View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10954A_low_109 (Length: 359)

Name: NF10954A_low_109
Description: NF10954A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10954A_low_109
NF10954A_low_109
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (7-359)||(4823-5175)
scaffold0348 (7-359)||(17458-17810)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (7-359)||(40036-40388)
scaffold0114 (207-355)||(17523-17671)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (7-355)||(16831727-16832075)
chr3 (7-355)||(8744589-8744937)
chr3 (7-355)||(13944606-13944954)
chr3 (7-355)||(31692384-31692732)
chr3 (7-355)||(31941485-31941833)
chr3 (7-355)||(17188956-17189304)
chr3 (7-355)||(24189886-24190234)
chr3 (12-355)||(12357731-12358074)
chr3 (14-353)||(16326915-16327254)
chr3 (163-355)||(13317889-13318081)
chr3 (14-355)||(11958387-11958728)
chr3 (165-359)||(10417402-10417596)
chr3 (7-355)||(11949124-11949472)
chr3 (14-355)||(10408550-10408891)
chr3 (14-355)||(12180926-12181267)
chr3 (12-355)||(18131551-18131893)
chr3 (165-355)||(16378291-16378481)
chr3 (14-355)||(47126526-47126867)
chr3 (14-355)||(28756901-28757242)
chr3 (14-348)||(17494236-17494569)
chr3 (15-355)||(16825486-16825828)
chr3 (14-355)||(14290738-14291079)
chr3 (192-355)||(12509867-12510030)
chr3 (154-355)||(12857842-12858042)
chr3 (7-147)||(16384571-16384711)
chr3 (191-355)||(15230185-15230349)
chr3 (191-355)||(15236053-15236217)
chr3 (228-355)||(12272920-12273047)
chr3 (14-279)||(35982839-35983104)
chr3 (291-355)||(14575568-14575632)
chr3 (153-282)||(15013114-15013243)
chr3 (165-355)||(15262202-15262392)
chr3 (192-355)||(15345640-15345803)
chr3 (192-355)||(43165247-43165410)
chr3 (192-355)||(48428019-48428182)
chr3 (192-355)||(10008172-10008335)
chr3 (192-355)||(10908782-10908945)
chr3 (192-355)||(12889281-12889444)
chr3 (192-355)||(13255262-13255425)
chr3 (192-355)||(12843498-12843661)
chr3 (165-355)||(15358655-15358845)
chr3 (165-355)||(15713424-15713614)
chr3 (192-355)||(16638345-16638508)
chr3 (193-355)||(24185762-24185924)
chr3 (192-352)||(15586787-15586947)
chr3 (192-352)||(3688518-3688678)
chr3 (165-355)||(15399885-15400075)
chr3 (165-355)||(15065643-15065833)
chr3 (226-355)||(14873997-14874126)
chr3 (9-97)||(13317770-13317858)
chr3 (192-355)||(16754096-16754259)
chr3 (192-355)||(16804342-16804505)
chr3 (192-355)||(20059449-20059612)
chr3 (192-286)||(6603376-6603470)
chr3 (192-286)||(53382413-53382507)
chr3 (165-282)||(26790781-26790898)
chr3 (226-286)||(5422359-5422419)
chr3 (192-355)||(16694736-16694899)
chr3 (207-295)||(23079427-23079515)
chr3 (165-355)||(14578776-14578966)
chr3 (207-268)||(11861033-11861094)
chr3 (21-141)||(12501719-12501839)
chr3 (13-97)||(10417250-10417334)
chr3 (299-355)||(17492423-17492479)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (7-355)||(22053882-22054230)
chr8 (7-355)||(22027694-22028042)
chr8 (90-355)||(29300923-29301188)
chr8 (12-355)||(16268643-16268986)
chr8 (14-355)||(31413953-31414294)
chr8 (14-355)||(28983930-28984271)
chr8 (15-355)||(22373888-22374228)
chr8 (14-355)||(21928447-21928788)
chr8 (154-355)||(28989149-28989350)
chr8 (15-355)||(19985199-19985539)
chr8 (154-355)||(20391105-20391306)
chr8 (245-355)||(27357555-27357665)
chr8 (192-355)||(19980986-19981149)
chr8 (210-310)||(22375071-22375171)
chr8 (207-355)||(22421506-22421654)
chr8 (192-355)||(17671621-17671784)
chr8 (165-355)||(22126531-22126721)
chr8 (165-355)||(21391433-21391623)
chr8 (165-355)||(21780759-21780949)
chr8 (192-355)||(20015862-20016025)
chr8 (165-355)||(21253964-21254154)
chr8 (237-355)||(21785999-21786117)
chr8 (192-353)||(22031124-22031285)
chr8 (229-355)||(22523565-22523691)
chr8 (165-355)||(22990064-22990254)
chr8 (194-355)||(32603164-32603325)
chr8 (192-355)||(19115419-19115582)
chr8 (192-355)||(30310743-30310906)
chr8 (165-355)||(22117747-22117937)
chr8 (207-355)||(18859596-18859744)
chr8 (192-355)||(19481671-19481834)
chr8 (165-355)||(22129189-22129379)
chr8 (192-355)||(22042846-22043009)
chr8 (163-355)||(22245585-22245777)
chr8 (163-355)||(22246003-22246195)
chr8 (192-355)||(15536402-15536565)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (7-359)||(14283332-14283684)
chr7 (55-355)||(14140622-14140922)
chr7 (7-355)||(11385387-11385735)
chr7 (7-355)||(18050911-18051259)
chr7 (12-355)||(13676394-13676737)
chr7 (14-355)||(15099568-15099909)
chr7 (16-355)||(13024288-13024626)
chr7 (14-355)||(26091763-26092104)
chr7 (163-355)||(15343374-15343566)
chr7 (14-355)||(16947437-16947778)
chr7 (14-355)||(49155244-49155585)
chr7 (27-355)||(13965646-13965974)
chr7 (14-351)||(12798466-12798803)
chr7 (14-355)||(40924782-40925123)
chr7 (12-355)||(21755355-21755698)
chr7 (14-355)||(26115555-26115896)
chr7 (14-355)||(14261211-14261552)
chr7 (14-355)||(12459571-12459912)
chr7 (14-355)||(19149954-19150295)
chr7 (14-355)||(20749353-20749694)
chr7 (7-233)||(12712621-12712847)
chr7 (191-351)||(12203942-12204102)
chr7 (7-89)||(14144870-14144952)
chr7 (192-355)||(44788516-44788679)
chr7 (165-355)||(15146061-15146251)
chr7 (165-354)||(17703593-17703782)
chr7 (192-355)||(8710547-8710710)
chr7 (192-355)||(14335338-14335501)
chr7 (193-355)||(11550268-11550430)
chr7 (165-355)||(13688983-13689173)
chr7 (192-355)||(18587336-18587499)
chr7 (165-355)||(11234351-11234541)
chr7 (148-283)||(15627538-15627673)
chr7 (192-286)||(9591375-9591469)
chr7 (207-355)||(14957496-14957644)
chr7 (165-286)||(16726579-16726700)
chr7 (165-352)||(15158195-15158382)
chr7 (192-355)||(18180685-18180848)
chr7 (207-310)||(14042682-14042785)
chr7 (207-310)||(14352712-14352815)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (7-355)||(263208-263556)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (7-355)||(9761-10108)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (7-355)||(203363-203711)
scaffold0003 (207-283)||(424362-424438)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (7-352)||(6231-6576)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (7-355)||(19716528-19716876)
chr2 (7-355)||(12576937-12577285)
chr2 (7-355)||(23097529-23097877)
chr2 (7-355)||(23274177-23274525)
chr2 (14-355)||(20848173-20848514)
chr2 (7-281)||(19721091-19721365)
chr2 (204-353)||(23113309-23113458)
chr2 (153-284)||(19817502-19817633)
chr2 (192-355)||(17001584-17001747)
chr2 (192-284)||(30208616-30208708)
chr2 (192-355)||(9338166-9338329)
chr2 (192-355)||(9486800-9486963)
chr2 (192-355)||(16983824-16983987)
chr2 (192-355)||(21322962-21323125)
chr2 (207-355)||(11351422-11351570)
chr2 (192-355)||(22323038-22323201)
chr2 (207-355)||(22742677-22742825)
chr2 (192-355)||(24712618-24712781)
chr2 (192-355)||(44383266-44383429)
chr2 (165-355)||(24705151-24705341)
chr2 (207-353)||(22733485-22733631)
chr2 (192-352)||(10871437-10871597)
chr2 (207-355)||(23064997-23065145)
chr2 (207-355)||(23074447-23074595)
chr2 (231-355)||(24817575-24817699)
chr2 (192-355)||(27373853-27374016)
chr2 (165-355)||(23105397-23105587)
chr2 (210-355)||(27220600-27220745)
chr2 (165-286)||(24265023-24265144)
chr2 (207-355)||(45673723-45673871)
chr2 (226-355)||(23029191-23029320)
chr2 (207-355)||(24874461-24874609)
chr2 (192-355)||(24657354-24657517)
chr2 (207-355)||(24678071-24678219)
chr2 (20-115)||(24657182-24657277)
chr2 (203-267)||(22280777-22280841)
chr2 (205-273)||(22739363-22739431)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (7-355)||(461-809)
scaffold0222 (7-355)||(20796-21144)
[»] chr6 (38 HSPs)
chr6 (7-355)||(14377032-14377380)
chr6 (7-355)||(19437819-19438167)
chr6 (12-351)||(18797511-18797850)
chr6 (7-352)||(34642702-34643047)
chr6 (9-359)||(15462149-15462499)
chr6 (7-355)||(21567107-21567455)
chr6 (7-354)||(24515530-24515877)
chr6 (14-355)||(19465985-19466326)
chr6 (14-355)||(19455840-19456181)
chr6 (14-355)||(24367217-24367558)
chr6 (14-355)||(10465971-10466312)
chr6 (154-355)||(21474417-21474618)
chr6 (154-355)||(19486557-19486758)
chr6 (154-355)||(25770661-25770862)
chr6 (257-359)||(20010820-20010922)
chr6 (165-355)||(5836502-5836692)
chr6 (207-355)||(16924956-16925104)
chr6 (207-355)||(18405260-18405408)
chr6 (192-355)||(22436686-22436849)
chr6 (192-355)||(29589740-29589903)
chr6 (192-355)||(16574707-16574870)
chr6 (192-355)||(16620510-16620673)
chr6 (192-308)||(23081287-23081403)
chr6 (163-355)||(23085097-23085289)
chr6 (165-355)||(2872076-2872266)
chr6 (153-355)||(30678286-30678488)
chr6 (210-355)||(18182686-18182831)
chr6 (192-355)||(24293083-24293246)
chr6 (192-286)||(28312516-28312610)
chr6 (207-355)||(27559285-27559433)
chr6 (210-286)||(27190322-27190398)
chr6 (210-286)||(27258842-27258918)
chr6 (192-355)||(28260498-28260661)
chr6 (192-355)||(28285255-28285418)
chr6 (192-355)||(28339247-28339410)
chr6 (233-355)||(19867504-19867626)
chr6 (13-76)||(20010624-20010687)
chr6 (207-274)||(22829702-22829769)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (7-355)||(53750441-53750789)
chr4 (14-355)||(20892984-20893325)
chr4 (7-355)||(51603763-51604111)
chr4 (9-359)||(27903334-27903684)
chr4 (14-355)||(3261772-3262113)
chr4 (7-355)||(16150589-16150937)
chr4 (7-355)||(16154735-16155083)
chr4 (14-355)||(29450515-29450856)
chr4 (14-355)||(44658844-44659185)
chr4 (19-355)||(14993350-14993686)
chr4 (14-348)||(15266736-15267070)
chr4 (27-355)||(11204223-11204551)
chr4 (12-295)||(7357280-7357563)
chr4 (15-355)||(15073312-15073652)
chr4 (163-355)||(14697054-14697246)
chr4 (207-355)||(15946-16094)
chr4 (291-355)||(15354295-15354359)
chr4 (192-355)||(17092045-17092208)
chr4 (189-251)||(15354229-15354291)
chr4 (192-355)||(8389365-8389528)
chr4 (192-355)||(12479553-12479716)
chr4 (207-355)||(14162423-14162571)
chr4 (165-355)||(8050492-8050682)
chr4 (165-355)||(14300848-14301038)
chr4 (165-355)||(14683520-14683710)
chr4 (194-355)||(16233890-16234051)
chr4 (14-119)||(18259630-18259735)
chr4 (207-355)||(19635089-19635237)
chr4 (207-355)||(23958700-23958848)
chr4 (192-352)||(27714292-27714452)
chr4 (165-355)||(16350423-16350613)
chr4 (165-355)||(40475993-40476183)
chr4 (192-286)||(13513372-13513466)
chr4 (233-355)||(15144829-15144951)
chr4 (192-310)||(16219186-16219304)
chr4 (192-310)||(16222506-16222624)
chr4 (226-355)||(18224376-18224505)
chr4 (207-352)||(19775704-19775849)
chr4 (210-274)||(18604733-18604797)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (7-355)||(98557-98905)
scaffold0020 (15-355)||(175970-176309)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (7-355)||(519-867)
scaffold0476 (207-355)||(10768-10916)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (7-359)||(49154-49506)
scaffold0067 (7-359)||(58188-58540)
scaffold0067 (7-355)||(64576-64924)
scaffold0067 (14-355)||(29606-29947)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (15-355)||(8444-8784)
scaffold0235 (15-355)||(18658-18998)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (12-355)||(325689-326032)
scaffold0004 (175-355)||(200610-200790)
scaffold0004 (12-98)||(319482-319568)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (7-355)||(8596-8944)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (7-355)||(828-1176)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (7-355)||(115544-115892)
scaffold0029 (165-355)||(94026-94216)
scaffold0029 (13-97)||(93874-93958)
[»] chr5 (37 HSPs)
chr5 (15-355)||(17266495-17266835)
chr5 (165-359)||(20824316-20824510)
chr5 (168-359)||(28892256-28892447)
chr5 (168-359)||(20778776-20778967)
chr5 (13-359)||(22464813-22465159)
chr5 (14-355)||(23563328-23563669)
chr5 (12-355)||(25850939-25851282)
chr5 (14-355)||(23078065-23078406)
chr5 (12-355)||(20345149-20345492)
chr5 (14-355)||(14884151-14884492)
chr5 (12-355)||(22505546-22505889)
chr5 (154-355)||(21983477-21983678)
chr5 (154-355)||(21561325-21561526)
chr5 (153-355)||(21631698-21631900)
chr5 (165-352)||(14997050-14997237)
chr5 (192-284)||(21410090-21410182)
chr5 (192-355)||(16359387-16359550)
chr5 (168-355)||(21882659-21882846)
chr5 (165-355)||(22330198-22330388)
chr5 (165-355)||(29473384-29473574)
chr5 (192-355)||(34569379-34569542)
chr5 (165-355)||(37288807-37288997)
chr5 (192-355)||(40711665-40711828)
chr5 (192-355)||(18781999-18782162)
chr5 (192-308)||(21332324-21332440)
chr5 (207-355)||(25429306-25429454)
chr5 (165-353)||(26736038-26736226)
chr5 (192-355)||(41773727-41773890)
chr5 (192-355)||(27521291-27521454)
chr5 (192-352)||(27613244-27613404)
chr5 (207-339)||(23525952-23526084)
chr5 (165-355)||(27682711-27682901)
chr5 (207-352)||(19772848-19772993)
chr5 (207-352)||(27665843-27665988)
chr5 (207-355)||(22350804-22350952)
chr5 (192-355)||(23460856-23461019)
chr5 (210-355)||(23474080-23474225)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (15-350)||(22109-22444)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (15-355)||(53405-53745)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (7-355)||(65272-65620)
scaffold0053 (15-211)||(62754-62950)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (15-355)||(5191-5531)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (7-355)||(54029-54377)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (15-355)||(164383-164723)
scaffold0023 (205-353)||(47155-47303)
scaffold0023 (233-355)||(30774-30896)
scaffold0023 (318-355)||(152063-152100)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (14-355)||(22015795-22016136)
chr1 (12-355)||(20074757-20075100)
chr1 (14-355)||(48425872-48426213)
chr1 (13-359)||(20853809-20854155)
chr1 (14-355)||(21742602-21742943)
chr1 (14-355)||(24096665-24097006)
chr1 (14-355)||(19857273-19857614)
chr1 (14-355)||(38909876-38910217)
chr1 (7-354)||(20832943-20833290)
chr1 (12-355)||(52988740-52989083)
chr1 (27-355)||(31537060-31537388)
chr1 (14-355)||(21739086-21739427)
chr1 (14-355)||(37680048-37680389)
chr1 (163-355)||(18710384-18710576)
chr1 (12-355)||(20297380-20297725)
chr1 (12-246)||(21961135-21961369)
chr1 (165-355)||(24785058-24785248)
chr1 (163-355)||(16379062-16379254)
chr1 (207-355)||(22496499-22496647)
chr1 (192-355)||(16347823-16347986)
chr1 (192-355)||(51330720-51330883)
chr1 (207-355)||(20081619-20081767)
chr1 (165-355)||(21228757-21228947)
chr1 (194-355)||(17042245-17042406)
chr1 (226-355)||(33388291-33388420)
chr1 (207-355)||(21752015-21752163)
chr1 (192-355)||(21833270-21833433)
chr1 (163-269)||(21045323-21045429)
chr1 (192-355)||(41350896-41351059)
chr1 (207-355)||(19109336-19109484)
chr1 (165-286)||(21842249-21842370)
chr1 (316-355)||(12200517-12200556)
chr1 (207-312)||(22401603-22401708)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (9-359)||(70350-70700)
scaffold0034 (12-355)||(1931-2274)
scaffold0034 (7-79)||(11880-11952)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (14-355)||(796-1137)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (12-355)||(36921-37264)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (15-355)||(9754-10094)
scaffold0243 (207-355)||(24119-24267)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (14-353)||(10961-11300)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (7-317)||(1822-2132)
[»] scaffold0010 (5 HSPs)
scaffold0010 (12-355)||(39312-39655)
scaffold0010 (262-353)||(44656-44747)
scaffold0010 (169-355)||(4897-5083)
scaffold0010 (13-97)||(180819-180903)
scaffold0010 (192-286)||(14475-14569)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (14-355)||(1292-1633)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (14-355)||(7726-8067)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (14-355)||(864-1205)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (14-355)||(5787-6128)
scaffold0035 (153-284)||(41228-41359)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (15-345)||(9003-9333)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (14-355)||(50087-50428)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (14-355)||(34319-34660)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (14-355)||(63500-63841)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (14-355)||(4285-4626)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (18-355)||(12709-13046)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (14-355)||(41717-42058)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (7-355)||(7020-7368)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (16-355)||(5128-5467)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (14-355)||(5163-5504)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (14-355)||(29916-30257)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (14-355)||(70090-70431)
scaffold0046 (219-355)||(60721-60857)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (12-355)||(443-786)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (12-355)||(514332-514675)
scaffold0001 (165-355)||(496002-496192)
scaffold0001 (231-355)||(441635-441759)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (14-355)||(251604-251942)
scaffold0009 (207-274)||(230026-230093)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (154-355)||(1393-1594)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (154-355)||(11791-11992)
scaffold0443 (14-100)||(12034-12120)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (154-355)||(28406-28607)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (82-355)||(30375-30648)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (14-355)||(43400-43741)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (163-355)||(67238-67430)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (14-355)||(11942-12283)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (179-355)||(1-177)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (180-355)||(15105-15280)
scaffold0074 (18-130)||(15279-15391)
scaffold0074 (163-355)||(6095-6287)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (163-353)||(567-757)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (14-355)||(42680-43021)
scaffold0102 (192-355)||(50504-50667)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (14-355)||(1703-2043)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (154-355)||(29509-29710)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (163-355)||(9357-9549)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (204-353)||(5-154)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (163-355)||(151549-151741)
scaffold0011 (165-355)||(23665-23855)
scaffold0011 (14-106)||(153723-153815)
scaffold0011 (228-277)||(73792-73841)
scaffold0011 (228-277)||(78173-78222)
scaffold0011 (228-280)||(175708-175760)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (154-355)||(11812-12011)
[»] scaffold0167 (2 HSPs)
scaffold0167 (204-354)||(1103-1253)
scaffold0167 (12-200)||(5190-5378)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (80-326)||(19016-19262)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (14-355)||(5584-5925)
[»] scaffold0523 (3 HSPs)
scaffold0523 (210-355)||(2853-2998)
scaffold0523 (14-253)||(11724-11963)
scaffold0523 (14-215)||(5562-5763)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (192-355)||(20687-20850)
scaffold0261 (192-353)||(12507-12668)
scaffold0261 (12-119)||(12391-12498)
scaffold0261 (12-119)||(20571-20678)
[»] scaffold2062 (1 HSPs)
scaffold2062 (14-281)||(853-1125)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (191-355)||(4247-4411)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (12-253)||(1586-1827)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (33-253)||(1487-1707)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (220-352)||(110595-110727)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (154-355)||(4013-4211)
scaffold0130 (192-355)||(7938-8101)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (242-355)||(21833-21946)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (12-250)||(782-1020)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (14-268)||(51720-51974)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (242-348)||(49086-49192)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (283-359)||(26090-26166)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (12-214)||(2754-2956)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (153-355)||(1981-2183)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (210-355)||(17860-18005)
scaffold0040 (207-355)||(111081-111229)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (165-355)||(15111-15301)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (207-355)||(36480-36628)
scaffold0079 (20-115)||(36720-36815)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (287-355)||(1193-1261)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (13-253)||(1364-1604)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (163-355)||(13609-13801)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (148-355)||(5070-5277)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (207-354)||(8393-8540)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (165-355)||(14398-14588)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (151-264)||(16727-16840)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (207-355)||(17240-17388)
scaffold0017 (153-282)||(24361-24490)
scaffold0017 (192-355)||(194997-195160)
scaffold0017 (14-81)||(4434-4501)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (207-355)||(2437-2585)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (207-355)||(55644-55792)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (192-355)||(22229-22392)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (192-355)||(7218-7381)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (207-353)||(1-147)
scaffold0621 (207-353)||(4418-4564)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (165-355)||(6855-7045)
scaffold0270 (165-355)||(13985-14175)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (14-184)||(265-435)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (207-353)||(40681-40827)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (207-355)||(29102-29250)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (165-282)||(216552-216669)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (207-355)||(552-700)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (207-355)||(10332-10480)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (207-355)||(14893-15041)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (207-355)||(1971-2119)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (165-305)||(15442-15582)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (207-355)||(23472-23620)
scaffold0018 (231-355)||(9549-9673)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (207-310)||(11291-11394)
scaffold0120 (228-355)||(14066-14193)
scaffold0120 (228-273)||(25242-25287)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (165-355)||(3406-3596)
scaffold0044 (192-355)||(17142-17305)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (233-355)||(37020-37142)
scaffold0042 (163-355)||(26334-26526)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (233-355)||(22-144)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (165-355)||(57746-57936)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (226-355)||(964-1093)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (207-355)||(11054-11202)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (165-348)||(15711-15894)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (207-351)||(3537-3681)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (207-355)||(7913-8061)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (207-355)||(8205-8353)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (165-355)||(10350-10540)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (14-213)||(16761-16960)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (207-310)||(41659-41762)
scaffold0022 (207-310)||(75379-75482)
scaffold0022 (233-355)||(34915-35037)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (163-284)||(11081-11202)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (310-355)||(3447-3492)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (192-355)||(13283-13446)
scaffold0109 (207-355)||(41137-41285)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (207-355)||(54619-54767)
scaffold0080 (208-355)||(31865-32012)
scaffold0080 (208-355)||(37331-37478)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (14-117)||(23904-24007)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (192-286)||(928-1022)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (192-286)||(192-286)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (207-359)||(8928-9077)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (166-355)||(8240-8429)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (237-355)||(24916-25034)
scaffold0218 (203-273)||(1122-1192)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (165-355)||(21586-21776)
scaffold0081 (165-355)||(37010-37200)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (165-283)||(11523-11641)
scaffold0028 (21-283)||(55058-55320)
scaffold0028 (209-283)||(17991-18065)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (207-355)||(1206-1354)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (207-355)||(18632-18780)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (194-286)||(2915-3007)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (192-283)||(48719-48810)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (229-355)||(4565-4691)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (210-355)||(11533-11678)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (203-273)||(13501-13571)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (14-46)||(523-555)


Alignment Details
Target: scaffold0348 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Original strand, 4823 - 5175
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4823 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 4922  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||| |||| ||  ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  4923 gggccatatcagtactcagtgtacacagccgaggaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgctttgactatgacgcagactactaatgaggaccgtctt 5022  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5023 atcagaggtacttgtttctttaatactactcctttaattgatattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 5122  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 359  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5123 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 5175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Original strand, 17458 - 17810
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  17458 gtaccaaggatgagaagaagtgctttaggtgtgatcaaaagggtcacacattagcggattacatgcgtggtgatgttgtatgttacaattgcaacgaaga 17557  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17558 gggccatatcagtactcagtgtacacagccgaagaaggttagaactggtgggaaaatgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggatcgtctt 17657  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17658 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacattggtgctacttattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 17757  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 359  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17758 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 17810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 40388 - 40036
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40388 gtaccaaagatgataagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagcggattgcaagcgttgtgatgttgtatgttataactgcaacgaaga 40289  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40288 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgtctt 40189  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40188 attagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacaggtgctactcattgttttattgctttagaaagtgcatataagttgg 40089  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 359  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40088 ggttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 40036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 17523 - 17671
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||  || |||||   ||||||||    
T  17523 atcagaggtacttgttatattaataatacacctttagttgctattattgatacaggtgctacgcattgtttcatttcttatgattgtgctactaagttgg 17622  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| ||  |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17623 gtcttatcatgcctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagc 17671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 16831727 - 16832075
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16831727 gtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacgtgttagcggactgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaaga 16831826  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16831827 gggccatatcagtacacagtgcacacagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 16831926  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16831927 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 16832026  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16832027 gtttgattgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagc 16832075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 8744589 - 8744937
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||    
T  8744589 gtaccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataattgtaatgaaga 8744688  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    |||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  8744689 gggccacatcagtactcagtgcacacaaccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctc 8744788  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8744789 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgg 8744888  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8744889 gtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 8744937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13944954 - 13944606
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||    
T  13944954 gtaccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataattgtaatgaaga 13944855  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    |||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  13944854 gggccacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctc 13944755  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  13944754 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgg 13944655  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13944654 gtttgattgtgtctgatatggaaggagaaatggttgttgaaactccagc 13944606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 31692384 - 31692732
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31692384 gtaccaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggttagaagggacacactctagctgactgcaagagtggtgatgttgtttgttataactgcaatgagga 31692483  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||  ||  |||| ||| |||||||| || |||||||||| || |||| |||||| || |||    
T  31692484 gggccatatcagttcacagtgtacgcagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgactt 31692583  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||    
T  31692584 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagtcgg 31692683  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31692684 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaacttcagc 31692732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 31941833 - 31941485
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  31941833 gtaccaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaagggacacactctagctgactgcaagcgtggtgatgttgtttgttataattgcaatgagga 31941734  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||||||||||||| |  |||| || ||||||||||| ||||  ||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||| |||||| || |||    
T  31941733 gggccatatcagttcatagtgtacgcagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgactt 31941634  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  31941633 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactcattttttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 31941534  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31941533 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 31941485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17189304 - 17188956
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||| | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||  | |||||    
T  17189304 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacgttggctaactgcaagtggggtgatgttgtttgttataattgtgatgagga 17189205  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    |||||| |||||| | ||||| || ||||| |||||  ||| |||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  17189204 gggccacatcagttcacagtgtactcagccaaagaagattagaaccggtgggaaagtgtttgcgttgactggtacgcaaactactaatgaggacaggctt 17189105  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17189104 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacgggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgg 17189005  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17189004 gtttgattgtatctgatatggagggagagatggttgttgaaactccagc 17188956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24190234 - 24189886
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||| | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||  | |||||    
T  24190234 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacgttggctaactgcaagtggggtgatgttgtttgttataattgtgatgagga 24190135  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    |||||| |||||| | ||||| || ||||| |||||  ||| |||| |||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  24190134 gggccacatcagttcacagtgtactcagccaaagaagattagaaccggtgggaaagagtttgcgttgactggtacgcagactactaacgaggacaggctt 24190035  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24190034 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgg 24189935  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24189934 gtttgattgtatctgatatgaagggagagatggttgttgagactccagc 24189886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Original strand, 12357731 - 12358074
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  ||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || |    
T  12357731 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcggggagacgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtc 12357830  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||  ||| |||| ||  |||||||| || |||||||||| || |||| |||||| || ||||||||    
T  12357831 atatcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcag 12357930  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  12357931 aggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctg 12358030  T
Q  312 attgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12358031 gttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactccagc 12358074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 353
Target Start/End: Original strand, 16326915 - 16327254
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||| |  ||||| |||    
T  16326915 agatgagaggaaatgtttcaggtgtggtcagaagggacacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcat 16327014  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | ||||| ||  |||||||||| |||| |||  |||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  16327015 atcagttcgcagtgtactaagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttattagag 16327114  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16327115 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgat 16327214  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327215 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 16327254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 163 - 355
Target Start/End: Original strand, 13317889 - 13318081
Alignment:
Q  163 tgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 262  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13317889 tgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 13317988  T
Q  263 tgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13317989 tgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 13318081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 11958387 - 11958728
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||| || || |   ||||||| || |||||||  ||  |||| || || ||||||||||| ||  | |||    
T  11958387 agatgagaggaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacatacactagctgaatgtaagcgtgaggacattgtctgctacaactgcaacgaagaaagtcat 11958486  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| |  |||| || ||||||||||| | ||  ||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11958487 atcagttcatagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 11958586  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11958587 gtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgat 11958686  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11958687 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 11958728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 165 - 359
Target Start/End: Original strand, 10417402 - 10417596
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10417402 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtg 10417501  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10417502 ctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 10417596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 11949124 - 11949472
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  11949124 gtactaaagatgagaagaagtgcttcagatgtggtcagaaaggacacatattagctgattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgagga 11949223  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
     || || ||||||   ||||| ||  || ||||||| ||||  | | |||| ||  |||||||| || |||||||||| || |||| |||||| |  |||    
T  11949224 aggtcacatcagtttgcagtgtacgtagacgaagaaggttaggatcggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcaactt 11949323  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  11949324 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtggttataagttgg 11949423  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11949424 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 11949472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 10408891 - 10408550
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| | ||| || |||    
T  10408891 agatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcat 10408792  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | |||||  |  ||||||||||   || ||   |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  10408791 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccaacttatcagag 10408692  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||      
T  10408691 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 10408592  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10408591 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 10408550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12181267 - 12180926
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| || ||||   |||||||||| |||| ||| ||  |||| |||||||| |||||| |||| || |||    
T  12181267 agatgagaagaagtgcttcagttgtggtcggaaaggacacacactagctgattgtaagcttggggacattgtttgttataattgcaacaaggaaggtcat 12181168  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| |  |||| || || |||||||| ||||  ||| |||| ||  ||||||||||| |||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||||    
T  12181167 atcagttcgtagtgtacgcaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtacgtaaaccactagtgaggaccgacttatcagag 12181068  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |    
T  12181067 gtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctgtt 12180968  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12180967 tgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgacactccagc 12180926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Original strand, 18131551 - 18131893
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||   |||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||  | |    
T  18131551 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacgcattagctaattgtaagcgtggggatgtagtgtgctataactgcaatgaggaaagtc 18131650  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    |||| ||| | ||||| || || | |||||| |||| |||| |||| ||  ||||| || || |||||||||| || |||| |||||| || ||||||||    
T  18131651 atattagttcgcagtgtactcaactgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttactctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcag 18131750  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  18131751 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagac-ctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctg 18131849  T
Q  312 attgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
     ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18131850 gttgtatctgatatgaaaggggaaacggttgttgaaactccagc 18131893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 16378291 - 16378481
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16378291 tttgcttggactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattgctatcatagacactggtg 16378390  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16378391 ctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatattaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 16378481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 47126867 - 47126526
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| | ||| || |||    
T  47126867 agatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcat 47126768  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | |||||  |  ||||||||||   || ||   |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  47126767 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaacgaggaccgacttatcagag 47126668  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||      
