View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10954A_low_294 (Length: 265)

Name: NF10954A_low_294
Description: NF10954A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10954A_low_294
NF10954A_low_294
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (6-265)||(19880069-19880328)
chr6 (6-265)||(18795461-18795720)
chr6 (33-265)||(34644864-34645096)
chr6 (13-260)||(15460112-15460359)
chr6 (28-265)||(25768962-25769199)
chr6 (27-259)||(19488544-19488776)
chr6 (30-265)||(19435773-19436008)
chr6 (6-265)||(21563383-21563642)
chr6 (6-265)||(21569242-21569501)
chr6 (28-259)||(21472378-21472609)
chr6 (11-265)||(19454191-19454445)
chr6 (30-265)||(8762208-8762443)
chr6 (27-259)||(23079246-23079478)
chr6 (75-260)||(28282133-28282318)
chr6 (13-260)||(10468107-10468354)
chr6 (27-250)||(18196997-18197220)
chr6 (30-259)||(5296481-5296710)
chr6 (93-265)||(14380805-14380977)
chr6 (27-259)||(1542356-1542588)
chr6 (27-259)||(22077962-22078194)
chr6 (27-265)||(25609133-25609371)
chr6 (27-259)||(16625989-16626221)
chr6 (63-251)||(18966600-18966788)
chr6 (93-218)||(14379255-14379380)
chr6 (14-259)||(15896871-15897116)
chr6 (30-259)||(25113329-25113558)
chr6 (27-259)||(2874075-2874307)
chr6 (27-259)||(22761727-22761959)
chr6 (27-259)||(29591192-29591424)
chr6 (25-223)||(20636571-20636769)
chr6 (27-259)||(24312440-24312672)
chr6 (27-259)||(5838491-5838723)
chr6 (75-259)||(24365189-24365373)
chr6 (27-259)||(27188213-27188445)
chr6 (27-259)||(27260795-27261027)
chr6 (27-259)||(28262469-28262701)
chr6 (27-259)||(28341218-28341450)
chr6 (30-253)||(18436392-18436615)
chr6 (27-260)||(16926912-16927145)
chr6 (27-260)||(16962717-16962950)
chr6 (27-223)||(19865500-19865696)
chr6 (27-259)||(27330705-27330937)
chr6 (27-259)||(27391445-27391677)
chr6 (30-223)||(18407217-18407410)
chr6 (27-219)||(22434686-22434878)
chr6 (27-219)||(22443084-22443276)
chr6 (102-259)||(27566327-27566484)
chr6 (161-248)||(16098838-16098925)
chr6 (73-196)||(28287991-28288114)
chr6 (162-253)||(14624764-14624855)
chr6 (162-253)||(16381780-16381871)
chr6 (27-97)||(27565093-27565163)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (6-265)||(19613572-19613831)
chr7 (6-265)||(11387521-11387780)
chr7 (6-259)||(19148114-19148367)
chr7 (6-259)||(20747513-20747766)
chr7 (13-259)||(15101703-15101949)
chr7 (25-265)||(12205912-12206152)
chr7 (13-265)||(13666434-13666686)
chr7 (13-265)||(14434588-14434840)
chr7 (6-259)||(14263337-14263590)
chr7 (75-259)||(14285538-14285722)
chr7 (73-260)||(18053113-18053300)
chr7 (75-265)||(569-759)
chr7 (36-265)||(16949595-16949823)
chr7 (76-259)||(15341334-15341517)
chr7 (28-259)||(11771378-11771609)
chr7 (28-259)||(14040597-14040828)
chr7 (28-259)||(14350627-14350858)
chr7 (13-260)||(23504970-23505217)
chr7 (75-259)||(12456605-12456789)
chr7 (14-253)||(321160-321399)
chr7 (30-251)||(16071412-16071632)
chr7 (27-251)||(15204529-15204753)
chr7 (52-259)||(15153818-15154025)
chr7 (118-259)||(15625454-15625595)
chr7 (75-262)||(12457540-12457727)
chr7 (30-265)||(13022254-13022489)
chr7 (27-259)||(8708507-8708739)
chr7 (75-259)||(11305425-11305609)
chr7 (27-259)||(18178644-18178876)
chr7 (27-259)||(44790487-44790719)
chr7 (75-259)||(49153204-49153388)
chr7 (26-259)||(11236348-11236581)
chr7 (27-259)||(10871897-10872129)
chr7 (133-265)||(14130770-14130902)
chr7 (29-259)||(9596959-9597189)
chr7 (27-259)||(8199530-8199762)
chr7 (27-259)||(14955460-14955688)
chr7 (31-259)||(11552242-11552470)
chr7 (27-259)||(12688403-12688634)
chr7 (27-259)||(13686966-13687198)
chr7 (75-259)||(13967830-13968014)
chr7 (27-259)||(14212576-14212808)
chr7 (75-259)||(26117767-26117951)
chr7 (27-259)||(18550894-18551126)
chr7 (27-259)||(15160193-15160425)
chr7 (27-259)||(16454-16684)
chr7 (27-223)||(14333334-14333530)
chr7 (64-259)||(23202786-23202981)
chr7 (64-259)||(23508913-23509108)
chr7 (131-259)||(8211346-8211474)
chr7 (161-253)||(4440836-4440928)
chr7 (161-253)||(17924559-17924651)
chr7 (189-260)||(21662862-21662933)
chr7 (162-253)||(27107045-27107136)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (6-265)||(32786-33045)
scaffold0076 (75-265)||(56078-56268)
scaffold0076 (162-253)||(41208-41299)
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (22-265)||(27364741-27364984)
chr2 (30-260)||(23277319-23277549)
chr2 (6-260)||(27209818-27210072)
chr2 (30-265)||(23294473-23294708)
chr2 (102-265)||(19651794-19651957)
chr2 (73-260)||(27788284-27788471)
chr2 (28-265)||(23111273-23111511)
chr2 (27-259)||(21144708-21144940)
chr2 (6-155)||(23099664-23099813)
chr2 (30-251)||(24819356-24819577)
chr2 (27-259)||(24876416-24876648)
chr2 (13-260)||(12574896-12575143)
chr2 (75-256)||(20828806-20828987)
chr2 (75-256)||(20833532-20833713)
chr2 (75-259)||(1064295-1064479)
chr2 (27-259)||(16925904-16926136)
chr2 (27-259)||(16999544-16999776)
chr2 (75-259)||(31831202-31831386)
chr2 (27-259)||(27371813-27372045)
chr2 (27-259)||(41608052-41608284)
chr2 (27-259)||(44385236-44385468)
chr2 (69-265)||(24949127-24949324)
chr2 (27-259)||(9610680-9610912)
chr2 (27-259)||(10869394-10869626)
chr2 (27-259)||(16923433-16923665)
chr2 (27-259)||(16982696-16982928)
chr2 (27-259)||(17064261-17064493)
chr2 (27-259)||(17067919-17068151)
chr2 (27-259)||(24676033-24676265)
chr2 (27-259)||(24710578-24710810)
chr2 (27-256)||(27218563-27218792)
chr2 (27-259)||(21324933-21325165)
chr2 (27-259)||(23066935-23067167)
chr2 (27-259)||(24262914-24263146)
chr2 (27-260)||(21890385-21890618)
chr2 (27-259)||(22324523-22324755)
chr2 (25-260)||(30210582-30210816)
chr2 (31-223)||(22756136-22756328)
chr2 (29-223)||(23107399-23107593)
chr2 (132-259)||(11357646-11357773)
chr2 (150-260)||(45530054-45530164)
chr2 (27-223)||(24707149-24707345)
chr2 (25-110)||(45533037-45533122)
chr2 (162-253)||(12640035-12640126)
chr2 (161-223)||(21905970-21906032)
chr2 (25-110)||(30011847-30011932)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (6-265)||(21680066-21680325)
chr5 (6-259)||(21890047-21890300)
chr5 (6-260)||(22462778-22463031)
chr5 (6-260)||(20774585-20774839)
chr5 (27-265)||(21831070-21831308)
chr5 (6-260)||(20822279-20822533)
chr5 (13-260)||(17268629-17268876)
chr5 (30-259)||(24619607-24619836)
chr5 (30-259)||(24715838-24716067)
chr5 (30-259)||(24748866-24749095)
chr5 (11-260)||(28894235-28894484)
chr5 (11-260)||(28915706-28915955)
chr5 (11-260)||(28923061-28923310)
chr5 (24-265)||(22235226-22235467)
chr5 (51-259)||(21496900-21497108)
chr5 (27-259)||(21563282-21563514)
chr5 (27-259)||(22135513-22135745)
chr5 (75-259)||(24797754-24797938)
chr5 (75-259)||(14886348-14886532)
chr5 (75-259)||(37542738-37542922)
chr5 (27-259)||(41771687-41771919)
chr5 (27-259)||(22332196-22332428)
chr5 (27-259)||(26738036-26738268)
chr5 (27-259)||(29475382-29475614)
chr5 (27-259)||(40709625-40709857)
chr5 (27-259)||(14999048-14999280)
chr5 (27-259)||(16357347-16357579)
chr5 (27-259)||(19770805-19771037)
chr5 (27-259)||(27519252-27519484)
chr5 (27-259)||(27611199-27611431)
chr5 (27-259)||(27684709-27684941)
chr5 (27-259)||(34567339-34567571)
chr5 (75-259)||(20343109-20343293)
chr5 (75-259)||(23079446-23079630)
chr5 (30-259)||(20467409-20467638)
chr5 (27-259)||(18776615-18776847)
chr5 (27-223)||(20800329-20800525)
chr5 (27-259)||(23441055-23441287)
chr5 (75-259)||(25848902-25849086)
chr5 (27-259)||(27667799-27668031)
chr5 (27-259)||(21338606-21338838)
chr5 (52-259)||(25424034-25424240)
chr5 (118-259)||(22349268-22349409)
chr5 (27-223)||(23517407-23517603)
chr5 (118-259)||(23472074-23472215)
chr5 (28-259)||(23574582-23574805)
chr5 (27-259)||(37290805-37291037)
chr5 (80-259)||(22503506-22503685)
chr5 (27-223)||(21881830-21882026)
chr5 (162-253)||(27011917-27012008)
chr5 (162-248)||(24582048-24582134)
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (22-265)||(13971470-13971713)
chr3 (6-265)||(14087209-14087468)
chr3 (6-260)||(10419379-10419633)
chr3 (13-259)||(14574465-14574711)
chr3 (13-249)||(16380269-16380505)
chr3 (25-259)||(15228191-15228425)
chr3 (13-265)||(17493166-17493418)
chr3 (24-265)||(13319854-13320095)
chr3 (6-259)||(16827537-16827790)
chr3 (30-265)||(18133704-18133939)
chr3 (13-265)||(16835851-16836103)
chr3 (73-260)||(4678979-4679166)
chr3 (73-260)||(41178063-41178250)
chr3 (13-259)||(31939445-31939691)
chr3 (52-259)||(15248679-15248886)
chr3 (13-259)||(31694527-31694773)
chr3 (76-260)||(8758486-8758670)
chr3 (13-265)||(11303114-11303366)
chr3 (73-260)||(44777788-44777975)
chr3 (15-260)||(13942565-13942810)
chr3 (23-214)||(13299873-13300064)
chr3 (23-214)||(13310531-13310722)
chr3 (13-265)||(12359868-12360135)
chr3 (27-259)||(10906742-10906974)
chr3 (75-259)||(47124486-47124670)
chr3 (25-190)||(15234128-15234293)
chr3 (27-259)||(5424296-5424528)
chr3 (27-259)||(26791765-26791997)
chr3 (75-259)||(28754860-28755044)
chr3 (52-259)||(15209423-15209630)
chr3 (27-259)||(10006132-10006364)
chr3 (75-259)||(10384510-10384694)
chr3 (27-259)||(16411648-16411880)
chr3 (27-259)||(48425979-48426211)
chr3 (27-249)||(14580308-14580530)
chr3 (27-259)||(13253222-13253454)
chr3 (27-259)||(15339801-15340033)
chr3 (27-259)||(15401883-15402115)
chr3 (27-259)||(15588758-15588990)
chr3 (27-259)||(15724300-15724532)
chr3 (27-259)||(16636305-16636537)
chr3 (27-259)||(20061420-20061652)
chr3 (27-259)||(43163629-43163861)
chr3 (29-259)||(53384386-53384616)
chr3 (27-259)||(15347611-15347843)
chr3 (27-259)||(17490382-17490614)
chr3 (78-259)||(16329066-16329247)
chr3 (75-259)||(11960572-11960756)
chr3 (76-259)||(16337916-16338099)
chr3 (27-259)||(6601268-6601500)
chr3 (29-259)||(16755953-16756183)
chr3 (102-260)||(16692695-16692853)
chr3 (27-223)||(16371980-16372176)
chr3 (28-223)||(12498816-12499011)
chr3 (29-223)||(16491549-16491743)
chr3 (27-259)||(14125960-14126192)
chr3 (27-259)||(14875865-14876096)
chr3 (27-259)||(16806292-16806524)
chr3 (73-249)||(15015168-15015344)
chr3 (102-223)||(15062312-15062433)
chr3 (183-251)||(9523259-9523327)
chr3 (161-253)||(16257692-16257784)
chr3 (162-253)||(8273900-8273991)
chr3 (162-253)||(13966841-13966932)
chr3 (162-253)||(30138354-30138445)
chr3 (162-253)||(30147905-30147996)
chr3 (162-248)||(16742204-16742290)
chr3 (161-253)||(6711909-6712001)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (6-265)||(49623-49882)
scaffold0028 (27-259)||(9418-9650)
scaffold0028 (14-247)||(733-966)
scaffold0028 (27-259)||(15880-16112)
scaffold0028 (27-259)||(44098-44327)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (6-265)||(113497-113756)
scaffold0029 (11-260)||(95116-95365)
scaffold0029 (27-259)||(108941-109173)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (6-260)||(19792-20046)
scaffold0090 (6-260)||(23954-24208)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (11-251)||(48148-48388)
scaffold0053 (13-265)||(56963-57215)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (6-260)||(826-1080)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (73-265)||(2506-2698)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (6-259)||(813-1066)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (6-211)||(48096-48301)
[»] chr8 (55 HSPs)
chr8 (6-259)||(21841396-21841649)
chr8 (13-259)||(1267217-1267463)
chr8 (28-259)||(19852390-19852621)
chr8 (28-259)||(19858426-19858657)
chr8 (13-259)||(23655906-23656152)
chr8 (12-265)||(20975206-20975459)
chr8 (36-265)||(31416053-31416282)
chr8 (6-257)||(20985096-20985347)
chr8 (25-265)||(20389072-20389312)
chr8 (28-250)||(20009491-20009713)
chr8 (13-265)||(22051836-22052088)
chr8 (73-260)||(31570458-31570645)
chr8 (75-259)||(803291-803475)
chr8 (27-259)||(18857556-18857788)
chr8 (28-259)||(22247988-22248219)
chr8 (28-259)||(22988175-22988406)
chr8 (27-259)||(19483634-19483866)
chr8 (38-250)||(22371928-22372140)
chr8 (28-259)||(22377025-22377256)
chr8 (28-259)||(22383200-22383431)
chr8 (105-259)||(23949898-23950052)
chr8 (75-259)||(14566121-14566305)
chr8 (90-259)||(27355527-27355695)
chr8 (75-259)||(6604637-6604821)
chr8 (75-259)||(6680090-6680274)
chr8 (79-259)||(16270846-16271026)
chr8 (27-259)||(19113669-19113901)
chr8 (27-259)||(22128528-22128760)
chr8 (27-259)||(23651020-23651252)
chr8 (118-259)||(20395793-20395934)
chr8 (27-259)||(17673593-17673825)
chr8 (27-259)||(30312714-30312946)
chr8 (27-259)||(32601123-32601355)
chr8 (27-223)||(19978982-19979178)
chr8 (27-259)||(21921306-21921538)
chr8 (75-259)||(29303044-29303228)
chr8 (78-265)||(12305731-12305918)
chr8 (14-223)||(16407602-16407811)
chr8 (27-259)||(21043424-21043656)
chr8 (27-259)||(22119744-22119976)
chr8 (27-223)||(21166108-21166304)
chr8 (27-259)||(22132611-22132843)
chr8 (30-259)||(15534359-15534591)
chr8 (30-259)||(21251920-21252152)
chr8 (27-259)||(22040838-22041070)
chr8 (161-248)||(25283120-25283207)
chr8 (29-219)||(21393437-21393627)
chr8 (29-219)||(21787931-21788121)
chr8 (161-248)||(25283346-25283433)
chr8 (118-180)||(23886082-23886144)
chr8 (161-253)||(23156716-23156808)
chr8 (162-253)||(16876800-16876891)
chr8 (150-223)||(22623557-22623630)
chr8 (161-253)||(21196206-21196298)
chr8 (161-253)||(22316176-22316268)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (113-265)||(34126-34278)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (13-265)||(89561-89813)
scaffold0001 (13-265)||(90239-90491)
scaffold0001 (186-259)||(390489-390562)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (28-259)||(27468-27699)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (6-260)||(68313-68567)
scaffold0034 (13-265)||(13017-13269)
scaffold0034 (13-265)||(4069-4321)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (6-259)||(15002470-15002723)
chr4 (12-260)||(27901298-27901546)
chr4 (13-252)||(15246844-15247083)
chr4 (27-259)||(8706831-8707063)
chr4 (13-260)||(1648390-1648637)
chr4 (25-256)||(15414151-15414382)
chr4 (30-265)||(16148618-16148853)
chr4 (30-265)||(16152764-16152999)
chr4 (13-259)||(15358233-15358479)
chr4 (28-259)||(15320063-15320294)
chr4 (28-249)||(15078558-15078779)
chr4 (73-259)||(14160383-14160569)
chr4 (75-259)||(29452712-29452896)
chr4 (75-259)||(3263969-3264153)
chr4 (27-259)||(12524589-12524821)
chr4 (27-259)||(14850233-14850465)
chr4 (29-259)||(40473953-40474183)
chr4 (30-223)||(14695062-14695255)
chr4 (27-259)||(8387325-8387557)
chr4 (27-259)||(12477513-12477745)
chr4 (27-259)||(14302845-14303077)
chr4 (27-259)||(19777660-19777892)
chr4 (27-259)||(8052490-8052722)
chr4 (27-259)||(14681480-14681712)
chr4 (27-259)||(23956660-23956892)
chr4 (27-259)||(27712249-27712481)
chr4 (27-259)||(29038271-29038503)
chr4 (75-259)||(44661041-44661225)
chr4 (75-259)||(11206406-11206590)
chr4 (27-259)||(18298118-18298350)
chr4 (75-259)||(20891895-20892079)
chr4 (84-259)||(33223836-33224011)
chr4 (99-259)||(1639364-1639524)
chr4 (28-259)||(18226314-18226545)
chr4 (27-223)||(15146752-15146948)
chr4 (28-259)||(7091345-7091576)
chr4 (28-121)||(18614692-18614785)
chr4 (183-223)||(16354468-16354508)
chr4 (162-253)||(15292420-15292511)
chr4 (203-259)||(18614852-18614908)
chr4 (162-223)||(18549321-18549382)
chr4 (192-248)||(16029035-16029091)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (6-186)||(6794-6974)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (6-260)||(342-597)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (13-259)||(5694-5940)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (6-259)||(3120-3373)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (27-259)||(24202-24434)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (30-259)||(3735-3964)
scaffold0403 (30-223)||(7352-7545)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (30-259)||(1106-1334)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (6-259)||(5374-5627)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (11-259)||(29001-29249)
scaffold0026 (27-226)||(29922-30121)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (28-259)||(193-424)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (30-265)||(11190-11425)
scaffold0298 (30-265)||(14960-15195)
scaffold0298 (13-259)||(20927-21173)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (13-259)||(802-1048)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (13-259)||(28169-28415)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (30-259)||(32354-32584)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (6-256)||(20855938-20856188)
chr1 (13-265)||(20939248-20939500)
chr1 (75-260)||(24098850-24099035)
chr1 (30-265)||(19662339-19662574)
chr1 (13-259)||(19855233-19855479)
chr1 (27-259)||(16373457-16373689)
chr1 (27-259)||(50619443-50619675)
chr1 (27-259)||(20139758-20139990)
chr1 (30-190)||(23197448-23197608)
chr1 (75-259)||(31539244-31539428)
chr1 (13-259)||(20835085-20835319)
chr1 (30-259)||(22109950-22110179)
chr1 (30-259)||(22113799-22114028)
chr1 (75-259)||(37678008-37678192)
chr1 (27-259)||(41352861-41353093)
chr1 (69-260)||(19107295-19107486)
chr1 (27-259)||(51332692-51332924)
chr1 (73-259)||(19760118-19760304)
chr1 (78-259)||(20295340-20295521)
chr1 (27-259)||(21831231-21831463)
chr1 (27-259)||(33390228-33390460)
chr1 (99-259)||(21837878-21838038)
chr1 (27-249)||(20250739-20250961)
chr1 (27-259)||(16349797-16350030)
chr1 (27-259)||(17044214-17044446)
chr1 (27-265)||(16077855-16078093)
chr1 (78-259)||(21951837-21952018)
chr1 (14-259)||(22361430-22361675)
chr1 (14-259)||(21749869-21750113)
chr1 (28-223)||(21025137-21025332)
chr1 (6-62)||(20061130-20061186)
chr1 (162-253)||(20830726-20830817)
chr1 (27-121)||(21234930-21235024)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (6-223)||(18329-18546)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (13-265)||(2471-2723)
scaffold0222 (75-265)||(7998-8188)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (13-265)||(20058-20310)
scaffold0058 (25-97)||(58342-58414)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (13-265)||(194820-195072)
scaffold0011 (13-259)||(149514-149760)
scaffold0011 (28-259)||(25664-25895)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (12-259)||(9923-10170)
[»] scaffold0067 (5 HSPs)
scaffold0067 (15-259)||(51298-51542)
scaffold0067 (15-259)||(60332-60576)
scaffold0067 (15-259)||(66720-66964)
scaffold0067 (109-211)||(26392-26494)
scaffold0067 (13-106)||(27722-27815)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (13-265)||(46515-46767)
scaffold0010 (75-259)||(41511-41695)
scaffold0010 (30-259)||(2858-3087)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (30-253)||(2618-2841)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (40-259)||(14340-14559)
scaffold0261 (40-259)||(22519-22738)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (27-259)||(31883-32115)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (13-265)||(323642-323894)
scaffold0004 (27-250)||(202598-202821)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (75-265)||(41855-42045)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (13-259)||(20844-21090)
scaffold0114 (30-259)||(45461-45690)
scaffold0114 (29-259)||(19473-19703)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (6-251)||(4728-4973)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (6-180)||(1-175)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (75-265)||(11964-12154)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (13-259)||(48322-48568)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (30-259)||(268-497)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (30-259)||(4585-4814)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (6-251)||(10745-10990)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (30-259)||(5469-5697)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (30-259)||(3695-3924)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (30-259)||(102177-102406)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (27-259)||(1197-1429)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (13-265)||(6354-6606)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (27-259)||(17107-17339)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (75-259)||(249557-249741)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (11-202)||(1968-2159)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (99-265)||(100751-100920)
scaffold0020 (27-259)||(181143-181375)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (13-265)||(13136-13390)
scaffold0124 (162-253)||(7073-7164)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (75-260)||(6156-6341)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (75-259)||(2532-2716)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (13-265)||(13415-13667)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (27-259)||(279-511)
scaffold0139 (13-247)||(28173-28407)
scaffold0139 (13-247)||(34426-34660)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (27-259)||(4084-4316)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (63-259)||(116071-116267)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (30-265)||(20574-20809)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (52-259)||(229987-230194)
scaffold0012 (28-259)||(218548-218779)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (84-259)||(261252-261427)
scaffold0005 (52-223)||(277985-278156)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (27-253)||(9920-10146)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (13-246)||(11690-11923)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (30-259)||(15821-16050)
scaffold0040 (59-259)||(112650-112850)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (27-259)||(4815-5047)
scaffold0270 (27-259)||(11945-12177)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (28-251)||(17633-17856)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (15-232)||(670-886)
scaffold0120 (27-253)||(13008-13234)
scaffold0120 (30-259)||(6967-7193)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (14-259)||(39876-40121)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (30-251)||(11330-11551)
scaffold0018 (30-251)||(17522-17743)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (63-259)||(14245-14441)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (27-259)||(26074-26306)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (27-259)||(8217-8449)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (111-259)||(25079-25227)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (30-259)||(7278-7507)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (28-265)||(4969-5206)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (36-265)||(10596-10825)
scaffold0235 (36-265)||(20810-21039)
scaffold0235 (162-253)||(26756-26847)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (50-259)||(51016-51225)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (75-259)||(43727-43911)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (27-259)||(3587-3819)
scaffold0023 (30-260)||(59698-59928)
scaffold0023 (29-259)||(131051-131281)
scaffold0023 (27-223)||(28502-28698)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (36-251)||(1860-2075)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (80-259)||(8310-8489)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (75-259)||(15891-16075)
scaffold0089 (27-139)||(10501-10613)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (28-259)||(640-871)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (27-259)||(6958-7190)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (27-251)||(7021-7245)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (78-265)||(81013-81200)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (27-265)||(1614-1852)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (27-220)||(50415-50608)
scaffold0081 (27-223)||(19582-19778)
scaffold0081 (27-223)||(35006-35202)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (75-203)||(1-129)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (27-259)||(7883-8115)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (27-259)||(16599-16830)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (75-259)||(32497-32681)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (27-259)||(66349-66581)
scaffold0042 (27-223)||(38950-39146)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (27-259)||(56961-57193)
scaffold0017 (27-223)||(19197-19393)
scaffold0017 (27-223)||(196608-196804)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (28-251)||(18346-18569)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (171-265)||(802-896)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (30-250)||(4725-4945)
[»] scaffold0719 (1 HSPs)
scaffold0719 (27-259)||(64-296)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (27-247)||(1849-2069)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (27-259)||(6993-7225)
scaffold0358 (27-191)||(3739-3903)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (75-259)||(27205-27389)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (27-251)||(6173-6397)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (27-259)||(4483-4715)
[»] scaffold0585 (2 HSPs)
scaffold0585 (30-121)||(6224-6315)
scaffold0585 (183-259)||(6322-6398)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (29-259)||(14343-14573)
scaffold0324 (29-259)||(19134-19364)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (84-265)||(20332-20513)
scaffold0104 (84-265)||(23152-23333)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (27-256)||(8344-8573)
scaffold0080 (29-223)||(49163-49357)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (30-130)||(3405-3505)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (27-223)||(2944-3140)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (30-130)||(30418-30518)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (27-259)||(32703-32935)
scaffold0109 (27-259)||(9540-9772)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (27-259)||(63161-63393)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (31-265)||(13406-13640)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (121-242)||(10240-10361)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (27-259)||(3535-3767)
[»] scaffold0149 (4 HSPs)
scaffold0149 (171-259)||(6510-6598)
scaffold0149 (171-259)||(10941-11029)
scaffold0149 (13-57)||(6446-6490)
scaffold0149 (13-57)||(10877-10921)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (189-260)||(7127-7198)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (27-259)||(2209-2445)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (30-259)||(7464-7693)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (27-212)||(39033-39218)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (27-223)||(3174-3370)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (183-259)||(22811-22887)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (183-259)||(8734-8810)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (183-259)||(1358-1434)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (78-210)||(27926-28058)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (27-223)||(79624-79820)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (27-154)||(18087-18214)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (168-259)||(40682-40773)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (28-138)||(15613-15723)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (27-136)||(2503-2612)
scaffold0621 (183-253)||(2417-2487)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (184-259)||(25006-25081)
scaffold0100 (30-151)||(24840-24961)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (126-259)||(3318-3451)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (102-219)||(28-145)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (161-253)||(8215-8307)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (183-223)||(25954-25994)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (90-148)||(13-71)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (160-253)||(3207-3300)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (161-253)||(10244-10336)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (162-253)||(3140-3231)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (162-253)||(24344-24435)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (150-232)||(85772-85854)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (161-253)||(3492-3584)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (27-139)||(29701-29813)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (161-253)||(18997-19089)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (161-253)||(72139-72231)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19880328 - 19880069
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19880328 agtatcagagaagcacaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcagactgaagatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtg 19880229  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19880228 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctaacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagccacaagagtagcttgagtatccatccggg 19880129  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19880128 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttagtggtctggtttgaagcgtga 19880069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18795720 - 18795461
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18795720 agtatcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatgttttatagtaatcaatctgaagatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtg 18795621  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18795620 tgttgaggttcagaggtagaatttgtattccggacaatgatgagttgaaaaagttgatcttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 18795521  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18795520 agctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 18795461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 33 - 265
Target Start/End: Original strand, 34644864 - 34645096
Alignment:
Q  33 gtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgta 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  34644864 gtcaagtttgtggatttaatgattgatagcaatcaaactgaagatggtgatttcaaggttgatgaacacggtgtgttgagattcagaggcagaatttgca 34644963  T
Q  133 ttcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaa 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34644964 ttcctgataacgatgagatgaaaagattgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtaccacgacttgaa 34645063  T
Q  233 aaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  34645064 aaagctgttttggtgggttggtttgaagcgtga 34645096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15460359 - 15460112
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15460359 gagaagcacaacgagttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaagctgaggatggtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtattgag 15460260  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||||    
T  15460259 atttagaggcagaatttgtattcccgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaatttgagtattcatccaggagctacg 15460160  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    || |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15460159 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggattgaag 15460112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25769199 - 25768962
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  25769199 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgctagtaatcaaaatgaagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtttagaggaagaat 25769100  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||     
T  25769099 ttgtattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgat 25769000  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    || || ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25768999 tttaagaaattgttttggtggtccggtttgaagcgtga 25768962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 19488544 - 19488776
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19488544 gttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgacttccaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggcagaa 19488643  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    || |||||||||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19488644 ttcgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatga 19488743  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||| ||  ||||||||||||| || |||||    
T  19488744 cttgaagaaattgttttggtggtccggattgaa 19488776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19436008 - 19435773
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| ||||| || |||| | |||||   ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19436008 gatgtgaagtttgttgatttgatagttgctggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggtggatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaattt 19435909  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  19435908 gtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaataaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgattt 19435809  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19435808 gaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtga 19435773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Original strand, 21563383 - 21563642
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| || | | |||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  21563383 agtatcagagaagcgcaacaagttgatgtcaagtttgtggatatattggttactagtaatcaagctgaggctagtgatttcaaggttgatgaacaaggcg 21563482  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||| ||||| || ||||| |||| ||||| ||| || |||||||||||    
T  21563483 tgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaacagttaattttagaggaaagccacaggagtaacttaagcatccatccggg 21563582  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21563583 agctacgaagatgtatcatgacttgaagagattgttttggtggtccggtttgaagcgtga 21563642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Original strand, 21569242 - 21569501
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| || | | |||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  21569242 agtatcagagaagcgcaacaagttgatgtcaagtttgtggatgtattggttactagtaatcaagctgaggctagtgatttcaaggttgatgaacaaggcg 21569341  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||| ||||| || ||||| |||| ||||| ||| || |||||||||||    
T  21569342 tgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaacagttaattttagaggaaagccacaggagtaacttaagcatccatccggg 21569441  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21569442 agctacgaagatgtatcatgacttgaagagattgttttggtggtccggtttgaagcgtga 21569501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21472609 - 21472378
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| | |||    
T  21472609 ttgatgtcaagtttgtggatttgatggttgctagtaatcaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggcgtgttgaggttcagaggaataat 21472510  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    ||| |||||||| |  |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||     
T  21472509 ttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagcagcttaagtattcacccgggagctacaaagatgtaccatgat 21472410  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  21472409 ttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaa 21472378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19454445 - 19454191
Alignment:
Q  11 cagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttg 110  Q
    |||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||   ||| | |||||||| || || |||||||| || |||||||||    
T  19454445 cagagaagcacaacaagtggatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttg 19454346  T
Q  111 aggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagcta 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  | || ||| ||||||  |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  19454345 aggttcagaggaagaatttgtattcctgatgatgacgagttgaaaaaattgattttcgaggaaagtcacaagagtaacttaagtattcatccgggagcta 19454246  T
Q  211 cgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19454245 cgaaaatgtaacatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 19454191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Original strand, 8762208 - 8762443
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||   ||||| ||||  | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  8762208 gatgtaaagtttgttgatttaatggttgcgggtaatgaaacagaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagaggtagaattt 8762307  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||    
T  8762308 gtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaataaagtcacaaaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtaccatgattt 8762407  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8762408 gaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 8762443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23079478 - 23079246
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| | |||||| |||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||    
T  23079478 gttgatgttaggtttgtagatttgttggttgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggagtgttgagattccgagggagaa 23079379  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  23079378 tttctattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcatga 23079279  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23079278 tctgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaa 23079246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 260
Target Start/End: Original strand, 28282133 - 28282318
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||| ||| ||  | || ||||    
T  28282133 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaa 28282232  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28282233 gtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaag 28282318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Original strand, 10468107 - 10468354
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||||   ||||| | ||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  10468107 gagaagcacagcaagtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgcgggtaatgagacagaggatagtgacttcaaagttgatgatcagggtgttttgag 10468206  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||     
T  10468207 gttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctaca 10468306  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  10468307 aagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaag 10468354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 18196997 - 18197220
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||| || ||||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||    
T  18196997 gttgacgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcacactaaggatagtgactttaaggtcgatgatcaaggtgtgttgagatttcgaggtagaa 18197096  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| | | ||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18197097 tttgtattccagacgacgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctaccaagatgtatcatga 18197196  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtc 250  Q
     ||||||||  |||||||||||||    
T  18197197 tttgaaaaatttgttttggtggtc 18197220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Original strand, 5296481 - 5296710
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||   ||||| ||||  | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  5296481 gatgtaaagtttgttgatttaatgtttgcgggtaatgaaacagaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagaggtagaattt 5296580  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||    
T  5296581 gtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagttacaagagtagcttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgattt 5296680  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  5296681 gaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 5296710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 265
Target Start/End: Original strand, 14380805 - 14380977
Alignment:
Q  93 gatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttga 192  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14380805 gatgatcagggtgtattgaggttcagaggaagaatttgtattcgtgacaatgatgagttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttga 14380904  T
Q  193 gtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    || | |||||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14380905 gtgttcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtga 14380977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 1542356 - 1542588
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| | || ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||| ||| |||  ||||    
T  1542356 gttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagtgaccagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtctgttgagattccgagagagaa 1542455  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1542456 tttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacga 1542555  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     ||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  1542556 tttgaagaagattttctggtggtctggtttgaa 1542588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 22077962 - 22078194
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||  |||| ||||    
T  22077962 gttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactaaagatggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaa 22078061  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||| ||  ||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22078062 tttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 22078161  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | |||||  | |||||||||||||| |||||    
T  22078162 tctaaaaaaattattttggtggtctggattgaa 22078194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 265
Target Start/End: Original strand, 25609133 - 25609371
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||| ||||  ||||||| ||  | ||||| |||||||| ||||||||  |||| || |    
T  25609133 gttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaagatcgatgaccaaggtgtattgaggtttcgaggtagga 25609232  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||| | || |||||||| | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  25609233 tttgtattccagacgatgaagagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatga 25609332  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
      | || ||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25609333 tctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaatgtga 25609371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 16625989 - 16626221
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  16625989 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 16626088  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16626089 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatga 16626188  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  16626189 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 16626221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 251
Target Start/End: Original strand, 18966600 - 18966788
Alignment:
Q  63 aatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttga 162  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || || |||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  | | |||    
T  18966600 aatcagactaaagatagtgactttaaggttgatgatcagggagtgttgtgatttcgaggtagaatttgtattcctgacaatgatgagatgaggaagatga 18966699  T
Q  163 ttttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtct 251  Q
    || | ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||    
T  18966700 ttcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaaaaatttgttttgctggtct 18966788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 218
Target Start/End: Original strand, 14379255 - 14379380
Alignment:
Q  93 gatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttga 192  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14379255 gatgatcagggtgtattgaggttcagaggaagaatttgtattcgtgacaatgatgagttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttga 14379354  T
Q  193 gtatccatccgggagctacgaagatg 218  Q
    || | |||||||||||||| ||||||    
T  14379355 gtgttcatccgggagctacaaagatg 14379380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15897116 - 15896871
Alignment:
Q  14 agaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgagg 113  Q
    ||||||| || | |||||||| |||||||| |||||| | |||| | | ||||| ||| |||||||||| || || |||||||| || || |||||| |     
T  15897116 agaagcacaaaaagttgatgtaaagtttgtagatttacttgttggtggaaatcagactgaagatagtgactttaaggttgatgatcagggagtgttgcga 15897017  T
Q  114 ttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacga 213  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | | ||||| |  |||| |||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  15897016 ttacgaggcagaattcgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttaaagagagtcacacaagtatcttgagtatccatccaggagctacaa 15896917  T
Q  214 agatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||||||| || ||||| | | | |||||||||||||| |||||    
T  15896916 agatgtatcatgatttgaagaggttattttggtggtctgggttgaa 15896871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25113558 - 25113329
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| || |||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  25113558 gatgtaaaatttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaattcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaattt 25113459  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  25113458 gtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgattt 25113359  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || ||| | || |||||||||||||||||    
T  25113358 aaagaagattttctggtggtctggtttgaa 25113329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 2874075 - 2874307
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| | |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  2874075 gttgatgtaaagtttgaggacttgttggttgctagagatcagactgaagacaatgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 2874174  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| |  ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2874175 tttgtatcccagacaatggagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 2874274  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  2874275 tttaaagaagattttttggtggtctggtttgaa 2874307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 22761727 - 22761959
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||| |||| |||| ||| |||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||  |||| || |    
T  22761727 gttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtgatcagactgaagacagtgactttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtagga 22761826  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22761827 tttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 22761926  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| |||||||||||||||| |||||    
T  22761927 tctaaagaagttgttttggtggtctggattgaa 22761959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 29591192 - 29591424
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || ||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||| | |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  29591192 gttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgataatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 29591291  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29591292 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 29591391  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  29591392 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 29591424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 20636571 - 20636769
Alignment:
Q  25 aggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcag 124  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||| |||  |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  20636571 aggttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaaggcagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtag 20636670  T
Q  125 aatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
     |||| |||||| ||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20636671 gatttttattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatca 20636769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 24312440 - 24312672
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||  | |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  24312440 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 24312539  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24312540 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 24312639  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || | |||||||||||||||    
T  24312640 tttaaagaagattttctagtggtctggtttgaa 24312672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 5838491 - 5838723
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||||  | || | ||||||||| ||| ||||| ||||||| || || ||||| || |||||||| || |||  |||   ||    
T  5838491 gttgatgtcaagtttgtggatttgttagtcgctagtaatcagactgaagatggtgattttaaggtcgatgaccatggtgtgttaagattccaaggtcaaa 5838590  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |   ||||| | || || ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  5838591 tttgtatccctgacaatgaagagatgaagaaaatgattctcgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 5838690  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     ||||| ||| | |||||||||| ||| |||||    
