View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1094_high_3 (Length: 356)

Name: NF1094_high_3
Description: NF1094
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1094_high_3
NF1094_high_3
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (1-328)||(1901-2228)
scaffold0234 (1-328)||(10792-11119)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (1-328)||(17691020-17691347)
chr6 (1-328)||(27380832-27381159)
chr6 (1-328)||(27471215-27471542)
chr6 (1-328)||(11652023-11652350)
chr6 (1-328)||(17684049-17684376)
chr6 (1-328)||(27296929-27297256)
chr6 (1-328)||(29309190-29309517)
chr6 (1-328)||(29316150-29316476)
chr6 (1-321)||(25536778-25537098)
chr6 (1-328)||(16559052-16559379)
chr6 (1-328)||(16394035-16394352)
chr6 (1-188)||(188697-188884)
chr6 (30-331)||(13358852-13359152)
chr6 (27-265)||(2669616-2669854)
chr6 (198-328)||(18336152-18336282)
chr6 (1-228)||(27508307-27508530)
chr6 (30-241)||(17120453-17120662)
chr6 (1-228)||(14074599-14074822)
chr6 (1-228)||(22859848-22860071)
chr6 (32-275)||(28756041-28756283)
chr6 (27-237)||(10359002-10359211)
chr6 (75-228)||(33317055-33317207)
chr6 (1-228)||(1586068-1586291)
chr6 (1-228)||(16789190-16789413)
chr6 (47-275)||(28172899-28173128)
chr6 (30-228)||(8613064-8613261)
chr6 (149-328)||(13194342-13194519)
chr6 (1-174)||(27527947-27528116)
chr6 (27-208)||(8510246-8510428)
chr6 (152-282)||(19346957-19347086)
chr6 (168-241)||(22560142-22560214)
chr6 (27-85)||(17850321-17850379)
chr6 (19-209)||(21994723-21994911)
chr6 (170-228)||(27525521-27525579)
chr6 (21-241)||(20736277-20736494)
chr6 (1-91)||(19218543-19218630)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (1-328)||(8858467-8858794)
chr4 (1-328)||(18262512-18262839)
chr4 (1-328)||(18269373-18269700)
chr4 (1-328)||(5707620-5707947)
chr4 (1-328)||(5714248-5714575)
chr4 (1-328)||(26963940-26964267)
chr4 (1-328)||(55612983-55613310)
chr4 (1-328)||(19926340-19926667)
chr4 (1-328)||(26970763-26971090)
chr4 (1-328)||(28392714-28393041)
chr4 (1-328)||(868897-869224)
chr4 (1-328)||(10620913-10621240)
chr4 (1-328)||(10627992-10628319)
chr4 (1-328)||(8845503-8845830)
chr4 (1-328)||(5667711-5668034)
chr4 (42-328)||(4426195-4426482)
chr4 (1-319)||(35223860-35224176)
chr4 (1-314)||(10677171-10677489)
chr4 (1-314)||(10890811-10891129)
chr4 (40-328)||(20311628-20311914)
chr4 (1-228)||(3368983-3369206)
chr4 (79-311)||(9937594-9937826)
chr4 (1-228)||(34975670-34975893)
chr4 (1-228)||(1941843-1942066)
chr4 (1-228)||(2677132-2677355)
chr4 (1-228)||(15461616-15461839)
chr4 (1-228)||(15815140-15815363)
chr4 (1-228)||(18111003-18111226)
chr4 (1-228)||(26531732-26531955)
chr4 (60-302)||(24701361-24701601)
chr4 (19-241)||(30040437-30040656)
chr4 (1-228)||(17299919-17300142)
chr4 (1-228)||(18163281-18163504)
chr4 (1-228)||(20244056-20244279)
chr4 (20-241)||(5528426-5528645)
chr4 (1-228)||(4675943-4676166)
chr4 (130-310)||(22805511-22805691)
chr4 (26-241)||(5616536-5616750)
chr4 (26-241)||(9538100-9538313)
chr4 (26-234)||(19362551-19362758)
chr4 (26-241)||(19365660-19365875)
chr4 (243-314)||(10689821-10689892)
chr4 (243-314)||(10903461-10903532)
chr4 (1-213)||(11421126-11421334)
chr4 (1-228)||(5870537-5870759)
chr4 (1-228)||(9487670-9487893)
chr4 (155-228)||(4546331-4546404)
chr4 (1-241)||(32636603-32636838)
chr4 (182-321)||(27031240-27031377)
chr4 (1-87)||(21453961-21454046)
chr4 (55-246)||(32646467-32646656)
chr4 (32-226)||(23056025-23056218)
chr4 (165-246)||(43707223-43707304)
chr4 (20-91)||(33888672-33888743)
chr4 (155-265)||(468954-469063)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (1-328)||(18252330-18252657)
chr1 (1-328)||(18532094-18532421)
chr1 (1-328)||(27130990-27131316)
chr1 (1-328)||(27310157-27310484)
chr1 (1-328)||(16358615-16358942)
chr1 (1-328)||(3855499-3855826)
chr1 (5-328)||(22641456-22641777)
chr1 (9-328)||(27277140-27277456)
chr1 (1-328)||(36816216-36816540)
chr1 (1-249)||(9916437-9916683)
chr1 (33-328)||(23507229-23507525)
chr1 (41-311)||(12013885-12014154)
chr1 (1-228)||(20391199-20391422)
chr1 (148-321)||(31234511-31234681)
chr1 (1-228)||(9456235-9456458)
chr1 (1-228)||(20779605-20779828)
chr1 (1-228)||(22670217-22670440)
chr1 (1-228)||(42816949-42817172)
chr1 (1-228)||(43802325-43802548)
chr1 (1-228)||(19706399-19706622)
chr1 (1-228)||(28134683-28134906)
chr1 (1-219)||(634053-634267)
chr1 (17-228)||(47667445-47667654)
chr1 (1-240)||(8727786-8728020)
chr1 (140-311)||(12006144-12006313)
chr1 (1-228)||(22612611-22612834)
chr1 (1-60)||(21171081-21171140)
chr1 (60-213)||(28145698-28145850)
chr1 (18-327)||(24301466-24301774)
chr1 (19-241)||(29096857-29097077)
chr1 (192-328)||(51550669-51550803)
chr1 (1-88)||(21881475-21881559)
chr1 (27-86)||(10852402-10852461)
chr1 (154-259)||(10852234-10852338)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (1-328)||(8490795-8491122)
chr3 (1-328)||(16482063-16482390)
chr3 (1-328)||(15357166-15357493)
chr3 (1-328)||(15600464-15600791)
chr3 (1-328)||(15607009-15607336)
chr3 (1-328)||(6110364-6110691)
chr3 (1-328)||(10572172-10572499)
chr3 (1-328)||(10578936-10579262)
chr3 (1-328)||(13211602-13211929)
chr3 (1-328)||(13248907-13249234)
chr3 (1-328)||(15341799-15342126)
chr3 (1-328)||(17780698-17781025)
chr3 (1-328)||(32056478-32056806)
chr3 (1-328)||(18520275-18520602)
chr3 (1-328)||(13517111-13517434)
chr3 (2-328)||(18522964-18523289)
chr3 (1-328)||(1647101-1647428)
chr3 (1-328)||(17136653-17136980)
chr3 (1-283)||(17199809-17200091)
chr3 (1-328)||(29974424-29974750)
chr3 (1-328)||(29925271-29925596)
chr3 (1-243)||(16200730-16200972)
chr3 (3-228)||(28088227-28088448)
chr3 (1-228)||(21034357-21034580)
chr3 (1-228)||(12300029-12300252)
chr3 (1-228)||(20147514-20147737)
chr3 (129-322)||(9504737-9504928)
chr3 (1-213)||(25978703-25978911)
chr3 (1-228)||(21398911-21399134)
chr3 (1-228)||(55427140-55427363)
chr3 (1-228)||(15846496-15846719)
chr3 (228-328)||(23014940-23015039)
chr3 (1-241)||(14890510-14890746)
chr3 (32-212)||(24253088-24253267)
chr3 (30-212)||(15317152-15317330)
chr3 (35-228)||(30464147-30464338)
chr3 (124-228)||(11787825-11787929)
chr3 (21-154)||(15526890-15527021)
chr3 (149-234)||(15537798-15537883)
chr3 (19-241)||(14147156-14147375)
chr3 (104-220)||(26816510-26816626)
chr3 (27-91)||(36138033-36138097)
chr3 (279-328)||(17197335-17197383)
chr3 (182-244)||(16240835-16240897)
chr3 (26-55)||(32280415-32280444)
chr3 (27-91)||(36142816-36142880)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (1-328)||(15152743-15153070)
chr7 (1-328)||(29328084-29328411)
chr7 (1-328)||(12751126-12751453)
chr7 (1-328)||(11535642-11535969)
chr7 (1-328)||(11542560-11542887)
chr7 (1-309)||(12738836-12739144)
chr7 (1-328)||(18561307-18561625)
chr7 (1-328)||(13392450-13392775)
chr7 (17-281)||(2365236-2365500)
chr7 (22-237)||(18257516-18257730)
chr7 (1-228)||(41680928-41681151)
chr7 (1-228)||(2204671-2204894)
chr7 (1-228)||(8465118-8465341)
chr7 (1-228)||(18400223-18400446)
chr7 (1-228)||(18407207-18407430)
chr7 (1-228)||(48808456-48808679)
chr7 (1-228)||(18139298-18139521)
chr7 (1-228)||(47166819-47167042)
chr7 (30-228)||(34128718-34128915)
chr7 (1-228)||(15729870-15730093)
chr7 (1-228)||(30254257-30254480)
chr7 (30-212)||(18259100-18259281)
chr7 (30-228)||(28130706-28130903)
chr7 (40-320)||(39112138-39112414)
chr7 (1-228)||(10668861-10669085)
chr7 (134-316)||(10235592-10235773)
chr7 (141-314)||(7396650-7396821)
chr7 (1-213)||(15169265-15169473)
chr7 (1-213)||(19231007-19231215)
chr7 (1-241)||(25845423-25845659)
chr7 (1-241)||(25845842-25846078)
chr7 (1-228)||(19393384-19393607)
chr7 (30-241)||(31190387-31190596)
chr7 (19-241)||(14591985-14592205)
chr7 (39-216)||(22948397-22948574)
chr7 (19-202)||(24443313-24443494)
chr7 (127-237)||(2635317-2635427)
chr7 (26-91)||(19388697-19388762)
chr7 (19-210)||(16011576-16011766)
chr7 (195-267)||(7662321-7662392)
chr7 (288-328)||(11546520-11546560)
chr7 (1-88)||(22969069-22969153)
chr7 (34-97)||(29984308-29984371)
chr7 (127-225)||(47833653-47833751)
chr7 (26-91)||(3588054-3588118)
chr7 (152-241)||(12409793-12409882)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (1-328)||(21329828-21330155)
chr2 (1-328)||(18796806-18797133)
chr2 (1-314)||(18620104-18620414)
chr2 (192-328)||(22791438-22791574)
chr2 (25-321)||(17241034-17241329)
chr2 (41-327)||(36270503-36270786)
chr2 (121-328)||(41661694-41661899)
chr2 (27-314)||(6991709-6991996)
chr2 (41-328)||(22183069-22183354)
chr2 (55-328)||(18822435-18822705)
chr2 (2-241)||(15341949-15342184)
chr2 (41-281)||(36799576-36799826)
chr2 (1-228)||(30174496-30174719)
chr2 (1-228)||(24249992-24250215)
chr2 (131-308)||(12298232-12298407)
chr2 (1-228)||(24229175-24229398)
chr2 (1-241)||(29800590-29800826)
chr2 (20-228)||(19616571-19616777)
chr2 (20-199)||(20978192-20978371)
chr2 (125-241)||(24763619-24763733)
chr2 (27-244)||(40300881-40301097)
chr2 (26-91)||(21626890-21626955)
chr2 (27-91)||(28740922-28740986)
chr2 (147-236)||(24471175-24471264)
chr2 (26-163)||(41316305-41316441)
chr2 (275-328)||(23662022-23662075)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (1-328)||(7407-7734)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (1-328)||(6514-6841)
scaffold0390 (1-328)||(13530-13857)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-328)||(18588-18914)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (1-328)||(15326498-15326825)
chr8 (1-328)||(15506867-15507194)
chr8 (1-328)||(22171787-22172113)
chr8 (1-328)||(21940965-21941292)
chr8 (1-328)||(6094423-6094750)
chr8 (47-328)||(28548393-28548674)
chr8 (1-328)||(24642949-24643274)
chr8 (81-313)||(24796599-24796826)
chr8 (1-220)||(22659462-22659677)
chr8 (1-228)||(8371213-8371436)
chr8 (1-228)||(27007477-27007700)
chr8 (1-228)||(27014620-27014843)
chr8 (1-228)||(27880447-27880670)
chr8 (1-228)||(28020628-28020851)
chr8 (1-218)||(14983619-14983828)
chr8 (1-228)||(22130569-22130792)
chr8 (19-241)||(8781822-8782042)
chr8 (1-228)||(6431005-6431228)
chr8 (1-228)||(12562242-12562465)
chr8 (1-228)||(21969452-21969675)
chr8 (1-228)||(25611314-25611537)
chr8 (27-328)||(32872430-32872729)
chr8 (1-220)||(21916795-21917010)
chr8 (1-73)||(24797224-24797295)
chr8 (1-228)||(45534233-45534456)
chr8 (30-228)||(2962892-2963089)
chr8 (26-241)||(20535157-20535371)
chr8 (199-321)||(8967891-8968013)
chr8 (203-328)||(17083675-17083800)
chr8 (75-219)||(2375411-2375555)
chr8 (90-281)||(38232005-38232197)
chr8 (1-213)||(26240603-26240811)
chr8 (141-248)||(27098936-27099043)
chr8 (216-328)||(14979062-14979173)
chr8 (25-91)||(18835490-18835556)
chr8 (30-192)||(36970394-36970555)
chr8 (285-313)||(29645894-29645922)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (1-328)||(25570-25897)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (1-328)||(19714078-19714405)
chr5 (1-328)||(24695038-24695373)
chr5 (1-328)||(19706799-19707125)
chr5 (81-328)||(24701802-24702057)
chr5 (1-204)||(18569565-18569768)
chr5 (16-328)||(17298483-17298793)
chr5 (14-220)||(27347224-27347428)
chr5 (32-281)||(17285377-17285627)
chr5 (107-321)||(39538954-39539168)
chr5 (103-314)||(28719351-28719558)
chr5 (148-321)||(17283045-17283216)
chr5 (200-328)||(18568080-18568206)
chr5 (1-228)||(32018-32241)
chr5 (1-228)||(12789623-12789846)
chr5 (1-228)||(22941369-22941592)
chr5 (1-228)||(23546041-23546264)
chr5 (1-228)||(20941146-20941369)
chr5 (1-228)||(24933266-24933489)
chr5 (1-228)||(25805345-25805568)
chr5 (1-228)||(31096935-31097158)
chr5 (19-214)||(20100217-20100410)
chr5 (30-228)||(7865390-7865587)
chr5 (30-228)||(12764950-12765147)
chr5 (1-241)||(5097770-5098005)
chr5 (148-275)||(18829195-18829324)
chr5 (19-238)||(26129644-26129860)
chr5 (30-228)||(9811693-9811890)
chr5 (30-228)||(12703834-12704031)
chr5 (2-60)||(39538889-39538947)
chr5 (30-94)||(18806490-18806555)
chr5 (30-94)||(18806670-18806735)
chr5 (30-94)||(18806850-18806915)
chr5 (30-241)||(26245247-26245456)
chr5 (207-321)||(17314566-17314678)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-328)||(229971-230298)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (1-328)||(5829-6149)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (1-169)||(1293-1461)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (1-241)||(12897-13132)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-228)||(67334-67557)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (1-228)||(105-328)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (1-228)||(3635-3858)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-228)||(119849-120072)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (1-228)||(302-525)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (19-237)||(26677-26892)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (154-321)||(24228-24393)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-241)||(39936-40171)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (30-228)||(11486-11683)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (30-244)||(8876-9089)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (129-249)||(92562-92682)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (75-241)||(53955-54118)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (1-150)||(130262-130407)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (1-91)||(8424-8511)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (29-91)||(83111-83173)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2228 - 1901
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2228 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 2129  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2128 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 2029  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2028 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 1929  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1928 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 1901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11119 - 10792
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11119 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 11020  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11019 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 10920  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10919 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 10820  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10819 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 10792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17691347 - 17691020
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17691347 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 17691248  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691247 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 17691148  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691147 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 17691048  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17691047 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 17691020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27381159 - 27380832
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27381159 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 27381060  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381059 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 27380960  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27380959 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 27380860  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27380859 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 27380832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27471542 - 27471215
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27471542 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 27471443  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471442 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 27471343  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471342 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 27471243  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27471242 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 27471215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 11652023 - 11652350
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11652023 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcataatgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 11652122  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652123 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 11652222  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652223 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 11652322  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11652323 aatatagacatgagagcaaaagggtaat 11652350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17684376 - 17684049
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17684376 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 17684277  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684276 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 17684177  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684176 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctatgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 17684077  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||    
T  17684076 aatatagacataagggcaaaagggtaat 17684049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 27296929 - 27297256
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27296929 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 27297028  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27297029 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggatatg 27297128  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27297129 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacagtctatgccttgtgttc 27297228  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27297229 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 27297256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 29309190 - 29309517
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29309190 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 29309289  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309290 tgttggagtcaggtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 29309389  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309390 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 29309489  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29309490 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 29309517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 29316150 - 29316476
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29316150 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 29316249  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316250 tgttggagtc-agtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 29316348  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316349 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 29316448  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29316449 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 29316476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25537098 - 25536778
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25537098 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgacagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatttaccctaga 25536999  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25536998 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgattataaagttggttgatgggtactccatgaattatgttgagggacatg 25536899  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25536898 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgtgcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 25536799  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaa 321  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  25536798 aatatagacatgagggcaaaa 25536778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16559379 - 16559052
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  16559379 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccgctatgtaccgtaga 16559280  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16559279 tgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcattctgagggacatg 16559180  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16559179 agtgacctggatggaatttgcccctcctaaataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactaaacaaggatgacacagtctatgccttgtgttc 16559080  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16559079 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 16559052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16394352 - 16394035
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  16394352 gaatactacgtagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacttgaaaccactatgtaccctaga 16394253  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16394252 tgttggaatcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 16394153  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||    ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||| |  | | | ||||||||     
T  16394152 agtgacc----tggaatttgcccct----cataacaggagaaatgtctacggacccaatattgaactggacaaaggtgacatg--ccacgtcttgtgttt 16394063  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||    
T  16394062 aatatagaaatgagggaaaaagggtaat 16394035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 188884 - 188697
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  188884 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 188785  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 188  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  188784 tgttggagtcgagtgctttgttatcattcaaatattgtctgtaacagaatgactataaagttgattgatggatactccataaatcatg 188697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13359152 - 13358852
Alignment:
Q  30 tgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccatt 128  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  |||||  || |     
T  13359152 tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtattttgttgccgta 13359053  T
Q  129 caaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13359052 caaacatcgtccgtaacaggatgactataaagtcggttgatggacattcaacgaatcatggtgagggacatgagtgacctatatggaatttgtccctcct 13358953  T
Q  229 acataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    ||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||||| |  |||||| || ||    |||||  |||||||||||||||||||||   |||||| |||||    
T  13358952 acataacagtagaatcgtctaagggtccaatattgaattcaacaagggtggca--tactatgtgttgtgttcaatatagacatgaagacaaaagagtaat 13358855  T
Q  329 gat 331  Q
    |||    
T  13358854 gat 13358852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 265
Target Start/End: Original strand, 2669616 - 2669854
Alignment:
Q  27 aagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcacc 125  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | || |||||| ||||  || ||||||||| || ||||||| || ||||| ||||||  || ||||||   |    
T  2669616 aagtatcataagttattctcatagtgacaagttgtgtattccactatttgacctgaaatcattatgtactctagatgtaggagtccggtactttgttgtc 2669715  T
Q  126 attcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccct 225  Q
     ||||||  || ||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2669716 gttcaaatgttatctataacaggatgactataaagtcagttgattggtactccc-gaatcatgctaagggacatgagtgacctagattgaattttcccct 2669814  T
Q  226 cctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaa 265  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2669815 cctacataacatgagaaatgtctaagggcccaatattgaa 2669854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 198 - 328
Target Start/End: Original strand, 18336152 - 18336282
Alignment:
Q  198 atgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtg 297  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  18336152 atgagtgacctagatgaaatttgcccctcctgcataatatgagaaatgtctacgagcccaatattgaactagacaaggatgacaaagtctatgctttgtg 18336251  T
Q  298 ttcaatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||| | || |||||||| ||||    
T  18336252 ttcaatatagacgtaagggcaaaaggttaat 18336282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27508530 - 27508307
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  27508530 gaatactacatagtaa--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 27508434  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  27508433 tgt-ggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatg 27508335  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  27508334 agtatcctagatgggatttgtccctcct 27508307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17120662 - 17120453
Alignment:
Q  30 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 129  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  ||||  |||| ||| || ||||||||||   |||||    
T  17120662 tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctatatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattc 17120564  T
Q  130 aaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctccta 229  Q
     ||| ||||| || | ||||| || |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  17120563 taacgttgtctgtcaaaggataaccataacgttggttgatgggtgcttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatggaatttgtccctcct- 17120465  T
Q  230 cataacaggaga 241  Q
    ||||||||||||    
T  17120464 cataacaggaga 17120453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 14074599 - 14074822
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||   |||||||   | ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  14074599 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattttcacaatgataaaagtgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatccctaga 14074695  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| | | || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  14074696 tgtag-actcaagtgctttgttgcctttctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaagggacatg 14074794  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  14074795 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 14074822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22860071 - 22859848
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  22860071 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 22859975  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || |||| |||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  22859974 tgt-ggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 22859876  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  22859875 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 22859848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28756283 - 28756041
Alignment:
Q  32 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||  || |||  |||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||  || |||| ||||||| |||    
T  28756283 tcataaaatattctcatagtgataatgatttatctcatcctatgacctgaaaccactgtgtaccatatatgtaggagtcatgtactttatcaccat-caa 28756185  T
Q  132 acattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctaca 231  Q
    |  ||||  |||||| |||| ||||||||| ||||||||| |  | ||||||| ||| |||| || || |||||||||||  || |||| ||||||||||    
T  28756184 atgttgtatgtaacaagatgcctataaagtcggttgatggttgtttcatgaattatgttgagagatattagtgacctagaaagagtttgtccctcctaca 28756085  T
