View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10954A_low_469 (Length: 241)

Name: NF10954A_low_469
Description: NF10954A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10954A_low_469
NF10954A_low_469
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (15-183)||(20254307-20254475)
chr1 (36-226)||(7641048-7641237)
chr1 (36-226)||(22035400-22035589)
chr1 (15-134)||(21650133-21650252)
chr1 (68-199)||(21194991-21195122)
chr1 (129-173)||(46523394-46523438)
chr1 (66-134)||(52400674-52400741)
chr1 (137-184)||(17004632-17004679)
chr1 (137-184)||(18059973-18060020)
chr1 (137-184)||(38055306-38055353)
chr1 (66-119)||(49997418-49997470)
chr1 (49-133)||(20177219-20177302)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (15-226)||(19629282-19629492)
chr6 (15-226)||(16300074-16300283)
chr6 (36-226)||(29869890-29870079)
chr6 (15-226)||(32276857-32277068)
chr6 (15-133)||(4991116-4991234)
chr6 (15-117)||(18823481-18823583)
chr6 (15-117)||(18839336-18839438)
chr6 (129-218)||(19609978-19610067)
chr6 (125-226)||(1555957-1556058)
chr6 (125-226)||(29665844-29665945)
chr6 (49-198)||(22361885-22362034)
chr6 (49-196)||(21623148-21623295)
chr6 (39-82)||(15005024-15005067)
chr6 (39-196)||(18381792-18381950)
chr6 (66-196)||(19854135-19854265)
chr6 (39-82)||(22585664-22585707)
chr6 (39-82)||(22590495-22590538)
chr6 (32-154)||(13620905-13621026)
chr6 (39-199)||(33324670-33324831)
chr6 (39-199)||(35136121-35136282)
chr6 (137-184)||(10488693-10488740)
chr6 (137-184)||(16376588-16376635)
chr6 (137-184)||(16383912-16383959)
chr6 (137-184)||(16556354-16556401)
chr6 (137-184)||(16632910-16632957)
chr6 (137-184)||(22225953-22226000)
chr6 (137-204)||(33314433-33314500)
chr6 (39-81)||(25640673-25640715)
chr6 (48-134)||(34966910-34966995)
chr6 (148-199)||(16888010-16888062)
chr6 (15-63)||(18002590-18002638)
chr6 (49-133)||(18398982-18399065)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (15-226)||(14996078-14996289)
chr4 (15-226)||(19697466-19697677)
chr4 (15-226)||(19708051-19708262)
chr4 (36-221)||(22738226-22738410)
chr4 (73-225)||(22352197-22352349)
chr4 (125-226)||(17145860-17145961)
chr4 (15-123)||(14500310-14500418)
chr4 (15-154)||(16522841-16522980)
chr4 (36-218)||(26338980-26339161)
chr4 (125-226)||(8374460-8374561)
chr4 (125-226)||(18248170-18248271)
chr4 (15-154)||(9295717-9295856)
chr4 (15-226)||(8044891-8045106)
chr4 (129-218)||(15287452-15287541)
chr4 (129-218)||(15294561-15294650)
chr4 (22-117)||(9795276-9795371)
chr4 (131-226)||(19020437-19020533)
chr4 (66-116)||(32460840-32460890)
chr4 (49-194)||(41166066-41166211)
chr4 (49-199)||(40905054-40905203)
chr4 (55-196)||(14901212-14901353)
chr4 (48-134)||(18238276-18238361)
chr4 (48-117)||(47468467-47468535)
chr4 (42-75)||(49071788-49071821)
chr4 (49-133)||(15044872-15044955)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (15-226)||(8268838-8269049)
chr3 (15-226)||(8275938-8276149)
chr3 (19-226)||(11477288-11477496)
chr3 (15-162)||(16934067-16934214)
chr3 (125-226)||(44228937-44229038)
chr3 (16-222)||(14284915-14285122)
chr3 (32-226)||(12264903-12265097)
chr3 (15-154)||(9303193-9303332)
chr3 (15-117)||(19946758-19946860)
chr3 (131-226)||(18897208-18897303)
chr3 (131-226)||(25058691-25058786)
chr3 (131-226)||(5228265-5228360)
chr3 (125-221)||(11986377-11986473)
chr3 (39-81)||(18970016-18970058)
chr3 (66-215)||(12952924-12953074)
chr3 (131-226)||(12902299-12902391)
chr3 (137-184)||(1467954-1468001)
chr3 (39-82)||(14177148-14177191)
chr3 (47-134)||(31412451-31412537)
chr3 (15-82)||(38168008-38168075)
chr3 (68-179)||(47984649-47984759)
chr3 (68-179)||(48003223-48003333)
chr3 (137-184)||(49232430-49232477)
chr3 (180-226)||(8631740-8631785)
chr3 (66-199)||(41661542-41661675)
chr3 (49-134)||(17191584-17191668)
chr3 (175-226)||(17938524-17938575)
chr3 (39-79)||(48421674-48421714)
chr3 (32-84)||(54651550-54651602)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (36-226)||(7162-7351)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (36-226)||(10000484-10000673)
chr7 (36-226)||(16418450-16418639)
chr7 (15-134)||(371132-371251)
chr7 (140-226)||(15852408-15852494)
chr7 (125-226)||(15760317-15760418)
chr7 (131-226)||(48622874-48622971)
chr7 (39-82)||(13352046-13352089)
chr7 (137-184)||(7822722-7822769)
chr7 (137-184)||(7830033-7830080)
chr7 (39-82)||(15977959-15978002)
chr7 (137-184)||(27101852-27101899)
chr7 (137-184)||(27109200-27109247)
chr7 (137-184)||(27176427-27176474)
chr7 (137-184)||(38783944-38783991)
chr7 (49-119)||(16919617-16919686)
chr7 (49-201)||(20583674-20583826)
chr7 (49-204)||(13377501-13377656)
chr7 (49-196)||(17224058-17224205)
chr7 (49-117)||(31501233-31501300)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (36-226)||(5888744-5888933)
chr2 (36-226)||(23774089-23774278)
chr2 (15-226)||(28031332-28031545)
chr2 (125-226)||(21141847-21141948)
chr2 (15-154)||(24826812-24826951)
chr2 (15-154)||(25213071-25213210)
chr2 (15-133)||(15633257-15633375)
chr2 (15-133)||(17204375-17204493)
chr2 (15-99)||(33128122-33128206)
chr2 (131-226)||(23778254-23778349)
chr2 (98-199)||(22138137-22138239)
chr2 (43-201)||(19669222-19669381)
chr2 (49-215)||(67952-68119)
chr2 (49-164)||(43645906-43646020)
chr2 (131-204)||(16935567-16935640)
chr2 (131-204)||(17006227-17006300)
chr2 (39-134)||(9636788-9636883)
chr2 (137-184)||(11231553-11231600)
chr2 (137-184)||(22513400-22513447)
chr2 (137-184)||(28776022-28776069)
chr2 (39-81)||(7321612-7321654)
chr2 (66-199)||(24884663-24884796)
chr2 (131-184)||(12728386-12728439)
chr2 (131-184)||(34824469-34824522)
chr2 (15-63)||(22274835-22274883)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (15-226)||(5172-5383)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (15-226)||(5674-5886)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (16-226)||(49942-50153)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (16-226)||(7528850-7529061)
chr5 (15-226)||(17909456-17909667)
chr5 (32-226)||(35791209-35791403)
chr5 (15-134)||(9730476-9730595)
chr5 (15-133)||(16105687-16105805)
chr5 (125-226)||(11212268-11212369)
chr5 (15-154)||(108926-109065)
chr5 (36-226)||(23328508-23328699)
chr5 (129-218)||(7425284-7425373)
chr5 (36-226)||(24616120-24616303)
chr5 (36-226)||(24712496-24712679)
chr5 (36-226)||(24745514-24745697)
chr5 (125-226)||(32950645-32950746)
chr5 (49-203)||(6456597-6456751)
chr5 (49-196)||(19862189-19862336)
chr5 (137-184)||(21932596-21932643)
chr5 (137-184)||(21938766-21938813)
chr5 (137-184)||(22883299-22883346)
chr5 (137-184)||(35582030-35582077)
chr5 (137-184)||(36989985-36990032)
chr5 (55-204)||(23493891-23494040)
chr5 (131-184)||(1219729-1219782)
chr5 (15-82)||(21650789-21650856)
chr5 (66-134)||(24084120-24084187)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (15-132)||(165059-165176)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (15-134)||(22147481-22147600)
chr8 (15-226)||(18612357-18612568)
chr8 (15-226)||(18619262-18619473)
chr8 (15-221)||(22886281-22886488)
chr8 (15-134)||(3431374-3431493)
chr8 (15-117)||(2545006-2545108)
chr8 (125-204)||(16195204-16195283)
chr8 (66-226)||(21494593-21494754)
chr8 (49-193)||(23837181-23837325)
chr8 (131-179)||(13662474-13662522)
chr8 (107-199)||(23149758-23149851)
chr8 (39-79)||(23217974-23218014)
chr8 (137-184)||(271575-271622)
chr8 (137-184)||(644298-644345)
chr8 (137-184)||(830033-830080)
chr8 (137-184)||(15319374-15319421)
chr8 (137-184)||(15499743-15499790)
chr8 (137-184)||(22089009-22089056)
chr8 (48-134)||(18261590-18261675)
chr8 (49-119)||(21198272-21198341)
chr8 (66-199)||(27233204-27233337)
chr8 (69-199)||(37653756-37653884)
chr8 (17-82)||(22321542-22321607)
chr8 (48-117)||(45559056-45559124)
chr8 (49-81)||(22981286-22981318)
chr8 (48-116)||(33172289-33172356)
chr8 (55-119)||(33611179-33611242)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (15-226)||(17651-17860)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (36-226)||(6549-6739)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (125-226)||(7659-7760)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (36-213)||(23863-24039)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (15-224)||(11701-11906)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (15-154)||(130579-130718)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (15-133)||(6309-6427)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (15-116)||(34506-34607)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (131-226)||(34367-34462)
scaffold0012 (32-84)||(34269-34321)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (15-115)||(61320-61419)
scaffold0023 (131-184)||(154216-154269)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (139-226)||(10556-10643)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (131-224)||(1784-1877)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (15-115)||(17407-17506)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (125-224)||(44964-45064)
scaffold0066 (32-224)||(54369-54561)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (131-226)||(205-300)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (131-226)||(53827-53922)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (36-117)||(13398-13479)
scaffold0032 (55-199)||(104749-104892)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (131-223)||(3369-3461)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (125-226)||(2341-2445)
[»] scaffold0390 (3 HSPs)
scaffold0390 (98-199)||(16009-16111)
scaffold0390 (98-199)||(3025-3127)
scaffold0390 (128-199)||(5159-5231)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (98-199)||(4492-4594)
scaffold0786 (128-199)||(1571-1643)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (39-79)||(1619-1659)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (49-196)||(76967-77114)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (39-78)||(244920-244959)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (66-199)||(37535-37668)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (66-199)||(43935-44068)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (38-179)||(13505-13645)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (41-82)||(44234-44275)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (39-79)||(203-243)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (49-215)||(85493-85660)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (137-184)||(31303-31350)
scaffold0107 (131-184)||(39640-39693)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (137-184)||(39097-39144)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (49-164)||(35491-35605)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (59-211)||(2419-2572)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (39-199)||(10639-10800)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (36-82)||(5035-5081)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (22-82)||(1411-1472)
[»] scaffold1311 (1 HSPs)
scaffold1311 (148-199)||(1652-1704)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (38-74)||(12712-12748)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (125-161)||(56310-56346)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (39-79)||(22176-22216)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20254475 - 20254307
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20254475 atgtatgaaaatgagttgttatgaaattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttg 20254376  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20254375 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaa 20254307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Original strand, 7641048 - 7641237
Alignment:
Q  36 tgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtg 135  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||   | |||||||||||||    
T  7641048 tgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtg 7641146  T
Q  136 ggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
     ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641147 agtgaattataacttgggtgtacttaattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 7641237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22035589 - 22035400
Alignment:
Q  36 tgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtg 135  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||   | |||||||||||||    
T  22035589 tgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtg 22035491  T
Q  136 ggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
     ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22035490 agtgaattataacttgggtatacttaattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 22035400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Original strand, 21650133 - 21650252
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21650133 atgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttg 21650232  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgt 134  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  21650233 ttgttgagacatgttgttgt 21650252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21195122 - 21194991
Alignment:
Q  68 gttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataatt-at 166  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||| |||||| | ||| || ||||||| | ||| | ||| ||||||| | ||||| | ||    
T  21195122 gttgttgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattaatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcat 21195024  T
Q  167 ggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttg 199  Q
    |  |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21195023 gatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttg 21194991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 46523438 - 46523394
Alignment:
Q  129 tgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattga 173  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46523438 tgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattga 46523394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 52400741 - 52400674
Alignment:
