View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10951_high_22 (Length: 231)

Name: NF10951_high_22
Description: NF10951
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10951_high_22
NF10951_high_22
[»] chr4 (108 HSPs)
chr4 (1-170)||(9388389-9388558)
chr4 (1-170)||(33848456-33848627)
chr4 (4-145)||(16278432-16278573)
chr4 (11-170)||(16278635-16278796)
chr4 (1-146)||(28382474-28382621)
chr4 (4-146)||(33848559-33848701)
chr4 (4-145)||(31117359-31117498)
chr4 (4-146)||(15280408-15280552)
chr4 (1-145)||(6511435-6511580)
chr4 (4-146)||(16359114-16359259)
chr4 (4-132)||(55503054-55503183)
chr4 (4-145)||(16359155-16359298)
chr4 (1-130)||(56116035-56116166)
chr4 (1-132)||(15242465-15242599)
chr4 (1-132)||(41791273-41791407)
chr4 (1-132)||(15989930-15990063)
chr4 (1-146)||(16278506-16278654)
chr4 (4-145)||(4170654-4170796)
chr4 (4-145)||(10313366-10313508)
chr4 (4-145)||(14698346-14698488)
chr4 (1-144)||(14698268-14698413)
chr4 (32-167)||(53388033-53388171)
chr4 (1-146)||(286739-286887)
chr4 (28-146)||(15242415-15242533)
chr4 (1-144)||(4170576-4170721)
chr4 (28-145)||(6511514-6511631)
chr4 (28-145)||(16359195-16359313)
chr4 (1-145)||(14942671-14942817)
chr4 (1-107)||(33684868-33684975)
chr4 (28-106)||(14942621-14942699)
chr4 (66-160)||(20899755-20899849)
chr4 (28-149)||(21190073-21190195)
chr4 (28-145)||(28382515-28382633)
chr4 (4-132)||(56116156-56116286)
chr4 (28-149)||(13881362-13881485)
chr4 (31-145)||(15449758-15449872)
chr4 (4-149)||(13877703-13877842)
chr4 (28-145)||(55503039-55503156)
chr4 (22-145)||(15448426-15448549)
chr4 (1-142)||(15989960-15990103)
chr4 (30-146)||(47127138-47127257)
chr4 (30-145)||(286780-286897)
chr4 (29-145)||(15280394-15280511)
chr4 (35-162)||(24047832-24047960)
chr4 (14-145)||(15989797-15989928)
chr4 (22-162)||(15989740-15989881)
chr4 (3-107)||(27027546-27027652)
chr4 (1-145)||(27027587-27027739)
chr4 (1-105)||(55503128-55503234)
chr4 (1-77)||(15449805-15449882)
chr4 (1-146)||(56115955-56116103)
chr4 (4-107)||(24047840-24047944)
chr4 (70-146)||(28382553-28382629)
chr4 (28-106)||(3337090-3337169)
chr4 (1-67)||(15448482-15448549)
chr4 (4-144)||(55503093-55503234)
chr4 (32-145)||(16278421-16278534)
chr4 (4-93)||(31117436-31117525)
chr4 (28-160)||(33684856-33684989)
chr4 (32-145)||(33848599-33848712)
chr4 (4-160)||(15242508-15242666)
chr4 (66-145)||(15990035-15990115)
chr4 (1-67)||(3336989-3337056)
chr4 (1-107)||(15989756-15989863)
chr4 (1-55)||(16359168-16359223)
chr4 (70-160)||(27027532-27027622)
chr4 (28-134)||(31117344-31117450)
chr4 (32-146)||(41791339-41791453)
chr4 (4-160)||(56116196-56116353)
chr4 (4-146)||(6511394-6511538)
chr4 (1-55)||(16278664-16278718)
chr4 (1-103)||(15242543-15242648)
chr4 (4-68)||(20899770-20899835)
chr4 (28-144)||(15448394-15448509)
chr4 (66-146)||(16278417-16278496)
chr4 (66-146)||(33848637-33848716)
chr4 (1-67)||(41791261-41791329)
chr4 (4-55)||(53388044-53388096)
chr4 (1-107)||(56116231-56116339)
chr4 (28-145)||(10313406-10313523)
chr4 (1-55)||(47127148-47127203)
chr4 (70-146)||(15280397-15280473)
chr4 (70-146)||(16359233-16359309)
chr4 (32-107)||(20899759-20899835)
chr4 (55-145)||(3336989-3337079)
chr4 (4-55)||(21190088-21190138)
chr4 (1-67)||(31117471-31117537)
chr4 (32-133)||(13877759-13877853)
chr4 (108-160)||(18221088-18221140)
chr4 (70-146)||(31117348-31117423)
chr4 (66-133)||(53388029-53388097)
chr4 (4-145)||(56115998-56116141)
chr4 (4-55)||(13881419-13881470)
chr4 (63-125)||(27027691-27027754)
chr4 (4-145)||(41791220-41791364)
chr4 (70-134)||(4170742-4170807)
chr4 (1-68)||(13877706-13877775)
chr4 (70-134)||(14698434-14698499)
chr4 (4-145)||(56115918-56116063)
chr4 (66-118)||(13877805-13877857)
chr4 (4-55)||(21190126-21190178)
chr4 (113-145)||(31131813-31131845)
chr4 (1-146)||(56116075-56116221)
chr4 (70-145)||(14942625-14942699)
chr4 (4-55)||(14942636-14942686)
chr4 (1-49)||(13881385-13881434)
chr4 (1-68)||(16278703-16278772)
chr4 (70-145)||(27027711-27027787)
[»] chr8 (85 HSPs)
chr8 (1-170)||(17794946-17795117)
chr8 (1-132)||(44431543-44431676)
chr8 (4-146)||(17795049-17795191)
chr8 (1-146)||(7301457-7301603)
chr8 (1-162)||(20459858-20460020)
chr8 (1-145)||(44431648-44431794)
chr8 (1-146)||(22145743-22145892)
chr8 (1-132)||(45135291-45135425)
chr8 (1-132)||(7301535-7301668)
chr8 (28-146)||(44523200-44523320)
chr8 (4-145)||(6608603-6608745)
chr8 (4-145)||(28853604-28853745)
chr8 (1-143)||(6608678-6608822)
chr8 (1-145)||(28853525-28853671)
chr8 (32-146)||(17614609-17614724)
chr8 (1-146)||(22059737-22059884)
chr8 (32-145)||(7301372-7301485)
chr8 (1-145)||(22059698-22059843)
chr8 (4-149)||(17614528-17614675)
chr8 (22-145)||(43111949-43112072)
chr8 (1-145)||(22145704-22145851)
chr8 (28-145)||(32949583-32949700)
chr8 (1-145)||(19881766-19881912)
chr8 (4-160)||(21415555-21415713)
chr8 (1-145)||(19881845-19881990)
chr8 (30-145)||(22145694-22145811)
chr8 (28-144)||(22059686-22059803)
chr8 (35-161)||(38186102-38186230)
chr8 (22-160)||(43111894-43112034)
chr8 (1-107)||(363613-363721)
chr8 (4-146)||(7301383-7301525)
chr8 (31-145)||(28853643-28853757)
chr8 (32-146)||(45135245-45135359)
chr8 (1-145)||(7301418-7301563)
chr8 (1-105)||(44431492-44431598)
chr8 (35-162)||(21861647-21861775)
chr8 (4-107)||(21861655-21861759)
chr8 (1-107)||(43111908-43112016)
chr8 (32-145)||(43111988-43112100)
chr8 (4-132)||(17614584-17614713)
chr8 (32-145)||(20459915-20460028)
chr8 (7-107)||(38186114-38186215)
chr8 (22-160)||(44431476-44431616)
chr8 (1-107)||(19881725-19881833)
chr8 (66-146)||(20459952-20460032)
chr8 (70-146)||(24708122-24708198)
chr8 (1-107)||(32949542-32949650)
chr8 (50-145)||(44523183-44523279)
chr8 (4-160)||(362193-362351)
chr8 (4-55)||(44523215-44523266)
chr8 (1-158)||(19881713-19881872)
chr8 (4-160)||(363599-363758)
chr8 (66-146)||(17795127-17795206)
chr8 (66-145)||(19881962-19882042)
chr8 (70-146)||(22059690-22059766)
chr8 (28-107)||(24708118-24708198)
chr8 (1-106)||(45135369-45135477)
chr8 (66-145)||(7301368-7301446)
chr8 (1-67)||(7301613-7301680)
chr8 (71-149)||(15004830-15004909)
chr8 (32-132)||(21415544-21415647)
chr8 (4-148)||(32949540-32949685)
chr8 (66-145)||(45135241-45135319)
chr8 (1-55)||(15004084-15004138)
chr8 (32-145)||(17795089-17795202)
chr8 (70-135)||(15004076-15004141)
chr8 (15-67)||(20454303-20454355)
chr8 (28-121)||(362178-362273)
chr8 (4-145)||(45135334-45135477)
chr8 (4-130)||(45135256-45135382)
chr8 (70-125)||(362182-362237)
chr8 (60-162)||(20454246-20454348)
chr8 (4-145)||(22521897-22522044)
chr8 (72-146)||(44431726-44431800)
chr8 (4-69)||(24708133-24708199)
chr8 (70-134)||(6608592-6608657)
chr8 (113-146)||(7301688-7301721)
chr8 (1-68)||(15004837-15004906)
chr8 (1-106)||(15267118-15267229)
chr8 (66-145)||(21415540-21415620)
chr8 (1-106)||(22521933-22522044)
chr8 (28-94)||(15004072-15004139)
chr8 (4-125)||(22434610-22434737)
chr8 (1-145)||(44431570-44431716)
chr8 (108-145)||(17272816-17272853)
[»] chr1 (68 HSPs)
chr1 (4-170)||(296153-296320)
chr1 (4-146)||(2333382-2333527)
chr1 (1-146)||(20630926-20631074)
chr1 (1-146)||(14432671-14432819)
chr1 (1-146)||(36181224-36181372)
chr1 (1-145)||(20630967-20631113)
chr1 (4-145)||(20586733-20586876)
chr1 (4-145)||(2333304-2333446)
chr1 (1-132)||(45306915-45307049)
chr1 (4-145)||(20579040-20579183)
chr1 (4-149)||(22900615-22900762)
chr1 (7-132)||(293834-293961)
chr1 (4-162)||(20901001-20901159)
chr1 (32-146)||(22900566-22900681)
chr1 (30-145)||(20631007-20631123)
chr1 (28-157)||(24087117-24087248)
chr1 (32-145)||(18823541-18823655)
chr1 (32-145)||(20579158-20579271)
chr1 (32-145)||(20586851-20586964)
chr1 (4-121)||(20901080-20901199)
chr1 (28-146)||(20901094-20901214)
chr1 (31-123)||(21181474-21181567)
chr1 (30-145)||(36181265-36181382)
chr1 (1-145)||(18823462-18823609)
chr1 (35-161)||(28312068-28312195)
chr1 (4-160)||(293767-293924)
chr1 (4-145)||(20579119-20579260)
chr1 (4-145)||(20586812-20586953)
chr1 (4-145)||(21181407-21181549)
chr1 (32-146)||(45306981-45307095)
chr1 (1-160)||(21181483-21181643)
chr1 (70-146)||(20631045-20631121)
chr1 (1-107)||(28204708-28204816)
chr1 (70-145)||(14432663-14432738)
chr1 (28-160)||(28204696-28204830)
chr1 (4-132)||(22900577-22900706)
chr1 (1-108)||(293780-293889)
chr1 (30-145)||(14432661-14432778)
chr1 (4-107)||(24087128-24087233)
chr1 (1-107)||(18270199-18270307)
chr1 (1-107)||(18274853-18274961)
chr1 (4-125)||(18823521-18823644)
chr1 (4-107)||(28312083-28312187)
chr1 (1-55)||(20579171-20579225)
chr1 (1-55)||(20586864-20586918)
chr1 (66-146)||(296256-296335)
chr1 (1-67)||(45306903-45306971)
chr1 (1-67)||(19209465-19209532)
chr1 (1-107)||(20901017-20901123)
chr1 (32-145)||(296218-296331)
chr1 (108-162)||(18270183-18270237)
chr1 (108-162)||(18274837-18274891)
chr1 (31-146)||(16400611-16400729)
chr1 (66-145)||(20579197-20579275)
chr1 (66-145)||(20586890-20586968)
chr1 (108-146)||(37358201-37358239)
chr1 (4-145)||(45306863-45307006)
chr1 (66-133)||(45307033-45307099)
chr1 (28-107)||(16400611-16400691)
chr1 (66-125)||(18270259-18270319)
chr1 (66-125)||(18274913-18274973)
chr1 (108-162)||(19209407-19209462)
chr1 (29-107)||(37358201-37358280)
chr1 (4-55)||(45307034-45307084)
chr1 (66-107)||(20043867-20043909)
chr1 (66-106)||(2333289-2333329)
chr1 (69-133)||(18823593-18823656)
chr1 (12-55)||(21181375-21181419)
[»] scaffold0525 (9 HSPs)
scaffold0525 (4-170)||(8657-8824)
scaffold0525 (1-145)||(11197-11342)
scaffold0525 (1-146)||(11275-11423)
scaffold0525 (1-134)||(8771-8905)
scaffold0525 (4-145)||(8799-8941)
scaffold0525 (30-146)||(11187-11304)
scaffold0525 (32-145)||(8838-8952)
scaffold0525 (66-145)||(8877-8956)
scaffold0525 (1-68)||(8681-8750)
[»] chr2 (68 HSPs)
chr2 (1-170)||(23339567-23339738)
chr2 (1-146)||(44620583-44620730)
chr2 (4-146)||(25035995-25036139)
chr2 (4-146)||(23339493-23339635)
chr2 (1-132)||(28348743-28348876)
chr2 (4-132)||(31755602-31755731)
chr2 (1-132)||(21239491-21239625)
chr2 (1-132)||(21242041-21242175)
chr2 (1-145)||(31503215-31503360)
chr2 (32-167)||(20591424-20591561)
chr2 (1-144)||(31503137-31503282)
chr2 (1-145)||(31505781-31505926)
chr2 (4-132)||(24504344-24504473)
chr2 (1-144)||(31505703-31505848)
chr2 (28-146)||(24274235-24274354)
chr2 (30-160)||(23374868-23374999)
chr2 (4-107)||(23374882-23374986)
chr2 (30-145)||(44620624-44620740)
chr2 (30-146)||(41685075-41685194)
chr2 (70-148)||(22109435-22109513)
chr2 (28-145)||(31755629-31755746)
chr2 (30-132)||(28352568-28352671)
chr2 (1-145)||(31503254-31503400)
chr2 (28-145)||(24504371-24504488)
chr2 (1-105)||(10040240-10040345)
chr2 (32-146)||(21239445-21239559)
chr2 (32-146)||(21241995-21242109)
chr2 (4-160)||(28348676-28348833)
chr2 (1-145)||(31505820-31505966)
chr2 (1-105)||(31755551-31755657)
chr2 (70-146)||(12628184-12628261)
chr2 (1-68)||(22109437-22109505)
chr2 (70-146)||(44620662-44620738)
chr2 (1-106)||(24274285-24274392)
chr2 (4-144)||(24504293-24504434)
chr2 (1-145)||(25035952-25036098)
chr2 (4-160)||(28352501-28352658)
chr2 (4-144)||(31755551-31755692)
chr2 (32-145)||(23339482-23339595)
chr2 (34-160)||(10040234-10040361)
chr2 (1-106)||(21239569-21239677)
chr2 (1-106)||(21242119-21242227)
chr2 (1-107)||(28348690-28348798)
chr2 (4-145)||(24274250-24274392)
chr2 (1-55)||(41685085-41685140)
chr2 (28-107)||(22109437-22109517)
chr2 (66-146)||(23339478-23339557)
chr2 (1-107)||(28352515-28352623)
chr2 (70-145)||(31503332-31503408)
chr2 (70-145)||(31505898-31505974)
chr2 (4-145)||(21239534-21239677)
chr2 (4-145)||(21242084-21242227)
chr2 (69-145)||(21239444-21239519)
chr2 (69-145)||(21241994-21242069)
chr2 (108-148)||(24275744-24275784)
chr2 (68-145)||(25035942-25036020)
chr2 (4-131)||(21239456-21239583)
chr2 (4-131)||(21242006-21242133)
chr2 (1-125)||(23085341-23085470)
chr2 (34-145)||(28348770-28348882)
chr2 (7-55)||(20591438-20591486)
chr2 (66-133)||(20591420-20591487)
chr2 (4-67)||(31518274-31518341)
chr2 (1-50)||(31518334-31518385)
chr2 (105-146)||(22109476-22109517)
chr2 (1-124)||(25651191-25651320)
chr2 (12-77)||(21903153-21903221)
chr2 (32-145)||(25035944-25036059)
[»] chr5 (68 HSPs)
chr5 (1-157)||(22759088-22759246)
chr5 (4-146)||(22759013-22759156)
chr5 (4-145)||(23671480-23671622)
chr5 (1-132)||(26495487-26495621)
chr5 (1-132)||(29325606-29325740)
chr5 (32-145)||(16256248-16256361)
chr5 (4-131)||(22357922-22358051)
chr5 (4-149)||(16256336-16256483)
chr5 (4-149)||(16259930-16260077)
chr5 (32-146)||(16259881-16259996)
chr5 (4-148)||(22469774-22469920)
chr5 (32-146)||(22590045-22590160)
chr5 (32-146)||(22593600-22593715)
chr5 (32-146)||(22597155-22597270)
chr5 (5-146)||(23693108-23693250)
chr5 (4-149)||(22593649-22593796)
chr5 (4-149)||(22597204-22597351)
chr5 (4-145)||(43120790-43120931)
chr5 (4-145)||(43124323-43124464)
chr5 (4-146)||(26361407-26361553)
chr5 (4-93)||(43120881-43120970)
chr5 (4-93)||(43124414-43124503)
chr5 (4-149)||(22590094-22590241)
chr5 (4-146)||(16256259-16256402)
chr5 (1-145)||(27869704-27869847)
chr5 (4-132)||(16256297-16256427)
chr5 (4-170)||(27869784-27869950)
chr5 (32-145)||(8953034-8953148)
chr5 (21-146)||(23671518-23671644)
chr5 (28-145)||(43120869-43120985)
chr5 (28-145)||(43124402-43124518)
chr5 (4-107)||(23693108-23693212)
chr5 (28-132)||(27869692-27869796)
chr5 (32-146)||(26495553-26495667)
chr5 (1-54)||(22357998-22358051)
chr5 (34-146)||(29325562-29325674)
chr5 (1-107)||(24277655-24277763)
chr5 (1-107)||(24384450-24384558)
chr5 (17-125)||(22469836-22469947)
chr5 (4-132)||(16259892-16260021)
chr5 (4-132)||(22593611-22593740)
chr5 (4-132)||(22597166-22597295)
chr5 (32-145)||(23693148-23693262)
chr5 (31-160)||(24277646-24277777)
chr5 (31-160)||(24384436-24384567)
chr5 (1-106)||(26495435-26495543)
chr5 (4-125)||(22590056-22590178)
chr5 (70-157)||(4397426-4397514)
chr5 (70-146)||(27869696-27869771)
chr5 (1-106)||(29325684-29325792)
chr5 (1-106)||(43120790-43120896)
chr5 (1-106)||(43124323-43124429)
chr5 (4-145)||(26495435-26495578)
chr5 (66-146)||(23693186-23693266)
chr5 (69-145)||(26495593-26495668)
chr5 (66-145)||(29325556-29325634)
chr5 (4-145)||(29325649-29325792)
chr5 (32-146)||(22357911-22358027)
chr5 (70-146)||(22469854-22469931)
chr5 (4-131)||(26495529-26495656)
chr5 (28-67)||(8953069-8953108)
chr5 (4-55)||(29325571-29325621)
chr5 (66-145)||(22357907-22357986)
chr5 (35-142)||(26361399-26361509)
chr5 (32-125)||(7785123-7785219)
chr5 (12-88)||(21559443-21559523)
chr5 (1-88)||(26706359-26706451)
chr5 (1-88)||(26976093-26976185)
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (1-167)||(2288246-2288415)
chr6 (1-157)||(15686436-15686594)
chr6 (1-162)||(13763942-13764104)
chr6 (1-146)||(16101992-16102140)
chr6 (4-145)||(23621251-23621394)
chr6 (1-132)||(8522533-8522667)
chr6 (1-167)||(15538810-15538980)
chr6 (4-145)||(23621212-23621354)
chr6 (1-146)||(12595607-12595754)
chr6 (1-146)||(13764270-13764416)
chr6 (1-94)||(13764244-13764338)
chr6 (28-144)||(29492446-29492564)
chr6 (28-146)||(16829487-16829607)
chr6 (28-146)||(16812467-16812587)
chr6 (1-124)||(13764057-13764182)
chr6 (35-162)||(23352115-23352243)
chr6 (4-107)||(23352131-23352235)
chr6 (28-145)||(16102033-16102152)
chr6 (28-145)||(12595648-12595766)
chr6 (32-145)||(15686428-15686542)
chr6 (31-146)||(23621200-23621316)
chr6 (32-146)||(8522599-8522713)
chr6 (1-125)||(13764134-13764260)
chr6 (1-67)||(29848507-29848573)
chr6 (44-146)||(16804648-16804752)
chr6 (4-55)||(16829541-16829592)
chr6 (34-162)||(221618-221747)
chr6 (1-145)||(13764349-13764494)
chr6 (32-145)||(24440865-24440978)
chr6 (1-106)||(8522481-8522589)
chr6 (66-146)||(15686424-15686504)
chr6 (4-133)||(13764244-13764373)
chr6 (1-55)||(15539005-15539060)
chr6 (4-55)||(16812521-16812572)
chr6 (4-55)||(29492498-29492549)
chr6 (66-145)||(29848495-29848573)
chr6 (5-55)||(16804702-16804752)
chr6 (70-146)||(12595686-12595762)
chr6 (32-145)||(15538952-15539068)
chr6 (66-145)||(8522639-8522717)
chr6 (4-145)||(8522481-8522624)
chr6 (32-147)||(29848499-29848615)
chr6 (4-107)||(221634-221738)
chr6 (66-133)||(15539004-15539072)
chr6 (32-145)||(2288238-2288353)
chr6 (4-145)||(13764076-13764217)
chr6 (8-67)||(24266717-24266776)
chr6 (70-145)||(29492485-29492560)
chr6 (66-146)||(2288234-2288315)
chr6 (4-131)||(8522575-8522702)
chr6 (4-88)||(21469786-21469870)
chr6 (60-162)||(24266659-24266762)
chr6 (1-67)||(23621326-23621394)
chr6 (28-88)||(1584298-1584361)
chr6 (1-50)||(12389543-12389594)
chr6 (4-55)||(25772710-25772761)
chr6 (4-106)||(29265487-29265593)
chr6 (70-145)||(1639120-1639198)
chr6 (4-50)||(22346692-22346738)
chr6 (2-67)||(1639120-1639189)
chr6 (4-64)||(24440907-24440967)
chr6 (66-145)||(13751328-13751411)
[»] chr3 (115 HSPs)
chr3 (1-167)||(16799347-16799516)
chr3 (1-146)||(2038852-2038998)
chr3 (1-146)||(2038891-2039037)
chr3 (1-146)||(2038930-2039076)
chr3 (1-146)||(2038969-2039115)
chr3 (1-146)||(2042593-2042739)
chr3 (1-146)||(2042632-2042778)
chr3 (1-146)||(2042671-2042817)
chr3 (1-146)||(2042710-2042856)
chr3 (1-145)||(2039008-2039153)
chr3 (1-145)||(2042749-2042894)
chr3 (1-160)||(179747-179909)
chr3 (1-146)||(2038813-2038959)
chr3 (1-146)||(2042554-2042700)
chr3 (4-146)||(15010461-15010605)
chr3 (4-145)||(10554073-10554215)
chr3 (1-125)||(10989921-10990047)
chr3 (1-146)||(2035345-2035493)
chr3 (1-146)||(2039086-2039234)
chr3 (1-146)||(2042827-2042975)
chr3 (1-146)||(14037826-14037974)
chr3 (1-146)||(14041294-14041442)
chr3 (30-146)||(39230430-39230547)
chr3 (1-144)||(18958546-18958693)
chr3 (4-132)||(54972935-54973066)
chr3 (4-132)||(54975545-54975676)
chr3 (4-132)||(54978155-54978286)
chr3 (1-145)||(2035306-2035452)
chr3 (1-106)||(10553995-10554101)
chr3 (1-146)||(23396066-23396214)
chr3 (70-170)||(55292743-55292843)
chr3 (32-146)||(179701-179816)
chr3 (30-146)||(2038803-2038920)
chr3 (30-146)||(2042544-2042661)
chr3 (30-145)||(14951841-14951958)
chr3 (32-145)||(54973081-54973194)
chr3 (32-145)||(54975691-54975804)
chr3 (32-145)||(54978301-54978414)
chr3 (28-146)||(603936-604056)
chr3 (30-145)||(2035296-2035412)
chr3 (31-145)||(52338963-52339078)
chr3 (4-145)||(16799449-16799593)
chr3 (28-145)||(6806015-6806132)
chr3 (4-124)||(52339053-52339175)
chr3 (4-145)||(14951789-14951918)
chr3 (4-160)||(6806030-6806187)
chr3 (4-145)||(54973041-54973183)
chr3 (4-145)||(54975651-54975793)
chr3 (4-145)||(54978261-54978403)
chr3 (32-146)||(16799487-16799604)
chr3 (66-146)||(18958625-18958705)
chr3 (28-145)||(14041335-14041454)
chr3 (28-145)||(10554113-10554230)
chr3 (28-145)||(15010446-15010564)
chr3 (30-145)||(14037867-14037984)
chr3 (1-107)||(6806065-6806173)
chr3 (4-145)||(16799409-16799553)
chr3 (1-146)||(54973001-54973148)
chr3 (1-146)||(54975611-54975758)
chr3 (1-146)||(54978221-54978368)
chr3 (4-145)||(179712-179854)
chr3 (32-130)||(18958602-18958701)
chr3 (1-107)||(39230430-39230537)
chr3 (70-146)||(7631933-7632010)
chr3 (70-146)||(2035298-2035374)
chr3 (4-106)||(14951854-14951958)
chr3 (70-149)||(30206558-30206638)
chr3 (4-55)||(603951-604002)
chr3 (4-160)||(10989964-10990121)
chr3 (22-160)||(52339110-52339250)
chr3 (70-146)||(54046463-54046540)
chr3 (1-107)||(10989999-10990107)
chr3 (1-107)||(52339128-52339236)
chr3 (37-161)||(1989365-1989491)
chr3 (4-122)||(6818963-6819078)
chr3 (4-107)||(1989371-1989476)
chr3 (2-67)||(23396186-23396251)
chr3 (36-162)||(10834465-10834592)
chr3 (66-134)||(14951774-14951842)
chr3 (70-146)||(15010450-15010526)
chr3 (1-162)||(23396145-23396308)
chr3 (1-67)||(54972923-54972991)
chr3 (1-67)||(54975533-54975601)
chr3 (1-67)||(54978143-54978211)
chr3 (2-125)||(6819033-6819160)
chr3 (70-160)||(17211123-17211213)
chr3 (66-145)||(54973120-54973198)
chr3 (66-145)||(54975730-54975808)
chr3 (66-145)||(54978340-54978418)
chr3 (1-68)||(30206566-30206635)
chr3 (66-145)||(16799528-16799608)
chr3 (4-67)||(10834472-10834535)
chr3 (1-55)||(52339010-52339065)
chr3 (4-144)||(54972884-54973026)
chr3 (4-144)||(54975494-54975636)
chr3 (4-144)||(54978104-54978246)
chr3 (1-67)||(14951890-14951958)
chr3 (4-106)||(52338975-52339078)
chr3 (28-107)||(55292739-55292819)
chr3 (1-68)||(55292751-55292819)
chr3 (66-145)||(179697-179775)
chr3 (32-94)||(14951778-14951841)
chr3 (30-107)||(17211137-17211215)
chr3 (4-145)||(10989884-10990027)
chr3 (66-145)||(23396054-23396133)
chr3 (1-106)||(3395009-3395120)
chr3 (1-88)||(15232180-15232271)
chr3 (1-88)||(15238048-15238139)
chr3 (4-50)||(1989290-1989336)
chr3 (66-145)||(3394997-3395079)
chr3 (6-67)||(6818941-6819003)
chr3 (4-68)||(54046463-54046529)
chr3 (30-67)||(15446424-15446461)
chr3 (108-160)||(6818887-6818938)
chr3 (105-145)||(30206554-30206594)
[»] chr7 (104 HSPs)
chr7 (28-160)||(35365924-35366056)
chr7 (1-167)||(13395865-13396035)
chr7 (1-146)||(48784925-48785071)
chr7 (1-146)||(48784846-48784993)
chr7 (1-146)||(48784964-48785110)
chr7 (1-145)||(13255668-13255811)
chr7 (4-146)||(38827797-38827941)
chr7 (1-145)||(48784887-48785032)
chr7 (11-167)||(17506158-17506316)
chr7 (11-167)||(17546898-17547056)
chr7 (4-132)||(124498-124627)
chr7 (4-146)||(13733852-13733996)
chr7 (1-146)||(16006007-16006153)
chr7 (1-145)||(13395787-13395933)
chr7 (1-145)||(13849928-13850074)
chr7 (1-132)||(16005941-16006075)
chr7 (4-145)||(16573169-16573310)
chr7 (4-145)||(16592352-16592493)
chr7 (4-162)||(14189366-14189525)
chr7 (4-145)||(21743634-21743776)
chr7 (1-132)||(8775925-8776059)
chr7 (1-144)||(21743709-21743854)
chr7 (28-145)||(38827916-38828034)
chr7 (28-146)||(13849878-13849996)
chr7 (1-158)||(14192118-14192276)
chr7 (4-145)||(14192083-14192223)
chr7 (30-146)||(48785003-48785120)
chr7 (30-145)||(13395777-13395893)
chr7 (1-92)||(21065508-21065600)
chr7 (1-132)||(4993111-4993245)
chr7 (32-146)||(14192072-14192186)
chr7 (2-145)||(14189324-14189468)
chr7 (28-144)||(48743284-48743401)
chr7 (1-160)||(13850006-13850168)
chr7 (28-145)||(124483-124600)
chr7 (4-146)||(8775991-8776133)
chr7 (4-107)||(11660763-11660866)
chr7 (1-160)||(16573075-16573237)
chr7 (31-146)||(16573208-16573322)
chr7 (31-146)||(16592340-16592454)
chr7 (1-160)||(16592425-16592587)
chr7 (4-145)||(17506111-17506254)
chr7 (4-145)||(17546960-17547103)
chr7 (28-106)||(709606-709684)
chr7 (32-132)||(4993190-4993291)
chr7 (1-106)||(13255629-13255734)
chr7 (35-161)||(13255414-13255541)
chr7 (4-107)||(13255429-13255533)
chr7 (4-146)||(14189288-14189431)
chr7 (32-146)||(16006085-16006199)
chr7 (1-105)||(124572-124678)
chr7 (35-162)||(11660747-11660874)
chr7 (70-146)||(13395779-13395855)
chr7 (4-144)||(124537-124678)
chr7 (32-146)||(14189278-14189392)
chr7 (1-107)||(14189402-14189509)
chr7 (35-145)||(16458947-16459056)
chr7 (1-145)||(38827838-38827984)
chr7 (32-145)||(8776031-8776144)
chr7 (26-146)||(13255705-13255825)
chr7 (29-145)||(13733838-13733955)
chr7 (4-162)||(48743227-48743386)
chr7 (1-55)||(17506187-17506241)
chr7 (1-55)||(17546973-17547027)
chr7 (66-146)||(17506096-17506177)
chr7 (66-146)||(17547037-17547118)
chr7 (1-107)||(16458906-16459013)
chr7 (39-158)||(47976002-47976121)
chr7 (66-145)||(16006125-16006203)
chr7 (4-50)||(15725496-15725542)
chr7 (1-57)||(709722-709779)
chr7 (4-67)||(4993099-4993164)
chr7 (1-106)||(8775873-8775981)
chr7 (1-67)||(16005929-16005997)
chr7 (22-148)||(16458904-16459031)
chr7 (108-159)||(711059-711110)
chr7 (4-145)||(16006047-16006188)
chr7 (31-107)||(711020-711097)
chr7 (108-145)||(8775873-8775910)
chr7 (28-65)||(47975964-47976001)
chr7 (66-146)||(14192068-14192147)
chr7 (4-145)||(38827877-38828019)
chr7 (4-125)||(13849893-13850014)
chr7 (2-68)||(35365938-35366005)
chr7 (1-55)||(48743296-48743351)
chr7 (4-56)||(21519357-21519411)
chr7 (108-149)||(13407736-13407777)
chr7 (70-134)||(21743623-21743688)
chr7 (1-57)||(11660775-11660830)
chr7 (1-106)||(15689866-15689976)
chr7 (1-106)||(15697459-15697569)
chr7 (70-125)||(15725498-15725553)
chr7 (28-88)||(15731800-15731863)
chr7 (72-146)||(21065502-21065576)
chr7 (1-106)||(40555764-40555875)
chr7 (1-125)||(12202057-12202187)
chr7 (4-145)||(16005889-16006032)
chr7 (109-159)||(21735551-21735601)
chr7 (25-67)||(47976026-47976068)
chr7 (28-88)||(15725496-15725557)
chr7 (22-106)||(16668610-16668698)
chr7 (22-106)||(17642980-17643068)
chr7 (113-145)||(12757143-12757175)
chr7 (4-107)||(35365938-35366041)
[»] scaffold0109 (6 HSPs)
scaffold0109 (1-131)||(2140-2272)
scaffold0109 (1-132)||(2061-2194)
scaffold0109 (2-107)||(2008-2115)
scaffold0109 (22-160)||(1994-2134)
scaffold0109 (4-145)||(2166-2309)
scaffold0109 (72-145)||(2244-2318)
[»] scaffold0500 (3 HSPs)
scaffold0500 (1-149)||(11736-11887)
scaffold0500 (1-145)||(11696-11843)
scaffold0500 (66-145)||(11684-11764)
[»] scaffold0004 (6 HSPs)
scaffold0004 (4-160)||(59151-59307)
scaffold0004 (4-132)||(59217-59346)
scaffold0004 (1-146)||(59242-59389)
scaffold0004 (32-144)||(59283-59397)
scaffold0004 (66-146)||(59320-59401)
scaffold0004 (1-67)||(205352-205422)
[»] scaffold0141 (3 HSPs)
scaffold0141 (4-125)||(32838-32960)
scaffold0141 (1-144)||(32741-32886)
scaffold0141 (28-145)||(32858-32975)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (4-145)||(40147-40289)
scaffold0058 (1-145)||(40183-40328)
scaffold0058 (28-146)||(40132-40251)
[»] scaffold0049 (3 HSPs)
scaffold0049 (4-125)||(81852-81974)
scaffold0049 (1-144)||(81926-82071)
scaffold0049 (28-145)||(81837-81954)
[»] scaffold0860 (3 HSPs)
scaffold0860 (1-149)||(148-298)
scaffold0860 (28-146)||(230-349)
scaffold0860 (4-145)||(192-334)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (1-145)||(137562-137708)
scaffold0003 (1-55)||(137535-137590)
scaffold0003 (1-160)||(137468-137630)
scaffold0003 (72-147)||(137639-137714)
[»] scaffold0609 (4 HSPs)
scaffold0609 (4-146)||(4395-4538)
scaffold0609 (1-149)||(4313-4463)
scaffold0609 (1-145)||(4357-4502)
scaffold0609 (28-146)||(4434-4553)
[»] scaffold0026 (8 HSPs)
scaffold0026 (2-145)||(20883-21029)
scaffold0026 (2-160)||(20788-20950)
scaffold0026 (28-106)||(21002-21079)
scaffold0026 (4-160)||(23866-24025)
scaffold0026 (1-55)||(20856-20911)
scaffold0026 (42-145)||(23921-24026)
scaffold0026 (8-106)||(35578-35678)
scaffold0026 (1-55)||(23934-23989)
[»] scaffold0381 (2 HSPs)
scaffold0381 (1-149)||(13994-14146)
scaffold0381 (66-145)||(13982-14062)
[»] scaffold0008 (8 HSPs)
scaffold0008 (1-145)||(12516-12662)
scaffold0008 (1-138)||(13158-13296)
scaffold0008 (1-94)||(12595-12689)
scaffold0008 (1-145)||(13118-13263)
scaffold0008 (1-146)||(13078-13226)
scaffold0008 (4-134)||(12559-12690)
scaffold0008 (66-145)||(12504-12583)
scaffold0008 (66-145)||(13066-13146)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (28-132)||(6085-6190)
scaffold0044 (1-107)||(6135-6243)
scaffold0044 (108-146)||(6205-6243)
[»] scaffold0338 (3 HSPs)
scaffold0338 (1-145)||(3951-4096)
scaffold0338 (4-162)||(3994-4153)
scaffold0338 (66-145)||(3939-4018)
[»] scaffold0034 (5 HSPs)
scaffold0034 (28-145)||(34873-34991)
scaffold0034 (1-125)||(34885-35011)
scaffold0034 (2-149)||(34925-35074)
scaffold0034 (70-146)||(34877-34953)
scaffold0034 (105-147)||(34873-34915)
[»] scaffold0107 (4 HSPs)
scaffold0107 (32-132)||(2830-2931)
scaffold0107 (4-146)||(2777-2920)
scaffold0107 (1-67)||(2818-2885)
scaffold0107 (66-145)||(2857-2935)
[»] scaffold0042 (7 HSPs)
scaffold0042 (4-158)||(50684-50840)
scaffold0042 (32-125)||(50915-51010)
scaffold0042 (1-67)||(50737-50803)
scaffold0042 (1-88)||(50875-50964)
scaffold0042 (32-146)||(50774-50893)
scaffold0042 (66-142)||(50939-51014)
scaffold0042 (4-55)||(50949-50999)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (32-146)||(134263-134380)
scaffold0021 (4-55)||(134274-134326)
[»] scaffold0586 (3 HSPs)
scaffold0586 (4-160)||(1488-1646)
scaffold0586 (32-132)||(1554-1657)
scaffold0586 (66-145)||(1581-1661)
[»] scaffold0151 (6 HSPs)
scaffold0151 (4-160)||(2106-2264)
scaffold0151 (4-160)||(8950-9108)
scaffold0151 (28-145)||(2161-2279)
scaffold0151 (28-145)||(9005-9123)
scaffold0151 (1-67)||(2161-2228)
scaffold0151 (1-67)||(9005-9072)
[»] scaffold0007 (4 HSPs)
scaffold0007 (41-125)||(165629-165714)
scaffold0007 (1-48)||(165666-165714)
scaffold0007 (4-55)||(165631-165681)
scaffold0007 (99-145)||(165648-165694)
[»] scaffold0825 (3 HSPs)
scaffold0825 (1-131)||(1813-1945)
scaffold0825 (22-160)||(1873-2013)
scaffold0825 (4-67)||(1894-1958)
[»] scaffold0491 (3 HSPs)
scaffold0491 (66-146)||(10466-10546)
scaffold0491 (4-68)||(10466-10531)
scaffold0491 (32-107)||(10466-10542)
[»] scaffold0635 (2 HSPs)
scaffold0635 (1-105)||(6725-6830)
scaffold0635 (34-160)||(6709-6836)
[»] scaffold0126 (3 HSPs)
scaffold0126 (28-132)||(5752-5857)
scaffold0126 (4-160)||(5685-5842)
scaffold0126 (1-107)||(5699-5807)
[»] scaffold0556 (3 HSPs)
scaffold0556 (4-112)||(9613-9723)
scaffold0556 (28-146)||(9618-9738)
scaffold0556 (108-162)||(9546-9600)
[»] scaffold0395 (3 HSPs)
scaffold0395 (1-145)||(8967-9112)
scaffold0395 (4-93)||(8930-9021)
scaffold0395 (4-53)||(8850-8900)
[»] scaffold0131 (4 HSPs)
scaffold0131 (32-106)||(1430-1505)
scaffold0131 (66-145)||(1430-1509)
scaffold0131 (4-55)||(1443-1494)
scaffold0131 (1-44)||(1414-1458)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (1-160)||(10554-10715)
scaffold0413 (70-145)||(10648-10723)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (34-162)||(223630-223759)
scaffold0012 (4-67)||(223639-223702)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (4-67)||(13952-14015)
scaffold0447 (28-160)||(13898-14030)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (4-67)||(11947-12010)
scaffold0383 (28-160)||(11893-12025)
[»] scaffold0216 (2 HSPs)
scaffold0216 (81-162)||(21233-21314)
scaffold0216 (4-47)||(21271-21314)
[»] scaffold1098 (3 HSPs)
scaffold1098 (4-160)||(1050-1209)
scaffold1098 (42-145)||(1105-1210)
scaffold1098 (1-55)||(1118-1173)
[»] scaffold1276 (2 HSPs)
scaffold1276 (108-149)||(128-169)
scaffold1276 (28-107)||(131-211)
[»] scaffold0364 (2 HSPs)
scaffold0364 (1-67)||(7109-7178)
scaffold0364 (70-145)||(7109-7186)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (108-160)||(120021-120073)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (32-106)||(21848-21926)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (31-87)||(2811-2869)
scaffold0130 (4-49)||(2823-2869)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (30-67)||(15731-15768)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (22-106)||(177910-177998)
[»] scaffold2046 (1 HSPs)
scaffold2046 (66-145)||(91-174)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 108)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 9388389 - 9388558
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9388389 cttatgccatggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 9388488  T
Q  101 attcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9388489 attcaactgttgggggcttatgccccggaatgcgtagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 9388558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33848627 - 33848456
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  33848627 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgtcttgt 33848528  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 170  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33848527 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatagaattggtgctaccttga 33848456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 16278432 - 16278573
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16278432 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcatt 16278531  T
Q  104 caactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  16278532 caattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 16278573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 16278635 - 16278796
Alignment:
Q  11 ggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact- 108  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  16278635 ggaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaatt 16278734  T
Q  109 gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278735 gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 16278796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 28382621 - 28382474
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  28382621 cttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgt 28382522  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28382521 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 28382474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33848701 - 33848559
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33848701 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcatt 33848602  T
Q  104 c-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    | || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  33848601 caaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 33848559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 31117359 - 31117498
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||    
T  31117359 atgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcatt 31117457  T
Q  104 caactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  31117458 caaccgttgagggcttatgccctggaatg-ttaatcattcaa 31117498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 15280408 - 15280552
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  15280408 atgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaacgccttgtcat 15280507  T
Q  103 tc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15280508 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 15280552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 6511580 - 6511435
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6511580 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 6511481  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| |||||||| |||||  ||||| |||||| ||| ||||||||    
T  6511480 cattcaaactgttgagggctcgtgccctggaatgttta-tcattcaa 6511435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16359259 - 16359114
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  16359259 atgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtca 16359160  T
Q  102 ttcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359159 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 16359114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 55503054 - 55503183
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  55503054 atgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcatt 55503153  T
Q  104 caa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    ||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  55503154 caatctgttgagggctcatgccctggaatg 55503183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16359298 - 16359155
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16359298 atgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcat 16359199  T
Q  103 tc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    || |||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  16359198 tcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 16359155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 56116035 - 56116166
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||    
T  56116035 cttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgtaatgatttgt 56116134  T
Q  100 cattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  56116135 cattcaatctgttgagggctcatgccctggaa 56116166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 15242465 - 15242599
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaa-tgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  15242465 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaattgccttg 15242564  T
Q  99 tcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  15242565 tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 15242599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 41791407 - 41791273
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaa-tgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  41791407 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttg 41791308  T
Q  99 tcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  41791307 tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 41791273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15990063 - 15989930
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15990063 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 15989964  T
Q  100 catt-caactgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    ||||  || ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  15989963 cattaaaaatgttgagggtttatgccctggaatg 15989930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 16278506 - 16278654
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| |||    
T  16278506 cttatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttg 16278605  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||| || ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  16278606 tcattcaaaatgttgggggcttacgctccggaatgctttgtcattcaac 16278654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4170796 - 4170654
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4170796 atgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 4170697  T
Q  103 tcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  4170696 tcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 4170654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10313508 - 10313366
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  10313508 atgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggcttgtgctctggaatgcttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctgggatgc-ttgtcat 10313410  T
Q  103 tcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10313409 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 10313366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14698488 - 14698346
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14698488 atgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 14698389  T
Q  103 tcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  14698388 tcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 14698346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 14698413 - 14698268
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |      
T  14698413 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttca 14698315  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 144  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14698314 tcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattca 14698268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 167
Target Start/End: Original strand, 53388033 - 53388171
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccgg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  53388033 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcgttcaaattgttgggggcttatgccccgg 53388132  T
Q  129 aatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctacct 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53388133 aatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgttacct 53388171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 286887 - 286739
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| |||  ||||||| | |||||||||||||| |||    
T  286887 cttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactattgagggctcatgccctggaatgctttg 286788  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  286787 tcattcaaattgttgggggcttatgccccgaaatacttagtcattcaac 286739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Original strand, 15242415 - 15242533
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgcccc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  15242415 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcatttaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccct 15242514  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  15242515 ggaatg-ttaatcattcaac 15242533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 4170721 - 4170576
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||   |      
T  4170721 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaat-tttca 4170623  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 144  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4170622 tcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattca 4170576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 6511631 - 6511514
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  6511631 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccct 6511532  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  6511531 ggaatgttta-tcattcaa 6511514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16359313 - 16359195
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||     
T  16359313 aactgttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccct 16359214  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  16359213 ggaatgctttgtcattcaa 16359195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 14942671 - 14942817
