View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10954A_low_200 (Length: 300)

Name: NF10954A_low_200
Description: NF10954A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10954A_low_200
NF10954A_low_200
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (7-300)||(16347950-16348243)
chr1 (7-300)||(51330847-51331140)
chr1 (7-300)||(33388384-33388677)
chr1 (7-300)||(41351023-41351316)
chr1 (7-300)||(21833013-21833306)
chr1 (7-300)||(19109079-19109372)
chr1 (7-300)||(17042370-17042663)
chr1 (7-300)||(24785212-24785505)
chr1 (10-292)||(16378813-16379095)
chr1 (7-172)||(20081731-20081896)
chr1 (153-300)||(21839661-21839808)
chr1 (102-300)||(21233181-21233379)
chr1 (7-157)||(21842066-21842216)
chr1 (114-300)||(22502751-22502937)
chr1 (71-298)||(21751650-21751877)
chr1 (7-101)||(22496611-22496705)
chr1 (7-253)||(19857063-19857309)
chr1 (70-226)||(429575-429731)
chr1 (7-226)||(22016100-22016319)
chr1 (7-205)||(21739391-21739589)
chr1 (159-300)||(22359751-22359892)
chr1 (7-226)||(20833255-20833474)
chr1 (7-226)||(21742907-21743126)
chr1 (7-292)||(20854115-20854400)
chr1 (159-300)||(21861880-21862021)
chr1 (7-226)||(31537352-31537571)
chr1 (7-178)||(38910181-38910352)
chr1 (7-226)||(48425689-48425908)
chr1 (7-226)||(52988557-52988776)
chr1 (10-226)||(24096973-24097189)
chr1 (7-178)||(12200382-12200553)
chr1 (7-177)||(37679914-37680084)
chr1 (10-67)||(21751991-21752048)
chr1 (7-183)||(20297240-20297416)
chr1 (7-127)||(18710300-18710420)
chr1 (7-67)||(20075064-20075124)
chr1 (192-300)||(20140794-20140902)
chr1 (7-43)||(21228911-21228947)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (7-300)||(17671748-17672041)
chr8 (7-300)||(18859339-18859632)
chr8 (7-300)||(20015989-20016282)
chr8 (7-300)||(19115162-19115455)
chr8 (7-300)||(19481798-19482091)
chr8 (7-300)||(22126685-22126978)
chr8 (7-300)||(22117901-22118194)
chr8 (7-300)||(19980729-19981022)
chr8 (7-300)||(30310870-30311163)
chr8 (7-300)||(22129343-22129636)
chr8 (7-300)||(21164264-21164557)
chr8 (7-300)||(32602907-32603200)
chr8 (7-300)||(15536145-15536438)
chr8 (7-300)||(22042589-22042882)
chr8 (7-300)||(22030865-22031158)
chr8 (10-300)||(22989807-22990097)
chr8 (7-292)||(21253715-21254000)
chr8 (7-300)||(21391587-21391880)
chr8 (7-300)||(21780913-21781206)
chr8 (7-300)||(21786081-21786374)
chr8 (10-292)||(22421621-22421903)
chr8 (10-278)||(22523330-22523598)
chr8 (10-274)||(22375183-22375446)
chr8 (10-292)||(22246162-22246444)
chr8 (10-134)||(22245744-22245868)
chr8 (7-226)||(22373705-22373924)
chr8 (10-292)||(22028009-22028291)
chr8 (164-277)||(21919987-21920100)
chr8 (7-220)||(21928270-21928483)
chr8 (18-298)||(20390850-20391130)
chr8 (7-101)||(19985141-19985235)
chr8 (7-205)||(22053720-22053918)
chr8 (7-101)||(31414258-31414352)
chr8 (7-226)||(28983747-28983966)
chr8 (7-178)||(29301152-29301323)
chr8 (7-226)||(28988966-28989185)
chr8 (7-183)||(16268950-16269126)
chr8 (7-175)||(27357423-27357591)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (7-300)||(14335081-14335374)
chr7 (7-300)||(44788643-44788936)
chr7 (7-300)||(8200733-8201026)
chr7 (7-300)||(8710290-8710583)
chr7 (7-300)||(18587463-18587756)
chr7 (13-300)||(10873375-10873662)
chr7 (7-300)||(11234505-11234798)
chr7 (7-300)||(13688726-13689019)
chr7 (7-300)||(18180430-18180721)
chr7 (7-300)||(15158349-15158642)
chr7 (7-300)||(11550394-11550687)
chr7 (7-300)||(17703747-17704040)
chr7 (7-300)||(14957239-14957532)
chr7 (19-300)||(12690187-12690468)
chr7 (7-300)||(9591053-9591342)
chr7 (9-202)||(15146217-15146410)
chr7 (18-278)||(14042402-14042662)
chr7 (18-278)||(14352432-14352692)
chr7 (141-300)||(14149862-14150021)
chr7 (24-276)||(15627233-15627485)
chr7 (177-300)||(16726845-16726968)
chr7 (7-226)||(19149771-19149990)
chr7 (7-226)||(20749170-20749389)
chr7 (7-253)||(13676184-13676430)
chr7 (7-226)||(18051223-18051442)
chr7 (7-277)||(15099873-15100143)
chr7 (7-178)||(13024153-13024324)
chr7 (7-226)||(14140439-14140658)
chr7 (7-226)||(14261516-14261734)
chr7 (7-226)||(16947742-16947961)
chr7 (8-183)||(11385700-11385875)
chr7 (7-226)||(26092068-26092287)
chr7 (7-183)||(12459431-12459607)
chr7 (247-295)||(15146416-15146464)
chr7 (7-177)||(26115860-26116030)
chr7 (7-183)||(14283644-14283820)
chr7 (7-226)||(49155061-49155280)
chr7 (7-112)||(15343305-15343410)
chr7 (7-199)||(12798771-12798963)
chr7 (7-183)||(21755215-21755391)
chr7 (18-113)||(12204081-12204176)
chr7 (7-226)||(40925087-40925306)
chr7 (7-130)||(13965938-13966061)
[»] chr5 (41 HSPs)
chr5 (7-300)||(40711408-40711701)
chr5 (7-300)||(16359130-16359423)
chr5 (7-300)||(34569122-34569415)
chr5 (7-300)||(22330352-22330645)
chr5 (7-300)||(27521034-27521327)
chr5 (7-300)||(27612984-27613277)
chr5 (7-300)||(27665955-27666248)
chr5 (7-300)||(41773470-41773763)
chr5 (7-300)||(37288961-37289254)
chr5 (7-300)||(19772588-19772881)
chr5 (7-300)||(22137296-22137589)
chr5 (7-300)||(22350547-22350840)
chr5 (7-300)||(29473538-29473831)
chr5 (7-300)||(14997204-14997497)
chr5 (8-300)||(27682866-27683158)
chr5 (7-300)||(20803225-20803518)
chr5 (7-300)||(18781742-18782035)
chr5 (7-300)||(21882402-21882695)
chr5 (7-295)||(21342879-21343167)
chr5 (8-300)||(25429049-25429341)
chr5 (10-278)||(26736195-26736463)
chr5 (10-292)||(23473831-23474113)
chr5 (10-291)||(21336762-21337043)
chr5 (64-146)||(23525869-23525951)
chr5 (24-205)||(20311573-20311754)
chr5 (7-277)||(23563633-23563903)
chr5 (18-226)||(21983653-21983861)
chr5 (18-205)||(21561501-21561688)
chr5 (7-277)||(20824086-20824356)
chr5 (7-292)||(20778531-20778816)
chr5 (7-292)||(28892407-28892692)
chr5 (12-292)||(17266804-17267084)
chr5 (7-75)||(23460824-23460892)
chr5 (24-172)||(21409890-21410038)
chr5 (7-291)||(22464569-22464853)
chr5 (7-101)||(23078370-23078464)
chr5 (7-235)||(14884456-14884684)
chr5 (10-67)||(21631867-21631924)
chr5 (10-183)||(22505406-22505579)
chr5 (7-175)||(25850807-25850975)
chr5 (7-52)||(20345140-20345185)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (7-300)||(12479296-12479589)
chr4 (7-300)||(16234015-16234308)
chr4 (7-300)||(17092172-17092465)
chr4 (7-300)||(23958443-23958736)
chr4 (7-300)||(8389108-8389401)
chr4 (7-300)||(19634832-19635125)
chr4 (7-300)||(8050646-8050939)
chr4 (7-300)||(14301002-14301295)
chr4 (7-300)||(19775816-19776109)
chr4 (7-300)||(27714032-27714325)
chr4 (7-300)||(40475736-40476029)
chr4 (7-300)||(18224469-18224762)
chr4 (7-300)||(16250873-16251166)
chr4 (7-300)||(15144915-15145209)
chr4 (7-300)||(14683263-14683556)
chr4 (18-292)||(14188210-14188484)
chr4 (10-292)||(14696805-14697087)
chr4 (7-292)||(14162174-14162459)
chr4 (10-300)||(16061-16351)
chr4 (42-292)||(16218934-16219184)
chr4 (42-292)||(16222254-16222504)
chr4 (151-300)||(16352697-16352846)
chr4 (9-155)||(16350579-16350725)
chr4 (7-226)||(15073129-15073348)
chr4 (168-300)||(22632396-22632528)
chr4 (7-226)||(14993650-14993869)
chr4 (7-178)||(29450820-29450991)
chr4 (7-292)||(51604075-51604360)
chr4 (7-226)||(3262077-3262296)
chr4 (7-60)||(13513286-13513339)
chr4 (7-183)||(27903198-27903374)
chr4 (162-292)||(14848543-14848673)
chr4 (7-177)||(44659149-44659319)
chr4 (7-183)||(15354323-15354499)
chr4 (7-111)||(20892916-20893020)
chr4 (7-67)||(53750753-53750813)
chr4 (7-101)||(16150531-16150625)
chr4 (7-101)||(16154677-16154771)
chr4 (11-183)||(11204519-11204691)
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (7-300)||(12889024-12889317)
chr3 (7-300)||(13255005-13255298)
chr3 (7-300)||(16754223-16754516)
chr3 (7-300)||(3688258-3688551)
chr3 (7-300)||(16638088-16638381)
chr3 (7-300)||(20059576-20059869)
chr3 (7-300)||(43164990-43165283)
chr3 (7-300)||(48427762-48428055)
chr3 (7-300)||(5422452-5422745)
chr3 (7-300)||(6603051-6603343)
chr3 (7-300)||(15345767-15346060)
chr3 (7-300)||(15586914-15587207)
chr3 (7-300)||(15713578-15713871)
chr3 (7-300)||(26790935-26791228)
chr3 (7-300)||(53382540-53382833)
chr3 (7-300)||(10908525-10908818)
chr3 (7-300)||(10007915-10008208)
chr3 (7-300)||(15358398-15358691)
chr3 (7-300)||(15400039-15400332)
chr3 (10-300)||(14874093-14874383)
chr3 (7-286)||(15065400-15065679)
chr3 (7-300)||(24185505-24185798)
chr3 (8-300)||(16804470-16804762)
chr3 (7-300)||(16694479-16694772)
chr3 (106-289)||(26190937-26191120)
chr3 (10-277)||(14578933-14579200)
chr3 (10-292)||(15261953-15262235)
chr3 (7-300)||(17492166-17492459)
chr3 (10-277)||(12843628-12843895)
chr3 (159-298)||(18437457-18437596)
chr3 (7-291)||(12858006-12858290)
chr3 (7-226)||(12272737-12272956)
chr3 (7-209)||(17494062-17494265)
chr3 (7-205)||(14291043-14291241)
chr3 (7-226)||(47126343-47126562)
chr3 (7-128)||(17188871-17188992)
chr3 (7-292)||(31692696-31692981)
chr3 (7-226)||(10408367-10408586)
chr3 (7-226)||(13944423-13944642)
chr3 (11-205)||(15013284-15013476)
chr3 (7-292)||(10417556-10417841)
chr3 (7-208)||(12358038-12358239)
chr3 (7-292)||(31941236-31941521)
chr3 (7-205)||(14575406-14575604)
chr3 (7-112)||(24189817-24189922)
chr3 (7-226)||(16832039-16832258)
chr3 (7-205)||(16825792-16825990)
chr3 (7-128)||(8744901-8745022)
chr3 (7-178)||(11958692-11958863)
chr3 (7-226)||(16378445-16378664)
chr3 (7-226)||(28756718-28756937)
chr3 (10-207)||(12180762-12180959)
chr3 (18-226)||(15230002-15230210)
chr3 (18-226)||(15235870-15236078)
chr3 (7-253)||(18131857-18132103)
chr3 (7-101)||(16327220-16327314)
chr3 (159-274)||(11888027-11888143)
chr3 (7-183)||(12509994-12510170)
chr3 (87-253)||(11949499-11949665)
chr3 (159-244)||(13969783-13969868)
chr3 (81-209)||(13318087-13318215)
chr3 (7-52)||(11949436-11949481)
chr3 (7-48)||(13318045-13318086)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (7-300)||(16983567-16983860)
chr2 (7-300)||(17001327-17001620)
chr2 (7-300)||(9337909-9338202)
chr2 (7-300)||(9486543-9486836)
chr2 (7-300)||(22323165-22323458)
chr2 (7-300)||(27220343-27220636)
chr2 (7-300)||(44383393-44383686)
chr2 (7-300)||(21142864-21143157)
chr2 (7-300)||(24712361-24712654)
chr2 (7-300)||(27373596-27373889)
chr2 (7-300)||(10871177-10871470)
chr2 (7-300)||(24874573-24874866)
chr2 (7-300)||(24264697-24264990)
chr2 (7-300)||(41606210-41606501)
chr2 (7-277)||(11351534-11351804)
chr2 (7-300)||(24657481-24657774)
chr2 (7-300)||(24677814-24678107)
chr2 (7-300)||(24705305-24705598)
chr2 (7-300)||(21323089-21323382)
chr2 (7-300)||(23204641-23204934)
chr2 (7-292)||(23105551-23105836)
chr2 (7-214)||(23029284-23029491)
chr2 (7-300)||(23074190-23074483)
chr2 (7-184)||(45673835-45674012)
chr2 (7-277)||(22733597-22733867)
chr2 (10-274)||(24817666-24817930)
chr2 (6-226)||(23097840-23098060)
chr2 (7-74)||(22742789-22742856)
chr2 (7-205)||(19716840-19717038)
chr2 (7-209)||(23274011-23274213)
chr2 (24-205)||(19817269-19817450)
chr2 (18-226)||(23113124-23113332)
chr2 (7-226)||(12576754-12576973)
chr2 (7-67)||(23064973-23065033)
chr2 (11-205)||(30208747-30208941)
chr2 (81-253)||(23279150-23279322)
chr2 (7-130)||(20848086-20848209)
chr2 (264-300)||(11351800-11351836)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (7-300)||(28312190-28312483)
chr6 (7-300)||(29589867-29590160)
chr6 (9-300)||(27189996-27190287)
chr6 (9-300)||(27258953-27259244)
chr6 (7-300)||(28260625-28260918)
chr6 (7-300)||(28284998-28285291)
chr6 (7-300)||(28339374-28339667)
chr6 (7-300)||(25115112-25115405)
chr6 (7-300)||(2872230-2872524)
chr6 (7-300)||(16574450-16574743)
chr6 (7-300)||(16620637-16620930)
chr6 (7-300)||(24293210-24293503)
chr6 (7-300)||(27559397-27559690)
chr6 (10-300)||(19867247-19867537)
chr6 (65-300)||(22827841-22828076)
chr6 (7-300)||(22436429-22436722)
chr6 (7-300)||(16925068-16925361)
chr6 (7-300)||(5836656-5836949)
chr6 (7-295)||(18405372-18405660)
chr6 (18-292)||(23080991-23081265)
chr6 (10-278)||(18182798-18183066)
chr6 (87-278)||(20135556-20135747)
chr6 (87-278)||(22197122-22197313)
chr6 (11-162)||(23085257-23085408)
chr6 (180-300)||(16961082-16961203)
chr6 (24-205)||(30678469-30678650)
chr6 (7-235)||(19437627-19437855)
chr6 (6-226)||(21567418-21567638)
chr6 (7-226)||(19455657-19455876)
chr6 (7-226)||(18797324-18797543)
chr6 (7-183)||(34643014-34643190)
chr6 (7-226)||(21474234-21474453)
chr6 (7-292)||(15461904-15462189)
chr6 (7-226)||(25770478-25770697)
chr6 (19-205)||(19486734-19486918)
chr6 (7-292)||(10466276-10466561)
chr6 (7-226)||(24515842-24516061)
chr6 (7-177)||(24367083-24367253)
chr6 (7-52)||(19465976-19466021)
chr6 (10-101)||(20010885-20010976)
chr6 (7-51)||(14377344-14377388)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (7-300)||(10093-10386)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (7-300)||(21972-22265)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (7-300)||(40880-41173)
scaffold0109 (7-300)||(13410-13703)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (7-300)||(11194-11487)
scaffold0028 (7-300)||(17662-17955)
scaffold0028 (29-300)||(53452-53723)
scaffold0028 (159-277)||(47952-48070)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (7-300)||(3149-3442)
scaffold0044 (7-300)||(16885-17178)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (7-294)||(36229-36516)
scaffold0079 (159-300)||(28803-28944)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (7-300)||(1318-1611)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (7-300)||(17352-17645)
scaffold0017 (7-295)||(195124-195412)
scaffold0017 (10-205)||(24126-24321)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (7-300)||(29214-29507)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (11-300)||(10448-10737)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (7-300)||(7983-8276)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (7-300)||(37106-37399)
scaffold0042 (10-277)||(26100-26367)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (7-300)||(35001-35293)
scaffold0022 (10-300)||(41357-41647)
scaffold0022 (10-300)||(75077-75367)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (7-295)||(50631-50919)
scaffold0102 (7-205)||(42518-42716)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (7-300)||(21329-21622)
scaffold0081 (7-300)||(36753-37046)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (8-300)||(31609-31900)
scaffold0080 (7-300)||(10524-10817)
scaffold0080 (8-300)||(37075-37366)
scaffold0080 (7-300)||(13179-13472)
scaffold0080 (10-299)||(54363-54652)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (10-300)||(12388-12678)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (7-300)||(11642-11935)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (10-277)||(10534-10801)
scaffold0476 (7-226)||(831-1050)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (7-275)||(18400-18668)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (11-246)||(14203-14438)
scaffold0010 (10-292)||(4648-4930)
scaffold0010 (7-226)||(44713-44932)
scaffold0010 (7-226)||(39619-39838)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (7-277)||(24998-25268)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (7-277)||(3349-3619)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (10-277)||(24234-24501)
scaffold0243 (7-209)||(10058-10260)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (10-291)||(23822-24103)
scaffold0011 (10-298)||(151294-151582)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (7-300)||(7948-8241)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (7-292)||(151814-152099)
scaffold0023 (10-298)||(47272-47541)
scaffold0023 (7-85)||(30860-30938)
scaffold0023 (123-300)||(1907-2084)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (10-277)||(4182-4449)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (10-292)||(5846-6128)
scaffold0074 (8-226)||(14922-15140)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (10-292)||(103960-104242)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (10-298)||(111196-111484)
scaffold0040 (10-292)||(17611-17893)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (7-214)||(766-973)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (126-300)||(8146-8320)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (7-269)||(8706-8968)
scaffold0358 (106-269)||(17902-18065)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (10-276)||(13768-14034)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (10-292)||(6606-6888)
scaffold0270 (10-292)||(13736-14018)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (10-300)||(55759-56049)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (7-244)||(13865-14102)
scaffold0120 (192-277)||(8770-8855)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (10-292)||(14555-14837)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (10-292)||(216709-216991)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (10-292)||(495753-496035)
scaffold0001 (10-171)||(441507-441668)
scaffold0001 (7-176)||(514639-514808)
scaffold0001 (222-274)||(441441-441493)
scaffold0001 (159-205)||(452651-452697)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (153-300)||(9665-9812)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (7-292)||(17635-17914)
scaffold0114 (7-292)||(39791-40076)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (10-291)||(4317-4598)
[»] scaffold0993 (2 HSPs)
scaffold0993 (7-226)||(781-1000)
scaffold0993 (129-277)||(630-778)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (7-277)||(664-934)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (106-300)||(15379-15573)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (7-201)||(11166-11360)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (10-265)||(40796-41049)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (7-165)||(1-159)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (10-274)||(15268-15532)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (128-300)||(554-726)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (7-184)||(2549-2726)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (51-300)||(1177-1426)
scaffold0278 (10-55)||(3521-3566)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (10-274)||(23587-23851)
scaffold0018 (10-274)||(9640-9904)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (7-157)||(8065-8217)
scaffold0130 (18-226)||(4186-4394)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (10-189)||(15258-15437)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (10-275)||(4838-5103)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (10-169)||(57903-58062)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (7-120)||(7141-7254)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (80-300)||(12573-12792)
scaffold0324 (10-146)||(1868-2004)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (150-300)||(1-151)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (178-300)||(27952-28074)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (123-277)||(6489-6643)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (7-277)||(60487-60757)
scaffold0046 (7-52)||(70081-70126)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (7-277)||(141-411)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (7-183)||(1169-1345)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (7-106)||(8329-8428)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (24-277)||(21488-21743)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (7-253)||(20586-20832)
scaffold0222 (7-205)||(773-971)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (7-228)||(2668-2889)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (7-292)||(94180-94465)
scaffold0029 (7-127)||(115460-115580)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (70-226)||(819-975)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (7-226)||(11759-11978)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (7-253)||(355-601)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (7-205)||(63805-64003)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (7-292)||(53709-53994)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (10-226)||(98872-99088)
scaffold0020 (7-226)||(175787-176006)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (18-226)||(200765-200973)
scaffold0004 (7-292)||(325440-325725)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (7-226)||(11608-11827)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (10-205)||(1819-2014)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (7-277)||(110358-110628)
scaffold0031 (226-300)||(52430-52504)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (18-275)||(4386-4643)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (7-300)||(29252-29545)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (7-127)||(3456-3576)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (7-298)||(1558-1849)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (7-298)||(28571-28862)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (7-226)||(43705-43924)
scaffold0104 (25-226)||(25015-25216)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (7-226)||(263025-263244)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (7-77)||(1055-1125)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (7-205)||(1597-1795)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (7-209)||(6854-7056)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (7-205)||(7564-7762)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (7-209)||(25928-26130)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (7-209)||(29440-29642)
scaffold0067 (7-205)||(49466-49664)
scaffold0067 (7-205)||(58500-58698)
scaffold0067 (7-205)||(64888-65086)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (7-220)||(8748-8961)
scaffold0235 (7-220)||(18962-19175)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (18-99)||(8036-8117)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (175-300)||(231-358)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (7-183)||(251464-251640)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (7-67)||(424266-424326)
scaffold0003 (7-112)||(203294-203399)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (18-225)||(11630-11837)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (7-226)||(919-1138)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (7-226)||(49904-50123)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (7-226)||(65584-65803)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (7-226)||(49163-49382)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (24-235)||(83824-84035)
scaffold0007 (7-39)||(48651-48683)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (7-277)||(5350-5620)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (7-292)||(5135-5420)
scaffold0348 (7-178)||(17770-17941)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (7-60)||(5-58)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (7-183)||(5023-5199)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (168-300)||(7106-7238)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (7-115)||(12637-12745)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (7-183)||(70214-70390)
scaffold0034 (7-209)||(2238-2441)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (7-226)||(120-339)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (7-138)||(1101-1232)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (7-226)||(10072-10291)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (8-183)||(1141-1316)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (7-178)||(36786-36957)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (186-300)||(1198-1312)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (7-133)||(21743-21869)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (7-60)||(14876-14929)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (7-292)||(53780-54065)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (7-183)||(303-479)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (7-226)||(8413-8632)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (7-209)||(20814-21014)
scaffold0261 (10-209)||(12637-12834)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (7-226)||(21921-22140)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (7-138)||(5692-5823)
scaffold0035 (11-177)||(41398-41563)
scaffold0035 (89-226)||(5550-5687)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (7-77)||(4590-4660)
scaffold0335 (141-226)||(4670-4755)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (27-253)||(9533-9758)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (164-274)||(20992-21102)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (7-101)||(30612-30706)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (9-111)||(67396-67498)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (7-128)||(5431-5552)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (7-292)||(34070-34355)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (7-226)||(41534-41753)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (160-274)||(5328-5442)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (159-277)||(114476-114594)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (10-183)||(5498-5671)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (7-67)||(6543-6603)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (9-253)||(991-1227)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (7-178)||(1568-1739)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (164-274)||(175788-175898)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (134-219)||(8459-8544)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (7-178)||(29781-29952)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (7-101)||(10901-10995)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (159-292)||(923-1056)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (162-226)||(51611-51675)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 16347950 - 16348243
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16347950 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16348049  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348050 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 16348149  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348150 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 16348243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 51330847 - 51331140
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51330847 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 51330946  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51330947 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 51331046  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51331047 aagtcagtgcatttcttttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 51331140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 33388384 - 33388677
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33388384 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 33388483  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33388484 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 33388583  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33388584 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttga 33388677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 41351023 - 41351316
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41351023 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtga 41351122  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41351123 ttttgaaatggatttagtttgcctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 41351222  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41351223 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 41351316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21833306 - 21833013
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21833306 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtctgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtga 21833207  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833206 tttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 21833107  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21833106 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 21833013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19109372 - 19109079
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19109372 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcatga 19109273  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19109272 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 19109173  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19109172 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 19109079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 17042370 - 17042663
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17042370 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 17042469  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  17042470 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 17042569  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||    
T  17042570 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctgctaagcagctgaagcaaatggaacacgatagtattttga 17042663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 24785212 - 24785505
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24785212 ctgatatgaatggagagatggtcgttgaaattccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24785311  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  24785312 ttttgaaatggatctggtttgtctacctttgagcggtatggatgtaattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 24785411  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24785412 aaatcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 24785505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16379095 - 16378813
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16379095 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 16378996  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    ||| || ||||| |||||| |||||||||| || ||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16378995 tgagattgatttggtttgtttacctttgagcggaatggatgtaatcctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaag 16378896  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    |||||  |||||||||| |  || || || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  16378895 tcagtgtatttctcttctgctgaggaagagagtggagcaaagtttttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 16378813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Original strand, 20081731 - 20081896
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20081731 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 20081830  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggtt 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20081831 ttttgagatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggtt 20081896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 153 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21839808 - 21839661
Alignment:
Q  153 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21839808 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 21839709  T
Q  253 ttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21839708 ttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 21839661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 102 - 300
Target Start/End: Original strand, 21233181 - 21233379
Alignment:
Q  102 cgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  21233181 cgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgtt 21233280  T
Q  202 ttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  21233281 ttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcaaagttcgtatctactatgcagctgaagcaaatgaaacgcgatggtattttga 21233379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21842216 - 21842066
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21842216 ctgatatgaatggagagattgttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcatttgtctatgtttggtcgtga 21842117  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattct 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  21842116 ttttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtgattct 21842066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 114 - 300
Target Start/End: Original strand, 22502751 - 22502937
Alignment:
Q  114 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||     
T  22502751 atggatttagtttgtctacctttgagcggaatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcaa 22502850  T
Q  214 tacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22502851 tgtatttctcctccgttgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactagaacgcgatggtattttga 22502937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 71 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21751877 - 21751650
Alignment:
Q  71 atgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactgg 170  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || || |||| |    
T  21751877 atgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtaattttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatcaactcg 21751778  T
Q  171 ttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagc 270  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || || ||  ||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21751777 ttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaaatcggtgtatttctcttctactgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaaacagc 21751678  T
Q  271 tgaagcaactggaacgcgatggtatctt 298  Q
    |||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  21751677 tgaagcagttagaacgtgatggaatctt 21751650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Original strand, 22496611 - 22496705
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22496611 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 22496705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19857309 - 19857063
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||  | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  19857309 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 19857210  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| |||| ||||||| |||  ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  19857209 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgactggtatggatgatatttttgggatgaacttgttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 19857110  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 253  Q
    ||| |||| ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  19857109 aagacagtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagcagagtt 19857063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 226
Target Start/End: Original strand, 429575 - 429731
Alignment:
Q  70 tatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactg 169  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  429575 tatgtttaagatgtcatttgtctatgtttgatagtgattttgagatggatttggtttgtctacatttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaattg 429674  T
Q  170 gttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| || |||||||| || |  ||||||||||  || ||||| ||  ||||||||||    
T  429675 gttggaatacaaccatgtgcacattaattgttacagtaagtcggtgtatttctcttc 429731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 22016100 - 22016319
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  22016100 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 22016199  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||  |||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  22016200 ctttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 22016299  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  22016300 aagacggtgcatttttcttc 22016319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 21739391 - 21739589
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| || ||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  21739391 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 21739490  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
     |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||    
T  21739491 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttag 21739589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 300
Target Start/End: Original strand, 22359751 - 22359892
Alignment:
Q  159 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||| || |||||  || ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22359751 ggtatgaactggttagagtataaccatgttcatattatttgctttagtaaatcagtgtatatctcttctgctgaagagaaaagtggtgcagagtttttgt 22359850  T
Q  259 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||| ||||    
T  22359851 ctactaagcagctgaagtagttagaacgtgatggtattttga 22359892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 20833255 - 20833474
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||||||  | |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  20833255 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagataagggttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 20833354  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  20833355 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 20833454  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  20833455 aagacggtgcatttttcttc 20833474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 21742907 - 21743126
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || |||||||  ||||  ||||||||||||||| | ||    
T  21742907 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaactacgtctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagaga 21743006  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||| |||| ||| | || |||   ||| || |||||||| | || ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| || |||||     
T  21743007 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgtcgggtgtggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccattttcatattaactgctttagt 21743106  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  21743107 aagacggtgcatttttcttc 21743126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 20854115 - 20854400
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  20854115 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 20854214  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||  | || ||||| |||||||| |||   || ||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||   ||| |||||||||| |    
T  20854215 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtataaattgttttaac 20854314  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||| | || || || ||||| |  |||||||| ||||| ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  20854315 aagacggtgcacttttcttctgcggaagaggagagtggagcagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 20854400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 300
Target Start/End: Original strand, 21861880 - 21862021
Alignment:
Q  159 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||| |  ||||| ||| |||| |||||||| || |    
T  21861880 ggtatgaactggttggagtacaaccatgttaatattaattgttttattaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaagaatgtggcgcagagttcttat 21861979  T
Q  259 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  21861980 ctacgaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaatcttga 21862021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 31537352 - 31537571
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  31537352 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 31537451  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||  || ||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||  | |||||||| |||||||| || || |  |||| ||| || || |||||     
T  31537452 ttttgtgattgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgagttcatatcaactgctttagt 31537551  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  31537552 aagacggtacatttctcttc 31537571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 38910181 - 38910352
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  38910181 ctgatatgaaagggaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 38910280  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagta 178  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  38910281 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 38910352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 48425908 - 48425689
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  48425908 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 48425809  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  48425808 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 48425709  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  48425708 aagacggtacatttctcttc 48425689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 52988776 - 52988557
