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Alignment Overview

Query: NF10993_high_1 (Length: 216)

Name: NF10993_high_1
Description: NF10993
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10993_high_1
NF10993_high_1
[»] chr1 (66 HSPs)
chr1 (51-214)||(51065743-51065907)
chr1 (53-216)||(5694346-5694510)
chr1 (51-216)||(29657796-29657962)
chr1 (50-216)||(18043187-18043354)
chr1 (54-215)||(47010019-47010181)
chr1 (53-216)||(15227764-15227928)
chr1 (57-216)||(38162875-38163035)
chr1 (56-216)||(24178463-24178624)
chr1 (55-216)||(12072061-12072223)
chr1 (52-216)||(42769986-42770151)
chr1 (56-211)||(30294381-30294537)
chr1 (55-215)||(3784712-3784873)
chr1 (54-216)||(17333282-17333443)
chr1 (45-211)||(8472903-8473070)
chr1 (54-216)||(38701935-38702094)
chr1 (56-216)||(9266728-9266889)
chr1 (57-216)||(13961237-13961396)
chr1 (79-214)||(35985644-35985780)
chr1 (53-212)||(3097688-3097845)
chr1 (83-216)||(36446352-36446485)
chr1 (79-208)||(45431311-45431441)
chr1 (84-208)||(6770370-6770495)
chr1 (55-211)||(45449243-45449400)
chr1 (50-214)||(43286749-43286916)
chr1 (55-209)||(19031814-19031969)
chr1 (54-215)||(14350277-14350437)
chr1 (55-213)||(51368789-51368943)
chr1 (51-208)||(50128167-50128325)
chr1 (56-216)||(23473464-23473625)
chr1 (56-216)||(48383111-48383272)
chr1 (82-213)||(48071510-48071642)
chr1 (83-216)||(29683220-29683355)
chr1 (56-216)||(30657633-30657788)
chr1 (79-216)||(41730330-41730471)
chr1 (56-209)||(47532671-47532824)
chr1 (94-214)||(38335196-38335317)
chr1 (115-216)||(29210438-29210540)
chr1 (82-197)||(12306962-12307077)
chr1 (50-216)||(30217785-30217952)
chr1 (133-213)||(15282592-15282672)
chr1 (50-215)||(26228219-26228370)
chr1 (88-197)||(37315300-37315409)
chr1 (62-190)||(52431632-52431761)
chr1 (87-216)||(52749627-52749757)
chr1 (45-147)||(19010676-19010779)
chr1 (51-216)||(28725900-28726067)
chr1 (70-214)||(3838791-3838936)
chr1 (139-216)||(39912363-39912440)
chr1 (133-213)||(35700729-35700808)
chr1 (109-216)||(39081826-39081933)
chr1 (133-208)||(39497340-39497415)
chr1 (109-195)||(37503260-37503346)
chr1 (55-107)||(21112680-21112732)
chr1 (62-216)||(30664173-30664329)
chr1 (171-216)||(19011112-19011157)
chr1 (50-99)||(29210537-29210586)
chr1 (148-216)||(49867454-49867523)
chr1 (55-107)||(21117422-21117474)
chr1 (127-212)||(28481873-28481954)
chr1 (54-216)||(52702144-52702307)
chr1 (113-162)||(14881036-14881086)
chr1 (56-216)||(38595752-38595914)
chr1 (171-216)||(10976018-10976063)
chr1 (54-142)||(11796969-11797056)
chr1 (175-213)||(14881086-14881124)
chr1 (111-215)||(33644390-33644495)
[»] chr3 (49 HSPs)
chr3 (53-216)||(39074444-39074607)
chr3 (51-213)||(4168211-4168374)
chr3 (56-216)||(272245-272406)
chr3 (56-214)||(10617284-10617443)
chr3 (50-216)||(46352659-46352826)
chr3 (54-216)||(52520706-52520869)
chr3 (56-216)||(49893356-49893517)
chr3 (54-216)||(48725296-48725459)
chr3 (55-215)||(858615-858776)
chr3 (53-216)||(43786896-43787060)
chr3 (54-216)||(40362578-40362741)
chr3 (51-215)||(41553935-41554100)
chr3 (55-213)||(2938039-2938198)
chr3 (49-216)||(42964242-42964410)
chr3 (52-216)||(18014697-18014862)
chr3 (55-215)||(43269738-43269899)
chr3 (69-211)||(2505379-2505522)
chr3 (56-214)||(7468438-7468595)
chr3 (56-184)||(6842676-6842805)
chr3 (50-214)||(50395557-50395721)
chr3 (53-216)||(53489821-53489985)
chr3 (86-216)||(22248911-22249042)
chr3 (82-214)||(28139336-28139469)
chr3 (61-216)||(41304030-41304184)
chr3 (55-214)||(11308210-11308369)
chr3 (59-216)||(20924017-20924173)
chr3 (82-216)||(42548120-42548255)
chr3 (52-216)||(49529264-49529430)
chr3 (56-216)||(52246607-52246768)
chr3 (51-216)||(24488391-24488557)
chr3 (52-209)||(41993616-41993773)
chr3 (57-189)||(33140937-33141070)
chr3 (78-209)||(38852246-38852381)
chr3 (94-216)||(2119456-2119577)
chr3 (84-209)||(13159929-13160055)
chr3 (84-213)||(50298973-50299103)
chr3 (89-209)||(29241669-29241790)
chr3 (78-216)||(50359208-50359347)
chr3 (84-203)||(31514829-31514948)
chr3 (102-199)||(21010039-21010133)
chr3 (84-208)||(25743842-25743967)
chr3 (83-164)||(52552551-52552632)
chr3 (160-216)||(2391632-2391688)
chr3 (160-216)||(2393393-2393449)
chr3 (172-214)||(52718194-52718236)
chr3 (115-193)||(2362880-2362958)
chr3 (171-213)||(23925308-23925350)
chr3 (84-216)||(17752709-17752842)
chr3 (84-216)||(19054029-19054162)
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (55-216)||(32985192-32985354)
chr6 (52-216)||(392121-392286)
chr6 (52-216)||(32929504-32929669)
chr6 (50-216)||(23402163-23402330)
chr6 (56-216)||(3515791-3515952)
chr6 (52-216)||(26467120-26467285)
chr6 (78-216)||(2350677-2350816)
chr6 (54-216)||(4215720-4215883)
chr6 (56-216)||(18276612-18276776)
chr6 (56-215)||(12145117-12145277)
chr6 (55-213)||(2580980-2581139)
chr6 (50-211)||(25165407-25165569)
chr6 (79-216)||(29451138-29451276)
chr6 (54-216)||(27433517-27433680)
chr6 (88-216)||(7851191-7851320)
chr6 (83-213)||(1391205-1391336)
chr6 (51-216)||(13416955-13417123)
chr6 (56-214)||(35043917-35044074)
chr6 (53-210)||(28225252-28225409)
chr6 (60-216)||(3026013-3026170)
chr6 (80-215)||(1840271-1840407)
chr6 (55-213)||(12525747-12525906)
chr6 (51-215)||(5323426-5323591)
chr6 (50-214)||(29978259-29978423)
chr6 (78-216)||(11115119-11115256)
chr6 (55-216)||(21878352-21878508)
chr6 (115-216)||(20897973-20898075)
chr6 (115-216)||(34477609-34477711)
chr6 (56-209)||(34851849-34852003)
chr6 (87-197)||(961053-961164)
chr6 (87-216)||(23629607-23629737)
chr6 (51-197)||(31280365-31280506)
chr6 (125-210)||(34396596-34396682)
chr6 (101-209)||(9661018-9661127)
chr6 (142-216)||(13529480-13529554)
chr6 (55-216)||(34706745-34706908)
chr6 (64-216)||(1127840-1127994)
chr6 (78-132)||(22417303-22417357)
chr6 (62-128)||(34712131-34712197)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (56-216)||(30486235-30486396)
chr2 (53-216)||(20552956-20553120)
chr2 (50-216)||(31390037-31390204)
chr2 (53-216)||(31438671-31438835)
chr2 (50-215)||(4381821-4381987)
chr2 (55-216)||(22068319-22068480)
chr2 (56-216)||(44587927-44588088)
chr2 (50-214)||(22567629-22567794)
chr2 (50-216)||(561512-561679)
chr2 (54-216)||(27856394-27856557)
chr2 (53-214)||(3668110-3668272)
chr2 (56-216)||(22887775-22887936)
chr2 (50-209)||(26387058-26387218)
chr2 (73-216)||(6580214-6580358)
chr2 (54-209)||(34442531-34442686)
chr2 (54-216)||(8969405-8969568)
chr2 (56-216)||(32360869-32361030)
chr2 (78-216)||(32860127-32860265)
chr2 (75-216)||(38590893-38591035)
chr2 (80-211)||(1859192-1859324)
chr2 (54-215)||(5093538-5093699)
chr2 (57-214)||(2898098-2898256)
chr2 (80-213)||(13574053-13574187)
chr2 (57-213)||(4022480-4022636)
chr2 (62-214)||(43637191-43637343)
chr2 (54-216)||(28600992-28601154)
chr2 (55-216)||(35851749-35851912)
chr2 (80-210)||(27584769-27584900)
chr2 (115-214)||(26891722-26891822)
chr2 (93-215)||(11021259-11021382)
chr2 (78-214)||(25782855-25782989)
chr2 (109-216)||(38296202-38296310)
chr2 (89-215)||(5881243-5881374)
chr2 (109-197)||(15079012-15079100)
chr2 (83-197)||(39531868-39531981)
chr2 (84-214)||(25772137-25772269)
chr2 (86-211)||(29102313-29102439)
chr2 (109-197)||(34123078-34123166)
chr2 (78-214)||(20431464-20431602)
chr2 (109-197)||(10820528-10820615)
chr2 (84-190)||(15146683-15146789)
chr2 (50-128)||(45262024-45262102)
chr2 (154-210)||(30217662-30217719)
chr2 (56-124)||(31782565-31782633)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (55-216)||(34650832-34650994)
chr5 (55-215)||(13661834-13661995)
chr5 (53-216)||(11957964-11958128)
chr5 (54-214)||(35132549-35132709)
chr5 (56-216)||(10054353-10054513)
chr5 (50-207)||(11846106-11846264)
chr5 (54-216)||(8787364-8787527)
chr5 (53-214)||(35504238-35504399)
chr5 (56-210)||(21547394-21547549)
chr5 (54-208)||(40564402-40564557)
chr5 (79-215)||(12506322-12506459)
chr5 (62-216)||(6283587-6283742)
chr5 (89-213)||(9721640-9721765)
chr5 (82-214)||(20175254-20175387)
chr5 (110-216)||(13470176-13470283)
chr5 (115-216)||(19647717-19647819)
chr5 (52-216)||(10955976-10956141)
chr5 (50-208)||(40057340-40057499)
chr5 (115-216)||(10069994-10070095)
chr5 (84-213)||(31909659-31909784)
chr5 (101-214)||(39066980-39067095)
chr5 (134-216)||(4837282-4837364)
chr5 (133-214)||(2619635-2619716)
chr5 (54-183)||(4268620-4268749)
chr5 (83-214)||(19436865-19436995)
chr5 (148-214)||(6284822-6284888)
chr5 (101-216)||(39069406-39069519)
chr5 (56-216)||(31467744-31467906)
chr5 (62-213)||(30889436-30889589)
chr5 (78-114)||(10955973-10956009)
chr5 (62-216)||(14214055-14214211)
[»] chr8 (54 HSPs)
chr8 (56-216)||(34228707-34228868)
chr8 (55-216)||(27988499-27988660)
chr8 (55-216)||(28045801-28045962)
chr8 (55-216)||(168491-168653)
chr8 (51-216)||(4537739-4537905)
chr8 (56-216)||(16888544-16888705)
chr8 (55-214)||(2805259-2805419)
chr8 (57-216)||(30675574-30675733)
chr8 (54-216)||(29444138-29444301)
chr8 (78-215)||(33357151-33357289)
chr8 (56-214)||(11112666-11112825)
chr8 (53-216)||(13643037-13643200)
chr8 (53-216)||(13743462-13743625)
chr8 (54-215)||(42034979-42035141)
chr8 (58-209)||(16890482-16890634)
chr8 (56-214)||(20831553-20831712)
chr8 (56-208)||(7304518-7304671)
chr8 (55-215)||(9063051-9063212)
chr8 (78-214)||(36730471-36730608)
chr8 (78-216)||(21595871-21596010)
chr8 (56-216)||(16394061-16394222)
chr8 (56-213)||(9537824-9537982)
chr8 (83-216)||(28626793-28626927)
chr8 (65-214)||(37373232-37373382)
chr8 (80-216)||(16785111-16785248)
chr8 (56-216)||(43119242-43119402)
chr8 (84-216)||(4648219-4648352)
chr8 (78-210)||(12203885-12204018)
chr8 (78-210)||(12448313-12448446)
chr8 (61-216)||(9253907-9254062)
chr8 (53-211)||(32113938-32114098)
chr8 (54-216)||(3930231-3930394)
chr8 (101-211)||(10870382-10870493)
chr8 (49-216)||(40831302-40831470)
chr8 (56-208)||(29235268-29235421)
chr8 (58-164)||(39406919-39407024)
chr8 (102-212)||(42433590-42433700)
chr8 (51-216)||(22956731-22956897)
chr8 (84-176)||(24843307-24843400)
chr8 (136-214)||(9278239-9278317)
chr8 (133-207)||(34192809-34192883)
chr8 (115-216)||(10618043-10618144)
chr8 (103-190)||(22451835-22451922)
chr8 (166-215)||(12652656-12652705)
chr8 (120-214)||(17467630-17467725)
chr8 (70-216)||(39751485-39751633)
chr8 (56-124)||(29566819-29566887)
chr8 (176-216)||(35695571-35695611)
chr8 (53-124)||(2490154-2490225)
chr8 (174-216)||(36923782-36923824)
chr8 (54-115)||(10618125-10618186)
chr8 (110-187)||(30933376-30933453)
chr8 (53-216)||(43714185-43714349)
chr8 (133-211)||(33124571-33124650)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (51-216)||(6105-6271)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (50-216)||(34333309-34333475)
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chr7 (56-216)||(29993487-29993648)
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chr7 (52-216)||(12218433-12218597)
chr7 (55-215)||(23363166-23363327)
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chr7 (50-216)||(42044288-42044454)
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chr7 (57-215)||(5729372-5729531)
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chr7 (55-211)||(46716668-46716825)
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chr7 (118-216)||(27456175-27456274)
chr7 (115-210)||(34546373-34546469)
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chr7 (88-211)||(29835735-29835860)
chr7 (57-209)||(23357711-23357861)
chr7 (118-216)||(37631604-37631703)
chr7 (78-197)||(18220693-18220812)
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chr7 (109-216)||(18469993-18470100)
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chr7 (13-55)||(36998003-36998045)
chr7 (108-164)||(47118041-47118098)
chr7 (111-213)||(36437405-36437507)
chr7 (148-214)||(4087650-4087716)
chr7 (148-210)||(18220531-18220593)
chr7 (54-128)||(38128406-38128480)
chr7 (55-211)||(6819946-6820100)
chr7 (172-216)||(22973623-22973667)
chr7 (54-216)||(30923986-30924152)
chr7 (148-210)||(3021922-3021984)
chr7 (50-216)||(19434518-19434685)
chr7 (101-179)||(13556474-13556552)
chr7 (102-191)||(20116940-20117029)
chr7 (148-199)||(5785507-5785559)
[»] chr4 (58 HSPs)
chr4 (53-216)||(29591214-29591378)
chr4 (50-216)||(4268816-4268983)
chr4 (56-216)||(43944532-43944692)
chr4 (54-216)||(7768963-7769126)
chr4 (54-216)||(32217070-32217232)
chr4 (53-208)||(16536081-16536237)
chr4 (53-211)||(36395129-36395288)
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chr4 (56-216)||(6164119-6164279)
chr4 (56-216)||(54897333-54897494)
chr4 (53-216)||(4089167-4089331)
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chr4 (50-210)||(4220226-4220386)
chr4 (54-216)||(18067877-18068040)
chr4 (53-216)||(42898741-42898907)
chr4 (55-216)||(33108672-33108833)
chr4 (53-211)||(37987965-37988124)
chr4 (89-211)||(39843937-39844060)
chr4 (54-216)||(43202382-43202544)
chr4 (88-213)||(19503137-19503263)
chr4 (56-216)||(54945780-54945939)
chr4 (89-216)||(32202514-32202641)
chr4 (56-216)||(15186268-15186423)
chr4 (84-216)||(24679671-24679803)
chr4 (57-216)||(28755645-28755803)
chr4 (50-216)||(55882709-55882874)
chr4 (51-216)||(30154158-30154323)
chr4 (87-214)||(52533816-52533944)
chr4 (86-215)||(47231902-47232032)
chr4 (56-216)||(5091612-5091771)
chr4 (54-216)||(3783496-3783662)
chr4 (55-181)||(16820912-16821039)
chr4 (89-191)||(30387167-30387270)
chr4 (70-207)||(46148973-46149111)
chr4 (50-214)||(50603254-50603420)
chr4 (81-214)||(53655903-53656037)
chr4 (56-177)||(39877247-39877371)
chr4 (101-215)||(49915185-49915300)
chr4 (115-213)||(42815137-42815237)
chr4 (78-214)||(31680485-31680622)
chr4 (115-216)||(46688264-46688371)
chr4 (115-216)||(54054573-54054675)
chr4 (53-189)||(31517217-31517354)
chr4 (80-190)||(41265510-41265620)
chr4 (55-128)||(37402758-37402830)
chr4 (86-197)||(53268764-53268875)
chr4 (148-216)||(50167616-50167682)
chr4 (54-162)||(53003954-53004063)
chr4 (172-216)||(1432659-1432703)
chr4 (53-99)||(54054672-54054718)
chr4 (109-161)||(8133787-8133840)
chr4 (55-128)||(28119905-28119978)
chr4 (83-210)||(52697083-52697210)
chr4 (54-164)||(8749794-8749907)
chr4 (69-128)||(28120062-28120121)
chr4 (111-211)||(17344714-17344814)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (56-216)||(14921-15082)
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[»] scaffold0003 (1 HSPs)
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[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (54-216)||(116229-116392)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (53-210)||(25750-25907)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (50-213)||(95579-95742)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (56-180)||(10771-10896)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
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[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (115-216)||(7956-8058)
[»] scaffold0549 (1 HSPs)
scaffold0549 (115-216)||(7313-7415)
[»] scaffold1152 (1 HSPs)
scaffold1152 (88-215)||(704-832)
[»] scaffold0050 (2 HSPs)
scaffold0050 (54-216)||(69251-69413)
scaffold0050 (109-215)||(33735-33841)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (56-208)||(40952-41105)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (84-209)||(146933-147059)
[»] scaffold1266 (1 HSPs)
scaffold1266 (84-216)||(317-450)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (87-216)||(17502-17631)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (115-214)||(11029-11129)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (56-169)||(233925-234039)
[»] scaffold0263 (1 HSPs)
scaffold0263 (78-210)||(19607-19740)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (148-210)||(5070-5132)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 125; Significance: 1e-64; HSPs: 66)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 51 - 214
Target Start/End: Original strand, 51065743 - 51065907
Alignment:
Q  51 tttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaa 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  51065743 tttaagggtcctgctaaccggtgcccctggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataa 51065842  T
Q  150 attaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  51065843 attaattacacaatttcaatacattaactactatataatttactttttcatatccttaaccagtg 51065907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5694510 - 5694346
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaat 151  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  5694510 taagggtcctgctaaccggtgcccccggagcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaat 5694411  T
Q  152 taattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5694410 taattacacaatttcaatgcattaactactatataatttccctttttatatccttaaccagtgcc 5694346  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 51 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29657962 - 29657796
Alignment:
Q  51 tttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaa 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  29657962 tttaagggtcctgctaaccggtgcccccagggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccaaaaaaggaaactgtttttgactttattatca 29657863  T
Q  150 attaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29657862 attaattatacaatttcaatgcattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 29657796  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18043354 - 18043187
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattaca 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |    
T  18043354 ttttaagggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaatagaattattaccataaaagaaaactgtttttgacattattata 18043255  T
Q  149 aattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18043254 aattaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttccttttttatacccttaaccagtgcc 18043187  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 47010181 - 47010019
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatt 152  Q
    |||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  47010181 aagggtcctgctaaccggtgcccctggagcactggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaaactgtttttgaatttattataaatt 47010082  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47010081 aattacacaatttcaatacattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 47010019  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15227928 - 15227764
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaat 151  Q
    |||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  15227928 taagggtcttgctaaccggtgcctccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaat 15227829  T
Q  152 taattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15227828 taattacacaatttcaatgcattaattactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 15227764  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 57 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38163035 - 38162875
Alignment:
Q  57 ggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaat 155  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  38163035 ggtcctgctaaccggtgcccccggggcacgggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaat 38162936  T
Q  156 tacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  38162935 tacacaatttcaatgcattaactactatataattttctttttcatacccttaaccagtgcc 38162875  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 24178463 - 24178624
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  24178463 gggtccggctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaatgaaattattaccataaaaggaaactgcttttgactttattatagattaa 24178562  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24178563 ttacacaatttcaatgcattaactattatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 24178624  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 216
Target Start/End: Original strand, 12072061 - 12072223
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatta 153  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||    
T  12072061 agggtgctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaaaggaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattatcaatta 12072160  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12072161 attacacaatttcaatgcattaactactacataatttcctttttcatatccttaaccggtgcc 12072223  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Original strand, 42769986 - 42770151
Alignment:
Q  52 ttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaa 150  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||    
T  42769986 ttaagggttctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaatagaattattaccataaaaggaaactgtttttgatattattataaa 42770085  T
Q  151 ttaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  42770086 ttaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcataccattaaccagtgcc 42770151  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 211
Target Start/End: Original strand, 30294381 - 30294537
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  30294381 gggtcctgctaaccggtgtccccggagcacaggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaagaaactgtttttgacattattataaattaa 30294480  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacca 211  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30294481 ttacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaacca 30294537  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Original strand, 3784712 - 3784873
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatta 153  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||  |||||    
T  3784712 agggtccggctaaccggtgcccccgggacacgggttaagcataccataaaaggaaattattaccataaaagaaaattgtttttgactttattatcaatta 3784811  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3784812 attacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 3784873  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Original strand, 17333282 - 17333443
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatt 152  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  17333282 aagggtcctgctaaccggtgcctccggggcattggttaag--taccataaaagggaagtattatcataaaaggaaactgtttttgactttattatgaatt 17333379  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17333380 aattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 17333443  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 211
Target Start/End: Original strand, 8472903 - 8473070
Alignment:
Q  45 gatacttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gacttta 143  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||    
T  8472903 gatatttttaagggtcctgctaaccggtatcctcgggacactggttaagtataccataaaagagaattattattataaaatgaaactgtttttgacttta 8473002  T
Q  144 ttacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacca 211  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8473003 ttataaattaattacacaattttaatgcattaactattatataatttccttttttatatccttaacca 8473070  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Original strand, 38701935 - 38702094
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatt 152  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||    
T  38701935 aagggtcctgctaaccggtgccctcggggcactggttaagcataccataa----gaattattaccataaaagaaaactgtttttgacattattataaatt 38702030  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38702031 aattacataatttcaatgcattaactactatatagtttcctttttcatacccttaaccagtgcc 38702094  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 9266728 - 9266889
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| ||||||    || |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  9266728 gggtcctgctaaccggtgcttctggagcactggttaagtataccataaaagcgaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatgaattaa 9266827  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9266828 ttacacaatttcaatgcattaaatactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 9266889  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13961396 - 13961237
Alignment:
Q  57 ggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaat 155  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  13961396 ggtcctgctaaccggtgcccttggagcactggttaagcataccataaaagaaaattattaccataaaatgaaactgtttttgactttattatcaattaat 13961297  T
Q  156 tacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  13961296 tacacaatttcaatgcattaactactatataattt-tttttttatatccttaacccgtgcc 13961237  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 214
Target Start/End: Original strand, 35985644 - 35985780
Alignment:
Q  79 ggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttg-actttattacaaattaattacacaattccaatacattaac 177  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  35985644 ggggcactggttaagtatactataaatgggaattattaccataaaaggaaactgtttttcactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaac 35985743  T
Q  178 tactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35985744 tactatataatttccttttttatatccttaaacagtg 35985780  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3097845 - 3097688
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaat 151  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  3097845 taagggtcctgctaaccggtgtccccgt---actggttaagcataccataaaaggaaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattataaat 3097749  T
Q  152 taattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccag 212  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3097748 taattacataatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccag 3097688  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Original strand, 36446352 - 36446485
Alignment:
Q  83 cactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactact 181  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  36446352 cactggttaaacataccataaaagggaattattactataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactact 36446451  T
Q  182 atataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  36446452 atataatttcc-tttttatattcttaaccagtgcc 36446485  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 45431441 - 45431311
Alignment:
Q  79 ggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaac 177  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45431441 ggggcactggttaagtatatcataaaagagaattattaccataaaaggaaactatttttgactttattataaattaattacacaatttcaatacattaac 45431342  T
Q  178 tactatataatttccttttttatatccttaa 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45431341 tactatataatttcctttttcatatccttaa 45431311  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6770495 - 6770370
Alignment:
Q  84 actggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactacta 182  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6770495 actggttaagcatatcataaaagggaattattatcataaaatgaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatacattaactacta 6770396  T
Q  183 tataatttccttttttatatccttaa 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6770395 tataatttcctttttcatatccttaa 6770370  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 211
Target Start/End: Original strand, 45449243 - 45449400
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatta 153  Q
    ||||||||||||| || |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  45449243 agggtcctgctaaccgatgcccctggggcactggttaaacataccataaaaggcaattattaccataaaaggaaactgcttttgactttattataattta 45449342  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacca 211  Q
    ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  45449343 attacactattttaatgcattaactactatataattttcttttttatatctttaacca 45449400  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43286916 - 43286749
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcac--tggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttatta 146  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43286916 ttttaagggtcctgctaaccgatgcccccgaagcacactggttaagcataccataaaagagaattattactataaaaggaaactatttttgactttatta 43286817  T
Q  147 caaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
     |||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43286816 taaattaattacataatttcaaaacattaactattatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 43286749  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 209
Target Start/End: Original strand, 19031814 - 19031969
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatta 153  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19031814 agggtcctgctaaccggtgtctccggggtacgggttaagcatatcataaaaggaaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaatta 19031913  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaac 209  Q
    ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19031914 attacacaatttcaatgttttaactactatataatttcctttttcatatccttaac 19031969  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 215
Target Start/End: Original strand, 14350277 - 14350437
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatt 152  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||    
T  14350277 aagggtcctgctaaccggtgccc-cggggcactggttaagcataccattaa-gggaattattaccataaaaggaaattgtttttgacattattataaatt 14350374  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  14350375 aattacacaattttaatgcattaactacaatataatttcctttttcatacccttaaccggtgc 14350437  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 213
Target Start/End: Original strand, 51368789 - 51368943
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatta 153  Q
    |||||||||||||||||||     | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  51368789 agggtcctgctaatcggtg-----gaggcactggttaagcataccataaaatggaattattactataaaaggaaactatttttgacattattataaatta 51368883  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  51368884 actacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatacccttaaccagt 51368943  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 51 - 208
Target Start/End: Original strand, 50128167 - 50128325
Alignment:
Q  51 tttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaa 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||     ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||    
T  50128167 tttaagggtcctgctaaccggtgtttctgggacactggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaatgaaactgcttttaactttattataa 50128266  T
Q  150 attaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaa 208  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  50128267 attaattacacaatttcaatgcattaactactatgtaattttctttttcatatccttaa 50128325  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 23473464 - 23473625
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttga-ctttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||    
T  23473464 gggtcctgctaaccggtaccctcggagcacaggttaagcatattataaaaagaaattattaccataaaaggaaactgctttaaactttattataaattaa 23473563  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23473564 ttatacaatttcaatacattaactgctatataatctcctttttcatatccttaaccaatgcc 23473625  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 48383111 - 48383272
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| | ||||||  | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  48383111 gggtcctgctaaccagtgcccctgaggcattggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaa 48383210  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||  ||| |||||||||||||   ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  48383211 ttacattatttcaatacattaactttcatataattttctttttcacatccttaaccagtgcc 48383272  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 48071642 - 48071510
Alignment:
Q  82 gcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactac 180  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  48071642 gcaccggttaagcatactataaaagataattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactat 48071543  T
Q  181 tatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  48071542 tatataatttccttttacatatccttaaccagt 48071510  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29683355 - 29683220
Alignment:
Q  83 cactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactact 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||| |||| |||||||||||    
T  29683355 cactggttaagcataccataaaagtgaattattactataaaatgaaactgtttttgactttattataaattaattatacgatttcaatgcattaactact 29683256  T
Q  182 atataatttcctt-ttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  29683255 atataatttcctttttttatatctttaaccagtgcc 29683220  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30657788 - 30657633
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||      ||||||| |||||||||| |||||||    
T  30657788 gggtcctgctaatcggtgcctccggggtactggttaagcataccataaaagggaattattatcataaa------ctgtttttgactttattataaattaa 30657695  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||    
T  30657694 ttacataatttcaatgcattaactactatataatttcttttttcatatgcttaactagtgcc 30657633  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41730471 - 41730330
Alignment:
Q  79 ggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacatta-- 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||      
T  41730471 ggggcacttgttaagcataccataaaagggaattattatcataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattaaacaatttcaatgcattaat 41730372  T
Q  176 -actactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
     |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||    
T  41730371 tactactatataatttcttttttcatattcttaacccgtgcc 41730330  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 47532671 - 47532824
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| ||||||||||  | ||||    
T  47532671 gggtcttgctaaccggtgtcttcggggcattggttaagcataccataaaagggaattattattataaaaggaaattatttttgactttattatca-ttaa 47532769  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaac 209  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  47532770 ttacacaatttcaatgcattaactactatataattttctttttcatatccttaac 47532824  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38335317 - 38335196
Alignment:
Q  94 cataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttcc 192  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  38335317 cataccataaaagtgaattattatcataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaattacacaattacaatgcattaattactatataatttcc 38335218  T
Q  193 ttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||||| ||||| ||||||||||    
T  38335217 tttttcatatctttaaccagtg 38335196  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29210540 - 29210438
Alignment:
Q  115 taccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29210540 taccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatacccttaaccagt 29210441  T
Q  214 gcc 216  Q
    |||    
T  29210440 gcc 29210438  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12307077 - 12306962
Alignment:
Q  82 gcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactac 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  12307077 gcactggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaatctgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgtattaactac 12306978  T
Q  181 tatataatttccttttt 197  Q
     ||||||||| ||||||    
T  12306977 -atataattttcttttt 12306962  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30217952 - 30217785
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattaca 148  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |    
T  30217952 ttttatgggtcctgctaacaggtgcc-tcggggcactg-ttaagcataccataaaaagaaattattaccataaaagaaaactatttttgactttattata 30217855  T
Q  149 aattaattacacaattccaatacattaactactatataatttcctttttt--atatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||| | ||||  ||| ||||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  30217854 aattaattaaataatttaaatgcattaactactctctaattccctttttttcatatccttagccagtgcc 30217785  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 133 - 213
Target Start/End: Original strand, 15282592 - 15282672
Alignment:
Q  133 ttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15282592 ttttgactttattataaattaattacacaatttcaatatattaactactatataattttctttttcatatccttaaccagt 15282672  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26228370 - 26228219
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaa 149  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||| | ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||              |||| ||||||| ||    
T  26228370 ttttaagggtcatgctaaccggtgtccccggagtaccagttaagcataccataaaagggaattattaccat--------------ttgattttattataa 26228285  T
Q  150 attaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26228284 attaattacataatttcaatgcattaactactatataatttcattttttatctccttaaccagtgc 26228219  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 197
Target Start/End: Original strand, 37315300 - 37315409
Alignment:
Q  88 gttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgt-tttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatata 186  Q
    ||||||||||||  |||| | |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  37315300 gttaagcataccaaaaaaagaaattattagcataaaagaaaactgtctttgacttt-ttataaattaattacataatttcaatgcattaactactatata 37315398  T
Q  187 atttccttttt 197  Q
    |||||||||||    
T  37315399 atttccttttt 37315409  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 52431761 - 52431632
Alignment:
Q  62 tgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaa-ttattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaattaca 159  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| || ||| ||||||||||||    
T  52431761 tgctaaccggtgtccctggggcactggttaagcataccaaaaaaaggaaattattaccataaaagaaaattgcttttgacatt-ttataaattaattaca 52431663  T
Q  160 caattccaatacattaactactatataattt 190  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  52431662 caatttcaatgcattaactactatataattt 52431632  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 52749757 - 52749627
Alignment:
Q  87 ggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttga-ctttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatat 185  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||  ||||| | || |||||| |||||||||||||| |||||    
T  52749757 ggttaaacataccataaaaaggaattattaccataaaaaaaaattgtttttaactttattgtaaatttagtatacaatttcaatacattaactattatat 52749658  T
Q  186 aatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  52749657 aatttcctttttcatatctttaaccaatgcc 52749627  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 147
Target Start/End: Original strand, 19010676 - 19010779
Alignment:
Q  45 gatacttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaact-gttttgacttta 143  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| |||||  |  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19010676 gataattttatgggtcctactaaccggtgttcctggggcactggttaatcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactatttttgacttta 19010775  T
Q  144 ttac 147  Q
    ||||    
T  19010776 ttac 19010779  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 216
Target Start/End: Original strand, 28725900 - 28726067
Alignment:
Q  51 tttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaa 150  Q
    |||| ||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||  | | |||||||  |||   |    
T  28725900 tttatgggtcttgctaaccggtgtccccggggcactggttaagcatacgaaaaaaggaaattcttaccataaaaggaagttttgttgacttatttatgga 28725999  T
Q  151 ttaattacacaa-ttccaatacattaactactatataatttcctttttta-tatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||| |||| || |||| || ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28726000 ttaattaaacaattttcaatgcaataattaacatataatttccttttttattatccttaaccagtgcc 28726067  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 214
Target Start/End: Original strand, 3838791 - 3838936
Alignment:
Q  70 ggtgccctcggggcactggttaagcatac-cctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaattacacaattcca 167  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||    |||||| ||||||| ||||||||  ||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||||  |    
T  3838791 ggtgccctcggggtactgattaagcatactaaaaaaaggaaattattgccataaaaaaaaattgcttttgacatt-ttataaattaattacacaatttta 3838889  T
Q  168 atacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  3838890 atgcattaactattatataatttcctttttagtatgcttaaccagtg 3838936  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 39912363 - 39912440
Alignment:
Q  139 ctttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  39912363 cttttttataaattaatcacacaatttcaatgcattaactagtatataatttccctttttatatccttaatcagtgcc 39912440  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 213
Target Start/End: Original strand, 35700729 - 35700808
Alignment:
Q  133 ttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  35700729 ttttgacttt-ttataaattaattacacaatttcaatgtattaactactgtataatttcctttttagtatccttaaccagt 35700808  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39081933 - 39081826
Alignment:
Q  109 aattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaa 208  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||| | | | ||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||    
T  39081933 aattattatcataaaatgaaactgcttttaatattttataaattaattataaaatttcaatacattaactagtatataatttcatttttagtatgcttaa 39081834  T
Q  209 ccagtgcc 216  Q
    ||||||||    
T  39081833 ccagtgcc 39081826  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 39497415 - 39497340
Alignment:
Q  133 ttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaa 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39497415 ttttgactttattataaattaattatataattttaatgcattaactactatataattttctttttcatatccttaa 39497340  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37503346 - 37503260
Alignment:
Q  109 aattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttt 195  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||   ||| ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  37503346 aattgttaccataaaaggaaaatatttttgattttttataaattaattacacaatttcaatgtattaactactatataatttccttt 37503260  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 107
Target Start/End: Original strand, 21112680 - 21112732
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagg 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21112680 agggtcctgctaaccggtgccctcggggcactagttaagcataccataaaagg 21112732  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 216
Target Start/End: Original strand, 30664173 - 30664329
Alignment:
Q  62 tgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacaca 161  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   |||| | |||| |||||||||||||||  | | |||||||  ||| | |||||||| |||    
T  30664173 tgctaaccggtgcccacggggcactggttaagcatacaaaaaaaagaaattcttaccataaaaggaagttttgttgacttatttatagattaattaaaca 30664272  T
Q  162 a-ttccaatacattaactactatataatttcctttttta-tatccttaaccagtgcc 216  Q
    | || |||| || ||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  30664273 attttcaatgcaataattaacatataattttcttttttattatccttaaccaatgcc 30664329  T