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||  ||     
T  14942671 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactattgagggctcatgccctagaatgtttatcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-tta 14942769  T
Q  99 tcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14942770 tcattcaaattgttgggggcttatgcacctgaatgcttagtcattcaa 14942817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 33684868 - 33684975
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| ||||||| |||||||| | ||    
T  33684868 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccatggaatgcttagt 33684967  T
Q  100 cattcaac 107  Q
    ||||||||    
T  33684968 cattcaac 33684975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 106
Target Start/End: Original strand, 14942621 - 14942699
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14942621 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 14942699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 160
Target Start/End: Original strand, 20899755 - 20899849
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20899755 aaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 20899849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 149
Target Start/End: Original strand, 21190073 - 21190195
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||     
T  21190073 aactattgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccct 21190172  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaacacg 149  Q
     |||||||| |||||||||||||    
T  21190173 agaatgcttggtcattcaacacg 21190195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 28382633 - 28382515
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  28382633 aactgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccct 28382534  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  28382533 ggaatgccttgtcattcaa 28382515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 56116156 - 56116286
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  56116156 atgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcgt 56116255  T
Q  103 tcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||| |||||| ||||| |||| | ||||||    
T  56116256 tcaatctgttgagggctcatgcactggaatg 56116286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 13881485 - 13881362
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccc 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  13881485 aactgttgagggctcatgctctggaatgctttgtcattcaaccattgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccc 13881386  T
Q  126 cggaatgcttagtcattcaacacg 149  Q
      || |||||||||||||||||||    
T  13881385 tagattgcttagtcattcaacacg 13881362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Original strand, 15449758 - 15449872
Alignment:
Q  31 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccgga 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||    
T  15449758 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactattgaggacttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgga 15449857  T
Q  130 atgcttagtcattcaa 145  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  15449858 atgttta-tcattcaa 15449872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 13877842 - 13877703
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        |||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||     
T  13877842 atgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggct--------ggaatgctttgtcattcaaccgttgaaggcttatgccctggaatgccttgtcac 13877751  T
Q  103 tcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 149  Q
    |||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13877750 tcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacg 13877703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Original strand, 55503039 - 55503156
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||     
T  55503039 aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaaccgttgagggcttatgccct 55503137  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  55503138 ggaatgccttgtcattcaa 55503156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 145
Target Start/End: Original strand, 15448426 - 15448549
Alignment:
Q  22 tcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattca-actgttgggggctta 120  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| |    
T  15448426 tcattcaattgttgagggcacatgccctagaatgttaatcattcaagtgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcagattgttgagggctca 15448525  T
Q  121 tgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||    
T  15448526 tgccctggaatg-ttaatcattcaa 15448549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 15990103 - 15989960
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  ||    
T  15990103 cttatgccctggaatgcctcgtcattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-tt 15990005  T
Q  98 gtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcatt 142  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15990004 atcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcatt 15989960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Original strand, 47127138 - 47127257
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  47127138 ctgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgtcgggggcttatgcccc 47127237  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  47127238 ggaatgcttagtcattcaac 47127257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 286897 - 286780
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccg 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||| |    
T  286897 ctgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactattgagggctcatgccctg 286798  T
Q  128 gaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||| |||||||||    
T  286797 gaatgctttgtcattcaa 286780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 145
Target Start/End: Original strand, 15280394 - 15280511
Alignment:
Q  29 actgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  15280394 actgttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctg 15280493  T
Q  128 gaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||| || | |||||||||    
T  15280494 gaacgccttgtcattcaa 15280511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 162
Target Start/End: Original strand, 24047832 - 24047960
Alignment:
Q  35 gagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||  || |||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  24047832 gagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggcttatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccagaatg 24047930  T
Q  133 cttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 162  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||    
T  24047931 cttagtcattcaacaagttgaaaatggtgc 24047960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15989928 - 15989797
Alignment:
Q  14 atgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttg 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||||||  |||| |||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  15989928 atgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgctctgaaatgtttatcattcaattgttgaggacttataccctagaatgctttgtcattcaactattg 15989829  T
Q  113 ggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
      |||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  15989828 aaggctcatgccctggaatgctta-tcattcaa 15989797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15989881 - 15989740
Alignment:
Q  22 tcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggctt 119  Q
    |||||||| |||||||| || || |||| ||||| ||  |||||||||  |||| || | |||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||    
T  15989881 tcattcaattgttgaggacttataccctagaatgctttgtcattcaactattgaaggctcatgccctggaatgc-ttatcattcaaattgttgggggctt 15989783  T
Q  120 atgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  15989782 atgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 15989740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27027652 - 27027546
Alignment:
Q  3 tatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |||    
T  27027652 tatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtc 27027553  T
Q  101 attcaac 107  Q
    |||||||    
T  27027552 attcaac 27027546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27027739 - 27027587
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtt------tatgccctggaat 92  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||| |      |||||||||||||    
T  27027739 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgaaatgtttgtcattcaaactgttgagggctcatgcctatgccctggaat 27027640  T
Q  93 gcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  27027639 gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 27027587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 55503128 - 55503234
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |    
T  55503128 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 55503227  T
Q  99 tcattca 105  Q
    |||||||    
T  55503228 tcattca 55503234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 15449805 - 15449882
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgaggg 77  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  15449805 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaattgttgaggg 15449882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 56115955 - 56116103
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  || ||| ||  | |||||| |||||||||||||||| ||    
T  56115955 cttatgctctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgcttt 56116054  T
Q  98 gtcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  56116055 gtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatg-ttaatcattcaac 56116103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Original strand, 24047840 - 24047944
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| ||||||||  |||||| | |||||    
T  24047840 atgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggcttatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccagaatgcttagtcat 24047939  T
Q  103 tcaac 107  Q
    |||||    
T  24047940 tcaac 24047944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 28382629 - 28382553
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28382629 gttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 28382553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 3337169 - 3337090
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3337169 aactgttgagggctcataccctggaatgttaatcattcaaactgttgagggcttatgccctagaatgccttgtcattcaa 3337090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 15448482 - 15448549
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattca-actgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15448482 cttatgccctggaatgccttgtcattcagattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 15448549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Original strand, 55503093 - 55503234
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  |||    
T  55503093 atgccctggaatgctc-gtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatca 55503190  T
Q  102 ttcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 144  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55503191 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 55503234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Original strand, 16278421 - 16278534
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  16278421 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaa 16278519  T
Q  131 tgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| |||||||||    
T  16278520 tgctttgtcattcaa 16278534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 93
Target Start/End: Original strand, 31117436 - 31117525
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatg 93  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||    
T  31117436 atgccctggaatgctc-gtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 31117525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 160
Target Start/End: Original strand, 33684856 - 33684989
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccc 125  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||     
T  33684856 aactattgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgcca 33684954  T
Q  126 cggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
     ||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  33684955 tggaatgcttagtcattcaacatgttgaaaatggt 33684989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 33848712 - 33848599
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33848712 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaa 33848614  T
Q  131 tgcttagtcattcaa 145  Q
    ||| | |||||||||    
T  33848613 tgccttgtcattcaa 33848599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 15242508 - 15242666
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt--taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  ||    
T  15242508 atgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatc 15242605  T
Q  101 attcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  15242606 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcatttaacacgttgaaaatggt 15242666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15990115 - 15990035
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15990115 aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctcgtcattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 15990035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 3337056 - 3336989
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3337056 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaa 3336989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 15989863 - 15989756
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | ||    
T  15989863 cttataccctagaatgctttgtcattcaactattgaaggctcatgccctggaatgcttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagt 15989764  T
Q  100 cattcaac 107  Q
    ||||||||    
T  15989763 cattcaac 15989756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 16359223 - 16359168
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359223 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 16359168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27027622 - 27027532
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    |||||||| | |||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  27027622 gttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 27027532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 134
Target Start/End: Original strand, 31117344 - 31117450
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||| |||| ||||| ||||||     
T  31117344 aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggctcatgccct 31117442  T
Q  127 ggaatgct 134  Q
    ||||||||    
T  31117443 ggaatgct 31117450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41791453 - 41791339
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||    
T  41791453 gttgagggctcatgccttggaacgctcgtcattcaaccgatgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 41791354  T
Q  131 tgcttagtcattcaac 146  Q
    || ||| |||||||||    
T  41791353 tg-ttaatcattcaac 41791339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 56116196 - 56116353
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |  || ||||| | |||||||| | |||| |||||||| ||  |||    
T  56116196 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcgttcaatctgttgagggctcatgcactggaatg-atcatca 56116293  T
Q  102 ttcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  56116294 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 56116353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 6511538 - 6511394
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| |  ||||||||||||  || ||    
T  6511538 atgccctggaatg-tttatcattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcgtgccctggaatgt-ttatc 6511441  T
Q  101 attcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6511440 attcaaattgttgggggattatgccccggaatgcttagtcattcaac 6511394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 16278664 - 16278718
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16278664 cttatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggcttatgccctggaatg 16278718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 15242543 - 15242648
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaat-gctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| |     
T  15242543 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctta 15242642  T
Q  98 gtcatt 103  Q
    ||||||    
T  15242643 gtcatt 15242648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 20899770 - 20899835
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 68  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20899770 atgccctggaatgccttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaac 20899835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 144
Target Start/End: Original strand, 15448394 - 15448509
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||| |||||  |  |||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  15448394 aactgttaagggctcatgctctggaatgttaatcattcaattgttgagggcacatgccctagaatg-ttaatcattcaagtgttgagggcttatgccctg 15448492  T
Q  128 gaatgcttagtcattca 144  Q
    |||||| | ||||||||    
T  15448493 gaatgccttgtcattca 15448509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Original strand, 16278417 - 16278496
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  16278417 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 16278496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33848716 - 33848637
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  33848716 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 33848637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 41791329 - 41791261
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaat-gctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41791329 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 41791261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Original strand, 53388044 - 53388096
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53388044 atgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 53388096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 56116231 - 56116339
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |    
T  56116231 cttatgccctggaatgccttgtcgttcaatctgttgagggctcatgcactggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 56116330  T
Q  99 tcattcaac 107  Q
    |||||||||    
T  56116331 tcattcaac 56116339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10313523 - 10313406
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  10313523 aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggcttgtgctctggaatgc-ttgtcattcaaccgttgagggctcatgccc 10313425  T
Q  126 cggaatgcttagtcattcaa 145  Q
     || |||||| |||||||||    
T  10313424 tgggatgctt-gtcattcaa 10313406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 47127148 - 47127203
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47127148 cttatgccctggaatgctatgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 47127203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 15280397 - 15280473
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||    
T  15280397 gttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaac 15280473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16359309 - 16359233
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||    
T  16359309 gttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaac 16359233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 107
Target Start/End: Original strand, 20899759 - 20899835
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20899759 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaac 20899835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3337079 - 3336989
Alignment:
Q  55 gttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  3337079 gttaattattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 3336989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Original strand, 21190088 - 21190138
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21190088 atgccctggaatg-tttatcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 21190138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 31117471 - 31117537
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31117471 cttatgccctggaatg-ttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 31117537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13877853 - 13877759
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  13877853 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgaggg--------ctggaatgctttgtcattcaaccgttgaaggcttatgccctggaa 13877762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18221140 - 18221088
Alignment:
Q  108 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  18221140 tgttgggggctcatgccccggaatgctcagtcattcaacacgttgaaaatggt 18221088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 31117348 - 31117423
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  31117348 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 31117423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 133
Target Start/End: Original strand, 53388029 - 53388097
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgc 133  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  53388029 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgc 53388097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 56115998 - 56116141
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| | | |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||||  |  ||    
T  56115998 atgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatgt-taatc 56116096  T
Q  101 attcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| | |||| || |||||||||    
T  56116097 attcaaccgttgagggcttatgccctgtaatgatttgtcattcaa 56116141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 13881470 - 13881419
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  13881470 atgctctggaatgctttgtcattcaaccattgagggcttatgccctggaatg 13881419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 27027754 - 27027691
Alignment:
Q  63 ttcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccc 125  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  27027754 ttcaatcgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccc 27027691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41791364 - 41791220
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt--taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  ||    
T  41791364 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatc 41791267  T
Q  101 attcaact-gttgggggcttatgcccc-ggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41791266 attcaaattgttgggggcttatgcccccggaatgcttagtcattcaa 41791220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 4170807 - 4170742
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgct 134  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  4170807 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgct 4170742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 13877775 - 13877706
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 68  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13877775 cttatgccctggaatgccttgtcactcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaac 13877706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14698499 - 14698434
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgct 134  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  14698499 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgct 14698434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 56115918 - 56116063
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| | | |||||||| |||| |||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||||||| || |||||    
T  56115918 atgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgctctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaacgccttgtc 56116017  T
Q  101 attc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
     ||| || || || |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  56116018 gttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 56116063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 13877857 - 13877805
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggct 118  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  13877857 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggct 13877805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Original strand, 21190126 - 21190178
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  21190126 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctagaatg 21190178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 145
Target Start/End: Original strand, 31131813 - 31131845
Alignment:
Q  113 ggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31131813 ggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 31131845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 56116075 - 56116221
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||||||| || |||    
T  56116075 cttatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgtaatgatttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaacgccttg 56116173  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    || ||| || || || ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  56116174 tcgttcaaattggtgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 56116221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 145
Target Start/End: Original strand, 14942625 - 14942699
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  14942625 gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 14942699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Original strand, 14942636 - 14942686
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14942636 atgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatg 14942686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 13881434 - 13881385
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccct 49  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  13881434 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccct 13881385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 16278703 - 16278772
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 68  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  16278703 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 16278772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27027787 - 27027711
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctg-gaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  27027787 gttgagggcttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaatcgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 27027711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 85)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17795117 - 17794946
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17795117 cttatgccctggaatgttttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 17795018  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 170  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17795017 cattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 17794946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 44431676 - 44431543
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  44431676 cttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgaaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 44431577  T
Q  100 cattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  44431576 cattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 44431543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17795191 - 17795049
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  17795191 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgttttgtcatt 17795092  T
Q  104 c-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    | || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  17795091 caaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 17795049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 7301457 - 7301603
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7301457 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 7301556  T
Q  100 cattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||| | |||||| ||| |||||||||    
T  7301557 cattcaatctgttgagggctcatgctctggaatg-ttaatcattcaac 7301603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20460020 - 20459858
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || |    
T  20460020 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgacggcttatgccctagaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgt-ttat 20459922  T
Q  100 cattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 162  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20459921 cattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 20459858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44431794 - 44431648
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || || ||||    
T  44431794 cttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccattgagggcttatgccctgtaacgccttgt 44431695  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| ||  | || |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  44431694 cattcaaagcggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 44431648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 22145743 - 22145892
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||    
T  22145743 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgcctt 22145842  T
Q  98 gtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22145843 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 22145892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 45135291 - 45135425
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaa-tgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  45135291 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaactgccttg 45135390  T
Q  99 tcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  45135391 tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 45135425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 7301535 - 7301668
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||    
T  7301535 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgaattgccttgt 7301634  T
Q  100 cattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  7301635 cattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 7301668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Original strand, 44523200 - 44523320
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44523200 aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 44523299  T
Q  126 cggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44523300 cggaatgcttagtcattcaac 44523320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 6608603 - 6608745
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6608603 atgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 6608702  T
Q  103 tcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  6608703 tcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 6608745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 28853745 - 28853604
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcatt 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28853745 atgccctggaatgctttgtcgttcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcatt 28853646  T
Q  104 caa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||  ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  28853645 caatttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 28853604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 6608678 - 6608822
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |      
T  6608678 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttca 6608776  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattc 143  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6608777 tcattcaaagtgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattc 6608822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 28853671 - 28853525
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatg--cat 96  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||  ||     
T  28853671 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgtcca- 28853573  T
Q  97 tgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
      |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28853572 --tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 28853525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17614724 - 17614609
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||    
T  17614724 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 17614625  T
Q  131 tgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||| ||||||||||    
T  17614624 tgctttgtcattcaac 17614609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 22059737 - 22059884
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  22059737 cttatgcccagggatgctatgtcattcaactgttgatggcttatgccctggaatgctttgtcattcagctgttgagggctcatgccctggaatgccttgt 22059836  T
Q  100 cattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22059837 cattcaaattgttgggggcttatgccccgaaatgcttagtcattcaac 22059884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Original strand, 7301372 - 7301485
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  7301372 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaatgttgagggcttatgccctggaat 7301471  T
Q  132 gcttagtcattcaa 145  Q
    || | |||||||||    
T  7301472 gccttgtcattcaa 7301485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 22059698 - 22059843
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  22059698 cttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgcccagggatgctatgtcattcaactgttgatggcttatgccctggaatgctttgt 22059797  T
Q  100 cattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  22059798 cattcagctgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 22059843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 17614675 - 17614528
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  |||    
T  17614675 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg-ttcatca 17614577  T
Q  102 ttc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 149  Q
    ||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17614576 ttcaaattgttgggggcttacgctccggaatgcttagtcattcaacacg 17614528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 43112072 - 43111949
Alignment:
Q  22 tcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |    
T  43112072 tcattcaactgttgagggctcatgccttggaatattaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctca 43111973  T
Q  121 tgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||    
T  43111972 tgccctggaatgttta-tcattcaa 43111949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 22145704 - 22145851
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22145704 cttatgccctggaatgctatgtcatttaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgctttg 22145803  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  22145804 tcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 22145851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 32949700 - 32949583
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||     
T  32949700 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccttggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccct 32949601  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  32949600 ggaatgttta-tcattcaa 32949583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 19881912 - 19881766
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  19881912 cttatgccctggaatgctttttcattcaaactgttgagggcttatgccatggaatgtttatcattcaaactgttgacggcttatgccctggaatgccttg 19881813  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  19881812 tcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 19881766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 21415555 - 21415713
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  ||    
T  21415555 atgccctggaatgctttgccattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatc 21415653  T
Q  101 attcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  21415654 attcaattgctgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 21415713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 19881990 - 19881845
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| | |||||||||||||||| || |    
T  19881990 cttatgccccggaatgccttgtcattcaaattgtcgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaattgttgagtgcttatgccctggaatgcttttt 19881891  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  19881890 cattcaaactgttgagggcttatgccatggaatgttta-tcattcaa 19881845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Original strand, 22145694 - 22145811
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccg 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  22145694 ctgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcatttaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggcttatgccctg 22145793  T
Q  128 gaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||| |||||||||    
T  22145794 gaatgctttgtcattcaa 22145811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 144
Target Start/End: Original strand, 22059686 - 22059803
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  22059686 aactgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgcccagggatgctatgtcattcaactgttgatggcttatgccct 22059785  T
Q  127 ggaatgcttagtcattca 144  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  22059786 ggaatgctttgtcattca 22059803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 161
Target Start/End: Original strand, 38186102 - 38186230
Alignment:
Q  35 gagggctcatgccc-tggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||  || |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  38186102 gagggctcatgcccctggaatgctttgtcattcaaccgttgatggcttatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 38186200  T
Q  132 gcttagtcattcaacacgatggaaatggtg 161  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||    
T  38186201 gcttagtcattcaacatgttgaaaatggtg 38186230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 43112034 - 43111894
Alignment:
Q  22 tcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggct 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||    
T  43112034 tcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggct 43111936  T
Q  119 tatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  43111935 tatcccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 43111894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 363721 - 363613
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||| ||| |||||||||||||||| | |    
T  363721 cttatgccctggactgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatgcttag 363622  T
Q  99 tcattcaac 107  Q
    |||||||||    
T  363621 tcattcaac 363613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 7301383 - 7301525
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7301383 atgccctggaatgctc-gtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaatgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 7301481  T
Q  103 tcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||| |||||| ||||| |||| | |||||| ||| |||||||||    
T  7301482 tcaatctgttgagggctcatgctctggaatg-ttaatcattcaac 7301525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 28853757 - 28853643
Alignment:
Q  31 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccgga 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  28853757 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcgttcaaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctgga 28853659  T
Q  130 atgcttagtcattcaa 145  Q
    |||| | |||||||||    
T  28853658 atgccttgtcattcaa 28853643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Original strand, 45135245 - 45135359
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||    
T  45135245 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 45135344  T
Q  131 tgcttagtcattcaac 146  Q
    || ||| |||||||||    
T  45135345 tg-ttaatcattcaac 45135359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 7301418 - 7301563
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||| ||||||||  |      
