View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10954A_low_70 (Length: 393)

Name: NF10954A_low_70
Description: NF10954A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10954A_low_70
NF10954A_low_70
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (20-393)||(19456333-19456706)
chr2 (17-393)||(21703073-21703449)
chr2 (15-391)||(34303210-34303586)
chr2 (24-391)||(27118646-27119013)
chr2 (25-391)||(3784612-3784978)
chr2 (25-391)||(16163557-16163923)
chr2 (25-391)||(34156969-34157334)
chr2 (25-391)||(31891245-31891611)
chr2 (20-366)||(27392952-27393298)
chr2 (15-369)||(23128473-23128827)
chr2 (15-369)||(27434351-27434705)
chr2 (15-369)||(28882194-28882548)
chr2 (15-339)||(40233521-40233845)
chr2 (15-369)||(12655522-12655876)
chr2 (15-369)||(20837898-20838252)
chr2 (15-339)||(9349889-9350213)
chr2 (15-369)||(22925935-22926289)
chr2 (15-369)||(11635093-11635447)
chr2 (15-369)||(21677089-21677443)
chr2 (15-339)||(12586820-12587144)
chr2 (15-369)||(11641282-11641636)
chr2 (15-343)||(13936451-13936779)
chr2 (15-339)||(27777232-27777556)
chr2 (15-339)||(27816990-27817314)
chr2 (15-339)||(37375171-37375495)
chr2 (50-369)||(34286334-34286653)
chr2 (50-369)||(34291394-34291713)
chr2 (15-369)||(12716509-12716863)
chr2 (15-369)||(16829245-16829599)
chr2 (15-369)||(16891882-16892236)
chr2 (15-369)||(31876261-31876615)
chr2 (15-369)||(34861660-34862014)
chr2 (15-369)||(37685816-37686170)
chr2 (15-369)||(37701081-37701435)
chr2 (15-369)||(37925473-37925827)
chr2 (15-339)||(39051729-39052053)
chr2 (18-339)||(27803717-27804038)
chr2 (15-339)||(260660-260984)
chr2 (15-369)||(32049778-32050132)
chr2 (134-369)||(34279429-34279664)
chr2 (15-273)||(39890150-39890408)
chr2 (15-273)||(19416406-19416664)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (20-393)||(15284851-15285224)
chr4 (17-393)||(15227845-15228221)
chr4 (17-393)||(1900232-1900608)
chr4 (25-391)||(24460533-24460899)
chr4 (20-393)||(14235448-14235824)
chr4 (50-366)||(15391291-15391607)
chr4 (15-369)||(17013999-17014353)
chr4 (15-370)||(24592232-24592587)
chr4 (15-369)||(14665017-14665371)
chr4 (15-369)||(5005872-5006226)
chr4 (15-369)||(14763222-14763576)
chr4 (15-369)||(14098540-14098894)
chr4 (15-369)||(31126436-31126790)
chr4 (15-351)||(6569870-6570206)
chr4 (15-339)||(18800531-18800855)
chr4 (15-339)||(36344433-36344757)
chr4 (15-339)||(33673716-33674040)
chr4 (15-285)||(40105556-40105826)
chr4 (46-375)||(34188909-34189238)
chr4 (15-339)||(30753783-30754107)
chr4 (15-369)||(27163235-27163589)
chr4 (46-375)||(24112655-24112984)
chr4 (15-339)||(39850667-39850991)
chr4 (15-339)||(54833416-54833740)
chr4 (15-369)||(21969700-21970054)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (20-393)||(16626470-16626843)
chr3 (17-363)||(18530339-18530685)
chr3 (25-391)||(4625867-4626233)
chr3 (25-391)||(17993753-17994119)
chr3 (15-369)||(32292697-32293051)
chr3 (24-391)||(5652310-5652677)
chr3 (15-369)||(31034076-31034430)
chr3 (15-369)||(15892665-15893019)
chr3 (15-370)||(8295916-8296271)
chr3 (15-369)||(18330614-18330968)
chr3 (15-348)||(22387537-22387870)
chr3 (25-369)||(5713172-5713516)
chr3 (25-369)||(5724082-5724426)
chr3 (25-369)||(5757051-5757395)
chr3 (25-369)||(5767942-5768286)
chr3 (15-369)||(15741053-15741407)
chr3 (15-369)||(18051207-18051561)
chr3 (15-375)||(8301226-8301586)
chr3 (15-369)||(4796612-4796966)
chr3 (15-369)||(6192261-6192615)
chr3 (15-369)||(29148714-29149068)
chr3 (15-369)||(4721576-4721930)
chr3 (15-369)||(7073157-7073511)
chr3 (15-369)||(35880711-35881065)
chr3 (15-369)||(4416864-4417218)
chr3 (15-369)||(10396078-10396432)
chr3 (15-369)||(28115913-28116267)
chr3 (15-339)||(11110308-11110632)
chr3 (15-369)||(17984915-17985269)
chr3 (15-369)||(18277011-18277365)
chr3 (15-369)||(18292312-18292666)
chr3 (15-369)||(18307613-18307967)
chr3 (15-339)||(5466960-5467284)
chr3 (15-339)||(29664929-29665253)
chr3 (15-339)||(36997036-36997360)
chr3 (15-369)||(21674638-21674992)
chr3 (15-375)||(4346646-4347006)
chr3 (15-339)||(6542421-6542745)
chr3 (15-375)||(28021214-28021574)
chr3 (15-339)||(48465902-48466226)
chr3 (15-369)||(31964432-31964786)
chr3 (15-369)||(50134030-50134384)
chr3 (15-339)||(8211713-8212037)
chr3 (15-339)||(20576806-20577130)
chr3 (15-369)||(5609281-5609635)
chr3 (15-369)||(28339247-28339601)
chr3 (15-285)||(51782052-51782322)
chr3 (15-348)||(22870815-22871148)
chr3 (15-348)||(22885874-22886207)
chr3 (15-285)||(51797141-51797412)
chr3 (15-369)||(47023398-47023752)
chr3 (46-375)||(32439093-32439422)
chr3 (15-273)||(5596316-5596574)
chr3 (15-369)||(18242684-18243038)
chr3 (46-339)||(20066018-20066311)
chr3 (15-339)||(5013687-5014011)
chr3 (15-369)||(7996507-7996861)
chr3 (15-369)||(10643015-10643369)
chr3 (15-369)||(18225136-18225490)
chr3 (15-273)||(24328200-24328458)
chr3 (149-375)||(4893149-4893375)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (15-393)||(2576-2954)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (15-393)||(20340253-20340631)
chr1 (17-363)||(20461070-20461416)
chr1 (17-393)||(16207951-16208324)
chr1 (15-369)||(28151845-28152199)
chr1 (15-369)||(10962653-10963007)
chr1 (15-369)||(41793226-41793580)
chr1 (15-369)||(28584964-28585318)
chr1 (15-258)||(51638312-51638555)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (23-389)||(16449810-16450176)
chr7 (17-393)||(16041284-16041660)
chr7 (15-369)||(26484679-26485033)
chr7 (25-391)||(31088278-31088644)
chr7 (23-369)||(2108817-2109163)
chr7 (15-357)||(39210827-39211169)
chr7 (25-391)||(45733423-45733789)
chr7 (15-369)||(2775344-2775698)
chr7 (15-219)||(26682804-26683008)
chr7 (15-219)||(4200682-4200886)
chr7 (13-369)||(5127977-5128333)
chr7 (46-369)||(18540784-18541107)
chr7 (15-369)||(11424580-11424934)
chr7 (16-369)||(16518221-16518574)
chr7 (15-375)||(10916672-10917032)
chr7 (16-369)||(16503185-16503538)
chr7 (15-369)||(2154558-2154912)
chr7 (15-369)||(5147144-5147498)
chr7 (15-369)||(26274898-26275252)
chr7 (15-369)||(26435242-26435596)
chr7 (15-339)||(3445321-3445645)
chr7 (15-369)||(4144927-4145281)
chr7 (15-339)||(11441587-11441911)
chr7 (15-339)||(31564194-31564518)
chr7 (15-369)||(26319673-26320027)
chr7 (15-339)||(26537674-26537998)
chr7 (15-369)||(9618636-9618990)
chr7 (15-369)||(26669718-26670072)
chr7 (15-369)||(45387328-45387682)
chr7 (15-369)||(16736264-16736618)
chr7 (15-369)||(16751318-16751672)
chr7 (15-369)||(17523517-17523871)
chr7 (15-369)||(17529344-17529698)
chr7 (15-273)||(24592345-24592603)
chr7 (15-369)||(31124905-31125259)
chr7 (46-375)||(5159498-5159827)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (15-369)||(22456795-22457149)
chr6 (15-369)||(14143146-14143500)
chr6 (15-369)||(26787925-26788279)
chr6 (15-369)||(27196298-27196652)
chr6 (15-369)||(27252588-27252942)
chr6 (25-391)||(28162616-28162982)
chr6 (25-391)||(33374127-33374493)
chr6 (20-391)||(13521939-13522310)
chr6 (25-391)||(8892182-8892547)
chr6 (25-391)||(8903417-8903782)
chr6 (15-372)||(27290231-27290588)
chr6 (122-369)||(22477241-22477488)
chr6 (20-384)||(20160667-20161031)
chr6 (20-384)||(22171800-22172164)
chr6 (15-370)||(22934741-22935096)
chr6 (15-370)||(23857186-23857541)
chr6 (15-343)||(27272441-27272769)
chr6 (15-369)||(26918361-26918715)
chr6 (15-351)||(26989000-26989336)
chr6 (18-369)||(16749835-16750186)
chr6 (15-369)||(13298812-13299166)
chr6 (15-369)||(24304479-24304833)
chr6 (15-369)||(24863698-24864052)
chr6 (15-375)||(29549450-29549810)
chr6 (29-369)||(27000054-27000394)
chr6 (15-369)||(15424178-15424532)
chr6 (15-369)||(29572994-29573348)
chr6 (15-339)||(4773017-4773341)
chr6 (15-339)||(4525297-4525621)
chr6 (15-339)||(4545636-4545960)
chr6 (15-339)||(4757775-4758099)
chr6 (15-339)||(16674150-16674474)
chr6 (15-339)||(3696092-3696416)
chr6 (15-339)||(4723995-4724319)
chr6 (15-339)||(27007738-27008062)
chr6 (15-339)||(28207465-28207789)
chr6 (15-339)||(34463207-34463531)
chr6 (14-369)||(27359852-27360207)
chr6 (14-369)||(27450195-27450550)
chr6 (15-369)||(30557877-30558231)
chr6 (15-339)||(17025288-17025612)
chr6 (15-273)||(29501492-29501750)
chr6 (15-339)||(27044398-27044723)
chr6 (15-267)||(26116271-26116523)
chr6 (14-273)||(26777475-26777734)
chr6 (15-273)||(16943888-16944146)
chr6 (15-141)||(17092301-17092427)
chr6 (15-369)||(27485110-27485464)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (17-393)||(22888439-22888815)
chr5 (17-393)||(25198998-25199374)
chr5 (25-391)||(13184473-13184839)
chr5 (15-375)||(29888897-29889257)
chr5 (20-391)||(33877218-33877589)
chr5 (25-391)||(13440319-13440685)
chr5 (15-369)||(23892199-23892553)
chr5 (25-391)||(11325765-11326131)
chr5 (15-369)||(24687972-24688326)
chr5 (15-369)||(23752265-23752619)
chr5 (15-369)||(33777480-33777834)
chr5 (15-375)||(30934620-30934980)
chr5 (15-366)||(24970014-24970365)
chr5 (15-369)||(11549347-11549701)
chr5 (15-369)||(23717803-23718157)
chr5 (15-369)||(9548358-9548712)
chr5 (15-369)||(22998929-22999283)
chr5 (15-369)||(15658575-15658929)
chr5 (15-339)||(37671298-37671622)
chr5 (15-339)||(28649258-28649582)
chr5 (15-339)||(31431463-31431787)
chr5 (15-339)||(31826222-31826546)
chr5 (15-369)||(8665290-8665644)
chr5 (15-369)||(9317444-9317798)
chr5 (15-369)||(12132148-12132502)
chr5 (15-369)||(15758672-15759026)
chr5 (15-369)||(18375227-18375581)
chr5 (15-369)||(30152011-30152365)
chr5 (23-339)||(18500553-18500869)
chr5 (15-369)||(2511044-2511398)
chr5 (15-369)||(26480385-26480739)
chr5 (15-369)||(37358458-37358812)
chr5 (14-375)||(32599286-32599647)
chr5 (15-369)||(6874298-6874652)
chr5 (15-369)||(33516349-33516703)
chr5 (15-339)||(24681463-24681787)
chr5 (15-339)||(24723990-24724314)
chr5 (15-375)||(34616505-34616865)
chr5 (15-339)||(40473364-40473688)
chr5 (15-339)||(43078275-43078599)
chr5 (15-369)||(30168462-30168816)
chr5 (15-339)||(13324644-13324968)
chr5 (15-339)||(37770802-37771126)
chr5 (46-369)||(41674702-41675025)
chr5 (15-369)||(5637903-5638257)
chr5 (15-339)||(3789564-3789888)
chr5 (15-339)||(37755003-37755327)
chr5 (15-273)||(29966881-29967139)
chr5 (15-273)||(30029504-30029762)
chr5 (46-348)||(33292539-33292841)
chr5 (14-357)||(28959600-28959943)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (17-366)||(20375-20723)
scaffold0124 (15-273)||(30532-30790)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (25-391)||(44563063-44563427)
chr8 (24-391)||(19658926-19659292)
chr8 (24-369)||(33244649-33244994)
chr8 (50-366)||(22080790-22081106)
chr8 (15-391)||(9354584-9354961)
chr8 (15-369)||(16283433-16283787)
chr8 (15-357)||(18710582-18710924)
chr8 (15-369)||(19688082-19688436)
chr8 (15-369)||(27608782-27609136)
chr8 (15-369)||(16277538-16277892)
chr8 (15-375)||(14557602-14557962)
chr8 (15-369)||(2137136-2137490)
chr8 (15-369)||(31354508-31354862)
chr8 (15-369)||(31489627-31489981)
chr8 (15-339)||(3329384-3329708)
chr8 (15-369)||(19208237-19208591)
chr8 (15-369)||(19674425-19674779)
chr8 (15-339)||(12092601-12092925)
chr8 (15-369)||(28361832-28362186)
chr8 (15-285)||(29829390-29829660)
chr8 (15-191)||(189256-189432)
chr8 (15-339)||(19286476-19286800)
chr8 (15-273)||(33258803-33259061)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (70-375)||(1-306)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (17-283)||(1838-2103)
scaffold0415 (23-285)||(6080-6344)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (50-343)||(21571-21864)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (15-369)||(39987-40341)
scaffold0089 (15-369)||(46903-47257)
scaffold0089 (15-369)||(29747-30101)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (16-369)||(27276-27629)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (15-207)||(536-728)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (15-369)||(47-402)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (15-375)||(9544-9904)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (15-369)||(26119-26474)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (15-369)||(7157-7511)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (15-369)||(14848-15202)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (15-369)||(8984-9338)
scaffold0159 (15-369)||(19999-20353)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (15-339)||(7963-8287)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (59-114)||(46764-46819)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 20 - 393
Target Start/End: Original strand, 19456333 - 19456706
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  19456333 tcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 19456432  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456433 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcattcttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 19456532  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagc 319  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19456533 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagc 19456632  T
Q  320 attgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatttg 393  Q
    ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  19456633 attggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttg 19456706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 393
Target Start/End: Original strand, 21703073 - 21703449
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  21703073 acatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 21703172  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703173 ttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcctttgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 21703272  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  21703273 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgtcctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcagcatac 21703372  T
Q  317 agcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatttg 393  Q
    | |||||| || ||||| || |||||| |||||||||| || |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  21703373 aacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 21703449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Original strand, 34303210 - 34303586
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  34303210 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttatagcagcatgtttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaa 34303309  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34303310 ggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttg 34303409  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||    
T  34303410 aggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcat 34303509  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
    ||| |||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  34303510 ataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 34303586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 24 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 27119013 - 27118646
Alignment:
Q  24 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  27119013 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 27118914  T
Q  124 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27118913 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 27118814  T
Q  224 tggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattg 323  Q
     ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| | ||| |    
T  27118813 cggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatacaacatcg 27118714  T
Q  324 ggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
    | || ||||| || |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  27118713 gtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 27118646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3784978 - 3784612
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  3784978 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 3784879  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  3784878 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 3784779  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  3784778 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 3784679  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
     ||  ||||||| |||||| |||| |||||||  ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  3784678 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 3784612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16163923 - 16163557
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  16163923 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 16163824  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16163823 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgccatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 16163724  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  16163723 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 16163624  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
     ||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  16163623 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 16163557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 34157334 - 34156969
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  34157334 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 34157235  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  34157234 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 34157136  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  34157135 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 34157036  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
     ||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  34157035 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 34156969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 25 - 391
Target Start/End: Original strand, 31891245 - 31891611
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||    
T  31891245 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacgtgagggacgttattcttaaaggtcaatttt 31891344  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||      
T  31891345 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacc 31891444  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  31891445 tgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 31891544  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
     ||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  31891545 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 31891611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27393298 - 27392952
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  27393298 tcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagtta 27393199  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    | ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27393198 actttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtc 27393099  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||||| | |    
T  27393098 agaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcatacatc 27392999  T
Q  320 attgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttg 366  Q
    ||||| || |||||||| |||||| | | |||||| || ||||||||    
T  27392998 attggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgttgctgttgttg 27392952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 23128473 - 23128827
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  23128473 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 23128572  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  23128573 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 23128672  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  23128673 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 23128772  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  23128773 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 23128827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 27434351 - 27434705
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  27434351 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 27434450  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  27434451 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 27434550  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   |||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| || ||| || ||||| ||||    
T  27434551 aggtcggacctgaacttgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagccggaagcaactcagcat 27434650  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  27434651 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 27434705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28882548 - 28882194
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  28882548 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28882449  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  28882448 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 28882349  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  28882348 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 28882249  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  28882248 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 28882194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 40233845 - 40233521
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  40233845 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcattttcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 40233746  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40233745 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 40233646  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  40233645 aggtcagaccggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctcagcat 40233546  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  40233545 acaacattggtataggaggaaaagt 40233521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12655876 - 12655522
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  12655876 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 12655777  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  12655776 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 12655677  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  12655676 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 12655577  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  12655576 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 12655522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20838252 - 20837898
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  20838252 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcaaatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 20838153  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||     
T  20838152 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacattta 20838053  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  20838052 aggtcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 20837953  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  20837952 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 20837898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 9349889 - 9350213
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9349889 ggacgtcaagaccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 9349988  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  9349989 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 9350088  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||| | || || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  9350089 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 9350188  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||    
T  9350189 ataacatcggtataggaggaaaagt 9350213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 22925935 - 22926289
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  22925935 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 22926034  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22926035 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22926134  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  22926135 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 22926234  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  22926235 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 22926289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 11635093 - 11635447
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||    
T  11635093 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaa 11635192  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |  ||||| || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  11635193 agtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 11635292  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  11635293 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 11635392  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  11635393 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 11635447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 21677089 - 21677443
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  21677089 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 21677188  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  21677189 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 21677288  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  21677289 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 21677388  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  21677389 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 21677443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12587144 - 12586820
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  12587144 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 12587045  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  12587044 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 12586945  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||  |||| ||||    
T  12586944 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcgactcagcat 12586845  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||    
T  12586844 ataacatcggtataggaggaaaagt 12586820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 11641282 - 11641636
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||    
T  11641282 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaa 11641381  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |  ||||| || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  11641382 agtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 11641481  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  11641482 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 11641581  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| |||  | || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  11641582 ataacatctgtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 11641636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 343
Target Start/End: Original strand, 13936451 - 13936779
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  13936451 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 13936550  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || |||||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  13936551 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 13936650  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  13936651 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 13936750  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggt 343  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||||||    
T  13936751 ataacatcggtatcggagggaaagtaggt 13936779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27777556 - 27777232