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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 19011112 - 19011157
Alignment:
Q  171 cattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19011112 cattaactactatataatttcctttttcatatccttaacccgtgcc 19011157  T

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Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29210586 - 29210537
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcatacc 99  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29210586 tttttagggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcatacc 29210537  T

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Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 49867523 - 49867454
Alignment:
Q  148 aaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttcctttttta-tatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||    
T  49867523 aaattaattacacaatttcaaaacattaattactatataactttcttttttagtatcattaaccagtgcc 49867454  T

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Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 107
Target Start/End: Original strand, 21117422 - 21117474
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagg 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  21117422 agggtcctgctaaccggtgccctcggggcacaagttaagcataccataaaagg 21117474  T

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Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28481954 - 28481873
Alignment:
Q  127 aaactgttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccag 212  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  ||| |||    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28481954 aaactgtttttattttattataaattaattacacaattttaatgcat----tactgtataatttcctttttcatatccttaaccag 28481873  T

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Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Original strand, 52702144 - 52702307
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaatta 153  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | || |||| |||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||  |||   ||||    
T  52702144 aagggtcatgcaaatcggtgctc-cgaggcattggttaagcatacaaaaaaaggaaattattaccataaaatgaagtttttttgacttatttatggatta 52702242  T
Q  154 attacacaa-ttccaatacattaactactatataatttcctttttta-tatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||| |||| || |||| || ||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  52702243 attaaacaattttcaatgcaataattaacatataatttccctttttattatccttaaccagtgcc 52702307  T

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Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 162
Target Start/End: Original strand, 14881036 - 14881086
Alignment:
Q  113 attaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaattacacaa 162  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14881036 attaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattatacaa 14881086  T