T  5838691 tttgaagaagttattttggtggtttggattgaa 5838723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24365373 - 24365189
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||| |||| | ||||||| | || || |    
T  24365373 gatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 24365274  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  24365273 gtcacaatagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaa 24365189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27188445 - 27188213
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||  || |||| || ||||| | | | |||||  |||| |||||||| ||| |||| ||||    
T  27188445 gttgatgtaaagtttgtggatttattggttgctagagatcaggctgaagacagcgattttagaatcgatgatgaaggcgtgttgagattccgaggaagaa 27188346  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  27188345 tttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatga 27188246  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     ||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  27188245 tttgaagaagattttctggtggtctggtttgaa 27188213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 27260795 - 27261027
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||  || |||| || ||||| | | | |||||  |||| |||||||| ||| |||| ||||    
T  27260795 gttgatgtaaagtttgtggatttattggttgctagagatcaggctgaagacagcgattttagaatcgatgatgaaggcgtgttgagattccgaggaagaa 27260894  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  27260895 tttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatga 27260994  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     ||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  27260995 tttgaagaagattttctggtggtctggtttgaa 27261027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 28262469 - 28262701
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||  ||||  || |||  |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||    
T  28262469 gttgatgtgaagttcgtggatttgttggttgctagagatcaggctcaaggcagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgagggagaa 28262568  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  28262569 tttgtattccagacgacgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 28262668  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  28262669 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 28262701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 28341218 - 28341450
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||  ||||  || |||  |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||    
T  28341218 gttgatgtgaagttcgtggatttgttggttgctagagatcaggctcaaggcagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgagggagaa 28341317  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  28341318 tttgtattccagacgacgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 28341417  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  28341418 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 28341450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18436615 - 18436392
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||  |    |||||||    
T  18436615 gatgtgaagttggtagatttaatggttggaaataatcagactgaagatagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcggaatagaattt 18436516  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||||||  |    || || |||| ||||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||| |||| || |||||||| || ||    
T  18436515 gtattcctgatgatacagaaatcaaaaagttgattctggaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggacctacaaaaatgtatcatgattt 18436416  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||    
T  18436415 gaagaagttattttggtggtctgg 18436392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 260
Target Start/End: Original strand, 16926912 - 16927145
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||| | ||| ||||| |||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||  | |    
T  16926912 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaattagactgaagatggtgactttaaagtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgga 16927011  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| ||||||||| | |  |||||||  |   ||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16927012 tttgcattcctgacgatgcagagatgaggaaaatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacga 16927111  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
      | || |||   |||||||||||||| ||||||    
T  16927112 tctaaagaagagattttggtggtctggattgaag 16927145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 260
Target Start/End: Original strand, 16962717 - 16962950
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||| ||||  | |    
T  16962717 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagtcgatgaccatggcgtgttgagattccgaggtcgga 16962816  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| ||||||||| | |  |||||||  |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16962817 tttgcattcctgacgatgcagagatgaggaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacga 16962916  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
      | || ||  | |||||||||||||| ||||||    
T  16962917 tctaaagaatatattttggtggtctggattgaag 16962950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19865696 - 19865500
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||| | || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || || || ||||| || ||||||||||| ||  |||   |||    
T  19865696 gttgatgtcaagtttatagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagatttcgagttcgaa 19865597  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    |||||||||||||  | || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19865596 tttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatca 19865500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 27330705 - 27330937
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||   |   ||||    
T  27330705 gttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcaaaatagaa 27330804  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    | |||||||| ||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||    
T  27330805 tatgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctgcgaagatgtaacatga 27330904  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | |||||||||||||| |||||    
T  27330905 tctaaagaagttattttggtggtctgggttgaa 27330937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 27391445 - 27391677
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||   |   ||||    
T  27391445 gttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcaaaatagaa 27391544  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    | |||||||| ||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||    
T  27391545 tatgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctgcgaagatgtaacatga 27391644  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | |||||||||||||| |||||    
T  27391645 tctaaagaagttattttggtggtctgggttgaa 27391677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 223
Target Start/End: Original strand, 18407217 - 18407410
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| || ||  |||||| |||| |||| |||  ||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||    
T  18407217 gatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtgatcagactggagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtaggattt 18407316  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    ||||||| ||  | || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18407317 gtattccagatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatctgggagctacgaagatgtatca 18407410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22434878 - 22434686
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||| | ||| ||||| |||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||| |||   |||    
T  22434878 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaattagactgaagatggtgacttcaaggtcgatgaccacggtgtgttgagattccgagatcgaa 22434779  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgt 219  Q
    ||||||||||||   | || || ||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22434778 tttgtattcctgttgatgaagaaatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgt 22434686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22443276 - 22443084
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||| | ||| ||||| |||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||| |||   |||    
T  22443276 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaattagactgaagatggtgacttcaaggtcgatgaccacggtgtgttgagattccgagatcgaa 22443177  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgt 219  Q
    ||||||||||||   | || || ||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22443176 tttgtattcctgttgatgaagaaatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgt 22443084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 259
Target Start/End: Original strand, 27566327 - 27566484
Alignment:
Q  102 ggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatc 201  Q
    ||||||||||| ||| ||||  | ||||| ||||||||| | |  |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  27566327 ggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataaaagtagcttgagtattcatc 27566426  T
Q  202 cgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || || ||| | || ||||||||||| |||||    
T  27566427 cgggagctacaaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggattgaa 27566484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16098925 - 16098838
Alignment:
Q  161 gattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtgg 248  Q
    ||||||||| ||| |||| | |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||    
T  16098925 gattttggacgaaggtcataggagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaagttgttttggtgg 16098838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 196
Target Start/End: Original strand, 28287991 - 28288114
Alignment:
Q  73 aagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaaga 172  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| || | | ||||| | |||||    
T  28287991 aagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgtattccagacgacgaagagattaagaagatgattcttgaaga 28288090  T
Q  173 aagtcacaagagtagcttgagtat 196  Q
     ||||| |  ||||||||||||||    
T  28288091 gagtcatagaagtagcttgagtat 28288114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Original strand, 14624764 - 14624855
Alignment:
Q  162 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||    
T  14624764 attttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtgttctgg 14624855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Original strand, 16381780 - 16381871
Alignment:
Q  162 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  16381780 attttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgg 16381871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Original strand, 27565093 - 27565163
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatga 97  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||    
T  27565093 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgactttaaagtcgatga 27565163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19613831 - 19613572
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19613831 agtatcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtg 19613732  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19613731 tgttgaagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccggg 19613632  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19613631 agctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtga 19613572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Original strand, 11387521 - 11387780
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  11387521 agtatcagagaagcgcaacaagttgatgtcaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaggttgatgaacaaggcg 11387620  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  11387621 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttaattttagaggaaagccacaggagtaacttaagtatccatccggg 11387720  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11387721 agctacgaagatgtatcatgacttgaagagattgttttggtggtccggtttgaagcgtga 11387780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19148367 - 19148114
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| || |||     
T  19148367 agtatcagagaagcacagcaagttgatgtcaagtttgtgggtttaatggttgctagtaatcaaactgaagatggtgatttcaaggttgatgatcagggta 19148268  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||| ||||| ||    
T  19148267 tgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacataaatagcttaagtattcatccagg 19148168  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  19148167 agctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaa 19148114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20747766 - 20747513
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| || |||     
T  20747766 agtatcagagaagcacagcaagttgatgtcaagtttgtgggtttaatggttgctagtaatcaaactgaagatggtgatttcaaggttgatgatcagggta 20747667  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||| ||||| ||    
T  20747666 tgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacataaatagcttaagtattcatccagg 20747567  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  20747566 agctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaa 20747513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 15101703 - 15101949
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||| | ||||| ||||||| | ||||| | ||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  15101703 gagaagcacaacaagtggatgtcaagtttattgatttgatggttgttggtaatgacactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgctgag 15101802  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  15101803 gttcagaggaagaatttgtattcctgataacgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctaca 15101902  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15101903 aaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaa 15101949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 265
Target Start/End: Original strand, 12205912 - 12206152
Alignment:
Q  25 aggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcag 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||| | ||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||    
T  12205912 aggttgatgttaagtttgtggatttgttggtggctagcaaccaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaag 12206011  T
Q  125 aatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcac 224  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| |||     
T  12206012 aatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaggttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctataaagatgtttcat 12206111  T
Q  225 gacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12206112 gacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaagcgtga 12206152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13666686 - 13666434
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||   ||||| |||||||| || || |||||||| || | |||||||||    
T  13666686 gagaagcacaacaagtagatgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatggcactaaggatagtgactttaaggttgatgatcaggatgtgttgag 13666587  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  13666586 gttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacg 13666487  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13666486 aaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 13666434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14434840 - 14434588
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||| || ||| | || |||| | |||||   ||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  14434840 gagaagcacagcaggtggatgtcaagttggttgatctgattgttgctggtaatggcactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 14434741  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14434740 attcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacg 14434641  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  14434640 aagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccgttttgaagcgtga 14434588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Original strand, 14263337 - 14263590
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  14263337 agtatcagagaagcacaacaagttgatgtcaagttcgttgatttaatggttactagtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtg 14263436  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||  |||||| ||||||||| || ||||||||||  | |||| | ||||| ||||| ||    
T  14263437 tgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacagaaatagcctaagtattcatccagg 14263536  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  14263537 aactacaaagatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 14263590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 14285538 - 14285722
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || ||||    
T  14285538 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagagggaggatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaggaaa 14285637  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14285638 gtcacaagagtagcttgagtattcatcctggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaa 14285722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 260
Target Start/End: Original strand, 18053113 - 18053300
Alignment:
Q  73 aagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaaga 172  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||| ||| || || || ||    
T  18053113 aagatagtgacttcaaggttgatgaacagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcttagagga 18053212  T
Q  173 aagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18053213 aagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaag 18053300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 265
Target Start/End: Original strand, 569 - 759
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||||  ||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  569 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgttatgaggttcagaagaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaa 668  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  669 gtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtga 759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 265
Target Start/End: Original strand, 16949595 - 16949823
Alignment:
Q  36 aagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattc 135  Q
    |||||||| ||||||||| ||  | ||||| | ||| | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  16949595 aagtttgttgatttaatgattattggtaatgacactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgttttgagatttagaggaagaatttgtattc 16949694  T
Q  136 ctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaa 235  Q
    || |||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||    
T  16949695 ctaacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtaccacgatttgagaaa 16949794  T
Q  236 gctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
     |||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  16949795 -ctgttttggtggtccggtttcaagcgtga 16949823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15341517 - 15341334
Alignment:
Q  76 atagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaag 175  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||| ||||| |||||||     
T  15341517 atagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaagaaat 15341418  T
Q  176 tcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15341417 tcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaa 15341334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Original strand, 11771378 - 11771609
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  || ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||||||||    
T  11771378 ttgatgttaagtttgtggacttgttgattgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtggtgagatttcgaggcagaat 11771477  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||     
T  11771478 ttgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgat 11771577  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  11771578 ttgaagaagttgttttggtggtctggattgaa 11771609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14040828 - 14040597
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    ||||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  14040828 ttgatgttaagtttgtagatttgttggttgttagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaat 14040729  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    ||||||||| |||   ||||||||||| |   ||| | | ||||| ||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  14040728 ttgtattccagacgctgatgagatgaagaaaatgaatcttgaagagagtcatagaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgat 14040629  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14040628 ttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaa 14040597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14350858 - 14350627
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    ||||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  14350858 ttgatgttaagtttgtagatttgttggttgttagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaat 14350759  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    ||||||||| |||   ||||||||||| |   ||| | | ||||| ||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  14350758 ttgtattccagacgctgatgagatgaagaaaatgaatcttgaagagagtcatagaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgat 14350659  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14350658 ttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaa 14350627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Original strand, 23504970 - 23505217
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| || ||| ||||||||| | |||||   | | |||||| ||| ||||| |||||||| || |||||| | ||    
T  23504970 gagaagcacaacaagtggatgtcaagttggttgatctaatggttgctggtaatggtattgaagataatgacttcaaggttgatgatcagggtgtgctaag 23505069  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||| ||| ||  | || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  23505070 attcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacg 23505169  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23505170 aagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaag 23505217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12456789 - 12456605
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  12456789 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgttctaaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaa 12456690  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  12456689 gtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccagtttgaa 12456605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Original strand, 321160 - 321399
Alignment:
Q  14 agaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgagg 113  Q
    ||||||| || | |||||||| ||| |||| || ||  |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||     
T  321160 agaagcacaaaaagttgatgttaagcttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaattgatgatcaaggtgtgttgaga 321259  T
Q  114 ttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacga 213  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  321260 ttccgagatagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaaagtgatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacga 321359  T
Q  214 agatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    |||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  321360 agatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgg 321399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 251
Target Start/End: Original strand, 16071412 - 16071632
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16071412 gatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaagctgaagatggtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaattt 16071511  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    |||||| ||| || |||||  | |||| ||||||||| || ||||| || |  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||    
T  16071512 gtattcatgataatgatga-tttaaaaagttgattttagaggaaagccatagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatataccatgattt 16071610  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtct 251  Q
    ||| ||  | ||||||||||||    
T  16071611 gaagaaattattttggtggtct 16071632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15204753 - 15204529
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||  ||  |||||| ||||||| | ||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| ||| |||||||||    
T  15204753 gttgatgttaagtttgtgggcttgttggttgctagtaattagactgaagatagtgacttcaaggtcgatgatcagggaatgttgagattccgaggcagaa 15204654  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||||||| | || ||||| || | | ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  15204653 tttgtattcctgacgatgaagagataaagaagatgattcttgaagagagtcacaaaagtagcttgagtattcatccggaagctacgaagatgtatcatga 15204554  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtct 251  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||    
T  15204553 tttgaagaagttgttttggtggtct 15204529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 259
Target Start/End: Original strand, 15153818 - 15154025
Alignment:
Q  52 tggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagat 151  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  15153818 tggttgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagat 15153917  T
Q  152 gaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtct 251  Q
    ||| |   ||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| ||  ||||||||||||||    
T  15153918 gaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtagcttgagtatccatccgggagctatgaagatgtatcatgatctgaagaatttgttttggtggtct 15154017  T
Q  252 ggtttgaa 259  Q
    || |||||    
T  15154018 ggattgaa 15154025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 118 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15625595 - 15625454
Alignment:
Q  118 gaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15625595 gaggcagaatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaagatgattcttgaagaaagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagat 15625496  T
Q  218 gtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  15625495 gtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 15625454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12457727 - 12457540
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| | || || |    
T  12457727 gatagtgattttaaggttgatgaccaaggtgtgctgaggtttagaggaagagtttgtattcctgacaacgatgatttgaagaagttgattcttgaggaga 12457628  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtg 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| | |||||||||    
T  12457627 gtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccgatttgaagtg 12457540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13022489 - 13022254
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||   ||||| | ||  | |||||||| ||||| ||| |||| || |||||  ||||||||||||| ||| |||    
T  13022489 gatgtaaagtttgttgatttaatggttgcgggtaatgagacagaggatagtgacttcaaggtttatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagttt 13022390  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||    
T  13022389 gtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgattt 13022290  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||| || |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13022289 gaagaaactgttttggtggtccgttttgaagtgtga 13022254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8708739 - 8708507
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  8708739 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 8708640  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8708639 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 8708540  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  8708539 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 8708507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 11305425 - 11305609
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||| | || || |    
T  11305425 gatagtgatttcaaagttgatgatcaaggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 11305524  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| | ||||||    
T  11305525 gtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccgatttgaa 11305609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18178876 - 18178644
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| |||||||| |||||||| | | | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  18178876 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactaaagacagtgattttagaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 18178777  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  18178776 tttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 18178677  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  18178676 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 18178644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 44790487 - 44790719
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  44790487 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 44790586  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44790587 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 44790686  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  44790687 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 44790719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 49153388 - 49153204
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||| | || || |    
T  49153388 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 49153289  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  49153288 gtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 49153204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 259
Target Start/End: Original strand, 11236348 - 11236581
Alignment:
Q  26 ggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcaga 125  Q
    |||||||||||||||||| || ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||    
T  11236348 ggttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaaga 11236447  T
Q  126 atttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacg 225  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  11236448 atttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatg 11236547  T
Q  226 acttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    | || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  11236548 atttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 11236581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10872129 - 10871897
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || ||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  10872129 gttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 10872030  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10872029 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 10871930  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  10871929 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 10871897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14130902 - 14130770
Alignment:
Q  133 ttcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaa 232  Q
    |||||||||| || ||  |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  14130902 ttcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaa 14130803  T
Q  233 aaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  14130802 aaagctgttttggtggtccgttttgaagcgtga 14130770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9597189 - 9596959
Alignment:
Q  29 tgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatt 128  Q
    ||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||  |||| || ||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||  | |||    
T  9597189 tgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaaatcgatgaccaaggtgtgttgagattccgaggtcggatt 9597090  T
Q  129 tgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgact 228  Q
    || ||||||||| | |  |||||||| | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9597089 tgcattcctgacgatgcagagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatt 9596990  T
Q  229 tgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  9596989 taaagaagattttatggtggtctggtttgaa 9596959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8199762 - 8199530
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  8199762 gttgatgtaaagtttgtagacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 8199663  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8199662 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 8199563  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  8199562 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 8199530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14955688 - 14955460
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  14955688 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 14955589  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||| ||    
T  14955588 tttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtattcat----gagctacgaagatgtatcatga 14955493  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||| ||||||||||    
T  14955492 tttaaagaagattttctggtggcctggtttgaa 14955460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 259
Target Start/End: Original strand, 11552242 - 11552470
Alignment:
Q  31 atgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttg 130  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||  |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  11552242 atgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagaccgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttg 11552341  T
Q  131 tattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttg 230  Q
    ||||||  |||| || ||||| || | | ||||| | || || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  11552342 tattccatacaatgaagagattaagaagatgattcttgaggagagtcacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga-ttg 11552440  T
Q  231 aaa-aagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||| ||| | || |||||| ||||||||||    
T  11552441 aaagaagattttctggtggcctggtttgaa 11552470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12688634 - 12688403
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||| | ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| | |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  12688634 gttgatttaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacattgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 12688535  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||  ||||  || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12688534 tttgtattctagacat-gaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 12688436  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | ||||||||| || |||||||    
T  12688435 tttaaagaagattttttggtggcctagtttgaa 12688403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13687198 - 13686966
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||  | ||||||||| |||| ||| |||| ||||    
T  13687198 gttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgctgagattccgaggaagaa 13687099  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13687098 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 13686999  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  13686998 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 13686966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 13967830 - 13968014
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  |||||  |||| |  |||||| | || || |    
T  13967830 gatagtgattttaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcttgacagtgatgatttgaagaatttgattctcgaggaga 13967929  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  13967930 gtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 13968014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14212808 - 14212576
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||  |||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||  | |    
T  14212808 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgatgatcacggtgtgttgagattccgaggtcgga 14212709  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||| | |  || ||||| |   ||||| | ||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14212708 tttgtattcccgacgatgcagaaatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatcgaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 14212609  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  14212608 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 14212576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 26117767 - 26117951
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||| || || ||| |||| | ||||||| | || || |    
T  26117767 gatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtaaagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 26117866  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  26117867 gtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 26117951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 18550894 - 18551126
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||  | |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  18550894 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 18550993  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | | ||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18550994 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcataa 18551093  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  18551094 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 18551126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 15160193 - 15160425
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||  | ||||||||| |||| ||| |||| ||||    
T  15160193 gttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgctgagattccgaggaagaa 15160292  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || |   ||||| | ||||| ||||| | |||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15160293 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtatatttagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 15160392  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  15160393 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 15160425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 16454 - 16684
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||  |||| || ||||| || || ||  |||||||||| ||| ||||  | |    
T  16454 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgacgatcacagtgtgttgagattccgaggtcgga 16553  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16554 tttgtattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacga--atgtatcacga 16651  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  16652 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 16684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14333530 - 14333334
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||| |||||| ||  |||||| |||  |||| ||| ||||  ||||||| ||| | ||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||    
T  14333530 gttgatgtaaagtgtgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacggtgattttaaaatcgatgatctaggtgtgttgagattccgaggaagaa 14333431  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    ||||||| || | ||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14333430 tttgtatcccaggcaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatca 14333334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 259
Target Start/End: Original strand, 23202786 - 23202981
Alignment:
Q  64 atcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgat 163  Q
    |||| ||| ||||||||||||| | |   ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| || | | ||||    
T  23202786 atcagactgaagatagtgattttagaaccgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatatgcattccagacaatgaagagattaagaagatgat 23202885  T
Q  164 tttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    | | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||| | || | |||||||||||||||    
T  23202886 tcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaa 23202981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 259
Target Start/End: Original strand, 23508913 - 23509108
Alignment:
Q  64 atcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgat 163  Q
    |||| ||| ||||||||||||| | |   ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| || | | ||||    
T  23508913 atcagactgaagatagtgattttagaaccgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatatgcattccagacaatgaagagattaagaagatgat 23509012  T
Q  164 tttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    | | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||| | || | |||||||||||||||    
T  23509013 tcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaa 23509108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 259
Target Start/End: Original strand, 8211346 - 8211474
Alignment:
Q  131 tattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttg 230  Q
    |||||||||||| || ||| |||| | ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||     
T  8211346 tattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattctggaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgattta 8211445  T
Q  231 aaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    || ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  8211446 aagaaattgttttggtggtccggtttgaa 8211474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4440928 - 4440836
Alignment:
Q  161 gattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    ||||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || | | ||||||||||||||||    
T  4440928 gattttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcgacgaagatgtatcaggatttaaagaggttgttttggtggtctgg 4440836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17924651 - 17924559
Alignment:
Q  161 gattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | || ||||| | | ||||||||||| ||||    
T  17924651 gattttggacgaaggtcacaggagtagtctgagtattcatccaggagcgacgaagatgtattaggatttgaagaggttgttttggtggcctgg 17924559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21662933 - 21662862
Alignment:
Q  189 ttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  21662933 ttgagtattcatccgggagctacaaaaatatatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccgggttgaag 21662862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Original strand, 27107045 - 27107136
Alignment:
Q  162 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  27107045 attttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgg 27107136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Original strand, 32786 - 33045
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32786 agtatcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtg 32885  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32886 tgttgaagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccggg 32985  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32986 agctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtga 33045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 75 - 265
Target Start/End: Original strand, 56078 - 56268
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  56078 gatagtgacttcaaggtggatgatcagggtgtattgagattcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaa 56177  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  56178 gtcacaagagtagcttgagtattcatccgagagctacaaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 56268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 41299 - 41208
Alignment:
Q  162 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  41299 attttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgg 41208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Original strand, 27364741 - 27364984
Alignment:
Q  22 aacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagagg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27364741 aacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagagg 27364840  T
Q  122 cagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtat 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27364841 cagaatttgcattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtat 27364940  T
Q  222 cacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27364941 cacgatttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtga 27364984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23277549 - 23277319
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23277549 gatgtgaagttcgttgatttgatggttgttggtaatgaaactgaagatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaattt 23277450  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    |||||||||| || |||||  |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  23277449 gtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgattt 23277350  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23277349 gaagaagctattttggtggtccggtttgaag 23277319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 260
Target Start/End: Original strand, 27209818 - 27210072
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  || |  |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27209818 agtatcagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgtggattttatggttactagtaatcaggctgagaatagtgatttcaagattgatgagcaaggtg 27209917  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    ||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||  | ||  |||| | |||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27209918 tgttgagatttagaggcaaaatctgtattcctgacaataaagaattgaagaagttgatattagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccggg 27210017  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27210018 agctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaag 27210072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23294708 - 23294473
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| || || | |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23294708 gatgtgaagtttgtggatttaatggttgctggtaatgaagctgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaattt 23294609  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    | ||||||||  | ||| |  |||||| ||| ||| | || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||    
T  23294608 gcattcctgatgatgataatttgaaaaagttaattctagaggaaagtcacaagagtagcttgaatattcatccgggagcaacgaaaatgtatcatgattt 23294509  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23294508 gaagaagctgttttggtggtccggtttgaagtgtga 23294473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 265
Target Start/End: Original strand, 19651794 - 19651957
Alignment:
Q  102 ggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatc 201  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19651794 ggtgtattgagattcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgaatattcatc 19651893  T
Q  202 cgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  19651894 cgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgatttggtggtccggtttgaagcgtga 19651957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27788471 - 27788284
Alignment:
Q  73 aagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaaga 172  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||| ||| ||  | || ||    
T  27788471 aagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagagga 27788372  T
Q  173 aagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27788371 aagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaag 27788284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23111511 - 23111273
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  23111511 ttgatgttaagtttgtggatttgttggttgctagtaatcaaactagagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtatgttgagattctgaggcagaat 23111412  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagc-ttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||  |||| |||||  |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  23111411 tttcattcttgacagtgatgagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacataagtagctttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatga 23111312  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||| ||  ||||||||||||| || || ||||||||    
T  23111311 cttgaagaaattgttttggtggtccggatttaagtgtga 23111273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 21144708 - 21144940
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  21144708 gttgatgtaaagtttgtggacttattggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagggagaa 21144807  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21144808 tttgtattccagacaatgaggagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 21144907  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  21144908 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 21144940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 155
Target Start/End: Original strand, 23099664 - 23099813