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  52988776 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 52988677  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  52988676 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 52988577  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  52988576 aagacggtacatttctcttc 52988557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 226
Target Start/End: Original strand, 24096973 - 24097189
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | || |||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||| | || ||    
T  24096973 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactt 24097072  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    || | | || ||||||||| | || ||||  |||||| |||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| |||    
T  24097073 tgtagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttagaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaag 24097172  T
Q  210 tcagtacatttctcttc 226  Q
     | || ||||| |||||    
T  24097173 acggtgcatttttcttc 24097189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12200553 - 12200382
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||  | |||||||||||| | ||    
T  12200553 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtagaga 12200454  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagta 178  Q
    |||||  || |||||||| ||||| || ||||  |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  12200453 ttttgtgattgatttagtgtgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 12200382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37680084 - 37679914
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  37680084 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 37679985  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagt 177  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||  | |||||||| ||||||||||    
T  37679984 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 37679914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 21752048 - 21751991
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctct 67  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21752048 atatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21751991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20297416 - 20297240
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| ||   |||||| | | |||||||||| | ||    
T  20297416 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatttatgtttggtagaga 20297317  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 183  Q
    |||||   | |||||||||||||| || ||||  |||||| |||||||  | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  20297316 ttttgtggttgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatctttggaatgaattggttagagtataacc 20297240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18710420 - 18710300
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  18710420 ctgatatgagaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 18710321  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttg 127  Q
     |||||| | || ||||||||    
T  18710320 ctttgaagtcgacttagtttg 18710300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Original strand, 20075064 - 20075124
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctct 67  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  20075064 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 20075124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20140902 - 20140794
Alignment:
Q  192 attaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 291  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  |  |||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  20140902 attaattgctttagtaagtcggtgtatttctcttatgctgaagaggaaagtggcgcataattcatgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatg 20140803  T
Q  292 gtatcttga 300  Q
    |||| ||||    
T  20140802 gtattttga 20140794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 43
Target Start/End: Original strand, 21228911 - 21228947
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagc 43  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21228911 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 21228947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 17671748 - 17672041
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671748 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 17671847  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671848 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 17671947  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17671948 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 17672041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18859632 - 18859339
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859632 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 18859533  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859532 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggaagtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 18859433  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859432 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtcaactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 18859339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 20015989 - 20016282
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20015989 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 20016088  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016089 ttttgaaatgggtttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 20016188  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20016189 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 20016282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19115455 - 19115162
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19115455 ctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 19115356  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19115355 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 19115256  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19115255 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 19115162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 19481798 - 19482091
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19481798 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtga 19481897  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19481898 ttttgaaatggatttagtttgcctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 19481997  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19481998 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 19482091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 22126685 - 22126978
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22126685 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgattacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 22126784  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22126785 tttcgaaatggatttagtttgtctacctctgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 22126884  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22126885 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 22126978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 22117901 - 22118194
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22117901 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 22118000  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22118001 tttcgaaatggatttagtttgtctacctctgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacatttttattaattgttttagc 22118100  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22118101 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 22118194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19981022 - 19980729
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19981022 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 19980923  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  19980922 ttttgagatggatttagtttgtctacccttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagc 19980823  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19980822 aagttagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgggatggtattttga 19980729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 30310870 - 30311163
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30310870 ctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 30310969  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  30310970 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 30311069  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  30311070 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 30311163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 22129343 - 22129636
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22129343 ctgatatgaatggacagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 22129442  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  22129443 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 22129542  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22129543 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagaattcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 22129636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 21164264 - 21164557
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21164264 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 21164363  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  21164364 tttcgagatggacttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagc 21164463  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  21164464 aagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattggaacgcgatgatattttga 21164557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 32603200 - 32602907
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  32603200 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggttgtga 32603101  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  32603100 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 32603001  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32603000 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaggtggtgcagagttcttatctactaaacagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 32602907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15536438 - 15536145
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||    
T  15536438 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttacgttgtcctttgtctatatttggtcgtga 15536339  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15536338 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgaatgtgattttgggtacgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 15536239  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15536238 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 15536145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22042882 - 22042589
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22042882 ctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 22042783  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  22042782 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgaacggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagaatacaaccatgttcatatcaattgttttagc 22042683  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22042682 aagttagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttaactactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 22042589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22031158 - 22030865
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22031158 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcatga 22031059  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  22031058 tttcgaaatggatttagtttgtctacatttaagcggtatggatgtaattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 22030959  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||   |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22030958 aagtcagtgtgtttctcttccgctgaggaggaaagtggtgcatagtttttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 22030865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22990097 - 22989807
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22990097 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgtgattt 22989998  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| || || |||||| ||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  22989997 tgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 22989898  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    || ||  |||||||||| |  |||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  22989897 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtgacgcatagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaatcttga 22989807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21254000 - 21253715
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21254000 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 21253901  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||  |||||||||| |||     
T  21253900 ttttgagatggatttggtttgtctacctttgagtggtatgcatgtgattcttggtatgagctggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagt 21253801  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    |||||  |  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  21253800 aagtcgctgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttggaacgtgatgg 21253715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 21391587 - 21391880
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21391587 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 21391686  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||| || |||     
T  21391687 ttttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattattatagt 21391786  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||| ||  ||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  21391787 aagtcggtgtattactcttctgctgaggaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtatcttga 21391880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 21780913 - 21781206
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21780913 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 21781012  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||| || |||     
T  21781013 ttttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattattatagt 21781112  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||| ||  ||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  21781113 aagtcggtgtattactcttctgctgaggaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtatcttga 21781206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 21786081 - 21786374
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21786081 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 21786180  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||| || |||     
T  21786181 ttttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattattatagt 21786280  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||| ||  ||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  21786281 aagtcggtgtattactcttctgctgaggaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 21786374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 22421621 - 22421903
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22421621 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtgattt 22421720  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| || || |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  22421721 tgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaattcttggcatgaactagttagtgtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 22421820  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    || ||  |||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22421821 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggtaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattggaacgtgatgg 22421903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22523598 - 22523330
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  22523598 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttttctatgtttggtcttgattt 22523499  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  22523498 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 22523399  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaa 278  Q
    |  ||  |||||||||| |  ||||| |||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22523398 ttggtgtatttctcttctgctgaagaagaaagtagcgcaaagttcttgtctaccaagcagctgaagcaa 22523330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 22375183 - 22375446
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  22375183 atatgaatggagagatggtcgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctc-cgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtagagattt 22375281  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  22375282 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 22375381  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 274  Q
    || ||  |||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||    
T  22375382 tcggtgtatttttcttctgccgacgaggaaagtggcgcagaattcttgtctactaagtagctgaa 22375446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 22246162 - 22246444
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22246162 atatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattt 22246261  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    ||||||  |||| |||||| ||||||||||||  ||| |||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||    
T  22246262 tgaaattaatttggtttgtttacctttgagtgaaatggatgtaatccttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattagttgttttagtaag 22246361  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||  |  |||| ||||| |  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  22246362 tcgatgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggtgcataattcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 22246444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Original strand, 22245744 - 22245868
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22245744 atatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattt 22245843  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacct 134  Q
    ||||||  |||| |||||| |||||    
T  22245844 tgaaattaatttggtttgtttacct 22245868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22373924 - 22373705
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| | | ||    
T  22373924 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttgatagaga 22373825  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||| | || ||| | || | ||  |||||| |||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||     
T  22373824 ctttgaagttgatcttgtatgtttgccatcgacaggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagt 22373725  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  22373724 aagacggtacatttttcttc 22373705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 22028009 - 22028291
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||| |||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  22028009 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattt 22028108  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||  | || ||||| ||| | || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| |||    
T  22028109 tgaggtcgacttagtatgtttgccgttgacgggtatgaatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatataaattgttttagtaag 22028208  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
     | || ||||| ||||| || ||||| ||  |||  |  ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  22028209 acggtgcatttttcttctgttgaagaagagggtgaagtggagttcttgtctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatgg 22028291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 277
Target Start/End: Original strand, 21919987 - 21920100
Alignment:
Q  164 gaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctact 263  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21919987 gaactggttggaatagaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttcttttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctact 21920086  T
Q  264 aagcagctgaagca 277  Q
    ||||||||||||||    
T  21920087 aagcagctgaagca 21920100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21928483 - 21928270
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||  ||| | ||||||||||||||| | ||    
T  21928483 ctgatatgaatggcgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagctgtgcgttgtctatgtttggtagaga 21928384  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  |||||| || | ||| | || ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||     
T  21928383 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatataatttttgggatgaactggatagagtataaccgtgttcatattaattgctttagt 21928284  T
Q  207 aagtcagtacattt 220  Q
    ||| | ||||||||    
T  21928283 aagacggtacattt 21928270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20391130 - 20390850
Alignment:
Q  18 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 117  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  20391130 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttg 20391031  T
Q  118 atttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 217  Q
    || | || ||| | || ||||  |||||| |||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||| |||||| ||| |  | ||    
T  20391030 atcttgtatgtttgccgttgatgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattattttagtaagacgatgca 20390931  T
Q  218 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatctt 298  Q
    ||| ||||| |  || || || |||   || ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  20390930 tttttcttctgctgaggaagagagtaaagctgagttcttgactactaaacagctgaagcaattagaacgtgatgggatctt 20390850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 19985235 - 19985141
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 101  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  19985235 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggt 19985141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22053918 - 22053720
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| |||  ||||||   |||||||||||| | ||    
T  22053918 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgaggtgtcctacatctatgtttggtagaga 22053819  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
     ||||   | |||||||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  22053818 ctttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgggttcatatcaattgctttag 22053720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Original strand, 31414258 - 31414352
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 101  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||    
T  31414258 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggt 31414352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28983966 - 28983747
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  28983966 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 28983867  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||  || || || |||||||| || ||||  |||||| |||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  28983866 ttttgtgattgacttggtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 28983767  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  28983766 aagacggtacatttctcttc 28983747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 29301152 - 29301323
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| |||  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  29301152 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 29301251  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagta 178  Q
     ||||   | |||||||||||| | || ||    |||||| |||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  29301252 ctttgtggttgatttagtttgtttgccgttatcgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 29301323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28989185 - 28988966
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  28989185 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgatactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 28989086  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||  || || || |||||||| || ||||  |||||| |||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  28989085 ttttgtgattgacttggtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 28988986  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  28988985 aagacggtacatttctcttc 28988966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 16268950 - 16269126
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| |  ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  16268950 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgcttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagaga 16269049  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 183  Q
    ||| |   | |||||||||||||| || |||   |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  16269050 tttcgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataacc 16269126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 27357591 - 27357423
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  27357591 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagaga 27357492  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttaga 175  Q
    |||||   | |||||||||||||| || |||   |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||    
T  27357491 ttttgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttaga 27357423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14335374 - 14335081
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335374 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 14335275  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335274 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 14335175  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14335174 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 14335081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 44788643 - 44788936
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44788643 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 44788742  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44788743 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 44788842  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44788843 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 44788936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8201026 - 8200733
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8201026 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 8200927  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8200926 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 8200827  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8200826 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 8200733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8710583 - 8710290
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710583 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 8710484  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710483 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 8710384  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8710383 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 8710290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 18587463 - 18587756
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18587463 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 18587562  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18587563 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 18587662  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18587663 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 18587756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10873662 - 10873375
Alignment:
Q  13 tgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873662 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 10873563  T
Q  113 aatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873562 aatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtca 10873463  T
Q  213 gtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873462 gtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 10873375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 11234505 - 11234798
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11234505 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 11234604  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11234605 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 11234704  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11234705 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 11234798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13689019 - 13688726
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13689019 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 13688920  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13688919 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 13688820  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13688819 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 13688726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18180721 - 18180430
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18180721 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 18180622  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18180621 ttttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttctcatcaattgttttagc 18180522  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18180521 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagag--tttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 18180430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 15158349 - 15158642
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15158349 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15158448  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15158449 tttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 15158548  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15158549 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 15158642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 11550394 - 11550687
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  11550394 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtga 11550493  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11550494 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 11550593  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  11550594 aagtcagtgtattcctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 11550687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 17703747 - 17704040
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17703747 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 17703846  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  17703847 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagaatacaaccatgttcatatcaattgttttagc 17703946  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17703947 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagaagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 17704040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14957532 - 14957239
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  14957532 ctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtga 14957433  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14957432 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 14957333  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  14957332 aagtcagtgtatttctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 14957239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12690468 - 12690187
Alignment:
Q  19 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 118  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12690468 gagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 12690369  T
Q  119 tttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  12690368 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaagcatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtat 12690269  T
Q  219 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  12690268 ttctcttccgccgaagaagaatgtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 12690187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9591342 - 9591053
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9591342 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtga 9591243  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  9591242 ttttgaaatggatttagtt----tacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgtacatatcaattgttttagc 9591147  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9591146 aagtcaatgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 9591053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 202
Target Start/End: Original strand, 15146217 - 15146410
Alignment:
Q  9 gatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatt 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  15146217 gatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttcgaaatgtcctttatctatgtttgatcttgatt 15146316  T
Q  109 ttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttt 202  Q
    |||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15146317 ttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatagttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttt 15146410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14042662 - 14042402
Alignment:
Q  18 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| || ||||  | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  14042662 ggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctatgtttgatcatgattttgaaattg 14042563  T
Q  118 atttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 217  Q
    | || |||||| ||||||| ||||||||| |||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||| ||  |    
T  14042562 acttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtaatccctagcatgaactggttagaatacaaccatgttcacattaatttttttagtaagtcggtgta 14042463  T
Q  218 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaa 278  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14042462 tttctcttctgctgaagaagaaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 14042402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14352692 - 14352432
Alignment:
Q  18 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| || ||||  | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  14352692 ggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctatgtttgatcatgattttgaaattg 14352593  T
Q  118 atttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 217  Q
    | || |||||| ||||||| ||||||||| |||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||| ||  |    
T  14352592 acttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtaatccctagcatgaactggttagaatacaaccatgttcacattaatttttttagtaagtcggtgta 14352493  T
Q  218 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaa 278  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14352492 tttctcttctgctgaagaagaaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 14352432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 141 - 300
Target Start/End: Original strand, 14149862 - 14150021
Alignment:
Q  141 ggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaa 240  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||    
T  14149862 ggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccattttcatatcaattgttttagcaagtgagtgtatttctcttccgctgaagaggaaa 14149961  T
Q  241 gtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14149962 gtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggagcgcgatggtattttga 14150021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15627485 - 15627233
Alignment:
Q  24 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||| | |  ||| ||||| | ||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  15627485 atggttttcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctttagtgtgtctaaggtgttctttgccgatgtttggtcgagactttgaaattgatttag 15627386  T
Q  124 tttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctc 223  Q
    ||||| | | ||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||  ||||| ||  |||| ||    
T  15627385 tttgtttgcatttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgttttaataagtcggtgtatttttc 15627286  T
Q  224 ttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagc 276  Q
    ||| |  ||||| || ||||| || ||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  15627285 ttctgcggaagaagagagtggagcggagttcttaactactaagcagctgaagc 15627233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 177 - 300
Target Start/End: Original strand, 16726845 - 16726968
Alignment:
Q  177 tacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagc 276  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  16726845 tacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagaagctgaagc 16726944  T
Q  277 aactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    || |||||||||||||||| ||||    
T  16726945 aaatggaacgcgatggtattttga 16726968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19149990 - 19149771
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  19149990 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 19149891  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| |  || |||| ||| | |||||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||     
T  19149890 ctttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagt 19149791  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| |  ||||||| |||||    
T  19149790 aagacgatacatttttcttc 19149771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20749389 - 20749170
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  20749389 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 20749290  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| |  || |||| ||| | |||||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||     
T  20749289 ctttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagt 20749190  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| |  ||||||| |||||    
T  20749189 aagacgatacatttttcttc 20749170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13676430 - 13676184
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  13676430 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 13676331  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  13676330 ctttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 13676231  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 253  Q
    ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  13676230 aagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagtt 13676184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 18051223 - 18051442
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||    
T  18051223 ctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagaga 18051322  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |    
T  18051323 ttttgaagtagatttagtgtgtttaccgttgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaac 18051422  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  18051423 aagactgtgcatttttcttc 18051442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 277
Target Start/End: Original strand, 15099873 - 15100143
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||  ||||||||||||||| | ||    
T  15099873 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagaga 15099972  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||  |||||||| |||| ||||  |||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |    
T  15099973 ctttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaac 15100072  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| || |||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  15100073 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagctgagttcctatctactaaacagttgaagca 15100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13024324 - 13024153
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || || ||||  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  13024324 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccgttgtctatgtttggtaggga 13024225  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagta 178  Q
    ||||    | || ||||| |||||||| ||||  |||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  13024224 ttttttggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggtatgaattggttagagta 13024153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14140658 - 14140439