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Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 38595752 - 38595914
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaat 155  Q
    ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |   |||||  |||| |||||||||||||||  | | |||||||  |||   ||||||    
T  38595752 gggtcatgctaaccggtgcctccggggcactggttaagcatgcaaaaaaagaaaattcttaccataaaaggaagttttgttgacttatttatggattaat 38595851  T
Q  156 tacacaa-ttccaatacattaactactatataatttcctttttta-tatccttaaccagtgcc 216  Q
    || |||| || |||| || ||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  38595852 taaacaattttcaatgcaataattaacatataatttccctttttattatccttaaccagtgcc 38595914  T

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Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 10976018 - 10976063
Alignment:
Q  171 cattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10976018 cattaactactatataatctcctttttcatatccttaacaagtgcc 10976063  T

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Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 142
Target Start/End: Original strand, 11796969 - 11797056
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgacttt 142  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| |||||| |||||  |||||| | |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  11796969 aagggtcatgctaaccggtgtcct-ggggcactagttaaggataccaaaaaaggaagttattaccataaaacgaaacttttttaacttt 11797056  T

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Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 213
Target Start/End: Original strand, 14881086 - 14881124
Alignment:
Q  175 aactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14881086 aactattatataatttcctttttcatatccttaaccagt 14881124  T

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Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 215
Target Start/End: Original strand, 33644390 - 33644495
Alignment:
Q  111 ttattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacacaa-ttccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaac 209  Q
    |||||| |||||||||||||| |  |||| |  |||  |||||||||||||| || |||| || ||| || |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33644390 ttattatcataaaaggaaactttgatgacatatttatgaattaattacacaattttcaatgcaataattattatataattttcttttttatagccttaac 33644489  T
Q  210 cagtgc 215  Q
    | ||||    
T  33644490 ctgtgc 33644495  T

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Target: chr3 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 49)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39074607 - 39074444
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaatt 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  39074607 taagggtcctgctaaccggtgcccctggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgacattattataaatt 39074508  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  39074507 aattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatacccttaaccagtgcc 39074444  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 51 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4168374 - 4168211
Alignment:
Q  51 tttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaa 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  4168374 tttaagggtcctgctaaccggtgcccccggggtacgggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattataa 4168275  T
Q  150 attaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4168274 attaattacacaatttcaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 4168211  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 272406 - 272245
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  272406 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcaccgattaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactatttttgactttattataaattaa 272307  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  272306 ttacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 272245  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 56 - 214
Target Start/End: Original strand, 10617284 - 10617443
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  10617284 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcacgggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaattgtttttgactttattataaattaa 10617383  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10617384 ttacacaattttaatgcattaactactatataatttccttttttatatccttaatcagtg 10617443  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46352826 - 46352659
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttt-tgactttattaca 148  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  46352826 ttttatgggtcctgctaaccggtgcctccggggcacgggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttctgactttattatc 46352727  T
Q  149 aattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46352726 aattaattacacaatttcaatgcattaactactgtataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 46352659  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 52520869 - 52520706
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatt 152  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  52520869 aagggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaatagaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaatt 52520770  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  52520769 aattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatacccttaaccagtgcc 52520706  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 49893517 - 49893356
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  49893517 gggtccggctaaccggtgcccccggggcactgattaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatagattaa 49893418  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49893417 ttacacaatttcaatgcattaactattatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 49893356  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 48725459 - 48725296
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatt 152  Q
    |||||||||||||| | |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  48725459 aagggtcctgctaacccgtggtcccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaatt 48725360  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48725359 aattacacaatttcaatgcattaattactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 48725296  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 858776 - 858615
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatta 153  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  858776 agggtccggctaaccggtgcccccggggcacgggttaagcataccataaaaggaaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaatta 858677  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  858676 attacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaactagtgc 858615  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43787060 - 43786896
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaat 151  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||    
T  43787060 taagggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaatagaattattaccataaaaggaaactgtttttgatattattataaat 43786961  T
Q  152 taattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  43786960 taattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcataccattaaccagtgcc 43786896  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Original strand, 40362578 - 40362741
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatt 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||    
T  40362578 aagggtcctgctaatcggtacccccggggcactggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattatcaatt 40362677  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  40362678 aattacacaattttaatgcattaactactatataatttcttttttcatatccttaatcagtgcc 40362741  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 51 - 215
Target Start/End: Original strand, 41553935 - 41554100
Alignment:
Q  51 tttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaa 149  Q
    |||| ||||||| ||||||||||  | | ||||||| |||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  41553935 tttatgggtcctactaatcggtgttcccagggcacttgttaagcataccataaaaaataattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataa 41554034  T
Q  150 attaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41554035 attaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 41554100  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 213
Target Start/End: Original strand, 2938039 - 2938198
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatta 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||    
T  2938039 agggtcctgctaaccggtgccctcggggtactcgttaagcataccataaaagtgaattattaccataaaatgaaattgtttttgactttattataaatta 2938138  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    || |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  2938139 atcacacaatttcagtgcattaactactatataattttcttttttatatctttaaccagt 2938198  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 42964242 - 42964410
Alignment:
Q  49 cttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattac 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||  | | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  42964242 cttttaagggtcctgctaaccggtgtccctgagacactggttaagcatatcataaaagtgaattattactataaaagaaaactgtttttgactttattat 42964341  T
Q  148 aaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  42964342 aaattaattacacaatttcaatgcattaactactataaaatttcatttttcatatccttaaccagtgcc 42964410  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18014862 - 18014697
Alignment:
Q  52 ttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaa 150  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |      
T  18014862 ttaagggtcttgctaactggtgcccccggggcactgattaagcataccataaaaggaaattattatcataaaaggaaactgtttttaactttattatagt 18014763  T
Q  151 ttaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  18014762 ttaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttactttttcatatccttaatcagtgcc 18014697  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Original strand, 43269738 - 43269899
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgt-tttgactttattacaaatta 153  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  43269738 agggtcctgctaaccggtgcctccggggcactggttaagcataccataaaggataattattactataaaaggaaactgtgtttgattttattataaatta 43269837  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  43269838 attacataatttcaatgcattaactactatgtaatttcccttttcatatccttaaccagtgc 43269899  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2505522 - 2505379
Alignment:
Q  69 cggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattcca 167  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  2505522 cggtgcccccagggcactggttaaacataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactatttttgactttattatgaattaattacacaatttca 2505423  T
Q  168 atacattaactactatataatttccttttttatatccttaacca 211  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2505422 atgcactaactactatataatttcctttttcatatctttaacca 2505379  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 56 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7468595 - 7468438
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  7468595 gggtcctgctaaccggtgctc-cggggcactgattaagcataccataaaaggga-ttattatcataaaagaaaactgcttttgactttattataaattaa 7468498  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  7468497 ttatacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatttccttaaccagtg 7468438  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 56 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6842805 - 6842676
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6842805 gggtcctgctaaccgctgcccccggggcactggttaagcataccataaatgggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaa 6842706  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactata 184  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  6842705 ttacacaatttcaatgcattaactattata 6842676  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Original strand, 50395557 - 50395721
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||| | |||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  50395557 ttttaagggtcctgctaatcggtgtctccggtgtactgattaatcatatcataaaagagaattattaccataaaaggaaattgttttgactttattatca 50395656  T
Q  150 attaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  50395657 attaattacacaatttctatgcattaactactgtataattttctttttcatatccctaaccagtg 50395721  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Original strand, 53489821 - 53489985
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaat 151  Q
    ||||||||| | |||  ||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  53489821 taagggtccggttaactggtgccaccggggcattggttaagcataccataaaatagaattattatcataaaaggaaactgtttttgacattattataaat 53489920  T
Q  152 taattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  53489921 taattacacaattttaatgcattaactactatataatttcctttttcatacccttaaccagtgcc 53489985  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22249042 - 22248911
Alignment:
Q  86 tggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactata 184  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22249042 tggtcaagcatactataaaagggaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattatcaattaattacacaatttcaatacaataactactata 22248943  T
Q  185 taatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22248942 taatttcctttttcatatccttaactagtgcc 22248911  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28139469 - 28139336
Alignment:
Q  82 gcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactac 180  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  28139469 gcactgtttaagtataccataaaagggaattattaccataaaaggaatctgcttttgactttattataaattaattatacaatttcaatgcattaactac 28139370  T
Q  181 tatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28139369 tatttaatttcttttttcatatccttaaccagtg 28139336  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41304184 - 41304030
Alignment:
Q  61 ctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaattaca 159  Q
    ||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  |    
T  41304184 ctgctaaccggtgtctccggggcattggttaagcataccataaaaggaaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaatt--a 41304087  T
Q  160 caattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  41304086 caatttcaatgcattaattactatataatttcctttttcatatccttaaccactgcc 41304030  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 214
Target Start/End: Original strand, 11308210 - 11308369
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatta 153  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  |||||    
T  11308210 agggtcctgctaatcggtgcccctggggcattggttaagcataccataaaagg-aattattaccataaaaggaaactatttttgattttattatcaatta 11308308  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  11308309 attacattatttcaatgcattaactattatataatttcctttttcacatccttaatcagtg 11308369  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20924173 - 20924017
Alignment:
Q  59 tcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaatta 157  Q
    ||||||||| ||||||  || || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||    
T  20924173 tcctgctaaccggtgc--tcaggacactggttaagtataccataaaagagaattattaccttaaaaggaaactgtttttgatattattataaattaatta 20924076  T
Q  158 cacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20924075 cacaatttcaatgaattaactactatataatttcctttttcatacccttaaccagtgcc 20924017  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42548255 - 42548120
Alignment:
Q  82 gcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactac 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  42548255 gcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaatgaaattatttttgactttattataaattaattacataatttcaatgcattaactac 42548156  T
Q  181 tatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  42548155 tatataatttcttttttcatatctttaagcagtgcc 42548120  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Original strand, 49529264 - 49529430
Alignment:
Q  52 ttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaa 150  Q
    |||| |||| |||||| |||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  49529264 ttaaaggtcttgctaaccggtgcccccgg--cactggttaaacataccataaaaggaaattattaccataaaaggaaaatgtttttgactttattataaa 49529361  T
Q  151 ttaattacacaattccaatacattaactac---tatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  49529362 ttaattacataatttcaatgcattaactactagtatataattttctttttcatatccttaatcagtgcc 49529430  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 52246768 - 52246607
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg--ttttgactttattacaaatta 153  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||| |   |||||||||||||| ||||||    
T  52246768 gggtcctgctaactggtgctctcggg-cactagttaagcataccataaaaggaaattattactataaaaaaaaaattgtttttgactttattataaatta 52246670  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  52246669 attatacaatttcaatgcattaacaactatataatttcatttttcatatccttaaccagtgcc 52246607  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 51 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24488557 - 24488391
Alignment:
Q  51 tttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaa 149  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| | ||| ||||| ||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  |    
T  24488557 tttaaaggtcctgttaaccggtgctcccggagcactagttcagcatatcataaaagagaattattaccataaaaagaaactgtttttgattttattatca 24488458  T
Q  150 attaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24488457 attaattacactatttccatgcattaactattatataatttccttttttacattcttaaccagtgcc 24488391  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 41993616 - 41993773
Alignment:
Q  52 ttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttga-ctttattacaaa 150  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |  ||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  41993616 ttaagggttctgctaaccggtgcctttagggtactagttaagcataccataaaagagaattattat-ataaaaggaaactgtttttaactttattataaa 41993714  T
Q  151 ttaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaac 209  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  41993715 ttaattacataatttcaatgcattaactactatataatttcatttttaatatacttaac 41993773  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33141070 - 33140937
Alignment:
Q  57 ggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaat 155  Q
    |||| |||||| ||||||   ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33141070 ggtcttgctaaccggtgcttccggggtactgattaagcatatcataaaagggaattattaccataaaagaaaactgcttttgactttattataaattaat 33140971  T
Q  156 tacacaattccaatacattaactactatataatt 189  Q
    || |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33140970 tatacaatttcaatgcattaactactatataatt 33140937  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38852381 - 38852246
Alignment:
Q  78 cggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacatta- 175  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||     
T  38852381 cggggcacgggttaaacataccataaaagtgaattattatcataaaataaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaa 38852282  T
Q  176 --actactatataatttccttttttatatccttaac 209  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38852281 ttactactatataatttcattttttatatccttaac 38852246  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2119577 - 2119456
Alignment:
Q  94 cataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttcc 192  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2119577 cataccataaaagg-aattattac-ataaaaggaaattgtttttgactttattataaattaattactcaatttcaatgcattaactactatataatttcc 2119480  T
Q  193 ttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||    
T  2119479 tttttcatatctttaaccagtgcc 2119456  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13160055 - 13159929
Alignment:
Q  84 actggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactacta 182  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13160055 actgattaagcataccataaaaagaaattattaccgtaatagaaaactgtttttgactttattatcaattaattacacaatttcaatgtattaactacta 13159956  T
Q  183 tataatttccttttttatatccttaac 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13159955 tataatttcctttttcatatccttaac 13159929  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Original strand, 50298973 - 50299103
Alignment:
Q  84 actggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactacta 182  Q
    |||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  50298973 actggttaagtataccataagagtgaattattatcataaaaagaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcagtgcattaactacta 50299072  T
Q  183 tataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    |||||||| | |||||||||| |||| ||||    
T  50299073 tataattttcctttttatatctttaatcagt 50299103  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29241790 - 29241669
Alignment:
Q  89 ttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataa 187  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  29241790 ttaagcatactataaaacggaattattatcataaaaagaatctgtttttgactttattataaattaattacataatttcaatgcattaactactatataa 29241691  T
Q  188 tttccttttttatatccttaac 209  Q
    ||||| |||| |||||||||||    
T  29241690 tttccattttcatatccttaac 29241669  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 216
Target Start/End: Original strand, 50359208 - 50359347
Alignment:
Q  78 cggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaa 176  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  50359208 cgggacactggttaagcataccatagaagataattattaccacaaaagaaaactgtttttgactttattatatattaattacccaatttcaatgcattaa 50359307  T
Q  177 ctactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||||  |||||  || ||||||||||||||    
T  50359308 ctactatataattttttttttcttaaccttaaccagtgcc 50359347  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 31514948 - 31514829
Alignment:
Q  84 actggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactacta 182  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31514948 actggttaagtatactataaaaggaaattattactataaaaa-aaattgtttttgattttattataaattaattacacaattttaatacattaactacta 31514850  T
Q  183 tataatttccttttttatatc 203  Q
    ||||||||  ||||| |||||    
T  31514849 tataattttatttttcatatc 31514829  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21010133 - 21010039
Alignment:
Q  102 aaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttcctttttta 199  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  21010133 aaaaggaagttattaccataaaaagaaacttttttgacttt-ttataaattaattatacaatttcaatg--ttaactactatataatttcctttttta 21010039  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25743967 - 25743842
Alignment:
Q  84 actggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacacaa-ttccaatacattaactacta 182  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | |||| |||||  |||||||||| |||  |||||||||||||| ||  ||| || ||| |||||    
T  25743967 actggttaagcataccaaaaaaggaaattattactaaaaaatgaaacgattttgacttt-ttatgaattaattacacaatttttaatgcaataattacta 25743869  T
Q  183 tataatttcctttttta-tatccttaa 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25743868 tataatttccttttttagtatccttaa 25743842  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 52552632 - 52552551
Alignment:
Q  83 cactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaatt 164  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  52552632 cactggttaaatataccataaaagagaattattaccataaaag-atactgtttttgactttattataaattaattacacaatt 52552551  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2391688 - 2391632
Alignment:
Q  160 caattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2391688 caatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcttatccttaaccagtgcc 2391632  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2393449 - 2393393
Alignment:
Q  160 caattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2393449 caatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcttatccttaaccagtgcc 2393393  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 52718236 - 52718194
Alignment:
Q  172 attaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52718236 attaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 52718194  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2362958 - 2362880
Alignment:
Q  115 taccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttcct 193  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||  |||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2362958 taccataaaagaaaactgtttttgattttattatcaattaattacactatttcaatgcattaacta-tatataatttcct 2362880  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23925350 - 23925308
Alignment:
Q  171 cattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23925350 cattaattactatataatttccttttttatattcttaaccagt 23925308  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17752842 - 17752709
Alignment:
Q  84 actggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacacaa-ttccaatacattaactacta 182  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||   |||||| ||||| || |||| || ||| ||||||||||||||| || |||  || ||| |||||    
T  17752842 actgattaagcataccaaaaaagggaattattattgtaaaagaaaactattatgacatt-ttataaattaattacacaattttcaacgcaataaatacta 17752744  T
Q  183 tataattt-ccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||| |||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  17752743 tatgatttaccattttagtatccttaaccagtgcc 17752709  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19054162 - 19054029
Alignment:
Q  84 actggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacacaa-ttccaatacattaactacta 182  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||   |||||| ||||| || |||| || ||| ||||||||||||||| || |||  || ||| |||||    
T  19054162 actgattaagcataccaaaaaagggaattattattgtaaaagaaaactattatgacatt-ttataaattaattacacaattttcaacgcaataaatacta 19054064  T
Q  183 tataattt-ccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||| |||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  19054063 tatgatttaccattttagtatccttaaccagtgcc 19054029  T