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| || | | |||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  23099664 agtatcagagaagcgcaacaagttgatgtcaagtttgtggatttattggttactagtaatcaagctgaggctagtgatttcaaggttgatgaacaaggcg 23099763  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaa 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  23099764 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaa 23099813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 251
Target Start/End: Original strand, 24819356 - 24819577
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||||    
T  24819356 gatgttaagtttgtggatttgttggttgctagtaatccgactgaagatagtgacttcaaagtcgatgatcaaggagtgttgagattctgaggtagaattt 24819455  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| | | ||| | |  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||    
T  24819456 gtattccagacgatgatgagatgaagaagatgactcttaaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcattattt 24819555  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtct 251  Q
    ||| | | ||||||||||||||    
T  24819556 gaagaggttgttttggtggtct 24819577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 24876416 - 24876648
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||  ||  ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  24876416 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcggaccgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 24876515  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24876516 tttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 24876615  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || ||||||| |||||||||    
T  24876616 tttaaagaagattttctggtggtttggtttgaa 24876648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12575143 - 12574896
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| || ||| ||||||||| | ||| |   | | |||||||||| ||||| |||||||| || |||||| | ||    
T  12575143 gagaagcacaacaagtggatgtcaagttagttgatctaatggttgctggtagtggtattgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgcttag 12575044  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     |||||||| ||| ||||||| ||||| || || || ||||||| ||| ||  | || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  12575043 attcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacg 12574944  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12574943 aagatgtatcatgatttgaaagagctgttttggtggtctgggttgaag 12574896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20828987 - 20828806
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||| | || || |    
T  20828987 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 20828888  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggttt 256  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  20828887 gtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggttt 20828806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20833713 - 20833532
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||| | || || |    
T  20833713 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 20833614  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggttt 256  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  20833613 gtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggttt 20833532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1064479 - 1064295
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| || ||| |||| | ||||||| | || || |    
T  1064479 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctaacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 1064380  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  1064379 gtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 1064295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16926136 - 16925904
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  16926136 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 16926037  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16926036 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 16925937  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  16925936 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 16925904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16999776 - 16999544
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  16999776 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 16999677  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16999676 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 16999577  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  16999576 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 16999544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31831386 - 31831202
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| | || | ||||||| | || || |    
T  31831386 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaggagttaaagaagttgattcttgaggaga 31831287  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31831286 gtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtatgaa 31831202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27372045 - 27371813
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  27372045 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 27371946  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  27371945 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatga 27371846  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  27371845 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 27371813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 41608052 - 41608284
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||  | |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  41608052 gttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 41608151  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41608152 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 41608251  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  41608252 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 41608284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 44385236 - 44385468
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  44385236 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaaattccgaggaagaa 44385335  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44385336 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 44385435  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  44385436 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 44385468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24949324 - 24949127
Alignment:
Q  69 actaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggt-gtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttg 167  Q
    ||||| ||| |||| ||||| |||||||| || ||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||| |  | ||||   |||||| |||||||||     
T  24949324 actaaggatcgtgacttcaaggttgatgatcatggttgtgatgagattcagaggaagaatttgcattcctcatgatgatggtttgaaaaagttgatttta 24949225  T
Q  168 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  24949224 gaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccagtttgaagcgtga 24949127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9610912 - 9610680
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || ||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  9610912 gttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 9610813  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9610812 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 9610713  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  9610712 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 9610680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10869626 - 10869394
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  10869626 gttgatgtaaagtttgtagacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 10869527  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||| | || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10869526 tttgtatcccagacgatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 10869427  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  10869426 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 10869394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16923665 - 16923433
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || ||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  16923665 gttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 16923566  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16923565 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 16923466  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  16923465 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 16923433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16982928 - 16982696
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || ||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  16982928 gttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 16982829  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16982828 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 16982729  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  16982728 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 16982696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17064493 - 17064261
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || ||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  17064493 gttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 17064394  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17064393 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 17064294  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  17064293 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 17064261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17068151 - 17067919
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || ||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  17068151 gttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 17068052  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17068051 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 17067952  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  17067951 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 17067919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24676265 - 24676033
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || || || ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||    
T  24676265 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggccgaa 24676166  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||||||  | || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24676165 tttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcctgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 24676066  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      |||| ||| | || ||||||||||| |||||    
T  24676065 tctgaagaagatattctggtggtctggattgaa 24676033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24710810 - 24710578
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||  | |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  24710810 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 24710711  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24710710 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 24710611  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  24710610 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 24710578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27218792 - 27218563
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||  |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  27218792 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagacggaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 27218693  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27218692 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 27218593  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggttt 256  Q
      | || ||| | || ||||||||||||||    
T  27218592 tctaaagaagattttctggtggtctggttt 27218563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 21324933 - 21325165
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  || ||| ||||||||| ||| ||||| |||| || || || ||||| || ||||||||||| ||| ||||  |||    
T  21324933 gttgatgtcaagtttgtagacttgttgattgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaa 21325032  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||||||  | || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21325033 tttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacga 21325132  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || ||||||||||| |||||    
T  21325133 tttaaagaagattttctggtggtctggattgaa 21325165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23067167 - 23066935
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||  |||| |||| ||| ||||  ||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||  |||| || |    
T  23067167 gttgatgttaagtttgtagacttgttggtttctagtgatcagactgaagacggtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgcggtttcgaggtagga 23067068  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23067067 tttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacga 23066968  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| |||||||||||||||| |||||    
T  23066967 tctaaagaagttgttttggtggtctggattgaa 23066935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24263146 - 24262914
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||  | |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  24263146 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 24263047  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | |||||  |||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24263046 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagggtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 24262947  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  24262946 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 24262914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 260
Target Start/End: Original strand, 21890385 - 21890618
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||| |||| ||  |||||| ||||||||| ||| |||   ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||  |||| || |    
T  21890385 gttgatgttaagtttatggacttgttggttgctagtaatcagactgaaggaggtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtagga 21890484  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  21890485 tttgtattctagacgacgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctaggagctacgaagatgtaccacga 21890584  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
      | || ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  21890585 tctaaagaagttgttttggtggtccggattgaag 21890618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 22324523 - 22324755
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||| |||  ||||  || |||| |||||||| ||| | ||  | |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  22324523 gttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcaggctgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 22324622  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||| | || || || || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22324623 tttgtgtcccagataatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 22324722  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  22324723 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 22324755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 260
Target Start/End: Original strand, 30210582 - 30210816
Alignment:
Q  25 aggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggtt-cagaggca 123  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| |||||||  | |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| |  |    
T  30210582 aggtggatgtgaagttggtagatttcatggttggcaataatcagactgaagatagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcag-gata 30210680  T
Q  124 gaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    ||||||||||||||||  |    || ||||||| | ||||| | |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  30210681 gaatttgtattcctgatgatacagaaatgaaaaagatgattctagaagaaagtcacaaaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatca 30210780  T
Q  224 cgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
     || ||||| ||| || |||||||||| || ||||||    
T  30210781 tgatttgaagaagttg-tttggtggtccgggttgaag 30210816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 223
Target Start/End: Original strand, 22756136 - 22756328
Alignment:
Q  31 atgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttg 130  Q
    ||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || || || ||||| || ||||||||||| ||| ||||  |||||||    
T  22756136 atgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaatttg 22756235  T
Q  131 tattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    |||||||||  | || |||||||| |   | ||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22756236 tattcctgatgatgaagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcaaccgggagctacgaagatgtatca 22756328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Original strand, 23107399 - 23107593
Alignment:
Q  29 tgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatt 128  Q
    |||||| | ||||||||| ||  |||||| |||| |||| ||| |||| | |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||  | |||    
T  23107399 tgatgtaatgtttgtggacttgttggttgctagtgatcagactgaagacaatgattttaaaattgatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatt 23107498  T
Q  129 tgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |   |||||   ||||| || || |  |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23107499 tgtattcctgacaatgatgagatgaagaaaatgattcctgaagagagccatagaagtaacttgagtattaatccgggagctacgaagatgtatca 23107593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 259
Target Start/End: Original strand, 11357646 - 11357773
Alignment:
Q  132 attcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttga 231  Q
    ||||||||||  || ||| |||| | ||||||| | || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| || |||||||| |||||||    
T  11357646 attcctgacattgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgacttga 11357745  T
Q  232 aaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||    
T  11357746 agaaactgttttggtggtccggtttgaa 11357773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 45530164 - 45530054
Alignment:
Q  150 atgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggt 249  Q
    ||||||| | ||||| | |||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||    
T  45530164 atgaaaaagatgattctagaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggt 45530065  T
Q  250 ctggtttgaag 260  Q
    | || ||||||    
T  45530064 ccgggttgaag 45530054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Original strand, 24707149 - 24707345
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||| |  ||||  | |||| ||||||||| ||| ||||| |||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||  |||    
T  24707149 gttgatgtcaagtttttttatttgttagttgttagtaatcagactgaagatggtgactttaaagtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaa 24707248  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    |||||||||||||  | ||   |||||| |   || || | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  24707249 tttgtattcctgatgatgaattgatgaagaaaatggttcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggatctacgaagatgtatca 24707345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 45533122 - 45533037
Alignment:
Q  25 aggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttg 110  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||  | |||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  45533122 aggtggatgtgaagttggtagatttaatggttgggaataatcagactgaagatagtaattttaaagttgatgaccaaggagtgttg 45533037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Original strand, 12640035 - 12640126
Alignment:
Q  162 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| | | ||||||||||| ||||    
T  12640035 attttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgg 12640126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 223
Target Start/End: Original strand, 21905970 - 21906032
Alignment:
Q  161 gattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21905970 gattttggaagaaggtcacaggagtagtcttagtattcatccaggagcgacgaagatgtatca 21906032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 110
Target Start/End: Original strand, 30011847 - 30011932
Alignment:
Q  25 aggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttg 110  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||| |||  | |||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  30011847 aggtggatgtgaagttggtagatttaatgtttgggaataatcagactgaagatggtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttg 30011932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Original strand, 21680066 - 21680325
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21680066 agtatcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtg 21680165  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21680166 tgttgaagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagataaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccggg 21680265  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21680266 agctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtga 21680325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Original strand, 21890047 - 21890300
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| || ||||    
T  21890047 agtatcagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgtcgatttaatggttgctagtaatcaaactaaatatagtgacttcaaggttggtgatcagggtg 21890146  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  21890147 tgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgagtttggaagaaagccacaaaagtagctttagtattcatccggg 21890246  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  21890247 agctacaaagatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaa 21890300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22463031 - 22462778
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |  |  ||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  22463031 agtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttgctggtaatcaagcagagaatagtgatttcaaggttgataa-caaggtg 22462933  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  22462932 tgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttggaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccggg 22462833  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22462832 agctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagctgttttggtggtctggtttgaag 22462778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20774839 - 20774585
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20774839 agtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttgtgagtaatcaagccgaggagagtgatttcaaggttgatgagcaaggtg 20774740  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||  |||| | ||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||| || | |||    
T  20774739 tgttgagatttagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaggtcataagagcaacttgagtattcacctggg 20774640  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||||| || |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20774639 agctacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaag 20774585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 265
Target Start/End: Original strand, 21831070 - 21831308
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21831070 gttgatgttaagtttgtagaattgttggttgctagtaatcaaactaaagatggtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattctgaggcagaa 21831169  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| ||||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21831170 tttgtatccctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaaaagtagtttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatga 21831269  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||| ||  ||||||||||||| || |||||| ||||    
T  21831270 cttgaagaaattgttttggtggtccggattgaagcgtga 21831308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20822533 - 20822279
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| || || | |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20822533 agtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtagatttgatagtcgctagtaatcaagctgaagatggtgatttcaaagttgatgaacaaggtg 20822434  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    | ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| || ||  |||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||    
T  20822433 tattgagatttagaggcagaatttgtgttcccgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagtaatttgagtattcatccggg 20822334  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  20822333 agctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtccggattgaag 20822279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Original strand, 17268629 - 17268876
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| | |||||   | | |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  17268629 gagaagcacagcaggtggatgtcaagtttgttgatctgatggttgctggtaatggcattgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 17268728  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||| ||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17268729 attcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcacaagagtagcttgagcattcatccgggagctacg 17268828  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17268829 aagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaag 17268876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Original strand, 24619607 - 24619836
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||| | ||| | ||||| |||||||| |||||||  || |||||  ||||||||||||| |||||||    
T  24619607 gatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgacactgaggatagcgatttcaaggttgatgttcagggtgttctgaggttcagaggaagaattt 24619706  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||    
T  24619707 gtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtaccatgattt 24619806  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  24619807 gaagaaactattttggtggtccggtttgaa 24619836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Original strand, 24715838 - 24716067
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||| | ||| | ||||| |||||||| |||||||  || |||||  ||||||||||||| |||||||    
T  24715838 gatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgacactgaggatagcgatttcaaggttgatgttcagggtgttctgaggttcagaggaagaattt 24715937  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||    
T  24715938 gtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtaccatgattt 24716037  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  24716038 gaagaaactattttggtggtccggtttgaa 24716067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Original strand, 24748866 - 24749095
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||| | ||| | ||||| |||||||| |||||||  || |||||  ||||||||||||| |||||||    
T  24748866 gatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgacactgaggatagcgatttcaaggttgatgttcagggtgttctgaggttcagaggaagaattt 24748965  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||    
T  24748966 gtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtaccatgattt 24749065  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  24749066 gaagaaactattttggtggtccggtttgaa 24749095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Original strand, 28894235 - 28894484
Alignment:
Q  11 cagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttg 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||   |||||||| |  | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28894235 cagagaagcacaacaagttgatgttaagttcgtggatttgatggttgtgggtaatcaagccgaggagagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttg 28894334  T
Q  111 aggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagcta 210  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||| || ||  |||| | ||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||    
T  28894335 agatttagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaactgaagaagttgattttagaagaaggtcataagagcaacttgagtattcacccgggagcta 28894434  T
Q  211 cgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    | || |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28894435 caaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaag 28894484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Original strand, 28915706 - 28915955
Alignment:
Q  11 cagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttg 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||   |||||||| |  | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28915706 cagagaagcacaacaagttgatgttaagttcgtggatttgatggttgtgggtaatcaagccgaggagagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttg 28915805  T
Q  111 aggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagcta 210  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||| || ||  |||| | ||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||    
T  28915806 agatttagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaactgaagaagttgattttagaagaaggtcataagagcaacttgagtattcacccgggagcta 28915905  T
Q  211 cgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    | || |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28915906 caaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaag 28915955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Original strand, 28923061 - 28923310
Alignment:
Q  11 cagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttg 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||   |||||||| |  | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28923061 cagagaagcacaacaagttgatgttaagttcgtggatttgatggttgtgggtaatcaagccgaggagagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttg 28923160  T
Q  111 aggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagcta 210  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||| || ||  |||| | ||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||    
T  28923161 agatttagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaactgaagaagttgattttagaagaaggtcataagagcaacttgagtattcacccgggagcta 28923260  T
Q  211 cgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    | || |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28923261 caaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaag 28923310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 265
Target Start/End: Original strand, 22235226 - 22235467
Alignment:
Q  24 caggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggca 123  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||| || || | |||||||| || || || ||||| || | |||||||||||||||||| |    
T  22235226 caggtagatgtgaagtttgttgatttgatggttgttggtaatgaagctgaggatagtgactttaaggtcgatgatcaggatgtgttgaggttcagaggaa 22235325  T
Q  124 gaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    |||||||||||| ||| || || ||| |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||    
T  22235326 gaatttgtattcatgataatgaagagttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctgggagctacaaagatgtacca 22235425  T
Q  224 cgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22235426 tgatttgaaaaagctgttttagtggtctggtttgaagcgtga 22235467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 51 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21497108 - 21496900
Alignment:
Q  51 atggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgaga 150  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||      
T  21497108 atggttgctagtaatgaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctaataaggatgatt 21497009  T
Q  151 tgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtc 250  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||    
T  21497008 tgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacctgaagaaattgttttggtggtc 21496909  T
Q  251 tggtttgaa 259  Q
    ||| |||||    
T  21496908 tgggttgaa 21496900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 21563282 - 21563514
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| ||  || ||    
T  21563282 gttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcaacgtgtgttgagattccgacacataa 21563381  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||||||| | ||  ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  21563382 tttgtattccttataattatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatga 21563481  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||| ||  ||||||||||||| || |||||    
T  21563482 cttgaagaaattgttttggtggtccggattgaa 21563514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22135745 - 22135513
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||  || |    
T  22135745 gttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagtaatcagactgaagaaagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagaaagga 22135646  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22135645 tttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattctagaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 22135546  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  22135545 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 22135513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 24797754 - 24797938
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| |||| | ||||||| | || || |    
T  24797754 gatagtgatttcaaagttgatgatcaaggtgttttgaggttcagaggtagagtttgcattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 24797853  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  24797854 gtcacaagagtaggttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 24797938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 14886348 - 14886532
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||| | || || |    
T  14886348 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggggtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 14886447  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  14886448 gtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 14886532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 37542738 - 37542922
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |  |||||| | || || |    
T  37542738 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaacgaagagttgaagaaattgattcttgaggaga 37542837  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||| ||||    
T  37542838 gtcacaagagtaggttgagtattcacccaggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtatgaa 37542922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 41771919 - 41771687
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  41771919 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 41771820  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41771819 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 41771720  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  41771719 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 41771687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 22332196 - 22332428
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  22332196 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 22332295  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22332296 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 22332395  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  22332396 tttaaataagattttctggtggtctggtttgaa 22332428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 26738036 - 26738268
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || ||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| | ||||| || |||| |||||| ||  |||| ||||    
T  26738036 gttgatgttaagtttgtggacttgttgattgctagtaatcagactgaagatggtgattttaaaatcgatgatcatggtgcgttgagatttcgaggaagaa 26738135  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  26738136 tttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatcagggagctacgaaaatgtatcatga 26738235  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      |||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  26738236 tctgaagaagttgttttggtggtctggattgaa 26738268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 29475382 - 29475614
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  29475382 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 29475481  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29475482 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 29475581  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | |  |||||||||||||||||    
T  29475582 tttaaagaagatttcctggtggtctggtttgaa 29475614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40709857 - 40709625
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||  |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  40709857 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagacggaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 40709758  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  40709757 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacga 40709658  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  40709657 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 40709625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 14999048 - 14999280
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||  | ||| |||||||||| ||| |||| ||||    
T  14999048 gttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaagtgtgttgagattccgaggaagaa 14999147  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14999148 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 14999247  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  14999248 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 14999280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16357579 - 16357347
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || ||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  16357579 gttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 16357480  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16357479 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 16357380  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  16357379 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 16357347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19771037 - 19770805
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||| |||  ||||  || |||| |||||||| ||| | ||  | |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  19771037 gttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcaggctgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 19770938  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19770937 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 19770838  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  19770837 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 19770805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27519484 - 27519252
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || ||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  27519484 gttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 27519385  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27519384 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 27519285  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  27519284 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 27519252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27611431 - 27611199
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || ||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||| | |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  27611431 gttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgataatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 27611332  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27611331 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 27611232  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  27611231 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 27611199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 27684709 - 27684941
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||  | |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  27684709 gttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 27684808  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| |  ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27684809 tttgtatcctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 27684908  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  27684909 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 27684941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 34567571 - 34567339
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || ||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  34567571 gttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 34567472  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34567471 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 34567372  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  34567371 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 34567339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20343293 - 20343109
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| | || || |    
T  20343293 gatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggaga 20343194  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||||||||||||  |||||||    
T  20343193 gtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatataccatgatttgaagaaactgttttggtggtccagtttgaa 20343109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 23079446 - 23079630
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| || |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| | ||||| |    
T  23079446 gataatgacttcaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaagaga 23079545  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  23079546 gtcacaaaagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 23079630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Original strand, 20467409 - 20467638
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| |||||| |  ||| | | ||||| ||| |||||||||| || || || ||||| || || |||||| | ||  |||||| |||||    
T  20467409 gatgtaaagtttgtagatttatttattggtggaaatcagactgaagatagtgactttaaggtcgatgatcagggagtgttgcgatttcgaggcaaaattt 20467508  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| | | ||||| | ||||| ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  20467509 gtattcctgatgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtaacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgattt 20467608  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||| ||| || |||||||||| || |||||    
T  20467609 gaagaagttggtttggtggtcggggttgaa 20467638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18776847 - 18776615
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| ||| ||||   ||| || ||||| || || || ||||||||||| ||| ||||  | |    
T  18776847 gttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagtaatcagactgaagacgatgactttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggtcgga 18776748  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| ||||||||| | |  |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18776747 tttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacga 18776648  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || ||||||| |||||||||    
T  18776647 tttaaagaagattttctggtggtttggtttgaa 18776615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20800525 - 20800329
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||  |||    
T  20800525 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaa 20800426  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    |||||||||||||| | || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20800425 tttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacctgagtattcacccgggagctacgaagatgtatca 20800329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23441287 - 23441055
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||  | |    
T  23441287 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgga 23441188  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| |||| |||| | || |||||||| |   ||||| | || || ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23441187 tttgcattcgtgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 23441088  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || ||||||||||| |||||    
T  23441087 tttaaagaagatattctggtggtctggattgaa 23441055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25849086 - 25848902
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| | || || |    
T  25849086 gatagtgattttaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtatgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttgattcttgatgata 25848987  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  25848986 gtcataagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaa 25848902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 27667799 - 27668031
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||| |||  ||||  || |||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||    
T  27667799 gttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcaggctgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagatttcgaggaagaa 27667898  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||    
T  27667899 tttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggatctacgaagatgtatcatga 27667998  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  27667999 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 27668031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 21338606 - 21338838
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| || | | |||||| ||| | ||||| || || || ||||| ||| |||| ||||    
T  21338606 gttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaaaacaatgattttaaaatcgatgatcagggagtattgagattccgaggtagaa 21338705  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||  ||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  21338706 tttgtattctagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatga 21338805  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||    
T  21338806 tttgaagaagttgttttcgtggtctgggttgaa 21338838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25424240 - 25424034
Alignment:
Q  52 tggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagat 151  Q
    |||||| |||| |||| |||  |||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  25424240 tggttgctagtgatcagactggagatagtgattttaaaatcgatgatcaacgtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagat 25424141  T
Q  152 gaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtct 251  Q
    ||| |   ||||| | ||||| ||||| |  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | || ||| ||||||||||||||    
T  25424140 gaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaa-ttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtct 25424042  T
Q  252 ggtttgaa 259  Q
    || |||||    
T  25424041 ggattgaa 25424034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22349409 - 22349268
Alignment:
Q  118 gaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagat 217  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22349409 gaggaagaatttgtattctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacgggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagat 22349310  T
Q  218 gtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||| || || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  22349309 gtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 22349268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23517603 - 23517407
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| ||  ||||| |||| || || || ||||| || ||||||||||| ||| ||||  |||    
T  23517603 gttgatgtcaagtttgtagacttattggttgctagtaatcagacagaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaa 23517504  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    ||||||||||| |  | || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  23517503 tttgtattcctaaagatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctatgaagatgtatca 23517407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23472215 - 23472074
Alignment:
Q  118 gaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| | | | |  |||||||| ||||| |||||||||||||  | |||    
T  23472215 gaggcagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagatttatagaagtagcttaagtattcatccgggagctagaacgat 23472116  T
Q  218 gtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  23472115 gtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 23472074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23574805 - 23574582
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| | | | ||| ||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  23574805 ttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagattgaggatggtgattttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggccgaat 23574706  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    |||||||||||   | |||  || ||||| ||| |||   ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||     
T  23574705 ttgtattcctg---atgat--gaagaaaatgtttatt---gaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgat 23574614  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  23574613 ctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 23574582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 37290805 - 37291037