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  14140658 ctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 14140559  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||  | || ||||| ||| | || ||||  || ||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| || ||||||||     
T  14140558 ttttgaggtagacttagtctgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaaatggttagagtataaccgagttcatatcaactgttttagt 14140459  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  14140458 aagacggtacatttttcttc 14140439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 14261516 - 14261734
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||| |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  14261516 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 14261615  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
      ||||| | ||| |||| ||||| || |||   |||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||||| |||||     
T  14261616 -attgaagtcgatctagtatgtctgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgtattcatattaattgctttagt 14261714  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  14261715 aagacggtgcatttttcttc 14261734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 16947742 - 16947961
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||| | ||    
T  16947742 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagaga 16947841  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||| | | || ||||||||  | || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||     
T  16947842 ctttgtagtcgacttagtttgcttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 16947941  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  16947942 aagacggtgcatttttcttc 16947961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 11385700 - 11385875
Alignment:
Q  8 tgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| |||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | |||    
T  11385700 tgatatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcaggaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagat 11385799  T
Q  108 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 183  Q
    |||||  | || ||||||||| | || ||||  || ||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  11385800 tttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 11385875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 26092068 - 26092287
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  26092068 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 26092167  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  26092168 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 26092267  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  26092268 aagacggtacatttctcttc 26092287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12459607 - 12459431
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||| | ||    
T  12459607 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttatctatgtttggtagaga 12459508  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 183  Q
     ||||   | |||||||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  12459507 ctttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataacc 12459431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Original strand, 15146416 - 15146464
Alignment:
Q  247 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15146416 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 15146464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 26115860 - 26116030
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  26115860 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 26115959  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagt 177  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||  | |||||||| ||||||||||    
T  26115960 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 26116030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 14283644 - 14283820
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| || |||| |||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  14283644 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 14283743  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 183  Q
    ||||||  | || ||||||||| | || ||||  || ||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  14283744 ttttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 14283820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 49155280 - 49155061
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||  | |||||||||||| | ||    
T  49155280 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtagaga 49155181  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||  || ||||| ||||| || || ||||  |||||| |||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  49155180 ttttgtgattgatttggtttgcctgccgttgacgggtatggatgttatttttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 49155081  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  49155080 aagacggtacatttctcttc 49155061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15343410 - 15343305
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||   || |||| |||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  15343410 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtaaagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 15343311  T
Q  107 ttttga 112  Q
    ||||||    
T  15343310 ttttga 15343305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 199
Target Start/End: Original strand, 12798771 - 12798963
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| || |||| ||||||  | ||| | |  ||||  ||||||||||||||| | ||    
T  12798771 ctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactcaagctaagggttcagtaactacttctcttatttgtctaagttgtctgttgtctatgtttggtagaga 12798870  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattg 199  Q
     |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||    
T  12798871 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattg 12798963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21755391 - 21755215
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||| | || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  21755391 ctgatatggaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 21755292  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 183  Q
    ||| |   | |||||||||||||| || |||   |||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  21755291 tttcgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaattggttagagtataacc 21755215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
Target Start/End: Original strand, 12204081 - 12204176
Alignment:
Q  18 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  | |||| |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  12204081 ggagaaatggttgttgaaactctagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaa 12204176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 40925087 - 40925306
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||  | || ||||||||| | ||    
T  40925087 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccatgtttggtaggga 40925186  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||  | |||||||| |||||||| || || |  |||| ||| || || |||||     
T  40925187 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgagttcatatcaactgctttagt 40925286  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  40925287 aagacggtacatttctcttc 40925306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 13965938 - 13966061
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  | || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  13965938 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagaga 13966037  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtct 130  Q
    |||||   | ||||||||||||||    
T  13966038 ttttgtggttgatttagtttgtct 13966061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 41)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 40711701 - 40711408
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40711701 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 40711602  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40711601 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 40711502  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40711501 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 40711408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16359423 - 16359130
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359423 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16359324  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359323 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 16359224  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16359223 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 16359130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34569415 - 34569122
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569415 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 34569316  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569315 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 34569216  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34569215 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 34569122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 22330352 - 22330645
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22330352 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 22330451  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22330452 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 22330551  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22330552 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 22330645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27521327 - 27521034
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27521327 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 27521228  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27521227 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 27521128  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27521127 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggcgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 27521034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27613277 - 27612984
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27613277 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 27613178  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27613177 ttttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 27613078  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27613077 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 27612984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 27665955 - 27666248
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665955 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 27666054  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666055 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 27666154  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27666155 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 27666248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41773763 - 41773470
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  41773763 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtactttgtctatgtttggtcgcga 41773664  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773663 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 41773564  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41773563 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 41773470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 37288961 - 37289254
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37288961 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctttgtttggtcgtga 37289060  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37289061 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 37289160  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37289161 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgtagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 37289254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19772881 - 19772588
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19772881 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 19772782  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19772781 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatcctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 19772682  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19772681 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagttgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 19772588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22137589 - 22137296
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22137589 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtga 22137490  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137489 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 22137390  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22137389 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 22137296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22350840 - 22350547
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22350840 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcga 22350741  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22350740 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaatttttttagc 22350641  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350640 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 22350547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 29473538 - 29473831
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29473538 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 29473637  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29473638 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 29473737  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29473738 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacgatatcttga 29473831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 14997204 - 14997497
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997204 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 14997303  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997304 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 14997403  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14997404 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacagtatcttga 14997497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Original strand, 27682866 - 27683158
Alignment:
Q  8 tgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27682866 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 27682965  T
Q  108 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagca 207  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27682966 ttcgaaatggatttagtgtgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactgtttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagca 27683065  T
Q  208 agtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  27683066 agtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaaggaactggaacgcaacggtatcttga 27683158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20803518 - 20803225
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20803518 ctgatatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 20803419  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||    
T  20803418 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaagtggttagagtacaaccatgttcatatcaattgctttagc 20803319  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20803318 aagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgaaggtatcttga 20803225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18782035 - 18781742
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18782035 ctgatatgaatggagagatggttgttgaaactccagctaagggttccgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 18781936  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  18781935 ttttgaaatggattaagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 18781836  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18781835 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 18781742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21882695 - 21882402
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21882695 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 21882596  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21882595 ttttgagatggatttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 21882496  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21882495 aagtcggtgtatttctcctccgtctaggaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtattttga 21882402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 295
Target Start/End: Original strand, 21342879 - 21343167
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21342879 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 21342978  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  21342979 ttttgaaatggatttagtttgtataccattgaacggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 21343078  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 295  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21343079 aagtcagtttatttctattccgttgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtat 21343167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25429341 - 25429049
Alignment:
Q  8 tgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25429341 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtctatgtttgatcgtgat 25429242  T
Q  108 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagca 207  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |    
T  25429241 tttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagta 25429142  T
Q  208 agtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    | |||||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  25429141 aatcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctaccaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 25429049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 26736195 - 26736463
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26736195 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggtttggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 26736294  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  26736295 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgatccttggaatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 26736394  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaa 278  Q
    || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  26736395 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaaatttttgtctatgaagcagctgaagcaa 26736463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23474113 - 23473831
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23474113 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtattaaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattt 23474014  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| || || |||||| ||||||||||||| ||| | || || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  23474013 tgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggacgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 23473914  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    || ||  |||| ||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  23473913 tcggtgtatttttcttctgctgaagaagaaagtggtgcagaattcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 23473831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 291
Target Start/End: Original strand, 21336762 - 21337043
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  || ||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21336762 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggtttggtgactacttctcgtgtgtgtttaagatgtcttttgtctatgtttggtcgcgattt 21336861  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| || || | |||| ||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  21336862 tgaaattgacttggattgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 21336961  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 291  Q
    || ||  |||| ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  21336962 tcggtgtatttttcttctgctgaagaagaaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatg 21337043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23525951 - 23525869
Alignment:
Q  64 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23525951 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 23525869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20311754 - 20311573
Alignment:
Q  24 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 123  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||| ||||    
T  20311754 atggttgtcgaaaccccaactaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtggacttag 20311655  T
Q  124 tttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
    | ||| |  | |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||  ||| | |||| ||| |||||||||||    
T  20311654 tctgtttgtcgttgagtggtatggatgtgatactaggtatgaactggttggagtttaactatgttcatatcaattgttttag 20311573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 277
Target Start/End: Original strand, 23563633 - 23563903
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||| | ||||||||||||||| | ||    
T  23563633 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtacgttgtctatgtttggtagaga 23563732  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  23563733 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccattgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 23563832  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    ||| | || ||||| |||||    ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  23563833 aagacggtgcatttttcttctacagaagaagagagtggagcagagttgctatctactaaacagttgaagca 23563903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 21983653 - 21983861
Alignment:
Q  18 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 117  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||| | ||||||||| | |    
T  21983653 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtttatgtttggtagagattttgaagttg 21983752  T
Q  118 atttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 217  Q
    || |||| ||| | || ||||  |||||| |||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||| | || ||    
T  21983753 atctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgttttagtaagacggtgca 21983852  T
Q  218 tttctcttc 226  Q
    ||| |||||    
T  21983853 tttttcttc 21983861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 205
Target Start/End: Original strand, 21561501 - 21561688
Alignment:
Q  18 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 117  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  21561501 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagttg 21561600  T
Q  118 atttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
    || |||| ||| | || ||||  ||| || |||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  21561601 atctagtatgtttgccattgacgggtgtggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgttttag 21561688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20824356 - 20824086
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  20824356 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 20824257  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||  | |||||||| |||||||| |||   || ||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||   |||||||||||||| |    
T  20824256 tttcgaggtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtattaattgttttaac 20824157  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    ||| | || || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||    
T  20824156 aagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggagcagagtttctaactactaaacagttgaagca 20824086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20778816 - 20778531
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  20778816 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 20778717  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||  | || ||||| |||||||| |||   || ||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||   |||||||||||||| |    
T  20778716 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtattaattgttttaac 20778617  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||| | || || || ||||| |  ||||| || ||||| ||| ||||| |  ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  20778616 aagacggtgcacttttcttctgcggaagaagagagtggagcacagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 20778531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 28892407 - 28892692
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  28892407 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 28892506  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||| | || ||||| |||||||| |||   || ||| |||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||  ||   |||||||||||||| |    
T  28892507 ttttgaagtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgtcatcttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtattaattgttttaac 28892606  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||| | || || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  28892607 aagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggagcagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 28892692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 292
Target Start/End: Original strand, 17266804 - 17267084
Alignment:
Q  12 atgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttg 111  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | |||||||    
T  17266804 atgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttg 17266903  T
Q  112 aaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtc 211  Q
    || | || ||||||||| | || ||||  || ||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||   |||| ||| || |||||||| ||| |    
T  17266904 aagtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataactgagttcatatcaactgttttagtaagac 17267003  T
Q  212 agtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
     |||||||| ||||||| |||||| || ||||  |  |||||||||  ||| |||||  |||||||  ||||||| |||||    
T  17267004 ggtacatttttcttccgccgaagaagagagtgaagttgagtttttgaatacgaagcaaatgaagcagttggaacgtgatgg 17267084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 23460892 - 23460824
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtt 75  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23460892 ctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtt 23460824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21410038 - 21409890
Alignment:
Q  24 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 123  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| | ||||||| | |||| ||||    
T  21410038 atggttgtcgaaaccccggctaaggcttcggtgactagttctctagtatgcttgaagtgtcctttgttgatgtttggtagagattttgcagtggacttag 21409939  T
Q  124 tttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggtt 172  Q
    | ||| | || |||| ||| ||| |||| || || ||||||||||||||    
T  21409938 tctgtttgccgttgactgggatggatgtaatactaggtatgaactggtt 21409890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22464853 - 22464569
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  22464853 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 22464754  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||  | || ||||| |||||||| |||   || ||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||  ||   ||| |||||||||| |    
T  22464753 ttttgaggtcgacttagtatgtctaccgttgttgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtacaaccgagtctgtataaattgttttaac 22464654  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 291  Q
    ||| | || || || ||||| |  |||||||| ||||| ||||||||| |  ||||||| ||  |||||||  ||||||| ||||    
T  22464653 aagacggtgcacttttcttctgcggaagaggagagtggagcagagtttctaactactaaacaattgaagcagttggaacgggatg 22464569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Original strand, 23078370 - 23078464
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 101  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||    
T  23078370 ctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggt 23078464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 14884456 - 14884684
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  14884456 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 14884555  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||  | |||||||| |||||||| || || |  |||| ||| || || |||||     
T  14884556 ttttgtgattgatttagtttgtcttccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgggttcatatcaactgctttagt 14884655  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaaga 235  Q
    ||| | |||||||||||||| || |||||    
T  14884656 aagacggtacatttctcttctgttgaaga 14884684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Original strand, 21631867 - 21631924
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctct 67  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21631867 atatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21631924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22505579 - 22505406
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||  | | |||||    
T  22505579 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttcatagagattt 22505480  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 183  Q
    ||   |||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  22505479 tgtggtggatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagtataacc 22505406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 25850975 - 25850807
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  25850975 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaaggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 25850876  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttaga 175  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||    
T  25850875 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatgaatgttatttttggaatgaattggttaga 25850807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 20345185 - 20345140
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 52  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20345185 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 20345140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12479589 - 12479296
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479589 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 12479490  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479489 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 12479390  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12479389 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 12479296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 16234015 - 16234308
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234015 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16234114  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234115 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 16234214  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16234215 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 16234308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 17092172 - 17092465
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092172 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 17092271  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092272 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 17092371  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17092372 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 17092465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23958736 - 23958443
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958736 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 23958637  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958636 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 23958537  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23958536 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 23958443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8389401 - 8389108
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389401 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttcactcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 8389302  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389301 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggaatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 8389202  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8389201 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 8389108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19635125 - 19634832
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19635125 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgttcggtcgtga 19635026  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19635025 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 19634926  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19634925 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaaagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 19634832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 8050646 - 8050939
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8050646 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtga 8050745  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050746 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 8050845  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8050846 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacacgacggtatcttga 8050939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 14301002 - 14301295
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14301002 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtga 14301101  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14301102 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 14301201  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14301202 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 14301295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 19775816 - 19776109
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775816 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 19775915  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775916 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 19776015  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19776016 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacagtatcttga 19776109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27714325 - 27714032
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27714325 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtga 27714226  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27714225 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 27714126  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27714125 aagtcagtatatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 27714032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 40476029 - 40475736
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40476029 ctgatatgaatggagagatggtggtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 40475930  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40475929 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttatagc 40475830  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40475829 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttgtatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 40475736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 18224469 - 18224762
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18224469 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 18224568  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  18224569 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgttattttgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcataacaattgttttagc 18224668  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18224669 aagtcagtgtatttctcttccgttgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 18224762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 16250873 - 16251166
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16250873 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16250972  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  16250973 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtataaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 16251072  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  16251073 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttaactactaaatagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 16251166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 15144915 - 15145209
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144915 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15145014  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag- 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  15145015 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtga-tctgggtataaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagt 15145113  T
Q  206 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagt-ggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15145114 caagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtaggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 15145209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14683556 - 14683263
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  14683556 ctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtga 14683457  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14683456 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcagtatggatgtgattctgggaatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 14683357  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    | ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  14683356 atgtcagtgtatttctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 14683263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14188484 - 14188210
Alignment:
Q  18 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14188484 ggagagatggttgtcgaaactccagctaaaggttcggttactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctttgtttgatcgtgattttgaaatgg 14188385  T
Q  118 atttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||       
T  14188384 atttagtttgtttacctttgagtggaatgaatgtgattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcttatcaactgttttagcaattcggtgtc 14188285  T
Q  218 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
     | ||| || |  ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14188284 ctcctcctctgctgaagaagaaagtggagtggagttcttgtctactaagcagctgaagcaactagaacgagatgg 14188210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14697087 - 14696805
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || | |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14697087 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgagattt 14696988  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  14696987 tgaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 14696888  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    |||||  |||| ||||| |  |||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  14696887 tcagtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaaattcttttctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 14696805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14162459 - 14162174
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| |  |||||||||||||||| || ||||||    
T  14162459 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcctttgtctatgtatgatcgtga 14162360  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14162359 ttttgaaatggatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcttattaattgttttagc 14162260  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||||| ||    ||||| || || ||||| ||||| || | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  14162259 aagtcggtgtccttctcctctgttgaagaagaaagcggagtagagttcttgtctaccaagcaactgaagcaactagaacgtgatgg 14162174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 16061 - 16351
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16061 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 16160  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