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  27777556 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 27777457  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  27777456 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 27777357  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  27777356 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 27777257  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||    
T  27777256 ataacatcggtataggaggaaaagt 27777232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27817314 - 27816990
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  27817314 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 27817215  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  27817214 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 27817115  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  27817114 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 27817015  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||    
T  27817014 ataacatcggtataggaggaaaagt 27816990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 37375495 - 37375171
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  37375495 ggacatcaagtctaggagcttccccacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 37375396  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  37375395 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 37375296  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  37375295 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcat 37375196  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | ||| || ||||||||||||||    
T  37375195 acaacataggtataggaggaaaagt 37375171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34286653 - 34286334
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 149  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| || || |    
T  34286653 atcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 34286554  T
Q  150 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 249  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  34286553 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 34286454  T
Q  250 tggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgggataggaggaaaagtaggtatagct 349  Q
    ||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||||||| |||||    
T  34286453 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 34286354  T
Q  350 tgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    || || |  |||||||||||    
T  34286353 tgctgattttgttgttgttg 34286334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34291713 - 34291394
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 149  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| || || |    
T  34291713 atcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 34291614  T
Q  150 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 249  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  34291613 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 34291514  T
Q  250 tggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgggataggaggaaaagtaggtatagct 349  Q
    ||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||||||| |||||    
T  34291513 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 34291414  T
Q  350 tgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    || || |  |||||||||||    
T  34291413 tgctgattttgttgttgttg 34291394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 12716509 - 12716863
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  12716509 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 12716608  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  12716609 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 12716708  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  12716709 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 12716808  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || |||||||||||||| ||| | |  | |||||| |||||||||||    
T  12716809 ataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgttgttgttg 12716863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 16829245 - 16829599
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  16829245 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16829344  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  16829345 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 16829444  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||    
T  16829445 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcat 16829544  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  16829545 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 16829599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16892236 - 16891882
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  16892236 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16892137  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  16892136 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 16892037  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||    
T  16892036 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcat 16891937  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  16891936 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 16891882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31876615 - 31876261
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  31876615 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 31876516  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31876515 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31876416  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || |    
T  31876415 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgt 31876316  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  31876315 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 31876261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34862014 - 34861660
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  34862014 ggacatctagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 34861915  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  34861914 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 34861815  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  34861814 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 34861715  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  34861714 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 34861660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 37685816 - 37686170
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  37685816 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37685915  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  37685916 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 37686015  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  37686016 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37686115  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  37686116 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 37686170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 37701081 - 37701435
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  37701081 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37701180  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  37701181 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 37701280  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  37701281 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37701380  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  37701381 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 37701435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37925827 - 37925473
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  37925827 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37925728  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||    
T  37925727 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatggaagtcgcatttg 37925628  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  37925627 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcgggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37925528  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| |||||| || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  37925527 ataacattggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 37925473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 39051729 - 39052053
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  39051729 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 39051828  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  39051829 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 39051928  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  39051929 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 39052028  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||    
T  39052029 ataacatcggtataggaggaaaagt 39052053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27804038 - 27803717
Alignment:
Q  18 catcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggt 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| ||    
T  27804038 catcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagt 27803939  T
Q  118 taattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagg 217  Q
     |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || ||     
T  27803938 cagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaaga 27803839  T
Q  218 tcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatata 317  Q
    |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||    
T  27803838 tcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatata 27803739  T
Q  318 gcattgggataggaggaaaagt 339  Q
     ||| || ||||||||||||||    
T  27803738 acatcggtataggaggaaaagt 27803717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 260660 - 260984
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||    
T  260660 ggacatcaagtctaggaacttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaa 260759  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  260760 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 260859  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  260860 agatcagacctgaaccttggaggcaacagatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 260959  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  260960 acaacattggtataggaggaaaagt 260984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 32050132 - 32049778
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  32050132 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 32050033  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  32050032 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 32049933  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  32049932 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtgggggtttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 32049833  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  32049832 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 32049778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34279664 - 34279429
Alignment:
Q  134 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 233  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |    
T  34279664 atgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttg 34279565  T
Q  234 gaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgggataggagg 333  Q
    |||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| || || |||||    
T  34279564 gaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagg 34279465  T
Q  334 aaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
     ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  34279464 gaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 34279429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 39890408 - 39890150
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  39890408 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 39890309  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||| ||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  39890308 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcagagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 39890209  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgt 273  Q
    || ||||    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||    
T  39890208 agatcagccctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 39890150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Original strand, 19416406 - 19416664
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  19416406 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 19416505  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  19416506 agtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 19416605  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||    
T  19416606 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 19416664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 20 - 393
Target Start/End: Original strand, 15284851 - 15285224
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  15284851 tcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcaacgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 15284950  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15284951 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 15285050  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagc 319  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  15285051 agaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcgaaatatagc 15285150  T
Q  320 attgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatttg 393  Q
    ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  15285151 attggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagttggtggctgttgttgcatttg 15285224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15228221 - 15227845
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  15228221 acatcaagtctgggagctatctcatataccccaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaagg 15228122  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15228121 ttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 15228022  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatat 316  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15228021 gtcagaacggaacctgggaggcaatggatcaggtggaggcttaccctgtctggttgtacagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatat 15227922  T
Q  317 agcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatttg 393  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  15227921 agcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttg 15227845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1900608 - 1900232
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||| |    
T  1900608 acatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaaggacataagggacattattctcaaaag 1900509  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900508 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagtgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 1900409  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatat 316  Q
    ||||||| | |||||| || ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  1900408 gtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcaggtggaggcttaccatgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatac 1900309  T
Q  317 agcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatttg 393  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  1900308 agcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgctgttgaactggtggctgttgttgcatttg 1900232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 391
Target Start/End: Original strand, 24460533 - 24460899
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  24460533 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 24460632  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24460633 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 24460732  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  24460733 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 24460832  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
     ||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  24460833 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 24460899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 393
Target Start/End: Original strand, 14235448 - 14235824
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  14235448 tcaagactgggagcttcttcataggtctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagtta 14235547  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    | ||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14235548 actttccctggtctatgagcttctttacaatgaacttcaaagcgtaacatccctcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 14235647  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagc 319  Q
      ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||| | |    
T  14235648 gaaatggaacctgggaggcaaagggttaggtggaggcttgccctgtctggttgtacagtgccctttaagaagcagagtcgggagcagctcggcatacaac 14235747  T
Q  320 attgggataggaggaaaagtaggtatagc---ttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatttg 393  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||| ||||   ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||    
T  14235748 attggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgttgctgctgttgttgctgagccggcggctgttgttgcatttg 14235824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 50 - 366
Target Start/End: Original strand, 15391291 - 15391607
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||||||| |||||||    
T  15391291 atcatgttcacagcagcgtgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttctttacaa 15391390  T
Q  150 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15391391 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttagg 15391490  T
Q  250 tggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgggataggaggaaaagtaggtatagct 349  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||| | | |    
T  15391491 tggaggcttcccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcaactcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtt 15391590  T
Q  350 tgttgctggtgttgttg 366  Q
    |||||||| ||||||||    
T  15391591 tgttgctgctgttgttg 15391607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17014353 - 17013999
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  17014353 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 17014254  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  17014253 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 17014154  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  17014153 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctttggagtaaagtcggaagcaactcagcat 17014054  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  17014053 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 17013999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 24592232 - 24592587
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24592232 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgattgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24592331  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  24592332 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 24592431  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  24592432 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 24592531  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttga 370  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  ||||||||||||    
T  24592532 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttga 24592587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14665371 - 14665017
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  14665371 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaa 14665272  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  14665271 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 14665172  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  14665171 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 14665072  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  14665071 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 14665017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5006226 - 5005872
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  5006226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5006127  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5006126 agtcaacttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5006027  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  5006026 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 5005927  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  5005926 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 5005872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 14763222 - 14763576
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  14763222 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 14763321  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  14763322 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 14763421  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  14763422 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 14763521  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  14763522 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 14763576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14098894 - 14098540
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  14098894 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 14098795  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  14098794 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 14098695  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || ||||    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  14098694 agatcagtcctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 14098595  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  14098594 acaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 14098540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 31126436 - 31126790
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  31126436 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 31126535  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31126536 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31126635  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||    
T  31126636 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcat 31126735  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  31126736 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 31126790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6570206 - 6569870
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  6570206 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 6570107  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||    
T  6570106 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 6570007  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  6570006 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 6569907  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttg 351  Q
    | | |||||| || ||||| ||||||||| |||||||    
T  6569906 acaacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttg 6569870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 18800531 - 18800855
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  18800531 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 18800630  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  18800631 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 18800730  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  18800731 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 18800830  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  18800831 acaacattggtataggaggaaaagt 18800855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 36344433 - 36344757
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  36344433 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 36344532  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  36344533 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 36344632  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  36344633 agatcagacctgaacctcggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcat 36344732  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | ||| || ||||||||||||||    
T  36344733 acaacataggtataggaggaaaagt 36344757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 33673716 - 33674040
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  33673716 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 33673815  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  33673816 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 33673915  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  33673916 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 33674015  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  33674016 acaacattggtataggaggaaaagt 33674040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Original strand, 40105556 - 40105826
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  40105556 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 40105655  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  40105656 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 40105755  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| || || || ||||||||    
T  40105756 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 40105826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 375
Target Start/End: Original strand, 34188909 - 34189238
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  34188909 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 34189008  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  34189009 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcaccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 34189108  T
Q  246 taggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgggataggaggaaaagtaggtat 345  Q
      |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | |||||| |||||||||||||| ||| |    
T  34189109 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 34189208  T
Q  346 agcttgttgctggtgttgttgttgagctgg 375  Q
    ||| | |||||| || || |||||| ||||    
T  34189209 agcatattgctgctgctgctgttgaactgg 34189238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 30754107 - 30753783
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  30754107 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 30754008  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  30754007 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 30753908  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  30753907 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 30753808  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  30753807 acaacattggtataggaggaaaagt 30753783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 27163235 - 27163589
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  27163235 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27163334  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  27163335 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 27163434  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  27163435 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 27163534  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  27163535 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 27163589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24112984 - 24112655
