View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10948_low_4 (Length: 315)

Name: NF10948_low_4
Description: NF10948
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10948_low_4
NF10948_low_4
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (1-315)||(16103804-16104118)
chr3 (1-315)||(32307701-32308006)
chr3 (1-285)||(16097352-16097637)
chr3 (1-315)||(9512944-9513246)
chr3 (1-315)||(49667867-49668173)
chr3 (1-312)||(13210114-13210424)
chr3 (1-315)||(9520919-9521221)
chr3 (14-315)||(1644466-1644757)
chr3 (1-285)||(15470948-15471232)
chr3 (85-274)||(49389453-49389642)
chr3 (1-207)||(12174152-12174356)
chr3 (141-315)||(12934094-12934268)
chr3 (7-285)||(14234517-14234798)
chr3 (1-312)||(37250953-37251265)
chr3 (83-285)||(1465223-1465424)
chr3 (1-158)||(52523665-52523826)
chr3 (4-162)||(24340657-24340817)
chr3 (1-252)||(22110196-22110449)
chr3 (4-162)||(23274714-23274874)
chr3 (1-162)||(37642199-37642362)
chr3 (225-315)||(14665853-14665943)
chr3 (225-315)||(14735366-14735456)
chr3 (134-312)||(43927291-43927468)
chr3 (1-157)||(27165271-27165429)
chr3 (1-137)||(43925982-43926121)
chr3 (211-285)||(12171918-12171992)
chr3 (225-315)||(12340000-12340090)
chr3 (225-315)||(14669008-14669098)
chr3 (39-158)||(2051137-2051260)
chr3 (1-83)||(53301566-53301648)
chr3 (1-102)||(12399233-12399335)
chr3 (1-154)||(22147467-22147622)
chr3 (1-102)||(42386434-42386536)
chr3 (1-98)||(606324-606423)
chr3 (1-163)||(43550457-43550620)
chr3 (227-315)||(12852147-12852235)
chr3 (225-300)||(4588586-4588661)
chr3 (1-157)||(14972878-14973036)
chr3 (1-95)||(18438558-18438653)
chr3 (4-75)||(11424783-11424853)
chr3 (1-102)||(24153204-24153305)
chr3 (1-102)||(36166619-36166719)
chr3 (1-92)||(12377945-12378039)
chr3 (1-75)||(14572613-14572686)
chr3 (1-102)||(21618470-21618570)
chr3 (1-54)||(20698480-20698532)
chr3 (1-42)||(28194714-28194755)
chr3 (1-157)||(9707592-9707748)
chr3 (1-157)||(12567581-12567737)
chr3 (1-102)||(13442298-13442400)
chr3 (1-157)||(13544046-13544202)
chr3 (1-102)||(23083356-23083458)
chr3 (1-98)||(25476384-25476482)
chr3 (1-102)||(26686911-26687013)
chr3 (1-137)||(29172587-29172724)
chr3 (1-147)||(17672647-17672794)
chr3 (1-162)||(53070633-53070794)
chr3 (1-102)||(17487880-17487982)
chr3 (1-102)||(17499362-17499464)
chr3 (1-98)||(40213720-40213817)
chr3 (1-102)||(43840956-43841058)
chr3 (1-102)||(14576828-14576929)
chr3 (88-162)||(19776033-19776107)
chr3 (88-162)||(37439403-37439477)
chr3 (225-282)||(14501371-14501428)
chr3 (225-270)||(45797415-45797460)
chr3 (117-157)||(8499657-8499697)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (1-312)||(10327-10638)
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (1-315)||(12774031-12774336)
chr4 (1-285)||(8846380-8846681)
chr4 (1-315)||(15551841-15552151)
chr4 (15-289)||(16596686-16596957)
chr4 (1-252)||(13695-13948)
chr4 (1-285)||(39706101-39706385)
chr4 (1-268)||(43198384-43198652)
chr4 (1-251)||(12288055-12288307)
chr4 (1-312)||(46640242-46640553)
chr4 (1-312)||(53081936-53082249)
chr4 (83-285)||(15190423-15190624)
chr4 (83-285)||(15099456-15099657)
chr4 (1-162)||(52243128-52243293)
chr4 (225-315)||(22633996-22634086)
chr4 (225-315)||(24028989-24029079)
chr4 (225-314)||(20157074-20157163)
chr4 (236-315)||(3332144-3332223)
chr4 (225-315)||(13812592-13812682)
chr4 (1-98)||(16377522-16377618)
chr4 (1-154)||(44928866-44929021)
chr4 (1-102)||(16270231-16270332)
chr4 (1-46)||(6190486-6190531)
chr4 (1-163)||(18215253-18215415)
chr4 (3-102)||(23374354-23374454)
chr4 (1-49)||(17046511-17046559)
chr4 (1-102)||(7798798-7798900)
chr4 (1-102)||(14280337-14280438)
chr4 (1-157)||(44615309-44615465)
chr4 (1-102)||(54798749-54798851)
chr4 (1-102)||(6899915-6900016)
chr4 (1-101)||(52873363-52873464)
chr4 (1-54)||(3096317-3096369)
chr4 (1-54)||(7088901-7088953)
chr4 (1-54)||(12902781-12902833)
chr4 (1-98)||(19618216-19618313)
chr4 (88-162)||(630710-630784)
chr4 (1-102)||(8574864-8574964)
chr4 (5-102)||(16239965-16240062)
chr4 (59-162)||(15464865-15464970)
chr4 (225-282)||(32851623-32851680)
chr4 (4-98)||(14038675-14038770)
chr4 (1-157)||(15355309-15355466)
chr4 (1-157)||(3515028-3515184)
chr4 (1-102)||(7893727-7893829)
chr4 (88-162)||(3331996-3332070)
chr4 (88-162)||(14953897-14953971)
chr4 (88-162)||(25690172-25690246)
chr4 (2-102)||(44052854-44052955)
chr4 (88-148)||(13812759-13812819)
chr4 (3-75)||(14053325-14053396)
[»] chr6 (57 HSPs)
chr6 (1-285)||(19652219-19652502)
chr6 (1-315)||(28496257-28496568)
chr6 (1-315)||(29808668-29808979)
chr6 (4-315)||(1561330-1561640)
chr6 (1-273)||(23019430-23019703)
chr6 (1-252)||(20109162-20109417)
chr6 (1-268)||(19668395-19668664)
chr6 (36-312)||(22080524-22080800)
chr6 (1-252)||(9098370-9098611)
chr6 (1-312)||(35008172-35008484)
chr6 (1-78)||(27333238-27333315)
chr6 (1-78)||(27393978-27394055)
chr6 (1-84)||(4185835-4185918)
chr6 (1-312)||(23076754-23077066)
chr6 (168-284)||(27333099-27333214)
chr6 (168-284)||(27393839-27393954)
chr6 (1-84)||(4186391-4186474)
chr6 (1-162)||(8227445-8227608)
chr6 (1-162)||(25644344-25644508)
chr6 (225-315)||(21939631-21939721)
chr6 (225-305)||(27325227-27325307)
chr6 (58-251)||(18204159-18204354)
chr6 (58-282)||(18199231-18199456)
chr6 (32-312)||(4668000-4668277)
chr6 (32-312)||(4674847-4675124)
chr6 (1-102)||(16496268-16496370)
chr6 (58-251)||(18177517-18177712)
chr6 (1-98)||(29060564-29060662)
chr6 (29-164)||(18706356-18706493)
chr6 (1-163)||(22782248-22782410)
chr6 (1-98)||(19303540-19303637)
chr6 (1-83)||(20076724-20076805)
chr6 (176-312)||(4185610-4185745)
chr6 (4-84)||(31155411-31155491)
chr6 (1-49)||(16920679-16920727)
chr6 (1-45)||(22831527-22831571)
chr6 (1-98)||(18409826-18409924)
chr6 (58-165)||(18696569-18696676)
chr6 (1-157)||(30676695-30676851)
chr6 (224-312)||(4189203-4189290)
chr6 (4-157)||(1595573-1595726)
chr6 (176-315)||(31155182-31155320)
chr6 (1-49)||(35245610-35245658)
chr6 (1-102)||(17287791-17287893)
chr6 (1-98)||(25629354-25629452)
chr6 (3-102)||(20360955-20361055)
chr6 (1-75)||(33443071-33443146)
chr6 (1-40)||(11185529-11185568)
chr6 (1-83)||(25656650-25656731)
chr6 (1-147)||(16448520-16448668)
chr6 (88-162)||(22949410-22949484)
chr6 (88-162)||(22953366-22953440)
chr6 (88-162)||(23871854-23871928)
chr6 (88-162)||(23875810-23875884)
chr6 (88-162)||(27325370-27325444)
chr6 (5-54)||(20638328-20638376)
chr6 (118-190)||(28103805-28103877)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (1-315)||(129929-130244)
scaffold0010 (1-162)||(60649-60813)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (1-315)||(33681031-33681346)
chr1 (1-315)||(21754069-21754373)
chr1 (1-285)||(22237651-22237937)
chr1 (1-285)||(52927795-52928067)
chr1 (1-315)||(20918628-20918939)
chr1 (1-285)||(22921681-22921966)
chr1 (1-285)||(20248303-20248584)
chr1 (1-312)||(21861355-21861667)
chr1 (1-312)||(21896044-21896353)
chr1 (1-310)||(16368074-16368383)
chr1 (118-312)||(12271696-12271882)
chr1 (84-312)||(20636957-20637184)
chr1 (83-285)||(49261447-49261648)
chr1 (1-312)||(50686635-50686948)
chr1 (83-285)||(35981500-35981701)
chr1 (1-157)||(14295495-14295648)
chr1 (1-162)||(35261015-35261175)
chr1 (1-312)||(50613902-50614214)
chr1 (1-312)||(50621730-50622042)
chr1 (1-291)||(41049842-41050133)
chr1 (1-164)||(16758673-16758839)
chr1 (30-163)||(22130844-22130975)
chr1 (3-84)||(21161742-21161822)
chr1 (1-154)||(16093826-16093982)
chr1 (1-147)||(45574836-45574984)
chr1 (45-157)||(51130632-51130741)
chr1 (1-162)||(433033-433193)
chr1 (1-98)||(50210212-50210310)
chr1 (3-53)||(38801433-38801483)
chr1 (5-145)||(26064966-26065108)
chr1 (1-95)||(34509804-34509899)
chr1 (1-157)||(23593719-23593876)
chr1 (1-48)||(20847205-20847251)
chr1 (1-102)||(21026704-21026806)
chr1 (1-98)||(21840788-21840885)
chr1 (1-102)||(27250724-27250826)
chr1 (1-46)||(20454606-20454650)
chr1 (1-157)||(16361938-16362095)
chr1 (5-102)||(22532297-22532395)
chr1 (88-162)||(1924896-1924970)
chr1 (88-162)||(20923910-20923984)
chr1 (1-39)||(22123171-22123209)
chr1 (215-312)||(28194235-28194332)
chr1 (125-162)||(21477666-21477703)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (1-285)||(21565566-21565851)
chr5 (1-285)||(22959347-22959629)
chr5 (1-315)||(19660621-19660932)
chr5 (1-285)||(19668922-19669206)
chr5 (1-285)||(21329309-21329594)
chr5 (1-285)||(26011848-26012132)
chr5 (1-312)||(20026726-20027038)
chr5 (1-281)||(21501971-21502253)
chr5 (1-252)||(22178064-22178318)
chr5 (1-162)||(22144073-22144236)
chr5 (83-285)||(21741357-21741546)
chr5 (225-315)||(22119976-22120066)
chr5 (1-162)||(40725877-40726040)
chr5 (225-315)||(24767120-24767210)
chr5 (1-78)||(36314601-36314678)
chr5 (30-164)||(29448055-29448192)
chr5 (1-102)||(21729059-21729161)
chr5 (1-102)||(21808384-21808486)
chr5 (1-157)||(1096491-1096649)
chr5 (1-102)||(22412208-22412309)
chr5 (1-102)||(24493593-24493694)
chr5 (241-312)||(5888962-5889033)
chr5 (180-312)||(25743924-25744055)
chr5 (1-83)||(21997549-21997631)
chr5 (1-102)||(22075043-22075145)
chr5 (1-102)||(13025335-13025436)
chr5 (1-102)||(13095519-13095620)
chr5 (1-54)||(8286888-8286940)
chr5 (1-100)||(25431418-25431518)
chr5 (4-49)||(37723930-37723975)
chr5 (8-98)||(9077983-9078074)
chr5 (1-95)||(24529244-24529339)
chr5 (1-102)||(23390491-23390593)
chr5 (1-102)||(25421556-25421658)
chr5 (1-162)||(20901988-20902150)
chr5 (88-162)||(21871507-21871581)
chr5 (88-162)||(21875787-21875861)
chr5 (197-252)||(27988774-27988829)
chr5 (1-48)||(21293020-21293066)
chr5 (118-157)||(36314690-36314728)
chr5 (88-162)||(10753629-10753703)
chr5 (1-147)||(18319027-18319175)
chr5 (88-162)||(22120131-22120205)
chr5 (1-47)||(26732884-26732929)
[»] chr8 (53 HSPs)
chr8 (1-285)||(26355512-26355795)
chr8 (1-315)||(5866060-5866371)
chr8 (1-312)||(21491019-21491327)
chr8 (1-315)||(17140940-17141251)
chr8 (1-285)||(38855064-38855348)
chr8 (1-315)||(21249408-21249719)
chr8 (1-285)||(23760654-23760941)
chr8 (1-315)||(21255246-21255557)
chr8 (1-284)||(6520392-6520674)
chr8 (1-286)||(21673728-21674013)
chr8 (1-285)||(21285621-21285905)
chr8 (1-252)||(20498586-20498839)
chr8 (1-312)||(37116371-37116683)
chr8 (1-251)||(983248-983503)
chr8 (1-312)||(17266778-17267091)
chr8 (1-312)||(24353044-24353359)
chr8 (58-312)||(22364744-22364997)
chr8 (4-162)||(13508019-13508179)
chr8 (4-162)||(13597551-13597711)
chr8 (2-164)||(17439438-17439603)
chr8 (4-150)||(17612056-17612204)
chr8 (1-102)||(22626760-22626861)
chr8 (1-102)||(16092337-16092439)
chr8 (1-157)||(28648983-28649141)
chr8 (1-102)||(22875089-22875190)
chr8 (1-102)||(21918995-21919097)
chr8 (1-75)||(16199668-16199741)
chr8 (1-75)||(31971281-31971354)
chr8 (1-49)||(19154936-19154984)
chr8 (1-49)||(21396029-21396077)
chr8 (1-49)||(21790522-21790570)
chr8 (1-102)||(7372802-7372904)
chr8 (1-157)||(14409429-14409585)
chr8 (88-162)||(21383922-21383996)
chr8 (1-54)||(18818454-18818506)
chr8 (1-54)||(18879276-18879328)
chr8 (1-54)||(23406403-23406455)
chr8 (1-49)||(21389499-21389547)
chr8 (1-49)||(21778825-21778873)
chr8 (1-83)||(6759282-6759364)
chr8 (1-157)||(16413301-16413457)
chr8 (1-102)||(20536232-20536334)
chr8 (1-102)||(21923923-21924025)
chr8 (1-48)||(45131047-45131093)
chr8 (1-102)||(26219738-26219838)
chr8 (264-305)||(19801221-19801261)
chr8 (58-114)||(40492834-40492891)
chr8 (88-162)||(18862412-18862486)
chr8 (88-162)||(21387342-21387416)
chr8 (88-162)||(21411215-21411289)
chr8 (88-162)||(21805707-21805781)
chr8 (88-162)||(21827781-21827855)
chr8 (59-157)||(26223997-26224096)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (1-285)||(160708-160992)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-285)||(45604-45889)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (1-285)||(6836-7118)
scaffold0556 (59-311)||(8097-8349)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (1-315)||(153-467)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (1-315)||(22133999-22134303)
chr2 (1-312)||(28406000-28406313)
chr2 (7-254)||(25175880-25176128)
chr2 (2-315)||(23071746-23072045)
chr2 (1-312)||(23791297-23791610)
chr2 (7-273)||(7556-7824)
chr2 (62-312)||(22459347-22459598)
chr2 (1-285)||(23207301-23207586)
chr2 (1-251)||(18786748-18787000)
chr2 (4-142)||(7679612-7679750)
chr2 (1-162)||(23708553-23708716)
chr2 (1-268)||(25108911-25109181)
chr2 (4-158)||(19671857-19672011)
chr2 (1-162)||(20520127-20520290)
chr2 (1-162)||(22413070-22413235)
chr2 (1-157)||(22105433-22105590)
chr2 (1-102)||(298809-298912)
chr2 (1-164)||(24697538-24697704)
chr2 (1-152)||(23004772-23004926)
chr2 (1-102)||(23060537-23060639)
chr2 (1-75)||(38138-38211)
chr2 (1-102)||(23660047-23660148)
chr2 (1-49)||(20309132-20309180)
chr2 (1-102)||(23076466-23076568)
chr2 (1-54)||(23103440-23103492)
chr2 (1-54)||(23285889-23285941)
chr2 (1-46)||(32451981-32452026)
chr2 (1-102)||(22337139-22337241)
chr2 (1-102)||(23654381-23654483)
chr2 (1-47)||(22731286-22731331)
chr2 (1-48)||(23287387-23287433)
chr2 (1-157)||(32214906-32215062)
chr2 (88-162)||(1283692-1283766)
chr2 (1-47)||(26392406-26392451)
chr2 (88-162)||(30344758-30344832)
chr2 (1-54)||(8946681-8946733)
chr2 (1-41)||(23040247-23040286)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-309)||(12790-13099)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-315)||(132682-132990)
scaffold0028 (1-294)||(62222-62512)
scaffold0028 (1-157)||(134232-134388)
scaffold0028 (1-157)||(136701-136857)
scaffold0028 (1-157)||(139170-139326)
scaffold0028 (1-157)||(144108-144264)
scaffold0028 (1-157)||(141639-141795)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (1-312)||(100398-100710)
scaffold0023 (4-285)||(39986-40268)
scaffold0023 (160-315)||(101578-101732)
scaffold0023 (1-54)||(101523-101576)
scaffold0023 (1-50)||(119899-119948)
scaffold0023 (1-157)||(17425-17581)
[»] chr7 (51 HSPs)
chr7 (4-315)||(15754671-15754981)
chr7 (1-315)||(28505084-28505395)
chr7 (1-315)||(11995813-11996124)
chr7 (1-315)||(34200810-34201121)
chr7 (1-285)||(67769-68053)
chr7 (1-312)||(16219503-16219814)
chr7 (1-312)||(810916-811228)
chr7 (1-285)||(18005670-18005954)
chr7 (1-285)||(47831831-47832116)
chr7 (1-312)||(16056352-16056662)
chr7 (1-285)||(44014202-44014481)
chr7 (62-312)||(15116565-15116815)
chr7 (8-285)||(22072944-22073223)
chr7 (62-312)||(15113028-15113278)
chr7 (1-312)||(20219976-20220285)
chr7 (1-268)||(12901347-12901620)
chr7 (1-157)||(16495426-16495579)
chr7 (1-162)||(2280053-2280216)
chr7 (83-285)||(9389509-9389710)
chr7 (4-158)||(12255729-12255887)
chr7 (168-285)||(16324197-16324313)
chr7 (225-315)||(9751333-9751423)
chr7 (1-162)||(1867929-1868092)
chr7 (1-162)||(19486678-19486841)
chr7 (1-162)||(15008433-15008596)
chr7 (225-315)||(39267429-39267519)
chr7 (1-163)||(13647349-13647512)
chr7 (1-163)||(14044770-14044935)
chr7 (1-163)||(14354800-14354965)
chr7 (225-315)||(2832088-2832178)
chr7 (225-305)||(2529846-2529926)
chr7 (4-162)||(10063757-10063912)
chr7 (247-315)||(18302448-18302516)
chr7 (1-102)||(38227505-38227606)
chr7 (1-102)||(18456408-18456509)
chr7 (1-98)||(3564363-3564461)
chr7 (1-162)||(17061895-17062056)
chr7 (1-157)||(18430733-18430889)
chr7 (1-102)||(26212020-26212122)
chr7 (1-98)||(48273413-48273511)
chr7 (1-54)||(12698855-12698907)
chr7 (5-75)||(14036282-14036354)
chr7 (5-75)||(14346312-14346384)
chr7 (1-54)||(16386292-16386345)
chr7 (1-102)||(9509213-9509315)
chr7 (1-48)||(40443415-40443462)
chr7 (1-47)||(27847881-27847927)
chr7 (3-49)||(48991206-48991252)
chr7 (1-162)||(44116530-44116691)
chr7 (3-54)||(10589065-10589115)
chr7 (1-98)||(24275192-24275289)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-285)||(22486-22767)
scaffold0037 (225-315)||(80115-80205)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (1-285)||(1106-1390)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (1-315)||(15685-15996)
scaffold0261 (225-282)||(18159-18216)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (1-289)||(11316-11602)
scaffold0046 (1-215)||(2021-2233)
scaffold0046 (1-95)||(28438-28533)
scaffold0046 (1-33)||(4576-4608)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (1-312)||(8490-8804)
scaffold0621 (1-285)||(6559-6843)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-285)||(32560-32843)
scaffold0034 (1-46)||(51936-51980)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-315)||(19288-19603)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (35-312)||(2003-2281)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (133-315)||(28593-28775)
scaffold0211 (1-61)||(28806-28867)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-285)||(2457-2742)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (1-315)||(32122-32420)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-315)||(34147-34458)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (1-312)||(2589-2903)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-312)||(10551-10862)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (1-285)||(5667-5951)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-285)||(5935-6220)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-285)||(14509-14794)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (26-315)||(29063-29352)
scaffold0218 (1-310)||(7864-8171)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (7-252)||(53393-53640)
scaffold0075 (225-315)||(8077-8167)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (46-315)||(2228-2494)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-285)||(6635-6920)
scaffold0333 (1-285)||(14015-14300)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (1-285)||(847-1131)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-312)||(7844-8158)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (133-315)||(2085-2267)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-312)||(12592-12903)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (1-285)||(12963-13247)
scaffold0138 (58-311)||(18024-18277)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (1-312)||(6068-6381)
scaffold0420 (1-43)||(13793-13835)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (1-312)||(38340-38653)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (1-312)||(128756-129067)
scaffold0022 (1-303)||(78346-78648)
scaffold0022 (1-102)||(116451-116551)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (1-268)||(136196-136466)
scaffold0021 (1-268)||(144904-145174)
scaffold0021 (1-49)||(174790-174838)
scaffold0021 (1-47)||(121790-121835)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (5-252)||(97033-97282)
scaffold0006 (5-252)||(106311-106560)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (1-285)||(19697-19982)
scaffold0080 (5-102)||(39941-40038)
scaffold0080 (88-162)||(48921-48995)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (27-312)||(54-341)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-157)||(1013-1166)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (1-268)||(103467-103728)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (1-86)||(23895-23980)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (168-285)||(15644-15761)
scaffold0020 (1-83)||(15792-15874)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (4-162)||(11491-11651)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (4-162)||(38190-38350)
scaffold0124 (225-315)||(24434-24524)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (1-268)||(574-841)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (1-162)||(27683-27846)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (1-162)||(13152-13316)
scaffold0357 (1-162)||(16034-16197)
scaffold0357 (1-48)||(2685-2732)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (4-162)||(17961-18121)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (1-252)||(1642-1895)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (1-102)||(1056-1158)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (225-315)||(10158-10248)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (1-145)||(25130-25276)
scaffold0123 (58-164)||(619-725)
scaffold0123 (223-312)||(25353-25441)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-312)||(267684-267986)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-157)||(3090-3247)
[»] scaffold0347 (2 HSPs)
scaffold0347 (237-315)||(288-366)
scaffold0347 (88-148)||(32-92)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (225-315)||(9617-9707)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (5-157)||(38641-38795)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (35-162)||(225465-225593)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (225-315)||(207302-207392)
scaffold0016 (1-102)||(1875-1977)
scaffold0016 (88-150)||(207467-207529)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (225-315)||(7554-7644)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-102)||(39501-39602)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-102)||(75210-75311)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (32-312)||(9133-9410)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (1-90)||(2699-2790)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (1-98)||(3185-3283)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (225-315)||(12592-12681)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-102)||(25920-26021)
scaffold0026 (5-102)||(39886-39983)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-157)||(339889-340044)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (1-95)||(4873-4968)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (4-102)||(44702-44801)
scaffold0122 (1-98)||(26064-26162)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-49)||(51606-51654)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (1-98)||(17214-17314)
[»] scaffold0145 (2 HSPs)
scaffold0145 (1-102)||(32966-33067)
scaffold0145 (1-102)||(38785-38886)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (1-102)||(32952-33053)
scaffold0120 (1-102)||(45952-46053)
scaffold0120 (1-54)||(16137-16189)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-47)||(1313-1359)
scaffold0106 (1-49)||(7290-7338)
scaffold0106 (1-46)||(15291-15335)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-148)||(20372-20519)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (241-285)||(3195-3239)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-49)||(16306-16354)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-63)||(13521-13582)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-54)||(24348-24400)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-114)||(1976-2091)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-49)||(10472-10520)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (225-305)||(13811-13891)
scaffold0235 (1-54)||(11488-11540)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (4-102)||(13238-13337)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (1-157)||(4715-4871)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-98)||(10794-10891)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (4-75)||(15487-15557)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-48)||(32091-32137)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-102)||(51937-52039)
scaffold0011 (1-54)||(168023-168075)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-43)||(5183-5225)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-47)||(47019-47065)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-54)||(1093-1145)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (118-251)||(165-297)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (1-54)||(4736-4788)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-102)||(8528-8626)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (236-281)||(26847-26892)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-49)||(1098-1146)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-95)||(20934-21030)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-102)||(3494-3596)
scaffold0292 (1-102)||(367-468)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (1-102)||(4532-4633)
scaffold0228 (1-102)||(12114-12215)
scaffold0228 (1-102)||(22066-22167)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (1-98)||(16599-16697)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (3-48)||(206575-206619)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-54)||(6166-6221)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (59-157)||(27912-28012)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (1-53)||(4548-4599)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 16103804 - 16104118
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103804 accgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 16103903  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  16103904 atcaaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaattcatatggattagtcttactggaacaacaacagcaagataaa 16104003  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  16104004 caacttagtttctaacctctaagattaactcacatcaactcgtgcgacaaagagcgcatttaacctaaacaaggcagtctgtaacaccagtactcacgag 16104103  T
Q  301 gcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||    
T  16104104 gcgagagcctctgct 16104118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 32307701 - 32308006
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32307701 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaatt 32307800  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||        ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||    
T  32307801 atcaa-cataatccatttaatgtatatacaa--------cattataaacaacattaattcataagcatcagtcttactagaacaatgacagcaagataaa 32307891  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32307892 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattatgtaacacaagtactcgcgag 32307991  T
Q  301 gcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||    
T  32307992 gcgagagcctctgct 32308006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 16097352 - 16097637
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16097352 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatcatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaa 16097451  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  16097452 tatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagcaagataa 16097551  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16097552 acaacttagtttctaatctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacataaacaagacattttgtaac 16097637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 9512944 - 9513246
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||  |    
T  9512944 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaaca---tctcattt 9513040  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9513041 atcaa-cataatccatttaatgtatataaaa--------cattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 9513131  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  9513132 caacttagtttctaacctctaagattaactcacataaacttgtgcgacaaagatcgcatttaacataagcaaggcattctgtaacacaagtaatctcgag 9513231  T
Q  301 gcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||    
T  9513232 gcgagagcctctgct 9513246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 49668173 - 49667867
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaa-catctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  49668173 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaaacatctcatt 49668074  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
    |||||| |||||| | ||||| |||||||||         ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  49668073 tatcaa-cataatccatttaaagtatatacag--------cattatatacaacatcaactcatatgcatcagtcttactggaacaatgacagcaagataa 49667983  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49667982 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgtatttaacctaaacaaggcagtctgtaacacaagtactcgcga 49667883  T
Q  300 ggcgagagcctctgct 315  Q
    ||||||||||||||||    
T  49667882 ggcgagagcctctgct 49667867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13210424 - 13210114
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| || ||||    
T  13210424 accgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgcaa--atcaacaacttaaat 13210327  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatc-aattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||    
T  13210326 atcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattgaattcatatgcatcagccttactggaatgttaacaacaagataa 13210227  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcga 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13210226 acaacttagtttctaacctctaggatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtgctcgcga 13210127  T
Q  300 ggcgagagcctct 312  Q
    |||||||||||||    
T  13210126 ggcgagagcctct 13210114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 9520919 - 9521221
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||  |    
T  9520919 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaaca---tctcattt 9521015  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||  |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9521016 atcaa-cataatccatttaatgtatataaca--------cattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 9521106  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  9521107 caacttagtttctaacctctaagattaactcacataaacttgtgcgacaaagatcgcatttaacataagcaaggcattctgtaacacaagtaatctcgag 9521206  T
Q  301 gcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||    
T  9521207 gcgagagcctctgct 9521221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1644757 - 1644466
Alignment:
Q  14 gcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaatatcaaacataatt 113  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||     
T  1644757 gcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatgcaaatcatcattatataacaatatcgaatacaatcaacaatatctcaattatcaa-cataatc 1644660  T
Q  114 cctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttct 213  Q
    | ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1644659 catttaatgtatatacaa--------cattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaagataaacaacttagtttct 1644568  T
Q  214 aacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644567 aacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacttaaacaaggcagtttgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctg 1644468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 15470948 - 15471232
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15470948 accgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaa 15471047  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |  ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  15471048 catcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaac-ttagatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataa 15471146  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15471147 acaacttagtttctaacctccaagatcatctaacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaagcattctgtaac 15471232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 49389642 - 49389453
Alignment:
Q  85 caacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaaca 184  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49389642 caacaacatctcaactatcaaacataattcatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaaca 49389543  T
Q  185 ataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaagg 274  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  49389542 acaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaacacacatcaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacctaaacaagg 49389453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12174356 - 12174152
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  12174356 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa--aacaacaactcaaat 12174259  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  12174258 atcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattgattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagcaagctaaa 12174159  T
Q  201 caactta 207  Q
    |||||||    
T  12174158 caactta 12174152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 141 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12934268 - 12934094
Alignment:
Q  141 attataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12934268 attataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 12934169  T
Q  241 cgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12934168 cgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggaagtctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagtctctgct 12934094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 285
Target Start/End: Original strand, 14234517 - 14234798
Alignment:
Q  7 tcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatatcaa 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||    
T  14234517 tcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaa 14234616  T
Q  106 acataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg--gaacaataacaacaaggtaaacaa 203  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | | |    |||| |||||||   ||||| ||||||||| |||| ||    
T  14234617 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattaaacaattcaggcttactgaacaacaacaacaacaagataaataa 14234716  T
Q  204 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14234717 cttagtttctaacctccaagatcaactaacatcaacttgttcgacaaagatcacatttaacctaaacaaggcattctgtaac 14234798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 37251265 - 37250953
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37251265 accgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctca 37251166  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    |  |||| | ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||| ||||  ||| |    
T  37251165 ac-atcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcagacttactggaacaacaacagtaagat 37251067  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||  |||||||||      ||||||    
T  37251066 aaacaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacttttaacct-aacaaggtgttctgtaactgggcaactcgc 37250968  T
Q  298 gaggcgagagcctct 312  Q
    |||||||||||||||    
T  37250967 gaggcgagagcctct 37250953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1465424 - 1465223
Alignment:
Q  83 atcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |    | |     ||| ||||||||||    
T  1465424 atcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatgtaatgtatatacaattgtataacattatcatcaacattagaataaacaatccaggcttactggaa 1465326  T
Q  183 caataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgt 282  Q
      | | || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1465325 tgacagcatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattacttttaacctaaacaaggcattctgt 1465226  T
Q  283 aac 285  Q
    |||    
T  1465225 aac 1465223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 52523826 - 52523665
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52523826 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctca 52523727  T
Q  98 aata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaat 158  Q
    || | ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52523726 aacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaat 52523665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24340817 - 24340657
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaata- 101  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||     
T  24340817 gactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatat 24340718  T