Q  66 atgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgt 134  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  52400741 atgttgttgttgaattatgatgagaatcatgttt-aattgacgttgttgttgctgagagatgttgttgt 52400674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17004679 - 17004632
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  17004679 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 17004632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 18059973 - 18060020
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  18059973 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 18060020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 38055306 - 38055353
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  38055306 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 38055353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 119
Target Start/End: Original strand, 49997418 - 49997470
Alignment:
Q  66 atgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgct 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  49997418 atgttgttgttgaattaaggtgagaatcatg-tttaactgatgttgttgttgct 49997470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20177302 - 20177219
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttg 133  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | | ||||| || |||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  20177302 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaaaagtcaag-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttg 20177219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19629492 - 19629282
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  19629492 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagatttaattgatgttgttg 19629393  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgg 213  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| | |||| || || ||||| || ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  19629392 ttgctgagacatgttgttgtttatg-attatggcttgggtgttcatatatcat-gattgttggtgagaaatgagttgttgtgattgttttgagaaaatgg 19629295  T
Q  214 gtcaaatggtgat 226  Q
    |||||||||||||    
T  19629294 gtcaaatggtgat 19629282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 16300074 - 16300283
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16300074 atgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcctaattgataaattatgacatgttgtggttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttg 16300173  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgg 213  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||| ||||| ||||||| | |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||    
T  16300174 ttgctgagatatgttgttgtatatgatttatggcttgggtgttcatatatcat-gattgttgatgaaaaataagatgttg--gttgttttgcaaaaatgg 16300270  T
Q  214 gtcaaatggtgat 226  Q
    |||||||||||||    
T  16300271 gtcaaatggtgat 16300283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Original strand, 29869890 - 29870079
Alignment:
Q  36 tgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtg 135  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||   | |||||||||||||    
T  29869890 tgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtg 29869988  T
Q  136 ggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
     ||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29869989 agtgaattataacttgggtgtacttaatgatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtcgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 29870079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 32276857 - 32277068
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  32276857 atgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattgtgacatgttattgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttg 32276956  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaatg 212  Q
    ||||||||| ||||||||||   || |||||| ||||||| | |||| || || ||||| || ||| |||| ||||| |||| |||||||||  ||||||    
T  32276957 ttgctgagatatgttgttgtttatg-attatggcttgggtgttcatatatcat-gattgttggtgagaaataagatgctgttggttgttttgcaaaaatg 32277054  T
Q  213 ggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||||||||||||    
T  32277055 ggtcaaatggtgat 32277068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 4991234 - 4991116
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  4991234 atgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggtgtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttg 4991135  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttg 133  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  4991134 ttgctgagatatgttgttg 4991116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 117
Target Start/End: Original strand, 18823481 - 18823583
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  18823481 atgtatgaaaatgggttgttgtgaagttatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgcggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttg 18823580  T
Q  115 ttg 117  Q
    |||    
T  18823581 ttg 18823583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 117
Target Start/End: Original strand, 18839336 - 18839438
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  18839336 atgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttattgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttg 18839435  T
Q  115 ttg 117  Q
    |||    
T  18839436 ttg 18839438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 129 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19610067 - 19609978
Alignment:
Q  129 tgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaa 218  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19610067 tgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatgagaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaa 19609978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1556058 - 1555957
Alignment:
Q  125 atgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtg 224  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1556058 atgttattgtgagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaatgagatgttgttgttgttttgtgaaaatgagtcaaatggtg 1555959  T
Q  225 at 226  Q
    ||    
T  1555958 at 1555957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29665945 - 29665844
Alignment:
Q  125 atgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| |||||| |||  || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  29665945 atgttgttgtgggtgaatcatgacttgggtatgcatattcatggattggtgatgagaaacaagttgttgttgttgttttgataaaatgagttaaatggtg 29665846  T
Q  225 at 226  Q
    ||    
T  29665845 at 29665844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 198
Target Start/End: Original strand, 22361885 - 22362034
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgac 148  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| | ||| | || |||||||||| |||||||| ||  || ||||||| | ||| | ||| |    
T  22361885 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgaaattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 22361983  T
Q  149 ttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgtt 198  Q
    |||||| | ||||||| ||| ||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  22361984 ttgggtgttcataattcatgaattgatgatgagaattgagttgttgttgtt 22362034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21623295 - 21623148
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgac 148  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||||| |||||||| ||  |||||| |||   ||| | ||| |    
T  21623295 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgttct-attgatgttgttgttgctaagtgatgttgatgttaatgagtcatggc 21623197  T
Q  149 ttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttg 196  Q
    |||||||| ||||||| |||  |||  ||||||||||||| ||||||||    
T  21623196 ttgggtattcataattcatgatttgtggatgaaaaatgagttgttgttg 21623148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Original strand, 15005024 - 15005067
Alignment:
Q  39 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattg 82  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15005024 aattatgttcaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattg 15005067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 196
Target Start/End: Original strand, 18381792 - 18381950
Alignment:
Q  39 aattatgcttaa-ttgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtggg 137  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||   |||||||||||||||| | | ||| ||| | || |||||||||| |||||||| ||  |||||||||| |     
T  18381792 aattatgcttaaattgttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagagtcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttga 18381890  T
Q  138 tgaattatgacttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttg 196  Q
    ||| | ||| ||||||||| ||||||| |||  ||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  18381891 tgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttg 18381950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19854265 - 19854135
Alignment:
Q  66 atgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacat-aatt 164  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| || ||||||| | ||| | ||  ||||||| | ||| |||     
T  19854265 atgttattgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatc 19854167  T
Q  165 atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttg 196  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19854166 atgaattgatgatgagaaatgagttgttgttg 19854135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Original strand, 22585664 - 22585707
Alignment:
Q  39 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattg 82  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22585664 aattatgctcaattgaagaattatgacatgttgttgttgaattg 22585707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Original strand, 22590495 - 22590538
Alignment:
Q  39 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattg 82  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22590495 aattatgctcaattgaagaattatgacatgttgttgttgaattg 22590538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 154
Target Start/End: Original strand, 13620905 - 13621026
Alignment:
Q  32 gttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgt 131  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||| |  ||||| |||| ||  |||||  | | |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13620905 gttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt-aattgatgttgttgttgctgagatatgttgt 13621003  T
Q  132 tgtgggtgaattatgacttgggt 154  Q
    ||    |||||||||||||||||    
T  13621004 tgattatgaattatgacttgggt 13621026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33324831 - 33324670
Alignment:
Q  39 aattatgcttaattg-atgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtggg 137  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  || |||| ||||||||  | |||||| || |||  |||||||||| || ||||| ||  |||||||||| |     
T  33324831 aattatgctcaattggatgaattatgctatattgtggttgaattatgatgagaaccatgttc-aattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttga 33324733  T
Q  138 tgaattatgacttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttg 199  Q
    ||| | ||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  33324732 tgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgttgttg 33324670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 199
Target Start/End: Original strand, 35136121 - 35136282
Alignment:
Q  39 aattatgcttaattg-atgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtggg 137  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  || |||| ||||||||  | |||||| || |||  |||||||||| || ||||| ||  |||||||||| |     
T  35136121 aattatgctcaattggatgaattatgctatattgtggttgaattatgatgagaaccatgttc-aattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttga 35136219  T
Q  138 tgaattatgacttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttg 199  Q
    ||| | ||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  35136220 tgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgttgttg 35136282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 10488740 - 10488693
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  10488740 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 10488693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 16376588 - 16376635
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  16376588 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 16376635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 16383912 - 16383959
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  16383912 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 16383959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 16556354 - 16556401
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  16556354 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 16556401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 16632910 - 16632957
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  16632910 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 16632957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 22225953 - 22226000
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  22225953 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 22226000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 204
Target Start/End: Original strand, 33314433 - 33314500
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttg 204  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  ||||||||||| ||||    
T  33314433 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaataaattgttgttgttggtttg 33314500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Original strand, 25640673 - 25640715
Alignment:
Q  39 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaatt 81  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25640673 aattgtgctcaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaatt 25640715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 34966995 - 34966910
Alignment:
Q  48 taattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgt 134  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||    