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  24112984 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 24112885  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  24112884 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 24112785  T
Q  246 taggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgggataggaggaaaagtaggtat 345  Q
      |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | |||||| |||||||||||||| ||| |    
T  24112784 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 24112685  T
Q  346 agcttgttgctggtgttgttgttgagctgg 375  Q
    ||| | |||||| || || |||||| ||||    
T  24112684 agcatattgctgctgctgctgttgaactgg 24112655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 39850991 - 39850667
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  39850991 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 39850892  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||     
T  39850891 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacattta 39850792  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  39850791 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 39850692  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||    
T  39850691 ataacatcggtataggaggaaaagt 39850667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 54833740 - 54833416
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  54833740 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 54833641  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  54833640 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 54833541  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  54833540 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcat 54833441  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | ||| || ||||||||||||||    
T  54833440 acaacataggtataggaggaaaagt 54833416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21970054 - 21969700
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | |  |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  21970054 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacatttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 21969955  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  21969954 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 21969855  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||| | || || || || || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  21969854 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 21969755  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  21969754 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 21969700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 20 - 393
Target Start/End: Original strand, 16626470 - 16626843
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  16626470 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagtgtgattcggaagaggattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 16626569  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626570 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 16626669  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagc 319  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |    
T  16626670 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctaagaagtagagtagggagtaactcgacatatatc 16626769  T
Q  320 attgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatttg 393  Q
    ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  16626770 attggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttg 16626843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18530685 - 18530339
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  18530685 acattaagtctgggagctccctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaagg 18530586  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530585 tcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 18530486  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||     
T  18530485 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcaggagtaactcagcatac 18530386  T
Q  317 agcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttg 363  Q
    | |||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  18530385 aacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttg 18530339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4626233 - 4625867
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  4626233 tctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 4626134  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4626133 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 4626034  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  4626033 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 4625934  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
     ||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  4625933 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 4625867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 391
Target Start/End: Original strand, 17993753 - 17994119
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  17993753 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 17993852  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  17993853 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaac 17993952  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  17993953 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 17994052  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
     ||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  17994053 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 17994119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 32293051 - 32292697
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32293051 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 32292952  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32292951 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 32292852  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32292851 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggagacttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 32292752  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    |||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  32292751 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 32292697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 24 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5652677 - 5652310
Alignment:
Q  24 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  5652677 gtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattt 5652578  T
Q  124 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5652577 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 5652478  T
Q  224 tggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattg 323  Q
     ||||| |||||||| |||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || ||||||| |||||    
T  5652477 cggaacttgggaggcgacgggtcaggtgaaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattg 5652378  T
Q  324 ggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
    | ||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  5652377 gtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 5652310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 31034076 - 31034430
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31034076 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 31034175  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31034176 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 31034275  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31034276 aggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 31034375  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    |||||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| |||||||    
T  31034376 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 31034430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 15892665 - 15893019
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15892665 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 15892764  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  15892765 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 15892864  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  15892865 agatcggacctgaacctgggaggcaaaggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 15892964  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  15892965 acaacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttg 15893019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 8296271 - 8295916
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  8296271 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 8296172  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  8296171 agtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 8296072  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||||||||||||| ||| |||| | |||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  8296071 agatcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtaggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctgtggagtaaagtcggaagcaactcagcat 8295972  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttga 370  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  ||||||||||||    
T  8295971 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttga 8295916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18330968 - 18330614
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18330968 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18330869  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  18330868 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 18330769  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | ||||  ||||| || ||||| ||||    
T  18330768 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaggtcggaagcaactcagcat 18330669  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  18330668 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 18330614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 22387537 - 22387870
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  22387537 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 22387636  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  22387637 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 22387736  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  22387737 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactctgcat 22387836  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagc 348  Q
    | | |||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  22387837 acaacattggtataggaggaaaagtcggtctagc 22387870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5713516 - 5713172
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5713516 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5713417  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||      
T  5713416 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5713317  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||    
T  5713316 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcgg 5713217  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
     || ||||| ||||||||| | ||||| || |  |||||||||||    
T  5713216 tatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttg 5713172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5724426 - 5724082
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5724426 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5724327  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||      
T  5724326 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5724227  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||    
T  5724226 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcgg 5724127  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
     || ||||| ||||||||| | ||||| || |  |||||||||||    
T  5724126 tatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttg 5724082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 5757051 - 5757395
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5757051 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5757150  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||      
T  5757151 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5757250  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||    
T  5757251 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcgg 5757350  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
     || ||||| ||||||||| | ||||| || |  |||||||||||    
T  5757351 tatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttg 5757395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 5767942 - 5768286
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5767942 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5768041  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||      
T  5768042 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5768141  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||    
T  5768142 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcgg 5768241  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
     || ||||| ||||||||| | ||||| || |  |||||||||||    
T  5768242 tatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttg 5768286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 15741053 - 15741407
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15741053 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 15741152  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  15741153 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttgatgaaaatcacatttg 15741252  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| |||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  15741253 agatcggacctgaaccttggaggcaacgaatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 15741352  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  15741353 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 15741407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18051561 - 18051207
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18051561 ggacatcaagtctaggagctttctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 18051462  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||    
T  18051461 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatagaaatcacatttg 18051362  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  18051361 agatcggacctgaacctgggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 18051262  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  18051261 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 18051207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 375
Target Start/End: Original strand, 8301226 - 8301586
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  8301226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 8301325  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  8301326 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctctacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 8301425  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  8301426 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 8301525  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctgg 375  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||| ||||    
T  8301526 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactgg 8301586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 4796612 - 4796966
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  4796612 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4796711  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  4796712 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 4796811  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  4796812 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 4796911  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  4796912 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 4796966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6192615 - 6192261
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  6192615 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 6192516  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  6192515 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 6192416  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  6192415 aggtcggacctgaaccttggaggcagcagatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 6192316  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  6192315 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 6192261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 29148714 - 29149068
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  29148714 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 29148813  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  29148814 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 29148913  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  29148914 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 29149013  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  29149014 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 29149068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4721930 - 4721576
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||| |||    
T  4721930 ggacatcgagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaa 4721831  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||| |||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  4721830 agtcagctttccttgatcaatgagatttttcacgatatacttcaaagtgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 4721731  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  4721730 aggtcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 4721631  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  4721630 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 4721576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7073511 - 7073157
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  7073511 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 7073412  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  7073411 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 7073312  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||| || |||||  | ||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  7073311 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgggggcttaccttgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 7073212  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||||||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  7073211 ataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 7073157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 35881065 - 35880711
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  35881065 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 35880966  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||    
T  35880965 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttg 35880866  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  35880865 agatcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtttggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 35880766  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  35880765 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 35880711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4417218 - 4416864
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  4417218 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 4417119  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  4417118 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 4417019  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  4417018 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 4416919  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  4416918 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 4416864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 10396432 - 10396078
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  10396432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 10396333  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
    ||| |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  10396332 ggtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 10396233  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  10396232 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcat 10396133  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  10396132 acaacataggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 10396078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 28115913 - 28116267
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  28115913 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28116012  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||    
T  28116013 tgtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 28116112  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||    
T  28116113 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaagtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaattcagcat 28116212  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  28116213 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 28116267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 11110308 - 11110632
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  11110308 ggacatcaagtcttggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11110407  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  11110408 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 11110507  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  11110508 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 11110607  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  11110608 acaacattggtataggaggaaaagt 11110632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 17984915 - 17985269
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  17984915 ggacatcaagtctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 17985014  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  17985015 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 17985114  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||    
T  17985115 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcat 17985214  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  17985215 acaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 17985269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 18277011 - 18277365
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18277011 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18277110  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18277111 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18277210  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  18277211 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 18277310  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  18277311 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 18277365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 18292312 - 18292666
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18292312 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18292411  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18292412 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18292511  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  18292512 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 18292611  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  18292612 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 18292666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 18307613 - 18307967
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18307613 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18307712  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18307713 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18307812  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  18307813 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 18307912  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  18307913 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 18307967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5467284 - 5466960
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  5467284 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5467185  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || | ||| ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  5467184 agtcagtttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5467085  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || ||||  || ||||    
T  5467084 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaggagttctgcat 5466985  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | ||| || ||| ||||||||||    
T  5466984 acaacataggtataagaggaaaagt 5466960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 29664929 - 29665253
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  29664929 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29665028  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||     
T  29665029 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacattta 29665128  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  29665129 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 29665228  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||    
T  29665229 ataacatcggtataggaggaaaagt 29665253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 36997036 - 36997360
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||  ||||  || ||||||||    
T  36997036 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatatgggacattattctcaaa 36997135  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  36997136 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 36997235  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||    
T  36997236 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcat 36997335  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  36997336 acaacattggtataggaggaaaagt 36997360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21674992 - 21674638
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||    || ||||||||    
T  21674992 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaa 21674893  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  21674892 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 21674793  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  21674792 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtagagttggaagaagttctgcat 21674693  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  21674692 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttg 21674638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 375
Target Start/End: Original strand, 4346646 - 4347006
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  || ||||||||    
T  4346646 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4346745  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  4346746 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 4346845  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  4346846 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 4346945  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctgg 375  Q
    | | |||||| |||||||||||||| ||| |||| | |||||| || || |||||| ||||    
T  4346946 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactgg 4347006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 6542421 - 6542745