      |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| |||    
T  16161 ctaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttaaagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaag 16260  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    || ||  ||||| |||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  16261 tcggtgtatttcccttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttgtctactaaacagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 16351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16219184 - 16218934
Alignment:
Q  42 gctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtg 141  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  16219184 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtg 16219085  T
Q  142 gtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaag 241  Q
    | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  16219084 gaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattggtttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaag 16218985  T
Q  242 tggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  16218984 tggcgcagagttcttgtctatcaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 16218934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16222504 - 16222254
Alignment:
Q  42 gctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtg 141  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  16222504 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtg 16222405  T
Q  142 gtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaag 241  Q
    | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  16222404 gaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattggtttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaag 16222305  T
Q  242 tggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  16222304 tggcgcagagttcttgtctatcaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 16222254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 300
Target Start/End: Original strand, 16352697 - 16352846
Alignment:
Q  151 tgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 250  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16352697 tgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 16352796  T
Q  251 gtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16352797 gttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 16352846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 155
Target Start/End: Original strand, 16350579 - 16350725
Alignment:
Q  9 gatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatt 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16350579 gatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtctggtcgtgatt 16350678  T
Q  109 ttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgatt 155  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16350679 tcgaaatggatctagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatt 16350725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15073348 - 15073129
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||| | ||    
T  15073348 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtcagtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagaga 15073249  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||| | || ||||| || ||||  |||||| |||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||     
T  15073248 ctttgaagttgatcttgtatgtctgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagt 15073149  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  15073148 aagacggtacatttttcttc 15073129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 168 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22632528 - 22632396
Alignment:
Q  168 tggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagc 267  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| || || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22632528 tggttggagtataaccatgttcatattaattgttttagtaaatcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagc 22632429  T
Q  268 agctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    || |||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  22632428 agttgaagcagttagaacgtgatggtattttga 22632396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 14993650 - 14993869
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | |     
T  14993650 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtggagg 14993749  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||  | |||||| |||| ||||  |||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||     
T  14993750 ctttgaagtcgaccttgtttgtttaccgttgacgggtatgcatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttagt 14993849  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  14993850 aagacggtgcatttttcttc 14993869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 29450820 - 29450991
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  29450820 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 29450919  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagta 178  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  29450920 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 29450991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 51604075 - 51604360
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||    
T  51604075 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagaga 51604174  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||| | || ||||||||| | ||  |||  || ||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |    
T  51604175 ttttgaagtagacttagtttgtttgccgctgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaac 51604274  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| |  ||  |||| ||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  51604275 aagactgtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagttgaaattttatctacaaagcagatgaagcaattagaacgtgatgg 51604360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 3262077 - 3262296
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  3262077 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 3262176  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  3262177 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 3262276  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  3262277 aagacggtacatttctcttc 3262296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 13513339 - 13513286
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgacta 60  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13513339 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgacta 13513286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27903374 - 27903198
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  27903374 ctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 27903275  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 183  Q
    ||||||  | || ||||| |||||||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  27903274 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatgaatgttattttagggatgaattggttagagtataacc 27903198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 292
Target Start/End: Original strand, 14848543 - 14848673
Alignment:
Q  162 atgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtcta 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  || || ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| ||| |  | |||||||    
T  14848543 atgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattattttattaaatcggtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaaactcttgtcta 14848642  T
Q  262 ctaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  14848643 ctaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 14848673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 44659149 - 44659319
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  44659149 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 44659248  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagt 177  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||  | |||||||| ||||||||||    
T  44659249 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 44659319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 15354323 - 15354499
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| |||||| || |||| |||||| || ||| | | |||||  ||||||||||||||| | ||    
T  15354323 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctacgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagaga 15354422  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 183  Q
     ||| || | || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || |||||||| |||||||| ||||    
T  15354423 ctttaaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactgattagagtataacc 15354499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 20893020 - 20892916
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||||||   | |||| | |||||||||||| | ||    
T  20893020 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtatcctatatctatgtttggtagaga 20892921  T
Q  107 ttttg 111  Q
    |||||    
T  20892920 ttttg 20892916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Original strand, 53750753 - 53750813
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctct 67  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  53750753 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 53750813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 16150625 - 16150531
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 101  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| |||||||||||||||    
T  16150625 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggt 16150531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 16154771 - 16154677
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 101  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| |||||||||||||||    
T  16154771 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggt 16154677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 183
Target Start/End: Original strand, 11204519 - 11204691
Alignment:
Q  11 tatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttt 110  Q
    |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   ||||||   |||||||||||| | ||||||    
T  11204519 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctaaatctatgtttggtagagatttt 11204618  T
Q  111 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 183  Q
    |   | |||||||||||||| || |||   |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  11204619 gtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataacc 11204691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12889317 - 12889024
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889317 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 12889218  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889217 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 12889118  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12889117 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 12889024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13255298 - 13255005
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255298 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 13255199  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255198 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 13255099  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13255098 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 13255005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 16754223 - 16754516
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16754223 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctctgtctatgtttggtcgtga 16754322  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16754323 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 16754422  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754423 aagtcagtacatttctcttccgtcgaggaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 16754516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3688551 - 3688258
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688551 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 3688452  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688451 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttacagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 3688352  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688351 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 3688258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16638381 - 16638088
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638381 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16638282  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638281 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 16638182  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16638181 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 16638088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 20059576 - 20059869
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059576 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 20059675  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059676 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 20059775  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20059776 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 20059869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43165283 - 43164990
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165283 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 43165184  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165183 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 43165084  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43165083 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 43164990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 48428055 - 48427762
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428055 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 48427956  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48427955 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattattttagc 48427856  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48427855 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 48427762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 5422452 - 5422745
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5422452 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtga 5422551  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5422552 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 5422651  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5422652 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 5422745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6603343 - 6603051
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603343 ctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 6603244  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6603243 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggtt-gagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 6603145  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6603144 aagtcaatacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 6603051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 15345767 - 15346060
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15345767 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15345866  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15345867 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtaaggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 15345966  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15345967 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttga 15346060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 15586914 - 15587207
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15586914 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15587013  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15587014 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgaatggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 15587113  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15587114 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 15587207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 15713578 - 15713871
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713578 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15713677  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713678 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 15713777  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15713778 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacgatatcttga 15713871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 26790935 - 26791228
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26790935 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 26791034  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791035 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 26791134  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26791135 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 26791228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 53382540 - 53382833
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382540 ctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 53382639  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53382640 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttggagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 53382739  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382740 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctaccaaacagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 53382833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10908818 - 10908525
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10908818 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtca 10908719  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908718 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 10908619  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10908618 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 10908525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10008208 - 10007915
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10008208 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcga 10008109  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10008108 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 10008009  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10008008 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcaactgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 10007915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15358691 - 15358398
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15358691 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15358592  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15358591 ttttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaactagttagagtgcaaccacgttcttattaattgttttagc 15358492  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15358491 aagtcagtgcatttttcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacacgatggtatcttga 15358398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 15400039 - 15400332
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400039 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcttagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15400138  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15400139 ttttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagt 15400238  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400239 aagtcagtgcatttttcttccgtcgaagagaagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 15400332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 14874093 - 14874383
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14874093 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaaagttctttgtctatgtttggtcgtgattt 14874192  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  14874193 tgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttcgagtagaaccatgttcatattaattattttagcaag 14874292  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||  ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14874293 tcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaattggtgcagagttcttgtttactaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtatattga 14874383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15065679 - 15065400
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15065679 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaatctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtttgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 15065580  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||     
T  15065579 ttttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttaga 15065480  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacg 286  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15065479 aagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacg 15065400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24185798 - 24185505
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  24185798 ctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24185699  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24185698 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 24185599  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  24185598 aagtcagtgtatttctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 24185505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Original strand, 16804470 - 16804762
Alignment:
Q  8 tgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16804470 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgcttgcgatgtcttctgtctatgtttggtcgtgat 16804569  T
Q  108 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||| ||    
T  16804570 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattattttacca 16804669  T
Q  208 agtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16804670 agtcagtgtatttctcttccgttgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 16804762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16694772 - 16694479
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16694772 ctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttctgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16694673  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  16694672 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatttaattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 16694573  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16694572 aagtcaatgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 16694479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 106 - 289
Target Start/End: Original strand, 26190937 - 26191120
Alignment:
Q  106 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26190937 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 26191036  T
Q  206 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcga 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26191037 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcga 26191120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Original strand, 14578933 - 14579200
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14578933 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtaactacttctatagtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 14579032  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  14579033 tgaaattgatttggtttgtttgcctttgagtggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 14579132  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14579133 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagaatttttatctactaagcagctgaagca 14579200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15262235 - 15261953
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15262235 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaatggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattt 15262136  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| || || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  15262135 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtgtgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 15262036  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    |||||  |||| |||||    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  15262035 tcagtgtatttttcttctactgaagaagaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 15261953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17492459 - 17492166
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| || ||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  17492459 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagagttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtttatgtttgatcgtga 17492360  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  17492359 ttttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagt 17492260  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    || || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  17492259 aaatctgtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcggagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 17492166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Original strand, 12843628 - 12843895
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12843628 atatgaatggagagatgattgttgaaactccagctaatggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtttatgtttgatcgtgattt 12843727  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| || || |||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  12843728 tgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 12843827  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    || ||  |||||||||  |  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||| ||||||    
T  12843828 tcggtgtatttctcttatgctgaagaggaaagtggcgcataattcttgtctactaagcagcagaagca 12843895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 159 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18437596 - 18437457
Alignment:
Q  159 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18437596 ggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatagtaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 18437497  T
Q  259 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatctt 298  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  18437496 ctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaatctt 18437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 291
Target Start/End: Original strand, 12858006 - 12858290
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12858006 ctgatatgaatggagaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagtga 12858105  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||| | || ||| | || ||||  |||||| |||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||     
T  12858106 ctttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgatgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagt 12858205  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 291  Q
    ||| | |||||||||||||| || || ||  |||||    | ||||| ||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||    
T  12858206 aagacggtacatttctcttctgttgaggaaaaaagtaaaactgagttcttgactactaagcagctgaaacaattagaacgtgatg 12858290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12272956 - 12272737
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  12272956 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagaga 12272857  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||| |||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  12272856 ctttgaagtcgatctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 12272757  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  12272756 aagacggtgcatttttcttc 12272737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17494265 - 17494062
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaa-ctccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | | |||||| ||||||||||||||| | |    
T  17494265 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaaactccagctaagggttcagtaactaattctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagag 17494166  T
Q  106 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
    | |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  17494165 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatgtatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 17494066  T
Q  206 caag 209  Q
    ||||    
T  17494065 caag 17494062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 14291043 - 14291241
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  14291043 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 14291142  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
     |||||| | ||| | || ||| | || |||   |||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  14291143 ctttgaagtcgatcttgtatgtttgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccatgttcatattaattgctttag 14291241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47126562 - 47126343
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  47126562 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 47126463  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || ||||  |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  47126462 ttttgtaattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 47126363  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  47126362 aagacggtacatttctcttc 47126343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17188992 - 17188871
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  17188992 ctgatatggagggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 17188893  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgt 128  Q
    ||||||| | || |||||||||    
T  17188892 ttttgaagtagacttagtttgt 17188871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 31692696 - 31692981
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  31692696 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 31692795  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || ||| |||| ||| | || |||||||| |||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  31692796 ctttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactgattagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 31692895  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || |||| |||||| ||  |  ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  31692896 aagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtgttgcagaattcctaactactaaacagttgaagcaattggagcgcgatgg 31692981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10408586 - 10408367
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  10408586 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtgtgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 10408487  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  10408486 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatcgggttcatatcaactgctttagt 10408387  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  10408386 aagacggtacatttctcttc 10408367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13944642 - 13944423
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||    
T  13944642 ctgatatggaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctagtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagaga 13944543  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |    
T  13944542 ttttgaagtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaac 13944443  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  13944442 aagactgtgcatttttcttc 13944423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Original strand, 15013284 - 15013476
Alignment:
Q  11 tatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttt 110  Q
    |||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | | ||||    
T  15013284 tatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagag-tttt 15013382  T
Q  111 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
    | | |||| ||||| | ||| || |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  || ||||  ||| | |||| ||| |||||||||||    
T  15013383 gcagtggacttagtat-tctgccgttgagtggaatggatgtgatactaggtatgaactacttggagtttaactatgttcatataaattgttttag 15013476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 10417556 - 10417841
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  10417556 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 10417655  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||  | || ||||| |||||||| |||   || ||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||   |||  |||||||||||||| |    
T  10417656 tttcgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataactgagtttgtattaattgttttaac 10417755  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||| | || || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  10417756 aagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggagcagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 10417841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 12358038 - 12358239
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  12358038 ctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 12358137  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | || ||||||||| || | ||||  |||||| |||| ||| | |  ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  12358138 ctttgaagtcgacttagtttgtttagcgttgacgggtatggatgttatttttgcgatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 12358237  T
Q  207 aa 208  Q
    ||    
T  12358238 aa 12358239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 31941521 - 31941236
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||   || |||| |||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||  | ||    
T  31941521 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtctagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgcccgttgtctatgtttggcagaga 31941422  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  31941421 ctttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatataaattgttttagc 31941322  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||| |||| ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||  |  ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  31941321 aagacagtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagaattcctaactactaaacagttgaagcaattggagcgcgatgg 31941236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14575604 - 14575406
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  14575604 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 14575505  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
     |||||| | ||  |||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || |||||||||||||| || ||||  | || ||||||||| |||||    
T  14575504 ctttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttggaatgaactggttagattataaccgagctcgtattaattgctttag 14575406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 24189922 - 24189817
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  24189922 ctgatatgaagggagagatggttgttgagactccagctaagggttcagtgactacttttctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 24189823  T
Q  107 ttttga 112  Q
    ||||||    
T  24189822 ttttga 24189817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 16832039 - 16832258
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  16832039 ctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 16832138  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||  | || ||||||||| | || ||||  || ||| | || ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||     
T  16832139 ttttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 16832238  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  16832239 aagacggtacatttttcttc 16832258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 16825792 - 16825990
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||  ||||| | ||    
T  16825792 ctgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctataattggtagaga 16825891  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
     |||||| | ||| | |||||| |||| ||||  |||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  16825892 ctttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 16825990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 8744901 - 8745022
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||    
T  8744901 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagaga 8745000  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgt 128  Q
    ||||||| | || |||||||||    
T  8745001 ttttgaagtagacttagtttgt 8745022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 11958692 - 11958863
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  11958692 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 11958791  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagta 178  Q
     ||||   | |||||||||||| |  | |||   |||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  11958792 ctttgtggttgatttagtttgtttgtcgttgtcgggtatggatgttattttcggtatgaattggttagagta 11958863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 16378445 - 16378664
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||    
T  16378445 ctgatattaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatatctatgtttggtagaga 16378544  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||  | || ||||||||| | || ||||  || ||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| || ||||||||     
T  16378545 ttttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgttttagt 16378644  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  16378645 aagacggtacatttttcttc 16378664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28756937 - 28756718
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| |    |||||| | |||||||||||| | ||    
T  28756937 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctacggtgtcctatatctatgtttggtagaga 28756838  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||  || ||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||  | |||||||| |||||||| || || |  |||| ||| || || |||||     
T  28756837 ttttgtgattgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgagttcatatcaactgctttagt 28756738  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  28756737 aagacggtacatttctcttc 28756718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12180959 - 12180762
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||   | |||||| ||||||||||||||| | || ||    
T  12180959 atatgaaaggagaaatggttgttgacactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtccaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactt 12180860  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagca 207  Q
    |||| | || ||||||| | |||| ||||  ||||||  ||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||||    
T  12180859 tgaagtcgacttagtttctttaccgttgacgggtatggttgttatctttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagca 12180762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15230210 - 15230002
Alignment:
Q  18 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||||| || |||||||  ||||| |||||||||||| || | ||||||||| | |    
T  15230210 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgttttgtagagattttgaagttg 15230111  T
Q  118 atttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 217  Q
    || | || ||| | || || |  |||||| |||| ||  | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  15230110 atcttgtatgtttgccgttaacgggtatggatgtaatctttgggatgaactagttagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagtaagacggtaca 15230011  T
Q  218 tttctcttc 226  Q
    ||| |||||    
T  15230010 tttttcttc 15230002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15236078 - 15235870
Alignment:
Q  18 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||||| || |||||||  ||||| |||||||||||| || | ||||||||| | |    
T  15236078 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgttttgtagagattttgaagttg 15235979  T
Q  118 atttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 217  Q
    || | || ||| | || || |  |||||| |||| ||  | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  15235978 atcttgtatgtttgccgttaacgggtatggatgtaatctttgggatgaactagttagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagtaagacggtaca 15235879  T
