View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11000_low_12 (Length: 243)

Name: NF11000_low_12
Description: NF11000
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11000_low_12
NF11000_low_12
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (13-228)||(15678-15893)
[»] chr3 (52 HSPs)
chr3 (13-228)||(13504881-13505096)
chr3 (13-228)||(10602472-10602687)
chr3 (13-228)||(11947407-11947622)
chr3 (13-228)||(16448760-16448975)
chr3 (13-228)||(9360971-9361186)
chr3 (13-228)||(7600355-7600570)
chr3 (13-228)||(15556942-15557157)
chr3 (13-228)||(16373565-16373780)
chr3 (13-228)||(12187076-12187291)
chr3 (13-228)||(37942378-37942593)
chr3 (21-227)||(12193491-12193697)
chr3 (13-224)||(6814868-6815079)
chr3 (13-228)||(10147011-10147226)
chr3 (13-228)||(15645001-15645216)
chr3 (13-228)||(10160173-10160388)
chr3 (13-227)||(13187418-13187632)
chr3 (21-227)||(3245589-3245795)
chr3 (21-228)||(2721305-2721511)
chr3 (20-228)||(4382751-4382961)
chr3 (21-228)||(13001425-13001634)
chr3 (20-228)||(13097711-13097919)
chr3 (20-228)||(1992803-1993011)
chr3 (20-228)||(20156515-20156722)
chr3 (20-228)||(10546936-10547148)
chr3 (20-228)||(13690608-13690816)
chr3 (20-228)||(11398215-11398424)
chr3 (20-228)||(14348588-14348797)
chr3 (23-228)||(22637702-22637908)
chr3 (21-228)||(3279191-3279399)
chr3 (23-228)||(17387839-17388045)
chr3 (20-228)||(12160207-12160416)
chr3 (13-220)||(17045697-17045902)
chr3 (13-220)||(17047857-17048062)
chr3 (13-111)||(16655798-16655897)
chr3 (172-228)||(27356728-27356784)
chr3 (171-228)||(13601220-13601277)
chr3 (20-228)||(20225754-20225960)
chr3 (172-228)||(3339226-3339282)
chr3 (172-228)||(12776534-12776590)
chr3 (172-228)||(13136210-13136266)
chr3 (172-228)||(20584262-20584318)
chr3 (177-228)||(15946773-15946824)
chr3 (170-228)||(14445768-14445826)
chr3 (172-228)||(15619283-15619339)
chr3 (159-228)||(8686387-8686457)
chr3 (172-228)||(13195458-13195514)
chr3 (177-228)||(13068306-13068357)
chr3 (197-228)||(2005499-2005530)
chr3 (13-60)||(13601062-13601108)
chr3 (20-101)||(12776660-12776739)
chr3 (20-101)||(15946619-15946698)
chr3 (172-228)||(16703307-16703363)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (13-228)||(123369-123584)
scaffold0029 (185-227)||(77391-77433)
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (13-228)||(9582893-9583108)
chr7 (13-228)||(16119849-16120064)
chr7 (13-224)||(23515067-23515278)
chr7 (13-228)||(14551098-14551314)
chr7 (13-228)||(8717865-8718080)
chr7 (13-228)||(13673856-13674071)
chr7 (13-228)||(18593352-18593567)
chr7 (13-228)||(18618117-18618332)
chr7 (20-228)||(4312564-4312772)
chr7 (20-228)||(538755-538964)
chr7 (20-228)||(8780936-8781146)
chr7 (20-226)||(9003958-9004165)
chr7 (20-228)||(12567020-12567229)
chr7 (20-228)||(20108375-20108584)
chr7 (21-228)||(12548805-12549012)
chr7 (21-227)||(48801777-48801983)
chr7 (23-228)||(9264939-9265145)
chr7 (20-228)||(13657873-13658081)
chr7 (20-228)||(11921307-11921512)
chr7 (20-228)||(16532100-16532311)
chr7 (20-228)||(16633351-16633562)
chr7 (20-228)||(16465616-16465821)
chr7 (159-228)||(4461242-4461311)
chr7 (172-228)||(825783-825839)
chr7 (172-228)||(14221718-14221774)
chr7 (172-228)||(15916776-15916832)
chr7 (172-228)||(18287761-18287817)
chr7 (172-228)||(27291496-27291552)
chr7 (165-228)||(15206584-15206647)
chr7 (170-228)||(5397273-5397331)
chr7 (179-228)||(15065935-15065984)
chr7 (175-228)||(9194544-9194597)
chr7 (172-224)||(6713072-6713124)
chr7 (132-227)||(4791383-4791478)
chr7 (172-227)||(15348532-15348587)
chr7 (160-212)||(15522504-15522557)
chr7 (185-227)||(15940731-15940773)
chr7 (20-101)||(15065779-15065858)
chr7 (20-101)||(18287612-18287691)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (13-228)||(15699555-15699770)
chr6 (13-228)||(22165549-22165764)
chr6 (13-228)||(22243812-22244027)
chr6 (13-228)||(22061503-22061718)
chr6 (13-228)||(20170242-20170458)
chr6 (20-228)||(24855245-24855453)
chr6 (13-228)||(22767116-22767331)
chr6 (20-228)||(23023093-23023302)
chr6 (20-224)||(20107784-20107989)
chr6 (20-228)||(25625691-25625899)
chr6 (20-228)||(18448140-18448349)
chr6 (28-228)||(18854026-18854226)
chr6 (23-228)||(2181063-2181269)
chr6 (20-228)||(21560554-21560762)
chr6 (20-228)||(25631269-25631477)
chr6 (21-228)||(29595697-29595904)
chr6 (20-228)||(25963248-25963457)
chr6 (20-228)||(25967895-25968104)
chr6 (25-228)||(30671807-30672011)
chr6 (20-199)||(19585571-19585750)
chr6 (14-117)||(20016339-20016443)
chr6 (159-228)||(18184874-18184943)
chr6 (161-228)||(20218981-20219048)
chr6 (161-228)||(22113006-22113073)
chr6 (171-228)||(35270971-35271028)
chr6 (165-228)||(18731868-18731931)
chr6 (172-228)||(11204004-11204060)
chr6 (159-228)||(29686587-29686657)
chr6 (172-224)||(23517835-23517887)
chr6 (20-60)||(29686449-29686489)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (13-228)||(20595831-20596046)
chr5 (13-228)||(20602117-20602332)
chr5 (13-228)||(20608408-20608623)
chr5 (13-228)||(15735534-15735749)
chr5 (13-228)||(23748051-23748266)
chr5 (13-203)||(23710701-23710892)
chr5 (20-228)||(24940540-24940749)
chr5 (13-228)||(18072900-18073115)
chr5 (13-228)||(24953174-24953389)
chr5 (21-210)||(20622170-20622359)
chr5 (13-228)||(20790714-20790929)
chr5 (20-228)||(23600636-23600845)
chr5 (20-228)||(24219752-24219961)
chr5 (20-224)||(20444843-20445048)
chr5 (34-228)||(21387410-21387605)
chr5 (24-228)||(20916456-20916660)
chr5 (20-189)||(22948518-22948688)
chr5 (21-191)||(20575510-20575680)
chr5 (172-228)||(22317513-22317569)
chr5 (172-228)||(25006808-25006864)
chr5 (172-228)||(30759655-30759711)
chr5 (165-228)||(18484212-18484275)
chr5 (178-228)||(25116171-25116221)
chr5 (172-228)||(26847803-26847859)
chr5 (183-228)||(25175261-25175306)
chr5 (172-224)||(22855723-22855775)
chr5 (183-227)||(27270563-27270607)
chr5 (20-101)||(22317639-22317719)
chr5 (179-227)||(17412736-17412784)
chr5 (20-101)||(22855572-22855651)
chr5 (21-101)||(25006934-25007012)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (13-228)||(11496614-11496829)
chr4 (13-228)||(13822913-13823128)
chr4 (19-228)||(42709731-42709940)
chr4 (14-228)||(15254349-15254563)
chr4 (21-228)||(10630758-10630965)
chr4 (20-228)||(3354646-3354855)
chr4 (21-228)||(18291945-18292153)
chr4 (20-228)||(18081459-18081669)
chr4 (21-228)||(17484910-17485118)
chr4 (20-228)||(45234232-45234441)
chr4 (21-228)||(56580539-56580748)
chr4 (21-228)||(38426745-38426938)
chr4 (23-228)||(8092427-8092634)
chr4 (165-228)||(14653998-14654061)
chr4 (172-226)||(15865647-15865701)
chr4 (172-228)||(10650547-10650603)
chr4 (172-228)||(15260109-15260165)
chr4 (172-228)||(16682913-16682969)
chr4 (177-228)||(15409534-15409585)
chr4 (159-228)||(9488878-9488948)
chr4 (179-227)||(17296250-17296298)
chr4 (22-101)||(15260235-15260312)
chr4 (20-60)||(12515042-12515081)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (13-228)||(22665062-22665277)
chr2 (13-228)||(117543-117758)
chr2 (13-228)||(22044660-22044875)
chr2 (13-228)||(25357511-25357726)
chr2 (20-228)||(11615-11823)
chr2 (13-228)||(16775651-16775866)
chr2 (13-228)||(24795285-24795500)
chr2 (13-228)||(17590407-17590622)
chr2 (13-228)||(27627580-27627796)
chr2 (20-228)||(25144757-25144966)
chr2 (21-228)||(5500265-5500473)
chr2 (20-228)||(25804267-25804475)
chr2 (22-223)||(25370890-25371091)
chr2 (21-228)||(23798922-23799129)
chr2 (20-228)||(23643950-23644160)
chr2 (74-228)||(24178193-24178348)
chr2 (20-148)||(24502168-24502297)
chr2 (140-228)||(24506777-24506865)
chr2 (172-228)||(23159385-23159441)
chr2 (172-228)||(23570642-23570698)
chr2 (172-228)||(27631655-27631711)
chr2 (172-228)||(27768816-27768872)
chr2 (177-228)||(24171510-24171561)
chr2 (159-224)||(24321314-24321380)
chr2 (159-228)||(25337651-25337720)
chr2 (172-228)||(23257570-23257625)
chr2 (167-209)||(23648123-23648165)
chr2 (20-101)||(27631506-27631585)
chr2 (182-227)||(29955868-29955913)
chr2 (183-227)||(19805618-19805662)
chr2 (179-227)||(21512567-21512615)
chr2 (172-227)||(24019068-24019123)
chr2 (185-227)||(17334606-17334648)
chr2 (20-60)||(15532753-15532792)
chr2 (20-60)||(24019228-24019267)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (13-228)||(27046874-27047089)
chr1 (13-228)||(17094601-17094816)
chr1 (13-228)||(21798662-21798878)
chr1 (13-228)||(20237456-20237671)
chr1 (23-224)||(8653126-8653327)
chr1 (20-228)||(52938621-52938830)
chr1 (20-228)||(3989944-3990154)
chr1 (27-228)||(19364043-19364244)
chr1 (140-228)||(14070632-14070720)
chr1 (170-224)||(19875648-19875702)
chr1 (165-228)||(21784472-21784535)
chr1 (165-228)||(4027832-4027895)
chr1 (159-225)||(16382578-16382645)
chr1 (165-228)||(8947515-8947578)
chr1 (21-101)||(21784598-21784677)
chr1 (185-227)||(18478234-18478276)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (13-228)||(21382093-21382309)
chr8 (13-228)||(21098794-21099009)
chr8 (13-228)||(21104115-21104330)
chr8 (13-228)||(23911441-23911655)
chr8 (13-228)||(8314467-8314683)
chr8 (13-228)||(8322846-8323062)
chr8 (20-228)||(21843524-21843733)
chr8 (20-228)||(21939996-21940206)
chr8 (20-228)||(20038981-20039189)
chr8 (21-228)||(17620755-17620961)
chr8 (20-228)||(16418620-16418830)
chr8 (21-228)||(23454945-23455154)
chr8 (49-228)||(24034049-24034230)
chr8 (21-217)||(14352181-14352378)
chr8 (39-228)||(21538573-21538765)
chr8 (117-228)||(20712537-20712649)
chr8 (172-228)||(11346953-11347009)
chr8 (172-228)||(19767684-19767740)
chr8 (172-228)||(22370102-22370158)
chr8 (177-228)||(20002279-20002330)
chr8 (172-228)||(22033555-22033611)
chr8 (172-228)||(22099655-22099711)
chr8 (172-228)||(22102552-22102608)
chr8 (177-228)||(21831181-21831232)
chr8 (20-89)||(20712470-20712539)
chr8 (177-228)||(22817755-22817806)
chr8 (179-227)||(18572977-18573025)
chr8 (185-227)||(19902174-19902216)
chr8 (20-101)||(22102403-22102482)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (13-228)||(615-831)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (13-228)||(1038-1253)
scaffold0404 (164-228)||(3460-3524)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (20-228)||(220-428)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (28-228)||(11064-11264)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (23-228)||(2852-3058)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (20-228)||(2287-2496)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (20-228)||(831-1041)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (20-228)||(251870-252079)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (21-228)||(14662-14869)
[»] scaffold0773 (1 HSPs)
scaffold0773 (23-228)||(482-687)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (20-228)||(7941-8149)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (21-228)||(120954-121162)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (20-228)||(1108-1318)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (20-228)||(58628-58838)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (20-228)||(97726-97936)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (20-228)||(510-718)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (70-228)||(164403-164562)
scaffold0011 (159-227)||(172248-172316)
scaffold0011 (165-228)||(161995-162058)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (23-228)||(13002-13207)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (81-228)||(8720-8869)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (110-228)||(10206-10325)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (23-228)||(35104-35307)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (67-226)||(12450-12609)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (67-226)||(232789-232948)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (22-224)||(37722-37922)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (127-228)||(38508-38610)
scaffold0096 (48-98)||(38625-38675)
[»] scaffold0512 (1 HSPs)
scaffold0512 (165-228)||(5232-5295)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (165-228)||(42237-42300)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (165-228)||(50506-50569)
scaffold0035 (185-227)||(88361-88403)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (170-228)||(912-970)
[»] scaffold1225 (1 HSPs)
scaffold1225 (160-228)||(1834-1902)
[»] scaffold0566 (2 HSPs)
scaffold0566 (172-228)||(2762-2818)
scaffold0566 (20-101)||(2612-2692)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (20-87)||(2859-2926)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (177-228)||(12743-12794)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (165-224)||(22159-22218)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (172-228)||(10720-10776)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (172-228)||(54849-54905)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (165-228)||(37743-37806)
scaffold0116 (21-101)||(37869-37948)
[»] scaffold0094 (2 HSPs)
scaffold0094 (172-227)||(1193-1248)
scaffold0094 (20-60)||(1041-1080)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (165-228)||(22756-22818)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (165-228)||(45228-45291)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (178-228)||(72572-72622)
scaffold0037 (178-228)||(84762-84812)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (183-228)||(18218-18263)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (172-212)||(83174-83214)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (185-225)||(3251-3291)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (20-60)||(5830-5869)


Alignment Details
Target: scaffold0230 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 15678 - 15893
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15678 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgagatttaag 15777  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15778 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15877  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  15878 gtgggggagtttgatg 15893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 52)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13505096 - 13504881
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13505096 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13504997  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13504996 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13504897  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  13504896 gtgggggagtttgatg 13504881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10602687 - 10602472
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602687 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 10602588  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602587 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 10602488  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  10602487 gtgggggagtttgatg 10602472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 11947407 - 11947622