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  6542421 ggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 6542520  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  6542521 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 6542620  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  6542621 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 6542720  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  6542721 acaacattggtataggaggaaaagt 6542745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28021574 - 28021214
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  28021574 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaa 28021475  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  28021474 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 28021375  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||| || |||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  28021374 agatcagacctgaaccttggaggtaatggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtatagttggaagaagttctgcat 28021275  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctgg 375  Q
    | | |||||| |||||||||||||| ||| |||| | |||||| || || |||||| ||||    
T  28021274 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactgg 28021214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 48466226 - 48465902
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  48466226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 48466127  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  48466126 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 48466027  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  48466026 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctttggagtaaagttggaagaagttctgcat 48465927  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  48465926 acaacattggtataggaggaaaagt 48465902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 31964432 - 31964786
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  31964432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 31964531  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  31964532 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 31964631  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  31964632 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 31964731  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  31964732 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 31964786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 50134030 - 50134384
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  50134030 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 50134129  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  50134130 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 50134229  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  50134230 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 50134329  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  50134330 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 50134384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8212037 - 8211713
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  8212037 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 8211938  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  8211937 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 8211838  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  8211837 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 8211738  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  8211737 acaacattggtataggaggaaaagt 8211713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 20576806 - 20577130
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  20576806 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 20576905  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  20576906 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 20577005  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  20577006 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 20577105  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||    
T  20577106 ataacatcggtataggaggaaaagt 20577130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 5609281 - 5609635
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  5609281 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 5609380  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5609381 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccttcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5609480  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  5609481 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 5609580  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  5609581 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 5609635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28339601 - 28339247
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  28339601 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 28339502  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||    
T  28339501 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 28339402  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  28339401 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 28339302  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  28339301 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 28339247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 51782322 - 51782052
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  51782322 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51782223  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  51782222 agtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 51782123  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||    
T  51782122 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51782052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 22870815 - 22871148
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  22870815 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 22870914  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22870915 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22871014  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  22871015 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 22871114  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagc 348  Q
    | | |||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  22871115 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22871148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 22885874 - 22886207
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  22885874 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 22885973  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22885974 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22886073  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  22886074 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 22886173  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagc 348  Q
    | | |||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  22886174 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22886207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 51797412 - 51797141
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  51797412 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51797313  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  51797312 agtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 51797213  T
Q  215 aggtcagaatggaacc-tgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    || |||||   ||||| || |||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||    
T  51797212 agatcagacctgaaccttgtgaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51797141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 47023752 - 47023398
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  47023752 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 47023653  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  47023652 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 47023553  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  47023552 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 47023453  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  47023452 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 47023398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32439422 - 32439093
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  32439422 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 32439323  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  32439322 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 32439223  T
Q  246 taggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgggataggaggaaaagtaggtat 345  Q
      |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | |||||| |||||||||||||| ||| |    
T  32439222 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 32439123  T
Q  346 agcttgttgctggtgttgttgttgagctgg 375  Q
    ||| | |||||| || || |||||| ||||    
T  32439122 agcatattgctgctgctgctgttgaactgg 32439093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Original strand, 5596316 - 5596574
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  5596316 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 5596415  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  5596416 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5596515  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||    
T  5596516 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 5596574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18243038 - 18242684
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  18243038 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 18242939  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  18242938 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18242839  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  18242838 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 18242739  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| |||||||||||||| ||| |||  |  ||||| |||||||||||    
T  18242738 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 18242684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20066311 - 20066018
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  20066311 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcatattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 20066212  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || ||      
T  20066211 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggc 20066112  T
Q  246 taggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
      |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  20066111 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagt 20066018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5014011 - 5013687
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  5014011 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 5013912  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  5013911 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 5013812  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || |    
T  5013811 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgt 5013712  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  5013711 acaacattggtataggaggaaaagt 5013687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7996861 - 7996507
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  7996861 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 7996762  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  7996761 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 7996662  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  7996661 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 7996562  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  7996561 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 7996507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 10643369 - 10643015
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  10643369 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 10643270  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  10643269 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 10643170  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  10643169 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 10643070  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  10643069 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 10643015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18225490 - 18225136
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18225490 ggacatcaagcctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18225391  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  18225390 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18225291  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  18225290 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 18225191  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| |||||||| || |||||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  18225190 acaacattggtataggagggaaggtaggcctagcttgttgattttgttgttgttg 18225136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24328458 - 24328200
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  24328458 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 24328359  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  24328358 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 24328259  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||    
T  24328258 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 24328200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4893375 - 4893149
Alignment:
Q  149 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 248  Q
    |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |  |    
T  4893375 atgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagtggaaccttggaggtaaagggtccg 4893276  T
Q  249 gtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgggataggaggaaaagtaggtatagc 348  Q
    ||||||| ||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | |||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  4893275 gtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 4893176  T
Q  349 ttgttgctggtgttgttgttgagctgg 375  Q
     | |||||| || || |||||| ||||    
T  4893175 atattgctgctgctgctgttgaactgg 4893149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 393
Target Start/End: Original strand, 2576 - 2954
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2576 ggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaa 2675  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 2775  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  2776 aggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcat 2875  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatttg 393  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  2876 atagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctgatgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcatttg 2954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 393
Target Start/End: Original strand, 20340253 - 20340631
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20340253 ggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaa 20340352  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340353 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 20340452  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  20340453 aggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcat 20340552  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatttg 393  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  20340553 atagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctgatgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcatttg 20340631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20461416 - 20461070
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||    
T  20461416 acatcaagtctgcgagcttgctcatatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattatcgaggacatgagggacgatattttcaaagg 20461317  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20461316 tcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgag 20461217  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20461216 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatat 20461117  T
Q  317 agcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttg 363  Q
    |||||| | || |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  20461116 agcattagtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgttg 20461070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 393
Target Start/End: Original strand, 16207951 - 16208324
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  16207951 acatcaagtctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 16208050  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208051 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 16208150  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  16208151 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggttttccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggtatac 16208250  T
Q  317 agcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatttg 393  Q
    | |||||| || |||||||| |||||| ||||||||   || |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  16208251 aacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgt---tgatgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 16208324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28152199 - 28151845
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28152199 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatatctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 28152100  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28152099 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 28152000  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28151999 aggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 28151900  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    |||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  28151899 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 28151845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 10963007 - 10962653
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  10963007 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 10962908  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  10962907 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaagtcacatttg 10962808  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | || | ||| || || ||||| ||||    
T  10962807 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagcaaagttggaagcaactcagcat 10962708  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  10962707 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 10962653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 41793226 - 41793580
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  41793226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 41793325  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  41793326 agtcagcttcccttgatcgacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 41793425  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  41793426 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 41793525  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  41793526 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 41793580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28585318 - 28584964
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  28585318 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28585219  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || || || |||    
T  28585218 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcgcatttg 28585119  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  28585118 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 28585019  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  28585018 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 28584964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 51638555 - 51638312
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  51638555 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51638456  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  51638455 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 51638356  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggctt 258  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| |||||    
T  51638355 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggctt 51638312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 389
Target Start/End: Original strand, 16449810 - 16450176
Alignment:
Q  23 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |    
T  16449810 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaact 16449909  T
Q  123 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    |||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449910 ttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 16450009  T
Q  223 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcatt 322  Q
    | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16450010 acgaaacctgggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcatt 16450109  T
Q  323 gggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgca 389  Q
    || || |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  16450110 ggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttgagctggtggctgttgttgca 16450176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16041660 - 16041284
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  16041660 acatcgagtctgggagcttcctcgtatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 16041561  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16041560 ttaactttccctgatcaatgagctttttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactttag 16041461  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  16041460 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatac 16041361  T
Q  317 agcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatttg 393  Q
    | |||||| || ||||| || |||||| |||||||||| || |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  16041360 aacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 16041284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26485033 - 26484679
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26485033 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 26484934  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26484933 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26484834  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26484833 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 26484734  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    |||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  26484733 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 26484679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 25 - 391
Target Start/End: Original strand, 31088278 - 31088644
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  31088278 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 31088377  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31088378 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 31088477  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  31088478 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 31088577  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
     ||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  31088578 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 31088644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Original strand, 2108817 - 2109163
Alignment:
Q  23 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |    
T  2108817 agtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaact 2108916  T
Q  123 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2108917 ttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 2109016  T
Q  223 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcatt 322  Q
      ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  2109017 ccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatatcatt 2109116  T
Q  323 gggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    || ||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  2109117 ggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 2109163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Original strand, 39210827 - 39211169
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39210827 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 39210926  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  39210927 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccaaagcaccttgatggaaatcacatttg 39211026  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39211027 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaagcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 39211126  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctg 357  Q
    |||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39211127 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctg 39211169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 25 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 45733789 - 45733423
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  45733789 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 45733690  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  45733689 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 45733590  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| || || ||||||| ||||||    
T  45733589 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagttaagagtaattcagcatataacattgg 45733490  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
     ||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  45733489 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 45733423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2775698 - 2775344
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2775698 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 2775599  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2775598 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 2775499  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  2775498 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagctactcagcat 2775399  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    |||||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||  ||| |||||||    
T  2775398 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttg 2775344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 26682804 - 26683008
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  26682804 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaa 26682903  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26682904 ggtcaattttccttggtctatgagtttttttaaaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26683003  T
Q  215 aggtc 219  Q
    |||||    
T  26683004 aggtc 26683008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4200886 - 4200682
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4200886 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 4200787  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4200786 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 4200687  T
Q  215 aggtc 219  Q
    |||||    
T  4200686 aggtc 4200682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5128333 - 5127977
Alignment:
Q  13 atggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctca 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||    