Q  102 tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24340717 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 24340657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22110449 - 22110196
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  22110449 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagcatctca 22110350  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    |  |||| | | ||||| | |||||  |||||| |||||| ||||||| |||||| |||| |||||    |||| ||||||| ||||| ||||  ||| |    
T  22110349 ac-atcatatagaattcatgtaatgcgtatacatttatatcacattattaacaacttcaaatcatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagat 22110251  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 252  Q
    || ||||||||||||| |||   | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22110250 aagcaacttagtttcttaccctcatgatcaactcacatcaattcgtgcgacaaag 22110196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Original strand, 23274714 - 23274874
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaata- 101  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||     
T  23274714 gactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatat 23274813  T
Q  102 tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    ||| | |||||||   ||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  23274814 tcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaaatcat 23274874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37642362 - 37642199
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||    
T  37642362 accgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaa 37642263  T
Q  100 t-atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    | |||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37642262 taatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 37642199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Original strand, 14665853 - 14665943
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14665853 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgct 14665943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Original strand, 14735366 - 14735456
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14735366 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgct 14735456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 312
Target Start/End: Original strand, 43927291 - 43927468
Alignment:
Q  134 atataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcac 233  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||    
T  43927291 atatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccatgatcaactcac 43927390  T
Q  234 atcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctct 312  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43927391 atcaactcgtgcgacaaaggtcacatttatcct-aacaaggtattctgtctcacaagggctcgcgaggcgagagcctct 43927468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 27165271 - 27165429
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  27165271 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaacaacatgatataccaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaa 27165370  T
Q  100 ta-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
    || ||| | ||||||    || ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27165371 tattcatatataatttaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 27165429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 43925982 - 43926121
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43925982 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctca 43926081  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatat 137  Q
    || |||| | | ||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  43926082 aacatcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatat 43926121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12171992 - 12171918
Alignment:
Q  211 tctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171992 tctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaagaatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 12171918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Original strand, 12340000 - 12340090
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12340000 tcaactctcaacaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaaacaaggcattatgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgct 12340090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Original strand, 14669008 - 14669098
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14669008 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgaatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggtgagagcctctgct 14669098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051137
Alignment:
Q  39 ataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatat-caaacataattcctttaatgtatatacaatta 134  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || || | |||||||   ||||| |||||||||||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaatta 2051161  T
Q  135 tataacattataaacaacatcaat 158  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  2051160 tatcacattataaacaacatcaat 2051137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 53301648 - 53301566
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 83  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  53301648 accgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaa 53301566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 12399233 - 12399335
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  12399233 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaattcaacaacatcttaa 12399331  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  12399332 atat 12399335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 22147622 - 22147467
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||   ||  | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||    
T  22147622 accgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaa 22147523  T
Q  100 ta-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 154  Q
    || ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22147522 taatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 22147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 42386434 - 42386536
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  42386434 accgactcatgcagtttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 42386532  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  42386533 atat 42386536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 606423 - 606324
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |   ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  606423 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcacataaatcagttcatgatataacaatatc-aatgcaattcaacaacatctca 606325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 43550620 - 43550457
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  43550620 accgactcatgcagcttagttaaataa-tgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 43550522  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata 163  Q
     || ||| | |||||||   |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  43550521 ttattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 43550457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12852235 - 12852147
Alignment:
Q  227 aactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||| | |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12852235 aactcataacaactcgtactacaaggatcgcatttaacctaaacatggcattctgtaatacaagtgctcgcgaggcaagagcctctgct 12852147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 225 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4588661 - 4588586
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  4588661 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagctcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgag 4588586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 14972878 - 14973036
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  14972878 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcat 14972976  T
Q  99 atat-caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
    |||| ||  ||||||||   ||||| |||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  14972977 atatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 14973036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 18438558 - 18438653
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatct 95  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18438558 accgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 18438653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 11424853 - 11424783
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 75  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  11424853 gactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataacaatatc 11424783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 24153305 - 24153204
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  24153305 accgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggtagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaa 24153207  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  24153206 tat 24153204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 36166619 - 36166719
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  36166619 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 36166716  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  36166717 tat 36166719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 12377945 - 12378039
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaaca 92  Q
    |||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12377945 accgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaatagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 12378039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 14572613 - 14572686
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 75  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  14572613 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaacagcatgacataataatatc 14572686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 21618470 - 21618570
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21618470 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 21618567  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  21618568 tat 21618570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 20698532 - 20698480
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  20698532 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 20698480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 28194714 - 28194755
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacatag 42  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28194714 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 9707748 - 9707592
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  9707748 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatacaagtcaacaacgtctcaa 9707651  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     || ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  9707650 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 9707592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 12567581 - 12567737
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  12567581 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 12567678  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     || ||| | |||||||   ||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  12567679 ttattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 12567737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 13442298 - 13442400
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||    
T  13442298 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaa 13442396  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  13442397 atat 13442400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 13544046 - 13544202
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  13544046 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 13544143  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     || ||| | |||||||   ||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  13544144 ttattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 13544202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 23083458 - 23083356
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||    
T  23083458 accgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaa 23083360  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  23083359 atat 23083356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 25476482 - 25476384
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25476482 accgactcatgtagcttagttaaaaaac-aacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 25476384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 26686911 - 26687013
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||    
T  26686911 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaa 26687009  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  26687010 atat 26687013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 29172724 - 29172587
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  29172724 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 29172627  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatat 137  Q
     || ||| | |||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  29172626 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29172587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 17672647 - 17672794
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  17672647 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaa 17672744  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataa 147  Q
     || ||| | |||||||   ||||| ||||| |||||||| ||| |||||    
T  17672745 ttattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcacaatataa 17672794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 53070794 - 53070633
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||| || || || |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  53070794 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 53070697  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
     || ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||||    
T  53070696 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatct-aacaacatcaaatcat 53070633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 17487880 - 17487982
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||    
T  17487880 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaa 17487978  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  17487979 atat 17487982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 17499362 - 17499464
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||    
T  17499362 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaa 17499460  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  17499461 atat 17499464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 40213817 - 40213720
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgca-aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| || || |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40213817 accgactcatgtagcttagttaaataac-aacatcaacaca-gcagtatacataaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 40213720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 43840956 - 43841058
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||    
T  43840956 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaa 43841054  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  43841055 atat 43841058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 14576929 - 14576828
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  | | || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| |||    
T  14576929 accgactcattcaacttagttaaataacaa-cagcaacatagacagtataaacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaa 14576831  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  14576830 tat 14576828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Original strand, 19776033 - 19776107
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  19776033 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 19776107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37439477 - 37439403
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  37439477 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 37439403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 282
Target Start/End: Original strand, 14501371 - 14501428
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgt 282  Q
    |||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  14501371 tcaactcataacaactcgcgtgacaaagatcgcatttaacctaaaccagacattctgt 14501428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 270
Target Start/End: Original strand, 45797415 - 45797460
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaac 270  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  45797415 tcaactcataacaactcgcgcgacaaagatcgcatttaacctaaac 45797460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 157
Target Start/End: Original strand, 8499657 - 8499697
Alignment:
Q  117 ttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8499657 ttaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 8499697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10638 - 10327
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10638 accgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaa 10539  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  10538 tatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacaacaagataa 10439  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||  |  ||||||||    
T  10438 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcaacaaagatcgcatttaacct-aacaaggcagtatgtaacaggacaactcgcga 10340  T
Q  300 ggcgagagcctct 312  Q
    |||||||||||||    
T  10339 ggcgagagcctct 10327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 12774031 - 12774336
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  12774031 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatacaatcaacaacatctcaatt 12774130  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  12774131 atcaa-cataatccatttaatgtatatacaa--------cattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagcaagataaa 12774221  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12774222 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacctaaacaaggcagtctgtaacacaagtactcgcgag 12774321  T
Q  301 gcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||    
T  12774322 gcgagagcctctgct 12774336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 8846380 - 8846681
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaa------------- 87  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||                 
T  8846380 accgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgagataacaatatcgaatgctaacaatatcgaatgcaag 8846479  T
Q  88 ----caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaac 183  Q
        ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8846480 tcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaac 8846579  T
Q  184 aataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgta 283  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8846580 aacaactacaagataaacaacttagtttctaatctctaagttcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacataaacaagacattctgta 8846679  T
Q  284 ac 285  Q
    ||    
T  8846680 ac 8846681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 15551841 - 15552151
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | ||  | ||||| ||||| |    
T  15551841 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgatataataatatcgaaggtaa--atcaacaactcaatt 15551938  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||| ||    
T  15551939 atcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattgattcataagcatcagtcttactgggacattaacagcagggt-aa 15552037  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||| |||||||| | | ||||||||    
T  15552038 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcattttacctaaa-aagacattttgtaacaccaatgctcgcgag 15552136  T
Q  301 gcgagagcctctgct 315  Q
    ||| |||||||||||    
T  15552137 gcgcgagcctctgct 15552151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 289
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596957
Alignment:
Q  15 cttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaatatcaaacataattc 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  | || || ||||| |||||||| ||| ||    
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa--atcatcaactcaattatcaaacttaagtc 16596783  T
Q  115 ctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttcta 214  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16596784 atgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaatttataagcatcagtcttacttgaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttcta 16596883  T
Q  215 acctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaa 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16596884 acctctaagatcaactcacatcaactcgaacgacaaagatcacattcaacctaaa-aaggcattctgtaacacaa 16596957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13948 - 13695
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  13948 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaa 13849  T
Q  100 tat-caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
    ||| || | |||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||  ||| ||    
T  13848 tattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacataaagata 13749  T
Q  199 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13748 aacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 13695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 39706385 - 39706101
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||    
T  39706385 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatgaacatcataaa 39706286  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
     ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||   |||| ||||||  ||||| |||| |||| |||    
T  39706285 catcaa-cataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatcatataattcaggcttactaaaacaacaacagcaagataa 39706187  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39706186 acaacttaattcctaatctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaagcattctgtaac 39706101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 43198652 - 43198384
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||| ||||||    
T  43198652 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatcaatatctca 43198553  T
Q  98 aatat-caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaagg 196  Q
    ||||| || | |||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||     
T  43198552 aatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatatgcattagtcttactggaacatcaacaacaaga 43198453  T
Q  197 taaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaa 268  Q
    ||||||||||||||| | ||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  43198452 taaacaacttagttttttacctct---agcaactcacatcaactcgtgtgacaaagatcgcatttaacctaa 43198384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12288307 - 12288055
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaat-caacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  12288307 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatcaca 12288208  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    |  |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| || ||||||   |||| ||||||| ||||| |||| |||| |    
T  12288207 ac-atcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaccaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaagat 12288109  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaa 251  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12288108 aaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaacttatgcgacaaa 12288055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 46640553 - 46640242
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatg-caatcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||     
T  46640553 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataacatctc- 46640455  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    || |||| | ||||||| | ||||| ||||||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||||   ||||  |||||| ||||||||||  ||| |    
T  46640454 aacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaatcatataattcaggtttactgaaacaataacagtaagat 46640355  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgc 297  Q
    || ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||  |||||    
T  46640354 aagcaacttagtttcttacc-ccatgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtattctgtctcacaagggctcgc 46640257  T
Q  298 gaggcgagagcctct 312  Q
     ||||||||||||||    
T  46640256 aaggcgagagcctct 46640242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 53082249 - 53081936
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||    
T  53082249 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaagcaaatcaataacatctcaa 53082150  T
Q  99 atatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
    | |||| | ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||  ||| ||    
T  53082149 acatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagata 53082050  T
Q  199 aacaacttagtttc-taacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgc 297  Q
    | |||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||  ||||||  ||||||  |||||    
T  53082049 agcaacttagtttcttaccccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaatgtcacatttaacct-aacaaggtgttctgtctcacaagggctcgc 53081951  T
Q  298 gaggcgagagcctct 312  Q
    || ||||||||||||    
T  53081950 gacgcgagagcctct 53081936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 285
Target Start/End: Original strand, 15190423 - 15190624
Alignment:
Q  83 atcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |    |||     ||| ||||||||||    
T  15190423 atcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaa 15190521  T
Q  183 caataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgt 282  Q
      | |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15190522 tgacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcttttaacctaaacaaggcattctgt 15190621  T
Q  283 aac 285  Q
    |||    
T  15190622 aac 15190624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 285
Target Start/End: Original strand, 15099456 - 15099657
Alignment:
Q  83 atcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |    |||     ||| ||||||||||    
T  15099456 atcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaa 15099554  T
Q  183 caataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgt 282  Q
      | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  15099555 tgacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcatgcgacaaagatcgcttttaacctaaacaagacattctgt 15099654  T
Q  283 aac 285  Q
    |||    
T  15099655 aac 15099657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 52243293 - 52243128
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  52243293 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaacaacatctca 52243194  T
Q  98 aata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    || | ||| | ||||| |   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  52243193 aacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 52243128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22634086 - 22633996
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22634086 tcaactcataacaaatcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtgctcgcgaggcgagagcctctgct 22633996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Original strand, 24028989 - 24029079
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24028989 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgct 24029079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 225 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20157163 - 20157074
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgc 314  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20157163 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcactctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgc 20157074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 236 - 315
Target Start/End: Original strand, 3332144 - 3332223
Alignment:
Q  236 caactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3332144 caactcatgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgct 3332223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13812682 - 13812592
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13812682 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaaacaaagcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgct 13812592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16377618 - 16377522
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16377618 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 16377522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 44929021 - 44928866
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||| || ||||||| |||| ||||||||||    
T  44929021 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaatgcaagtcaataacatctcaa 44928923  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 154  Q
     || ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  44928922 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacat 44928866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 16270332 - 16270231
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||| |||    
T  16270332 accgactcatgcagcttaattaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagttaacaacatcttaaa 16270234  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  16270233 tat 16270231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 6190486 - 6190531
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcag 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6190486 accgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcag 6190531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18215415 - 18215253
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  18215415 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 18215318  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata 163  Q
     || ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  18215317 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 18215253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 23374454 - 23374354
Alignment:
Q  3 cgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  23374454 cgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttaaat 23374356  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  23374355 at 23374354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 17046511 - 17046559
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat 49  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17046511 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtat 17046559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 7798798 - 7798900
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||    
T  7798798 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcatcaacatcttaa 7798896  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  7798897 atat 7798900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 14280337 - 14280438
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14280337 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 14280434  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  14280435 atat 14280438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 44615309 - 44615465
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  44615309 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 44615406  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     || ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  44615407 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 44615465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 54798851 - 54798749
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  54798851 accgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 54798753  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  54798752 atat 54798749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 6899915 - 6900016
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||   |||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  6899915 accgactcatgcatcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacaacatagcataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaa 6900013  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  6900014 tat 6900016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 52873464 - 52873363
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||    
T  52873464 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaa 52873366  T
Q  99 ata 101  Q
    |||    
T  52873365 ata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 3096317 - 3096369
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3096317 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 3096369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 7088901 - 7088953
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  7088901 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 7088953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 12902781 - 12902833
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12902781 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 12902833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 19618313 - 19618216
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  19618313 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 19618216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 630784 - 630710
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||| | |  ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  630784 caacatctcaatcatcaaacataatgcatgcaatatatatccaattatataacattataaataacatcaaatcat 630710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 8574964 - 8574864
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  8574964 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgtaattcaacaacatctcaaa 8574867  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  8574866 tat 8574864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 16240062 - 16239965
Alignment:
Q  5 actcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatat 102  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16240062 actcatgcaacttaattaaataacaat-agcaaaataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 16239965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15464970 - 15464865
Alignment:
Q  59 catgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatca 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||| | |||||||   || || |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  15464970 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtattgcatatacaattatatcaaattttaaacgacatca 15464871  T
Q  157 attcat 162  Q
    | ||||    
T  15464870 aatcat 15464865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 282