T  47126667 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttgga 47126568  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47126567 tatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 47126526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 28757242 - 28756901
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| || ||||| |  || || |||    
T  28757242 agatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcat 28757143  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | |||||  |  ||||||||||   || ||   | || ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28757142 attagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 28757043  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||      
T  28757042 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 28756943  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28756942 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 28756901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17494569 - 17494236
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||   ||||||| || ||| |||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || |||    
T  17494569 agatgagaagaagtgct-caggtgtggtcagaaaggacacacactagctgactgtaagtgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcat 17494471  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | ||||| || || |||||||| ||||  ||| |||| ||  |||||||| || |||||||||| || | || |||||||   ||||||||||    
T  17494470 attagttcgcagtgtactcaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccattagtgaggacatgcttatcagag 17494371  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |    
T  17494370 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataaattgggtctggt 17494271  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaa 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17494270 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaa 17494236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Original strand, 16825486 - 16825828
Alignment:
Q  15 gatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccata 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||  ||||||||||| |||||||| ||  |||| || || |||| ||| ||||| || ||||    
T  16825486 gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtaaaaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaatgaggaaggtcata 16825585  T
Q  115 tcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagagg 214  Q
    |||||   ||||| || ||||| ||||| ||||  ||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||| | |||||||||||    
T  16825586 tcagtttgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggactgacttatcagagg 16825685  T
Q  215 tacttgtttctttaata--gtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctga 312  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||     
T  16825686 tacttgtttctttaatatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctgg 16825785  T
Q  313 ttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16825786 ttgtatctgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagc 16825828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 14290738 - 14291079
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||  ||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||| ||  | || ||||| |||    
T  14290738 agatgagaagaagtgctttaggtgtggacagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttatttgctataattgtgatgaagagggacat 14290837  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||  | |||||||   |||| ||||| |||   ||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||| ||||||||||    
T  14290838 attagctcgcagtgcaagaagcctaagaaggttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaaccgtgaatgaggaccgacttatcagag 14290937  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |    
T  14290938 gtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggt 14291037  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291038 tatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 14291079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 12509867 - 12510030
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||    
T  12509867 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 12509966  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12509967 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 12510030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 154 - 355
Target Start/End: Original strand, 12857842 - 12858042
Alignment:
Q  154 gtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 253  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12857842 gtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggac-gacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 12857940  T
Q  254 agacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    ||| ||||||||||   |||||||||||||| | |  |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12857941 agatactggtgctagttattgtttcattgctgtggtttgtgcatataagttggttctggttatatctgatatgaatggagaaacggttgttgaaactcca 12858040  T
Q  354 gc 355  Q
    ||    
T  12858041 gc 12858042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 147
Target Start/End: Original strand, 16384571 - 16384711
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||    
T  16384571 gtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacatgttggctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgctataattgtaatgaaga 16384670  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagtta 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16384671 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggtta 16384711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15230349 - 15230185
Alignment:
Q  191 taatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaa 290  Q
    |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  15230349 taatgaggattgacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgat 15230250  T
Q  291 tgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | ||||||||||||||||||| || | ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15230249 tttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagc 15230185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15236217 - 15236053
Alignment:
Q  191 taatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaa 290  Q
    |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  15236217 taatgaggattgacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgat 15236118  T
Q  291 tgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | ||||||||||||||||||| || | ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15236117 tttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagc 15236053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 228 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12273047 - 12272920
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatga 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | | || | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12273047 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgactatgcatttaagttgggtctggttgtatctgatatga 12272948  T
Q  328 aaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12272947 aaggagaaatggttgttgaaactccagc 12272920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 35983104 - 35982839
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||  |||| || ||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| || || ||||| || ||||| || |||    
T  35983104 agatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacat 35983005  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | || || || ||||| ||||| ||||  ||  |||| ||| ||||||||||| ||| |||||| ||    ||||||||||| ||||||||||    
T  35983004 attagttcgcattgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactgttacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagag 35982905  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttca 279  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  35982904 atacttgtttctttaatagtactcttttaattgctattatagatactggtactactcattgtttca 35982839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 291 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14575632 - 14575568
Alignment:
Q  291 tgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14575632 tgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 14575568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 282
Target Start/End: Original strand, 15013114 - 15013243
Alignment:
Q  153 agtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 252  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15013114 agtgggaaggtgtttgctttagctggtactcagacagcgaatgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagcactcctttaattactatta 15013213  T
Q  253 tagacactggtgctacacattgtttcattg 282  Q
    |||| ||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  15013214 tagatactagtgttacacatttttttattg 15013243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15262392 - 15262202
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    || ||||| ||| | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||||||    
T  15262392 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 15262293  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||| |||||| | || ||||| | ||||||||||||   | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15262292 ctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 15262202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 15345640 - 15345803
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  15345640 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 15345739  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15345740 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 15345803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 43165410 - 43165247
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  43165410 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 43165311  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  43165310 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 43165247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 48428182 - 48428019
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  48428182 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 48428083  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  48428082 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 48428019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 10008335 - 10008172
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  10008335 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 10008236  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  10008235 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 10008172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 10908945 - 10908782
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  10908945 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 10908846  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  10908845 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 10908782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12889444 - 12889281
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  12889444 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 12889345  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  12889344 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 12889281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13255425 - 13255262
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  13255425 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 13255326  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13255325 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 13255262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 12843498 - 12843661
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | || |    
T  12843498 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgatt 12843597  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| | |||||||| |||   | | ||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12843598 gtgcttctaagttggatcttgctatgtcaaatatgaatggagagatgattgttgaaactccagc 12843661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15358845 - 15358655
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||    || ||||| | | | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  15358845 tttgctttgactggtacgcagacggagaacgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 15358746  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15358745 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 15358655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 15713424 - 15713614
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    || ||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  15713424 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 15713523  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15713524 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 15713614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16638508 - 16638345
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  16638508 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgatt 16638409  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16638408 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 16638345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24185924 - 24185762
Alignment:
Q  193 atgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatg 292  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||    
T  24185924 atgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattg 24185825  T
Q  293 tgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||  | ||  ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24185824 tgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagc 24185762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 352
Target Start/End: Original strand, 15586787 - 15586947
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  15586787 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 15586886  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 352  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  15586887 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactcc 15586947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 3688678 - 3688518
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||  || |    
T  3688678 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttccgatt 3688579  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 352  Q
    |||  | |   ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  3688578 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactcc 3688518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 15399885 - 15400075
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| |||||||| ||||    || ||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||  |||||||||| || |||||||    
T  15399885 tttgctttgactggtacgtagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttggttgctattattgatactggtg 15399984  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15399985 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 15400075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15065833 - 15065643
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| ||  | |||| ||||||||| |   |||||| ||||| |||| |||||||||| || |||||||    
T  15065833 tttgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcaaaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactggtg 15065734  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||| | |   ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  15065733 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaatctccagc 15065643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 355
Target Start/End: Original strand, 14873997 - 14874126
Alignment:
Q  226 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatat 325  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| | ||  ||||||||   | | ||| ||||    
T  14873997 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatatgtctaatat 14874096  T
Q  326 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14874097 gaatggagagatggttgtcgaaactccagc 14874126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 97
Target Start/End: Original strand, 13317770 - 13317858
Alignment:
Q  9 accaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactg 97  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  13317770 accaaagatgagaagaagtgtttcagatgtggtcaaaaaggtcatgttttagcggattgcaagcgtggggatgtggtttgttataactg 13317858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 16754096 - 16754259
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  16754096 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 16754195  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16754196 gtgtttctgctttgggtcttgagt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 16754259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 16804342 - 16804505
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  16804342 aatgaggatcgtttgatcagatgtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 16804441  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16804442 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 16804505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 20059449 - 20059612
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  20059449 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 20059548  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20059549 gtgtttctgctttgggtcttgagt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 20059612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6603470 - 6603376
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgcttt 286  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  6603470 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacccattgctttattgcttt 6603376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 286
Target Start/End: Original strand, 53382413 - 53382507
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgcttt 286  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  53382413 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 53382507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 282
Target Start/End: Original strand, 26790781 - 26790898
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    || ||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  26790781 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 26790880  T
Q  265 ctacacattgtttcattg 282  Q
    |||| |||||||| ||||    
T  26790881 ctacgcattgttttattg 26790898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 5422359 - 5422419
Alignment:
Q  226 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgcttt 286  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  5422359 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 5422419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16694899 - 16694736
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  16694899 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcccttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 16694800  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |  |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  16694799 gtgtttctgcgttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagc 16694736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 295
Target Start/End: Original strand, 23079427 - 23079515
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgc 295  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  23079427 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgc 23079515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 14578776 - 14578966
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||   |||||||| | | | ||||||| ||| |||||  || ||| ||| |||||| || ||||||| ||  || |||    
T  14578776 tttgctttgactggtactcagactgagaatgaggatcatttgatcagagctacatgttttattgataatacacctttagttactattattgatcctagtg 14578875  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||| |||||| | || ||||| | ||||||||||||     | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14578876 ctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttcccatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 14578966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11861094 - 11861033
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctac 268  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  11861094 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 11861033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12501839 - 12501719
Alignment:
Q  21 aagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccatatcagta 120  Q
    ||||| || ||| |||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  || ||||| || |||||  ||||  ||     
T  12501839 aagaaatgtttccggtgtggcaagaagggtcacacattagctgattgcaagcatggtgatattgtgtgtttcaattgcaaggaagagggaaatattggtt 12501740  T
Q  121 ctcagtgcacacagccgaaga 141  Q
    |||||||||  ||||||||||    
T  12501739 ctcagtgcaagcagccgaaga 12501719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 97
Target Start/End: Original strand, 10417250 - 10417334
Alignment:
Q  13 aagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactg 97  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||| |||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  10417250 aagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaaaggtcatgtgttggcggattgcaagcgtggagatattgtttgttttaactg 10417334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17492479 - 17492423
Alignment:
Q  299 taagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17492479 taagttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 17492423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22054230 - 22053882
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22054230 gtaccaaggatgagaagaagtgcttcagatgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaaga 22054131  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||  |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22054130 gggccatatcagtacacagtgcacacagccgaagaaggatagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 22054031  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22054030 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 22053931  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22053930 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 22053882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 22027694 - 22028042
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| | || || ||||| || ||||||| ||| || ||    
T  22027694 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacacattagctgattgtaagaggggagacgttgtttgctataactacaatgaaga 22027793  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22027794 gggccatatcagttctcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgcattgaccggtacgcagactactaatgaggaccgactt 22027893  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22027894 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 22027993  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22027994 gtttggttttatcttatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 22028042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 90 - 355
Target Start/End: Original strand, 29300923 - 29301188
Alignment:
Q  90 tataactgcaacgaggagggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagacta 189  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||| ||||||| || ||||||||||| | ||  | | |||||||  ||||| | ||| | |||||||||||||    
T  29300923 tataactgcaatgaagaaggtcatatcagttctcagtgtactcagccgaagaaggctaggatcggtgggaaagtgttttcattgacgggtacgcagacta 29301022  T
Q  190 ctaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttaga 289  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29301023 caaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttaga 29301122  T
Q  290 atgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29301123 atgtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 29301188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Original strand, 16268643 - 16268986
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||||| ||||||||||| ||| |||| || || || ||||| |  ||||| |    
T  16268643 aaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcatagcctagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtc 16268742  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    |||||||| | |||||  |  |||||||||| | || |||  |||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16268743 atatcagttcacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcag 16268842  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  16268843 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttg 16268942  T
Q  312 attgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16268943 gatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 16268986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 31413953 - 31414294
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||| |||| || ||||   ||||||| || |||||||| ||  |||| || || ||||||||||| || || |||    
T  31413953 agatgagaggaagtgttttaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggtcat 31414052  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | ||||| || ||| ||||||| | || |||| |||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31414053 atcagttcacagtgtactcagtcgaagaaggctagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtatgcagactactaatgaggaccgacttatcagag 31414152  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| ||      
T  31414153 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctaatgaatgtgcttataagttgggtttgga 31414252  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31414253 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 31414294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 28984271 - 28983930
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| | ||| || |||    
T  28984271 agatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcat 28984172  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | |||||  |  ||||||||||   || ||   |||| ||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28984171 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctctgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagag 28984072  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||      
T  28984071 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttgga 28983972  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28983971 tatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 28983930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22374228 - 22373888
Alignment:
Q  15 gatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccata 114  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||  |||| || ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||  | || || || ||||    
T  22374228 gatgaaaagaagtgttttaggtgtggaaagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtggtgatattgtttgctataattgtgatgaagaaggtcata 22374129  T
Q  115 tcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagagg 214  Q
    | ||  | |||||||   |||| ||||| | |  |||  |||| ||| ||||||||||| ||||||| || |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  22374128 ttagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacccaaactgttaatgaggaccgacttatcagagg 22374029  T
Q  215 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgatt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | | || ||||||||||||||||||||  ||    
T  22374028 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatagtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctagtt 22373929  T
Q  315 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22373928 atatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagc 22373888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21928788 - 21928447
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||  |||| || ||||  || | ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||  | || ||||| |||    
T  21928788 agatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacactttgggtgattgcaagcgtggtgatgtcgtttgctataattgtgatgaagaggggcat 21928689  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||  | || ||||   |||| ||||| |||   ||  |||| ||| ||||||||||| || ||| ||| |||   ||||| ||||| ||||||||||    
T  21928688 attagctcacaatgcaagaagcccaagaaggttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactagtaagcaaactgtgaatgaagaccgacttatcagag 21928589  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |    
T  21928588 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggt 21928489  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21928488 tatatctgatatgaatggcgaaatggttgttgaaactccagc 21928447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 154 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 28989350 - 28989149
Alignment:
Q  154 gtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 253  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28989350 gtggaaaggtgtttgctctgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 28989251  T
Q  254 agacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
     || ||||||||||| || ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28989250 tgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgatactcca 28989151  T
Q  354 gc 355  Q
    ||    
T  28989150 gc 28989149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19985539 - 19985199
Alignment:
Q  15 gatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccata 114  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||  ||||  | ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| ||  | || ||||| ||||    
T  19985539 gatgagaagaagtatttcagatgtggacagaaatgacacacattagctgattgcaagagtggggatgttgtttgctataattgtgatgaagaggggcata 19985440  T
Q  115 tcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagagg 214  Q
    | ||  | |||||||   |||| ||||| |||   ||  |||| ||| | ||||| ||| || |||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||    
T  19985439 ttagctcacagtgcaagaagcctaagaaggttcggacaggtggcaaggtatttgcattgactagtacgcagactgtgaataaggaccgacttatcagagg 19985340  T
Q  215 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgatt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| || ||    
T  19985339 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtttggtt 19985240  T
Q  315 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19985239 atatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagc 19985199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 154 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20391306 - 20391105
Alignment:
Q  154 gtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 253  Q
    |||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20391306 gtggaaaggtgtttgcattgactggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctattat 20391207  T
Q  254 agacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||| |  | |||| |||||||||||||||| || | ||   ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  20391206 tgatactggtgctacacattgattcattgctgttaattgtgaatataagttgggtctggttatgtcaagtattagtggagaaatggttgttgaaactcca 20391107  T
Q  354 gc 355  Q
    ||    
T  20391106 gc 20391105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27357665 - 27357555
Alignment:
Q  245 tgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgtt 344  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27357665 tgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgtt 27357566  T
Q  345 gaaactccagc 355  Q
    |||||||||||    
T  27357565 gaaactccagc 27357555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19981149 - 19980986
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  19981149 aatgaggatcggctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 19981050  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| | ||  ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19981049 gtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 19980986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 210 - 310
Target Start/End: Original strand, 22375071 - 22375171
Alignment:
Q  210 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc 309  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | || ||||| | |||||||||||    
T  22375071 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgatattgattgtgcttctaagttgggtc 22375170  T
Q  310 t 310  Q
    |    
T  22375171 t 22375171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 22421506 - 22421654
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| | ||||||||    
T  22421506 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 22421605  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||   | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22421606 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 22421654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 17671621 - 17671784
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  17671621 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 17671720  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17671721 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 17671784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 22126531 - 22126721
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  22126531 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 22126630  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22126631 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 22126721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 21391433 - 21391623
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    || ||||| ||| | |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||    
T  21391433 tttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 21391532  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| ||| |||  || |||||   ||||||||||||  |  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21391533 ctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagc 21391623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 21780759 - 21780949
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    || ||||| ||| | |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||    
T  21780759 tttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 21780858  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| ||| |||  || |||||   ||||||||||||  |  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21780859 ctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagc 21780949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 20015862 - 20016025
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  20015862 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 20015961  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20015962 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 20016025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21254154 - 21253964
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||    
T  21254154 tttgctttgactggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 21254055  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||| ||| |||||||  || |||||   ||||||||||||  |  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  21254054 ctacgcattattttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagc 21253964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 237 - 355
Target Start/End: Original strand, 21785999 - 21786117
Alignment:
Q  237 cctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaa 336  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||   ||||||||||||  |  | ||||||||||| |||||||    
T  21785999 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21786098  T
Q  337 tggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21786099 tggttgttgaaactccagc 21786117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22031285 - 22031124
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  22031285 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 22031186  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  22031185 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 22031124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 229 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22523691 - 22523565
Alignment:
Q  229 atagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaa 328  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| | ||||||||||||   | | ||  |||||||    
T  22523691 atagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaa 22523592  T
Q  329 aggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22523591 tggagagatggttgtcgaaactccagc 22523565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22990254 - 22990064
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||  ||| | ||||| |||||| |||||||||| || ||| |||    
T  22990254 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgacagtacacctttagttgctattattgatactagtg 22990155  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||||||||| |||||| | || ||||| |  |||||||||||   | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22990154 ctaaacattgttttattgctattgattgtgcttcaaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 22990064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 32603325 - 32603164
Alignment:
Q  194 tgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgt 293  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||    
T  32603325 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgt 32603226  T
Q  294 gcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  32603225 gtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 32603164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19115582 - 19115419
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  19115582 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 19115483  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  19115482 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagc 19115419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 30310743 - 30310906
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  30310743 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgatt 30310842  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  30310843 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagc 30310906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 22117747 - 22117937
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| | | | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  22117747 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 22117846  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||  |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22117847 ctacgcattgttttattgctttcgatcgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 22117937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18859744 - 18859596
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  18859744 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18859645  T
Q  307 gtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  18859644 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 18859596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 19481671 - 19481834
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  19481671 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 19481770  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19481771 gtgtttctgctttgggtcttgagt-tgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagc 19481834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 22129189 - 22129379
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    |||||| || ||||||| ||||| |  |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||| ||||| |||||||||| || |||||||    
T  22129189 tttgctctggctggtactcagacaaagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctagattaataatactgctttagttgctattattgatactggtg 22129288  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
     ||||||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  22129289 ttacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggacagatggttgtcgaaactccagc 22129379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22043009 - 22042846
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||| |||| || |    
T  22043009 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatttcttttgatt 22042910  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22042909 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tttctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagc 22042846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 355
Target Start/End: Original strand, 22245585 - 22245777
Alignment:
Q  163 tgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 262  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||  ||||||  | | | |    
T  22245585 tgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttatattattcatattag 22245684  T
Q  263 tgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||| |||||| | || ||||| | ||||||||||||   | | ||  ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  22245685 tgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagc 22245777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 355
Target Start/End: Original strand, 22246003 - 22246195
Alignment:
Q  163 tgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 262  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||  ||||||  | | | |    
T  22246003 tgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttatattattcatattag 22246102  T
Q  263 tgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||| |||||| | || ||||| | ||||||||||||   | | ||  ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  22246103 tgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagc 22246195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15536565 - 15536402