T  5128333 atggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctca 5128234  T
Q  113 aaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacact 212  Q
    || || |  |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  5128233 aaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatt 5128134  T
Q  213 tgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggc 312  Q
    |||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||    
T  5128133 tgagatcagacctgaaccttggaggcaacggattaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagc 5128034  T
Q  313 atatagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| | ||| || || ||||||||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  5128033 atacaacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 5127977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18541107 - 18540784
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  18541107 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 18541008  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  18541007 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 18540908  T
Q  246 taggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgggataggaggaaaagtaggtat 345  Q
      |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |    
T  18540907 ccggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaagtaggtct 18540808  T
Q  346 agcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  18540807 agcttgttgctgctgtcgttgttg 18540784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 11424580 - 11424934
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  11424580 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11424679  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  11424680 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 11424779  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  11424780 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtgcaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 11424879  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  11424880 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 11424934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 369
Target Start/End: Original strand, 16518221 - 16518574
Alignment:
Q  16 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaag 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||     
T  16518221 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaa 16518320  T
Q  116 gttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttga 215  Q
    || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  16518321 gtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 16518420  T
Q  216 ggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcata 315  Q
    | || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| |||||    
T  16518421 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcata 16518520  T
Q  316 tagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
     | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  16518521 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 16518574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 375
Target Start/End: Original strand, 10916672 - 10917032
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  10916672 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 10916771  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  10916772 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 10916871  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  10916872 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 10916971  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctgg 375  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||| ||||    
T  10916972 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactgg 10917032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 369
Target Start/End: Original strand, 16503185 - 16503538
Alignment:
Q  16 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaag 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||     
T  16503185 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaa 16503284  T
Q  116 gttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttga 215  Q
    || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  16503285 gtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 16503384  T
Q  216 ggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcata 315  Q
    | || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| |||||    
T  16503385 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcata 16503484  T
Q  316 tagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
     | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  16503485 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 16503538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2154912 - 2154558
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  2154912 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 2154813  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||    
T  2154812 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttg 2154713  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  2154712 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 2154613  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| |||||| || ||||||| || |  |||||||||||    
T  2154612 acaacatcggtatcggagggaaagtatgtctagcttgctgattttgttgttgttg 2154558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 5147144 - 5147498
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  5147144 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5147243  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5147244 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5147343  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  5147344 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 5147443  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  5147444 ataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgttgattttgttgttgttg 5147498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 26274898 - 26275252
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26274898 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26274997  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26274998 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26275097  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  26275098 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 26275197  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  26275198 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 26275252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26435596 - 26435242
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26435596 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26435497  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  26435496 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 26435397  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  26435396 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 26435297  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  26435296 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttg 26435242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3445645 - 3445321
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  3445645 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 3445546  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  3445545 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 3445446  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  3445445 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 3445346  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  3445345 acaacattggtataggaggaaaagt 3445321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 4144927 - 4145281
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  4144927 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4145026  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  4145027 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 4145126  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  4145127 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 4145226  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  4145227 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 4145281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 11441911 - 11441587
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  11441911 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11441812  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  11441811 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 11441712  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || |    
T  11441711 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcgt 11441612  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  11441611 acaacattggtataggaggaaaagt 11441587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 31564194 - 31564518
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  31564194 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31564293  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  31564294 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 31564393  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  31564394 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 31564493  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  31564494 acaacattggtataggaggaaaagt 31564518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 26319673 - 26320027
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26319673 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26319772  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26319773 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26319872  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  26319873 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 26319972  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  26319973 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 26320027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 26537674 - 26537998
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  26537674 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 26537773  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  26537774 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 26537873  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| || |  || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  26537874 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgcacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 26537973  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||    
T  26537974 ataacatcggtataggaggaaaagt 26537998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9618990 - 9618636
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  9618990 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9618891  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  9618890 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 9618791  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  9618790 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 9618691  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  9618690 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 9618636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 26669718 - 26670072
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26669718 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26669817  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  26669818 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 26669917  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| || |||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  26669918 agatcagacctgaaccttgggggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 26670017  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  26670018 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 26670072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 45387682 - 45387328
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  45387682 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 45387583  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  45387582 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 45387483  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  45387482 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 45387383  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  45387382 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 45387328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 16736264 - 16736618
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  16736264 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 16736363  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  16736364 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 16736463  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  16736464 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 16736563  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  16736564 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 16736618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 16751318 - 16751672
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  16751318 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 16751417  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  16751418 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 16751517  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  16751518 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 16751617  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  16751618 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 16751672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17523871 - 17523517
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  17523871 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 17523772  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  17523771 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 17523672  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  17523671 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 17523572  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  17523571 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 17523517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 17529344 - 17529698
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  17529344 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 17529443  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  17529444 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 17529543  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  17529544 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 17529643  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  17529644 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 17529698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Original strand, 24592345 - 24592603
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  24592345 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 24592444  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  24592445 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 24592544  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||    
T  24592545 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 24592603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31125259 - 31124905
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  31125259 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31125160  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31125159 agtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31125060  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  31125059 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 31124960  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| |||||||||||||| ||| |||  |  ||||| |||||||||||    
T  31124959 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 31124905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5159827 - 5159498
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    |||||| || ||||| ||||| | ||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  5159827 ctcaattatattcacggcagcatcatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 5159728  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || | ||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  5159727 acgatgtactttagagcatagcaccccttaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 5159628  T
Q  246 taggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgggataggaggaaaagtaggtat 345  Q
      |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | |||||| |||||||||||||| ||| |    
T  5159627 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 5159528  T
Q  346 agcttgttgctggtgttgttgttgagctgg 375  Q
    ||| | |||||| || || |||||| ||||    
T  5159527 agcatattgctgctgctgctgttgaactgg 5159498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 22456795 - 22457149
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22456795 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaa 22456894  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456895 agttaactttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 22456994  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22456995 aggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccttatgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 22457094  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  22457095 acatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttg 22457149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 14143146 - 14143500
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14143146 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 14143245  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14143246 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 14143345  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14143346 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 14143445  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    |||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  14143446 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 14143500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26788279 - 26787925
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26788279 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 26788180  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26788179 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26788080  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26788079 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 26787980  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    |||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  26787979 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 26787925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27196652 - 27196298
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27196652 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 27196553  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27196552 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 27196453  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27196452 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 27196353  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    |||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  27196352 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 27196298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 27252588 - 27252942
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27252588 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 27252687  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27252688 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 27252787  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27252788 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 27252887  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    |||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  27252888 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 27252942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28162982 - 28162616
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  28162982 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 28162883  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  28162882 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcctccgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 28162783  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  28162782 ggaacttgggaggcgatggatcaagtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 28162683  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
     ||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  28162682 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 28162616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 391
Target Start/End: Original strand, 33374127 - 33374493
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||    
T  33374127 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaatttt 33374226  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  33374227 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 33374326  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  33374327 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 33374426  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
     ||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  33374427 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 33374493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 20 - 391
Target Start/End: Original strand, 13521939 - 13522310
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  13521939 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 13522038  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522039 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 13522138  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagc 319  Q
     ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| |    
T  13522139 cgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataac 13522238  T
Q  320 attgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  13522239 attggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 13522310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 25 - 391
Target Start/End: Original strand, 8892182 - 8892547
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8892182 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 8892281  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  8892282 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 8892380  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  8892381 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 8892480  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
     ||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  8892481 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 8892547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 25 - 391
Target Start/End: Original strand, 8903417 - 8903782
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8903417 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 8903516  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  8903517 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 8903615  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  8903616 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 8903715  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
     ||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  8903716 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 8903782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 27290231 - 27290588
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  27290231 ggacatcaagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatatttacagtagcatgattcggaagaagattgttgaggacatgagggacattgttctcaaa 27290330  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290331 agttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 27290430  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27290431 aggtcagaacggaacttgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 27290530  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagc 372  Q
    ||| |||||| ||  ||||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  27290531 ataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttattgctgctgtcgttgttgagc 27290588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 122 - 369
Target Start/End: Original strand, 22477241 - 22477488
Alignment:
Q  122 tttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcag 221  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22477241 tttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggttag 22477340  T
Q  222 aatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcat 321  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||    
T  22477341 aacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccatatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcat 22477440  T
Q  322 tgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  22477441 tggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttg 22477488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20161031 - 20160667
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |    
T  20161031 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 20160932  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
      || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20160931 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatc 20160832  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagc 319  Q
     |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||| |    
T  20160831 ggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataac 20160732  T
Q  320 attgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttg 384  Q
    || || || |||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  20160731 atcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgttgagctggtggctgttg 20160667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 384
Target Start/End: Original strand, 22171800 - 22172164
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |    
T  22171800 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 22171899  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
      || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22171900 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatc 22171999  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagc 319  Q
     |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||| |    
T  22172000 ggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataac 22172099  T
Q  320 attgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttg 384  Q
    || || || |||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  22172100 atcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgttgagctggtggctgttg 22172164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 22934741 - 22935096
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  22934741 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 22934840  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  22934841 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 22934940  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  22934941 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 22935040  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttga 370  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  ||||||||||||    