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11947407 tggacttcacacacacactcatttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 11947506  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11947507 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagtaaagattcaagt 11947606  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  11947607 gtgggggagtttgatg 11947622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16448975 - 16448760
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16448975 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttggaatttaag 16448876  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448875 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16448776  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
     |||||||||||||||    
T  16448775 atgggggagtttgatg 16448760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9361186 - 9360971
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9361186 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttggaatttaag 9361087  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9361086 cccttgaggagacatgtcctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 9360987  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
     |||||||||||||||    
T  9360986 atgggggagtttgatg 9360971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 7600355 - 7600570
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7600355 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 7600454  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7600455 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 7600554  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
     |||||||||||||||    
T  7600555 atgggggagtttgatg 7600570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15557157 - 15556942
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15557157 tggacttcatacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaagatttcaagaaatgcttaagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 15557058  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15557057 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgaattaactattgatgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagt 15556958  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  15556957 gtgggggagtttgatg 15556942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16373780 - 16373565
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16373780 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 16373681  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16373680 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 16373582  T
Q  212 tgtgggggagtttgatg 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  16373581 tatgggggagtttgatg 16373565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12187291 - 12187076
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12187291 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 12187192  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12187191 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 12187093  T
Q  212 tgtgggggagtttgatg 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  12187092 tatgggggagtttgatg 12187076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 37942378 - 37942593
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37942378 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaggaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 37942477  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37942478 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 37942576  T
Q  212 tgtgggggagtttgatg 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  37942577 tatgggggagtttgatg 37942593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12193697 - 12193491
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12193697 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttga 12193598  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12193597 ggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaggtatggggg 12193499  T
Q  220 agtttgat 227  Q
    ||||||||    
T  12193498 agtttgat 12193491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 6814868 - 6815079
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  6814868 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttat 6814967  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6814968 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 6815066  T
Q  212 tgtgggggagttt 224  Q
    | || ||||||||    
T  6815067 tatgagggagttt 6815079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 10147011 - 10147226
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10147011 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 10147110  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10147111 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaag 10147209  T
Q  212 tgtgggggagtttgatg 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  10147210 tatgggggagtttgatg 10147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 15645001 - 15645216
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15645001 tggacttcacacacacactcacttgaaacttaattgttgggtagaataaagatttcaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 15645100  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15645101 gcccttgaggagacatgtgctttaattga-ttgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 15645199  T
Q  212 tgtgggggagtttgatg 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  15645200 tatgggggagtttgatg 15645216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10160388 - 10160173
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  10160388 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 10160289  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10160288 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcattcgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 10160190  T
Q  212 tgtgggggagtttgatg 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  10160189 tatgggggagtttgatg 10160173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13187632 - 13187418
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13187632 tggacttcacacacacactcacttgaaactcgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 13187533  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13187532 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 13187434  T
Q  212 tgtgggggagtttgat 227  Q
    | ||||||||||||||    
T  13187433 tatgggggagtttgat 13187418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3245795 - 3245589
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  3245795 acacacatactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 3245696  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3245695 gagacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 3245596  T
Q  221 gtttgat 227  Q
    |||||||    
T  3245595 gtttgat 3245589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Original strand, 2721305 - 2721511
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |  ||||| |||||    
T  2721305 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaattaaaagcctttgag 2721404  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| | ||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2721405 gagacataagttttaattgaattgtcatattataatcttgtttatgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt-gggga 2721503  T
Q  221 gtttgatg 228  Q
    ||||||||    
T  2721504 gtttgatg 2721511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 4382751 - 4382961
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  4382751 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 4382850  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtt-tatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||   |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4382851 aggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttctatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 4382950  T
Q  218 ggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||    
T  4382951 ggagtttgatg 4382961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13001634 - 13001425
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||    
T  13001634 acacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttga 13001535  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgttt-atgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13001534 ggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 13001435  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  13001434 gagtttgatg 13001425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 13097711 - 13097919
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  13097711 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 13097810  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||    |||   |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13097811 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaaatgtggggg 13097910  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  13097911 agtttgatg 13097919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 1992803 - 1993011
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  1992803 cacacacacactcacttgaaatttgattgttgagttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 1992902  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | | |    
T  1992903 ggagacataagttttaatttaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgagcataagcaaagattcaagtgggagag 1993002  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  1993003 agtttgatg 1993011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20156722 - 20156515
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  ||  ||||| ||||    
T  20156722 cacacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagtttacaagaaatgcttgagcttgtgattagtgtaaaattgaaataaaagcctttga 20156623  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||| |   |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20156622 ggagacatgagttttaatttaattgtcatatgattatcttgtttatgctaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagc-aagattcaagtgtggggg 20156524  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  20156523 agtttgatg 20156515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10547148 - 10546936
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaa--attacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccct 116  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |    
T  10547148 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctt 10547049  T
Q  117 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgttt-atgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 215  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||||||| |||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10547048 tgaggagacatgtgcttcgaattaattgtcatatgataatatcgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 10546949  T
Q  216 ggggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||||    
T  10546948 ggggagtttgatg 10546936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 13690608 - 13690816
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||| ||||    
T  13690608 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtggacacttgaaattaaagcctttga 13690707  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  13690708 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatgaaataatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgatgacaactaaagattcaagtgtggggg 13690807  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  13690808 agtttgatg 13690816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 11398215 - 11398424
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||   ||  ||||| ||||    
T  11398215 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttatgattagtgtacgctttaaataaaagcctttga 11398314  T
Q  120 ggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
     |||||||  | ||| |||||||||||| | || |||   |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11398315 agagacataagttttcaattgaattgtcgtatgttaatcttgtttatgctgctatatttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtgggg 11398414  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  11398415 gagtttgatg 11398424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14348797 - 14348588
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  14348797 cacacacacactcacttagaacttgattgtttggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 14348698  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaac-tgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    |||||||   | ||||||||||||||||| || |||  | || ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14348697 ggagacacaagttttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgttaccatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 14348598  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  14348597 gagtttgatg 14348588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 22637702 - 22637908
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | |||||||    
T  22637702 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaattgcttaagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgagga 22637801  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactg-tttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    | |||  | ||||||||||||||||| ||||||   || |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22637802 ggcataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgttttatgctaccatgttgatgccttttgcttgagcacaagtaaagattcaagtgtaggggag 22637901  T
Q  222 tttgatg 228  Q
    |||||||    
T  22637902 tttgatg 22637908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Original strand, 3279191 - 3279399
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||  ||| | |||||    
T  3279191 acacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgttcgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagtctttgag 3279290  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataa-aactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||||   | ||||||| ||||||||| || |||  | |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3279291 gagacacaagttttaatttaattgtcatatgttaagtattgtttatgttgctatgtctatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtggggg 3279390  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  3279391 agtttgatg 3279399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 17387839 - 17388045
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    |||  ||  ||||| |||||||    
T  17387839 acacacactcactttaaacttgattgttgggttgaataaagatttcaagaattgcttgagtttgtgattagtgtgtgcttgaaataaaagcctttgagga 17387938  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgttt-atgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    || ||  | ||||||||||||||||  ||||||   ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17387939 gatataagttttaattgaattgtcacatgataatcttgttttatgctaccatgttgatgccttttgcttaaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 17388038  T
Q  222 tttgatg 228  Q
    |||||||    
T  17388039 tttgatg 17388045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12160416 - 12160207