Q  232 taacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaagg 275  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  28756084 taacaagagaaatgtctacggacctaatattgaactcgacaagg 28756041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10359211 - 10359002
Alignment:
Q  27 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcacca 126  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||| |||| |||| ||| ||||||| |   ||    
T  10359211 aagtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcgtgtgctttattgtca 10359113  T
Q  127 ttcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| || |  |||  | |||||||| |||||||||| |||| | ||||||  || || |||||    
T  10359112 ttcaaacattgtccgtaacaggataaccattaagttggttaattgacacttgacgaatcatgttgagggacataagtgtcttagatgagatatgtccctc 10359013  T
Q  227 ctacataacag 237  Q
    || ||||||||    
T  10359012 cttcataacag 10359002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 228
Target Start/End: Original strand, 33317055 - 33317207
Alignment:
Q  75 gacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 174  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  33317055 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 33317153  T
Q  175 ctccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  33317154 cttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatgggatttgtccctcct 33317207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1586291 - 1586068
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||   | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  1586291 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 1586195  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  1586194 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatg 1586096  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    ||||  | |||||| ||||| |||||||    
T  1586095 agtgttccagatgggatttgtccctcct 1586068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 16789190 - 16789413
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  16789190 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 16789286  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||   ||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  16789287 tgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 16789385  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  16789386 agtgtcctagatgagatttgtccctcct 16789413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 275
Target Start/End: Original strand, 28172899 - 28173128
Alignment:
Q  47 atagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaac 145  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| | ||||||   | ||| ||   |   |||| ||||||||||||    
T  28172899 atagtgataagtggtgtattccacccttcgaccggaaaccagtatgtaccctagatataggagtcatatacttagttgtcgcacaaatattgtccgtaac 28172998  T
Q  146 aggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatg 245  Q
    ||||| |  |||||||  |||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||  |||| | ||| ||||||||||    
T  28172999 aggataatcataaagtcagttgatgggtactcgacaaatcatgttgagtgacatgagtgttctagatggaattttccaatcctccgtaataggagaaatg 28173098  T
Q  246 tctacgggcccaatattgaactagacaagg 275  Q
    |||| ||  ||||||||||||| |||||||    
T  28173099 tctatggatccaatattgaactggacaagg 28173128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Original strand, 8613064 - 8613261
Alignment:
Q  30 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 129  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||| || |||  |||||  || |||    
T  8613064 tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtattttgtttcccttc 8613162  T
Q  130 aaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
     ||| ||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  8613163 taacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggatatgagtgtcctagatgtgatttgtccctcct 8613261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 328
Target Start/End: Original strand, 13194342 - 13194519
Alignment:
Q  149 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtct 248  Q
    ||||||||  ||| |||| |||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  13194342 atgactatctagtcggtttatgggtgctcgataaatcatgttgagggacatgagtaacctagatggaattttccccttctatataataggagaaatgtct 13194441  T
Q  249 acgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    | || | |||||||||||| | |||||  |||| |   |||||||||||||||| |||   |||||  ||||||||||||    
T  13194442 aaggtctcaatattgaacttggcaagggggacatg--ttatgccttgtgttcaaaataagtatgagaccaaaagggtaat 13194519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27528116 - 27527947
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  27528116 gaatactacatagtaa--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 27528020  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 174  Q
    || |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  27528019 tg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggta 27527947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 208
Target Start/End: Original strand, 8510246 - 8510428
Alignment:
Q  27 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcacca 126  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| |||||| ||  ||  ||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||| |         
T  8510246 aagtgtcattagttactctcatagtgatggtggtgcattacatgcttcggcctggaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtactttatttttg 8510345  T
Q  127 ttcaaacatt-gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacct 208  Q
     ||| ||||| || || |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||    
T  8510346 ctcatacatttgtgcgaaacaggataactataaagtcggttgataggtactccacacatcatgttgagagacatgagtgacct 8510428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19347086 - 19346957
Alignment:
Q  152 actataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacg 251  Q
    ||||||||||  | |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  | ||| ||||||||| ||||||||| || |    
T  19347086 actataaagtcagctgatgaatactccatgaatcatgttgagg-acatgagtgacctagatgaaatttttctctcatacataacaagagaaatgtttatg 19346988  T
Q  252 ggcccaatattgaactagacaaggatgacac 282  Q
     |||||||  ||| || ||||||||| ||||    
T  19346987 agcccaatggtgagctggacaaggataacac 19346957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22560214 - 22560142
Alignment:
Q  168 atgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggaga 241  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22560214 atgggtacttgatgaatcatgttgagggacatgagtgtcctagatgggatttgtccctcct-cataacaggaga 22560142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 17850379 - 17850321
Alignment:
Q  27 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaacc 85  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17850379 aagtatcataagttattcttatagtgatagtgatgtataccaccctttgacctgaaacc 17850321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 21994723 - 21994911
Alignment:
Q  19 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||   ||| |||  |||| || |||| ||    
T  21994723 gttatgaaaa-tgtcataagatattttcacaatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaacgactatgatgcctagat-atggactcaagtgttt 21994820  T
Q  119 tgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgaccta 209  Q
    | |   ||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| ||||| | |||| || |  ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21994821 tattgtcattctaacattgtttgtaaaaggataaccataacgttggctaatggataattgatgaatcatgcagagggacatgagtgtccta 21994911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27525579 - 27525521
Alignment:
Q  170 gggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  27525579 gggtacttgatgaatcatgctgaggggcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcct 27525521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20736494 - 20736277
Alignment:
Q  21 tatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||||  |||| ||||| ||| || ||||||||     
T  20736494 tatgaaaa-tgtcataagatattctcacagtgataatagtgtatatcactcttagacctaaaactactatgatccctagatgt-ggactcaagtgcttta 20736397  T
Q  121 tcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttg 220  Q
    |   ||||  ||  || ||  ||  ||||  || |||| ||||| | || ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  20736396 ttgtcattataatgttatctatagaaggagaaccataacgttggctaataggtacttgatgaatcatgttgagggacatgagtgtcctagatgagatttg 20736297  T
Q  221 cccctcctacataacaggaga 241  Q
     ||||||| ||||| ||||||    
T  20736296 tccctcct-cataataggaga 20736277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 19218543 - 19218630
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 91  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| || | ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  19218543 gaatactacatagtat--gttatgaaaatt-tcataagatattctcagaatgataatgatatatactactcttagacctgaaaccactatg 19218630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 8858467 - 8858794
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8858467 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 8858566  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858567 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 8858666  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858667 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 8858766  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8858767 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 8858794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 18262512 - 18262839
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18262512 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 18262611  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262612 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 18262711  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262712 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 18262811  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18262812 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 18262839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 18269373 - 18269700
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18269373 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 18269472  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269473 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 18269572  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269573 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 18269672  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18269673 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 18269700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 5707620 - 5707947
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5707620 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 5707719  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707720 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 5707819  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707820 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 5707919  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5707920 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 5707947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 5714248 - 5714575
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5714248 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 5714347  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714348 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 5714447  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714448 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 5714547  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5714548 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 5714575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 26963940 - 26964267
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26963940 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 26964039  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964040 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 26964139  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26964140 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacagtctatgccttgtgttc 26964239  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26964240 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 26964267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 55612983 - 55613310
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55612983 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 55613082  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55613083 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgttgagggacatg 55613182  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613183 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 55613282  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  55613283 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 55613310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19926667 - 19926340
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19926667 gaatactacatagtaaaagttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 19926568  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926567 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 19926468  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926467 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatatctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 19926368  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19926367 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 19926340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 26970763 - 26971090
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26970763 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 26970862  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26970863 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgaggaacatg 26970962  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26970963 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacagtctatgccttgtgttc 26971062  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26971063 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 26971090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28393041 - 28392714
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  28393041 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctaga 28392942  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392941 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgagtactccatgaatcatgctgagggacatg 28392842  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392841 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 28392742  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28392741 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 28392714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 868897 - 869224
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  868897 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 868996  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868997 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 869096  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  869097 agtgacctagatggaatttgctcctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 869196  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  869197 aatatagacatgagggcaaaagagtaat 869224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 10621240 - 10620913
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10621240 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgttttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 10621141  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10621140 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgttgagggacatg 10621041  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10621040 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttatgttc 10620941  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10620940 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 10620913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 10628319 - 10627992
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10628319 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgttttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 10628220  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  10628219 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgttaagggacatg 10628120  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10628119 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttatgttc 10628020  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10628019 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 10627992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 8845503 - 8845830
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8845503 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 8845602  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8845603 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatt 8845702  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8845703 agtgacctagatggaatttgcctctcctacataacaggagaaatgtctacgtgcccaatattgaactagacaaggatgacacagtctatgccttgtgttc 8845802  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8845803 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 8845830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5668034 - 5667711
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  5668034 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttagacctgaaaccactatgtaccctaga 5667935  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5667934 tgttgg--tcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgctgagggacatg 5667837  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |   ||||||||||||||    
T  5667836 actgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatttctacgggcccaatattgaacttgagaagggtgacatg--ttatgccttgtgttc 5667739  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||    
T  5667738 aatatagacattagggcaaaaaggtaat 5667711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 42 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4426482 - 4426195
Alignment:
Q  42 ttctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4426482 ttctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttaccattcaaacattgtccg 4426383  T
Q  142 taacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctg-agggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggag 240  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  4426382 taataggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgttgaagggacatgagtgacatagatggaattttcccctcctacataacaagag 4426283  T
Q  241 aaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  4426282 aaatgtctatgggcccaatattgaactagacaaggatgacacaatatatgccttgtgttcagtatagacatgagggaaaaagggtaat 4426195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 35223860 - 35224176
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||    
T  35223860 gaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgttgtattccaccctttgacctgaaaccacgatgtaccttaga 35223959  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35223960 tgttggagtcgagtgctttatcaacattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgtgtactccacgaatcatgctgagggacatg 35224059  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||| | ||||||    
T  35224060 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataataggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaagggtgaca--tactatgcatcgtgttc 35224157  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaa 319  Q
    |||||| ||||||| ||||    
T  35224158 aatataaacatgagggcaa 35224176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10677489 - 10677171
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  10677489 gaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctaga 10677390  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||||| |||| ||||  |||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  10677389 tgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-ataaagttggtagatgggtactccatgaaccatgctaagggatatg 10677291  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacg------gtctatgcctt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| ||    
T  10677290 agtgacatagatggaatttgcctctccaatataacaggagaaatgtctatgagcccaatattgaactagacaaggatgacacggtcactgtctatgcatt 10677191  T
Q  295 gtgttcaatatagacatgag 314  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  10677190 gtgttcaatatagatatgag 10677171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10891129 - 10890811
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  10891129 gaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctaga 10891030  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||||| |||| ||||  |||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  10891029 tgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-ataaagttggtagatgggtactccatgaaccatgctaagggatatg 10890931  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacg------gtctatgcctt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| ||    
T  10890930 agtgacatagatggaatttgcctctccaatataacaggagaaatgtctatgagcccaatattgaactagacaaggatgacacggtcactgtctatgcatt 10890831  T
Q  295 gtgttcaatatagacatgag 314  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  10890830 gtgttcaatatagatatgag 10890811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 328
Target Start/End: Original strand, 20311628 - 20311914
Alignment:
Q  40 tattctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgt 138  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||||  || | ||||| ||||    
T  20311628 tattctcatagtgataagtggtgtattccacccttctacttgaaaccactatttaccctagatgtaggattcgagtactttgttcccgtacaaacgttgt 20311727  T
Q  139 ccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacagg 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | |||||| |    
T  20311728 ccgtagcaggatgactataaagtcggttaatcggtactccacgaatcatgatgagggacatgagtgatctagatggaattt-tccctcccatataacatg 20311826  T
Q  239 agaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||| || ||    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20311827 agaaatgtctaagggcccaatattgtaatggacaagggtgtca--tactatgccttatgttcaatatagacatgagagcaaaagggtaat 20311914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3369206 - 3368983
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  3369206 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttga 3369110  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  3369109 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatg 3369011  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  3369010 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 3368983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9937826 - 9937594
Alignment:
Q  79 tgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 178  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| | |||| ||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||| ||| |      
T  9937826 tgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgaatactttatcgtcgttcaaacattgttcgtaaaaggatgactataaagacagttgatgagtatttt 9937727  T
Q  179 atgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatg 278  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |  | ||| | ||||||||  | ||||| ||||    
T  9937726 atgaatcatgttgaaagacatgagtgatctagatgaaattttcccctcttacataacaggagaaattttgaagggtctaatattgagttggacaatgatg 9937627  T
Q  279 acacggtctatgccttgtgttcaatatagacat 311  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  9937626 acacggtatatgtcttgtgttaaatatagacat 9937594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 34975670 - 34975893
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  34975670 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaga 34975766  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||    
T  34975767 tgt-ggactcaagtgctttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgttgaggggcatg 34975865  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  34975866 agtgccctagatgggatttgtccctcct 34975893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 1941843 - 1942066
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |  |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  1941843 gaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcatgagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaga 1941939  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||  ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1941940 tgt-ggactcaagtactttgttgccattctaatgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggacatg 1942038  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  1942039 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 1942066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 2677132 - 2677355
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  2677132 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 2677228  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  2677229 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 2677327  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  2677328 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 2677355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 15461616 - 15461839
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  15461616 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaga 15461712  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  15461713 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatg 15461811  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  15461812 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 15461839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 15815140 - 15815363
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  15815140 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 15815236  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  15815237 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 15815335  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  15815336 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 15815363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18111226 - 18111003
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  18111226 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 18111130  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  18111129 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 18111031  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  18111030 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 18111003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 26531732 - 26531955
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  26531732 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 26531828  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  26531829 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 26531927  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  26531928 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 26531955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 302
Target Start/End: Original strand, 24701361 - 24701601
Alignment:
Q  60 tgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaa 159  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| | | |||||    | ||||||||||||| ||||  | |    ||||||    
T  24701361 tgtattccacccttcgacctaaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtcaaatactttgatgtcgttcaaacattgtctgtaattgaaaatttataaa 24701460  T