Q  218 tttctcttc 226  Q
    ||| |||||    
T  15235878 tttttcttc 15235870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 253
Target Start/End: Original strand, 18131857 - 18132103
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||  ||||||||||||||| | ||    
T  18131857 ctgatatgaaaggggaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagaga 18131956  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     | |||| | || ||||| ||| |||| ||||  |||||| |||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  18131957 ctatgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggtatggatgttattttttggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 18132056  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 253  Q
    ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  18132057 aagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagtt 18132103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Original strand, 16327220 - 16327314
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 101  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| |||||| || ||||||   |||||| | ||||||||||||    
T  16327220 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggt 16327314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 274
Target Start/End: Original strand, 11888027 - 11888143
Alignment:
Q  159 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttct-cttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 257  Q
    |||| ||||| ||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||  || || ||| |||| | |||| || ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  11888027 ggtaagaactagttggagtataaccatgttcatattaattgttttaataaatcggtatattttttcttctgttgaagaagagagtggagcagagtttttg 11888126  T
Q  258 tctactaagcagctgaa 274  Q
     ||||||||||||||||    
T  11888127 actactaagcagctgaa 11888143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 12509994 - 12510170
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||  ||| |  || | |||||| || ||||||   |||| | | |||||||||||| | ||    
T  12509994 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagatttcagcaaccacttctctggtttgtttggggtgtcttatatctatgtttggtagaga 12510093  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 183  Q
    |||||   | |||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  12510094 ttttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagtataacc 12510170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 253
Target Start/End: Original strand, 11949499 - 11949665
Alignment:
Q  87 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacg 186  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || ||| |||| ||| | |  ||||||||||| ||||| ||||  |    
T  11949499 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgatgggaatggatgttatttttgcgatgaactggttcgagtataaccgag 11949598  T
Q  187 ttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 253  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  11949599 ttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagtt 11949665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 244
Target Start/End: Original strand, 13969783 - 13969868
Alignment:
Q  159 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtgg 244  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  13969783 ggtatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgctttaacaagacagtgcatttttcttccgccgaagaagagagtgg 13969868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Original strand, 13318087 - 13318215
Alignment:
Q  81 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtaca 180  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | ||| | || |||||||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| |    
T  13318087 tgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggttgatcttgtatgtctaccgttgatgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtata 13318186  T
Q  181 accacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||  |||| ||| |||||||||| ||||    
T  13318187 accgagttcatataaattgttttaacaag 13318215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 52
Target Start/End: Original strand, 11949436 - 11949481
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 52  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11949436 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 11949481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 48
Target Start/End: Original strand, 13318045 - 13318086
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagg 48  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13318045 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 13318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16983860 - 16983567
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16983860 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16983761  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16983760 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 16983661  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16983660 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 16983567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17001620 - 17001327
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17001620 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 17001521  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17001520 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 17001421  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17001420 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 17001327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9338202 - 9337909
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338202 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 9338103  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338102 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 9338003  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9338002 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 9337909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9486836 - 9486543
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9486836 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 9486737  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9486736 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 9486637  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9486636 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 9486543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 22323165 - 22323458
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22323165 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 22323264  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22323265 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttaggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 22323364  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22323365 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 22323458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27220636 - 27220343
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220636 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 27220537  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220536 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 27220437  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27220436 aagtcagtacgtttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 27220343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 44383393 - 44383686
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383393 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 44383492  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383493 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 44383592  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44383593 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgtagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 44383686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 21142864 - 21143157
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21142864 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 21142963  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21142964 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 21143063  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143064 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 21143157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24712654 - 24712361
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712654 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24712555  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712554 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 24712455  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24712454 aaatcagtacatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 24712361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27373889 - 27373596
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373889 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 27373790  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373789 tttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 27373690  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27373689 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttga 27373596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10871470 - 10871177
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10871470 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcgtttgtctatgtttggtcgtga 10871371  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871370 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 10871271  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871270 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 10871177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 24874573 - 24874866
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24874573 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggtttcggtgactacttctctcgtatgtttcaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24874672  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24874673 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacattcttattaattgttttagc 24874772  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24874773 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 24874866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24264990 - 24264697
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24264990 ctgatatgagtggatagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtga 24264891  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264890 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 24264791  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24264790 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttctatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 24264697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 41606210 - 41606501
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41606210 ctgatatgaatggagagatggt-gtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctt-gtctatgtttggtcgtga 41606307  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41606308 tttcgaaatggatttagtttgtctatctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 41606407  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41606408 aagtctgtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 41606501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 277
Target Start/End: Original strand, 11351534 - 11351804
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11351534 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 11351633  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11351634 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgatatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 11351733  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  11351734 aagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagca 11351804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 24657481 - 24657774
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24657481 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24657580  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||     
T  24657581 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttgatatgaattgggtagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagt 24657680  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24657681 cagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggagcagagttcttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 24657774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24678107 - 24677814
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24678107 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaacttcagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24678008  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||    
T  24678007 ttttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagc 24677908  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24677907 aagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcaaagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacacgatggtattttga 24677814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 24705305 - 24705598
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24705305 ctgatatgaatgcagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtaactacttctctcgtatgtttgagatgccctttgtctatgtttggtcgtga 24705404  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  24705405 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtattaatatgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 24705504  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24705505 aagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 24705598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 21323089 - 21323382
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21323089 ctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 21323188  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||| ||| || |||||||||    
T  21323189 tttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtgtggatgtgattctgggtatgaattggttgcaatacaaccatgttcatatgaactgttttagc 21323288  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21323289 aagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggcgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 21323382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23204934 - 23204641
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||  |||||||||    
T  23204934 ctgatatgaatggagagatggttgtcgatactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgctcgcgatgtcctttgtctatggatggtcgtga 23204835  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  23204834 ttttgtaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 23204735  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23204734 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggagagtgatgcagagttcttatctactaagcagttgaagcaaatggaacgcgatggtatcttga 23204641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 23105551 - 23105836
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23105551 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 23105650  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||| |||     
T  23105651 ttttgagatggatttagtttgtctacctttgatcggtatggatgtgtttctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagt 23105750  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  23105751 aagtcggtgtatttctcttctgatgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagtagttggaacgtgatgg 23105836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 23029284 - 23029491
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23029284 ctgatatgaatggagtgatggttgtcgaaaatccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 23029383  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  23029384 tttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagc 23029483  T
Q  207 aagtcagt 214  Q
    ||||||||    
T  23029484 aagtcagt 23029491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23074483 - 23074190
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| || |||    
T  23074483 ctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcttga 23074384  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||     
T  23074383 ttttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagt 23074284  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  23074283 aagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttatctaccaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 23074190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 45673835 - 45674012
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  45673835 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcttttgtctatgtttggtcgtga 45673934  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacca 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45673935 ttttgaaatgaatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacca 45674012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 277
Target Start/End: Original strand, 22733597 - 22733867
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||| | | |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22733597 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtataagatgtcccttgtctatgtttgatcgtga 22733696  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||     
T  22733697 ttttcagattgatttggtttgtctagctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgacctggttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagt 22733796  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    ||||| ||   ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22733797 aagtcggtgtttttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 22733867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 24817666 - 24817930
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | | ||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  24817666 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattt 24817765  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    ||| || ||||| |||||| | ||||||||| | ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||  |||||||||| ||  |||    
T  24817766 tgagattgatttggtttgtttgcctttgagtagaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtgtaaccatgttcacattaattgttataataag 24817865  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 274  Q
    || ||  |||| ||||  |||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  24817866 tcggtgtatttttcttttgtcgaagaagagagtgcagcagagttcttgtctactaatcaactgaa 24817930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 226
Target Start/End: Original strand, 23097840 - 23098060
Alignment:
Q  6 actgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | |    
T  23097840 actgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 23097939  T
Q  106 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
    ||||||   | || ||||| |||||||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||    
T  23097940 attttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggtatggatgtcatttttggaatgaactgggtagagtataaccgtgttcatatcaattgttttag 23098039  T
Q  206 caagtcagtacatttctcttc 226  Q
    |||| | || ||||| |||||    
T  23098040 caagacggtgcatttttcttc 23098060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Original strand, 22742789 - 22742856
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgt 74  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22742789 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 22742856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 19716840 - 19717038
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||| | ||    
T  19716840 ctgatttgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagaga 19716939  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
     |||||| | || ||||||||| | || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  19716940 ctttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 19717038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23274213 - 23274011
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  23274213 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 23274114  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||| ||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  23274113 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatggactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 23274014  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  23274013 aag 23274011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19817450 - 19817269
Alignment:
Q  24 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 123  Q
    ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| | ||||||||| || |||||| | ||||||| | |||| ||||    
T  19817450 atggttgtcaaaaacccggctaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtttcctttgtcgatatttggtagagattttgcagtggacttag 19817351  T
Q  124 tttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
    | ||| | || |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||| || |  ||| | |||| |||||||||||||||    
T  19817350 tctgtttgccgttgagtgggatggatgtgatactaggtatgaactggttggaatttaactatgttcatattaattgttttag 19817269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23113332 - 23113124
Alignment:
Q  18 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  23113332 ggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagttg 23113233  T
Q  118 atttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 217  Q
    || |||| ||| | || ||||  |||||| |||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||  ||| ||||||||||| ||| |  ||||    
T  23113232 atctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgtttatataaattgttttagtaagacgataca 23113133  T
Q  218 tttctcttc 226  Q
    ||| |||||    
T  23113132 tttttcttc 23113124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12576973 - 12576754
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||    
T  12576973 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaatgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagaga 12576874  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |    
T  12576873 ttttgaagtagacttagtgtgtttaccgttgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaac 12576774  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  12576773 aagactgtgcatttttcttc 12576754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 23065033 - 23064973
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctct 67  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23065033 ctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23064973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Original strand, 30208747 - 30208941
Alignment:
Q  11 tatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttt 110  Q
    |||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||| || ||| || || || || ||||||||||| ||||||| | | ||||||    
T  30208747 tatgaaaggggaaatggttgtcgaaaccccggcaaagggttcggtgactaattttctagtgtgcttaaagtgtcctttgtcgatgtttgatagagatttt 30208846  T
Q  111 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
    | | |||| ||||| ||| | || |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  || || |  ||| | |||| |||||||||||||||    
T  30208847 gcagtggacttagtctgtttgccattgagtgggatggatgtgatactaggtatgaactaattggaatttaactatgttcatattaattgttttag 30208941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23279322 - 23279150
Alignment:
Q  81 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtaca 180  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||| ||||||||||||| |    
T  23279322 tgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatggactggttagagtata 23279223  T
Q  181 accacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 253  Q
    |||  |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||    ||||| |||||||| ||||||||    
T  23279222 accgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctacggaagaagaaagtggagcagagtt 23279150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20848209 - 20848086
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  20848209 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 20848110  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtct 130  Q
    |||||  || ||||||||||||||    
T  20848109 ttttgtgattgatttagtttgtct 20848086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 300
Target Start/End: Original strand, 11351800 - 11351836
Alignment:
Q  264 aagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11351800 aagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 11351836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28312483 - 28312190
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312483 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 28312384  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28312383 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 28312284  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312283 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 28312190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 29589867 - 29590160
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589867 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 29589966  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589967 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 29590066  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29590067 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 29590160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27190287 - 27189996
Alignment:
Q  9 gatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatt 108  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27190287 gatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgatt 27190188  T
Q  109 ttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27190187 ttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaa 27190088  T
Q  209 gtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27190087 gtcagtacatttctcttctgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 27189996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Original strand, 27258953 - 27259244
Alignment:
Q  9 gatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatt 108  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27258953 gatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgatt 27259052  T
Q  109 ttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27259053 ttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaa 27259152  T
Q  209 gtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27259153 gtcagtacatttctcttctgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 27259244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 28260625 - 28260918
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28260625 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 28260724  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28260725 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 28260824  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28260825 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgatatcttga 28260918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28285291 - 28284998
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28285291 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 28285192  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28285191 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 28285092  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28285091 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgatatcttga 28284998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 28339374 - 28339667
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339374 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 28339473  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28339474 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttattaattgttttagc 28339573  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28339574 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgatatcttga 28339667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25115405 - 25115112
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115405 ctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 25115306  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115305 ttttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 25115206  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115205 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaggaggaaagtggtgcaaagtttttatccactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 25115112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 2872230 - 2872524
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872230 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 2872329  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872330 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 2872429  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagag-tttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2872430 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttttatctactaagcagctgaagcaactagaacgcgacggtatcttga 2872524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16574743 - 16574450
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16574743 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16574644  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16574643 tttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtccttattaattgttttagc 16574544  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16574543 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttga 16574450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 16620637 - 16620930
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620637 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 16620736  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16620737 tttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtccttattaattgttttagc 16620836  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16620837 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttga 16620930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 24293210 - 24293503
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24293210 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 24293309  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24293310 tttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattagttgttttagc 24293409  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  24293410 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgatgcaactggaacgtgacggtatcttga 24293503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 27559397 - 27559690
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27559397 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 27559496  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  27559497 ttttgaaatggatttagtttgtctacttttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 27559596  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27559597 aagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaaagttcttatctactaagcaggtgaagcaactggaacgcgatggtattttga 27559690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19867537 - 19867247
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19867537 atatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 19867438  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  19867437 cgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaag 19867338  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  19867337 tcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgtagagttcttgtctaccaagcagctgaaacaactagaacgcgatggtattttga 19867247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 65 - 300
Target Start/End: Original strand, 22827841 - 22828076
Alignment:
Q  65 tctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatg 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22827841 tctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatg 22827940  T
Q  165 aactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctacta 264  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  22827941 aattgcttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgaagagtttttatctacta 22828040  T
Q  265 agcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22828041 agcaggtgaagcaactggaacgcgatgatatcttga 22828076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22436722 - 22436429
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22436722 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgttctttgtctatgtttggtcgtga 22436623  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| || ||| | |||||  | |||||||||||||||   || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22436622 ttttgagattgatatggtttgcttgcctttgagtggtatgggcgtcattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 22436523  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22436522 aagtcagtgtatttctctttcgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtattttga 22436429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 16925068 - 16925361
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16925068 ctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccagctaagggatcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttttctatgtttggtcgtga 16925167  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | || || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  16925168 ttttgaaatggatttagtttgtttgcctttgagtggtatggacgtcatccttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 16925267  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  16925268 aagtcagtgtatttctcttccatcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatgtagcgcgatggtattttga 16925361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 5836656 - 5836949
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5836656 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactaccactctagtatgtttgaaatgtcctttttctatgtttggtcgtga 5836755  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||  ||||    
T  5836756 ttttgaaatggatttagtttgtctccctttgagcggtatggatgttattcttggtaggaattggttagagtacaatcatgttcatattaattgtgctagc 5836855  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5836856 aagtcagtgtatttctcttcagtcgaagaggaaagtggtgcagaattcttatctactaaacagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 5836949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 295
Target Start/End: Original strand, 18405372 - 18405660
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||    
T  18405372 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcccttgtctatgtttgattgtga 18405471  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||     
T  18405472 ttttgaaattaatttggtttgtctgcctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattacttgttttagt 18405571  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 295  Q
    || |||||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  18405572 aaatcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttgtctaccaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtat 18405660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23081265 - 23080991
Alignment:
Q  18 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  23081265 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattatgaaattg 23081166  T
Q  118 atttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 217  Q
    | || |||||| ||||||||| ||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |    
T  23081165 acttggtttgtttacctttgattggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaatcatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgta 23081066  T
Q  218 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    |||||||||    |||||||||||||| ||| | |||| |||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  23081065 tttctcttcttctgaagaggaaagtggcgcaaaattttggtctaccaagcagttgaagcaattagaacgtgatgg 23080991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 18182798 - 18183066
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  18182798 atatgaatggagagatggtagtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcatttgtctatgcttggtcgagattt 18182897  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| |||    ||||| |||||||| |||| ||| |||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||    
T  18182898 tgaaattgatacgttttgtttacctttgtgtggaatggatgtaatccttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattattttagtaag 18182997  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaa 278  Q
    |||||  | || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18182998 tcagtgtacttttcttctgctgaagaagaaagtggagcagagttcttgtctactaagtagctgaagcaa 18183066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20135747 - 20135556
Alignment:
Q  87 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacg 186  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| || || |||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  20135747 ttgtctatgtttggccgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatggactagttagagtacaaccatg 20135648  T
Q  187 ttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaa 278  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||  | || ||||  |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20135647 ttcatattaattgttttagtaagtcagtgtacttttcttttgctgaagaagaaagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 20135556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 278
Target Start/End: Original strand, 22197122 - 22197313
Alignment:
Q  87 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacg 186  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| || || |||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  22197122 ttgtctatgtttggccgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatggactagttagagtacaaccatg 22197221  T
Q  187 ttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaa 278  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||  | || ||||  |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22197222 ttcatattaattgttttagtaagtcagtgtacttttcttttgctgaagaagaaagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 22197313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 162
Target Start/End: Original strand, 23085257 - 23085408
Alignment:
Q  11 tatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttt 110  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  23085257 tatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttggtagagatttt 23085356  T
Q  111 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggta 162  Q
    ||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  23085357 gaaattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggta 23085408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 180 - 300
Target Start/End: Original strand, 16961082 - 16961203
Alignment:
Q  180 aaccacgttcttat-taattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaa 278  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16961082 aaccatgttcttatctaatagttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaa 16961181  T
Q  279 ctggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  16961182 ctggaacgtgatggtatattga 16961203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 205
Target Start/End: Original strand, 30678469 - 30678650
Alignment:
Q  24 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||    
T  30678469 atggttgtcgaaactccagctaagggtttggttactacttctctagtgtgtctgaagtgttcgttgtcgatgtttggtcgagactttgaagttgatttag 30678568  T
Q  124 tttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
    | ||| | ||||||||||| ||| |||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  30678569 tctgttttcctttgagtggaatggatgtaatacttggtatgaattggttggagtataaccatgttcacattaattgttttag 30678650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19437855 - 19437627
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| |||| |||||||| | | ||    
T  19437855 ctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtttatgtttgttagaga 19437756  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | || ||||||||| | ||||||| ||||||| |||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  19437755 ctttgaagtcgacttagtttgttttcctttgactggtatggatgttatttttgggatgaacttgttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 19437656  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaaga 235  Q
    ||| | || ||||| ||||| || |||||    
T  19437655 aagacggtgcatttttcttctgtggaaga 19437627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 226
