |||||     
T  41135623 ggagagattcatggggttgggaaacacatcaaaggagagtc-tttgtgagaaacttgggtgagtcttaggaaaccaaaagagaagatcatttg-gaaatt 41135720  T
Q  634 aaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaaca 686  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41135721 aaaggctaaggattggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaaca 41135773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31928651 - 31928443
Alignment:
Q  1 tggatgcaaggaataagacttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | |||||||    
T  31928651 tggatgcaaggaataagacttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggtgtgtggatcaaagttcaagcagggctttgg 31928552  T
Q  101 acttgattggttttgtcttgagggattgttcaaggcaaggataaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||| | ||||||||||||||||    
T  31928551 acttgattggttttgtcttggggaatagttcaaggcaaggttaaggagcaaggtggttgatggttaaattggcatcaccataaatttagagtcaaggtgg 31928452  T
Q  201 agaattgtt 209  Q
    |||||||||    
T  31928451 agaattgtt 31928443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 379 - 686
Target Start/End: Original strand, 6808093 - 6808399
Alignment:
Q  379 gtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggtttt-agatactaaaggttgaggg-tctttgggtgaggttcaaaacttcaaga 476  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6808093 gtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagattttttagatactaaaggttgaggggtctttaggtgaggttcaaaacttcaaga 6808192  T
Q  477 tgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtct 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |   || ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  6808193 tgtgaatcttggagaaccaaaagattgggctcttggagagat--tttgtgtcttttgggaagagattcatggggttggaaaacacatgaatgaagagtca 6808290  T
Q  576 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctaga 675  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||| || |||||||  |  | |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6808291 tttgtgagcaactagggtgagtaatggaaaaccaaaagagaagatcatta-tgtaatcaaagacggaaggttggttctctttcga-ggttagattctaga 6808388  T
Q  676 gttgggaaaca 686  Q
    |||| ||||||    
T  6808389 gttgagaaaca 6808399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 515 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 31926091 - 31925926
Alignment:
Q  515 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 614  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31926091 aaagggttggtgccttttggggaagattcatgggtttgggaaacacgtgagtggagaatcttttgtgagcaacttgggtgagacttgtgaaaccaaaaga 31925992  T
Q  615 gaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgg 680  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31925991 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttttgggggttagattctagagttgg 31925926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 297 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 31928405 - 31928208
Alignment:
Q  297 aatcgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgct-aatgacccattt-attaggtaagcttggtgaatc 394  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  31928405 aatcgtgacacgattttggaaaacgtgatacgattttgacagatctgaaacacgtcttaagcactccatgacccatttgattgggtaagcttggtgaatt 31928306  T
Q  395 tcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaacc 494  Q
    |||| ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  31928305 tcatggaaaccaaaggagggaac--------ttttagatactaaaggttgagagtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttagaaaacc 31928214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 384 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 9109918 - 9109680
Alignment:
Q  384 cttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaa 482  Q
    |||||||||| |||| |||| |||| || | ||||||| |||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9109918 cttggtgaatgtcatggaaatcaaatgatgaaacttttggggtatataaatactaaaggttgagggtatttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaa 9109819  T
Q  483 tcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacaca-cgagtgaagagtcttttgt 580  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| | | || ||||||||||||    
T  9109818 tcttggagaaccaaaaaaggggactcat-gggagagggttgatgtcttttggggagagattcatgaggttgggagacacatcaaatg-agagtcttttgt 9109721  T
Q  581 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatc 621  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  9109720 gagcaatttggatgagtcttgggaaatcaaaatagaagatc 9109680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 385 - 690
Target Start/End: Original strand, 22078995 - 22079278
Alignment:
Q  385 ttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatc 484  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||||| |||       ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22078995 ttggtgaatcttatggaaactaaatgatggaacttttagggtatta-------aagtttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatc 22079087  T
Q  485 ttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagc 584  Q
    ||  ||||||||||||||||||  |||||  | ||||||||| | ||||||||           ||||| |||||||  |  | ||||||||| ||||||    
T  22079088 ttaaagaaccaaaagagggggcaattgggtga-gggttggtgtcgtttgggga-----------gttgggaaacacatcaagggagagtcttt-gtgagc 22079174  T
Q  585 aacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaa 684  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22079175 aacttaggtgagtcttggcaaaccaaaatataagatgctta-tgaaatcaaaggctaaggattg-ttctcttttgggggttagattctagagttgagaaa 22079272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 177
Target Start/End: Original strand, 41141405 - 41141572
Alignment:
Q  9 aggaataagacttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttggacttgatt 108  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  | ||| ||||||||     
T  41141405 aggaatcagacttgaaaatttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggtgtatagatcagggttcaagcgaggatttagacttgatc 41141504  T
Q  109 ggttttgtcttgagggattgttcaaggcaaggataaggagaatggtggttgatggttaaattagtatca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||  |  ||||||||| |||||||||| ||||    
T  41141505 ggttttgtcttga-ggaatggtcaaggcaaggttaaggaccaacgtggttgatagttaaattagcatca 41141572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 427 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 16216966 - 16216709
Alignment:
Q  427 tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtg 526  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16216966 tttagaaactaaaggttaagggtctttgggtgatattcaaaggttcaagatgtatatcttgaagaaccaaaagagggggctctt-cgaaaagggttggtg 16216868  T
Q  527 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctta 625  Q
    | ||||||  | | |||||| | ||||| ||||||| ||| | ||||||  |||||||||||||| |||| | |||  ||   |||||||||||||||||    
T  16216867 cattttggatagaaattcat-gtgttggcaaacacatgagaggagagtc-attgtgagcaacttgagtgaattttgaaaacttaaaagagaagatcctta 16216770  T
Q  626 gtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaatt 689  Q
    | ||||||||| |||| | |||||||   |||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16216769 g-gaaatcaaaggctacgagttggtttagttt--agggttagattctagagttgagaaacaatt 16216709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50167806 - 50167718
Alignment:
Q  137 aaggataaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgttgaaatgtggctcaaaa 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |   |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  50167806 aaggaaaaggagaatggtggttgatggttaaagtttcatcaccatcaatttagagtcaaggtggagaaatgttgaaatgtgtctcaaaa 50167718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 230
Target Start/End: Original strand, 776784 - 776871
Alignment:
Q  143 aaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgttgaaatgtggctcaaaaatgaa 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  776784 aaggagaatggtggttgatggttaaagttccatcaccatcaatttagagtcaaggtggagaaatgttgaaatgtgtctcaaaattgaa 776871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 686
Target Start/End: Original strand, 3331255 - 3331505
Alignment:
Q  443 tgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtg-ccttttggggaagat 541  Q
    ||||||||||| |||||| || |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||  ||||    
T  3331255 tgagggtctttaggtgagatttaaatgatcaagatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctctt-gggaaagggttcgtgtcgttttgggagagat 3331353  T
Q  542 tcatgg--------ggttggaaaacacacgagtgaag--agtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaa 631  Q
    |||| |         ||||| ||||||| ||| | ||  ||  | ||| ||||||||| ||||| ||||  |  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  3331354 tcattgcttaggaaagttgggaaacacatgagaggaggtagagtcttgcgagcaacttaggtgaatcttagggtaccaaaagaggagatccttag-gaaa 3331452  T
Q  632 tcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaaca 686  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3331453 tcaaaggctaagggtttgtt-tcttttg-gggttggattctagagttgggaaaca 3331505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 490 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 12318890 - 12318725
Alignment:
Q  490 gaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaaga-ttcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaact 588  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  | ||||| || |||  |||||||  |  | ||||| |||| |||||||||    
T  12318890 gaaccaaatgagagggctcttggg-agagggttggtgccttttggggagaagttcataggattgagaaacacatcaaaggagagt-ttttatgagcaact 12318793  T
Q  589 tgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttt 657  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||| ||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12318792 tgggtgagtcttgggagaccaaaatagaaaatcttttg-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 12318725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 578 - 691
Target Start/End: Original strand, 25651931 - 25652044
Alignment:
Q  578 tgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttt--tgagggttagattctaga 675  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||  ||||||||||||  ||| || |||||||||||    
T  25651931 tgtgagcaacttgggtgaatcttgggaaagcaaaagtgaagatccttag-aaaatcaaatattaagaattggttctcttttatgaagg-tagattctaga 25652028  T
Q  676 gttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||||    
T  25652029 gttgggaaacaattgt 25652044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 562
Target Start/End: Original strand, 6068287 - 6068448
Alignment:
Q  402 aaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaga 500  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   ||| |  ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||   | |||| ||||||||  | |||||||||||    
T  6068287 aaccaaaggagagaacttttagggaacttaaaggctaaaagttgagggtctttggatgagattcaaatgatgaagacgtgaatctaagggaaccaaaaga 6068386  T
Q  501 gggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacac 562  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||  |||||| ||||||||    
T  6068387 gggggctctt-aggaaaaggttggtgtcttttgggaagagattcataaggttgggaaacacac 6068448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 4535860 - 4535783
Alignment:
Q  515 aaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgg 591  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  4535860 aaagggttggtgtcttttgggaatagattcatggggttgaaaaacacatgagtggatagtcgtttgtgagcaacttgg 4535783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 255
Target Start/End: Original strand, 19752140 - 19752189
Alignment:
Q  206 tgttgaaatgtggctcaaaaatgaaaattgagaaagtgttggaatcgtga 255  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19752140 tgttgagatgtggctcaaaaatgaaaattgagaaattgttggaatcgtga 19752189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 28318225 - 28318110
Alignment:
Q  435 ctaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaact-tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagag-ggggctcttggggaaagggttggtgcctttt 532  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||| ||||    
T  28318225 ctaaaagttgaggatctttggatgagtttcaaaggggtcaagatgtgaattttggataaccaaaagagaggggttcttggg-aaagggttagtgcatttt 28318127  T
Q  533 gggga-agattcatggg 548  Q
    ||||| |||||||||||    
T  28318126 ggggagagattcatggg 28318110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28220614 - 28220571
Alignment:
Q  295 caaatcgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacag 338  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28220614 caaaacgtgtcacgatttgggaaaacgtgacacgattttgacag 28220571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 38747144 - 38747055
Alignment:
Q  471 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacaca 561  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||||   |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  38747144 tcaagatatgaatcttagacaaccaaaac-gggggctcttgaa-aaagggttggtgccttttggagagaggttcatagggttggaaaacaca 38747055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30476831 - 30476793
Alignment:
Q  300 cgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacag 338  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30476831 cgtgtcacgatttgggaaaacgtgacacgattttgacag 30476793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 213
Target Start/End: Original strand, 41360468 - 41360533
Alignment:
Q  147 agaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgttgaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41360468 agaatggtggttgatggttaattgac-atcaccatcaaattagagtcaaggtggagaaatgttgaaa 41360533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 338
Target Start/End: Original strand, 49918131 - 49918172
Alignment:
Q  297 aatcgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacag 338  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  49918131 aatcgtgtcacgatttgggaaaatgtgacacgattttgacag 49918172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 302; Significance: 1e-169; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 295 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 1632338 - 1631941
Alignment:
Q  295 caaatcgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgcta-atgacccatttattaggtaagcttggtgaat 393  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  1632338 caaaacgtgacacgattttggaaaacgtgacacgattttgacagatctaaaacacgttttaagcactccatgacctatttgttgtgtaagcttggtgaat 1632239  T
Q  394 ctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaac 493  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1632238 ctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgagtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggggaac 1632139  T
Q  494 caaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggt 593  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1632138 caaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgtcttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggt 1632039  T
Q  594 gagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1632038 gagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 1631941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 327 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 42288682 - 42288319
Alignment:
Q  327 cgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgcta-atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttaggg 425  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||  ||||||||||| |||   ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  42288682 cgattttgacagatctgtcacactatttaagcactctatgacccatttgttaaa-aagctaggtgaatctcatggaaaccaaatgagagaacttttaggg 42288584  T
Q  426 ttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42288583 ttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggt 42288484  T
Q  526 gccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctta 625  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42288483 gcctttt-gggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctta 42288385  T
Q  626 gtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42288384 gtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttcgggtttagattctagagttgggaaacaattgt 42288319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 363 - 691
Target Start/End: Original strand, 45726561 - 45726888
Alignment:
Q  363 atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45726561 atgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggt 45726660  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacac 562  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||     
T  45726661 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacat 45726759  T
Q  563 gagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagg 662  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  45726760 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggg 45726859  T
Q  663 gttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  45726860 gttagattctagggttaggaaacaattgt 45726888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 363 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 35447421 - 35447093
Alignment:
Q  363 atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  35447421 atgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtatttgtgtgaggt 35447322  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttg-gagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacaca 561  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35447321 tcaaagcttcaagatgtgagtcttgagagaaccaaaagagggg-ctcttgtgaaaagggttggtgccttttgggaaagattcatggggttgggaaacaca 35447223  T
Q  562 cgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgag 661  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  35447222 tgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggg 35447123  T
Q  662 ggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35447122 ggttagattctagagttgggaaacaattgt 35447093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 363 - 686
Target Start/End: Original strand, 17450222 - 17450544
Alignment:
Q  363 atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    ||||||||||| || || || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17450222 atgacccatttgttgggcaaacttagagaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgagtgaggt 17450321  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacac 562  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||||||     
T  17450322 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctt-gggaaagggttggtgccctttgtgaaagattcatggggatgggaaacacat 17450420  T
Q  563 gagtgaa-gagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgag 661  Q
    ||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |    
T  17450421 gagcgaaggagtcaattgtgagaaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcattag-gaaatcaaaggctaagggttgattctctattggg 17450519  T
Q  662 ggttagattctagagttgggaaaca 686  Q
    |||| |||||||||||||| |||||    
T  17450520 ggttggattctagagttggcaaaca 17450544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 244 - 590
Target Start/End: Original strand, 7450812 - 7451158
Alignment:
Q  244 ttggaatcgtgacacgattttcaaggccgtgaatgggtgtgctctggaattcaaat----cgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacaga 339  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7450812 ttgggatcgtggcacgatttttaaggccgtgaatgggtgtgctctggatgccaaattaatcgtgacacgatttgggaaaacgtgacacgattttgacaga 7450911  T
Q  340 tctgaaacacgttttaagcgcta-atgacccattta-ttaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatacta 437  Q