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||   |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||  | |||| ||||||||| ||| |||| ||||    
T  37290805 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctaaagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaagctgtgttgagattccgaggaagaa 37290904  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||  || ||||| |  | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  37290905 tttgtatcccagacattgaagagattaggaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagccacgaagatgtatcatga 37291004  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     ||||| ||| | || ||||||||| |||||||    
T  37291005 tttgaagaagattttctggtggtctagtttgaa 37291037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22503685 - 22503506
Alignment:
Q  80 tgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcac 179  Q
    |||||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| | || || |||||     
T  22503685 tgattttaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtatgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttgattcttgaggagagtcat 22503586  T
Q  180 aagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| || || ||||| || || |||| |||||| ||||||||    
T  22503585 aagagtaggttgagtattcagcccggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttagtggtccggtttgaa 22503506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21882026 - 21881830
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||||||||||||  | ||  |||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || || || ||||| || ||||||||||| ||| ||||  | |    
T  21882026 gttgatgtcaagtttgtatacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaatgtcgatgaccatggtgtgttgagtttccgaggtcgta 21881927  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    |||||||||||||  | |  |||||||| |   ||||| | ||| | ||||| |  |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  21881926 tttgtattcctgattatgtagagatgaagaaaatgattcttgaatagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgagagctacgaagatgtatca 21881830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27012008 - 27011917
Alignment:
Q  162 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    |||||||| ||| |||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||    
T  27012008 attttggacgaaggtcatagaagtagttttagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggtctgg 27011917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24582134 - 24582048
Alignment:
Q  162 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtgg 248  Q
    |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | |||||||||||    
T  24582134 attttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtgg 24582048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Original strand, 13971470 - 13971713
Alignment:
Q  22 aacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagagg 121  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13971470 aacaggttgatgtcgagtttgtggatttaatagttaatagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagagg 13971569  T
Q  122 cagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtat 221  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13971570 cagaatttgcattcccgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtat 13971669  T
Q  222 cacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13971670 cacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtga 13971713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14087468 - 14087209
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14087468 agtatcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtg 14087369  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14087368 tgttgaagttcagaggcagaatttgcattccagacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccggg 14087269  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14087268 agctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtga 14087209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 260
Target Start/End: Original strand, 10419379 - 10419633
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10419379 agtatcagagaagcacaacgagttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaagctgaggatggtgatttcaaagttgatgaacaaggtg 10419478  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    | ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| || ||  |||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||    
T  10419479 tattgagatttagaggcagaatttgtgttcccgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagtaatttgagtattcatccagg 10419578  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||    
T  10419579 agctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctagattgaag 10419633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14574711 - 14574465
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  14574711 gagaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtagtgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcatggtgtgttgag 14574612  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  14574611 gttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattctagaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctaca 14574512  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  14574511 aagatgtatcacgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaa 14574465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 249
Target Start/End: Original strand, 16380269 - 16380505
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| || |||  | |||||   ||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  16380269 gagaagcacaacaggtggatgtcaagttggttgatttgattgttactggtaatggcactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 16380368  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16380369 attcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacg 16380468  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggt 249  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  16380469 aagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggt 16380505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15228425 - 15228191
Alignment:
Q  25 aggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcag 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||  ||    
T  15228425 aggttgatgttaagtttgtggatttgttggtggctagtaaccaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgagtaag 15228326  T
Q  125 aatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcac 224  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||     
T  15228325 aatttctattcctgataatgatgagttgaaaacgttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctataaagatgtatcat 15228226  T
Q  225 gacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  15228225 gacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaa 15228191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17493418 - 17493166
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||| | | ||| |||||||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  17493418 gagaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtagtgacactgaagatagtgacttaaaggttgatgatcagggtgtgttgag 17493319  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||    
T  17493318 gtttagaggaagaatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcattctggagctacg 17493219  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17493218 aaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 17493166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 265
Target Start/End: Original strand, 13319854 - 13320095
Alignment:
Q  24 caggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggca 123  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||| | || || ||||| |  ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  13319854 caggtagatgtaaaatttgttgatttaatgattgctggttatgaaactgagaatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaa 13319953  T
Q  124 gaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    ||||||||||||||||  | ||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  13319954 gaatttgtattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagattgagtattcacccgggagctacgaaaatgtacca 13320053  T
Q  224 cgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13320054 tgatttgaagaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtga 13320095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Original strand, 16827537 - 16827790
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  16827537 agtatcagagaagcacatcaagttgatgtcaagtttgttgatttgatggttgctagtaatgaaactgaagataatgacttcaaggttgatgatcaaggtg 16827636  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||||  |||||| ||||||||| || ||||  ||||| |||||||| ||||| |||| |||    
T  16827637 tgttgaggttcagaggaaaaatttgtattcatgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaacccacaaaagtagcttaagtattcatcaggg 16827736  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||| || |||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  16827737 agctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaa 16827790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Original strand, 18133704 - 18133939
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||| ||| | ||||| ||||| | |||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||     
T  18133704 gatgtgaagtttgttcatttgatgattgttggtaatgaaactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttaaggttcagaggaagaatta 18133803  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    |||||||||| || || ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||    
T  18133804 gtattcctgataatgacgagttgaaaaagttaattttggaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgattt 18133903  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18133904 gaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 18133939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 16835851 - 16836103
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||| || ||| | || |||| | |||||   ||| |||||||||| |||||||||||||| || || || || ||    
T  16835851 gagaagcacagcaggtggatgtcaagttggttgatctgattgttgctggtaatggcactgaagatagtgacttcaaagttgatgatcagggagtattaag 16835950  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    |||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16835951 attcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaatcaaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcccggagctacg 16836050  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16836051 aagatgtatcatgagttgaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagcgtga 16836103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4679166 - 4678979
Alignment:
Q  73 aagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaaga 172  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||| ||| ||  | || ||    
T  4679166 aagatagtgacttcaaggttgatgaacagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagagga 4679067  T
Q  173 aagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4679066 aagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaag 4678979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41178250 - 41178063
Alignment:
Q  73 aagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaaga 172  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||| ||||||  | || ||    
T  41178250 aagatagtgacttcaaggttgatgaacagggtgtgttgagaatcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttgatcctagagga 41178151  T
Q  173 aagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41178150 aagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaag 41178063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31939691 - 31939445
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||||| | |||||   ||| | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  31939691 gagaagcacagcaagtggatgtgaagtttgttgacttaatggttgctggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 31939592  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||  | || ||  |||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  31939591 attcagaggaagaatttgcattcctgatgatgacgaattgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagggtagcttgagtattcatccgggagctaca 31939492  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31939491 aagatgtattatgatctgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaa 31939445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15248886 - 15248679
Alignment:
Q  52 tggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagat 151  Q
    |||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| || || |||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15248886 tggttgctaggaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcagggagtgttgcgttttcgaggcagaatttgtattcctgacgacgatgagat 15248787  T
Q  152 gaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtct 251  Q
    ||| | | ||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||    
T  15248786 gaagaagatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtct 15248687  T
Q  252 ggtttgaa 259  Q
    || |||||    
T  15248686 gggttgaa 15248679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 31694527 - 31694773
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||||| | |||||   ||| | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  31694527 gagaagcacagcaagtggatgtgaagtttgttgacttaatggttgctggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 31694626  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||  | || ||  |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  31694627 attcagaggaagaatttgcattcctgatgatgacgaattgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctaca 31694726  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||| | ||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31694727 aagatgtattatgatctgaagaagttgttttggtggtccggtttgaa 31694773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Original strand, 8758486 - 8758670
Alignment:
Q  76 atagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaag 175  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||| ||| ||  | || |||||    
T  8758486 atagtgacttcaaggttgatgaacagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaag 8758585  T
Q  176 tcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  8758586 tcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaag 8758670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 11303114 - 11303366
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| | || || ||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||   ||| | |||||||| || || |||||||| || |||||||| ||    
T  11303114 gagaagcacagcaagtagatgttaagtttgttgatttgatggttaatggtaatggcactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttaag 11303213  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||  | |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11303214 gttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttcaaaaggttgagtttagaggaaaggcacaagagtagcttgagtattcatctgggagctacg 11303313  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  11303314 aaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccgggttgaaatgtga 11303366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 44777975 - 44777788
Alignment:
Q  73 aagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaaga 172  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| || |||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||| ||| ||  | || ||    
T  44777975 aagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgctaagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagagga 44777876  T
Q  173 aagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44777875 aagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaag 44777788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13942810 - 13942565
Alignment:
Q  15 gaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggt 114  Q
    |||||| |||| || ||||||||| | || ||| ||||||||| | |||||   | | |||||||||| ||| | |||||||| || |||||| | || |    
T  13942810 gaagcacaacaagtggatgtcaagctggttgatctaatggttgctggtaatggcattgaagatagtgacttccaggttgatgatcagggtgtgctaagat 13942711  T
Q  115 tcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaa 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||| ||| ||  | || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  13942710 tcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaa 13942611  T
Q  215 gatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13942610 gatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaag 13942565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Original strand, 13299873 - 13300064
Alignment:
Q  23 acaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggc 122  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||| | || || ||||| |  ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  13299873 acaggtagatgtaaaatttgttgatttaatgattgctggttatgaaactgagaatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagagga 13299972  T
Q  123 agaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaa 214  Q
    |||||||||||||||||  | ||||   |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13299973 agaatttgtattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctacgaa 13300064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Original strand, 13310531 - 13310722
Alignment:
Q  23 acaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggc 122  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||| | || || ||||| |  ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  13310531 acaggtagatgtaaaatttgttgatttaatgattgctggttatgaaactgagaatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagagga 13310630  T
Q  123 agaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaa 214  Q
    |||||||||||||||||  | ||||   |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13310631 agaatttgtattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctacgaa 13310722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 12359868 - 12360135
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||   ||| | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  12359868 gagaagcacaacaagtagatgtgaagtttgttgatttaatggttgttggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 12359967  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatg---------------agatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatc 197  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||  | ||||               |  |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  12359968 attcagaggaagaatttgcattcctgatgatgatgttcctgatgatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtatt 12360067  T
Q  198 catccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12360068 catccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 12360135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10906974 - 10906742
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  10906974 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaattgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 10906875  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10906874 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 10906775  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  10906774 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 10906742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 47124670 - 47124486
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| |||| | ||||||| | || || |    
T  47124670 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggtagagtttgcattcctgacaatgaggagttgaagaagttgattcttgaggaga 47124571  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  47124570 gtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaa 47124486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 15234293 - 15234128
Alignment:
Q  25 aggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcag 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||  ||    
T  15234293 aggttgatgttaagtttgtggatttgttggtggctagtaaccaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgagtaag 15234194  T
Q  125 aatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagctt 190  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  15234193 aatttctattcctgataatgatgagttgaaaacgttgattttagaagaaagtcacagaagtagctt 15234128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 5424296 - 5424528
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  5424296 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 5424395  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5424396 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 5424495  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  5424496 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 5424528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 26791765 - 26791997
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  26791765 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 26791864  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26791865 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 26791964  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  26791965 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 26791997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28755044 - 28754860
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||| | || || |    
T  28755044 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 28754945  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  28754944 gtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 28754860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15209630 - 15209423
Alignment:
Q  52 tggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagat 151  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| || || |||||| | ||  |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  15209630 tggttgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcatggagtgttgcgttttcgaggcagaatttgttttcttgacgacgatgagat 15209531  T
Q  152 gaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtct 251  Q
    ||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||    
T  15209530 gaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggtgctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtct 15209431  T
Q  252 ggtttgaa 259  Q
    || |||||    
T  15209430 gggttgaa 15209423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10006364 - 10006132
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  10006364 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 10006265  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||| | || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10006264 tttgtatcccagacgatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 10006165  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  10006164 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 10006132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10384694 - 10384510
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||| | || || |    
T  10384694 gatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 10384595  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  10384594 gtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaa 10384510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 16411648 - 16411880
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||| | ||||||||||| ||  |||||| |||  ||||  || |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  16411648 gttgatttaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagtctgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 16411747  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16411748 tttgtattccagacaatgaagaggttaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacga 16411847  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  16411848 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 16411880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 48426211 - 48425979
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  48426211 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 48426112  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48426111 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 48426012  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  48426011 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 48425979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Original strand, 14580308 - 14580530
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||  |||| ||||    
T  14580308 gttgatgtcaagtttgtggatttgttggttactagtaatcagattgaagatagtgatttcaagatcgatgatcaaggtgtattaaggtttcgaggtagaa 14580407  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||| | || ||||| || | | ||||| | || || |||||||  |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||    
T  14580408 tttgtattccagacgatgaagagattaagaagatgattcttgaggagagtcacagaagtagcttgagtattcacccaggagctacgaaaatgtatcatga 14580507  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggt 249  Q
     ||||| ||| ||||||||||||    
T  14580508 tttgaagaagttgttttggtggt 14580530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13253454 - 13253222
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || ||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  13253454 gttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 13253355  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  13253354 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 13253255  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  13253254 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 13253222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15340033 - 15339801
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| | |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  15340033 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacaatgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 15339934  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  15339933 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 15339834  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  15339833 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 15339801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 15401883 - 15402115
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  15401883 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaattgatgatcaaggtgtgttgagattccaaggaagaa 15401982  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  15401983 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 15402082  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||  | || |||||||||||||||||    
T  15402083 tttaaagaatattttctggtggtctggtttgaa 15402115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 15588758 - 15588990
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  15588758 gttgatgtaaagtttgtagacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 15588857  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15588858 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 15588957  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  15588958 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 15588990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 15724300 - 15724532
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||| |||||||||| || ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  15724300 gttgatttcaagtttgtagacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 15724399  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15724400 tctgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 15724499  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  15724500 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 15724532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16636537 - 16636305
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || ||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  16636537 gttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 16636438  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16636437 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 16636338  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  16636337 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 16636305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 20061420 - 20061652
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  20061420 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 20061519  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | || || ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20061520 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 20061619  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  20061620 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 20061652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 43163861 - 43163629
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || ||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  43163861 gttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 43163762  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43163761 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 43163662  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  43163661 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 43163629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 259
Target Start/End: Original strand, 53384386 - 53384616
Alignment:
Q  29 tgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatt 128  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||  ||||  || |||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||    
T  53384386 tgatgtgaagtttgtggatttgttggttgctagagatcaggctgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgagggagaatt 53384485  T
Q  129 tgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgact 228  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||      
T  53384486 tgtattccagacgacgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatc 53384585  T
Q  229 tgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  53384586 taaagaagattttctggtggtctggtttgaa 53384616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 15347611 - 15347843
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||  | |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  15347611 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 15347710  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15347711 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatga 15347810  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  15347811 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 15347843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17490614 - 17490382
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||| |||| ||| |||| | |||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| || |    
T  17490614 gttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcagactgaagacaatgattttaaaatcgttgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtagga 17490515  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17490514 tttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 17490415  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  17490414 tctaaagaagttgttttggtggtccggattgaa 17490382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 259
Target Start/End: Original strand, 16329066 - 16329247
Alignment:
Q  78 agtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtc 177  Q
    |||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| | || || ||||    
T  16329066 agtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 16329165  T
Q  178 acaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||  |||| |||||||| || ||  |||| ||  | ||||||||||| ||||||||    
T  16329166 acaagagtaggttgagtattcacccggggtctacaaagatgtaccatgatctgaagaaattattttggtggtccggtttgaa 16329247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 11960572 - 11960756
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| | ||||| |    
T  11960572 gatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagattttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaagaga 11960671  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||| | ||||| |||||||| || || || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  11960672 gtcacgatagtagtttgagtattcacccaggggctataaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 11960756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 16337916 - 16338099
Alignment:
Q  76 atagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaag 175  Q
    ||||||| || || |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| | || || ||    
T  16337916 atagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagag 16338015  T
Q  176 tcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||| |||||||| |||||||| || | ||| ||||| |||||||| || ||  |||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  16338016 tcataagagtaggttgagtattcacctgggggctacaaagatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 16338099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6601500 - 6601268
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||  ||||  || |||| |||||||| ||| | |||||  |||| |||||||| ||| |||| ||||    
T  6601500 gttgatgtaaagtttgtggatttgctggttgccagagatcaggctgaagacagtgattttaaaatcgatgatgaaggcgtgttgagattccgagggagaa 6601401  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  6601400 tttgcattcccgacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 6601301  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | |||||||||||| |||||||    
T  6601300 tctaaagaagattttttggtggtctagtttgaa 6601268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 259
Target Start/End: Original strand, 16755953 - 16756183
Alignment:
Q  29 tgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatt 128  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||  ||  |||| ||| |||| |  ||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||    
T  16755953 tgatgtaaagtttgtggatttgttggttgccagagatcagactgaagacatcgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgagggagaatt 16756052  T
Q  129 tgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgact 228  Q
    || ||||| ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||      
T  16756053 tgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatc 16756152  T
Q  229 tgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    | |||||| | || ||| |||||||||||||    
T  16756153 taaaaaagattttctgggggtctggtttgaa 16756183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16692853 - 16692695
Alignment:
Q  102 ggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatc 201  Q
    ||||||||||| ||| ||||  | ||||| ||||||||| | |  ||||||||||   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  16692853 ggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaaaaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatc 16692754  T
Q  202 cgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||| || ||| | || ||||||||||||||||||    
T  16692753 cgagagctacgaagatgtatcaggacttaaagaagattttctggtggtctggtttgaag 16692695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16372176 - 16371980
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||||||||||||  | ||  |||||| ||||||||| ||| ||||| |||  || || || ||||| || ||||||||||| ||| ||| | |||    
T  16372176 gttgatgtcaagtttgtatacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtggctttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgagcccgaa 16372077  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    |||||||||||||  |  | |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16372076 tttgtattcctgatgataaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatca 16371980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12499011 - 12498816
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||| | ||| ||| | |||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||  | ||    
T  12499011 ttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaattagactgaagttggtgactttaaagtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcggat 12498912  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    ||| ||||||||| | || |||||||| |   ||||| | || || ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12498911 ttgcattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatca 12498816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Original strand, 16491549 - 16491743
Alignment:
Q  29 tgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatt 128  Q
    |||||| |||||||||||  |  |||||| |||| |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||  |||||||| ||||||||  ||||  | |||    
T  16491549 tgatgttaagtttgtggacctgttggttgctagtgatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatggtcaaggtgtattgaggttttgaggtcggatt 16491648  T
Q  129 tgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| | | ||||| | |||||    || || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16491649 tgtattcccgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagtaccataaaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatca 16491743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 14125960 - 14126192
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || ||||| ||| | || ||||||||||| ||| ||||  | |    
T  14125960 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagtcgattatcatggtgtgttgagattccgaggttgta 14126059  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| |||||| || | |  |||||||  |   ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  14126060 tttgcattccttacgatgtagagatgatgaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagcattcaaccgggagctacgaagatgtatcaaga 14126159  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || ||||||||||| |||||    
T  14126160 tttaaagaagattttctggtggtctggattgaa 14126192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 14875865 - 14876096
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||| |||||||||| || ||  ||||||  |||||||| ||| ||||| |||| || || || ||||| || ||||||||||| ||| ||||  |||    
T  14875865 gttgatatcaagtttgtagacttgttggttgcaagtaatcagactgaagatggtgactt-aaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggttgaa 14875963  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||||||  | || |||||||| |   ||||| | ||| | ||| | |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  14875964 tttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaaaagagttatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 14876063  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      |||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  14876064 tctgaagaaaattttctggtggtctggtttgaa 14876096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 16806292 - 16806524
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||  |||  || ||||| || || || ||||||||||| ||| |||   | |    
T  16806292 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgtctttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgagatcgga 16806391  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| ||||||||| |    |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16806392 tttgcattcctgacgatccagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctaggagctacgaagatgtatcacga 16806491  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  16806492 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 16806524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 249
Target Start/End: Original strand, 15015168 - 15015344
Alignment:
Q  73 aagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaaga 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||  |    |||||||||||||||||  |    || ||||| | | ||||| |||||||    
T  15015168 aagatagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcggaatagaatttgtattcctgatgatacagaaatgaagaagatgattatggaaga 15015267  T
Q  173 aagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggt 249  Q
    || |||||  ||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||| | ||||||||||    
T  15015268 aattcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttattttggtggt 15015344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15062433 - 15062312
Alignment:
Q  102 ggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatc 201  Q
    ||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| |||  | || | |||||| |   ||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||| || |    
T  15062433 ggtgtgttgagattccgaggccaaatttgtattcatgatgatgaagggatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcacc 15062334  T
Q  202 cgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15062333 cgggagctacgaagatgtatca 15062312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9523327 - 9523259
Alignment:
Q  183 agtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtct 251  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  | || ||| ||||||||||||||    
T  9523327 agtaacttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtct 9523259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16257784 - 16257692
Alignment:
Q  161 gattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    ||||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  16257784 gattttggacgaaggtcatataagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaaaaggttgttttggtggcctgg 16257692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Original strand, 8273900 - 8273991
Alignment:
Q  162 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  8273900 attttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgg 8273991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Original strand, 13966841 - 13966932
Alignment:
Q  162 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  13966841 attttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgg 13966932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30138445 - 30138354
Alignment:
Q  162 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  30138445 attttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgg 30138354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30147996 - 30147905
Alignment:
Q  162 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  30147996 attttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgg 30147905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 248
Target Start/End: Original strand, 16742204 - 16742290
Alignment:
Q  162 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtgg 248  Q
    |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | |||||||||||    
T  16742204 attttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaaaaggttgttttggtgg 16742290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 253
Target Start/End: Original strand, 6711909 - 6712001
Alignment:
Q  161 gattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||  || | || ||||||||||| || ||||| | | ||||||||||| ||||    
T  6711909 gattttggaagaaggtcacaggagtagtctgagtattcatccaagaacaactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgg 6712001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Original strand, 49623 - 49882
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49623 agtatcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatgaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtg 49722  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49723 tgttgaagttcagatgcagaatttgcattcctgataacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccggg 49822  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  49823 agctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtga 49882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9650 - 9418
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||| |||  ||| |||| | |||||| ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||    
T  9650 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcggactgaagacaatgatttgaaaatcgatgatcaaggtgtggtgagattccgaggaagaa 9551  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9550 tttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatga 9451  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  9450 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 9418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 733 - 966
Alignment:
Q  14 agaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgagg 113  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||    
T  733 agaagcacaaaaagttgatgtcaagtttgtggccttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcatggtgtattgagg 832  T
Q  114 ttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacga 213  Q
    ||  |||| |||||||||||||  ||| | || ||||| || | | ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  833 tttcgaggtagaatttgtattctagacgatgaagagataaagaagatgattctggaagagagtcacaaaagtagcttgagtattcatccgggagctacaa 932  T
Q  214 agatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtg 247  Q
    | |||||||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  933 aaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtg 966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16112 - 15880
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||  ||| |||| | |||||| ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||    
T  16112 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcggactgaagacaatgattttaaaatcgatgatcaaggtgtggtgagattccgaggaagaa 16013  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| |||||  | ||||| || | | ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16012 tttgtattccagacaataaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatga 15913  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  15912 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 15880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 44327 - 44098
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||   ||||| |||| | || ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||  ||||    
T  44327 gttgatgtcaagtttgtggactt---ggttgctagtgaccagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagagagaa 44231  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||| | ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  44230 tttgtattacagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcactcgggagctacgaagatgtatcacga 44131  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     ||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  44130 tttgaagaagattttctggtggtctggtttgaa 44098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 113756 - 113497
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| || ||||    
T  113756 agtatcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagcttgtggatttaatggttaatagtaatcaaactgaagatagtgattgcaaggttgatgaacacggtg 113657  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  113656 tgttgagattcggaggcagaatttgtattcttgacaacgatgagatgaaaaggctgattttggaagaaagtcacaagaatagcttgagtatccatccggg 113557  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  113556 agctacgaagatgtatcacgacttgaagaagctattttggtggtctagtttgaagcgtga 113497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Original strand, 95116 - 95365
Alignment:
Q  11 cagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttg 110  Q
    |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  95116 cagagaagcacaacaagttgacatcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaagctgaagatggtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtattg 95215  T
Q  111 aggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagcta 210  Q
    || || ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||  | || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  95216 agatttagaggtagaatttgtgttcccgacaatgaagaattaaagaagttaattttagaagaaagtcataagagcaatttgagtattcatccgggagcta 95315  T
Q  211 cgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  95316 cgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaag 95365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 108941 - 109173
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  108941 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 109040  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  109041 tttatattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 109140  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  109141 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 109173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20046 - 19792
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20046 agtatcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttaatggtaatcaagctgaagatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtg 19947  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19946 tgttgaggttcagaggcagaatttgcattcctgacaatgatgagatgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcattcggg 19847  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19846 agctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtccggtttgaag 19792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24208 - 23954
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24208 agtatcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatgttttattgtaatcaatctgaagatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtg 24109  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24108 tgttgaggttcagaggcagaatttgcattcctgacaatgatgagatgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcattcggg 24009  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24008 agctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtccggtttgaag 23954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 251