T  22935041 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttga 22935096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 23857186 - 23857541
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  23857186 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 23857285  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  23857286 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 23857385  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  23857386 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 23857485  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttga 370  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  ||||||||||||    
T  23857486 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttga 23857541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 343
Target Start/End: Original strand, 27272441 - 27272769
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||    
T  27272441 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaa 27272540  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
    ||| |  || ||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27272541 ggtcagcttcccttgatcgatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttg 27272640  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   ||||||||||||| |||||| |||||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  27272641 aggtcggacctgaacctgggaggcgacggatcaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctctggagtagagtcggaagcaactcagcat 27272740  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggt 343  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||||||    
T  27272741 ataacatcggtatcggagggaaagtaggt 27272769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26918715 - 26918361
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26918715 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26918616  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  26918615 agtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 26918516  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  26918515 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 26918416  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  26918415 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 26918361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26989336 - 26989000
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  26989336 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 26989237  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  26989236 agtcagctttccttgatcaatgagcttctttacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 26989137  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  26989136 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 26989037  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttg 351  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| |||||||    
T  26989036 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttg 26989000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16750186 - 16749835
Alignment:
Q  18 catcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggt 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||    
T  16750186 catcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagt 16750087  T
Q  118 taattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagg 217  Q
     |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||     
T  16750086 cagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaga 16749987  T
Q  218 tcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatata 317  Q
    |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||    
T  16749986 tcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatata 16749887  T
Q  318 gcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
     ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  16749886 acatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 16749835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 13298812 - 13299166
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  13298812 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 13298911  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  13298912 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 13299011  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  13299012 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 13299111  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  13299112 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 13299166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 24304479 - 24304833
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24304479 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24304578  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  24304579 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 24304678  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  24304679 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 24304778  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  24304779 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 24304833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24864052 - 24863698
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24864052 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24863953  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  24863952 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 24863853  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  24863852 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 24863753  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  24863752 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 24863698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29549810 - 29549450
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  29549810 ggacatcaagtccaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29549711  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  29549710 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 29549611  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||    
T  29549610 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcat 29549511  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctgg 375  Q
    | | |||||| |||||||||||||| ||| |||| | |||||| || ||||||||| ||||    
T  29549510 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagcgtattgctgctgctgttgttgaactgg 29549450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27000394 - 27000054
Alignment:
Q  29 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttcctt 128  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||    
T  27000394 ggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcctt 27000295  T
Q  129 ggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaa 228  Q
    | |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||    
T  27000294 gatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaa 27000195  T
Q  229 cctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgggata 328  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| || ||     
T  27000194 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatc 27000095  T
Q  329 ggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  27000094 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 27000054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 15424178 - 15424532
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  15424178 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatactttgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaa 15424277  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||    
T  15424278 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttg 15424377  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  15424378 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 15424477  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  15424478 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 15424532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29573348 - 29572994
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  29573348 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29573249  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  29573248 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 29573149  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  29573148 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 29573049  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  29573048 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttg 29572994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4773341 - 4773017
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  4773341 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 4773242  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  4773241 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 4773142  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  4773141 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 4773042  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  4773041 acaacattggtataggaggaaaagt 4773017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4525621 - 4525297
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  4525621 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 4525522  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  4525521 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4525422  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
     | |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  4525421 ggatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 4525322  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  4525321 acaacattggtataggaggaaaagt 4525297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 4545636 - 4545960
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  4545636 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 4545735  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  4545736 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 4545835  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || ||||| ||||    
T  4545836 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 4545935  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  4545936 acaacattggtataggaggaaaagt 4545960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4758099 - 4757775
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  4758099 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 4758000  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  4757999 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4757900  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  4757899 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 4757800  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  4757799 acaacattggtataggaggaaaagt 4757775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16674474 - 16674150
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  16674474 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16674375  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  16674374 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 16674275  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  16674274 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcat 16674175  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  16674174 acaacattggtataggaggaaaagt 16674150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3696416 - 3696092
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  3696416 ggacatcaagtctaggagcttcatcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 3696317  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  3696316 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 3696217  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  3696216 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 3696117  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  3696116 acaacattggtataggaggaaaagt 3696092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 4723995 - 4724319
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  4723995 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaa 4724094  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  4724095 agtcagctttccctgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4724194  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||    
T  4724195 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 4724294  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  4724295 acaacattggtataggaggaaaagt 4724319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27008062 - 27007738
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  27008062 ggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27007963  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| ||||  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  27007962 agtcagctttccctggtcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 27007863  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  27007862 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 27007763  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  27007762 acaacattggtataggaggaaaagt 27007738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 28207789 - 28207465
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  28207789 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 28207690  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  28207689 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 28207590  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||    
T  28207589 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 28207490  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  28207489 acaacattggtataggaggaaaagt 28207465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 34463207 - 34463531
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  34463207 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 34463306  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  34463307 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 34463406  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  | ||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  34463407 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggctttccttgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 34463506  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||    
T  34463507 ataacatcggtataggaggaaaagt 34463531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 369
Target Start/End: Original strand, 27359852 - 27360207
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||    
T  27359852 tggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaa 27359951  T
Q  114 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    | || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  27359952 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 27360051  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggca 313  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||    
T  27360052 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgca 27360151  T
Q  314 tatagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    || | ||| || |||||||||||||| ||| |||  |  ||||| |||||||||||    
T  27360152 tacaacatcggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 27360207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 369
Target Start/End: Original strand, 27450195 - 27450550
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||    
T  27450195 tggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaa 27450294  T
Q  114 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    | || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  27450295 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 27450394  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggca 313  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||    
T  27450395 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgca 27450494  T
Q  314 tatagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    || | ||| || |||||||||||||| ||| |||  |  ||||| |||||||||||    
T  27450495 tacaacatcggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 27450550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 30557877 - 30558231
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  30557877 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30557976  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  30557977 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 30558076  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||    
T  30558077 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcat 30558176  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  30558177 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 30558231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17025612 - 17025288
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  17025612 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 17025513  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  17025512 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 17025413  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  17025412 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 17025313  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  17025312 acaacattggtataggaggaaaagt 17025288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29501750 - 29501492
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  29501750 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 29501651  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  29501650 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 29501551  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||    
T  29501550 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 29501492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27044723 - 27044398
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  27044723 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 27044624  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagc-atccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || | | || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||    
T  27044623 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattt 27044524  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggca 313  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| |||    
T  27044523 gagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgca 27044424  T
Q  314 tatagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    || | ||| || ||||||||||||||    
T  27044423 tacaacataggtataggaggaaaagt 27044398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 267
Target Start/End: Original strand, 26116271 - 26116523
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  26116271 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 26116370  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  26116371 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 26116470  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtct 267  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  26116471 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 26116523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Original strand, 26777475 - 26777734
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 113  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||    
T  26777475 tggacatcaagtctaggattttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaa 26777574  T
Q  114 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    | || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  26777575 aagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 26777674  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgt 273  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||    
T  26777675 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 26777734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Original strand, 16943888 - 16944146
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  16943888 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 16943987  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  16943988 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 16944087  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||    
T  16944088 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 16944146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 141
Target Start/End: Original strand, 17092301 - 17092427
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||   || ||||||||    
T  17092301 ggacatcaagtttggtagcttcctcacatacctcagtcatgttcacagcagcgtggtttggaaggggattatcgaggacatgaggggtattattctcaaa 17092400  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagctt 141  Q
     || || ||||| ||||  ||||||||    
T  17092401 agtcaactttccctggtcaatgagctt 17092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27485464 - 27485110
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  27485464 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27485365  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  27485364 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 27485265  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  27485264 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 27485165  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| |||||||||||||| ||| |||  |  ||||| |||||||||||    
T  27485164 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 27485110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22888815 - 22888439
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  22888815 acatcgagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 22888716  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888715 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 22888616  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||     
T  22888615 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaaatagagtcgggagtaactcagcatac 22888516  T
Q  317 agcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatttg 393  Q
    | |||||| || ||||| || |||||| |||||||||| || |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  22888515 aacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 22888439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 17 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 25199374 - 25198998
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  25199374 acatcaagtctgggggctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 25199275  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199274 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 25199175  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatat 316  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  25199174 atcagaacggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatac 25199075  T
Q  317 agcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatttg 393  Q
    | |||||| || |||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  25199074 aacattggtatcggagaaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 25198998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 25 - 391
Target Start/End: Original strand, 13184473 - 13184839
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  13184473 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 13184572  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13184573 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 13184672  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  13184673 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 13184772  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
     ||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  13184773 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 13184839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 375
Target Start/End: Original strand, 29888897 - 29889257
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29888897 ggacatcaagtctgggagcttcctcatacacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 29888996  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || |||||||| |  |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29888997 agtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatatg 29889096  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||    
T  29889097 aggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtggtgcagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcagcat 29889196  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctgg 375  Q
    | | |||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  29889197 acaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctgg 29889257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 20 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 33877589 - 33877218
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  33877589 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 33877490  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877489 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 33877390  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagc 319  Q
     ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| |    
T  33877389 cgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataac 33877290  T
Q  320 attgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  33877289 attggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 33877218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 25 - 391
Target Start/End: Original strand, 13440319 - 13440685
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  13440319 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcagaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 13440418  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13440419 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 13440518  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |  ||||||| ||||||    
T  13440519 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaatttagcatataacattgg 13440618  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
     ||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  13440619 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 13440685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23892553 - 23892199
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23892553 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 23892454  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||| |||||||| |  |||||||| || || |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23892453 agttaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcagagcatagcatctttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 23892354  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23892353 aggtcggaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggaagcaactcggcat 23892254  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | |  ||||| || |||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  23892253 acatgattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttg 23892199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 25 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 11326131 - 11325765
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||    
T  11326131 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcaacgtgattcggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaacttt 11326032  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  11326031 ccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaac 11325932  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  11325931 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 11325832  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