T  7301418 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaatgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatg-ttaa 7301516  T
Q  99 tcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  7301517 tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 7301563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 44431598 - 44431492
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||||||| |||||||| ||||||| | |    
T  44431598 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaaattgttgagggcttatgccccggaatgcttag 44431499  T
Q  99 tcattca 105  Q
    |||||||    
T  44431498 tcattca 44431492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 162
Target Start/End: Original strand, 21861647 - 21861775
Alignment:
Q  35 gagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||   |||||| |||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  21861647 gagggctcatgccctagaatgctttgtcattcaactactgagggcttatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatg 21861745  T
Q  133 cttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 162  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21861746 cttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 21861775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Original strand, 21861655 - 21861759
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||||||||||| | |||||    
T  21861655 atgccctagaatgctttgtcattcaactactgagggcttatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatgcttagtcat 21861754  T
Q  103 tcaac 107  Q
    |||||    
T  21861755 tcaac 21861759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 43112016 - 43111908
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||| ||| ||||||| | |    
T  43112016 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatcccccggaatgcttag 43111917  T
Q  99 tcattcaac 107  Q
    |||||||||    
T  43111916 tcattcaac 43111908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 43112100 - 43111988
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcatt-gtcattcaactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||  |||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  43112100 gttgaggactcatgtcctggaatgttaatcattcaactgttgagggctcatgccttggaat--attaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaa 43112003  T
Q  131 tgcttagtcattcaa 145  Q
    ||| | |||||||||    
T  43112002 tgccttgtcattcaa 43111988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17614713 - 17614584
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  17614713 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtca 17614615  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  17614614 ttcaaccgttgagggcttatgccctggaatg 17614584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20460028 - 20459915
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20460028 gttgaggacttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgacggcttatgccctagaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaa 20459929  T
Q  131 tgcttagtcattcaa 145  Q
    || ||| ||||||||    
T  20459928 tgttta-tcattcaa 20459915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 107
Target Start/End: Original strand, 38186114 - 38186215
Alignment:
Q  7 ccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattca 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | ||||||||    
T  38186114 ccctggaatgctttgtcattcaaccgttgatggcttatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 38186213  T
Q  106 ac 107  Q
    ||    
T  38186214 ac 38186215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 44431616 - 44431476
Alignment:
Q  22 tcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggct 118  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | ||||||||||||| ||  |||||||| | |||| |||||    
T  44431616 tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-atcatcattcaaattgttgagggct 44431518  T
Q  119 tatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  44431517 tatgccccggaatgcttagtcattcatcacgttgaaaatggt 44431476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 19881833 - 19881725
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||  ||||||| | |    
T  19881833 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccacggaatgcttag 19881734  T
Q  99 tcattcaac 107  Q
    |||||||||    
T  19881733 tcattcaac 19881725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20460032 - 20459952
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  20460032 aaccgttgaggacttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgacggcttatgccctagaatgctttgtcattcaac 20459952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 24708122 - 24708198
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708122 gttgagggctcatgccctagaatgctatgtcattcaaccgttgagggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 24708198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 32949650 - 32949542
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| ||||||||| |||||| | |    
T  32949650 cttatgccttggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccctagaatgcttag 32949551  T
Q  99 tcattcaac 107  Q
    |||||||||    
T  32949550 tcattcaac 32949542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 145
Target Start/End: Original strand, 44523183 - 44523279
Alignment:
Q  50 ggaatgttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  44523183 ggaatgttaatcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 44523279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 362193 - 362351
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaat-gttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||   |  |||||| ||| |||||||| |||| |||| |||||  || |||    
T  362193 atgccctggaatgctttgtcattcaactattgagggcttatgccctataataccttgtcattcaaactgttgagggcttataccctagaatg-tttatca 362291  T
Q  102 ttc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    ||| || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||    
T  362292 ttcaaattgttgggggcttaagccccggaatacctagtcattcaacacgttgaaaatggt 362351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Original strand, 44523215 - 44523266
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44523215 atgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatg 44523266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19881872 - 19881713
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  |  ||||||||   |||||||| | |||||||||||||  ||    
T  19881872 cttatgccatggaatg-tttatcattcaaactgttgacggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-tt 19881775  T
Q  98 gtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatg 158  Q
     |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19881774 atcattcaaattgttgggggcttatgccacggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatg 19881713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 363758 - 363599
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| | | |||||||| |||||||||| || ||  |||||||| | |||||||| | ||||||||||||| ||  ||    
T  363758 atgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggactgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-atcatc 363660  T
Q  101 attcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  363659 attcaaattgttgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 363599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17795206 - 17795127
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  17795206 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 17795127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 19882042 - 19881962
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19882042 aaccgttgagggcttatgccctagaatgcctcgtcattcaaactgttgagggcttatgccccggaatgccttgtcattcaa 19881962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 22059690 - 22059766
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||  ||||||||||    
T  22059690 gttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgcccagggatgctatgtcattcaac 22059766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 107
Target Start/End: Original strand, 24708118 - 24708198
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaac 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  24708118 aactgttgagggctcatgccctagaatgctatgtcattcaaccgttgagggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 24708198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 45135369 - 45135477
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaa-tgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| |     
T  45135369 cttatgccctggaactgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgtccatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctta 45135468  T
Q  98 gtcattcaa 106  Q
    |||||||||    
T  45135469 gtcattcaa 45135477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Original strand, 7301368 - 7301446
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  7301368 aaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 7301446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 7301613 - 7301680
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7301613 cttatgccctgaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 7301680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 149
Target Start/End: Original strand, 15004830 - 15004909
Alignment:
Q  71 ttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 149  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15004830 ttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggtttatgctctggaatgcttagtcattcaacacg 15004909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 132
Target Start/End: Original strand, 21415544 - 21415647
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgccccgg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  21415544 gttgagggctcatgccctggaatgctttgccattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgg 21415643  T
Q  129 aatg 132  Q
    ||||    
T  21415644 aatg 21415647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 32949685 - 32949540
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |  ||||||||   |||||||| | |||||||||||||  || |||    
T  32949685 atgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccttggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatca 32949588  T
Q  102 ttcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacac 148  Q
    ||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32949587 ttcaaattgttgggggcttatgccctagaatgcttagtcattcaacac 32949540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Original strand, 45135241 - 45135319
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  45135241 aaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 45135319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 15004084 - 15004138
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15004084 cttatgccctagaatgctttgttattcaactgttgagggcttatgccctggaatg 15004138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17795202 - 17795089
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||| || | |||||||||||| ||||    
T  17795202 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgtggagggcttatgccctggaa 17795104  T
Q  131 tgcttagtcattcaa 145  Q
    || || |||||||||    
T  17795103 tgttttgtcattcaa 17795089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 135
Target Start/End: Original strand, 15004076 - 15004141
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgctt 135  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15004076 gttgagggcttatgccctagaatgctttgttattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctt 15004141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 20454355 - 20454303
Alignment:
Q  15 tgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  20454355 tgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgaaatgtttatcattcaa 20454303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 121
Target Start/End: Original strand, 362178 - 362273
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  362178 aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactattgagggcttatgccctataataccttgtcattcaaactgttgagggcttat 362273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 45135334 - 45135477
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaa-tgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatg--cattg 98  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |||      
T  45135334 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaactgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgtccat-- 45135430  T
Q  99 tcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45135431 -cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 45135477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 45135256 - 45135382
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||| | |||||||||||||  |  |||    
T  45135256 atgccctggaatgctc-gtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatca 45135353  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  45135354 ttcaaccgttgagggcttatgccctggaa 45135382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 125
Target Start/End: Original strand, 362182 - 362237
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccc 125  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  362182 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactattgagggcttatgccc 362237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20454348 - 20454246
Alignment:
Q  60 tcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttg-ggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatg 158  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  || |||||||| |  |  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20454348 tcattcaactgttgagggcttatgccctgaaatgt-ttatcattcaaattatcaggggcttatgccctgaaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatg 20454250  T
Q  159 gtgc 162  Q
    ||||    
T  20454249 gtgc 20454246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 22521897 - 22522044
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctg-gaatgtta-atcattc-aaccgttgagggtttatgccctg-gaatgcatt-g 98  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||      
T  22521897 atgccctggaacgccttgtcgttcaatcgttgagggcttatgccctgtgaatgctagatcattcaaaccgttgagggctcatgccctgtgaatgctttaa 22521996  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
     ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  22521997 ccattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 22522044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 44431800 - 44431726
Alignment:
Q  72 tgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  44431800 tgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 44431726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Original strand, 24708133 - 24708199
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc 69  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  24708133 atgccctagaatgctatgtcattcaaccgttgagggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacc 24708199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 134
Target Start/End: Original strand, 6608592 - 6608657
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgct 134  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  6608592 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgct 6608657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 146
Target Start/End: Original strand, 7301688 - 7301721
Alignment:
Q  113 ggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7301688 ggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 7301721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 15004837 - 15004906
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||||| ||| |||||||||    
T  15004837 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggtttatgctctggaatgcttagtcattcaac 15004906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 15267229 - 15267118
Alignment:
Q  1 cttatgccctg-gaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgc 94  Q
    ||||||||||| |||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||| | ||||||||||||||    
T  15267229 cttatgccctgtgaatgctagttcattcaaaccgttgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgc 15267130  T
Q  95 attgtcattcaa 106  Q
     |||||||||||    
T  15267129 cttgtcattcaa 15267118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Original strand, 21415540 - 21415620
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  21415540 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgccattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 21415620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 22521933 - 22522044
Alignment:
Q  1 cttatgccctg-gaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgc 94  Q
    ||||||||||| |||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||| | ||||||||||||||    
T  22521933 cttatgccctgtgaatgctagatcattcaaaccgttgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgc 22522032  T
Q  95 attgtcattcaa 106  Q
     |||||||||||    
T  22522033 tttgtcattcaa 22522044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 94
Target Start/End: Original strand, 15004072 - 15004139
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgc 94  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15004072 aactgttgagggcttatgccctagaatgctttgttattcaactgttgagggcttatgccctggaatgc 15004139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Original strand, 22434610 - 22434737
Alignment:
Q  4 atgccctg-gaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctg-gaatgcatt 97  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| | |||||||| |||| | |     
T  22434610 atgccctgtgaatgcttaatcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatactta 22434709  T
Q  98 gtcattcaactgttgggggcttatgccc 125  Q
     | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  22434710 attattcaactgttgagggctcatgccc 22434737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44431716 - 44431570
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||   | |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||| ||||  |     
T  44431716 cttatgccctgtaacgccttgtcattcaaagcggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgaaatgt-ta 44431618  T
Q  98 gtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  44431617 atcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 44431570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 145
Target Start/End: Original strand, 17272816 - 17272853
Alignment:
Q  108 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17272816 tgttgggggtttatgctccggaatgcttagtcattcaa 17272853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 68)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 296320 - 296153
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  296320 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgtcttgtcatt 296221  T
Q  104 c-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 170  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  296220 caaattgttgggggcttaagccccggaatgcttagtcattcaacacgatagaaatggtgataccttga 296153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 2333382 - 2333527
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||    
T  2333382 atgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatcgttgagggctcatgccttggaatgccttgtcat 2333481  T
Q  103 tc-aactgtt-gggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2333482 tcaaattgttggggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 2333527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20631074 - 20630926
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| |||    
T  20631074 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttg 20630975  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630974 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 20630926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 14432671 - 14432819
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| |||    
T  14432671 cttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgggggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttg 14432770  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14432771 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 14432819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 36181372 - 36181224
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| |||    
T  36181372 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttg 36181273  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36181272 tcattcaaattgttgggggcttatgccccgaaatgcttagtcattcaac 36181224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20631113 - 20630967
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20631113 cttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 20631014  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  20631013 cattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 20630967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20586876 - 20586733
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  |||    
T  20586876 atgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttcatca 20586778  T
Q  102 ttc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20586777 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 20586733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 2333304 - 2333446
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  2333304 atgccctggaatgctttgtcattcaatctgtcgagggctcgtgccctggagtgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcat 2333403  T
Q  103 tcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  2333404 tcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 2333446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 45307049 - 45306915
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaa-tgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  45307049 cttatgccctggaatgccttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttg 45306950  T
Q  99 tcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  45306949 tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 45306915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20579183 - 20579040
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| |  |  |||    
T  20579183 atgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaacg-ttcatca 20579085  T
Q  102 ttc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20579084 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 20579040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 22900615 - 22900762
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  |||    
T  22900615 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg-ttcatca 22900713  T
Q  102 ttc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 149  Q
    ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22900714 ttcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcaacacg 22900762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 293961 - 293834
Alignment:
Q  7 ccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattca 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  293961 ccctggaatgccttgtcattcaatttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccttggaatgccttgtcattca 293862  T
Q  106 a-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    | |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  293861 atctgttgagggctcatgccctggaatg 293834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20901159 - 20901001
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| ||||  ||||  || ||||    
T  20901159 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccatggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttattcccttcaatg-tttatcat 20901061  T
Q  103 tcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 162  Q
    |||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20901060 tcaaattgttggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 20901001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Original strand, 22900566 - 22900681
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||    
T  22900566 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 22900665  T
Q  131 tgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||| ||||||||||    
T  22900666 tgctttgtcattcaac 22900681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20631123 - 20631007
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccgg 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20631123 ctgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 20631024  T
Q  129 aatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||| |||||||||    
T  20631023 aatgctttgtcattcaa 20631007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24087248 - 24087117
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccc 125  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||    
T  24087248 aactgttgagggctcatgccctagaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttatcattcaaattgttgggggcttatgccc 24087149  T
Q  126 cggaatgcttagtcattcaacacgatggaaat 157  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24087148 cggaatgcttagtcattcaacatgttggaaat 24087117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18823655 - 18823541
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||| | |||||| ||||    
T  18823655 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttttcattcaaactgttgagggttcatgccctggaa 18823556  T
Q  131 tgcttagtcattcaa 145  Q
    ||| | |||||||||    
T  18823555 tgccttgtcattcaa 18823541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20579271 - 20579158
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||    
T  20579271 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaat 20579172  T
Q  132 gcttagtcattcaa 145  Q
    || | |||||||||    
T  20579171 gccttgtcattcaa 20579158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20586964 - 20586851
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||    
T  20586964 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaat 20586865  T
Q  132 gcttagtcattcaa 145  Q
    || | |||||||||    
T  20586864 gccttgtcattcaa 20586851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 20901199 - 20901080
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  20901199 atgccctgtaatgccttgtcattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccatggaatgctttgtca 20901100  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttat 121  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  20901099 ttcaactgttgagggcttat 20901080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20901214 - 20901094
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |  |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  20901214 aactgttgagggctcatgccctgtaatgccttgtcattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgcca 20901115  T
Q  126 cggaatgcttagtcattcaac 146  Q
     ||||||||| ||||||||||    
T  20901114 tggaatgctttgtcattcaac 20901094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 123
Target Start/End: Original strand, 21181474 - 21181567
Alignment:
Q  31 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgc 123  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  21181474 tgttgagggcttatgccatggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgc 21181567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 36181382 - 36181265
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccg 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |    
T  36181382 ctgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctg 36181283  T
Q  128 gaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| | |||||||||    
T  36181282 gaatgccttgtcattcaa 36181265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18823609 - 18823462
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | ||||||| |||||  ||    
T  18823609 cttatgccctggaatgccttttcattcaaactgttgagggttcatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgt-tt 18823511  T
Q  98 gtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18823510 atcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 18823462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28312195 - 28312068
Alignment:
Q  35 gagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  || |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  28312195 gagggctcatgccctgaaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccttggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttttgccccggaatg 28312097  T
Q  133 cttagtcattcaacacgatggaaatggtg 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28312096 cttagtcattcaacacgttgaaaatggtg 28312068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 293924 - 293767
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |  |||||||| | |||||||| | ||||||||||||| ||  |||    
T  293924 atgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccttggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-atcatca 293827  T
Q  102 ttcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  293826 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaactcgttgaaaatggt 293767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20579260 - 20579119
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  20579260 atgccctggaatgctc-gtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcat 20579162  T
Q  103 tcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  20579161 tcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 20579119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20586953 - 20586812
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  20586953 atgccctggaatgctc-gtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcat 20586855  T
Q  103 tcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  20586854 tcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 20586812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 21181407 - 21181549
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||   |||||||| ||||||| |||||||  |  |||    
T  21181407 atgccctggaatgccttgtcattgaaactgttgagggctcatgccctagaatgtttatgattcaaattgttgagggcttatgccatggaatgt-taatca 21181505  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  21181506 ttcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 21181549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 45307095 - 45306981
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||    
T  45307095 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 45306996  T
Q  131 tgcttagtcattcaac 146  Q
    || ||| |||||||||    
T  45306995 tg-ttaatcattcaac 45306981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 21181483 - 21181643
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||| |||||| |  ||     
T  21181483 cttatgccatggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgctctggaaggt-tta 21181580  T
Q  99 tcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  21181581 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 21181643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20631121 - 20631045
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20631121 gttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 20631045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 28204708 - 28204816
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |    
T  28204708 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 28204807  T
Q  99 tcattcaac 107  Q
    |||||||||    
T  28204808 tcattcaac 28204816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 145
Target Start/End: Original strand, 14432663 - 14432738
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  14432663 gttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgggggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 14432738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 160
Target Start/End: Original strand, 28204696 - 28204830
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgcc 124  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | ||||||| |||||  || |||||||| | ||||||||||||||||    
T  28204696 aactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgcc 28204794  T
Q  125 ccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  28204795 ccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 28204830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 22900577 - 22900706
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  22900577 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtca 22900675  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  22900676 ttcaaccgttgagggcttatgccctggaatg 22900706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 293889 - 293780
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |    
T  293889 cttatgccttggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 293790  T
Q  99 tcattcaact 108  Q
    ||||||||||    
T  293789 tcattcaact 293780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Original strand, 14432661 - 14432778
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccg 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |    
T  14432661 ctgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgggggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctg 14432760  T
Q  128 gaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| | |||||||||    
T  14432761 gaatgccttgtcattcaa 14432778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 24087233 - 24087128
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | ||||    
T  24087233 atgccctagaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 24087134  T
Q  102 ttcaac 107  Q
    ||||||    
T  24087133 ttcaac 24087128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18270307 - 18270199
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |    
T  18270307 cttatgccctggaatgccttgtctttcaaactgttgagggctcatgccctggagtgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 18270208  T
Q  99 tcattcaac 107  Q
    |||||||||    
T  18270207 tcattcaac 18270199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18274961 - 18274853
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |    
T  18274961 cttatgccctggaatgccttgtctttcaaactgttgagggctcatgccctggagtgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 18274862  T
Q  99 tcattcaac 107  Q
    |||||||||    
T  18274861 tcattcaac 18274853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18823644 - 18823521
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18823644 atgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttttcattcaaactgttgagggttcatgccctggaatgccttgtca 18823546  T
Q  102 ttc-aactgttgggggcttatgccc 125  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  18823545 ttcaaactgttgagggctcatgccc 18823521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28312187 - 28312083
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||  |||| ||| || ||||| ||||||| | |||||    
T  28312187 atgccctgaaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccttggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttttgccccggaatgcttagtcat 28312088  T
Q  103 tcaac 107  Q
    |||||    
T  28312087 tcaac 28312083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 20579225 - 20579171
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20579225 cttatgccctggaatgttttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 20579171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 20586918 - 20586864
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20586918 cttatgccctggaatgttttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 20586864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 296335 - 296256
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  296335 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 296256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 45306971 - 45306903
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaat-gctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45306971 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 45306903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 19209532 - 19209465
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19209532 cttatgccttggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttattattcaa 19209465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20901123 - 20901017
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | ||    
T  20901123 cttatgccatggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttattcccttcaatgtttatcattcaaattgttg-gggcttatgccccggaatgcttagt 20901025  T
Q  100 cattcaac 107  Q
    ||||||||    
T  20901024 cattcaac 20901017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 296331 - 296218
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  296331 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaa 296233  T
Q  131 tgcttagtcattcaa 145  Q
    ||  | |||||||||    
T  296232 tgtcttgtcattcaa 296218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18270237 - 18270183
Alignment:
Q  108 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  18270237 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatagtgc 18270183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18274891 - 18274837
Alignment:
Q  108 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  18274891 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatagtgc 18274837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16400729 - 16400611
Alignment:
Q  31 tgttgagggctcatgccctg-gaatgttaat-cattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| | |||||||| | ||||| |||||||  || |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  16400729 tgttgagggctcatgccctgtgaatgctagttcattcaaactgttgagggctcatgccttggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttattcccc 16400631  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16400630 ggaatgcttagtcattcaac 16400611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20579275 - 20579197
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  20579275 aaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttttgtcattcaa 20579197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20586968 - 20586890
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  20586968 aaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttttgtcattcaa 20586890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 37358239 - 37358201
Alignment:
Q  108 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37358239 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 37358201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 45307006 - 45306863
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt--taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  ||    
T  45307006 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatc 45306909  T
Q  101 attcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45306908 attcaaattgtggggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 45306863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 45307099 - 45307033
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgc 133  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  45307099 aaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgc 45307033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16400691 - 16400611
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaac 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||| ||| ||||||| | ||||||||||    
T  16400691 aactgttgagggctcatgccttggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttattccccggaatgcttagtcattcaac 16400611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18270319 - 18270259
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccc 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  18270319 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtctttcaaactgttgagggctcatgccc 18270259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18274973 - 18274913
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccc 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  18274973 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtctttcaaactgttgagggctcatgccc 18274913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19209462 - 19209407
Alignment:
Q  108 tgttgggggcttatgccccggaatgctt-agtcattcaacacgatggaaatggtgc 162  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  19209462 tgttgggggcttatcccctggaatgcttaagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 19209407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 37358280 - 37358201
Alignment:
Q  29 actgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  37358280 actgttgagggctcatgccctggaatgatcattattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 37358201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 45307084 - 45307034