Target Start/End: Original strand, 21567418 - 21567638
Alignment:
Q  6 actgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | |    
T  21567418 actgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 21567517  T
Q  106 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
    ||||||   | || ||||| |||||||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  21567518 attttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgtcatttttggaatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 21567617  T
Q  206 caagtcagtacatttctcttc 226  Q
     ||| | || ||||| |||||    
T  21567618 taagacggtgcatttttcttc 21567638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19455876 - 19455657
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||| | ||||||||||||||| | ||    
T  19455876 ctgatatgaaaggtgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgttcgttgtctatgtttggtagaga 19455777  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  19455776 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 19455677  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  19455676 aagacggtgcatttttcttc 19455657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18797543 - 18797324
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||  | |||| | |||||||||||| | ||    
T  18797543 ctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactctagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtttcctatatctatgtttggtaggga 18797444  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||  | || ||||| ||| ||||  |||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| || || ||||||    
T  18797443 ttttgaggtagacttagtgtgtttaccgctgacgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatataaactgctttagc 18797344  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| |||| ||||| |||||    
T  18797343 aagacagtgcatttttcttc 18797324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 34643014 - 34643190
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||    
T  34643014 ctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtaggga 34643113  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 183  Q
    ||||||| | ||  |||||||  |||||||||  || ||| |||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  34643114 ttttgaagtagacctagtttgcttacctttgacggggatggatgttatatttgggatgaattggttagagtataacc 34643190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21474453 - 21474234
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    ||||||||||  || | |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||  || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  21474453 ctgatatgaatagaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcatgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 21474354  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||| | || ||| |  | ||||  |||||| |||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||     
T  21474353 ctttgaagttgatcttgtatgtttgtcgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgttttagt 21474254  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  21474253 aagacggtacatttttcttc 21474234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15462189 - 15461904
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | ||    
T  15462189 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttatctatgtttggtagaga 15462090  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||  | || ||||| |||||||| |||   || ||| |||| ||  | || ||||| |||||||| || ||||  |||  |||||||||||||| |    
T  15462089 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttatcttcgggatgaattggttagaatataaccgagtttgtattaattgttttaac 15461990  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||| | || ||||| |||||  | ||||| || ||||| ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  15461989 aagacggtgcatttttcttctatggaagaagagagtggagcagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 15461904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25770697 - 25770478
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||  | |||| |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  25770697 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaatctccagcaaagggttcaatcactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 25770598  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||  | || ||| | || ||||  |||||| |||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| ||||||     
T  25770597 ctttgaagttgaccttgtatgtttgccattgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattattttagt 25770498  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| || ||||||| |||||    
T  25770497 aagacaatacatttttcttc 25770478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Original strand, 19486734 - 19486918
Alignment:
Q  19 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 118  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||| |||||| || |||||||  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||| | ||    
T  19486734 gagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttga 19486833  T
Q  119 tttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
    | |||| ||| | ||  |||  |||||| |||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  19486834 tctagtatgtttgcc--tgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatgaattgttttag 19486918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 10466276 - 10466561
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||||| |  ||||  || |||||||||||| | ||    
T  10466276 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtctgttatctatgtttggtaggga 10466375  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     ||||   | |||||||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || || || ||||||||||| ||||  |||| ||| || || |||||     
T  10466376 ctttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggataaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctttagt 10466475  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||| | || ||||| ||||| |  ||||| ||| |||  |  ||||| |||||||| || ||| |||| || |||||||| |||||    
T  10466476 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaggtgaagttgagttcttgtctacaaaacagatgaaacagctggaacgtgatgg 10466561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 24515842 - 24516061
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||| ||||  | |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  24515842 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagttaagtgttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 24515941  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||| |||| ||| |||| ||||  || ||| |  | ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  24515942 ctttgaagtcgatctagtgtgtttaccgttgacgggaatggacattatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 24516041  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  24516042 aagacggtgcatttttcttc 24516061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24367253 - 24367083
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||| ||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | ||||| |||||| | ||    
T  24367253 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggattcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatctttggtagaga 24367154  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagt 177  Q
    |||||  || |||||||||||||| || || |  |||||| |||| ||  | |||||||| ||||||||||    
T  24367153 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttcacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 24367083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 19466021 - 19465976
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 52  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19466021 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 19465976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 101
Target Start/End: Original strand, 20010885 - 20010976
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 101  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||||    
T  20010885 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatttttggt 20010976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 51
Target Start/End: Original strand, 14377344 - 14377388
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtt 51  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14377344 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcaaagggtt 14377388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10386 - 10093
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10386 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 10287  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10286 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtttttattaattgttttagc 10187  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10186 aagtcagtgcatttctcttccctcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgggacgcgatggtatcttga 10093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 258; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22265 - 21972
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22265 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 22166  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 22066  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22065 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaaaaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttga 21972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41173 - 40880
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41173 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 41074  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  41073 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacattcttataaattgttttagc 40974  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40973 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaggcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 40880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 13410 - 13703
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||    
T  13410 ctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttatcaatggttggtcgtga 13509  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  13510 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgttatggatgtgattttgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagc 13609  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13610 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagaattcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 13703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11487 - 11194
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11487 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 11388  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11387 ttttgaaatggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 11288  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11287 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcgactggaacgcgatggtatcttga 11194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17955 - 17662
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 17856  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17855 ttttgaaatggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 17756  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17755 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcgactggaatgcgatggtatcttga 17662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 29 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 53723 - 53452
Alignment:
Q  29 tgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53723 tgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgt 53624  T
Q  129 ctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccg 228  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53623 ctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccg 53524  T
Q  229 tcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53523 tcgaagaggaaagtggtgcaaagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 53452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 277
Target Start/End: Original strand, 47952 - 48070
Alignment:
Q  159 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||| | || ||||| |||||    ||||| || ||||| |||||||| ||      
T  47952 ggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagtaagacggtgcatttttcttctacggaagaagagagtggagcagagttcttaa 48051  T
Q  259 ctactaagcagctgaagca 277  Q
    ||||||| ||| |||||||    
T  48052 ctactaaacagttgaagca 48070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3442 - 3149
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3442 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 3343  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3342 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 3243  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3242 aagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcgaagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 3149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17178 - 16885
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  17178 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttaagatgccctttatctatgtttagtcgtga 17079  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  17078 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccgtgttcatatcaattgttttagc 16979  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  16978 aagtcagtgtacttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaatgcgatggtattttga 16885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36516 - 36229
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36516 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 36417  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  36416 ttttgaaatggatctagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 36317  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 294  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36316 aagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtttaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 36229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 159 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28944 - 28803
Alignment:
Q  159 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28944 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgt 28845  T
Q  259 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28844 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 28803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 1318 - 1611
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1318 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 1417  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  1418 ttttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttacagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 1517  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1518 aagtcagtgtatttctcttccatcgaagaggaaagtggtgtagagtttctatctactaagcagctgaagcaactgcaacgcgatggtattttga 1611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 17352 - 17645
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17352 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtga 17451  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  17452 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgatatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 17551  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17552 aagtcagtatatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagaagctgaagcaattggaacgcgatggtattttga 17645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 295
Target Start/End: Original strand, 195124 - 195412
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  195124 ctgatatgattggagagatagttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggacgtga 195223  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||  ||||||||||| |||    
T  195224 tttcgagatggatttagtttctctacctttgagcggtgtggatgtgattctgggtatgaactgattgcaatacaaccatgttcacattaattgtttcagc 195323  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 295  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  195324 aagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaattagaacgcgatggtat 195412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24321 - 24126
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  24321 atatgaatggagaaatggttgtcgaaaccccggctaagggttcagtgactacttctctagtatgcctgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattt 24222  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
    || | ||||  |||| ||| |  | |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  24221 tgtagtggacctagtctgtttgtcgttgagtgggatggatgtgatactaggtatgaactggttggagtttaaccatgttcatattaattgctttag 24126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 29214 - 29507
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29214 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtga 29313  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  29314 ttttgaaatggatttagtttgtctacatttgagcggtatggatgtgattctggatatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 29413  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  29414 aagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagaaactggagcgcgatggtattttga 29507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 300
Target Start/End: Original strand, 10448 - 10737
Alignment:
Q  11 tatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttt 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10448 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttt 10547  T
Q  111 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagt 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||    
T  10548 gagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaattggttagagtacaatcatgttcatattagttgttttagcaagt 10647  T
Q  211 cagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10648 cagtgtatttctcctctgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagaagctgaagcaactggaacgcgatggtatattga 10737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8276 - 7983
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8276 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcattgtccgttgtctatgtttggtcgtga 8177  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8176 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagc 8077  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  8076 aagtcagtgtatttctcttccgccgaagaggatagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 7983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 37106 - 37399
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37106 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgatatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 37205  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||  | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  37206 tttcaagatggacttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagc 37305  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37306 aagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 37399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26367 - 26100
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | | ||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  26367 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtcgagactt 26268  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||  |||    
T  26267 tgaaattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgttttaataag 26168  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    || ||| |||| ||||| ||  |||| || ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26167 tcggtatatttttcttctgttaaagaagagagtggggcggagtttttgactactaagcagctaaagca 26100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 35001 - 35293
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35001 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 35100  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  35101 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtga-tctgggtataaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagc 35199  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35200 aagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 35293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41647 - 41357
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41647 atatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 41548  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || | |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  41547 tgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttgatatgaatttgttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 41448  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||    
T  41447 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaatgtgatggaatcttga 41357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 75367 - 75077
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  75367 atatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 75268  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || | |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  75267 tgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttgatatgaatttgttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 75168  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||    
T  75167 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaatgtgatggaatcttga 75077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 295
Target Start/End: Original strand, 50631 - 50919
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50631 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 50730  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  50731 ttttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaactggttaaaatacaaccatgttcacattaattgttttagc 50830  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 295  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50831 aagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactagaacgcgatggtat 50919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 42716 - 42518
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  42716 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 42617  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||    
T  42616 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccattgacaggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttag 42518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21622 - 21329
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21622 ctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtga 21523  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  21522 tttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgcgtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagc 21423  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21422 aagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaacaggaacgcgatggtatattga 21329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37046 - 36753
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37046 ctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtga 36947  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  36946 tttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgcgtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagc 36847  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  36846 aagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaacaggaacgcgatggtatattga 36753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31900 - 31609
Alignment:
Q  8 tgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31900 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 31801  T
Q  108 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagca 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31800 tttgatatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagca 31701  T
Q  208 agtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||| |||   |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  31700 agtaagt-gttttctcctctgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagcagctgatgcgactggaacgcgatggtattttga 31609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 10524 - 10817
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  10524 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttaactatgtttggtcgtga 10623  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  10624 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagc 10723  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| | || || ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10724 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcaaaattcttatctactaagtagatgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 10817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37366 - 37075
Alignment:
Q  8 tgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37366 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttctgttactacttctctcttatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 37267  T
Q  108 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagca 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  37266 tttgatatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagca 37167  T
Q  208 agtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||| |||   |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  37166 agtaagt-gttttctcctctgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagcagctgatgcgactggaacgcgatggtattttga 37075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 13179 - 13472
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  13179 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttaactatgtttggtcgtga 13278  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  13279 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagc 13378  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| | || || ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13379 aagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcaaaattcttatctactaagtagatgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 13472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 54652 - 54363
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  54652 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttttctatgtttgatcgtgattt 54553  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  54552 tgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 54453  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttg 299  Q
    || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||| ||||||    
T  54452 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagttgaagcagttagaacgtgatggaatcttg 54363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12678 - 12388
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12678 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 12579  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    ||| || ||| | |||||  | ||||||||||||||| | || ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12578 tgagattgatatggtttgcttgcctttgagtggtatggacgtcattcttggtctgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaag 12479  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12478 tcagtgtatttctcctccgtcaaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactagaacgcgatggtattttga 12388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 11642 - 11935
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11642 ctgatatgaatggagatatggttttttaaactccagctaagggttcggtgactacttgtctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttagtcgtga 11741  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  11742 ttttgaaatgaatttagtttgtctacccttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagc 11841  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11842 aagtcagtgtatttctcttctgtcgaagaggaaagtggtgtagagttcttatctactaagcagctgaagtaactggaacgcgatggtattttga 11935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10801 - 10534
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10801 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtccattgtctatgtttggtcgtgattt 10702  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||    
T  10701 tgaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaag 10602  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    |||||  |||||||||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10601 tcagtgtatttctcttctgcggaagaggaaagtagcgtagagtttttgtctactaagcagctgaagca 10534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 831 - 1050
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  831 ctgatatgaaaggagagatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtgactacttcccttgtttgtttgaggtgtcctctatctatgtttggtaggga 930  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||  | || |||||||||||||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| || |  ||||||    
T  931 ttttgaggtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatggatgtcatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatataaactactttagc 1030  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| |||| ||||| |||||    
T  1031 aagacagtgcatttttcttc 1050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18668 - 18400
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||    
T  18668 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtga 18569  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  18568 ttttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagt 18469  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaag 275  Q
    ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468 aagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaag 18400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14438 - 14203
Alignment:
Q  11 tatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14438 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttt 14339  T
Q  111 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  14338 gaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagt 14239  T
Q  211 cagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 246  Q
    ||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  14238 cagtgtatttttcttccgctgaagaggaaagtggtg 14203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4930 - 4648
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||| || ||||| | ||||||||||||| |||||||||  || ||    
T  4930 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtgtgtttaacatgtcctttgtctttgtttggtcaagagtt 4831  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  4830 tgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 4731  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    |||||| |||| |||||   |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4730 tcagtatatttttcttctaccgaagaagagagtggagcagaattcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgcgatgg 4648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 44713 - 44932
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  44713 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 44812  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  44813 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 44912  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  44913 aagacggtgcatttttcttc 44932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 39619 - 39838
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  39619 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 39718  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  39719 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagt 39818  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  39819 aagacggtacatttctcttc 39838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 277
Target Start/End: Original strand, 24998 - 25268
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24998 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacatctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtga 25097  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||     
T  25098 ttttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactagttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagt 25197  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25198 aagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 25268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3619 - 3349
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  3619 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactgcagctaaggtttcggtaactatttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 3520  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  3519 ttttgaaattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagt 3420  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3419 aagtcggtgtatttctcttctgcggaagaggaaagtggcgcagagtttttatctactaaacagctgaagca 3349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Original strand, 24234 - 24501
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24234 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgcgtttgagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 24333  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |   || ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||     
T  24334 taggattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaaa 24433  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    || ||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24434 tcggtgtatttctcttctgctgaagagaaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 24501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 10058 - 10260
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | | |||||| |||||||||||| || | ||    
T  10058 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttagtagaga 10157  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  10158 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 10257  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  10258 aag 10260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 291
Target Start/End: Original strand, 23822 - 24103
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23822 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttgtctatgtttggtcgagattt 23921  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  23922 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 24021  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 291  Q
    || ||| |||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  24022 tcggtatatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatg 24103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 151582 - 151294
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | | |||||| ||||||||||||||| | ||  |    
T  151582 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagacat 151483  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||| | || ||||||||| |||  ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  151482 tgaagtcgacttagtttgtttacagttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaag 151383  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatctt 298  Q
     | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||  | ||||| || ||| |||||||  |||| || ||||| |||||    
T  151382 acggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagttcctatctacgaaacagttgaagcagttggagcgtgatggaatctt 151294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8241 - 7948
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8241 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 8142  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  8141 ttttgagattcatttggtttgtctaccgttgagtgctatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagt 8042  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    || || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  8041 aattctgtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtcaattaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 7948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 152099 - 151814
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  152099 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 152000  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||| |||     
T  151999 ttttgagattgatttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagt 151900  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||||| ||  ||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  151899 aagtcggtgtatttcgcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttggaacgtgatgg 151814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Original strand, 47272 - 47541
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || ||||| |  |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  47272 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaagg-ttcggtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcttttgtctatgtttgatcgtgattt 47370  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |                  ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |||    
T  47371 tgaaattgatttggtttgtctacctttgaat------------------ggtatgaactggttagagtacaatcatgttcacattaattgttttagtaag 47452  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatctt 298  Q
    ||| |  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  47453 tcaatgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttttagtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaatctt 47541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 85
Target Start/End: Original strand, 30860 - 30938
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcc 85  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30860 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcc 30938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 300
Target Start/End: Original strand, 1907 - 2084
Alignment:
Q  123 gtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttct 222  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||| |    
T  1907 gtttgtttccctttgagtggtatggatgtaatccagggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtattttt 2006  T
Q  223 cttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||| |  ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  2007 cttctgctgaagaagacagtgacgcagagttcttatctactaaacagctgaagcaattagaacgtgatggtattttga 2084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4449 - 4182
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4449 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 4350  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    ||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |  || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  4349 tgagatcgatttggtttgtttacctttgagtggtatgaatgtgattcttggcaaaaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 4250  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    || ||  |||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4249 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcacagagtttttgtctactaagcagctgaagca 4182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6128 - 5846
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  6128 atatgaaaggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtcaatgtttggtcgagatgt 6029  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  6028 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagtgcaacaacgttcatattaattgttttagtaag 5929  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    || ||  |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  5928 tcggtgtatttttcttcggttgaagaagaaagtggagcagagttcttatctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15140 - 14922
Alignment:
Q  8 tgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| |||||| || ||| | |  ||||| |||||||||||| || | |||    
T  15140 tgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagcaactacttctctagtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttcgtagagat 15041  T
Q  108 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagca 207  Q
    |||||| | || ||||||||| | || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| |    
T  15040 tttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgatgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagta 14941  T
Q  208 agtcagtacatttctcttc 226  Q
    || | || ||||| |||||    
T  14940 agacggtgcatttttcttc 14922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 104242 - 103960
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  104242 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 104143  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| || || |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||    