Q  160 gttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaat 259  Q
    |  ||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24701461 gccggttgatgggtactccgcaaatcatgacgagggacatgagtgacctatatagaatttgcccctcctacacaacaggataaatgtctaagggcccaat 24701560  T
Q  260 attgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaa 302  Q
    ||| || | || |||| |||| ||  ||||| |||||||||||    
T  24701561 atttaattggaaaagggtgacccg--ctatgtcttgtgttcaa 24701601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30040656 - 30040437
Alignment:
Q  19 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||| || |||||||    
T  30040656 gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctt 30040559  T
Q  119 tgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatt 218  Q
    |||   ||||| ||  ||||  |||| ||||| || |||| ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  30040558 tgttgtcattctaatgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggttaatgagtacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatgagatt 30040459  T
Q  219 tgcccctcctacataacaggaga 241  Q
    || ||||||| ||||||||||||    
T  30040458 tgtccctcct-cataacaggaga 30040437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17300142 - 17299919
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  17300142 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 17300046  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  17300045 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgagcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 17299947  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  17299946 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 17299919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18163281 - 18163504
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||   | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  18163281 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 18163377  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  18163378 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatg 18163476  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    ||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  18163477 agtgttctagatgggatttgtccctcct 18163504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 20244056 - 20244279
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||   | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  20244056 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 20244152  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  20244153 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatg 20244251  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    ||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  20244252 agtgttctagatgggatttgtccctcct 20244279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5528645 - 5528426
Alignment:
Q  20 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 119  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||  |||||  |||| ||||| ||| || ||||||||    
T  5528645 ttatgaaaa-tgccataagatattctcataatgataatggtgtataacactcttatacctgaaactgctatgatccctagatgt-ggactcaagtgcttt 5528548  T
Q  120 gtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaattt 219  Q
     |  |||||||||| || || |||||||||| || |||| ||||||| ||||| | |  |||||||||| ||||||||||||| |  |||||||  ||||    
T  5528547 atttccattcaaacgttatctgtaacaggataaccataatgttggttaatgggcatttgatgaatcatgttgagggacatgagagttctagatgagattt 5528448  T
Q  220 gcccctcctacataacaggaga 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  5528447 gcccctccttcataacaggaga 5528426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4676166 - 4675943
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||   | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  4676166 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 4676070  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||  ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  4676069 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattataacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatg 4675971  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    ||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  4675970 agtgttctagatgggatttgtccctcct 4675943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 310
Target Start/End: Original strand, 22805511 - 22805691
Alignment:
Q  130 aaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctccta 229  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||  || ||| ||| ||||  |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||    
T  22805511 aaacgttgtctgtaataggatgaccctagagtcggtagatgaatactccacaaatcatgttgaaggacatgagtgatatagatggaatttacccctcata 22805610  T
Q  230 cataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagaca 310  Q
    ||||||| || |||||| || ||| |||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22805611 cataacatgataaatgtttaagggtccaatattgaactaaattagggtaacacggtctatgccttgtgtttaatatagaca 22805691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 5616536 - 5616750
Alignment:
Q  26 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcacc 125  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||  |||| |||| |||| || |||||||| |  ||    
T  5616536 aaagtgtcataagatattcttacaatgataatggtgtataccaatcttagatctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgcc 5616634  T
Q  126 attcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccct 225  Q
    |||||||| ||||  |||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  5616635 attcaaacgttgtttgtaacaagataactgtaacgttggttaatgggcacatgacgaatcatgttgagggacatgagtgttctagatgggatttgtccct 5616734  T
Q  226 cctacataacaggaga 241  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  5616735 ccttcataaaaggaga 5616750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 9538100 - 9538313
Alignment:
Q  26 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcacc 125  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||| || | |||  ||| ||||| ||||||| |||  || ||||||| ||| || |||||||| |  ||    
T  9538100 aaagtgtcataagatattctcacaatgataatggcgtgt-ccagtcttagacctcaaaccaccatgatccttggatgt-ggactcaagtgctttattgcc 9538197  T
Q  126 attcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccct 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||  | |||||||| ||||||||||||||  |||||||   ||||| ||||    
T  9538198 attcaaacattgtccgtaacaggataaccataacgttggttaatgggcacttgacgaatcatgttgagggacatgagtttcctagattagatttgtccct 9538297  T
Q  226 cctacataacaggaga 241  Q
    ||| ||||||||||||    
T  9538298 ccttcataacaggaga 9538313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 19362551 - 19362758
Alignment:
Q  26 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcacc 125  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  || | |||| |||| |  | |||||| |   |    
T  19362551 aaagtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttaaacctgaaaccactatgatccttagatg-tggacttaaatgctttattgtc 19362649  T
Q  126 attcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccct 225  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||  | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||    
T  19362650 attcaaacgttgtctgtaacaggatgaccataacggtggttaatggccacttgacgaatcatgttgagggacatgagtgtcctagatgcgatttgtccct 19362749  T
Q  226 cctacataa 234  Q
    ||| |||||    
T  19362750 ccttcataa 19362758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 19365660 - 19365875
Alignment:
Q  26 aaagtgtcataagatattctcat-agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||| ||||| ||| || |||||||| |       
T  19365660 aaagtgtcataagatattctcaccaatgataatggtgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttattgt 19365758  T
Q  125 cattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccc 224  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||  | ||||||| ||||||||| |||||| |||| |||  ||||| |||    
T  19365759 cattcaaacgttgtctgtaacaggatgaccataacgttagttaatgggcacttgacgaatcattctgagggacgtgagtgtcctacatgtgatttgtccc 19365858  T
Q  225 tcctacataacaggaga 241  Q
    |||| || || ||||||    
T  19365859 tccttcaaaataggaga 19365875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 243 - 314
Target Start/End: Original strand, 10689821 - 10689892
Alignment:
Q  243 atgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgag 314  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  10689821 atgtctatgagcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgcattgtgttcaatatagatatgag 10689892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 243 - 314
Target Start/End: Original strand, 10903461 - 10903532
Alignment:
Q  243 atgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgag 314  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  10903461 atgtctatgagcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgcattgtgttcaatatagatatgag 10903532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 11421126 - 11421334
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| ||| || |||| |  |||||| ||| | | |||||||||||||||||  || | ||    
T  11421126 gaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattatcacagggataataatgtatatcactcatagacctgaaaccactatgatccgtaga 11421222  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| | | || |||||||| |   ||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11421223 tgt-gtactcaagtgctttattgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggctaatgggtactcgatgaatcatgctgagggacatg 11421321  T
Q  201 agtgacctagatg 213  Q
    |||| ||||||||    
T  11421322 agtgtcctagatg 11421334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 5870537 - 5870759
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  5870537 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcatatgatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 5870633  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || |||| |||||   ||||| ||| |||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  5870634 tgt-ggactcaagtgttttgttgtcattctaacgttgtctataataggataacaataacgttggttgatgagtacttgatgaatcatgctgaggg-catg 5870731  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  5870732 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 5870759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 9487670 - 9487893
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  9487670 gaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaga 9487766  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || |||  |||||   ||||  ||| ||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  9487767 tgt-ggactcaagtattttgttgtcattataacgttgtctgtaataggataaccataacattggttgatgggtacttgatgaatcatgttgagggacatg 9487865  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    ||||  ||| |||| ||||| |||||||    
T  9487866 agtgttctatatgggatttgtccctcct 9487893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Original strand, 4546331 - 4546404
Alignment:
Q  155 ataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  4546331 ataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatgggatttgtccctcct 4546404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 32636603 - 32636838
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||  ||||  |    
T  32636603 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactctccgacgtgaaacca-tatgatccctata 32636698  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
     | | || || |||||||| |   ||||||||| ||||  |||||| ||| || |||| ||||||| ||||| |||  | ||||||    || |||||||    
T  32636699 cg-tagactcaagtgctttattgtcattcaaacgttgtttgtaacatgataaccataacgttggttaatgggcacttaacgaatcacttcgaaggacatg 32636797  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggaga 241  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  32636798 agtgacctagatgggatttgtccctccttcataacatgaga 32636838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 321
Target Start/End: Original strand, 27031240 - 27031377
Alignment:
Q  182 aatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgaca 281  Q
    |||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||  | ||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||| | || ||    
T  27031240 aatcatgacgagggacacgagtgaccaagatgaaattcgcccctcctacataacattataaaagtctaagggcgcaaaattaaactagacaaaggtggca 27031339  T
Q  282 cggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaa 321  Q
    |   | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27031340 c--accatgccttgtgttcaatatagacacgagggcaaaa 27031377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 21454046 - 21453961
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccac 87  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21454046 gaatactacata-tatgagttatgtaaaatatcataagatattttcattgtgatagtggtgtatgtcacccttcgacctgaaaccac 21453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32646656 - 32646467
Alignment:
Q  55 agtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgact 154  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||||| || ||||||   | | ||||| |  ||| ||||||||||| |    
T  32646656 agtggtgtattttacccttcgacctgaaacaactctgtatcctggatgtatgagtcgggtactttgttgtcgtacaaacgtcatccataacaggatgatt 32646557  T
Q  155 ataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgt 246  Q
    || |||| |||||||||||||   |||||||||| | |||||||   ||||  |||||| ||||| |||||| ||||||||  |||||||||    
T  32646556 atgaagtcggttgatgggtaccggatgaatcatgttaagggacacaggtga--tagatgaaatttccccctcttacataacgagagaaatgt 32646467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23056218 - 23056025
Alignment:
Q  32 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 131  Q
    ||||||||||||||||||| | || |  |||||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||| ||||| | | || |||| ||| |   |||||||    
T  23056218 tcataagatattctcatagaggtaatattgtataccactcttagacctcaaaccactatgatccctagatgt-gaactcaagtgttttattgacattcaa 23056120  T
Q  132 acattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctc 226  Q
    |  || || |||||||||| ||||||||||||||| |||| || |  | |||||||| |||| |||||||||| |||| |||  ||||| |||||    
T  23056119 atgttatctgtaacaggataactataaagttggttaatggttatttgacgaatcatgttgagcgacatgagtgtcctaaatgtgatttgaccctc 23056025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 43707304 - 43707223
Alignment:
Q  165 ttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgt 246  Q
    ||||||||||||||   ||| ||| |||||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||  ||||||||    
T  43707304 ttgatgggtactcccataattatgttgagggacataagtgacctaaacggaatttgtccatcctacataacaaaagaaatgt 43707223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 91
Target Start/End: Original strand, 33888672 - 33888743
Alignment:
Q  20 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 91  Q
    ||||| ||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  33888672 ttatgtaaagtgtgataagataatatcatattgacagtggtgtatgccacatttcgacctgaaatcactatg 33888743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 265
Target Start/End: Original strand, 468954 - 469063
Alignment:
Q  155 ataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggc 254  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||||||||||  || || | |||||||  ||||| ||||||||| || |||     
T  468954 ataaagttcattgatgggtactccat-aatcatgatgagtgacattaatgacctagataaaaatttctcctcctatgtaacatgagaaatgtataagggt 469052  T
Q  255 ccaatattgaa 265  Q
     ||||||||||    
T  469053 tcaatattgaa 469063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 18252330 - 18252657
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18252330 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 18252429  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252430 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 18252529  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252530 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 18252629  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18252630 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 18252657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18532421 - 18532094
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18532421 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 18532322  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532321 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 18532222  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18532221 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttt 18532122  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18532121 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 18532094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27131316 - 27130990
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  27131316 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacc-taga 27131218  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131217 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 27131118  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27131117 agtgacctagatgtaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgtcttgtgttc 27131018  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27131017 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 27130990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27310484 - 27310157
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27310484 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 27310385  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310384 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 27310285  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310284 agtgacctagatgtaattttcccctcctacataacaggagaaatgtctacaggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 27310185  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27310184 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 27310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16358942 - 16358615
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||    
T  16358942 gaatactacatagtaaaagttatgagaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgtcttgaaaccaccatgtaccctaga 16358843  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16358842 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactttaaagttggttgatgggtactccatgaatcatgttgagggacatg 16358743  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358742 agtgacctagatggaattttcccctcctacataacaagagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 16358643  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16358642 aatatagagatgagggcaaaagggtaat 16358615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3855826 - 3855499
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  3855826 gaatactacatagtaaaggttatgaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccaccattcgacccgaaaccactatgtaccctaga 3855727  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3855726 tgttggagttgagcgctttgtcaccattcaagcgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgaccggtactccatgaatcatgctgagggacatg 3855627  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3855626 agtgacctagatgaaattttcccctccaacataacaggagaaatgtctacgagcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 3855527  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||    
T  3855526 aatatagtcatgagggcgaaagggtaat 3855499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22641777 - 22641456
Alignment:
Q  5 actacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgtt 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22641777 actacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgtt 22641678  T
Q  105 ggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22641677 ggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggtcgatgggtactccacgaatcatgctaagggacatgagtg 22641578  T
Q  205 acctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaata 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    |||||||||||||||||||    
T  22641577 acctagatggaattttcccctcctacataacaggagcaatgtctacgggcccaatattgatctggacaagggtgaca--tcctatgccttgtgttcaata 22641480  T
Q  305 tagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||| | |||||||||||    
T  22641479 tagacatgagggaaaaagggtaat 22641456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27277456 - 27277140
Alignment:
Q  9 catagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggag 108  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27277456 catagtaaaagtcatgaaa-gtgccataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggag 27277358  T
Q  109 tcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacct 208  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27277357 tcgagtgctttatcataattcaaacattgtttgtaacaagatgaccataaagttggttgaagggtactccataaatcatgttgagggacatgagtgacct 27277258  T
Q  209 agatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatataga 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| |    
T  27277257 agatggaattttcccctcctacataacagaagaaatgtctacgggcccaatatcgaactgaacaagggtgacatg--ctatgccttgtgttcaatataaa 27277160  T
Q  309 catgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||| | |||||||||||    
T  27277159 catgagggaaaaagggtaat 27277140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 36816540 - 36816216
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  36816540 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataaaa-attatcatagtgatggtggtgtattccaccctttgaactgaaaccactatgtaccctaga 36816442  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36816441 tgttggagtcgagcgttttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagataactataaagttggttgataggtactccacaaatcatgctgagggacatg 36816342  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||| | |||||   | ||||||||||||||    
T  36816341 agtgacctagatgaaattttcccctcatacataacatgagcaatgtctacggacccaatattgaattggacaatggtgaca--ttatatgccttgtgttc 36816244  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||    
T  36816243 aatatagacataagggcaaaagggtaat 36816216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9916683 - 9916437
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaa-ccactatgtaccctg 98  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  9916683 gaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaaccactatgtacccta 9916587  T
Q  99 gatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggaca 198  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||| ||||||| |    
T  9916586 gatgtaggagtcgagtactttgttaccgtccaaacgttgtccgtaacaaggtgactataaagttagtttatgagttctccacgaatcatgttgagggaaa 9916487  T
Q  199 tgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtcta 249  Q
    |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9916486 tgagtgacctatgtggaattt-tccctcctacataaaaggagatatgtcta 9916437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 23507229 - 23507525
Alignment:
Q  33 cataagatattctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 131  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || | |||| |||||| | ||| |||    
T  23507229 cataagttattctcatagtgataagtggagtatgtcatccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaagatttgagtactttgttatcatacaa 23507328  T
Q  132 acattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacct--agatggaatttgcccctccta 229  Q
    | |  ||| |||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||  || | | ||||||||| |  ||||||||||| ||| | |||    
T  23507329 ataccgtctgtaataggatgactataaattcgatttatgggtactccataaatcatgtcgaagaagatgagtgacttttagatggaattttcccattcta 23507428  T
Q  230 cataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  23507429 cataacaggataaatgtctaagggaccaatattaaactagaccagggtgacacgg--tatgccttgtgttcaatatagacacgaaggaaaaagggtaat 23507525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12014154 - 12013885
Alignment:
Q  41 attctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtc 139  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| ||| |||| ||||| || ||||| ||||||  || ||||||     |  |||| | |||    
T  12014154 attctcatagtgataagtggtgtatttcacccttcaacctaaaatcactgtgtactctagatgtaggagtcatgtactttgttgttgtagaaacctcgtc 12014055  T
Q  140 cgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacagga 239  Q
    ||||||| | |||||||||| |  ||||||||||| |  | |||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  12014054 cgtaacaaggtgactataaactcagttgatgggtatttgacgaatcatgttgagggacacaagtgtcctagatggaatttgcccctccgacataacaaga 12013955  T
Q  240 gaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacat 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||    |||||| |||||||||||||||||||    
T  12013954 gaaatgtctaagggcccaatattgaactggacaagggtggca--tactatgcattgtgttcaatatagacat 12013885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20391422 - 20391199
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| |  |||||||| | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  20391422 gaatactacatagtaa--gttatgaaattt-tcataagatattctcacaatgataataatgtataccgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 20391326  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  20391325 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggtcatg 20391227  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  20391226 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 20391199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31234681 - 31234511
Alignment:
Q  148 gatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtc 247  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| | || ||||    
T  31234681 gatgactataaagtcggttaatgggcacttcacaagtcatgttgagggacatgagtgacctagatgaaatttgtccctcttacatgacagaaaaattgtc 31234582  T
Q  248 tacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaa 321  Q
    ||  || ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31234581 ta-aggtccaatattgaactggacaagggtgacacg--ctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaa 31234511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 9456235 - 9456458
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  9456235 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 9456331  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  9456332 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 9456430  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  9456431 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 9456458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20779828 - 20779605
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  20779828 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 20779732  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  20779731 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 20779633  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  20779632 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 20779605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22670440 - 22670217
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  22670440 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 22670344  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  22670343 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 22670245  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  22670244 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 22670217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42817172 - 42816949
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  42817172 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 42817076  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  42817075 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 42816977  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  42816976 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 42816949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43802548 - 43802325