T  34966995 taattgttgaattatgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatg-tttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgt 34966910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Original strand, 16888010 - 16888062
Alignment:
Q  148 cttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttg 199  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  16888010 cttgggtatacataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgttgttg 16888062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Original strand, 18002590 - 18002638
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatg 63  Q
    |||||||||||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  18002590 atgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattgatgaattatg 18002638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18399065 - 18398982
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttg 133  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||| | || |||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  18399065 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttg 18398982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14996289 - 14996078
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14996289 atgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttg 14996190  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| | |||| || || ||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||||    
T  14996189 ttgctgagacatgttgttgtttatg-attatggcttgggtgttcatatatcat-gattgttggtgagaaataagatgttgttggttgttttgcaaaaatg 14996092  T
Q  213 ggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||||||||||||    
T  14996091 ggtcaaatggtgat 14996078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 19697466 - 19697677
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19697466 atgtatgagaatgagttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttg 19697565  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| | |||| || || ||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||||    
T  19697566 ttgctgagacatgttgttgtttatg-attatggcttgggtgttcatatatcat-gattgttggtgagaaataagatgttgttggttgttttgcaaaaatg 19697663  T
Q  213 ggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||||||||||||    
T  19697664 ggtcaaatggtgat 19697677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 19708051 - 19708262
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19708051 atgtatgagaatgagttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttg 19708150  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| | |||| || || ||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||||    
T  19708151 ttgctgagacatgttgttgtttatg-attatggcttgggtgttcatatatcat-gattgttggtgagaaataagatgttgttggttgttttgcaaaaatg 19708248  T
Q  213 ggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||||||||||||    
T  19708249 ggtcaaatggtgat 19708262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22738410 - 22738226
Alignment:
Q  36 tgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtg 135  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||   |||||| |||||||||| || ||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  22738410 tgaaattatgcttaattgatggtttatgatgagttgttattgaattgag-tgtgaatcaagttccaatggatgttgttgttgcttagacatgttgttgag 22738312  T
Q  136 ggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22738311 ggtgaattatgacttgggtatacttaattgtggattaatgatgagaaatgagatgttgttgttgttttcagaaaatgggtcaaatg 22738226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Original strand, 22352197 - 22352349
Alignment:
Q  73 tgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattg 172  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||   | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22352197 tgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatacttaattatggattg 22352296  T
Q  173 atgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtga 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22352297 atgatgagaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtga 22352349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 125 - 226
Target Start/End: Original strand, 17145860 - 17145961
Alignment:
Q  125 atgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17145860 atgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattacggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtg 17145959  T
Q  225 at 226  Q
    ||    
T  17145960 at 17145961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 14500310 - 14500418
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14500310 atgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttg 14500409  T
Q  115 ttgctgaga 123  Q
    |||||||||    
T  14500410 ttgctgaga 14500418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16522980 - 16522841
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  16522980 atgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttg 16522881  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggt 154  Q
    ||||||||| |||||||||    ||||||||| |||||||    
T  16522880 ttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggt 16522841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26339161 - 26338980
Alignment:
Q  36 tgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtg 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||| || ||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||   | |||||||||||||    
T  26339161 tgaaattttgcttaattaatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggagagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtg 26339063  T
Q  136 ggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaa 218  Q
     ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26339062 agtgaattataacttgggtatacttaattatggattaatgatgaaaaatgaaatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaa 26338980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 125 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8374561 - 8374460
Alignment:
Q  125 atgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtg 224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8374561 atgttgttgtgggtgaattatggcttgggtatacataattatcgattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtg 8374462  T
Q  225 at 226  Q
    ||    
T  8374461 at 8374460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 125 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18248271 - 18248170
Alignment:
Q  125 atgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248271 atgttgttgtgggtgaattatgactttggtatacataattatcgattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtg 18248172  T
Q  225 at 226  Q
    ||    
T  18248171 at 18248170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9295856 - 9295717
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  9295856 atgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttg 9295757  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggt 154  Q
    ||||||||| |||||||||    ||||||||| |||||||    
T  9295756 ttgctgagatatgttgttgataatgaattatggcttgggt 9295717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8045106 - 8044891
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgag--gtgagaatcaagttttaattgatgtttt 112  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||| |    
T  8045106 atgtatgagaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgtgaatcaagttccaattgatgttgt 8045007  T
Q  113 tgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaa 210  Q
    || |||||||| |||||||||    ||| ||||| ||||||| | |||| || ||| |||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||  | ||    
T  8045006 tgctgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgaattgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgcaataa 8044907  T
Q  211 tgggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  8044906 tgggtaaaatgatgat 8044891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 129 - 218
Target Start/End: Original strand, 15287452 - 15287541
Alignment:
Q  129 tgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaa 218  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15287452 tgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatgagaaatgagatgttgttgtttctttgagaaaatgggtcaa 15287541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 129 - 218
Target Start/End: Original strand, 15294561 - 15294650
Alignment:
Q  129 tgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaa 218  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15294561 tgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatgagaaatgagatgttgttgtttctttgagaaaatgggtcaa 15294650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 9795371 - 9795276
Alignment:
Q  22 aaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttg 117  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9795371 aaaatgagtagttgtgaaattatgtttaattggtgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtggaaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 9795276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19020533 - 19020437
Alignment:
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||| |||||| |||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  19020533 ttgtgagtgaatcatgatttgagtatacttaattgtggattgatgatgagaaataagatgttgttggttgttttgcaaaaatgggtcaaatgatgat 19020437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 116
Target Start/End: Original strand, 32460840 - 32460890
Alignment:
Q  66 atgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgtt 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32460840 atgttgttgttggattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgtt 32460890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 41166066 - 41166211
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgac 148  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||| ||| | || |||||||||| |||||||| ||  |||||||||| | ||||| ||| |    
T  41166066 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggcaagagtcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggc 41166164  T
Q  149 ttgggtatacataa-ttatggattgatgatgaaaaatgagatgttgt 194  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  41166165 ttgggtattcataacttatgatttgttgatgagaaatgagttgttgt 41166211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 199
Target Start/End: Original strand, 40905054 - 40905203
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgac 148  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| | |||||||||  | |||||||||||| |||||||| ||| || ||||||| | ||| |  || |    
T  40905054 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatca--tgttaattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgactcgtggc 40905151  T
Q  149 ttgggtatacat-aattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttg 199  Q
    |||||| | ||| ||| |||  |||||||||| |||| || |||||||||||    
T  40905152 ttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttg 40905203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14901353 - 14901212
Alignment:
Q  55 tgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggt 154  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||| |||||||  ||  |||||||||| |||||||| ||  ||| |||||| | ||| | ||||| |||||    
T  14901353 tgaattatgatatgttattattgaattgtggtaagaatcatattc-aattgatgttgttgttgctaagtgatgctgttgttgatgattcatgacatgggt 14901255  T
Q  155 atacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttg 196  Q
     | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  14901254 gtgcataattcatgaattgatgatgagaaatgggttgttgttg 14901212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 134
Target Start/End: Original strand, 18238276 - 18238361
Alignment:
Q  48 taattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgt 134  Q
    |||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||    
T  18238276 taattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatg-tttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgt 18238361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 117
Target Start/End: Original strand, 47468467 - 47468535
Alignment:
Q  48 taattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttg 117  Q
    |||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  47468467 taattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatg-tttaattgatgttgttgttg 47468535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 49071821 - 49071788
Alignment:
Q  42 tatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgt 75  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49071821 tatgctcaattgatgaattatgacatgttgttgt 49071788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15044955 - 15044872
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttg 133  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||| ||| | || |||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  15044955 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttg 15044872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 8268838 - 8269049
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8268838 atgtatgaaaattggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttattg 8268937  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| | |||| || || ||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||||    
T  8268938 ttgctgagacatgttgttgtttatg-attatggcttgggtgttcatatatcat-gattgttggtgagaaataagatgttgttggttgttttgcaaaaatg 8269035  T
Q  213 ggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||||||||||||    
T  8269036 ggtcaaatggtgat 8269049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 8275938 - 8276149
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8275938 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttattg 8276037  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| | |||| || || ||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||  || |||    
T  8276038 ttgctgagacatgttgttgtttatg-attatggcttgggtgttcatatatcat-gattgttggtgagaaataagatgttgttggttgttttgcaaacatg 8276135  T
Q  213 ggtcaaatggtgat 226  Q
    | ||||||||||||    
T  8276136 gatcaaatggtgat 8276149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 11477288 - 11477496
Alignment:
Q  19 atgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgc 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  11477288 atgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgtggttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgctgc 11477387  T
Q  119 tgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaatgggtc 216  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||| ||||||| | |||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  11477388 tgagatatgttgttgtttatgatttatggcttgggtgttcatatatcat-gattgttgatgaaaaataagatgttgttggttgttttgcaaaaatgggtc 11477486  T
Q  217 aaatggtgat 226  Q
    |||| |||||    
T  11477487 aaatagtgat 11477496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Original strand, 16934067 - 16934214
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16934067 atgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttg 16934166  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataa 162  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||| |||||    
T  16934167 ttgctgagacatgttgttgtttatgatttatggcttgggtattcataa 16934214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 125 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44229038 - 44228937
Alignment:
Q  125 atgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44229038 atgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgatgttttgagaaaatgggtcaaatggtg 44228939  T
Q  225 at 226  Q
    ||    
T  44228938 at 44228937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14285122 - 14284915
Alignment:
Q  16 tgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14285122 tgtatgaaaatgggtagttgtgaaaatatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgt 14285023  T
Q  116 tgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaatgg 213  Q
    |||| ||| ||||||||||   ||| ||||||||||||| | |||| || || || || || ||  || |||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  14285022 tgctcagatatgttgttgtttatgatttatgacttgggtgttcatatatcat-gaatgttggtgtgaattgagatgttgttggttgttttgcaaaaatgg 14284924  T
Q  214 gtcaaatgg 222  Q
    |||||||||    
T  14284923 gtcaaatgg 14284915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 226
Target Start/End: Original strand, 12264903 - 12265097
Alignment:
Q  32 gttatgaaattatgcttaattgatgaa-ttatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttg 130  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||| || || ||| |||  | |||||||| ||| |  | |   ||||||    
T  12264903 gttatgagattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttcca-ttgatgttgttgctattaactgatgttg 12265001  T
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12265002 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgagaaatgagatgttgttgttgttttgtgaaaatgggtcaaatggtgat 12265097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 154
Target Start/End: Original strand, 9303193 - 9303332
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  9303193 atgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgctgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttg 9303292  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggt 154  Q
    ||||||||| |||||||||    ||||||||| |||||||    
T  9303293 ttgctgagatatgttgttgactatgaattatggcttgggt 9303332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 19946860 - 19946758
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  19946860 atgtatgaaaatgagtagttgtgaaattatgcttaattgatgatttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttg 19946761  T
Q  115 ttg 117  Q
    |||    
T  19946760 ttg 19946758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Original strand, 18897208 - 18897303
Alignment:
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18897208 ttgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaataaaatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 18897303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25058786 - 25058691
Alignment:
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||| |||||| |||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058786 ttgtgagtgaatcatgatttgagtatacttaattgtgaattgatgatgagaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 25058691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5228360 - 5228265
Alignment:
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5228360 ttgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtgaattgattatgagaaatgagatgttgtggttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 5228265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Original strand, 11986377 - 11986473
Alignment:
Q  125 atgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatg 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  11986377 atgttgttgtgggtgaatcatgacttgggtatgcatattcatggattggagatgagaaataagatgttgtttttgttttgataaaatgggttaaatg 11986473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 18970058 - 18970016
Alignment:
Q  39 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaatt 81  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18970058 aattatgctcaattgatgaattatgacatgttgttgttgaatt 18970016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12953074 - 12952924
Alignment:
Q  66 atgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataatt- 164  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| | | |||| |||||||||| |||||||| ||| || ||||||| | ||| | ||| ||||||| | ||||| |     
T  12953074 atgttgttgttgaattgtgatgagatttatgttt-aattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatc 12952976  T
Q  165 atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgtt-gttttgagaaaatgggt 215  Q
    |||  |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  12952975 atgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggt 12952924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Original strand, 12902299 - 12902391
Alignment:
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||| |||||| |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||||| |||| ||||   ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  12902299 ttgtgagtgaatcatgatttggatatacttaattgtggattaatgatgagaaataagat---gttgttgttttgaaaaaatgtgtcaattggtgat 12902391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 1467954 - 1468001
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  1467954 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 1468001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Original strand, 14177148 - 14177191
Alignment:
Q  39 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattg 82  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14177148 aattgtgctcaattgatgaattatgacatgttgtggttgaattg 14177191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 134
Target Start/End: Original strand, 31412451 - 31412537
Alignment:
Q  47 ttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgt 134  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||    
T  31412451 ttaattgttgaattgtgatatgttgttgttgaattgtgatgagaat-taggtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgt 31412537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 38168075 - 38168008
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattg 82  Q
    |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  38168075 atgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattg 38168008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 47984759 - 47984649
Alignment:
Q  68 gttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatg 167  Q
    |||||||||| |||||| || || ||| |||  ||||||||||||||||| | |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| | |||    
T  47984759 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttc-aattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatg 47984661  T
Q  168 gattgatgatga 179  Q
     |||||||||||    
T  47984660 aattgatgatga 47984649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 48003333 - 48003223
Alignment:
Q  68 gttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatg 167  Q
    |||||||||| |||||| || || ||| |||  ||||||||||||||||| | |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| | |||    
T  48003333 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttc-aattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatg 48003235  T
Q  168 gattgatgatga 179  Q
     |||||||||||    
T  48003234 aattgatgatga 48003223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 49232477 - 49232430
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  49232477 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 49232430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8631785 - 8631740
Alignment:
Q  180 aaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  8631785 aaaatgagttgttgttgttgttt-gtgaaaatgggtcaaatggtgat 8631740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 41661675 - 41661542
Alignment:
Q  66 atgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacat-aatt 164  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||| | ||| | ||  |||| || | ||| |||     
T  41661675 atgttattgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttgagagatattgttgttgatgattcatagcttgagtgttcataaatc 41661577  T
Q  165 atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttg 199  Q
    ||| ||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  41661576 atgaattgatgatgataaataagttgttgttgttg 41661542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17191668 - 17191584
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgt 134  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | | ||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||||    
T  17191668 aattgatgaattatgttatgttgttgctgaattgtgataagaatcatg-tttaattgatgttgctgttgctaagtaatgttgttgt 17191584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17938575 - 17938524
Alignment:
Q  175 gatgaaaa-atgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17938575 gatgaaaagatgagttgttgttgttgttttt-gaaaatgggtcaaatggtgat 17938524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 48421714 - 48421674
Alignment:
Q  39 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaa 79  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48421714 aattatgttcaattggtgaattatgacatgttgttgttgaa 48421674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 54651602 - 54651550
Alignment:
Q  32 gttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgag 84  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  54651602 gttatgaaattatactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgag 54651550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7351 - 7162
Alignment:
Q  36 tgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtg 135  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||   |  ||||||||||||    
T  7351 tgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaccatgttgttgtg 7253  T
Q  136 ggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7252 agtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 7162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Original strand, 10000484 - 10000673
Alignment:
Q  36 tgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtg 135  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||  |||||   | |||||||||||||    
T  10000484 tgaaattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgctgttgacaaaacatgttgttgtg 10000582  T
Q  136 ggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
     ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10000583 agtgaattataacttgggtatacttaattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 10000673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16418639 - 16418450
Alignment:
Q  36 tgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtg 135  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||   |  ||||||||||||    
T  16418639 tgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaccatgttgttgtg 16418541  T
Q  136 ggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16418540 agtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 16418450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 371251 - 371132
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  371251 atgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcgattgatgttgttg 371152  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgt 134  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  371151 ttgccgagacatgttgttgt 371132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 140 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15852494 - 15852408
Alignment:
Q  140 aattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15852494 aattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgagaaatgagatgttgttgttgttttgtgaaaatgggtcaaattgtgat 15852408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 226
Target Start/End: Original strand, 15760317 - 15760418
Alignment:
Q  125 atgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtg 224  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15760317 atgttattgtgagtgaataatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaatgagatgttgttgttgttttgtgaaaatgagtcaaatggtg 15760416  T
Q  225 at 226  Q
    ||    
T  15760417 at 15760418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Original strand, 48622874 - 48622971
Alignment:
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatga--aaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||  | |||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48622874 ttgtgagtgaaccatgacttgggtatacatgttcatgggttgttgatgagaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 48622971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 13352089 - 13352046
Alignment:
Q  39 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattg 82  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13352089 aattatgctcaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattg 13352046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7822769 - 7822722
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  7822769 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 7822722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7830080 - 7830033