     ||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  11325831 tatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 11325765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 24687972 - 24688326
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24687972 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24688071  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24688072 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttg 24688171  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  24688172 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 24688271  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | |  || || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  24688272 acaatatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 24688326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 23752265 - 23752619
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  23752265 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 23752364  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  23752365 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 23752464  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  23752465 aggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 23752564  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  23752565 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 23752619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33777834 - 33777480
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  33777834 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 33777735  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  33777734 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 33777635  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  33777634 aggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 33777535  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  33777534 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 33777480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30934980 - 30934620
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  30934980 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatatacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 30934881  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  30934880 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 30934781  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  30934780 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 30934681  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctgg 375  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||| ||||    
T  30934680 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactgg 30934620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24970365 - 24970014
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |  ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24970365 ggacatcaagtctaggagcttcctcacgtactttgatcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 24970266  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||    |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  24970265 agtccgctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 24970166  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  24970165 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 24970066  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttg 366  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  24970065 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttg 24970014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 11549701 - 11549347
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  11549701 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11549602  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  11549601 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 11549502  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  11549501 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 11549402  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  11549401 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 11549347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 23717803 - 23718157
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  23717803 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 23717902  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  23717903 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 23718002  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  23718003 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 23718102  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  23718103 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 23718157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 9548358 - 9548712
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  9548358 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 9548457  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  9548458 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttg 9548557  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||    
T  9548558 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcat 9548657  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  9548658 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 9548712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 22998929 - 22999283
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  22998929 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatggtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 22999028  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  22999029 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttg 22999128  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  22999129 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 22999228  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  22999229 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 22999283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 15658575 - 15658929
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15658575 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 15658674  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  15658675 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 15658774  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  15658775 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 15658874  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  15658875 ataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 15658929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 37671298 - 37671622
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  37671298 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 37671397  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  37671398 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 37671497  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  37671498 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37671597  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  37671598 acaacattggtataggaggaaaagt 37671622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 28649582 - 28649258
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  28649582 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 28649483  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  28649482 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 28649383  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  28649382 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 28649283  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  28649282 acaacattggtataggaggaaaagt 28649258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 31431787 - 31431463
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  31431787 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31431688  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31431687 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31431588  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||    
T  31431587 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 31431488  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  31431487 acaacattggtataggaggaaaagt 31431463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 31826222 - 31826546
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  31826222 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 31826321  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31826322 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31826421  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  31826422 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 31826521  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  31826522 acaacattggtataggaggaaaagt 31826546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 8665290 - 8665644
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  8665290 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 8665389  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  8665390 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 8665489  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  8665490 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 8665589  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  8665590 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 8665644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9317798 - 9317444
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  9317798 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9317699  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  9317698 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 9317599  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  9317598 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 9317499  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  9317498 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 9317444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12132502 - 12132148
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  12132502 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 12132403  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  12132402 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 12132303  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  12132302 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 12132203  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  12132202 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 12132148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 15758672 - 15759026
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  15758672 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 15758771  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  15758772 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 15758871  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  15758872 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 15758971  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  15758972 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 15759026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 18375227 - 18375581
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18375227 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18375326  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  18375327 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18375426  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  18375427 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcat 18375526  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  18375527 acaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 18375581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30152365 - 30152011
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  30152365 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30152266  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  30152265 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 30152166  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  30152165 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 30152066  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  30152065 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 30152011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 339
Target Start/End: Original strand, 18500553 - 18500869
Alignment:
Q  23 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |    
T  18500553 agtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagct 18500652  T
Q  123 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    |||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18500653 ttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 18500752  T
Q  223 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcatt 322  Q
       |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| |||     
T  18500753 cctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatc 18500852  T
Q  323 gggataggaggaaaagt 339  Q
    || ||||||||||||||    
T  18500853 ggtataggaggaaaagt 18500869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2511398 - 2511044
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  2511398 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 2511299  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  2511298 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 2511199  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  2511198 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 2511099  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  2511098 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 2511044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26480739 - 26480385
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26480739 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26480640  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  26480639 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 26480540  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  26480539 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 26480440  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  26480439 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 26480385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 37358458 - 37358812
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  37358458 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaa 37358557  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  37358558 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 37358657  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  37358658 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttccgcat 37358757  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| |||||||||||||| ||| |||  |  ||||| |||||||||||    
T  37358758 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 37358812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 375
Target Start/End: Original strand, 32599286 - 32599647
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 113  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||    
T  32599286 tggacatcaagtctaggggcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaa 32599385  T
Q  114 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    | || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||    
T  32599386 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaatgcaccttgatgaaaatcacattt 32599485  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggca 313  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || |||    
T  32599486 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgca 32599585  T
Q  314 tatagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctgg 375  Q
    || | |||||| |||||||||||||| ||| |||| | |||||| || || |||||| ||||    
T  32599586 tacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactgg 32599647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6874652 - 6874298
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  6874652 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 6874553  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  || ||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  6874552 agtcagcttcccttgatcgataagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 6874453  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  6874452 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcagctcagcat 6874353  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  6874352 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 6874298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33516703 - 33516349
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  33516703 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 33516604  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  33516603 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 33516504  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||    
T  33516503 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcat 33516404  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  33516403 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 33516349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24681787 - 24681463
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  24681787 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 24681688  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  24681687 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 24681588  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  24681587 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 24681488  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||    
T  24681487 ataacatcggtataggaggaaaagt 24681463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24724314 - 24723990
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  24724314 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 24724215  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  24724214 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 24724115  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  24724114 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 24724015  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||    
T  24724014 ataacatcggtataggaggaaaagt 24723990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34616865 - 34616505
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  34616865 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 34616766  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  34616765 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 34616666  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || ||||| ||||    
T  34616665 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 34616566  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctgg 375  Q
    | | |||||| |||||||||||||| ||| |||| | |||||| || || |||||| ||||    
T  34616565 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactgg 34616505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 40473364 - 40473688
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  40473364 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 40473463  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  40473464 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 40473563  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  40473564 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 40473663  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||    
T  40473664 ataacatcggtataggaggaaaagt 40473688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 43078599 - 43078275
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  43078599 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 43078500  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  43078499 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 43078400  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  43078399 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 43078300  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  43078299 acaacattggtataggaggaaaagt 43078275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30168816 - 30168462
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||    
T  30168816 ggacatcaagtctaggagtttcttcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaa 30168717  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  30168716 agtgagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 30168617  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  30168616 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 30168517  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  30168516 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 30168462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 13324644 - 13324968
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  13324644 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 13324743  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  13324744 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 13324843  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  13324844 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 13324943  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  13324944 acaacattggtataggaggaaaagt 13324968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 37770802 - 37771126
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  37770802 ggacatcaagtctagaagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 37770901  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || |  || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  37770902 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcatgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 37771001  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| || || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  37771002 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37771101  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  37771102 acaacattggtataggaggaaaagt 37771126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41675025 - 41674702
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| | ||| ||||| ||     
T  41675025 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttcttg 41674926  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  41674925 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatggcctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggat 41674826  T
Q  246 taggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgggataggaggaaaagtaggtat 345  Q
     |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||| |    
T  41674825 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 41674726  T
Q  346 agcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    |||||| || |  |||||||||||    
T  41674725 agcttgctgattttgttgttgttg 41674702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5638257 - 5637903
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || || |||||    
T  5638257 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattttcaaa 5638158  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  5638157 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5638058  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  5638057 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 5637958  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  5637957 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 5637903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3789888 - 3789564
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  3789888 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 3789789  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  3789788 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 3789689  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  3789688 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 3789589  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  3789588 acaacattggtataggaggaaaagt 3789564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 37755327 - 37755003
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  37755327 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 37755228  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  37755227 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 37755128  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||| || || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  37755127 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37755028  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  37755027 acaacattggtataggaggaaaagt 37755003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Original strand, 29966881 - 29967139
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  29966881 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 29966980  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  29966981 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 29967080  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||    
T  29967081 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 29967139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30029762 - 30029504
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  30029762 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 30029663  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  30029662 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 30029563  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||    
T  30029562 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 30029504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33292841 - 33292539
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  33292841 ctcaatcatattcacggcatcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 33292742  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  33292741 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 33292642  T
Q  246 taggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgggataggaggaaaagtaggtat 345  Q
      |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | |||||| |||||||||||||| ||| |    
T  33292641 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 33292542  T
Q  346 agc 348  Q
    |||    
T  33292541 agc 33292539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 357
Target Start/End: Original strand, 28959600 - 28959943
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||    
T  28959600 tggacatcaagtctaggagtctcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaa 28959699  T
Q  114 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    | || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  28959700 aagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 28959799  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggca 313  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||    
T  28959800 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgca 28959899  T
Q  314 tatagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctg 357  Q
    || | |||||| |||||||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  28959900 tacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctg 28959943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20723 - 20375