         |||| ||||||||| ||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7450912 -----aacatgttttaagcactccatgacccattttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaacaaaaggagggaacttttagggttttagatacta 7451006  T
Q  438 aaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga 537  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| ||    
T  7451007 aaggttg-gcgtctttgggtgaggttcaaagcttcaggatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctttggtaaagggttgatgacttttggaga 7451105  T
Q  538 agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttg 590  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7451106 agatttatggggttggaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttg 7451158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 381 - 682
Target Start/End: Original strand, 33647817 - 33648118
Alignment:
Q  381 aagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgt 479  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33647817 aagcttggtgaatttcatggaaaccaaaggagagaacttttagagtatttagatactaaaggttgaaggtctttgggtgaggttcaaagtttcaagatgt 33647916  T
Q  480 gaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtctttt 578  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| | ||||  |||||| |||    
T  33647917 gaatcttggagaatcaaaagaggaggctcttgggaaaagggttggtgccttttgaggagagattcacgaggttggaaaacatatgagtagagagtcattt 33648016  T
Q  579 gtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagtt 678  Q
    || ||| |||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  33648017 gttagctacttaggcgagtcttataaaaccaaaagagaagatccttagggaaatcaaa-gc-aagggttaattatcttttgggggttagattctagagtt 33648114  T
Q  679 ggga 682  Q
    ||||    
T  33648115 ggga 33648118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 381 - 691
Target Start/End: Original strand, 24397713 - 24398012
Alignment:
Q  381 aagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgt 479  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  24397713 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaa--------cttttagggtatttagatactaaaggttgacggtctttgtgtgaggttcaaagcttcaaaatgt 24397804  T
Q  480 gaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtctttt 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||    
T  24397805 gaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttagggagagactcatcgggctggtaaacacatgagtggagagtcattt 24397904  T
Q  579 gtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagtt 678  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||| |||||||||||||||   |||| |||||||||| |||||||    
T  24397905 gtgaccaatttgggttagtcttgtgaaaccaaaagagaatatccttag-aaagtcaaa-gctaagggttggttc---tttgggggttagattatagagtt 24397999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 364 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 42262146 - 42261826
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42262146 tgacccatttgttgagcaagcttggtgaatctcatgagaaccaaaggagggagcttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 42262047  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacaca 561  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||    
T  42262046 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctctt-tggagagggttggtgcctttaggtgagagattcatgggattgggaaacaca 42261948  T
Q  562 cgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgag 661  Q
      |  | ||||| |||| ||||||||||||| |||||||  || |||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||  |    
T  42261947 tcaaaggagagt-ttttatgagcaacttgggcgagtcttacgagaccaaaagagtatatcattag-gaaatcaaaagctacggattggttc-cttttagg 42261851  T
Q  662 ggttagattctagagttgggaaaca 686  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  42261850 ggttagaatctagagttgggaaaca 42261826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 378 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 30218556 - 30218250
Alignment:
Q  378 ggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaaga 476  Q
    ||||| |||||||||| | || |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  30218556 ggtaatcttggtgaatattatggaactcaaaggagggaacttttagggtatttagatactatatgttgagggtctttgggtgaggttcaaaacatcaaaa 30218457  T
Q  477 tgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtct 575  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | ||||| |  |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  | ||| ||     
T  30218456 tgtgaatcttggacaaccaaaaatgagggct-tatgggagagagttagtgccttttggggagagattcatggggttgggaaacacaccaaaggagaatc- 30218359  T
Q  576 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctaga 675  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||| |||||   |||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  30218358 tttgtgagcaacttgagtgagtcttgcgaaaccaaaag-ggggatccttag-gaaatcaaaagctaaatattggttctcttttgggggttaggctctaga 30218261  T
Q  676 gttgggaaaca 686  Q
    |||||||||||    
T  30218260 gttgggaaaca 30218250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 390 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 40935690 - 40935542
Alignment:
Q  390 gaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttgg 488  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || | |||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||   || | |||||||||| ||    
T  40935690 gaatctcatggaaaccaaaggagagaccgtttagggaacttagaaactaaaggttgagggcctttgggagagattcaaagtgtccaaatgtgaatctagg 40935591  T
Q  489 agaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaa 538  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40935590 agaaccaaaagatgaggctctt-gggaaagggttggtgcctattggggaa 40935542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 264
Target Start/End: Original strand, 7450754 - 7450813
Alignment:
Q  205 ttgttgaaatgtggctcaaaaatgaaaattgagaaagtgttggaatcgtgacacgatttt 264  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7450754 ttgttgagatgtggctcaaaaatgaaaattgagaaagtgttggaatcgtgacacgatttt 7450813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 537
Target Start/End: Original strand, 24197643 - 24197703
Alignment:
Q  476 atgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga 537  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  24197643 atgtgaatcttggggaaccaaaagaggggactctt-gggagagggttggtgccttttgggga 24197703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 575 - 680
Target Start/End: Original strand, 43730991 - 43731093
Alignment:
Q  575 ttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctag 674  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  43730991 ttttgtgagcaatttgggtgaatcttgggaaaccaaaatagaatatccgtag-gaaatcaaagtctaaaggttggtt-tcttttg-gggttaaattctag 43731087  T
Q  675 agttgg 680  Q
    ||||||    
T  43731088 agttgg 43731093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37048096 - 37048021
Alignment:
Q  135 gcaaggataaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgttg 210  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||| | | |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  37048096 gcaagggtaaggagcaaggtggttgatggttaaagtggaatcaccattgatttagagtcaaggtggagaattgttg 37048021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 6396282 - 6396189
Alignment:
Q  11 gaataagacttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttggacttgat 107  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| || || | |||||||||||||||   | ||||||||||||    
T  6396282 gaatcagacttggatgcttgtgggactaccgag--tggttagatgcaagtggaggt-ggtgtgtagatcaaggttcaagcaaggatttggacttgat 6396189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13828893 - 13828836
Alignment:
Q  150 atggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattg 207  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  13828893 atggtggttgatggttaaattgacatcatcacaaatttagagtcaaggtggagaattg 13828836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 412
Target Start/End: Original strand, 44750240 - 44750273
Alignment:
Q  379 gtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggag 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44750240 gtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggag 44750273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31056751 - 31056685
Alignment:
Q  147 agaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgttgaaa 213  Q
    |||| ||||||||||| |||||||   |||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31056751 agaaaggtggttgatgattaaattgacatcaccaccaatttagagtcaaggtggagaaatgttgaaa 31056685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35892936 - 35892740
Alignment:
Q  16 agacttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttggacttgattggttttg 115  Q
    ||||||||||||||| || ||| || ||| |||||| ||| || |||||||||| || | ||| || ||| |||||| |||    ||||||| |||||||    
T  35892936 agacttggaagcttgagggactcccaaggatggttgaatgtaa-tggaggtcggtgtctcgatgaatgtttaagcggggctcaa-acttgatcggttttg 35892839  T
Q  116 tcttgagggattgttcaaggc-aaggataaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgttgaaa 213  Q
    |||||| |  | ||| ||| | |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||    
T  35892838 tcttgaagagtagtttaagacaaaggttaacgagaaaggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcggtttgaaggcaaggtggagaattgttgaaa 35892740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 48)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 316 - 691
Target Start/End: Original strand, 8664989 - 8665366
Alignment:
Q  316 aaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgcta-atgacccattta-ttaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagg 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  8664989 aaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagcactccatgacccattttgttaggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaga 8665088  T
Q  414 gaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665089 gaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg 8665188  T
Q  514 gaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaag 613  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665189 aaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacaggagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaag 8665288  T
Q  614 agaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || | ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8665289 agaagatccttagtgaaatcaaaggttatgtgttggttttcttttgggggttagattctggagttgggaaacaattgt 8665366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 363 - 689
Target Start/End: Original strand, 26363896 - 26364222
Alignment:
Q  363 atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26363896 atgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaagggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggcctttgggtgaggt 26363995  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacac 562  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  26363996 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggggccttttggagaagattcatggggttgggaaacacat 26364095  T
Q  563 gagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagg 662  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  26364096 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttggtg 26364195  T
Q  663 gttagattctagagttgggaaacaatt 689  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26364196 gttagattttagagttgggaaacaatt 26364222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Original strand, 6655588 - 6655915
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6655588 tgacccatttgttgggtaagcttggtaaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 6655687  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  6655688 caaaactttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatg 6655787  T
Q  564 agtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgaggg 663  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||    
T  6655788 agtggagagtcatttctgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcattagtaaaatcaaaggctaaaggttgtttctctttttgggg 6655887  T
Q  664 ttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6655888 ttagattctagagttgggaaacaattgt 6655915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 381 - 691
Target Start/End: Original strand, 12073042 - 12073351
Alignment:
Q  381 aagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtg 480  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  12073042 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgta 12073141  T
Q  481 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttg 579  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12073142 aatcttggagaaccaaaagagggg-ctcttgggaaaaagggttggtgccttttggg-aagattcatggggttggaaaacacatgagtgaagagtcttttg 12073239  T
Q  580 tgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttg 679  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12073240 tgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttg 12073339  T
Q  680 ggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||    
T  12073340 ggaaacaattgt 12073351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Original strand, 54882652 - 54882979
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54882652 tgactcatttgttgggtaagcttagtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 54882751  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  54882752 caaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttatgaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatg 54882851  T
Q  564 agtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgaggg 663  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  54882852 agtgtagagtcttttgtgagaaacttgggtgagtctcgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 54882951  T
Q  664 ttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54882952 ttagattctagagttgggaaacaattgt 54882979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 55085902 - 55085574
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55085902 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcaatgaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 55085803  T
Q  464 caaaactt-caagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacac 562  Q
     ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  55085802 aaaagctttcaagatgtaaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacat 55085703  T
Q  563 gagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagg 662  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||    
T  55085702 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgtgtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgattctcctttgggg 55085603  T
Q  663 gttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55085602 gttagattctagagttcggaaacaattgt 55085574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 50674382 - 50674055
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  50674382 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttaaatactaaatgttaagggtctttgggtgaggtt 50674283  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  50674282 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctaatgaaaagggttggtgccttatgggaaagattcatggggttgggaaacacatg 50674183  T
Q  564 agtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgaggg 663  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  50674182 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 50674083  T
Q  664 ttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50674082 ttagattctagagttggaaaacaattgt 50674055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 385 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 50263213 - 50262907
Alignment:
Q  385 ttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatc 484  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50263213 ttggtgaatctcatgaaaaccaaaggagggaacttttagggttttagacactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatc 50263114  T
Q  485 ttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagc 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  50263113 ttggagaaccaaaagagggggctcttggaaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagc 50263014  T
Q  585 aacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaa 684  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50263013 aacctcggtgactcttgtgaaaccaaaagagaagacccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaa 50262914  T
Q  685 caattgt 691  Q
    |||||||    
T  50262913 caattgt 50262907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 385 - 691
Target Start/End: Original strand, 41964069 - 41964373
Alignment:
Q  385 ttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaat 483  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41964069 ttggtgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtgaat 41964168  T
Q  484 cttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgag 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  41964169 cttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttagt--cttttgggaaagattcatggggttgggaaacacatgagtagagagtcttttgtgag 41964266  T
Q  584 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaa 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41964267 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttg-gggttagattctagagttgggaa 41964365  T
Q  684 acaattgt 691  Q
    ||||||||    
T  41964366 acaattgt 41964373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 384 - 691
Target Start/End: Original strand, 35662094 - 35662399
Alignment:
Q  384 cttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaat 483  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  35662094 cttggtgaatctcatggacaccaaatgagagaacttttaggattttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaatatgtgaat 35662193  T
Q  484 cttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgag 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||    
T  35662194 cttggagaaccaaaagagggggctcttaggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgaatggagagttctttgtgag 35662293  T
Q  584 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaa 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35662294 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa-gctaagggttggttctcttttgggtgttagattctagagttgggaa 35662391  T
Q  684 acaattgt 691  Q
    ||||||||    
T  35662392 acaattgt 35662399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 383 - 691
Target Start/End: Original strand, 46703152 - 46703458
Alignment:
Q  383 gcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaa 482  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46703152 gcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaa 46703251  T
Q  483 tcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtga 582  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| || || |||||||||||| |    
T  46703252 tcttcgagaatcaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatgggaaa-acatgaatggagagtcttttgtca 46703350  T
Q  583 gcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttggga 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  46703351 gcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaaaatccttag-gaaatcaaaggctaaaagttggttctcttttgggggttagattatagtgttggga 46703449  T
Q  683 aacaattgt 691  Q
    |||||||||    
T  46703450 aacaattgt 46703458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 382 - 691