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  7830080 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 7830033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 82
Target Start/End: Original strand, 15977959 - 15978002
Alignment:
Q  39 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattg 82  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977959 aattatactcaaatgatgaattatgacatgttgttgttgaattg 15978002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 27101852 - 27101899
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27101852 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 27101899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 27109200 - 27109247
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27109200 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 27109247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27176474 - 27176427
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27176474 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 27176427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 38783944 - 38783991
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  38783944 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 38783991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16919686 - 16919617
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgct 119  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||  | ||||||||||||| ||||||||    
T  16919686 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcgtg-tttaattgatgttgttgttgct 16919617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Original strand, 20583674 - 20583826
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgac 148  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||  || ||||||| | ||| | ||| |    
T  20583674 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagggatattgttgttgatgattcatggc 20583772  T
Q  149 ttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgtt 201  Q
    |||||| | ||||| | |||  |||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  20583773 ttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttgtt 20583826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13377656 - 13377501
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgac 148  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| | | ||| ||| | || |||||||||| |||||||| ||  |||||||||  | ||| | ||| |    
T  13377656 aattgattaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggc 13377558  T
Q  149 ttgggtatacat-aattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttg 204  Q
    |||||| | ||| ||| |||  |||||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  13377557 ttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttg 13377501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 196
Target Start/End: Original strand, 17224058 - 17224205
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgac 148  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  || ||| ||| | || |||||||||| |||||||| ||  ||||||||   | ||| | ||| |    
T  17224058 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgttgtaagagtcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttaatgatgattcatggc 17224156  T
Q  149 ttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttg 196  Q
    |||||||| ||||||| |||  ||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  17224157 ttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttg 17224205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 31501300 - 31501233
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttg 117  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  31501300 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatg-tttaattgatgttgttgttg 31501233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Original strand, 5888744 - 5888933
Alignment:
Q  36 tgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtg 135  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||   |  ||||||||||||    
T  5888744 tgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaccatgttgttgtg 5888842  T
Q  136 ggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5888843 agtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 5888933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23774278 - 23774089
Alignment:
Q  36 tgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtg 135  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||   | |||||||||||||    
T  23774278 tgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtg 23774180  T
Q  136 ggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23774179 agtgaattataacttgggtatacttaattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgtgaaaatgggtcaaatggtgat 23774089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 28031332 - 28031545
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  28031332 atgtgtgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatgatatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttg 28031431  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatga-aaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaat 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||   ||| ||||| ||||||| | |||| || || ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  28031432 ttgttgagatatgttgttgtttatgatttatggcttgggtgttcatatatcat-gattgttgatgagaaaatgagatgttgttggttgttttgcaaaaat 28031530  T
Q  212 gggtcaaatggtgat 226  Q
    |||||||||| ||||    
T  28031531 gggtcaaatgatgat 28031545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 125 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21141948 - 21141847
Alignment:
Q  125 atgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtg 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21141948 atgttgttgtgggtgaattacgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtg 21141849  T
Q  225 at 226  Q
    ||    
T  21141848 at 21141847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 154
Target Start/End: Original strand, 24826812 - 24826951
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  24826812 atgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttg 24826911  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggt 154  Q
    ||||||||| | |||||||    ||||||||| |||||||    
T  24826912 ttgctgagatacgttgttgattatgaattatggcttgggt 24826951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25213210 - 25213071
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  25213210 atgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttg 25213111  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggt 154  Q
    ||||||||| |||||||||    ||||||||| |||||||    
T  25213110 ttgctgagatatgttgttgataatgaattatggcttgggt 25213071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15633375 - 15633257
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  15633375 atgtttgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaattgatgttgttg 15633276  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttg 133  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  15633275 ttgctgagatatgttgttg 15633257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17204493 - 17204375
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  17204493 atgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttg 17204394  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttg 133  Q
    ||||||||| || ||||||    
T  17204393 ttgctgagatatattgttg 17204375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 33128206 - 33128122
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  33128206 atgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgttt 33128122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Original strand, 23778254 - 23778349
Alignment:
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23778254 ttgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaataagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaattggtgat 23778349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22138239 - 22138137
Alignment:
Q  98 tttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttg 196  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  22138239 tttaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgatttatgacttgggtattcataattcatgaattgatgatgataaatgagttattgttg 22138140  T
Q  197 ttg 199  Q
    |||    
T  22138139 ttg 22138137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 201
Target Start/End: Original strand, 19669222 - 19669381
Alignment:
Q  43 atgcttaattgat-gaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaa 141  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  | || ||| || |||  |||||||||| |||||||| ||  ||||| |||| | |||     
T  19669222 atgcttaattggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgtgaaccatgttc-aattgatgttgttgttgctaagtgatgttattgttgatgat 19669320  T
Q  142 ttatgacttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgtt 201  Q
    | ||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19669321 tcatggcttgggtattcataattcatgaactgatgatgaaaaatgagttgttgttgttgtt 19669381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 68119 - 67952
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgac 148  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| | || |||||||||| |||||||| ||  || ||||||| ||||| | ||| |    
T  68119 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgattcatggc 68021  T
Q  149 ttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgtt-gttttgagaaaatgggt 215  Q
    ||| || | ||||||| |||  |||||||||| |||| || |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  68020 ttgcgtgttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggt 67952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 43646020 - 43645906
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgac 148  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||||| |||  |||||||||| |||||||| ||  |||||||||| | ||| | |||||    
T  43646020 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaactgtggtaagaatcatgttc-aattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgtcgatgattcatgac 43645922  T
Q  149 ttgggtatacataatt 164  Q
    |||||| | |||||||    
T  43645921 ttgggtgttcataatt 43645906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16935640 - 16935567
Alignment:
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttg 204  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  ||||||||||| ||||    
T  16935640 ttgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaataaattgttgttgttggtttg 16935567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17006300 - 17006227
Alignment:
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttg 204  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  ||||||||||| ||||    
T  17006300 ttgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaataaattgttgttgttggtttg 17006227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 9636883 - 9636788
Alignment:
Q  39 aattatgct-taattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgt 134  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||    
T  9636883 aattatgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatg-tttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgt 9636788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 11231553 - 11231600
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  11231553 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 11231600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 22513400 - 22513447
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  22513400 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 22513447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 28776022 - 28776069
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  28776022 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 28776069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 7321654 - 7321612
Alignment:
Q  39 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaatt 81  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7321654 aattgtgctcaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaatt 7321612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24884796 - 24884663
Alignment:
Q  66 atgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacat-aatt 164  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| | | || ||||||| | ||| | ||||||||||| | ||| |||     
T  24884796 atgttattgttgaattgtgatgagattcatgttt-aattgatgttgttgttgctaatagatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcataaatc 24884698  T
Q  165 atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttg 199  Q
    |||  ||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  24884697 atgatttgatgaggagaaatgagttgttgttgttg 24884663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 12728439 - 12728386
Alignment:
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  12728439 ttgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 12728386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34824522 - 34824469
Alignment:
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  34824522 ttgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 34824469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22274883 - 22274835
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatg 63  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  22274883 atgtatgaaaatgggttgtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 22274835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5383 - 5172
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  5383 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagatttaattgatgttgttg 5284  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| | |||| || || ||||| || | | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||    
T  5283 ttgctgagacatgttgttgtttatg-attatggcttgggtgttcatatatcat-gattgttggtaagaaataagatgttgttggttgttttgcaaaaatg 5186  T
Q  213 ggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||||||||||||    
T  5185 ggtcaaatggtgat 5172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 5674 - 5886