Target Start/End: Original strand, 48148 - 48388
Alignment:
Q  11 cagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttg 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  48148 cagagaagcacagcaagttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaactgaagatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttg 48247  T
Q  111 aggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagcta 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| ||||  |||||||    
T  48248 aggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagccataggagtagcttaagtattcatctaggagcta 48347  T
Q  211 cgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtct 251  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  48348 caaagatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtct 48388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 56963 - 57215
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||  |||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||   | | |||||||||| ||||| |||||||| || || || |||||    
T  56963 gagaagcgcaacaagtggatgtgaagtttgttgatttgatggttgttggtaatggcattgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgag 57062  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||  | ||     |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  57063 gttcaggggaagaatttgcattcctgatgatgacagtttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacg 57162  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||| || || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  57163 aagatgtaccatgatttaaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagcgtga 57215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1080 - 826
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| || |  ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  1080 agtatcagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgtggattttatggttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgaacaaggtg 981  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  980 tgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccggg 881  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  880 agctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaag 826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 73 - 265
Target Start/End: Original strand, 2506 - 2698
Alignment:
Q  73 aagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaaga 172  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  2506 aagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtatccctgacaatgatgggttgaaaaagttgattttggaaga 2605  T
Q  173 aagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  2606 aagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttcgtggtccggtttgaagcgtga 2698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1066 - 813
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| || ||||    
T  1066 agtatcagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatgaaactgaagatggtgatttcaaggttgatgatcagggtg 967  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| ||    
T  966 tgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataacaatgatttgaaaaagttgattttggtagaaagccacagaagtagcttaagtattcatccagg 867  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||| |||||    
T  866 agctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtttgggttgaa 813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 48301 - 48096
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||    
T  48301 agtatcagagaagcacatcaggttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaactgaagatggtgatttcaaggttgatgatgaaggtg 48202  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  48201 tgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattctggaagaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccggg 48102  T
Q  206 agctac 211  Q
    ||||||    
T  48101 agctac 48096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 55)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21841649 - 21841396
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||||| || ||||    
T  21841649 agtatcagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgctagtaattaaactgaagagggtgatttcaaggttgatgatcagggtg 21841550  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||    
T  21841549 tgttgaggttcagaggaaggatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccagg 21841450  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  21841449 agctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaa 21841396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1267463 - 1267217
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| | || || ||||||||| | || ||||| ||||||| | ||||| | ||| | |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  1267463 gagaagcacatcaagtggatgtcaagctggttgatttgatggttgctggtaatgacactgaggatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 1267364  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  1267363 attcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccaggagctaca 1267264  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1267263 aagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaa 1267217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19852621 - 19852390
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  19852621 ttgatgtcaagtttgtggatttaatgattgctagtattcaaactgaagatggtgatttcaaggatgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaat 19852522  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    ||| |||||||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  19852521 ttgcattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgac 19852422  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  19852421 ttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaa 19852390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19858657 - 19858426
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  19858657 ttgatgtcaagtttgtggatttaatgattgctagtattcaaactgaagatggtgatttcaaggatgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaat 19858558  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    ||| |||||||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  19858557 ttgcattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgac 19858458  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  19858457 ttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaa 19858426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23656152 - 23655906
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| ||||| | |||||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  23656152 gagaagcacaacaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgag 23656053  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  23656052 gttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggaagaaggtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctaca 23655953  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23655952 aagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaa 23655906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 265
Target Start/End: Original strand, 20975206 - 20975459
Alignment:
Q  12 agagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttga 111  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||   ||| | |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  20975206 agagaagcaaaacaagtggatgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttga 20975305  T
Q  112 ggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctac 211  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||   |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20975306 ggttcagaggaagaatttgcattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatacgggagctac 20975405  T
Q  212 gaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20975406 gaaaatgtatcatgatttgaggaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 20975459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 265
Target Start/End: Original strand, 31416053 - 31416282
Alignment:
Q  36 aagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattc 135  Q
    |||||||| ||||||||| ||  | ||||| | ||| | |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31416053 aagtttgttgatttaatgattactggtaatgacactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggcgtattgagattcagaggaagaatttgtattc 31416152  T
Q  136 ctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaa 235  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||    
T  31416153 ctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaa 31416252  T
Q  236 gctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31416253 gctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 31416282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Original strand, 20985096 - 20985347
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| |  | ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||| || ||||    
T  20985096 agtatcagagaagcacagaaagttgatgtcaagtttgttgatttaatagttactagtaatgaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtg 20985195  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| || ||| |    
T  20985196 tgttgaggtttagaggaagaatttgtattcctaaaaatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaagtatcttaagtattcacccgag 20985295  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttg 257  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  20985296 agctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctggtttg 20985347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20389312 - 20389072
Alignment:
Q  25 aggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcag 124  Q
    |||||||| | |||||||| || ||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  20389312 aggttgatattaagtttgtcgacttgttggttgctagtattcaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggcag 20389213  T
Q  125 aatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcac 224  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  20389212 aatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacatacgtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcat 20389113  T
Q  225 gacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||| ||  |||||| |||||| || |||||| ||||    
T  20389112 gacttgaagaaattgttttagtggtccggattgaagcgtga 20389072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 250
Target Start/End: Original strand, 20009491 - 20009713
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20009491 ttgatgtcaagcttgtggatttaatggttactagtaatcgaactgaagagggtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaggttcagaggaagaat 20009590  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    |||||||| ||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||     
T  20009591 ttgtattcttgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaatatgtatcatgat 20009690  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtc 250  Q
    ||||| ||  | |||||||||||    
T  20009691 ttgaagaaattattttggtggtc 20009713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22052088 - 22051836
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| | || || ||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||   ||  | |||||||| ||||| |||||||| || || || |||||    
T  22052088 gagaagcacagcaagtggatgtcaagctggttgatttaatgattgctagtaatggcacggaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgag 22051989  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22051988 attcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtaggttgagtattcatccgggagctacg 22051889  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22051888 aagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 22051836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 260
Target Start/End: Original strand, 31570458 - 31570645
Alignment:
Q  73 aagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaaga 172  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||| ||| ||  | || ||    
T  31570458 aagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagagga 31570557  T
Q  173 aagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31570558 aagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaag 31570645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 803291 - 803475
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||| | || || |    
T  803291 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattctagaggaga 803390  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  803391 gtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaa 803475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18857788 - 18857556
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||  ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| || |    
T  18857788 gttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagtaatcggactgaagaaagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagga 18857689  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18857688 tttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattctagaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 18857589  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  18857588 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 18857556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Original strand, 22247988 - 22248219
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  || ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| || || |||||||| |||  |||||||||    
T  22247988 ttgatgttaagtttgtggacttgttgattgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcagggagtgttgagattccaaggcagaat 22248087  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  22248088 ttgtattcctgacattgacgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgtgtattcatccgggagctacgaggatgtatcatgat 22248187  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  22248188 ttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 22248219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22988406 - 22988175
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  || ||  ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  22988406 ttgatgttaagtttgtggaattgttgatttctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgaggcagaat 22988307  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    || ||||||| || | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  22988306 ttctattccttacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgat 22988207  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     |||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  22988206 ctgaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 22988175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 19483634 - 19483866
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||||| ||| |||| || |    
T  19483634 gttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaagatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagga 19483733  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  19483734 tttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 19483833  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     ||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  19483834 tttgaagaagattttctggtggtctggtttgaa 19483866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22372140 - 22371928
Alignment:
Q  38 gtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcct 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |  |||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||    
T  22372140 gtttgtggatttaatggttgctagtaatcaaaccgaaaagggtgatttcaaggttgatgatctgtgtgtgttgaggttcagaggaagaatattcattcct 22372041  T
Q  138 gacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagc 237  Q
    || |  |||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||  |||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||      
T  22372040 gatagtgatgagttgaaaaagttgattatagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcacctgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaat 22371941  T
Q  238 tgttttggtggtc 250  Q
    | |||||||||||    
T  22371940 tattttggtggtc 22371928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Original strand, 22377025 - 22377256
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    ||||||| ||||||||| | ||  |||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| |  || |||||||| ||| ||||||||||    
T  22377025 ttgatgttaagtttgtgcacttgttggtttctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatctgggagtgttgagattctgaggcagaat 22377124  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    |||||||||| || | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  22377125 ttgtattcctaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaaatagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgat 22377224  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  22377225 ttgaagaagttgttttggtggtctggattgaa 22377256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Original strand, 22383200 - 22383431
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    ||||||| ||||||||| | ||  |||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| |  || |||||||| ||| ||||||||||    
T  22383200 ttgatgttaagtttgtgcacttgttggtttctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcggggagtgttgagattctgaggcagaat 22383299  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    |||||||||| || | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  22383300 ttgtattcctaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaaatagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgat 22383399  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  22383400 ttgaagaagttgttttggtggtctggattgaa 22383431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23950052 - 23949898
Alignment:
Q  105 gtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgg 204  Q
    |||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |  |||| | ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  23950052 gtgttgcgattccgaggcagaaattgtattcctgacaatgatgagatgaagaagacgattcttgaagagagtcacataagtagcttgagtattcatccgg 23949953  T
Q  205 gagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  23949952 gagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 23949898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14566305 - 14566121
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||| | || || |    
T  14566305 gatagtgattttaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 14566206  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  14566205 gtcacaaaagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 14566121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27355695 - 27355527
Alignment:
Q  90 gttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagct 189  Q
    |||||||| || |||||  |||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| | ||||| |||||||||||||| |    
T  27355695 gttgatgatcagggtgtactgagattcagagggagagtttgtattcctgacagcgatgagttgaag-ggttgattcttgaagatagtcacaagagtagat 27355597  T
Q  190 tgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  27355596 tgagtatacacccgggggctacaaagatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 27355527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6604821 - 6604637
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| | || || |    
T  6604821 gatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcaggggtagagtctgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggaga 6604722  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||| |||||| || |||||||| || ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  6604721 gtcacaagagtaggttgagtattcacccggaagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaa 6604637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6680274 - 6680090
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| | || || |    
T  6680274 gatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcaggggtagagtctgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggaga 6680175  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||| |||||| || |||||||| || ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  6680174 gtcacaagagtaggttgagtattcacccggaagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaa 6680090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 259
Target Start/End: Original strand, 16270846 - 16271026
Alignment:
Q  79 gtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtca 178  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| | || || |||||    
T  16270846 gtgattttaaggttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggaagagtatgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtca 16270945  T
Q  179 caagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16270946 caagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaa 16271026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19113901 - 19113669
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || ||| |||  |||| |||||||| |||||||| ||| | ||| | |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  19113901 gttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactaaagacagtgattttaaaatcgataatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 19113802  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19113801 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 19113702  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  19113701 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 19113669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 22128528 - 22128760
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  22128528 gttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 22128627  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || || || || | | ||||| | ||||| ||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22128628 tttgtatcccagacaatgaagatattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagtttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 22128727  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  22128728 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 22128760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23651252 - 23651020
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||  | ||||| ||| |||||||||||||  |||| || |    
T  23651252 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactaaagacagtgattttaagatcgatgatcaatgtgtgttgaggtttcgaggtagga 23651153  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||||   ||| | || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  23651152 tttgtattttagacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtatcttgagtattcatctgggagctacgaagatgtatcatga 23651053  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23651052 tctgaaaaagttgttttggtggtctggattgaa 23651020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 259
Target Start/End: Original strand, 20395793 - 20395934
Alignment:
Q  118 gaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagat 217  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || | | ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20395793 gaggcagaatttatattcccgacaatgatgagataaagaagatgattcttgaagaaagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagat 20395892  T
Q  218 gtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||| || ||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  20395893 gtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaa 20395934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 17673593 - 17673825
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||  | |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  17673593 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 17673692  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17673693 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatga 17673792  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  17673793 ttttaagaagattttctggtggtctggtttgaa 17673825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 30312714 - 30312946
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||| ||||||||| ||| ||||  |||| || ||||| || || || ||||||||||| ||| ||||  | |    
T  30312714 gttgatgtcaagtttgtagatttgttagttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggtcgga 30312813  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| ||||||||| | |  |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30312814 tttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacga 30312913  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  30312914 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 30312946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 32601355 - 32601123
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||| ||| ||||  |||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||  | |    
T  32601355 gttgatgtcaagtatgtagatttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgatgatcacggtgtgttgagattccgaggtcgga 32601256  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||| | |  ||||||||     ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32601255 tttgtattcccgacgatgcagagatgaaggaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 32601156  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  32601155 tataaataagattttctggtggtctggtttgaa 32601123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19979178 - 19978982
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||||  || ||||| |||| || || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||  |||    
T  19979178 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcaggctgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtattgagattccgaggtcgaa 19979079  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19979078 tttgtattcttgacaatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatca 19978982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 21921306 - 21921538
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| |||| |  ||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||  |||| || |    
T  21921306 gttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacaacgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtagga 21921405  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||  ||| | |||||||| || |   ||||| | ||||| ||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21921406 tttgtattcaagacgatgatgagataaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccacga 21921505  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| |||||||||||||||| |||||    
T  21921506 tctaaagaagttgttttggtggtctggattgaa 21921538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 29303044 - 29303228
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||  |||| |  |||||| | | ||| |    
T  29303044 gatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagatgaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaaattgattcttgtagaga 29303143  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||  | |||||||||||||| ||||||||    
T  29303144 gtcacaagagtaggttgagcattcacccgggggctacaaagatgtatcatgatttgaaggaactgttttggtggtccggtttgaa 29303228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12305918 - 12305731
Alignment:
Q  78 agtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtc 177  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||| | ||| | || ||||||||||| |||||| |||| | ||| ||| | ||||| ||||    
T  12305918 agtgattttaaggttgatgatcagggtgttttgaggttcagatgaagagtatgcattcctgacaatgatgagttgaagaagttaattcttgaagagagtc 12305819  T
Q  178 acaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12305818 ataagagtaggttgagtattcacccgggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaattgtga 12305731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 16407602 - 16407811
Alignment:
Q  14 agaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgagg 113  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || ||||| ||||| || |||||||||||     
T  16407602 agaagcacaaaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagtcgatgaccatggtgtgttgaga 16407701  T
Q  114 ttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacga 213  Q
    ||| ||||  | ||||| ||||||||| | || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  16407702 ttccgaggtcggatttgcattcctgacgatgaagagatgaataaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccaggagctacga 16407801  T
Q  214 agatgtatca 223  Q
    ||||||||||    
T  16407802 agatgtatca 16407811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21043656 - 21043424
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  ||||||  |||||||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| ||| | ||| |||||||  |||| || |    
T  21043656 gttgatgttaagtttgtggacttgttggttgcaagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaagagtgctgaggtttcgaggtagga 21043557  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| || || |  |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  21043556 tttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgagagctacgaagatgtatcatga 21043457  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  21043456 tttaaagaagttgttttggtggtccggattgaa 21043424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 22119744 - 22119976
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||    
T  22119744 gttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtatgttgagattccgaggaagaa 22119843  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || || || || | | ||||| | ||| | ||||| |  ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22119844 tttgtatcccagacaatgaagatattaagaagatgattcttgaatagagtcatagaagttgcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 22119943  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || | |||||||||||||||    
T  22119944 tttaaagaagattttctagtggtctggtttgaa 22119976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Original strand, 21166108 - 21166304
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||| | || || || || ||||| || ||||||||||| ||| ||||  |||    
T  21166108 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggagactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaa 21166207  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    ||||||||||  || | || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21166208 tttgtattcccaacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatca 21166304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 22132611 - 22132843
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||  |||| || ||||| || || || ||||||||||| ||| ||||  | |    
T  22132611 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattctgaggtcgga 22132710  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| ||||| ||| | |  |||||||| |   ||||| | || || |||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132711 tttgcattcccgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaggagagtcattgaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacga 22132810  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  22132811 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 22132843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15534591 - 15534359
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    |||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||  |||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||  | ||||    
T  15534591 gatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgatgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggattt 15534492  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    | |||| |||  | |  || || || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15534491 gcattcatgatgatgcagaaataaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgattt 15534392  T
Q  230 ---gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
        |||||| | || |||||||||||||||||    
T  15534391 agaaaaaaagattttctggtggtctggtttgaa 15534359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21252152 - 21251920
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||  ||||  | ||||    
T  21252152 gatgttaagtttgtggacttgttggttgttagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtcggattt 21252053  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagct---acgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| || ||||  |||| | ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  21252052 gtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccacagaagtaacctgagtattcatccgggagctacgacgaagatgtatcatga 21251953  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  21251952 tctaaagaagttgttttggtggtccggattgaa 21251920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22041070 - 22040838
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||  ||||   ||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||  | |    
T  22041070 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagacggaagacgatgactttaaagtcgatgatcacggtgtgttgagattccgaggtcgga 22040971  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| ||||||||| | |   | ||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22040970 tttgcattcctgacgatgcaaatatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctaggagctacgaagatgtatcacga 22040871  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || ||||||||||| |||||    
T  22040870 tttaaagaagattttctggtggtctggattgaa 22040838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25283207 - 25283120
Alignment:
Q  161 gattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtgg 248  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||    
T  25283207 gattttggaagaaggtcacaggagtagtttaagtattcatctaggagcgacgaagatgtatcaggatttgaagaagttgttttggtgg 25283120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 219
Target Start/End: Original strand, 21393437 - 21393627
Alignment:
Q  29 tgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatt 128  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| | |||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||  ||||  | |||    
T  21393437 tgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacaatgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatt 21393536  T
Q  129 tgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgt 219  Q
    |||||||||||| | |||||||||||     ||||| | ||||| || || |  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21393537 tgtattcctgacgatgatgagatgaaggaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccaggagctacgaagatgt 21393627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 219
Target Start/End: Original strand, 21787931 - 21788121
Alignment:
Q  29 tgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatt 128  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| | |||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||  ||||  | |||    
T  21787931 tgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacaatgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatt 21788030  T
Q  129 tgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgt 219  Q
    |||||||||||| | |||||||||||     ||||| | ||||| || || |  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21788031 tgtattcctgacgatgatgagatgaaggaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccaggagctacgaagatgt 21788121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25283433 - 25283346
Alignment:
Q  161 gattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtgg 248  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||  ||||  |||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||    
T  25283433 gattttggaagaaggtcacaagagtagtttaagtattcatctaggagtgacgaagatgtatcaggatttgaagaaattgttttggtgg 25283346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23886144 - 23886082
Alignment:
Q  118 gaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcaca 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||||| |||||||    
T  23886144 gaggcagaatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcaca 23886082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 253
Target Start/End: Original strand, 23156716 - 23156808
Alignment:
Q  161 gattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| | | |||||| |||| ||||    
T  23156716 gattttggacgaaggtcataagagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgtttttgtggcctgg 23156808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Original strand, 16876800 - 16876891
Alignment:
Q  162 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  16876800 attttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgg 16876891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 223
Target Start/End: Original strand, 22623557 - 22623630
Alignment:
Q  150 atgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  22623557 atgaaaaagatgattctggaaaaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatca 22623630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 253
Target Start/End: Original strand, 21196206 - 21196298
Alignment:
Q  161 gattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    ||||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| | | ||||||||||| ||||    
T  21196206 gattttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagatgttgttttggtggcctgg 21196298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22316268 - 22316176
Alignment:
Q  161 gattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    ||||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |   ||||||||||| ||||    
T  22316268 gattttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagagattgttttggtggcctgg 22316176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 113 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 34278 - 34126
Alignment:
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34278 gttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagataaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacg 34179  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34178 aagatgtatcacgatttgaaaaagcttttttggtggtctggtttgaagcgtga 34126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 89561 - 89813
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  89561 gagaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctagtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 89660  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||     
T  89661 gttcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagctaaagtattcatccgggagctaca 89760  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    || |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  89761 aaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaatgtga 89813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 90239 - 90491
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  90239 gagaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctagtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 90338  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||     
T  90339 gttcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagctaaagtattcatccgggagctaca 90438  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    || |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  90439 aaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaatgtga 90491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 259
Target Start/End: Original strand, 390489 - 390562
Alignment:
Q  186 agcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  390489 agcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttattttggtggtctggattgaa 390562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27699 - 27468
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  27699 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgctagtaatcaaactgaaaatgatgacttcaatgttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaat 27600  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    ||| |||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27599 ttgcattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgac 27500  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||| ||  ||||||||||||| || |||||    
T  27499 ttgaagaaattgttttggtggtccggattgaa 27468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 68567 - 68313
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  68567 agtatcagagaagcacaacaagttgatgctaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagctgaggatagagatttcaaggttgatgaacaaggtg 68468  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  68467 tgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagtaacttgagtattcatccggg 68368  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||||| || |||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  68367 agctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgtttttgtggtctggtttgaag 68313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 13017 - 13269
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||   |||||   ||| | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  13017 gagaagcacaacaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgcgggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgag 13116  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  13117 attcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctaca 13216  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13217 aagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtga 13269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 4069 - 4321
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||  || ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||   ||| | |||||||| || || || ||||| || |||||||||||    
T  4069 gagaagcacaactagtagatgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatggcactgaggatagtgagtttaaggtggatgatcagggtgtgttgag 4168  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||     
T  4169 gttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttcaaaaggttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcattcgggagctaca 4268  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4269 aagatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 4321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Original strand, 15002470 - 15002723
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||    
T  15002470 agtatcagagaagcacaacaagatgatgtcaagtttgtggatttaatggttgctagtaatgaaactgaagataatgacttcaaggttgatgatcagggtg 15002569  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  ||||||  |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  15002570 tgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaaattgattctagaagaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccggg 15002669  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||| || |||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  15002670 agctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaa 15002723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27901546 - 27901298
Alignment:
Q  12 agagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttga 111  Q
    ||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27901546 agagaagcacaacaagttgatgcaaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagctgaggatagagatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttga 27901447  T
Q  112 ggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctac 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  27901446 gatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagtaacttgagtattcatccggaagctac 27901347  T
Q  212 gaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
     || |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27901346 aaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaag 27901298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15247083 - 15246844
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| | ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15247083 gagaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgacactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgag 15246984  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  15246983 gttcaggggaagaatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattctggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctaca 15246884  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctg 252  Q
    || |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15246883 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctg 15246844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8707063 - 8706831
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  8707063 gttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggcagaa 8706964  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  8706963 tttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaaaagtaacttaagtattcatccgagagctacaaagatgtatcatga 8706864  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||| || ||  |||||||||||||||| |||||    
T  8706863 cttaaagaaattgttttggtggtctggattgaa 8706831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Original strand, 1648390 - 1648637
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||  ||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||| | ||||| ||||| |  || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1648390 gagaagctcaacaggtggatgtaaaatttgttgatttaatgattgctggtaatgaaactgagaatggtgatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttgag 1648489  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     |||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  1648490 attcagaagcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaggttaattctagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctaca 1648589  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||||||| || || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1648590 aagatgtaccatgatttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaag 1648637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 256
Target Start/End: Original strand, 15414151 - 15414382
Alignment:
Q  25 aggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcag 124  Q
    |||||||| | ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||| |||| ||    
T  15414151 aggttgatattaagtttgtggatttgttggttgttagtaatcaaactgaagaaagtgatttcaaggttcatgatcagggtgtgttgagattctgaggaag 15414250  T
Q  125 aatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcac 224  Q
    ||||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||     
T  15414251 aatttgtattcctcataatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaagtagtttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcat 15414350  T
Q  225 gacttgaaaaagctgttttggtggtctggttt 256  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| |||||    
T  15414351 gacttgaagaaattgttttggtggtccggttt 15414382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16148853 - 16148618
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||   ||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16148853 gatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaagtcgatgatcagggtgtgttgaggttcataggaagaattt 16148754  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||||||||| || | | |||||| ||||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16148753 gtattcctgacaatgaagggttgaaaaagttgactctggaggaaagtcacaagagcagcttaagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcacgattt 16148654  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||||    
T  16148653 gaagaagttgttttggtggtccggcttgaagcgtga 16148618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16152999 - 16152764
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||   ||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16152999 gatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaagtcgatgatcagggtgtgttgaggttcataggaagaattt 16152900  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||||||||| || | | |||||| ||||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16152899 gtattcctgacaatgaagggttgaaaaagttgactctggaggaaagtcacaagagcagcttaagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcacgattt 16152800  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||||    
T  16152799 gaagaagttgttttggtggtccggcttgaagcgtga 16152764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 15358233 - 15358479
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| | || || ||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||   ||| | |||||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  15358233 gagaagcacagcaagtagatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgag 15358332  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||  |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15358333 gttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagagtaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacg 15358432  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    || |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  15358433 aaaatgtatcatgatttgaagaaactattttggtggtctggtttgaa 15358479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15320294 - 15320063
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||    ||||| ||||| ||||| ||||  |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  15320294 ttgatgtcaggtttgtggatttaatagttacccgtaattaaactgaagatggtgacctcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaat 15320195  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    ||  |||||||| || |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  15320194 ttacattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttaaaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggacctacaaagatgtatcacgac 15320095  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  15320094 ttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaa 15320063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15078779 - 15078558