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||  |||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  15536565 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaatgatactccgttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 15536466  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
     ||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15536465 atgtttctgccttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 15536402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Original strand, 14283332 - 14283684
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14283332 gtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacacattagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaaga 14283431  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14283432 gggtcatatcagcacacagtgcccacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggactgtctt 14283531  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14283532 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttcattgctattatagacattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 14283631  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 359  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14283632 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactctagccaag 14283684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 55 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14140922 - 14140622
Alignment:
Q  55 tgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccag 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |    
T  14140922 tgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataattgtaacgaagagggccacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagaactgg 14140823  T
Q  155 tgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattata 254  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14140822 tgggaaggtatttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaaagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattata 14140723  T
Q  255 gacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccag 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14140722 gacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgagtgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccag 14140623  T
Q  355 c 355  Q
    |    
T  14140622 c 14140622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 11385387 - 11385735
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  || ||| | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||  | |||||    
T  11385387 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgatgagga 11385486  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    |||||| |||||| | |||||||| || || |||||  ||| |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  11385487 gggccacatcagttcacagtgcactcaaccaaagaagattagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacagactt 11385586  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11385587 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgatgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 11385686  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11385687 gtctgattgtatttgatatgaaaggagagatggttgttgaaactccagc 11385735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 18050911 - 18051259
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||    
T  18050911 gtaccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgttataattgtaatgaaga 18051010  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    |||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  18051011 gggtcacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctc 18051110  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18051111 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgg 18051210  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18051211 gtttgattgtgtctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagc 18051259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13676737 - 13676394
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||| ||||| || ||  | || || ||||||||||| ||||||||||    
T  13676737 aaagatgagaagaagtacttcaggtgtggacagaagggacacacattagctgattgtaagcggggagacatagtttgctataactgcaatgaggagggcc 13676638  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    |||||||| | |||||  |||| |||||||| |||| |||| |||| ||  |||||||| || |||||||||| || |||| |||||| || ||||||||    
T  13676637 atatcagttcacagtgtgcacaaccgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcag 13676538  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  13676537 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctg 13676438  T
Q  312 attgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13676437 gttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 13676394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 15099568 - 15099909
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||| |||||| |||||||| ||  | || |||||||||||||| ||||| || |||    
T  15099568 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacactctagatgattgtaagcgtggggacatcgtttgttataactgcaatgaggaaggtcat 15099667  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | ||||| || ||||||||||| ||||  ||  |||| ||| ||||||||||  |||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||     
T  15099668 atcagttcgcagtgtacgcagccgaagaaggttaggacaggtggtaaggtgtttgctttaactggtatgcagacagttaatgaggaccgacttatcagat 15099767  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||  |    
T  15099768 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagt 15099867  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15099868 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 15099909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13024626 - 13024288
Alignment:
Q  16 atgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccatat 115  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||   ||||||| || |||||||| ||  |||| || || ||||||||||| || || |||||    
T  13024626 atgagaggaaatgtttcaggtgtggttagaaaggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaacgaagaaggtcatat 13024527  T
Q  116 cagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggt 215  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||| | ||  ||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13024526 cagttctcagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggt 13024427  T
Q  216 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattg 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||  ||    
T  13024426 acttgtttctttaatag-actcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttggatg 13024328  T
Q  316 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13024327 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 13024288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 26091763 - 26092104
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| | ||| || |||    
T  26091763 agatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcat 26091862  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | |||||  |  ||||||||||   || ||   |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26091863 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 26091962  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||      
T  26091963 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 26092062  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26092063 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 26092104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15343566 - 15343374
Alignment:
Q  163 tgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 262  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15343566 tgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 15343467  T
Q  263 tgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15343466 tgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 15343374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 16947437 - 16947778
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||| ||||||  | ||||||||| |||| || ||||   ||||||| || |||||||| ||  |||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  16947437 agatgagaggaagtgtgttaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctacaactgcaacgaagagggtcat 16947536  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | ||||| |  |||| |||||| | || |||| |||||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16947537 atcagttcacagtgtattcagctgaagaaggctagaaccggtgggaaagtgtttgcattgaatggtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagag 16947636  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||      
T  16947637 gtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttgga 16947736  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16947737 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 16947778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 49155585 - 49155244
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| | ||| || |||    
T  49155585 agatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcatagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcat 49155486  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | |||||  |  ||||||||||   || ||   |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  49155485 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 49155386  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||      
T  49155385 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 49155286  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49155285 tatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 49155244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 355
Target Start/End: Original strand, 13965646 - 13965974
Alignment:
Q  27 tgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccatatcagtactcagt 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||| |||| || || || ||||| |  ||||| ||||||||| | ||||    
T  13965646 tgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtctagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagt 13965745  T
Q  127 gcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctt 226  Q
    |  |  |||||||||| | || |||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13965746 gtcctgagccgaagaaggctagaactggtgggaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctt 13965845  T
Q  227 taatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  13965846 taatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatg 13965945  T
Q  327 aaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13965946 aaaggggaaatggttgttgaaactccagc 13965974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 12798466 - 12798803
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  |||||||||||  ||||||| |||||||| || || ||||| || || || || |||    
T  12798466 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtgagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaagaaggtcat 12798565  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | ||||| |||||||| ||||| | ||  ||  |||| ||| | ||||| ||| |||||||||| ||    ||||||||||| ||||||||||    
T  12798566 atcagttcgcagtgtacacagcctaagaaggctaggacaggtggcaaggtttttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagag 12798665  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| |    
T  12798666 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggt 12798765  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactc 351  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12798766 tgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactc 12798803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 40924782 - 40925123
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| | ||| || |||    
T  40924782 agatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcat 40924881  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | |||||  |  ||||||||||   || ||   | || ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  40924882 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 40924981  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||      
T  40924982 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttgga 40925081  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40925082 tatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 40925123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21755698 - 21755355
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||| |||| || || |||||||| |  ||||| |    
T  21755698 aaagatgagaggaagtgtttcaggtgtggtcagaagggtcacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtctgctacaactgcaatggagagggtc 21755599  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    |||| ||  | |||||  |  |||||||||| |||| |||  | || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21755598 atattagctcacagtgtcctgagccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcag 21755499  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  21755498 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttg 21755399  T
Q  312 attgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
      ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21755398 gatgtatctgatatggaaggggaaatggttgttgaaactccagc 21755355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 26115555 - 26115896
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| || ||||| |  || || |||    
T  26115555 agatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcat 26115654  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||||| |||||  |  | ||||||||   || |||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||    
T  26115655 attagtacacagtgtcctgaaccgaagaagactagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcacactcctaatgaggaccgactcatcagag 26115754  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||      
T  26115755 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 26115854  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26115855 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 26115896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 14261211 - 14261552
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| || |||| || ||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| || || ||||| || ||||| || |||    
T  14261211 agatgagaagaagtactttaggtgtagtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacat 14261310  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | ||||  |  ||||| ||||| ||||  ||  |||| ||| | ||||| ||| |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  14261311 attagttcgcagtttatgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaactatgaatgaggaccgacttatcagag 14261410  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | | || || |||||||||||||||||| |    
T  14261411 gtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgagcatataagttgggtctggt 14261510  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14261511 tgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagc 14261552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12459912 - 12459571
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||| ||| || || ||||||||| ||||||| ||||   ||||||| || |||||||| ||  |||| || ||||||||||| || || || |||    
T  12459912 agatgagaggaaatgttttaggtgtggtcagaagggacacaccctagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgcaatgaagaaggtcat 12459813  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | ||||| || ||||||||||| || |  ||| | |||||  ||||||  |||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12459812 attagttcacagtgtactcagccgaagaaggtcaggaccggagggaaagtgtttgaattgaaaggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagag 12459713  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||      
T  12459712 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactaattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 12459613  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12459612 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 12459571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19150295 - 19149954
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| || || ||||| || || || || |||    
T  19150295 agatcagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggagatattgtttgctacaactgtaatgaagaaggacat 19150196  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | ||||| || || || ||||| | ||  |   |||| ||  | ||||| ||| |||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||    
T  19150195 attagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggctaggataggtggtaaagtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagag 19150096  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| | | || |||||||||||||| |||||| |    
T  19150095 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttaggtctggt 19149996  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19149995 tgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagc 19149954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20749694 - 20749353
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| || || ||||| || || || || |||    
T  20749694 agatcagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggagatattgtttgctacaactgtaatgaagaaggacat 20749595  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | ||||| || || || ||||| | ||  |   |||| ||  | ||||| ||| |||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||    
T  20749594 attagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggctaggataggtggtaaagtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagag 20749495  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| | | || |||||||||||||| |||||| |    
T  20749494 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttaggtctggt 20749395  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20749394 tgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagc 20749353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 233
Target Start/End: Original strand, 12712621 - 12712847
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||    
T  12712621 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacgtgttagctgattgcaaacgtggtgatattgtatgctataactgcaatgggga 12712720  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||| ||||||| | |||||||||| || | |||||| ||||  ||||| |||||  ||||||| ||| | |||||||| || || ||| | ||  | |||    
T  12712721 gggtcatatcaattctcagtgcactcaacggaagaaggttaggaccagcgggaaagtgtttgccttggcgggtacgcaaaccacaaatcaagatagactt 12712820  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12712821 atcagaggtacttgtttctttaatagt 12712847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 351
Target Start/End: Original strand, 12203942 - 12204102
Alignment:
Q  191 taatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaa 290  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||     
T  12203942 taatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgttgttgat 12204041  T
Q  291 tgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactc 351  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||   |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12204042 tgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactc 12204102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 14144952 - 14144870
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgt 89  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14144952 gtaccaaggaggagaagaagtgcttcaggtgtggtcaaaagggtcacgtgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgt 14144870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 44788516 - 44788679
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  44788516 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 44788615  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  44788616 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 44788679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 15146061 - 15146251
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||   |||||||| ||  | | ||||||||| ||||   ||||||| || |||||| |||||||||| || |||||||    
T  15146061 tttgctttgactggtactcagactgagaatgaggatcgcttgagcagaggtacatgttatattaatagaacacctttagttgctattattgatactggtg 15146160  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||| | || ||||| | ||||||||||||   | | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15146161 ctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttgctttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 15146251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 354
Target Start/End: Original strand, 17703593 - 17703782
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| ||| | ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||| |||    
T  17703593 tttgctttggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtg 17703692  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccag 354  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  17703693 ctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccag 17703782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 8710710 - 8710547
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  8710710 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 8710611  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8710610 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 8710547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14335501 - 14335338
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  14335501 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 14335402  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14335401 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 14335338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 355
Target Start/End: Original strand, 11550268 - 11550430
Alignment:
Q  193 atgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatg 292  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||    
T  11550268 atgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcttttgattg 11550367  T
Q  293 tgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || || |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11550368 tgtatctgccttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 11550430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13689173 - 13688983
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    || ||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  13689173 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 13689074  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13689073 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtgtctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 13688983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 18587336 - 18587499
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  18587336 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 18587435  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  18587436 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 18587499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 11234351 - 11234541
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    || ||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||  | |||||||    
T  11234351 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattaatactggtg 11234450  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11234451 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 11234541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15627673 - 15627538
Alignment:
Q  148 aaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 247  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||    |||||||||||  | || | |||||| || |||||| ||||||||||||||||| |    
T  15627673 aaactagtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgattataggtacatgcttctttgatagtactcctttaattac 15627574  T
Q  248 tattatagacactggtgctacacattgtttcattgc 283  Q
    |||||| || ||||||| ||| |||||||| |||||    
T  15627573 tattattgatactggtgatacgcattgttttattgc 15627538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 9591469 - 9591375
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgcttt 286  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9591469 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgcttt 9591375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14957644 - 14957496
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  14957644 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 14957545  T
Q  307 gtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14957544 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagc 14957496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 286
Target Start/End: Original strand, 16726579 - 16726700
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||| |||    
T  16726579 tttgctttggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgatatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtg 16726678  T
Q  265 ctacacattgtttcattgcttt 286  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  16726679 ctacacattgctttattgcttt 16726700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 352
Target Start/End: Original strand, 15158195 - 15158382
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    || ||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  15158195 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 15158294  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 352  Q
    |||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  15158295 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactcc 15158382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18180848 - 18180685
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  18180848 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 18180749  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  18180748 gtgtttctgctttgggtcttgagt-tatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 18180685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14042785 - 14042682
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||   ||||||||    
T  14042785 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgg 14042686  T
Q  307 gtct 310  Q
    ||||    
T  14042685 gtct 14042682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14352815 - 14352712
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||   ||||||||    
T  14352815 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgg 14352716  T
Q  307 gtct 310  Q
    ||||    
T  14352715 gtct 14352712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 263556 - 263208
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  263556 gtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaaggatggtgatgttgtatgttataactgtaacgaaga 263457  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  263456 gggccatatcagtacacagtgcacacagtcgaagaaggttagaactagtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggctt 263357  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  263356 attagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 263257  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  263256 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 263208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 9761 - 10108
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9761 gtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcaccttttagcggattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaaga 9860  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||  |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  | |||    
T  9861 gtgccatatcagtacacagtgcacactgccgaagaaggttagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgat-ataggctt 9959  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9960 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 10059  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 10108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 203711 - 203363
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  203711 gtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaaggatggtgatgttgtatgttataactgtaacgaaga 203612  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  203611 gggccatatcagtacacagtgcacacagtcgaagaaggttagaactagtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggctt 203512  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  203511 attagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgg 203412  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  203411 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 203363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 424438 - 424362
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgc 283  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  424438 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgc 424362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 7 - 352
Target Start/End: Original strand, 6231 - 6576
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||  |    
T  6231 gtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacgtgctagctgattgtaagcgtggcgatattgtatgctataattgtaacgaata 6330  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||  |||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6331 gggccacatcagtactcagtgcacacaacagaagaaggttagaactggtggaaaggtatttgctttgactggtacacagactactaatgaggaccgtctt 6430  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6431 atcagaggtacttgtttctataatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgg 6530  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 352  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6531 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 6576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 19716528 - 19716876
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  19716528 gtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtagtgatgttgtttgttataactgcaacaaaga 19716627  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  19716628 gggccatatcagttcgcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgactt 19716727  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  19716728 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 19716827  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19716828 gtttagttgtatctgatttgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 19716876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12577285 - 12576937
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||    
T  12577285 gtaccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataattgtaatgaaga 12577186  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    |||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||     
T  12577185 gggtcacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgcctc 12577086  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  12577085 atcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcctataaactgg 12576986  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12576985 gtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 12576937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 23097529 - 23097877
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||  || ||| | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||  | |||||    
T  23097529 gtaccaaagatcagaagaagtgcttcaagtgtggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgatgagga 23097628  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    |||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||  ||| |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  23097629 gggccacatcagttcacagtgcactcagccaaagaagattagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggctt 23097728  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23097729 ataagaggtacttgattctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatttaagttgg 23097828  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23097829 gtctggttgtaactgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagc 23097877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23274525 - 23274177
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||| ||||| || ||  | || || ||||||||||| |||||    
T  23274525 gtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggacacacattagctgattgtaagcggggagacatagtttgctataactgcaatgagga 23274426  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||  ||  |||| ||  |||||||| || |||||| ||| || |||| |||||| || |||    
T  23274425 gggccatatcagttcacagtgcacacaaccgaagaaggttaggactggtggtaaagtgtttgctctgactggtatgcaaaccactagtgaggatcgactt 23274326  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  23274325 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 23274226  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23274225 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 23274177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20848514 - 20848173
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| | ||| || |||    
T  20848514 agatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcat 20848415  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | |||||  |  ||||||||||   || ||   |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20848414 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 20848315  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||      
T  20848314 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 20848215  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20848214 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 20848173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 281
Target Start/End: Original strand, 19721091 - 19721365
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  19721091 gtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtagtgatgttgtttgttataactgcaacaaaga 19721190  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  19721191 gggccatatcagttcgcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgactt 19721290  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcatt 281  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19721291 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 19721365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 204 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23113458 - 23113309
Alignment:
Q  204 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagt 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||| |    
T  23113458 cttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataaat 23113359  T
Q  304 tgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    |||||||| || | ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23113358 tgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactcca 23113309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19817633 - 19817502
Alignment:
Q  153 agtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 252  Q
    ||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  19817633 agtgggaatgtgtttgctttagctggtactcagacatcgaatgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactacta 19817534  T
Q  253 tagacactggtgctacacattgtttcattgct 284  Q
     ||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  19817533 cagatactggtgctacacattgctttattgct 19817502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17001747 - 17001584
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  17001747 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 17001648  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17001647 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 17001584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 284
Target Start/End: Original strand, 30208616 - 30208708
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgct 284  Q
    |||||||| | ||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  30208616 aatgaggatcatctgatcaaaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattgttttattgct 30208708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 9338329 - 9338166
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  9338329 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 9338230  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  9338229 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 9338166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 9486963 - 9486800
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  9486963 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 9486864  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  9486863 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 9486800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16983987 - 16983824
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  16983987 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 16983888  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16983887 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 16983824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 21322962 - 21323125
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  21322962 aatgaggatcgcctaatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 21323061  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| | ||  ||||||||  || | ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21323062 gtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagc 21323125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 11351422 - 11351570
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| | ||  ||||    
T  11351422 atcagaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 11351521  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||   | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11351522 gtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 11351570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 22323038 - 22323201
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  22323038 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 22323137  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22323138 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 22323201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 22742677 - 22742825
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| | ||  ||||    
T  22742677 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattggtactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 22742776  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22742777 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 22742825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24712781 - 24712618
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  24712781 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 24712682  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24712681 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 24712618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 44383266 - 44383429
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  44383266 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 44383365  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  44383366 gtgtttctgttttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 44383429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 24705151 - 24705341
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||| |||||| || |||||||    
T  24705151 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgatattattgatactggtg 24705250  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||  | ||  ||||||| ||||| | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  24705251 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatgcagagatggttgtcgaaactccagc 24705341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 353
Target Start/End: Original strand, 22733485 - 22733631
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||| || |||||||| || |||||   ||||||||    
T  22733485 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcgttgatttattgcttttgattgtgctactaagttgg 22733584  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    ||||  |  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22733585 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactcca 22733631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 10871597 - 10871437
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  10871597 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 10871498  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 352  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  10871497 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactcc 10871437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23065145 - 23064997
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||   ||||||||    
T  23065145 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgg 23065046  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||   | | ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||    
T  23065045 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagc 23064997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23074595 - 23074447
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||   ||||||||    
T  23074595 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgg 23074496  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||   | | ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||    
T  23074495 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagc 23074447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 355
Target Start/End: Original strand, 24817575 - 24817699
Alignment:
Q  231 agtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaag 330  Q
    |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||| | |||||||||||| |   | ||  ||||||| |    
T  24817575 agtactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatg 24817674  T
Q  331 gagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  24817675 gagaaatggttgtcgaaactccagc 24817699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27374016 - 27373853