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Target: chr6 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 216
Target Start/End: Original strand, 32985192 - 32985354
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatta 153  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32985192 agggttctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattatcataaaaggaaactgtttttgactttattataaatta 32985291  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32985292 attacacaatttcaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccaatgcc 32985354  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 392286 - 392121
Alignment:
Q  52 ttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  392286 ttaagggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaa 392187  T
Q  151 ttaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  392186 ttaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatacccttaaccagtgcc 392121  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Original strand, 32929504 - 32929669
Alignment:
Q  52 ttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaa 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  32929504 ttaagggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaa 32929603  T
Q  151 ttaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  32929604 ttaattacacaatttcaatgcattaattaatatataatttcctttttcatacccttaaccattgcc 32929669  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23402330 - 23402163
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattaca 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  23402330 ttttaagggtcctgctaaccggtgcctccggggcacgggttaagcataccataaaaggtaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattata 23402231  T
Q  149 aattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23402230 aattaatttcacaatttcaatgcattaattactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 23402163  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3515952 - 3515791
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  3515952 gggtcctgctaaccggtgcccctggggcacaggttaaacataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaa 3515853  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3515852 ttacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatacccttaaccagtgcc 3515791  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Original strand, 26467120 - 26467285
Alignment:
Q  52 ttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaa 150  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  26467120 ttaagggtcatgctaaccggtgcctccggggcactggttagacataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactatttttgactttattataaa 26467219  T
Q  151 ttaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26467220 ttaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccggtgcc 26467285  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2350816 - 2350677
Alignment:
Q  78 cggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaa 176  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2350816 cggggtactggttaagcatatcataaaagggaattattaccataaaaggaaactatttttgactttattataaattaattacacaatttcaatacattaa 2350717  T
Q  177 ctactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2350716 ctactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 2350677  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4215883 - 4215720
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatt 152  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  4215883 aagggtcctgctaaccgatgcccccggggcactggttaagcataccataaaaggaaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaatt 4215784  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  4215783 aattacacaatttcaatgcattaactattatataatttcctttttcatactcttaaccagtgcc 4215720  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 18276612 - 18276776
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcata---ccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaat 151  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18276612 gggtcctgctaaccggtgccccaggggcactggttaagcataataccataaaaggaaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaat 18276711  T
Q  152 taattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18276712 taattacacaaattcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 18276776  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 215
Target Start/End: Original strand, 12145117 - 12145277
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12145117 gggtcctgctaaccggtgcctccggagcactggttaagcatactataaaaggaaattattatcataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaa 12145216  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12145217 ttacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaacaagtgc 12145277  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2581139 - 2580980
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatta 153  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||    
T  2581139 agggtcctgctaaccggtgctcccggggtattggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaattatttttgactttattataaatta 2581040  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2581039 attacataatttcaatgcattaactactatataatttccttttttatatcattaaccagt 2580980  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 211
Target Start/End: Original strand, 25165407 - 25165569
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattaca 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | | ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  25165407 ttttaagggtcctgctaaccggtgctcccagggcattggttaagcatatcgtaaaagagaattattatcataaaagaaaactgtttttgactttattata 25165506  T
Q  149 aattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacca 211  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25165507 aattaattacacaatttcaatatattaactactatataatttcttttttcatatccttaacca 25165569  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 216
Target Start/End: Original strand, 29451138 - 29451276
Alignment:
Q  79 ggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgt-tttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaac 177  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||    
T  29451138 ggggcacgggttaagcataccataaaagggaattattatcataaaaggaaactgtgtttgactttattataatttaattacacaatttcaatgcattaac 29451237  T
Q  178 tactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29451238 tactatataatttcctttttcatatccttaaccggtgcc 29451276  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27433680 - 27433517
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatt 152  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| | |||||    
T  27433680 aagggtcttgctaaccggtgcccccggggaacgggttaaacataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactatttttgacattatgataaatt 27433581  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27433580 aattacacaattttaatgcattaactactatataatttcctttttcatacccttaaccagtgcc 27433517  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 88 - 216
Target Start/End: Original strand, 7851191 - 7851320
Alignment:
Q  88 gttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatata 186  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  7851191 gttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaattttaatgcattaattactatata 7851290  T
Q  187 atttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7851291 attttctttttcatatccttaaccagtgcc 7851320  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 83 - 213
Target Start/End: Original strand, 1391205 - 1391336
Alignment:
Q  83 cactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactact 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  1391205 cactggttaagcataccataaaagggaattattatcataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaattatacaatttcaatgcattaactact 1391304  T
Q  182 atataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1391305 atataatttcctttttcatatccttaatcagt 1391336  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 51 - 216
Target Start/End: Original strand, 13416955 - 13417123
Alignment:
Q  51 tttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattac-- 147  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||       
T  13416955 tttaagggtccagctaaccggtgcc-tccgggcactggttaagcatattataaaagagaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattatta 13417053  T
Q  148 -aaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13417054 taaattaattacacaatttcaatacattaactaatatataatttcctttttcatatccttaactagtgcc 13417123  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 56 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35044074 - 35043917
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    ||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35044074 gggtcatgttaaccggtgccc-cggggcactggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaa 35043976  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
     ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35043975 -tacacaatttcaatgaattaactactatataatttcttttttcatatccttaaccagtg 35043917  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 53 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28225409 - 28225252
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaat 151  Q
    |||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||    
T  28225409 taagggtcctactaacctgtgccttcgggtcactgtttaaggataccataaaagggaattattaccataaaagaaaattgtttttgactttattataaat 28225310  T
Q  152 taattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacc 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28225309 taattacacaatttcaatacattaattactatataa-ttcctttttcatatccttaacc 28225252  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 216
Target Start/End: Original strand, 3026013 - 3026170
Alignment:
Q  60 cctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaattac 158  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||     
T  3026013 cctgctaaccggtgccctcgggacactgattaagcataccataaaagagaattattacgataaaagaaaactgtttttgacattattataaattaattat 3026112  T
Q  159 acaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  3026113 acaatttcaatgcattaactactgtataatttcatttttcatacccttaaccagtgcc 3026170  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 215
Target Start/End: Original strand, 1840271 - 1840407
Alignment:
Q  80 gggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttga-ctttattacaaattaattacacaattccaatacattaact 178  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  1840271 gggcactggttaaacatatcataaaagggaattattaccatgaaaggaaactgtttttaactttattataaattaattacacaattttaatacattaatt 1840370  T
Q  179 actatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1840371 attatataatttctttttttatatccttaaccagtgc 1840407  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12525906 - 12525747
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgt-tttgactttattacaaatta 153  Q
    ||||||||||||| ||||  ||  |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  12525906 agggtcctgctaaccggtatccctggggcactagttaagcatatcataaaagggaattattaccataaaatgaaactgtgtttgacattattataaatta 12525807  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12525806 attacacattttcaatgtattaactactatataatttcctttttcatacccttaaccagt 12525747  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 51 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5323591 - 5323426
Alignment:
Q  51 tttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaa 149  Q
    ||||| |||| || |||||||||||  | |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  5323591 tttaaaggtcatgttaatcggtgcctccagggcaccggttacgcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaattgtttttgactttattataa 5323492  T
Q  150 attaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5323491 attaattacataattttaatgctttaattactatataatttccttttttatattcttaatcagtgc 5323426  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29978423 - 29978259
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattaca 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |    
T  29978423 ttttaagggtcctgctaaccggtgttc-cagggcgctggttaagcatatcataaaagggaattattaccataaaattaaactgtttttgactttattata 29978325  T
Q  149 aattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    |||  |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29978324 aatatattacataatttcaatacattaaatactatataatttcctttttcatatccttaactagtg 29978259  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 216
Target Start/End: Original strand, 11115119 - 11115256
Alignment:
Q  78 cggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaa 176  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  11115119 cggggcactggttaaacatatcataaaagggaattattaccataaaagaaaactatttttga--ttattataaattaattacacaatttcaatgtattaa 11115216  T
Q  177 ctactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11115217 ctattatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 11115256  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 216
Target Start/End: Original strand, 21878352 - 21878508
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatta 153  Q
    ||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||| |||||      |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21878352 agggtcctgctaaccggtgttcctggggcactggttaaacatac------agggaattattaccataaaaagaaactgtttttgactttattataaatta 21878445  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21878446 attaaataatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaacccgtgcc 21878508  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20898075 - 20897973
Alignment:
Q  115 taccataaaaggaaactgttt-tgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20898075 taccataaaaggaaactgtttctgactttattatcaattaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagt 20897976  T
Q  214 gcc 216  Q
    |||    
T  20897975 gcc 20897973  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Original strand, 34477609 - 34477711
Alignment:
Q  115 taccataaaaggaaactgttt-tgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34477609 taccataaaaggaaactgtttctgactttattatcaattaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagt 34477708  T
Q  214 gcc 216  Q
    |||    
T  34477709 gcc 34477711  T

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Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 34851849 - 34852003
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| |||| ||    
T  34851849 gggtcctgctaatcggtgtcaccggaacactggttaagcatattataaaagagaattattactataaaaggaaattatttttgactttattataaatcaa 34851948  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaac 209  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  34851949 ttacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatctttaac 34852003  T

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Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 961164 - 961053
Alignment:
Q  87 ggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttt-tgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatat 185  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  961164 ggttaagcataccataaaagagaattattatcataaaaggaaattgtttctgactttattatcaattaattacacaattttaatgcattaactactatat 961065  T
Q  186 aatttccttttt 197  Q
    ||||||||||||    
T  961064 aatttccttttt 961053  T

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Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 216
Target Start/End: Original strand, 23629607 - 23629737
Alignment:
Q  87 ggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatat 185  Q
    ||||||| ||| | ||||||  |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23629607 ggttaagtataacataaaagaaaattattgtcataaaaggaaattgtttttgactttattataaagtaattacacaatttcaatacattaactactatat 23629706  T
Q  186 aatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  23629707 aattttctttttcatatccttaatcagtgcc 23629737  T

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Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31280506 - 31280365
Alignment:
Q  51 tttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaa 149  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||| ||     |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||    
T  31280506 tttatgggtcctgctaaccggtgcc-tccgggcactcgttaagcataccata-----gaattattactataaaaggaaaccgtttttgacattattataa 31280413  T
Q  150 attaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttt 197  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31280412 attaattatacaatttcaatgcattaactactatataatttccttttt 31280365  T

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Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 125 - 210
Target Start/End: Original strand, 34396596 - 34396682
Alignment:
Q  125 ggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacc 210  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34396596 ggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaacc 34396682  T

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Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9661127 - 9661018
Alignment:
Q  101 taaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttcctttttta 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| |    
T  9661127 taaaatggaattattaccataaaaggaaactgcttttaactttattttaaattaattatacaatttcaatgcattaactattatgtaatttcttttttca 9661028  T
Q  200 tatccttaac 209  Q
    ||||||||||    
T  9661027 tatccttaac 9661018  T

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Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13529554 - 13529480
Alignment:
Q  142 tattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13529554 tattataaattaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcacatccttaaccagtgcc 13529480  T

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Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34706908 - 34706745
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||  | | |||||||  |||   |||||    
T  34706908 agggtcttgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcatacgaaaaaaggaaattcttaccataaaaggaagttttgttgacttatttatggattaa 34706809  T
Q  155 ttacacaa-ttccaatacattaactactatataatttcctttttta-tatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||| |||| || |||| || ||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  34706808 ttaaacaattttcaatgcaataattaacatataatttccctttttattatccttaaccggtgcc 34706745  T

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Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1127994 - 1127840
Alignment:
Q  64 ctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacacaa- 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||  |||| |||||||||||  ||  | | |||||||  ||| |||||||||| ||||     
T  1127994 ctaaccggtgccctcggggcactggttaagcatacaaaaaaagaaaattcttaccataaaaaaaagttttgttgacttatttataaattaattaaacaat 1127895  T
Q  163 ttccaatacattaactactatataatttcctttttta-tatccttaaccagtgcc 216  Q
    || |||| || ||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  1127894 tttcaatgcaataattaacatataatttccctttttattatccttaaccggtgcc 1127840  T

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Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 22417357 - 22417303
Alignment:
Q  78 cggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg 132  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  22417357 cggggcactgattaagcataccataaaagagaattattagcataaaaggaaactg 22417303  T

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Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 128
Target Start/End: Original strand, 34712131 - 34712197
Alignment:
Q  62 tgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaa 128  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   ||| || |||| |||||||||||||||    
T  34712131 tgctaaccggtgcccccggggcactagttaagcatacaaaaaatggaaattcttaccataaaaggaa 34712197  T

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Target: chr2 (Bit Score: 122; Significance: 9e-63; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30486396 - 30486235
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||    
T  30486396 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatagtttaa 30486297  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30486296 ttacacaatttcaatacattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 30486235  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20553120 - 20552956
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaat 151  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  20553120 taagggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaat 20553021  T
Q  152 taattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20553020 taattacacaatttcaatgcattaattactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 20552956  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31390204 - 31390037
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattaca 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31390204 ttttatgggtcctgctaatcggtgcccccggagcacgggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattata 31390105  T
Q  149 aattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31390104 aattaattacataatttcaatacattaactactatataatttcctttttcatatccttaactagtgcc 31390037  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31438835 - 31438671
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaat 151  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  31438835 taagggtcctgctaaccggtgtccccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattatcataaaaggaaactgtttttgactttattataaat 31438736  T
Q  152 taattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31438735 taattacacaatttcaatgcattaactactgtataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 31438671  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4381987 - 4381821
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattaca 148  Q
    |||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  4381987 ttttaagggtcctgctaaccagtgctcccggggcactggttaagcataccataaaatggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattata 4381888  T
Q  149 aattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4381887 aattaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatacccttaaccagtgc 4381821  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 216
Target Start/End: Original strand, 22068319 - 22068480
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatta 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  22068319 agggtcctgctaatcggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaatta 22068418  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22068419 attatacaatttcaatgca-taactactatataattccctttttcatatccttaaccagtgcc 22068480  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44588088 - 44587927
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  44588088 gggtcctgctaaccggtacccccggggcacttgttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttttactttattataaattaa 44587989  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44587988 ttacacaatttcaatgtattaactactatataatttccttttttatatccttaaccggtgcc 44587927  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22567794 - 22567629
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattaca 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |    
T  22567794 ttttaagggtcctgctaaccggtgcccctggagcacgggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaaattatttttgactttattata 22567695  T
Q  149 aattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22567694 aattaattacacaatttcaatacattaactactatataatttcttttttcatatccttaaccagtg 22567629  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Original strand, 561512 - 561679
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattaca 148  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  561512 ttttaagagtcctgctaaccggtgcctccggggtactgattaagcataccataaaagagaattattattataaaaggaaactgattttgactttattata 561611  T
Q  149 aattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  561612 aattaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 561679  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Original strand, 27856394 - 27856557
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatt 152  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  27856394 aagggtcctgctaaccgatgcccccggggcactggttaagcataccataaaaggaaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaatt 27856493  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  27856494 aattacacaatttcaatgcattaactattatataatttcctttttcatactcttaaccagtgcc 27856557  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 53 - 214
Target Start/End: Original strand, 3668110 - 3668272
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaat 151  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  3668110 taagggtcttgctaaccggtgccctcggggcactggttaaacatactataaaaggaaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaat 3668209  T
Q  152 taattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  3668210 taattacacaatttcaatgcattaactactatataatttccttttccatacccttaaccagtg 3668272  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22887936 - 22887775
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  22887936 gggtcatgctaatcggtgcccccggagcactggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaaactgtttttaactttattataaattaa 22887837  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  22887836 ttacataatttcaatgcattaactactatataatttcttttttcatatccttaaccactgcc 22887775  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 209
Target Start/End: Original strand, 26387058 - 26387218
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattaca 148  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |    
T  26387058 tttttagggtcctgttaaccggtgcccccaaggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaagaaaattgtttttgactttattata 26387157  T
Q  149 aattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaac 209  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26387158 aattaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaac 26387218  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6580358 - 6580214
Alignment:
Q  73 gccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaattacacaattccaatac 171  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||| |    
T  6580358 gcccccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaattacataatttcaatgc 6580259  T
Q  172 attaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6580258 attaactactatatagtttcctttttcatacccttaaccagtgcc 6580214  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Original strand, 34442531 - 34442686
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatt 152  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  34442531 aagggtcctgctaaccgatgcccccggg-cactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattataaatt 34442629  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaac 209  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  34442630 aattacacaatttcaatgcattaactactatataatcttctttttcatatccttaac 34442686  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Original strand, 8969405 - 8969568
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatt 152  Q
    |||||| ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8969405 aagggtactgctaaccggtgccccaggggcactagttaagcatactataaaaggaaattattaccataaaaggaaactgcttttgactttattataaatt 8969504  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  8969505 aattacactatttcaatgcattaactactatataattttctttttcatatccttaactagtgcc 8969568  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 32360869 - 32361030
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  32360869 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcattggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaa 32360968  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||| |  ||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  32360969 ttatattatttcaatgcattaactattatataattttctttttcacatccttaaccagtgcc 32361030  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 78 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32860265 - 32860127
Alignment:
Q  78 cggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaa 176  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32860265 cgggacactggttaagcataccataaaagagaattattac-ataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaa 32860167  T
Q  177 ctactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32860166 atactatataatttccttttttatatccttaacccgtgcc 32860127  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 216
Target Start/End: Original strand, 38590893 - 38591035
Alignment:
Q  75 cctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacat 173  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  38590893 cctcggggtattggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattatcaattaattacacaattttaatacat 38590992  T
Q  174 taactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  38590993 taactactgtataatttcctttttcatattcttaaccagtgcc 38591035  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1859324 - 1859192
Alignment:
Q  80 gggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaact 178  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  1859324 gggcactggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaattacataatttcaatgcattaact 1859225  T
Q  179 actatataatttccttttttatatccttaacca 211  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  1859224 actatacaatttctttttttatatccttaacca 1859192  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 215
Target Start/End: Original strand, 5093538 - 5093699
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatt 152  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  5093538 aagggtcctgttaaccggtgccc-cggggcactagttaaacataccataaaaggaaattattatcataaaaggaaattgcttttgactttattataaatt 5093636  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5093637 aattacacaattttaatgcattaactactatttaatttcctttttcatatccttaactagtgc 5093699  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 57 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2898256 - 2898098
Alignment:
Q  57 ggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaat 155  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  2898256 ggtcctgctaaccggtgcctccgggacactgattaaacataccataaaagagaattattatgatagaagaaaactgtttttgactttattataaattaat 2898157  T
Q  156 tacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2898156 tacacaatttcaatgcattaactactatataattttctttttcatatccttaaccagtg 2898098  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 213
Target Start/End: Original strand, 13574053 - 13574187
Alignment:
Q  80 gggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaact 178  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13574053 gggcacgggttaagcataccataaaaggaaattattaccataaaaagaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatacattaatt 13574152  T
Q  179 actatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
      |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13574153 tttatatattttcctttttcatatccttaaccagt 13574187  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Original strand, 4022480 - 4022636
Alignment:
Q  57 ggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttt-tgactttattacaaattaat 155  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4022480 ggtcctgctaaccggtgcccccgggacactggttaaacatatcataaaaggaaattattatcataaaaggaaactgtttctgactttattataaattaat 4022579  T
Q  156 tacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  4022580 tacagaatttcaatacattaactactat-taatttcttttttcatattcttaatcagt 4022636  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43637343 - 43637191
Alignment:
Q  62 tgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacac 160  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  43637343 tgctaaccggtgccc-cggagcacgggttaaacatactgtaaaaggaaattattaccataaaaagaaattgtttttgactttattataaattaattacac 43637245  T
Q  161 aattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  43637244 aatttcaatgcattaactactatataatttccttattcatatccttaaccagtg 43637191  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28601154 - 28600992
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatt 152  Q
    |||||||||||||| |||||| | | | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||    
T  28601154 aagggtcctgctaaccggtgctcccagtgcactggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaagaaactgtttttaactttattatcaatt 28601055  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  28601054 aattatacaatttcaatgca-taactactttataattccctttttcatatccttaaccagtgcc 28600992  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 216
Target Start/End: Original strand, 35851749 - 35851912
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcgg-ggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatt 152  Q
    ||||||||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  35851749 agggtcctgctaaccggtgccccccgaggcattggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaatgaaactgtttttgactttattatcaatt 35851848  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  35851849 aattacattatttcaatgcattaactattatataatttcctttttcacatccttaaccggtgcc 35851912  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 80 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27584900 - 27584769
Alignment:
Q  80 gggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaact 178  Q
    |||||||||||||| ||||| | || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  27584900 gggcactggttaagtataccatgaatgagaattattaccataaaaggaaactgcttttgattttattataaattaattacacaatttcaatgctttaact 27584801  T
Q  179 actatataatttccttttttatatccttaacc 210  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27584800 actatataatttcccttttcatatccttaacc 27584769  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 214
Target Start/End: Original strand, 26891722 - 26891822
Alignment:
Q  115 taccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26891722 taccataaaaggaaactatttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactaatatataatttccttttttatatccttaatcagt 26891821  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  26891822 g 26891822  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 215
Target Start/End: Original strand, 11021259 - 11021382
Alignment:
Q  93 gcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttc 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  11021259 gcataccataaaagggaattattaccacaaaagaaaactgtttttgactttattatatattaattacacaatttcaatgcattaactaccatataatttc 11021358  T
Q  192 cttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||    
T  11021359 ttttttcatatctttaatcagtgc 11021382  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Original strand, 25782855 - 25782989
Alignment:
Q  78 cggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaa 176  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||     
T  25782855 cgggacactggttaagcataccataaaagggaattattatcataaaagaaaattgtttttgactttattataaaataattacacaatttcaatgcatta- 25782953  T
Q  177 ctactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
      ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  25782954 --actatataatttcctttttcatattcttaactagtg 25782989  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38296310 - 38296202
Alignment:
Q  109 aattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatcctta 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  38296310 aattattaccataaaaagaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgtattaattactatataattttctttttcatatcttta 38296211  T
Q  208 accagtgcc 216  Q
    |||||||||    
T  38296210 accagtgcc 38296202  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5881374 - 5881243
Alignment:
Q  89 ttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacat----taactactat 183  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||    ||||||||||    
T  5881374 ttaagcataccataaaagataattattatcataaaaggaaactctttttgactttattatcaattaattacacaatttcaatgcatgcattaactactat 5881275  T
Q  184 ataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5881274 ataatttcctttttcatatccttaacctgtgc 5881243  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 197
Target Start/End: Original strand, 15079012 - 15079100
Alignment:
Q  109 aattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttt 197  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15079012 aattattatcataaaaggaaattgtttttgacttt-ttataaattaattacacaatttcaatacattaactactatataatttccttttt 15079100  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39531981 - 39531868
Alignment:
Q  83 cactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactact 181  Q
    ||||||||||||||| |  |||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  39531981 cactggttaagcatatcgaaaaagaaaat-attaccataaaagaaaactggttttgactct-ttataaattaattacacaatttcaatgcattaactact 39531884  T
Q  182 atataatttccttttt 197  Q
    ||||||||||||||||    
T  39531883 atataatttccttttt 39531868  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25772269 - 25772137
Alignment:
Q  84 actggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaacta-ct 181  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||| ||  |    
T  25772269 actgattaagtataccataaaagggaattattatcataaagggaaattatttttgactttattataaattaattacacaatttcattgcattaattattt 25772170  T
Q  182 atataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  25772169 ttataatttcctttttcatattcttaactagtg 25772137  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 211
Target Start/End: Original strand, 29102313 - 29102439
Alignment:
Q  86 tggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactata 184  Q
    ||||||| |||| | ||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||| ||||  ||||||  |||||    
T  29102313 tggttaaacatatcataaaagataattattactataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaattataaaatttcaatgtattaaccgctata 29102412  T
Q  185 taatttccttttttatatccttaacca 211  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  29102413 taattttctttttgatattcttaacca 29102439  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 197
Target Start/End: Original strand, 34123078 - 34123166
Alignment:
Q  109 aattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttt 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  34123078 aattatgaccataaaaggaaactgtttttgacttt-ttataaattaattacacaaattcaaagcattaactattatataatttctttttt 34123166  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20431602 - 20431464
Alignment:
Q  78 cggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacaca-attccaatacattaa 176  Q
    |||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| ||||||||  |||  |||||||||| ||    ||||||||||||  || |||| || |||    
T  20431602 cggggcactggttaagtatgccaaaaaaggaaattattatcataaaagataacacttttgactttttttagtattaattacacagttttcaatgcaataa 20431503  T
Q  177 ctactatataatttcctttttt-atatccttaaccagtg 214  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  20431502 ctacaatataatttccttttttgacatccttaactagtg 20431464  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10820615 - 10820528
Alignment:
Q  109 aattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| |||||||||| |||||  ||||  |||||||| | ||||||||| |||||    
T  10820615 aattattaccataaaaggaaactgtttttaactttttataaattaatta-acaatctcaatgtattaactattttataatttctttttt 10820528  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 15146789 - 15146683
Alignment:
Q  84 actggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaact-gttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactacta 182  Q
    ||||||||| ||||||  ||| |  |||||||| |||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||  |||||||| ||    
T  15146789 actggttaaacataccaaaaaggaaaattattatcataaaaggaaattatttttgacttt-ttataaattaattatacaatttcaatgtattaactatta 15146691  T
Q  183 tataattt 190  Q
    ||||||||    
T  15146690 tataattt 15146683  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 45262102 - 45262024
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaa 128  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||||    
T  45262102 ttttatgggtcatgctaaccggtgcccccgggacaaaggttaagcatacaaaaaaaagaaattattaccataaaaggaa 45262024  T