T  104142 tgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggcatggatgtaatcatgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattacttgttttagcaag 104043  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  104042 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 103960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Original strand, 111196 - 111484
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| || ||||| | ||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  111196 atatgaatggagtgatggttgtcgaaactccagctaagggtttgttgactacttctcttgtgtgtttaagatgccctttgtttatgtttgatcgtgattt 111295  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| || || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  111296 tgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 111395  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatctt 298  Q
    || ||  |||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  111396 tcggtgtatttctcttctgctgaaaaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaatctt 111484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 17893 - 17611
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17893 atatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagactt 17794  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||   |||    
T  17793 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaatcatgttcatattaattgttttgttaag 17694  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    || ||  |||| |||||    | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  17693 tcggtgtatttttcttctactgtagaagaaagtggagcagagtttttgtctactaagtagctgaagcaattagaacgcgatgg 17611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 766 - 973
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  766 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctctcgtatgatagaaatgtcctttatatatgtttggtcgtga 865  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| |||    
T  866 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtgcaaccatgttcatatcaattgtttcagc 965  T
Q  207 aagtcagt 214  Q
    ||||||||    
T  966 aagtcagt 973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 126 - 300
Target Start/End: Original strand, 8146 - 8320
Alignment:
Q  126 tgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctctt 225  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8146 tgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccacgttcttattcattgttttagcaagtcagtgcatttctctt 8245  T
Q  226 ccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8246 tcgttgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagaaactggaacgcgatggtatcttga 8320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 8968 - 8706
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||    
T  8968 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtga 8869  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||| |||     
T  8868 ttttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagt 8769  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcag 269  Q
    ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8768 aagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagattttttgtctactaagcag 8706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18065 - 17902
Alignment:
Q  106 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||| |||    
T  18065 attttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatag 17966  T
Q  206 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcag 269  Q
     ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17965 taagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagattttttgtctactaagcag 17902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Original strand, 13768 - 14034
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || || || | |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13768 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagagttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtccattgtctatgtttggtcgagattt 13867  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  13868 taaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 13967  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagc 276  Q
    |||||  |||| ||||| |  |||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  13968 tcagtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcataattcttgtctactaagcagctgaagc 14034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6888 - 6606
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6888 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattt 6789  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| || || |||||| ||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  6788 tgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 6689  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    || ||  |||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  6688 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcacagagttcttatctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14018 - 13736
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14018 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattt 13919  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| || || |||||| ||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  13918 tgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 13819  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    || ||  |||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  13818 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcacagagttcttatctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 13736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 55759 - 56049
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55759 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 55858  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
      |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| |||    
T  55859 ctaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttaaagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaag 55958  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    || ||  ||||| |||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  55959 tcggtgtatttcccttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttgtctactaaacagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 56049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14102 - 13865
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| |||||||||| |||| ||||||    
T  14102 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgttctttgtctatttttgatcgtga 14003  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  14002 ctttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagt 13903  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtgg 244  Q
    ||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||    
T  13902 aagtcggtgtatttctcttctgttgaagaggaaagtgg 13865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8855 - 8770
Alignment:
Q  192 attaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8855 attaattgttttagtaaatcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctaccaagcagctgaagca 8770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 14555 - 14837
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14555 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtatttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattt 14654  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| | || || || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  14655 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggaagtaatccttggaatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 14754  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    |  ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  14755 ttggtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcataattcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 14837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Original strand, 216709 - 216991
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  216709 atatgaatggagagatggttgtagaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttcagatgtcctttgtctatgattggtcgagattt 216808  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    | |||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  216809 taaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 216908  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    || ||  |||| ||||| |  |||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  216909 tcggtgtatttttcttctgctgaagcggaaagtggcgcaaaattcttgtctactaagcagctgaaacaattagaacgcgatgg 216991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 496035 - 495753
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  496035 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtttttaagatgttctttgtctatgtttggtcgagattt 495936  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    | |||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  495935 ttaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaag 495836  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    || ||  |||| |||||    ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  495835 tcggtttatttttcttcttctgaagatgaaagtggcgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 495753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 441668 - 441507
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | | ||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  441668 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattt 441569  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggt 171  Q
    | | || ||||| |||||| | |||| |||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||    
T  441568 ttagattgatttggtttgtttgccttagagtggaatggatgtaattcttggtatgaattggt 441507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 514639 - 514808
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  514639 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagaga 514738  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagag 176  Q
    |||||   | |||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||| | || ||||| |||||||||    
T  514739 ttttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagag 514808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 441493 - 441441
Alignment:
Q  222 tcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 274  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  441493 tcttctgtcgaagaagagagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaa 441441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Original strand, 452651 - 452697
Alignment:
Q  159 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  452651 ggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgttttag 452697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 153 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9812 - 9665
Alignment:
Q  153 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9812 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 9713  T
Q  253 ttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9712 ttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 9665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 17635 - 17914
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || ||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17635 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggctcgctgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctt-gtctatgtttgatcgtga 17733  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||     ||| ||||  |||||||||| |||     
T  17734 ttttgagatggatttagtttgcttacctttgagtggtatggatgtgattattggtatgaactggttggag-----ccatgttcacattaattgttatagt 17828  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  17829 aagtcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttggaacgtgatgg 17914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 40076 - 39791
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  || |||| |||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  40076 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggtttagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 39977  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||   | || ||||| |||||||| ||||  |||||| |||| | | | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||     
T  39976 ttttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacaggtatggatgttagttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatataaattgctttagt 39877  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||| | || ||||| |||||||  ||||| ||  ||| ||  ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  39876 aagacggtgcatttttcttccgatgaagaagagggtgatgtggagttcttgtctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatgg 39791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 4598 - 4317
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || || ||||| | | |||||||||||||||||| || ||||||    
T  4598 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctgagggttcggtgactacttcccttgtgtgtttaagaagtcctttgtctatgtttgatcatgattt 4499  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||    
T  4498 tgaaattgatttggtttgtttacctttgtgtggtatggatgtaattcttgtcatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaag 4399  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 291  Q
    || ||  |||||||||| |  |||||||||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  4398 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagttgcgcagagttcttatctactaaacagctgaagcaattagaacgtgatg 4317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1000 - 781
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1000 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctgtcgtatgcttaaagtgtcctttgtctatgtttgatcgtga 901  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| || || || |||||| ||| ||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  900 ttttgagattgaattggtttgtttacgtttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagt 801  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  800 aagtcagtgtatttctcttc 781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 129 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 630
Alignment:
Q  129 ctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccg 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |    
T  778 ctacgtttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaactatgttcacattaattgttttagtaagtcagtgtatttctcttctg 679  T
Q  229 tcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
       ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  678 ctaaagaggagagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 277
Target Start/End: Original strand, 664 - 934
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  664 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttctgtgactacttcacttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 763  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||| || ||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||     
T  764 ttttgagattgatatggtttgtttacctttgggtggtatggatgtgattatgggtatgaactggttagagtacatccatgttcacattaattgttatagt 863  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    ||||| ||  ||||||||||    |||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  864 aagtcggtgtatttctcttctactgaagaggaaagtggcgaaaagtttttatctacaaagcagctgaagca 934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 106 - 300
Target Start/End: Original strand, 15379 - 15573
Alignment:
Q  106 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  15379 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaactgttttag 15478  T
Q  206 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15479 caagtcggtgtatttctctttcgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtattttga 15573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Original strand, 11166 - 11360
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  11166 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 11265  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtt 201  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||    
T  11266 ttttgagatggatttggtttgtctacctttcagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgtt 11360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 40796 - 41049
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||  ||||||||| || ||||||    
T  40796 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaatatgtccttt--ctatgtttgatcctgattt 40893  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    ||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||    
T  40894 tgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatttaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaaatgttttagtaag 40993  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaa 265  Q
    || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  40994 tcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttgtctactaa 41049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 159 - 1
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  159 ctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaacttcagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcatga 60  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  59 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 15268 - 15532
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||| | || |||||| |||||||||||| |  ||||    
T  15268 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctttagtgtgtttaagatatcctttatctatgtttggtagatattt 15367  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    ||| || ||||| |||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||| || ||||    
T  15368 tgagattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtataaccatgttcacattaattgttataacaag 15467  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 274  Q
    |||||  |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15468 tcagtgtatttttcttctgtcgaagaagagagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaa 15532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 128 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 726 - 554
Alignment:
Q  128 tctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttcc 227  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||     
T  726 tctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgaatttctcctca 627  T
Q  228 gtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  626 gtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 2549 - 2726
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  2549 ctgatatgaatggagacatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 2648  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacca 184  Q
    |||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  2649 ttttgagatagatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaacca 2726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 51 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1426 - 1177
Alignment:
Q  51 tcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatg 150  Q
    |||||||||| |||||| |  ||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| | |||    
T  1426 tcggtgactacttctcttgcgtgtttaagatgtcctttgtctatgcttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtttacctttgagtggtacggatg 1327  T
Q  151 tgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 250  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||| |  |||||||||||||| | |||    
T  1326 tgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgtccatattaattgttttagtaagttggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgtaga 1227  T
Q  251 gtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||| |||||||    
T  1226 gtttttgtctactaagcagttgaagcagttagaacgtgatggaatcttga 1177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 3566 - 3521
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 55  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3566 atatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggt 3521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 23587 - 23851
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| | ||||| ||| |||||||||||| | |||||    
T  23587 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggcgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcatttatctatgtttggtagagattt 23686  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    ||| || ||||| |||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||| || ||||    
T  23687 tgagattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtataaccatgttcacattaattgttataacaag 23786  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 274  Q
    || ||  |||| ||||| |||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23787 tcggtgtatttttcttctgtcgaataagagagtggagcagagttcttgtcaactaagcagctgaa 23851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 9640 - 9904
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | | ||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  9640 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattt 9739  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    ||| || ||||| |||||| | ||||||||| | ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||  |||||||||| ||  |||    
T  9740 tgagattgatttggtttgtttgcctttgagtagaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtgtaaccatgttcacattaattgttataataag 9839  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 274  Q
    || ||  |||| ||||  |||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  9840 tcggtgtatttttcttttgtcgaagaagagagtgcagcagagttcttgtctactaatcaactgaa 9904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 157
Target Start/End: Original strand, 8065 - 8217
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctc--tcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgt 104  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  8065 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaacgttcggtgactacttctctctcgtatgtttgcgatgttctttgtctatgtttggtcgt 8164  T
Q  105 gattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattct 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8165 gattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 8217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 4186 - 4394
Alignment:
Q  18 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 117  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| || ||| || ||||| | |||||  ||||||||||||||| | || | |||| | |    
T  4186 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttatcttgtttgtttaagatgtcaattgtctatgtttggtagagaatatgaagtag 4285  T
Q  118 atttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 217  Q
    |  |||| ||| |||| || |  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  4286 aaatagtatgtttaccgttaaagggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagtaagacggtaca 4385  T
Q  218 tttctcttc 226  Q
     || |||||    
T  4386 cttttcttc 4394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15437 - 15258
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  15437 atatgaaaggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctacgattggtcgagattt 15338  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttc 189  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15337 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttc 15258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5103 - 4838
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | |  ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  5103 atatgaatggagatatggtcgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaaggtgtcctttgtcgatgtttggtcgagactt 5004  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| |  |||    
T  5003 tgaaattgatttagtttgtttgtctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgtttcaataag 4904  T
Q  210 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaag 275  Q
    || ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  4903 tcggtatatttttcttctgctgaagaagagagtggagcaaagttattgactactaagcagctgaag 4838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 57903 - 58062
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  57903 atatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattt 58002  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactg 169  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||| || ||| ||||||| || |||||||||||    
T  58003 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagcggaatggatgtgatccttggtatgaactg 58062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 7254 - 7141
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  7254 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctgagattggtcgtga 7155  T
Q  107 ttttgaaatggatt 120  Q
    ||||||||||||||    
T  7154 ttttgaaatggatt 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 300
Target Start/End: Original strand, 12573 - 12792
Alignment:
Q  80 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtac 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| || | ||||| || ||| ||||||||||||||    
T  12573 atgtcctttgtctatgtttgatcgtaattttgaaattgatttggtttgcttacctttgagtggtatggatataattcttggcatgcactggttagagtac 12672  T
Q  180 aaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaac 279  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| || |  ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||      
T  12673 aaccatgttcatattaattgttttagtaaattggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggtgcagag-ttctatctactaagcagctgaagcagt 12771  T
Q  280 tggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    | ||||| ||||| |||||||    
T  12772 tagaacgtgatggaatcttga 12792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2004 - 1868
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2004 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 1905  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 146  Q
    ||| || ||| | |||||| |||||||||| ||||||    
T  1904 tgagattgatatggtttgtttacctttgagcggtatg 1868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 150 - 300
Target Start/End: Original strand, 1 - 151
Alignment:
Q  150 gtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcag 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  1 gtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcatcagacgaagaggaaagtggtgcag 100  T
Q  250 agtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  101 agttcatatctactaagcagctgaagcaaatggaacgagatggtatattga 151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 178 - 300
Target Start/End: Original strand, 27952 - 28074
Alignment:
Q  178 acaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  27952 acaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtagaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagca 28051  T
Q  278 actggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||| ||||||||||||| ||||    
T  28052 actgaaacgcgatggtattttga 28074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 277
Target Start/End: Original strand, 6489 - 6643
Alignment:
Q  123 gtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttct 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||  ||||||    
T  6489 gtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttatagtacaaccatgttcatattaattgtttaagtaagtcggtgtatttct 6588  T
Q  223 cttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    |||| |  |||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6589 cttctgctgaagaggaaagtggcgtagagttcttatctactaagcagctgaagca 6643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 60757 - 60487
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  60757 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 60658  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||| |||| ||| | || |||   |||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||     
T  60657 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagt 60558  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    ||| | || ||||| ||||| |  ||||| |||||||  || ||||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  60557 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaagtgaagctgagttcttgactactaaacagttgaagca 60487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 70126 - 70081
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 52  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  70126 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 70081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 277
Target Start/End: Original strand, 141 - 411
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | | |||| | ||||||||||||||| | ||    
T  141 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtataagatgtacgttgtctatgtttggtagaga 240  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||| | || ||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  241 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagggtataaccgagttcatattaattgctttagc 340  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    ||  | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| || |||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  341 aaaacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagcggagttcctatctactaaacagttgaagca 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 1169 - 1345
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | | |||||| ||||||||||||||| | ||    
T  1169 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagaga 1268  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 183  Q
     |||||| |||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  1269 ctttgaagtggacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataacc 1345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 8428 - 8329
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8428 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 8329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 277
Target Start/End: Original strand, 21488 - 21743
Alignment:
Q  24 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||| || || ||||||||||| || |||||| | |||||||    
T  21488 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctgaagtgtccgttctcgatgtttggtcgagactttgaagttgatttag 21587  T
Q  124 tttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttaga-gt-acaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttc 221  Q
    ||||| | ||||||||||| ||| || | || || ||||||| ||| || || || | ||||| |||  |||||| |||||||| ||| | ||||||||     
T  21588 tttgtttgcctttgagtggaatggatctaatacttggtatgagctgcttggatgtaataaccatgtttatattaactgttttagtaagacggtacatttt 21687  T
Q  222 tcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    ||||| |  ||||| || ||||  || ||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  21688 tcttctgctgaagaagagagtgaagctgagttcttgactactaagcagcttaagca 21743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20832 - 20586
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  20832 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 20733  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  20732 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 20633  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 253  Q
    ||| |||| ||||| ||||| |  ||| | |||||||| ||||||||    
T  20632 aagacagtgcatttttcttctgcggaacaagaaagtggagcagagtt 20586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 773 - 971
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| || | ||    
T  773 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaaatgtccgttgtctatgtttagtagaga 872  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
     |||||| | || |||||| || | || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  873 ctttgaagtcgacttagttggttttccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2889 - 2668
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  2889 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 2790  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  |||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||     
T  2789 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatagatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttagt 2690  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccg 228  Q
    ||| | || ||||| |||||||    
T  2689 aagacggtgcatttttcttccg 2668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 94180 - 94465
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  94180 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 94279  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||| |||   || ||| |||| ||| | || ||||| |||||||| || ||||  ||   |||||||||||||| |    
T  94280 ttttgaagtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagaatataaccgagtctgtattaattgttttaac 94379  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||| | || || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  94380 aagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggggcagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 94465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 115580 - 115460
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||    
T  115580 ctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgatatgtcctatatctatgtttggtaggga 115481  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttg 127  Q
    ||||||| | |||||||||||    
T  115480 ttttgaagtagatttagtttg 115460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 975 - 819
Alignment:
Q  70 tatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactg 169  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  975 tatgtttaagatgtcatttgtctatgtttgatagtgattttgagatggatttggtttgtctacatttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaattg 876  T
Q  170 gttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| || |||||||| || |  ||||||||||  || ||||| ||  ||||||||||    
T  875 gttggaatacaaccatgtgcacattaattgttacagtaagtcggtgtatttctcttc 819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11978 - 11759
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| |  |    
T  11978 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagata 11879  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||  | ||| | |||||| | || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||     
T  11878 ctttgaggttgatcttgtttgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagt 11779  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  11778 aagacggtacatttttcttc 11759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 601 - 355
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  601 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccatctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 502  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  501 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgggttcatatcaattgctttagc 402  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 253  Q
    ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  401 aagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagtt 355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 63805 - 64003
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  63805 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 63904  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
     |||||| | ||| |||| ||| | || |||   |||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  63905 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgttgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 64003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 53709 - 53994
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||| | ||    
T  53709 ctgaaatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagaga 53808  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | || ||||||||| | || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| | ||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||     
T  53809 ctttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattagttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 53908  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||  |  ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  53909 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaagttgagttcttgtctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatgg 53994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 226
Target Start/End: Original strand, 98872 - 99088
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||| | ||||||||||||||| | || ||    
T  98872 atatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgttcgttgtctatgtttggtagagactt 98971  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||| | || ||||||||| | || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  98972 tgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaag 99071  T
Q  210 tcagtacatttctcttc 226  Q
     | || ||||| |||||    
T  99072 acggtgcatttttcttc 99088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 176006 - 175787
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  176006 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 175907  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||| | ||| | || ||| | || ||||  |||||| |||| ||  | || ||||||||||||||| | || |  |||| ||| |||||||||||     
T  175906 ttttgaagtcgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagaataatcgtgttcatatcaattgttttagt 175807  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| |  ||||||| |||||    
T  175806 aagacgatacatttttcttc 175787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 200765 - 200973
Alignment:
Q  18 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 117  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  200765 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgatttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttg 200864  T
Q  118 atttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 217  Q
    || |||| ||| | || ||||  |||||| |||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||| | || ||    
T  200865 atctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgttttagtaagacggtgca 200964  T
Q  218 tttctcttc 226  Q
    ||| |||||    
T  200965 tttttcttc 200973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 325725 - 325440
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | | |||||  ||||||||||||||| | ||    
T  325725 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagaga 325626  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||| ||||||     
T  325625 ctttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattattttaga 325526  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||  |  ||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||    
T  325525 aagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagaattcctaactactaaacagttgaagcagttggagcgcgatgg 325440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11827 - 11608
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  11827 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagaga 11728  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || |||||     
T  11727 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatcgggttcatatcaactgctttagt 11628  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  11627 aagacggtacatttctcttc 11608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2014 - 1819
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  2014 atatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctttagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattt 1915  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
    || | || | ||||| ||  | || || ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||  ||| | |||| ||| |||||||||||    
T  1914 tgcagtgaacttagtctgcttgccattcagtgggatggatgtgatactaggtataaactggttggagtttaactatgttcatatcaattgttttag 1819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 110628 - 110358
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  110628 ctgatatgaaaggagaaatggttgttaaaactccggctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 110529  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| |  |  |||||||| |||||||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  110528 ctttgaagtcaacctagtttgtttacctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 110429  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| || |||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  110428 aagacggtgcatttttcttctgcagaagaagagagtggagccgagttcctatctactaaacagttgaagca 110358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 300
Target Start/End: Original strand, 52430 - 52504
Alignment:
Q  226 ccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  52430 ccgtcgaagaggaaagtggtgtagagttcttgtctaccaagcagctgaagcagctggaacgcgatggtatgttga 52504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 4386 - 4643
Alignment:
Q  18 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 117  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| | || |||||||  ||||||||||||||||||||| | || |||||| | |    
T  4386 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagactttgaagttg 4485  T
Q  118 atttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 217  Q
    || | || ||| | || ||||  ||| || |||| || || || |||||||||||||| || ||||  |||| ||| || |||||||| ||| | |||||    
T  4486 atcttgtatgtttgccgttgacgggtttggatgtaatccttgggatgaactggttagaatataaccgtgttcatatcaactgttttagtaagacggtaca 4585  T
Q  218 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaag 275  Q
    ||||||||| |  || || ||||||   || ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4586 tttctcttctgctgaggaagaaagtaaagctgagttcttgactactaagcagctgaag 4643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29545 - 29252
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  29545 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcacttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 29446  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||  | ||| | || ||| | || ||||  |||||| |||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||     
T  29445 ctttgaggttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagt 29346  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||   |||||||| ||||  || || || || ||||  || ||||| ||| ||||||| ||| |||||||  | ||||| ||||| |||||||    
T  29345 aagatggtacatttttcttatgttgaggaagagagtgaagctgagttcttgactactaaacagttgaagcagttagaacgtgatggaatcttga 29252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 3456 - 3576
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||    
T  3456 ctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtaggga 3555  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttg 127  Q
    ||||||| | || ||||||||    
T  3556 ttttgaagtagacttagtttg 3576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Original strand, 1558 - 1849
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | || |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  1558 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 1657  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||| | || ||| | || ||||  |||||| |||| ||  | || ||||| |||||||| || ||||  |||| |||||||||||||||     
T  1658 ctttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaattggttagaatataaccgtgttcatattaattgttttagt 1757  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatctt 298  Q
    ||| |  ||||||| ||||| |  || || ||| |||  |  ||||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  1758 aagacgatacatttttcttctgcggaggaagaaggtgaagttgagttgttgactactaaacagatgaagcaattggaacgtgatggaatctt 1849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 298
Target Start/End: Original strand, 28571 - 28862
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | || |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  28571 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 28670  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||| | || ||| | || ||||  |||||| |||| ||  | || ||||| |||||||| || ||||  |||| |||||||||||||||     
T  28671 ctttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaattggttagaatataaccgtgttcatattaattgttttagt 28770  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatctt 298  Q
    ||| |  ||||||| ||||| |  || || ||| |||  |  ||||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  28771 aagacgatacatttttcttctgcggaggaagaaggtgaagttgagttgttgactactaaacagatgaagcaattggaacgtgatggaatctt 28862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 43705 - 43924
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||  || |||| |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| |  |    
T  43705 ctgatatgaatggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagata 43804  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||  |||||     
T  43805 ctttgaactcgatctagtatgtttgccattgacgggtatgaatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaatttctttagt 43904  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| |||| ||||| |||||    
T  43905 aagacagtgcatttttcttc 43924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25216 - 25015
Alignment:
Q  25 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagt 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| | || |||||||  ||||| |||||||||| |||| | ||||||||  |  | || ||    
T  25216 tggttgtcgaaactcgagctaagggttcgataactacttctttggtttgtttgagttgtccgttgtctatgtatggtagagattttgaggttaacttggt 25117  T
Q  125 ttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctct 224  Q
    |||| |||| ||||  || ||| |||| || || ||||||||||||||  |||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||| | || ||||| |||    
T  25116 ttgtttaccgttgacgggaatggatgtaatccttggtatgaactggttgaagtataaccatgttcatattaattgctttagtaagaccgtgcatttttct 25017  T
Q  225 tc 226  Q
    ||    
T  25016 tc 25015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 263244 - 263025
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  263244 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 263145  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||  | || ||||||||| | || ||||  || ||| | || ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||     
T  263144 ttttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 263045  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  263044 aagacggtacatttttcttc 263025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 1055 - 1125
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttg 77  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1055 ctgacatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 1597 - 1795
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  1597 ctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 1696  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
     |||||| | ||| | |||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  1697 ctttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 1795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7056 - 6854
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  7056 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 6957  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     ||| || | || ||||| ||| |||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  6956 ctttaaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagc 6857  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  6856 aag 6854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7762 - 7564
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  7762 ctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 7663  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
     |||||| | ||| | |||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  7662 ctttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 7564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26130 - 25928
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  26130 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 26031  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||  | || ||||| |||||||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| |||||||||| |    
T  26030 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagtttgtataaattgttttaac 25931  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  25930 aag 25928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29642 - 29440
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  29642 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagaga 29543  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||  ||| |||| |||| ||||  |||||| | |||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |    
T  29542 ctttgaagtcgacctagcttgtttaccgttgacgggtatggaggtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaac 29443  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  29442 aag 29440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 49466 - 49664
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  49466 ctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 49565  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
    ||||||  | || ||||| |||||||| ||||  |||||| |||  ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  49566 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 49664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 58500 - 58698
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  58500 ctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 58599  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
    ||||||  | || ||||| |||||||| ||||  |||||| |||  ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  58600 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 58698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 64888 - 65086
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  64888 ctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagcaaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 64987  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
    ||||||  | || ||||| |||||||| ||||  |||||| |||  ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  64988 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 65086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 8748 - 8961
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  8748 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 8847  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||| |||| ||| |||| ||||  || ||| | || ||| | || || |||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  8848 ctttgaagtcgatctagtgtgtttaccgttgacaggaatggacgttatttttgggataaactagttagagtataaccgggttcatatcaattgttttagc 8947  T
Q  207 aagtcagtacattt 220  Q
    ||| |||| |||||    
T  8948 aagacagtgcattt 8961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 18962 - 19175
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  18962 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 19061  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||| |||| ||| |||| ||||  || ||| | || ||| | || || |||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  19062 ctttgaagtcgatctagtgtgtttaccgttgacaggaatggacgttatttttgggataaactagttagagtataaccgggttcatatcaattgttttagc 19161  T
Q  207 aagtcagtacattt 220  Q
    ||| |||| |||||    
T  19162 aagacagtgcattt 19175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 99
Target Start/End: Original strand, 8036 - 8117
Alignment:
Q  18 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8036 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgaaaacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttg 8117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 300
Target Start/End: Original strand, 231 - 358
Alignment:
Q  175 agtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagag--tttttgtctactaagcagctg 272  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  231 agtacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttttgtctaccaagcagctg 330  T
Q  273 aagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  331 aagcaactagaacgcaatggtattttga 358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 251640 - 251464
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||| | ||    
T  251640 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagaga 251541  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 183  Q
     |||| | | ||| |||||||| | || |||   |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  251540 ctttgtagtcgatctagtttgtttgccgttgtcgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 251464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 424326 - 424266
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctct 67  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  424326 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 424266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 203399 - 203294
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  203399 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 203300  T
Q  107 ttttga 112  Q
    ||||||    
T  203299 ttttga 203294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11837 - 11630
Alignment:
Q  18 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  11837 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagattttgaagttg 11738  T
Q  118 atttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 217  Q
    || | || ||| | |  |||   |||||| |||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||||| ||| |||| ||    
T  11737 atcttgtatgtttgctgttgtcgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaactgttttagtaagacagtgca 11638  T
Q  218 tttctctt 225  Q
    ||| ||||    
T  11637 tttttctt 11630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1138 - 919
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || || ||||| |||||||||| ||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||  ||||||||||||||| | ||    
T  1138 ctgatatgaaaggggaaattgttgttgaaactccagttaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagaga 1039  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  1038 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 939  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  938 aagacggtgcatttttcttc 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 50123 - 49904
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  50123 ctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 50024  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||| | |||||  |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||     
T  50023 ctttgaagtcgatcttgtttgcttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaaatggttagagtataaccaagttcatatcaattgctttagt 49924  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  49923 aagacggtgcatttttcttc 49904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 65584 - 65803
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||||| |  |||||| | || ||||||||| | ||    
T  65584 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtcctatatccatgtttggtagaga 65683  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||| | || ||||| ||| | || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| || |  |||| ||| ||||| |||||     
T  65684 ttttgaagttgacttagtatgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaattgctttagt 65783  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  65784 aagacggtacatttttcttc 65803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 49163 - 49382
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||| || |||||||||||| || |||| |||||| || |||||||  ||||  ||||||||||||||| | ||    
T  49163 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaaatcaagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagaga 49262  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||| |||| | | | || |||   |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||     
T  49263 ctttgaagtcgatctagtatatttgccgttgtcgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttagt 49362  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| |||| ||||| |||||    
T  49363 aagacagtgcatttttcttc 49382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 83824 - 84035
Alignment:
Q  24 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 123  Q
    |||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||| ||||    
T  83824 atggttatcgaaaccccggctaaggattcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtggacttag 83923  T
Q  124 tttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctc 223  Q
    | ||  | || || ||||| ||| ||||||  || || |||||||||||  |||  ||| | ||||  |||||||||||||| ||| |||| | ||| ||    
T  83924 tctgcttgccgttaagtgggatggatgtgaaactaggaatgaactggttgaagtttaactatgttcacattaattgttttagaaagacagtgcgtttttc 84023  T
Q  224 ttccgtcgaaga 235  Q
    ||| ||||||||    
T  84024 ttctgtcgaaga 84035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 48683 - 48651
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactc 39  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48683 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactc 48651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5620 - 5350
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||||||  | |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  5620 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttatttgtttgacttgtccgttgtctatgtttggtagaga 5521  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| |  || |||| ||| | || |||   || ||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||     
T  5520 ctttgaagtcaatctagtatgtttgccgttgtcgggcatggatgtaatttttgggatgaattggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagt 5421  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 277  Q
    ||| | |||||||| ||||| || ||||| || || |  || ||||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  5420 aagacggtacatttttcttctgttgaagaagagagcgaagctgagttcttgcctactaaacagttgaagca 5350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Original strand, 5135 - 5420
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||| || | ||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  5135 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctctttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 5234  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||   | || ||||| |||||||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| | ||| |||||     
T  5235 ttttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcagttgctttagt 5334  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||  |  ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  5335 aagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaagtggagttcttgtctacgaaacagatgaaacaacttgaacgtgatgg 5420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 17770 - 17941
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||| || ||||| |   |||  ||| ||||||||||| | ||    
T  17770 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggagtcagttgactatgtttggtagaga 17869  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagta 178  Q
    |||||   | || ||||| |||||||| ||||  |||||| |||| ||| | || || || |||||||||||    
T  17870 ttttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggaataaattggttagagta 17941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 58 - 5
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgacta 60  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgacta 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5199 - 5023
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||| ||||||||| | ||    
T  5199 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctgaggtttcagtaactatttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtcaatgtttggtagaga 5100  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 183  Q
     |||||| | ||| | |||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  5099 ctttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataacc 5023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 300
Target Start/End: Original strand, 7106 - 7238
Alignment:
Q  168 tggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagc 267  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| ||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  7106 tggttggagtacaaccatgttcacatgaattgttctagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcggagaatttttgtctactaagc 7205  T
Q  268 agctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 300  Q
    ||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  7206 agctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 7238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 12745 - 12637
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  12745 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaagttgtccattgtctatgtttggtagaga 12646  T
Q  107 ttttgaaat 115  Q
     ||||||||    
T  12645 ctttgaaat 12637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 70390 - 70214
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| || |||| |||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  70390 ctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 70291  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 183  Q
    ||||||  | || ||||| |||||||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  70290 ttttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatgtatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 70214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 2238 - 2441
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | | |||| | ||||||||||||||| | ||    
T  2238 ctgatatgaaaggggatatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgttcgttgtctatgtttggtagaga 2337  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtga-ttctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 205  Q
     |||||| | || ||||||||| |||  ||||  | |||| |||| | || || | ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  2338 ctttgaagtcgacttagtttgtttactgttgaccgctatggatgttatttttgaggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 2437  T
Q  206 caag 209  Q
    ||||    
T  2438 caag 2441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 120 - 339
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  || |||| |||||| || ||||||   |||||| | |||||||||| | | ||    
T  120 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttgttaggga 219  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     ||||   |||||||||||||| | || |||   |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| || || |||||     
T  220 ctttgtggtggatttagtttgtttgccgttgtcgggtatgaatgtgatttttggtatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctttagt 319  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  320 aagacggtacatttttcttc 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 138
Target Start/End: Original strand, 1101 - 1232
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || | | | | |||||| ||||||||||||||| | ||    
T  1101 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttttctaagatgtccgttgtctatgtttggtagaga 1200  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttga 138  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||    
T  1201 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttga 1232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 10072 - 10291
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || |||| |||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  10072 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtacagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 10171  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||  | || ||||||||| | || ||||  || ||| | || ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||     
T  10172 ttttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttattttttgaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 10271  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | |||||||| |||||    
T  10272 aagacggtacatttttcttc 10291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 1141 - 1316
Alignment:
Q  8 tgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||     
T  1141 tgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagac 1240  T
Q  108 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 183  Q
    |||||| | || ||||| ||| |||| ||||   | ||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  1241 tttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgagaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataacc 1316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 36957 - 36786
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  36957 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 36858  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagta 178  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||  ||| | || |||||||| ||||||||    
T  36857 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgatatttttgggatgaactgtttagagta 36786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 300
Target Start/End: Original strand, 1198 - 1312
Alignment:
Q  186 gttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaac 285  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||    
T  1198 gttcatattatttgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctaaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagtagctgaagcagttagaac 1297  T
Q  286 gcgatggtatcttga 300  Q
    | |||||||| ||||    
T  1298 gtgatggtattttga 1312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21869 - 21743
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||  |||||| | |||||||| ||| | ||    
T  21869 ctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgttcggtaggga 21770  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacc 133  Q
    ||||||  | || ||||||||| ||||    
T  21769 ttttgaggtagacttagtttgtttacc 21743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 14929 - 14876
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgacta 60  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14929 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgacta 14876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 54065 - 53780
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  54065 ctgatatgaatgtagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 53966  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     ||| || | || ||||| ||| |||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| |||  |||||||||||    
T  53965 cttttaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatctattgttttagc 53866  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||  |  ||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||    
T  53865 aagacggtgcatttttcttctgcggaagaagatagtggagcagaattcctaactactaaacagttgaagcagttggagcgcgatgg 53780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 479 - 303
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  479 ctgatatgaaaggggaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagaga 380  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 183  Q
    |||||   | |||||||||||| |||| ||||  |||||| | |||||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  379 ttttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggaggtgatttttggaatgaattggttagagtataacc 303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8632 - 8413
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  8632 ctgatataaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagaga 8533  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||  | || ||||| ||| | || ||||   ||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||     
T  8532 ttttgaggtcgacttagtatgtttgccgttgacgtgtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 8433  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  8432 aagacggtgcatttttcttc 8413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 20814 - 21014
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  20814 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 20913  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||  |||||||| |||| ||  ||    || |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  20914 ctttgaagtcgacctagtttgtttaccgtt--gtctcttggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagc 21011  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  21012 aag 21014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 12637 - 12834
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || ||    
T  12637 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactt 12736  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 209  Q
    |||| | ||  |||||||| |||| ||  ||    || |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||||||    
T  12737 tgaagtcgacctagtttgtttaccgtt--gtctcttggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaag 12834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22140 - 21921
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  22140 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactttagctaagtgttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagaga 22041  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    ||||||  | |||||||||||| | ||  |||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||     
T  22040 ttttgaggtcgatttagtttgtttgccgctgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 21941  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  21940 aagacggtgcatttttcttc 21921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 5823 - 5692
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| || |||| |||||| || ||| | | |||||| ||||||||||||||| | ||    
T  5823 ctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctatgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagaga 5724  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttga 138  Q
     |||||| | || ||||||||| |||| ||||    
T  5723 ctttgaagtcgacttagtttgtttaccgttga 5692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Original strand, 41398 - 41563
Alignment:
Q  11 tatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttt 110  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |  |||| ||||| | ||| ||||| |||||||||   ||||||    
T  41398 tatgaatggggaaatggttgtcgaaacttcggctaagggttcggtgactacttctttattatgcttgaagtatcc-ttgtcgatgtttggtatagatttt 41496  T
Q  111 gaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagt 177  Q
    | | |||| ||||| ||| | || |||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  41497 gtagtggacttagtctgtttgccgttgagtgggatggatgtgatactaggcatgaactggttggagt 41563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5687 - 5550
Alignment:
Q  89 gtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtt 188  Q
    ||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  5687 gtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgggtt 5588  T
Q  189 cttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 226  Q
    | ||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  5587 catatcaattgctttagcaagacagtgcatttttcttc 5550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 4590 - 4660
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttg 77  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||    
T  4590 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtatgtttg 4660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 226
Target Start/End: Original strand, 4670 - 4755
Alignment:
Q  141 ggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 226  Q
    |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||    
T  4670 ggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagtaagacgatacatttttcttc 4755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Original strand, 9533 - 9758
Alignment:
Q  27 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||  || || | || |||||||    
T  9533 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagacattaaagtcgacttagttt 9632  T
Q  127 gtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 226  Q
    || |||| ||||  || ||| |||| ||| |  | |||||||||||||| || ||||  |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  9633 gtttaccgttgacggg-atggatgttattttttggatgaactggttagaatataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttc 9731  T
Q  227 cgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 253  Q
     |  ||||| |||||||| ||||||||    
T  9732 tgcggaagaagaaagtggagcagagtt 9758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21102 - 20992
Alignment:
Q  164 gaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctact 263  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||    ||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  21102 gaactggttggagtataaccatgtttatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctactgaataggaaagtggcgcaaaatttttgtctact 21003  T
Q  264 aagcagctgaa 274  Q
    |||||||||||    
T  21002 aagcagctgaa 20992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Original strand, 30612 - 30706
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 101  Q
    |||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  30612 ctgatatgaaaggggtaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggt 30706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 111
Target Start/End: Original strand, 67396 - 67498
Alignment:
Q  9 gatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatt 108  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||||||   |||||| | |||||||||||| | ||||    
T  67396 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggtagagatt 67495  T
Q  109 ttg 111  Q
    |||    
T  67496 ttg 67498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 5431 - 5552
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || || ||||  ||||| |||| |||||||||| | ||    
T  5431 ctgatatgaaaagagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccattgtttatgtttggtagaga 5530  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgt 128  Q
    |||||   | ||||||||||||    
T  5531 ttttgtggttgatttagtttgt 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34355 - 34070
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| |  || |||||||| |||| ||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||| | |  ||||| |||||||||||||||   ||    
T  34355 ctgatatgaaagtggaaatggttgttgaaattccagctaagggttcagtagctatttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtaaaga 34256  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
     |||||| | ||  |||||||| || | ||||  |||||| |||| ||| | || |||||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||  ||||||    
T  34255 ctttgaagtcgacctagtttgtttatcgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtacaatcgagttcatatcaattactttagc 34156  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||| | || ||||| |||||    ||||| || ||||| || |||||  | |||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  34155 aagacggtgcatttttcttctactgaagaagagagtggagcggagttcctatctactaaacagttgaagcagttggaacgtgatgg 34070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41753 - 41534
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||| ||   |||||  | || ||||||||| | ||    
T  41753 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccatgtttggtaggga 41654  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 206  Q
    |||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||  | |||||||| |||||||| || || |  |||| ||| || || |||||     
T  41653 ttttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgagttcatatcaactgctttagt 41554  T
Q  207 aagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  41553 aagacggtacatttctcttc 41534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 5328 - 5442
Alignment:
Q  160 gtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtc 259  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||| |||||| ||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  5328 gtatgaactggttggagtataaccatgttcacattcattgttatagtaagtcggtgtatttttcttctgtcgaagaagatagtggagcagagttcttgtc 5427  T
Q  260 tactaagcagctgaa 274  Q
    ||||||  |||||||    
T  5428 tactaactagctgaa 5442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 277
Target Start/End: Original strand, 114476 - 114594
Alignment:
Q  159 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 258  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||  ||  ||||||||     
T  114476 ggtatgaactggttggagtataaccatgtttatattaattgttttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaagctaagtttttga 114575  T
Q  259 ctactaagcagctgaagca 277  Q
    |||||||||||||||||||    
T  114576 ctactaagcagctgaagca 114594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 183
Target Start/End: Original strand, 5498 - 5671
Alignment:
Q  10 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 109  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||  ||||||||||||||| | || ||    
T  5498 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagactt 5597  T
Q  110 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 183  Q
    | || | || ||||| ||| |||| ||||  |||||| || | ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  5598 taaagtcgacttagtctgtttaccgttgacgggtatggatattatttttgggatgaactggttagagtataacc 5671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Original strand, 6543 - 6603
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctct 67  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6543 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctct 6603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1227 - 991
Alignment:
Q  9 gatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatt 108  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||        | |||||| || ||| | | |||||  ||||||||||||||| | || |    
T  1227 gatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggtt--------acttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagagact 1136  T
Q  109 ttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaa 208  Q
    ||||| | || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||| ||||||||| || |  |||| ||| ||||| ||||||||    
T  1135 ttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataatcgagttcatatcaattgctttagcaa 1036  T
Q  209 gtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 253  Q
    | | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  1035 gacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagcagagtt 991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1739 - 1568
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || |||| |||| |  | |||||||  | |||  |||||||||||||| | ||    
T  1739 ctgatatgaatggagaaatggttcttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttctttgtttgagttttccactgtctatgtttggtagaga 1640  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagta 178  Q
     |||||| | ||| |||| ||| | || || |  |||||| |||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  1639 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttaacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 1568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 274
Target Start/End: Original strand, 175788 - 175898
Alignment:
Q  164 gaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctact 263  Q
    |||||||||  |||| ||||| |||| |  |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |||| ||| ||| |||||    
T  175788 gaactggttgaagtataaccatgttcattataattgttttagtaagtcggtatatttttcttctgttgaagaagagagtggagcagggttcttgactact 175887  T
Q  264 aagcagctgaa 274  Q
    |||||||||||    
T  175888 aagcagctgaa 175898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 219
Target Start/End: Original strand, 8459 - 8544
Alignment:
Q  134 tttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 219  Q
    ||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  8459 tttgagtggaatggatgtaatacttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattagttgttttagtaagacggtacatt 8544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 29952 - 29781
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 106  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    || | |||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||    
T  29952 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaagaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagaga 29853  T
Q  107 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttagagta 178  Q
    |||||   | |||||||||||||| || |||   |||||| |||||||| | || ||||| |||| ||||||    
T  29852 ttttgtggttgatttagtttgtctgccgttgttgggtatggatgtgatttttggaatgaattggtcagagta 29781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 10995 - 10901
Alignment:
Q  7 ctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactatttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 101  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||| || |||| |||||| || ||||||   |||||| | ||||||||||||    
T  10995 ctgatatgaaaggagaaatacttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggt 10901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 292
Target Start/End: Original strand, 923 - 1056
Alignment:
Q  159 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||| ||||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| || |||||  | |    
T  923 ggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgcttttgcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcggagttcctat 1022  T
Q  259 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 292  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||    
T  1023 ctactaaacagttgaagcagctggagcgtgatgg 1056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 51675 - 51611
Alignment:
Q  162 atgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||  ||| | |||||||| |||||    
T  51675 atgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttattaagactgtacatttttcttc 51611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University