Target Start/End: Original strand, 32851623 - 32851680
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgt 282  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  32851623 tcaactcataacaactcacgcgacaaagatcgcatttaacctaaaccaggcattctgt 32851680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Original strand, 14038675 - 14038770
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14038675 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 14038770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15355466 - 15355309
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaa-caacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||    
T  15355466 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctca 15355369  T
Q  98 aata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
    | || ||| | |||||||  |||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15355368 attattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 15355309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 3515028 - 3515184
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || || || |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  3515028 accgactcatgcagcttagttaaaaaac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 3515125  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     || ||| | |||||||   ||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  3515126 ttattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 3515184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 7893727 - 7893829
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||    
T  7893727 accgattcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaa 7893825  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  7893826 atat 7893829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Original strand, 3331996 - 3332070
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  3331996 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 3332070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14953971 - 14953897
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  14953971 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 14953897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Original strand, 25690172 - 25690246
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  25690172 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 25690246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 102
Target Start/End: Original strand, 44052854 - 44052955
Alignment:
Q  2 ccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| |||    
T  44052854 ccgactcatgcagctcagttaaataac-aacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaa 44052952  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  44052953 tat 44052955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 13812819 - 13812759
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaa 148  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  13812819 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 13812759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 14053396 - 14053325
Alignment:
Q  3 cgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 75  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  14053396 cgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa-cagcatgacataataatatc 14053325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 57)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 19652219 - 19652502
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19652219 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaac 19652318  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19652319 atcaa-cataatccatttaaagtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacagcaagataaa 19652417  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  19652418 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttatcctaaacaaggtattttgtaac 19652502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28496568 - 28496257
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||||    
T  28496568 accgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa--atcaacaactcaaat 28496471  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28496470 atcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaa 28496371  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496370 caacttagtttctaaactctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgca-ttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 28496272  T
Q  301 gcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||    
T  28496271 gcgagagcctctgct 28496257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 29808979 - 29808668
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||||    
T  29808979 accgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa--atcaacaactcaaat 29808882  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29808881 atcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaa 29808782  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808781 caacttagtttctaaactctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgca-ttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 29808683  T
Q  301 gcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||    
T  29808682 gcgagagcctctgct 29808668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Original strand, 1561330 - 1561640
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaatatc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  1561330 gactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgcaa--atcaacaactcaaatatc 1561427  T
Q  104 aaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa-ttcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaaca 202  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||    
T  1561428 aaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgcatcagtcttactggaatattaacagcaagataaaca 1561527  T
Q  203 acttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggc 302  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||    
T  1561528 acttagtttctaacctctaggatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattatgtaaaacaagtgctcccgaggc 1561627  T
Q  303 gagagcctctgct 315  Q
    |||||||| ||||    
T  1561628 gagagcctatgct 1561640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 23019430 - 23019703
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23019430 accgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 23019529  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |  | ||||   |||| ||||||| ||||| |||| |||| |||    
T  23019530 catcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacgacattagattatatagttcaggcttactgaaacaacaacagcaagataa 23019629  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaag 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23019630 acaacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgttcgacaaagatcgcatttaacctaaccaag 23019703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 20109162 - 20109417
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  20109162 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacataatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaa 20109261  T
Q  100 tat-caaacataattcctttaatgtatatacaat--tatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaagg 196  Q
    ||| || | |||||||   |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||  | | || ||||     
T  20109262 tattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattgatatacatcagtcttactagaaagacatcagcaaga 20109361  T
Q  197 taaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 252  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109362 taaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 20109417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 19668395 - 19668664
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  19668395 accgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatcaca 19668494  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    |  |||| || |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |  |||||| |||||| ||||||| ||||| |||| |||| |    
T  19668495 ac-atcatacgtaattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacactacatcatatacatcagacttactgaaacaacaacagcaagat 19668593  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaa 268  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  19668594 aaacaacttagtttcttacctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 19668664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22080800 - 22080524
Alignment:
Q  36 aacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattat 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||   |||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  22080800 aacataggcagtatgcaaaacatcatgatataacaatatcgaatgcacagaacaacatctcaaacatcgt-cataattaatataatgtatatacatttat 22080702  T
Q  136 ataacattataaacaacatcaattcatatgcatc-agtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcaca 234  Q
    |||||||||  |||| ||| |  ||||||  ||  || ||||||| ||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080701 ataacattaacaacatcattaggtcatatcaatttaggcttactgaaacaacaagagcaagataagcaacttagtttctaacctctaagatcaactcaca 22080602  T
Q  235 tcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctct 312  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||  |||||| | |||    ||||||||||||||||||||    
T  22080601 tcaactcgtgcgacaaggatcgcattattcctaaacaaggtgttctgtcagacacaagctcgcgaggcgagagcctct 22080524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 9098611 - 9098370
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgca-atcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || |     
T  9098611 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaacaacttcac- 9098513  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||            || ||||||   |||| ||||||| |||||||||  |||| |    
T  9098512 aacatcaaacataattcatgtaatgtatatataattatataacatt------------aaatcatataattcaggcttactgaaacaataactgcaagat 9098425  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 252  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098424 aaacaaattagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 9098370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 35008172 - 35008484
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcat--catgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| |||  |  ||||||| |||||| | ||  |||||| |||| || |    
T  35008172 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaaaaacaactta 35008271  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    || |||| | ||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| ||||||||||  ||| |    
T  35008272 aacatcatatataattcatgtaatgaatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaataacagtaagat 35008371  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgc 297  Q
    || ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||| ||||| ||| |||||  |||||   |||||    
T  35008372 aagcaacttagtttcttacccccatgatcaactcacatcaactcgtgcaacaaaggtcacatttatcct-aacaa-gcagtctgtctcacaacagctcgc 35008469  T
Q  298 gaggcgagagcctct 312  Q
    |||||||||||||||    
T  35008470 gaggcgagagcctct 35008484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 27333315 - 27333238
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333315 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 27333238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 27394055 - 27393978
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394055 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 27393978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 4185918 - 4185835
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaat 84  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4185918 accgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaat 4185835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 23076754 - 23077066
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcat--catgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| |||  |  ||||||| |||||| | ||  ||||||||||| || |    
T  23076754 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaacaactta 23076853  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    || |||| | ||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| ||||| ||||  ||| |    
T  23076854 aacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacagtaagat 23076953  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgc 297  Q
    || ||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||| ||| ||||| ||| |||||  ||||||  |||||    
T  23076954 aagcaaattagtttcttacccccatgatcaactcacatcaactcatgcaacaaaggtcacatttatcct-aacaa-gcagtctgtctcacaagggctcgc 23077051  T
Q  298 gaggcgagagcctct 312  Q
     ||||||||||||||    
T  23077052 aaggcgagagcctct 23077066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27333214 - 27333099
Alignment:
Q  168 tcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaaccta 267  Q
    |||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||     
T  27333214 tcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcacatttaacct- 27333116  T
Q  268 aacaaggcattctgtaa 284  Q
    ||||| |||||||||||    
T  27333115 aacaaagcattctgtaa 27333099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27393954 - 27393839
Alignment:
Q  168 tcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaaccta 267  Q
    |||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||     
T  27393954 tcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcacatttaacct- 27393856  T
Q  268 aacaaggcattctgtaa 284  Q
    ||||| |||||||||||    
T  27393855 aacaaagcattctgtaa 27393839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 4186391 - 4186474
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaat 84  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4186391 accgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaat 4186474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 8227608 - 8227445
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||    
T  8227608 accgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaa 8227509  T
Q  100 ta-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    || ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8227508 taatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 8227445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 25644344 - 25644508
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||    
T  25644344 accgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatcaacatctcaa 25644443  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    | | ||| | |||||||   |||||  ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  25644444 acattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacatcaaatcat 25644508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Original strand, 21939631 - 21939721
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21939631 tcaactcataacaactcgtgcgacaaggatcacatttaacctaaacaagacattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgct 21939721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 225 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27325307 - 27325227
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgag 305  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  27325307 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagattgtatttaacataaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgag 27325227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 251
Target Start/End: Original strand, 18204159 - 18204354
Alignment:
Q  58 tcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaaca-tctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatc 155  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||| || ||| ||| |||| | |||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  18204159 tcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatcaatcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 18204258  T
Q  156 aattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaa 251  Q
    || |||| | |||||| ||||||| ||||| |||| ||   ||| ||||||  ||||  ||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18204259 aaatcatttacatcagacttactgaaacaacaacagcagtataagcaacttcatttcctaccccaaggatcaactcacaacaactcgtgcgacaaa 18204354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18199456 - 18199231
Alignment:
Q  58 tcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaaca-tctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatc 155  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||| || ||| ||| |||| | |||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  18199456 tcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatcaatcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 18199357  T
Q  156 aattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatt 255  Q
    || |||| |  ||||| ||||||| ||||| |||| ||   ||| ||||||  ||||  ||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  18199356 aaatcatttatatcagacttactgaaacaacaacagcagtataagcaacttcatttcctaccccaaggatcaactcacaacaactcgtgcgacaaa-atc 18199258  T
Q  256 gcatttaacctaaacaaggcattctgt 282  Q
    ||||  | ||||||||||||| |||||    
T  18199257 gcatagaccctaaacaaggcagtctgt 18199231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4668277 - 4668000
Alignment:
Q  32 cagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatatca--aacataattcctttaatgtatata 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    ||||||  ||||||| || |  ||||| ||||    
T  4668277 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaacttc----atatcatcaacataaatcatgcaatgtttata 4668182  T
Q  129 caattatataacattataaacaacatcaattcat--atgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatc 226  Q
    || || | |||||| ||   |||||||| |  ||  |   || || || |||||||||  |||| || | ||  ||||||||||  |||| |||||||||    
T  4668181 catttgtttaacatcat---caacatcattggattaaacaattagactcactggaacatcaacagcatgctaggcaacttagttcttaacatctaagatc 4668085  T
Q  227 aactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagta-ctcgcgaggcgagagcctct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||    
T  4668084 aactcacaacaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacct-agcaaggcattctgtaa-atgggtagctcgcgaggcgagagcctct 4668000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4675124 - 4674847
Alignment:
Q  32 cagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatatca--aacataattcctttaatgtatata 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    ||||||  ||||||| || |  ||||| ||||    
T  4675124 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaacttc----atatcatcaacataaatcatgcaatgtttata 4675029  T
Q  129 caattatataacattataaacaacatcaattcat--atgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatc 226  Q
    || || | |||||| ||   |||||||| |  ||  |   || || || |||||||||  |||| || | ||  ||||||||||  |||| |||||||||    
T  4675028 catttgtttaacatcat---caacatcattggattaaacaattagactcactggaacatcaacagcatgctaggcaacttagttcttaacatctaagatc 4674932  T
Q  227 aactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagta-ctcgcgaggcgagagcctct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||    
T  4674931 aactcacaacaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacct-agcaaggcattctgtaa-atgggtagctcgcgaggcgagagcctct 4674847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 16496268 - 16496370
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||    
T  16496268 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaa 16496366  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  16496367 atat 16496370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18177712 - 18177517
Alignment:
Q  58 tcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaaca-tctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatc 155  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||| || ||| ||| |||| | |||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  18177712 tcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatcaatcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 18177613  T
Q  156 aattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaa 251  Q
    || |||| |  ||||| ||||||| ||||| |||| ||   ||| ||||||  ||||  ||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18177612 aaatcatttatatcagacttactgaaacaacaacagcagtataagcaacttcatttcctaccccaaggatcaactcacaacaactcgtgcgacaaa 18177517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 29060564 - 29060662
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29060564 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 29060662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 164
Target Start/End: Original strand, 18706356 - 18706493
Alignment:
Q  29 aaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtata 126  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||| ||| |||| | ||||||| | ||||| |||    
T  18706356 aaacagcaacataggcaatatataaaacagttcatgatataacaatatcaaagcaaatcaataacatcttaaacatcatatataattcatgtaatgcata 18706455  T
Q  127 tacaattatataacattataaacaacatcaattcatat 164  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18706456 tacatttatatgacattattaacaacatcaaatcatat 18706493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 22782248 - 22782410
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  22782248 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 22782345  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata 163  Q
     || ||| |||||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  22782346 ttattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 22782410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 19303637 - 19303540
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19303637 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacacaggaagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 19303540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 20076724 - 20076805
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  20076724 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 20076805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4185745 - 4185610
Alignment:
Q  176 actggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggc 275  Q
    |||||||||  ||||||| | ||  ||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||    
T  4185745 actggaacatcaacaacatgctaggcaacttagttcttaacatctaagatcaactcacaacaactcgtgcggcaaggatcgcatttaacct-agcaaggc 4185647  T
Q  276 attctgtaacacaagta-ctcgcgaggcgagagcctct 312  Q
    ||||| ||| |   ||| ||||||||||||||||||||    
T  4185646 attctataa-atgggtagctcgcgaggcgagagcctct 4185610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 31155491 - 31155411
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaa-cagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaat 84  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31155491 gactcatgcaacttagttaaataacaaaacagcaac-taaacagtatgcaagtcatcgtgatataacaatatcgaatgcaat 31155411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 16920727 - 16920679
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat 49  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16920727 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtat 16920679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 22831527 - 22831571
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggca 45  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22831527 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 22831571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 18409924 - 18409826
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18409924 accgactcatgcagctcagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 18409826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 165
Target Start/End: Original strand, 18696569 - 18696676
Alignment:
Q  58 tcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||| || |||| | ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||    
T  18696569 tcatgatataacaatatcaaagcaaatcaataacatctccaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacattaa 18696668  T
Q  158 ttcatatg 165  Q
     |||||||    
T  18696669 atcatatg 18696676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 30676851 - 30676695
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  30676851 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 30676754  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     || ||| | |||||||   ||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  30676753 ttattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 30676695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 312
Target Start/End: Original strand, 4189203 - 4189290
Alignment:
Q  224 atcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagta-ctcgcgaggcgagagcctct 312  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||    
T  4189203 atcaactcacaacaactcgtgcgacaacgatcgcatttaacct-agcaaggcattctgtaa-atgggtagctcgcgaggcgagagcctct 4189290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Original strand, 1595573 - 1595726
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaata 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||    
T  1595573 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaattcaacaacgtctcaatta 1595670  T
Q  102 -tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  1595671 ttcacatataattcaagtaatggatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 1595726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31155320 - 31155182
Alignment:
Q  176 actggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggc 275  Q
    |||||||||  |||| |||| ||  ||||||||||  |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||    
T  31155320 actggaacatcaacagcaagctaggcaacttagttcttaacatctaaaatcatctcacaacaactcgtgcgacaaggaccgcatttaacct-aacaaggc 31155222  T
Q  276 attctgtaacacaagta-ctcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    ||  ||||| |   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31155221 atgttgtaa-aggggtagctcgcgaggcgagagcctctgct 31155182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 35245610 - 35245658
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat 49  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  35245610 accgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtat 35245658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 17287893 - 17287791
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||  || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||    
T  17287893 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaa 17287795  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  17287794 atat 17287791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 25629452 - 25629354
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25629452 accgactcatgcagcttagttaaattac-aacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 25629354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 20361055 - 20360955
Alignment:
Q  3 cgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||    
T  20361055 cgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaat 20360957  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  20360956 at 20360955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 33443071 - 33443146
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatc 75  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  33443071 accgactcatgcagcttagttaataaac-aacagcaacataggcagtatataaaacatctcaagatataacaatatc 33443146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 11185529 - 11185568
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacat 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11185529 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacat 11185568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 25656650 - 25656731
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  25656650 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 25656731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16448668 - 16448520
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaa-caacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||    
T  16448668 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctca 16448571  T
Q  98 aata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataa 147  Q
    | || ||| | |||||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  16448570 attattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa 16448520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Original strand, 22949410 - 22949484
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  22949410 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 22949484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Original strand, 22953366 - 22953440
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  22953366 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 22953440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Original strand, 23871854 - 23871928
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  23871854 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 23871928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Original strand, 23875810 - 23875884
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  23875810 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 23875884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27325444 - 27325370
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  |  ||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  27325444 caacatctcaatcatcaaacataattaatgcaatatatatataattatataacattataaatatcatcaaatcat 27325370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 20638376 - 20638328
Alignment:
Q  5 actcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  20638376 actcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaa 20638328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28103877 - 28103805
Alignment:
Q  118 taatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataaca 190  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||    
T  28103877 taatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 28103805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 129929 - 130244
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  129929 accgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaa 130028  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  130029 tatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagcaagataa 130128  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagta-ctcgcg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |  || ||||||    
T  130129 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttatcctaaacaaggcattttgtaac-tagttagctcgcg 130227  T
Q  299 aggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||||    
T  130228 aggcgagagcctctgct 130244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 60813 - 60649
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  60813 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagctcatgatataccaatatc-aatgcaaatcaacaacatctca 60715  T
Q  98 aata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    || | ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  60714 aacattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatcaaatcat 60649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 33681031 - 33681346
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  33681031 accgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcgtcaacatctcaaa 33681130  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  33681131 tatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactagaacaacaacaacaagataa 33681230  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||      | ||||||    
T  33681231 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgtgacaaagatcgcatttaacataagcaaggcactctgtaactgggtaattcgcga 33681330  T
Q  300 ggcgagagcctctgct 315  Q
    ||||||||||||||||    
T  33681331 ggcgagagcctctgct 33681346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 21754069 - 21754373
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  21754069 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaatcaacaacatctcaatt 21754168  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  21754169 atcaa-cataatccatttaatgtatatacaa--------cattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaatgacagcaagataaa 21754259  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21754260 caacttagtttctaacctctgagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcacatttaacct-aacaaggcagtctgtaaaacaagtactcgcgag 21754358  T
Q  301 gcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||    
T  21754359 gcgagagcctctgct 21754373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 22237651 - 22237937
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22237651 accgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaa 22237750  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataa-caacaaggta 198  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || || |||| ||    
T  22237751 tatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataactttagaaacaacatcaattcatatgtatcagtctcgctggaacaacaatcagcaagata 22237850  T
Q  199 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237851 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgaaaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 22237937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 52928067 - 52927795
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||    
T  52928067 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat-----------catctcaaat 52927979  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||    
T  52927978 atcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaatagcaagataaa 52927879  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52927878 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacct-aacaaggcattctgtaac 52927795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 20918628 - 20918939
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||| |    
T  20918628 accgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa--atcaacaactcaatt 20918725  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20918726 atcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacatcaattcataagcatgagtcttactggaacattaacaacaaggtaaa 20918825  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||    
T  20918826 cgacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaagtcgaacgacaaagatcgcattcaacctaaa-aaggcattctttaacacacaagctcgcgag 20918924  T
Q  301 gcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||    
T  20918925 gcgagagcctctgct 20918939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22921966 - 22921681
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22921966 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaa 22921867  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcat-cagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
    |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||  || ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||    
T  22921866 tatcaa-caaaattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagata 22921768  T
Q  199 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22921767 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacccaaacaaggcattctgtaac 22921681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 20248303 - 20248584