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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Original strand, 30217662 - 30217719
Alignment:
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttcctttttta-tatccttaacc 210  Q
    ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30217662 attacacaatttcaatgcaataaatactatataattttcttttttagtatccttaacc 30217719  T

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Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 124
Target Start/End: Original strand, 31782565 - 31782633
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaa 124  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||    
T  31782565 gggtcatgctaaccggtgcccccgaggcacgggttaagcatacaaaaaaaggaaatttttaccataaaa 31782633  T

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Target: chr5 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 216
Target Start/End: Original strand, 34650832 - 34650994
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatta 153  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  34650832 agggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaatta 34650931  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34650932 attacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatacccttaaccagtgcc 34650994  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13661995 - 13661834
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttt-tgactttattacaaatta 153  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  13661995 agggtcctgctaaccggtgcctccggggcacgggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaaactgtttctgactttattatcaatta 13661896  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13661895 attacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 13661834  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Original strand, 11957964 - 11958128
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaat 151  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  11957964 taagggtcctgctaaccggtgcccctggggcactggttaagcatgccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaat 11958063  T
Q  152 taattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11958064 taattacacaatttcattgcattaactactatataatttccttttttatatctttaacctgtgcc 11958128  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35132709 - 35132549
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatt 152  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||    
T  35132709 aagggtcctgctaaccggtgcccccggggcattggttaagcataccataaaagagaattattaccataaa-gaaaactgtttttgactttattataaatt 35132611  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35132610 aattacacaatttcaatgtattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 35132549  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 10054353 - 10054513
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaat 155  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10054353 gggtcctgctaaccggtacccccggggcacgggttaaacataccataaaaaggaattattaccataaaaggaaactgttttgacattattataaattaat 10054452  T
Q  156 tacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10054453 tacacaatttcaatgcattaattattatataatttcctttttcatacccttaaccagtgcc 10054513  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11846264 - 11846106
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattaca 148  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  11846264 tttttagggtcctgctaacccatgccctaggggcactggttaagcatactataaaagggatttattaccataaaaggaaactacttttgactttattata 11846165  T
Q  149 aattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatcctta 207  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11846164 aattaattacacaatttcaatgtattaactactatataatttccttttttatatcctta 11846106  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8787527 - 8787364
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatt 152  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||    
T  8787527 aagggtcctgctaaccggtgcccccggggcacaggttaagcataccataaaatggaattattatcataaaaggaaactgtttttgatattattataaatt 8787428  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||    
T  8787427 aattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcatttttcatacccttaaccaatgcc 8787364  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 53 - 214
Target Start/End: Original strand, 35504238 - 35504399
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaat 151  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||    
T  35504238 taagggtcctgctaaccggtgcccccgga-cacgggttaagcataccataaaagggaattattgccataaaagggaactgtttttgacattattataaat 35504336  T
Q  152 taattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  35504337 taattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatacccttaaccagtg 35504399  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 21547394 - 21547549
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21547394 gggtcctgctaaccggtgtctccggggtactggttaagcataccataaatgagaattattaacttaaaatgaaactgtttttgactttattataaattaa 21547493  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacc 210  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21547494 ttacacaatttcaatgcattaactactatataatttccttttttatatccttaacc 21547549  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 208
Target Start/End: Original strand, 40564402 - 40564557
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatt 152  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||| |||||    
T  40564402 aagggtcctgctaaccggtgcccttggggtattggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaaaaaattgtttttgactttattataaatt 40564501  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaa 208  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  40564502 aattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcaaatccttaa 40564557  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12506459 - 12506322
Alignment:
Q  79 ggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaac 177  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  12506459 ggggcactggttaagcattccataaaagagaattattactataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaattacacaatttcaatgcattaac 12506360  T
Q  178 tactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  12506359 tactatataatttcctttttcatactcttaacgagtgc 12506322  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6283742 - 6283587
Alignment:
Q  62 tgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacac 160  Q
    |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6283742 tgctaaccggtgcccctagggcactggttaagcataccataaaaatgaattattaccataaaagaaaattgtttttgactttattataaattaattacac 6283643  T
Q  161 aattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||| |||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  6283642 aatttcaatgcattaattattatataattttctttttcatatctttaactagtgcc 6283587  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 213
Target Start/End: Original strand, 9721640 - 9721765
Alignment:
Q  89 ttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataa 187  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  9721640 ttaaacataccataaaagggaattattatcataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaattaaacaatttcaatgcattaattactatataa 9721739  T
Q  188 tttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||    
T  9721740 tttcctttttcatattcttaaccagt 9721765  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20175387 - 20175254
Alignment:
Q  82 gcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactac 180  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20175387 gcactagttaagcatattataaaagggaattattatcataaaagaaaattgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac 20175288  T
Q  181 tatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  20175287 tatataatttctttttttatatttttaaccagtg 20175254  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13470283 - 13470176
Alignment:
Q  110 attattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13470283 attattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattatacaatttcaatgcattgactactatattatttcctttttcatatccttaa 13470184  T
Q  209 ccagtgcc 216  Q
    ||||||||    
T  13470183 ccagtgcc 13470176  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Original strand, 19647717 - 19647819
Alignment:
Q  115 taccataaaaggaaactgttt-tgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19647717 taccataaaaggaaactgtttatgactttattatcaattaattatacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagt 19647816  T
Q  214 gcc 216  Q
    |||    
T  19647817 gcc 19647819  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10956141 - 10955976
Alignment:
Q  52 ttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaa 150  Q
    ||||||||| |||||| |||| |  |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||    
T  10956141 ttaagggtcttgctaaccggtacattcggggtactggttaagcatatcataaaaggaaattattaccataaaaggaaattgtttttgactttgttataaa 10956042  T
Q  151 ttaattacacaattccaatacattaactactatataatttcctttt-ttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||    
T  10956041 ttaatta-acaatttcaatgcattaactactttataattcccttttatggtatgcttaaccagtgcc 10955976  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 40057499 - 40057340
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcgggg-cactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattac 147  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||| || | | |||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||     
T  40057499 ttttatgggtcctgctaaccggtgcc-tcgaggtcactggttaaacacatcataaaagggaaatattactataaaagaaaactgcttttgattttattat 40057401  T
Q  148 aaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaa 208  Q
    |||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40057400 aaattaattatactatttcaatgcactaactactatataatttcctttttcatatccttaa 40057340  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10070095 - 10069994
Alignment:
Q  115 taccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10070095 taccataaaaagaaactgtttttgactttattatca-ttaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagt 10069997  T
Q  214 gcc 216  Q
    |||    
T  10069996 gcc 10069994  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31909784 - 31909659
Alignment:
Q  84 actggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactacta 182  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||     |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  31909784 actggttaagcataccataaaagaaaattattatca-----ggaaactgtttttgactttattataaatcaattacacaatttcaatgcattaactacta 31909690  T
Q  183 tataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31909689 tataatttcccttttaatatccttaaccagt 31909659  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 214
Target Start/End: Original strand, 39066980 - 39067095
Alignment:
Q  101 taaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaact-actatataatttcctttttt 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||     
T  39066980 taaaagagaattattaccataaaaggatattgtttttgactttattataaattaattacataatttcaatatattaactaattatataatttcttttttc 39067079  T
Q  199 atatccttaaccagtg 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  39067080 atatccttaaccagtg 39067095  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4837364 - 4837282
Alignment:
Q  134 tttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  4837364 tttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaattactatataatttcctttttcatattcttaaccggtgcc 4837282  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Original strand, 2619635 - 2619716
Alignment:
Q  133 ttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  2619635 ttttaactttattataaattaattacacaatttcaatacattaactactaaataattttctttttcatatccttaacaagtg 2619716  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4268749 - 4268620
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaatta 153  Q
    ||||||| | |||| |||||||| | || ||| |||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||    
T  4268749 aagggtcatactaaccggtgccccctggacacgggttaagcataccaaaaaagaaaattattaccataaaaggaaactgttttttattttttataaatta 4268650  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactat 183  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  4268649 attacacaattttaatgcattaactactat 4268620  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Original strand, 19436865 - 19436995
Alignment:
Q  83 cactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttga-ctttattacaaattaattacacaattccaatacattaactact 181  Q
    ||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||| | |||||||||| |||||| |||| | ||||| |||    
T  19436865 cactggtgaaacataccataaaagagaattattaccataaaaa-aaactatttttaactttat-ataaattaattatacaatttcaatgctttaaccact 19436962  T
Q  182 atataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19436963 atataatttcctttttcatatccttaacgagtg 19436995  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6284888 - 6284822
Alignment:
Q  148 aaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6284888 aaattaattatacaatttcaatacattaattactatataatttcctttttagtatccttaaccagtg 6284822  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39069519 - 39069406
Alignment:
Q  101 taaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttat 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |   ||||  |  |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  39069519 taaaagagaattattaccataaaaggaaattgttttt-cacaattattatataattacacaattttaatgcattaactactatataatttcc-ttttcat 39069422  T
Q  201 atccttaaccagtgcc 216  Q
    | ||||||||||||||    
T  39069421 acccttaaccagtgcc 39069406  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31467906 - 31467744
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaat 155  Q
    ||||| |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||  | | |||||||  ||| | ||||||    
T  31467906 gggtcttgctaaccggtgtccctggggcactggttaagcatacaaaaaaaggaaattcttaccataaaaggaagttttgttgacttatttatagattaat 31467807  T
Q  156 tacacaa-ttccaatacattaactactatataatttcctttttta-tatccttaaccagtgcc 216  Q
    || |||| || |||| || ||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  31467806 taaacaattttcaatgcaataattaacatataatttccctttttattatccttaaccggtgcc 31467744  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 213
Target Start/End: Original strand, 30889436 - 30889589
Alignment:
Q  62 tgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacaca 161  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||   |||||| |||| ||| |||||||||||  | | |||||||  ||| | |||||||| | |    
T  30889436 tgctaatcggtgcctccggggtactggttaagcatacaaaaaaaggaaatttttatcataaaaggaagttttgttgacttatttatagattaattaaata 30889535  T
Q  162 a-ttccaatacattaactactatataatttcctttttta-tatccttaaccagt 213  Q
    | || |||| || ||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30889536 attttcaattcaataattaacatataatttccctttttattatccttaaccagt 30889589  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 114
Target Start/End: Original strand, 10955973 - 10956009
Alignment:
Q  78 cggggcactggttaagcataccctaaaagggaattat 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10955973 cggggcactggttaagcataccataaaagggaattat 10956009  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 216
Target Start/End: Original strand, 14214055 - 14214211
Alignment:
Q  62 tgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacaca 161  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||  | | |||||||  |||   |||||||| |||    
T  14214055 tgctaaccggtgcccccgggacaccggttaagcatacaaaaaaaggaaattcttaccataaaaggaagttttgttgacttatttatggattaattaaaca 14214154  T
Q  162 a-ttccaatacattaactactatataatttcctttttta-tatccttaaccagtgcc 216  Q
    | || |||| || ||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  14214155 attttcaatgcaataattaacatataatttccctttttattatccttaacctgtgcc 14214211  T