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  20723 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 20624  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    ||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623 ttaattt-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 20525  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  20524 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcagcatac 20425  T
Q  317 agcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttg 366  Q
    | |||||| || || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20424 aacattggtatcgggggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttg 20375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30790 - 30532
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  30790 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30691  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  30690 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 30591  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||    
T  30590 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 30532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 44563427 - 44563063
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || || |||    
T  44563427 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtt-acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaacttt 44563329  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44563328 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 44563230  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44563229 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 44563130  T
Q  325 gataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
     ||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  44563129 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 44563063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 24 - 391
Target Start/End: Original strand, 19658926 - 19659292
Alignment:
Q  24 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  19658926 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 19659025  T
Q  124 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19659026 tccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 19659124  T
Q  224 tggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattg 323  Q
     ||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||    
T  19659125 cggaacttgggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattg 19659224  T
Q  324 ggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
    | ||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  19659225 gtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggttgttgttgcatt 19659292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 24 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33244994 - 33244649
Alignment:
Q  24 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  33244994 gtctgagagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtggttcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 33244895  T
Q  124 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33244894 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 33244795  T
Q  224 tggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattg 323  Q
     ||||| | |||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||    
T  33244794 cggaacttaggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcaacatataacattg 33244695  T
Q  324 ggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | ||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| |||||||    
T  33244694 gtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 33244649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 50 - 366
Target Start/End: Original strand, 22080790 - 22081106
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  22080790 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 22080889  T
Q  150 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22080890 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttagg 22080989  T
Q  250 tggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgggataggaggaaaagtaggtatagct 349  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | |||||| || |||||||| || |||||||| |||||| | | |    
T  22080990 tggaggctttccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtt 22081089  T
Q  350 tgttgctggtgttgttg 366  Q
    |||||||| || |||||    
T  22081090 tgttgctgctgctgttg 22081106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 9354961 - 9354584
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  9354961 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 9354862  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagctttttt-acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9354861 ggtcaattttccttggtctatgagttttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatggaaatcacactt 9354762  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggca 313  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || |||    
T  9354761 gaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagca 9354662  T
Q  314 tatagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctggggggtgttgatgcatt 391  Q
    |||| |||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  9354661 tataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcatt 9354584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16283787 - 16283433
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  16283787 ggacaacaagtctaggagcttcctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 16283688  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  16283687 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccttcgacatcatgacccagggtgccttgatggaaatcacatttg 16283588  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| || ||||| ||||    
T  16283587 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctaaggagtaaagtcggaagcaactcagcat 16283488  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| || |||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  16283487 acaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttg 16283433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18710924 - 18710582
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18710924 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18710825  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18710824 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccctgatgaaaatcacacttg 18710725  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||| ||||| |||||  |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  18710724 agatcagacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgagggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 18710625  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctg 357  Q
    | | |||||| |||||||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  18710624 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctg 18710582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19688436 - 19688082
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  19688436 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 19688337  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  19688336 agtcaactttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 19688237  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  19688236 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 19688137  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  19688136 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 19688082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 27608782 - 27609136
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  27608782 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 27608881  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  27608882 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 27608981  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  27608982 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 27609081  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  27609082 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 27609136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16277892 - 16277538
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  16277892 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 16277793  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  16277792 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 16277693  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  16277692 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 16277593  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  16277592 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 16277538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14557962 - 14557602
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  14557962 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcacatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaa 14557863  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  14557862 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 14557763  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  14557762 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgagggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 14557663  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctgg 375  Q
    ||| |||||| || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||| ||||    
T  14557662 ataacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactgg 14557602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 2137136 - 2137490
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| || | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||    
T  2137136 ggacatcaagtctaggagctttctcacatgcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgagacattattctcaaa 2137235  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||    
T  2137236 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttg 2137335  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  2137336 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 2137435  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  2137436 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 2137490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31354862 - 31354508
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  31354862 ggacatcaagtctgggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 31354763  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  31354762 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 31354663  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||||||||    
T  31354662 agatcagacctgaaccttggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcggcat 31354563  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  31354562 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 31354508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 31489627 - 31489981
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  31489627 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 31489726  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  31489727 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 31489826  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  31489827 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 31489926  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  31489927 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 31489981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 3329384 - 3329708
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  3329384 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 3329483  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  3329484 agtcagcttcccttgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 3329583  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  3329584 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 3329683  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  3329684 acaacattggtataggaggaaaagt 3329708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 19208237 - 19208591
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  19208237 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 19208336  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  19208337 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 19208436  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  19208437 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 19208536  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  19208537 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 19208591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19674779 - 19674425
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  19674779 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 19674680  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  19674679 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacctctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 19674580  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  19674579 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 19674480  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  19674479 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 19674425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 12092601 - 12092925
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  12092601 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 12092700  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  12092701 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 12092800  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  12092801 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttccgcat 12092900  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  12092901 acaacattggtataggaggaaaagt 12092925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 28361832 - 28362186
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  28361832 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 28361931  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  28361932 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 28362031  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  28362032 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 28362131  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  28362132 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 28362186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29829660 - 29829390
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  29829660 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 29829561  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  29829560 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 29829461  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| || || ||||||||    
T  29829460 agatcagagcggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctggtggtacaatgccctct 29829390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 189432 - 189256
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  189432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 189333  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagag 191  Q
     || |  |||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  189332 agtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagag 189256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19286800 - 19286476
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  19286800 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 19286701  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  19286700 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 19286601  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  19286600 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcat 19286501  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | ||| || ||||||||||||||    
T  19286500 acaacataggtataggaggaaaagt 19286476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 33259061 - 33258803
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  33259061 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 33258962  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  33258961 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 33258862  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||    
T  33258861 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 33258803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 70 - 375
Target Start/End: Original strand, 1 - 306
Alignment:
Q  70 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcat 100  T
Q  170 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctgg 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  101 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctgg 200  T
Q  270 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  201 ttgagcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttg 300  T
Q  370 agctgg 375  Q
    ||||||    
T  301 agctgg 306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 1838 - 2103
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  1838 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 1937  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    ||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1938 ttaattt-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 2036  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccct 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2037 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 6344 - 6080
Alignment:
Q  23 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |    
T  6344 agtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagct 6245  T
Q  123 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttc-aaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatg-gaaatcacacttgaggtca 220  Q
    |||| || |  |||||||| || || || |||||| ||||| || || || || ||||||||||| |  |||||||||||  |||||||| ||||| |||    
T  6244 ttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaaatcacatttgagatca 6145  T
Q  221 gaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| || || || ||||||||    
T  6144 gacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 50 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21864 - 21571
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  21864 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 21765  T
Q  150 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 249  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  21764 tctacttcaaagcgtaacatccttcaacatcttggcccagagccccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttagg 21665  T
Q  250 tggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcatatagcattgggataggaggaaaagtaggt 343  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  21664 tggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgtcctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggt 21571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 39987 - 40341
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  39987 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 40086  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||  || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  40087 agtcagctttccttgatcaatgagctccttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 40186  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   ||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  40187 agatcggacctgaacctggggggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 40286  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  40287 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 40341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 46903 - 47257
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  46903 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 47002  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  47003 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 47102  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  47103 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 47202  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  47203 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 47257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30101 - 29747
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  30101 ggacatcaagtctaagagcttcctcacatacttcgatcatatttacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 30002  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  30001 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttggtggaaatcacatttg 29902  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  29901 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 29802  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  29801 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttg 29747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27629 - 27276
Alignment:
Q  16 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaag 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||     
T  27629 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaa 27530  T
Q  116 gttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttga 215  Q
    || |  |||||||| |  || ||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  27529 gtcagctttccttgatcaataagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttga 27430  T
Q  216 ggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcata 315  Q
    | || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| |||||    
T  27429 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcata 27330  T
Q  316 tagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    || ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  27329 taacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 27276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 536 - 728
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||    
T  536 ggacgtcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattattctcaaa 635  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatc 207  Q
     ||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  636 agttaactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcatcttgatggaaatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 47 - 402
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  47 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 146  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||    
T  147 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccaacgcgccttgatgaaaatcacatttg 246  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaact-cggca 313  Q
    || || ||   |||| |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||   |||    
T  247 agatcggacctgaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactaaagca 346  T
Q  314 tatagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    |||| ||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  347 tataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9904 - 9544
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  9904 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9805  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  9804 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 9705  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  9704 agatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 9605  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttgagctgg 375  Q
    | | ||| || |||||||||||||| ||| |||| | |||||| || || |||||| ||||    
T  9604 acaacataggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactgg 9544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 26119 - 26474
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26119 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26218  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26219 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26318  T
Q  215 aggtcagaatggaacctg-ggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggca 313  Q
    || |||||   ||||||  ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| |||    
T  26319 agatcagacctgaacctttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgca 26418  T
Q  314 tatagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    || | |||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  26419 tacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 26474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 7157 - 7511
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  7157 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 7256  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  7257 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 7356  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  7357 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 7456  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  7457 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 7511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 14848 - 15202
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  14848 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcacattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 14947  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  14948 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 15047  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  15048 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcat 15147  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  15148 acaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 15202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 8984 - 9338
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  8984 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9083  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  9084 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 9183  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  9184 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 9283  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  9284 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 9338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20353 - 19999
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  20353 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 20254  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  20253 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 20154  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  20153 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 20054  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagtaggtatagcttgttgctggtgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  20053 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 19999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8287 - 7963
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  8287 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 8188  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  8187 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 8088  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgacctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggaggaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||    
T  8087 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 7988  T
Q  315 atagcattgggataggaggaaaagt 339  Q
    | | |||||| ||||||||||||||    
T  7987 acaacattggtataggaggaaaagt 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 114
Target Start/End: Original strand, 46764 - 46819
Alignment:
Q  59 acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  46764 acagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 46819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University