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || ||||    
T  20248303 accgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa--atcaacaacttaaat 20248400  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  20248401 atcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatatatcattataaacaacatggattcatatgcatcagtcttactgg-acaacaacatcaagataaa 20248499  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20248500 taacttagtttctaacctctaagatcaatttacatcaacttgtgcgacaagaatcgcatttaacctaaataaggcattctgtaac 20248584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21861667 - 21861355
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  21861667 accgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaa 21861568  T
Q  100 ta-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
     | ||| | |||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||    |||| ||||||| ||||| || | |||| ||    
T  21861567 cattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcatatcataatattcaggcttactgaaacaacaatagcaagata 21861468  T
Q  199 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcg 298  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||  |||||| || ||||    
T  21861467 aacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaatgtcacatttaacct-aacaaggcattctgtctcacaaggacacgcg 21861369  T
Q  299 aggcgagagcctct 312  Q
    ||||||| ||||||    
T  21861368 aggcgagggcctct 21861355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21896353 - 21896044
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  21896353 accgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaa 21896254  T
Q  100 tat-caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
     || || | ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||| ||||||| |||||   ||||||| ||    
T  21896253 cattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataatattcaggcttactgaaacaa---caacaagata 21896157  T
Q  199 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcg 298  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  21896156 aacaacttagtttcttacatctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggcattttgtctcacaaggactcgcg 21896058  T
Q  299 aggcgagagcctct 312  Q
    ||||| | ||||||    
T  21896057 aggcgggggcctct 21896044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16368383 - 16368074
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16368383 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctca 16368285  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    |  |||    ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||  ||| |    
T  16368284 ac-atcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagat 16368186  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgc 297  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||  ||||||  ||||||  |||||    
T  16368185 aaacaacttaatttcttacccctatgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgtctcacaagggctcgc 16368087  T
Q  298 gaggcgagagcct 310  Q
    |||||||||||||    
T  16368086 gaggcgagagcct 16368074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 312
Target Start/End: Original strand, 12271696 - 12271882
Alignment:
Q  118 taatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacc 217  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||       ||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| |||    
T  12271696 taatatatatacaattatatcacattataaataacatcaactca-------cagtcttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttcttacc 12271788  T
Q  218 tctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctct 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12271789 tctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggcattctgtctcacaaggactcgcgaggcgagagcctct 12271882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 312
Target Start/End: Original strand, 20636957 - 20637184
Alignment:
Q  84 tcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaac 183  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||   |||    |||| ||||||||||     
T  20636957 tcaacaacatcccaaata-caaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaaaaaatacaattcaggcttactggaat 20637055  T
Q  184 aataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgta 283  Q
     | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  20637056 gacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcatgcgacaaagatcgcttttaacctaaacaagacattctgta 20637155  T
Q  284 acacaagtactcgcgaggcgagagcctct 312  Q
    ||  |    ||||||||||||||||||||    
T  20637156 actgattagctcgcgaggcgagagcctct 20637184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 285
Target Start/End: Original strand, 49261447 - 49261648
Alignment:
Q  83 atcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |    |||    || | ||||||||||    
T  49261447 atcaacaacatctcaaatatcaa-cataatttatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaattccggcttactggaa 49261545  T
Q  183 caataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgt 282  Q
      | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  49261546 ggacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcttttaacctaaacaaggcattctgt 49261645  T
Q  283 aac 285  Q
    |||    
T  49261646 aac 49261648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 50686635 - 50686948
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||    |||  |  ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  50686635 accgactcatgcagtttagttaataaacaaacggcaacataggcagttcataaaatagttcatgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaacatctca 50686734  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    || |||| | ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||  ||| |    
T  50686735 aacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcggatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagat 50686834  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgc 297  Q
    || ||||||||||||| ||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||| |||||||  |||| |  |||||    
T  50686835 aagcaacttagtttcttacccccatgatcaactcacgtcaactcgtgcgacaaaggtcacatttatcct-aacaaggtattctgtctcacaggggctcgc 50686933  T
Q  298 gaggcgagagcctct 312  Q
    |||||||||||||||    
T  50686934 gaggcgagagcctct 50686948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35981701 - 35981500
Alignment:
Q  83 atcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |    |||     ||| ||||||||||    
T  35981701 atcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatgcaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaa 35981603  T
Q  183 caataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgt 282  Q
      | |||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  35981602 tgacaacatcaagataaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaattcgtgcgacaaagatcgcttttaacctaaacaaggcattctgt 35981503  T
Q  283 aac 285  Q
    |||    
T  35981502 aac 35981500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14295648 - 14295495
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||| |    
T  14295648 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa--atcaacaactcaatt 14295551  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
    |||| || ||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14295550 atcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattat-aacaacatcaa 14295495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35261175 - 35261015
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||     
T  35261175 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaa--atcaacatctcaaac 35261078  T
Q  101 a-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    | ||| |||||||||   ||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||    
T  35261077 attcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaatcat 35261015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 50614214 - 50613902
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  50614214 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctca 50614115  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    || |||    ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||  | ||||||||| ||||||   |||| ||||||| |  || |||   |||      
T  50614114 aacatcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaagtaacaacggtaagac 50614015  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||| |   |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||  ||||||  ||||||  |||||    
T  50614014 aaacaacttagtttcttacc-ccctgatcaattcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgtctcacaagggctcgc 50613917  T
Q  298 gaggcgagagcctct 312  Q
    | ||||||| |||||    
T  50613916 ggggcgagaacctct 50613902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 50622042 - 50621730
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  50622042 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctca 50621943  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    || |||    ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||  | ||||||||| ||||||   |||| ||||||| |  || |||   |||      
T  50621942 aacatcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaagtaacaacggtaagac 50621843  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgc 297  Q
    |||||||||||||||| ||| |   |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||  ||||||  ||||||  |||||    
T  50621842 aaacaacttagtttcttacc-ccctgatcaattcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgtctcacaagggctcgc 50621745  T
Q  298 gaggcgagagcctct 312  Q
    | ||||||| |||||    
T  50621744 ggggcgagaacctct 50621730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41050133 - 41049842
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41050133 accgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctca 41050034  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    |  |||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||  ||| |    
T  41050033 ac-atcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagat 41049935  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagt 291  Q
    ||  ||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| |||||| ||||||| |||||||  |||||||    
T  41049934 aagaaacctagttccttacccctatgatcaactcacatcaactcatgcgacaaaggtcacatataacct-aacaaggtattctgtctcacaagt 41049842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 16758673 - 16758839
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaat-caacaacatctca 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||    
T  16758673 accgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaacaacatcaca 16758772  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatat 164  Q
    |   ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16758773 acattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatat 16758839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22130975 - 22130844
Alignment:
Q  30 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatac 129  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| ||| || | ||||| ||||||    
T  22130975 aacagcaacataggcagtatccaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa--atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgcatatac 22130878  T
Q  130 aattatataacattataaacaacatcaattcata 163  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22130877 aattatataacattataagcaacatcaaatcata 22130844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 84
Target Start/End: Original strand, 21161742 - 21161822
Alignment:
Q  3 cgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaat 84  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21161742 cgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaacaaaa-cagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaatgcaat 21161822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16093982 - 16093826
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaa-caacatctc 96  Q
    ||||||||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  16093982 accgactcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaaacaacatctc 16093884  T
Q  97 aaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 154  Q
    ||| |||| |  |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  16093883 aaacatcataggtaattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattaaaatcaacat 16093826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 45574984 - 45574836
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||| | ||||||| |||||||| ||||||    
T  45574984 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 45574886  T
Q  99 atatcaa-acataattcctttaatgtatatacaattatataacattataa 147  Q
     ||| || | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  45574885 ttattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 45574836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Original strand, 51130632 - 51130741
Alignment:
Q  45 agtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacatta 144  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||| || ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  51130632 agtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa--atcaacaactcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 51130729  T
Q  145 taaacaacatcaa 157  Q
    | |||||||||||    
T  51130730 t-aacaacatcaa 51130741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 433033 - 433193
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||     |||||| ||||||||| ||||  ||||| || |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  433033 accgactcatgcagcttagttaaataacg----gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 433128  T
Q  99 atat-caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
     ||| || | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  433129 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatcat 433193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 50210310 - 50210212
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  50210310 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 50210212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 38801483 - 38801433
Alignment:
Q  3 cgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  38801483 cgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa 38801433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 26064966 - 26065108
Alignment:
Q  5 actcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaata 101  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||   |||  |  |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |    
T  26064966 actcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaata-ccaatgcaaatcaacaacatctcaaaga 26065064  T
Q  102 tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattat 145  Q
    ||| | |||||||   ||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  26065065 tcatatataattcaagtaatacatatacaaatatatcacattat 26065108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 34509804 - 34509899
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatct 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  34509804 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaatgcaagtcaacaacatct 34509899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23593876 - 23593719
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  23593876 accgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 23593779  T
Q  99 atat-caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     ||| || | |||||||   ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23593778 ttattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 23593719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 20847251 - 20847205
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagta 48  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20847251 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 20847205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 21026704 - 21026806
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||  |||  ||||| | ||||| |||||||||||| ||    
T  21026704 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatcaattgcaattcaacaacatcttaa 21026802  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  21026803 atat 21026806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 21840788 - 21840885
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  21840788 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 21840885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 27250826 - 27250724
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||    
T  27250826 accgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaa 27250728  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  27250727 atat 27250724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 20454650 - 20454606
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcag 46  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20454650 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcag 20454606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 16361938 - 16362095
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |  ||||||  |||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  16361938 accgactcatgcagcttagttaaataacga-cagcaacacaa-cagtatataaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 16362035  T
Q  99 atat-caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     ||| || | |||||||   ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16362036 ttattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 16362095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 102
Target Start/End: Original strand, 22532297 - 22532395
Alignment:
Q  5 actcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatat 102  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  22532297 actcatgcaatttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatccattgcaattcaacaacatcttaaatat 22532395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1924970 - 1924896
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  1924970 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 1924896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20923984 - 20923910
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  20923984 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 20923910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 22123209 - 22123171
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaaca 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22123209 accgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaaca 22123171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28194332 - 28194235
Alignment:
Q  215 acctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagta-ctcgcgaggcgagagcctct 312  Q
    ||||| ||| |||||||| | || | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| |   ||| ||||||||||||||||||||    
T  28194332 acctcaaaggtcaactcataacatcacgtgcgacaaagatcgcatgtaacctaaacaagacattttgtaa-atgggtagctcgcgaggcgagagcctct 28194235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 162
Target Start/End: Original strand, 21477666 - 21477703
Alignment:
Q  125 tatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21477666 tatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 21477703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 21565566 - 21565851
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  21565566 accgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatccaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatttcaaa 21565665  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  21565666 tatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactagaacaacaacaacaagataa 21565765  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||    
T  21565766 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcattttacataaacaagtcattctgtaac 21565851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22959629 - 22959347
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||    
T  22959629 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaa--atcaacaactcaaat 22959532  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22959531 atcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattttaaccaacattgattcatatgcatcagtcttactggaacaaaaacaacaagataaa 22959432  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959431 caacttggtttttaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcaacaagaatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 22959347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19660932 - 19660621
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||  ||  | ||||| ||||| |    
T  19660932 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcttgatataatgatatcgaatataa--atcaacaactcaatt 19660835  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19660834 atcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaa 19660735  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  19660734 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaacgacaaagattgcattcaacctaaa-aaggcgttctgtaacacaaacgctcgcgag 19660636  T
Q  301 gcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||    
T  19660635 gcgagagcctctgct 19660621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 19668922 - 19669206
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||    
T  19668922 accgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaatgcaa--atcaacaactcaaat 19669019  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaat--tcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  19669020 atcaaacataagtcctgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaatattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacaacaagata 19669119  T
Q  199 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19669120 aacgacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaagaatcacatttatcctaaacaaggcattctgtaac 19669206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21329594 - 21329309
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||  |||    
T  21329594 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaattcaagtcatcaacatcataaa 21329495  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  21329494 catcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataa 21329395  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329394 acaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 21329309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26012132 - 26011848
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  26012132 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaacatgatataacaatatcaaatgtgaatcaacaacatctcaaa 26012033  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
     |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  | ||||   |||| ||||||| ||||| || |||||| |||    
T  26012032 catcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacatcaacaacaacatcagattatatagttcaggcttactgaaacaacaataacaagataa 26011933  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26011932 acaacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtgtgacaaagatcacatttaacct-aacaaagcattctgtaac 26011848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20027038 - 20026726
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaat-caacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  20027038 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaacatcaca 20026939  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    |  |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||  |||||   |||| ||||||| |||||  |||||||| |    
T  20026938 ac-atcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatatagcattatcaacaacattaaaacatataattcaggcttactgaaacaactacaacaagat 20026840  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgc 297  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  ||||||| || |||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  20026839 aaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcgactcgtgcgacaacggtcacatttaagct-aacaaggcattctgtctcacaaggactcgc 20026741  T
Q  298 gaggcgagagcctct 312  Q
    |||||||||||||||    
T  20026740 gaggcgagagcctct 20026726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 21502253 - 21501971
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||    
T  21502253 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcagcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcatcatcttaaa 21502154  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| ||||| |||| |||| ||    
T  21502153 catcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagata 21502054  T
Q  199 aacaacttag-tttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctg 281  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  21502053 aacaacttagttttctaacttccaagatcaactaacatcaactcgtgcgacaaatatcgcatttaacc-caacaaggcattctg 21501971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22178318 - 22178064
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22178318 accgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctca 22178219  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    || |||| | ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | ||||||   | ||  |||||| ||||| ||||  ||| |    
T  22178218 aacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatccaatcatataatttaggtttactgaaacaacaacagtaagat 22178119  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 252  Q
    || ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22178118 aagcaacttagtttcttacccccatgatcaactcacatcaactcgtgtgacaaag 22178064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 22144073 - 22144236
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  22144073 accgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacatctcaaa 22144172  T
Q  100 ta-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
     | ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22144173 cattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattgtaaacaacatcaattcat 22144236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21741546 - 21741357
Alignment:
Q  83 atcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||     ||        ||| ||||||||||    
T  21741546 atcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataacattagaatatacaa----tc--------caggcttactggaa 21741460  T
Q  183 caataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgt 282  Q
      | |||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||    
T  21741459 tgacaacatcaaggtaattaacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcttttaacctaaacaagacattatgt 21741360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22120066 - 22119976
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22120066 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgct 22119976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 40725877 - 40726040
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||    
T  40725877 accgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaagcatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaa 40725976  T
Q  100 t-atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    | |||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40725977 taatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 40726040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24767210 - 24767120
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24767210 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgct 24767120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 36314601 - 36314678
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36314601 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaa 36314678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 164
Target Start/End: Original strand, 29448055 - 29448192
Alignment:
Q  30 aacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtata 126  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||| | ||||| |||    
T  29448055 aacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatacgtaattcatgtaatgcata 29448154  T
Q  127 tacaattatataacattataaacaacatcaattcatat 164  Q
    ||||| || || || |||| | ||||||||| ||||||    
T  29448155 tacaaatacatcaccttattatcaacatcaaatcatat 29448192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21729161 - 21729059
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||    
T  21729161 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaa 21729063  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  21729062 atat 21729059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21808486 - 21808384
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||    
T  21808486 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaa 21808388  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  21808387 atat 21808384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 1096491 - 1096649
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||| || ||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  1096491 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcac 1096589  T
Q  99 atat-caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
    |||| ||  ||||||||   ||||| |||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  1096590 atatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 1096649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 22412208 - 22412309
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22412208 accgactcatgtagcttagttaaataacgataa-caacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 22412306  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  22412307 tat 22412309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 24493593 - 24493694
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  24493593 accgactcatgcagcttggttaagtaacaat-agcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaa 24493691  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  24493692 tat 24493694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5889033 - 5888962
Alignment:
Q  241 cgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagta-ctcgcgaggcgagagcctct 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||    
T  5889033 cgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaa-atgggtagctcgcgaggcgagagcctct 5888962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 312
Target Start/End: Original strand, 25743924 - 25744055
Alignment:
Q  180 gaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattc 279  Q
    |||||| |||||||   ||| ||||||||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |  || | ||||  ||||||||| ||    
T  25743924 gaacaacaacaacagcataagcaacttagtttattacccccatgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcaca-taaaccctaacaaggcagtc 25744022  T
Q  280 tgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctct 312  Q
    ||| || ||||  ||||||||||||||||||||    
T  25744023 tgtcactcaagggctcgcgaggcgagagcctct 25744055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 21997631 - 21997549
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  21997631 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 21997549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 22075043 - 22075145
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||    
T  22075043 accgactcattcagcttagttaaataac-aacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaa 22075141  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  22075142 atat 22075145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 13025335 - 13025436
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||   ||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  13025335 accgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaa 13025433  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  13025434 tat 13025436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 13095519 - 13095620
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||   ||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  13095519 accgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaa 13095617  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  13095618 tat 13095620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 8286940 - 8286888
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8286940 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 8286888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 25431418 - 25431518
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||    
T  25431418 accgactcatgcatcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaa 25431516  T
Q  99 at 100  Q
    ||    
T  25431517 at 25431518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 49
Target Start/End: Original strand, 37723930 - 37723975
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat 49  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  37723930 gactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtat 37723975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 98
Target Start/End: Original strand, 9077983 - 9078074
Alignment:
Q  8 catgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  9077983 catgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaacatctcaa 9078074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 24529244 - 24529339
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatct 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24529244 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaatgcaagtcaacaacatct 24529339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 23390593 - 23390491
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||    
T  23390593 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaa 23390495  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  23390494 atat 23390491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 25421556 - 25421658
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||    
T  25421556 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacagcatcttaa 25421654  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  25421655 atat 25421658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20902150 - 20901988
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||    
T  20902150 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaacgtctcaa 20902053  T
Q  99 --atatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
      || ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  20902052 ttatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 20901988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21871581 - 21871507
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21871581 caacatctcaagcatcaaacataattcatgcaatatatatcgaattatataacattataaatatcatcaattcat 21871507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21875861 - 21875787
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21875861 caacatctcaagcatcaaacataattcatgcaatatatatcgaattatataacattataaatatcatcaattcat 21875787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 27988829 - 27988774
Alignment:
Q  197 taaacaacttagtttct-aacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 252  Q
    |||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27988829 taaacaacttagttccttaacctc-atgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 27988774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 21293066 - 21293020