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  43802548 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaga 43802452  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  43802451 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatg 43802353  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  43802352 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 43802325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19706622 - 19706399
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  19706622 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaga 19706526  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  19706525 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatg 19706427  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| || || |||||||    
T  19706426 agtgtcctagatgggatctgtccctcct 19706399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28134906 - 28134683
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  ||||  |    
T  28134906 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaaa 28134810  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  28134809 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatg 28134711  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  28134710 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 28134683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 634053 - 634267
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  634053 gaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaga 634149  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||    
T  634150 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgacgagcacttgatgaatcatgctgagggacatg 634248  T
Q  201 agtgacctagatggaattt 219  Q
    |||| ||||||||| ||||    
T  634249 agtgtcctagatgggattt 634267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47667654 - 47667445
Alignment:
Q  17 aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgc 116  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||||| ||| || |||||    
T  47667654 aagttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgc 47667557  T
Q  117 tttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaa 216  Q
    |||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  47667556 tttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaagggacatgagtgtcctagatggga 47667457  T
Q  217 tttgcccctcct 228  Q
    |||| |||||||    
T  47667456 tttgtccctcct 47667445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 8727786 - 8728020
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||   ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||  |||| ||    
T  8727786 gaatactacatagtat--gttatgaaaa-taccataagatattctcttagtgataagagtgtatatcactcttagacctggaaccactatgatccctaga 8727882  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||  ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || ||||  |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8727883 tgc-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggctaatgggtacttgatgaatcatgctgagggacatg 8727981  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggag 240  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||    
T  8727982 agtgtcctagatgagatttgtccctcct-cataacaggag 8728020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12006313 - 12006144
Alignment:
Q  140 cgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacagga 239  Q
    ||||||||| | ||||||| ||  |||||||||||||  | |||||||| ||||||| |  |||| |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||    
T  12006313 cgtaacagggtaactataatgtcagttgatgggtacttgaagaatcatgatgagggatacaagtgtcctagatgaaattttcccctcctacacaaaatga 12006214  T
Q  240 gaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacat 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||   |||||| || ||||||||||||||||    
T  12006213 gaaatgtctaagggcccaatattgaactggacaagggtgaaac--actatgcattttgttcaatatagacat 12006144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22612611 - 22612834
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  22612611 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatcactaga 22612707  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| |||||  ||| ||||| |  |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  22612708 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataatcataacgttggttgatggctacttgatgaatcatgctaaggggcatg 22612806  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  22612807 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 22612834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 21171140 - 21171081
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171140 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 21171081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28145850 - 28145698
Alignment:
Q  60 tgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaa 159  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  ||||     
T  28145850 tgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataac 28145752  T
Q  160 gttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatg 213  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  28145751 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatgagtgtcctagatg 28145698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24301774 - 24301466
Alignment:
Q  18 agttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgct 117  Q
    |||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| || ||||  |||| ||| | | | | ||||| |    
T  24301774 agttatgttaagtatcataagacattctcatagtgatagtggtgtatacaaccctttgacctaaaatcattatgatccctagatatagaaat-gagtgtt 24301676  T
Q  118 ttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaat 217  Q
    ||||     ||||||| ||||  |||||| ||| | |||| | || |||  |||||| ||||  |||| || |||||||| |||| ||| || |||||||    
T  24301675 ttgttgttgttcaaacgttgtttgtaacaagataattatatattttgttagtgggtattccacaaatcctgttgagggacttgagggacgtaaatggaat 24301576  T
Q  218 ttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgc 317  Q
     |  |||| |||  ||| || |||||||| ||  || |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||  |||||||||| |||||||  |    
T  24301575 gtttcccttctatgtaatagaagaaatgtttataggtccaatattgaactaaacaagggtgacactgtctatgtctttggttcaatataaacatgaggtc 24301476  T
Q  318 aaaagggtaa 327  Q
     |||||||||    
T  24301475 caaagggtaa 24301466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Original strand, 29096857 - 29097077
Alignment:
Q  19 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  ||| ||| ||| |||||||||||||  |||| |||  |||| || |||| ||    
T  29096857 gttatgaaaa-tgtcataagatattctcataatgataatggtgtttcacactcttagacatgaaaccactatgatccctagat-atggactcaagtgttt 29096954  T
Q  119 tgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatt 218  Q
    | |  | |||||||| || || |||| ||||| || |||| ||||||| |||||   |  | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||     
T  29096955 tatttcgattcaaacgttatctgtaataggataaccataacgttggttaatgggcgtttgacgaatcatgttgagggacatgagtatcctagatgggatg 29097054  T
Q  219 tgcccctcctacataacaggaga 241  Q
    || ||||||| ||||||| ||||    
T  29097055 tgtccctccttcataacatgaga 29097077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 51550803 - 51550669
Alignment:
Q  192 agggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgc 291  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||  |||| | ||| || |||||||||| ||||||| |||||    ||||||    
T  51550803 agggacacgagcgacctagatggaagtggtccctcctacataacgggagatctgtcgaagggaccgatattgaactggacaagggtgaca--tactatgc 51550706  T
Q  292 cttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
     ||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  51550705 attgtgatcaatatagacacgaggacaaaagtgtaat 51550669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 21881559 - 21881475
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccact 88  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  21881559 gaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataacggtgtataccactcttagacctgaagccact 21881475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 10852461 - 10852402
Alignment:
Q  27 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaacca 86  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  10852461 aagtgtcataagatatttttaaagtgataatggtgtatgtcacccttcaacctgaaacca 10852402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10852338 - 10852234
Alignment:
Q  154 tataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacggg 253  Q
    ||||||||  ||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| | ||| ||| |||||  ||||||||||| ||     
T  10852338 tataaagtcagttgatgggcacttcacgaatcatgatgagg-acataagtgacctagataaaatttgtctctcatacgtaacaaaagaaatgtctatgga 10852240  T
Q  254 cccaat 259  Q
    ||||||    
T  10852239 cccaat 10852234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 8490795 - 8491122
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8490795 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 8490894  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490895 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 8490994  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490995 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 8491094  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8491095 aatatagacatgagggcaaaaggataat 8491122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16482390 - 16482063
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16482390 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 16482291  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16482290 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgttgagggacatg 16482191  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482190 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 16482091  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16482090 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 16482063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15357493 - 15357166
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15357493 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 15357394  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357393 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 15357294  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15357293 agtgacctagatggaatttacccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtttatgccttgtgttc 15357194  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15357193 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 15357166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15600791 - 15600464
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15600791 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 15600692  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15600691 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtaccccatgaatcatgctgagggacatg 15600592  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15600591 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttatgttc 15600492  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15600491 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 15600464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15607336 - 15607009
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15607336 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 15607237  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15607236 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtaccccatgaatcatgctgagggacatg 15607137  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15607136 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttatgttc 15607037  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15607036 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 15607009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 6110364 - 6110691
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6110364 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 6110463  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110464 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 6110563  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110564 agtgacctagatggaatttttccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 6110663  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||    
T  6110664 aatatagacatgggggcaaaagggtaat 6110691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 10572499 - 10572172
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  10572499 gaatactacatagtaaaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtaga 10572400  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572399 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 10572300  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572299 agtgacctagatggaatttgctcctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 10572200  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10572199 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 10572172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 10579262 - 10578936
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10579262 gaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 10579163  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10579162 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggac-tg 10579064  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579063 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 10578964  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10578963 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 10578936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 13211602 - 13211929
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  13211602 gaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccattatgtaacctaga 13211701  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211702 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 13211801  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211802 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 13211901  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13211902 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 13211929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 13248907 - 13249234
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  13248907 gaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaacctaga 13249006  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13249007 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 13249106  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13249107 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 13249206  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||    
T  13249207 aatatagacatgagggaaaaagggtaat 13249234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15342126 - 15341799
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15342126 gaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 15342027  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342026 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 15341927  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15341926 agtgacctagatggaatttacccttcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 15341827  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||    
T  15341826 aatatagacatgagggaaaaagggtaat 15341799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17781025 - 17780698
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17781025 gaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 17780926  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780925 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 17780826  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17780825 agtgacctagatggaatttgcctctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacagtctatgccttgtgttc 17780726  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17780725 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 17780698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 32056806 - 32056478
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  32056806 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctaga 32056707  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056706 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatgctgagggacatg 32056607  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056606 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 32056507  T
Q  301 aat-atagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  32056506 aataatagacatgagggcaaaagagtaat 32056478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 18520275 - 18520602
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18520275 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgaactgaaaccactatgtaccctaga 18520374  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520375 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 18520474  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18520475 agtgagctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactacacaaggatgacacggtctatgccttgtgttt 18520574  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18520575 aatatagacatgagggcaaaaggataat 18520602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 13517111 - 13517434
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13517111 gaatactaaatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggcc----ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 13517206  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517207 tgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtagatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 13517306  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517307 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 13517406  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13517407 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 13517434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 2 - 328
Target Start/End: Original strand, 18522964 - 18523289
Alignment:
Q  2 aatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18522964 aatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatttcacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 18523063  T
Q  102 gttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatga 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18523064 gttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaataatgctgagggacatga 18523163  T
Q  202 gtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttca 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18523164 gtgacctagatggaatttgtccctcctacataacaggagaaatgtctac-ggcccaatagtgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttta 18523262  T
Q  302 atatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||| || |||||||||||||    
T  18523263 atatagacatcagggcaaaagggtaat 18523289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1647428 - 1647101
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  1647428 gaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcatacgatattcccatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctaaaaccactatataccctaga 1647329  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647328 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgagtactccatgaatcatgctgagggacatg 1647229  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647228 agtgatctagatgaaattttcccctcctacataacaggtgaaatgtctacgggcccaattttgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 1647129  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  1647128 aatatagacatgagggcaaaagagtaat 1647101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 17136653 - 17136980
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  17136653 gaatactacatagtaaaagttattgaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacttgaaaccactatgtaccctaga 17136752  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136753 tgttggagtcgagtgcttagtaaacattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatgctgagggacatg 17136852  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17136853 agtgacctagatggaattttcccctcctacataaccggggaaatgtctacggacccaatattgaacaagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttt 17136952  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  17136953 aatatagacaggagggaaaaagggtaat 17136980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17200091 - 17199809
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17200091 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttaga 17199992  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17199991 tgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaatgttgttcgtatcaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatgagggacatg 17199892  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacg 283  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17199891 agtgccgtagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacggacccaatattgaactagacaaggatgacacg 17199809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 29974424 - 29974750
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| ||    
T  29974424 gaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctaga 29974523  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  29974524 cgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggatactccacgaatcatgttgaggaacatg 29974623  T
Q  201 agtgacc-tagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgtt 299  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||    
T  29974624 agtgaccttaggtagaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacaggcccaatattgaactagacaagggtgacatg--ctatgtcttgtgtt 29974721  T
Q  300 caatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  29974722 caatatagacatgagggtaaaatggtaat 29974750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 29925271 - 29925596
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| ||    
T  29925271 gaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctaga 29925370  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  29925371 cgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggatactccacgaatcatgttgaggaacatg 29925470  T
Q  201 agtgacc-tagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgtt 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||    
T  29925471 agtgaccttaggtagaatttgcccctcctacataacgggagaaatgtcta-aggcccaatattgaactagacaagggtgacatg--ctatgtcttgtgtt 29925567  T
Q  300 caatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  29925568 caatatagacatgagggtaaaatggtaat 29925596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 16200730 - 16200972
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  16200730 gaatactacatagtcaaaattatgtaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcaaccctttgacctgaaaccactatgtaccctaga 16200829  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16200830 tgttgaagtcgagtgctttgtcaccattcaaatgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatggatactccacgaatcatgctgagagacatg 16200929  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaa 243  Q
    |||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16200930 agtgacgtagacaaaatttgcccctcctacataacaggagaaa 16200972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 28088227 - 28088448
Alignment:
Q  3 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatg 102  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  28088227 atactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg 28088323  T
Q  103 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgag 202  Q
    | ||| || || |||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28088324 t-ggactcaagggctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatggatacttgatgaatcatgctgagggacatgag 28088422  T
Q  203 tgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    || ||||||||| ||||| |||||||    
T  28088423 tgtcctagatgggatttgtccctcct 28088448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 21034357 - 21034580
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  21034357 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 21034453  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  21034454 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatg 21034552  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  21034553 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 21034580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 12300029 - 12300252
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  12300029 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 12300125  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || |||| |||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  12300126 tgt-ggactcaagtgatttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggtcatg 12300224  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  12300225 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 12300252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20147737 - 20147514
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  20147737 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 20147641  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  20147640 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 20147542  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  20147541 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 20147514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 322
Target Start/End: Original strand, 9504737 - 9504928
Alignment:
Q  129 caaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9504737 caaacatcatccgtaacaggatgatcataaagttggttgaggggtcctcgacaaatcatgctaagggacacaagtgacctagatggaattttcccctcct 9504836  T
Q  229 acataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaag 322  Q
    ||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||     ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  9504837 acataatgggagatatgtctaagcgcccaatattgaaccggacaagggtgaca--tattatgcattgtgttctatatatacatgagggcaaaag 9504928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25978911 - 25978703
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  25978911 gaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaga 25978815  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  25978814 tgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgttgagggacatg 25978716  T
Q  201 agtgacctagatg 213  Q
    |||| ||||||||    
T  25978715 agtgtcctagatg 25978703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 21398911 - 21399134
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| | | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  21398911 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattcttacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaga 21399007  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  21399008 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatg 21399106  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  21399107 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 21399134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 55427140 - 55427363