Target Start/End: Original strand, 379028 - 379337
Alignment:
Q  382 agcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtg 480  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  379028 agcttggtgaatctcgtggaaaccaaaggagagaacttttaggatttgtagatactaaaggttgagggactttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtg 379127  T
Q  481 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgt 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||| |||||| |||||    
T  379128 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggtcggtgccttttggggaagattcatgagaatgggaaacacatgagtggagagtcatttgt 379227  T
Q  581 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgg 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  379228 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgtgggttagattctagagttgg 379326  T
Q  681 gaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||    
T  379327 gaaacaattgt 379337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 300 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 27417552 - 27417170
Alignment:
Q  300 cgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacag-atctgaaacacgttttaagcgcta-atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctca 397  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | | |||| ||||||  | ||||| ||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27417552 cgtgtcacgatttgggaaatcgtgacacgattttgtccggatct-aaacactatataagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctca 27417454  T
Q  398 tagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaa 497  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27417453 tgaaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagctttaagatgtgaatcttggagaaccaaa 27417354  T
Q  498 agagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagt 597  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||          ||||||||||    
T  27417353 agaaggggctcttgggaaaggggttggtgtcttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttt----------ttgggtgagt 27417264  T
Q  598 cttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  27417263 cttgtaaaaccaaaaaagaagatccttagtgaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattcttgagttttgaaacaattgt 27417170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 364 - 626
Target Start/End: Original strand, 40630616 - 40630878
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40630616 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 40630715  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  40630716 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagcttttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 40630815  T
Q  564 agtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag 626  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40630816 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag 40630878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Original strand, 2209340 - 2209672
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2209340 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaagcaaatgagggaacttttagggttttagatactaaagattgagggtctttgggtgaggtt 2209439  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  2209440 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaacgaggggactcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 2209539  T
Q  564 agtgaagagtc-----ttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctctttt 658  Q
    |||| ||||||      | || |       |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2209540 agtggagagtcaaaggctatgggttggttctcagcgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctctttt 2209639  T
Q  659 gagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2209640 gggggttagattctagagttgggaaataattgt 2209672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 381 - 687
Target Start/End: Original strand, 33989511 - 33989816
Alignment:
Q  381 aagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgt 479  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33989511 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaagcagataacttttagggtatttagatactaaagtttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgt 33989610  T
Q  480 gaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttg 579  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  33989611 gaatcttgaagaaccaaaatagggggctcttgggagaagg-ttggtgccttttgggagagattcatgggattgggaaacacatgagtggagagtcatttg 33989709  T
Q  580 tgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttg 679  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33989710 tgagcaacttgggtgagtcttttgaaaccaaaagagaagatccttag-gtaatcaaaggctaaggatttgttctcttttggaggttagattctagagttg 33989808  T
Q  680 ggaaacaa 687  Q
    ||||||||    
T  33989809 ggaaacaa 33989816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 455 - 687
Target Start/End: Original strand, 8647861 - 8648093
Alignment:
Q  455 ggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgga 554  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8647861 ggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggg 8647960  T
Q  555 aaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctc 654  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8647961 aaacacaggagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgttatgtgttggttctc 8648060  T
Q  655 ttttgagggttagattctagagttgggaaacaa 687  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8648061 ttttgggggttagattctggagttaggaaacaa 8648093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 363 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 46570083 - 46569816
Alignment:
Q  363 atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  46570083 atgacccatttgttgggcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaaattttagggttttagatactaaatgttgaaggtctttaggtgaggt 46569984  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacac 562  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |     
T  46569983 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaaggattggtgccttttgggaaagattcatggggttgggaaacaaat 46569884  T
Q  563 gagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaa 630  Q
    ||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  46569883 gagtggaaagtcttttgtgaacaacttaggtgaatcttatgaaaccaaaagagaaggtccttattgaa 46569816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 316 - 513
Target Start/End: Original strand, 8653182 - 8653381
Alignment:
Q  316 aaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgcta-atgacccattta-ttaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagg 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  8653182 aaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagcactccatgacccattttgttaggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaga 8653281  T
Q  414 gaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8653282 gaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg 8653381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 295 - 523
Target Start/End: Original strand, 10071446 - 10071676
Alignment:
Q  295 caaatcgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgcta-atgacccattta-ttaggtaagcttggtgaa 392  Q
    |||| ||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  10071446 caaaacgtaacacgattttggaaaatgtgacacaattttgacagatctgaaacacgttttaagcactccatgacccattttgttgggtaatcttggtgaa 10071545  T
Q  393 tctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaa 492  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10071546 tctcatggaaatcaaaggagggaacttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagctttaagatgtgaatcttggagaa 10071645  T
Q  493 ccaaaagagggggctcttggggaaagggttg 523  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  10071646 ccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttg 10071676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 366 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 22883287 - 22882964
Alignment:
Q  366 acccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttc 464  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||    
T  22883287 acccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaaattttagggtatttagatactaaaggttgagactatttgagtgaggttc 22883188  T
Q  465 aaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacaca-c 562  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||| || ||| |||| ||||| | ||||||| |    
T  22883187 aaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctctt-gggagagggctgataccttttggagagagactcatagggttaggaaacacatc 22883089  T
Q  563 gagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctctttt-gag 661  Q
     | || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||||| | |    
T  22883088 aaatg-agagtc-tttgtgagcaatttgggcgagtcttaggagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggataatggttggttctcttttgggg 22882992  T
Q  662 ggttagattctagagttgggaaacaatt 689  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22882991 ggttagattctagaattggaaaacaatt 22882964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 366 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 22934951 - 22934628
Alignment:
Q  366 acccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttc 464  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||    
T  22934951 acccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaaattttagggtatttagatactaaaggttgagactatttgagtgaggttc 22934852  T
Q  465 aaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacaca-c 562  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||| || ||| |||| ||||| | ||||||| |    
T  22934851 aaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctctt-gggagagggctgataccttttggagagagactcatagggttaggaaacacatc 22934753  T
Q  563 gagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctctttt-gag 661  Q
     | || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||||| | |    
T  22934752 aaatg-agagtc-tttgtgagcaatttgggcgagtcttaggagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggataatggttggttctcttttgggg 22934656  T
Q  662 ggttagattctagagttgggaaacaatt 689  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22934655 ggttagattctagaattggaaaacaatt 22934628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 415 - 686
Target Start/End: Original strand, 33089582 - 33089841
Alignment:
Q  415 aacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggg 514  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  33089582 aacttttaggtatttagatactaaagattgagggtctttgggtgaggttcaaagtttgaagatgtgaatcttggagaatcaaaagagggggctctt-ggg 33089680  T
Q  515 aaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaag 613  Q
    | |||||||||| ||||||| || ||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||           || ||||||||    
T  33089681 agagggttggtgtcttttggagagagattcatggggtcgaaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgg-----------gagaccaaaag 33089769  T
Q  614 agaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaaca 686  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  33089770 agaagatccttag-aaaatcaaaggctaaaggttggttctcttttggaggttagattatagagttgggaaaca 33089841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 364 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 35370874 - 35370553
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35370874 tgacccatctattgagtaagcttgatgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttaaggtatttagatactaaaggttgagggtctttgggagaggt 35370775  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaacc-aaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacac 560  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||||||||| |||||  ||| ||    
T  35370774 tcaaagctttaagatgtgaatcttggagaacctaaaagagggggttctt-gggagagggttggtcccttttcgaaagagattcatgaggttgataaaaac 35370676  T
Q  561 acgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttga 660  Q
    |  |  | |||||| ||||| ||||||||||||||||||   || ||||||| ||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  35370675 atcaaaggagagtc-tttgtaagcaacttgggtgagtctatggataccaaaatagaagat-ctttgggaaatcaaaggctaatggttggttctcttttg- 35370579  T
Q  661 gggttagattctagagttgggaaaca 686  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||    
T  35370578 gagttagattatagaattgggaaaca 35370553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 381 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 26699967 - 26699655
Alignment:
Q  381 aagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgt 479  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26699967 aagctttgtgaatctcatggaaaccaaatgagggaacttgtagggcatttagatactaaaggttgaagatctttggttgaggttcaaaacttcaagatgt 26699868  T
Q  480 gaatcttggagaaccaaaag-agggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttt 577  Q
    ||||||| |||| ||||| | |||||| ||||||  ||||||||||||||||||  | | ||||||||||||| || | | ||| ||||| ||| || ||    
T  26699867 gaatcttagagagccaaatgaagggggatcttggaaaaagggttggtgccttttcagaagagattcatggggtcgggagatacatgagtggagattcatt 26699768  T
Q  578 tgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagt 677  Q
     |||| |||||  | ||||||||   |||| |||||||| |||| ||| || ||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| || |||    
T  26699767 agtgaacaactcagatgagtcttagaaaactaaaagagatgatcttta-tgtaatcaaaggttaaaggttggttctcttttaggggttagattataaagt 26699669  T
Q  678 tgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||    
T  26699668 tgggaaacaattgt 26699655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 364 - 678
Target Start/End: Original strand, 3785722 - 3786034
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    |||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |   | |||||||||||||||| |||||| || ||| |    
T  3785722 tgacccatttgttgagtaagtttggtggatctcatggaaatcaaaggatggaacttttaggatacatggatactaaaggttgagagtctttaggcgagat 3785821  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacaca 561  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| |   |||||     
T  3785822 tcaaagcttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaagagggggctctt-ggaaaagggttggtgccttttgaggagagaattatggggtcgaggaacact 3785920  T
Q  562 cgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgag 661  Q
      |  | |||||| ||||||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  3785921 tcaaaggagagtc-tttgtgagcaaattgtgcgagtcttgggagaccaaaagagaatatccttag-gaaatcaaaggctaagagttggttctcttttg-g 3786017  T
Q  662 ggttagattctagagtt 678  Q
    || ||||||||||||||    
T  3786018 gggtagattctagagtt 3786034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 473 - 691
Target Start/End: Original strand, 12119281 - 12119496
Alignment:
Q  473 aagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagag 572  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||| ||||  |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||||  ||     
T  12119281 aagatatgaatcttggagaattaaaaaagggaactcttggg-aaagggttggttcccttttgggaagattcatggggttgcgaaacacattagtggtgaa 12119379  T
Q  573 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattct 672  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  12119380 tcatttgtgagcaatttgggtgtgtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctta-agaaatcgaa-gttaagggttggttctcttttgggggttagattat 12119477  T
Q  673 agagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12119478 agagttgggaaacaattgt 12119496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 389 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 38811590 - 38811405
Alignment:
Q  389 tgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttg 487  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  38811590 tgaatctcatggaaactaaaggagggaacttttagggtacttagatactaaaggttgagggtatttgggtgaggttcaaagctttaagatgtgaatcttg 38811491  T
Q  488 gagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtc 574  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||  |||| ||||||    
T  38811490 gagaacccaaaga-ggggctctt-gggaaagggttggtgtcttttgcggagagattcatgaggttaggaaacacataagtggagagtc 38811405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 379 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 35369956 - 35369652
Alignment:
Q  379 gtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatg 478  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  35369956 gtaagcttgatgaatctcatggaaattaaaggagggaactttta----tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagatttaagatg 35369861  T
Q  479 tgaatcttggagaacc-aaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtctt 576  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||||||||| ||||   |||||||  |    | |||| |    
T  35369860 tgaatcttggagaacctaaaagagggggttctt-gggagagggttggtcccttttcgaaagagattcatgaggtttagaaacacatcaaaagatagtc-t 35369763  T
Q  577 ttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagag 676  Q
    |||| ||||||||||||||||||   || | ||||| |||||||| ||   | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||     
T  35369762 ttgtaagcaacttgggtgagtctatggatagcaaaatagaagatcttt--gggaatcaaaggctaagggttggttctcttttg-gggttggattatagaa 35369666  T
Q  677 ttgggaaacaattg 690  Q
    ||||||||||||||    
T  35369665 ttgggaaacaattg 35369652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 424 - 526
Target Start/End: Original strand, 10071963 - 10072065
Alignment:
Q  424 ggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttg 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  10071963 ggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaactaaaagagggggctcttgtgaaaagggttg 10072062  T
Q  524 gtg 526  Q
    |||    
T  10072063 gtg 10072065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 435 - 690
Target Start/End: Original strand, 41961110 - 41961368
Alignment:
Q  435 ctaaaggttgagggtctttggg-tgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttg 533  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||   || | |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||  |||| | ||||| |||||    
T  41961110 ctaaagggtgagggtctttggggtgagattcaaagtgtccaaatgtgaatcttgtagaaccgaaaaagggggctctagggagaagg-tcggtgctttttg 41961208  T
Q  534 ggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaac-----ttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagt 627  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||  |  | ||||||| | |||||||||     |||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||     
T  41961209 gggagagattcatggg-ttgggaaacacattaaaggagagtctat-gtgagcaacgtaacttgggtgagtcttgggagaccaaaaaagaatatccttag- 41961305  T
Q  628 gaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattg 690  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41961306 gaaatcaaaagctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattg 41961368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 434 - 659
Target Start/End: Original strand, 34112314 - 34112538
Alignment:
Q  434 actaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttg 533  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||  || |  ||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  34112314 actaaagattgagggtctttgtgtgagattcaaaatgtccaattgtgaatcttggataacctaaagacgaggctcttaga-aaagggttggtgccttttg 34112412  T
Q  534 ggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaat 632  Q
    |||| || |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| ||| |||||  ||| |||||  |||||||||||| |||||    