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Target: chr8 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 54)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34228868 - 34228707
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  34228868 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaa 34228769  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34228768 ttacacaatttcaatgcattaattactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 34228707  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 216
Target Start/End: Original strand, 27988499 - 27988660
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatta 153  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27988499 agggtcctgctaaccggtgcccccggg-cactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaatta 27988597  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27988598 attacacaatttcaatgcattaactattatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 27988660  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 216
Target Start/End: Original strand, 28045801 - 28045962
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatta 153  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28045801 agggtcctgctaaccggtgcccccggg-cactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaatta 28045899  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28045900 attacacaatttcaatgcattaactattatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 28045962  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 168653 - 168491
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatta 153  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  168653 agggtcctgctaaccggtgcccccggggcattggttaagcataccataaaatggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaatta 168554  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  168553 attacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatacccttaaccagtgcc 168491  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 51 - 216
Target Start/End: Original strand, 4537739 - 4537905
Alignment:
Q  51 tttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaa 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  4537739 tttaagggtcctgctaaccggtgcctctggggcacaggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatca 4537838  T
Q  150 attaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4537839 attaattacataatttcaatgcattaactactatataatttcctattttatatccttaaccagtgcc 4537905  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 16888544 - 16888705
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16888544 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcattggttaagcataccacaaaagagaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaa 16888643  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16888644 ttacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaacctgtgcc 16888705  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 214
Target Start/End: Original strand, 2805259 - 2805419
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatta 153  Q
    ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  2805259 agggtccggctaaccggtgcctccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgcttttgactttattataggtta 2805358  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2805359 attacacaatttcaatgcattaactattatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 2805419  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 57 - 216
Target Start/End: Original strand, 30675574 - 30675733
Alignment:
Q  57 ggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaat 155  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  30675574 ggtcctgctaaccggtgtccccggggcactggttaagcataccataaaagg-aattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaat 30675672  T
Q  156 tacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30675673 tacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatacccttaaccagtgcc 30675733  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Original strand, 29444138 - 29444301
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatt 152  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  29444138 aagggtcctgttaatcggtgcctccgggacactggttaaacataccataaaagggaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattataaatt 29444237  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  29444238 aattacacaatttcaatgcgttaactactatataatttcctttttcatatccttaatcagtgcc 29444301  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 78 - 215
Target Start/End: Original strand, 33357151 - 33357289
Alignment:
Q  78 cggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaa 176  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33357151 cggggcactagttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaa 33357250  T
Q  177 ctactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33357251 ctactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 33357289  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 56 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11112825 - 11112666
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| | |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11112825 gggtcctgctaaccagtgcccccagggcacaggttaagcataccataaaagtgaattattatcataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaa 11112726  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11112725 ttacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 11112666  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13643200 - 13643037
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaatt 152  Q
    ||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  13643200 taagggtcctgctaaccggtgctcctagggcactggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaattttttttgactttattataaatt 13643101  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13643100 aattacataatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcgtatccttaaccagtgcc 13643037  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13743625 - 13743462
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaatt 152  Q
    ||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  13743625 taagggtcctgctaaccggtgctcctagggcactggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaattttttttgactttattataaatt 13743526  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13743525 aattacataatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcgtatccttaaccagtgcc 13743462  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 215
Target Start/End: Original strand, 42034979 - 42035141
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatt 152  Q
    |||||||| ||||| ||||| |   |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||    
T  42034979 aagggtcccgctaaccggtgtctctggggcacgtgttaagcataccataaaagggaattattaccataaaagaaaattgtttttgactttattataaatt 42035078  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42035079 aattacacaatttcaatacattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 42035141  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 58 - 209
Target Start/End: Original strand, 16890482 - 16890634
Alignment:
Q  58 gtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaatt 156  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  16890482 gtcctgctaaccggtgccccggaggcaccggttaagcataccataaaaaggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaatt 16890581  T
Q  157 acacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaac 209  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16890582 acacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaac 16890634  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 56 - 214
Target Start/End: Original strand, 20831553 - 20831712
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| ||||| ||  || |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20831553 gggtcctgctaaccggtgtcccgggagcactgattaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaaactgcttttgactttattataaattaa 20831652  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20831653 ttatactatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 20831712  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 208
Target Start/End: Original strand, 7304518 - 7304671
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7304518 gggtcctactaaccggtgcccccggagcactggttaagcataccataaaagagaattattttcataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaa 7304617  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaa 208  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  7304618 ttacacaatttcaatgcattaactactatataattttctttttcatatccttaa 7304671  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Original strand, 9063051 - 9063212
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatta 153  Q
    ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  9063051 agggtcctgctaaccggtgcttccggggcactggttaagcatatcacaaaagggaattattaccataaaagaaaattgtttttgactttattataaatta 9063150  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9063151 attgcacgatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 9063212  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36730608 - 36730471
Alignment:
Q  78 cggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaa 176  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  36730608 cggggcacaggttaagcatactataaaagagaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaa 36730509  T
Q  177 ctactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36730508 ctactatataatttcctttttcatatccttaactagtg 36730471  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 78 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21596010 - 21595871
Alignment:
Q  78 cggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaa 176  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21596010 cgggacactggttaagcataccataaaagggaattaataccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaattacacaatttcaatgcattaa 21595911  T
Q  177 ctactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21595910 ctcctatataatttcctttttcatacccttaaccagtgcc 21595871  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 16394061 - 16394222
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  16394061 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcattggttaagcataccataaaagagaattattagcataaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaa 16394160  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||  ||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  16394161 ttacattatttcaatgcattaactattatataattttctttttcacatccttaaccagtgcc 16394222  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 56 - 213
Target Start/End: Original strand, 9537824 - 9537982
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  9537824 gggtcctgctaaccggtgtctccgggacactggttaagcataccataaaaggaaattattactataaaaagaaactccttttgaatttattataaattaa 9537923  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9537924 ttacacaattttaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagt 9537982  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28626927 - 28626793
Alignment:
Q  83 cactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactact 181  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28626927 cactgattaagcataccataaaagggaattattatcataaaaagaaactgtttttgactttattataaattaatcacacaatttcaatacattaactact 28626828  T
Q  182 atataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  28626827 atataatttcctttttcacatccttaaccggtgcc 28626793  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37373382 - 37373232
Alignment:
Q  65 taatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaat 163  Q
    ||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  37373382 taatcggtgtctccgggacacgggttaagcataccatgaaagggaattattaccataaaagaaaactgttttcgactttattatcaattaattacacaat 37373283  T
Q  164 tccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37373282 ttcaatgcattaactattatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 37373232  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16785248 - 16785111
Alignment:
Q  80 gggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaact 178  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16785248 gggcacgggttaatcataccataaaagagaattattattataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatacattaact 16785149  T
Q  179 actatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16785148 gctatataatttcttttttcatatccttaaccagtgcc 16785111  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43119402 - 43119242
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  43119402 gggtcctgctaaccggtgccc-cgggccattggttaagcataccataaaagagaattatcaccataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaa 43119304  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||    
T  43119303 ttatacaatttcaatgcattaactactatataattttctttttcatatctttaatcagtgcc 43119242  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4648352 - 4648219
Alignment:
Q  84 actggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactacta 182  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4648352 actggttaagcatatcataaaagggaattattaccatcaaaagaaactgtttttgacattattataaattaattacacaatttcaatgtattaactacta 4648253  T
Q  183 tataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4648252 tataatttcctttttcatatccttaatcagtgcc 4648219  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12204018 - 12203885
Alignment:
Q  78 cggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaa 176  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12204018 cgggacactggttcagcataccataaaagggaattattatcataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaattacacaatttcaatgcattaa 12203919  T
Q  177 ctactatataatttccttttttatatccttaacc 210  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  12203918 ctactatataatttcttttttcatacccttaacc 12203885  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12448446 - 12448313
Alignment:
Q  78 cggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaa 176  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12448446 cgggacactggttcagcataccataaaagggaattattatcataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaattacacaatttcaatgcattaa 12448347  T
Q  177 ctactatataatttccttttttatatccttaacc 210  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  12448346 ctactatataatttcttttttcatacccttaacc 12448313  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 216
Target Start/End: Original strand, 9253907 - 9254062
Alignment:
Q  61 ctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattaca 159  Q
    ||||||| ||||||||  ||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||    
T  9253907 ctgctaaccggtgcccctgggacattggttaagcataccataaaagagaattattactataaaaggaaactgtttttgactttattatca-ttaattaca 9254005  T
Q  160 caattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9254006 caatttcaatgcattaactactataaaatttcatttttcatatccttaaccagtgcc 9254062  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32114098 - 32113938
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaagg-aaactgttttg-actttattacaaa 150  Q
    ||||||||||||||| ||||| |   || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||    
T  32114098 taagggtcctgctaaccggtggctctggagcactggttaaacatactataaaagggaattattatcataaaagggaaactgttttttactttattataaa 32113999  T
Q  151 ttaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacca 211  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32113998 ttaattaaacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaacca 32113938  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Original strand, 3930231 - 3930394
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatt 152  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  3930231 aagggtcctgctaatcgatgctcctggggcactggttaagcatatcataaaaggaaattattatcaaaaaaggaaactgtttttgactttattatcaatt 3930330  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||    
T  3930331 aattacacaacttcaatgcattaactactatataatttcctctttcatattattaactagtgcc 3930394  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10870493 - 10870382
Alignment:
Q  101 taaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttcctttttta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10870493 taaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgattttattataaattaattacacaatttcaatgtattaactattatataattttctttttta 10870394  T
Q  200 tatccttaacca 211  Q
    |||| |||||||    
T  10870393 tatcattaacca 10870382  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40831470 - 40831302
Alignment:
Q  49 cttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattac 147  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |  | ||| || | ||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||     
T  40831470 cttttatgggtcctgctaaccggtgtctccagggtacagattatgcatactataaaagaaaattattaccataaaagaaaattgtttttgactttattat 40831371  T
Q  148 aaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  40831370 aaattaattatacaatttcaatgcattaactactatataattttctttttcatatctttaaccagtgcc 40831302  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29235421 - 29235268
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    ||||| |||||| |||||  | |||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| || ||||||| |||||||    
T  29235421 gggtcatgctaaccggtgttcccgggacactggttaagcatcctataaaaggaaattattatcataaaaggaacctatttttgattttattataaattaa 29235322  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaa 208  Q
    |||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29235321 ttacacaaatttaatgcattaactactatataatttctttttttatatccttaa 29235268  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 39407024 - 39406919
Alignment:
Q  58 gtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaatt 156  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  39407024 gtcctgctaaccggtgccc--ggggcactagttaaacataccataaaagggaattattatcataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaatt 39406927  T
Q  157 acacaatt 164  Q
    ||||||||    
T  39406926 acacaatt 39406919  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 212
Target Start/End: Original strand, 42433590 - 42433700
Alignment:
Q  102 aaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttat 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  42433590 aaaaggaaattattaccataaaagaaaactgtttttgacttt-ttataaattaattacacaatttcaatgcattaactattatataatttcctttttagt 42433688  T
Q  201 atccttaaccag 212  Q
    || |||||||||    
T  42433689 atgcttaaccag 42433700  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22956897 - 22956731
Alignment:
Q  51 tttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaa--gggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattac 147  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||  |||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  22956897 tttaagggtcctgttaaccggtgtcttcggg-cacttattaaacataccataaaaaagggaatttttaccataaaaggaaactgtttttgacattattat 22956799  T
Q  148 aaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||| ||||  |||  ||||||||| |||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  22956798 aaattaattacataattttaatgtattaactaccatatga-ttccttttttatactcttaaccagtgcc 22956731  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 176
Target Start/End: Original strand, 24843307 - 24843400
Alignment:
Q  84 actggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaa 176  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24843307 actgattaagcataccataaaagagaattattgtcataaaaggaaactgattttgactttattataaattaattacacaatttcaatagattaa 24843400  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9278317 - 9278239
Alignment:
Q  136 tgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  9278317 tgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactattatataatttcctttttcatatctttaacgagtg 9278239  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34192883 - 34192809
Alignment:
Q  133 ttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatcctta 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34192883 ttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactagtatataatttcctttttcatattctta 34192809  T

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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10618144 - 10618043
Alignment:
Q  115 taccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||||  ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  10618144 taccataaaaggtaattattctgactttattatcaattaattacacaatttaattgcattaactactatataattttctttttcatatccttaacctgtg 10618045  T
Q  215 cc 216  Q
    ||    
T  10618044 cc 10618043  T

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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22451922 - 22451835
Alignment:
Q  103 aaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataattt 190  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  22451922 aaaggaaattattaccataaaaggaagctatttttgacttt-ttataaattaattacacaatttcaatgcattaactgctatataattt 22451835  T

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Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12652705 - 12652656
Alignment:
Q  166 caatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12652705 caatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 12652656  T

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Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17467725 - 17467630
Alignment:
Q  120 taaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  17467725 taaaaggaaattgtttttgattttattatcaattaattacacaatttcaatgcattaattactgcataatttcctttttcatatcattaactagtg 17467630  T

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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 216
Target Start/End: Original strand, 39751485 - 39751633
Alignment:
Q  70 ggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacacaa-ttccaa 168  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||  | | |||||||  ||| | |||||||| |||| ||  ||    
T  39751485 ggtgcccccgaggcactggttaagcatacaaaaaaaggaaattcttaccataaaaggaagttttgttgacttatttatagattaattaaacaatttttaa 39751584  T
Q  169 tacattaactactatataa-tttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    | || ||| || ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  39751585 tgcaataaataatatataattttcctttttattatccttaaccagtgcc 39751633  T

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Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 29566887 - 29566819
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaa 124  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||| |||| ||| |||||||    
T  29566887 gggtcatgctaatcggtgctctcggggcagtggttaagcatacaaaaaaaggaaattcttatcataaaa 29566819  T

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Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35695611 - 35695571
Alignment:
Q  176 actactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  35695611 actactatataatttcattttttatatccttaatcagtgcc 35695571  T

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Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 124
Target Start/End: Original strand, 2490154 - 2490225
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaa 124  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||    
T  2490154 taagggtcatgctaaccggtgcccccgaggcacgggttaagcatacaaaaaaaggaaatttttaccataaaa 2490225  T

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Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 216
Target Start/End: Original strand, 36923782 - 36923824
Alignment:
Q  174 taactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36923782 taactattatataatttcctttttcatatccttaatcagtgcc 36923824  T

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Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 10618186 - 10618125
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattatt 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10618186 aagggtcctgctaaccggtgccccggagacacgggttaagcataccataaaaggtaattatt 10618125  T

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Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 187
Target Start/End: Original strand, 30933376 - 30933453
Alignment:
Q  110 attattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataa 187  Q
    ||||||| | |||||| ||| |||||| |  || ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  30933376 attattatcgtaaaagaaaaatgtttttaactttttataaattaattacacaatttcaatgcattaattactatataa 30933453  T

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Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Original strand, 43714185 - 43714349
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaatt 152  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||   ||||   |||| |||||||||||||||  | | |||||||  ||| | |||    
T  43714185 taagggtcatgctaaccggtgtcccgggggcactggttaagcatacaaaaaaaataaatttttaccataaaaggaagttttgttgacttatttatagatt 43714284  T
Q  153 aattacacaa-ttccaatacattaactactatataatttcctttttta-tatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||| |||| || |||| || ||| ||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  43714285 aattaaacaattttcaatgcaataattaacatataatttccctttttattatcc-taaccagtgcc 43714349  T

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Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 211
Target Start/End: Original strand, 33124571 - 33124650
Alignment:
Q  133 ttttgactttattacaaattaattacacaattc-caatacattaactactatataatttcctttttta-tatccttaacca 211  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  33124571 ttttgacttt-ttataaattgattacacaattttcaatgcaataactactatataacttcctttttaagtatccttaacca 33124650  T

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Target: scaffold0188 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 51 - 216
Target Start/End: Original strand, 6105 - 6271
Alignment:
Q  51 tttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaa 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  6105 tttaagggtcctgctaaccggtgcccccggggcacgggttaaacataccataaaaggggattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataa 6204  T
Q  150 attaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6205 tttaattacacaattccaatgcattaactactatatagtttcctttttcatatccttaaccagtgcc 6271  T