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagta 48  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21293066 accgattcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 21293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 157
Target Start/End: Original strand, 36314690 - 36314728
Alignment:
Q  118 taatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36314690 taatgtatatacaattatataacattat-aacaacatcaa 36314728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Original strand, 10753629 - 10753703
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  10753629 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 10753703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18319175 - 18319027
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaa-caacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||    
T  18319175 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctca 18319078  T
Q  98 aata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataa 147  Q
    | || ||| | |||||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  18319077 attattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa 18319027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22120205 - 22120131
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  22120205 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 22120131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 26732929 - 26732884
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagt 47  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  26732929 accgactcatgcagcttagttaataaac-aacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 53)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26355795 - 26355512
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  26355795 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcacgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcagcc 26355696  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  26355695 atcaa-catattccatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactagaacaataacaaaaagataaa 26355597  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26355596 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaaagatcgcatttaacataaacaaggcattctgtaac 26355512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5866371 - 5866060
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||| |    
T  5866371 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa--atcaacaactcaatt 5866274  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5866273 atcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaa 5866174  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||    
T  5866173 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcattcaacctaaa-aaggcattctgtaacacaaacgctcgcgag 5866075  T
Q  301 gcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||    
T  5866074 gcgagagcctctgct 5866060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 21491019 - 21491327
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||| |    
T  21491019 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattgaatgtaa--atcaacaactcaatt 21491116  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21491117 atcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataggcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaa 21491216  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||    
T  21491217 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacattaactcgaactacaaagatcgcattcaacctaaa-aaggcattctgtaacacaaacgctcgcgag 21491315  T
Q  301 gcgagagcctct 312  Q
    || |||||||||    
T  21491316 gcaagagcctct 21491327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 17140940 - 17141251
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||  | || || ||||| |    
T  17140940 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgacataataatatcgaatgtaa--atcatcaactcaatt 17141037  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17141038 atcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaa 17141137  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  17141138 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaatgacaaagatcgcattcaacctaaa-aaggcgttctgtaacacaaacgctcgcgag 17141236  T
Q  301 gcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||    
T  17141237 gcgagagcctctgct 17141251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 38855348 - 38855064
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38855348 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaa 38855249  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| ||||| |||| |||| |||    
T  38855248 tatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataa 38855150  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    ||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38855149 acaacttagttcctaatgtccaagatcaattcacatcaactcgtgcgacaaagatcgtgtttaacctaagcaaggcattctgtaac 38855064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 21249408 - 21249719
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaac-agcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||     
T  21249408 accgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatcgaatgtaa--atcaacaactcaat 21249505  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
    |||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||| || ||| |    
T  21249506 tatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttagtgagacattaacagcagggt-a 21249604  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcga 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21249605 acaacttagttcctaacctctaagataaactcacatcaacttgaacgacaaagatcgcatttaacctaaa-aaggcattctgtaacacaaatgctcgcga 21249703  T
Q  300 ggcgagagcctctgct 315  Q
    ||||||||||||||||    
T  21249704 ggcgagagcctctgct 21249719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 23760941 - 23760654
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  23760941 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcatcatgatataacaatattgaattcaaatcaacaacatctcaaa 23760842  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactg---gaacaataacaacaag 195  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||||    ||||| |||||||||    
T  23760841 tatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatttattcaggcttactgaaacaacaacaacaacaag 23760743  T
Q  196 gtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  23760742 gtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaaagatcgcatttatcct-aacaaggcattttgtaac 23760654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 21255246 - 21255557
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaac-agcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||     
T  21255246 accgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatcgaatgtaa--atcaacaactcaat 21255343  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
    |||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||| || ||| |    
T  21255344 tatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttagtgagacattaacagcagggt-a 21255442  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcga 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  21255443 acaacttagttcctaacctctaagataaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcatttaacctaaa-aaggcattctgtaatacaaatgctcgcga 21255541  T
Q  300 ggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||| |||||    
T  21255542 ggcgagagccgctgct 21255557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 6520392 - 6520674
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||    
T  6520392 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 6520491  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
     ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| ||||| |||| |||| |||    
T  6520492 catc-aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataa 6520590  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaa 284  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6520591 ataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcatgcaacaaagatcgcatttaacct-aacaaagcattctgtaa 6520674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 21673728 - 21674013
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21673728 accgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaa 21673827  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
    |||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||  ||||||| ||||| ||||||||| |     
T  21673828 tatc-aatataatttatttaatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaagcttactgaaacaacaacaacaagat- 21673925  T
Q  199 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaaca 286  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21673926 aacaacttagtttttaacctctaatatcaactcacattaacttgtgcgacaaagatcgcatttatcctaaacaaggcattctgtaaca 21674013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 21285621 - 21285905
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21285621 accgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 21285720  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
     |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| || |  | ||||   |||| ||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  21285721 catcaaacatagttcatgtaatgtatatacaattatatatcattaacaacaatattagattatataattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataa 21285820  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21285821 agcacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgataaagatcgcatttaacct-aacaaagcattctgtaac 21285905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 20498586 - 20498839
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  20498586 accgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaa 20498685  T
Q  100 tat-caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
     || || | |||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||  |||| |||| ||    
T  20498686 cattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtcttaccgaaacatcaacatcaagata 20498785  T
Q  199 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 252  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20498786 aacaacttagtttcttacctccaagatcaactcacatcaactcgtgtgacaaag 20498839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 37116371 - 37116683
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37116371 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctca 37116470  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    || |||| | ||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| ||||| ||||  ||| |    
T  37116471 aacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaacagtaagat 37116570  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgc 297  Q
    || ||||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||| ||| |||||  ||||||  |||||    
T  37116571 aagcaacttagtttcttacccccatgatcatctcacatcaactcgtacgacaaaggtcacatttatcct-aacaa-gcagtctgtctcacaagggctcgc 37116668  T
Q  298 gaggcgagagcctct 312  Q
    |||||||||||||||    
T  37116669 gaggcgagagcctct 37116683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 983503 - 983248
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |     
T  983503 accgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaacaacatcac- 983405  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaa--- 194  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  | ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||||       
T  983404 aacatcaaacataattcatgtaatgtatatacagctatataacattatcaacaacattcaatcatataattcagacttactgaaacaacaacaacaacat 983305  T
Q  195 ggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaa 251  Q
    | ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  983304 gataaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcatatcaactcgtgcgacaaa 983248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17267091 - 17266778
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| |   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17267091 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctca 17266992  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    || |||| | ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| || |||| ||||| ||||  ||| |    
T  17266991 aacatcatatataattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggctcactgaaacaacaacagtaagat 17266892  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgc 297  Q
    || ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||  ||||||  ||||||  |||||    
T  17266891 aagcaacttagtttcttacccccgtgatcaactcacatcaactcgtgcgataaaggtcacatttaacct-aacaaggagttctgtctcacaagggctcgc 17266793  T
Q  298 gaggcgagagcctct 312  Q
    |||||||||||||||    
T  17266792 gaggcgagagcctct 17266778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 24353044 - 24353359
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24353044 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctca 24353142  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaac---aa 194  Q
    || |||  | | ||||| | ||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||   ||    
T  24353143 aacatcgtatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaacagtaa 24353242  T
Q  195 ggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtact 294  Q
    | ||| ||||||||||||| | | | | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||| |||||||  ||||||  ||    
T  24353243 gataagcaacttagtttcttatccccatgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttatcct-aacaaggtattctgtctcacaagggct 24353341  T
Q  295 cgcgaggcgagagcctct 312  Q
    | ||||||||| ||||||    
T  24353342 cacgaggcgagggcctct 24353359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 312
Target Start/End: Original strand, 22364744 - 22364997
Alignment:
Q  58 tcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||| | ||||||| | ||||| ||||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  22364744 tcatgatataacaatatcaaagaaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcactttattaacaacatcaa 22364843  T
Q  158 ttcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgc 257  Q
     ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||  ||| ||| ||||||||||| | | | |   |||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  22364844 atcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttattatccccctgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcac 22364943  T
Q  258 atttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctct 312  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||    
T  22364944 atttaacct-aacaaggtgttctgtctcacaagggctcgtgaggcgagagcctct 22364997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13508179 - 13508019
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaata- 101  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||     
T  13508179 gactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatat 13508080  T
Q  102 tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13508079 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 13508019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13597711 - 13597551
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaata- 101  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||     
T  13597711 gactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatcccaaatat 13597612  T
Q  102 tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13597611 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 13597551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17439603 - 17439438
Alignment:
Q  2 ccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17439603 ccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 17439504  T
Q  99 atatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatat 164  Q
    | |||| | ||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||| || ||||||    
T  17439503 acatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaatcatat 17439438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 17612204 - 17612056
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaat-a 101  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| |    
T  17612204 gactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataa 17612105  T
Q  102 tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaaca 150  Q
    ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17612104 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaaca 17612056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 22626760 - 22626861
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||    
T  22626760 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatacaaatcaacaacatcttaaa 22626858  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  22626859 tat 22626861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 16092439 - 16092337
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16092439 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 16092341  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  16092340 atat 16092337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 28649141 - 28648983
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  28649141 accgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaa 28649043  T
Q  99 atat-caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     ||| ||  ||||||||   |||||| ||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  28649042 ttatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 28648983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 22875089 - 22875190
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | |||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22875089 accgactcatgcagcttagttaaatagc-agcagcaacacaggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 22875187  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  22875188 tat 22875190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21919097 - 21918995
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||    
T  21919097 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaa 21918999  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  21918998 atat 21918995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 16199741 - 16199668
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 75  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  16199741 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa-caacatgacataataatatc 16199668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 31971281 - 31971354
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 75  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  31971281 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatc 31971354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 19154984 - 19154936
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat 49  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19154984 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat 19154936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 21396077 - 21396029
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat 49  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21396077 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 21396029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 21790570 - 21790522
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat 49  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21790570 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 21790522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 7372802 - 7372904
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||    
T  7372802 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaa 7372900  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  7372901 atat 7372904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14409585 - 14409429
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  14409585 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 14409488  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     || ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  14409487 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 14409429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Original strand, 21383922 - 21383996
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  21383922 caacatctcaaatatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 21383996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 18818506 - 18818454
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18818506 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 18818454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 18879328 - 18879276
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18879328 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 18879276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 23406403 - 23406455
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  23406403 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 23406455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 21389547 - 21389499
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat 49  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  21389547 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtat 21389499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 21778873 - 21778825
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat 49  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  21778873 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtat 21778825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 6759282 - 6759364
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  6759282 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 6759364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16413457 - 16413301
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  16413457 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 16413360  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     || ||| | |||||||   ||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16413359 ttattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 16413301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 20536232 - 20536334
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||    
T  20536232 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaa 20536330  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  20536331 atat 20536334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21924025 - 21923923
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| || | |||||| | ||||| |||||||||||| ||    
T  21924025 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaa 21923927  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  21923926 atat 21923923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 45131093 - 45131047
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagta 48  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  45131093 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 45131047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 26219738 - 26219838
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||| ||||  |  |||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26219738 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaatagtatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 26219835  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  26219836 tat 26219838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19801261 - 19801221
Alignment:
Q  264 cctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgag 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19801261 cctaaacaaggc-ttctgtaacacaagtactcgcgaggcgag 19801221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 40492891 - 40492834
Alignment:
Q  58 tcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaatatcaaacataattc 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  40492891 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcataaataattc 40492834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18862486 - 18862412
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  18862486 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 18862412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Original strand, 21387342 - 21387416
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  21387342 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 21387416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Original strand, 21411215 - 21411289
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  21411215 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 21411289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Original strand, 21805707 - 21805781
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  21805707 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 21805781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21827855 - 21827781
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  21827855 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 21827781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 157
Target Start/End: Original strand, 26223997 - 26224096
Alignment:
Q  59 catgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatat-caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatca 156  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| || | ||||||   |||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  26223997 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataatttaattaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatca 26224095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 160708 - 160992
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  160708 accgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaatcaacaacatgtcaaat 160807  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  160808 atcaaacataagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaa 160907  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  160908 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcacatttatcctaaccaagacattctgtaac 160992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 45889 - 45604
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||     
T  45889 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaagtcatcaacatctcaat 45790  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||    
T  45789 tatcaaacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaattacagcaatataa 45690  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  45689 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttatcctaaacaagacattctgtaac 45604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 6836 - 7118
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||    
T  6836 accgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaa--atcaacaactcaaat 6933  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  6934 atcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagcaagataaa 7033  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7034 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaagaatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 7118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 59 - 311
Target Start/End: Original strand, 8097 - 8349
Alignment:
Q  59 catgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |     
T  8097 catgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattag 8196  T
Q  158 ttcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgc 257  Q
     | ||||   |||| ||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  8197 attatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaggataaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgagacaaagatcac 8296  T
Q  258 atttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctc 311  Q
    |||  |||| ||||| ||||| ||||||   |  |||||||||||||| |||||    
T  8297 attatacct-aacaaagcattatgtaactggacaactcgcgaggcgagggcctc 8349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 153 - 467
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  153 accgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaa 252  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| |||| | |    
T  253 tatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacatcaattcatatgtatcagtctcactagaacaacaacagcaagat-a 351  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcga 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||      ||||||||    
T  352 acaactcagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtacgacaaagatcgcatttaacataagcaagacattctgtaactgggtcactcgcga 451  T
Q  300 ggcgagagcctctgct 315  Q
    ||||||||||||||||    
T  452 ggcgagagcctctgct 467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22134303 - 22133999
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  22134303 accgactcatgcagcttagttaaatatcaa-cagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaatgcaatcaataacatctcattt 22134205  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  22134204 atcaa-cataatccatttaatgtatatacaa--------cattataaacaacaccaattcatatgcatcagtcttactggaaaaatgacagcaagataaa 22134114  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22134113 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcagtctgtaacacaagtattcgcgag 22134014  T
Q  301 gcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||    
T  22134013 gcgagagcctctgct 22133999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 28406000 - 28406313
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28406000 accgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 28406099  T
Q  99 atatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    ||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |  ||||||  | | || ||||||  ||||| |||| |||| |    
T  28406100 atatcaa-cttaattcataaaatgtatatacaattatataccattaacaacaacaatagatcatattaaattaggcttactaaaacaacaacagcaagat 28406198  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  28406199 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacctaaacaaggcattatgtaacacaagtacttgc 28406298  T
Q  298 gaggcgagagcctct 312  Q
    |||||||||||||||    
T  28406299 gaggcgagagcctct 28406313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Original strand, 25175880 - 25176128
Alignment:
Q  7 tcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaatatcaa 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  25175880 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-a 25175978  T
Q  106 acataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaac 204  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||    
T  25175979 acataattcatataacgtatatataattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaac 25176078  T
Q  205 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25176079 ttagtttctaacctctaagatcaacttacatcaattcgtgcgacaaagat 25176128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23072045 - 23071746
Alignment:
Q  2 ccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaata 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||  | || || ||||| ||    
T  23072045 ccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatataa--atcagcaactcaatta 23071948  T
Q  102 tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaac 201  Q
    |||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||      
T  23071947 tcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattagcaacaaggtaa-- 23071850  T
Q  202 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgagg 301  Q
    || |||         ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||||   |||||||||    
T  23071849 aaatta---------ctctaagatcaactcacatcaactcgaacgaaaaagatctcattcaacctaaa-aaggcattttgtaacacaaacgctcgcgagg 23071760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 23791297 - 23791610
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||   ||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23791297 accgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaacatctca 23791396  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    || || | | ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||||| |    
T  23791397 aacattatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaacaagat 23791496  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgc 297  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||  ||||||  ||||||  |||||    
T  23791497 aaacaacttagtttccaacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgtctcacaagggctcgc 23791595  T
Q  298 gaggcgagagcctct 312  Q
    |||||||||||||||    
T  23791596 gaggcgagagcctct 23791610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7824 - 7556
Alignment:
Q  7 tcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatat-ca 104  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || ||    
T  7824 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattca 7725  T
Q  105 aacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaac 204  Q
     | |||||||   |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||| | ||||||||    
T  7724 tatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaacatgataaacaac 7625  T
Q  205 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaag 273  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| ||||    
T  7624 ttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacattaaacctaaccaag 7556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 62 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22459598 - 22459347
Alignment:
Q  62 gatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatat-caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaatt 159  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||| ||||||||||||||| || | |||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  22459598 gatataacaacatcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaact 22459499  T
Q  160 catatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcat 259  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |  |||    
T  22459498 cgtatacatcagtcttactgaaacaataacagcaagataaacaacttagtttcttacctctaaggtcaactcacatcaactcgtaggacaaaggtcacat 22459399  T
Q  260 ttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctct 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22459398 ttaacct-aacaaggcattctgtctcacaaggactcgcgaggcaagagcctct 22459347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 23207301 - 23207586
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  23207301 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgacatctca 23207400  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    |  || | | ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| |||||| |||||| ||||  ||| |    
T  23207401 ac-attataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttacttgaacaacaacagtaagat 23207499  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||  |||||||||    
T  23207500 aagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgtaac 23207586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18787000 - 18786748
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaat-caacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| || ||    
T  18787000 accgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaaccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaacaacgtcaca 18786901  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    |  |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  | ||||||   | || ||||||| ||||| |||| || | |    