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||  ||  || |  |||    
T  12160416 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaa-aagaattacaagaaatgcttgagttttttattagtgtactctttgaaataaaaacatttg 12160318  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaact-gtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||   |  ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12160317 aggagacatgttctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgccaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 12160218  T
Q  218 ggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||    
T  12160217 ggagtttgatg 12160207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 17045697 - 17045902
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||    | ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||  ||  |||    
T  17045697 tggacttcacacacacactcacttggaatttgtt-gttgggttgaataggt-tcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacacttgaaata-aag 17045793  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    || ||||||||||||  | ||| |||||||||||||| || |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045794 cctttgaggagacataagtttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctactatttttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 17045893  T
Q  212 tgtggggga 220  Q
    |||||||||    
T  17045894 tgtggggga 17045902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 17047857 - 17048062
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||    | ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||  ||  |||    
T  17047857 tggacttcacacacacactcacttggaatttgtt-gttgggttgaataggt-tcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacacttgaaata-aag 17047953  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    || ||||||||||||  | ||| |||||||||||||| || |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17047954 cctttgaggagacataagtttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctactatttttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 17048053  T
Q  212 tgtggggga 220  Q
    |||||||||    
T  17048054 tgtggggga 17048062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 16655798 - 16655897
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16655798 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 16655897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27356784 - 27356728
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356784 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27356728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 228
Target Start/End: Original strand, 13601220 - 13601277
Alignment:
Q  171 tatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13601220 tatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13601277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20225960 - 20225754
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||    | ||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||    
T  20225960 cacacacacacttacttgaaacttgtt-gctgggttgaataggt-tcacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacacttgaaata-aagcctttga 20225864  T
Q  120 ggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||  | ||| |||||  ||||||| || |||   | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  20225863 ggagacataagtttttaattgttttgtcatatgttaatcttatttatgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaaacaaagatttaagtatgggg 20225764  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  20225763 gagtttgatg 20225754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3339282 - 3339226
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3339282 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 3339226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12776590 - 12776534
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12776590 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 12776534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13136266 - 13136210
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13136266 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13136210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 20584262 - 20584318
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20584262 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20584318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 228
Target Start/End: Original strand, 15946773 - 15946824
Alignment:
Q  177 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15946773 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15946824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14445826 - 14445768
Alignment:
Q  170 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14445826 ctatgtctatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14445768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15619339 - 15619283
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15619339 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggcagtttgatg 15619283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8686457 - 8686387
Alignment:
Q  159 tgtttatgctactat-gtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8686457 tgtttatgctgctattgtttatgctttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 8686387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13195514 - 13195458
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13195514 atgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgtgggagtttgatg 13195458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 228
Target Start/End: Original strand, 13068306 - 13068357
Alignment:
Q  177 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13068306 tatgtcttttggttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13068357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 228
Target Start/End: Original strand, 2005499 - 2005530
Alignment:
Q  197 aagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2005499 aagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 2005530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Original strand, 13601062 - 13601108
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13601062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 13601108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12776739 - 12776660
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||  | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  12776739 cacacacacactcacttgagacttg-ttgttgggttgaat-aagttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 12776660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 101
Target Start/End: Original strand, 15946619 - 15946698
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | || |||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15946619 cacacacacactcacttgagatttgtt-gtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacatt 15946698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 16703307 - 16703363
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  16703307 atgtttataccttttgctttaggttaagcaaagattcaagcatggaggagtttgatg 16703363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 123369 - 123584
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123369 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 123468  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123469 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 123568  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  123569 gtgggggagtttgatg 123584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 77433 - 77391
Alignment:
Q  185 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 227  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  77433 ttgcttgaggacaagcaatggttcaagtgtaggggagtttgat 77391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 9582893 - 9583108
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9582893 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 9582992  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9582993 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 9583092  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  9583093 gtgggggagtttgatg 9583108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16120064 - 16119849
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16120064 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 16119965  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16119964 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgtttgtgctactatgtatatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16119865  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  16119864 gtgggggagtttgatg 16119849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 23515067 - 23515278
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515067 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23515166  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515167 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23515266  T
Q  213 gtgggggagttt 224  Q
    ||||||||||||    
T  23515267 gtgggggagttt 23515278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 14551098 - 14551314
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaa-attacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551098 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 14551197  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551198 gcccttgaggggacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 14551297  T
Q  212 tgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  14551298 tgtgggggagtttgatg 14551314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 8717865 - 8718080
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8717865 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacacttgggatttaag 8717964  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8717965 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactattggtgctactatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 8718064  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  8718065 gtgggggagtttgatg 8718080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 13673856 - 13674071
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13673856 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaaaaaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13673955  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13673956 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13674055  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
     |||||||||||||||    
T  13674056 atgggggagtttgatg 13674071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18593567 - 18593352
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18593567 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagattccaagaaatacttgagtttgtaattagtgtacattttggatttaag 18593468  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18593467 cccttgaggagacatgtactttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 18593368  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
     |||||||||||||||    
T  18593367 atgggggagtttgatg 18593352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 18618117 - 18618332
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18618117 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagattccaagaaatacttgagtttgtaattagtgtacattttggatttaag 18618216  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18618217 cccttgaggagacatgtactttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 18618316  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
     |||||||||||||||    
T  18618317 atgggggagtttgatg 18618332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 4312564 - 4312772
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  4312564 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 4312663  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4312664 ggagacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 4312763  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  4312764 agtttgatg 4312772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 538964 - 538755
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaa-tgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || |||||     
T  538964 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaaaaaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaaacccttc 538865  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  538864 aggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 538765  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  538764 gagtttgatg 538755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8781146 - 8780936
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||    
T  8781146 cacacacacactaccttgaaacttgattgttgggttgaataaaggttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcctttga 8781047  T
Q  120 ggagacat--gtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    ||||||||  ||  ||||||||||||||||| || |||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8781046 ggagacataagttttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctgctatgtttatgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 8780947  T
Q  218 ggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||    
T  8780946 ggagtttgatg 8780936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 226
Target Start/End: Original strand, 9003958 - 9004165
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  9003958 cacacatacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagatcacaagaaatgcttgagtttgtaattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 9004057  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgttt-atgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9004058 ggagacataagttttaattgaattgtcatatgataaacttgttttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtgggg 9004157  T
Q  219 gagtttga 226  Q
    ||||||||    
T  9004158 gagtttga 9004165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 12567020 - 12567229
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  12567020 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgtttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 12567119  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactg-tttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||| | || ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12567120 ggagacatgagttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgttctaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtgggg 12567219  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  12567220 gagtttgatg 12567229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 20108375 - 20108584
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  20108375 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 20108474  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactg-tttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||  | |||||||||||| |||| ||||||   || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20108475 ggagacatcagttttaattgaattctcatatgataaccttgttttatgctactatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgggg 20108574  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  20108575 gagtttgatg 20108584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12549012 - 12548805