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  27374016 aatgaggatcgtttgatcagatgtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 27373917  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27373916 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 27373853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 23105397 - 23105587
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||   || ||||| ||| | | |||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| |  |||||||    
T  23105397 tttgctttgactggtacacagactgagaacgaggatcgtttgaccagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgttactggtg 23105496  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| ||| |||  || |||||   ||||||||||||  |  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23105497 ctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagc 23105587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27220745 - 27220600
Alignment:
Q  210 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc 309  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   |||||||    
T  27220745 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 27220646  T
Q  310 -tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
     ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27220645 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 27220600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24265144 - 24265023
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    || ||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  24265144 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 24265045  T
Q  265 ctacacattgtttcattgcttt 286  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  24265044 ctacgcattgttttattgcttt 24265023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 45673723 - 45673871
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  45673723 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggagctacgcattgttttattgctttcgattgtgattctgctttgg 45673822  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  45673823 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 45673871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 355
Target Start/End: Original strand, 23029191 - 23029320
Alignment:
Q  226 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatat 325  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| | |   ||||||||  || | ||||||||    
T  23029191 ttaataatactcccttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 23029290  T
Q  326 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  23029291 gaatggagtgatggttgtcgaaaatccagc 23029320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 24874461 - 24874609
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| || ||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  24874461 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 24874560  T
Q  307 gtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24874561 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 24874609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 24657354 - 24657517
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||| ||| |||||||||| || || | |||||| |||||||| |||||||| || |    
T  24657354 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactccattagttgctattattgatacagctgctacgcattgttttattgctttcgatt 24657453  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | ||  |||| || ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24657454 gtgtttctactttggatcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 24657517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24678219 - 24678071
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   | |||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||| | ||  ||||    
T  24678219 atcagaggtacttgctatatgaataatactcctttagttgctattaatgatactggtgctaggcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 24678120  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||   | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  24678119 gtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaacttcagc 24678071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 115
Target Start/End: Original strand, 24657182 - 24657277
Alignment:
Q  20 gaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccatat 115  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||| | || |||| |||  |||| |||||||| |||||    
T  24657182 gaagaagtgtttccggtgtggcaagaagggtcacacattagctgattgcaaacatggtgatatcgtgtgttttaatggcaaagaggagggtcatat 24657277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22280841 - 22280777
Alignment:
Q  203 tcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgcta 267  Q
    ||||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  22280841 tcttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgcta 22280777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 273
Target Start/End: Original strand, 22739363 - 22739431
Alignment:
Q  205 ttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacatt 273  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  22739363 ttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 22739431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 461 - 809
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||   |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  461 gtaccaaggatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacagcctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgcaatgaaga 560  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  561 gggccatatcagttcacagtgcacacagccgaagaaggttagaaccgatgggaaagtgtttgcattgactggtacacagactactaatgaggaccgactt 660  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  661 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaaactggtgctacacaatgtttaattgctatagaatgtgcatataagatgg 760  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  761 gtataaaaatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21144 - 20796
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||| |||||| ||||| || ||  |  | || ||||||||||| |||||    
T  21144 gtactaaaggtgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggacacacattagttgattgtaagcggggagacataatttgctataactgcaatgagga 21045  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||| ||  |||||||| || |||||||||| || |||| |||||| |  |||    
T  21044 gggccgtatcagttcacagtgtacacaaccgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggatctactt 20945  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  20944 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 20845  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20844 gtctggtcgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 20796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 38)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 14377032 - 14377380
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  14377032 gtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctaattgtaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaaga 14377131  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    |||||| |||||| | || || |||||||||||||| |||| |||| |||| ||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  14377132 gggccacatcagttcgcaatgtacacagccgaagaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgactt 14377231  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  14377232 atcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 14377331  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14377332 gtttggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 14377380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19438167 - 19437819
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19438167 gtactaaagatgagaataagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaaga 19438068  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    | ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||| |||||||| || |||||||||| || |||| | |||| || |||    
T  19438067 gcgccatatcagttcgcagtgcacacagccgaagaaggttaggactagtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtaaggatcgactt 19437968  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||     
T  19437967 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttga 19437868  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19437867 gtctagttgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagc 19437819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18797850 - 18797511
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||    
T  18797850 aaagatgagcagaaatgtttcaggtgtggtcagaagggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgctataactgcaatgatgaaggcc 18797751  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    |||||||| | |||||||| || || ||||| |||| |||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  18797750 atatcagttcacagtgcactcaaccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcag 18797651  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18797650 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtttg 18797551  T
Q  312 attgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactc 351  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18797550 attgtatctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactc 18797511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 352
Target Start/End: Original strand, 34642702 - 34643047
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||| | |||    
T  34642702 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacgtgttagctgattgtaaacgtggtgatattgtatgctacaactgcaatgggga 34642801  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||  ||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||| ||  | ||||| ||  | |||    
T  34642802 gggtcatatcagttctcagtgcactcaaccgaagaaggttaggaccggtgggaaagtgtttgccttggctggtacgcaaaccgcgaatgaagatagactt 34642901  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||    
T  34642902 atcagaggtacttgtttctttaatagtatccctttaatcgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcttataaactgg 34643001  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 352  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34643002 gtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactcc 34643047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15462499 - 15462149
Alignment:
Q  9 accaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagg 108  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| || ||| |||| |||||  |||| ||||| |||||||| || ||| | || |||||||||||    |||||||    
T  15462499 accagagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaaaggtcatgtgttggctgagtgcaagcggggagatatcgtgtgttataactgtggtgaggagg 15462400  T
Q  109 gccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttat 208  Q
    |||| || ||| | |||||||| || || ||||| || | |||  | || ||  | ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  15462399 gccacattagttcgcagtgcacgcaacctaagaaggtcagaactggaggaaaagtatttgccttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttat 15462300  T
Q  209 cagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15462299 cagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggt 15462200  T
Q  309 ctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15462199 ctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 15462149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 21567107 - 21567455
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  || ||| | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||  |  ||||    
T  21567107 gtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgataagga 21567206  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    |||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||  ||| |||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||    
T  21567207 gggccacatcagttcccagtgcactcagccaaagaagattagaaccggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaataaggacatgctt 21567306  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21567307 atcagaggtacttgtttctttaatagtacttattcaattgctattatagacactggtactactcattgtttcattgctttagaatgtgcatattagttgg 21567406  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21567407 gtttgattgtaactgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagc 21567455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 354
Target Start/End: Original strand, 24515530 - 24515877
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | ||||   |||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24515530 gtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaagacacacactagctgattggaagaggggagatgttgtttgttataactgcaatgagga 24515629  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
     || || |||||| | ||||| || || |||| ||  ||||  ||| |||| ||  ||||| || || |||||||||| || |||| |||||| || |||    
T  24515630 aggtcacatcagttcgcagtgtacgcaaccgaggacggttaggaccggtggtaacgtgttttctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgactt 24515729  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||    
T  24515730 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgg 24515829  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccag 354  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24515830 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccag 24515877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19466326 - 19465985
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| || ||||   ||| |||||| |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || |||    
T  19466326 agatgagaagaagtgcttcaggtggtgtcagaaaggacacacactagatgattgtaagcgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcat 19466227  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| |  |||| || || || ||||| ||||  ||| |||| ||  |||||||| || |||||||||| || |||| ||||||   |||||||||||    
T  19466226 attagttcgtagtgtactcaaccaaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggattttcttatcagag 19466127  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |    
T  19466126 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggt 19466027  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19466026 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 19465985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19456181 - 19455840
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| || ||||   ||| |||||| |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || |||    
T  19456181 agatgagaagaagtgcttcaggtggtgtcagaaaggacacacactagatgattgtaagcgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcat 19456082  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| |  |||| || || || ||||| ||||  ||| |||| ||  |||||||| || |||||||||| || |||| ||||||   |||||||||||    
T  19456081 attagttcgtagtgtactcaaccaaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggattttcttatcagag 19455982  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |    
T  19455981 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggt 19455882  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19455881 tgtatctgatatgaaaggtgaaatggttgttgaaactccagc 19455840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24367558 - 24367217
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| |  || || |||    
T  24367558 agatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcggggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcat 24367459  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | |||||| |  | |||||||||  || |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24367458 attagttcacagtgccctgaaccgaagaaaactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 24367359  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||| |      
T  24367358 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatatcagttgggtccgga 24367259  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24367258 tatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 24367217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 10465971 - 10466312
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||| ||| || || ||||||||| ||||||| ||||   ||||||| || |||||||| ||  |||| || ||||||||||| || || || |||    
T  10465971 agatgagaggaaatgttttaggtgtggtcagaagggacacaccctagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgcaatgaagaaggtcat 10466070  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | ||||| || ||||||||||| || |  ||| | |||||  ||||||  |||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10466071 attagttcacagtgtactcagccgaagaaggtcaggaccggagggaaagtgtttgtattgatcggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 10466170  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||      
T  10466171 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgttgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttgga 10466270  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10466271 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 10466312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 154 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21474618 - 21474417
Alignment:
Q  154 gtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 253  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474618 gtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacttctaatgaggaccgacttatcagaggtatttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 21474519  T
Q  254 agacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||| | | || ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  21474518 agatactggtgctactcattgtttgattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatagaaaaatggttgttgaaactcca 21474419  T
Q  354 gc 355  Q
    ||    
T  21474418 gc 21474417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 355
Target Start/End: Original strand, 19486557 - 19486758
Alignment:
Q  154 gtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 253  Q
    |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19486557 gtggaaagttgtttgcattgactggtacgcaaacatttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttattat 19486656  T
Q  254 agacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |  | ||   |||||   |||||||||||||||||||||||    
T  19486657 tgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggtcatgtcaagtatgagtagagaaatggttgttgaaactcca 19486756  T
Q  354 gc 355  Q
    ||    
T  19486757 gc 19486758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 25770862 - 25770661
Alignment:
Q  154 gtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 253  Q
    |||| ||| ||||| ||||| || ||| ||| |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25770862 gtggcaaggtgtttcctttgactagtaagcaaactgttaataaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 25770763  T
Q  254 agacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    ||| | ||||||||  ||||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25770762 agatattggtgctattcattgtttcattgttgttgattgtgcttataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaatctcca 25770663  T
Q  354 gc 355  Q
    ||    
T  25770662 gc 25770661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 257 - 359
Target Start/End: Original strand, 20010820 - 20010922
Alignment:
Q  257 cactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcc 356  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20010820 cactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcttataagttgggcctaatcgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagcc 20010919  T
Q  357 aag 359  Q
    |||    
T  20010920 aag 20010922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 5836502 - 5836692
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||   ||||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  5836502 tttgctttgactggtactcagacatataatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtg 5836601  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||  ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  5836602 ctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttatactttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 5836692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 16924956 - 16925104
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  | ||  ||||    
T  16924956 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 16925055  T
Q  307 gtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  16925056 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccagc 16925104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 18405260 - 18405408
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  ||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||   ||||||||    
T  18405260 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctatgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 18405359  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||   | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  18405360 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 18405408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22436849 - 22436686
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  22436849 aatgaggaccgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgatt 22436750  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| | ||  ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22436749 gtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 22436686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 29589740 - 29589903
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  29589740 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 29589839  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  29589840 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 29589903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16574870 - 16574707
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  16574870 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 16574771  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16574770 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 16574707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 16620510 - 16620673
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  16620510 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 16620609  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16620610 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 16620673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23081403 - 23081287
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | || |    
T  23081403 aatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgatt 23081304  T
Q  292 gtgcatataagttgggt 308  Q
    |||| | ||||||||||    
T  23081303 gtgcttctaagttgggt 23081287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 355
Target Start/End: Original strand, 23085097 - 23085289
Alignment:
Q  163 tgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 262  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||    |||||||||||  | || |||||||| ||||  ||| |||||||||||||| || ||||||| || |||||    
T  23085097 tgtttgctttgactagtatgcagacagagaatgaggaccgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagtttctattattgaaactgg 23085196  T
Q  263 tgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||| |||| | | || | ||| | |||||||||||| | | | ||   |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23085197 tgctacacattgttttattgttgttgattatgcttctaagttgggtcttactatgtcaagtatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagc 23085289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 2872076 - 2872266
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    || ||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  2872076 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 2872175  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  2872176 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 2872266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 355
Target Start/End: Original strand, 30678286 - 30678488
Alignment:
Q  153 agtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 252  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||| || ||    |||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30678286 agtgggaaaacgtttgctttgactggtacacaaacagtgaatgaggatcggttgatcagaggtacatgtttctttaatagtacttctttaattgctatta 30678385  T
Q  253 tagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 352  Q
    | || | | ||||||| | |||||| ||||||   || ||||| | ||||||||||||  || | ||   |||| | || ||||||||||| ||||||||    
T  30678386 ttgatatttgtgctacgcgttgttttattgctactgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactcc 30678485  T
Q  353 agc 355  Q
    |||    
T  30678486 agc 30678488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 355
Target Start/End: Original strand, 18182686 - 18182831
Alignment:
Q  210 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc 309  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||   | |||||| | || ||||| | |||||||||||    
T  18182686 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacacatttccttattgctattgattgtgcttctaagttgggtc 18182785  T
Q  310 tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |   | | ||  ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  18182786 ttgctatgtcaaatatgaatggagagatggtagtcgaaactccagc 18182831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 24293083 - 24293246
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||  |||| |||||||| || |    
T  24293083 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcacggttttattgctttcgatt 24293182  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24293183 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 24293246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28312610 - 28312516
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgcttt 286  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  28312610 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 28312516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 27559285 - 27559433
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||| ||  |||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  27559285 atcagaggtacttgttatattaataatactccatttgttgctattattgataatggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27559384  T
Q  307 gtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27559385 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 27559433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 210 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27190398 - 27190322
Alignment:
Q  210 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgcttt 286  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27190398 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 27190322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 210 - 286
Target Start/End: Original strand, 27258842 - 27258918
Alignment:
Q  210 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgcttt 286  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27258842 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 27258918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 28260498 - 28260661
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  28260498 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 28260597  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  28260598 gtgtttctgctttgggtcttgagt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 28260661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 28285418 - 28285255
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  28285418 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 28285319  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  28285318 gtgtttctgctttgggtcttgagt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 28285255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 28339247 - 28339410
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  28339247 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 28339346  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  28339347 gtgtttctgctttgggtcttgagt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 28339410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19867626 - 19867504
Alignment:
Q  233 tactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaagga 332  Q
    |||||||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| | ||  ||||| ||  || | ||| ||||||| | |    
T  19867626 tactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgggccttgttatgtcttatatgaatgaa 19867527  T
Q  333 gaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  19867526 gagatggttgtcgaaactccagc 19867504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 76
Target Start/End: Original strand, 20010624 - 20010687
Alignment:
Q  13 aagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtgg 76  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  20010624 aagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaagggtcatatgttggctgaatgcaagcgtgg 20010687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Original strand, 22829702 - 22829769
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattg 274  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  22829702 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 22829769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 53750441 - 53750789
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||    
T  53750441 gtaccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataattgtaatgaaga 53750540  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    |||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  53750541 gggccacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctc 53750640  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  53750641 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgg 53750740  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53750741 gtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 53750789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20893325 - 20892984
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||| |  || |||||||| || ||||| |||    
T  20893325 agatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacaatttagctgaatgcaagcgtggggatattgtctactacaactgcaatgaagaggggcat 20893226  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | ||||| ||  |||||||||| |||| |||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20893225 atcagttcgcagtgtactgagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 20893126  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20893125 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgat 20893026  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20893025 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 20892984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 51603763 - 51604111
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||    
T  51603763 gtaccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtgtgctataattgtaatgaaga 51603862  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    |||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  51603863 gggccacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctc 51603962  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  51603963 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgg 51604062  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51604063 gtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 51604111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27903684 - 27903334
Alignment:
Q  9 accaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagg 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  27903684 accaaagatgagaagaagtgtttcagatgtggtcagaaaggtcatgtgttggctgaatgcaagcgtggagatattgtttgttataactgtaatgaggagg 27903585  T
Q  109 gccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttat 208  Q
    || | || ||| | |||||||| || || ||||| || | |||  | || ||  | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  27903584 gcaacattagttcacagtgcacgcaacctaagaaggtcagaacttgaggaaaagtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttat 27903485  T
Q  209 cagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggt 308  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27903484 cagaggtacatgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggt 27903385  T
Q  309 ctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 359  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27903384 ctgattatatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagccaag 27903334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 3261772 - 3262113
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| | ||| || |||    
T  3261772 agatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcat 3261871  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | |||||  |  ||||||||||   || ||   |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3261872 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 3261971  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||      
T  3261972 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 3262071  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3262072 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 3262113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16150937 - 16150589
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||   |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | || ||    
T  16150937 gtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgtgatgaaga 16150838  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||| ||||| ||  | || ||||   | |||||||| |||| |||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| |||| |||| |||||| || |||    
T  16150837 ggggcatattagctcgcaatgcaagaaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgtagaccactagtgaggatcgactt 16150738  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16150737 atcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 16150638  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16150637 gtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 16150589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16155083 - 16154735
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||   |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | || ||    
T  16155083 gtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgtgatgaaga 16154984  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||| ||||| ||  | || ||||   | |||||||| |||| |||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| |||| |||| |||||| || |||    
T  16154983 ggggcatattagctcgcaatgcaagaaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgtagaccactagtgaggatcgactt 16154884  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16154883 atcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 16154784  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16154783 gtttggttgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 16154735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 29450515 - 29450856
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| | ||| || ||     
T  29450515 agatgataggaagtgtttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcac 29450614  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | |||||  |  ||||||||||   || ||   | || ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29450615 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 29450714  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||      
T  29450715 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 29450814  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29450815 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 29450856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 44658844 - 44659185
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||| |  ||  | |||    
T  44658844 agatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgttacaattgcaatggagaatgtcat 44658943  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | |||||  |  | ||||||||   || |||  |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  44658944 attagttcacagtgtcctgaaccgaagaagactagaactggtggaaaggtgtttgctttgaatggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 44659043  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||      
T  44659044 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 44659143  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44659144 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 44659185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Original strand, 14993350 - 14993686
Alignment:
Q  19 agaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccatatcag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||    
T  14993350 agaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgcaagcatggggatgttgtttgctacaactgcaatgaggaaggtcatatcag 14993449  T
Q  119 tactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtact 218  Q
    | | ||||| || || || ||||| ||||  ||  |||| ||| |||||||||||  ||||||||| ||    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14993450 ttcgcagtgtacgcaacctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgaatggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtact 14993549  T
Q  219 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  14993550 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctcttcattatttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtat 14993649  T
Q  319 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14993650 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 14993686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15267070 - 15266736
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||   |||||||||| |||| ||| ||  |||| || |||||||||||||| || || |||    
T  15267070 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgtaagcatggagacattgtttgctataactgcaacgaagaaggtcat 15266971  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| |  |||| || ||||||||||| ||||  ||| |||| ||| ||||||||||  |  ||||||| || |||| ||| ||| | ||||||||||    
T  15266970 atcagttcgtagtgtacgcagccgaagaaggttaggaccggtggcaaggtgtttgctttaaccagtacgcaaacaactagtgaagacagacttatcagag 15266871  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||| |    
T  15266870 gtagttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtactactcattgtttcattgatgttgattgtgcttataagttgggtctggt 15266771  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaa 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15266770 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaa 15266736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 355
Target Start/End: Original strand, 11204223 - 11204551
Alignment:
Q  27 tgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccatatcagtactcagt 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||||| ||| |||| || || || ||||| |  ||||| ||||||||| | ||||    
T  11204223 tgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtctagcttaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagt 11204322  T
Q  127 gcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctt 226  Q
    |  |  ||||||| || | || |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11204323 gtcctgagccgaaaaaggctagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcanactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctt 11204422  T
Q  227 taatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||| ||  |||||||| ||||    
T  11204423 taatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttaggtttggatgtatctggtatg 11204522  T
Q  327 aaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11204523 aaaggggaaatggttgttgaaactccagc 11204551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7357563 - 7357280
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  |||| || || |||||||| |  ||||| |    
T  7357563 aaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacaatttagctgaatgcaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaatggagagggtc 7357464  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    |||| ||| | |||||  |  |||||||||| | || ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7357463 atattagttcacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactagtgggaaggtgtttgcattgactggtacacagactaccaatgaggaccgacttatcag 7357364  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||    
T  7357363 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgc 7357280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15073652 - 15073312
Alignment:
Q  15 gatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccata 114  Q
    |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||  |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||| ||  | || || || ||||    
T  15073652 gatgagaagaagtgttttaggtgtggaaagaaaggacacacattagctgattgcaagctttgtgatgttgtttgctataattgtgatgaagaaggtcata 15073553  T
Q  115 tcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagagg 214  Q
    | ||  | |||||||   |||| ||||| | |   ||  |||| ||| ||||| ||||| ||||||| || |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  15073552 taagctcacagtgcaggaagcctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgttttctttgactggtacacaaactgttaatgaggaccgacttatcagagg 15073453  T
Q  215 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgatt 314  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| |||| ||    
T  15073452 tacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcacataagttggctctggtt 15073353  T
Q  315 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15073352 atatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagc 15073312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14697246 - 14697054
Alignment:
Q  163 tgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 262  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||    |||||||| ||| | || | |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14697246 tgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactgg 14697147  T
Q  263 tgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||| |||||| | || ||||| | ||||||||||||   | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14697146 tgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 14697054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 15946 - 16094