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  45307084 atgccctggaatgctc-gtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg 45307034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20043909 - 20043867
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctg-gaatgcattgtcattcaac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20043909 aaccgttgagggtttatgccctgtgaatgccttgtcattcaac 20043867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 106
Target Start/End: Original strand, 2333289 - 2333329
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa 106  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  2333289 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 2333329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18823656 - 18823593
Alignment:
Q  69 cgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgc 133  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18823656 cgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgc 18823593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 55
Target Start/End: Original strand, 21181375 - 21181419
Alignment:
Q  12 gaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21181375 gaatgccttgtcattcaaactattgagggctcatgccctggaatg 21181419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 9)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 8824 - 8657
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8824 atgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcatt 8725  T
Q  104 c-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 170  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8724 caaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgaaggaaatggtgctaccttga 8657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 11197 - 11342
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11197 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 11296  T
Q  100 cattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  11297 cattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 11342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 11275 - 11423
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||| |||||||| |||    
T  11275 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccttggaatgccttg 11374  T
Q  99 tcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11375 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggactgcttagtcattcaac 11423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 8905 - 8771
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  8905 cttatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgt 8806  T
Q  100 cattcaactgttgggggcttatgccccggaatgct 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  8805 cattcaattgttgagggctcatgccctggaatgct 8771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8941 - 8799
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  8941 atgccctggaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcat 8842  T
Q  103 tcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  8841 tcaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 8799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Original strand, 11187 - 11304
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccgg 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  11187 ctgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 11286  T
Q  129 aatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  11287 aatgctttgtcattcaac 11304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8952 - 8838
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  8952 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaa 8853  T
Q  131 tgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| |||||||||    
T  8852 tgctttgtcattcaa 8838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8956 - 8877
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  8956 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 8877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 8750 - 8681
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 68  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  8750 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 8681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 68)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 23339567 - 23339738
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  23339567 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgtcttgt 23339666  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 170  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23339667 cattcaaattgttgggggcttatgccacggaatgcttagtcattcaacacgatggaattggtgctaccttga 23339738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 44620730 - 44620583
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  44620730 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 44620631  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620630 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 44620583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 25035995 - 25036139
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  25035995 atgccctagaatgattcgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatcgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcat 25036094  T
Q  103 tc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25036095 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 25036139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 23339493 - 23339635
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23339493 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcatt 23339592  T
Q  104 c-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    | || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  23339593 caaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 23339635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 28348876 - 28348743
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28348876 cttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 28348777  T
Q  100 cattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  28348776 cattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 28348743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 31755731 - 31755602
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  31755731 atgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcatt 31755632  T
Q  104 caa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    ||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  31755631 caatctgttgagggctcatgccctggaatg 31755602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 21239491 - 21239625
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaa-tgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  21239491 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttg 21239590  T
Q  99 tcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  21239591 tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 21239625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 21242041 - 21242175
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaa-tgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  21242041 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttg 21242140  T
Q  99 tcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  21242141 tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 21242175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31503360 - 31503215
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31503360 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 31503261  T
Q  100 cattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  31503260 cattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 31503215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 167
Target Start/End: Original strand, 20591424 - 20591561
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccgga 129  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20591424 gttgagggctcataccctgaaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgccatgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 20591523  T
Q  130 atgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctacct 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20591524 atgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgttacct 20591561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31503282 - 31503137
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |      
T  31503282 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttca 31503184  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 144  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31503183 tcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattca 31503137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31505926 - 31505781
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  31505926 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccatggaatgccttgt 31505827  T
Q  100 cattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  31505826 cattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 31505781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24504473 - 24504344
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  24504473 atgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcatt 24504374  T
Q  104 caa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    ||| |||||| ||||| || ||| ||||||    
T  24504373 caatctgttgagggctcataccctggaatg 24504344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31505848 - 31505703
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |      
T  31505848 cttatgccatggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttca 31505750  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 144  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31505749 tcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattca 31505703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Original strand, 24274235 - 24274354
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| || ||||| ||||| ||||||     
T  24274235 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctcgaataccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccct 24274334  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  24274335 ggaatgctttgtcattcaac 24274354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23374999 - 23374868
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||  || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23374999 ctgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccg 23374901  T
Q  128 gaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  23374900 gaatgcttagtcattcaacaagttgaaaatggt 23374868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23374986 - 23374882
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |||||    
T  23374986 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcat 23374887  T
Q  103 tcaac 107  Q
    |||||    
T  23374886 tcaac 23374882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44620740 - 44620624
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccgg 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  44620740 ctgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 44620641  T
Q  129 aatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| | |||||||||    
T  44620640 aatgccttgtcattcaa 44620624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Original strand, 41685075 - 41685194
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41685075 ctgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcccc 41685174  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41685175 ggaatgcttagtcattcaac 41685194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22109513 - 22109435
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacac 148  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22109513 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacac 22109435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31755746 - 31755629
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||     
T  31755746 aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaaccgttgagggcttatgccct 31755648  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  31755647 ggaatgccttgtcattcaa 31755629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 28352671 - 28352568
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgccccgg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  28352671 ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgatggcttatgtcctggaatgacttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgg 28352572  T
Q  129 aatg 132  Q
    ||||    
T  28352571 aatg 28352568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31503400 - 31503254
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |     
T  31503400 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgc-tc 31503302  T
Q  98 gtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  31503301 gtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 31503254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24504488 - 24504371
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||||||     
T  24504488 aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaaccgttgagggctcatgccct 24504390  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  24504389 ggaatgccttgtcattcaa 24504371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 10040240 - 10040345
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | ||    
T  10040240 cttatgccctggaatgccttgtcattcaactgttgagggctcatgcccaggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagt 10040339  T
Q  100 cattca 105  Q
    ||||||    
T  10040340 cattca 10040345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Original strand, 21239445 - 21239559
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||    
T  21239445 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 21239544  T
Q  131 tgcttagtcattcaac 146  Q
    || ||| |||||||||    
T  21239545 tg-ttaatcattcaac 21239559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Original strand, 21241995 - 21242109
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||    
T  21241995 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 21242094  T
Q  131 tgcttagtcattcaac 146  Q
    || ||| |||||||||    
T  21242095 tg-ttaatcattcaac 21242109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 28348833 - 28348676
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | ||||||||||||| ||  |||    
T  28348833 atgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-atcatca 28348736  T
Q  102 ttcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||    
T  28348735 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgattagtcattcaacccgttgaaaatggt 28348676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31505966 - 31505820
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |     
T  31505966 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgc-tc 31505868  T
Q  98 gtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  31505867 gtcattcaaccgttgagggcttatgccatggaatgccttgtcattcaa 31505820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 31755657 - 31755551
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |    
T  31755657 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 31755558  T
Q  99 tcattca 105  Q
    |||||||    
T  31755557 tcattca 31755551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 12628184 - 12628261
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12628184 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 12628261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 22109505 - 22109437
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22109505 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaac 22109437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 44620738 - 44620662
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  44620738 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaac 44620662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 24274285 - 24274392
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  24274285 cttatgccctcgaataccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactattgagggcttatgccctggaatgccttg 24274384  T
Q  99 tcattcaa 106  Q
    ||||||||    
T  24274385 tcattcaa 24274392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24504434 - 24504293
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | || ||||||||||  |  |||    
T  24504434 atgccctggaatgctc-gtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcataccctggaatgt-tcatca 24504337  T
Q  102 ttcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 144  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24504336 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 24504293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 25035952 - 25036098
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |     
T  25035952 cttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgattcgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-tta 25036050  T
Q  98 gtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
     ||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  25036051 atcattcaatcgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 25036098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 28352658 - 28352501
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||  |  |||||||| | |||||||| | ||||||||||||| ||  |||    
T  28352658 atgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgatggcttatgtcctggaatgacttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-atcatca 28352561  T
Q  102 ttcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  28352560 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 28352501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31755692 - 31755551
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  |||    
T  31755692 atgccctggaatgctc-gtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatca 31755595  T
Q  102 ttcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 144  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31755594 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 31755551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Original strand, 23339482 - 23339595
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23339482 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaa 23339580  T
Q  131 tgcttagtcattcaa 145  Q
    ||| | |||||||||    
T  23339581 tgccttgtcattcaa 23339595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 160
Target Start/End: Original strand, 10040234 - 10040361
Alignment:
Q  34 tgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    |||||||| |||||||||||||  |  ||||||||| |||||||| | |||||| ||||||  || |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10040234 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaactgttgagggctcatgcccaggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 10040332  T
Q  132 gcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||    
T  10040333 gcttagtcattcatcacgttgaaaatggt 10040361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 21239569 - 21239677
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaat-gctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| |     
T  21239569 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctta 21239668  T
Q  98 gtcattcaa 106  Q
    |||||||||    
T  21239669 gtcattcaa 21239677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 21242119 - 21242227
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaat-gctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| |     
T  21242119 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctta 21242218  T
Q  98 gtcattcaa 106  Q
    |||||||||    
T  21242219 gtcattcaa 21242227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28348798 - 28348690
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||  | |    
T  28348798 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgattag 28348699  T
Q  99 tcattcaac 107  Q
    |||||||||    
T  28348698 tcattcaac 28348690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 24274250 - 24274392
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |  ||||||||   |||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  24274250 atgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccctcgaataccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtca 24274348  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  24274349 ttcaactattgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 24274392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 41685085 - 41685140
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41685085 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 41685140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22109517 - 22109437
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaac 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22109517 aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaac 22109437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Original strand, 23339478 - 23339557
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  23339478 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 23339557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28352623 - 28352515
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |    
T  28352623 cttatgtcctggaatgacttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 28352524  T
Q  99 tcattcaac 107  Q
    |||||||||    
T  28352523 tcattcaac 28352515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31503408 - 31503332
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  31503408 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 31503332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31505974 - 31505898
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  31505974 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 31505898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 21239534 - 21239677
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt--taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  ||    
T  21239534 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatc 21239631  T
Q  101 attcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239632 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 21239677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 21242084 - 21242227
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt--taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  ||    
T  21242084 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatc 21242181  T
Q  101 attcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21242182 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 21242227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 145
Target Start/End: Original strand, 21239444 - 21239519
Alignment:
Q  69 cgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  21239444 cgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 21239519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 145
Target Start/End: Original strand, 21241994 - 21242069
Alignment:
Q  69 cgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  21241994 cgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 21242069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Original strand, 24275744 - 24275784
Alignment:
Q  108 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacac 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275744 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacac 24275784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Original strand, 25035942 - 25036020
Alignment:
Q  68 ccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||  ||||| || |||||||||    
T  25035942 ccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgattcgtcattcaa 25036020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 21239456 - 21239583
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||| | |||||||||||||  |  |||    
T  21239456 atgccctggaatgctc-gtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatca 21239553  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  21239554 ttcaaccgttgagggcttatgccctggaat 21239583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 21242006 - 21242133
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||| | |||||||||||||  |  |||    
T  21242006 atgccctggaatgctc-gtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatca 21242103  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  21242104 ttcaaccgttgagggcttatgccctggaat 21242133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23085470 - 23085341
Alignment:
Q  1 cttatgccctg-gaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctg-gaat-gttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctg-gaatgca 95  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||     
T  23085470 cttatgccctgtgaatgctttttcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatacttaattattcaactgttgagggctcatgccctgtgaatgct 23085371  T
Q  96 ttgtcattcaactgttgggggcttatgccc 125  Q
       |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  23085370 agttcattcaattgttgagggctcatgccc 23085341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 28348882 - 28348770
Alignment:
Q  34 tgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  28348882 tgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaactgttgagggcttatgccctggaat 28348784  T
Q  132 gcttagtcattcaa 145  Q
    || | |||||||||    
T  28348783 gccttgtcattcaa 28348770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 55
Target Start/End: Original strand, 20591438 - 20591486
Alignment:
Q  7 ccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  20591438 ccctgaaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatg 20591486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 133
Target Start/End: Original strand, 20591420 - 20591487
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgc 133  Q
    |||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||| || | |||||||||||| |||||||    
T  20591420 aaccgttgagggctcataccctgaaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgc 20591487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 31518341 - 31518274
Alignment:
Q  4 atgccctg-gaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaa 67  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31518341 atgccctgtgaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaa 31518274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 31518385 - 31518334
Alignment:
Q  1 cttatgccctg-gaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctg 50  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31518385 cttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctg 31518334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22109517 - 22109476
Alignment:
Q  105 aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22109517 aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 22109476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 25651320 - 25651191
Alignment:
Q  1 cttatgccctg-gaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccct-ggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggtttatgccctg-gaatgc 94  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  25651320 cttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaacccgttgagggctcatgccctaggaatgcttaatcattccaactgttgagggctcatgccctgtgaatgc 25651221  T
Q  95 attgtcattcaactgttgggggcttatgcc 124  Q
    |   ||||||||  |||| |||||||||||    
T  25651220 aagttcattcaatcgttgagggcttatgcc 25651191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 21903221 - 21903153
Alignment:
Q  12 gaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctg-gaat-gttaatcattcaaccgttgaggg 77  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  21903221 gaatgcttagtcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatacttaattattcaactgttgaggg 21903153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Original strand, 25035944 - 25036059
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgccccgg 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||| |||||  | ||||||||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  25035944 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgattcgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgg 25036043  T
Q  129 aatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  25036044 aatg-ttaatcattcaa 25036059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 68)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 22759088 - 22759246
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  22759088 cttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgt 22759187  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaat 157  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22759188 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacatgttggaaat 22759246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 22759013 - 22759156
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22759013 atgccctagaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcat 22759112  T
Q  103 tcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  22759113 tcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 22759156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23671622 - 23671480
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  23671622 atgccctggaatgcttcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgcctcgtcattcaatcgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcat 23671523  T
Q  103 tcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  23671522 tcaactgttgagggctcatgccctggaatgcttagccattcaa 23671480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26495621 - 26495487
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaa-tgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  26495621 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttg 26495522  T
Q  99 tcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  26495521 tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 26495487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 29325606 - 29325740
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaa-tgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||    
T  29325606 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccttggaattgccttg 29325705  T
Q  99 tcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  29325706 tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 29325740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Original strand, 16256248 - 16256361
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||    
T  16256248 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaat 16256347  T
Q  132 gcttagtcattcaa 145  Q
    || | |||||||||    
T  16256348 gccttgtcattcaa 16256361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 22357922 - 22358051
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22357922 atgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgctttgtca 22358021  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  22358022 ttcaactgttgagggctcatgccctggaat 22358051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 16256336 - 16256483
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  |||    
T  16256336 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgt-tcatca 16256434  T
Q  102 ttcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 149  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16256435 ttcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcaacacg 16256483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 16259930 - 16260077
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  |||    
T  16259930 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg-ttcatca 16260028  T
Q  102 ttc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 149  Q
    ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16260029 ttcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcaacacg 16260077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Original strand, 16259881 - 16259996
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||    
T  16259881 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 16259980  T
Q  131 tgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||| ||||||||||    
T  16259981 tgctttgtcattcaac 16259996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22469920 - 22469774
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  || |||    
T  22469920 atgccctggaaagccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgaaatgt-ttatca 22469822  T
Q  102 ttcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacac 148  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22469821 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacac 22469774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Original strand, 22590045 - 22590160
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||    
T  22590045 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 22590144  T
Q  131 tgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||| ||||||||||    
T  22590145 tgctttgtcattcaac 22590160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Original strand, 22593600 - 22593715
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||    
T  22593600 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 22593699  T
Q  131 tgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||| ||||||||||    
T  22593700 tgctttgtcattcaac 22593715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Original strand, 22597155 - 22597270
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||    
T  22597155 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 22597254  T
Q  131 tgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||| ||||||||||    
T  22597255 tgctttgtcattcaac 22597270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23693250 - 23693108
Alignment:
Q  5 tgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcatt 103  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||    
T  23693250 tgccctggaatgcctcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgcttcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgcctcgtcatt 23693151  T
Q  104 caactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||| ||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  23693150 caattgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaac 23693108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 22593649 - 22593796
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |  |||    
T  22593649 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgtgggcttatgccctggaatg-ttcatca 22593747  T
Q  102 ttc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 149  Q
    ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22593748 ttcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcaacacg 22593796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 22597204 - 22597351
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |  |||    
T  22597204 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgtgggcttatgccctggaatg-ttcatca 22597302  T
Q  102 ttc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 149  Q
    ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22597303 ttcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcaacacg 22597351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 43120931 - 43120790
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  ||||    
T  43120931 atgccctggaatgctc-gtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttcatcat 43120834  T
Q  103 tc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43120833 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 43120790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 43124464 - 43124323
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  ||||    
T  43124464 atgccctggaatgctc-gtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttcatcat 43124367  T
Q  103 tc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43124366 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 43124323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 26361407 - 26361553
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaac-cgttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  26361407 atgccctggaatgctatgtcattcaaatcgttgagggctcatgccctgaaatgctatgtcattcaaatcgttgagggctcatgccctggaatgccttgtc 26361506  T
Q  101 attcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26361507 attgaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 26361553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 43120970 - 43120881
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatg 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43120970 atgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg 43120881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 43124503 - 43124414
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatg 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43124503 atgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg 43124414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 22590094 - 22590241
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  |  |||    
T  22590094 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgtgggcttatgccctagaatg-ttcatca 22590192  T
Q  102 ttc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 149  Q
    ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22590193 ttcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcaacacg 22590241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 16256259 - 16256402
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  16256259 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcat 16256357  T
Q  103 tc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    || || ||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16256358 tcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaac 16256402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 27869704 - 27869847
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||||||  || |    
T  27869704 cttatgccctggaatgctt-gtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctttatcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg--ttat 27869800  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| || ||||| | ||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  27869801 cattctaattgttgagagctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 27869847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 16256297 - 16256427
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||   |||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  16256297 atgccctggaatgccttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtca 16256396  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  16256397 ttcaaccgttgagggcttatgccctggaatg 16256427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 170
Target Start/End: Original strand, 27869784 - 27869950
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    |||||||||||||  || |||||| || ||||||| |||||||||||||||||  |  |||||||| | |||||||  | |||||||| ||||  || ||    
T  27869784 atgccctggaatg--ttatcattctaattgttgagagctcatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgaggactcatgccctgaaatg--ttatc 27869879  T
Q  101 attcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 170  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27869880 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtggtaccttga 27869950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Original strand, 8953034 - 8953148
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccgga 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||  || |||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  8953034 gttgagggctcatgcccttgaatgttaatcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttggggacttatgccccgga 8953132  T
Q  130 atgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||||||||||    
T  8953133 atgcttagtcattcaa 8953148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23671644 - 23671518
Alignment:
Q  21 gtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggctt 119  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||  |||| |||||     
T  23671644 gtcagtcaaccgttgagggctcatgccctggaatgcttcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgcctcgtcattcaatcgttgagggctc 23671545  T