T  18786900 ac-atcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaataacattcaatcatataatttaggcttactgaaacaacaacagcatgat 18786802  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaa 251  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786801 aaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaa 18786748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Original strand, 7679612 - 7679750
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||  ||| ||    
T  7679612 gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc-aatgtaagtcatcaacatcataaacat 7679710  T
Q  103 caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacat 142  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  7679711 caaacataattcatgtaatgtatatataattatataacat 7679750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23708716 - 23708553
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||    
T  23708716 accgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcatcgacatctcaaa 23708617  T
Q  100 ta-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
     | ||||| |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23708616 cattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcat 23708553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 25108911 - 25109181
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa--tcaacaacatctc 96  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||  |  |||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||    
T  25108911 accgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaatagttcatgatataacaatatcaaa-gcaaaatcaacaatatctc 25109009  T
Q  97 aaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaagg 196  Q
    ||| |||| | ||||||| | ||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||  |||     
T  25109010 aaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaaga 25109109  T
Q  197 taaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaa 268  Q
    ||| ||||||||||||| | | | | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  25109110 taagcaacttagtttcttatccccatgatcaacttacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 25109181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 158
Target Start/End: Original strand, 19671857 - 19672011
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatat 102  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||   |    
T  19671857 gactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaatatt 19671956  T
Q  103 caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaat 158  Q
    || | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19671957 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattat-aacaacatcaat 19672011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20520290 - 20520127
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20520290 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctca 20520192  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    || |||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||    
T  20520191 aacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatcaaatcat 20520127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22413235 - 22413070
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataaca--atatcgaatgc-aatcaacaacatct 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22413235 accgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaacaacatct 22413136  T
Q  96 caaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    | || |||| | ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  22413135 c-aacatcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcat 22413070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 22105433 - 22105590
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  22105433 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacttctcaa 22105531  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     || ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  22105532 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 22105590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 298912 - 298809
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||| |||||||||||| ||    
T  298912 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttaa 298813  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  298812 atat 298809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24697704 - 24697538
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaat-caacaacatctca 97  Q
    ||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||| |||||||||    || ||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24697704 accgactcatgcaacatagttaataaacaaacaacaacgtaggcagtacatcaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctca 24697605  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatat 164  Q
    ||  ||| | | ||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||||    
T  24697604 aacttcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacataaaatcatat 24697538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 23004772 - 23004926
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||   |||  |  ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23004772 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaatagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctca 23004871  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaac 152  Q
    || |||| | ||||| |   ||||| |||||||| ||| |||||| || ||||||    
T  23004872 aacatcatatataatccacataatgcatatacaaatatttaacatcattaacaac 23004926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 23060537 - 23060639
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||    
T  23060537 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaa 23060635  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  23060636 atat 23060639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 38211 - 38138
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 75  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  38211 accgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 38138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 23660047 - 23660148
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||  |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  23660047 accgactcatgtatcttagttaaacaac-aacagcaacataggcagtatacgaaacaggatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacatcttaaa 23660145  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  23660146 tat 23660148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 20309132 - 20309180
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat 49  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20309132 accgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat 20309180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 23076466 - 23076568
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||| |||| ||    
T  23076466 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaatatcttaa 23076564  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  23076565 atat 23076568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 23103492 - 23103440
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23103492 accgactcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggcagtatacaaa 23103440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 23285889 - 23285941
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  23285889 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 23285941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 32452026 - 32451981
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcag 46  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  32452026 accgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcag 32451981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 22337139 - 22337241
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||   ||| || ||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  22337139 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 22337237  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  22337238 atat 22337241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 23654483 - 23654381
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| || ||||| |||||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||    
T  23654483 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaa 23654385  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  23654384 atat 23654381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 22731331 - 22731286
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagt 47  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22731331 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 22731286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 23287387 - 23287433
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagta 48  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  23287387 accgactcatgcagcttagttaataaac-aacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 32215062 - 32214906
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  32215062 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 32214965  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     || ||| | |||||||   ||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  32214964 ttattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 32214906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Original strand, 1283692 - 1283766
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  1283692 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 1283766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 26392406 - 26392451
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagt 47  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  26392406 accgactcatgcagcttagttaataaac-aacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30344832 - 30344758
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  30344832 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 30344758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 8946681 - 8946733
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  8946681 accgactcatgcagcttagttagataac-aatagcaacataggcagtatacaaa 8946733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 23040286 - 23040247
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacata 41  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23040286 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 12790 - 13099
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||    
T  12790 accgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 12889  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||   |||| ||||||||||||| |||| |||| |||    
T  12890 catcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaataacaacattagatcatataattcaggcttactggaacaacaacagcaagataa 12989  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcga 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12990 accacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattttgtaacacaagtactcgtga 13089  T
Q  300 ggcgagagcc 309  Q
    ||||||||||    
T  13090 ggcgagagcc 13099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 132682 - 132990
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||     
T  132682 accgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaatgtaatcatcaacgtctcaat 132781  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||    
T  132782 tatcaa-cataatccatttaatgtatata------tacaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataa 132874  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  132875 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaaacaaggcattatgtaagacaagtactcgcga 132974  T
Q  300 ggcgagagcctctgct 315  Q
    ||||||||||||||||    
T  132975 ggcgagagcctctgct 132990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 62222 - 62512
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  62222 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgaaaaacatcatggtataataatatcgaatgca--caacaacatctcaaat 62319  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| | ||||||   | |||| ||||||| ||||| |||| |||| |||    
T  62320 atc-aacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacatcattagttcataacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataa 62418  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtact 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  62419 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcgaatcgggcgacaaggatcgca-ttaacataaacaaggcattcagtaacacaagtact 62512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 134232 - 134388
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  134232 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 134329  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     || ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  134330 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 134388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 136701 - 136857
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  136701 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 136798  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     || ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  136799 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 136857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 139170 - 139326
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  139170 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 139267  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     || ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  139268 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 139326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 144108 - 144264
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  144108 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 144205  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     || ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  144206 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 144264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 141639 - 141795
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  141639 accgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 141736  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     || ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  141737 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 141795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 100398 - 100710
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  100398 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaa 100497  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
    |||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||  | | || ||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  100498 tat-taacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaatttaggcttactgaaacaacaacaacaagata 100596  T
Q  199 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  100597 aacaacttagtttctaacctctaagagcaagtcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacttagacaaggcattttgtaacacaagtactcgcg 100696  T
Q  299 aggcgagagcctct 312  Q
    ||||| ||||||||    
T  100697 aggcgggagcctct 100710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 40268 - 39986
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40268 gactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 40169  T
Q  103 caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcat-cagtcttactggaacaataacaacaaggtaaac 201  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  || ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  40168 caa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacataagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacatcaaggtaaac 40070  T
Q  202 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40069 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcaacaaagatcgcatttaacctaaataaggcattttgtaac 39986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 160 - 315
Target Start/End: Original strand, 101578 - 101732
Alignment:
Q  160 catatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcat 259  Q
    |||| |||| ||||||| | |||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  101578 cataggcattagtcttaattgaacaacaacaacaagagaa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcacat 101676  T
Q  260 ttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  101677 ttaacctaaacaagacagtctataacacaagtactcccgaggcaagagcctctgct 101732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 101523 - 101576
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  101523 accgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 119899 - 119948
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatg 50  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  119899 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 119948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17581 - 17425
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  17581 accgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 17484  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     || ||| | |||||||   ||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  17483 ttattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacagtat-aacaacatcaa 17425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 51)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15754981 - 15754671
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaatatc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  15754981 gactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgcaa--atcaacaactcaaatatc 15754884  T
Q  104 aaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa-ttcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaaca 202  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||    
T  15754883 aaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgcatcagtcttactggaatattaacagcaagataaaca 15754784  T
Q  203 acttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggc 302  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||    
T  15754783 acttagtttctaacctctaggatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattatgtaaaacaagtgctcccgaggc 15754684  T
Q  303 gagagcctctgct 315  Q
    |||||||| ||||    
T  15754683 gagagcctatgct 15754671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28505395 - 28505084
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  ||  | || || ||||| |    
T  28505395 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcggatataa--atcagcaactcaatt 28505298  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  28505297 atcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattgacaacaaggtaaa 28505198  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||    
T  28505197 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcattcaacctaaa-aaggcattctgtaacacaaacgctcgcgag 28505099  T
Q  301 gcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||    
T  28505098 gcgagagcctctgct 28505084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11996124 - 11995813
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||| |||||||    
T  11996124 accgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattgaatgtaa--atcaacaactcaaat 11996027  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  11996026 atcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactgggacattaacagcaaggtaaa 11995927  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11995926 caaattagtttctaacctctaagataaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcatttaacctaaa-aaggcattctgtaacacaaatgctcgcgag 11995828  T
Q  301 gcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||    
T  11995827 gcgagagcctctgct 11995813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 34200810 - 34201121
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||| |    
T  34200810 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa--atcaacaactcaatt 34200907  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  34200908 atcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactgggacattaacagcaaggtaaa 34201007  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||    
T  34201008 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaatgacagggatcgcatttaacctaaa-aaggcattatgtaacacaaacgctcgcgag 34201106  T
Q  301 gcgagagcctctgct 315  Q
    || ||||||||||||    
T  34201107 gcaagagcctctgct 34201121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 67769 - 68053
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  67769 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa- 67867  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcat-cagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||  || ||| || |||| ||||| |||| |||| ||    
T  67868 tatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctcactgaaacaacaacagcaagata 67966  T
Q  199 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67967 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaaggatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 68053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16219814 - 16219503
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||    
T  16219814 accgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcttaaa 16219715  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | ||||   |||| ||||||| ||||| |||| |||| |||    
T  16219714 catcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataa 16219615  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcga 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |  ||||||||    
T  16219614 acaacttagtttctaacctccaagatcaactaacatcaacttgtgcgacaaagatcgcatttaacct-aacaaggcattctgtaactagacaactcgcga 16219516  T
Q  300 ggcgagagcctct 312  Q
    |||||| ||||||    
T  16219515 ggcgagggcctct 16219503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 811228 - 810916
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||    
T  811228 accgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcattaacatcataaa 811129  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| ||| | |||| |||| |||    
T  811128 catcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaactacaacagcaagataa 811029  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcga 299  Q
    | ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  811028 ataacttagtttctaacttccaaggtcaactcacatcaacttgcgcgacaaagatcgcatttaacttaaacaaggcattttgtaacataagtactcgcga 810929  T
Q  300 ggcgagagcctct 312  Q
    |||||||||||||    
T  810928 ggcgagagcctct 810916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 18005670 - 18005954
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18005670 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatggaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaa 18005769  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||    
T  18005770 tatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagata 18005868  T
Q  199 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18005869 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcatatcaacttgtgcgacaaagatcgca-ttatcctaaacaaggcattttgtaac 18005954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 47831831 - 47832116
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||    
T  47831831 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcatatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 47831930  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |  | |||    |||| ||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  47831931 catcaaacataattcatataatgtatatacaattatataacattagcgacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataa 47832030  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47832031 ataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtccgacaaagatcacatttaacctaaacaaagcattctgtaac 47832116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 16056352 - 16056662
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16056352 accgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 16056450  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | ||||   |||| ||||| | ||||| |||| |||| |||    
T  16056451 catcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatatcattcaggcttaccgaaacaacaacatcaagataa 16056550  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcga 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||      ||||||||    
T  16056551 acaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgctacaaagatcgcatttaacct-aacaaggcattctgtaactgggtaactcgcga 16056649  T
Q  300 ggcgagagcctct 312  Q
    |||||||||||||    
T  16056650 ggcgagagcctct 16056662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 44014202 - 44014481
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  44014202 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa--atcaacatctcaaat 44014299  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| ||||| |||| |||| | |    
T  44014300 atc-aacataattcatataatgtatatacagttatataccattaaaaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagat-a 44014397  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014398 acaacttagtttttaacctct--gatcaactcacatcaattcgtgcgacaatgatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 44014481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 62 - 312
Target Start/End: Original strand, 15116565 - 15116815
Alignment:
Q  62 gatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattc 160  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||   ||| | |||| ||   |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  15116565 gatataacaatatcaattgcaagtcatcaacatctcaatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaactc 15116664  T
Q  161 atatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatt 260  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  15116665 atatacatcagtcttactgaaacaataacagtaggataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatt 15116764  T
Q  261 taacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctct 312  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15116765 taacct-aacaaggcattctgtctcacaaggactcgcgaggcgagagcctct 15116815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 22072944 - 22073223
Alignment:
Q  8 catgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatatcaa 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||    
T  22072944 catgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaa 22073043  T
Q  106 acataat-tcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaac 204  Q
    ||||||  || | |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |  | ||||   |||| ||||||| ||||| |||| ||||  |||||||    
T  22073044 acataaactcatgtaatgtatatgcaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaacatcaagacaaacaac 22073143  T
Q  205 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22073144 ttagttccttacctgtaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacct-aacaaagcattctgtaac 22073223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 312
Target Start/End: Original strand, 15113028 - 15113278
Alignment:
Q  62 gatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattc 160  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||   ||| | |||| ||   |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||    
T  15113028 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaactc 15113127  T
Q  161 atatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatt 260  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  15113128 atataaatcagtcttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatt 15113227  T
Q  261 taacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctct 312  Q
    |||||| |||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15113228 taacct-aacaaggcatcctgtctcacaaggactcgcgaggcgagagcctct 15113278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20220285 - 20219976
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||    
T  20220285 accgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaa--atcaacatctcaa 20220188  T
Q  99 atatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
    | |||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||| ||||  ||| ||    
T  20220187 acatcatatataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactggaacaacaacagtaagata 20220088  T
Q  199 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcg 298  Q
    | ||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||| |||||||  ||||||  |||||     
T  20220087 agcaacttagtttcttacccctgtgatcacctcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttatcct-aacaaggtattctgtctcacaag-gctcgca 20219990  T
Q  299 aggcgagagcctct 312  Q
    |||||||| |||||    
T  20219989 aggcgagaacctct 20219976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 12901347 - 12901620
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaat-caacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||| |||||||  || ||||||| ||    
T  12901347 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagcaacatcaca 12901446  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    |  |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| || ||||||   |||  ||||||| ||||| ||||||||| |    
T  12901447 ac-atcatacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaatcatataattcaagcttactgaaacaacaacaacaagat 12901545  T
Q  198 aaacaacttagtttc-ta---acctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaa 268  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |  ||||||||||||    
T  12901546 aaacaacttagtttcctacgtacctccaagatcaactcacatcaactcgtacgacaaatgtcacatttaacctaa 12901620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 16495426 - 16495579
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||| |    
T  16495426 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa--atcaacaactcaatt 16495523  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
    |||| || ||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16495524 atcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattat-aacaacatcaa 16495579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2280216 - 2280053
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2280216 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 2280117  T
Q  100 ta-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    || ||| | |||||||   ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2280116 tattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 2280053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 9389710 - 9389509
Alignment:
Q  83 atcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaa 182  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |    |||     ||| ||||||||||    
T  9389710 atcaacaacatctcatatatcaa-cataattcatacaatgtatatacaattatataacattatcatcaatattagaatatacaatccaggcttactggaa 9389612  T
Q  183 caataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgt 282  Q
      | |||| ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9389611 tgacaacatcaaggtcgataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtgtgacaaagatcgcttttaacctaaacaaggcattctgt 9389512  T
Q  283 aac 285  Q
    |||    
T  9389511 aac 9389509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12255887 - 12255729
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||     
T  12255887 gactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatctcaaac 12255788  T
Q  101 a-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaat 158  Q
    | ||| | |||||||   ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12255787 attcatatataattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacatcaat 12255729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 285
Target Start/End: Original strand, 16324197 - 16324313
Alignment:
Q  168 tcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaaccta 267  Q
    |||| ||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||     
T  16324197 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagatcaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcatgcgacaaggatcacatttaacct- 16324295  T
Q  268 aacaaggcattctgtaac 285  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16324296 aacaaggcattctgtaac 16324313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9751423 - 9751333
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9751423 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcatttaaactaaacaaggcattctgtaacacaagcgctcgcgaggcgagagcctctgct 9751333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1868092 - 1867929
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  1868092 accgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaacaacatctca 1867994  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    || |||| | ||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  1867993 aacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat 1867929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19486841 - 19486678
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||    
T  19486841 accgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaa 19486742  T
Q  100 t-atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    | |||| | |||||||   | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19486741 taatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 19486678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15008596 - 15008433
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  15008596 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacacctca 15008498  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    || |||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  15008497 aacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat 15008433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 39267519 - 39267429
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  39267519 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcccgaggcgagagcctctgct 39267429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 13647349 - 13647512
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  13647349 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 13647447  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata 163  Q
     || ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  13647448 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 13647512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 14044770 - 14044935
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaa-caacatctc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||    
T  14044770 accgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctc 14044868  T
Q  97 aaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata 163  Q
    ||| |||| | ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  14044869 aaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14044935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 14354800 - 14354965
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaa-caacatctc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||    
T  14354800 accgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctc 14354898  T
Q  97 aaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata 163  Q
    ||| |||| | ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  14354899 aaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14354965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2832178 - 2832088