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||| | || |||||   ||||||||    
T  15946 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgg 16045  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16046 gtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 16094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 291 - 355
Target Start/End: Original strand, 15354295 - 15354359
Alignment:
Q  291 tgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15354295 tgtgtatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 15354359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 17092045 - 17092208
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  17092045 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 17092144  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17092145 gtgtttctgccttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 17092208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 15354229 - 15354291
Alignment:
Q  189 actaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatt 251  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15354229 actagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatatt 15354291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 8389528 - 8389365
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  8389528 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 8389429  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8389428 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 8389365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12479716 - 12479553
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  12479716 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 12479617  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  12479616 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 12479553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14162571 - 14162423
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||| |||| |||||| | || ||||| | ||||||||    
T  14162571 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataccggtgctacgcatagttttattgctcttgattgtgcttctaagttgg 14162472  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
     |||   | | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14162471 atcttgctatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagc 14162423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 8050492 - 8050682
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    || ||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  8050492 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 8050591  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8050592 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 8050682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 14300848 - 14301038
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    || ||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  14300848 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 14300947  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14300948 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 14301038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14683710 - 14683520
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |   ||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  14683710 tttgctttgactggtactcagacaaaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 14683611  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14683610 ctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagc 14683520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 355
Target Start/End: Original strand, 16233890 - 16234051
Alignment:
Q  194 tgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgt 293  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||    
T  16233890 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgt 16233989  T
Q  294 gcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16233990 gtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 16234051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 18259735 - 18259630
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||   |||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||||||||| ||||| || |||    
T  18259735 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgtaagcgtggggacattgtttgctataactgcaatgaggaaggtcat 18259636  T
Q  114 atcagt 119  Q
    ||||||    
T  18259635 atcagt 18259630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19635237 - 19635089
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  19635237 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19635138  T
Q  307 gtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19635137 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 19635089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23958848 - 23958700
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  23958848 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 23958749  T
Q  307 gtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23958748 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 23958700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 27714452 - 27714292
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  27714452 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 27714353  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 352  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  27714352 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactcc 27714292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 16350423 - 16350613
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||| |||    
T  16350423 tttgctttggctggtacacagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtg 16350522  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  |||||||| |||||||| || ||||  | ||  ||||||| ||||| | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16350523 ctatgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 16350613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40476183 - 40475993
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||    || ||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  40476183 tttgctttgactggtacgcagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 40476084  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  40476083 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggtggtcgaaactccagc 40475993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13513466 - 13513372
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgcttt 286  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13513466 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgcttt 13513372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 355
Target Start/End: Original strand, 15144829 - 15144951
Alignment:
Q  233 tactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaagga 332  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||| ||| || ||||| | ||  ||||||||  || | ||||||||||| |||    
T  15144829 tactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 15144928  T
Q  333 gaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  15144929 gagatggttgtcgaaactccagc 15144951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16219304 - 16219186
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||| |||||| | || |    
T  16219304 aatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacacactgttttattgctattgatt 16219205  T
Q  292 gtgcatataagttgggtct 310  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  16219204 gtgcttctaagttgggtct 16219186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16222624 - 16222506
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||| |||||| | || |    
T  16222624 aatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacacactgttttattgctattgatt 16222525  T
Q  292 gtgcatataagttgggtct 310  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  16222524 gtgcttctaagttgggtct 16222506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 355
Target Start/End: Original strand, 18224376 - 18224505
Alignment:
Q  226 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgata 324  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | |||||||    
T  18224376 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 18224474  T
Q  325 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  18224475 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 18224505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 352
Target Start/End: Original strand, 19775704 - 19775849
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  19775704 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19775803  T
Q  307 gtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 352  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  19775804 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactcc 19775849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 274
Target Start/End: Original strand, 18604733 - 18604797
Alignment:
Q  210 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattg 274  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  18604733 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 18604797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 98557 - 98905
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  98557 gtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaaga 98656  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||  |||| ||| |||||||| || ||||||| || || |||| ||||||||| |||    
T  98657 gggccatatcagttcgcagtgcacacagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggtacacaaaccactagtgaggaccgactt 98756  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || | |||||||| ||||||||||    
T  98757 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattactattgaatgtgcttataagttgg 98856  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  98857 gtctggttgtatctaatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagc 98905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 176309 - 175970
Alignment:
Q  15 gatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccata 114  Q
    |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | || || || ||||    
T  176309 gatgagaagaagtgttttaggtgtggaaagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataattgtgatgaagaaggtcata 176210  T
Q  115 tcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagagg 214  Q
    | ||  | |||||||   |||   |||| | |   ||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||  |||| | ||||| |||||||||||    
T  176209 ttagctcgcagtgcaggaagctttagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaataaagaccgacttatcagagg 176110  T
Q  215 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgatt 314  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||    
T  176109 tacttatttcttta-tagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggtt 176011  T
Q  315 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  176010 atatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagc 175970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 519 - 867
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  || ||| | |||||| |   ||||||||| |||||||| ||  | |||||    
T  519 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggaatgatgttgtttgttataattgtgatgagga 618  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    |||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||  ||| |||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  619 gggccacatcagttcacagtgcactcagccaaagaagattagaaccggtgggaaagtgtttgcgttgactggtacgcagactactaatgaggacaagctt 718  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  719 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 818  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  819 gtttgattgtatctgatatgaaaggagagatggttgttgaaacttcagc 867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 10916 - 10768
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||| | | || |||||   ||||||||    
T  10916 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgg 10817  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  10816 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 10768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Original strand, 49154 - 49506
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| || ||||   ||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| ||  | || ||    
T  49154 gtaccaaggatgagaagaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctaattgcaagcgtggtgatgtagtttgctataattgtgatgaaga 49253  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||| |||  || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49254 gggccatattagttcacagtgcacacaaccgaagaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 49353  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  49354 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttga 49453  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 359  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49454 atttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaag 49506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Original strand, 58188 - 58540
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| || ||||   ||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| ||  | || ||    
T  58188 gtaccaaggatgagaagaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctaattgcaagcgtggtgatgtagtttgctataattgtgatgaaga 58287  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||| |||  || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58288 gggccatattagttcacagtgcacacaaccgaagaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 58387  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  58388 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttga 58487  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 359  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  58488 atttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaag 58540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 64576 - 64924
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| || ||||   ||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| ||  | || ||    
T  64576 gtaccaaggatgagaagaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctaattgcaagcgtggtgatgtagtttgctataattgtgatgaaga 64675  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||| |||  || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64676 gggccatattagttcacagtgcacacaaccgaagaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 64775  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  64776 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttga 64875  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  64876 atttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagc 64924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 29947 - 29606
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||   |||||||||| ||| |||| ||  | || |||||||  ||||| ||||| || |||    
T  29947 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcaaaagggacacactctagctgattgtaagtgtggggacatcgtttgttatatttgcaatgaggaaggtcat 29848  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | ||||| || || |||||||| ||||  ||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||    
T  29847 atcagttcgcagtgtacgcaaccgaagaaggttaggacaggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagag 29748  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||  |    
T  29747 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcaatgtttgattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagt 29648  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29647 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 29606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Original strand, 8444 - 8784
Alignment:
Q  15 gatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccata 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||    
T  8444 gatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaagggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgttataactgcaatgaatagggccata 8543  T
Q  115 tcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagagg 214  Q
    ||||| | |||||||  || |||||||| |||| |||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  8544 tcagttcgcagtgcaatcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcagagg 8643  T
Q  215 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgatt 314  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||| ||    
T  8644 tacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgtgcttataagttaggtctggtt 8743  T
Q  315 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8744 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 8784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Original strand, 18658 - 18998
Alignment:
Q  15 gatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccata 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||    
T  18658 gatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaagggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgttataactgcaatgaatagggccata 18757  T
Q  115 tcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagagg 214  Q
    ||||| | |||||||  || |||||||| |||| |||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  18758 tcagttcgcagtgcaatcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcagagg 18857  T
Q  215 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgatt 314  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||| ||    
T  18858 tacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgtgcttataagttaggtctggtt 18957  T
Q  315 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18958 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 18998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 326032 - 325689
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||  |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  326032 aaagatgagaagaagtgcttcaagtgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgttataactgcaatgaagagggcc 325933  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    |||||||| | ||||||||||| || ||||| |||| |||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||| || |||| |||||| || ||||||||    
T  325932 atatcagttcacagtgcacacaaccaaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcag 325833  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctg 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  325832 aggtacttgtttctttaatattactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctg 325733  T
Q  312 attgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  325732 gttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 325689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 175 - 355
Target Start/End: Original strand, 200610 - 200790
Alignment:
Q  175 ctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattg 274  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  200610 ctggtacgcagacggttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactagtgctacacattg 200709  T
Q  275 tttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||| | | || ||||||||||||||||||||| || | ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  200710 tttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagc 200790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 319568 - 319482
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  319568 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgttataactgc 319482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 8944 - 8596
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||   ||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||||| ||    
T  8944 gtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacattgtttgctacaactgcaacgaaga 8845  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
     |||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||  ||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| || |||    
T  8844 aggccatatcagttcgcagtgcactcaaccgaagaaggttagtaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcatactactagtgaggatcgactt 8745  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8744 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 8645  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8644 gtttggttgtatctgatataaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 8596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 828 - 1176
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||    
T  828 gtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatattgtttgttataactgcaatgaaga 927  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||| ||||||||| | ||||| || || |||| ||| |||| |||| |||| ||  ||||||||||| |||||| ||| || |||| |||||| ||  ||    
T  928 gggtcatatcagttcacagtgtacgcaaccgaggaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtatgcaaaccactagtgaggatcgaatt 1027  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  1028 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 1127  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1128 gtctggttgtatatgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 1176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 115892 - 115544
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| | |||    
T  115892 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacgtgttagctgattgcaagcgtggtgatatagtatgctataattgcaatgggga 115793  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||  ||| |||||||  ||||||| ||| |||||| ||| || || ||||| ||  | |||    
T  115792 gggtcatatcagttctcagtgcactcaaccgaagaaggttaggaccggtgggaaagtgtttgccttggctggtatgcaaaccacaaatgaagatagactt 115693  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |    
T  115692 atcagaggtacttgtttctttaatagtatccctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataaactag 115593  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  115592 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagc 115544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 94026 - 94216
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94026 tttgctttgactggtacgcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 94125  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94126 ctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 94216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 97
Target Start/End: Original strand, 93874 - 93958
Alignment:
Q  13 aagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactg 97  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||| |||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  93874 aagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaaaggtcatgtgttggcggattgcaagcgtggagatattgtttgttttaactg 93958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Original strand, 17266495 - 17266835
Alignment:
Q  15 gatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccata 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || |    
T  17266495 gatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataattgtaatgaagagggtcaca 17266594  T
Q  115 tcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagagg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |    |||| ||  | ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  17266595 tcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacctagactgctaatgaggaccgtctcatcaaagg 17266694  T
Q  215 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgatt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||    
T  17266695 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggtttgttt 17266794  T
Q  315 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17266795 gtgtctaacatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 17266835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 165 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20824510 - 20824316
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20824510 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 20824411  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20824410 ctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 20824316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 168 - 359
Target Start/End: Original strand, 28892256 - 28892447
Alignment:
Q  168 gctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgcta 267  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28892256 gctttgactggtactcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatggtactcctttaattgctattatagacactggtgcta 28892355  T
Q  268 cacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 359  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28892356 cgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 28892447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 168 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20778967 - 20778776
Alignment:
Q  168 gctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgcta 267  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20778967 gctttgactggtaatcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgcta 20778868  T
Q  268 cacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20778867 cacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 20778776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22465159 - 22464813
Alignment:
Q  13 aagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcca 112  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | || |||| ||| ||   ||| ||||||||    
T  22465159 aagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaagggtcatatgttggctgaatgcaagcgtggagatatcgtttgttttaattgtggcgatgagggcca 22465060  T
Q  113 tatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcaga 212  Q
     || ||  | |||||||| || || ||||| || | ||   | |||||| | || |||||| ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||    
T  22465059 cattagctcgcagtgcacgcaacctaagaaggtcagaattggagggaaggttttcgctttgactggtacccagactaccaacgaggatcgacttatcaga 22464960  T
Q  213 ggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22464959 ggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaa 22464860  T
Q  313 ttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 359  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22464859 ttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaag 22464813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 23563328 - 23563669
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||   ||||||| || ||| |||| ||   ||| |||||||||||||| ||||| || |||    
T  23563328 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgactgtaagggtggagacaatgtttgttataactgcaatgaggaaggtcat 23563427  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | ||||| || ||||||||||| ||||  ||  |||| ||| ||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  23563428 attagttcgcagtgtacgcagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggaccgacttatcagag 23563527  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||      
T  23563528 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatattatagaaactggtgctactcaatgtttaattgctattgaatgtgcatataagttgggtatgga 23563627  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23563628 tatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 23563669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 25851282 - 25850939
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| | ||||||||| ||  |||| || || |||||||| |  ||||| |    
T  25851282 aaagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtctagctgaatacaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaatggagagggtc 25851183  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    |||| ||| | |||||  |  |||||||||| | || |||  |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25851182 atattagttcacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtgggaaggtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgtcttatcag 25851083  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  25851082 aggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttg 25850983  T
Q  312 attgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25850982 gatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 25850939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 23078065 - 23078406
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||| |||| || ||||   ||||||| || |||||||| ||  |||| || || ||||||||||| || || |||    
T  23078065 agatgagaggaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggtcat 23078164  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| |  |||| || ||||||||||| | ||  ||| |||||||  ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23078165 atcagttcatagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactagtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagag 23078264  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||      
T  23078265 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgcaattgaatgtgcttataagttgggtttgga 23078364  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23078365 tgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagc 23078406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20345492 - 20345149
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| || || |||||||| | ||| || |    
T  20345492 aaagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtctagttgaatgcaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggggaaggtc 20345393  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    |||| ||| | |||||  |  |||||||||| | || |||  |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20345392 atattagttcacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtgggaaggtatttgctttaactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcag 20345293  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  20345292 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttg 20345193  T
Q  312 attgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20345192 gatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 20345149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 14884151 - 14884492
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| | ||| || |||    
T  14884151 agatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttggctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcat 14884250  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | |||||  |  |||||| |||   || ||   |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14884251 attagttcacagtgtcctgagccgaggaagactagaattggtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 14884350  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |       
T  14884351 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttaga 14884450  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14884451 tgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 14884492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22505889 - 22505546
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||| || |  |||||||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||| |  ||||| |    
T  22505889 aaagacgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagatgggacatagcttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtc 22505790  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    | |||||| | |||||  |  | |||||||| |||| |||  | || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  22505789 acatcagttcacagtgtcctgaaccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcaa 22505690  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  22505689 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttg 22505590  T
Q  312 attgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
      ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22505589 gatgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 22505546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 154 - 355
Target Start/End: Original strand, 21983477 - 21983678
Alignment:
Q  154 gtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 253  Q
    |||| ||| ||||||| ||| ||| |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21983477 gtggaaaggtgtttgcattgactgttacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattactattat 21983576  T
Q  254 agacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || | ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21983577 tgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactcca 21983676  T
Q  354 gc 355  Q
    ||    
T  21983677 gc 21983678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 154 - 355
Target Start/End: Original strand, 21561325 - 21561526
Alignment:
Q  154 gtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 253  Q
    |||| ||| ||||||| ||| |||||| ||| ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21561325 gtggaaaggtgtttgcattgactggtatgcaaacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttctttaattgctattat 21561424  T
Q  254 agacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| || || | ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21561425 tgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttaggtatggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactcca 21561524  T
Q  354 gc 355  Q
    ||    
T  21561525 gc 21561526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 355
Target Start/End: Original strand, 21631698 - 21631900
Alignment:
Q  153 agtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 252  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    |||||||||||  | || |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21631698 agtgggaaagtgtttgctttgactggtacacagacagtgaatgaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctatta 21631797  T
Q  253 tagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 352  Q
    |  | ||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||| | ||||||||||||  || | ||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  21631798 ttaatactggtgctacgcattgttttattgctgttgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactcc 21631897  T
Q  353 agc 355  Q
    |||    
T  21631898 agc 21631900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 352
Target Start/End: Original strand, 14997050 - 14997237
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||    || ||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  14997050 tttgctttgactggtacgcagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 14997149  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 352  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  14997150 ctacacattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactcc 14997237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21410182 - 21410090
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgct 284  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21410182 aatgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactatcatagatactggtgctacatattgttttattgct 21410090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16359550 - 16359387
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  16359550 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 16359451  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16359450 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 16359387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21882846 - 21882659
Alignment:
Q  168 gctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgcta 267  Q
    |||||| ||||||| ||||| |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||    
T  21882846 gctttggctggtacacagacaaagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttggtattattgatactggtgcta 21882747  T
Q  268 cacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||| | ||  ||||||||   | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21882746 cgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 21882659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 22330198 - 22330388
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||   ||| ||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  22330198 tttgctttgactggtactcagacagataacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 22330297  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22330298 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 22330388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 29473384 - 29473574
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    || ||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  29473384 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 29473483  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  29473484 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagc 29473574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 34569542 - 34569379
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  34569542 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 34569443  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  34569442 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 34569379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 37288807 - 37288997
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    || ||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  37288807 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 37288906  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  37288907 ctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 37288997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40711828 - 40711665
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  40711828 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatcttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 40711729  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  40711728 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 40711665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18782162 - 18781999
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  18782162 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 18782063  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18782062 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgttgaaactccagc 18781999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 308
Target Start/End: Original strand, 21332324 - 21332440
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | || |    
T  21332324 aatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgatt 21332423  T
Q  292 gtgcatataagttgggt 308  Q
    |||| | ||||||||||    
T  21332424 gtgcttctaagttgggt 21332440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 25429454 - 25429306
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || | |||   ||||||||    
T  25429454 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattttgctactaagttgg 25429355  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||  || | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25429354 gtcttgttatgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 25429306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 353
Target Start/End: Original strand, 26736038 - 26736226
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    || ||||| ||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||||||    
T  26736038 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 26736137  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    ||||||||||||| ||| || | || ||||| | || |||||||||   | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  26736138 ctacacattgttttatttctattgattgtgcttctatgttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 26736226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 41773890 - 41773727
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  41773890 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 41773791  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  41773790 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 41773727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27521454 - 27521291
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  27521454 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 27521355  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||||   | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27521354 gtgtttctgctttgggtcttggtttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 27521291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 27613404 - 27613244
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  27613404 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 27613305  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 352  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  27613304 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactcc 27613244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23526084 - 23525952
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| | || |||||    
T  23526084 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctacgttgg 23525985  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatgg 339  Q
    ||||   | | ||||||||||| ||||| ||||    
T  23525984 gtcttgatatgtctgatatgaatggagagatgg 23525952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 27682711 - 27682901
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    || ||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  27682711 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 27682810  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27682811 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 27682901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 19772993 - 19772848
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  19772993 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19772894  T
Q  307 gtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 352  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  19772893 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactcc 19772848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 352