T  34112413 gggagaggttcacggggttggaaaacacatgagtggagagtcatctgtgagcaacttggatgaatcttggaaaaacaaaactgaagatccttag-gaaat 34112511  T
Q  633 caaatgctaagggttggttctcttttg 659  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||    
T  34112512 caaaggctaaagtttggttctcttttg 34112538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 379 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 47515023 - 47514888
Alignment:
Q  379 gtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagat 477  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  47515023 gtaagcttgtggaatctcatggaaaccaaatgagtgaacttttagggtacttaaacactaaaggttgaaggtcttcgggtgaagttcaaagcttcaagat 47514924  T
Q  478 gtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg 513  Q
     |||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  47514923 atgaatcttggtgaaccaaaagagtggactcttggg 47514888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 364 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 25723752 - 25723604
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagggtctttgg-gtgagg 461  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| |||||||  ||  |||||||| ||||||  ||||||| | ||||    
T  25723752 tgacctatttgttaagtaagcttggtgaatttcatggaaaccaaatgagtgaactcttagggtacttcaatactaaatgttgag--tctttggagggagg 25723655  T
Q  462 ttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgg 512  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25723654 ttcaaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgg 25723604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 621 - 691
Target Start/End: Original strand, 40632334 - 40632404
Alignment:
Q  621 ccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40632334 ccttagtgaaatcaaatgttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 40632404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 390 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22629399 - 22629290
Alignment:
Q  390 gaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttgg 488  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   |||||| |||||||||| || |||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  22629399 gaatctcatagaaaccaaatgagtgaacttttaggaaatttagaaactaaaggttcagtgtctctgggtgagatttaaaagttcaagatgtgaatcttgg 22629300  T
Q  489 agaaccaaaa 498  Q
    ||||||||||    
T  22629299 agaaccaaaa 22629290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 385 - 487
Target Start/End: Original strand, 32091222 - 32091326
Alignment:
Q  385 ttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt--tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaa 482  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32091222 ttggtgaatttcatggaaactaaaagagggaatttttaaggtattttggatactaaatgttgagggtctttgagtgaggttcaaaacttcaagatgtgaa 32091321  T
Q  483 tcttg 487  Q
    |||||    
T  32091322 tcttg 32091326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 199
Target Start/End: Original strand, 54882355 - 54882411
Alignment:
Q  143 aaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54882355 aaggagaatggtggttgatggttaaattagcatcatcatcattttagagtcaaggtg 54882411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 35371254 - 35371079
Alignment:
Q  36 ctaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttggacttgattggttttgtcttgagggattgttcaagg 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||   || ||||||||||||||||||    |||||| || ||||||||| |||||| | || ||||||||    
T  35371254 ctaccgagggtggttggatgcaagtgaaagtcaatgtgtggatcaaggttcaagcgagaatttggaatttattggttttatcttgatgaatagttcaagg 35371155  T
Q  136 caaggataaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgttga 211  Q
     |||| ||||  | | | |||||||||||||||||   |||| ||| | |||||| |||||||||| |||||||||    
T  35371154 taaggttaagatgcaagttggttgatggttaaattgacatcaccataaatttagattcaaggtggataattgttga 35371079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 577 - 690
Target Start/End: Original strand, 32091324 - 32091435
Alignment:
Q  577 ttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagag 676  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||| || |||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||    
T  32091324 ttgtgaacaacttgggtaagttttgggagaccagaggagaagatccttag-gaaatcaaaggcaaagtgttggttcttttttg-gggtaagattctaaag 32091421  T
Q  677 ttgggaaacaattg 690  Q
    || |||||||||||    
T  32091422 tttggaaacaattg 32091435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 435 - 531
Target Start/End: Original strand, 6719289 - 6719384
Alignment:
Q  435 ctaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttt 531  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  6719289 ctaaaggttgaaggttttagggtgagattcaaaggttcaagatgtgaatcttggaaaactaaaagagtggattctt-gggaaagggttgatgccttt 6719384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Original strand, 36770955 - 36771031
Alignment:
Q  152 ggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgttgaaatgtggctcaaaaatg 228  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  36770955 ggtgattgatggttaaatttgcatcatcactattttagagtcaaggtgaagaattgttaaaaagtgactcaaaaatg 36771031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 227
Target Start/End: Original strand, 29055908 - 29055983
Alignment:
Q  152 ggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgttgaaatgtggctcaaaaat 227  Q
    ||||||| || |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  29055908 ggtggttaattgttaaattggcatcaccatcattttagagtcaaggtggagaaatgttgtaatttgactcaaaaat 29055983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 691
Target Start/End: Original strand, 41639345 - 41639385
Alignment:
Q  651 tctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41639345 tctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 41639385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 54882287 - 54882325
Alignment:
Q  1 tggatgcaaggaataagacttggaagcttgtggaactac 39  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54882287 tggattcaaggaataagacttggaagcttgtggaactac 54882325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34570797 - 34570759
Alignment:
Q  300 cgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacag 338  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34570797 cgtgtcacgatttgggaaaacgtgacacgattttgacag 34570759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 213
Target Start/End: Original strand, 3792432 - 3792493
Alignment:
Q  152 ggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgttgaaa 213  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3792432 ggtggttgatggttaaattgacatcaccactaatttagagtcaaggtggagaaatgttgaaa 3792493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 338
Target Start/End: Original strand, 37740416 - 37740449
Alignment:
Q  305 cacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacag 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37740416 cacgatttgggaaaacgtgacacgattttgacag 37740449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 237 - 691
Target Start/End: Original strand, 44353295 - 44353751
Alignment:
Q  237 gaaagtgttggaatcgtgacacgattttcaaggccgtg----aatgggtgtgctctggaattcaaatcgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattt 332  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  44353295 gaaaatgttggaaccgtgacacgaatttcaaggccgtgcgtgaatgggtgtgctctggaagccaaattgtgacatgatttgggaaaacatgacacgattt 44353394  T
Q  333 tgacagatctgaaacacgttttaagcgcta-atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttag 431  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44353395 tgacagctctgaaacacgttttaagcaatccatgactcatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttag 44353494  T
Q  432 atactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttt 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  44353495 atactaaaggttgagggtctttgggtgaggtttaaaacttcaaga---gaatcttggagaactaaaagagggggctcttgtgaagagggttggtgccttt 44353591  T
Q  532 tggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaa 631  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  44353592 tggagaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcatcggtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagattcttagtgaaa 44353691  T
Q  632 tcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44353692 tcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 44353751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 42435527 - 42435200
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42435527 tgacccatttgttcggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 42435428  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  42435427 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaaaggttggtgacttttggggaagattcatggggttgggaaacatatg 42435328  T
Q  564 agtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgaggg 663  Q
    | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42435327 aatggagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggg 42435228  T
Q  664 ttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42435227 ttagattctagagttggtaaacaattgt 42435200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 367 - 691
Target Start/End: Original strand, 11383621 - 11383945
Alignment:
Q  367 cccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaa 466  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11383621 cccatttgttaggcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaa 11383720  T
Q  467 aacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagt 566  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  |||    
T  11383721 agcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctattgtgaaaagggttggtgccttttgaggaagattcatggggttgggaaatacataagt 11383820  T
Q  567 gaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggtta 666  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11383821 ggaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggtta 11383920  T
Q  667 gattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  11383921 gattctagagttgggaaataattgt 11383945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Original strand, 40221376 - 40221704
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggaggg-aacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  40221376 tgacccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccataggaggggaacttttagggtttttgatactaaaggtggaaggtctttggatgaggt 40221475  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacac 562  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  40221476 ttagaacttcaagatgtgaatcttcgagaaccaaaatagggggctcttgggaaaggggttagtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacat 40221575  T
Q  563 gagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagg 662  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  40221576 gagtggagagtcttttgtgagcaacttaggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttggttctcttttgggg 40221675  T
Q  663 gttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221676 gttagattctagagttgggaaacaattgt 40221704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 429 - 691
Target Start/End: Original strand, 40328476 - 40328738
Alignment:
Q  429 tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgcc 528  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40328476 tagatactaaagatttagggtctttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggttcttgggaaaagggttggtgcc 40328575  T
Q  529 ttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtg 628  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40328576 ttttagggaagattcatggggatgggaaacacatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatctttagtg 40328675  T
Q  629 aaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40328676 aaatcaaaggctatgagttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 40328738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Original strand, 4283178 - 4283483
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283178 tgacccatttgttgtgtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 4283277  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                      ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4283278 caaagcttcaagatgtggatcttggagaaccaaaagagggggc----------------------ttttgggaaagattcatggggttgggaaacacatg 4283355  T
Q  564 agtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgaggg 663  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  4283356 agtggaaagtcttttgtgagaaacttggttgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 4283455  T
Q  664 ttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283456 ttagattctagagttgggaaacaattgt 4283483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40220413 - 40220186
Alignment:
Q  1 tggatgcaaggaataagacttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  40220413 tggatgcaaggaataagacttggaagcttgtggaactaccgaggatggttggatgcaagtggaggccggtgtttggatcaaggttcaagcggggctttgg 40220314  T
Q  101 acttgattggttttgtcttgagggattgttcaaggcaaggataaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtgg 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40220313 acttgattggttttgccttgagggattgttcaaggcaaggataaggagaatggtggttgatggttaaattagcatcatcatcattttagagtcaaggtgg 40220214  T
Q  201 agaattgttgaaatgtggctcaaaaatg 228  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||    
T  40220213 agaattgttgagatatgactcaaaaatg 40220186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 366 - 588
Target Start/End: Original strand, 22976168 - 22976389
Alignment:
Q  366 acccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttca 465  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22976168 acccatttgttgggtaagcttagtgaatctcttcgaaaccaaaggagtgaacttttagagttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttca 22976267  T
Q  466 aaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgag 565  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  22976268 aagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggaggctcttggaaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtt-gaaaacacatgag 22976366  T
Q  566 tgaagagtcttttgtgagcaact 588  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  22976367 tgaagagtctattgtgagcaact 22976389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 42436003 - 42435799
Alignment:
Q  1 tggatgcaaggaataagacttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttgg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  42436003 tggacgcaaggaataagacttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggtgtgtggatcaaggttcaagcggggctttgg 42435904  T
Q  101 acttgattggttttgtcttgagggattgttcaaggcaaggataaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtgg 200  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||  || ||||||||    
T  42435903 acttgattggttttgtcttggggaataattcaaggcaaggttaaggagattggtgattgatggttaaagtggtctcatcatcaatttgaaggcaaggtgg 42435804  T
Q  201 agaat 205  Q
    |||||    
T  42435803 agaat 42435799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 384 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 3000037 - 2999823
Alignment:
Q  384 cttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaa 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3000037 cttggtgaatctcatagaaaccaaaggagagaacttttagggaatttagatactaaaggttgagggtctttgggtgatgttcaaagcttcaagatgtgaa 2999938  T
Q  483 tcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggg-aagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||  ||||||  |||||    
T  2999937 tcttggagaaccaaaagagggggttctt-gggatatggttggtgtcttttggggaaagattcatggggatgagaaacacatgagtagagagtcaattgtg 2999839  T
Q  582 agcaacttgggtgagt 597  Q
    ||||||||||| ||||    
T  2999838 agcaacttgggcgagt 2999823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 364 - 678
Target Start/End: Original strand, 40585356 - 40585669
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    |||||||||| ||  || |||||| | ||||||||  |||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  40585356 tgacccatttgttgcgtgagcttgattaatctcatgaaaaccaaaggaaataacttttagagtatttagatactaaaggttaagagtctttggttgaggt 40585455  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacaca 561  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||  ||| ||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  40585456 tcaaagcttcaagatgtgaatatttgagaatcaaaagagtgggctcttttggagagggttgatgtcttttggtgagagattcatggggtttgaaaacaca 40585555  T
Q  562 cgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgag 661  Q
      |  | |||||| ||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  40585556 tcaaaggagagtc-tttgtgagcaatttgggtgagtattggtagaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaagactaagggttggttctcttttg-g 40585652  T
Q  662 ggttagattctagagtt 678  Q
    || ||||||||| ||||    
T  40585653 gggtagattctaaagtt 40585669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 577 - 691
Target Start/End: Original strand, 18655246 - 18655359
Alignment:
Q  577 ttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagag 676  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||     
T  18655246 ttgtgagcaacttcggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgatactcttttg-gggttagattctagac 18655344  T
Q  677 ttgggaaacaattgt 691  Q
    || ||||||||||||    
T  18655345 ttaggaaacaattgt 18655359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20686976 - 20686787
Alignment:
Q  20 ttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttggacttgattggttttgtctt 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||    |||||| |||||||||||||||||    
T  20686976 ttggaagcttgtgggactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggtgtgtagatcaaggttcaaacgagaatttggagttgattggttttgtctt 20686877  T
Q  120 gagggattgttcaaggcaaggataaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgttg 210  Q
    || |||    ||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| | |||| ||  | ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  20686876 ga-ggagaagtcaaggcaaggttaaggattaaggtggttgatggttaaattggcatcaccacaaatttggagtcaaggcggaaaattgttg 20686787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 378 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 20686579 - 20686443
Alignment:
Q  378 ggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaaga 476  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  20686579 ggtaagctcggtgaatctcattgaaaccaaaggagggaactttcagggtacttagatactaaatgttgaggatcttt-ggtgaagttcaaagcttcaaga 20686481  T
Q  477 tgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggg 514  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  20686480 tgtgaatcttggataaccaaaagagagggatctcgggg 20686443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 3846318 - 3846032
Alignment:
Q  400 gaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaa 498  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||  || || ||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||  ||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  3846318 gaaaccaaaggagaaaactttcagggtactttgaaactaaaggttgagggttcttgagtgagattcaaaggttcataatgtgaatcttgaagaaccaaaa 3846219  T
Q  499 gagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagt 597  Q
    ||  | |||||| || |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| |||||| | |    
T  3846218 ga-agagctctt-ggaaaagagttggtgtcttttggggagagattcatggggttgggaaacacatgagagaagattc-tttgtgagcaaattgggtaaat 3846122  T
Q  598 cttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattg 690  Q