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2832178 tcaactcataacaactcgtgcgacaaggatcacatttaacctaaacaagacattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgct 2832088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 225 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2529926 - 2529846
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgag 305  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2529926 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaattaaggcattctgtaacactagtgctcgcgaggcgag 2529846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10063912 - 10063757
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaata- 101  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||||||     
T  10063912 gactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaacatcatgatataataatatcgaacacaagtaaacaacatctcaaatat 10063813  T
Q  102 tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    ||| | |||||||     |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  10063812 tcacatataattc-----aaacatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 10063757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 315
Target Start/End: Original strand, 18302448 - 18302516
Alignment:
Q  247 acaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18302448 acaaggatcgcatttaacctaaacatggcattctgtaacacaagtgctcgcgaggcgagagcctctgct 18302516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 38227505 - 38227606
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  38227505 accgactcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaa 38227603  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  38227604 tat 38227606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 18456509 - 18456408
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  18456509 accgactcatgcagcttagttaaataacgat-agcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaa 18456411  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  18456410 tat 18456408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 3564461 - 3564363
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| || |||||||||||||||    
T  3564461 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 3564363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17062056 - 17061895
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |  ||||||| ||||  | ||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||     
T  17062056 accgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaac-tcagcagtatacaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtcagcaacgtctcaat 17061958  T
Q  100 tatcaa-acataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    ||| || | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  17061957 tattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 17061895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 18430733 - 18430889
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||  |||  |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18430733 accgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 18430830  T
Q  99 atat-caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     ||| || | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  18430831 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 18430889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 26212020 - 26212122
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||    
T  26212020 accgactcatacaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaa 26212118  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  26212119 atat 26212122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 48273413 - 48273511
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  48273413 accgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 48273511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 12698855 - 12698907
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12698855 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 12698907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 75
Target Start/End: Original strand, 14036282 - 14036354
Alignment:
Q  5 actcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatc 75  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  14036282 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatc 14036354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 75
Target Start/End: Original strand, 14346312 - 14346384
Alignment:
Q  5 actcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatc 75  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  14346312 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatc 14346384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 16386345 - 16386292
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  16386345 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaa 16386292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 9509213 - 9509315
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||| | || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||    
T  9509213 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaa 9509311  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  9509312 atat 9509315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 40443415 - 40443462
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagta 48  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40443415 accgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagta 40443462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 27847927 - 27847881
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagt 47  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27847927 accgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagt 27847881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 49
Target Start/End: Original strand, 48991206 - 48991252
Alignment:
Q  3 cgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat 49  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  48991206 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtat 48991252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 44116530 - 44116691
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  44116530 accgactcatgcagcttggttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 44116627  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
     || ||| | |||||||    |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  44116628 ttattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 44116691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 54
Target Start/End: Original strand, 10589065 - 10589115
Alignment:
Q  3 cgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  10589065 cgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatatgcagtatacaaa 10589115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 24275192 - 24275289
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  24275192 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 24275289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22767 - 22486
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22767 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaa 22668  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||  ||    
T  22667 tatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaat----atgcatcagtcttactggaacagcaacatcaagacaa 22572  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||| | |||||||||    
T  22571 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttagcataagcaagactttctgtaac 22486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 80205 - 80115
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||    
T  80205 tcaactcataacaactcgtgcgacgaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaatactattgctcgcgaggcgagagcctctgct 80115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 1106 - 1390
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||    
T  1106 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatacaggtcatcaacatttcaaa 1205  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
     |||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  1206 catcaaacataattcatggaatgtatatacaactatataacattaacaacaacatcaaatcatatacatcagtcttactggaacaacaacaacaagataa 1305  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1306 aaaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgtgacaaagatcgcatttaacct-aacaaggcattctgtaac 1390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 15685 - 15996
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||| |    
T  15685 accgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa--atcaacaactcaatt 15782  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| | ||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  15783 atcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattatttcataagaatcagtcttactggatcattaacagcaaggtaaa 15882  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||    
T  15883 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcattccacctaaa-aaggcattctgtaacacaaaagctcgcgag 15981  T
Q  301 gcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||    
T  15982 gcgagagcctctgct 15996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18216 - 18159
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgt 282  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18216 tcaactcataacaactcgcacgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgt 18159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 11316 - 11602
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||| |    
T  11316 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa--atcaacaactcaatt 11413  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||||| ||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  11414 atcaaacttaagtcatgtaatgtatatactattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttacttgaacattaacaccaaggtaaa 11513  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaa 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  11514 caacttagtttctaacctctaagattaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcattcaacctaaaaagggcattctgtaacacaa 11602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 2021 - 2233
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||| |    
T  2021 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa--atcaacaactcaatt 2118  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2119 atcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagacttactggaacattaacagcaaggtaaa 2218  T
Q  201 caacttagtttctaa 215  Q
    |||||||||||||||    
T  2219 caacttagtttctaa 2233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 28438 - 28533
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatct 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  28438 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 4576 - 4608
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaaca 33  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4576 accgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 4608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 8490 - 8804
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  8490 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaa 8589  T
Q  100 tat-caaacataattcctttaatgtatatacaat--tatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaagg 196  Q
    ||| || | |||||||   |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||     
T  8590 tattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattcatatacatcagtcttactggaacaacatcagcaaga 8689  T
Q  197 taaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcg 296  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||    
T  8690 taaacaacttagtttcttacctctaagatcaattcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggcattctgtctcacaaggactcg 8788  T
Q  297 cgaggcgagagcctct 312  Q
    ||||||||| ||||||    
T  8789 cgaggcgagggcctct 8804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 6559 - 6843
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6559 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaa 6658  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| ||||| |||| |||| |     
T  6659 tatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagat- 6756  T
Q  199 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6757 aacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaaagatcgcatttatcctaaacaaggcattttgtaac 6843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 32560 - 32843
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  32560 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaatcaacaacatctcaaac 32659  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| |  | ||||   |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  32660 atcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaaaaacattagattatataattcaggcttactgaaacaataacaacaagataaa 32759  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  32760 caacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacc-caacaaggcattctgtaac 32843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 51980 - 51936
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcag 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  51980 accgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcag 51936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 19288 - 19603
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19288 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaa 19387  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  |||||  |||||| ||||| |||| |||| ||    
T  19388 tatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagggttactgaaacaacaacatcaagata 19486  T
Q  199 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||      | |||||    
T  19487 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaaggatcgcatttaacataagcaagacattctgtaactgggtcattcgcg 19586  T
Q  299 aggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||||    
T  19587 aggcgagagcctctgct 19603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 35 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2003
Alignment:
Q  35 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaatt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||    
T  2281 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcag-cataattcatataatgtatatacaatt 2183  T
Q  134 atataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactca 232  Q
    ||||| |||||  ||||||||    ||||||  | |||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2182 atataccattaacaacaacattggatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttattttctaacctctaagatcaactca 2083  T
Q  233 catcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctct 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2082 catcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagaccctct 2003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 133 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28775 - 28593
Alignment:
Q  133 tatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactca 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28775 tatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactca 28676  T
Q  233 catcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28675 catcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 28593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 28867 - 28806
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaa-acagcaacataggcagtatgcaaatcatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28867 accgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaatcatcat 28806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 2742 - 2457
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2742 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatgtaaatcatcatgttataacaatattgaatgcaaatcaacaacatctcaaa 2643  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcat-cagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  || ||| ||||||| ||||| | || |||| ||    
T  2642 tatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacatcagcaagata 2544  T
Q  199 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2543 aacaacttaatttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaaagatcgcatttatcctaaacaaggcattctgtaac 2457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 32122 - 32420
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||     
T  32122 accgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaatcatcaacgtctcaat 32221  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||    
T  32222 tatcaa-cataatccatttaatgtatata------tacaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataa 32314  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32315 acaacttagtttctaacctctaag----------atcaactagtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattatgtaacacaagtactcgcga 32404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 34147 - 34458
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||| |    
T  34147 accgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaacccatcatgatataataatatcgaatgtaa--atcaacaactcaatt 34244  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaa 200  Q
    ||||||| ||| ||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  34245 atcaaacttaagtcaagtaatatatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaaaattaacagcaaggtaaa 34344  T
Q  201 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||  | |||||||    
T  34345 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactagaacaacaaagatcgcattcaacctaaa-aaggaattatgtaacacaaaaaatcgcgag 34443  T
Q  301 gcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||    
T  34444 gcgagagcctctgct 34458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2903 - 2589
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2903 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 2804  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatata----caattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaataacaacaa 194  Q
    |||||  | |||||| |  ||||||||||    ||||||||   |||||  |||||||  |  ||||||  | |||| ||||||| ||||| |||| |||    
T  2803 tatcag-cttaattcataaaatgtatatatatacaattatac--cattaacaacaacaatagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaa 2707  T
Q  195 ggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtact 294  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2706 gataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcacatttttcctaaacaaggcattctgtaacacaagtact 2607  T
Q  295 cgcgaggcgagagcctct 312  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2606 cgcgaggcgagagcctct 2589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 10551 - 10862
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10551 accgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaa 10650  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
     ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |  | ||||   |||| ||||||| ||||| |||| |||| |||    
T  10651 catcgaacataattcatgtaatgtatatacaattatatgacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataa 10750  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagt-actcgcg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||  | || |||||||    
T  10751 acaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacagagatcgcatttaacct-aacaaggcattttggaac-taggtaactcgcg 10848  T
Q  299 aggcgagagcctct 312  Q
    ||||||||||||||    
T  10849 aggcgagagcctct 10862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 5667 - 5951
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5667 accgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatgaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaa 5766  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  5767 tatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacaacaagata 5865  T
Q  199 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  5866 aa-aacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaagaatcacatttagcctaaataaggcattctgtaac 5951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 6220 - 5935
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||    
T  6220 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcattaacatcataaa 6121  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||||||||| |||| |||    
T  6120 catcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaataacagcaagataa 6021  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    | |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6020 ataacttagtttttaacctccaagatcaactaacatcaacttgcgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattatgtaac 5935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14794 - 14509
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14794 accgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaagaaaatcatcatgatatagtaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaa 14695  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||  || ||||| |  ||||| |  ||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||    
T  14694 tatc-aacataattcatataatgtatatactattatataccattaacaaaaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagata 14596  T
Q  199 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14595 tacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgaccaagatcgcatttatcctaaacaaggcattctgtaac 14509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 29352 - 29063
Alignment:
Q  26 aacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtat 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||  | || || ||||| |||||||| ||| || | || |||||    
T  29352 aacaaacagcaacataggtagtattcaaactatcatgatataataatatcgaatgtaa--atcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtactgtat 29255  T
Q  126 atacaattatataacat---tataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaa 222  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29254 atacaattatataacataattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaa 29155  T
Q  223 gatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||    
T  29154 gatcaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcattcaacctaaa-aaggcattctgtaacacaaacgctcacgaggcgagagcctctgct 29063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8171 - 7864
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||    
T  8171 accgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaacaacatcaca 8072  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    |  |||| | ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||   |||| ||||||| |||||   || |||| |    
T  8071 ac-atcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaa---cagcaagat 7976  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgc 297  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||      ||||||    
T  7975 aaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaccct-aacaaggcattttgtaactgggcaactcgc 7877  T
Q  298 gaggcgagagcct 310  Q
    |||||||||||||    
T  7876 gaggcgagagcct 7864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 53640 - 53393
Alignment:
Q  7 tcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatat-ca 104  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  53640 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattca 53541  T
Q  105 aacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaac 204  Q
     | |||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||    
T  53540 tatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacataaagataaacaac 53441  T
Q  205 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53440 ttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 53393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8167 - 8077
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8167 tcaacccatatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacactagtgctcgcgaggcgagagcctctgct 8077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2494 - 2228
Alignment:
Q  46 gtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattat 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  | || || ||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2494 gtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa--atcagcaactcaattatcaaacttaagtcatttaatgtatatacaattatataacattat 2397  T
Q  146 aaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgc 245  Q
    || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  2396 aagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaatagcaaggtaaaaaacttagtttctaacctctaagatcaactcacataaactcgaac 2297  T
Q  246 gacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    | ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  2296 ggcaaagatcgcattcaacctaaa-aaggcattctgtaacacacacgctcgcgaggcgagagcctctgct 2228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 6635 - 6920
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | || |||   |||    
T  6635 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatgcaagttatcatcattataaa 6734  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||   |||  ||||||  ||||| |||| |||| |||    
T  6735 catcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagcttactaaaacaacaacagcaagataa 6834  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  6835 acaacttagattctaatctccaagttcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaatgcattctataac 6920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 14015 - 14300
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | || |||   |||    
T  14015 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatgcaagttatcatcattataaa 14114  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||   |||  ||||||  ||||| |||| |||| |||    
T  14115 catcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagcttactaaaacaacaacagcaagataa 14214  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14215 acaacttagattctaatctccaagttcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaatgcattctataac 14300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1131 - 847
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  |||    
T  1131 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgcagatcatcatgatataacaacatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 1032  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatca-attcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||  ||    |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  1031 catcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatt--tacaattcaggcttactgaaacaacaacaacaagata 934  T
Q  199 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    || ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  933 aataacttagtttctaacttccaagatcaactaacatcaacttgcgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattatgtaac 847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8158 - 7844
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaat-caacaacatctca 97  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||| |    
T  8158 accgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatcagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacatctta 8059  T
Q  98 aatat-caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaagg 196  Q
    || || || | |||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | || ||||     
T  8058 aacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtctcactggaacaacatcagcaaga 7959  T
Q  197 taaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagt-actc 295  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| | || ||||    
T  7958 taaacaacttagtttcatacctctaagatcaactcacatcaattcttgcgacaaagatcgcatttaacct-agcaaggcattctggaaca-aggtaactc 7861  T
Q  296 gcgaggcgagagcctct 312  Q
    |||||||||||||||||    
T  7860 gcgaggcgagagcctct 7844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 133 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2267 - 2085
Alignment:
Q  133 tatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactca 232  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2267 tatacaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactgggataagatcagtaagataaacaacttagtttctaacctctaagattaactca 2168  T
Q  233 catcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2167 catccactcgtgcgacaaggatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 2085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 12592 - 12903
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  12592 accgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaa 12691  T
Q  100 ta-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
    || | | | |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||| || ||||||| ||||| |||| |||| ||    
T  12692 tacttatatataattcagt-aatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaataatacacattagacttactgaaacaacaacagcaagata 12790  T
Q  199 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcg 298  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||  ||||||  | || |  ||||||    
T  12791 aacaacttagtttattacctctaagatcaactcacatccactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgtctctcatgagctcgcg 12889  T
Q  299 aggcgagagcctct 312  Q
    ||||||||||||||    
T  12890 aggcgagagcctct 12903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 12963 - 13247
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||    
T  12963 accgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcagcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 13062  T
Q  100 tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaa 199  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | ||     |||| ||||||| ||||| |||| |||| |||    
T  13063 catcaaacataattcgtgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatccaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataa 13162  T
Q  200 acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13163 ataacttagtttctaatctccatgatcaactcacatcaactcgtgtgacaaagatcacatttaacct-aacaaggcattctgtaac 13247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18277 - 18024
Alignment:
Q  58 tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatca 156  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||    
T  18277 tcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatca 18178  T
Q  157 attcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattg 256  Q
    |  |||||   |||| ||||||| ||||| ||||   || ||| ||||||||||||| ||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||| |      
T  18177 aaacatataattcaggcttactgaaacaacaacagtgagataagcaacttagtttcttacccccatgatcatctcacatcaactcgtgcgacaaaggtca 18078  T
Q  257 catttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctc 311  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  18077 catttaacct-aacaaggtattctgtctcactagggctcgcgaggcgagagcctc 18024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6381 - 6068
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  6381 accgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctca 6282  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    || |||| | ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||   || |    
T  6281 aacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtgagat 6182  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgc 297  Q
    || ||||||||||||| ||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||| |  ||| ||  |||||    
T  6181 aagcaacttagtttcttacccccatgatcatctcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtattctatctcactagggctcgc 6083  T
Q  298 gaggcgagagcctct 312  Q
    |||| ||||||||||    
T  6082 gaggtgagagcctct 6068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 13835 - 13793
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacatagg 43  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  13835 accgactcatgcagcttagttaatgaacaaacaacaacatagg 13793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 38340 - 38653
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  38340 accgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatctca 38439  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    || |||| | ||||||| | ||||| |||||||  ||||| ||||||    ||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||  ||| |    
T  38440 aacatcatatataattcatgtaatgcatatacatatatatcacattaatctcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagat 38539  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgc 297  Q
    || ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||  ||||||| |||||||  ||||||  |||||    
T  38540 aagcaacttagtttcttacccccgtgatcaactcacatcaactcgtgcgataaaggtctcatttaacc-caacaaggtattctgtctcacaagggctcgc 38638  T
Q  298 gaggcgagagcctct 312  Q
    |||||||||||||||    
T  38639 gaggcgagagcctct 38653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 129067 - 128756
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  129067 accgactcatgcagcttagttaat-aacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctca 128969  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    || |||| | ||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| ||||| ||||  ||| |    
T  128968 aacatcatatataattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaacagtaagat 128869  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgc 297  Q
    || ||||||||||||| ||| | | |||||||||| | || |||||||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||   ||| |  |||||    
T  128868 aagcaacttagtttcttacc-ccatgatcaactcataacatctcgtgcgacaaagatcgca-acaacctaaacaaggtattctgtcttacaggagctcgc 128771  T
Q  298 gaggcgagagcctct 312  Q
    |||||||||||||||    
T  128770 gaggcgagagcctct 128756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 78346 - 78648
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  78346 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctca 78444  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    |  |||    ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||  ||| |    
T  78445 ac-atcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagat 78543  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgc 297  Q
    || |||||||||| || ||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||| |||||||  ||||||  ||||||| |||||    
T  78544 aagcaacttagttgcttacccccatgatcaactcacatcaactcatgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgtctcacaagtgctcgc 78642  T
Q  298 gaggcg 303  Q
    ||||||    
T  78643 gaggcg 78648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 116451 - 116551
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |  |||||| |||| || ||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  116451 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataatcatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 116548  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  116549 tat 116551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 136466 - 136196
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  136466 accgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatcaca 136367  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaat-tcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaagg 196  Q
       |||  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||  ||||||   |||| ||||||| ||||| |||| ||||     
T  136366 tc-atcgtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaaga 136268  T
Q  197 taaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaa 268  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  136267 taaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgtacgacaaaggtcacatttaacctaa 136196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 145174 - 144904