Target Start/End: Original strand, 27665843 - 27665988
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  27665843 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27665942  T
Q  307 gtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 352  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  27665943 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactcc 27665988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22350952 - 22350804
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | ||  ||||    
T  22350952 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 22350853  T
Q  307 gtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22350852 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 22350804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23461019 - 23460856
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || | ||||||||| |||  ||| |||||||| || |    
T  23461019 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctgtattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacccatgtttttattgctttcgatt 23460920  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| | ||  ||||||| ||||| | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  23460919 gtgcttctactttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagc 23460856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23474225 - 23474080
Alignment:
Q  210 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc 309  Q
    |||||||| ||||  ||| || |||| |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||| | || ||| | | |||||||||||    
T  23474225 agaggtacatgttattttgattgtacacctttagttgctattattgataccggtgctacacattgttttattgctattgattgtacttctaagttgggtc 23474126  T
Q  310 tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||  | |  |  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23474125 tggctatgacgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 23474080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22444 - 22109
Alignment:
Q  15 gatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccata 114  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || ||||   ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||    
T  22444 gatgagaagaaatgcttcaagtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgcaatgaagagggccata 22345  T
Q  115 tcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagagg 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| |   ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22344 tcagttctcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccgttggtatagtgtttgcattgactggtactcagactactaatgaggaccgacttatcagagg 22245  T
Q  215 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgatt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| || ||    
T  22244 tacttgtttctttaatagtactcctttaattggtattatagatactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcatatatgttgggtttggtt 22145  T
Q  315 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaact 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaact 22109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Original strand, 53405 - 53745
Alignment:
Q  15 gatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccata 114  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | || || |||||  ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  53405 gatgagaagaaatgattcaggtgtggtcaaaaaggacacatcctagttgattgcaagcgtggtgacgtggtatgttataactgtaatgaagagggccata 53504  T
Q  115 tcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagagg 214  Q
    ||||| | || |||||| |||||||||| |||| |||| |||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  53505 tcagttcacaatgcacatagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtatttgcattgactggtacgcagactactaatgaggaccaacttatcagagg 53604  T
Q  215 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgatt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  53605 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaaactggtgctactcattgtttcaatgctatagaaagtgcatataagttaggtttaatt 53704  T
Q  315 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53705 gtatctgaaatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 53745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 65272 - 65620
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||| |||| ||| | || |||||||| |||||||| ||  | |||||    
T  65272 gtaccaaagatgagaaaaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacgttggctaattgtaagagaggagatgttgtttgttataattgtgatgagga 65371  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
     ||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||  ||| |||| ||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  65372 aggccacatcagttcacagtgcacccagccaaagaaggttaggaccggtggaaaagtgtatgcattgactggtacgcagactaccaatgaggacaggctt 65471  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  65472 atcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttccttgctttagaatgtgcatataagttgg 65571  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65572 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 65620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 211
Target Start/End: Original strand, 62754 - 62950
Alignment:
Q  15 gatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccata 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||| || ||  | || ||||    
T  62754 gatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaagtacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgttttctacaactgtaatgaataaggtcata 62853  T
Q  115 tcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    ||||| | ||||| || ||||| ||||||||||  ||  |||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||| ||||||||    
T  62854 tcagttcgcagtgtacgcagcctaagaaagttaggacaggtggcaaagtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcag 62950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Original strand, 5191 - 5531
Alignment:
Q  15 gatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccata 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| |||||  | |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  5191 gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacactttagctgattgtaagcggagagatgttgtttgctataactgcaatgaggagggccata 5290  T
Q  115 tcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagagg 214  Q
    ||||| |  |||| ||| | |||||||| |||| |||| |||| ||  |||||||| || |||||||||| || |||| |||||| || |||||||||||    
T  5291 tcagttcatagtgtacataaccgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactactgaggatcgacttatcagagg 5390  T
Q  215 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgatt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5391 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggtt 5490  T
Q  315 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5491 gtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 5531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 54377 - 54029
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  54377 gtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaagggacacactctagcttattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaaga 54278  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||| ||||||||  | | ||||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||  ||||||||||  |||||||||| || |||| |||||| || |||    
T  54277 gggtcatatcagctcacggtgcacacaaccgaaaaaggttaggaccagtggtaaagtgtttgctttcactggtacgcaaaccactagtgaggatcgactt 54178  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||     
T  54177 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgt 54078  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  54077 gtctggttgtatctgatatgaatgtagaaatggttgttgaaactccagc 54029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Original strand, 164383 - 164723
Alignment:
Q  15 gatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccata 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  164383 gatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagttgattgcaagcgtggtaatgttgtttgttataactgcaatgaagaaggccata 164482  T
Q  115 tcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagagg 214  Q
    ||||| | || |  || ||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  164483 tcagttcgcattatactcagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgaccggtacgtagactactagtgaggaccgacttatcagagg 164582  T
Q  215 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgatt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  164583 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgccattgaatgtgcttataagttgggtctggtt 164682  T
Q  315 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
     ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  164683 atatctgataagaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 164723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 353
Target Start/End: Original strand, 47155 - 47303
Alignment:
Q  205 ttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagtt 304  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| | || |||||   ||||||    
T  47155 ttatcagaggtacttgttattttaatagtacacctttagttactattattgattctggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagtt 47254  T
Q  305 gggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    ||||||   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  47255 gggtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 47303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 355
Target Start/End: Original strand, 30774 - 30896
Alignment:
Q  233 tactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaagga 332  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| | |   ||||||||  || | ||||||||||| |||    
T  30774 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatgga 30873  T
Q  333 gaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  30874 gagatggttgtcgaaactccagc 30896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 152100 - 152063
Alignment:
Q  318 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  152100 tctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagc 152063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 22015795 - 22016136
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||    
T  22015795 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgcaagcgtggggatgttgtttgttataactgcaacgaggaagatcat 22015894  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || |||   ||||| || ||||||||||| ||||  ||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||| ||||||||||    
T  22015895 attagtttgcagtgtacgcagccgaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagag 22015994  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| |    
T  22015995 gtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggt 22016094  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22016095 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 22016136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Original strand, 20074757 - 20075100
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||| |||| || || |||||||| |  ||||| |    
T  20074757 aaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagcttggctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaactgcaatggagagggtc 20074856  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    |||||| | | |||||  |  |||||||||| |||| |||  | || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20074857 atatcaattcgcagtgtcctgagccgaagaaggttagaactgggggcaagatgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcag 20074956  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  20074957 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttg 20075056  T
Q  312 attgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20075057 gatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 20075100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 48426213 - 48425872
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| | ||| || |||    
T  48426213 agatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcat 48426114  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | |||||  |  ||||||||||   || ||   |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  48426113 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 48426014  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||      
T  48426013 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 48425914  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48425913 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 48425872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Original strand, 20853809 - 20854155
Alignment:
Q  13 aagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcca 112  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | || |||| ||| ||   ||| ||||||||    
T  20853809 aagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaagggtcatatgttggctgaatgcaagcgtggagatatcgtttgttttaattgtggcgatgagggcca 20853908  T
Q  113 tatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcaga 212  Q
     || ||  | |||||||| || || ||||| || | |||  | |||||| | || |||||| ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||    
T  20853909 cattagctcgcagtgcacgcaacctaagaaggtcagaacttgagggaaggttttcgctttgactggtacccagactaccaacgaggatcgacttatcaga 20854008  T
Q  213 ggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  20854009 ggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaa 20854108  T
Q  313 ttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 359  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20854109 ttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaag 20854155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 21742602 - 21742943
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||| || |||    
T  21742602 agatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaggaaggacat 21742701  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||  ||  |||| ||| | ||||| ||| |||||||||| ||    ||||||||||| ||||||||||    
T  21742702 attagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagag 21742801  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||    
T  21742802 gtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctgat 21742901  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21742902 tgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagc 21742943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 24096665 - 24097006
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||| |||| || ||||   ||||||| || |||||||| ||  |||| || || ||||||||||| || || |||    
T  24096665 agatgagaggaagtgttttaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggtcat 24096764  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | ||||| || ||||||||||| | || |||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24096765 atcagttcacagtgtactcagccgaagaaggctagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactaatgaggactgacttatcagag 24096864  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||      
T  24096865 gtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttgga 24096964  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24096965 tgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 24097006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19857614 - 19857273
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||   |||||||||| ||||| || ||  |||| |||||||||| ||| ||||| || |||    
T  19857614 agatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgtaagcggggagacattgtttgttataactacaatgaggaaggtcat 19857515  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | ||||| || || |||||||| ||||  |||||||| ||  |||||||| || |||||||||| || |||| |||||| || ||||| ||||    
T  19857514 attagttcgcagtgtactcaaccgaagaaggttatgaccagtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttattagag 19857415  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| || |    
T  19857414 gtacttgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgggtatggt 19857315  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 19857273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 38909876 - 38910217
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| | ||| || |||    
T  38909876 agatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcat 38909975  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | |||||  |  ||||||||||   || ||   |||| ||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38909976 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtttttgccttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 38910075  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||      
T  38910076 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 38910175  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38910176 tgtatctgatatgaaagggaaaatggttgttgaaactccagc 38910217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 354
Target Start/End: Original strand, 20832943 - 20833290
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||| || ||||   |||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20832943 gtactaaagatgagaagaattgtttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagaggggagatgttgtttgttataactgcaatgagga 20833042  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
     || || |||||| | ||||| || || |||| ||| ||||  ||| || | ||  |||||||| || |||||||||| || |||| |||||| || |||    
T  20833043 aggtcacatcagttcgcagtgtacgcaaccgaggaaggttaggaccggtagtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgactt 20833142  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| | ||||||||||    
T  20833143 atcagaggtacttgtttctttaatattattcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgttcttataagttgg 20833242  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccag 354  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20833243 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccag 20833290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 52989083 - 52988740
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||| |  ||||| |    
T  52989083 aaagatgagaggaagtgtttcaggtgtggtcagaagggtcacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtc 52988984  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    |||||||| | || ||  |  | |||||||| |||| |||  | || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  52988983 atatcagttcacaatgtcctgaaccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcag 52988884  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  52988883 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttg 52988784  T
Q  312 attgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52988783 gatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 52988740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 355
Target Start/End: Original strand, 31537060 - 31537388
Alignment:
Q  27 tgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccatatcagtactcagt 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||| | ||||    
T  31537060 tgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggccatattagttcacagt 31537159  T
Q  127 gcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctt 226  Q
    |  |  ||||||||||   || ||   |||| ||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31537160 gtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctctgactggtacgcagactcctaatgaagaccgacttatcagaggtacttgtttctt 31537259  T
Q  227 taatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  31537260 taatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtgtctgatatg 31537359  T
Q  327 aaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31537360 aaaggggaaatggttgttgaaactccagc 31537388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 21739086 - 21739427
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||  |||| |||||| |||||||| |||||| | || || ||||  || || || || |||    
T  21739086 agatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacaccttagttgattgtaagcgtggggatgttttttgctacaactataatgaagaaggtcat 21739185  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | ||||| ||  |||| ||||| ||||  ||  |||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||    
T  21739186 atcagttcgcagtgtacggagcctaagaaggttaggacaggtggcaagctgttttctttgactggtacgcaaacggttaatgaggaccgacttatcagag 21739285  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||  |    
T  21739286 gtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtcttgt 21739385  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21739386 tttatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 21739427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 37680389 - 37680048
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| || ||||| |  || || |||    
T  37680389 agatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcat 37680290  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | |||||  |  |||||| |||   || ||   |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  37680289 attagttcacagtgtcctgagccgaggaagactagaattggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggacagacttatcagag 37680190  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||      
T  37680189 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctattcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 37680090  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37680089 tatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 37680048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 163 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18710576 - 18710384
Alignment:
Q  163 tgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 262  Q
    |||||||| || |||||||||| || |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18710576 tgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattataaacactgg 18710477  T
Q  263 tgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18710476 tgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgcgtctggttgtatctgatatgagaggggaaatggttgttgaaactccagc 18710384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20297725 - 20297380
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||  |||| || || |||||||| |  || || |    
T  20297725 aaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacagcctagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagaaggtc 20297626  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgt-ctggtacgcag-actactaatgaggaccgtcttatc 209  Q
    |||| ||| |  ||||  |  || ||||||| |||| |||  |||||||| |||||| ||||  |||||    |  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  20297625 atattagttcatagtgtcctgagtcgaagaaggttagaactggtgggaaggtgtttggtttgagctggttattaccactaccaatgaggaccgacttatc 20297526  T
Q  210 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||     
T  20297525 agaggtactggtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtt 20297426  T
Q  310 tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20297425 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 20297380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21961369 - 21961135
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| || |||||||| ||| |||| || || |||||||| |  ||||| |    
T  21961369 aaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacagtttagctgaatgtaagcgtggggatattgtctgctacaactgcaatggagagggtc 21961270  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    |||||||| | |||||| |  |||||||||| |||| |||  |||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21961269 atatcagttcgcagtgccctgagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcag 21961170  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21961169 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 21961135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 24785058 - 24785248
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||| |||    
T  24785058 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtg 24785157  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| | |   ||||||||  || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  24785158 ctacacattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttatctgatatgaatggagagatggtcgttgaaattccagc 24785248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16379254 - 16379062
Alignment:
Q  163 tgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 262  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||    || ||||| ||| | ||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||| || | |||    
T  16379254 tgtttgctttgactggtacgcaaacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatggtactcctttaattgctattattgatattgg 16379155  T
Q  263 tgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||| |||||||| |||||| | || ||||| | |||||||||||    | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16379154 tgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcatgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 16379062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 22496499 - 22496647
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| | ||  ||||    
T  22496499 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctacattgg 22496598  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22496599 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 22496647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 16347823 - 16347986
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  16347823 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 16347922  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16347923 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 16347986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 51330720 - 51330883
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  51330720 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 51330819  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  51330820 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 51330883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 20081619 - 20081767
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| | ||  ||||    
T  20081619 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtactacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 20081718  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20081719 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 20081767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 21228757 - 21228947
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  21228757 tttgctttggctggtactcagacggagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaatattactcctttagttgctattattgatactggtg 21228856  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21228857 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 21228947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 355
Target Start/End: Original strand, 17042245 - 17042406
Alignment:
Q  194 tgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgt 293  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || |||    
T  17042245 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgt 17042344  T
Q  294 gcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |  | |   ||||| | ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17042345 gtttctgctttgggccttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 17042406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 355
Target Start/End: Original strand, 33388291 - 33388420
Alignment:
Q  226 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatat 325  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||||||  || | ||||||||    
T  33388291 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 33388390  T
Q  326 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  33388391 gaatggagagatggttgtcgaaactccagc 33388420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21752163 - 21752015
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||| | || |||||   ||||||||    
T  21752163 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 21752064  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||   | | ||| ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  21752063 gtcttgctatgtctaatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagc 21752015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21833433 - 21833270
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || |    
T  21833433 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatggctttcgatt 21833334  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21833333 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 21833270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 269
Target Start/End: Original strand, 21045323 - 21045429
Alignment:
Q  163 tgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 262  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||    |||||||| ||| | || | |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21045323 tgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactgg 21045422  T
Q  263 tgctaca 269  Q
    |||||||    
T  21045423 tgctaca 21045429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 41350896 - 41351059
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  41350896 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 41350995  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  41350996 gtgtttctgctttgggtcttgagt-tgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagc 41351059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19109484 - 19109336
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |  || ||||| | |   |||     
T  19109484 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggtgctatgcattgttttattgcctatgattgtgcttctgctttga 19109385  T
Q  307 gtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19109384 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 19109336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21842370 - 21842249
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||    || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  21842370 tttgctttgactggtacgcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtg 21842271  T
Q  265 ctacacattgtttcattgcttt 286  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  21842270 ctacgcattgttttattgcttt 21842249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12200556 - 12200517
Alignment:
Q  316 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12200556 tatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 12200517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22401708 - 22401603
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||| ||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||   || |||||    
T  22401708 atcagagatacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttaagattgtgctactatgttgg 22401609  T
Q  307 gtctga 312  Q
    ||||||    
T  22401608 gtctga 22401603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 70700 - 70350
Alignment:
Q  9 accaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagg 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  70700 accaaagatgagaagaagtgtttcagatgcggtcataaaggtcatgtgttggctgaatgcaagcgtggagatattgtttgttataactgtaatgaggagg 70601  T
Q  109 gccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttat 208  Q
    |||| || ||| | |||||||| || || ||||| || | |||  | || ||  | |||| |||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  70600 gccacattagttcacagtgcacgcaacctaagaaggtcagaactggaggaaaagtatttgttttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttat 70501  T
Q  209 cagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  70500 cagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttctttgctttagaatgtgcatataagttgggt 70401  T
Q  309 ctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  70400 ctgattgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactctagccaag 70350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Original strand, 1931 - 2274
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  ||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || |    
T  1931 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcggggagacgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtc 2030  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||  ||| |||| ||  |||||||| || ||||||||||  | |||| |||| |    ||||||||    
T  2031 atatcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaacccactagtgagaagatgcttatcag 2130  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||    
T  2131 aggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgttcttataagttgggtctg 2230  T
Q  312 attgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2231 gttgtatctgatatgaaaggggatatggttgttgaaactccagc 2274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 11880 - 11952
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtga 79  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  11880 gtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtga 11952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 796 - 1137
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  796 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacacactagctgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaacgaggaaggacat 895  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||  ||  |||| ||| ||||||||||| | |||||||| || |||||||||||| | ||||||| ||    
T  896 atcagttcgcagtgtacgcagccaaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggacagacttatcaaag 995  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||      
T  996 gtacttgtttctttaatagtactcccttaattgctattatagacactagtgctactcattgttttattgctattgattgtgcatataagttgggtctggc 1095  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 1137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 37264 - 36921
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||| ||| |||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| || |    
T  37264 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacacactagctgattgtaagtgtggggatattgtttgctataactgcaatgaggaaggtc 37165  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    |||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||  ||  |||| ||| ||||| ||||| | |||||||| || |||||||| ||| | |||||||     
T  37164 atatcagttcacagtgtacgcagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgttttctttgaccggtacgcaaacaactaatgaagacagacttatcat 37065  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | | || |||||||| ||||||||||||    
T  37064 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatacaagttgggtctg 36965  T
Q  312 attgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36964 gttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 36921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Original strand, 9754 - 10094
Alignment:
Q  15 gatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccata 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||   ||| |||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  9754 gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggagggccata 9853  T
Q  115 tcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagagg 214  Q
    | ||| | || || || || |||||||| ||||  ||  |||| ||| |||||||| || |||||||||| || |||| |||||| || ||||||| |||    
T  9854 taagttcacaatgtacgcaaccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcaaagg 9953  T
Q  215 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgatt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  9954 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatttgcttataagttgggtctggtt 10053  T
Q  315 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10054 gtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 10094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 24119 - 24267
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||||| |||||| | || |||||   |||||| |    
T  24119 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttag 24218  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||   | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24219 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 24267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 11300 - 10961
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    ||||||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||| || ||||| |||    
T  11300 agatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacgcactagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatgaagagggtcat 11201  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||  | ||||| || ||||||||||| | ||  ||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11200 atcagctcacagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggagggaaggtgtttgcgttgactggtacgcagactattaatgaggaccgacttatcagag 11101  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11100 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatttttttagaaagtgcatataagttgggtttgat 11001  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11000 tgtatctgatatgaaaggagaaatacttgttgaaactcca 10961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 317
Target Start/End: Original strand, 1822 - 2132
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  || ||| | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||  | |||||    
T  1822 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgatgagga 1921  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    |||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||  ||| |||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| | |||    
T  1922 gggccacatcagttcccagtgcactcagccaaagaagattagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactagtacgcagactgctattgaggacaggctt 2021  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2022 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgg 2121  T
Q  307 gtctgattgta 317  Q
    || ||||||||    
T  2122 gtttgattgta 2132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 5)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Original strand, 39312 - 39655
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  |||||| |||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| || |    
T  39312 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtc 39411  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
     ||||||| | ||||| |||||  ||||||| ||||  ||| |||| ||  |||||||| || |||||||||| || |||| |||||| || ||||||||    
T  39412 gtatcagttcgcagtgtacacaatcgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcag 39511  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  39512 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttg 39611  T
Q  312 attgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39612 gatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 39655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Original strand, 44656 - 44747
Alignment:
Q  262 gtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44656 gtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcca 44747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5083 - 4897
Alignment:
Q  169 ctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctac 268  Q
    ||||| |||||||||||||    |||||||| ||  | || |||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  5083 ctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattaattagaggtacatgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctac 4984  T
Q  269 acattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||| ||| || | || ||||| | |||||||||| |  || | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  4983 acattgttttatttctattgattgtgcttctaagttgggttttgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 4897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 97
Target Start/End: Original strand, 180819 - 180903
Alignment:
Q  13 aagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactg 97  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  180819 aagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaagggtcatgtgttggctgattgcaagcgtggagatattgtttgttttaactg 180903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14569 - 14475
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgcttt 286  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || | ||||||||| ||||| || ||||||||    
T  14569 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgcttt 14475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 1292 - 1633
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  |||||||| || |||||||| ||| |||| || || |  ||||| ||||| || |||    
T  1292 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtttgctacacttgcaatgaggaaggtcat 1391  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||  ||  |||| ||  |||| || ||| |||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1392 atcagttcgcagtgtactcagcctaagaaggttaggacaggtggtaaagtgttcgcgttgactggcatgcagactactagtgaggaccgacttatcagag 1491  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |    
T  1492 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgggtctggt 1591  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1592 tgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 1633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 8067 - 7726
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  |||||||| || |||||||| ||| |||| || || |  ||||| ||||| || |||    
T  8067 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtttgctacacttgcaatgaggaaggtcat 7968  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||  ||  |||| ||  |||| || ||| |||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7967 atcagttcgcagtgtactcagcctaagaaggttaggacaggtggtaaagtgttcgcgttgactggcatgcagactactagtgaggaccgacttatcagag 7868  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |    
T  7867 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgggtctggt 7768  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7767 tgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 7726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 864 - 1205
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||   |||||||||| |||||||| ||  |||| | |||||||||||| ||||| || |||    