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5674 atgtatgaaaatgggttgttttgaaattatgcttaattaatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttg 5773  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaatgg 213  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||| | ||||  |   ||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||||    
T  5774 ttgctgagaaatgttgttgtttatgatttatgacttgggtgttcatatgtcatgattgttggtgagaaatgagatgttgttggttgttttgtataaatgg 5873  T
Q  214 gtcaaatggtgat 226  Q
    |||||||| ||||    
T  5874 gtcaaatgatgat 5886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 226
Target Start/End: Original strand, 49942 - 50153
Alignment:
Q  16 tgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  49942 tgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatacttaattgatgaattatgacatgttgtggttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgt 50041  T
Q  116 tgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaatgg 213  Q
    |||||||| ||||||||||   ||| ||||| ||||||| | |||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  50042 tgctgagatatgttgttgtttatgatttatggcttgggtgttcatatatcat-gattgttgatgaaaaataagatgttgttggttgttttgcaaaaatgg 50140  T
Q  214 gtcaaatggtgat 226  Q
    |||||||||||||    
T  50141 gtcaaatggtgat 50153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7529061 - 7528850
Alignment:
Q  16 tgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgt 115  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7529061 tgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgt 7528962  T
Q  116 tgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaatgg 213  Q
    |||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||| | |||| || || ||||| || ||  || |||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  7528961 tgctgagatatgttgttgtttatgatttatgacttgggtgttcatatatcat-gattgttggtgtgaattgagatgttgttggttgttttgcaaaaatgg 7528863  T
Q  214 gtcaaatggtgat 226  Q
    |||||||||||||    
T  7528862 gtcaaatggtgat 7528850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17909667 - 17909456
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17909667 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttg 17909568  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaatg 212  Q
     || || |||||||||||||   || |||||| ||||||| | |||| || || ||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||||    
T  17909567 ctgatgcgacatgttgttgtttatg-attatggcttgggtgttcatatatcat-gattggtggtgagaaataagatgttgttggttgttttgcaaaaatg 17909470  T
Q  213 ggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||||||||||||    
T  17909469 ggtcaaatggtgat 17909456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 226
Target Start/End: Original strand, 35791209 - 35791403
Alignment:
Q  32 gttatgaaattatgcttaattgatgaa-ttatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttg 130  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||| || || ||| |||  | |||||||| ||| |  | |   ||||||    
T  35791209 gttatgagattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttcca-ttgatgttgttgctattaactgatgttg 35791307  T
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35791308 ttgagggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgagaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 35791403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Original strand, 9730476 - 9730595
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  9730476 atgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcgattgatgttgttg 9730575  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgt 134  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  9730576 ttgctgagacatattgttgt 9730595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16105805 - 16105687
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  16105805 atgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttg 16105706  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttg 133  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  16105705 ttgctgagatatgttgttg 16105687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 125 - 226
Target Start/End: Original strand, 11212268 - 11212369
Alignment:
Q  125 atgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtg 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11212268 atgttgttgtgggtggattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgagaaatgagatgttgttgttgttttgtgaaaatgggtcaaatggtg 11212367  T
Q  225 at 226  Q
    ||    
T  11212368 at 11212369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 154
Target Start/End: Original strand, 108926 - 109065
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  108926 atgtatgaaaatggattgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttg 109025  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggt 154  Q
    ||||||||| |||||||||    ||||||||| |||||||    
T  109026 ttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggt 109065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23328699 - 23328508
Alignment:
Q  36 tgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtg 135  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||   | |||||||||||||    
T  23328699 tgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtg 23328601  T
Q  136 ggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatga--aaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23328600 agtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatgatgaaaaaaacgaaatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatgatgat 23328508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7425373 - 7425284
Alignment:
Q  129 tgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaa 218  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7425373 tgttgtgagtgaatcatgacttggatatacttaattatggattgatgatgagaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaa 7425284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24616303 - 24616120
Alignment:
Q  36 tgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtg 135  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||   | |||||||||||||    
T  24616303 tgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaa-acatgttgttgtg 24616206  T
Q  136 ggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24616205 agtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga--aaaaatgaaa---tgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 24616120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24712679 - 24712496
Alignment:
Q  36 tgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtg 135  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||   | |||||||||||||    
T  24712679 tgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaa-acatgttgttgtg 24712582  T
Q  136 ggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712581 agtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga--aaaaatgaaa---tgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 24712496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24745697 - 24745514
Alignment:
Q  36 tgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtg 135  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||   | |||||||||||||    
T  24745697 tgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaa-acatgttgttgtg 24745600  T
Q  136 ggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24745599 agtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga--aaaaatgaaa---tgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 24745514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32950746 - 32950645
Alignment:
Q  125 atgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  32950746 atgttgttgtgggtgaatcatgacttgggtctgcatattcatggattgaagatgagaaataagatgttgttattgttttgataaaatgagttaaatggtg 32950647  T
Q  225 at 226  Q
    ||    
T  32950646 at 32950645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6456751 - 6456597
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgac 148  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||||| | ||| || | ||||| | ||| | ||| |    
T  6456751 aattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatg-tttaattgatgttgttgttgttaagagatatcgttgttgatgattcatggc 6456653  T
Q  149 ttgggtatacat-aattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgtttt 203  Q
    |||||| | ||| ||| |||  |||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  6456652 ttgggtgttcatgaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttgtttt 6456597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19862336 - 19862189
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgac 148  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||| | |  |||||||||| |||||||| ||  || || |||| | ||| | |||||    
T  19862336 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatg-tgcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatgac 19862238  T
Q  149 ttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttg 196  Q
    |||||| | ||||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19862237 ttgggtgttcataattcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttg 19862189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 21932596 - 21932643
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  21932596 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 21932643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 21938766 - 21938813
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  21938766 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 21938813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 22883299 - 22883346
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  22883299 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 22883346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 35582077 - 35582030
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  35582077 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 35582030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 36989985 - 36990032
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  36989985 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 36990032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23494040 - 23493891
Alignment:
Q  55 tgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggt 154  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| | | ||| ||| | || |||||||||| |||||||| ||  |||||||||  | ||| | ||| |||||||    
T  23494040 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggt 23493942  T
Q  155 atacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttg 204  Q
     | ||||||| |||  |||||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  23493941 gttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttg 23493891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 184
Target Start/End: Original strand, 1219729 - 1219782
Alignment:
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  1219729 ttgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 1219782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 21650856 - 21650789
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacat-gttgttgttgaattg 82  Q
    |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21650856 atgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgttgaattg 21650789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24084187 - 24084120
Alignment:
Q  66 atgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgt 134  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  24084187 atgttgttgttgaattgtgatgtgaatcatgttt-aattgatgttgttgttgctaagaaatattgttgt 24084120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 132
Target Start/End: Original strand, 165059 - 165176
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  165059 atgtatgaaaatgggttcttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttg 165158  T
Q  115 ttgctgagacatgttgtt 132  Q
    ||||||||||||||||||    
T  165159 ttgctgagacatgttgtt 165176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22147600 - 22147481
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  22147600 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaaattttaattgatgttgttg 22147501  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgt 134  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  22147500 ttgctgagacatgtcgttgt 22147481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18612568 - 18612357
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||    
T  18612568 atgtatgaaaatggattgttatgaaattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtggaaatcaagatttaattgatgttgttg 18612469  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||| |||| || | |||| || || ||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||||    
T  18612468 ttgctgagacatgttgttgtttatg-attatggcttgagtgttcatatatcat-gattgttggtgagaaataagatgttgttggttgttttgcaaaaatg 18612371  T
Q  213 ggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||||||||||||    
T  18612370 ggtcaaatggtgat 18612357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18619473 - 18619262
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||    
T  18619473 atgtatgaaaatggattgttatgaaattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtggaaatcaagatttaattgatgttgttg 18619374  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||| |||| || | |||| || || ||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||||    
T  18619373 ttgctgagacatgttgttgtttatg-attatggcttgagtgttcatatatcat-gattgttggtgagaaataagatgttgttggttgttttgcaaaaatg 18619276  T
Q  213 ggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||||||||||||    
T  18619275 ggtcaaatggtgat 18619262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22886488 - 22886281
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22886488 atgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgaactatgacatgttgttg-tgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttg 22886390  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatga-aaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaat 211  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||| | |||| || || ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||||||||  |||||    