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||   | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  55427140 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 55427236  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  55427237 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatg 55427335  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    ||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  55427336 agtgttctagatgggatttgtccctcct 55427363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15846719 - 15846496
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  15846719 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaga 15846623  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || |||| |||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  15846622 tgt-ggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatg 15846524  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| |||| |||| ||||| |||||||    
T  15846523 agtgtcctatatgggatttgtccctcct 15846496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 23015039 - 23014940
Alignment:
Q  228 tacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaagggtaa 327  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||    
T  23015039 tacataacagaagaaatgtctacaagcccaatattgaactagacaag-atgacacggtctatgccttgtgttcattatagacacgagggcaaaaggataa 23014941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 14890510 - 14890746
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||   | ||| ||||||||| |||| ||  | || ||    
T  14890510 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaagcactgtgatctctaga 14890606  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||   ||||| ||| ||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  14890607 tgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataattataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaagggacatg 14890705  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggaga 241  Q
    |||| ||||||||| |||||  ||||||   ||||||||||    
T  14890706 agtgtcctagatgggatttgttcctcctcattaacaggaga 14890746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24253267 - 24253088
Alignment:
Q  32 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| | |||||  || |||||| ||||||   | |||||    
T  24253267 tcataagttattctcatagtgataacggtgtattccaca-ttcgacctaaaaccactatgtaccttagatgtatgactcgagtactttgttgtcgttcaa 24253169  T
Q  132 acattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagat 212  Q
    ||||||||  | ||||  |||| |||||||| |||||||  || ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24253168 acattgtcaattacagagtgaccataaagttagttgatgaatattccacaagtcatgctaagggacatgagtgacctagat 24253088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15317330 - 15317152
Alignment:
Q  30 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 129  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||| | | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||| || ||| ||||||||   |||    
T  15317330 tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtaaatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtca---ttc 15317235  T
Q  130 aaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagat 212  Q
     ||| ||||| ||||  |||| |  |||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15317234 taacgttgtctgtaaacggataatcataacgttggttgacgggtacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagat 15317152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 228
Target Start/End: Original strand, 30464147 - 30464338
Alignment:
Q  35 taagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaaca 134  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || |||| ||| |   |||||||||     
T  30464147 taagatattctcataatgataatggtctataccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttattgacattcaaacg 30464245  T
Q  135 ttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    ||||| |||| ||||| |  |||| | ||||| |||| ||||  | |||||||| |||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  30464246 ttgtctgtaaaaggataatcataacg-tggttaatggatacttgacgaatcatggtgagagacatgagtgtcctagatgagatttgtccctcct 30464338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 228
Target Start/End: Original strand, 11787825 - 11787929
Alignment:
Q  124 ccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgccc 223  Q
    |||||| ||| ||||| ||||  |||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||    
T  11787825 ccattctaacgttgtctgtaaatggataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatcatgttgagggacatgagtgtcctagataggatttgtcc 11787924  T
Q  224 ctcct 228  Q
    |||||    
T  11787925 ctcct 11787929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Original strand, 15526890 - 15527021
Alignment:
Q  21 tatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | | || || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  || |  ||| |||| || ||||||||     
T  15526890 tatgaaaa-tgtcataagatattcttacaatgttaatggtgtataccactcttagacctgaaaccactatgatccatacatg-tggactcaagtgcttta 15526987  T
Q  121 tcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgact 154  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  15526988 taaccattcaaacgttgtctgtaacagcatgact 15527021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Original strand, 15537798 - 15537883
Alignment:
Q  149 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataa 234  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  15537798 atgaccataatgttggttaatggacactcgacgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatgagatttgtccctccttcataa 15537883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Original strand, 14147156 - 14147375
Alignment:
Q  19 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 118  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||   |||| || | |||| |||| |||||    
T  14147156 gttatgaaaa-tgtcgtaagatattctcacattgataaaggtgtatatcactcttagacctgaaaccactataatccctagacg-tggactcgattgctt 14147253  T
Q  119 tgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatt 218  Q
    | |  |||||| ||| ||||  |||| ||| | || |||| ||||  | |||||||||  ||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  14147254 tattgccattctaacgttgtttgtaaaagggtaaccataatgttgactaatgggtacttgatgaaccatcttgagggacatgagtatcctagatgggatt 14147353  T
Q  219 tgcccctcctacataacaggaga 241  Q
    || |||||||  |||||||||||    
T  14147354 tgtccctcct-tataacaggaga 14147375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 220
Target Start/End: Original strand, 26816510 - 26816626
Alignment:
Q  104 tggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagt 203  Q
    |||| ||||||||||| |  |||| ||||  ||||| |||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  26816510 tggattcgagtgctttatttccatacaaatgttgtctgtaaaaggataactataacgttagttaatgggtacttgaggaatcatgttgagtgacatgagt 26816609  T
Q  204 gacctagatggaatttg 220  Q
    | ||||||||| |||||    
T  26816610 gtcctagatggtatttg 26816626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 36138097 - 36138033
Alignment:
Q  27 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 91  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  36138097 aagtgccataagatatttccaaagtgataatggtgtataccacccttcaacctgaaatcactatg 36138033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17197383 - 17197335
Alignment:
Q  279 acacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  17197383 acacggtctatgccttgtgttcaatatata-atgagggcaaaagggtaat 17197335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 244
Target Start/End: Original strand, 16240835 - 16240897
Alignment:
Q  182 aatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaat 244  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||||| |||||||||    
T  16240835 aatcatgttgacggacatgagtgacctagatgatatttgtctctactacataataggagaaat 16240897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 55
Target Start/End: Original strand, 32280415 - 32280444
Alignment:
Q  26 aaagtgtcataagatattctcatagtgata 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280415 aaagtgtcataagatattctcatagtgata 32280444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 91
Target Start/End: Original strand, 36142816 - 36142880
Alignment:
Q  27 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 91  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  36142816 aagtgccataagatatttccaaagtgataatgatgtatgtcacccttcaacctgaaaccactatg 36142880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 15152743 - 15153070
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15152743 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 15152842  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15152843 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaattatgttgagggacatg 15152942  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152943 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 15153042  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15153043 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 15153070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 29328084 - 29328411
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29328084 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 29328183  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328184 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgcttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 29328283  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328284 agtgacctagatggaacttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 29328383  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29328384 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 29328411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 12751126 - 12751453
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  12751126 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactaggtaccctaga 12751225  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12751226 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatgctgaggaacatg 12751325  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751326 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 12751425  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12751426 aatatagacatgagggcaaaaggataat 12751453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11535969 - 11535642
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11535969 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccaacattcgacctgaaaccactatgtaccctaga 11535870  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535869 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 11535770  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11535769 agtgacctagatggaattttcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtattc 11535670  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11535669 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 11535642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11542887 - 11542560
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11542887 gaatactacatagtaaatgttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 11542788  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542787 tgctggagtcgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 11542688  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542687 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaacttgacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 11542588  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11542587 aatatagacatgagggcaaaaggataat 11542560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 12738836 - 12739144
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  12738836 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccgttcgacctgaaactactatgtaccctaga 12738935  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12738936 tgttgtagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgttgagggacatg 12739035  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12739036 agtgacctagatggaatttggccctcctacataacaggagaaatgtctacgggaccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 12739135  T
Q  301 aatatagac 309  Q
    |||||||||    
T  12739136 aatatagac 12739144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 18561307 - 18561625
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18561307 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa---------atagtgatagtggtgtattccacccttcgacttgaaaccactatgtaccctaga 18561397  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18561398 tgttggagttgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgattgataggtactgcacgaatcatgctgagggacatg 18561497  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561498 agtgacctagagggaatttgcccctcctacataacagaagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 18561597  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||    
T  18561598 aatatagacataagggcaaaagggtaat 18561625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 13392450 - 13392775
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||    
T  13392450 gaatattacatagtaaaatttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctttgacctaaaatcactatgtaccataga 13392549  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13392550 tgttggagtcaggtgctttgtcaccatacaaacgttgtttgtaacaagatgactataaaattggttgatgggtactccatgaatcatgctgagagacatg 13392649  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||| | |||||||    
T  13392650 agtgacctagatagaatttgcccctcctacataacatgaaaaatatctacgggcccaatattgaactagacaagggtgacatg--ttatgtcctgtgttc 13392747  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||    
T  13392748 aatatagacatgagggcgaaagggtaat 13392775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 281
Target Start/End: Original strand, 2365236 - 2365500
Alignment:
Q  17 aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 115  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| |||     
T  2365236 aagttatgtaaa-tgtcataagttattctcattgtgataagtggtgtatttcaccattcgacctaaagccactatgtaccctagaccttggagtcaagta 2365334  T
Q  116 ctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatgga 215  Q
    ||||||   | | ||||| | |||||||||||  |||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  2365335 ctttgttgtcgtacaaacgtcgtccgtaacagattgactataaagtcggttgatgagtgctcaacgaatcatgttgagggacatgagtgtcatagatgga 2365434  T
Q  216 atttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgaca 281  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  2365435 atttacccctcctacataacaagagatatgtctaagggcccaatattgaaatggacaagggtgaca 2365500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18257730 - 18257516
Alignment:
Q  22 atgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgt 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||| || ||||||||||    
T  18257730 atgaaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgt 18257632  T
Q  122 caccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgc 221  Q
      |||||||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||     
T  18257631 tgccattcaaacgttgtgtgtaacaagataactataaagttggttgatgggtacttgaagaatcatgttgatggacatgagtgtcctagatgggatttgt 18257532  T
Q  222 ccctcctacataacag 237  Q
    ||||||| ||||||||    
T  18257531 ccctccttcataacag 18257516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41681151 - 41680928
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  41681151 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaga 41681055  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  41681054 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgattggtacttgatgaatcatgttgagggacatg 41680956  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  41680955 agtgtcctagatggaatttgtccctcct 41680928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 2204671 - 2204894
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  2204671 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 2204767  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  2204768 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 2204866  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  2204867 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 2204894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 8465118 - 8465341
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  || | ||    
T  8465118 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccttaga 8465214  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  8465215 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaagggacatg 8465313  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||| | ||||| |||||||    
T  8465314 agtgtcctagataggatttgtccctcct 8465341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18400223 - 18400446
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  18400223 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctaga 18400319  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  18400320 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 18400418  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  18400419 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 18400446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18407207 - 18407430
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  18407207 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctaga 18407303  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  18407304 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 18407402  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  18407403 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 18407430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48808679 - 48808456
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  48808679 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 48808583  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  48808582 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 48808484  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  48808483 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 48808456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18139521 - 18139298
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  18139521 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 18139425  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||    
T  18139424 tgt-ggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataataataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgttgaggggcatg 18139326  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  18139325 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 18139298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47167042 - 47166819
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  47167042 gaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaga 47166946  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||    
T  47166945 tgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgataaatcatgttgagggacatg 47166847  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  47166846 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 47166819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Original strand, 34128718 - 34128915
Alignment:
Q  30 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 129  Q
    |||||||||||||||||| | | ||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||| || ||| ||||||   |||||    
T  34128718 tgtcataagatattctcacaattataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattc 34128816  T
Q  130 aaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
     ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  34128817 taacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgttgagggacatgagtgtcctagatgggatttgtccctcct 34128915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 15729870 - 15730093
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||   | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  15729870 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 15729966  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  15729967 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatg 15730065  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    ||||  | |||||| ||||| |||||||    
T  15730066 agtgttccagatgggatttgtccctcct 15730093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 30254257 - 30254480
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||  || ||| ||| |||||||||||||  | || ||    
T  30254257 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattactcttagacttgaaaccactatgatctctaga 30254353  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||    
T  30254354 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgataaatcatgctaagggacatg 30254452  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  30254453 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 30254480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18259281 - 18259100
Alignment:
Q  30 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 129  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||  ||||  |||| ||||| ||| || ||| ||||||  ||||||    
T  18259281 tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaacccttatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattc 18259183  T
Q  130 aaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagat 212  Q
     ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18259182 taacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaagggacatgagtgtcctagat 18259100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Original strand, 28130706 - 28130903
Alignment:
Q  30 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 129  Q
    |||||||||||||||||| | | ||| | ||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||  || | ||||| ||| || ||||||||||   |||||    
T  28130706 tgtcataagatattctcacaataataatagtgtatatcattcttagacctgaaatcactatgatccgtagatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattc 28130804  T
Q  130 aaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
     ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||    
T  28130805 taacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatcatgttgagggacatgagtgtcatagatgaaatttgtccctcct 28130903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Original strand, 39112138 - 39112414
Alignment:
Q  40 tattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtc 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||   ||| || ||||| |||||||||| || ||||| ||| || |||  |||||   | ||||||| |||||    
T  39112138 tattctcttagtgatagtggtgtattccattattcaacatgaaatcactatgtactctagatgtaggaatcaagtattttgttgtcgttcaaacgttgtc 39112237  T
Q  140 cgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacagga 239  Q
     |||| | | |||||||||||||||||||| ||||||| |  || |||  |||||||||||| |||||  ||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  39112238 tgtaataaggtgactataaagttggttgataggtactctacaaaacattttgagggacatgaatgacc--gatggaatttgcttctcctacataacaaga 39112335  T
Q  240 gaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaa 320  Q
    ||||||| || | | ||| |||| |||| ||||| | ||||||   | ||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  39112336 gaaatgtttaagagtccagtattaaactggacaaaggtgacac--acaatgtcttgtgttcaatataaacacgagggcaaa 39112414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10669085 - 10668861
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagt-gatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgg 99  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||  | | |||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  || |      
T  10669085 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcgcaattgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccgtaa 10668989  T
Q  100 atgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacat 199  Q
    |||| ||| || | ||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10668988 atgt-ggactcaaatgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggacat 10668890  T
Q  200 gagtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    ||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  10668889 gagtgtcccagatgggatttgtccctcct 10668861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 316
Target Start/End: Original strand, 10235592 - 10235773
Alignment:
Q  134 attgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacata 233  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||   ||  |||||||    
T  10235592 attgttcgtagcaggatgaccataaactcggttgatgggtactccataaatcacgctgagggacatttgtgacctagat-gaattttttccatctacata 10235690  T
Q  234 acaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtg 316  Q
    || |||||||||| ||  |   | || |||| || ||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10235691 actggagaaatgtttaaagagtctatgttgagcttgacaagggtgacatggtttatgccaagtgttcaatatagacatgagtg 10235773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 141 - 314
Target Start/End: Original strand, 7396650 - 7396821
Alignment:
Q  141 gtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacag--g 238  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | | |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||       
T  7396650 gtaacaagatgactataaagtcggtagatgggtactctacgcatcatgttgaggaacatgagtgacctagatgcaatttttccct-ctacataacagaaa 7396748  T
Q  239 agaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgag 314  Q
    | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||  | ||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7396749 aaaaatatctaagggccaaatattgaactagacataggtga-acg--ttatgccttctgttcaatatagacatgag 7396821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15169473 - 15169265
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | || ||| | ||| |||||||||||  |||  ||    
T  15169473 gaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatgctactcttagtcctaaaaccactatgatcccaaga 15169377  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| |  | |||||| |  |||||||||| || ||  ||||||||| || |||| |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||    
T  15169376 tgt-ggacttaaatgctttattgccattcaaacgttatctataacaggataaccataacgttggttgataggcacttgatgaatcatgctgagggacatg 15169278  T
Q  201 agtgacctagatg 213  Q
    |||| ||||||||    
T  15169277 agtgtcctagatg 15169265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 19231007 - 19231215
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  ||||  |    
T  19231007 gaatactacataataa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaaa 19231103  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || |||| |||||  |||||| ||| ||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  19231104 tgt-ggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatg 19231202  T
Q  201 agtgacctagatg 213  Q
    ||||  |||||||    
T  19231203 agtgttctagatg 19231215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25845659 - 25845423
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||| || |||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||| ||    
T  25845659 gaatactacatagtat--gttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctaga 25845563  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    || |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| ||||||| || || | |  ||||||||||||||||||||||    
T  25845562 tg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtttataggaatttgatgaatcatgctgagggacatg 25845464  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggaga 241  Q
    |||   |||||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  25845463 agttttctagatgttatttatccctccttcataacatgaga 25845423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25846078 - 25845842