T  864 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggatacactctagctgattgtaagcgtggggacattgtttattataactgcaatgaggaaggtcat 963  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | ||||| || || |||||||| ||||  ||  |||| ||| ||||||||||| | |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||    
T  964 atcagttcgcagtgtacgcaaccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggacagacttatcagag 1063  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| | | || |||||  ||||||||||||||||    
T  1064 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagctactggtgctactcattatttcattgttgttgattgtgcgcataagttgggtctgat 1163  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1164 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 1205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6128 - 5787
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  6128 agatgagaagaagtgcttcagatgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagcgtggggacattgtttgttataactgcaacgaggaaggacat 6029  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | ||||| ||||| |||||||| ||||  ||| |||| ||  |||||||| |  ||| |||||| || ||||  |||||| | ||||||||||    
T  6028 attagttcacagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctaactgatacgcaaaccactagcgaggacaggcttatcagag 5929  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |    
T  5928 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttattatagatactagtgctactcattgtttcattgctatttaatgtgcatataagttgggtctggt 5829  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5828 tgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagc 5787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 284
Target Start/End: Original strand, 41228 - 41359
Alignment:
Q  153 agtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 252  Q
    ||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||  | |||||||| | ||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  41228 agtgggatggtgtttgctttagctggtactcagacagcgaatgaggatcatctgatcagaggtacatgttacattaatagtactcccttaattactatta 41327  T
Q  253 tagacactggtgctacacattgtttcattgct 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41328 tagatactggtgctacacattgttttattgct 41359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 9003 - 9333
Alignment:
Q  15 gatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccata 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  |||||| |||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
T  9003 gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcaaa 9102  T
Q  115 tcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagagg 214  Q
    ||| | | ||||| |||||  ||||||| ||||  ||| |||| ||  |||||||| || |||||||||| || |||| |||||| || |||||||||||    
T  9103 tcaattcgcagtgtacacaaacgaagaaggttaggaccggtggtaatgtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagagg 9202  T
Q  215 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgatt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| | ||    
T  9203 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtcaggtt 9302  T
Q  315 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttg 345  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9303 gtatctgatatgaaaggggaaatggttgttg 9333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 50428 - 50087
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  ||||||||||| |||||||| ||| |||| || || |||||||| ||||| || |||    
T  50428 agatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacaccttagctgattgtaagcgtggggatattgtttgctacaactgcaatgaggaaggtcat 50329  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| |  |||| || ||||| ||||| ||||  ||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||| ||||| ||||    
T  50328 atcagttcgtagtgtacccagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttattagag 50229  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||  |    
T  50228 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggggctagt 50129  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50128 tgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactccagc 50087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 34660 - 34319
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||    
T  34660 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaaaggacacacattagttgattgtaagcgtggggacgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcat 34561  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| |  |||| || ||||||||||| ||||  ||  |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||    
T  34560 attagttcgtagtgtacgcagccgaagaaggttaggacaggtggaaaggtgtttgccttgactggtacgcaaacagttaatgaggaccgacttattagag 34461  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| | |    
T  34460 gtacttgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgaatatgtatataagttgggtccggt 34361  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  34360 tgtatctgatatgaaagtggaaatggttgttgaaattccagc 34319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 63500 - 63841
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  ||||||||||| |||| ||| ||| |||| || || ||||  || ||||| || |||    
T  63500 agatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcatggggatattgtttgctacaactataatgaggaaggtcat 63599  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||  || ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||| ||||||||||    
T  63600 atcagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaagtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagag 63699  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| |    
T  63700 gtacttgtttctttaatagtactcttttaattgctattatagatactggtgttactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggt 63799  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63800 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 63841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 4285 - 4626
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| || || ||||| || ||||| || |||    
T  4285 agatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacat 4384  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||  ||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||    
T  4385 attagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcagacggtgaatgaggaccgacttatcagag 4484  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | |    
T  4485 gtacttgtttctttaatagtactcatttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtcgggt 4584  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4585 tatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagc 4626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13046 - 12709
Alignment:
Q  18 gagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccatatca 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || || || |||||||    
T  13046 gagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaagaaggtcatatca 12947  T
Q  118 gtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtac 217  Q
    || | ||||| || ||||| ||||| ||||  ||  |||| ||| ||||||| ||  |||||||||| ||    ||||||||||  |||||||| |||||    
T  12946 gttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgcgttaactggtacgcaaacggtgaatgaggaccaacttatcaggggtac 12847  T
Q  218 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgta 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12846 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 12747  T
Q  318 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12746 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 12709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 42058 - 41717
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| | ||| || |||    
T  42058 agatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcat 41959  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | |||||  |  ||||||||||   || ||   | || ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  41958 atcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagag 41859  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||      
T  41858 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttgga 41759  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41758 tatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 41717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 7368 - 7020
Alignment:
Q  7 gtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | || ||    
T  7368 gtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactatgatgaaga 7269  T
Q  107 gggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtctt 206  Q
    ||| ||||| ||  | || ||||   |||| |||||  |||  ||| |||| ||  |||||||| |  |||| ||||| || |||| |||||| || |||    
T  7268 ggggcatattagctcgcaatgcaagaagcccaagaagattaggaccggtggtaaagtgtttgctctaactggcacgcaaaccactagtgaggatcgactt 7169  T
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  7168 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 7069  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7068 gtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 7020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 355
Target Start/End: Original strand, 5128 - 5467
Alignment:
Q  16 atgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccatat 115  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| |||| || ||||   ||||||| || |||||||| ||  |||| || || ||||||||||| || || |||||    
T  5128 atgagaggaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaacgaagaaggtcatat 5227  T
Q  116 cagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggt 215  Q
    |||| |  |||| || ||||||||||| | ||  ||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  5228 cagttcatagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggt 5327  T
Q  216 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattg 315  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||  ||    
T  5328 acttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtatggatg 5427  T
Q  316 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5428 tatctgatatgaaaagagaaatggttgttgaaactccagc 5467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5504 - 5163
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || || || |||    
T  5504 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaagaaggtcat 5405  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | ||||| || ||||| |||||   ||   |  |||| ||| | ||||| ||| |||||||||| ||    ||||||||||| ||||||||||    
T  5404 atcagttcgcagtgtacgcagcctaagaagtctaggtcaggtggcaaggtttttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagag 5305  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |    
T  5304 gtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggt 5205  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5204 tatgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 5163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30257 - 29916
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||  | ||||   ||||||| || |||||||| ||  |||| ||||| |||||||| |  ||||| |||    
T  30257 agatgagaggaagtgattcaggtgtggtcagaaaagacacaacctagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggagagggtcat 30158  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | |||||  |  |||||||||| |||| ||   |||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30157 atcagttcgcagtgtcctgagccgaagaaggttagaaatggtggaaaggtgtttgcattgattggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagag 30058  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||      
T  30057 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgga 29958  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29957 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 29916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 70431 - 70090
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||  |||| || ||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| || || ||||| || ||||| || |||    
T  70431 agatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacat 70332  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||  ||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||| ||||||||||    
T  70331 attagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagag 70232  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||  |    
T  70231 gtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagt 70132  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  70131 tatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagc 70090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 219 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 60857 - 60721
Alignment:
Q  219 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtat 318  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||  || |||    
T  60857 tgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatat 60758  T
Q  319 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  60757 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagc 60721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 786 - 443
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||| |  ||||| |    
T  786 aaagatgagaggaagtgcttcaggtgcggtcagaagggtcacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtc 687  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    |||| ||| | |||||  |  | |||||||| |||| |||  | || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  686 atataagttcacagtgtcctgaaccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcag 587  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  586 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctagtcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttg 487  T
Q  312 attgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
      |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  486 gatgtatctgatatgaaaggggaaatggtcgttgaaactccagc 443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Original strand, 514332 - 514675
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| |||| || ||| |||| ||  |||| || || |||||||| |  ||||| |    
T  514332 aaagacgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacagcttaactgaatgtaagtgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtc 514431  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    |||||||| | |||||  |  | |||||||| |||| |||  | || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  514432 atatcagttcacagtgtcctgaaccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcag 514531  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  514532 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttg 514631  T
Q  312 attgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  514632 gatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 514675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 496192 - 496002
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||| |||    
T  496192 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtagacctttagttgctattattgatactagtg 496093  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||| |||||| | || ||||| |  |||||||||||   | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  496092 ctacacattgttttattgctattgattgtgcttcgaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 496002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 441759 - 441635
Alignment:
Q  231 agtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaag 330  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||  ||||||| |||||| | || ||||| | ||| |||||||| | | | ||  ||||||| |    
T  441759 agtactcctttagttgctattattgatactggtgctacggattgttttattgctcttgattgtgcttctaaattgggtcttactatgtcaaatatgaatg 441660  T
Q  331 gagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  441659 gagaaatggttgtcgaaactccagc 441635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 251942 - 251604
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||| ||| || || ||||||||| |||| || ||||   ||||||| || |||||||| ||  |||| || || ||||||||||| || || |||    
T  251942 agatgagaggaaatgttttaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctaaaactgcaacgaagaaggtcat 251843  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | ||||| || |||||||||   | ||  ||| ||||| |  ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  251842 atcagttcacagtgtactcagccgaag---gctaggaccggtggggaagtgtttgcatggactggtacgcagactactaatgaggaccggcttatcagag 251746  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||      
T  251745 gtacttgtttctttaatagtacttctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttgga 251646  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  251645 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 251604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Original strand, 230026 - 230093
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattg 274  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  230026 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 230093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 154 - 355
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1594
Alignment:
Q  154 gtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 253  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1393 gtggcaaggtgtttgctttgactggtacgaaaactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 1492  T
Q  254 agacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1493 agatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgggtctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactcca 1592  T
Q  354 gc 355  Q
    ||    
T  1593 gc 1594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 154 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 11992 - 11791
Alignment:
Q  154 gtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 253  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11992 gtggaaaggtgtttgctttgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 11893  T
Q  254 agacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11892 agatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcca 11793  T
Q  354 gc 355  Q
    ||    
T  11792 gc 11791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 12120 - 12034
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaa 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  || | ||||| ||||||||    
T  12120 agatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattatctgttacaactgcaa 12034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 154 - 355
Target Start/End: Original strand, 28406 - 28607
Alignment:
Q  154 gtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 253  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28406 gtggcaaggtgtttgctttgactggtacgaaaactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 28505  T
Q  254 agacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28506 agatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgggtctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactcca 28605  T
Q  354 gc 355  Q
    ||    
T  28606 gc 28607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 82 - 355
Target Start/End: Original strand, 30375 - 30648
Alignment:
Q  82 ttgtatgttataactgcaacgaggagggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtac 181  Q
    ||||||| || |||||||| || || || ||||||||| |  |||| || ||||||||||| | ||  ||| |||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  30375 ttgtatgctacaactgcaaagaagaaggtcatatcagttcgaagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 30474  T
Q  182 gcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcatt 281  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  30475 gcagacaacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaaaagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcatt 30574  T
Q  282 gctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | | | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  30575 gatattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtatctgatatgaaaggggtaatggttgttgaaactccagc 30648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 43400 - 43741
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||  | || ||||| |||    
T  43400 agatgagaagaagtgctttaggtgtggacagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctataattgtgatgaagagggtcat 43499  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||  | |||||||   |||| ||||| |||   ||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||| ||||||||||    
T  43500 attagctcgcagtgcaagaagcccaagaaggttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagag 43599  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| |    
T  43600 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggt 43699  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  43700 tatgtctgatatgaatggaaaaatggttgttgaaactccagc 43741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 163 - 355
Target Start/End: Original strand, 67238 - 67430
Alignment:
Q  163 tgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 262  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  67238 tgtttgcattgactggtatgcagactaccaatgaggaccgactcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactgg 67337  T
Q  263 tgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67338 tgctactcattgttttattgccttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatccgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 67430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12283 - 11942
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||  |||| || ||||  || |||||||||||| |||| ||| |||| || || ||||| || || || || |||    
T  12283 agatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacacattggctgattgcaagtgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaagaaggacat 12184  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | ||||| || ||||| ||||| |||   ||  |||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||    
T  12183 attagttcacagtgtacgcagcctaagaaggttcggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagag 12084  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |    
T  12083 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggcgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggt 11984  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11983 tatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagc 11942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 179 - 355
Target Start/End: Original strand, 1 - 177
Alignment:
Q  179 tacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttc 278  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  1 tacgcaaacaactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatacgggtgctactcattgtttc 100  T
Q  279 attgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101 attgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15280 - 15105
Alignment:
Q  180 acgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttca 279  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15280 acgcaaaccactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcttttatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttca 15181  T
Q  280 ttgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15180 ttgctattgaatgtgcatataagttgggtttgattgtatttgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 15105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15391 - 15279
Alignment:
Q  18 gagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccatatca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15391 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaatgacacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatca 15292  T
Q  118 gtactcagtgcac 130  Q
    || | ||||||||    
T  15291 gttcacagtgcac 15279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6287 - 6095
Alignment:
Q  163 tgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 262  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||    |||||||| ||| | || |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  6287 tgtttggtttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactga 6188  T
Q  263 tgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||| |||||||| | |||| |  | ||||| | |||||||||||| | | | ||  ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  6187 tgctacgcattgttttaatgctatttattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaaaggagagatgattgtcgaaactccagc 6095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 163 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 757 - 567
Alignment:
Q  163 tgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 262  Q
    |||||||| || |||||||||| || |||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  757 tgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtaaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgg 658  T
Q  263 tgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  657 tgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcca 567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 43021 - 42680
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||| || ||||  ||||| ||||  |||||||| |||||||| || || || || || |  || || |||    
T  43021 agatgagaagaagtgctttaggtgtagtcagaaaggacacactttagcggattttaagcgtggggatgttgtttgctacaattgtaatgcagaaggtcat 42922  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | ||||| || || || |||||  |||  ||  |||| ||| ||||||||||  ||||| |||| ||   |||||||||||| ||||||||||    
T  42921 attagttcgcagtgtacgcaacctaagaagattaggacaggtggcaaggtgtttgctttcactggtgcgcaaacagttaatgaggaccgacttatcagag 42822  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||| |    
T  42821 gtacttgtttctttaatagtactcctttatttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgtagttgattgtgcatataagttgggtctggt 42722  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42721 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 42680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 50504 - 50667
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  50504 aatgaggatcgcctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 50603  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| | ||  ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  50604 gtgcttctaccttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 50667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 2043 - 1703
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||| || || |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||    
T  2043 agatgagaagaagtgctttaggtgtggacagaaaggacatactttagctgattgtaagcgtgg-gatgttgtatgctataattgtgatgaagagggacat 1945  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||  | |||||||   |||| |||||  ||   ||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||| ||||||| ||    
T  1944 attagctcgcagtgcaagaagcccaagaagtttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcaaag 1845  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| |    
T  1844 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggt 1745  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  1744 tatgtctgatatgaatggagaaatggttcttgaaactccagc 1703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 154 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 29710 - 29509
Alignment:
Q  154 gtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 253  Q
    |||| ||| |||||||| || |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29710 gtggcaaggtgtttgctctgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 29611  T
Q  254 agacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29610 agatactagtgctactcattgtttcattgcagttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactcca 29511  T
Q  354 gc 355  Q
    ||    
T  29510 gc 29509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 163 - 355
Target Start/End: Original strand, 9357 - 9549
Alignment:
Q  163 tgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 262  Q
    |||||||| || |||||||||| || |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9357 tgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcattaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 9456  T
Q  263 tgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  9457 tgctactcattgtttcattgctattgaatgtacttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaacgggaaatagttgttgaaactccagc 9549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 204 - 353
Target Start/End: Original strand, 5 - 154
Alignment:
Q  204 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctattcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagt 104  T
Q  304 tgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  105 tgagtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 163 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 151741 - 151549
Alignment:
Q  163 tgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 262  Q
    |||||||| || |||||||||| || |||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  151741 tgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggacaggcttattagaggtatttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactag 151642  T
Q  263 tgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  151641 tgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatcttatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 151549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 23665 - 23855
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| | | | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||||||    
T  23665 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcatttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 23764  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||| |||||| | || ||||| | ||||||||||||   | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23765 ctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 23855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 153815 - 153723
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgagga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  ||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||||||||| |||||    
T  153815 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcgtggagacattgtttgctataactgcaatgagga 153723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 277
Target Start/End: Original strand, 73792 - 73841
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgttt 277  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  73792 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttt 73841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 277
Target Start/End: Original strand, 78173 - 78222
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgttt 277  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  78173 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttt 78222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 280
Target Start/End: Original strand, 175708 - 175760
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcat 280  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||    
T  175708 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattctttcat 175760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 154 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12011 - 11812
Alignment:
Q  154 gtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 253  Q
    |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12011 gtggaaaggtgtttgcattgactggtacgcagacaattaatgaggaccgacttattagagatacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 11912  T
Q  254 agacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||  || | |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11911 agaccatggtgctacacattgtttcattgctattgattgtgcatataagttgggtctgattg--tcaggtatgagtggagaaatggttgttgaaactcca 11814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 204 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 1253 - 1103
Alignment:
Q  204 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  1253 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagt 1154  T
Q  304 tgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccag 354  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1153 tgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaattgttgttgaaactccag 1103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5378 - 5190
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || |    
T  5378 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagacgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtc 5279  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggac 200  Q
    |||||||| | ||||| || || |||||||| ||||  ||| |||| ||  |||||||| || |||||||||| || |||| |||||||    
T  5278 atatcagttcgcagtgtactcaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggac 5190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 80 - 326
Target Start/End: Original strand, 19016 - 19262
Alignment:
Q  80 tgttgtatgttataactgcaacgaggagggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggt 179  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||  ||| |||| ||  |||||||| || |||||    
T  19016 tgttatatgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggt 19115  T
Q  180 acgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttca 279  Q
    ||||| || |||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19116 acgcaaaccactagtgaggacaggcttatcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctactcattgtttca 19215  T
Q  280 ttgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatg 326  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  19216 ttgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatctgttatg 19262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5925 - 5584
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||  |||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | || ||||| ||     
T  5925 agataagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtggggatgttgtttgttataattgtgatgaagagggacac 5826  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||  |  ||||||   | || ||||| |||  |||| |||| | | |||||||| |   ||||||||| ||    ||||||||||| ||||||||||    
T  5825 attagctcgtagtgcaagaaacctaagaaggttcgaaccggtggcatggtgtttgctctaattggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagag 5726  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | | |  | ||||||||||||||||||| |    
T  5725 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgtttatgcatataagttgggtctggt 5626  T
Q  314 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5625 tatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagc 5584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 210 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 2998 - 2853
Alignment:
Q  210 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | | |  |||||||||||||||||||    
T  2998 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggggctactcattgtttcattgttgttgcttgtgcatataagttgggtc 2899  T
Q  310 tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2898 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 2853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Original strand, 11724 - 11963
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| |  || || |||    
T  11724 agatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaaagcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggagaaggtcat 11823  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||||| |||||  |  | ||||||||   || |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  11824 attagtacacagtgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactaccagtgaggaccgacttatcagag 11923  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11924 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 11963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5763 - 5562
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| || || || || || || || || |||    
T  5763 agatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctacaattgtaatgaagaaggtcat 5664  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    |||||| | ||||| || || || ||||| ||||  ||  |||| ||  ||||||| ||| |||||||||| ||    ||||||||||| ||||||||||    
T  5663 atcagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggttaggacaggtggcaaagtgtttgcgttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagag 5564  T
Q  214 gt 215  Q
    ||    
T  5563 gt 5562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 20687 - 20850
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  20687 aatgaggaccgacttatcaaagctacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 20786  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20787 gtgcatataaattgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 20850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 192 - 353
Target Start/End: Original strand, 12507 - 12668
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  12507 aatgaggaccgacttatcaaagctacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 12606  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12607 gtgcatataaattggatctggttgtatcaaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 12668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 119
Target Start/End: Original strand, 12391 - 12498
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||  |||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| || |    
T  12391 aaagatgagaagaagtgctttaggtgtgctcagaaaggacacacattagatgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaatgaggaaggtc 12490  T
Q  112 atatcagt 119  Q
    ||||||||    
T  12491 atatcagt 12498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 119
Target Start/End: Original strand, 20571 - 20678
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||  |||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| || |    
T  20571 aaagatgagaagaagtgctttaggtgtgctcagaaaggacacacattagatgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaatgaggaaggtc 20670  T
Q  112 atatcagt 119  Q
    ||||||||    
T  20671 atatcagt 20678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2062 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold2062
Description:

Target: scaffold2062; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 281
Target Start/End: Original strand, 853 - 1125
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||   |||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| || ||     
T  853 agatgagaagaagtgcttcatgtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgtaagcgtggtgacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcac 952  T
Q  114 atcagtact-----cagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttat 208  Q
    |||||| |      ||||| ||||| |||||||| ||||  ||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||| | ||||| | |||||    
T  953 atcagttcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacaactagtaaggacagacttat 1052  T
Q  209 cagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcatt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  1053 cagaggtacttgtttctttaataatacgcctttaattgctattatagacactagtgttactcattgtttcatt 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 355
Target Start/End: Original strand, 4247 - 4411
Alignment:
Q  191 taatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaa 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | ||     
T  4247 taatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 4346  T
Q  291 tgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||  || | ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4347 tgtgcatataagttgggtctacttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagc 4411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 253
Target Start/End: Original strand, 1586 - 1827
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||  || | || || |||||||| |  ||||| |    
T  1586 aaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattatctgctacaactgcaatggagagggtc 1685  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    |||||||| | |||||  |  | |||||||| |||| |||  | || ||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1686 atatcagttcacagtgtcccgaaccgaagaaggttagaactgggggcaaagtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcag 1785  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1786 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 1827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 253
Target Start/End: Original strand, 1487 - 1707
Alignment:
Q  33 aggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccatatcagtactcagtgcacac 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||| || ||| |||| ||  |||| || || |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || |    
T  1487 aggtgtggttagaagggacacaccctagctgaatgtaagtgtggggacattgtttgctacaactgcaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtactc 1586  T
Q  133 agccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatag 232  Q
    |||||||||| || |  ||| | |||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1587 agccgaagaaggtcaggaccggagggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 1686  T
Q  233 tactcctttaattgctattat 253  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1687 tactcctttaattgctattat 1707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 110727 - 110595
Alignment:
Q  220 gtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  110727 gtttctttaatagtactcctttaattgctgttatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtgtc 110628  T
Q  320 tgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  110627 tgatatgaaaggagaaatggttgttaaaactcc 110595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 154 - 355
Target Start/End: Original strand, 4013 - 4211
Alignment:
Q  154 gtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 253  Q
    |||| ||| ||||||| ||| | ||||| |||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  4013 gtggaaaggtgtttgcattgaccggtacacagacggttaatgaggaccgacttataagaggtacttgtttctttaatagtactc---taattgctattat 4109  T
Q  254 agacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || | ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4110 tgacactggtgctacactttgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactcca 4209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 7938 - 8101