    |||  || ||||||||||| |||| || | ||||||||| |  || |||||||||  ||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||    
T  3846121 ctttggataccaaaagagacgatcttttg-gaaatcaaaggtaaatggttggttc-attttg-gggttagaatctagagtcagaaaacaattg 3846032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 442 - 686
Target Start/End: Original strand, 10020150 - 10020398
Alignment:
Q  442 ttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgcc--ttttggggaag 539  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  |||||||  ||    
T  10020150 ttgagggtctttaggtgagattcaaatgatcaatatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctctt-gggaaagggttcgtgtcatttttgggagag 10020248  T
Q  540 attcatgg--------ggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaa 631  Q
    |||||| |         |||| |||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||  |  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  10020249 attcattgcttaggaaagttgaaaaacacatgagagaagagtc--ttgtgaacaacttaggtgaatcttagggtaccaaaagaggagatccttag-gaaa 10020345  T
Q  632 tcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaaca 686  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10020346 tcaaaggctaagggtttgtt-tctttt-tgggttggattctagagttgggaaaca 10020398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 418 - 595
Target Start/End: Original strand, 40535538 - 40535713
Alignment:
Q  418 ttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaa 516  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||  |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| |||| | |||    
T  40535538 ttttagggtatttagatactaaagattgatggtctttgggt--ggttcaaagtttcaagttgtggatcttttagaaccaaaagagggggttctt-gagaa 40535634  T
Q  517 agggttggtgccttttggggaaga-ttcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtga 595  Q
    ||||||| ||||||||||  || | |||||| | |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  40535635 agggttgatgccttttggataaaagttcatgtgattggaaaacacatgagagaagagtc-attgtgagcaacttaggtga 40535713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 428 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 9634007 - 9633816
Alignment:
Q  428 ttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgc 527  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||   || | |||||||||||| | || ||||||| || |||||||   ||| ||||||| |    
T  9634007 ttagaaactaaaggtcgaacgtctttgggtgagattcaaagtgtccaaatgtgaatcttgaataatcaaaagatggcgctcttga--aaaaggttggtac 9633910  T
Q  528 cttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatc 621  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||  ||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  9633909 cttttgggagagattaatggggttggtaaacacataagatgagagtcatttgtgagcaacttgggtgaatcttaggaaaccaaacgagaagatc 9633816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Original strand, 10014676 - 10014762
Alignment:
Q  143 aaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgttgaaatgtggctcaaaaatga 229  Q
    |||||||||||||||| || |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||    
T  10014676 aaggagaatggtggttcattgttaaagtggcatcatcatcattttagagtcaaggtggagaaatgttgcaaagtgactcaaaaatga 10014762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 394 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 3817840 - 3817641
Alignment:
Q  394 ctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaa 492  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| | || || |  ||||||  || |||||| || ||||| ||||    
T  3817840 ctcatggaaaccaaaggagaaaacttttagggtacttagaaactaaaggttgagggtttctgagtaaa-ttcaaaggttgaagatgggattcttgaagaa 3817742  T
Q  493 ccaaaagagg--gggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaa-gattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaactt 589  Q
    ||||||||    ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  || ||||| || ||||||||||| ||    
T  3817741 ccaaaagaattagggctcttgga-aaagggttggtgccttttggagaaagattcatggggttggaaaatacataagagaagattc-tttgtgagcaaatt 3817644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 576 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 33655628 - 33655516
Alignment:
Q  576 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctaga 675  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  || | |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  33655628 tttgtgagcaatttgggtgaatcttaggagaacaaaagagaagatccttaga-aaatcaaaggttaagggttggttctctttcaagggttaaattttaga 33655530  T
Q  676 gttgggaaacaatt 689  Q
    ||||| ||| ||||    
T  33655529 gttggaaaataatt 33655516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 580
Target Start/End: Original strand, 11136843 - 11136989
Alignment:
Q  434 actaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttg 533  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   || | || ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || ||  ||| | |||||||||    
T  11136843 actaaaggttgggggtctttgggtgagattcaaattgtccaaatatgaattttggagaactaaaagagagggctctt-ggaaattggtcgatgccttttg 11136941  T
Q  534 ggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgt 580  Q
    |||| || ||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  11136942 gggagaggttcattgggtaggaaaacacatgagtggagagtcatttgt 11136989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 10101588 - 10101525
Alignment:
Q  471 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggg 535  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  10101588 tcaaaatgtgaaccttggagaaccaaaagaggaggctctt-gggaaagggttgctgcattttggg 10101525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Original strand, 15949126 - 15949182
Alignment:
Q  157 ttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgttgaaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15949126 ttgatggttaaattggtatcatcgccaatttagagtcaaggtggagaaatgttgaaa 15949182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 476 - 546
Target Start/End: Original strand, 28461305 - 28461375
Alignment:
Q  476 atgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatg 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28461305 atgtgaatcttggagaaccaaaagaggaagctctt-aggaaatggttggttccttttggggatagattcatg 28461375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 512 - 690
Target Start/End: Original strand, 10239940 - 10240113
Alignment:
Q  512 gggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacaca-cgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaacca 609  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| | | |||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |||||    || |    
T  10239940 gggaaagtgttgctgcctttttgggatagattcgtggggttagaaaacacatcaaatgaa-agtcttt-gtgagtaacttggatgaatcttggactacta 10240037  T
Q  610 aaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattg 690  Q
    ||| ||||||||||||   ||||||   |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10240038 aaaaagaagatccttaaa-aaatcag--gctaagagttggttctctttgg--ggttagattctagatttgggaaacaattg 10240113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19492313 - 19492248
Alignment:
Q  147 agaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgttgaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19492313 agaatggtggttgatggttaattgac-atcaccatcaaattagagtcaaggtggagaaatgttgaaa 19492248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26268843 - 26268777
Alignment:
Q  147 agaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgttgaaa 213  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| | |||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26268843 agaaaggtgattgatagttaaattggcatcatcactaatttagagtcaaggtggagaaatgttgaaa 26268777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 338
Target Start/End: Original strand, 43036208 - 43036246
Alignment:
Q  300 cgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacag 338  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43036208 cgtgtcacgatttgggaaaacgtgacacgattttgacag 43036246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 209
Target Start/End: Original strand, 26402624 - 26402681
Alignment:
Q  152 ggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgtt 209  Q
    |||||||||||||||||||   |||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  26402624 ggtggttgatggttaaatttacatcaccaccaatttagagtcaaggtggagaaatgtt 26402681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 26)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 297 - 691
Target Start/End: Original strand, 213031 - 213424
Alignment:
Q  297 aatcgtgacacgatat-gggaaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgcta-atgacccatttattaggtaagcttggtgaatc 394  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  213031 aatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagtactccatgacccattttttgggtaagcttgatgaatc 213130  T
Q  395 tcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttgg-agaac 493  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  213131 tcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttgggagaac 213230  T
Q  494 caaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggt 593  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  213231 caaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggt 213330  T
Q  594 gagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213331 gagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaag----ggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 213424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 363 - 691
Target Start/End: Original strand, 40146892 - 40147220
Alignment:
Q  363 atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40146892 atgacccatttgttggttaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 40146991  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacac 562  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  40146992 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaatggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacat 40147091  T
Q  563 gagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagg 662  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  40147092 gagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggg 40147191  T
Q  663 gttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40147192 gttagattctagagttgggaaacaattgt 40147220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Original strand, 38746637 - 38746964
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38746637 tgactcatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 38746736  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  38746737 caaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttaagaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacgtg 38746836  T
Q  564 agtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgaggg 663  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  38746837 agtggagagtcatttgcgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttattgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 38746936  T
Q  664 ttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38746937 ttagattctagagttgggaaacaattgt 38746964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 378 - 691
Target Start/End: Original strand, 27015178 - 27015491
Alignment:
Q  378 ggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagat 477  Q
    |||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27015178 ggtatgcttggcgaatctaatggaaatcaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggatcaaagcttcaagat 27015277  T
Q  478 gtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttt 577  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  27015278 gtgaatcttgaagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagaatcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttt 27015377  T
Q  578 tgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagt 677  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27015378 tgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagt 27015477  T
Q  678 tgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||    
T  27015478 tgggaaacaattgt 27015491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 382 - 691
Target Start/End: Original strand, 5057698 - 5058006
Alignment:
Q  382 agcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtga 481  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5057698 agctgggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggatcaaagcttcaagatgtga 5057797  T
Q  482 atcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtg 581  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  5057798 atctttgagaaccaaaagagggg-cttttgggaaaaaggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcatttgtg 5057896  T
Q  582 agcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttggg 681  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  5057897 agcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtaaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgga 5057996  T
Q  682 aaacaattgt 691  Q
    ||||||||||    
T  5057997 aaacaattgt 5058006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 380 - 691
Target Start/End: Original strand, 28277963 - 28278275
Alignment:
Q  380 taagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgt 479  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28277963 taagcttggtgaatctcaaggaaactaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgt 28278062  T
Q  480 gaatcttggagaaccaaaagagggg-gctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtctttt 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| || ||    
T  28278063 gaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagactatt 28278162  T
Q  579 gtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagtt 678  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28278163 gtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagattgttagtgaaatcaaatgctaagggttggctctcttttaggggttagattctagagtt 28278262  T
Q  679 gggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||||    
T  28278263 gggaaacaattgt 28278275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 327 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 27638188 - 27637823
Alignment:
Q  327 cgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgcta-atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttaggg 425  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||  ||||||||||| |||   | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27638188 cgattttgacagatctgtcacactatttaagcactctatgacccatttgttaaaaaggcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttaagg 27638089  T
Q  426 ttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggt 525  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27638088 ttttagatactaaaggttgagaatctttgggtgaggttc-aaagttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaagggttggt 27637990  T
Q  526 gccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaa--agagaagatcct 623  Q
    || |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27637989 gcatttt-gggaagattcatggggttaggaaacacatgagtgaagagtcttttatgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagagaagatcct 27637891  T
Q  624 tagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27637890 tagtgaaatcaaagactaaaagtttgttctcttttgggggttagatgctagagttgggaaacaattgt 27637823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 386 - 690
Target Start/End: Original strand, 316419 - 316720
Alignment:
Q  386 tggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatc 484  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  316419 tggtgaatctcatggaaactaaaggagagaacttttattgtacttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatc 316518  T
Q  485 ttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgag 583  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||  |    |||||| ||||||||    
T  316519 ttggagaaccaaaagggggggctctt-gggagagggttggtgccttttggggagagattcataaggttgggaaacacatcaaaagagagtc-tttgtgag 316616  T
Q  584 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaa 683  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||    
T  316617 caactt-ggtgaatcttgggagaccaaaagagaaaatcc-tag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattttaaagttggaaa 316713  T
Q  684 acaattg 690  Q
    |||||||    
T  316714 acaattg 316720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 379 - 689
Target Start/End: Original strand, 35615818 - 35616125
Alignment:
Q  379 gtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagat 477  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||   ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  35615818 gtaagcttggtgaatctccttgaaaccaaatgaaaaaacttttagagtatttagatactaaaggttgagggtctttgagtgaggttcaaagcttcaagat 35615917  T
Q  478 gtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtctt 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||  |  |||||||| |    
T  35615918 gtgaatcttggagaaccaaaagaggggactctt-gggaaaggggtgatgccttttggggagagattcatggagttgagaaacacataaaagaagagtc-t 35616015  T
Q  577 ttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagag 676  Q
    |||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |  ||||||||| ||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  35616016 ttgtaatcaactttggtgagtcttgggaaaccaaaagcgaagatcatca-agaaatcaaaggct-agagttgattctcttttg-tggttagattctagag 35616112  T
Q  677 ttgggaaacaatt 689  Q
    || ||||||||||    
T  35616113 tttggaaacaatt 35616125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 382 - 691
Target Start/End: Original strand, 4160284 - 4160590
Alignment:
Q  382 agcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtg 480  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  || |||| |||    
T  4160284 agctcggtgaatctcatggaaaccaaatgagagaacatttagggtatttagatactaaagtttgagggt-tttgggtgatgttcaaagtttaaagaagtg 4160382  T
Q  481 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttg 579  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||| || |||   |||| |||||| ||||    
T  4160383 aatcctggagaactaaaagagggggctcttggg-agagggtaagtgtcttttggggagagattcatagggttgggaa-cacgtaagtggagagtcatttg 4160480  T
Q  580 tgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttg 679  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4160481 tgagcaactagggtgaatcttgggaaaccaaaagagaagatccttag-gtaattaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattc-agagttg 4160578  T
Q  680 ggaaacaattgt 691  Q
     |||||||||||    
T  4160579 agaaacaattgt 4160590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 363 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 16642414 - 16642211
Alignment:
Q  363 atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgagg 461  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16642414 atgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagcacttttagggtatttagatactaaaggttgatggtctttgggtgagg 16642315  T
Q  462 ttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacac 560  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  16642314 ttcaaagcttcaagaagtgaatcttgaagaaccaaaaga--gggctctt-gggaaagggttggtgccttttggggacagattcatggggttaggaaacac 16642218  T
Q  561 acgagtg 567  Q
    | |||||    
T  16642217 atgagtg 16642211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 366 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 14689942 - 14689622
Alignment:
Q  366 acccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttc 464  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| | |||||| |||||||||| |||| ||||    
T  14689942 acccatttgttgagtaggcttggtgaatctcatggaaactaaaggagaaaacttttagggcatttagatagtgaaggttaagggtctttgagtgatgttc 14689843  T
Q  465 aaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacga 564  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||| | |||||| || |  ||| |||||||  |    
T  14689842 aaagtttcaagatgtgaattttggagaaccaaaagaaggggttctt-gtgaaagggttggtgccttttggag-agattcgtgagaatgggaaacacataa 14689745  T
Q  565 gtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggt 664  Q
      | |||||  |||||||||||||| | | ||||||| || ||||||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||     
T  14689744 aaggagagt-atttgtgagcaacttagataagtcttgggacaccaaaagaaaagatccttag-aaaatcaaaggctaggggttggttctcttttg-ggga 14689648  T
Q  665 tagattctagagttgggaaacaattg 690  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14689647 tagattctagagttgtgaaacaattg 14689622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 383 - 573
Target Start/End: Original strand, 30802592 - 30802782
Alignment:
Q  383 gcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtga 481  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||      
T  30802592 gcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaacttttagggtatttagatattctaggttgagggtctttaggtgaggttcaaagcttcatgatgt-t 30802690  T
Q  482 atcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagt 573  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  30802691 atcttagagaaccaaaagaggaggctctt-gggaaagggtttgtgccttttggggagagattcatggggttagaaaacacatgagtggagagt 30802782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 437 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 33906491 - 33906288
Alignment:
Q  437 aaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggg 536  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  33906491 aaaggttgagggtctttgagtgaggttcgaagcctcaaaatgtgaatcttgtagaaccaaaaaagggggctctt-gggagagggttggtgccttttgggg 33906393  T
Q  537 a-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaa 635  Q
    | |||||||||||||||  |||||||  |  | |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33906392 agagattcatggggttgagaaacacatcaaaggagagac-ttagtgagcaacttgggtgagtcttgggaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaa 33906295  T
Q  636 atgctaa 642  Q
    | |||||    
T  33906294 aggctaa 33906288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 566
Target Start/End: Original strand, 30792872 - 30793073
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  30792872 tgacccatttgttaagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagtaaacttttagggtaattagatactaaaggttgagggtctttaggtgatgt 30792971  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacaca 561  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  30792972 tcaaagcttcaagatgt-tatcttggagaaccaaaatatgtgg--ctttgggaaaaggttggtgccttttggggagatattcatggggttgggaaacaca 30793068  T
Q  562 cgagt 566  Q
     ||||    
T  30793069 tgagt 30793073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 379 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 10055228 - 10055040
Alignment:
Q  379 gtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagat 477  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||  || |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  10055228 gtaagtttggtgaatctcatagaaatcaaatgatggaacatttagagtacttggatactaaagattgaaggtttttgggtgagattcaaagcttcaagat 10055129  T
Q  478 gtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  10055128 gtgaatcttggagaaccaaaagagagggctctt-gggaaaggtttggtgccttatggggagagattcacggggttgggaaacacatgagt 10055040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 476 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 21206076 - 21205873
Alignment:
Q  476 atgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtc 574  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||| |||||  ||| || ||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  21206076 atgtgaatcttagagaaccaaaagatggggttctttgg-aaagggttggtgtctttttcggagaggttcatagggttgggaaacacatgagtgaggagtc 21205978  T
Q  575 ttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctag 674  Q
     ||||| || || |||||||| | ||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  21205977 atttgtcagaaatttgggtgaattttaggaaactaaaagtgaagaacctta-tgaaatcaaagactaaggattggttctcttttgagggttagattatgg 21205879  T
Q  675 agttgg 680  Q
    ||||||    
T  21205878 agttgg 21205873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 577 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 16641263 - 16641150
Alignment:
Q  577 ttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagag 676  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16641263 ttgtgaacaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatacttaaa-aaatcaaaggctaaaggttggttctcttttggggattagattctagag 16641165  T
Q  677 ttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||| |||| ||||    
T  16641164 ttggggaacatttgt 16641150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 33906650 - 33906578
Alignment:
Q  381 aagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtcttt 453  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  33906650 aagcttggtgaatctcat-gaaaccaaagaagagaacttttagggtatttagatattaaaggttgaggttcttt 33906578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 102
Target Start/End: Original strand, 520631 - 520710
Alignment:
Q  23 gaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttggac 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||   || |  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  520631 gaagcttgtggaactagcgagggtgattggatgcaagtgaaggtcaacgtctaaatcaaggttcgagcggggctttggac 520710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 211
Target Start/End: Original strand, 8037910 - 8038075
Alignment:
Q  45 gtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttggacttgattggttttgtcttgagggattgttcaaggcaaggataa 144  Q
    |||||||||||||||| || ||||  || | ||||||| ||||||||  | |||| ||||||||| ||||||||| |||  | ||||||| ||||| |||    
T  8037910 gtggttggatgcaagtagaagtcgatgtgttgatcaagattcaagcgaggatttgaacttgattgattttgtcttaaggagtagttcaagtcaaggttaa 8038009  T
Q  145 ggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgttga 211  Q
    | || |  ||| ||||||||||||||   ||| |||  | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8038010 gaaggaatgtgtttgatggttaaattgacatcgtcactaattta-agtcaaggtagagaattgttga 8038075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 106
Target Start/End: Original strand, 34700950 - 34701040
Alignment:
Q  16 agacttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttggacttga 106  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||  | | ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34700950 agacttggaagcttctgagactatcgatgttggttggatgctagtggaggccggtctcttgatcaaggttcaagcggggctttgaacttga 34701040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 338
Target Start/End: Original strand, 533554 - 533592
Alignment:
Q  300 cgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacag 338  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  533554 cgtgtcacgatttgggaaaacgtgacacgattttgacag 533592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 13487743 - 13487797
Alignment:
Q  151 tggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaat 205  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  13487743 tggtggttgatggttaaagtggcatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 13487797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28751039 - 28751001
Alignment:
Q  300 cgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacag 338  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28751039 cgtgacacaatttgggaaaacgtgacacgattttgacag 28751001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 608 - 689
Target Start/End: Original strand, 8019464 - 8019542
Alignment:
Q  608 caaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaatt 689  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  8019464 caaaagtgaagatccttaga-aaatcaaaggctaagg-ttggttat-ttttgggggttagattctatagttgggaaataatt 8019542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 295 - 691
Target Start/End: Original strand, 30235686 - 30236084
Alignment:
Q  295 caaatcgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgcta-atgacccattta-ttaggtaagcttggtgaa 392  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  30235686 caaaacgtgacacgattttggaaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacattttaagcactccatgacccattttgttgggtaagcttggtgaa 30235785  T
Q  393 tctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaa 492  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30235786 tctcaatgaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaa 30235885  T
Q  493 ccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttggg 592  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  30235886 ccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaatattcatggggttggaaaacacaagagtggagagtcatttgtgagcaagttggg 30235985  T
Q  593 tgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30235986 tgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcgaaggctaatgattggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 30236084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 49200007 - 49199679
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49200007 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 49199908  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  49199907 caaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctattgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacatatg 49199808  T
Q  564 agtgaagagtcttttgtgagcaacttggg-tgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagg 662  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  49199807 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggttgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttttgggg 49199708  T
Q  663 gttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49199707 gttagattctagagttgggaaacaattgt 49199679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 381 - 691
Target Start/End: Original strand, 34490862 - 34491172
Alignment:
Q  381 aagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtg 480  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34490862 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtg 34490961  T
Q  481 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgt 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||||    
T  34490962 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggagttgaaaaacacatgagtggagagtcatttgt 34491061  T
Q  581 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgg 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34491062 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgg 34491161  T
Q  681 gaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||    
T  34491162 gaaacaattgt 34491172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 381 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 6096118 - 6095808
Alignment:
Q  381 aagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtg 480  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6096118 aagcttggtgaatctcatggaaatcagaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtg 6096019  T
Q  481 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgt 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||    
T  6096018 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttttgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgt 6095919  T
Q  581 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgg 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6095918 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaaaggttggttctcttttgggggttagattctagagttgg 6095819  T
Q  681 gaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||    
T  6095818 gaaacaattgt 6095808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 316 - 689
Target Start/End: Original strand, 47303834 - 47304208
Alignment:
Q  316 aaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgcta-atgacccattta-ttaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagg 413  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  47303834 aaaacgtgacatgatttagacatatctgaaacacgttttaagcactccacgacccattttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaatcaaaggaga 47303933  T
Q  414 gaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg 513  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47303934 gaacttttatggttttagatactaaatgttgaaggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg 47304033  T
Q  514 gaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaag 613  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  47304034 aaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt-ttttgtgagcaacttaggtgagtcttgtaaaaccaaaag 47304132  T
Q  614 agaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaatt 689  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47304133 agaatatccttagtgaaatcaaaaactaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaatt 47304208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 363 - 691
Target Start/End: Original strand, 54593335 - 54593663
Alignment:
Q  363 atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagggtctttgggtgagg 461  Q
    ||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54593335 atgacccatttgttcgaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtccttgggtgagg 54593434  T
Q  462 ttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacaca 561  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54593435 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtaccttttggggaagattcatggggatggaaaacaca 54593534  T
Q  562 cgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgag 661  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  54593535 tgagtggagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaatagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttggg 54593633  T
Q  662 ggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54593634 ggttagattctagagttgggaaacaattgt 54593663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Original strand, 4569583 - 4569910
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4569583 tgacccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 4569682  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4569683 caaagcttcaagatgtaaatcttggagaatcaaaagagggggctcttgggaaaagggggtgtgcctattggggaagattcatggggttgggaaacacatg 4569782  T
Q  564 agtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgaggg 663  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  4569783 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagatgatctttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggtgg 4569882  T
Q  664 ttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4569883 ttagattctagagttggaaaacaattgt 4569910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 363 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 55302502 - 55302174
Alignment:
Q  363 atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  55302502 atgacccatttgttgggtaagcttggtgaatttcattgaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaagttgagggtctttggatgaggt 55302403  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacac 562  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||     
T  55302402 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaagggttggtgccttttgggaaaaattcatgaggttggaaaacacat 55302303  T
Q  563 gagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagg 662  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |    
T  55302302 gagtggagattcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaggggttggttctcttttgtag 55302203  T
Q  663 gttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55302202 gttagattatagagttgggaaacaattgt 55302174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Original strand, 40912969 - 40913298
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaa-gcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40912969 tgacccatttgttgggtaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggggacttttagggttttagatactaaaggtttagggtctttgggtgaggt 40913068  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgcc-ttttggggaagattcatggggttggaaaacaca 561  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  40913069 tcaaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgcctttttggagaagattcatggggttgggaaacaca 40913168  T
Q  562 cgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgag 661  Q
     ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |    
T  40913169 tgagtggagagtcatttgtgagcaaattgggtgagtcttgtgaaagcaaaagagaagatccttagtgaaattaaaggttaagggttggttctcttttggg 40913268  T
Q  662 ggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40913269 ggttagattctagagttgggaaacaattgt 40913298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 364 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 43404269 - 43403975
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43404269 tgacccatttgttgggtgagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaacttttagggttttagatactaaaagttgagggtctttgggtgaggtt 43404170  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43404169 caaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatg 43404070  T
Q  564 agtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctctttt 658  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43404069 agtggagagtcatttgggagcaacttgggtgagtcttgtgaaactaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctctttt 43403975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Original strand, 36018482 - 36018810
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36018482 tgacccatttgttggataagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaactttcagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttggatgaggt 36018581  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacac 562  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||     
T  36018582 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagcttttgggaaaagggttggtgccttttggggaagatccatggggatgggaaacacat 36018681  T
Q  563 gagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagg 662  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||    
T  36018682 gaatggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatggattggttctcttttgggg 36018781  T
Q  663 gttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36018782 tttagattctagagttgggaaacaattgt 36018810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 364 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 43402326 - 43402032
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||| ||||| || ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43402326 tgactcatttgttgggtgagcttggtgaatcttatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 43402227  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  43402226 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgagaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 43402127  T
Q  564 agtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctctttt 658  Q