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||| || |||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||| ||    
T  25846078 gaatactacatagtat--gttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctaga 25845982  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    || |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| ||||||| || || | |  ||||||||||||||||||||||    
T  25845981 tg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtttataggaatttgatgaatcatgctgagggacatg 25845883  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggaga 241  Q
    |||   |||||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  25845882 agttttctagatgttatttatccctccttcataacatgaga 25845842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19393607 - 19393384
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| | ||||||| ||| ||| |||||||| ||| ||||  |||| ||    
T  19393607 gaatactacatagtat--gttatgaaaa-tctcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaatccagtatgatccctaga 19393511  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||| | || |||||||||| ||| ||| ||  ||||| |||| ||||| || |||  ||| | | || ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19393510 tgttg-actcaagtgctttgttacctttctaatgttgtctgtaaaaggataaccatagcgttagctaataggtacttgatgaatcatgctgagggacatg 19393412  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||| | ||||| |||||||    
T  19393411 agtgtcctagattggatttgtccctcct 19393384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31190596 - 31190387
Alignment:
Q  30 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||| |  |||| ||||  | | || ||||| || |   |||||    
T  31190596 tgtcttaagatattctcatagtgataatggtgtatatcactgttagacctgaaaccactaagatccctagatgcag-actcaagtgcgttattgtcattc 31190498  T
Q  130 aaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctccta 229  Q
     ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||| | |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||     
T  31190497 taacattgtctgtaaaaggataaccataacattggctaatggatacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatgagatttttccctcct- 31190399  T
Q  230 cataacaggaga 241  Q
    ||||||||||||    
T  31190398 cataacaggaga 31190387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Original strand, 14591985 - 14592205
Alignment:
Q  19 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||  |||| |   |  | | |||    
T  14591985 gttatgaaaa-tgtcataagatattctcagattgataatagtgtatatcactcttagacttgaaaccactatgatccctatatgtggacttacatttctt 14592083  T
Q  119 tgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatt 218  Q
    | |  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||| | |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  14592084 tattgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggctaatgggtacttgatgaatcatgttgagggacatgagtgtcctagatgggatt 14592183  T
Q  219 tgcccctcctacataacaggaga 241  Q
    || | ||||| ||||||| ||||    
T  14592184 tgtcgctcct-cataacatgaga 14592205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22948574 - 22948397
Alignment:
Q  39 atattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgt 138  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| | ||||  |||| | || |||||    
T  22948574 atattctcgtagtaatagtcgtgtatgccacccttcgacatgaaaccgctatgtaccttagatgtaggagttgagtacgttgtttccatactaagattgt 22948475  T
Q  139 ccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaa 216  Q
      |||| |||| || ||||||||| |||||||  ||||| |  ||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||    
T  22948474 atgtaaaaggacgattataaagtttgttgatgaatactctagaaatcatgttgaaggacatgagttgtctagatggaa 22948397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24443494 - 24443313
Alignment:
Q  19 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 118  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||  |||| ||||| ||| || |||||||    
T  24443494 gttatgaaaa-tgtcataagttattctcacagtgataatggtgtataacactcttagacttgaaaccattatgatccctagatgt-ggactcaagtgctt 24443397  T
Q  119 tgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgag 202  Q
    | |    |||||||| ||||  ||||||||||||| |||| |||||||  |||  |||  |  |||||||||||||||||||||    
T  24443396 tattgttattcaaacgttgtgtgtaacaggatgaccataacgttggttattggacacttgacaaatcatgctgagggacatgag 24443313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2635427 - 2635317
Alignment:
Q  127 ttcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctc 226  Q
    |||||| ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||  ||| ||| ||||| || | ||||| |||||||  |||||||||||    
T  2635427 ttcaaatattgtctattacaggatgactataaagtcggttgatgggtattgcacaaattatgttgaggaacttaagtgatctagatgagatttgcccctc 2635328  T
Q  227 ctacataacag 237  Q
    |||||||||||    
T  2635327 ctacataacag 2635317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 91
Target Start/End: Original strand, 19388697 - 19388762
Alignment:
Q  26 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  19388697 aaagtgtcataagatattctcatagtggtaatagtgtataccactcttagacctgaaaccattatg 19388762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 16011576 - 16011766
Alignment:
Q  19 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||||  |||| |   |  | | |||    
T  16011576 gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacattgataataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatgtggacttacatttctt 16011674  T
Q  119 tgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctag 210  Q
    | |  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||| | |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16011675 tattgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggctaatgggtacttgatgaatcatgttgagggacatgagtgtcctag 16011766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7662392 - 7662321
Alignment:
Q  195 gacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaact 267  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7662392 gacatgggtgacctagatgaaattttccc-tcctacatagcaagagaaatgtctaagggcacaatattgaact 7662321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11546560 - 11546520
Alignment:
Q  288 atgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11546560 atgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaat 11546520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 22969069 - 22969153
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccact 88  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  22969069 gaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataacggtgtataccactcttagacctgaagccact 22969153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Original strand, 29984308 - 29984371
Alignment:
Q  34 ataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 97  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || ||| |||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  29984308 ataagatattctcatagtggaagtgatgcatatcacccttcaacttgaaaccaccatgtaccct 29984371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47833751 - 47833653
Alignment:
Q  127 ttcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccct 225  Q
    ||||||| | ||| |||||| |||||  ||||||| | |||||  |||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  47833751 ttcaaacgtcgtcagtaacaagatgatcataaagtcgattgatctgtacgccacaaatcatgttgagggacatgaatgacctaaatggaatttacccct 47833653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 91
Target Start/End: Original strand, 3588054 - 3588118
Alignment:
Q  26 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 91  Q
    ||||| ||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  3588054 aaagtttcaaaagatattctcacaatgatagtgatgtata-cactcttagacctgaaaccactatg 3588118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 241
Target Start/End: Original strand, 12409793 - 12409882
Alignment:
Q  152 actataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggaga 241  Q
    ||||||||||||||| ||||  | |  |||||||||| |||||||||||||||  | |||||  ||||  ||||||| ||||||||||||    
T  12409793 actataaagttggttaatggacaattgatgaatcatgatgagggacatgagtgttcaagatgatatttttccctcctgcataacaggaga 12409882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21330155 - 21329828
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21330155 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 21330056  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21330055 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtaggttgatggggactccatgaatcatgctgagggacatg 21329956  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329955 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 21329856  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21329855 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 21329828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 18796806 - 18797133
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18796806 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatggtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaaa 18796905  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18796906 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtacgtaacaggatgactataaagtttgttgatgggtacaccatgaatcatgttgagggacatg 18797005  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  18797006 agtgacctagatgaaattttcccctcctacataataggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacatggtttatgccttgtattc 18797105  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||    
T  18797106 aatatagacatgagggaaaaagggtaat 18797133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 18620104 - 18620414
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  18620104 gaatactacatagtaaaagttatgaaa-gtgtcataagatattctcatggtgatattggtgtatcccaccctttgacctgaaaccactatgtaccctaaa 18620202  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  18620203 tgttggagtcgagtgctttatcaccattcacattatgtatgtaacaagatgaccataaagttggttgatgggtactccactaatcatgctgatggacatg 18620302  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  18620303 agtgacccagatataatttggtcctcctacataacaggataaatgtctacgggcccaatattaaactgaacaagggtgacatg--ctatgccttgtgttc 18620400  T
Q  301 aatatagacatgag 314  Q
    ||||||||||||||    
T  18620401 aatatagacatgag 18620414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 192 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22791574 - 22791438
Alignment:
Q  192 agggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgc 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22791574 agggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaattgtctacgggaccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgc 22791475  T
Q  292 cttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22791474 cttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaat 22791438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 321
Target Start/End: Original strand, 17241034 - 17241329
Alignment:
Q  25 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcac 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17241034 aaaagtgtaataagatattctcatagtgataatggtgtatttcacc-ttcgacctaaaaccactatgtactgtagatgtaggagtcaagtactttatcac 17241132  T
Q  125 cattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccc 224  Q
    |  |||||| ||||  |||||| || | ||||||| | ||| |||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  17241133 cgctcaaacgttgtgtgtaacatgaagcctataaaatcggtagatatgtacttcatgaaacatgttgagggacatgagtgacctagatgaaatttgtccc 17241232  T
Q  225 tcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaa 321  Q
     ||||||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  17241233 acctacataacatgataaatgtctacaaacccaatattgaactagataaggatgacactgtctataccttatgttcaatatagacataagagcaaaa 17241329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 327
Target Start/End: Original strand, 36270503 - 36270786
Alignment:
Q  41 attctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtc 139  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||  ||||||| | ||||||  || | ||||  | ||     
T  36270503 attctcatagtgataagtggtgtattc-acccttcgacctaaaaccaccatgcaccctagatgtatgagtcgaatactttgttgccgtacaaaagtcgtt 36270601  T
Q  140 cgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacagga 239  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||||| |||||| ||    
T  36270602 cgtaacaggatgactataaagtcggttgttgggtactcaatgaatcatgctgagggacacaagtgatctagattgaatttgtctctcctatataaca-ga 36270700  T
Q  240 gaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaagggtaa 327  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36270701 gaaatgtctaagggccgaatattgaactggataaggatgata--tactatgccttgtgttcaatatagacatgagggaaaaagggtaa 36270786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 121 - 328
Target Start/End: Original strand, 41661694 - 41661899
Alignment:
Q  121 tcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttg 220  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  41661694 tcaccattcaaacgttgtctataataagatgatcataaagttggttgatgggtactccatgaaacatgttgagggacatgagtgacctagatag-atttg 41661792  T
Q  221 cccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaa 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||     ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  41661793 tccctcctacataacaggagaaatgtctac-ggcccaatattgaactgaacaagggtgacatatattataccttgtgttcaatatatacatgagggcaaa 41661891  T
Q  321 agggtaat 328  Q
    | ||||||    
T  41661892 atggtaat 41661899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6991996 - 6991709
Alignment:
Q  27 aagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt-gtcac 124  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| ||  |    
T  6991996 aagtgacataaactattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcggcctgaaatcactatgttccctagatgtaggagtcgagtacttttgtttc 6991897  T
Q  125 cattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccc 224  Q
      || |||| |||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  6991896 tgtttaaacgttgtctatgacacgatgactataaagtcggttgatgggtattacacaaatcatgcagagggacatgagtgacctagatggaatttatccc 6991797  T
Q  225 tcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgag 314  Q
    || ||||||| |   ||||||||||  | | || ||||||||| ||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6991796 tcttacataataatggaaatgtctaaagtctcactattgaactggacaagggtgacac--actatgtcttgtgttcaatatagacatgag 6991709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22183354 - 22183069
Alignment:
Q  41 attctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtc 139  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||| || ||||| |||||||||| ||||||     | ||||| ||||     
T  22183354 attctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccaacgtgtactcttgatgtaggagtcgagtactttgttgttgtacaaacgttgtt 22183255  T
Q  140 cgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacagga 239  Q
     ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||| |||||||||  |||| || |||||||||||| | ||||| ||||||  ||    
T  22183254 tgtaacaggatgactataaagtcgattgatgggtatttgatgaatcatgttgagggacacaagtgtccaagatggaatttg-cgctcctgcataactaga 22183156  T
Q  240 gaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
     |||||| || ||||  ||||||||| | ||||||| ||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  22183155 aaaatgtatatgggcttaatattgaattggacaagggtgacatg--ttatgccttgtgttcaatatatacatgaggacaaaagggtaat 22183069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 328
Target Start/End: Original strand, 18822435 - 18822705
Alignment:
Q  55 agtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgact 154  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||| |   |||  |||| |  |||||||||  ||||||    
T  18822435 agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtcaagtacttttttgtcatataaacgtcatccgtaacacaatgact 18822534  T
Q  155 ataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggc 254  Q
    |||||||||||| |||||||||    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||| | | ||||||||||||  |||||||| || |||     
T  18822535 ataaagttggttaatgggtacttggcgaatcatgatgagggacacgggtgacctagatgaatttttctcgtcctacataacataagaaatgtttaaggg- 18822633  T
Q  255 ccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||     |||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  18822634 ccaattttgaactggacaagggtgaca--tattatgtcttgtgttcaatatagacatgaggtcgaaagggtaat 18822705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15342184 - 15341949
Alignment:
Q  2 aatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggat 101  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||    
T  15342184 aatactacatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatagtctcacaatgatagtggtgtatgccactcttagacctgaaaccactatgatccctagat 15342088  T
Q  102 gttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatga 201  Q
    || | | || | |||||| |  | ||||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||  |  ||||||||||||| ||||||    
T  15342087 gt-gaactcaaatgctttattgcaattcaaaaattgtttgtaacaggatgaccataacgttggttaatgggtacttgacaaatcatgctgaggtacatga 15341989  T
Q  202 gtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggaga 241  Q
    ||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15341988 gtgtcctagatgagatttgtccctccttcataacaggaga 15341949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 36799826 - 36799576
Alignment:
Q  41 attctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtc 139  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||| ||||||  || | |||||   |||    
T  36799826 attctcatagtgataagtggtgtattctaccgtttgacctgaaaccactatgcgccctagatgtaggagtcaagtactttgttgccgtacaaacgccgtc 36799727  T
Q  140 cgtaaca--------ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgct-gagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctac 230  Q
    ||||| |        ||| |||||| | |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  36799726 cgtaagaacgtaataggaggactattacgttggttgatgggtactcgacgaatcatgtttgagggacatgagtgacctagatggaatttgtacctcctaa 36799627  T
Q  231 ataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgaca 281  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||| |||||    
T  36799626 ataacagaagaaatgtctaagggtccaatattgaacttgaaaagggtgaca 36799576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 30174496 - 30174719
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  30174496 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 30174592  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  30174593 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 30174691  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  30174692 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 30174719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24250215 - 24249992
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  24250215 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 24250119  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || |||| |||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  24250118 tgt-ggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 24250020  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  24250019 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 24249992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 308
Target Start/End: Original strand, 12298232 - 12298407
Alignment:
Q  131 aacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctac 230  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||  | ||||| |    
T  12298232 aacattgttcgtaacaagatgactataaagtcagttgataggtacttcacaaatcatgatgagggacacgagtaacctagatgaaatttttctctcctgc 12298331  T
Q  231 ataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatataga 308  Q
    |||| |||| |||||| ||  | |||||| ||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  12298332 ataataggataaatgtttaatgacccaattttgaactggacaagggtgacacg--ttatgccttgtgttcaatataga 12298407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24229398 - 24229175
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| | | ||| | | |||||||||||||  |||| ||    
T  24229398 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagccttgaaaccactatgatccctaga 24229302  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| | | || ||||||||||   ||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24229301 tgtag-actcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgaagggtacttgatgaatcatgctgagggacatg 24229203  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| | |||||  |||||| |||||||    
T  24229202 agtgtcatagataaaatttgtccctcct 24229175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 29800590 - 29800826
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||||||| | | |||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||| ||    
T  29800590 gaatactacatagtat--gttat-aaaagtgtaacatgatattctcacaaggataatggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctaga 29800686  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || |||||||| |   ||||||||||||||| |||||||||| |  |||| ||||||| ||||| |||  | |||||||| | |||||||||    
T  29800687 tgt-ggactcaagtgctttattgtcattcaaacattgtctgtaacaggataatcataatgttggttaatgggcacttgacgaatcatgataagggacatg 29800785  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggaga 241  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||| || ||||||| ||||    
T  29800786 agtgtcctagatgagatttgtcccttcttcataacatgaga 29800826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 19616571 - 19616777
Alignment:
Q  20 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 119  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||| | ||||| |||    
T  19616571 ttatgaaaa-tgtcatatgatattctcacagtgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggacttgagtgtttt 19616668  T
Q  120 gtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaattt 219  Q
     |   ||||| ||||||||  |||| ||||| |  |||| ||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  19616669 attgtcattctaacattgtgtgtaaaaggataatcataacgttgactaatgggtacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagataggattt 19616768  T
Q  220 gcccctcct 228  Q
    | |||||||    
T  19616769 gtccctcct 19616777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 199
Target Start/End: Original strand, 20978192 - 20978371
Alignment:
Q  20 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 118  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||| ||| ||| || |||||||||||| ||||| ||| |||||| |||    
T  20978192 ttatgaaaa-tgtcataagttattctcgtagtgataagtggtgtattccactctttgacatgacactactatgtaccctagatgtaggattcgagtactt 20978290  T
Q  119 tgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacat 199  Q
    ||    |||  |||| | |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||    
T  20978291 tgatgtcatataaacgtagtccgtaacatgataactataaagtcgattgatggatactccacaaatcatgctgaggaacat 20978371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24763733 - 24763619
Alignment:
Q  125 cattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccc 224  Q
    ||||| |||||| || |||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||    
T  24763733 cattctaacattatctgtaaaaggatgactataacgtttgctaatgggtactt-atgaatcatgctgacggacatgagtgtcctagatgagatttgtccc 24763635  T
Q  225 tcctacataacaggaga 241  Q
    |||| ||||||||||||    
T  24763634 tcct-cataacaggaga 24763619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40301097 - 40300881
Alignment:
Q  27 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcacca 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||| ||||||||||||      | |||| |||| || |||||||| | | ||    
T  40301097 aagtgtcataagatagtctcatagtgataatgatgtataccactcttagacatgaaaccactatcatgagtagatg-tggactcaagtgctttattatca 40300999  T
Q  127 ttcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctc 226  Q
        |||||| |  |||||| ||| | |||||||||||||  ||| || |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  40300998 aatcaacattatttgtaacatgataaatataaagttggttagtggttagttgatgaatcatgttgagggacatgagtgtcctagatgatattttcccctc 40300899  T
Q  227 ctacataacaggagaaat 244  Q
     || |||||| |||||||    
T  40300898 ttatataacatgagaaat 40300881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 91
Target Start/End: Original strand, 21626890 - 21626955
Alignment:
Q  26 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  || ||||||||| |||||||    
T  21626890 aaagtgtcataagatattctcatagtgataatagtgtctaccactgttagacctgaaatcactatg 21626955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 28740986 - 28740922
Alignment:
Q  27 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 91  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||    
T  28740986 aagtgtcataagacattctcataatgataatggtgtataccattcttagatctgaaaccactatg 28740922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24471264 - 24471175
Alignment:
Q  147 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataaca 236  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||| |  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||  ||||| | || ||||||||||    
T  24471264 ggatgactataaattcggttgataggtactctacaaatcatgttgaaggacattagtgacctagatgtgatttgtctcttctacataaca 24471175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41316441 - 41316305
Alignment:
Q  26 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcacc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||  ||| |||||||| ||||||||  |||| |||| |||| |  || ||||| |   |    
T  41316441 aaagtgtcataagatattctcatactgataacggagaataccattcttagacctgaatccactatgatccctagatg-tggacttaagggctttattgtc 41316343  T
Q  126 attcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttg 163  Q
    |||||||| || || |||||||||| ||||||||||||    
T  41316342 attcaaacgttatctgtaacaggataactataaagttg 41316305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 328
Target Start/End: Original strand, 23662022 - 23662075
Alignment:
Q  275 gatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||    
T  23662022 gatgacacggtcaatgccttgtgttcaacatagatatgagagtaaaaaggtaat 23662075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 7407 - 7734
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  7407 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacaactatgtaccctaga 7506  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7507 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 7606  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7607 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacaggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 7706  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7707 aatataggcatgagggcaaaagggtaat 7734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 6841 - 6514
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6841 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 6742  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6741 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 6642  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6641 agtgacctagatggaatttgtccctcctacataacaggagaaatgtctatgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 6542  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6541 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 6514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13857 - 13530
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13857 gaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 13758  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13757 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggttactccatgaatcatgttgagggacatg 13658  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13657 agtgacctagatggaatttgtccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaacaagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 13558  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13557 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 13530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 18588 - 18914