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | ||||||| |||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  7938 aatgaggatcgtttgatcagagttacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgatt 8037  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | |  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8038 gggtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 8101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21946 - 21833
Alignment:
Q  242 aattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  21946 aattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataaattgggtttgattatatctgatatgaaaggagaaatggtc 21847  T
Q  342 gttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||    
T  21846 gttgaaactccagc 21833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 782 - 1020
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||||| || |||||||| ||  |||| || |||||||| || |  ||||| |    
T  782 aaagacgagaggaagtgcttcaggtgtggtcaaaagggacacagtttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgaaatggagagggtc 881  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    |||| ||| | |||||  |  | |||||||| |||| ||| || || ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||    
T  882 atattagttcgcagtgtcctgaaccgaagaaggttagaactaggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagtctaccaatgaggaccaacttatcag 981  T
Q  212 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  982 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 1020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 51974 - 51720
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||  | || || ||  ||    
T  51974 agatgagaagaagtgctttaggtgtggtaagaaaggacacactttagcttattgcaagcatggtgatgttgttttctataactgtgatgaagaaggtaat 51875  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | ||||| || ||||| ||||| |||   ||  |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||| |   ||||||||| | ||||||||||    
T  51874 attagttcacagtgtacgcagccaaagaaggttcggacaggtggcaaggtgtttactttgactggtacgcagattgtgaatgaggactgacttatcagag 51775  T
Q  214 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctac 268  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  51774 gtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactcgtgctac 51720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 242 - 348
Target Start/End: Original strand, 49086 - 49192
Alignment:
Q  242 aattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 341  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49086 aattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 49185  T
Q  342 gttgaaa 348  Q
    |||||||    
T  49186 gttgaaa 49192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 283 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26166 - 26090
Alignment:
Q  283 ctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26166 ctttagaatgtgcatataagttgggcctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 26090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2956 - 2754
Alignment:
Q  12 aaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcc 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||| ||||| || ||  | || || ||||||||||| ||||||||||    
T  2956 aaagatgagaagaagttcttcaggtgtggacagaagggacacacattagctgattgtaagcggggagacatagtttgctataactgcaatgaggagggcc 2857  T
Q  112 atatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcag 211  Q
    |||||||| | |||||  |||| |||||||| |||| |||| |||| ||  |||||||| || |||||||||| || |||| |||||| || ||||||||    
T  2856 atatcagttcacagtgtgcacaaccgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcag 2757  T
Q  212 agg 214  Q
    |||    
T  2756 agg 2754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 2183 - 1981
Alignment:
Q  153 agtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 252  Q
    ||||||||| ||||| ||||  ||||||  |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  2183 agtgggaaggtgttttctttagctggtaatcagacagcgaatgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagtactcctttaattactatta 2084  T
Q  253 tagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 352  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||| |   || |||||   |||||||||||| ||| | ||  ||||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  2083 tagatactggtgctacgcattgttttattgttgctgattgtgctactaagttgggtcttattatgtcatatatgaatggggaaatggttgtcgaaacccc 1984  T
Q  353 agc 355  Q
    |||    
T  1983 agc 1981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18005 - 17860
Alignment:
Q  210 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc 309  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| | |||||||||||    
T  18005 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctgttgattgtgcgtctaagttgggtc 17906  T
Q  310 tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | | | | ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  17905 ttactatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagc 17860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 111081 - 111229
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||   ||||||||    
T  111081 atcagaggtacatgttattttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 111180  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||   | | ||  ||||||| ||||  |||||||| |||||||||||    
T  111181 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagtgatggttgtcgaaactccagc 111229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 15111 - 15301
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||    |||||||| ||  | || |||||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||    
T  15111 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagttgctattattaatactggtg 15210  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||| | || ||||| | |||||||||||| | | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15211 ctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcaaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagc 15301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 36628 - 36480
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  | ||  ||||    
T  36628 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttcattgctttcgattgtgtttctactttgg 36529  T
Q  307 gtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  36528 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 36480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 36815 - 36720
Alignment:
Q  20 gaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccatat 115  Q
    |||||| || ||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||| || | ||| ||||| || ||||| |||||    
T  36815 gaagaaatgtttccggtgtggcaagaagggtcatacgttagctgattgcaagcgtagtgatattgtgtgctttaattgcaaggaagagggtcatat 36720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 287 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 1261 - 1193
Alignment:
Q  287 agaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1261 agaatgtgcatataagttgggtctggttgtatccgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagc 1193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1604 - 1364
Alignment:
Q  13 aagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggcca 112  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||| |||| |||||  |||| ||||| ||||||| ||| ||| | || |||| ||| ||   ||| ||||||||    
T  1604 aagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaatggtcatttgttggctgaatgcaagcttggagatatcgtttgttttaattgtggcgatgagggcca 1505  T
Q  113 tatcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcaga 212  Q
     || ||  | |||||||| || || ||||| || | |||  | |||||| | || |||||| ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||    
T  1504 cattagctcgcagtgcacgcaacctaagaaggtcagaacttgagggaaggtattcgctttgactggtacacagactaccaacgaggatcgacttatcaga 1405  T
Q  213 ggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1404 ggtacttgtttcttgaatagtactcctttaatagctattat 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 355
Target Start/End: Original strand, 13609 - 13801
Alignment:
Q  163 tgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 262  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||    |||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||     
T  13609 tgtttgctttgactggtacacaaacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattga 13708  T
Q  263 tgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||  |||||| | || ||||| | ||||||||||||   | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13709 tgctacacattgttctattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 13801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5277 - 5070
Alignment:
Q  148 aaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 247  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    ||| |||||||  | || |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  5277 aaactagtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagacattgaataaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcttttaattgc 5178  T
Q  248 tattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 347  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | || ||||| | ||||||||||||  || | |   ||||||| ||||| ||||| || |||    
T  5177 tattattgatactggtgctacgcattgttttattggtgttgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgttaaatatgaatggagatatggtcgtcgaa 5078  T
Q  348 actccagc 355  Q
    ||||||||    
T  5077 actccagc 5070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8540 - 8393
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||  || |||||   ||||||||    
T  8540 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 8441  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccag 354  Q
    ||||  |  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  8440 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccag 8393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 14398 - 14588
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||    |||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||| || |||||||    
T  14398 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatattactcctttaatagcttttattgatactggtg 14497  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||| ||| || | || |||||   ||||||||||||   | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14498 ctacacattgttttatttctattgattgtgctcctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 14588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 264
Target Start/End: Original strand, 16727 - 16840
Alignment:
Q  151 ccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||    |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16727 ccagtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgatcagaggtacatgtttctttaattgtactcctttaattgctat 16826  T
Q  251 tatagacactggtg 264  Q
    ||| || |||||||    
T  16827 tattgatactggtg 16840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 17240 - 17388
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||  | ||  ||||    
T  17240 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 17339  T
Q  307 gtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17340 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 17388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24490 - 24361
Alignment:
Q  153 agtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 252  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||| ||||   | |||||||| | ||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24490 agtgggaaggtgtttgctttagcaggtactcagaaagcgaatgaggatcatctgataagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactatta 24391  T
Q  253 tagacactggtgctacacattgtttcattg 282  Q
    |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  24390 tagatactagggctacacattgttttattg 24361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 194997 - 195160
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  194997 aatgaggatcgcctgattagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 195096  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| | ||  ||||||||  || | ||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||    
T  195097 gtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattggagagatagttgtcgaaactccagc 195160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Original strand, 4434 - 4501
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatg 81  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  4434 agatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcgtggtgatg 4501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 2437 - 2585
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||   ||||||||    
T  2437 atcagaggtacttgctatattaataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattcttttattgcttatgaatgtgctactaagttgg 2536  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  2537 gtcttgttatgtctgatatgaatggagacatggttgtcgaaactccagc 2585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 55644 - 55792
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||| | || |||||   ||||||||    
T  55644 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgg 55743  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  55744 gtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 55792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22392 - 22229
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  22392 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 22293  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22292 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 22229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 7381 - 7218
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  7381 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 7282  T
Q  292 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  7281 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 7218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 207 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 1
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||   ||||||||    
T  147 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 48  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    ||||   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  47 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 207 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4564 - 4418
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||   ||||||||    
T  4564 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 4465  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    ||||   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  4464 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 4418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 7045 - 6855
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||  | | || |||||||||||| || |||||| || |||||||    
T  7045 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattgtgatcgtactcctttaactgttattattgatactggtg 6946  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||| | || ||||| | ||||||||||||   | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  6945 ctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagc 6855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14175 - 13985
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||  | | || |||||||||||| || |||||| || |||||||    
T  14175 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattgtgatcgtactcctttaactgttattattgatactggtg 14076  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||| | || ||||| | ||||||||||||   | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14075 ctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagc 13985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 184
Target Start/End: Original strand, 265 - 435
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||   |||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| || |||    
T  265 agatgagaagaagtgcttcatgtgtggtcagaaaagacacacactagctgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaatgaggaaggtcat 364  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgca 184  Q
    || ||| | || || || || |||||||| ||||  ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  365 attagttcgcaatgtacgcaaccgaagaaggttaggaccggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgca 435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 207 - 353
Target Start/End: Original strand, 40681 - 40827
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||   ||||||||    
T  40681 atcagaggtacttgctattttgatagtacacctttagttgccattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 40780  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 353  Q
    ||||  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  40781 gtcttgttatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 40827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 29102 - 29250
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | ||  ||||    
T  29102 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgctacgcattgatttattgctttcgattgtgtttctactttgg 29201  T
Q  307 gtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  29202 gtcttgatt-tatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 29250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 282
Target Start/End: Original strand, 216552 - 216669
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||    |||||||| |   | ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  216552 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcaattgatcagaggtacatgttactttgatagtactactttaattgctattattgatactggtg 216651  T
Q  265 ctacacattgtttcattg 282  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  216652 ctacacattgttttattg 216669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 552 - 700
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||  || |||||   ||| ||||    
T  552 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaaattgg 651  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||  |  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  652 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagc 700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 10332 - 10480
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| | ||  ||||    
T  10332 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgccacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 10431  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||   | | |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  10432 gtctacatatgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 10480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15041 - 14893
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||  || |||||   ||||||||    
T  15041 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 14942  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||  |  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14941 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagc 14893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 2119 - 1971
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||| || |||||   ||||||||    
T  2119 atcagaagtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 2020  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  2019 gtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 1971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15582 - 15442
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| |||||||||| ||    |||||||| ||  | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  15582 tttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgattgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtg 15483  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttg 305  Q
    |||| |||||||| |||||| | || ||||| | |||||||    
T  15482 ctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttg 15442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 23472 - 23620
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| || | | ||||||| |||||||| |||||| | ||  |||| | ||||||||    
T  23472 atcagaggtacgtgttattttgatagtactcctttagttgctattattgataatagtgctacgcattgttttattgctcttgatagtgcttctaagttgg 23571  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||   | | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23572 gtcttgctatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagc 23620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 355
Target Start/End: Original strand, 9549 - 9673
Alignment:
Q  231 agtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaag 330  Q
    |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||| | |||||||||||| |   | ||  ||||||| |    
T  9549 agtactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatg 9648  T
Q  331 gagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  9649 gagaaatggttgtcgaaactccagc 9673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11394 - 11291
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||   ||||||||    
T  11394 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 11295  T
Q  307 gtct 310  Q
    ||||    
T  11294 gtct 11291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14193 - 14066
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatga 327  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||   ||||||||||||   | | ||||||||||    
T  14193 aatagtacacctttagttgctattattgatagtggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatga 14094  T
Q  328 aaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14093 atggagagatggttgtcgaaactccagc 14066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25287 - 25242
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacatt 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  25287 aatagtactcctttaattgcaattattgatactggtgctactcatt 25242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3596 - 3406
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    || ||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  3596 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 3497  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  3496 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 3406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17305 - 17142
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||   ||||||  ||||||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  17305 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataaaactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 17206  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17205 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 17142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 355
Target Start/End: Original strand, 37020 - 37142
Alignment:
Q  233 tactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaagg 331  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  37020 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tatctgatatgaatgg 37118  T
Q  332 agaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  37119 agagatggttgtcgaaactccagc 37142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 26526 - 26334
Alignment:
Q  163 tgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 262  Q
    ||||||||||  |||||||||||||    |||||||| ||  | || |||||||  ||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||| || | |||    
T  26526 tgtttgcttttactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtaaatgttattttgatagtactcttttagttgctattattgatattgg 26427  T
Q  263 tgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||||| || ||||| |||| | | || ||||| | |||||||||||| | | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26426 tgctacgcaatgttttattgttgttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagc 26334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 144 - 22
Alignment:
Q  233 tactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaagga 332  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || | ||| | ||  ||||||||  || | ||||||||||| |||    
T  144 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattatgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 45  T
Q  333 gaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  44 gagatggttgtcgaaactccagc 22  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 57746 - 57936
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||    |||||||  ||| | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||||||    
T  57746 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggctcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 57845  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||| |||| | | || ||||| | |||||| |||||   | | ||  ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  57846 ctacacattgttttattgttattgattgtgcttctaagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagc 57936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 1093 - 964
Alignment:
Q  226 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatat 325  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||||||  || | ||||||||    
T  1093 ttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttcttttttgggtcttgttttgtctgatat 994  T
Q  326 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  993 gaatggagagatggttgtcgaaactccagc 964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 11054 - 11202
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||  || |||||   ||||||||    
T  11054 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagtttctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 11153  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||  |  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11154 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagc 11202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 348
Target Start/End: Original strand, 15711 - 15894
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||| ||||| || |||||||    
T  15711 tttgctttggctggtacacagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgcaattattgatactggtg 15810  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaa 348  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||  | ||  ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  15811 ctacgcattgtttaattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaa 15894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3681 - 3537
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||   ||||||||    
T  3681 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctatcattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 3582  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactc 351  Q
    ||||   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  3581 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactc 3537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 7913 - 8061
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||| | || |||||   |||| |||    
T  7913 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctattgattgtgctactaaggtgg 8012  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||   | | ||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8013 gtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagc 8061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 8353 - 8205
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||  | | ||||||| |||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||   | ||| ||    
T  8353 atcagaggtacttgttattgtgatagtacgcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttttgattgtgctacttagtcgg 8254  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    | ||   | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8253 gacttgatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 8205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 10540 - 10350
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    |||| |||| |||||||||||||    || ||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  10540 tttgttttgactggtacgcagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 10441  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  10440 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 10350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16960 - 16761
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| || || ||||| || ||||| || |||    
T  16960 agatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacat 16861  T
Q  114 atcagtactcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagag 213  Q
    || ||| | ||||| || ||| | ||||| ||||  ||  |||| ||| | ||| | |||||||||| ||| |||   ||||||||||| ||||||||||    
T  16860 attagttcgcagtgtacgcagactaagaaggttaggacaggtggcaaggtattttcgttgtctggtatgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagag 16761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41762 - 41659
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | || |||||   ||||||||    
T  41762 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 41663  T
Q  307 gtct 310  Q
    ||||    
T  41662 gtct 41659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 75482 - 75379
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | || |||||   ||||||||    
T  75482 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 75383  T
Q  307 gtct 310  Q
    ||||    
T  75382 gtct 75379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 355
Target Start/End: Original strand, 34915 - 35037
Alignment:
Q  233 tactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaagga 332  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||| ||| || ||||| | ||  ||||||||  || | ||||||||||| |||    
T  34915 tactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 35014  T
Q  333 gaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  35015 gagatggttgtcgaaactccagc 35037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11202 - 11081
Alignment:
Q  163 tgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 262  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||    |||||||| ||| | || |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  11202 tgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcatttaattgttattattgatactgg 11103  T
Q  263 tgctacacattgtttcattgct 284  Q
    | |||| |||||||| ||||||    
T  11102 tactactcattgttttattgct 11081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 310 - 355
Target Start/End: Original strand, 3447 - 3492
Alignment:
Q  310 tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3447 tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagc 3492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 13283 - 13446
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 291  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  13283 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 13382  T
Q  292 gtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  13383 gtgtttctggtttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagc 13446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 41285 - 41137
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || | ||  | |   ||||    
T  41285 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggggctacgcattgctttattgctttggattatgtttctgctttgg 41186  T
Q  307 gtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  41185 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 41137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 54767 - 54619
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||  || |||||   ||||||||    
T  54767 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 54668  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||  |  | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  54667 gtcttttcatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagc 54619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 32012 - 31865
Alignment:
Q  208 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttggg 307  Q
    ||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| |||| ||| |||||||| || ||||| | |   |||||    
T  32012 tcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttggg 31913  T
Q  308 tctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  || | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  31912 tcttgttttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 31865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 37478 - 37331
Alignment:
Q  208 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttggg 307  Q
    ||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| |||| ||| |||||||| || ||||| | |   |||||    
T  37478 tcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttggg 37379  T
Q  308 tctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||  || | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  37378 tcttgttttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 37331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Original strand, 23904 - 24007
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccat 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| || ||||| | ||| || |||    
T  23904 agatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggggaaggtcat 24003  T
Q  114 atca 117  Q
    ||||    
T  24004 atca 24007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 286
Target Start/End: Original strand, 928 - 1022
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgcttt 286  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  928 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 1022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 286 - 192
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgcttt 286  Q
    |||||||| ||| | || |||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  286 aatgaggatcgtttgattagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttttttgcttt 192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9077 - 8928
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |   |||||||   | |||||   ||||||||    
T  9077 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacacatttt---attgcttattattgtgctactaagttgg 8981  T
Q  307 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 359  Q
    ||||  |  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8980 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagccaag 8928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 8429 - 8240
Alignment:
Q  166 ttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgc 265  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    ||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  8429 ttgctttgactggtactcagactgaggatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgc 8330  T
Q  266 tacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||||| || |||||||| || |||| || |   || |||| ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8329 tactcattgctttattgctttcgattgtgtatctgctttaggtcttgaat-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 8240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 355
Target Start/End: Original strand, 24916 - 25034
Alignment:
Q  237 cctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaa 336  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||  || |||||   |||||  |||||  |  | ||||||||||| |||||||    
T  24916 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagtcaggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 25015  T
Q  337 tggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  25016 tggttgtcgaaactccagc 25034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 273
Target Start/End: Original strand, 1122 - 1192
Alignment:
Q  203 tcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacatt 273  Q
    ||||||| ||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  1122 tcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattatagatactggtgctactcatt 1192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21776 - 21586
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||||| ||||   |||||| |||||| ||| |||||||||| || |  ||||    
T  21776 tttgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtg 21677  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||| ||| |||||||| || ||||| | ||  ||||||||  || | |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21676 ctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 21586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 37200 - 37010
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||||| ||||   |||||| |||||| ||| |||||||||| || |  ||||    
T  37200 tttgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtg 37101  T
Q  265 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    |||| |||| ||| |||||||| || ||||| | ||  ||||||||  || | |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  37100 ctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 37010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11641 - 11523
Alignment:
Q  165 tttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 264  Q
    |||||||||  ||||||||||||    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  11641 tttgctttgaatggtacgcagacggagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 11542  T
Q  265 ctacacattgtttcattgc 283  Q
    |||| ||||| || |||||    
T  11541 ctactcattgctttattgc 11523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 55320 - 55058
Alignment:
Q  21 aagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccatatcagta 120  Q
    ||||||||  || |||||||  |||||||||| ||  || ||||||||||||||   ||  ||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||     
T  55320 aagaagtgtgtccggtgtggcaagaagggtcatatagtatctgattgcaagcgtcaggacattgtatgttttaactgcaatgaagagggacatattagtt 55221  T
Q  121 ctcagtgcacacagccgaagaaagttaaaaccagtgggaagatgtttgctttgtctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttg 220  Q
    ||||||| || ||||| ||||  |    ||| | ||| | | | ||||||||| |||| || |||||    |||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  55220 ctcagtgtactcagcctaagagggcgccaactactggtagggtctttgctttgactggaactcagacggagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttg 55121  T
Q  221 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgc 283  Q
     |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  55120 ctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgc 55058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18065 - 17991
Alignment:
Q  209 cagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgc 283  Q
    |||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  18065 cagaggtacttgctatattaataatactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgctttattgc 17991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 1206 - 1354
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    |||||||| |||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||  |||| || |||||||| || | ||  | ||  ||||    
T  1206 atcagaggaacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgtattgctttattgctttcgactttgtttctactttgg 1305  T
Q  307 gtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  1306 gtcttgatt-tttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 1354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18780 - 18632
Alignment:
Q  207 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 306  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||| || ||| ||||||| |||||||| |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  18780 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgatattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18681  T
Q  307 gtc-tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
    ||| ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  18680 gtcttgagt-tgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagc 18632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 3007 - 2915
Alignment:
Q  194 tgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgcttt 286  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||   |||||| |||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  3007 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactccattagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttttttgcttt 2915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 48810 - 48719
Alignment:
Q  192 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgc 283  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  48810 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgc 48719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4691 - 4565
Alignment:
Q  229 atagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaa 328  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||| | | || |||||   ||||||||||||   | | ||| |||||||    
T  4691 atagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaa 4592  T
Q  329 aggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||    
T  4591 tggagagatggttgtcgaaactccagc 4565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 355
Target Start/End: Original strand, 11533 - 11678
Alignment:
Q  210 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc 309  Q
    |||||||||||||   |||||| |||||||||| || ||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   |||||||    
T  11533 agaggtacttgttatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 11632  T
Q  310 -tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 355  Q
     ||||| | ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||    
T  11633 ttgatt-tgtctgatatgaatggagatatggttttttaaactccagc 11678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 273
Target Start/End: Original strand, 13501 - 13571
Alignment:
Q  203 tcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacatt 273  Q
    ||||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  13501 tcttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 46
Target Start/End: Original strand, 523 - 555
Alignment:
Q  14 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaa 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  523 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaa 555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University