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Target: chr7 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34333475 - 34333309
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaa 149  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  34333475 ttttaagggtcctgctaaccggtgcccccggggcacgggttaaacataccataaaaaggaattattaccataaaaggaaactgttttgacattattataa 34333376  T
Q  150 attaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34333375 attaattacacaatttcaatgcattaattactatataatttcctttttcatacccttaaccagtgcc 34333309  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 24798403 - 24798564
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24798403 gggtcctgctaactggtgcccccggggcactggttaagcatactataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaa 24798502  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  24798503 ttacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatcctcaacaagtgcc 24798564  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34606448 - 34606286
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatta 153  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34606448 agggtcctgctaaccggtgctcccggggcacgggttaagcataccataaaaggtaattattaccataaaaggaaactgcttttgactttattataaatta 34606349  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34606348 atttcacaatttcaatgcattaattactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 34606286  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24438663 - 24438502
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  24438663 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaa 24438564  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  24438563 ttacataatttcaatgcattaactactatatagtttcctttttcatacccttaactagtgcc 24438502  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 29993487 - 29993648
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  29993487 gggtcctgctaaccgatgcctccgggacactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaattgattttgactttattataaattaa 29993586  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29993587 ttacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccggtgcc 29993648  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18486148 - 18485986
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttga-ctttattacaaatta 153  Q
    |||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  18486148 agggccctgctaaccggtgtcttcggggcacgggttaagcataccataaaatgaaattattaccataaaaggaaactgtttttaactttattataaatta 18486049  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18486048 attacacaatttcaatacattaattactatataatttccttttcaatatccttaaccagtgcc 18485986  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4628752 - 4628591
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttt-tgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4628752 gggtcctgctaaccggtgcccctaaggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaagtaaactgtttctgactttattataaattaa 4628653  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4628652 ttaaacaatttcaatgtattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccggtgcc 4628591  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 211
Target Start/End: Original strand, 13064873 - 13065033
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg--ttttgactttattacaaa 150  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  13064873 taagggttctgctaaccggtgcccctagagcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttttgactttattataaa 13064972  T
Q  151 ttaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacca 211  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13064973 ttaattacacaaattcaatacattaaatattatataatttcctttttcatatccttaacca 13065033  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30810845 - 30810680
Alignment:
Q  52 ttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaa 150  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||  |||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  30810845 ttaagggtcctactaaccggtacccctggggcattggttaaacataccataaaagaaaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattataaa 30810746  T
Q  151 ttaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30810745 ttaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 30810680  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Original strand, 12218433 - 12218597
Alignment:
Q  52 ttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttg-actttattacaaa 150  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| |||    
T  12218433 ttaagggtcctgctaaccggtgtcc-cggggcactggttaaacataccataaaagagaattattaccataaaaggaaactattttttattttattataaa 12218531  T
Q  151 ttaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  12218532 ttaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatacttatccagtgcc 12218597  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Original strand, 23363166 - 23363327
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatta 153  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  23363166 agggtcctgctaatcggtgttttcggggcactggttaaacataccataaaagagaaatattaccataaaaggaaactgtttttaactttattataaatta 23363265  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  23363266 attacacaatttcaatgcattaactactatacaatttcctttttcttatccttaacgagtgc 23363327  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 56 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5239471 - 5239311
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| | ||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  5239471 gggtcctgctaaccagtgccccgggggcacaagttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaagaaactgtttttgacattattataaattaa 5239372  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  5239371 ttacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcataccattaaccagtgc 5239311  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28588065 - 28587936
Alignment:
Q  86 tggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactata 184  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28588065 tggttaaacataccataaaagggaattattaccataaaagaaaattgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatacattgactactata 28587966  T
Q  185 taatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28587965 taatttcctttttcatatccttaaccagtg 28587936  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Original strand, 43594030 - 43594195
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattaca 148  Q
    |||||||||||| | ||||||||||   ||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  43594030 ttttaagggtcccgttaatcggtgcttccgaaacactggttaagcataccataaaagagaattattatcataagaggaaactgtttttgactttattata 43594129  T
Q  149 aattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43594130 aattaattatacaatttcaatgcattaactattatataatttccttttttatatccttaaccagtg 43594195  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 47839656 - 47839520
Alignment:
Q  78 cggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaa 176  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  47839656 cggggcactggttattcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgtattaa 47839557  T
Q  177 ctactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  47839556 ctattatataaattcctttttcatatccttaaccagt 47839520  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Original strand, 42044288 - 42044454
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattaca 148  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |    
T  42044288 tttttagggtcatgctaaccggtgccc-cggggcactggttaaacataccataaaagggaattattaccataaaagaaaactgtttttgacattattata 42044386  T
Q  149 aattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||| |||||    
T  42044387 aattaattacacaatttcaatctattaactactatataatttcttttttcatacctttaaccggtgcc 42044454  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45045934 - 45045799
Alignment:
Q  78 cggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaa 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  45045934 cggggcactggttaagcataccataaaagggaattattatcataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaattacacaatttcaatgcattaa 45045835  T
Q  177 ctactatataatttccttttttatatccttaaccag 212  Q
     |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  45045834 ttactatataatttcatttttcatacccttaaccag 45045799  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 215
Target Start/End: Original strand, 8754607 - 8754745
Alignment:
Q  78 cggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaa 176  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8754607 cggggtactagttaagcataccataaaaggaaattattaccataaaacaaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaa 8754706  T
Q  177 ctactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8754707 ctactatataatttcatttttcatatccttaaccagtgc 8754745  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Original strand, 7689219 - 7689359
Alignment:
Q  75 cctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacat 173  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  7689219 cctcagggcactggttaagtataccataaaagagaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcat 7689318  T
Q  174 taactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7689319 taattactgtaaaatttccttttttatatccttaatcagtg 7689359  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Original strand, 11686324 - 11686482
Alignment:
Q  57 ggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaa--ctgtttt-gactttattacaaatta 153  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||| || ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  11686324 ggtcctgctaaccggtgcc-tccgggtacaggttaagcatatcataaaagagaattattaccataaaaaaaaaaactgtttttgactttattataaatta 11686422  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11686423 attacacaatttcaatgcattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 11686482  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 47083241 - 47083086
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttga-ctttattacaaatta 153  Q
    ||||| || |||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||    
T  47083241 agggttctactaaccggtgccc-cggagcattggttaaacatatcataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttaactttattatcaatta 47083143  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacc 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  47083142 attacacaatttcaatacattaactactatataatttcttttttcatatccttaacc 47083086  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 81 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47657139 - 47657005
Alignment:
Q  81 ggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaacta 179  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  47657139 ggcactgattaagcataccataaaagggaattattaccataaaa--aaactgcttttaactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaatta 47657042  T
Q  180 ctatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  47657041 ctatataattttctttttcatatccttaaccagtgcc 47657005  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18117305 - 18117175
Alignment:
Q  80 gggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaact 178  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18117305 gggcactggttaagcataccataaaatgaaattattactataaaaaaaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatacattaact 18117206  T
Q  179 actatataatttccttttttatatccttaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  18117205 actatataatttcctctttcatatacttaac 18117175  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5729531 - 5729372
Alignment:
Q  57 ggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaat 155  Q
    ||||||||||| | |||||  || |||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||  |||||||    
T  5729531 ggtcctgctaacctgtgcctccgaggcactggttaagcatgccataaaagagaattattactataaaagaaaattatttttgactttattatcaattaat 5729432  T
Q  156 tacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5729431 tacattatttcaatacattaactattatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 5729372  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 214
Target Start/End: Original strand, 525076 - 525234
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  525076 gggtcctgctaaccggtgctc-cggagtactggttaaacatatcataaaagagaattattaccataaaaggaaactgtttttgattttattataaattaa 525174  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||| |||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  525175 ttatacaatttcaatgcattaactactgtatacttttctttttcatatctttaaccagtg 525234  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 46716825 - 46716668
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatta 153  Q
    ||||||||||||| |||   | |||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||    
T  46716825 agggtcctgctaaccgggatcttcggagcaccggttaaacataccataaaagggaattattatcataaaaggaaaatatttttgactttattataaatta 46716726  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacca 211  Q
    |||||| |||| || | |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46716725 attacataatttcagtgcattaagtattatataatttccttttttatatctttaacca 46716668  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1737160 - 1737005
Alignment:
Q  61 ctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttga-ctttattacaaattaattaca 159  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||| | ||||||||  |||||||||||    
T  1737160 ctgctaaccggtgcttccggggcactggttaagcataccataaaatg-aattattatcataaatggaaaatgtttttaactttattatcaattaattaca 1737062  T
Q  160 caattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    | ||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1737061 ctatttcaatgcattaactattatataatttcatttttcatatccttaaccagtgcc 1737005  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 118 - 216
Target Start/End: Original strand, 27456175 - 27456274
Alignment:
Q  118 cataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  27456175 cataaaaggaaactgcttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttctttttccatatccttaaccagtgcc 27456274  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 210
Target Start/End: Original strand, 34546373 - 34546469
Alignment:
Q  115 taccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacc 210  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34546373 taccataaaagtaaactgtttttgactttactataaattaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaacc 34546469  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 191
Target Start/End: Original strand, 37674100 - 37674240
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattaca 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||||||| |||||   || |  || |||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  37674100 ttttaagggtcctgctaaccggtgcccc--ggacactggttaagcataccataaaaaaaaaattatatcataaaagaaaactgtttttgactttattata 37674197  T
Q  149 aattaattacacaattccaatacattaactactatataatttc 191  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  37674198 aattaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttc 37674240  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28262188 - 28262062
Alignment:
Q  80 gggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaact 178  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| |||| |||     |||||    
T  28262188 gggcattggttaagcataccataaaaaagaattattactataaaaggaaactgtttttgattttattatcaattaattacataatttcaa-----taact 28262094  T
Q  179 actatataatttccttttttatatccttaacc 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28262093 actatataatttcctttttcatatccttaacc 28262062  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33636613 - 33636479
Alignment:
Q  81 ggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttg-actttattacaaattaattacacaattccaatacattaacta 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||    
T  33636613 ggcactggttaagcataccataaaatagaattattaccataaaaataaactattttttactttattataaattaattacacaatttcaatgaattaatta 33636514  T
Q  180 ctatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
     |||||||||| |||||| |||| |||||| ||||    
T  33636513 ttatataattttctttttcatattcttaactagtg 33636479  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 211
Target Start/End: Original strand, 29835735 - 29835860
Alignment:
Q  88 gttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaa-ctgttttga-ctttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatat 185  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  29835735 gttaagcataccataaaatagaattattaccataaaaaaaaaactgtttttaactttattacaaattaattacgcaattttaatacattaactagtatat 29835834  T
Q  186 aatttccttttttatatccttaacca 211  Q
    || ||||||||| ||||| |||||||    
T  29835835 aacttcctttttcatatctttaacca 29835860  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Original strand, 23357711 - 23357861
Alignment:
Q  57 ggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaat 155  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  23357711 ggtcttgctaatcggtgtctccggggcactggttaagcatatcatagaagagaattattatcataaatggaaactgtttttgacttttttataaattaat 23357810  T
Q  156 tacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaac 209  Q
    || ||   |  ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  23357811 tatac---tgaaatgcattaactactatacaattttctttttcatatccttaac 23357861  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 216
Target Start/End: Original strand, 37631604 - 37631703
Alignment:
Q  118 cataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37631604 cataaaaggaaactgtttttgattttattataaattaattacataattttaatgcattaattattatataatttccttttttatatccttaacccgtgcc 37631703  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Original strand, 18220693 - 18220812
Alignment:
Q  78 cggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaac 177  Q
    |||||||| | ||||| |||||  |||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||  |  | ||| ||||||||||||||||| | |||||||||     
T  18220693 cggggcaccgattaaggataccaaaaaaggaatttattaccataaaagaaaactatttttgccattttataaattaattacacaatttctatacattaat 18220792  T
Q  178 tactatataatttccttttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18220793 tactatataatttccttttt 18220812  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22739957 - 22739868
Alignment:
Q  109 aattattaccataaaaggaaactgttttgactttatt--acaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttcctttt 196  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||  | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22739957 aattattaccataaaagaaaactgtttttaattttttttataaattaattacacaatttcaatgcattaactactatatactttcctttt 22739868  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 18220620 - 18220688
Alignment:
Q  144 ttacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccag 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  18220620 ttacaaattaattacacaatttcaatacagtaattactatataatttcctttttagtattcttaaccag 18220688  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 216
Target Start/End: Original strand, 18469993 - 18470100
Alignment:
Q  109 aattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatcctta 207  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  18469993 aattattaccataaaatgtaactgtttttgacttt-tcataaattaattacacaatttcaatgtattaactgctatataatttcctttttagtatgctta 18470091  T
Q  208 accagtgcc 216  Q
    ||| |||||    
T  18470092 accggtgcc 18470100  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Original strand, 4100602 - 4100684
Alignment:
Q  133 ttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    |||||| || |||| |||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4100602 ttttgatttgattataaattaataacataattttaatacattaattactatataatttcctttttcatatccttaaccggtgc 4100684  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 36998045 - 36998003
Alignment:
Q  13 ttcactgcctaaaactaaaatctacatatttggatacttttaa 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36998045 ttcactgcctaaaactaaaatctacatatttggatacttttaa 36998003  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 164
Target Start/End: Original strand, 47118041 - 47118098
Alignment:
Q  108 gaattattaccataaaaggaaactgtt-ttgactttattacaaattaattacacaatt 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47118041 gaattattaccataaaaggaaactgctcttgactttattataaattaattacacaatt 47118098  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36437507 - 36437405
Alignment:
Q  111 ttattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaac 209  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  36437507 ttattatcataaaagaaaactatttttgacttt-ttataaattaattaaacaatttcaatgaattacctactatataattacctttttagtatccttaac 36437409  T
Q  210 cagt 213  Q
    ||||    
T  36437408 cagt 36437405  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4087716 - 4087650
Alignment:
Q  148 aaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  4087716 aaattaatcacactatttcaatgcattaactactatataatttcctttttagtatgcttaaccagtg 4087650  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Original strand, 18220531 - 18220593
Alignment:
Q  148 aaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacc 210  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  18220531 aaattaattacacaattttaatacattaattactatataattttctttttagtatccttaacc 18220593  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 38128480 - 38128406
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaa 128  Q
    ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||    
T  38128480 aagggtcatgctaaccggtgcctccggggcactggttaagcatacaaaaaaaggaaattcttaccataaaaggaa 38128406  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6820100 - 6819946
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| || |   |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||   |||||    
T  6820100 agggtcatgctaaccggtgccctaggg-cactggttaaggatgctaaaaaaggtaattattaccataaaatgaaacatttttgactttttta-gtattaa 6820003  T
Q  155 ttacaca-attccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacca 211  Q
    |||||||  || | ||||| |||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  6820002 ttacacagttttctatacaataactactgtataattt-ctttttaacatccttaacca 6819946  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22973667 - 22973623
Alignment:
Q  172 attaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22973667 attaactactatataatttctttttttatatcattaaccagtgcc 22973623  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Original strand, 30923986 - 30924152
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcatac--cctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaat 151  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||     |||||| |||| |||||||||||||||  | | |||||||  |||  |||    
T  30923986 aagggtcatgctaactggtgccctcggggcactcgttaagcatacaaaaaaaaaggaaattcttaccataaaaggaagttttgttgacttatttatgaat 30924085  T
Q  152 taattacacaa-ttccaatacattaactactatataatttcctttttta-tatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||| |||| || |||| || ||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  30924086 taattaaacaattttcaatgcactaattaacatataatttccctttttattatccttaacccgtgcc 30924152  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3021984 - 3021922
Alignment:
Q  148 aaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacc 210  Q
    |||||||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  3021984 aaattaattatacaatttcaatgtattaactagtatataatttcctttttaatatgcttaacc 3021922  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19434685 - 19434518
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaa 149  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||  |||| |||||||||||||||  | | |||||||  |||       
T  19434685 ttttaagggtcatgctgaccggtgcccccggg-cactggttaagcatacaaaaaaagaaaattcttaccataaaaggaagttttgttgacttatttatgg 19434587  T
Q  150 attaattacacaa-ttccaatacattaactactatataatttcctttttta-tatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||| |||| || |||| || ||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  19434586 attaattaaacaattttcaatgcaataattaacatataatttccctttttattatccttaatcagtgcc 19434518  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13556552 - 13556474
Alignment:
Q  101 taaaagggaattattaccataaaaggaaactgtt-ttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaacta 179  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || | |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  13556552 taaaaggaaattattaccataaaaagatattgttattgacttt-ttataaattaattacacaatttcaatgcattgacta 13556474  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20117029 - 20116940
Alignment:
Q  102 aaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttc 191  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| | | || ||| ||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  20117029 aaaaggaaattattatcataaaagaaaactgtttttggcctt-ttaaaaatttactacacaatttcaatgcattaattactatataatttc 20116940  T

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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5785559 - 5785507
Alignment:
Q  148 aaattaattacacaattc-caatacattaactactatataatttcctttttta 199  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5785559 aaattaattacacaattttcactacattaattactataaaatttcctttttta 5785507  T

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Target: chr4 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 58)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29591378 - 29591214
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaat 151  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  29591378 taagggtcctgctaaccggtgcccccggggcactagttaagcataccataaaaggtaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaat 29591279  T
Q  152 taattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  29591278 taagtacacaatttcaatgcattaactactatataatttccttattcatattcttaaccagtgcc 29591214  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Original strand, 4268816 - 4268983
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattaca 148  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |    
T  4268816 ttttatgggtcctgctaaccggtgccctcggggcactggttaatcataccataaaagggaattattaccataaaaagaaactgtttttgacattattata 4268915  T
Q  149 aattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  4268916 aattaattacataatttcaatgcattaactactatatagtttcctttttcatacccttaaccagtgcc 4268983  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43944692 - 43944532
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  43944692 gggtcttgctaaccggtgccctcggg-cactggttaagcataccatacaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaa 43944594  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43944593 ttacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatacccttaaccagtgcc 43944532  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7769126 - 7768963
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttga-ctttattacaaatt 152  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||    
T  7769126 aagggtcctgctaaccggtgcccccggggcacgggttaagtatgccataaaagagaattattaccataaaaggaaactgtttttaacattattataaatt 7769027  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7769026 aattacacaatttcaatacattaactactatataatttcctttttcatacccttaaccagtgcc 7768963  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32217232 - 32217070
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatt 152  Q
    |||||||||| ||| |||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| |||||    
T  32217232 aagggtcctgttaaccggtgcctccggggcacaggttaagcataccataaaagggaattattatcataaaaa-aaactgtttttgactttattataaatt 32217134  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32217133 aattacacaatttcaatgcattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 32217070  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 53 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16536237 - 16536081
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaat 151  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  16536237 taagggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagaataccataaaatagaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaat 16536138  T
Q  152 taattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaa 208  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16536137 taattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatacccttaa 16536081  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 36395288 - 36395129
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaat 151  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  36395288 taagggtcctgctaactggtgcccccagggcactggttaagcataccataaaagggaattattatcataaaagaaaactgcttttgactttattataaat 36395189  T
Q  152 taattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacca 211  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  36395188 taattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatttttaacca 36395129  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50619277 - 50619111
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattaca 148  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  50619277 ttttaagggtcccgctaaccggtgccc-ctgggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttttactttattata 50619179  T
Q  149 aattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||    
T  50619178 aattaagtacacaatttcaatgcattaactactatataattttctttttcatattcttaatcagtgcc 50619111  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6164279 - 6164119
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  6164279 gggtcctgctaaccggtgtcctcggggtactggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaaactgttttttgctttattataaattaa 6164180  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  6164179 ttacacaatttcaatgcattaactactatataattttc-ttttgatatccttaaccagtgcc 6164119  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 54897494 - 54897333
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  54897494 gggtcctgctaaccggtgcctccgggacactggttaaacataccataaaaggaaattattaccataaaaggaaattgtttttgactttattataaattaa 54897395  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  54897394 ttatacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttctcatatccttaaccagtgcc 54897333  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4089331 - 4089167
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaat 151  Q
    |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  4089331 taagggtcctgctaactggtgcccctggggcactggttaaacataccataaaagagaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaat 4089232  T
Q  152 taattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  4089231 taattacacaatttcaatgcattaactactatataattttctttttcatacccttaatcagtgcc 4089167  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 58 - 216
Target Start/End: Original strand, 54655879 - 54656037
Alignment:
Q  58 gtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaatt 156  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  54655879 gtcctgctaaccggtgccc-cgggacactggttaagcatatcataagagagaattattatcctaaaagaaaattgtttttgactttattataaattaatt 54655977  T
Q  157 acacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54655978 acacaatttcaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 54656037  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 789530 - 789691
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggc-actggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatta 153  Q
    |||||| ||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  789530 gggtcccgctaaccggtgcc-tctgggctactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaatta 789628  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  789629 attacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatacccttaacccgtgcc 789691  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12356430 - 12356272
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12356430 gggtcctgctaaccggtgcccccggaacactggttaagcataccataaaagagaattattatcataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaa 12356331  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    ||| | |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12356330 ttatataatttcaatgtattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagt 12356272  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4220386 - 4220226
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattaca 148  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||| |    
T  4220386 ttttaagggtcatgctaaccggtgcctacggagcacatgttaagcataccataaaagggaattattac-ataaaagaaaattgtttttgactttattata 4220288  T
Q  149 aattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacc 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4220287 aattaattacacaatttcaatacattaactactatataatttcctttttcatatccttaacc 4220226  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Original strand, 18067877 - 18068040
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatt 152  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| | |||||    
T  18067877 aagggtcttgctaaccggtgcccccggggaacgggttaaacataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactatttttgacattatgataaatt 18067976  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18067977 aattacacaattttaatgcattaactactatataatttcctttttcatacccttaaccagtgcc 18068040  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Original strand, 42898741 - 42898907
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattacca--taaaaggaaactgtttt-gactttattacaa 149  Q
    ||||| || ||| |||||||| || |||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||| ||    
T  42898741 taaggatcatgcgaatcggtgtccccgggacattggttaagcataccataaaagagaattattaccacataaaaagaaactatttttgactttattataa 42898840  T
Q  150 attaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42898841 attaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 42898907  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 216
Target Start/End: Original strand, 33108672 - 33108833
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatta 153  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  33108672 agggtcctgctaaccggtgcctccggggcacgggttaagcataccataaaaaggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaatta 33108771  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  33108772 attatactatttcaatgcattaactattatataatttcctttttcatat-cttaaccagtgcc 33108833  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 53 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 37988124 - 37987965
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttga-ctttattacaaat 151  Q
    |||||||||| |||| ||||||  |||||| | |||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  37988124 taagggtcctactaaccggtgctttcgggggattggttaagcatactataaaagagaattattacaataaaaggaaactgtttttaacattattataaat 37988025  T
Q  152 taattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacca 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37988024 taattacacaatttcaatacattaactactatataatttcctttttcatacccttaacca 37987965  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 89 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 39844060 - 39843937
Alignment:
Q  89 ttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataa 187  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  39844060 ttaagcataccctaaaaaggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacataatttcaatgcattaactactatataa 39843961  T
Q  188 tttccttttttatatccttaacca 211  Q
    |||| ||||| |||||||||||||    
T  39843960 tttcatttttcatatccttaacca 39843937  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Original strand, 43202382 - 43202544
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatt 152  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||    
T  43202382 aagggtcctgctaaccggtgcccccggg-cactggttaagcttaccataaaagagaattattaccataaaagaaaactgtttttgacattattataaatt 43202480  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  43202481 aattacacaattttaatgcattaattactatataatttcctttttcatacccttaactagtgcc 43202544  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 88 - 213
Target Start/End: Original strand, 19503137 - 19503263
Alignment:
Q  88 gttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatata 186  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  19503137 gttaagcataccataaaagggaattattacaataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgtattaactagtatata 19503236  T
Q  187 atttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19503237 atttcctttttcatatccttaaccagt 19503263  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 54945780 - 54945939
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  54945780 gggtcctgctaaccggtgttc-cggagcactggttaagtataccataaaaaggaattat-accataaaacgaaattgtttttgactttattataaattaa 54945877  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54945878 ttacacaatttcaatacattaactgctatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 54945939  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 216
Target Start/End: Original strand, 32202514 - 32202641
Alignment:
Q  89 ttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataa 187  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  32202514 ttaagcatatcataaaagg-aattattatcataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactactatataa 32202612  T
Q  188 tttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32202613 tttccttttttatatccttaacccgtgcc 32202641  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15186423 - 15186268
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||      || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  15186423 gggtcctgttaaccggtgcccccggggcactggtta------ccataaaatggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaa 15186330  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15186329 ttacacaatttcaatggattaactactatataatttcctttttcatacccttaaccagtgcc 15186268  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 216
Target Start/End: Original strand, 24679671 - 24679803
Alignment:
Q  84 actggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttga-ctttattacaaattaattacacaattccaatacattaactacta 182  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24679671 actgattaagcataccataaaagagaattattaccataaa-ggaaattgtttttaactttattataaattaattacacaatttcaatacattaactacta 24679769  T
Q  183 tataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24679770 tataatttcttttttcatatccttaaccagtgcc 24679803  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28755803 - 28755645
Alignment:
Q  57 ggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttt-tgactttattacaaattaat 155  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||  ||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  28755803 ggtcctgctaaccggtgtc-tcggggcatgggttaagcatactataaaagg-aagtattatcataaaaggaaactgtttctaactttattatcaattaat 28755706  T
Q  156 tacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28755705 tacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 28755645  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 55882874 - 55882709
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattaca 148  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  55882874 ttttaagggtcctactaaccggtgcccccgaggcacgggttaagtataccataaaagtgaatt-ttaccataaaagaaaactgtttttgactttattata 55882776  T
Q  149 aattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  55882775 aattaattacacaatttcaatgcattaattactatataattt-ttttttcatatccttaacgagtgcc 55882709  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 216
Target Start/End: Original strand, 30154158 - 30154323
Alignment:
Q  51 tttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaa 149  Q
    |||| |||||||||||| || ||   ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| || ||||||| ||    
T  30154158 tttatgggtcctgctaaccgatgttttcggggcactggttaagcacaccataaaagagaattattatcatataaggaaattgtttttgattttattataa 30154257  T
Q  150 attaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  30154258 attaattacataatttcaatacattaactactatataatttcctttttcatat-cttaactagtgcc 30154323  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 214
Target Start/End: Original strand, 52533816 - 52533944
Alignment:
Q  87 ggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatat 185  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  ||||| || | |||||||||||||||    
T  52533816 ggttaaacataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttcgactttattatcaattaattattcaatttcagtgcattaactactatat 52533915  T
Q  186 aatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  52533916 aatttcctttttcatattcttaaccagtg 52533944  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 215
Target Start/End: Original strand, 47231902 - 47232032
Alignment:
Q  86 tggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactata 184  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||    
T  47231902 tggttaaacataccataaaagggaattattatcataaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaattacattatttcaatgcattaactattata 47232001  T
Q  185 taatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  47232002 taatttcctttttcacatccttaaccagtgc 47232032  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 5091612 - 5091771
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttt-tgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5091612 gggtcctgctaaccggtgctcccgga-cactggttaagcataca-taaaagggaattattactataaaaggaaactgtttatgactttattataaattaa 5091709  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||  |||| ||||| || ||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||    
T  5091710 ttacacaattttaatatattaattattatataattttatttttcatattcttaaccagtgcc 5091771  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Original strand, 3783496 - 3783662
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggt---taagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaa 149  Q
    |||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |    
T  3783496 aagggtcctgttaaccggtgctcccggggcactagtacttaagcataccataaaagggaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattatca 3783595  T
Q  150 attaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||    
T  3783596 attaattaaacaattttaatgcattaactactatataatttcatttttcatatgtttaaccggtgcc 3783662  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16821039 - 16820912
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatta 153  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||    
T  16821039 agggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaaggaaattattaccataaaaggaaactgcgtatgactttattataagtta 16820940  T
Q  154 attacacaattccaatacattaactact 181  Q
    |||||| |||| |||| |||||| ||||    
T  16820939 attacagaatttcaatgcattaattact 16820912  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 191
Target Start/End: Original strand, 30387167 - 30387270
Alignment:
Q  89 ttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataa 187  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30387167 ttaagcatatcataaaaaggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactactatataa 30387266  T
Q  188 tttc 191  Q
    ||||    
T  30387267 tttc 30387270  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 46149111 - 46148973
Alignment:
Q  70 ggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaa 168  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  46149111 ggtgccctcgagacactggttaaacataccataaaagagaattattaccataaaaagaaattgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaa 46149012  T
Q  169 tacattaactactatataatttccttttttatatcctta 207  Q
    |  ||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  46149011 tgtattaattattatataatttcctttttcatattctta 46148973  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 50603420 - 50603254
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccat-aaaaggaaactg-ttttgactttattac 147  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||  |||||| ||||||| ||||||     
T  50603420 ttttaagggtcctgctaactggtgttctcggggtactggttaagcataccataaaagagaattattatcataaaaaaaaaactgtttttgacattattat 50603321  T
Q  148 aaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||| |||||||||||  | | ||||||||||||    
T  50603320 aaattaattacacaatttcaatgcattaattattatacaatttccttttccacacccttaaccagtg 50603254  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 214
Target Start/End: Original strand, 53655903 - 53656037
Alignment:
Q  81 ggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttga-ctttattacaaattaattacacaattccaatacattaacta 179  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||| | |||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53655903 ggcactgattaagcataccataaaatgaaattattaccataaaataaaattatttttaactttattataaattaattacacaatttcaatacattaacta 53656002  T
Q  180 ctatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  53656003 ttatataatttcttttttcatatccttaacaagtg 53656037  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 177
Target Start/End: Original strand, 39877247 - 39877371
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcata--ccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatt 152  Q
    |||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  39877247 gggtcctgctaacccgtgcctccggggcactggttaagcatataccataaaagagaattattactataaaatgaaactgtttttgactttattataaatt 39877346  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaac 177  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  39877347 aattacacaatttcaatacattaac 39877371  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 49915300 - 49915185
Alignment:
Q  101 taaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttg-actttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttcctttttta 199  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| |    
T  49915300 taaaaggaaattattattataaaaggaaactgttttttactttattataaattaattacacaatttcaatacattaattactatataaatttctttttca 49915201  T
Q  200 tatccttaaccagtgc 215  Q
    ||||||||| ||||||    
T  49915200 tatccttaatcagtgc 49915185  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42815237 - 42815137
Alignment:
Q  115 taccataaaag-gaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccag 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42815237 taccataaaagagaaactgtttttgactttattataaattaattacataatttcaatacattaactatgatataatttcctttttcatatccttaaccag 42815138  T
Q  213 t 213  Q
    |    
T  42815137 t 42815137  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Original strand, 31680485 - 31680622
Alignment:
Q  78 cggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaa 176  Q
    |||| ||| |||||| |||| | |||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  31680485 cgggacacgggttaaacatatcataaaaatgaattattaccataaaaggaaattgtttttgactttattataaattaattatacaatttcaatgcattaa 31680584  T
Q  177 ctactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    ||| ||| ||| || |||||| ||| ||||||||||||    
T  31680585 ctattatgtaactttctttttcatacccttaaccagtg 31680622  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Original strand, 46688264 - 46688371
Alignment:
Q  115 taccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttcc-----ttttttatatccttaa 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |     ||||| ||||||||||    
T  46688264 taccataaaaggaaactgcttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactactgtataattttctttaatttttcatatccttaa 46688363  T
Q  209 ccagtgcc 216  Q
    ||||||||    
T  46688364 ccagtgcc 46688371  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 54054675 - 54054573
Alignment:
Q  115 taccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  54054675 taccataaaaggaaattgtttttgactttattatcaattaattacactatttcaatgcattaactattatataatttcttttttcatatccttaaccggt 54054576  T
Q  214 gcc 216  Q
    |||    
T  54054575 gcc 54054573  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31517354 - 31517217
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaact--gttttgactttattacaaa 150  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  ||  |   ||||||||||||||  ||    
T  31517354 taagggtccttctaatcggtgcccccagg-cactggttaagcataccatataagagaattattaccataaaaaaaacattatttttgactttattatcaa 31517256  T
Q  151 ttaattacacaattccaatacattaactactatataatt 189  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  31517255 ttaattacactatttcaatgcattaactattatataatt 31517217  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 41265620 - 41265510
Alignment:
Q  80 gggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaacta 179  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  41265620 gggcactggttaaacataccaaaaaagaaaattattacaataaaagaaaactgtttttgattttttataaattaattacacaatttcactgcattaacta 41265521  T
Q  180 ctatataattt 190  Q
    |||||||||||    
T  41265520 ctatataattt 41265510  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 128
Target Start/End: Original strand, 37402758 - 37402830
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaa 128  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| |||||||||||||||    
T  37402758 agggtcatgctaaccggtgccctcggggcactggttaagcata-caaaaaaggaaattcttaccataaaaggaa 37402830  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 53268875 - 53268764
Alignment:
Q  86 tggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactata 184  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  53268875 tggttaagcataccaaaaaagaaaattattattataaaagaaaattgtttttgacttt-ttataaattaattacacaattttaatgcattaactaatata 53268777  T
Q  185 taatttccttttt 197  Q
    ||||||| |||||    
T  53268776 taatttctttttt 53268764  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50167682 - 50167616
Alignment:
Q  148 aaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  50167682 aaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tataattttctttttcatatctttaaccagtgcc 50167616  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 162
Target Start/End: Original strand, 53003954 - 53004063
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaact-gttttgactttattacaaatt 152  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||   |||||||||| |  |||||||||||||| | |||    
T  53003954 aagggtcctgctaaccggtgtcccggggacactgattaagcatatcataaaagagaattattattttaaaaggaaattatttttgactttattatacatt 53004053  T
Q  153 aattacacaa 162  Q
    ||||||||||    
T  53004054 aattacacaa 53004063  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 216
Target Start/End: Original strand, 1432659 - 1432703
Alignment:
Q  172 attaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1432659 attaactattatataatttcctttttcatatccttaaccagtgcc 1432703  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 54054718 - 54054672
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcatacc 99  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54054718 taagggtcctgccaaccggtgcccccggggcactggttaagcatacc 54054672  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8133840 - 8133787
Alignment:
Q  109 aattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacaca 161  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  8133840 aattattaccataaaagaaaactatttttgactttattataaattaattacaca 8133787  T