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  15078779 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggatgctagtaatcaaactgaagaggaagatttcaaggtcgatgagcagggtgtgttaaggttcagaggaagaat 15078680  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    ||| |||| ||| |  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  15078679 ttgcattcttgatagtgatgagttgaaaaagttgattctggaagaaagtcatagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgac 15078580  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggt 249  Q
    ||||| ||  | ||||||||||    
T  15078579 ttgaagaaattattttggtggt 15078558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14160569 - 14160383
Alignment:
Q  73 aagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaaga 172  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||| | |||||    
T  14160569 aagatagtgactttaaagttgatgaccaaggagtgttgagattccgcggtagaatttgtattccagacaatgatgagatgaagaagatgattcttgaaga 14160470  T
Q  173 aagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  14160469 gagccatcggagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaa 14160383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 29452712 - 29452896
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| | || || |    
T  29452712 gataatgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggaga 29452811  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  29452812 gtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaa 29452896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 3263969 - 3264153
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||| | || || |    
T  3263969 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 3264068  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  3264069 gtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 3264153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12524821 - 12524589
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| |||||||| |||||||| ||| | |||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  12524821 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactaaagacagtgattttaaaatcgatgatgaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 12524722  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||| | |  ||||| ||   | ||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12524721 tttgtattccagacgatggagagattaaggagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccggaagctacgaagatgtatcacga 12524622  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  12524621 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 12524589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 14850233 - 14850465
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||| ||||||||| | | ||||||| || || || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  14850233 gttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagattgaagatagagactttaaggtcgatgatcaaggcgtgttgagattccgaggcagaa 14850332  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| | ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  14850333 tttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagattcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctatgaagatgtatcatga 14850432  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| |||||||||||||||| |||||    
T  14850433 tttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 14850465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40474183 - 40473953
Alignment:
Q  29 tgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatt 128  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  40474183 tgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatt 40474084  T
Q  129 tgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgact 228  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| || |    
T  40474083 tgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctatgaagatgtatcatgatt 40473984  T
Q  229 tgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  40473983 taaagaagattttctggtggtctggtttgaa 40473953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14695255 - 14695062
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  14695255 gatgttaagtttgtggacttgttggtttctagtaattaaactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcagggagtgttgagattccgaggcagaattt 14695156  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14695155 gtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatataagtagcttgagtactcatccgggagctacgaagatgtatca 14695062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8387557 - 8387325
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || ||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  8387557 gttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 8387458  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8387457 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 8387358  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  8387357 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 8387325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12477745 - 12477513
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  12477745 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 12477646  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12477645 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 12477546  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  12477545 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 12477513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 14302845 - 14303077
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  14302845 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgaccaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 14302944  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || |||||  | ||| | || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14302945 tttgtatcccagacaataaagagtttaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 14303044  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     ||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  14303045 tttgaagaagattttctggtggtctggtttgaa 14303077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 19777660 - 19777892
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  19777660 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 19777759  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  19777760 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatga 19777859  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  19777860 ttttaagaagattttctggtggtctggtttgaa 19777892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 8052490 - 8052722
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| ||||  ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  8052490 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacggtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 8052589  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| | ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8052590 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagattcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 8052689  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  8052690 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 8052722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14681712 - 14681480
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  | |||  |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||    
T  14681712 gttgatgtaaagtttgtggacttgttagtttctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagatttcgaggaagaa 14681613  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14681612 tttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 14681513  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||| ||||||||||    
T  14681512 tttaaagaagattttctggtggcctggtttgaa 14681480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23956892 - 23956660
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  23956892 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 23956793  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| |  ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23956792 tttgtatccaggacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatga 23956693  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  23956692 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 23956660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27712481 - 27712249
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||| |||  ||||  || |||| |||||||| ||| | ||  | |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  27712481 gttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcaggctgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 27712382  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27712381 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 27712282  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  27712281 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 27712249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 29038271 - 29038503
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || ||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  29038271 gttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 29038370  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29038371 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 29038470  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  29038471 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 29038503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 44661041 - 44661225
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||| |||| | ||||||| | || || |    
T  44661041 gatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 44661140  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  44661141 gtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 44661225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 11206406 - 11206590
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| | || || |    
T  11206406 gatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagggtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggaga 11206505  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  11206506 gtcacaatagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 11206590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18298350 - 18298118
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||  |||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||    
T  18298350 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagacggaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgtttagattccgaggaagaa 18298251  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18298250 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtatcacga 18298151  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  18298150 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 18298118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20892079 - 20891895
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||| |  ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||  |||| | ||||||| | ||||| |    
T  20892079 gatagtgattttaaggttgatgatcagggtttcctgaggttcagagaaagagtttgtatttctgacaacgatgatttgaagaagttgattcttgaagaga 20891980  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||  |||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  20891979 gtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 20891895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33224011 - 33223836
Alignment:
Q  84 ttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaaga 183  Q
    ||||| |||||||| || |||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| | ||||| ||||| ||||    
T  33224011 ttcaaggttgatgatcagggtgttctgtggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcataaga 33223912  T
Q  184 gtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || ||||||||||||||  |||||||    
T  33223911 gtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccagtttgaa 33223836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 259
Target Start/End: Original strand, 1639364 - 1639524
Alignment:
Q  99 caaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatcc 198  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| | ||||| || ||||| ||   | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  1639364 caaggtgtgttgaggtttcgaggtagaatttgtatttcagacaatgaagagattaaggagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 1639463  T
Q  199 atccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1639464 acccgagagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctggattgaa 1639524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Original strand, 18226314 - 18226545
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||  |||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||  | ||    
T  18226314 ttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgacgagcacggtgtgttgagattccgaggtcggat 18226413  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    ||| ||||||||| | |  || ||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  18226414 ttgcattcctgacgatgcagatatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacaat 18226513  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  18226514 ttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 18226545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Original strand, 15146752 - 15146948
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||| ||| ||||  |||| || || || ||| | || ||||||||||| ||| ||||  |||    
T  15146752 gttgatgtcaagtttgtagacttattggtagctagtaatcagactgaagaaggtgaatttaaggtcgataaacatggtgtgttgagattccgaggtcgaa 15146851  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    | |||||||||||  | || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15146852 tatgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatca 15146948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7091576 - 7091345
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    ||||||| |||||||| || ||  |||||| |||| |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||  |||| |  ||    
T  7091576 ttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtgatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtatgat 7091477  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| || || |  |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  7091476 ttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattattgaagagagccatagaagtaacttaagtatttatccgggagctacgaagatgtatcatgat 7091377  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     | || | | |||||||||||||||| |||||    
T  7091376 ctaaagaggttgttttggtggtctggattgaa 7091345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 121
Target Start/End: Original strand, 18614692 - 18614785
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagagg 121  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||| ||||    
T  18614692 ttgatgtcaagtttgtagatttattggttgctagtaatcagactgaagactgtgattttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattctgagg 18614785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Original strand, 16354468 - 16354508
Alignment:
Q  183 agtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16354468 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatca 16354508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Original strand, 15292420 - 15292511
Alignment:
Q  162 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||    
T  15292420 attttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaaaaggttgttttggtggtctgg 15292511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 259
Target Start/End: Original strand, 18614852 - 18614908
Alignment:
Q  203 gggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  18614852 gggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 18614908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Original strand, 18549321 - 18549382
Alignment:
Q  162 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  18549321 attttagaggaaggtcacaagagtagcttaagtatacacccgggagccactaagatgtatca 18549382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16029091 - 16029035
Alignment:
Q  192 agtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtgg 248  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||    
T  16029091 agtattcatccaggagcgacgaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtgg 16029035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 186
Target Start/End: Original strand, 6794 - 6974
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  6794 agtatcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagcttgtggatttaagggttaatagtaatcaaactgaagatagtgatttcaaggttgatgaacacggtg 6893  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagta 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6894 tgttgaggttcagaggcagaatttgtgttcctgacaatgatgagatgaaaaggctgattttagaagaaagtcacaagagta 6974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 260
Target Start/End: Original strand, 342 - 597
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |  |  ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  342 agtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgatttcaaggttgatgaacaaggtg 441  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttg-gaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgg 204  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| | |||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||    
T  442 tgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgg 541  T
Q  205 gagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  542 gagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagctgttttagtggtctggtttgaag 597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5940 - 5694
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  5940 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaattgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtatgttgag 5841  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  5840 gttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctaca 5741  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    || |||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  5740 aaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaa 5694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3373 - 3120
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||   | ||||    
T  3373 agtatcagagaagcacagcaagttgatgccaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaactgaagatggtgatttcaaggttgatggtgagggtg 3274  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  3273 tgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagatgattctggaagaatgtcacaaaagtagcttaagtattcatccggg 3174  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||| || |||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  3173 agctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaa 3120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 24202 - 24434
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24202 gttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggcagaa 24301  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  24302 tttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtataatga 24401  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||| ||  ||||||||||||| || |||||    
T  24402 cttgaagaaattgttttggtggtccggattgaa 24434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3964 - 3735
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3964 gatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaactgaagagagtgacttcaaggttgatgttcagggtgtgttgaggttcagagggagaattt 3865  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    | ||||| || || |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3864 gcattccagataatgatgagttgaaaaagtttattctggaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgactt 3765  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  3764 gaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 3735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7545 - 7352
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| |||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||  | |||||  ||||  | ||||    
T  7545 gatgttaagtttgtggacttgttggttgttagagatcagactaaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtactaaggtttcgaggtcggattt 7446  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| |  || |  |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  7445 gtattcccgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagatccatagaagtaacttgagtattcatctgggagctacgaagatgtatca 7352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Original strand, 1106 - 1334
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  1106 gatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatgga-ctgaagatagtgatttcaaggttgatgatcaaggagtgttgaggttcagaggaagaattt 1204  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||    
T  1205 gcattcctgacaatgatgagttgaaaatgttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatctaggagctacaaagatgtatcatgactt 1304  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  1305 gaagaaattgttttggtggtctgggttgaa 1334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5627 - 5374
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||| || ||||    
T  5627 agtatcagagaagcacaaaaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatggttactagtaatgaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtg 5528  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| ||    
T  5527 tgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagtcgattttggaagaaatacacagaagtagcttaagtattcatccagg 5428  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  5427 agctacaaagatgtatcatgacttgaagaaactgttttggtggtctgggttgaa 5374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29249 - 29001
Alignment:
Q  11 cagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttg 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  29249 cagagaagcacagcaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatggttactagtaatgaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttg 29150  T
Q  111 aggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagcta 210  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||| |  |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  29149 aggttcagaggaagaattttcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagccacagaagtagcttaagtattcatccaggagcta 29050  T
Q  211 cgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  29049 caaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaa 29001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30121 - 29922
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||  ||||  |||||  |||| |||| ||| |||| |||||||| ||  | ||||| ||| |||||||||||||  |||| || |    
T  30121 gttgatgttaagtttgtacatttgttggtttctagtgatcagactgaagacagtgattttaagatcgatgatcaacgtgtgttgaggtttcgaggtagga 30022  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||||||  || | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30021 tttgtattccaaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccacga 29922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Original strand, 193 - 424
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  193 ttgatgtcatgtttgtggatttaatggttgctagtaatcaaactgaagagggtgatttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaggttcagaggaagaac 292  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    ||| |||| ||| |  |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  293 ttgcattcttgatagtgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcatagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgac 392  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||| ||  | ||||||||||| ||||||||    
T  393 ttgaagaaattattttggtggtccggtttgaa 424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Original strand, 11190 - 11425
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  11190 gatgtgaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaactgaagatagtgactttaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattcaaaggaagaattt 11289  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    | |||||||| || |||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  11290 gcattcctgataatgatgatgtgaaaaagttgattttggaggaaagccacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgattt 11389  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11390 gaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 11425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Original strand, 14960 - 15195
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  14960 gatgtgaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaactgaagatagtgactttaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattcaaaggaagaattt 15059  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    | |||||||| || |||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  15060 gcattcctgataatgatgatgtgaaaaagttgattttggaggaaagccacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgattt 15159  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15160 gaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 15195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21173 - 20927
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||| |||| || ||| | ||||     
T  21173 gagaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaattgaagatagtgacttcaaggttaatgatcagggtatattgaa 21074  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||| || |||||  |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21073 gttcacaggaaggatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacg 20974  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    || |||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||    
T  20973 aaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggttgtctgggttgaa 20927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 802 - 1048
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  802 gagaagcacaacaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctaataatgaaacggaagatattgacttcaaagttgatgatcagggtgtgttgag 901  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||| || ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||     
T  902 gttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttggaaaagttgattctagaagaaagtcacaagagtagctagagtattcacccgggagctaca 1001  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    || |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  1002 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 1048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28415 - 28169
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||| ||  | || |||| | ||||| ||||| | |||||||| |  || |||||||| || |||||||| ||    
T  28415 gagaagcacaacaagtggatgtcaagtttgttgacctgatagttgctggtaatgaaactgaggatagtgactataaggttgatgatcagggtgtgttaag 28316  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  28315 gttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattctggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctaca 28216  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28215 aaaatgtatcacgacttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaa 28169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 32584 - 32354
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  32584 gatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaattt 32485  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    | |||||||| || |||||  |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  32484 gcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgactt 32385  T
Q  230 gaaaaagctg-ttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||| || ||| |||||||||||||| |||||    
T  32384 gaagaaactgtttttggtggtctgggttgaa 32354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Original strand, 20855938 - 20856188
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| | |  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20855938 agtatcagagaagcgcaacaagttgatgttaagtttgtggatttgatggtcgctagtaatctagcggagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggtg 20856037  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  20856038 tgttgagattaagaggcagaatttgtattcctgacaatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccggg 20856137  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggttt 256  Q
    |||||| || |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  20856138 agctacaaaaatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctggttt 20856188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 20939248 - 20939500
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||   ||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20939248 gagaagcacaacaagtggatgtgaaggttgttgatttaatggttgctggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgag 20939347  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     |||||| | |||||||| ||||||||  | |||||  | |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20939348 attcagaagaagaatttgcattcctgatgatgatgatttaaaaaagttaattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacg 20939447  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20939448 aaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccggtttgaagcgtga 20939500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 260
Target Start/End: Original strand, 24098850 - 24099035
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||| |||||||    
T  24098850 gatagtgacttcaaggttgacgatcagggtgttttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgggttgaaaaagttgattttagaagaaa 24098949  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  24098950 gtcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaag 24099035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Original strand, 19662339 - 19662574
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||||||| | || ||||| ||||||| | |||||   ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19662339 gatgtcaagctggttgatttgatggttgctggtaatggcactaaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtattgaggttcagaggaagaattt 19662438  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    |||||||||| || || ||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||| || ||    
T  19662439 gtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcgtccggaagctacgaaaatgtatcatgattt 19662538  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19662539 gaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 19662574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19855479 - 19855233
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||| || |||| | |||||   ||| | |||||||| || || |||||||| || ||||| |||||    
T  19855479 gagaagcacaacaagtggatgttaagtttgttgatttgattgttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtattgag 19855380  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  19855379 gttcagaggaaggatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagaatagcttaagtattcatctgggagctacg 19855280  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    || |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  19855279 aaaatgtatcatgatttgaagacgctgttttggtggtctgggttgaa 19855233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16373689 - 16373457
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||| |||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||    
T  16373689 gttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgactttaaggtcgatgatcaaggtgtgttgagatttcgaggtagaa 16373590  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  16373589 tttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctgcgaagatgtatcatga 16373490  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  16373489 tttgaagaagttgttttggtggtctggattgaa 16373457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 50619443 - 50619675
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||  ||||||||| ||| |||| ||  |||| ||| | ||||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  50619443 gttgatgttaagtttgtagacttgttggttactagtaatcagactgaagacagatattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtagaa 50619542  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50619543 tttgtattccatacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataaaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 50619642  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  50619643 tttgaaaaagttgttttggtggtctggattgaa 50619675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20139990 - 20139758
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||   ||| || |    
T  20139990 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaatatcgatgaccaaggtgtgttgaggtttcaaggtagga 20139891  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||| | || || ||||| | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20139890 tttgtattccagactatgaagaaatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 20139791  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  20139790 tttgaagaagttgttttggtggtctggattgaa 20139758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 190
Target Start/End: Original strand, 23197448 - 23197608
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| | ||| | ||||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23197448 gatgttaagtttgtggatttgatggttgctggtagtgaaactgaagatagtgactttaaagttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaattt 23197547  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagctt 190  Q
    |||||||||| || |||||  |||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  23197548 gtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtgacaagagtagctt 23197608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 31539244 - 31539428
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||| |||| || |    
T  31539244 gatagtgatttcaaaattgatgatcagggtgtgctgaggttcacaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattctggaggaga 31539343  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  31539344 gtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacgaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 31539428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 20835085 - 20835319
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||  || ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||   ||| | ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  20835085 gagaagcacaactagtggatgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatggcactgaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgttgag 20835184  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatga-gatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctac 211  Q
    ||||||||| |||||||| |||||      |||||| |||||   |||| |     || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20835185 gttcagaggaagaatttgcattcc------cgatgatgatgat--ggttca-----gaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctac 20835271  T
Q  212 gaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20835272 gaaaatgtatcatgacttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaa 20835319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22110179 - 22109950
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  22110179 gatgttaagtttgtggacttgttggttcctagtaatcagactgaagatagtgattttaagatcgatgaccaaggagtgttgagattccgaggcagaattt 22110080  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22110079 gtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcacccgggagctacgaagatgtaccacgattt 22109980  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || ||| |||||||||||||||| |||||    
T  22109979 aaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 22109950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22114028 - 22113799
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  22114028 gatgttaagtttgtggacttgttggttcctagtaatcagactgaagatagtgattttaagatcgatgaccaaggagtgttgagattccgaggcagaattt 22113929  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22113928 gtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcacccgggagctacgaagatgtaccacgattt 22113829  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || ||| |||||||||||||||| |||||    
T  22113828 aaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 22113799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 37678192 - 37678008
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||| | || || |    
T  37678192 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 37678093  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  37678092 gtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 37678008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 41352861 - 41353093
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||||| ||| |||| || |    
T  41352861 gttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaagatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagga 41352960  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  41352961 tttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 41353060  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     ||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  41353061 tttgaagaagattttctggtggtctggtttgaa 41353093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19107486 - 19107295
Alignment:
Q  69 actaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttgg 168  Q
    |||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || | | ||||| | |    
T  19107486 actaaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttg 19107387  T
Q  169 aagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||| | || ||||||| ||||||||||    
T  19107386 aagagagccacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtttggtttgaag 19107295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 51332692 - 51332924
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||  |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  51332692 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagacggaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 51332791  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  51332792 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacga 51332891  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  51332892 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 51332924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 259
Target Start/End: Original strand, 19760118 - 19760304
Alignment:
Q  73 aagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaaga 172  Q
    |||||||||| || || || ||||| || || |||||| | ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| | |||||    
T  19760118 aagatagtgactttaaggtcgatgatcagggagtgttgcgattccgaggtagaatttgtattcctgacgacgatgagatgagaaagatgattcttgaaga 19760217  T
Q  173 aagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || || || ||| |||||||||||||||| |||||    
T  19760218 gagtcacataagtagcttgagtatccatccaggagctataaagatgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 19760304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20295521 - 20295340
Alignment:
Q  78 agtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtc 177  Q
    |||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| | ||||| ||||    
T  20295521 agtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaagagagtc 20295422  T
Q  178 acaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||  |||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  20295421 acaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 20295340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21831463 - 21831231
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  21831463 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 21831364  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| |  ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21831363 tttgtatcctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatttatcatga 21831264  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  21831263 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 21831231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 33390228 - 33390460
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||  | |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  33390228 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 33390327  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  33390328 tttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatga 33390427  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  33390428 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 33390460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21838038 - 21837878
Alignment:
Q  99 caaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatcc 198  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  21838038 caaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaataagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 21837939  T
Q  199 atccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  21837938 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 21837878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20250961 - 20250739
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||| | ||||||||  ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||  |||| || |    
T  20250961 gttgatgttaagtttgtggacttgttggtggctagtaatcggactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtatgttgaggttttgaggtagga 20250862  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  20250861 tttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatga 20250762  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggt 249  Q
      | || ||| ||||||||||||    
T  20250761 tctaaagaagttgttttggtggt 20250739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 16349797 - 16350030
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcag-a 125  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||  |||| |||||||| ||| | ||| | |||||||||||||| ||| |||| || |    
T  16349797 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagacggaagacagtgattttaaaatcgataatcaaggtgtgttgagattccgaggaagta 16349896  T
Q  126 atttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacg 225  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16349897 atttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatg 16349996  T
Q  226 acttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |  | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  16349997 atctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 16350030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 17044214 - 17044446
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||  |||| || ||||| ||||| || |   ||||||| ||| ||||  | |    
T  17044214 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgatgatcacgacatgttgagattccgaggtcgga 17044313  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||| | |  |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17044314 tttgtattcccgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccacccgggagctacgaagatgtatcacga 17044413  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  17044414 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 17044446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 265
Target Start/End: Original strand, 16077855 - 16078093
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||  |||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||  |||  | |    
T  16077855 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgatgaccacggtgtgttgagattccaaggtcgga 16077954  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| || |||||| | |  |||||||| |   | ||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16077955 tttgcatccctgacgatgcagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacga 16078054  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
     || || ||| | || | ||||||||||||||| |||||    
T  16078055 tttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaatgtga 16078093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21952018 - 21951837
Alignment:
Q  78 agtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtc 177  Q
    |||||||| || || ||||| || |||||  |||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||  |||| | ||||||  | ||||| ||||    
T  21952018 agtgattttaaggtggatgatcagggtgtactgagattcagaggaagagtttgtattcctaacaatgatgatttgaagaagttgatccttgaagagagtc 21951919  T
Q  178 acaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||| ||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  21951918 acaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaatatgtttcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 21951837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Original strand, 22361430 - 22361675
Alignment:
Q  14 agaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgagg 113  Q
    ||||||| || | |||||||| |||||||| || ||  |||||| |||| |||| ||| ||||  ||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||    
T  22361430 agaagcataaaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtgatcagactgaagacggtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgctgagg 22361529  T
Q  114 ttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacga 213  Q
    ||  |||| || |||||||||||  || | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  || | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22361530 tttcgaggtaggatttgtattccaaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagaaacttgagtattcatccgggagctacga 22361629  T
Q  214 agatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||| ||||| ||  | || ||| |||||||||||||||| |||||    
T  22361630 agatctatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaa 22361675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21750113 - 21749869
Alignment:
Q  14 agaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgagg 113  Q
    ||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||  |||| | |||| || | ||| |||| || ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||     
T  21750113 agaagcacaaaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggtggctagtgattagactgaagacagagattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaga 21750014  T
Q  114 ttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacga 213  Q
    ||  |||| || ||||||||||| ||  |  |||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21750013 tttcgaggtaggatttgtattccagatgat-atgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacga 21749915  T
Q  214 agatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||||||| ||  | || ||| |||||||||||||||| |||||    
T  21749914 agatgtatcatgatctaaagaagatgttttggtggtctggattgaa 21749869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21025332 - 21025137
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || || ||  |||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  21025332 ttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcaatgaccatggtgtgttgagattccgaggccgaat 21025233  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    ||||||||||||  | || | || ||| |   ||||| | ||| | ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21025232 ttgtattcctgatgatgaagggaggaagaaaatgattcttgaaaagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatca 21025137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Original strand, 20061130 - 20061186
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagt 62  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20061130 agtatcagagaagcgcaacagattgatgtcaagtttgtggatttaatgattgatagt 20061186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Original strand, 20830726 - 20830817
Alignment:
Q  162 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  20830726 attttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgg 20830817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 121
Target Start/End: Original strand, 21234930 - 21235024
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagagg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| ||| ||||  |||| || ||||| || || || ||||||||||| ||| ||||    
T  21234930 gttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgagg 21235024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18546 - 18329
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  18546 agtatcagagaagcacagcaagttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtg 18447  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  18446 tgttgaggttcagaggaagaatttgcattcatgatagtgatgagttgaaaaagttgattctggaagaaagtaacaaaagtagcttaagtattcatccggg 18347  T
Q  206 agctacgaagatgtatca 223  Q
    |||||| || ||||||||    
T  18346 agctacaaaaatgtatca 18329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 2471 - 2723
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||  |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||  | |||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||    