T  22886389 ttgctgagatatgttgttgtttatgatttatgacttgggtgttcatatatcat-gattgttgatgagaaattaagatgttgttggttgttttgcaaaaat 22886291  T
Q  212 gggtcaaatg 221  Q
    ||||||||||    
T  22886290 gggtcaaatg 22886281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Original strand, 3431374 - 3431493
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  3431374 atgtatgaaaatgagttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcgattgatgttgttg 3431473  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgt 134  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3431474 ttgctgagacatgttgttgt 3431493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 2545108 - 2545006
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  2545108 atgtgtgaaaatgggtagttgtaaaattatgcttaattgatgaattataacatgttgttgttgaattgaggtgggaatcaagtttcaattgatgttgttg 2545009  T
Q  115 ttg 117  Q
    |||    
T  2545008 ttg 2545006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16195283 - 16195204
Alignment:
Q  125 atgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttg 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16195283 atgttgttgagggtgaattatgacttaggtatatataattatggattgatgatgagaaatgagatgttgttgttgttttg 16195204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 226
Target Start/End: Original strand, 21494593 - 21494754
Alignment:
Q  66 atgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-att 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||| |||| |||||||| | |||| ||     
T  21494593 atgttgttgttggattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgtttatgatttataacttgggtgtgcatatatc 21494692  T
Q  165 atggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
    || ||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  21494693 at-gattgttggtgagaattgagatgttgttggttgttttgcaaaaatggatcaaatggtgat 21494754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23837325 - 23837181
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgac 148  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| | || |||||||||| |||||||| ||  |||||||||| | ||| | ||| |    
T  23837325 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagagtcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggc 23837227  T
Q  149 ttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttg 193  Q
    |||||||| ||||||| |||  ||| |||||| ||||||| |||||    
T  23837226 ttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttg 23837181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 179
Target Start/End: Original strand, 13662474 - 13662522
Alignment:
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatga 179  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662474 ttgtgagtgaatcatgatttgggtatacataattatggattgatgatga 13662522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23149851 - 23149758
Alignment:
Q  107 tgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttg 199  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| | ||| | ||| |||| |||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23149851 tgtttttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgatgatgaaaaatgagttgttgttgttg 23149758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 23218014 - 23217974
Alignment:
Q  39 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaa 79  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23218014 aattatgttcaattgatgaattatgacatgttgttgttgaa 23217974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 271575 - 271622
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  271575 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 271622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 644345 - 644298
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  644345 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 644298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 830080 - 830033
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  830080 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 830033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 15319374 - 15319421
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  15319374 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 15319421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 15499743 - 15499790
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  15499743 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 15499790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Original strand, 22089009 - 22089056
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  22089009 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 22089056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 134
Target Start/End: Original strand, 18261590 - 18261675
Alignment:
Q  48 taattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgt 134  Q
    |||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||    
T  18261590 taattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatg-tttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgt 18261675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 119
Target Start/End: Original strand, 21198272 - 21198341
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgct 119  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||    
T  21198272 aattgttgaattatgttatgttgttgttgaattgtggtaagaatcatg-ttcaattgatgttgttgttgct 21198341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 199
Target Start/End: Original strand, 27233204 - 27233337
Alignment:
Q  66 atgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacat-aatt 164  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||||| | ||| | ||| ||||||| | ||| |||     
T  27233204 atgttgttgttgaattgtgatgagaatcatg-tttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatc 27233302  T
Q  165 atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttg 199  Q
    |||  ||||| |||| |||| || |||||||||||    
T  27233303 atgatttgataatgagaaataagttgttgttgttg 27233337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 199
Target Start/End: Original strand, 37653756 - 37653884
Alignment:
Q  69 ttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatgg 168  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||  || ||||||| | ||| ||||| ||||||| | |||| | |||     
T  37653756 ttgttgttgaattctgttgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaaggaatattgttgttgatgatttatggcttgggtgttcata-tcatga 37653853  T
Q  169 attgatgatgaaaaatgagatgttgttgttg 199  Q
     ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37653854 tttgatgatgaaaaataagttgttgttgttg 37653884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Original strand, 22321542 - 22321607
Alignment:
Q  17 gtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattg 82  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  22321542 gtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattataacatgttattgttaaattg 22321607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 117
Target Start/End: Original strand, 45559056 - 45559124
Alignment:
Q  48 taattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttg 117  Q
    |||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  45559056 taattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatg-tttaattgatgttgttgttg 45559124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22981318 - 22981286
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaatt 81  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22981318 aattgatgaattgtgacatgttgttgttgaatt 22981286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 33172356 - 33172289
Alignment:
Q  48 taattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgtt 116  Q
    |||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  33172356 taattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatg-tttaattgatgttgttgtt 33172289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 119
Target Start/End: Original strand, 33611179 - 33611242
Alignment:
Q  55 tgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgct 119  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||| ||||||||    
T  33611179 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgttgagaaccatg-tttaattgatgttgttgttgct 33611242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17860 - 17651
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||    
T  17860 atgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatg---ttg 17764  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaatg 212  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||| ||||| |||||||   |||| || || ||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||||    
T  17763 ttgctgagacaagttgttgtttatgatttatggcttgggtgctcatatatcat-gattgttggtgagaaataagatgttgttggttgttttgcaaaaatg 17665  T
Q  213 ggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||||||||||||    
T  17664 ggtcaaatggtgat 17651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6739 - 6549
Alignment:
Q  36 tgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtg 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||| || ||| | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||   | |||||||||||||    
T  6739 tgaaattttgcttaattaatgatttgtgataagttgt-gttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttattgttgacaaaacatgttgttgtg 6641  T
Q  136 ggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatga-aaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6640 agtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatgatgaaaaaatgaaatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 6549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 125 - 226
Target Start/End: Original strand, 7659 - 7760
Alignment:
Q  125 atgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtg 224  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7659 atgttgttgtgagtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgatgttttgagaaaatgggtcaaatggtg 7758  T
Q  225 at 226  Q
    ||    
T  7759 at 7760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 213
Target Start/End: Original strand, 23863 - 24039
Alignment:
Q  36 tgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtg 135  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||   | |||||||||||||    
T  23863 tgaaattttgcctaattaatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtg 23961  T
Q  136 ggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgg 213  Q
     ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23962 agtgaattataacttgggtgtacttaattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgg 24039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11906 - 11701
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  11906 atgtttgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaatcatgacatgtt-ttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttg 11808  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata-attatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgg 213  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| | |||| || || ||||| || ||| |||| ||||||||  |||||||||  |||||||    
T  11807 ttgctgagacatgttgttgt-tatgatttatggcttgggtgttcatatatcat-gattgttggtgagaaataagatgttg--gttgttttgcaaaaatgg 11712  T
Q  214 gtcaaatggtg 224  Q
    |||||||||||    
T  11711 gtcaaatggtg 11701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 130718 - 130579
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  130718 atgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttg 130619  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggt 154  Q
    ||| ||||| |||||||||    ||||||||| |||||||    
T  130618 ttgttgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggt 130579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 6309 - 6427
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  6309 atgtatgaaaatgggttgttgtgaaattaagcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttg 6408  T
Q  115 ttgctgagacatgttgttg 133  Q
     |||||||| |||||||||    
T  6409 atgctgagatatgttgttg 6427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 116
Target Start/End: Original strand, 34506 - 34607
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  34506 atgtgtgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgaaaatcaagtttcaattgatgttgttg 34605  T
Q  115 tt 116  Q
    ||    
T  34606 tt 34607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Original strand, 34367 - 34462
Alignment:
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34367 ttgtgagtgaatcatgacttgggtatactaaattatggattgatgatgagaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 34462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 84
Target Start/End: Original strand, 34269 - 34321
Alignment:
Q  32 gttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgag 84  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||    
T  34269 gttatgaagttatacttaattgatgaatttggatatgttgttgttgaaatgag 34321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 115
Target Start/End: Original strand, 61320 - 61419
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  61320 atgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatg-tttaattgatgttgttg 61418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 184
Target Start/End: Original strand, 154216 - 154269
Alignment:
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  154216 ttgtgggtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 154269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Original strand, 10556 - 10643
Alignment:
Q  139 gaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10556 gaatcatgacttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatggatcaaatggtgat 10643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 224
Target Start/End: Original strand, 1784 - 1877
Alignment:
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtg 224  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1784 ttgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaatgagatgttgttgttgttttgaaaaaatgggtcaaatggtg 1877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 115