Q  120 atgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  23671544 atgccctggaatgccttgtcattcaac 23671518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 43120985 - 43120869
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||     
T  43120985 aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaaccgttgagggcttatgccct 43120887  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  43120886 ggaatg-ttaatcattcaa 43120869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 43124518 - 43124402
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||     
T  43124518 aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaaccgttgagggcttatgccct 43124420  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  43124419 ggaatg-ttaatcattcaa 43124402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23693212 - 23693108
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  23693212 atgccctggaatgcttcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgcctcgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcat 23693113  T
Q  103 tcaac 107  Q
    |||||    
T  23693112 tcaac 23693108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Original strand, 27869692 - 27869796
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccg 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  27869692 aactgttgagggcttatgccctggaatgcttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctttatcattcaactgttgagggctcatgccctg 27869791  T
Q  128 gaatg 132  Q
    |||||    
T  27869792 gaatg 27869796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 26495667 - 26495553
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||    
T  26495667 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 26495568  T
Q  131 tgcttagtcattcaac 146  Q
    || ||| |||||||||    
T  26495567 tg-ttaatcattcaac 26495553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 22357998 - 22358051
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaat 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22357998 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaat 22358051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 146
Target Start/End: Original strand, 29325562 - 29325674
Alignment:
Q  34 tgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  29325562 tgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 29325661  T
Q  133 cttagtcattcaac 146  Q
     ||| |||||||||    
T  29325662 -ttaatcattcaac 29325674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 24277655 - 24277763
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| |      
T  24277655 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttat 24277754  T
Q  99 tcattcaac 107  Q
    |||||||||    
T  24277755 tcattcaac 24277763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 24384558 - 24384450
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| |      
T  24384558 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttat 24384459  T
Q  99 tcattcaac 107  Q
    |||||||||    
T  24384458 tcattcaac 24384450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22469947 - 22469836
Alignment:
Q  17 ctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22469947 ctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaaagccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttga 22469848  T
Q  114 gggcttatgccc 125  Q
    ||||||||||||    
T  22469847 gggcttatgccc 22469836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 16259892 - 16260021
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  16259892 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtca 16259990  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  16259991 ttcaaccgttgagggcttatgccctggaatg 16260021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 22593611 - 22593740
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  22593611 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtca 22593709  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  22593710 ttcaaccgttgtgggcttatgccctggaatg 22593740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 22597166 - 22597295
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  22597166 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtca 22597264  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  22597265 ttcaaccgttgtgggcttatgccctggaatg 22597295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23693262 - 23693148
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||    
T  23693262 gttgagggctcttgccctggaatgcctcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgcttcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaa 23693163  T
Q  131 tgcttagtcattcaa 145  Q
    ||| | |||||||||    
T  23693162 tgcctcgtcattcaa 23693148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 160
Target Start/End: Original strand, 24277646 - 24277777
Alignment:
Q  31 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccg 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24277646 tgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccg 24277744  T
Q  128 gaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  24277745 gaatgcttattcattcaacacgttgaaaatggt 24277777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24384567 - 24384436
Alignment:
Q  31 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccg 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24384567 tgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccg 24384469  T
Q  128 gaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  24384468 gaatgcttattcattcaacacgttgaaaatggt 24384436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 26495543 - 26495435
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaat-gctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| |     
T  26495543 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctta 26495444  T
Q  98 gtcattcaa 106  Q
    |||||||||    
T  26495443 gtcattcaa 26495435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Original strand, 22590056 - 22590178
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  22590056 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtca 22590154  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccc 125  Q
    |||||| |||| ||||||||||||    
T  22590155 ttcaaccgttgtgggcttatgccc 22590178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4397514 - 4397426
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactg-ttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaat 157  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4397514 gttgagggctcatgccctgaaatgccttgtcattcaaattattgggggcttatgccccagaatgcttagtcattcaacccgttggaaat 4397426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 27869696 - 27869771
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||  |||||||||    
T  27869696 gttgagggcttatgccctggaatgc-ttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctttatcattcaac 27869771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 29325684 - 29325792
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaat-gctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| |     
T  29325684 cttatgccttggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctta 29325783  T
Q  98 gtcattcaa 106  Q
    |||||||||    
T  29325784 gtcattcaa 29325792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 43120896 - 43120790
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |    
T  43120896 cttatgccctggaatg-ttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 43120798  T
Q  99 tcattcaa 106  Q
    ||||||||    
T  43120797 tcattcaa 43120790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 43124429 - 43124323
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |    
T  43124429 cttatgccctggaatg-ttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 43124331  T
Q  99 tcattcaa 106  Q
    ||||||||    
T  43124330 tcattcaa 43124323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26495578 - 26495435
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt--taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  ||    
T  26495578 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatc 26495481  T
Q  101 attcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26495480 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 26495435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23693266 - 23693186
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23693266 aaccgttgagggctcttgccctggaatgcctcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgcttcgtcattcaac 23693186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26495668 - 26495593
Alignment:
Q  69 cgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  26495668 cgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 26495593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Original strand, 29325556 - 29325634
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  29325556 aaccgctgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 29325634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 29325649 - 29325792
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt--taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  ||    
T  29325649 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccttggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatc 29325746  T
Q  101 attcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29325747 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 29325792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Original strand, 22357911 - 22358027
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccgg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||   |||||||| | |||||||||||||  || |||||||| | |||| |||||||||||| ||    
T  22357911 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgagggcttatgccctgg 22358009  T
Q  129 aatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  22358010 aatgctttgtcattcaac 22358027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22469931 - 22469854
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| | ||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22469931 gttgagggctcatgccctggaaagccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaac 22469854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 26495656 - 26495529
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||| | |||||||||||||  |  |||    
T  26495656 atgccctggaatgctc-gtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatca 26495559  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  26495558 ttcaaccgttgagggcttatgccctggaat 26495529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 67
Target Start/End: Original strand, 8953069 - 8953108
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8953069 aactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaa 8953108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Original strand, 29325571 - 29325621
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29325571 atgccctggaatgctc-gtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatg 29325621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Original strand, 22357907 - 22357986
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  22357907 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 22357986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 142
Target Start/End: Original strand, 26361399 - 26361509
Alignment:
Q  35 gagggctcatgccctggaatgtta-atcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||| || ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||| | |||| ||||| |||||| |||||    
T  26361399 gagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaaatcgttgagggctcatgccctgaaatgctatgtcattcaaatcgttgagggctcatgccctggaat 26361498  T
Q  132 gcttagtcatt 142  Q
    || | ||||||    
T  26361499 gccttgtcatt 26361509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 7785219 - 7785123
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccct-ggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggtttatgccctg-gaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccc 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  7785219 gttgagggctcatgccctgggaatgcttaatcattccaattgttgagggcttatgccctgtgaatgca-agtcattcaatcgttgagggcttatgccc 7785123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 88
Target Start/End: Original strand, 21559443 - 21559523
Alignment:
Q  12 gaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctg 88  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||    
T  21559443 gaatgccttgtcgttcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaactgttgagggctcatgccctg 21559523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 26706451 - 26706359
Alignment:
Q  1 cttatgccctg-gaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccct-ggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggtttatgccctg 88  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  26706451 cttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaaatcgttgagggctcatgccctgggaatgcttaatcattccaactgttgagggcttatgccctg 26706359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 26976185 - 26976093
Alignment:
Q  1 cttatgccctg-gaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccct-ggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggtttatgccctg 88  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  26976185 cttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaaatcgttgagggctcatgccctgggaatgcttaatcattccaactgttgagggcttatgccctg 26976093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 2288246 - 2288415
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |  |||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  2288246 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcaagccctggaatgccttgtcattcaactattgagggttcatgccctggaatgctttg 2288345  T
Q  99 tcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctacct 167  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2288346 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgttacct 2288415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 15686436 - 15686594
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  15686436 cttatgccctggaatgctatgtcattcaacagttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgt 15686535  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaat 157  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15686536 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacccgttggaaat 15686594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13764104 - 13763942
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  || |    
T  13764104 cttatgccctggtatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccgtggaatttttatcattcaattgttgagggcttatgccctggaatgt-ttat 13764006  T
Q  100 cattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 162  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13764005 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 13763942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16102140 - 16101992
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| |||    
T  16102140 cttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttg 16102041  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16102040 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 16101992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 23621251 - 23621394
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  23621251 atgccctggaatgctttgacattcaactgttgagggttcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgtaatgccttgtcat 23621350  T
Q  103 tcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23621351 tcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaa 23621394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 8522667 - 8522533
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaa-tgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  8522667 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttg 8522568  T
Q  99 tcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  8522567 tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 8522533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15538980 - 15538810
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||    
T  15538980 cttatgctccggaaagctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgggatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgcctt 15538881  T
Q  98 gtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctacct 167  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15538880 gtcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgttacct 15538810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 23621212 - 23621354
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23621212 atgccctggaatgctttttcattcaactattgagggctcatgccctggaatgctttgacattcaactgttgagggttcatgccctggaatgctttgtcat 23621311  T
Q  103 tcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| | |||||||||    
T  23621312 tcaactgttgagggcttatgccctgtaatgccttgtcattcaa 23621354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 12595754 - 12595607
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  12595754 cttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgctctagaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgt 12595655  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  12595654 cattcaaattgttggggacttatgccctagaatgcttagtcattcaac 12595607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13764416 - 13764270
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  13764416 cttatgccctagaatgatttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaattgttgatggcttatgccctggaatgctttgt 13764317  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  13764316 cattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaac 13764270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 13764338 - 13764244
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgc 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13764338 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgc 13764244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29492564 - 29492446
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  29492564 aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgcctcgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 29492465  T
Q  126 cggaatgcttagtcattca 144  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29492464 cggaatgcttagtcattca 29492446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16829607 - 16829487
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16829607 aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 16829508  T
Q  126 cggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  16829507 cggattgcttagtcattcaac 16829487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16812587 - 16812467
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccc 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16812587 aactattgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 16812488  T
Q  126 cggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  16812487 cggattgcttagtcattcaac 16812467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13764182 - 13764057
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||||||| |||| ||||    
T  13764182 cttatgccctggaatgatttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggattgtttatcattcaattgttgatggcttatgccctggtatgctttgt 13764083  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgcc 124  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  13764082 cattcaaactgttgagggctcatgcc 13764057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23352243 - 23352115
Alignment:
Q  35 gagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23352243 gagggctcatgccttggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 23352145  T
Q  133 cttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 162  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23352144 cttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 23352115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23352235 - 23352131
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |||||    
T  23352235 atgccttggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcat 23352136  T
Q  103 tcaac 107  Q
    |||||    
T  23352135 tcaac 23352131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16102152 - 16102033
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccc 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  16102152 aactgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccc 16102053  T
Q  126 cggaatgcttagtcattcaa 145  Q
     ||||||| | |||||||||    
T  16102052 tggaatgccttgtcattcaa 16102033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12595766 - 12595648
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  12595766 aactgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgctctagaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccct 12595667  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  12595666 ggaatgccttgtcattcaa 12595648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Original strand, 15686428 - 15686542
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  15686428 gttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaacagttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaa 15686527  T
Q  131 tgcttagtcattcaa 145  Q
    ||| | |||||||||    
T  15686528 tgccttgtcattcaa 15686542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Original strand, 23621200 - 23621316
Alignment:
Q  31 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccgga 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||| |||    
T  23621200 tgttgagggctcatgccctggaatgctttttcattcaactattgagggctcatgccctggaatgctttgacattcaactgttgagggttcatgccctgga 23621299  T
Q  130 atgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||| ||||||||||    
T  23621300 atgctttgtcattcaac 23621316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8522713 - 8522599
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||    
T  8522713 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 8522614  T
Q  131 tgcttagtcattcaac 146  Q
    || ||| |||||||||    
T  8522613 tg-ttaatcattcaac 8522599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13764260 - 13764134
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  13764260 cttatgccctggaatgcctggtcgttcaaactgccgagggctcatgctctggaatgtttatcattcaattgttgagggcttatgccctggaatgatttgt 13764161  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccc 125  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  13764160 cattcaaactgttgagggctcatgccc 13764134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 29848507 - 29848573
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  29848507 cttatgcccttgaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtttatcattcaa 29848573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16804752 - 16804648
Alignment:
Q  44 tgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcat 141  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16804752 tgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttggggtcttatgccccggattgcttagtcat 16804653  T
Q  142 tcaac 146  Q
    |||||    
T  16804652 tcaac 16804648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 16829592 - 16829541
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16829592 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 16829541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 221747 - 221618
Alignment:
Q  34 tgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||  ||||| || |||||||||||||||  || |||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  221747 tgagggatcatgccctggaatgcttcgtcactcaattgttgatggcttatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccagaat 221649  T
Q  132 gcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 162  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  221648 gcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 221618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13764494 - 13764349
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||||  ||||    
T  13764494 cttatgccctgtaatgcctggtcatttaaactgctgagggctcattctctggaatgtttatcattcaattgttgagggcttatgccctagaatgatttgt 13764395  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  13764394 cattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 13764349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24440978 - 24440865
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||| |||||||  || ||||| || |  | ||||||||||||||||||    
T  24440978 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaactgttgagggctcatgccttggaatg-tttatcattgaaattgttggggcttatgccccggaa 24440880  T
Q  131 tgcttagtcattcaa 145  Q
    ||| |||||||||||    
T  24440879 tgcgtagtcattcaa 24440865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 8522589 - 8522481
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaat-gctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| |     
T  8522589 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctta 8522490  T
Q  98 gtcattcaa 106  Q
    |||||||||    
T  8522489 gtcattcaa 8522481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Original strand, 15686424 - 15686504
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  15686424 aaccgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaacagttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaac 15686504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13764373 - 13764244
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  || |||    
T  13764373 atgccctggaatg-tttatcattcaattgttgatggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatca 13764276  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaatgc 133  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13764275 ttcaactgttgagggcttatgccctggaatgc 13764244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 15539060 - 15539005
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539060 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 15539005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 16812572 - 16812521
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16812572 atgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 16812521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 29492549 - 29492498
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29492549 atgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatg 29492498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Original strand, 29848495 - 29848573
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  29848495 aaccgttgagggcttatgcccttgaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgttta-tcattcaa 29848573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 16804752 - 16804702
Alignment:
Q  5 tgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16804752 tgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 16804702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 12595762 - 12595686
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  12595762 gttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgctctagaatgctttgtcattcaac 12595686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15539068 - 15538952
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccgg 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  15539068 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgccattcaaattgttgggggcttatgctccgg 15538969  T
Q  129 aatgcttagtcattcaa 145  Q
    || |||| |||||||||    
T  15538968 aaagctttgtcattcaa 15538952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8522717 - 8522639
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  8522717 aaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 8522639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8522624 - 8522481
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt--taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  ||    
T  8522624 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatc 8522527  T
Q  101 attcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522526 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 8522481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 147
Target Start/End: Original strand, 29848499 - 29848615
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccgga 129  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || |||||| || | ||| ||||||||||| || |    
T  29848499 gttgagggcttatgcccttgaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatg-tttatcattcaaatttttgagggcttatgcctcgaa 29848597  T
Q  130 atgcttagtcattcaaca 147  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29848598 atgcttagtcattcaaca 29848615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 221738 - 221634
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| ||||||||  |||||| | |||||    
T  221738 atgccctggaatgcttcgtcactcaattgttgatggcttatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccagaatgcttagtcat 221639  T
Q  103 tcaac 107  Q
    |||||    
T  221638 tcaac 221634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15539072 - 15539004
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  15539072 aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgc 15539004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Original strand, 2288238 - 2288353
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccgga 129  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||    
T  2288238 gttgaaggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcaagccctggaatgccttgtcattcaactattgagggttcatgccctgga 2288337  T
Q  130 atgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| |||||||||    
T  2288338 atgctttgtcattcaa 2288353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13764217 - 13764076
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||| ||  || |||    
T  13764217 atgctctggaatg-tttatcattcaattgttgagggcttatgccctggaatgatttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggattgt-ttatca 13764120  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  13764119 ttcaattgttgatggcttatgccctggtatgctttgtcattcaa 13764076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 24266776 - 24266717
Alignment:
Q  8 cctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24266776 cctggaatgttttgtcattcaaccgttaacggctcatgccctggaatgtttatcattcaa 24266717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29492560 - 29492485
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  29492560 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgcctcgtcattcaa 29492485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Original strand, 2288234 - 2288315
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||||||| | ||||||||||    
T  2288234 aaccgttgaaggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcaagccctggaatgccttgtcattcaac 2288315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 8522702 - 8522575
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||| | |||||||||||||  |  |||    
T  8522702 atgccctggaatgctc-gtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatca 8522605  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  8522604 ttcaaccgttgagggcttatgccctggaat 8522575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 21469870 - 21469786
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctg 88  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||| | ||||||||    
T  21469870 atgccctggaacgccttgtcgttcaattggtgagggctcatgccctggaatgctagtcattcaattggtgagggctcatgccctg 21469786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24266762 - 24266659
Alignment:
Q  60 tcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgctt-agtcattcaacacgatggaaat 157  Q
    ||||||||||||| | || | |||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  24266762 tcattcaaccgttaacggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccataatgcttaagtcattcaacacgttgaaaat 24266664  T
Q  158 ggtgc 162  Q
    |||||    
T  24266663 ggtgc 24266659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 23621326 - 23621394
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 67  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23621326 cttatgccctgtaatgccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaa 23621394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 1584361 - 1584298
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctg 88  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  1584361 aactgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaactgttgagggcttatgccctg 1584298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 12389594 - 12389543
Alignment:
Q  1 cttatgccctg-gaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctg 50  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12389594 cttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctg 12389543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 25772761 - 25772710
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  25772761 atgccctggaacgctttgtcgttcaattggtgagggctcattccctggaatg 25772710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 29265593 - 29265487
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac-cgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||  || |||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  29265593 atgccctggaacgccttgtcgttcaattggtgagggcttatgccctgtgaatgctttaaccattcaaatcggtgagggcttatgccttggaatgccttgt 29265494  T
Q  100 cattcaa 106  Q
    |||||||    
T  29265493 cattcaa 29265487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 1639198 - 1639120
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctg-gaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  1639198 gttgagggtttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaactattgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaa 1639120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 22346738 - 22346692
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctg 50  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22346738 atgccctggaacgccttgtcattcaattggtgagggctcatgccctg 22346692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 1639189 - 1639120
Alignment:
Q  2 ttatgccctg-gaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaa 67  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1639189 ttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaactattgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaa 1639120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 24440967 - 24440907
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcatt 64  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24440967 atgccctggaatg-ttaatcattcaaactgttgagggctcatgccttggaatgtttatcatt 24440907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Original strand, 13751328 - 13751411
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctg-gaatgcattgtcattc--aactgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||| | ||||||||| | ||||||    
T  13751328 aaccgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaaattgttgagggcttatgccctgtgaatgcttaattattcaa 13751411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 115)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16799516 - 16799347
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |||    
T  16799516 cttatgccccggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttg 16799417  T
Q  99 tcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctacct 167  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16799416 tcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgttacct 16799347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 2038852 - 2038998
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2038852 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 2038951  T
Q  100 cattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2038952 cattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2038998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 2038891 - 2039037
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2038891 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 2038990  T
Q  100 cattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2038991 cattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2039037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 2038930 - 2039076
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2038930 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 2039029  T
Q  100 cattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2039030 cattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2039076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 2038969 - 2039115
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2038969 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 2039068  T
Q  100 cattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2039069 cattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2039115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 2042593 - 2042739
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2042593 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 2042692  T
Q  100 cattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2042693 cattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2042739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 2042632 - 2042778
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2042632 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 2042731  T
Q  100 cattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2042732 cattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2042778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 2042671 - 2042817
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2042671 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 2042770  T
Q  100 cattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2042771 cattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2042817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 2042710 - 2042856
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2042710 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 2042809  T
Q  100 cattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2042810 cattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2042856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 2039008 - 2039153
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2039008 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 2039107  T
Q  100 cattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  2039108 cattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 2039153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 2042749 - 2042894
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2042749 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 2042848  T
Q  100 cattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  2042849 cattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 2042894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 179747 - 179909
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  179747 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgatttgtcattcaactgttgagggcttacgccctggaatgccttg 179846  T
Q  99 tcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  179847 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 179909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 2038813 - 2038959
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2038813 cttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 2038912  T
Q  100 cattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2038913 cattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2038959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 2042554 - 2042700
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2042554 cttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 2042653  T
Q  100 cattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2042654 cattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2042700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 15010461 - 15010605
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| |||||||    
T  15010461 atgccctggaatgctttgtcattcaactgctgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttcagggctcatgccctggaatgccttgtcat 15010560  T
Q  103 tc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15010561 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 15010605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10554215 - 10554073