T  2471 gagaagcgcaacaagtagatgtgaagtttgttgatttaatggttgttggtaatgaaacagaggatagtgacttcaaggtcgatgatcagggtgtgttaag 2570  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2571 gttcagaggaaggatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccaggagctacg 2670  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    || |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2671 aaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccggtttgaagcgtga 2723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8188 - 7998
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||  | ||||   |||||| ||| ||||| || || |    
T  8188 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtttagaggaagaattttcattcctgatgatgatggtttgaaaaagttaattttagaggaga 8089  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||    
T  8088 gtcacaagagtagcttgagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaataagttgttttggtggtccagtttgaagcgtga 7998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20310 - 20058
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||  |||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||| || || |||||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  20310 gagaagcgcaacaagtggatgttaagtttgttgatttgatggttactggtaatgaagctgaagatattgacttcaaagttgatgatcagggtgtattgag 20211  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  20210 attcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagagagtcacaagagtagcttgagtattcatcctggagctact 20111  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20110 aatttgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 20058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 97
Target Start/End: Original strand, 58342 - 58414
Alignment:
Q  25 aggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatga 97  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  58342 aggtggatgtgaagttggtagatttaatggttgggaataatcatactgaagatagtgattttaaagttgatga 58414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 194820 - 195072
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||   ||| | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  194820 gagaagcacaacaagtggatgtgaagtttgttgatttaatggttgttggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 194919  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||  | |||||  |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  194920 attcagaggaagaatttgcattcctgatgatgatgatttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctaca 195019  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  195020 aagatgtatcacgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 195072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 149760 - 149514
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||  || ||||||||||||||||| || ||||||| | ||||| ||||| | || ||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  149760 gagaagcacaactagtggatgtcaagtttgtggacttgatggttgctggtaatgaaactgaggaaagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgag 149661  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||| || |||||  |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  149660 gttcagaggaaaaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctaca 149561  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  149560 aagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaa 149514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Original strand, 25664 - 25895
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  || ||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| | |||||  | || |||||| | ||  |||| |||||    
T  25664 ttgatgttaagtttgtggacttgttgattgctagtaatcagactgaagatagcgattttaaaatcgatgattagggagtgttgcgttttcgagggagaat 25763  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  25764 ttgtattcctgacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgat 25863  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  25864 ttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 25895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 259
Target Start/End: Original strand, 9923 - 10170
Alignment:
Q  12 agagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttga 111  Q
    ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||    
T  9923 agagaagcacagaaggttgatgttaagtttgtggatttgttggttggtagtaatccaactaaagatagtgacttcaaggttgatgatctgggtgtgttga 10022  T
Q  112 ggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctac 211  Q
    | ||| |||| |||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||     
T  10023 gattccgaggaagaatttgtatttctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatcagggagctaa 10122  T
Q  212 gaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  10123 aaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaa 10170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 5)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Original strand, 51298 - 51542
Alignment:
Q  15 gaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggt 114  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||   ||  | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  51298 gaagcacaacaagtggatgtgaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcaccgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggt 51397  T
Q  115 tcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaa 214  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  51398 tcagagatagaatttgtattcctgacaatgacgaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgcgagctacgaa 51497  T
Q  215 gatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     |||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||    
T  51498 aatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtctgggttgaa 51542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Original strand, 60332 - 60576
Alignment:
Q  15 gaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggt 114  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||   ||  | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  60332 gaagcacaacaagtggatgtgaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcaccgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggt 60431  T
Q  115 tcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaa 214  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  60432 tcagagatagaatttgtattcctgacaatgacgaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgcgagctacgaa 60531  T
Q  215 gatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     |||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||    
T  60532 aatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtctgggttgaa 60576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Original strand, 66720 - 66964
Alignment:
Q  15 gaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggt 114  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||   ||  | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  66720 gaagcacaacaagtggatgtgaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcaccgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggt 66819  T
Q  115 tcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaa 214  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  66820 tcagagatagaatttgtattcctgacaatgacgaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgcgagctacgaa 66919  T
Q  215 gatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     |||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||    
T  66920 aatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtctgggttgaa 66964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26494 - 26392
Alignment:
Q  109 tgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagc 208  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26494 tgaggtttagaggaagaatttgtattcctgataacgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagc 26395  T
Q  209 tac 211  Q
    |||    
T  26394 tac 26392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 27815 - 27722
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgt 106  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| | ||| |||||| ||| ||||| |||||||| || |||||    
T  27815 gagaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgacactgaagataatgacttcaaggttgatgatcagggtgt 27722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 46515 - 46767
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| | || || ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| || || | |||||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  46515 gagaagcacagcaagtagatgtgaagtttgttgatttgatggttgctagtaatgaagctgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgag 46614  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  46615 gttcagaggaagaatctgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccaggagctaca 46714  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    || ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  46715 aaaatgaatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 46767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 41511 - 41695
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||| | || || |    
T  41511 gatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 41610  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  41611 gtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 41695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3087 - 2858
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  3087 gatgttaagtttgtggacttgttggttactagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcagggggtgttgagattctgaggcagaattt 2988  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    |||||||| |  | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  2987 gtattcctaatgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtatcatgattt 2888  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  2887 gaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 2858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Original strand, 2618 - 2841
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||  |||||||    
T  2618 gatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatgagggtgtgttgaggttcggagaaagaattt 2717  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    | |||||||| || |||||| ||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  2718 gcattcctgataatgatgagttgaaaaatttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgactt 2817  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||    
T  2818 gaagaagttgttttggtggtctgg 2841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 259
Target Start/End: Original strand, 14340 - 14559
Alignment:
Q  40 ttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctga 139  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14340 ttgttgatttgatggttgctagtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaggatttgtattcctga 14439  T
Q  140 caacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctg 239  Q
     || |||||  |||||| ||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||    
T  14440 taatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaaaactagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctg 14539  T
Q  240 ttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  14540 ttttggtggtctgggttgaa 14559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 259
Target Start/End: Original strand, 22519 - 22738
Alignment:
Q  40 ttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctga 139  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22519 ttgttgatttgatggttgctagtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaggatttgtattcctga 22618  T
Q  140 caacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctg 239  Q
     || |||||  |||||| ||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||    
T  22619 taatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaaaactagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctg 22718  T
Q  240 ttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  22719 ttttggtggtctgggttgaa 22738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 31883 - 32115
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  31883 gttgatgtcaagtttgtagacttgttagttgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaa 31982  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31983 tttgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatga 32082  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32083 tgtgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaa 32115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 323894 - 323642
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||| || | ||| |||||||| ||||||||||||| | |||||   | | | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  323894 gagaagcacaacaagtgggtgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatggcaatgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 323795  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     |||||||| |||||||| |||| |||  | |||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  323794 attcagaggaagaatttgcattcttgatgatgatgatttgaaaaagttaattttggaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacg 323695  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  323694 aaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 323642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 202598 - 202821
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||  ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | || ||||    
T  202598 gttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctaaaaatcaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgcggtagaa 202697  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||||||||| || |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  202698 tttgtattcctgataatgatgagttaaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatcagggagctacaaagatgtatcatga 202797  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtc 250  Q
    |||||| ||  |||||||||||||    
T  202798 cttgaagaaattgttttggtggtc 202821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 42045 - 41855
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || || ||| |||||| ||||||||| || ||||    
T  42045 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtccagaggaagaatttgtattcctaataatgacgagttgaaaaagttgattttagaggaaa 41946  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  41945 gtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 41855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21090 - 20844
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||  |||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||   ||||| ||||  | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  21090 gagaagcgcaacaagtggatgtaaagattgttgatttaatggttgcgggtaatgaaacagaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgag 20991  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||| || ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||     
T  20990 attcagaggtagaatttgtattccttacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcatgagtattcatccgggacctaca 20891  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20890 aaaatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaa 20844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 45690 - 45461
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||    |||| ||||  | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||| | |||||||    
T  45690 gatgtaaagtttgttgatttaatggttgcggataatgaaacagaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagatgtagaattt 45591  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||| || |||||| || ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||    
T  45590 gtaatcttgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccatgattt 45491  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45490 gaagaagctgtttcggtggtccggtttgaa 45461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 259
Target Start/End: Original strand, 19473 - 19703
Alignment:
Q  29 tgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatt 128  Q
    |||||| |||||||| || ||  |||||| |||| |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||  |||||||  ||||  | |||    
T  19473 tgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtgatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtactgaggtttcgaggtcggatt 19572  T
Q  129 tgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgact 228  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| || || |   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||      
T  19573 tgtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagatgtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatc 19672  T
Q  229 tgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    | || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  19673 taaagaagttgttttggtggtccggattgaa 19703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4973 - 4728
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||||| |||||||| || ||||    
T  4973 agtatcagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaaccgaagagggtgacttcaaggttgatgatcagggtg 4874  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||  ||| || ||||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  4873 tgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctaataatgatgatttgataaagttgattttagaagaaagccacagaagtagcttaagtattcatccggg 4774  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtct 251  Q
    |||||  ||||||  ||| |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  4773 agctaaaaagatgattcatgacttgaagaaattgttttggtggtct 4728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 175 - 1
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| || || |    
T  175 agtatcagagaagcacagcaagttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaactgaagagggtgatttcaaggttgatgatcaggggg 76  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcaca 180  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  75 tgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataacgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcaca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 265
Target Start/End: Original strand, 11964 - 12154
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||| ||||| || ||||    
T  11964 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagatgaaa 12063  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  12064 gtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggttcggtttgaattgtga 12154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 48322 - 48568
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||| ||| |||| || ||||||||| | || ||||| ||| ||| | ||||| ||||  | |||||||| || || |||||||| || ||||| |||||    
T  48322 gagaggcacaacaagtggatgtcaagctggttgatttgatgattgctggtaatgaaacagaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtattgag 48421  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  48422 attcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaggaaagtcataagagtagcttgagtattcatccgggagctaca 48521  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48522 aaaatgtaccacgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaa 48568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 497 - 268
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||   ||||| ||||  | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  497 gatgtaaagtttgttgatttaatggttgcgggtaatgaaacagaggatagtgacttcaaggttgatgaccagggtgtattgagattcagaggtagaattt 398  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
     ||||||||| || || ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||    
T  397 atattcctgaaaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccatgattt 298  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  297 gaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Original strand, 4585 - 4814
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||   ||||| ||||  | |||| ||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  4585 gatgtaaagtttgttgatttaatggttgcgggtaatgaaacagaggataatgacttcaaggttgatgattagggtgtattgagattcagaggtagaattt 4684  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || || ||    
T  4685 gtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcataagagtagcttgagtattcatccggaagctacgaaaatgtaccatgattt 4784  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4785 gaagaagctgttttggtggtccggtttgaa 4814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10990 - 10745
Alignment:
Q  6 agtagcagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtg 105  Q
    |||| |||||||||| |  | ||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| || || |||| ||||| |||||||| || ||||    
T  10990 agtatcagagaagcacataaagtttatgtaaagtttgttgatttaatggttgctagcaatgaaactgaaaatggtgacttcaaggttgatgatcagggtg 10891  T
Q  106 tgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg 205  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||||  |||||| ||||||| | |||||||||||||  |||||| | ||||| ||||||||    
T  10890 tgttgaggttcagaggaaggatttgcattcttgataatgatgatttgaaaaagttgattctagaagaaagtcacagaagtagcctaagtattcatccggg 10791  T
Q  206 agctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtct 251  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  10790 agctacaaagatgtatcatgacttgaagaaactgttttggtggtct 10745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Original strand, 5469 - 5697
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||   ||| | ||||  | |||||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |||||||| |||||||    
T  5469 gatgtaaagtttgttgatttaatggttgtatgtagtgaaacacaggatagtgacttcaaagttgatgattagggagtattgagattcagaggtagaattt 5568  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  5569 gtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccacgattt 5668  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    | ||||||| |||||||||||  |||||||    
T  5669 g-aaaagctattttggtggtccagtttgaa 5697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3924 - 3695
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||   | | | |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3924 gatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcattgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaattt 3825  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    | |||||||| || |||||  |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||    
T  3824 gcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcatgattt 3725  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  3724 gaagaagctgttttagtggtctgggttgaa 3695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 102406 - 102177
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  102406 gatgttaagtttgtagatttgttggttgatagtaatgagactgaaaatagtgattttaaaatcgatgaccaaggtgtgttgagattccgaggtagaattt 102307  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |    
T  102306 gtattcctgacgatgaggagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcatgatct 102207  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  102206 gaaaaagttgttttggtggtctgggttgaa 102177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 1197 - 1429
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  1197 gttgatgttaagtttgtagactttttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaa 1296  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |   |||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  1297 tttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgatatttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatatatcatga 1396  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      |||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  1397 tctgaaaaagttgttttggtgatctgggttgaa 1429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 6354 - 6606
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||||| || || | ||| ||||| || ||||||||||||| | |||||   ||| | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  6354 gagaagcaaagcaagtggctgtgaagttagttgatttaatggttgctggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 6453  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||  | |||||  |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6454 atttagaggaagaatttgcattcctgatgatgatgatttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacg 6553  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||  || |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  6554 aaagtgcatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 17107 - 17339
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||| || |  |||||| | ||| |||||||||    
T  17107 gttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagataatgacttcaaggttgatgatcaggaggtgttgcgattctgaggcagaa 17206  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||||| |||  | ||||||||||| | | ||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17207 tttgtattcttgaagatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcacaaaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 17306  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  17307 tttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 17339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 249741 - 249557
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| |||    
T  249741 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaaaaaa 249642  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  249641 gtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaa 249557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Original strand, 1968 - 2159
Alignment:
Q  11 cagagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttg 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||||    
T  1968 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgttgatttgatgattgctagtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttaatgatcagggtgtgttg 2067  T
Q  111 aggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatcc 202  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||  |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2068 aggttccgaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagagaaaagtcacaagagtagcttaagtattcatcc 2159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 265
Target Start/End: Original strand, 100751 - 100920
Alignment:
Q  99 caaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgag---ta 195  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||    
T  100751 caaggtgtgttgagattcagaggaagaatttgtattcctaacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttaagtatta 100850  T
Q  196 tccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  100851 ttcatctgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgatttgaagcgtga 100920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 181375 - 181143
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| || |||||| ||| ||||| |||| || || || ||||| || ||||||||||  ||| ||||| |||    
T  181375 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctaataatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgaaattccgaggccgaa 181276  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||||||| | || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  181275 tttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 181176  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      |||| ||| | || ||||||||||| |||||    
T  181175 tctgaagaagatattctggtggtctggattgaa 181143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13390 - 13136
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||  || ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||   ||| | |||||||| || || || ||||| || |||||||||||    
T  13390 gagaagcacaactagtagatgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatggcactgaggatagtgagtttaaggtggatgatcagggtgtgttgag 13291  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccggg-agctac 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  13290 gttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttcaaaaggttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggaagctac 13191  T
Q  212 gaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttgg-tggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||| |||||||| || || || |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  13190 gaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggttggtccggtttgaagcgtga 13136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Original strand, 7073 - 7164
Alignment:
Q  162 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  7073 attttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgg 7164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6341 - 6156
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||| ||||| || ||||    
T  6341 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagagatagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaggaaa 6242  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  6241 gtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctattttggtggtccagtttgaag 6156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2716 - 2532
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||||||| || || ||||||||  | |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||  ||||||  |||||||| || ||||    
T  2716 gatagtgactttaaggttgatgattagggtgtgttaaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaaattgattttagaggaaa 2617  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2616 gtcacaagagtagcttaattattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctggtttgaa 2532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 13415 - 13667
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||   ||| | |||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  13415 gagaagcacaacaagtggatgtgaagtttgttgatttaatggttgctagtaatggcactgaggatagtgacttcaaggttgatgaaaagggtgtgttgag 13514  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     |||||||| |||||||| |||| |||  | |||||  |||||| ||| ||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||     
T  13515 attcagaggaagaatttgcattcttgatgatgatgatttgaaaaagttaattctagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctaggagctaca 13614  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13615 aaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtga 13667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 279 - 511
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||    
T  279 gttgatgtcaagtgtgtggatttaatggttactagtaatgaaactgaagatcgtgacttcaaggttgacgattagggtgtgttgaggttcagaggaagaa 378  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| |||||||| |  |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||   |||||||| ||||||||| | ||    
T  379 tttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttcgaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatttaggagctacaaagatgtattatga 478  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    | |||| |   |||||||||||||||| |||||    
T  479 cctgaagagattgttttggtggtctgggttgaa 511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28407 - 28173
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||| | |||||   ||| | |||||||| || || ||||||   || |||||||||||    
T  28407 gagaagcacaacaagtggatgtcaagcttgttgatttgatggttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaggttgattttcagggtgtgttgag 28308  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    |||| |||| |||||||||||| || | || |||||  |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||    
T  28307 gttcggaggaagaatttgtatttctaataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctgggatctacg 28208  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtg 247  Q
    || |||||||| || || || ||||||||||||||    
T  28207 aaaatgtatcatgatttcaagaagctgttttggtg 28173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34660 - 34426
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||| | |||||   ||| | |||||||| || || ||||||   || |||||||||||    
T  34660 gagaagcacaacaagtggatgtcaagcttgttgatttgatggttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaggttgattttcagggtgtgttgag 34561  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    |||| |||| |||||||||||| || | || |||||  |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||    
T  34560 gttcggaggaagaatttgtatttctaataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctgggatctacg 34461  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtg 247  Q
    || |||||||| || || || ||||||||||||||    
T  34460 aaaatgtatcatgatttcaagaagctgttttggtg 34426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4316 - 4084
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||| | |||||||| || | ||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||| |||    
T  4316 gttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaggatagtgactttagagttgatgaccaaggtgtgctgagatttcgaggccgaa 4217  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||||| |||| | |||||||| || | | ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||  |||| |||| ||||||||||||||    
T  4216 tttgtattcatgacgatgatgagattaagaagatgattttggaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatttgggatctaccaagatgtatcacga 4117  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  4116 tttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 4084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 259
Target Start/End: Original strand, 116071 - 116267
Alignment:
Q  63 aatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttga 162  Q
    ||||| ||| |||||||||| || || || ||||| || || |||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||    
T  116071 aatcagactgaagatagtgactttaaggtcgatgatcagggagtgttgcgatttcgaggcagaatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaagatga 116170  T
Q  163 ttttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    || | ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  116171 ttcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaa 116267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Original strand, 20574 - 20809
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||| |   ||| | |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20574 gatgtcaagtttgtcgatttgatggttgctggtagtggcactcaggatagtgactttaaggttgatgatcatggtgtgttgagattcagaggaagaattt 20673  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    | ||||||||  | |||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  || ||    
T  20674 gcattcctgatgatgatgatttgaaaaagttgattttagaaaaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatctatcttgattt 20773  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20774 gaagaagcttttttggtggtctgggttgaagcgtga 20809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 230194 - 229987
Alignment:
Q  52 tggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagat 151  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||  | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||    
T  230194 tggttgctagtaatcagactgaagatggtgattttaagatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaatttatattccagacgatgatgagat 230095  T
Q  152 gaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtct 251  Q
    ||| | | ||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||    
T  230094 gaagaagatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttggtttggtggtct 229995  T
Q  252 ggtttgaa 259  Q
    || |||||    
T  229994 ggattgaa 229987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Original strand, 218548 - 218779
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||| |||| | |||||| ||| |  |||| || ||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  218548 ttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacaatgattttaaaatcaatgatcagggattgttgagattccgaggcagaat 218647  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  218648 ttgtattcctgataatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgat 218747  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  218748 ttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 218779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 261427 - 261252
Alignment:
Q  84 ttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaaga 183  Q
    ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||  |||||| ||| ||||| |||||| |||||||||    
T  261427 ttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtgttcttgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaagaaggtcacaaga 261328  T
Q  184 gtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  261327 gtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaa 261252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 277985 - 278156
Alignment:
Q  52 tggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagat 151  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || || || ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  | || |||||    
T  277985 tggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggccgaatttgtattcctgatgatgaagagat 278084  T
Q  152 gaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    ||| |   ||||| | ||||| ||||| |  ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  278085 gaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaggttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatca 278156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10146 - 9920
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||| | ||  |||||| ||||||||| || ||||||| ||| || || || ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  10146 gttgatgttaagtttgtgtacttgttggttgctagtaatcagacaaaagataatgactttaaggtcgatgaccaaggtgtgttgagattctgaggaagaa 10047  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  10046 tttgtattcatgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagcattcatccaggagctacgaagatgtatcatga 9947  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9946 tttgaaaaagttgttttggtggtctgg 9920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11923 - 11690
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgag 112  Q
    |||||||  |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||  | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  11923 gagaagcgcaacaagtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgctggtaatgaaacagaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgag 11824  T
Q  113 gttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  11823 attcataggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgatcttagaagaaagtcataagagtagcttaagtattcatccaggagctaca 11724  T
Q  213 aagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggt 246  Q
    || |||||||| || ||||| ||| |||||||||    
T  11723 aaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggt 11690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16050 - 15821
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||  ||||||  |||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||  |||  | |||||    
T  16050 gatgttaagtttgtggacttgttggttgcaagtaatcagacggaagatagtgacttcaaagtcgatgatcagggtgtgttgagatttcgagatataattt 15951  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |   ||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  15950 gtattcctgacgacgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctactaagatgtatcatgattt 15851  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  15850 gaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 15821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 259
Target Start/End: Original strand, 112650 - 112850
Alignment:
Q  59 tagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaagg 158  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| | ||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| | || |||||||| | |    
T  112650 tagtaatcatactgaagatggtgattttaaaatcgatgatcgaggtgtgttgagattccgaggtagaatttgtattccagacgatgaggagatgaagaag 112749  T
Q  159 ttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttga 258  Q
     ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  112750 atgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctgggttga 112849  T
Q  259 a 259  Q
    |    
T  112850 a 112850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5047 - 4815
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||| | ||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||    
T  5047 gttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatagtgactttaaaatcgatgatcaaggagtgttgagattccgagccagaa 4948  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4947 tttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatga 4848  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     ||||| ||| ||||||||| |||||| |||||    
T  4847 tttgaagaagttgttttggtcgtctgggttgaa 4815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12177 - 11945
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||| | ||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||    
T  12177 gttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatagtgactttaaaatcgatgatcaaggagtgttgagattccgagccagaa 12078  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  12077 tttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatga 11978  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     ||||| ||| ||||||||| |||||| |||||    
T  11977 tttgaagaagttgttttggtcgtctgggttgaa 11945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17856 - 17633
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||| | ||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  17856 ttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagataatgattttaaaatcgatgatcagggagtgttgagattctgaggcagaat 17757  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  17756 ttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttaagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgat 17657  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtct 251  Q
     |||| ||| ||||||||||||||    
T  17656 ctgaagaagttgttttggtggtct 17633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Original strand, 670 - 886
Alignment:
Q  15 gaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggt 114  Q
    |||||| |||| || ||||||||| | || ||||| ||||||| | |||||   ||| | |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||    
T  670 gaagcacaacaagtggatgtcaagctggttgatttgatggttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaggttgatgatcaaggtgtattgaggt 769  T
Q  115 tcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaa 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  770 tcagaggaagaatttgtattcctgataatga-gagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacgaa 868  T
Q  215 gatgtatcacgacttgaa 232  Q
     |||||||| || |||||    
T  869 aatgtatcatgatttgaa 886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13234 - 13008
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||||| ||  |||| || |    
T  13234 gttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaagatcgatgatcaaggtgtgttgagatttcgaggtagga 13135  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||    
T  13134 tttgtattccagacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcaccctggagctacgaagatgtatcatga 13035  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
      | || ||| ||||||||| ||||||    
T  13034 tctaaagaagttgttttggttgtctgg 13008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7193 - 6967
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| || ||  |||||| |||| |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||| |||||| ||||| ||||| || ||||    
T  7193 gatgttaagtttgttgacttgttggttgctagtgatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaagctgtgttaaggtttagaggtaggattt 7094  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |    
T  7093 gtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccaggagctacgaagatgtaccacgatct 6994  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
       |||| |||||||||||||||| |||||    
T  6993 ---aaagttgttttggtggtctggattgaa 6967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Original strand, 39876 - 40121
Alignment:
Q  14 agaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgagg 113  Q
    ||||||| || | |||||| | |||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  39876 agaagcacaaaaagttgatattaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggcgtgttgaga 39975  T
Q  114 ttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacga 213  Q
    ||  |||| ||||||||||||||| | || |||||  |||||| ||||||||| ||||| | |||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  39976 tttcgaggaagaatttgtattccttataatgatgaattgaaaaagttgattttagaagatattcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaa 40075  T
Q  214 agatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || |||||    
T  40076 agatttatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaa 40121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 251
Target Start/End: Original strand, 11330 - 11551
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||||    
T  11330 gatgttaagtttgtggatttgttggttgctagtaatccgactgaagatagtgacttcaaagtcgatgatcaaggagtgttgagattctgaggtagaattt 11429  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| | | ||| | |  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||    
T  11430 gtattccagacgatgatgagatgaagaagatgactcttaaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcattattt 11529  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtct 251  Q
    ||| | | ||||||||||||||    
T  11530 gaagaggttgttttggtggtct 11551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 251
Target Start/End: Original strand, 17522 - 17743
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||||    
T  17522 gatgttaagtttgtggatttgttggttgctagtaatccgactgaagatagtgacttcaaagtcgatgatcaaggagtgttgagattctgaggtagaattt 17621  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| | | ||| | |  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||    
T  17622 gtattccagacgatgatgagatgaagaagatgactcttaaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcattattt 17721  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtct 251  Q
    ||| | | ||||||||||||||    
T  17722 gaagaggttgttttggtggtct 17743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 259
Target Start/End: Original strand, 14245 - 14441
Alignment:
Q  63 aatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttga 162  Q
    ||||| ||| |||||||||| || || || ||||| || || |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | |||    
T  14245 aatcagactgaagatagtgactttaaggtcgatgatcagggagtgttgcggtttcgaggcagaatttgtattcctgactatgatgagatgaagaagatga 14344  T
Q  163 ttttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    || | ||||| |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  14345 ttcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatcagggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 14441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 26074 - 26306
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  | |||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||    
T  26074 gttgatgttaagtttgtagacttgttagttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagatttcgaggtagaa 26173  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26174 tttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaaatagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 26273  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     ||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  26274 tttgaaaaagttattttggtggtctgggttgaa 26306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 8217 - 8449
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||  | ||  |||||| ||||||||| ||| |||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  8217 gttgatgttaagtttgtatacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgagtttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaa 8316  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| | ||| |  ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  8317 tttgtattcatgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagaatcatagaagtggcttaagtatccatccgggagctacgcagatgtatcatga 8416  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  8417 tttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaa 8449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 259
Target Start/End: Original strand, 25079 - 25227
Alignment:
Q  111 aggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagcta 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25079 aggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagcta 25178  T
Q  211 cgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25179 cgaaaatgtatcctgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaa 25227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Original strand, 7278 - 7507
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||   ||||| | ||  | |||||||| ||||| ||| |||| || |||||  ||||||||||||| ||| |||    
T  7278 gatgtaaagtttgttgatttaatggttgcgggtaatgagacagaggatagtgacttcaaggtttatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagttt 7377  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||||||||| || ||    
T  7378 gtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgagggctacaaagatgtatcatgattt 7477  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  7478 gaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 7507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5206 - 4969
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    ||||||| |||||||| || ||  ||||||  |||||||| ||| |||||||||| || || || ||||| || || |||||| | ||  ||||||||||    
T  5206 ttgatgttaagtttgtagacttgttggttgcaagtaatcagactgaagatagtgactttaaggtcgatgatcagggagtgttgcgttttcgaggcagaat 5107  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  5106 ttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcataaaagtagcttgagtaatcatccgggagctacgaagatgtatcatgat 5007  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    || || ||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5006 ttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaatgtga 4969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 265