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||| |||||||||||    
T  12549012 acacacacactcacttgaagcttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtggacgcttgaaattgaagcccttgag 12548913  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaact-gtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| | |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12548912 gagacatgt-atttaattaaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttgggg 12548814  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  12548813 agtttgatg 12548805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 48801983 - 48801777
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||    
T  48801983 acacacatactcactttttacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaattaaagcctttgag 48801884  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgttta-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48801883 gagacatgagttttgattgaattgtcatat-ataatcttgtttattgctactatgtgtatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 48801785  T
Q  220 agtttgat 227  Q
    ||||||||    
T  48801784 agtttgat 48801777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9265145 - 9264939
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | |||||||    
T  9265145 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgagga 9265046  T
Q  123 gacatgtg-ctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||  |  ||| ||||||||||||| || |||   || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9265045 gacataagttttttattgaattgtcatatgttaatcttgcttatgctgctatgtttatgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 9264946  T
Q  222 tttgatg 228  Q
    |||||||    
T  9264945 tttgatg 9264939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 13657873 - 13658081
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  13657873 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggtggaaaagggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 13657972  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||    |||   |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13657973 ggagatatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttacgctaccatgttgatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 13658072  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  13658073 agtttgatg 13658081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11921512 - 11921307
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  11921512 cacacacacactcacttaggactagattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgcgtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 11921413  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||   ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11921412 aggagacgtgtgctttaatgtaattgtcatgtg---aaaatg-ttatgctaccatgtttatgacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 11921317  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  11921316 gagtttgatg 11921307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 16532100 - 16532311
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcg-ttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa-gccctt 117  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || | | | || ||| ||    
T  16532100 cacacacacactcaattaagacttgattgattgggttgaaaaaaggttataagaaatacttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgccttt 16532199  T
Q  118 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgttt-atgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 216  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||   | ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16532200 gaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgaaaatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 16532299  T
Q  217 gggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||    
T  16532300 gggagtttgatg 16532311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16633562 - 16633351
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcg-ttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa-gccctt 117  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || | | | || ||| ||    
T  16633562 cacacacacactcaattaagacttgattgattgggttgaaaaaaggttataagaaatacttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgccttt 16633463  T
Q  118 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgttt-atgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 216  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||   | ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16633462 gaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgaaaatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 16633363  T
Q  217 gggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||    
T  16633362 gggagtttgatg 16633351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16465821 - 16465616
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccctt- 117  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||  | ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||     
T  16465821 cacacacacactcacttaggactagactgatgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttt 16465722  T
Q  118 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||| |||| ||||||  | |||||||  || |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16465721 gaggagacgtgtgttttaatgtatttgtcat--gagaaa--tgtt-atgctactatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 16465627  T
Q  218 ggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||    
T  16465626 ggagtttgatg 16465616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4461311 - 4461242
Alignment:
Q  159 tgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4461311 tgtttatgctgccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 4461242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 825783 - 825839
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  825783 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 825839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14221774 - 14221718
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14221774 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14221718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15916832 - 15916776
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15916832 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15916776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 18287761 - 18287817
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18287761 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18287817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 27291496 - 27291552
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27291496 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27291552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15206647 - 15206584
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15206647 tgctgctatgtctatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15206584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Original strand, 5397273 - 5397331
Alignment:
Q  170 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5397273 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggagtttgatg 5397331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 15065935 - 15065984
Alignment:
Q  179 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15065935 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15065984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9194597 - 9194544
Alignment:
Q  175 tttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9194597 tttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgggggagtttgatg 9194544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6713124 - 6713072
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6713124 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtataggggagttt 6713072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4791478 - 4791383
Alignment:
Q  132 tttaattgaattgtcatttgataaaactgtttat-gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 227  Q
    ||||||||||||||||| || |||  || ||||| ||| | |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4791478 tttaattgaattgtcatatgttaat-ctttttattgctgccatgtctatgcattctgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 4791383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 227
Target Start/End: Original strand, 15348532 - 15348587
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15348532 atgtttatgccttttacttgaggacaaacaaagattcaagtttggggaagtttgat 15348587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 212
Target Start/End: Original strand, 15522504 - 15522557
Alignment:
Q  160 gtttatgctacta-tgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15522504 gtttatgctgctaatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagt 15522557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 227
Target Start/End: Original strand, 15940731 - 15940773
Alignment:
Q  185 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 227  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  15940731 ttgcttgaggacaagcaacggttcaagtgtaggggagtttgat 15940773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 101
Target Start/End: Original strand, 15065779 - 15065858
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | || |||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15065779 cacacacacactcacttgagatttgtt-gtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacatt 15065858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 101
Target Start/End: Original strand, 18287612 - 18287691
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 101  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18287612 cacacagacactcacttgaaatttgtt-gtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacatt 18287691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 15699555 - 15699770
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699555 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 15699654  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699655 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15699754  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  15699755 gtgggggagtttgatg 15699770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22165764 - 22165549
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165764 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22165665  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165664 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22165565  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  22165564 gtgggggagtttgatg 22165549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 22243812 - 22244027
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243812 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22243911  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243912 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22244011  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  22244012 gtgggggagtttgatg 22244027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22061718 - 22061503
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061718 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22061619  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061618 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22061519  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
     |||||||||||||||    
T  22061518 atgggggagtttgatg 22061503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 20170242 - 20170458
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20170242 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 20170341  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttga-taaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20170342 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 20170440  T
Q  211 gtgtgggggagtttgatg 228  Q
    || |||||||||||||||    
T  20170441 gtatgggggagtttgatg 20170458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24855453 - 24855245
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24855453 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttg 24855354  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24855353 aggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 24855255  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  24855254 gagtttgatg 24855245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22767331 - 22767116
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22767331 tggacttcacacacactctcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 22767232  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22767231 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgttactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 22767133  T
Q  212 tgtgggggagtttgatg 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  22767132 tatgggggagtttgatg 22767116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 23023093 - 23023302
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  23023093 cacacgcacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 23023192  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgt-ttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23023193 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttatgctaccatgtttaagacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 23023292  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  23023293 gagtttgatg 23023302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20107989 - 20107784
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  20107989 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagcctttga 20107890  T
Q  120 ggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||  | ||| |||||||||||||| || | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20107889 ggagacataagttttcaattgaattgtcatatgtttatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 20107790  T
Q  219 gagttt 224  Q
    ||||||    
T  20107789 gagttt 20107784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 25625691 - 25625899
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||| |    
T  25625691 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttaa 25625790  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25625791 ggagacatatgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttacaccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtatggggg 25625890  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  25625891 agtttgatg 25625899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 18448140 - 18448349