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Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 128
Target Start/End: Original strand, 28119905 - 28119978
Alignment:
Q  55 agggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaa 128  Q
    |||||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||    
T  28119905 agggtcatgctaaccggtgtctccggggcactggttaagcatacaaaaaaaggaaattcttaccataaaaggaa 28119978  T

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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 52697210 - 52697083
Alignment:
Q  83 cactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactact 181  Q
    |||| ||||| |||| | |||||| |||||||||| ||||| | ||| | |||| |||||||||| |||||| ||| | ||||  |||  ||||||||||    
T  52697210 cactcgttaaacatatcataaaagagaattattacaataaaggaaaattatttttgactttattataaatta-ttatataattttaatgtattaactact 52697112  T
Q  182 atataatttccttttttatatccttaacc 210  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  52697111 atataattttgtttttcatatccttaacc 52697083  T

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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 164
Target Start/End: Original strand, 8749794 - 8749907
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcatac---cctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaa 150  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||      |||||| | |||||||||||| || ||||| | |||||||  ||| | |    
T  8749794 aagggtcatgctaaccggtgcccttggggcacgggttaagcatacaaaaaaaaaaggaatttattaccataatagaaaactttgttgacttatttataga 8749893  T
Q  151 ttaattacacaatt 164  Q
    ||||||||||||||    
T  8749894 ttaattacacaatt 8749907  T

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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 128
Target Start/End: Original strand, 28120062 - 28120121
Alignment:
Q  69 cggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaa 128  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||    
T  28120062 cggtgcccccggggcacaggttaagcatacaaaaaaaggaaattcttaccataaaaggaa 28120121  T

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Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 211
Target Start/End: Original strand, 17344714 - 17344814
Alignment:
Q  111 ttattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacc 210  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |  || ||| || ||||||| | ||||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||    
T  17344714 ttattaccataaaaagaaactttttttaaatttttataatttaattatataatttaaatgcattaactattatataatttcatttttattatacttaacc 17344813  T
Q  211 a 211  Q
    |    
T  17344814 a 17344814  T

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Target: scaffold0190 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15082 - 14921
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15082 gggtcctgttaaccagtgcctccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaa 14983  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
     ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14982 ctacacaatttcagtgcattaactactatataatttctttttttatatctttaaccagtgcc 14921  T

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Target: scaffold0264 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23153 - 22987
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattaca 148  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  23153 tttttagggtcttgctaaccggtgtccttggggcactggttaaacataccataaaagagaattattaacataaaaggaaactgtttttgactttattata 23054  T
Q  149 aattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23053 aattaattacacaatttcaatgtattaattactatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 22987  T

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Target: scaffold0524 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0524
Description:

Target: scaffold0524; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1016 - 851
Alignment:
Q  51 tttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaa 149  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  1016 tttaagggtctggctaaccggtgtccttagggcactggttaagcataccataaaagagaattattactataaaaggaaattgattttgactttattataa 917  T
Q  150 attaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  916 attaattacacaatttcaatgcattaactactatataattttctttttcatatccttaactagtgc 851  T

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Target: scaffold0014 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 68290 - 68451
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||     
T  68290 gggtcctgctaaccgatgccttcggggtactggttaagcataccataaaagggaattattaccttaaaaggaaactgattttaactttattataatttat 68389  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  68390 ttacacaattttaatgcattaactactatataatttcatttttcatatccttaaccagtgcc 68451  T

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Target: scaffold0003 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Original strand, 53683 - 53846
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaatt 152  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| | |||||    
T  53683 aagggtcttgctaaccggtgcccccggggaacgggttaaacataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactatttttgacattatgataaatt 53782  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  53783 aattacacaattttaatgcattaactactatataatttcctttttcatacccttaaccagtgcc 53846  T

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Target: scaffold0021 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 116392 - 116229
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttt-tgactttattacaaatt 152  Q
    |||||| ||||||| ||||  ||  ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  116392 aagggtactgctaaccggtatccctggggcacgggttaaacataccataaaagggaattattatcataaaaggaaactgtttctgactttattatcaatt 116293  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  116292 aattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatctttaacctgtgcc 116229  T

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Target: scaffold0038 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 53 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25907 - 25750
Alignment:
Q  53 taagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaat 151  Q
    |||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||    
T  25907 taagggtcctactaacctgtgccttcgggtcactgtttaaggataccataaaagggaattattaccataaaagaaaattgtttttgactttattataaat 25808  T
Q  152 taattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacc 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25807 taattacacaatttcaatacattaattactatataa-ttcctttttcatatccttaacc 25750  T

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Target: scaffold0034 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 213
Target Start/End: Original strand, 95579 - 95742
Alignment:
Q  50 ttttaagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaa 149  Q
    |||| |||||||| |||| ||| ||||  |||  || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  95579 tttttagggtcctcctaaccggagcccctgggataccggttaaacataccataaaagggaattattaccataaaagaaaactgttttgactttattataa 95678  T
Q  150 attaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  95679 attaattacataatttcaattcattaattattatataatttcctttttcatattcttaaccagt 95742  T

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Target: scaffold0425 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10896 - 10771
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10896 gggtcctgctaaccgctgcccccgaggcactggttaagcataccataaatgggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaa 10797  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactac 180  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||    
T  10796 ttacacaatttcaatgcattaactac 10771  T

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Target: scaffold0045 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 71 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50719 - 50573
Alignment:
Q  71 gtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaattacacaattccaat 169  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||     
T  50719 gtgcccccggagcactggttaaacatactataaaagagaattattatcataaaagaaaattgattttgactttattataaattaattatacaatttcaaa 50620  T
Q  170 acattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  50619 acattaactactatataatttcctttttcatatctttaaccagtgcc 50573  T

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Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 214
Target Start/End: Original strand, 53358 - 53505
Alignment:
Q  57 ggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaat 155  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||           || |||||| |||||||||| ||||||||    
T  53358 ggtcctgctaaccggtgcctccggggcactagttaagcataccataaaagagaattatta-----------aattgtttttgactttattataaattaat 53446  T
Q  156 tacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 214  Q
    || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53447 tatacaatttcaatgcattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtg 53505  T

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Target: scaffold0674 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Original strand, 7956 - 8058
Alignment:
Q  115 taccataaaaggaaactgttt-tgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7956 taccataaaaggaaactgtttctgactttattatcaattaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagt 8055  T
Q  214 gcc 216  Q
    |||    
T  8056 gcc 8058  T

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Target: scaffold0549 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0549
Description:

Target: scaffold0549; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7415 - 7313
Alignment:
Q  115 taccataaaaggaaactgttt-tgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7415 taccataaaaggaaactgtttctgactttattatcaattaattacacaatttcaatgcattaactactatataatttcctttttcatatccttaaccagt 7316  T
Q  214 gcc 216  Q
    |||    
T  7315 gcc 7313  T

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Target: scaffold1152 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1152
Description:

Target: scaffold1152; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 832 - 704
Alignment:
Q  88 gttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatata 186  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  832 gttaagcataccataaaagagaattatcaccataaaagaaaacagtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatggattaactactatata 733  T
Q  187 atttccttttttatatccttaaccagtgc 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  732 atttcctttttcatatctttaacccgtgc 704  T

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Target: scaffold0050 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 69413 - 69251
Alignment:
Q  54 aagggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaatt 152  Q
    ||||||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||| |||||    
T  69413 aagggtccttctaaccggtgctcccgaggcactggttaagcataccataaaaga-aattattaccttaaaaaaaaactgcttttgactttattataaatt 69315  T
Q  153 aattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  69314 aattacataattttaatgtattaactactatataatttactttttcatatccttaacgagtgcc 69251  T

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Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 215
Target Start/End: Original strand, 33735 - 33841
Alignment:
Q  109 aattattaccataaaaggaaactgttttgactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaa 208  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||   | | ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||    
T  33735 aattattagcataaaagaaaactattttttatcttttataaattaattacacaatttcaatgtattaactattatataatttccattttaatatacttaa 33834  T
Q  209 ccagtgc 215  Q
    | |||||    
T  33835 caagtgc 33841  T

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Target: scaffold0113 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41105 - 40952
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    ||||||||| || ||||| |  |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  41105 gggtcctgccaaccggtgtctccgggacactggttaagcatatcataaaaggaaattattatcataaaaggaaactgtttttgacttcattataaattaa 41006  T
Q  155 ttacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaa 208  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  41005 ttacataatttcaatgcattaactattatataatttcatttttcatattcttaa 40952  T

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Target: scaffold0002 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Original strand, 146933 - 147059
Alignment:
Q  84 actggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactacta 182  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  146933 actgattaagcataccataaaaagaaattattaccgtaatagaaaactgtttttgactttattatcaattaattacacaatttcaatgtattaactacta 147032  T
Q  183 tataatttccttttttatatccttaac 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  147033 tataatttcctttttcatatccttaac 147059  T

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Target: scaffold1266 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1266
Description:

Target: scaffold1266; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 450 - 317
Alignment:
Q  84 actggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactacta 182  Q
    |||| |||| |||| | |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  450 actgattaatcatatcataaaagagaattattaccgtagaaggaaactgtttttgactttattataaatttattacacaatttcaatgcattaactatta 351  T
Q  183 tataatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  350 tataattttctttttcatatgcttaaccagtgcc 317  T

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Target: scaffold0325 (Bit Score: 63; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 216
Target Start/End: Original strand, 17502 - 17631
Alignment:
Q  87 ggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatat 185  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  17502 ggttaaacataccataaaaaggaattattatcataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaatt-cacaatttcaatgcattagctactatat 17600  T
Q  186 aatttccttttttatatccttaaccagtgcc 216  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| |||||||    
T  17601 aattttctttttcatatccgtaaacagtgcc 17631  T

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Target: scaffold0206 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 214
Target Start/End: Original strand, 11029 - 11129
Alignment:
Q  115 taccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaaccagt 213  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11029 taccataaaatgaaactgtttttgactttattatagtttaattacacaatttcaatgcattaactaatatataatttcctttttcatatccttaaccagt 11128  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  11129 g 11129  T

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Target: scaffold0007 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 234039 - 233925
Alignment:
Q  56 gggtcctgctaatcggtgccctcggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactg-ttttgactttattacaaattaa 154  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | || |||||| |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  234039 gggtcctgctaaccggtgcccccggagtaccggttaaacataccataaaaggaaattattttcataaaaggaaactgcttttgactttattataaattaa 233940  T
Q  155 ttacacaattccaat 169  Q
    |||||||||| ||||    
T  233939 ttacacaatttcaat 233925  T

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Target: scaffold0263 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0263
Description:

Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 210
Target Start/End: Original strand, 19607 - 19740
Alignment:
Q  78 cggggcactggttaagcataccctaaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttt-gactttattacaaattaattacacaattccaatacattaa 176  Q
    |||| ||||| |||| |||| | |||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  19607 cgggacactgattaatcatatcataaaagagaactattatcgtaaaaggaaactgtttttgactttattataaattcattacacaatttcaatgcattaa 19706  T
Q  177 ctactatataatttccttttttatatccttaacc 210  Q
     || ||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  19707 ttattatataatttcttttttcatatgcttaacc 19740  T

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Target: scaffold0533 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5132 - 5070
Alignment:
Q  148 aaattaattacacaattccaatacattaactactatataatttccttttttatatccttaacc 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||    
T  5132 aaattaattacacaatttcaataaattaactactatataattttttttttaatattcttaacc 5070  T

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