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  10554215 atgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctagaatgctcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcatt 10554116  T
Q  104 c-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  10554115 caaattgttgggggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 10554073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 10989921 - 10990047
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10989921 cttatgccctgtaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 10990020  T
Q  100 cattcaa-ctgttgggggcttatgccc 125  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  10990021 cattcaatctgttgagggctcatgccc 10990047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 2035345 - 2035493
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||   |||||||| | |||||||||||||| |||    
T  2035345 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgccttg 2035444  T
Q  99 tcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2035445 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 2035493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 2039086 - 2039234
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||   |||||||| | |||||||||||||| |||    
T  2039086 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgccttg 2039185  T
Q  99 tcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2039186 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 2039234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 2042827 - 2042975
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||   |||||||| | |||||||||||||| |||    
T  2042827 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgccttg 2042926  T
Q  99 tcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042927 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 2042975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14037974 - 14037826
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| |||    
T  14037974 cttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttg 14037875  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14037874 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 14037826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14041442 - 14041294
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| |||    
T  14041442 cttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttg 14041343  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14041342 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 14041294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 39230547 - 39230430
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccgg 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39230547 ctgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaactgttgggggcttatgccccgg 39230448  T
Q  129 aatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||||||||||||    
T  39230447 aatgcttagtcattcaac 39230430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18958693 - 18958546
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctgg-aatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||    
T  18958693 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaaatgccttg 18958594  T
Q  99 tcatt--caactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 144  Q
    |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18958593 tcatttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 18958546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 54973066 - 54972935
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaa-tgcattgtca 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  54973066 atgctctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttgtca 54972967  T
Q  102 ttcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  54972966 ttcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 54972935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 54975676 - 54975545
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaa-tgcattgtca 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  54975676 atgctctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttgtca 54975577  T
Q  102 ttcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  54975576 ttcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 54975545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 54978286 - 54978155
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaa-tgcattgtca 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  54978286 atgctctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttgtca 54978187  T
Q  102 ttcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  54978186 ttcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 54978155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 2035306 - 2035452
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2035306 cttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 2035405  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  2035406 cattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 2035452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 10554101 - 10553995
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||    
T  10554101 cttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaacgccttgt 10554002  T
Q  100 cattcaa 106  Q
    | |||||    
T  10554001 cgttcaa 10553995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 23396066 - 23396214
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaac-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||| |||||| |||    
T  23396066 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaaatgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaattgttgggggcttatgccctagaatgccttg 23396165  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23396166 tcattcaaattgttgggggattatgccctggaatgctttgtcattcaac 23396214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 170
Target Start/End: Original strand, 55292743 - 55292843
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttg 169  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55292743 gttgagggcttatgccctgaaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttg 55292842  T
Q  170 a 170  Q
    |    
T  55292843 a 55292843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Original strand, 179701 - 179816
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  179701 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaa 179800  T
Q  131 tgcttagtcattcaac 146  Q
    || || ||||||||||    
T  179801 tgatttgtcattcaac 179816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Original strand, 2038803 - 2038920
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccgg 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  2038803 ctgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 2038902  T
Q  129 aatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  2038903 aatgctttgtcattcaac 2038920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Original strand, 2042544 - 2042661
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccgg 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  2042544 ctgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 2042643  T
Q  129 aatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  2042644 aatgctttgtcattcaac 2042661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Original strand, 14951841 - 14951958
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  14951841 ctgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccccg 14951940  T
Q  128 gaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14951941 gaatgcttagtcattcaa 14951958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 54973194 - 54973081
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  54973194 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaatgttgagggcttatgccctggaat 54973095  T
Q  132 gcttagtcattcaa 145  Q
    || | |||||||||    
T  54973094 gccttgtcattcaa 54973081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 54975804 - 54975691
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  54975804 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaatgttgagggcttatgccctggaat 54975705  T
Q  132 gcttagtcattcaa 145  Q
    || | |||||||||    
T  54975704 gccttgtcattcaa 54975691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 54978414 - 54978301
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  54978414 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaatgttgagggcttatgccctggaat 54978315  T
Q  132 gcttagtcattcaa 145  Q
    || | |||||||||    
T  54978314 gccttgtcattcaa 54978301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Original strand, 603936 - 604056
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  603936 aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 604035  T
Q  126 cggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  604036 cagaatgcttagtcattcaac 604056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Original strand, 2035296 - 2035412
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccgg 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  2035296 ctgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 2035395  T
Q  129 aatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||| |||||||||    
T  2035396 aatgctttgtcattcaa 2035412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Original strand, 52338963 - 52339078
Alignment:
Q  31 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccgga 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||    
T  52338963 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgga 52339062  T
Q  130 atgcttagtcattcaa 145  Q
    |||| | |||||||||    
T  52339063 atgccttgtcattcaa 52339078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16799593 - 16799449
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| |||||    
T  16799593 atgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctttgtc 16799494  T
Q  101 attcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  16799493 attcaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 16799449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Original strand, 6806015 - 6806132
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||     
T  6806015 aactgttgagggctcatgccctggaatgctaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccct 6806114  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  6806115 ggaatgttta-tcattcaa 6806132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 52339053 - 52339175
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  52339053 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagagctcatgccctgaaatgttaatcattcaactgttgatggcttatgccctggaatgccttgtcat 52339152  T
Q  103 tcaa-ctgttgggggcttatgcc 124  Q
    |||| |||||| ||||| |||||    
T  52339153 tcaatctgttgagggctcatgcc 52339175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 14951789 - 14951918
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcatt 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||            | |||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  14951789 atgcccttgaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatg------------ctgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcatt 14951876  T
Q  104 caactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14951877 caactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 14951918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 6806030 - 6806187
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||   |||||||| | |||||||||||||  || |||    
T  6806030 atgccctggaatgctaa-tcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatca 6806127  T
Q  102 ttcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6806128 ttcaaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 6806187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 54973183 - 54973041
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  54973183 atgccctggaatgctc-gtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaatgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 54973085  T
Q  103 tcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||| |||||| ||||| |||| | ||||||||| |||||||||    
T  54973084 tcaatctgttgagggctcatgctctggaatgctttgtcattcaa 54973041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 54975793 - 54975651
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  54975793 atgccctggaatgctc-gtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaatgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 54975695  T
Q  103 tcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||| |||||| ||||| |||| | ||||||||| |||||||||    
T  54975694 tcaatctgttgagggctcatgctctggaatgctttgtcattcaa 54975651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 54978403 - 54978261
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  54978403 atgccctggaatgctc-gtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaatgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 54978305  T
Q  103 tcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||| |||||| ||||| |||| | ||||||||| |||||||||    
T  54978304 tcaatctgttgagggctcatgctctggaatgctttgtcattcaa 54978261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16799604 - 16799487
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccgg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16799604 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 16799505  T
Q  129 aatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  16799504 aatgctttgtcattcaac 16799487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18958705 - 18958625
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18958705 aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 18958625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14041454 - 14041335
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccc 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  14041454 aactgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccc 14041355  T
Q  126 cggaatgcttagtcattcaa 145  Q
     ||||||| | |||||||||    
T  14041354 tggaatgccttgtcattcaa 14041335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10554230 - 10554113
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | |||||||||| |||| ||||| ||||||     
T  10554230 aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctagaatgc-tcgtcattcaaccgttgagggctcatgccct 10554132  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  10554131 ggaatgctttgtcattcaa 10554113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Original strand, 15010446 - 15010564
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||     
T  15010446 aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgctgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttcagggctcatgccct 15010545  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  15010546 ggaatgccttgtcattcaa 15010564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14037984 - 14037867
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccg 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |    
T  14037984 ctgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctg 14037885  T
Q  128 gaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| | |||||||||    
T  14037884 gaatgccttgtcattcaa 14037867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 6806065 - 6806173
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||| ||||||| | |    
T  6806065 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaactgttgggggcttatgccccggaatgcttag 6806164  T
Q  99 tcattcaac 107  Q
    |||||||||    
T  6806165 tcattcaac 6806173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16799553 - 16799409
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  16799553 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtca 16799454  T
Q  102 ttc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  16799453 ttcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 16799409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 54973148 - 54973001
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||| ||||||||| |||    
T  54973148 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaatgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatgctttg 54973049  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  54973048 tcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 54973001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 54975758 - 54975611
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||| ||||||||| |||    
T  54975758 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaatgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatgctttg 54975659  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  54975658 tcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 54975611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 54978368 - 54978221
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||| ||||||||| |||    
T  54978368 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaatgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatgctttg 54978269  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  54978268 tcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 54978221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 179712 - 179854
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||  ||||||    
T  179712 atgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgatttgtca 179810  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||||    
T  179811 ttcaactgttgagggcttacgccctggaatgccttgtcattcaa 179854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18958701 - 18958602
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  18958701 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaa 18958602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 39230537 - 39230430
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| | ||    
T  39230537 cttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagt 39230438  T
Q  100 cattcaac 107  Q
    ||||||||    
T  39230437 cattcaac 39230430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 7632010 - 7631933
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7632010 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 7631933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 2035298 - 2035374
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2035298 gttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2035374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Original strand, 14951854 - 14951958
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||  |||||||| |||||||| ||||||| | ||||    
T  14951854 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccccggaatgcttagtca 14951953  T
Q  102 ttcaa 106  Q
    |||||    
T  14951954 ttcaa 14951958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 149
Target Start/End: Original strand, 30206558 - 30206638
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 149  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30206558 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacg 30206638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Original strand, 603951 - 604002
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  603951 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 604002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 10989964 - 10990121
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | ||||||| ||||| ||  |||    
T  10989964 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatg-atcatca 10990061  T
Q  102 ttcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  10990062 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 10990121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 160
Target Start/End: Original strand, 52339110 - 52339250
Alignment:
Q  22 tcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggct 118  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | ||||| ||||||| ||  |||||||| | ||||||||||    
T  52339110 tcattcaactgttgatggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccatggaatg-atcatcattcaaattgttgggggct 52339208  T
Q  119 tatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  52339209 tatgccccggaatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 52339250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 54046540 - 54046463
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54046540 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcgaattgttgggggctcatgccccggaatgcttagtcattcaac 54046463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 10989999 - 10990107
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |    
T  10989999 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 10990098  T
Q  99 tcattcaac 107  Q
    |||||||||    
T  10990099 tcattcaac 10990107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 52339128 - 52339236
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |    
T  52339128 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccatggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 52339227  T
Q  99 tcattcaac 107  Q
    |||||||||    
T  52339228 tcattcaac 52339236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 161
Target Start/End: Original strand, 1989365 - 1989491
Alignment:
Q  37 gggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattca-actgttgggggcttatgccccggaatgc 133  Q
    |||| ||||||||||||||| |  |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||  || ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  1989365 gggcgcatgccctggaatgtcttgtcattcaaactgttgagggttcatgccctagaatgt-ttatcattcacattgttgggggcttatgccctggaatgc 1989463  T
Q  134 ttagtcattcaacacgatggaaatggtg 161  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||    
T  1989464 ttagtcattcaacacgttgaaaatggtg 1989491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 6819078 - 6818963
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || ||||      ||||| |||||||||||||    
T  6819078 atgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgtttatcattcaaactgtagagg------gccctagaatgcattgtca 6818985  T
Q  102 ttc-aactgttgggggcttatg 122  Q
    ||| |||||||| |||||||||    
T  6818984 ttcaaactgttgagggcttatg 6818963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Original strand, 1989371 - 1989476
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattca-accgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |  |||| ||| |||||||||||||||| | ||||    
T  1989371 atgccctggaatgtcttgtcattcaaactgttgagggttcatgccctagaatgtttatcattcacattgttgggggcttatgccctggaatgcttagtca 1989470  T
Q  102 ttcaac 107  Q
    ||||||    
T  1989471 ttcaac 1989476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 23396186 - 23396251
Alignment:
Q  2 ttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||| |||||||||    
T  23396186 ttatgccctggaatgctttgtcattcaactattgatgacttatgccctggaatgtttatcattcaa 23396251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 162
Target Start/End: Original strand, 10834465 - 10834592
Alignment:
Q  36 agggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgc 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||  || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||    
T  10834465 agggctcatgccctggagtgttttgtcattcaattgttgagggcttatgccctagaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccataatgc 10834563  T
Q  134 ttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 162  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||    
T  10834564 ttagtcattcaacatgttgaaaatggtgc 10834592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 134
Target Start/End: Original strand, 14951774 - 14951842
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgct 134  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14951774 aaccgttgagggctcatgcccttgaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgct 14951842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 15010450 - 15010526
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15010450 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgctgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaac 15010526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 23396145 - 23396308
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| | |||| ||| | ||||||||||||| ||  |||||||||  |||| |  |||||||||||||||  ||     
T  23396145 cttatgccctagaatgccttgtcattcaaattgttgggggattatgccctggaatgctttgtcattcaactattgatgacttatgccctggaatgt-tta 23396243  T
Q  99 tcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 162  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  23396244 tcattcaaattgttgggggcttatgccccgatatacttagtcattcaacacgttgaaaatagtgc 23396308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 54972991 - 54972923
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaat-gctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54972991 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 54972923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 54975601 - 54975533
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaat-gctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54975601 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 54975533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 54978211 - 54978143
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaat-gctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54978211 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 54978143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 6819160 - 6819033
Alignment:
Q  2 ttatgccctg-gaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||  || |||| | |||||||||||||| |||    
T  6819160 ttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaactgttgagggcttatgccatgaaatgtttatcattcaaactatttagggctcatgccctggaatgccttg 6819061  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccc 125  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  6819060 tcattcaaactgttgagggctcatgccc 6819033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17211213 - 17211123
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  17211213 gttgagggctcatgccctggaatg-atcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 17211123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 54973198 - 54973120
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  54973198 aaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 54973120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 54975808 - 54975730
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  54975808 aaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 54975730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 54978418 - 54978340
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  54978418 aaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 54978340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 30206566 - 30206635
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30206566 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaac 30206635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16799608 - 16799528
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  16799608 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 16799528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 10834472 - 10834535
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  10834472 atgccctggagtgttttgtcattcaattgttgagggcttatgccctagaatgtttatcattcaa 10834535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 52339010 - 52339065
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  52339010 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 52339065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 54973026 - 54972884
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt--taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  ||    
T  54973026 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatc 54972929  T
Q  101 attcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 144  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54972928 attcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattca 54972884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 54975636 - 54975494
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt--taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  ||    
T  54975636 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatc 54975539  T
Q  101 attcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 144  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54975538 attcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattca 54975494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 54978246 - 54978104
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt--taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  ||    
T  54978246 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatc 54978149  T
Q  101 attcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 144  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54978148 attcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattca 54978104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 14951890 - 14951958
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  14951890 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 14951958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Original strand, 52338975 - 52339078
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  52338975 atgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgccttgtca 52339073  T
Q  102 ttcaa 106  Q
    |||||    
T  52339074 ttcaa 52339078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 107
Target Start/End: Original strand, 55292739 - 55292819
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaac 107  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  55292739 aactgttgagggcttatgccctgaaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 55292819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 55292751 - 55292819
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 68  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  55292751 cttatgccctgaaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 55292819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Original strand, 179697 - 179775
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  179697 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 179775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 94
Target Start/End: Original strand, 14951778 - 14951841
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgc 94  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14951778 gttgagggctcatgcccttgaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgc 14951841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17211215 - 17211137
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaac 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  17211215 ctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 17211137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 10989884 - 10990027
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| | | |||||||| |||||||| |||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  ||    
T  10989884 atgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctgtaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-taatc 10989982  T
Q  101 attcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  10989983 attcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 10990027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Original strand, 23396054 - 23396133
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  23396054 aaccgttgagcgcttatgccctggaatgccttgtcattcaaaatgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 23396133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 3395009 - 3395120
Alignment:
Q  1 cttatgccctg-gaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctg-gaatgc 94  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||| | |||||||| |||||     
T  3395009 cttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatga 3395108  T
Q  95 attgtcattcaa 106  Q
     |||||||||||    
T  3395109 cttgtcattcaa 3395120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15232271 - 15232180
Alignment:
Q  1 cttatgccctg-gaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccct-ggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggtttatgccctg 88  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  15232271 cttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaaccgttgagggctcatgacctaggaatgcttaatcattccaactgttgagggcttatgccctg 15232180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15238139 - 15238048
Alignment:
Q  1 cttatgccctg-gaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccct-ggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggtttatgccctg 88  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  15238139 cttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaaccgttgagggctcatgacctaggaatgcttaatcattccaactgttgagggcttatgccctg 15238048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 1989290 - 1989336
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctg 50  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  1989290 atgccctggaacgctttgtcgttcaattggtgagggctcatgccctg 1989336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Original strand, 3394997 - 3395079
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctg-gaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  3394997 aaccgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaa 3395079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 6819003 - 6818941
Alignment:
Q  6 gccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  6819003 gccctagaatgcattgtcattcaaactgttgagggcttatgtcctgtaatgtttatcattcaa 6818941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 54046529 - 54046463
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 68  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  54046529 atgccctggaatgccttgtcattcgaattgttgggggctcatgccccggaatgcttagtcattcaac 54046463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 15446461 - 15446424
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15446461 ctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaa 15446424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 6818938 - 6818887
Alignment:
Q  108 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  6818938 tgttgggggcttataccc-ggaattcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 6818887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 145
Target Start/End: Original strand, 30206554 - 30206594
Alignment:
Q  105 aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  30206554 aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 30206594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 104)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 35366056 - 35365924
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |    
T  35366056 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgaggggttatgccctggaatgccttgtcattcaactggtgagggcttatgctctg 35365957  T
Q  128 gaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35365956 caatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 35365924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 13395865 - 13396035
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||    
T  13395865 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgcctt 13395964  T
Q  98 gtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctacct 167  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13395965 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgttacct 13396035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 48785071 - 48784925
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  48785071 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 48784972  T
Q  100 cattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  48784971 cattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 48784925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 48784993 - 48784846
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  48784993 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgt 48784894  T
Q  100 cattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48784893 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 48784846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 48785110 - 48784964
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  48785110 cttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 48785011  T
Q  100 cattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  48785010 cattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 48784964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13255811 - 13255668
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  13255811 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtttatcattcaattgttgagggcttatgccctggaatgctttggc 13255712  T
Q  101 attcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  13255711 attcaactgttgagggcttatgccctggaatgttta-tcattcaa 13255668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 38827941 - 38827797
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  38827941 atgccctagaatgattcgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatcgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcat 38827842  T
Q  103 tc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38827841 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 38827797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 48785032 - 48784887
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  48785032 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 48784933  T
Q  100 cattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  48784932 cattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 48784887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 17506158 - 17506316
Alignment:
Q  11 ggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact- 108  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  17506158 ggaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaatt 17506257  T
Q  109 gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctacct 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17506258 gttgggggcttatgtcccggaatgcttagtcattcaacaggatggaaatggtgttacct 17506316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17547056 - 17546898
Alignment:
Q  11 ggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact- 108  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  17547056 ggaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaatt 17546957  T
Q  109 gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctacct 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17546956 gttgggggcttatgtcccggaatgcttagtcattcaacaggatggaaatggtgttacct 17546898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 124498 - 124627
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  124498 atgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcatt 124597  T
Q  104 caa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    ||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  124598 caatctgttgagggctcatgccctggaatg 124627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 13733852 - 13733996
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  13733852 atgccctggaatgctatgtcattcaatcgttgagggctcatgccctggaatactatgtcattcaatcgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcat 13733951  T
Q  103 tc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13733952 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 13733996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16006153 - 16006007
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  16006153 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttataccctggaatgccttgt 16006054  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  16006053 cattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 16006007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 13395787 - 13395933
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13395787 cttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 13395886  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  13395887 cattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 13395933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 13849928 - 13850074
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||| ||||    
T  13849928 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactattgagggcttatgccctagattgccttgt 13850027  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  13850028 cattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 13850074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16006075 - 16005941