Target Start/End: Original strand, 10596 - 10825
Alignment:
Q  36 aagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattc 135  Q
    |||||||| ||||| ||||||  | ||||| | ||| | |||||||| || || |||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10596 aagtttgttgatttgatggttattggtaatgacactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagagggagaatttgcattc 10695  T
Q  136 ctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaa 235  Q
    || |  | ||||   |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  10696 ctaatgatgatggtttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaa 10795  T
Q  236 gctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    | |||||||||||||  |||||||| ||||    
T  10796 gttgttttggtggtccagtttgaagcgtga 10825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 265
Target Start/End: Original strand, 20810 - 21039
Alignment:
Q  36 aagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattc 135  Q
    |||||||| ||||| ||||||  | ||||| | ||| | |||||||| || || |||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20810 aagtttgttgatttgatggttattggtaatgacactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagagggagaatttgcattc 20909  T
Q  136 ctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaa 235  Q
    || |  | ||||   |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  20910 ctaatgatgatggtttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaa 21009  T
Q  236 gctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    | |||||||||||||  |||||||| ||||    
T  21010 gttgttttggtggtccagtttgaagcgtga 21039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26847 - 26756
Alignment:
Q  162 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| | | ||||||||||| ||||    
T  26847 attttggatgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcatgatttgaagaggttgttttggtggcctgg 26756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 259
Target Start/End: Original strand, 51016 - 51225
Alignment:
Q  50 aatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgag 149  Q
    |||||||  ||||||| |||||  ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||     
T  51016 aatggtttctagtaatgaaactggagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgat 51115  T
Q  150 atgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggt 249  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| |   ||||||||||||    
T  51116 ttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtaacttaagtattcatctaggagctacaaagatgtatcatgatttgaagagattgttttggtggt 51215  T
Q  250 ctggtttgaa 259  Q
    |||| |||||    
T  51216 ctgggttgaa 51225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 43911 - 43727
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||| ||| | ||||| |    
T  43911 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgttttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttaattctagaagaga 43812  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||  | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  43811 gtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtacaatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 43727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 3587 - 3819
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||| || |||||| ||| ||| ||||||||| ||| | ||||  ||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  3587 gttgatgttaagtttgtagacttggtggttgctaataatcagactgaaggtagtgattttaaaatcgatgctcaaggtgcgttgagattccgaggtagaa 3686  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  3687 tttgtattcctgacggtgatgagatgaaaaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatga 3786  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      |||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  3787 tctgaagaagttgttttggtggtctggattgaa 3819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 59928 - 59698
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||  |    |||||||    
T  59928 gatgtgaagttagtagacttaatggttgggaacaatcagactaaagatagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcggaatagaattt 59829  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||||||  |    || ||||| | | ||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||    
T  59828 gtattcctgatgatacagaaatgaagaagatgattatggaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcaagattt 59729  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
     || ||| | ||||||||||| || ||||||    
T  59728 taagaagttattttggtggtccgggttgaag 59698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 131281 - 131051
Alignment:
Q  29 tgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatt 128  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||| |||| |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||  |||||||  ||||  | |||    
T  131281 tgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtactgaggtttcgaggtcggatt 131182  T
Q  129 tgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgact 228  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| || || |  || | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||      
T  131181 tgtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagcaacttgagtattcatccgggagctacgaagaggtatcatgatc 131082  T
Q  229 tgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    | || ||| |||||||||||||||| |||||    
T  131081 taaagaagttgttttggtggtctggattgaa 131051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Original strand, 28502 - 28698
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||| | || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||  | |    
T  28502 gttgatgtcaagtttatagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagtcgatgaccatggtgtgttgagtttccgaggtcgga 28601  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    ||||||||||| || | |  ||| |||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28602 tttgtattccttacgatgtagagttgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatca 28698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2075 - 1860
Alignment:
Q  36 aagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattc 135  Q
    |||||||| |||||| || ||| | | ||||| ||| | |||||||| || ||||||||||| || || |||||| | ||  ||||||||||||||||||    
T  2075 aagtttgtagatttattgattggtggaaatcagactgaggatagtgactttaaagttgatgatcagggagtgttgcgatttcgaggcagaatttgtattc 1976  T
Q  136 ctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaa 235  Q
     |||||| |||||||| || | | ||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||    
T  1975 ttgacaatgatgagataaagaagatgattctcgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctataaagatgtatcatgatttgaagaa 1876  T
Q  236 gctgttttggtggtct 251  Q
    ||||||||||||||||    
T  1875 gctgttttggtggtct 1860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 80 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8489 - 8310
Alignment:
Q  80 tgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcac 179  Q
    |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||||    
T  8489 tgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcac 8390  T
Q  180 aagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  8389 aggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 8310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 15891 - 16075
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||| |||| | ||||||| | || || |    
T  15891 gatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 15990  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  15991 gtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 16075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 10613 - 10501
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| | | |||||||||    
T  10613 gttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatgaaggtgtgttgagataccgaggcagaa 10514  T
Q  127 tttgtattcctga 139  Q
    ||||||| |||||    
T  10513 tttgtatccctga 10501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 871 - 640
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    ||||||| |||||||| || ||  |||| | ||||||||| ||| | ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||  |||| || ||    
T  871 ttgatgttaagtttgtagagttgttggtggctagtaatcagactgaggatagtgattttaaaatcgatgatcaagctgtgttgaggtttcgaggtaggat 772  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  771 ttctattccagacgacgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgattattcatccgggagctacgaagatgtatcatgat 672  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  671 ttgaagaagttgttttggtggtctggattgaa 640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7190 - 6958
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| ||| ||||  |||    
T  7190 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagcaatcaaactgaagatggtgattttaaagtcgatgaccttggtgtgttgagattccgaggtcgaa 7091  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||||||  | || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  7090 tttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctatgaagatgtatcatga 6991  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | |||||||||||||| |||||    
T  6990 tctaaagaagatattttggtggtctggattgaa 6958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 251
Target Start/End: Original strand, 7021 - 7245
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||| |||| ||| |||||| ||| || || || ||||| || || |||||| | ||  |||| ||||    
T  7021 gttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcagactgaagataatgactttaaggtcgatgatcagggagtgttgcgtttttgaggtagaa 7120  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||||||| || | ||||| ||||| | | ||||| | ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7121 tttgtattccttacgatgatgaaatgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatga 7220  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtct 251  Q
      | || ||| ||||||||||||||    
T  7221 tctaaagaagatgttttggtggtct 7245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 265
Target Start/End: Original strand, 81013 - 81200
Alignment:
Q  78 agtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtc 177  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||| | ||||| ||||    
T  81013 agtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattcttgaagagagtc 81112  T
Q  178 acaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  81113 acaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggcggtccggtttgaaatgtga 81200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1852 - 1614
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| | || || |||||||||||||| || ||||| || |    
T  1852 gttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacgatcaaggtgtgttgagatttagaggaagga 1753  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||  ||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| |||||    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  1752 tttgtattctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcattgaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgcaccatga 1653  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
     ||||| | | ||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  1652 tttgaagatgttgttttgatggtctggattgaagcgtga 1614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 50608 - 50415
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||  ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||    
T  50608 gttgatgttaagtttgtagacttgttggttactagtaatcagactgaagacagtgattttaaaattgatgatcaaggtgtattgaggtttcgaggtagaa 50509  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgta 220  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50508 tttgtattccagaagatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgta 50415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19778 - 19582
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||   ||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || || || ||||| || ||||||||||| ||| ||||  |||    
T  19778 gttgatgttaagtttgtagacttgtcggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaa 19679  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    |||||||||||||| | || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  19678 tttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcctaagtattcacccggcagctacgaagatgtatca 19582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35202 - 35006
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||   ||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || || || ||||| || ||||||||||| ||| ||||  |||    
T  35202 gttgatgttaagtttgtagacttgtcggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaa 35103  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    |||||||||||||  | || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  35102 tttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcctaagtattcacccggcagctacgaagatgtatca 35006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 129 - 1
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||  |||||| ||||||||| || ||||    
T  129 gatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaa 30  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccg 203  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29 gtcacaagagtagcttaagtattcatccg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8115 - 7883
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  8115 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaa 8016  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    ||||||| |  ||||| || ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  8015 tttgtatcctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatttatcatga 7916  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  7915 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 7883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16830 - 16599
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||| |||| || ||  |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||    
T  16830 gttgatgttaaggttgtagacttgttggttgctagtaatcagacagaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtcttgaggtttcgaggtagaa 16731  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| ||||| ||| | | ||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16730 tttgcattccagacgatg-tgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 16632  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | |||||| | |||||||||||||| |||||    
T  16631 tctaaaaaagttattttggtggtctggattgaa 16599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 32497 - 32681
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| | ||||| |    
T  32497 gatagtgacttcaaggtagatgatcagggtgtaatgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattctagaagaga 32596  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |  ||  |||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  32597 gtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccgtgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 32681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 66581 - 66349
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||  ||| ||||  |||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||  | |    
T  66581 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcggactgaagacggtgactttaaagttgatgatcacggtgtgttgagattccgaggtcgga 66482  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| ||||||||| | |  |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  66481 tttgcattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccatctgggagctacgaaaatgtatcacga 66382  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  66381 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 66349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Original strand, 38950 - 39146
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||| ||| | || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || ||  ||||||| || ||||||||||| ||| |||   |||    
T  38950 gttgatgtcaattttttagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaagcttgatgaccatggtgtgttgagattccgagatcgaa 39049  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    |||||||||||||| | || |||||||| |   ||||| | ||||| | ||| |  |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  39050 tttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagactcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtatca 39146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 57193 - 56961
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| ||| ||||  |||| || ||||| || || || ||||||||||| ||| ||||  | |    
T  57193 gttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggtcgga 57094  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||  ||||||||| | |  |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  57093 tttacattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccacccgggagctacgaagatgtatcacga 56994  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  56993 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 56961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Original strand, 19197 - 19393
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||| ||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||||||| || |||| |||||||||| ||||  | |    
T  19197 gttgatgtccagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagttgatgaccatggtgcgttgaggttccgaggtcgga 19296  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    |||| ||||||||| | |  |||||||| |   ||||| | ||| | ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19297 tttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaatagagtcatataagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatca 19393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Original strand, 196608 - 196804
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||  | |    
T  196608 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagttgatgaccatcgtgtgttgagattccgaggtcgta 196707  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    |||| ||||||||| | |  |||||||| |   ||||| | || || || || |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  196708 tttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaggagagccatagaagtagcttgagtattcaaccgggagctacgaagatgtatca 196804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 251
Target Start/End: Original strand, 18346 - 18569
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  |||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| | ||||| || || |||||| | ||  ||  ||||||    
T  18346 ttgatgttaagtttgtggacttgttggtttctagtaatcagactgaagattgtgattttaaaatcgatgatcagggagtgttgcgttttcgattcagaat 18445  T
Q  128 ttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgac 227  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||     
T  18446 ttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacctgggagctacgaagatgtatcatgat 18545  T
Q  228 ttgaaaaagctgttttggtggtct 251  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||    
T  18546 ttgaagaagttgttttggtggtct 18569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 896 - 802
Alignment:
Q  171 gaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  896 gaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccggtttgaagcgtga 802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Original strand, 4725 - 4945
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||  |  ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||  |     ||||||    
T  4725 gatgtgaagttggtagatttaatggttgggaacaatcagactgaagatagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcggaattgaattt 4824  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    |||||||||| ||    || ||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  4825 gtattcctgataatacagaaatgaaaaagatgattctggaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcacgattt 4924  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtc 250  Q
    ||| ||| | |||||||||||    
T  4925 gaagaagttattttggtggtc 4945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0719 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0719
Description:

Target: scaffold0719; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 64 - 296
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||  ||||  || ||||  ||||||| ||| | |||||  |||| |||||||| ||| |||| ||||    
T  64 gttgatgtaaagtttgtggatttgctggttgccagagatcaggctgaagacggtgattttaaaatcgatgatgaaggcgtgttgagattccgagggagaa 163  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || | | ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  164 tttgtattccagacaacgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 263  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || |||||||||||||||||    
T  264 tctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2069 - 1849
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  | |||| ||||||||| ||| |||| | |||||| ||| | ||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||    
T  2069 gttgatgttaagtttgtagacttggtagttgctagtaatcagactgaagacaatgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttcagattccgaggtagaa 1970  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||  ||| | || |||||||| | | ||||| |  |||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  1969 tttgtattctagacgatgaggagatgaagaagatgattctcaaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatga 1870  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtg 247  Q
     ||||||||| | ||||||||    
T  1869 tttgaaaaagttattttggtg 1849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7225 - 6993
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  | |||| |||| |||| |||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||  |||||||  ||||  | |    
T  7225 gttgatgttaagtttgtggacttgttagttgttagtgatcagactaaagacagtgattttaaaatcgataatcaaggtgtactgaggttttgaggtcgga 7126  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| || || |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7125 tttgtattcccgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatga 7026  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | |||||| ||||||||||||| || |||||    
T  7025 tctaaaaaagttgttttggtggtccggattgaa 6993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 191
Target Start/End: Original strand, 3739 - 3903
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  ||||||  |||||||||||  |||| || ||| | ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  3739 gttgatgttaagtttgttgacttcttggttgcaagtaatcaaaccgaagacagcgatattaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaa 3838  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttg 191  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| | | ||||| | ||||| || || | ||||||||||    
T  3839 tttgtattccagacgatgatgagatgaacaagatgattcttgaagagagccataggagtagcttg 3903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27389 - 27205
Alignment:
Q  75 gatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 174  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||  | |||||  |||| | ||||||| | || || |    
T  27389 gatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcaaaggaagagtttgtattcctgatcatgatgatttgaagaagttgattcttgaggaga 27290  T
Q  175 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  27289 gtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaa 27205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6397 - 6173
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| | |||||  |||||||||||| |||  |||| || |    
T  6397 gttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgataaaggtgtgttgaagtttcgaggtagga 6298  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| ||||  ||||| ||||||||||| |   ||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  6297 tttgcattctagacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatctgggagctatgaagatgtaccacga 6198  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtct 251  Q
      | || ||| |||||| |||||||    
T  6197 tctaaagaagttgttttagtggtct 6173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 4483 - 4715
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||| | || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||  |||    
T  4483 gttgatgtcaagtttttagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggttgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaa 4582  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||| |   ||||| | |||||  |||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  4583 tttgcattcctgacgatgaagagatgaagataatgattcttgaagagggtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatga 4682  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | |||||||||||||| |||||    
T  4683 tctaaagaagatattttggtggtctggattgaa 4715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 121
Target Start/End: Original strand, 6224 - 6315
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagagg 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6224 gatgccaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaaactgaagatggtgacttcaaagttgatgatcaaggtgtgttaaggttcagagg 6315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 6322 - 6398
Alignment:
Q  183 agtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  6322 agtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaa 6398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 259
Target Start/End: Original strand, 14343 - 14573
Alignment:
Q  29 tgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatt 128  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||| |||| |||||||| |||| | ||| || ||| | ||||| ||||||||| |||||||  ||||  | |||    
T  14343 tgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcaaactgaagacaatgaatttaaaatcgatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatt 14442  T
Q  129 tgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgact 228  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| || || |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||      
T  14443 tgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatc 14542  T
Q  229 tgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    | || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  14543 taaagaagttgttttggtggtccggattgaa 14573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 259
Target Start/End: Original strand, 19134 - 19364
Alignment:
Q  29 tgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatt 128  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||| |||| |||||||| |||| | ||| || ||| | ||||| ||||||||| |||||||  ||||  | |||    
T  19134 tgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcaaactgaagacaatgaatttaaaatcgatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatt 19233  T
Q  129 tgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgact 228  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| || || |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||      
T  19234 tgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatc 19333  T
Q  229 tgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    | || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  19334 taaagaagttgttttggtggtccggattgaa 19364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20513 - 20332
Alignment:
Q  84 ttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaaga 183  Q
    ||||| |||||||| || |||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||  |||| | ||||||| | ||||| ||||||||||    
T  20513 ttcaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcataggaagaatttgtattcctgagaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcacaaga 20414  T
Q  184 gtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||| |||||||| || || || ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  20413 gtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaatctgttttggtggtccggtttaaagcgtga 20332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23333 - 23152
Alignment:
Q  84 ttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaaga 183  Q
    ||||| |||||||| || |||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||  |||| | ||||||| | ||||| ||||||||||    
T  23333 ttcaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcataggaagaatttgtattcctgagaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcacaaga 23234  T
Q  184 gtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    |||| |||||||| || || || ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  23233 gtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaatctgttttggtggtccggtttaaagcgtga 23152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8573 - 8344
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||| ||| |||| | |||||| ||| | ||||  |||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  8573 gttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacaatgattttaaaatcgatggtcaaggtgtgttgagattccaaggaagaa 8474  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||||||||| ||||| |  ||||| |  | | ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8473 tttgtattccagacaatggagagattacgaagatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacga 8374  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggttt 256  Q
     || || ||| | || ||||||||||||||    
T  8373 tttaaagaagattttctggtggtctggttt 8344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 49357 - 49163
Alignment:
Q  29 tgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatt 128  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||| |||| |||| ||| |||| | |||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||  ||||  | |||    
T  49357 tgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcagactgaagacaatgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatt 49258  T
Q  129 tgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| |   ||||| | ||||| || || || |||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  49257 tgtattcccgacgacaatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccataaaagtaacttgagtattcatccggcagatacgaagatgtatca 49163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Original strand, 3405 - 3505
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||  |||  |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3405 gatgtcaagtttgtggatttgatggttgctagtaatcaaactgaagatgttgacatcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaattt 3504  T
Q  130 g 130  Q
    |    
T  3505 g 3505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Original strand, 2944 - 3140
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||| | ||| ||||| |||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||  | |    
T  2944 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaataagactgaagatggtgactttaaagtcgatgaccatggtgtgttgaggttccgaggtcgga 3043  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  3044 tttgtattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatca 3140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Original strand, 30418 - 30518
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||  |||  |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30418 gatgtcaagtttgtggatttgatggttgctagtaatcaaactgaagatgttgacatcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaattt 30517  T
Q  130 g 130  Q
    |    
T  30518 g 30518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 32703 - 32935
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||| | || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||  |||| || ||||| || || || ||||||||||| ||| ||||  | |    
T  32703 gttgatgtcaagtttctagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggtcgga 32802  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| ||||||||| | |  |||||||| |   ||||| | || || ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32803 tttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacga 32902  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  32903 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 32935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9772 - 9540
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| | | ||||  |||| || ||||| || || || ||||||||||| ||| ||||  | |    
T  9772 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagaatgaagacggtgaatttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggtcgga 9673  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| ||||||||| | |  |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9672 tttgcattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctgggtgctacgaagatgtatcacga 9573  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  9572 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 9540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 63161 - 63393
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| ||||  |||| || ||||| ||  | |||||||||||||| ||  ||||  |||    
T  63161 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagaaggtgactttaaagtcgaaaaacaaggtgtgttgagattacgaggtcgaa 63260  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  63261 tttgaattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacga 63360  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
      | || ||| | || ||||||||||| |||||    
T  63361 tctaaagaagatattctggtggtctggattgaa 63393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13640 - 13406
Alignment:
Q  31 atgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttg 130  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||| || ||||||||| |||  |||  |||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||| ||||  | |||||    
T  13640 atgttaagtttgtggacttgttggatgctagtaatcagactggagacggtgactttaaagtcgatgaccacggcgtgttgagattccgaggtcggatttg 13541  T
Q  131 tattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttg 230  Q
     ||||||||| | |  |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  13540 cattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgattta 13441  T
Q  231 aaaaagctgttttggtggtctggtttgaagtgtga 265  Q
    || ||| | || ||||||||||||||||| |||||    
T  13440 aagaagattttctggtggtctggtttgaaatgtga 13406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 242
Target Start/End: Original strand, 10240 - 10361
Alignment:
Q  121 gcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgta 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |   ||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10240 gcagaatttgtattcctgacgacgatgacatgaagaaaatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtatacatccgggagctacaaagatgta 10339  T
Q  221 tcacgacttgaaaaagctgttt 242  Q
    ||| || ||||| ||| |||||    
T  10340 tcatgatttgaagaagttgttt 10361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 3535 - 3767
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||| | | ||||  |||| || ||||| || || || ||||||||||| ||| ||||  | |    
T  3535 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagaatgaagacggtgaatttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggtcgga 3634  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacga 226  Q
    |||| ||||||||| | |  |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3635 tttgcattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctgggtgctacgaagatgtatcacga 3734  T
Q  227 cttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  3735 tttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 3767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 259
Target Start/End: Original strand, 6510 - 6598
Alignment:
Q  171 gaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  6510 gaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaa 6598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 259
Target Start/End: Original strand, 10941 - 11029
Alignment:
Q  171 gaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  10941 gaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaa 11029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Original strand, 6446 - 6490
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttg 57  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6446 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgttgatttgatggttg 6490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Original strand, 10877 - 10921
Alignment:
Q  13 gagaagcaaaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttg 57  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10877 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgttgatttgatggttg 10921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7198 - 7127
Alignment:
Q  189 ttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaag 260  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7198 ttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaag 7127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2445 - 2209
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| ||||||||| | ||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||  |||| || |    
T  2445 gttgatgttaagtttgtgtacttgttggttgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtagga 2346  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcaca---ag-agtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatc 222  Q
    ||||| |||| ||| | || |||||||| |   ||||| | ||| | ||||| |   || |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  2345 tttgtcttccagacgatgacgagatgaagaaaatgattcttgaatagagtcatatatagaagtaacttgagtattcatccgggagctccgaagatgtagc 2246  T
Q  223 acgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    | ||  | || ||| |||||||||||||||| |||||    
T  2245 atgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaa 2209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Original strand, 7464 - 7693
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| || ||  |||||| |||  |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||  |||||||  |||| || ||||    
T  7464 gatgttaagtttgtagacttgttggttgttagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtactgaggtttcgaggtaggattt 7563  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgactt 229  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| || || |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  7564 gtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatct 7663  T
Q  230 gaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
     || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  7664 aaagaagttgttttggtggtccggattgaa 7693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 212
Target Start/End: Original strand, 39033 - 39218
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||| |||| |||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| ||||| ||| |||||||  |||| || |    
T  39033 gttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtgatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggagtgatgaggtttcgaggtagga 39132  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacg 212  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  39133 tttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtaacttgagtattcatccgggagctacg 39218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3370 - 3174
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||  |||||||| ||| ||||| |||| || || || ||||| || ||||||||||| ||| ||||   ||    
T  3370 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgccagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtttaa 3271  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    |||||||||||||  | || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  3270 tttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacctgggagctacgaagatgtatca 3174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22887 - 22811
Alignment:
Q  183 agtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||||||||    
T  22887 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaaaattttttggtggtctggtttgaa 22811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8810 - 8734
Alignment:
Q  183 agtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  8810 agtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatgacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 8734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1434 - 1358
Alignment:
Q  183 agtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||| | || |||||||||||||||||    
T  1434 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 1358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28058 - 27926
Alignment:
Q  78 agtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtc 177  Q
    |||||||||||  |||||||  | |||||  |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| | ||||| ||||    
T  28058 agtgatttcaagattgatgattagggtgtactgagattcagaggaagagtttgtattcctgacaacgatgaattgaggaagttgattcttgaagagagtc 27959  T
Q  178 acaagagtagcttgagtatccatccgggagcta 210  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  27958 acaagagtagattgagtattcacccgggggcta 27926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Original strand, 79624 - 79820
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||| ||| ||||  |||| || || || ||||| || ||||||||||| ||  |||    ||    
T  79624 gttgatgtcaagtttgtagacttattggtagctagtaatcagactgaagaaggtgaatttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattacgagatcaaa 79723  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    |||||||||||||  | || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  79724 tttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcaaccgggagctacgaagatgtatca 79820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 154
Target Start/End: Original strand, 18087 - 18214
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||| |||||| || |||| ||||    
T  18087 gttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtattgaggatccgaggtagaa 18186  T
Q  127 tttgtattcctgacaacgatgagatgaa 154  Q
    |||||||||| ||| | || ||||||||    
T  18187 tttgtattccagacgatgaagagatgaa 18214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40773 - 40682
Alignment:
Q  168 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||  | |||||||||||||| |||||    
T  40773 gaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgagagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaatttttttggtggtctgggttgaa 40682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 138
Target Start/End: Original strand, 15613 - 15723
Alignment:
Q  28 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaat 127  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| | ||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  15613 ttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgattttaaaatcgatgatcagggagtgttgagattccgaggcagaat 15712  T
Q  128 ttgtattcctg 138  Q
    |||||| ||||    
T  15713 ttgtatccctg 15723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 2612 - 2503
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||  |||||| ||||||||| ||| |||| | |||||| ||| | ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  2612 gttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacaatgattttaaaatcgatgaccaaggtgtgttgaagtttagaggtagaa 2513  T
Q  127 tttgtattcc 136  Q
    ||||||||||    
T  2512 tttgtattcc 2503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 2487 - 2417
Alignment:
Q  183 agtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| || || ||||||||||||||    
T  2487 agtagcttaagtattgatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaactattttggtggtctgg 2417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 259
Target Start/End: Original strand, 25006 - 25081
Alignment:
Q  184 gtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  25006 gtagcttgagtattcattagggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 25081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 151
Target Start/End: Original strand, 24840 - 24961
Alignment:
Q  30 gatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaattt 129  Q
    ||||| |||||||| |||||| || ||| | | ||||| ||| | |||||||| || ||||||||| | || || |||||| | ||  ||||||||||||    
T  24840 gatgtaaagtttgtagatttattgattggtggaaatcagactgaggatagtgacttaaaagttgataatcagggagtgttgcgatttcgaggcagaattt 24939  T
Q  130 gtattcctgacaacgatgagat 151  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  24940 gtattcctaacaatgatgagat 24961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3451 - 3318
Alignment:
Q  126 atttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacg 225  Q
    ||||||||||| ||| | || |||||||| |   ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3451 atttgtattccagacgatgaggagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccacg 3352  T
Q  226 acttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaa 259  Q
    |  | || ||| |||| ||||||||||| |||||    
T  3351 atctaaagaagttgttctggtggtctggattgaa 3318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 219
Target Start/End: Original strand, 28 - 145
Alignment:
Q  102 ggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatc 201  Q
    ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| | || |||||||| |   | ||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || |    
T  28 ggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacc 127  T
Q  202 cgggagctacgaagatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  128 cgggagctacgaagatgt 145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8307 - 8215
Alignment:
Q  161 gattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    ||||||||| ||| |||| | |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||    
T  8307 gattttggacgaaggtcaaaggagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggctgttttggtggcctgg 8215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25994 - 25954
Alignment:
Q  183 agtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatca 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25994 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatca 25954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 90 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 71 - 13
Alignment:
Q  90 gttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgacaacgatga 148  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  71 gttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatga 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 253
Target Start/End: Original strand, 3207 - 3300
Alignment:
Q  160 tgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    |||||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| | | ||||||||||| ||||    
T  3207 tgattttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgg 3300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10336 - 10244
Alignment:
Q  161 gattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    ||||||||| ||| |||| | |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| | | ||||||||||| ||||    
T  10336 gattttggacgaaggtcataggagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctgg 10244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Original strand, 3140 - 3231
Alignment:
Q  162 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  3140 attttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgg 3231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24435 - 24344
Alignment:
Q  162 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    |||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  24435 attttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgg 24344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 232
Target Start/End: Original strand, 85772 - 85854
Alignment:
Q  150 atgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaa 232  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||  || |  ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  85772 atgaaaaagatgattttggaagaaagtcacataagcaatttgagtatttatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaa 85854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3584 - 3492
Alignment:
Q  161 gattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    ||||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| | | ||||||||||| ||||    
T  3584 gattttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctgg 3492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 139
Target Start/End: Original strand, 29701 - 29813
Alignment:
Q  27 gttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaaactaaagatagtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtgttgaggttcagaggcagaa 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||| | ||||||| ||| ||||| |||| || |  || ||||| || |||||||| || ||| ||||  |||    
T  29701 gttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgcttgtaatcagactgaagatggtgactttatggtcgatgaccatggtgtgttaagattccgaggtcgaa 29800  T
Q  127 tttgtattcctga 139  Q
    |||||||||||||    
T  29801 tttgtattcctga 29813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19089 - 18997
Alignment:
Q  161 gattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    ||||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| | | ||||||||||| ||||    
T  19089 gattttggacgaaggtcatagaagtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctgg 18997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 72231 - 72139
Alignment:
Q  161 gattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctgg 253  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||| | | ||||||||||| ||||    
T  72231 gattttggacgaaggtcacaggagtagtctgagtattcatccaggagcaaataagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctgg 72139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University