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  145174 accgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatcaca 145075  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaat-tcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaagg 196  Q
       |||  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||  ||||||   |||| ||||||| ||||| |||| ||||     
T  145074 tc-atcgtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaaga 144976  T
Q  197 taaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaa 268  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  144975 taaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgtacgacaaaggtcacatttaacctaa 144904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 174790 - 174838
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat 49  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  174790 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 174838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 121790 - 121835
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagt 47  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  121790 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 252
Target Start/End: Original strand, 97033 - 97282
Alignment:
Q  5 actcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaata 101  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  97033 actcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca 97132  T
Q  102 tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaac 201  Q
    ||| | ||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| ||||| ||||  |||  || |    
T  97133 tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacagtaagaaaagc 97232  T
Q  202 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 252  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  97233 aacttagtttcttacc-ccatgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 97282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 252
Target Start/End: Original strand, 106311 - 106560
Alignment:
Q  5 actcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaata 101  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  106311 actcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca 106410  T
Q  102 tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaac 201  Q
    ||| | ||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| ||||| ||||  |||  || |    
T  106411 tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacagtaagaaaagc 106510  T
Q  202 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 252  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106511 aacttagtttcttacc-ccatgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 106560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19982 - 19697
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaat-caacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19982 accgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctca 19883  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
       |||| | |||| || | ||||| ||||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |    
T  19882 gc-atcataaataactcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaataacatcaaatcatataattcatgcttactggaacaacaacagtaagat 19784  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    || ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||| |||||||  |||||||||    
T  19783 aagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcatatcaacccgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgtaac 19697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 102
Target Start/End: Original strand, 39941 - 40038
Alignment:
Q  5 actcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgca-atcaacaacatctcaaatat 102  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  39941 actcatgcagcttaattaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcatgtcaataacatcttaaatat 40038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 48995 - 48921
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  48995 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 48921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 312
Target Start/End: Original strand, 54 - 341
Alignment:
Q  27 acaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||| ||  ||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||| | ||||||| | |||||     
T  54 acaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgc 153  T
Q  124 atatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |   | || ||||||| ||||| ||||  ||| ||  ||||||||||||| ||| | | |    
T  154 atatacatttatataacattattaacaacatcaaatcatttaatttaggcttactgaaacaacaacagtaagatatgcaacttagtttcttacccccatg 253  T
Q  224 atcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctct 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  254 atcaactcacatcaacttgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtattctgtctcacaagggctcacgaggcgagagcctct 341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1166 - 1013
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||| |    
T  1166 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa--atcaacaactcaatt 1069  T
Q  101 atcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
    |||| || ||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1068 atcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattat-aacaacatcaa 1013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 103728 - 103467
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaa 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |        
T  103728 accgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaa--aacaacaac---- 103635  T
Q  99 atatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggta 198  Q
      |||| ||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||  |||||||| || ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||  ||| ||    
T  103634 --atcatacataattcatgtaatgtatatacaactacataacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaggaagata 103537  T
Q  199 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaa 268  Q
    || |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  103536 aagaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgtacgacaaaggtcacatttaacctaa 103467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 23980 - 23895
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatca 86  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23980 accgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatca 23895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 168 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15761 - 15644
Alignment:
Q  168 tcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaaccta 267  Q
    |||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  15761 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaatctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcacatttaacata 15662  T
Q  268 aacaaggcattctgtaac 285  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15661 aacaaggcattctgtaac 15644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 15874 - 15792
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15874 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatgcaa 15792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Original strand, 11491 - 11651
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaat-a 101  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| |    
T  11491 gactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataa 11590  T
Q  102 tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11591 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 11651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 38350 - 38190
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaat-a 101  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| |    
T  38350 gactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataa 38251  T
Q  102 tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38250 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 38190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24524 - 24434
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||| | |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24524 tcaactcataacaactcgtactacaaggatcgcatttaacctaaacatgacattctgtaacacaagtgctcgcgaggcgagagcctctgct 24434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 574 - 841
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |     
T  574 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatc-cc 671  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    || |||| | ||||||| | ||||| ||||||| | |||| | |||||  | || ||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||   || |    
T  672 aacatcatatataattcatgtaatgcatatacattaatatcatattatttaaaagatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagttagat 771  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaa 268  Q
    |||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  772 aaacaacttagtttcttacc-atatgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtctcatttaacctaa 841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27846 - 27683
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg-caatcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  27846 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaacatctcaaa 27747  T
Q  100 ta-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
     | ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  27746 cattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcat 27683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 13152 - 13316
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  13152 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctgaaa 13251  T
Q  100 --tatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
        ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  13252 ccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcat 13316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16197 - 16034
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg-caatcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  16197 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaacatctcaaa 16098  T
Q  100 ta-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
     | ||  | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  16097 cattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcat 16034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 2685 - 2732
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagta 48  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  2685 accgactcatgcagcttagttaataaacaagcaacaacataggcagta 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18121 - 17961
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaata- 101  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||     
T  18121 gactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatat 18022  T
Q  102 tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18021 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 17961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1895 - 1642
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||| |||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1895 accgactcatgcagcttagttattaaactaacattaacataggtagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctca 1796  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggt 197  Q
    |  |||| | ||||||  | ||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||||   |||| ||||||||||||| || |  ||| |    
T  1795 ac-atcatatataatttatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactggaacaacaatagtaagat 1697  T
Q  198 aaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 252  Q
    |  ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1696 aggcaacttagtttcttaccctcaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 1642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 1056 - 1158
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||    
T  1056 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacatctcaaa 1155  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  1156 tat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Original strand, 10158 - 10248
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10158 tcaactcataacaactcgtacgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtgctcgcgaggcgagagcctctgct 10248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 25130 - 25276
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25130 accgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaacaacatctca 25228  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattat 145  Q
    || |||| | ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25229 aacatcatatataattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattat 25276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 164
Target Start/End: Original strand, 619 - 725
Alignment:
Q  58 tcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||| |||| | ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  619 tcatgatataacaatatcaaagcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaa 718  T
Q  158 ttcatat 164  Q
     ||||||    
T  719 atcatat 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 312
Target Start/End: Original strand, 25353 - 25441
Alignment:
Q  223 gatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctct 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||| ||| |||  ||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  25353 gatcaactcacaacaactcgtgcgacaaaggtcacatttatcct-aacaaggtattatgtctcacaagggctcgcgagacgagaacctct 25441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 267684 - 267986
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctca 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||     
T  267684 accgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaatatctc- 267782  T
Q  98 aatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcat-cagtcttactggaacaataacaacaagg 196  Q
    || |||| | ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||||| | ||  |||     
T  267783 aacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaatcatat-catccaggcttactgaaacaacagcagtaagc 267881  T
Q  197 taaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcg 296  Q
    ||| ||||||||||||| |||  || |          ||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||  ||||||  |||||| |||||    
T  267882 taagcaacttagtttcttacccttatg----------atcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgtctcacaaggactcg 267970  T
Q  297 cgaggcgagagcctct 312  Q
    ||||||||||||||||    
T  267971 cgaggcgagagcctct 267986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3247 - 3090
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3247 accgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 3149  T
Q  100 tat-caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
    ||| ||  ||||||||   ||||| |||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  3148 tatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 3090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 237 - 315
Target Start/End: Original strand, 288 - 366
Alignment:
Q  237 aactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  288 aactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgct 366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 148
Target Start/End: Original strand, 32 - 92
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaa 148  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  32 caacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 92  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9707 - 9617
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9707 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgct 9617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 38795 - 38641
Alignment:
Q  5 actcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaata-t 102  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||| |    
T  38795 actcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatatt 38696  T
Q  103 caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     | | |||||||   || ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  38695 tatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 38641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 162
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225593
Alignment:
Q  35 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaatt 133  Q
    |||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||   ||||| ||||||||||    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaatt 225564  T
Q  134 atataacattataaacaacatcaattcat 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  225565 atatcacattataaacaacatcaaatcat 225593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 207392 - 207302
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  207392 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaagcattgtgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgct 207302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 1875 - 1977
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||    
T  1875 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaa 1973  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  1974 atat 1977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 207529 - 207467
Alignment:
Q  88 caacatctcaaatatcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaaca 150  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  207529 caacatttcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatataattatataacattataaaca 207467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7644 - 7554
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||| | |||||||| | |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7644 tcaactcataacaactcgtactacaaggatctcatttaacctaaacatggcattctgtaacacaagtgctcgcgaggcgagagcctctgct 7554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 39501 - 39602
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39501 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 39599  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  39600 tat 39602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 75311 - 75210
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  75311 accgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 75213  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  75212 tat 75210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 312
Target Start/End: Original strand, 9133 - 9410
Alignment:
Q  32 cagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatatca--aacataattcctttaatgtatata 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    ||||||  ||||||| || |  ||||| ||||    
T  9133 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaacttc----atatcatcaacataaatcatgcaatgtttata 9228  T
Q  129 caattatataacattataaacaacatcaattcat--atgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatc 226  Q
    || || | |||||| ||   |||||||| |  ||  |   || || || |||||||||  |||| || | ||  ||||||||||  |||| |||||||||    
T  9229 catttgtttaacatcat---caacatcattggattaaacaattagactcactggaacatcaacagcatgctaggcaacttagttcttaacatctaagatc 9325  T
Q  227 aactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagta-ctcgcgaggcgagagcctct 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||    
T  9326 aactcacaacaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacct-agcaaggcattctgtaa-atgggtagctcgcgaggcgagagcctct 9410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 2699 - 2790
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaa 90  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2699 accgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaatcaacaa 2790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 3283 - 3185
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||    
T  3283 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgtaattcaacaacatctcaa 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12681 - 12592
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgct 315  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||    
T  12681 tcaactcataacaactcgtgcgacaagaatcgcatttaacctaaacaa-gcattctgtaatactagtgcttgcgaggcgagagcctctgct 12592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 25920 - 26021
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  25920 accgactcatgaagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacatctcaaa 26018  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  26019 tat 26021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 102
Target Start/End: Original strand, 39886 - 39983
Alignment:
Q  5 actcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatat 102  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  39886 actcatgaagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacatctcaaatat 39983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 340044 - 339889
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatcaacaacatctcaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||  | ||||||||||||||| |    
T  340044 accgactcatgcagcttagttaaataaca--caacaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatcaagtcaacaacatctcaagt 339947  T
Q  101 at-caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
    || ||  ||||||||   |||||| ||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  339946 atacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 339889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 4873 - 4968
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatct 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  4873 accgactcatgcagattagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaattcaacaacatct 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 44801 - 44702
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaata 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  44801 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaata 44703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 26162 - 26064
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| || |||||||| ||||||    
T  26162 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaattcaacaacgtctcaa 26064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 51606 - 51654
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat 49  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51606 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 51654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 17314 - 17214
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc---aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |   ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17314 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctc 17216  T
Q  97 aa 98  Q
    ||    
T  17215 aa 17214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 32966 - 33067
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||| |||    
T  32966 accgactcatgcagcttaattaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagttaacaacatcttaaa 33064  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  33065 tat 33067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 38785 - 38886
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||| ||| |||||||||| |||    
T  38785 accgagtcatgcagcttaattaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaataaacaacatcttaaa 38883  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  38884 tat 38886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 33053 - 32952
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| |||    
T  33053 accgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaa 32955  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  32954 tat 32952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 45952 - 46053
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| |||    
T  45952 accgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaa 46050  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  46051 tat 46053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 16137 - 16189
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  16137 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaa 16189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 1313 - 1359
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagt 47  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1313 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 1359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 7290 - 7338
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat 49  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  7290 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 7338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 15335 - 15291
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcag 46  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  15335 accgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcag 15291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 20519 - 20372
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||     
T  20519 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-tcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaat 20422  T
Q  100 ta-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaa 148  Q
    || ||| | |||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  20421 tattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaa 20372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 285
Target Start/End: Original strand, 3195 - 3239
Alignment:
Q  241 cgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3195 cgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaac 3239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 16306 - 16354
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat 49  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16306 accgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtat 16354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 13521 - 13582
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatga 63  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  13521 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatga 13582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 24400 - 24348
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24400 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 24348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 1976 - 2091
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||| |||||||||||| ||    
T  1976 accgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaattgcaattcaacaacatcttaa 2074  T
Q  99 ata-tcaaacataattc 114  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  2075 atattcaaacattattc 2091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 10520 - 10472
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat 49  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10520 accgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtat 10472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 305
Target Start/End: Original strand, 13811 - 13891
Alignment:
Q  225 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgag 305  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||   |||||  |||||||||||||    
T  13811 tcaactcataacaactcgcgcgacaaagatcgcatttaacctaaaccaggaattctgtcttacaagagctcgcgaggcgag 13891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 11540 - 11488
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  11540 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggtagtatacaaa 11488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 102
Target Start/End: Original strand, 13238 - 13337
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaata 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| |||||    
T  13238 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaata 13336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 4715 - 4871
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  4715 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 4812  T
Q  99 ata-tcaaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 157  Q
     || ||| | |||||||   ||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  4813 ttattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 4871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 10794 - 10891
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  10794 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15557 - 15487
Alignment:
Q  4 gactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 75  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  15557 gactcatgcagcttagttaaataacaag-agcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatc 15487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 32091 - 32137
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagta 48  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  32091 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 32137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 51937 - 52039
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||    
T  51937 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaa 52035  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  52036 atat 52039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 168075 - 168023
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  168075 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaa 168023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 5225 - 5183
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacatagg 43  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  5225 accgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacatagg 5183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 47019 - 47065
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagt 47  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47019 accgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 47065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 1145 - 1093
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  1145 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaa 1093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 251
Target Start/End: Original strand, 165 - 297
Alignment:
Q  118 taatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacc 217  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| |||||| |||||| || |  ||  ||||||||||  ||||  |||    
T  165 taatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttact-gaacaacaatagtaatataaacaacttcatttcctacc 263  T
Q  218 tctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaa 251  Q
     | | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  264 ccaaggatcgactcacaacaactcgtgcgacaaa 297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 4736 - 4788
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  4736 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaa 4788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 8626 - 8528
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||  ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| |||    
T  8626 accgactcatgcagcttagttaaa----taacagcaacataggcagtatcaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaa 8531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 281
Target Start/End: Original strand, 26847 - 26892
Alignment:
Q  236 caactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaaggcattctg 281  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26847 caactcgcgcgacaaagatcacatttaacctaaacaaggcattctg 26892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 1146 - 1098
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat 49  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  1146 accgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtat 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 20934 - 21030
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatct 95  Q
    ||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  20934 accgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatct 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 3494 - 3596
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||    
T  3494 accgactcatgtagcttagttaaataactaa-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaa 3592  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  3593 atat 3596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 367 - 468
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||  | |||||  ||| |||||| | || || |||||||||||| |||    
T  367 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacaataacataggcagtatacaaaatagcatgacgtaataatatcaattggaagtcaacaacatcttaaa 465  T
Q  100 tat 102  Q
    |||    
T  466 tat 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 4532 - 4633
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||  |||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4532 accgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 4629  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  4630 atat 4633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 12114 - 12215
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||  |||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12114 accgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 12211  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  12212 atat 12215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 22066 - 22167
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||  |||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22066 accgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 22163  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  22164 atat 22167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16697 - 16599
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| || |||||| ||||||||    
T  16697 accgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatggaagtcaacagcatctcaa 16599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 206619 - 206575
Alignment:
Q  3 cgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagta 48  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  206619 cgactcatgcagcttagttaataaac-aacagcaacataggcagta 206575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 6221 - 6166
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaaca--aacagcaacataggcagtatgcaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  6221 accgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaa 6166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 157
Target Start/End: Original strand, 27912 - 28012
Alignment:
Q  59 catgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatat-caaacataattcctttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatca 156  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||   ||||| |||||  ||||||| |||| |||| ||||||||    
T  27912 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatca 28011  T
Q  157 a 157  Q
    |    
T  28012 a 28012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 4548 - 4599
Alignment:
Q  1 accgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaa 53  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||    
T  4548 accgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacagcataggcagtatgcaa 4599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University