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaa-tgcattg 98  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  16006075 cttataccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttg 16005976  T
Q  99 tcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  16005975 tcattcaatctgttgggggctcatgccctggaatg 16005941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16573310 - 16573169
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcatt 103  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  16573310 atgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttataccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtcttgtcatt 16573212  T
Q  104 caa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  16573211 caacctgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 16573169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 16592352 - 16592493
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcatt 103  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  16592352 atgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttataccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtcttgtcatt 16592450  T
Q  104 caa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  16592451 caacctgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 16592493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Original strand, 14189366 - 14189525
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||  || ||||    
T  14189366 atgccctagaatgccttgtcattcaacttttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgaaggcttatgccctggaatgt-ttatcat 14189464  T
Q  103 tcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 162  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14189465 tcaaattgttgggggcttatgccccggaacgcctagtcattcaacacgttggaaatggtgc 14189525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 21743634 - 21743776
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21743634 atgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 21743733  T
Q  103 tcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  21743734 tcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 21743776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 8776059 - 8775925
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaa-tgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  8776059 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaactgccttg 8775960  T
Q  99 tcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||||| || ||| ||||| |||||| ||||||    
T  8775959 tcattcaatctattgagggctcatgccctggaatg 8775925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 21743709 - 21743854
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |      
T  21743709 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttca 21743807  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 144  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21743808 tcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattca 21743854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 38828034 - 38827916
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  38828034 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccct 38827935  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaa 145  Q
     ||||| || |||||||||    
T  38827934 agaatgattcgtcattcaa 38827916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Original strand, 13849878 - 13849996
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||     
T  13849878 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccct 13849977  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  13849978 ggaatg-ttaatcattcaac 13849996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 14192118 - 14192276
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||  || |    
T  14192118 cttatgccctagaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaactggtgagggcttatgccccggaatg-tttat 14192216  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatg 158  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14192217 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcctagtcattcaacacgttggaaatg 14192276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 14192083 - 14192223
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14192083 atgccctggaatg-tttatcattcaattgttgagggcttatgccctagaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 14192181  T
Q  103 tcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14192182 tcaactggtgagggcttatgccccggaatgttta-tcattcaa 14192223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 48785120 - 48785003
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccgg 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  48785120 ctgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 48785021  T
Q  129 aatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  48785020 aatgctttgtcattcaac 48785003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Original strand, 13395777 - 13395893
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccgg 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  13395777 ctgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 13395876  T
Q  129 aatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||| |||||||||    
T  13395877 aatgctttgtcattcaa 13395893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 21065508 - 21065600
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaat 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21065508 cttatgccctggaatgctctgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccatggaat 21065600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 4993245 - 4993111
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaa-tgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||    
T  4993245 cttatgccctggaatgccttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattgaaccgttgagggctcatgccctggaattgccttg 4993146  T
Q  99 tcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  4993145 tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 4993111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Original strand, 14192072 - 14192186
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  14192072 gttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaattgttgagggcttatgccctagaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaat 14192171  T
Q  132 gcttagtcattcaac 146  Q
    || | ||||||||||    
T  14192172 gccttgtcattcaac 14192186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Original strand, 14189324 - 14189468
Alignment:
Q  2 ttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14189324 ttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgccttgtcattcaacttttgagggcttatgccctggaatgctttgt 14189423  T
Q  100 cattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  14189424 cattcaaccgttgaaggcttatgccctggaatgttta-tcattcaa 14189468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 48743401 - 48743284
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||| ||||||     
T  48743401 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaattgttgagggcttatgccctggaatcccttgtcattcaaactgtggagggctcatgccct 48743302  T
Q  127 ggaatgcttagtcattca 144  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  48743301 ggaatgctttgtcattca 48743284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 13850006 - 13850168
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  ||    
T  13850006 cttatgccctagattgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-tt 13850104  T
Q  98 gtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
     |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13850105 atcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 13850168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Original strand, 124483 - 124600
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||     
T  124483 aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaaccgttgagggcttatgccct 124581  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  124582 ggaatgccttgtcattcaa 124600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8776133 - 8775991
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  8776133 atgccctggaatgctc-gccattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 8776035  T
Q  103 tc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    || || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  8776034 tcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 8775991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 11660866 - 11660763
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||||||||||  | ||||||    
T  11660866 atgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagagcttatgccctggaatgtttatcattcaattgtttagggcttatgccctggaatgtttagtcatt 11660767  T
Q  104 caac 107  Q
    ||||    
T  11660766 caac 11660763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16573237 - 16573075
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaac-tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| || | ||| |||||||||  ||    
T  16573237 cttatgccctggaatgtcttgtcattcaacctgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaaccgttgatggctcatgtcctggaatgt-tt 16573139  T
Q  98 gtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
     |||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16573138 atcattcaaattgttgggggctcatgcccaggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 16573075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16573322 - 16573208
Alignment:
Q  31 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16573322 tgttgatggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttataccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaa 16573224  T
Q  131 tgcttagtcattcaac 146  Q
    ||  | ||||||||||    
T  16573223 tgtcttgtcattcaac 16573208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Original strand, 16592340 - 16592454
Alignment:
Q  31 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16592340 tgttgatggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttataccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaa 16592438  T
Q  131 tgcttagtcattcaac 146  Q
    ||  | ||||||||||    
T  16592439 tgtcttgtcattcaac 16592454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 16592425 - 16592587
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaac-tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| || | ||| |||||||||  ||    
T  16592425 cttatgccctggaatgtcttgtcattcaacctgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaaccgttgatggctcatgtcctggaatgt-tt 16592523  T
Q  98 gtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
     |||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16592524 atcattcaaattgttgggggctcatgcccaggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 16592587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 17506111 - 17506254
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaac-tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| | | || |||||| ||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17506111 atgccctggaatgccttgtcattcaaaatgttgggggcttacgtcccggaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgctttgtca 17506210  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  17506211 ttcaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 17506254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17547103 - 17546960
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaac-tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| | | || |||||| ||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17547103 atgccctggaatgccttgtcattcaaaatgttgggggcttacgtcccggaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgctttgtca 17547004  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  17547003 ttcaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 17546960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 106
Target Start/End: Original strand, 709606 - 709684
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  709606 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaattgttgagggcttatgccctggaattccttgtcattcaa 709684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 4993291 - 4993190
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||    
T  4993291 gttgagggctcatgccctggaatattaatcattcaaccattgagggcttatgccctggaatgccttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 4993192  T
Q  131 tg 132  Q
    ||    
T  4993191 tg 4993190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 13255734 - 13255629
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  | |||||| | |||||| |||| || |||||    
T  13255734 cttatgccctggaatgctttggcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtttatcattcaattggtgagggctcatgcccgggaacgccttgtc 13255635  T
Q  101 attcaa 106  Q
     |||||    
T  13255634 gttcaa 13255629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13255541 - 13255414
Alignment:
Q  35 gagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||  || || ||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  13255541 gagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgaaggcttatgccctggaatgt-ttatctttcaaattgttgagggcttatgccccggaatg 13255443  T
Q  133 cttagtcattcaacacgatggaaatggtg 161  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13255442 cttagtcattcaacacgttgaaaatggtg 13255414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 13255533 - 13255429
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| ||  |||||||| |||||||| ||||||| | |||||    
T  13255533 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgaaggcttatgccctggaatgtttatctttcaaattgttgagggcttatgccccggaatgcttagtcat 13255434  T
Q  103 tcaac 107  Q
    |||||    
T  13255433 tcaac 13255429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 14189288 - 14189431
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||| |||||| ||||||    
T  14189288 atgccctagaatg-tttatcattcaattgttgagggattatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgccttgtca 14189386  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14189387 ttcaacttttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 14189431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16006199 - 16006085
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||    
T  16006199 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 16006100  T
Q  131 tgcttagtcattcaac 146  Q
    || ||| |||||||||    
T  16006099 tg-ttaatcattcaac 16006085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 124572 - 124678
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |    
T  124572 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 124671  T
Q  99 tcattca 105  Q
    |||||||    
T  124672 tcattca 124678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11660874 - 11660747
Alignment:
Q  35 gagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgc 133  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| | |||||||||||||||  || |||||||| ||||  |||||||||||| ||||||     
T  11660874 gagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagagcttatgccctggaatgt-ttatcattcaattgtttagggcttatgccctggaatgt 11660776  T
Q  134 ttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 162  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||    
T  11660775 ttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 11660747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 13395779 - 13395855
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13395779 gttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 13395855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Original strand, 124537 - 124678
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  |||    
T  124537 atgccctggaatgctc-gtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatca 124634  T
Q  102 ttcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 144  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124635 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 124678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Original strand, 14189278 - 14189392
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||    
T  14189278 gttgagggc-catgccctagaatgtttatcattcaattgttgagggattatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaa 14189376  T
Q  131 tgcttagtcattcaac 146  Q
    ||| | ||||||||||    
T  14189377 tgccttgtcattcaac 14189392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 14189402 - 14189509
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| |||| || | ||    
T  14189402 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgaaggcttatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaacgcctagt 14189501  T
Q  100 cattcaac 107  Q
    ||||||||    
T  14189502 cattcaac 14189509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16459056 - 16458947
Alignment:
Q  35 gagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgc 133  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||| |||||||| || || |||||| ||||||     
T  16459056 gagggctcatgccctagaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg-gttatcattcaaactgttgaggtctcatgccctggaatg- 16458959  T
Q  134 ttagtcattcaa 145  Q
    ||| ||||||||    
T  16458958 ttaatcattcaa 16458947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 38827984 - 38827838
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |     
T  38827984 cttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgattcgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-tta 38827886  T
Q  98 gtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
     ||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  38827885 atcattcaatcgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 38827838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8776144 - 8776031
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||||||| | |||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  8776144 gttgagggctcatgccctggaatgctcgccattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaa 8776046  T
Q  131 tgcttagtcattcaa 145  Q
    ||| | |||||||||    
T  8776045 tgccttgtcattcaa 8776031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13255825 - 13255705
Alignment:
Q  26 tcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcc 124  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  13255825 tcaattgttgagtgcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgt-ttatcattcaattgttgagggcttatgcc 13255727  T
Q  125 ccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    | ||||||||| | ||||||||    
T  13255726 ctggaatgctttggcattcaac 13255705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 145
Target Start/End: Original strand, 13733838 - 13733955
Alignment:
Q  29 actgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||| |||||| |    
T  13733838 actgttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaatcgttgagggctcatgccctggaatactatgtcattcaatcgttgagggctcatgccctg 13733937  T
Q  128 gaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| | |||||||||    
T  13733938 gaatgccttgtcattcaa 13733955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 48743386 - 48743227
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |  |||||||| | || ||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  48743386 atgccctggaatg-ttaatcattcaattgttgagggcttatgccctggaatcccttgtcattcaaactgtggagggctcatgccctggaatgctttgtca 48743288  T
Q  102 ttca-actgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 162  Q
    |||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  48743287 ttcagattgttgggg-cttatgccccagaatgcttagtcattcaacatgttgaaaatggtgc 48743227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 17506187 - 17506241
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17506187 cttatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggcttatgccctggaatg 17506241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 17547027 - 17546973
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17547027 cttatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggcttatgccctggaatg 17546973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Original strand, 17506096 - 17506177
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  17506096 aaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaaatgttgggggcttacgtcccggaatgctttgtcattcaac 17506177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17547118 - 17547037
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  17547118 aaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaaatgttgggggcttacgtcccggaatgctttgtcattcaac 17547037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16459013 - 16458906
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||| | |    
T  16459013 cttatgccctggaatggtta-tcattcaaactgttgaggtctcatgccctggaatgttaatcattcaaactgttgagggcgtatgctctggaatgcttag 16458915  T
Q  99 tcattcaac 107  Q
    | |||||||    
T  16458914 ttattcaac 16458906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 158
Target Start/End: Original strand, 47976002 - 47976121
Alignment:
Q  39 gctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttag 137  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||||| |||||||  || |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47976002 gctcatgtcctgaaatgttaatcgttcaactgttgaggactcatgccttggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgattag 47976100  T
Q  138 tcattcaacacgatggaaatg 158  Q
    | |||||||||| || |||||    
T  47976101 taattcaacacgttgaaaatg 47976121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16006203 - 16006125
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  16006203 aaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 16006125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 15725542 - 15725496
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctg 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15725542 atgccctggaatgctttgtcattcaacttttgagggctcatgccctg 15725496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 709722 - 709779
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgtt 57  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  709722 cttatgccctggaatgccttgtcatttaaactgttgagggctcatgccctggaatgtt 709779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 4993164 - 4993099
Alignment:
Q  4 atgccctggaat-gctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4993164 atgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 4993099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 8775981 - 8775873
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaa-tgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| |     
T  8775981 cttatgccctggaactgccttgtcattcaatctattgagggctcatgccctggaatgtccatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctta 8775882  T
Q  98 gtcattcaa 106  Q
    |||||||||    
T  8775881 gtcattcaa 8775873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 16005997 - 16005929
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaat-gctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16005997 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgggggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 16005929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16459031 - 16458904
Alignment:
Q  22 tcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggctt 119  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  |  |||||| |||||||| |||| |    
T  16459031 tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatggttatcattcaaactgttgaggtctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaactgttgagggcgt 16458933  T
Q  120 atgccccggaatgcttagtcattcaacac 148  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||||    
T  16458932 atgctctggaatgcttagttattcaacac 16458904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 711059 - 711110
Alignment:
Q  108 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatgg 159  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  711059 tgttgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatgg 711110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16006188 - 16006047
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||| | |||||||||||||  |  |||    
T  16006188 atgccctggaatgctc-gtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatca 16006091  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| ||||||| | |||||||||    
T  16006090 ttcaaccgttgagggcttataccctggaatgccttgtcattcaa 16006047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 711020 - 711097
Alignment:
Q  31 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaac 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  711020 tgttgagggctcatgcactggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaac 711097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8775910 - 8775873
Alignment:
Q  108 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8775910 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 8775873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 65
Target Start/End: Original strand, 47975964 - 47976001
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47975964 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc 47976001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Original strand, 14192068 - 14192147
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  14192068 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-tttatcattcaattgttgagggcttatgccctagaatgctttgtcattcaac 14192147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 38828019 - 38827877
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||| |||||  | ||||    
T  38828019 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgattcgtca 38827921  T
Q  102 ttcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  38827920 ttcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 38827877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Original strand, 13849893 - 13850014
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||  |  |||    
T  13849893 atgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatca 13849990  T
Q  102 ttcaactgttgggggcttatgccc 125  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||    
T  13849991 ttcaactattgagggcttatgccc 13850014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 35366005 - 35365938
Alignment:
Q  2 ttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 68  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||    
T  35366005 ttatgccctggaatgccttgtcattcaactggtgagggcttatgctctgcaatgcttagtcattcaac 35365938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 48743351 - 48743296
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  48743351 cttatgccctggaatcccttgtcattcaaactgtggagggctcatgccctggaatg 48743296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 56
Target Start/End: Original strand, 21519357 - 21519411
Alignment:
Q  4 atgccctg-gaatgctttgtc-attcaactgttgagggctcatgccctggaatgt 56  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21519357 atgccctgtgaatgctttgactattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt 21519411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 13407777 - 13407736
Alignment:
Q  108 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13407777 tgttgggggctcatgccccggaatgctcagtcattcaacacg 13407736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 134
Target Start/End: Original strand, 21743623 - 21743688
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgct 134  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  21743623 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgct 21743688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 11660830 - 11660775
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgtt 57  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  11660830 cttatgccctggaatg-tttatcattcaattgtttagggcttatgccctggaatgtt 11660775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 15689976 - 15689866
Alignment:
Q  1 cttatgccctg-gaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgca 95  Q
    ||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||| |||||||| | ||||||| |||||      
T  15689976 cttatgccctgtgaatgctagttcattcaaccgttgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgcccttgaatgtc 15689877  T
Q  96 ttgtcattcaa 106  Q
    |||||||||||    
T  15689876 ttgtcattcaa 15689866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 15697569 - 15697459
Alignment:
Q  1 cttatgccctg-gaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgca 95  Q
    ||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||| |||||||| | ||||||| |||||      
T  15697569 cttatgccctgtgaatgctagttcattcaaccgttgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgcccttgaatgtc 15697470  T
Q  96 ttgtcattcaa 106  Q
    |||||||||||    
T  15697469 ttgtcattcaa 15697459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15725553 - 15725498
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccc 125  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  15725553 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaacttttgagggctcatgccc 15725498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 88
Target Start/End: Original strand, 15731800 - 15731863
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctg 88  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  15731800 aactgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaactgttgagggcttatgccctg 15731863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 21065502 - 21065576
Alignment:
Q  72 tgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  21065502 tgagggcttatgccctggaatgctctgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 21065576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 40555764 - 40555875
Alignment:
Q  1 cttatgccctg-gaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctg-gaatgc 94  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||     
T  40555764 cttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccttgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggttcatgccctgtgaatgt 40555863  T
Q  95 attgtcattcaa 106  Q
     |||||||||||    
T  40555864 cttgtcattcaa 40555875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 12202057 - 12202187
Alignment:
Q  1 cttatgccctg-gaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccct-ggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggtttatgccctg-gaatgc 94  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  12202057 cttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaaaccgttgagggctcatgccctgggaatgcttaatcattccaactgttgagggcttatgccctgtgaatgc 12202156  T
Q  95 attgtcattcaactgttgggggcttatgccc 125  Q
        ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  12202157 tagttcattcaatcgttgagggcttatgccc 12202187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16006032 - 16005889
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt--taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    |  |||||||| | |||| ||| | |||||||||||||  |  ||    
T  16006032 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgggggctcatgccctggaatgt-tcatc 16005935  T
Q  101 attcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16005934 attcaaattgttgggagcttatgccccggaatgtttagtcattcaa 16005889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 159
Target Start/End: Original strand, 21735551 - 21735601
Alignment:
Q  109 gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatgg 159  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  21735551 gttgggggctcatgccctggaatgctcagtcattcaacacgttgaaaatgg 21735601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 67
Target Start/End: Original strand, 47976026 - 47976068
Alignment:
Q  25 ttcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  47976026 ttcaactgttgaggactcatgccttggaatgtttatcattcaa 47976068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15725557 - 15725496
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctg 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  15725557 aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaacttttgagggctcatgccctg 15725496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Original strand, 16668610 - 16668698
Alignment:
Q  22 tcattcaactgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac-cgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||  || |||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  16668610 tcattcaattggtgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaatcggtgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 16668698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Original strand, 17642980 - 17643068
Alignment:
Q  22 tcattcaactgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac-cgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||  || |||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  17642980 tcattcaattggtgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaatcggtgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 17643068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 145
Target Start/End: Original strand, 12757143 - 12757175
Alignment:
Q  113 ggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12757143 ggggcttatgccccgaaatgcttagtcattcaa 12757175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 35366041 - 35365938
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||| | |||||    
T  35366041 atgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgaggggttatgccctggaatgccttgtcattcaactggtgagggcttatgctctgcaatgcttagtcat 35365943  T
Q  103 tcaac 107  Q
    |||||    
T  35365942 tcaac 35365938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 6)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2272 - 2140
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  2272 cttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttat 2173  T
Q  100 cattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  2172 cattcaatctgttgagggctcatgccctggaat 2140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2194 - 2061
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  2194 cttatgccctggaatgctttatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatattaatcattcaaccgttgagggattatgccctagaatgccttgt 2095  T
Q  100 cattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  2094 cattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 2061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 2115 - 2008
Alignment:
Q  2 ttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||| ||| ||||||||  |||||| | ||    
T  2115 ttatgccctagaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccagaatgcttagt 2016  T
Q  100 cattcaac 107  Q
    ||||||||    
T  2015 cattcaac 2008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2134 - 1994
Alignment:
Q  22 tcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggct 118  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||  |  |||||||| | |||||||| | ||||||||||||| ||  |||||||| | ||||||||||    
T  2134 tcattcaaccgttgagggattatgccctagaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-atcatcattcaaattgttgggggct 2036  T
Q  119 tatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  2035 tatgccccagaatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2309 - 2166
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | | |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  ||    
T  2309 atgccctggaatgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-taatc 2211  T
Q  101 attcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  2210 attcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttatcattcaa 2166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2318 - 2244
Alignment:
Q  72 tgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||| ||| || || || |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  2318 tgagggctcatgccctggaatgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 2244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 11736 - 11887
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  11736 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttg 11835  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 149  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11836 tcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacg 11887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 11696 - 11843
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||| | |||||||||||||| ||    
T  11696 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgcttt 11795  T
Q  98 gtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  11796 gtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 11843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Original strand, 11684 - 11764
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  11684 aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 11764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 6)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 59307 - 59151
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||| | |||||||||||||  || ||||    
T  59307 atgccctggaatgctttgtcattcacctgttgagggctcatgctctggaatgttttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg--ttatcat 59210  T
Q  103 tcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  59209 taaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 59151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 59346 - 59217
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||| | |||| ||||||||  |||||||    
T  59346 atgctctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcacctgttgagggctcatgctctggaatgttttgtcat 59247  T
Q  103 tcaactgttgggggcttatgccccggaatg 132  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  59246 tcaactgttgagggctcatgccctggaatg 59217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 59389 - 59242
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaac-tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||    
T  59389 cttatgccctggaatgccttgtcattcaacctattgagggctcatgctctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctttg 59290  T
Q  99 tcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||| | |||||| || ||||||||||    
T  59289 tcattcacctgttgagggctcatgctctggaatgttttgtcattcaac 59242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 59397 - 59283
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccgga 129  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||  ||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  59397 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaacctattgagggctcatgctctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctgga 59298  T
Q  130 atgcttagtcattca 144  Q
    |||||| ||||||||    
T  59297 atgctttgtcattca 59283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 59401 - 59320
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||| | ||||||||| ||||||||||    
T  59401 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaacctattgagggctcatgctctggaatgctttgtcattcaac 59320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 205352 - 205422
Alignment:
Q  1 cttatgccctg-gaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaa 67  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  205352 cttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgtttaatcattcaa 205422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 32960 - 32838
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  32960 atgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcatt 32861  T
Q  104 caa-ctgttgggggcttatgccc 125  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||    
T  32860 caatctgttgagggctcatgccc 32838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 32886 - 32741
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |      
T  32886 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttca 32788  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 144  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32787 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 32741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 32975 - 32858
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||     
T  32975 aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaaccgttgagggcttatgccct 32877  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  32876 ggaatgccttgtcattcaa 32858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 40147 - 40289
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  40147 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcat 40246  T
Q  103 tcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||| |||||||  ||| ||||||| | |||||||||    