Target Start/End: Original strand, 17407 - 17506
Alignment:
Q  15 atgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttg 114  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  17407 atgtatgaaaatgggttgctgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatg-tttaattgatgttgttg 17505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45064 - 44964
Alignment:
Q  125 atgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaatgggtcaaatggt 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  45064 atgttgttgtgggtgaatcatgacttgggtatacatatttatggattgatgatgagaaataagatgtggttagttgttttgcaaaaatgggtcaaatggt 44965  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  44964 g 44964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 54561 - 54369
Alignment:
Q  32 gttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgt 131  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||| || || ||| |||  | |||||||| ||| |  | |   |||||||    
T  54561 gttatgaaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttcca-ttgatgttgttgctattaactgatgttgt 54463  T
Q  132 tgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgtt-gttgttttgagaaaatgggtcaaatggtg 224  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  54462 tgtgggtgaatcatgagttgggtatacatatttatggattgatgatgagaaataagattttgttagttgttttgcaaaaatgggtcaaatggtg 54369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Original strand, 205 - 300
Alignment:
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  205 ttgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaataagatgttgttgttgttttaagaaaatgggtcaaatggtgat 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 53922 - 53827
Alignment:
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 226  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53922 ttgtgagtgaaccatgacttgggtatacatgttcatgggttgttgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggtgat 53827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 117
Target Start/End: Original strand, 13398 - 13479
Alignment:
Q  36 tgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13398 tgaaattatgtttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtggaaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 13479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 199
Target Start/End: Original strand, 104749 - 104892
Alignment:
Q  55 tgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggt 154  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  | ||| || || |||  |||||||||| |||||||| ||  || ||||||| | ||| | ||| |||||||    
T  104749 tgaattatgttatgttgttgttgaattatgatgataaccatgtt--aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 104846  T
Q  155 atacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttg 199  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  104847 attcataattcatgaattgatgatgataaatgagttgttgttgttg 104892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3461 - 3369
Alignment:
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggt 223  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3461 ttgtgagtgaaccatgacttgggtatacatgttcatgggttgttgatgaaaaatgagatgttgttgttgttttgagaaaatgggtcaaatggt 3369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2445 - 2341
Alignment:
Q  125 atgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaatgagatgttg---ttgttgttttgagaaaatgggtcaaatg 221  Q
    ||||| ||||| |||||| |||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2445 atgttattgtgagtgaatcatggtttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaatgagatgttgtttttgttgttttgagaaaatgggtcaaatg 2346  T
Q  222 gtgat 226  Q
    |||||    
T  2345 gtgat 2341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 16009 - 16111
Alignment:
Q  98 tttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttg 196  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  16009 tttaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgatttatgacttgggtattcataattcatgaattgatgatgataaatgagttattgttg 16108  T
Q  197 ttg 199  Q
    |||    
T  16109 ttg 16111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 3025 - 3127
Alignment:
Q  98 tttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttg 196  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  3025 tttaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgatttatgacatgggtattcataattcatgaattgatgatgataaatgagttattgttg 3124  T
Q  197 ttg 199  Q
    |||    
T  3125 ttg 3127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5231 - 5159
Alignment:
Q  128 ttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttg 199  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5231 ttgttgttggtgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatgataaatgagttgttgttgttg 5159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 4492 - 4594
Alignment:
Q  98 tttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttg 196  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  4492 tttaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgatttatgatttgggtattcataattcatgaattgatgatgataaatgagttattgttg 4591  T
Q  197 ttg 199  Q
    |||    
T  4592 ttg 4594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1643 - 1571
Alignment:
Q  128 ttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttg 199  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1643 ttgttgttggtgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatgataaatgagttgttgttgttg 1571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 79
Target Start/End: Original strand, 1619 - 1659
Alignment:
Q  39 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaa 79  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1619 aattatgctcaattgatgaattatgacatgttgttgttgaa 1659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 196
Target Start/End: Original strand, 76967 - 77114
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgac 148  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| | || |||||||||| |||||||| ||  || ||||| | | ||| | ||| |    
T  76967 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtgagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttattgatgattcatggc 77065  T
Q  149 ttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttg 196  Q
    |||||||| ||||||| |||  ||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  77066 ttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttg 77114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 78
Target Start/End: Original strand, 244920 - 244959
Alignment:
Q  39 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttga 78  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  244920 aattatgctcaattgatgaattatgacatgttgttgttga 244959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 37668 - 37535
Alignment:
Q  66 atgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataatt- 164  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||||| | ||| | ||  ||||||| | ||||| |     
T  37668 atgttattgttgaattgagacgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatc 37570  T
Q  165 atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttg 199  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37569 atgaattgatgatgagaaatgagttgttgttgttg 37535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 199
Target Start/End: Original strand, 43935 - 44068
Alignment:
Q  66 atgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataatt- 164  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||  || ||||||| | ||| | ||| ||||||| | ||||| |     
T  43935 atgttgttgttgaattatgatgagaatcatgttt-aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatc 44033  T
Q  165 atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttg 199  Q
    |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44034 atgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttg 44068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13645 - 13505
Alignment:
Q  38 aaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtggg 137  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||  | |||||| || | || |||||||||| |||||| | |   |||||||||| |     
T  13645 aaattgtgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatg-ttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgttga 13547  T
Q  138 tgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatga 179  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||| |||||    
T  13546 tgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatga 13505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 82
Target Start/End: Original strand, 44234 - 44275
Alignment:
Q  41 ttatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattg 82  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44234 ttatgctcaattgacgaattatgacatgttgttgttgaattg 44275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 243 - 203
Alignment:
Q  39 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaa 79  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  243 aattatgctcaattgttgaattatgacatgttgttgttgaa 203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 85660 - 85493
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgac 148  Q
    |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||| |||| || |||||||| ||| || ||||||| | ||| | |||||    
T  85660 aattaatgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagaatcatg-tttaagtgatattgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatgac 85562  T
Q  149 ttgggtatacat-aattatggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgtt-gttttgagaaaatgggt 215  Q
    |||||| | ||| ||| |||| ||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  85561 ttgggtgttcataaatcatggtttgttgatgaaaaataggttgttgttgttggttttgtaaaaatgggt 85493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31350 - 31303
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  31350 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 31303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 39693 - 39640
Alignment:
Q  131 ttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  39693 ttgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 39640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 39144 - 39097
Alignment:
Q  137 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaaat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  39144 gtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatgagaaat 39097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 35605 - 35491
Alignment:
Q  49 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgac 148  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||| || ||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||| | ||| |    
T  35605 aattgttgatttatgctatgttgttgttgaaatgtggtaagagtcatgttc-aattgatgtttttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggc 35507  T
Q  149 ttgggtatacataatt 164  Q
    |||||||| |||||||    
T  35506 ttgggtattcataatt 35491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2572 - 2419
Alignment:
Q  59 ttatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatac 158  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | |||||| || | || |||||||||| |||||||| ||  |||||||||| | ||| | ||| ||||||||| |    
T  2572 ttatgatatgttgttgttgaattatgatgagaaccatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattc 2474  T
Q  159 ataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgtt-gttttgagaaaat 211  Q
    ||||||  |   |||||||||| |||| || |||||||||| |||||| ||||||    
T  2473 ataattccttatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgtgaaaat 2419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10800 - 10639
Alignment:
Q  39 aattatgcttaattgat-gaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgtttttgttgctgagacatgttgttgtggg 137  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||| | |||||||| |||||  | |||||| || |||  |||||||||| || ||||| ||  |||||||||| |     
T  10800 aattatgcttaattggttggattatgatacgttgttgtcgaattatgatgagaaccatgttc-aattgatgttgtttttgctaagtgatgttgttgttga 10702  T
Q  138 tgaattatgacttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttg 199  Q
    | | | ||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10701 tcattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatgaaaaatgaattgttgttgttg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 5081 - 5035
Alignment:
Q  36 tgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattg 82  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5081 tgaaaatatgcttaattggtgaattatgatttgttgttgttgaattg 5035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 1472 - 1411
Alignment:
Q  22 aaaatgggt-tgttatgaaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattg 82  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||    
T  1472 aaaatgggtatgtgatgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattg 1411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1311 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1311
Description:

Target: scaffold1311; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1704 - 1652
Alignment:
Q  148 cttgggtatacataatt-atggattgatgatgaaaaatgagatgttgttgttg 199  Q
    ||||||||| ||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1704 cttgggtattcataattcatgatttgatgatgagaaatgagatgttgttgttg 1652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Original strand, 12712 - 12748
Alignment:
Q  38 aaattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttg 74  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12712 aaattatgctcaattgatgaattgtgacatgttgttg 12748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 161
Target Start/End: Original strand, 56310 - 56346
Alignment:
Q  125 atgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata 161  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  56310 atgttgttgtgggtgaatcatgacttgggtatgcata 56346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 79
Target Start/End: Original strand, 22176 - 22216
Alignment:
Q  39 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaa 79  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22176 aattatgttcaattggtgaattatgacatgttgttgttgaa 22216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University