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  18448140 cacacacacagtcacttgaaacttgactgttgggatgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 18448239  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactg-tttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | || ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18448240 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccaagtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 18448339  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  18448340 gagtttgatg 18448349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Original strand, 18854026 - 18854226
Alignment:
Q  28 cactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacat 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||| ||||||||||||||||||    
T  18854026 cactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgctggaaattaaagcccttgaggagacat 18854125  T
Q  128 gtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 227  Q
    |||  |||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18854126 gtgtattaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatgggggagtttgat 18854225  T
Q  228 g 228  Q
    |    
T  18854226 g 18854226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 2181063 - 2181269
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |  | |  |||||||||||||||||    
T  2181063 acacacactcacttgaaacttggttgttgagttgaataaggattacgagaaatgcttaagtttgtgattaatgtgcgctcgaaatttaagcccttgagga 2181162  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgttta-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2181163 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 2181262  T
Q  222 tttgatg 228  Q
    |||||||    
T  2181263 tttgatg 2181269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21560762 - 21560554
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  21560762 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 21560663  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||    |||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21560662 ggagacatgtgttttaattaaattgacatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggg 21560563  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  21560562 agtttgatg 21560554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25631477 - 25631269
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||| ||||    
T  25631477 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttga 25631378  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgttta-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
     |||| ||  | ||||||||||||||||| | ||||   |||||| |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25631377 agagatataagttttaattgaattgtcatat-ataatcttgtttattgctaccatgtttatgcatttttcctgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25631279  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  25631278 gagtttgatg 25631269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Original strand, 29595697 - 29595904
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||  ||| ||||||||| |    
T  29595697 acacacacagtcatttgaaacttgattattgggttgaaaaaggattacaagaaatgtttgagttttttattagtgtacacttgaaattaaagcccttggg 29595796  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||   | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29595797 gagacatgtgttttaattaaatcgtcatgtgataatcttatttatgctaccatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgaggga 29595896  T
Q  221 gtttgatg 228  Q
    ||||||||    
T  29595897 gtttgatg 29595904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 25963248 - 25963457
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  25963248 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattaaaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 25963347  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaact-gtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    |||||||     ||||||||||||||||| || |||  || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25963348 ggagacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25963447  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  25963448 gagtttgatg 25963457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 25967895 - 25968104
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  25967895 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattaaaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 25967994  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaact-gtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    |||||||     ||||||||||||||||| || |||  || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25967995 ggagacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25968094  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  25968095 gagtttgatg 25968104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30672011 - 30671807
Alignment:
Q  25 acacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggaga 124  Q
    ||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||| ||| |    
T  30672011 acacactcaattagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttggggaaa 30671912  T
Q  125 catgtgctttaattgaattgtcatttgataaaact-gtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtt 223  Q
    ||     ||||||||||||||||| || |||  || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30671911 cacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtt 30671812  T
Q  224 tgatg 228  Q
    |||||    
T  30671811 tgatg 30671807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19585750 - 19585571
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||  ||||| || |    
T  19585750 cacatacacactcacttaaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgtgtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcctttta 19585651  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtt-tatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaag 199  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| || |||   |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19585650 ggagacatgagttttaattgtattgtcatatg-taatcttgttctatgctgctatgtatatgccttttgcttgaggacaag 19585571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 20016443 - 20016339
Alignment:
Q  14 ggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaag 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  20016443 ggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttggatagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgcaattagtgtacattttgggatttaag 20016344  T
Q  113 ccctt 117  Q
    |||||    
T  20016343 ccctt 20016339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18184943 - 18184874
Alignment:
Q  159 tgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18184943 tgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 18184874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20219048 - 20218981
Alignment:
Q  161 tttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20219048 tttatgctgctatgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggagtttgatg 20218981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22113073 - 22113006
Alignment:
Q  161 tttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22113073 tttatgctgctatgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggagtttgatg 22113006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 228
Target Start/End: Original strand, 35270971 - 35271028
Alignment:
Q  171 tatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35270971 tatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggtgtttgatg 35271028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 18731868 - 18731931
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18731868 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagctaagattcaagtgtggaggagtttgatg 18731931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 11204004 - 11204060
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11204004 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatatttaagtgtgggggagtttgatg 11204060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 228
Target Start/End: Original strand, 29686587 - 29686657
Alignment:
Q  159 tgtttatgctacta-tgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29686587 tgtttatgctgctaatgtttatgcctcttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatgggagagtttgatg 29686657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23517887 - 23517835
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23517887 atgtgtatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtatgggggagttt 23517835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 29686449 - 29686489
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29686449 cacacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaata 29686489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20596046 - 20595831
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20596046 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20595947  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595946 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20595847  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  20595846 gtgggggagtttgatg 20595831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20602332 - 20602117
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602332 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20602233  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602232 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20602133  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  20602132 gtgggggagtttgatg 20602117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20608623 - 20608408
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608623 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20608524  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608523 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20608424  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  20608423 gtgggggagtttgatg 20608408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 15735534 - 15735749
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15735534 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacacttgggatttaag 15735633  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735634 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15735733  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  15735734 gtgggggagtttgatg 15735749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 23748051 - 23748266
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23748051 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23748150  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23748151 cccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23748250  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
     |||||||||||||||    
T  23748251 atgggggagtttgatg 23748266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23710892 - 23710701
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23710892 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23710793  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23710792 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaa 23710701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 24940540 - 24940749
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24940540 cacacactcactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtttacattttgggatttaagcccttg 24940639  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24940640 aggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 24940739  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  24940740 gagtttgatg 24940749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 18072900 - 18073115
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18072900 tggacttcacacacacactcacttgaaacttaattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 18072999  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18073000 gcccttgaggagacatgtgctttaattga-ttgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 18073098  T
Q  212 tgtgggggagtttgatg 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  18073099 tatgggggagtttgatg 18073115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24953389 - 24953174
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24953389 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 24953290  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24953289 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttataccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 24953191  T
Q  212 tgtgggggagtttgatg 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  24953190 tatgggggagtttgatg 24953174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Original strand, 20622170 - 20622359
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622170 acacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 20622269  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622270 gagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaattgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 20622359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20790929 - 20790714
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20790929 tggacttcacacacacactcgcttgaaacttgattgttaggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 20790830  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20790829 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 20790731  T
Q  212 tgtgggggagtttgatg 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  20790730 tatgggggagtttgatg 20790714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23600845 - 23600636
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||    
T  23600845 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttga 23600746  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgt-ttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23600745 ggagacatgtgttctaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 23600646  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    || |||||||    
T  23600645 gaatttgatg 23600636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 24219752 - 24219961
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  24219752 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 24219851  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactg-tttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24219852 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaagtgtgggg 24219951  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  24219952 gagtttgatg 24219961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20445048 - 20444843
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  20445048 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 20444949  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaact-gtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | |  ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20444948 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaatcaaagattcaagtgtgggg 20444849  T
Q  219 gagttt 224  Q
    ||||||    
T  20444848 gagttt 20444843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 228
Target Start/End: Original strand, 21387410 - 21387605
Alignment:
Q  34 cttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctt 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | ||||||||||||  | ||    
T  21387410 cttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagtctttgaggagacataagttt 21387509  T
Q  134 t-aattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    | |||||||||||||| || ||    ||| | |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21387510 tcaattgaattgtcatatgttagtcttgtgtgtgctgctatgtttatgcatttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21387605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20916660 - 20916456
Alignment:
Q  24 cacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggag 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||||||    
T  20916660 cacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagttcgtgattagtgtacggttgaaataaaagcctttgaggag 20916561  T
Q  124 acatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaact-gtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagt 222  Q
    ||||| | ||| ||| ||||||| | || |||   |  |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||    
T  20916560 acatgagttttgatttaattgtcctatg-taatcttattttatgcagctatgtctatgccttttgcttgaggacaaccaaaaattcatgtgtaggggagt 20916462  T
Q  223 ttgatg 228  Q
    ||||||    
T  20916461 ttgatg 20916456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 22948518 - 22948688
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||| ||||    
T  22948518 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttga 22948617  T
Q  120 ggagacatgtg-ctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgct 189  Q
    | | ||||  |  ||||||||||||||||| || |||   |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22948618 gaaaacataagtttttaattgaattgtcatatgttaatcgtgtttatgctgccatgtttatgccttttgct 22948688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 20575510 - 20575680
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  20575510 acacacgcactcacttgaaacttgattgtcgggttgaataaagactacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 20575609  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactg-tttatgctactatgtttatgccttttgcttg 191  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| ||| || |||   || |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20575610 gagacatgagttttgattgaattgccatatg-taatcttgttttatgctgctatgtctatgccttttgcttg 20575680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22317569 - 22317513
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22317569 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22317513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25006864 - 25006808
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25006864 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25006808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30759711 - 30759655
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759711 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 30759655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18484275 - 18484212
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18484275 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttggggagtttgatg 18484212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 178 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25116221 - 25116171
Alignment:
Q  178 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25116221 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25116171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 26847803 - 26847859
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26847803 atgtctatgccttttggttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 26847859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25175306 - 25175261
Alignment:
Q  183 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175306 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25175261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 224
Target Start/End: Original strand, 22855723 - 22855775
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 224  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22855723 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 22855775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Original strand, 27270563 - 27270607
Alignment:
Q  183 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 227  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27270563 ttttgcttgaggacaagcaatgattcaagtgtgggggagtttgat 27270607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 22317719 - 22317639
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 101  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||  | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  22317719 cacacacacactcacttaagacttgtt-gttgggttgaataaagttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 22317639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 17412736 - 17412784
Alignment:
Q  179 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 227  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17412736 tgccttttgcttgacgacaaacaatgattcaagtatgggggagtttgat 17412784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 101
Target Start/End: Original strand, 22855572 - 22855651
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 101  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||   ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  22855572 cacacacacactcacttaagacttgtt-gttgggttgaataagt-ttacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 22855651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 25007012 - 25006934
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||   ||||||| |||||||||  || |||||||||||||||    
T  25007012 acacacacactcacttgaaatttgtt-gtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttatgattagtgtacatt 25006934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11496829 - 11496614
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496829 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 11496730  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496729 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 11496630  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  11496629 gtgggggagtttgatg 11496614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 13822913 - 13823128
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13822913 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13823012  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13823013 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13823112  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  13823113 gtgggggagtttgatg 13823128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42709940 - 42709731
Alignment:
Q  19 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42709940 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgagatttaagcccttg 42709841  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42709840 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 42709741  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  42709740 gagtttgatg 42709731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Original strand, 15254349 - 15254563
Alignment:
Q  14 ggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagc 113  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15254349 ggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattttggatttaaac 15254448  T
Q  114 ccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtg 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15254449 ccttaaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgcaactacgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtg 15254548  T
Q  214 tgggggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||||||    
T  15254549 tgggggagtttgatg 15254563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Original strand, 10630758 - 10630965
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||    
T  10630758 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgag 10630857  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgt-ttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10630858 gagacatgtgctttaattaaattgtcatatgataata-tgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 10630956  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  10630957 agtttgatg 10630965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 3354646 - 3354855
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  3354646 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 3354745  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactg-tttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3354746 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaactattcaagtgtgggg 3354845  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  3354846 gagtttgatg 3354855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Original strand, 18291945 - 18292153
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  18291945 acacacacgctcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgactttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgag 18292044  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactg-tttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | || ||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18292045 gagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgcctttttcttgtggacaagcaaagattcaagtgtggggg 18292144  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  18292145 agtttgatg 18292153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18081669 - 18081459
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  18081669 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 18081570  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtt-tatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||   |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18081569 aggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttctatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 18081470  T
Q  218 ggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||    
T  18081469 ggagtttgatg 18081459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17485118 - 17484910
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  |||||| ||||    
T  17485118 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcccctgag 17485019  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactg-tttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    |||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||   || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17485018 gagacataagttttaattaaattgtcatgtgataatcttgttttatgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 17484919  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  17484918 agtttgatg 17484910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45234441 - 45234232
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  45234441 cacacacacactcacttgaaacttgatagttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattactgtacgcttgaaataaaagcctttga 45234342  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactg-tttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||   || ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45234341 ggagacattagttttaatttaattgtcatatgataatcttgttttatgccaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtctgggg 45234242  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  45234241 gagtttgatg 45234232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 56580748 - 56580539
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||| | |||||||   ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||    
T  56580748 acacacacactcacttaagacttgatttatgggttgaaaaatgattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttga 56580649  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaact-gtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||   |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56580648 ggagacatgtgctttaatttaattgtcagatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 56580549  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  56580548 gagtttgatg 56580539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Original strand, 38426745 - 38426938
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  38426745 acacacacactcacttgaaacttgattgttggcttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgag 38426844  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||       |||       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38426845 gagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataa-------tat-------tatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 38426930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8092634 - 8092427
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| || | ||    
T  8092634 acacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttaatga 8092535  T
Q  123 gacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgataaaactgttta-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    |||||  | ||| | |||||||||| | |  |||   |||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  8092534 gacataagttttcagttgaattgtcgtatattaatcttgtttattgttactatgtttatgtctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggaaa 8092435  T
Q  221 gtttgatg 228  Q
    ||||||||    
T  8092434 gtttgatg 8092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14654061 - 14653998
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14654061 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14653998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 226
Target Start/End: Original strand, 15865647 - 15865701
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15865647 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 15865701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 10650547 - 10650603
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10650547 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 10650603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15260165 - 15260109
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15260165 atgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15260109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 16682913 - 16682969
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16682913 atgtctatgccttttgcttgatgacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 16682969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 228
Target Start/End: Original strand, 15409534 - 15409585
Alignment:
Q  177 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15409534 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattctagtgtgggggagtttgatg 15409585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9488948 - 9488878
Alignment:
Q  159 tgtttatgctacta-tgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9488948 tgtttatgctgctaatgttcatgccttttgcttgaggacaagcaaagattgaagtatgggggagtttgatg 9488878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17296298 - 17296250
Alignment:
Q  179 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17296298 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcatgggggagtttgat 17296250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 15260312 - 15260235
Alignment:
Q  22 cacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15260312 cacacacactcacttgaaatttgtt-gtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacatt 15260235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 12515042 - 12515081
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12515042 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 12515081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 22665062 - 22665277
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22665161  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665162 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22665261  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  22665262 gtgggggagtttgatg 22665277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 117543 - 117758
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117543 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 117642  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  117643 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgagctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatatgcaagt 117742  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  117743 gtgggggagtttgatg 117758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22044875 - 22044660
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044875 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22044776  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044775 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22044676  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
     |||||||||||||||    
T  22044675 atgggggagtttgatg 22044660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 25357511 - 25357726
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357511 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 25357610  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357611 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 25357710  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
     |||||||||||||||    
T  25357711 atgggggagtttgatg 25357726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11823 - 11615
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11823 cacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 11724  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11723 ggagatatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgagctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagaggcaagtgtggggg 11624  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  11623 agtttgatg 11615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 16775651 - 16775866
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775651 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 16775750  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775751 cccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16775850  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
     |||||||||||||||    
T  16775851 atgggggagtttgatg 16775866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24795500 - 24795285
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795500 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 24795401  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795400 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgctgatggtactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 24795301  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
     |||||||||||||||    
T  24795300 atgggggagtttgatg 24795285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 17590407 - 17590622
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17590407 tggacttcacatacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaatagagatttccagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 17590506  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17590507 cccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgctgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 17590606  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
     |||||||||||||||    
T  17590607 atgggggagtttgatg 17590622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 27627580 - 27627796
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttg-ggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  27627580 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattaatgtacattttaggatttaa 27627679  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27627680 gcccttgaggagacatgtgctttaattaatttgtcatttgattcaactgtcgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 27627779  T
Q  212 tgtgggggagtttgatg 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  27627780 tatgggggagtttgatg 27627796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25144966 - 25144757
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  25144966 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 25144867  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactg-tttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25144866 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25144767  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  25144766 gagtttgatg 25144757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5500473 - 5500265
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  5500473 acacacacactcacttgaaacttgattgttgagttgaataaggtttacgtgaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgag 5500374  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactg-tttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5500373 gagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 5500274  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  5500273 agtttgatg 5500265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25804475 - 25804267
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||   |  ||||| ||||    
T  25804475 cacacgcacactcacttgaaatttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacgcttgaattaaaagcctttga 25804376  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||| ||||  | ||||||||||||||||| || |||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804375 ggatacataagttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttgtgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 25804276  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  25804275 agtttgatg 25804267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25371091 - 25370890
Alignment:
Q  22 cacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagg 121  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||| ||||| ||||||    
T  25371091 cacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattataagaaatgcttgagtttgtaattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgagg 25370992  T
Q  122 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgttta-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||  ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25370991 agacatgagttttgattgaattgtcatat-ataatcctgtttattgttactatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 25370893  T
Q  221 gtt 223  Q
    |||    
T  25370892 gtt 25370890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23799129 - 23798922
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  23799129 acacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaaggatacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 23799030  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactg-tttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||| || |||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23799029 gagacatgagttttgattgaattgtcatatg-taatcttgttttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggataatcaaagattcaagtgtggggg 23798931  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  23798930 agtttgatg 23798922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 23643950 - 23644160
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacat-ttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||| ||| ||||| | ||||||| || |||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| |||    
T  23643950 cacacacgcacccacttaagacttgattgtagggttgaaaaaggattacaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtactccttgaaataaaagcctttg 23644049  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaact-gtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   |  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23644050 aggagacacgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 23644149  T
Q  218 ggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||    
T  23644150 ggagtttgatg 23644160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24178348 - 24178193
Alignment:
Q  74 atgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctacta 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||  ||||||||||||  | ||| |||| ||||||||| ||||||   |||||||||| |||    
T  24178348 atgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcttttgaggagacataagtttttaattaaattgtcatatgataatcttgtttatgctgcta 24178249  T
Q  173 tgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24178248 tgtttatgccttttgtttgaagacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24178193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 148
Target Start/End: Original strand, 24502168 - 24502297
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||  ||||    
T  24502168 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcatttga 24502267  T
Q  120 ggagacatgtg-ctttaattgaattgtcat 148  Q
    ||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  24502268 ggagacataagtttttaattgaattgtcat 24502297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 228
Target Start/End: Original strand, 24506777 - 24506865
Alignment:
Q  140 aattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24506777 aattgtcatatgataatcttgtttatgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24506865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23159441 - 23159385
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23159441 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23159385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23570698 - 23570642
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23570698 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23570642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 27631655 - 27631711
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27631655 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27631711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27768872 - 27768816
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27768872 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27768816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 228
Target Start/End: Original strand, 24171510 - 24171561
Alignment:
Q  177 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24171510 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24171561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 159 - 224
Target Start/End: Original strand, 24321314 - 24321380
Alignment:
Q  159 tgtttatgctacta-tgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 224  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24321314 tgtttatgctactaatgtttacgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagttt 24321380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25337720 - 25337651
Alignment:
Q  159 tgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25337720 tgtttatgctgctatatttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggaatttgatg 25337651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23257625 - 23257570
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23257625 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtat-ggggagtttgatg 23257570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 23648123 - 23648165
Alignment:
Q  167 ctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattca 209  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23648123 ctactatgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattca 23648165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 101
Target Start/End: Original strand, 27631506 - 27631585
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27631506 cacacacacactcacttgaaatttgtt-gtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacatt 27631585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 227
Target Start/End: Original strand, 29955868 - 29955913
Alignment:
Q  182 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  29955868 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatcgggaagtttgat 29955913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19805662 - 19805618
Alignment:
Q  183 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 227  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  19805662 ttttgcttgaggacaagcaatggttctagtgtgggggagtttgat 19805618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21512615 - 21512567
Alignment:
Q  179 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  21512615 tgccttttgcttgaggacaagcaaggattcaagcatgggggaatttgat 21512567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24019123 - 24019068
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 227  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24019123 atgtttatgtcttttgtttgaggacaaaaaaagattcaagtatgggggaatttgat 24019068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17334648 - 17334606
Alignment:
Q  185 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 227  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17334648 ttgcttgaggacaatcaatggttcaagtgtgggggagtttgat 17334606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 15532753 - 15532792
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15532753 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 15532792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24019267 - 24019228
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24019267 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 24019228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 27046874 - 27047089
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046874 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 27046973  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046974 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggagctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 27047073  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  27047074 gtgggggagtttgatg 27047089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17094816 - 17094601
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17094816 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaagatttcaagaaatgcttaagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 17094717  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17094716 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgaattaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 17094617  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  17094616 gtgggggagtttgatg 17094601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21798878 - 21798662