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18588 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 18687  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18688 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgat-ggtactccatgaatcatgctgagggacatg 18786  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18787 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaacgagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 18886  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18887 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 18914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 15326498 - 15326825
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15326498 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 15326597  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15326598 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgttgagggacatg 15326697  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15326698 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatggcacggtctatgccttgtgttc 15326797  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15326798 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 15326825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 15506867 - 15507194
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15506867 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 15506966  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15506967 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgttgagggacatg 15507066  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15507067 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatggcacggtctatgccttgtgttc 15507166  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15507167 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 15507194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 22171787 - 22172113
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22171787 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 22171886  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171887 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 22171986  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171987 agtga-ctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacaggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 22172085  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22172086 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 22172113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 21940965 - 21941292
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21940965 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 21941064  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21941065 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatattgagggacatg 21941164  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941165 agtgacctagatggaattttcccctcctacataacatgagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 21941264  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21941265 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 21941292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 6094423 - 6094750
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  6094423 gaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgaccagaaaccactatgtaccctaga 6094522  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094523 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgttcgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 6094622  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094623 agtgaccaagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 6094722  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6094723 aatatagacatgagggcaaaaaggtaat 6094750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 47 - 328
Target Start/End: Original strand, 28548393 - 28548674
Alignment:
Q  47 atagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaaca 146  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28548393 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 28548492  T
Q  147 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgt 246  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28548493 gggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtggcctagatggaatttgcccctcctacataacatgagaaatgt 28548592  T
Q  247 ctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28548593 ctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaat 28548674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 24642949 - 24643274
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  24642949 gaatactacatagtaaaa-ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccacccttcgaactgaaaccactatgtaccctaga 24643047  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643048 tgttggagtcaagtgttttgtcaccattcaaacgtggtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 24643147  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  24643148 agtgatctagatggaattttcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaata-tgaactagacaaggatgacacggtctatgccatgtgtac 24643246  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
      |||||||||||| | |||||||||||    
T  24643247 cgtatagacatgagggaaaaagggtaat 24643274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 81 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24796826 - 24796599
Alignment:
Q  81 aaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 180  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |  |||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||      
T  24796826 aaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaatcgttct--gtaatataatggctataaaattggttgatgggtactccgc 24796729  T
Q  181 gaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgac 280  Q
     ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24796728 aaatcatgttgatggacatgactgacctagatgaaatttgcccctcctacataataggagaaatgtatgc-ggcccaatattgaactaaacaagggtgac 24796630  T
Q  281 acggtctatgccttgtgttcaatatagacatga 313  Q
    | |   ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24796629 atg--ttatgcattgtgttcaatataaacatga 24796599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22659677 - 22659462
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  22659677 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaga 22659581  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22659580 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggacatg 22659482  T
Q  201 agtgacctagatggaatttg 220  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  22659481 agtgtcctagatgggatttg 22659462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8371436 - 8371213
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  8371436 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaga 8371340  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  8371339 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggatgatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatg 8371241  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  8371240 agtgtcctagatgagatttgtccctcct 8371213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27007700 - 27007477
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  27007700 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 27007604  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  27007603 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 27007505  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  27007504 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 27007477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27014843 - 27014620
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  27014843 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 27014747  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  27014746 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 27014648  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  27014647 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 27014620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27880670 - 27880447
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  27880670 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 27880574  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  27880573 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 27880475  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  27880474 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 27880447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28020851 - 28020628
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  28020851 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 28020755  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  28020754 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 28020656  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  28020655 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 28020628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14983828 - 14983619
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgg 99  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  14983828 gaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggtgtattccgtccttcgacctgaaatcactatgtaccctag 14983732  T
Q  100 atgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacat 199  Q
    ||||  ||||||||| ||||||   | | ||||  |      ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  14983731 atgtaagagtcgagtactttgttttcgtacaaaagt------taacaagatgactataaagtcagttgatgggtaatcaatgaatcatgttgagggacat 14983638  T
Q  200 gagtgacctagatggaatt 218  Q
    || ||||||||||| ||||    
T  14983637 gactgacctagatgtaatt 14983619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22130792 - 22130569
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  22130792 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctaga 22130696  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| |||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  22130695 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 22130597  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  22130596 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 22130569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8782042 - 8781822
Alignment:
Q  19 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||| || |||| ||    
T  8782042 gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgttt 8781945  T
Q  119 tgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatt 218  Q
    | |   ||||||||| ||||  |||||| ||| || |||| ||| ||| ||||  |||  | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8781944 tattgtcattcaaacgttgtttgtaacatgataaccataacgttcgttaatggacacttgacgaatcatgttgagggacatgagtgtcctagatggaatt 8781845  T
Q  219 tgcccctcctacataacaggaga 241  Q
    || ||||||  ||||||||||||    
T  8781844 tgtccctccctcataacaggaga 8781822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 6431005 - 6431228
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| | | ||  ||||||||| |||||||  |||| ||    
T  6431005 gaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctctaagacctgaaatcactatgatccctaga 6431101  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6431102 tgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggacatg 6431200  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  6431201 agtgtcctagatgagatttgtccctcct 6431228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 12562242 - 12562465
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  12562242 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaga 12562338  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||   ||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  12562339 tgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatg 12562437  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  12562438 agtgtcctagatgagatttgtccctcct 12562465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 21969452 - 21969675
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  21969452 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 21969548  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  21969549 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaatggacatg 21969647  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||  |||||||    
T  21969648 agtgtcctagatgggatttatccctcct 21969675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 25611314 - 25611537
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| ||| ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  25611314 gaatactacatagtaa--gttatgaaac-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatctctaga 25611410  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||  ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| ||||    
T  25611411 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcatagtgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctaaggggcatg 25611509  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  25611510 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 25611537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 32872729 - 32872430
Alignment:
Q  27 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcacca 126  Q
    |||| ||||||  |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| |  |||||||||||| || ||| ||||| | |||| ||| ||||||         
T  32872729 aagtatcataaattattatcatagtgatattggtgtatgtcacccttcaatttgaaaccactatctatccttgatgtagaagtcaagtactttgttgttg 32872630  T
Q  127 ttcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctc 226  Q
    ||||||| |||||| |||||| | ||| ||||| | ||||  ||| ||||| || ||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||     
T  32872629 ttcaaacgttgtccataacagaacgaccataaaatcggttattggatactctataaattatgttgagggatatgagtgatctagatggaattttctccta 32872530  T
Q  227 ctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaagggta 326  Q
    || ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||| ||||||||    ||||  ||||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  32872529 ctgcataataggagaaatgtctaaaggctcaatattgaattggacaatgatgacac--aatatggtttgtgttaaatatagacatgatggaaaaagggta 32872432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 21916795 - 21917010
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  21916795 gaatactacattgtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 21916891  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  21916892 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataactttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggccatg 21916990  T
Q  201 agtgacctagatggaatttg 220  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  21916991 agtgtcctagatgggatttg 21917010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 24797295 - 24797224
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccaccctt 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  24797295 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-gtggtgtattccaccctt 24797224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45534456 - 45534233
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||   | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  45534456 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 45534360  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| |||||  ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||    
T  45534359 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggagcatg 45534261  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    ||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  45534260 agtgttctagatgggatttgtccctcct 45534233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2963089 - 2962892
Alignment:
Q  30 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 129  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | | ||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| || || ||| || ||| ||||||  ||||||    
T  2963089 tgtcataagatattctcacaatgataatagcgtatatccctcttagacctgaaaccactatgatccctagacgt-ggactcaagtactttgtttccattc 2962991  T
Q  130 aaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
     ||| ||||| | || ||||| || |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  2962990 taacgttgtctgcaaaaggataaccataacgttggttgatggttacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatgggatctgtccctcct 2962892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20535371 - 20535157
Alignment:
Q  26 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcacc 125  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| | |||  |   |||| || |||||||| |  ||    
T  20535371 aaagtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacctggaaccactatg-atccttaaatatggactcaagtgctttattgcc 20535273  T
Q  126 attcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccct 225  Q
    |||||||| |||||  ||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||  |  ||||||  |||||||||||| || | || |||| ||||| ||||    
T  20535272 attcaaacgttgtctataacaggataaccataatgttggttaatgggcacttgacaaatcatattgagggacatgaatgtcgtaaatgggatttgtccct 20535173  T
Q  226 cctacataacaggaga 241  Q
    ||| ||||||||||||    
T  20535172 ccttcataacaggaga 20535157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8968013 - 8967891
Alignment:
Q  199 tgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgt 298  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||| |||| ||  | | ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||     
T  8968013 tgagtgacttagatgaaattttcccctcctatataaaaggagacatgtttatagtctcaatattgacctagacaagggtaacacggtctatgtcttgtga 8967914  T
Q  299 tcaatatagacatgagtgcaaaa 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  8967913 tcaatatagacatgagggcaaaa 8967891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 328
Target Start/End: Original strand, 17083675 - 17083800
Alignment:
Q  203 tgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaa 302  Q
    ||||||||||||||||||  | || |||||||||| | ||||||||| |||  ||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17083675 tgacctagatggaatttgtgcttcttacataacagcaaaaatgtctatgggttcaatattaaactagacagggatgacatggtgtatgccttgtgttcaa 17083774  T
Q  303 tatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    | ||||||| |  | |||||||||||    
T  17083775 tgtagacattaaagaaaaagggtaat 17083800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 219
Target Start/End: Original strand, 2375411 - 2375555
Alignment:
Q  75 gacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 174  Q
    |||||||||| | ||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||  | || |||||||  |||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||     
T  2375411 gacctgaaactattatttaccatagatgtaggagtcgagtactttgttgctatacaaacatcatccgcaattggataactataaagtcggttgatgggtg 2375510  T
Q  175 ctccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaattt 219  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2375511 ctccatgaattatgatgagggacatgtgtgacctagatgaaattt 2375555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 38232197 - 38232005
Alignment:
Q  90 tgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgc 189  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| ||||||   | | ||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||   |||| |||||||      
T  38232197 tgtacccttgatgtagaagtcgagtactttgttgtcgtacaaacgttgtccgtgacatgatggttataaagttggttgatgggagttccacgaatcatta 38232098  T
Q  190 tgagggacatga-gtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgaca 281  Q
    |||| ||||| | |||||| | |||||||||||  || || ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  38232097 tgagagacataaagtgacccaaatggaatttgctactgcttcataacatgataaatgtctaagggcccaatattgaattagacaagggtgaca 38232005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 26240603 - 26240811
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||  |  |||||| | | ||| ||||| |||||||||||  |||| ||    
T  26240603 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgattataatgtatatcgctcttagacctaaaaccactatgatccctaga 26240699  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||   ||||| ||| ||||  |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  26240700 tgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtttgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatg 26240798  T
Q  201 agtgacctagatg 213  Q
    |||| ||||||||    
T  26240799 agtgtcctagatg 26240811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27099043 - 27098936
Alignment:
Q  141 gtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggag 240  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| ||||  | |  |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||    
T  27099043 gtaataggataaccataaagttggttaatggaaagttgatgaatcatgatgagggacataagtgtcctagatgagatttgcccctcctgcataacacgag 27098944  T
Q  241 aaatgtct 248  Q
    ||||||||    
T  27098943 aaatgtct 27098936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14979173 - 14979062
Alignment:
Q  216 atttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacggg-cccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgag 314  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||| ||||||| |||||    |||||| |||||||| || ||||||||||    
T  14979173 atttgcccctccaacataacaggagaaatctctaagggtaccaatattgaactggacaagggtgaca--tactatgcattgtgttctatgtagacatgag 14979076  T
Q  315 tgcaaaagggtaat 328  Q
      |||||| |||||    
T  14979075 gacaaaagagtaat 14979062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Original strand, 18835490 - 18835556
Alignment:
Q  25 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 91  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  18835490 aaaaatgtcataagatattcacacagtgataatggtgtatatcactcttagacctgaaaccattatg 18835556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Original strand, 36970394 - 36970555
Alignment:
Q  30 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 129  Q
    ||||||||||||||||   | ||||| | |||||||   | ||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||| || ||||||||||  ||||||    
T  36970394 tgtcataagatattcttgcaatgataatagtgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattc 36970492  T
Q  130 aaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctga 192  Q
     ||| || |  |||| ||| | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36970493 taacgttatatgtaaaagggtaacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctga 36970555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 313
Target Start/End: Original strand, 29645894 - 29645922
Alignment:
Q  285 tctatgccttgtgttcaatatagacatga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29645894 tctatgccttgtgttcaatatagacatga 29645922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25897 - 25570
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25897 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 25798  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25797 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccataaatcatgatgagggacatg 25698  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25697 agtgacctagatggaattcgcccctcctacgtaacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacatggtctatgccttgtgttc 25598  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25597 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 25570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19714405 - 19714078
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19714405 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 19714306  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19714305 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactacatgaatcatgttgagggacatg 19714206  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19714205 agcgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactatacaaggatgacacggtctatgccttgtgttt 19714106  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19714105 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 19714078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24695373 - 24695038
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24695373 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 24695274  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695273 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 24695174  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctaca--------taacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgcc 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24695173 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataactacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatggaacggtctatgcc 24695074  T
Q  293 ttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24695073 ttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaat 24695038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19707125 - 19706799
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| ||    
T  19707125 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagattttctcatagtgataattgtgtattccacccttcgacctgaata-actatgtaccctaga 19707027  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707026 tattggagtcgagtgctctgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 19706927  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19706926 agcgacctagatgaaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggacgacacggtctatggcttgtgttc 19706827  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19706826 aatatagacatgagggcaaaagggtaat 19706799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24702057 - 24701802
Alignment:
Q  81 aaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702057 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 24701958  T
Q  181 gaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctaca--------taacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagaca 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24701957 gaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataactacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagaca 24701858  T
Q  273 aggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24701857 aggatggcacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagggcaaaagggtaat 24701802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18569768 - 18569565
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18569768 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattatcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaca 18569669  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18569668 tgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaaattggttgatgggtacttcatgaatcatgctgagggacatg 18569569  T
Q  201 agtg 204  Q
    ||||    
T  18569568 agtg 18569565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17298793 - 17298483
Alignment:
Q  16 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagt 114  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | | | ||||||||||    
T  17298793 aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggcgtattccacccttcaacctgaaaccaatatgtaccctaggtttaggagtcgagt 17298695  T
Q  115 gctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatgg 214  Q
     ||||||  || | ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17298694 actttgtttccgtacaaacgttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatgcttagggacatgagtgacctagatgg 17298595  T