    |||| ||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43402126 agtggagaatcatttgtgaacaacttgggtaagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctctttt 43402032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 382 - 691
Target Start/End: Original strand, 46860120 - 46860431
Alignment:
Q  382 agcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtg 480  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  46860120 agcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagagaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtg 46860219  T
Q  481 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgt 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||||    
T  46860220 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatagggatgggaaacacatgagtggagagtcatttgt 46860319  T
Q  581 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgcta--agggttggttctcttttgagggttagattctagagtt 678  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46860320 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaagactaagagggttggttctcttttgggggttagattctagagtt 46860418  T
Q  679 gggaaacaattgt 691  Q
    | |||||||||||    
T  46860419 gagaaacaattgt 46860431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 381 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 41820040 - 41819733
Alignment:
Q  381 aagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtg 480  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41820040 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagataacttttaggtttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtg 41819941  T
Q  481 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgt 580  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || |||||    
T  41819940 aatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgcctttt-gggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagactcatttgt 41819842  T
Q  581 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgg 680  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  41819841 gagcaacttgagtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatcttta-tgaaatcaaa-gctaagggttggttctcttttagcggttagattctagagttgg 41819744  T
Q  681 gaaacaattgt 691  Q
    |||| ||||||    
T  41819743 gaaataattgt 41819733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 363 - 604
Target Start/End: Original strand, 28074248 - 28074488
Alignment:
Q  363 atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28074248 atgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 28074347  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacac 562  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  28074348 tcaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctt-gggaaatagttggtgcgttttggggaagattcatggggatgggaaacacat 28074446  T
Q  563 gagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtga 604  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  28074447 gagtggagagtctattgagagaaacttaggtgagtcttgtga 28074488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 379 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 5434400 - 5434087
Alignment:
Q  379 gtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagat 477  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||| |||||||||| | |||||| ||| |||||||||    
T  5434400 gtaagcttggtgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttaggatatttagataccaaaagttaagggtctttgagggaggtttaaagcttcaagat 5434301  T
Q  478 gtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtctt 576  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  5434300 gtaaatcttatagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttagtgttttttagggagagattcatggggttaggaaacacatgagtggagagtctt 5434201  T
Q  577 ttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagag 676  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||| | ||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  5434200 ttgtgagcaagttgggtgagtcttgggaaaccaaaagagaagatcctta-tgtaatcaaagactaaagattgattctcttttgggggttagattatagag 5434102  T
Q  677 ttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||||||    
T  5434101 ttgggaaacaattgt 5434087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 428 - 686
Target Start/End: Original strand, 1683184 - 1683440
Alignment:
Q  428 ttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgc 527  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  | ||||||||||||||||||||||||||  || | ||  |||||||||||||||    
T  1683184 ttagaaactaaaggttgagggtctttgggtgagattcaaatgtttcaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagaagg-tttttcggaaagggttggtgc 1683282  T
Q  528 cttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag 626  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| | | || ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1683283 attttgggaagagattcatggggttggaaaacacatgagtggataatcatttatgagcaactttggtgagtcttgtgagaccaaaagagaagatccttag 1683382  T
Q  627 tgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaaca 686  Q
      |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1683383 -aaaatcaaaggctaagggttggttatcttttg-gggttagaatctagagttgggaaaca 1683440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 43402803 - 43402599
Alignment:
Q  1 tggatgcaaggaataagacttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  43402803 tggatgcaaggaataagacttggaagcttgtggaactaccgaggattgttggatgcaagtggaggtcggtgtgtggatcaaggttcaagcagggctttgg 43402704  T
Q  101 acttgattggttttgtcttgagggattgttcaaggcaaggataaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtgg 200  Q
    |||| ||| ||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||  || ||||||||    
T  43402703 acttaatttgttttgtcttggggaatagttcaaggcaaggttaaggagattggtggttgatggttaaagtggcatcatcttcaatttgaaggcaaggtgg 43402604  T
Q  201 agaat 205  Q
    |||||    
T  43402603 agaat 43402599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 378 - 684
Target Start/End: Original strand, 34795515 - 34795819
Alignment:
Q  378 ggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaaga 476  Q
    |||||| ||||||||||  ||  |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  34795515 ggtaagtttggtgaatcctatgaaaaccaaaggagagatcttttagggtatttagatactaaaggttgatggtcgttgggtgatgttcaaagcttcaaga 34795614  T
Q  477 tgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtct 575  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||| ||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||  |  | ||||| |    
T  34795615 tctgaatcttggagaaccagaagagggggttc-tagggagaggtttcatgccttttgaggagagattcatggggttgggatacacatcaaaggagagt-t 34795712  T
Q  576 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctaga 675  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||| |    
T  34795713 tttgtaagaaacttgggtgagtcttgggagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggctaagggatggttctcttttg-tggttaaattctaaa 34795810  T
Q  676 gttgggaaa 684  Q
    |||||||||    
T  34795811 gttgggaaa 34795819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 35139250 - 35138917
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  35139250 tgacccatttgttaagtaagcttggtgaatttcatggaaaccaaaggagggtactttttgggtatttagatactaaacgttgagggtctttagatgaggt 35139151  T
Q  463 tcaaaactt-------caagatgtgaatcttggagaaccaaaag-agggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttgg 553  Q
    |||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  35139150 tcaaaactttaagatgtaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaaatgggttctt-cggaaagggttgatgccttttgaggagagattcatgaggttgg 35139052  T
Q  554 aaaacaca-cgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaat-caaatgctaagggttggtt 651  Q
    |||||| | | | || |||||| ||| |||||||||||  ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||  ||    
T  35139051 aaaacaaatcaaatg-agagtc-tttatgagcaacttgaatgagtcttgggagaccaaaatagaagatccttag-gaaataaaaaagctaagggttaatt 35138955  T
Q  652 ctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||| |||||| ||| || |||| ||||||||||||    
T  35138954 ctcttttg-gggttaaattttaaagtt-ggaaacaattgt 35138917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 379 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 26324034 - 26323821
Alignment:
Q  379 gtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagat 477  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  26324034 gtaagtttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttaagatatttagatactaaaggttgagggtcattgggtgaagttcaaagcttcaagat 26323935  T
Q  478 gtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtctt 576  Q
    || ||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||  | | |||||||||||||||  |||||||  |  | |||||| |    
T  26323934 gtaaatcttgaagaatcaaaagagagggctatt-gggaaagggttggtgcattttcagcagagattcatggggttgagaaacacatcaaaggagagtc-t 26323837  T
Q  577 ttgtgagcaacttggg 592  Q
    ||||||||||||||||    
T  26323836 ttgtgagcaacttggg 26323821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Original strand, 1686348 - 1686541
Alignment:
Q  18 acttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttggacttgattggttttgtc 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||||| || | ||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  1686348 acttggaagcttgtgggactaccgatggtggttacatacaagtggaggtcggtgtgtagatcaaggtccaagtgaggatttggacttgattggttttgtc 1686447  T
Q  118 ttgagggattgttcaaggcaaggataaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgttga 211  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| | | |||| |   | ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1686448 ttgaggaatagttcaaggcaaggttaaggagcaaggtgattgatggttaaaatggcatcaccgcaaatttagagtcaaggaggagaatttttga 1686541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 379 - 690
Target Start/End: Original strand, 39127206 - 39127503
Alignment:
Q  379 gtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagat 477  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39127206 gtaagcttagtgaatctcatggaaatcaacggagagaacttttagggtatttacatactaaaggtttggggcctttgg-tgaggttcaaagcttcaagat 39127304  T
Q  478 gtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtctt 576  Q
     |||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || | || ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||  |   | ||||| |    
T  39127305 atgaatcttagagaactaaaataggggactctt-ggaagagagttggtgcctttttgggagagattcatgaggttgggaaacacatcaaatatgagtc-t 39127402  T
Q  577 ttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagag 676  Q
    ||||| ||||           |||| || |||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||    
T  39127403 ttgtgggcaa-----------cttgagagaccaaaagagaatacccttag-gaaatcaaaggctaagggttagttctcttttg-tggttaaattctagag 39127489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 590 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 26323385 - 26323286
Alignment:
Q  590 gggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaatt 689  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26323385 gggtgagtcttgggagaccaaaaaagaatatccttag-gaaatcaaaagctaagggttggttctcttttgagggttagattttagagttgggaaacaatt 26323287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 364 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31340577 - 31340501
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaag 440  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31340577 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatcttatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaag 31340501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 513 - 690
Target Start/End: Original strand, 20937438 - 20937613
Alignment:
Q  513 ggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaa 611  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||  |     |||||||| ||||  ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  20937438 ggaaaaggttggtgccttttgaggagagattcatgtggttgaaaaacacatcaaaagggagtcttt-gtgacaaacttgggtgattcttgggagaccaaa 20937536  T
Q  612 agagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattg 690  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  20937537 agagaagattcttag-gaaatcaaaggataaaggttggttctcttttg-ggagtagattctagagttgagaaataattg 20937613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 626
Target Start/End: Original strand, 36796064 - 36796306
Alignment:
Q  390 gaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaa----tc 484  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||    |     
T  36796064 gaatctcatggaaatcaaaggagataacttttagggaacttagaaactaaaggttgaaggtctttagatgaggttcaaagcttcaagatgtaaacctctt 36796163  T
Q  485 ttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgag 583  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||  | ||| ||| |||   ||||||||| ||||||| ||||| || | ||||| ||||| |||||| || || ||    
T  36796164 ttgaagaaccaaaagaggggactctt-tgaaaaaggtcggttgattttggggagagattcacggggtcgggagacacaagagtggagagtcattggttag 36796262  T
Q  584 caacttgggtgagtctt-gtgaaaccaaaagagaagatccttag 626  Q
    |||||||||||| ||||   ||||||||||| | ||||||||||    
T  36796263 caacttgggtgaatcttaaggaaaccaaaagtgtagatccttag 36796306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 473 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 31340503 - 31340448
Alignment:
Q  473 aagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgcc 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31340503 aagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaatggttggtgcc 31340448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 210
Target Start/End: Original strand, 4386445 - 4386505
Alignment:
Q  150 atggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgttg 210  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  4386445 atggtggttgatggttaaattgacatcatcaccaatttagagtcaaggtggagaaatgttg 4386505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 243
Target Start/End: Original strand, 34490591 - 34490630
Alignment:
Q  204 attgttgaaatgtggctcaaaaatgaaaattgagaaagtg 243  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34490591 attgttgagatgtggctcaaaaatgaaaattgagaaagtg 34490630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 628 - 686
Target Start/End: Original strand, 36796692 - 36796749
Alignment:
Q  628 gaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaaca 686  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36796692 gaaatcaaaggctaagggttgatta-cttttgagggttagattcaagagttgggaaaca 36796749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 576 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 50432898 - 50432840
Alignment:
Q  576 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatca 634  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  50432898 tttgtgagcaacttggttgaatcttgagagaccaaaaaaggagatccttagtgaaatca 50432840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 50433006 - 50432935
Alignment:
Q  442 ttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggga 515  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||   |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  50433006 ttgagggtctttgagtgagattcaaagggtcaagaggtgaatcttg--gaaccaaaagagggggctattgggga 50432935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 644 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 31340457 - 31340410
Alignment:
Q  644 ggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340457 ggttggtgcccttttaggggttagattctagagttgggaaacaattgt 31340410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 338
Target Start/End: Original strand, 29810653 - 29810691
Alignment:
Q  300 cgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacag 338  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29810653 cgtgtcacgatttgggaaaacgtgacacgattttgacag 29810691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 205
Target Start/End: Original strand, 44331085 - 44331147
Alignment:
Q  143 aaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaat 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |   |||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  44331085 aaggagattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 44331147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 338
Target Start/End: Original strand, 30709464 - 30709505
Alignment:
Q  297 aatcgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacag 338  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  30709464 aatcgtgtcacgatttggaaaaacgtgacacgattttgacag 30709505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 547
Target Start/End: Original strand, 41509960 - 41510072
Alignment:
Q  435 ctaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgg 534  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||| ||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||| ||  ||||||||||  |||||||| |    
T  41509960 ctaaaggttaagggtctttagatgagattcaaatggtcaagatgtgaatattggaaaaccaaaaaagagagct-tttaggaaagggttaatgccttttag 41510058  T
Q  535 gga-agattcatgg 547  Q
    ||| ||||||||||    
T  41510059 ggagagattcatgg 41510072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 203 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 18697 - 18212
Alignment:
Q  203 aattgttgaaatgtggctcaaaaatgaaaattgagaaagtgttggaatcgtgacacgattttcaaggccgtgaatgggtgtgctctggaattcaaatcgt 302  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  18697 aattgttgagatgtggctaaaaaatgaaa-ttgagaaagtgttggaatcgtggcacgattttcaaggttgtgaatgggtgtgttctggaagccaaatcgt 18599  T
Q  303 gacacgatatgggaaaacgtgacacgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgcta-atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcataga 401  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |  ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||    
T  18598 gacacgatttgggaaaatgtgacacgattttgacagatttgaaacacgttttaagcagtccatgacacatttgttgggtaagctgggtgaatctcatgga 18499  T
Q  402 aaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagag 501  Q
    |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18498 aaccaaaggagaaaacttatagg-ttttagatactaaaggttgcgggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagag 18400  T
Q  502 ggggctcttggggaaagggttggtgcctttt-ggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtctt 600  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  18399 ggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttgggggaagattcatgaggtt-gaaaacacatgagtggagagttatttgtgagcaacttgagtgagtctt 18301  T
Q  601 gtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18300 gtaaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaagactaagagttggttctcttttg-gggttagattatagagtt-ggaaacaattgt 18212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 272; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Original strand, 6960 - 7286
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6960 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 7059  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7060 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatg 7159  T
Q  564 agtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgaggg 663  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  7160 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtaaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 7259  T
Q  664 ttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7260 ttagattctagagct-ggaaacaattgt 7286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 327 - 691
Target Start/End: Original strand, 5043222 - 5043586
Alignment:
Q  327 cgattttgacagatctgaaacacgttttaagcgcta-atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttaggg 425  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||  |||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  5043222 cgattttgacagatctgtcacactatttaagcactctatgacccatttattaaaggagcttggtgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttaggg 5043321  T
Q  426 ttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggt 525  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5043322 ttttagatactaaagattgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgagaatcttggagaaccaaaagagagggctcttgggaaaagggttggt 5043421  T
Q  526 gccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctta 625  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5043422 gcctttt-gggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaatttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctta 5043520  T
Q  626 gtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5043521 gtggaatcaaaggctaagagttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 5043586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 366 - 691
Target Start/End: Original strand, 21593300 - 21593623
Alignment:
Q  366 acccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttca 465  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21593300 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggttagaacttttagggttttagatactaaatgttgagggtctttgggtgaggttca 21593399  T
Q  466 aaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgag 565  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21593400 aagatttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttggaaaacacatgag 21593499  T
Q  566 tgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggtt 665  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21593500 tggagagtcatttttgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa-gctaagggttggttctcttttgggggtt 21593597  T
Q  666 agattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21593598 agattctagagttgggaaacaattgt 21593623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 3809245 - 3808918
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3809245 tgacccatttgttgagcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 3809146  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagag-ggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacac 562  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  3809145 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgtgaaaagggttggttccttttggagaagattcatggggttgggaaacacat 3809046  T
Q  563 gagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagg 662  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  3809045 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaaaatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct-ttttgggg 3808947  T
Q  663 gttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3808946 gttagattctagagttgggaaacaattgt 3808918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 329 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 2973512 - 2973148
Alignment:
Q  329 attttgacagatctgaaacacgttttaagcgcta-atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggtt 427  Q
    |||||||||||||||  ||||  ||||||| ||  ||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2973512 attttgacagatctgtcacactatttaagcactttatgacccatttgttaagagaccttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt 2973413  T
Q  428 t-tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtg 526  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2973412 tgtagatactaaaggttgaaggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtg 2973313  T
Q  527 ccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag 626  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2973312 cttttttgggaagattcatggggttgggaaacacatgaatgcagagtcatttgtgaacaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag 2973213  T
Q  627 tgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2973212 tgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttagggattagattctagagttgggaaacaattgt 2973148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 367 - 691
Target Start/End: Original strand, 17762622 - 17762948
Alignment:
Q  367 cccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaa 466  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17762622 cccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaacaaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgaggatctttgggtgaagttcaa 17762721  T
Q  467 aacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga--agattcatggggttggaaaacacacga 564  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17762722 ggcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaaggtttggtgccttttgggggttagattcatggggttgggaaacacatga 17762821  T
Q  565 gtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggt 664  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17762822 gtggagagtcttttgggagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggt 17762921  T
Q  665 tagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  17762922 tagattctagagttgggaaacaattgt 17762948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 363 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 26830661 - 26830333
Alignment:
Q  363 atgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||    
T  26830661 atgatccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 26830562  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacac 562  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |     
T  26830561 ttaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggagtctcttgggaaaaaggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagat 26830462  T
Q  563 gagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagg 662  Q
    ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  26830461 gagcgcagagtcatttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggg 26830362  T
Q  663 gttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26830361 gttagattctagagttggaaaacaattgt 26830333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 430 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 603550 - 603289
Alignment:
Q  430 agatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgcct 529  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  603550 agatagtaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgaggaaagggttggtgcct 603451  T
Q  530 tttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtga 629  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  603450 tttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagtgtcctttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtga 603351  T
Q  630 aatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  603350 aatcaaaggctaatggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 603289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 380 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 22425346 - 22425037
Alignment:
Q  380 taagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgt 479  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  22425346 taagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttt-agggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgtggttcagagcttcaagatgt 22425248  T
Q  480 gaatcttggagaaccaaaagaggggg--ctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttt 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| ||    
T  22425247 gaatcttggagaaccaaaagaggggggcctcttgggataagggttggtgcattttggggaagattcatggggttgtgaaacacatgggtgaagagtcatt 22425148  T
Q  578 tgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagt 677  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22425147 taagagcaacttcggttagtcttgtgaaaccaaaagagaatatccttag-gaaatcaaa-gctaagggttggttctcttttg-gggttagattatagagt 22425051  T
Q  678 tgggaaacaattgt 691  Q
    ||||||||||||||    
T  22425050 tgggaaacaattgt 22425037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 439 - 643
Target Start/End: Original strand, 17757789 - 17757995
Alignment:
Q  439 aggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga- 537  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||      
T  17757789 aggttgatggtctttgggtgagattcaaagcttgaagatgtgaatgttggagaaccaaaatagggggctcttgtgaaaagggttggtgcattttgggggt 17757888  T
Q  538 -agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaa 636  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17757889 tagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagagaagatcatcagtgaaatcaaa 17757988  T
Q  637 tgctaag 643  Q
     ||||||    
T  17757989 ggctaag 17757995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 399 - 596
Target Start/End: Original strand, 26800437 - 26800634
Alignment:
Q  399 agaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaa 497  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  26800437 agaaaccaaaggagaaaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtggatcatggataaccaaa 26800536  T
Q  498 agagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgag 596  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26800537 agagggggctcttgggaaaaaggttggtgccttttggggaagattcat-gggatgggaaacacatgagtggagagtctattgagagcaacttgggtgag 26800634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 17759114 - 17759321
Alignment:
Q  4 atgcaaggaataagacttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttggact 103  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  17759114 atgcaaggaataagatatggaagcttgtggaactaccaagggaggttggatgcaagtggaggtcggtgtgtggatcaaggttcaagcagggctttagact 17759213  T
Q  104 tgattggttttgtcttgagggattgttcaaggcaaggataaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggaga 203  Q
    |||||| |||||||||  || || ||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  17759214 tgattgattttgtcttagggaatagttcaaggcaatgttaaggagcaaggtggttgatggttaaattggcatcaacacaaatttagagtcaaggtggaga 17759313  T
Q  204 attgttga 211  Q
    ||||||||    
T  17759314 attgttga 17759321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 379 - 624
Target Start/End: Original strand, 25072832 - 25073076
Alignment:
Q  379 gtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagat 477  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25072832 gtaagcttgatgaatctcatggaaatcaaagaagtgaacttttagggtatttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagat 25072931  T
Q  478 gtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtctt 576  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| || |||||| | |||||| ||||| | |||||||| ||||| | |||||||  |  | ||||||||    
T  25072932 gtgaatctttgagaacccaaag-gggggctctt-ggaaaagggattgtgcctcttgggaagagattcatagggtttggaaacacatcaaaggagagtctt 25073029  T
Q  577 t-tgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctt 624  Q
    | |||||  ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25073030 tatgtga--aacttggataggtcttgggaaaccaaaagagaagatcctt 25073076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 570 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 5741120 - 5741001
Alignment:
Q  570 gagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagat 669  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||| | |||||||||    
T  5741120 gagtcttttgtgagcaatttgggtgaatcttgagaaacaaaaagtgaagatccttagt-aaatcaaaggctaagggttggttacttttggggggttagat 5741022  T
Q  670 tctagagttgggaaacaattg 690  Q
    |||| |||||| |||||||||    
T  5741021 tctaaagttggaaaacaattg 5741001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 628 - 690
Target Start/End: Original strand, 25073463 - 25073525
Alignment:
Q  628 gaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattg 690  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25073463 gaaattaaaggctaagggttgattctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattg 25073525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 576 - 689
Target Start/End: Original strand, 11660452 - 11660562
Alignment:
Q  576 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctaga 675  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||| | | || ||| ||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  11660452 tttgtgagcaatttggatgaatcttgggagaccaaaagaggataaccatag-gaattcaaaggctaagggttggttca-ttttg-gggttagattctaga 11660548  T
Q  676 gttgggaaacaatt 689  Q
    ||| ||||||||||    
T  11660549 gttcggaaacaatt 11660562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 28038314 - 28038258
Alignment:
Q  147 agaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggaga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  28038314 agaatggtggttgatggttaaattggtatcatcactaatttaaagtcaaggtggaga 28038258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5406809 - 5406749
Alignment:
Q  145 ggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaat 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  5406809 ggagattggtggttgatggttaaagtggcatcatcatcaatttcaagtcaaggtggagaat 5406749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5411134 - 5411074
Alignment:
Q  145 ggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaat 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  5411134 ggagattggtggttgatggttaaagtggcatcatcatcaatttcaagtcaaggtggagaat 5411074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 210
Target Start/End: Original strand, 30517571 - 30517629
Alignment:
Q  152 ggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaaggtggagaattgttg 210  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  30517571 ggtggttaatggttaaattggcatcagcatcaatttagagtcaatatggagaattgttg 30517629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 364 - 686
Target Start/End: Original strand, 11190 - 11512
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 463  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11190 tgacccatttgttgggtaagcttggtaaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 11289  T
Q  464 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacg 563  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  11290 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttggggaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatg 11389  T
Q  564 agtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgaggg 663  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||    
T  11390 agtggagagtcatttctgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcattagtaaaatcaaaggctaaaggttgtttctctttttgggg 11489  T
Q  664 ttagattctagagttgggaaaca 686  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11490 ttagattctagagttgggaaaca 11512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 384 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 80799 - 80492
Alignment:
Q  384 cttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaat 483  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  80799 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactagaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatttgaat 80700  T
Q  484 cttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacacgagtgaagagtcttttgtgag 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  80699 cttggagaaccaaaagagggggctcttatgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagcggagagtcttttgtgag 80600  T
Q  584 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaa 683  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  80599 caacttgggtgagtcttgggaaactaaaagagtagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctattttgggggttagattctagagttaggaa 80500  T
Q  684 acaattgt 691  Q
    ||||||||    
T  80499 acaattgt 80492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 81294 - 81083
Alignment:
Q  1 tggatgcaaggaataagacttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtggaggtcggagtatggatcaaggttcaagcggagctttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  81294 tggatgcaaggaataagacttggaagcttgtggaactaccgagggtggctggatgcaagtggaggtcggtgtttggatcaaggttcaagcggggctttgg 81195  T
Q  101 acttgattggttttgtcttgagggattgttcaaggcaaggataaggagaatggtggttgatggttaaattagtatcatcatcattttagagtcaag--gt 198  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |||| ||  | ||||||||||||  ||    
T  81194 acttgattgg-tttgtcttggggaattgttcaaggcaaggttaaggagcaaggtggttgatggttagattggcatcaccacaaatttagagtcaaggtgt 81096  T
Q  199 ggagaattgttga 211  Q
    |||||||||||||    
T  81095 ggagaattgttga 81083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 133; Significance: 9e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 364 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 490981 - 490661
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  490981 tgacccatttgttgagcaagcttggtgaatctcatgagaaccaaaggagggagcttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 490882  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacaca 561  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||    
T  490881 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctctt-tggagagggttggtgcctttaggtgagagattcatgggattgggaaacaca 490783  T
Q  562 cgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgag 661  Q
      |  | ||||| |||| ||||||||||||| |||||||  || |||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||  |    
T  490782 tcaaaggagagt-ttttatgagcaacttgggcgagtcttacgagaccaaaagagtatatcattag-gaaatcaaaagctacggattggttc-cttttagg 490686  T
Q  662 ggttagattctagagttgggaaaca 686  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  490685 ggttagaatctagagttgggaaaca 490661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 364 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 1942 - 1609
Alignment:
Q  364 tgacccatttattaggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 462  Q
    ||||| |||| ||| |||| |||||||||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  1942 tgacctatttgttaagtaaacttggtgaattttatggaaaccaaatgagagaacttttagggtatttagatactaaaggttgaaggtctttgggtgagct 1843  T
Q  463 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacaca 561  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||| |||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||    
T  1842 ccaaagcttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaagaggggactctt-gggcgaggcttggtgtcttttgtggagagattcatgtagttgagaaacaca 1744  T
Q  562 cgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgc----------taagggttggtt 651  Q
      |    ||||||  |||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||          |||| |||||||    
T  1743 tcatatgagagtc-attgtgagcaacttgggcgagtcttgggagatcaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaagcttataacttataagtgttggtt 1646  T
Q  652 ctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaatt 689  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1645 ctcttttg-gggttagattctagagttgggaaacaatt 1609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11645 - 11608
Alignment:
Q  295 caaatcgtgacacgatatgggaaaacgtgacacgattt 332  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11645 caaatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgattt 11608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 61
Target Start/End: Original strand, 17021 - 17066
Alignment:
Q  16 agacttggaagcttgtggaactaccgagggtggttggatgcaagtg 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  17021 agacttggaagcttgtggaactactaaggatagttggatgcaagtg 17066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University