T  40247 tcaactgttgagggcttactccctggaatgccttgtcattcaa 40289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 40183 - 40328
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  40183 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttactccctggaatgccttgt 40282  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  40283 cattcaaactgttaagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 40328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Original strand, 40132 - 40251
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  40132 aactattgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccct 40231  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  40232 ggaatgctttgtcattcaac 40251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Original strand, 81852 - 81974
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  81852 atgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcatt 81951  T
Q  104 caa-ctgttgggggcttatgccc 125  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||    
T  81952 caatctgttgagggctcatgccc 81974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 81926 - 82071
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |      
T  81926 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttca 82024  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 144  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82025 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 82071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Original strand, 81837 - 81954
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||     
T  81837 aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaaccgttgagggcttatgccct 81935  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  81936 ggaatgccttgtcattcaa 81954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0860 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0860
Description:

Target: scaffold0860; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 148
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||||| | |||||||||||||  ||||    
T  298 cttatgccctgggatgccttgtcatccaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactattgagggatcatgccctggaatgtcttgt 199  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 149  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  198 cattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacg 148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0860; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 349 - 230
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||     
T  349 aactgttgagggctcatgccctagaatgctttgtcatccaactgttgagggcttatgccctgggatgccttgtcatccaactgttgagggctcatgccct 250  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  249 ggaatgctttgtcattcaac 230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0860; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 334 - 192
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |  |||| |||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  334 atgccctagaatgctttgtcatccaactgttgagggcttatgccctgggatgccttgtcatccaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcat 235  T
Q  103 tcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| ||| ||| | |||||| ||||||  | |||||||||    
T  234 tcaactattgagggatcatgccctggaatgtcttgtcattcaa 192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 137708 - 137562
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| || ||||    
T  137708 cttattccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatgttaatcattcaacagttgagggcttatgccctagaacgccttgt 137609  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    | ||| || || || |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  137608 cgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 137562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 137590 - 137535
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  137590 cttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 137535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 137630 - 137468
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    |||||||||| ||| || ||||| ||||| | | |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||||||||| ||     
T  137630 cttatgccctagaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-atc 137532  T
Q  98 gtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
     | |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  137531 attattcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcatcacgttgaaaatggt 137468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 137714 - 137639
Alignment:
Q  72 tgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaaca 147  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| | |||||| ||| ||||||||||    
T  137714 tgagggcttattccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatg-ttaatcattcaaca 137639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 4538 - 4395
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  4538 atgccctggaatgctttgtcatccaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgcgggcttatgccctgggatgccttgtcat 4439  T
Q  103 tcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
     ||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4438 ccaactattgagggctaatgccctggaatgctttgtcattcaac 4395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 4463 - 4313
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  4463 cttatgccctgggatgccttgtcatccaactattgagggctaatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgt 4364  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 149  Q
    ||||| || ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4363 cattcaaattgttgagggcttgtgccctggaatgcttagtcattcaacacg 4313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4502 - 4357
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |  |||| ||||  ||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  4502 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgcgggcttatgccctgggatgccttgtcatccaactattgagggctaatgccctggaatgctttgt 4403  T
Q  100 cattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  4402 cattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 4357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 4553 - 4434
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  4553 aactattgagggctcatgccctggaatgctttgtcatccaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgcgggcttatgccct 4454  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    || |||| | ||||| ||||    
T  4453 gggatgccttgtcatccaac 4434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 8)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21029 - 20883
Alignment:
Q  2 ttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21029 ttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggttcatgccctggaatgtttatcattcaaactgttgaggatttatgccctggaatgccttgt 20930  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  20929 cattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 20883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20950 - 20788
Alignment:
Q  2 ttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |||    
T  20950 ttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttg 20851  T
Q  99 tcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20850 tcattcaaattgttgagggctcatgccccgaaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 20788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 21079 - 21002
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21079 aactgttgaggg-tcatgccctggaatgttaatcatttaactgttgagggtttatgccctggaatgccttgtcattcaa 21002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24025 - 23866
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||| ||||||| |||||  |  |||||||| | |||||||| | ||||||| |||||| |||||    
T  24025 atgccctggaatg-tttatcattcaaactattgagggcttatgccctagaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgccttgtc 23927  T
Q  101 attcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    |||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23926 attcaaactattgagggctcatgccctagaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 23866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 20911 - 20856
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20911 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 20856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24026 - 23921
Alignment:
Q  42 catgccctggaatgttaatcattcaaccg-ttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtc 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||| | |||    
T  24026 catgccctggaatgtttatcattcaaactattgagggcttatgccctagaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgccttgtc 23927  T
Q  140 attcaa 145  Q
    ||||||    
T  23926 attcaa 23921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 35678 - 35578
Alignment:
Q  8 cctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctg-gaatgttaa-tcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattca 105  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| | || |||  | |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  35678 cctggaatgccttgtcattcaattggtgagggctcatgccctgtgaatgctaatttatccaattggtgagggcttacgccctggaatgccttgtcattca 35579  T
Q  106 a 106  Q
    |    
T  35578 a 35578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 23989 - 23934
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23989 cttatgccctagaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatg 23934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 13994 - 14146
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||   |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  13994 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcctt 14093  T
Q  98 gtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 149  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14094 gtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacg 14146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Original strand, 13982 - 14062
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  13982 aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 14062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 8)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 12516 - 12662
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  12516 cttatgccttggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaactgttgagggcttatgccctgaaatgccttg 12615  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  12616 tcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 12662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 13158 - 13296
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || |    
T  13158 cttatgccctgaaatgctttgtcattcatctgttgacggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgt-ttat 13256  T
Q  100 cattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagt 138  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13257 cattcaaattgtttggggcttatgccccagaatgcttagt 13296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 12595 - 12689
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgc 94  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  12595 cttatgccctgaaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaattgttgagggcttatgccctggaatgc 12689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 13118 - 13263
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| |||||||| |||| ||  ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  13118 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaaccgctgagggcttatgccctgaaatgctttgtcattcatctgttgacggcttatgccctggaatgctttg 13217  T
Q  99 tcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  13218 tcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgttta-tcattcaa 13263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 13078 - 13226
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcatt 97  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||    
T  13078 cttatgccctggaatgcctcgtgattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaaccgctgagggcttatgccctgaaatgcttt 13177  T
Q  98 gtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13178 gtcattcatctgttgacggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 13226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 134
Target Start/End: Original strand, 12559 - 12690
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  || ||    
T  12559 atgccctggaatg-tttatcattcaaactgttgagggcttatgccctgaaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatc 12656  T
Q  101 attcaactgttgggggcttatgccccggaatgct 134  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12657 attcaattgttgagggcttatgccctggaatgct 12690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Original strand, 12504 - 12583
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  12504 aaccgttgagggcttatgccttggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 12583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Original strand, 13066 - 13146
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  13066 aaccattgagggcttatgccctggaatgcctcgtgattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 13146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Original strand, 6085 - 6190
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  6085 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaagcattcaaccgttgagggcttatgccctagaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccct 6184  T
Q  127 ggaatg 132  Q
    ||||||    
T  6185 ggaatg 6190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 6135 - 6243
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |    
T  6135 cttatgccctagaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatctttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 6234  T
Q  99 tcattcaac 107  Q
    |||||||||    
T  6235 tcattcaac 6243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 146
Target Start/End: Original strand, 6205 - 6243
Alignment:
Q  108 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 6243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 3951 - 4096
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  3951 cttatgccctggaatgccttgtcatttaaaccgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaattgttgagggcttatgccatggaatgccttgt 4050  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  4051 cattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 4096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Original strand, 3994 - 4153
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |  |||||||| |||||||||| | |||||||||||||  || |||    
T  3994 atgccctggaatg-tttatcattcaattgttgagggcttatgccatggaatgccttgtcattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatca 4091  T
Q  102 ttcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 162  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4092 ttcaaattgttgggggcttatgccccgaaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 4153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Original strand, 3939 - 4018
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca-ttcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  3939 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcatttaaaccgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 4018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 5)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Original strand, 34873 - 34991
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  34873 aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaacagttgagggtttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggattatgccct 34972  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaa 145  Q
     |||||| | |||||||||    
T  34973 agaatgccttgtcattcaa 34991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 34885 - 35011
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  34885 cttatgccctggaatgctttgtcattcaacagttgagggtttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggattatgccctagaatgccttgt 34984  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccc 125  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  34985 cattcaaactgttgagggctcatgccc 35011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 149
Target Start/End: Original strand, 34925 - 35074
Alignment:
Q  2 ttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||  |  |||||||| | |||||||| | ||||||| |||||  || |    
T  34925 ttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggattatgccctagaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgt-ttat 35023  T
Q  100 cattcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 149  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35024 cattcaaattgttgggggcttatgccccgaaatgcttagtcattcaacacg 35074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 34877 - 34953
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34877 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaacagttgagggtttatgccctggaatgctttgtcattcaac 34953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 147
Target Start/End: Original strand, 34873 - 34915
Alignment:
Q  105 aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaaca 147  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  34873 aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaca 34915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2931 - 2830
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgccccggaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  2931 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtcttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaa 2832  T
Q  131 tg 132  Q
    ||    
T  2831 tg 2830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2920 - 2777
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| | |||||||| | ||||||||||||| ||  |||    
T  2920 atgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtcttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-atcatca 2823  T
Q  102 ttcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2822 ttcaaattgttaggggcttatgccgcggaatgcttagtcattcaac 2777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 2885 - 2818
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  2885 cttatgccctggaatgtcttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaa 2818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2935 - 2857
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||    
T  2935 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtcttgtcattcaa 2857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 7)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 50840 - 50684
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || |||    
T  50840 atgcccttgaatgccttgtcattcaaactgttgagggcttatgccctagaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgt-ttatca 50742  T
Q  102 ttcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatg 158  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  50741 ttcaaattgtttggggcttatgccccggaatgctcagtcattcaacacgttgaaaatg 50684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 51010 - 50915
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca--ttcaactgttgggggcttatgccc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||||| ||||| ||||||    
T  51010 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattttaaactgttgagggctcatgccc 50915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 50803 - 50737
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  50803 cttatgccctagaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtttatcattcaa 50737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 50964 - 50875
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc--aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctg 88  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  50964 cttatgccctggaatgccttgtcattttaaactgttgagggctcatgccctgaaatgtttatcgttcaatcgttgagggcttatgccctg 50875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 50893 - 50774
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  50893 gttgagggcttatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgcccttgaatgccttgtcattcaaactgttgagggcttatgccct 50794  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaac 146  Q
     |||||||| ||||||||||    
T  50793 agaatgctttgtcattcaac 50774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 51014 - 50939
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcatt 142  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  51014 aaccgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcatt 50939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 50999 - 50949
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50999 atgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatg 50949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Original strand, 134263 - 134380
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaac-cgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccgg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  134263 gttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaaatcgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 134362  T
Q  129 aatgcttagtcattcaac 146  Q
    ||||||||||||||||||    
T  134363 aatgcttagtcattcaac 134380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Original strand, 134274 - 134326
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  134274 atgccctggaatgctatgtcattcaaatcgttgagggctcatgccctggaatg 134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1646 - 1488
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  ||    
T  1646 atgccctggaatgctttgccattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatc 1548  T
Q  101 attcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1547 attcaattgctgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 1488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1657 - 1554
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa-ctgttgggggcttatgccccgg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  1657 gttgagggctcatgccctggaatgctttgccattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgg 1558  T
Q  129 aatg 132  Q
    ||||    
T  1557 aatg 1554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 1661 - 1581
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  1661 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgccattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 1581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 6)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2264 - 2106
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||| | |||||||||||||  || |||    
T  2264 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-tttatca 2166  T
Q  102 ttc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  2165 ttcaaattgttgggggcttaagcctcggaatgcttagtcattcagcacgttgaaaatggt 2106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9108 - 8950
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||| | |||||||||||||  || |||    
T  9108 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-tttatca 9010  T
Q  102 ttc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  9009 ttcaaattgttgggggcttaagcctcggaatgcttagtcattcagcacgttgaaaatggt 8950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2279 - 2161
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  2279 aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccc 2180  T
Q  126 cggaatgcttagtcattcaa 145  Q
     |||||| ||| ||||||||    
T  2179 tggaatgttta-tcattcaa 2161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 9123 - 9005
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  9123 aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccc 9024  T
Q  126 cggaatgcttagtcattcaa 145  Q
     |||||| ||| ||||||||    
T  9023 tggaatgttta-tcattcaa 9005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 2228 - 2161
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2228 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaa 2161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 9072 - 9005
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9072 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaa 9005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 125
Target Start/End: Original strand, 165629 - 165714
Alignment:
Q  41 tcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  165629 tcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgcattgtcattcaaactgttgagggctcatgccc 165714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 165666 - 165714
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccc 48  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  165666 cttatgccctggaatgcattgtcattcaaactgttgagggctcatgccc 165714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Original strand, 165631 - 165681
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  165631 atgccctggaatg-ttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatg 165681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 145
Target Start/End: Original strand, 165648 - 165694
Alignment:
Q  99 tcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  165648 tcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgcattgtcattcaa 165694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 1813 - 1945
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  1813 cttatgcgttggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcataccctagaatgttaatcattcaactgttgaggactgatgccctggaatgccttgt 1912  T
Q  100 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    ||||| ||||||||  |||| |||||| |||||    
T  1913 cattcaaactgttgatggctcatgccctggaat 1945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 160
Target Start/End: Original strand, 1873 - 2013
Alignment:
Q  22 tcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggct 118  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||  |  |||||||| | ||||| || | ||||||||||||   || |||||||| | ||||||||||    
T  1873 tcattcaactgttgaggactgatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgatggctcatgccctggaatat-ttatcattcaaattgttgggggct 1971  T
Q  119 tatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1972 tacaccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 2013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 1894 - 1958
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1894 atgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgatggctcatgccctggaatatttatcattcaa 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 10546 - 10466
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 146  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10546 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccccggaatgcttagtcattcaac 10466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 10531 - 10466
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  10531 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccccggaatgcttagtcattcaac 10466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 10542 - 10466
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaac 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  10542 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccccggaatgcttagtcattcaac 10466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 6830 - 6725
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgt 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | ||    
T  6830 cttatgccctggaatgccttgtcattcaactgttgagggctcatgcccaggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagt 6731  T
Q  100 cattca 105  Q
    ||||||    
T  6730 cattca 6725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 6836 - 6709
Alignment:
Q  34 tgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    |||||||| |||||||||||||  |  ||||||||| |||||||| | |||||| ||||||  || |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6836 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaactgttgagggctcatgcccaggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 6738  T
Q  132 gcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||    
T  6737 gcttagtcattcatcacgttgaaaatggt 6709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 5857 - 5752
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||| ||||||     
T  5857 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaattgtcgagggcttatgccctggaatgacttatcattcaaactgttgagggctcatgccct 5758  T
Q  127 ggaatg 132  Q
    ||||||    
T  5757 ggaatg 5752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 5842 - 5685
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||  | ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||  || |||    
T  5842 atgccctggaatg-ttaatcattcaattgtcgagggcttatgccctggaatgacttatcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatca 5745  T
Q  102 ttcaact-gttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  5744 tttaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 5685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 5807 - 5699
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatca-ttcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |    
T  5807 cttatgccctggaatgacttatcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcatttaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 5708  T
Q  99 tcattcaac 107  Q
    |||||||||    
T  5707 tcattcaac 5699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 9723 - 9613
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||||| | ||||||| | |||| ||||||    
T  9723 atgccctggaatgctttgtcattaaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaaccgttgagggctcatgcccttgtatgctttgtca 9624  T
Q  102 ttcaactgttg 112  Q
    |||||||||||    
T  9623 ttcaactgttg 9613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 9738 - 9618
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  9738 aactgttgacggctcatgccctggaatgctttgtcattaaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaaccgttgagggctcatgccc 9639  T
Q  126 cggaatgcttagtcattcaac 146  Q
      | |||||| ||||||||||    
T  9638 ttgtatgctttgtcattcaac 9618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9600 - 9546
Alignment:
Q  108 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9600 tgttgggggcttatgccccagaatgcctagtcattcaacacattggaaatggtgc 9546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 8967 - 9112
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||| | |||||||||||||  |      
T  8967 cttatgccctggaatgcctt-tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgaaaatcattcaaaatgttgagggctcatgccctggaatg-ttca 9064  T
Q  99 tcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  9065 tcattcaaattgttgggggcttaagccccggaaagctcagtcattcaa 9112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 93
Target Start/End: Original strand, 8930 - 9021
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggtttatgccctggaatg 93  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||    |||||||| | |||||||| | |||||||||||||    
T  8930 atgccctgaaatgctttgtcattcaaattggtgagggcttatgccctggaatgcctttcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 9021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 53
Target Start/End: Original strand, 8850 - 8900
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  8850 atgccctggaatgctttgtcattcaaattggtgagggcttatgccctggaa 8900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 1505 - 1430
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1505 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 1430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 1509 - 1430
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  1509 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 1430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 1494 - 1443
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1494 atgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg 1443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 1458 - 1414
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcat 44  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  1458 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcat 1414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10715 - 10554
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccg-ttgagggtttatgccctggaatgcattg 98  Q
    |||||||||| |||| |  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| |  ||||||| | |||||||||||||  ||     
T  10715 cttatgccctagaataccctgtcattcaactattgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactattgagggctcatgccctggaatgt-tta 10617  T
Q  99 tcattcaactg-ttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  10616 tcattcaaattattgggggcttatgccccggaatgcttactcattcaacacgttgaaaatggt 10554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10723 - 10648
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  10723 gttgagggcttatgccctagaataccctgtcattcaactattgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 10648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 223630 - 223759
Alignment:
Q  34 tgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaact-gttgggggcttatgccccggaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  || |||||||| | ||||||||||| || ||| ||||    
T  223630 tgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgaggggttatgccatggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttgtgtcccagaat 223728  T
Q  132 gcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 162  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  223729 gcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 223759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 223639 - 223702
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||    
T  223639 atgccctggaatgctttgtcattcaattgttgaggggttatgccatggaatgtttatcattcaa 223702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 14015 - 13952
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14015 atgccttggaatgcattgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatatttatcattcaa 13952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14030 - 13898
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||   || |||||||| |  | ||||||||||||||    
T  14030 aactgttgagggctcatgccttggaatgcattgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaat-atttatcattcaaattgttggggcttatgcccc 13932  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    | ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  13931 gaaatgcttagtcattcaacatgttgaaaatggt 13898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 12010 - 11947
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12010 atgccttggaatgcattgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatatttatcattcaa 11947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12025 - 11893
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgcccc 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||   || |||||||| |  | ||||||||||||||    
T  12025 aactgttgagggctcatgccttggaatgcattgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaat-atttatcattcaaattgttggggcttatgcccc 11927  T
Q  127 ggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    | ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  11926 gaaatgcttagtcattcaacatgttgaaaatggt 11893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21314 - 21233
Alignment:
Q  81 atgccctggaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 162  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  21314 atgccctagaatgctttttcattcaactgttgagggcttatgcctcggaatgcttagttattcaacacgttaaaaatggtgc 21233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 21314 - 21271
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgcc 47  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21314 atgccctagaatgctttttcattcaactgttgagggcttatgcc 21271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold1098
Description:

Target: scaffold1098; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1209 - 1050
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtc 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||| ||||||| |||||  |  |||||||| | |||||||| | ||||||| |||||| |||||    
T  1209 atgccctggaatg-tttatcattcaaactattgagggcttatgccctagaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgccttgtc 1111  T
Q  101 attcaa-ctgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    |||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1110 attcaaacttttgagggctcatgccctagaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 1050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 1210 - 1105
Alignment:
Q  42 catgccctggaatgttaatcattcaaccg-ttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtc 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||| | |||    
T  1210 catgccctggaatgtttatcattcaaactattgagggcttatgccctagaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgccttgtc 1111  T
Q  140 attcaa 145  Q
    ||||||    
T  1110 attcaa 1105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 1173 - 1118
Alignment:
Q  1 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ctgttgagggctcatgccctggaatg 55  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1173 cttatgccctagaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatg 1118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 169 - 128
Alignment:
Q  108 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  169 tgttgggggctcatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 211 - 131
Alignment:
Q  28 aactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaac 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| | |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  211 aactgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggctcatgccccggaatgcttagtcattcaac 131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 7178 - 7109
Alignment:
Q  1 cttatgccctg-gaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaa 67  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7178 cttatgccctgtgaatgccttgtcgttcaactgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaa 7109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7186 - 7109
Alignment:
Q  70 gttgagggtttatgccctg-gaatgcattgtcattcaactgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  7186 gttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcgttcaactgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaa 7109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 120073 - 120021
Alignment:
Q  108 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 160  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  120073 tgttgggggctcatgccccagaatgctcagtcattcaacacgttgaaaatggt 120021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 106
Target Start/End: Original strand, 21848 - 21926
Alignment:
Q  32 gttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  21848 gttgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 21926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 87
Target Start/End: Original strand, 2811 - 2869
Alignment:
Q  31 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggtttatgccct 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  2811 tgttgagggctcatgccctggaatgcttaatcattccaactgttgagggctcatgccct 2869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 49
Target Start/End: Original strand, 2823 - 2869
Alignment:
Q  4 atgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccct 49  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2823 atgccctggaatgcttaatcattccaactgttgagggctcatgccct 2869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 67
Target Start/End: Original strand, 15731 - 15768
Alignment:
Q  30 ctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15731 ctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaa 15768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 177998 - 177910
Alignment:
Q  22 tcattcaactgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac-cgttgagggtttatgccctggaatgcattgtcattcaa 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||  || |||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  177998 tcattcaattggtgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaatcggtgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 177910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2046 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2046
Description:

Target: scaffold2046; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 174 - 91
Alignment:
Q  66 aaccgttgagggtttatgccctg-gaatgcattgtcattc--aactgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 145  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||| | ||||||||| | ||||||    
T  174 aaccgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaaattgttgagggcttatgccctgtgaatgcttaattattcaa 91  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University