Q  215 aatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgag 314  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |  |||||||| | ||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17298594 aatttggccctcctacataacagaagaaatatctaagggacatatattgaattggacaagggtgaca--tactatgccttgtgttcaatatagacatgag 17298497  T
Q  315 tgcaaaagggtaat 328  Q
     | |||| ||||||    
T  17298496 ggaaaaatggtaat 17298483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27347428 - 27347224
Alignment:
Q  14 taaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgag 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27347428 taaaagttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctttgacacgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgag 27347330  T
Q  114 tgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatg 213  Q
    || ||||||||||||||||  || ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27347329 tgttttgtcaccattcaaatgttatctttaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatgagggacatgaatgacctagatg 27347231  T
Q  214 gaatttg 220  Q
    |||||||    
T  27347230 gaatttg 27347224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 17285627 - 17285377
Alignment:
Q  32 tcataagatattctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattca 130  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| || |||||||||| | | | ||| |||||| ||||||  || | ||    
T  17285627 tcataagttattatcatagtgataagtggtatattccactcttcgacctgaaatcaatatgtaccctaggtttaggattcgagtactttgtttccgtaca 17285528  T
Q  131 aacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctac 230  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17285527 aactttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatgcttagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctac 17285428  T
Q  231 ataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgaca 281  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | ||||||||| | ||||||| |||||    
T  17285427 ataacaggagaaatatctaagggacaaatattgaattggacaagggtgaca 17285377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 107 - 321
Target Start/End: Original strand, 39538954 - 39539168
Alignment:
Q  107 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgac 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||  | || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  39538954 agtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtttggaataggatgattataaagttggttggtaggtactccacgaatcatgttgagggacatgagtgac 39539053  T
Q  207 ctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatata 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||| | || | ||||||| |||||     ||||||||||||||||||||    
T  39539054 ctagatggaattttcccctcctacataacaagagaaatgtctacaaacccaataataaattggacaagggtgacatatgttatgccttgtgttcaatata 39539153  T
Q  307 gacatgagtgcaaaa 321  Q
    |||||||||||||||    
T  39539154 gacatgagtgcaaaa 39539168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 103 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28719558 - 28719351
Alignment:
Q  103 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgag 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  28719558 ttggagtcgagtgctttatcaccgt-caaacgttgtctgtaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatgaggaacatgag 28719461  T
Q  203 tgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaa 302  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||  ||   ||||| |||||||||||    
T  28719460 tgacctagatgaaattttcccttcctacataacaagagaaatgtcaacgggtccaatattaaactagacaagggtg--acttactatgtcttgtgttcaa 28719363  T
Q  303 tatagacatgag 314  Q
    ||||||||||||    
T  28719362 tatagacatgag 28719351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 17283216 - 17283045
Alignment:
Q  148 gatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtc 247  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17283216 gatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatgcttagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatatc 17283117  T
Q  248 tacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaa 321  Q
    || ||| | ||||||||| | ||||||| |||||    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17283116 taagggacaaatattgaattggacaagggtgaca--tactatgcattgtgttcaatatagacatgggggcaaaa 17283045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18568206 - 18568080
Alignment:
Q  200 gagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgtt 299  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  18568206 gagtgatctacaaggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcacaatattgaactaggcaaggatgacatggtctatgcct--tgtt 18568109  T
Q  300 caatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18568108 caatatagacatgaggacaaaagggtaat 18568080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 32018 - 32241
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  32018 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 32114  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  32115 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 32213  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  32214 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 32241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12789846 - 12789623
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||||  | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  12789846 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatactgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 12789750  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  12789749 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatg 12789651  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    ||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  12789650 agtgttctagatgggatttgtccctcct 12789623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22941369 - 22941592
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  22941369 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaga 22941465  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  22941466 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatg 22941564  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  22941565 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 22941592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 23546041 - 23546264
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  23546041 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 23546137  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  23546138 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 23546236  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  23546237 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 23546264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 20941146 - 20941369
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  20941146 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaga 20941242  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||   ||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  20941243 tgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatg 20941341  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  20941342 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 20941369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24933489 - 24933266
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||   | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  24933489 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 24933393  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  24933392 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatg 24933294  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    ||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  24933293 agtgttctagatgggatttgtccctcct 24933266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25805568 - 25805345
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | |||  ||||||||||||||||  |||| ||    
T  25805568 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttacacctgaaaccactatgatccctaga 25805472  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  25805471 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaagggacatg 25805373  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    | || ||||||||| ||||| |||||||    
T  25805372 actgtcctagatgggatttgtccctcct 25805345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 31096935 - 31097158
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||| ||||  |||| ||    
T  31096935 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatccctaga 31097031  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  31097032 tgt-ggaatcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatg 31097130  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  31097131 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 31097158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20100410 - 20100217
Alignment:
Q  19 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||  ||||| ||| || |||||||    
T  20100410 gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacatgaaaccactatgatcccaagatgt-ggactcaagtgctt 20100313  T
Q  119 tgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatgg 214  Q
    | |  |||||||||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||||||| || |||||||||    
T  20100312 tattgccattcaaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggttgatgggtacttgacgaataatgttgagggacatgaatgtcctagatgg 20100217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7865587 - 7865390
Alignment:
Q  30 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 129  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||| || |||  |||||  || |||    
T  7865587 tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtattttgtttcccttc 7865489  T
Q  130 aaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
     ||| ||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  7865488 taacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggatatgagtgtcctagatgggatttgtccctcct 7865390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12765147 - 12764950
Alignment:
Q  30 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 129  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||||| ||| || ||| ||||||  ||||||    
T  12765147 tgtcataagacattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatgt-ggactcaagtactttgtttccattc 12765049  T
Q  130 aaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
     ||| ||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||    
T  12765048 taacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcgtagatgggatttgtccctcct 12764950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 5097770 - 5098005
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||   |||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||  ||    
T  5097770 gaatactacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagttattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatcccgaga 5097866  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||  |||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  5097867 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgtttgttgatgggtacatgatgaatcatgctgagggacacg 5097965  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggaga 241  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5097966 agtgtcctagatgagatttgtccctcct-cataacaggaga 5098005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18829324 - 18829195
Alignment:
Q  148 gatgactataaagttggtt---gatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaat 244  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  18829324 gatgactataaagttggttattgatgggtactccatggatcatgttgagggacatgagggaactatatggaattcgcccc-actacataacaagagaaat 18829226  T
Q  245 gtctacgggcccaatattgaactagacaagg 275  Q
    || || ||||||| ||||||| | |||||||    
T  18829225 gtataagggcccagtattgaattcgacaagg 18829195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26129860 - 26129644
Alignment:
Q  19 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 118  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||  | || ||||| ||| || |||||||    
T  26129860 gttatgaaaa-tgtaataagatattctcacattgataatggtgtatatcactcttagacatgaaaccactatgatcactagatgt-ggactcaagtgctt 26129763  T
Q  119 tgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatt 218  Q
    | |  |||||| |||||||||  ||| | ||| || |||| ||||| | |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  26129762 tattgccattctaacattgtctataaaaagataaccataacgttggctaatgggtacttaatgaatcatgatgagggacatgagtgtcctagatgagatt 26129663  T
Q  219 tgcccctcctacataacagg 238  Q
    ||  |||||| |||||||||    
T  26129662 tgtacctcct-cataacagg 26129644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9811890 - 9811693
Alignment:
Q  30 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 129  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||||| ||| || ||| ||||||  ||||||    
T  9811890 tgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatgt-ggactcaagtactttgtttccattc 9811792  T
Q  130 aaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
     ||| ||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||  ||||| |||||||    
T  9811791 taacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgttgagggacatgagtgtcgtagatgagatttgtccctcct 9811693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12704031 - 12703834
Alignment:
Q  30 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 129  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||||| ||| || ||| ||||||  ||||||    
T  12704031 tgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatgt-ggactcaagtactttgtttccattc 12703933  T
Q  130 aaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
     ||| ||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||  ||||| |||||||    
T  12703932 taacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgttgagggacatgagtgtcgtagatgagatttgtccctcct 12703834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 39538889 - 39538947
Alignment:
Q  2 aatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39538889 aatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataaaatattctcatagtgatagtggt 39538947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18806555 - 18806490
Alignment:
Q  30 tgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtac 94  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18806555 tgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtac 18806490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18806735 - 18806670
Alignment:
Q  30 tgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtac 94  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18806735 tgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtac 18806670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18806915 - 18806850
Alignment:
Q  30 tgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtac 94  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18806915 tgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtac 18806850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 241
Target Start/End: Original strand, 26245247 - 26245456
Alignment:
Q  30 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 129  Q
    |||||||||||||||||| | || || | ||||||| | | ||| |||||||||||| ||||  | || ||| | ||| |  ||||||||||   |||||    
T  26245247 tgtcataagatattctcacaatgttaatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatctctagatat-ggacttaagtgctttgttgtcattc 26245345  T
Q  130 aaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctccta 229  Q
     ||| ||||| |||| ||||| || |||  |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||   ||||||  ||||| |||||||     
T  26245346 taacgttgtctgtaaaaggataaccatagcgttggttgatgggtacttgatgaatcatgttgagggacacgagtgttttagatgagatttgtccctcct- 26245444  T
Q  230 cataacaggaga 241  Q
    ||||||||||||    
T  26245445 cataacaggaga 26245456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 17314678 - 17314566
Alignment:
Q  207 ctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatata 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| | ||||||||| | || |||| |||||    |||||  ||||||||||||||    
T  17314678 ctagatggaatttgctcctcctacataacatgagaaatatctaagggacaaatattgaattggaaaagggtgaca--tactatgtattgtgttcaatata 17314581  T
Q  307 gacatgagtgcaaaa 321  Q
    || ||| | ||||||    
T  17314580 gatatgggggcaaaa 17314566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 230298 - 229971
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  230298 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattctacccttcgacctgaaaccattatgtaccctaga 230199  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  230198 tgttggagtcgagtgctttgtcactattcaaacgttgtctgtaacaagatgacaataaagttggttggtggatacaccatgaatcatgttgagggacatg 230099  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttc 300  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  230098 agtgatttagatggaattcgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacatggtttatgtcttgtgttc 229999  T
Q  301 aatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||    
T  229998 aatatagacataagggcaaaagggtaat 229971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 5829 - 6149
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaa-gtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccaccctt-cgacctgaaaccactatgtaccctg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          || ||| |||| |||| |||||||||||||||||||     
T  5829 gaatactacatagtaaaagttatgaaaaagtgtcataagatattctcatagtgc---------attccatcctttcgacatgaaaccactatgtacccta 5919  T
Q  99 gatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggaca 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5920 gatgttggagtcaagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatcaatcatgatgagggaca 6019  T
Q  199 tgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggcccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6020 tgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacgggccaaatattcaactagacaaggatgagacgatctatgccttgtgt 6119  T
Q  299 tcaatatagacatgagtgcaaaagggtaat 328  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||||    
T  6120 tcaatatagaaataagggcaaaagtgtaat 6149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 1293 - 1461
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1293 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 1392  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1393 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggataaatataaagttggttgat 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13132 - 12897
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  13132 gaatactacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcataatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctaga 13036  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || | ||||||||  |||||| ||| ||||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||     
T  13035 tgt-ggactcaattgctttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggttgatgggtacttgatcaatcatgctgagggacatc 12937  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggaga 241  Q
    |||  |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12936 agtctcctaaatgggatttgtccctcct-cataacaggaga 12897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 67557 - 67334
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |  |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  67557 gaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcatgagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaga 67461  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  67460 tgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggacatg 67362  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  67361 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 67334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 105 - 328
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||  |||| ||    
T  105 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactctgatccctaga 201  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||| ||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  202 tgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatg 300  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  301 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3858 - 3635
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  3858 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 3762  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  3761 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 3663  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  3662 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 3635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 119849 - 120072
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  119849 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 119945  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  119946 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatg 120044  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  120045 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 120072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 302 - 525
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  302 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctaga 398  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||    
T  399 tgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggaacatg 497  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  498 agtgtcctagatgggatttgtccctcct 525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 26677 - 26892
Alignment:
Q  19 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||||  ||| |||| ||||||||||    
T  26677 gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacagtgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatg-tggactcgagtgctt 26774  T
Q  119 tgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatt 218  Q
    | |   ||||  ||  ||||| |||| ||||| || |||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||    
T  26775 tattgtcattttaatgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggataatgggtactcgatgaatcatgttgagggacattagtgtcctagatgagatt 26874  T
Q  219 tgcccctcctacataacag 237  Q
    || ||||||| ||||||||    
T  26875 tgtccctcct-cataacag 26892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 321
Target Start/End: Original strand, 24228 - 24393
Alignment:
Q  154 tataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggagaaatgtctacggg 253  Q
    |||||||| ||||||||| |||||    ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||     
T  24228 tataaagtcggttgatggatactcgtcaaatcatgttgagggacatgagtattctagatggaatttgcccctccaacataacaagagaaatgtctaagga 24327  T
Q  254 cccaatattgaactagacaaggatgacacggtctatgccttgtgttcaatatagacatgagtgcaaaa 321  Q
     |||||||| |||| ||||||  |||||    ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  24328 tccaatattaaactggacaagagtgaca--tactatgtcttgtgttcaatacaaacatgagggcaaaa 24393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40171 - 39936
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  || ||| ||| |||||||||||||  ||||  |    
T  40171 gaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacagtgataatggtgtatataactcttagacttgaaaccactatgatccctaaa 40075  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatg 200  Q
    |  |||| || |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||| ||||| || |||||||||| | |||| ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  40074 t-atggactcaagtgctttatttccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggctaatggttacttgatgaatcatgttgagggacatg 39976  T
Q  201 agtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggaga 241  Q
    |||| | |||| |   |||| ||||||| ||||||||||||    
T  39975 agtgtcttagaagagttttgtccctcct-cataacaggaga 39936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11683 - 11486
Alignment:
Q  30 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 129  Q
    |||||||||||||||||| | |||||   ||||| | | | ||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || ||| ||||||  ||||||    
T  11683 tgtcataagatattctcacaatgataacagtgtacatcgctcttagacctgaaaccactttgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattc 11585  T
Q  130 aaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
     ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||   |||||||| ||||| |||||||    
T  11584 taacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatgttgagggtcatgagttttctagatgggatttgtccctcct 11486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 244
Target Start/End: Original strand, 8876 - 9089
Alignment:
Q  30 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||| |||  || |  ||| ||||||| |||| ||| |   |||||    
T  8876 tgtcataagatattctcatagtgataatggtgtataccactcctagacctgaaaccacaatgatccttaaatg-tggagtcaagtgttttattgtcattc 8974  T
Q  130 aaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctccta 229  Q
    |||| || || |||||| ||| ||||||||| | ||||| ||| | |  |  ||||||| | ||||||||||||| |||| |||  ||||||| ||||||    
T  8975 aaacgttctctgtaacatgataactataaagctagttgacgggcagttgacaaatcatgttaagggacatgagtgtcctatatgagatttgcctctccta 9074  T
Q  230 cataacaggagaaat 244  Q
     |||||| |||||||    
T  9075 tataacatgagaaat 9089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 249
Target Start/End: Original strand, 92562 - 92682
Alignment:
Q  129 caaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 228  Q
    |||||||  ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||| |||    
T  92562 caaacatcatccataagaggatgaccataaagtcggttgatgggtactcaaaaaatcatgttgaggcacaggagtgatctagatgaaattttccccgcct 92661  T
Q  229 acataacaggagaaatgtcta 249  Q
    |||| ||| ||||||||||||    
T  92662 acattacaagagaaatgtcta 92682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 241
Target Start/End: Original strand, 53955 - 54118
Alignment:
Q  75 gacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 174  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||| ||| || |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  53955 gacctgaaaccactatgatccctaggtgt-ggactcaagtgctttatg-ccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 54052  T
Q  175 ctccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacataacaggaga 241  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  54053 cttgatgaatcatgctaagggacatgagtgtcctacatgggatttgtccttcct-cataacaggaga 54118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 130407 - 130262
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  130407 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaga 130311  T
Q  101 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacattgtccgtaacaggat 150  Q
    || |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| |||||    
T  130310 tg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggat 130262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 8424 - 8511
Alignment:
Q  1 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 91  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||    
T  8424 gaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatg 8511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 83173 - 83111
Alignment:
Q  29 gtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 91  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||| ||| |||||||||||| ||||    
T  83173 gtgtcataagatattatcatagtcatattggtgtactccactcttagacctgaaaccagtatg 83111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University