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21798878 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaaaatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21798779  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21798778 cccttgaggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 21798679  T
Q  212 tgtgggggagtttgatg 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  21798678 tatgggggagtttgatg 21798662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 20237456 - 20237671
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20237456 tggacttcacacaaacactcacttaaagcttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtggttagtgtacatttgggatttaag 20237555  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20237556 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattatttgtgctactgcatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20237655  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  20237656 gtgggggagtttgatg 20237671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Original strand, 8653126 - 8653327
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||| |||||||    
T  8653126 acacacacacacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgagga 8653225  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgttta-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| | ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8653226 gacatgagttttgattgaattgtcatat-ataatcttgtttattgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 8653324  T
Q  222 ttt 224  Q
    |||    
T  8653325 ttt 8653327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 52938830 - 52938621
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  52938830 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttga 52938731  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgttt-atgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52938730 ggagacatgtgatttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgattatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 52938631  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  52938630 gagtttgatg 52938621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 3989944 - 3990154
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||  ||||| |||    
T  3989944 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgcactctttgaaataaaagcctttg 3990043  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgttt-atgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3990044 acgagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatggg 3990143  T
Q  218 ggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||    
T  3990144 ggagtttgatg 3990154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Original strand, 19364043 - 19364244
Alignment:
Q  27 acactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagaca 126  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||||||||    
T  19364043 acactcacttagaactggattgttgggttgaataaagactacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagaca 19364142  T
Q  127 tgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactg-tttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 225  Q
    || | ||| ||||||||||||| || |||   || |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19364143 tgagttttgattgaattgtcatatg-taatcttgttttatgctgctatgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 19364241  T
Q  226 atg 228  Q
    |||    
T  19364242 atg 19364244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 228
Target Start/End: Original strand, 14070632 - 14070720
Alignment:
Q  140 aattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14070632 aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 14070720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19875702 - 19875648
Alignment:
Q  170 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19875702 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 19875648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21784535 - 21784472
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21784535 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtgggggagtttgatg 21784472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 4027832 - 4027895
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4027832 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagggtgggggagtttgatg 4027895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16382645 - 16382578
Alignment:
Q  159 tgtttatgctacta-tgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 225  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16382645 tgtttatgctgctaatgtttattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttg 16382578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8947578 - 8947515
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8947578 tgctgctatgtctatgtcttttccttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 8947515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21784677 - 21784598
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 101  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||  | ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  21784677 acacacacactcacttaagacttgtt-gttgggttgaataaagttcacaagaaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 21784598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18478276 - 18478234
Alignment:
Q  185 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 227  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  18478276 ttgcttgaggacaagcaatggttcaagtgtaggggagtttgat 18478234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 21382093 - 21382309
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382093 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21382192  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382193 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 21382292  T
Q  212 tgtgggggagtttgatg 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  21382293 tatgggggagtttgatg 21382309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21099009 - 21098794
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21099009 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcattgggttgaataaaaatgacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21098910  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21098909 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 21098810  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  21098809 gtgggggagtttgatg 21098794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21104330 - 21104115
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21104330 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcattgggttgaataaaaatgacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21104231  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21104230 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 21104131  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  21104130 gtgggggagtttgatg 21104115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 23911441 - 23911655
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23911441 tggacttcacacacacactcacttgaaatttgatc-ttgggttgaataaaaattacaagaaatgtttaagtttgtgattagtgtacatctgggatttaag 23911539  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23911540 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgatataactattggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23911639  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
     |||||||||||||||    
T  23911640 atgggggagtttgatg 23911655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 8314467 - 8314683
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8314467 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 8314566  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8314567 cccttgaggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaaatgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 8314666  T
Q  212 tgtgggggagtttgatg 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  8314667 tatgggggagtttgatg 8314683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8323062 - 8322846
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8323062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 8322963  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8322962 gcccttgaggagacatgtgctttaattaatttgtcatttgatttaactgtcgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 8322863  T
Q  212 tgtgggggagtttgatg 228  Q
    | || ||||||||||||    
T  8322862 tatgagggagtttgatg 8322846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21843733 - 21843524
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||||    
T  21843733 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattactgtacgcttgaaatttaagcccttga 21843634  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgt-ttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21843633 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 21843534  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  21843533 gagtttgatg 21843524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21940206 - 21939996
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  21940206 cacacacacactcacttcagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaatgaaagcctttg 21940107  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaact-gtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21940106 aggagacatgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtggg 21940007  T
Q  218 ggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||    
T  21940006 ggagtttgatg 21939996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20039189 - 20038981
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  20039189 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatacttgagtttgtgattattgtacatttgaaattaaagcctttga 20039090  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
     |||||||||   ||| || || |||||| |||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20039089 agagacatgtatcttagttaaaatgtcatgtgatgatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 20038990  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  20038989 agtttgatg 20038981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Original strand, 17620755 - 17620961
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||| |||||    
T  17620755 acacacacactcacttgaaacttgattgttgg-ttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttatgattagggtacacttgaaattaaagcctttgag 17620853  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||    |||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17620854 gagacatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtggggga 17620953  T
Q  221 gtttgatg 228  Q
    ||||||||    
T  17620954 gtttgatg 17620961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16418830 - 16418620
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  16418830 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 16418731  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaact-gtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||   |  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16418730 aggagacatgtgttttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtggg 16418631  T
Q  218 ggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||    
T  16418630 ggagtttgatg 16418620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Original strand, 23454945 - 23455154
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| |||||    
T  23454945 acacacacactcacttgaaacttgattgttggattgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaatgaaagcctttgag 23455044  T
Q  121 gagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt-gggg 218  Q
    |||||||    ||| |||||||||||||| ||  |    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23455045 gagacataaattttcaattgaattgtcatatgtgagtcttgtttatgctactatgtttatgccttttgctcgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 23455144  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  23455145 gagtttgatg 23455154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Original strand, 24034049 - 24034230
Alignment:
Q  49 ttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtca 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||| ||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  24034049 ttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacgcttgaaattaaagcctttgaggagacataagttttcaattgaattgtca 24034148  T
Q  148 tttgataaaact-gtttat-gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    | | || || || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24034149 tat-attaatctcgtttattgctactatgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24034230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14352378 - 14352181
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||||  |||  ||  |||||   |||    
T  14352378 acacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagattacaaagaatgcttgagttagtaattagtgtacgcttgaaataaaagcctcggag 14352279  T
Q  121 gagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||| | || |   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14352278 gagacatgagttttaattttaattgtcatataattatcttgtttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 14352181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 228
Target Start/End: Original strand, 21538573 - 21538765
Alignment:
Q  39 aacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatta--gtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaa 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||  ||||||  |||  ||| ||| | ||||||||||||  | |||||    
T  21538573 aacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaaccctggagtttgtgattatagtgtacgattgaaattaaagtctttgaggagacataagttttaa 21538672  T
Q  137 ttgaattgtcatttgataaaactgttt-atgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  21538673 ttgaattgtcatatgataatcttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaaaatttaagtgtgggggattttgatg 21538765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 228
Target Start/End: Original strand, 20712537 - 20712649
Alignment:
Q  117 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgttta-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 215  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||   |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20712537 tgaggagacatgtgctttgattaaattgtcatatgataatgttgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagatttaagtgta 20712636  T
Q  216 ggggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||||    
T  20712637 ggggagtttgatg 20712649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11347009 - 11346953
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11347009 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 11346953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 19767684 - 19767740
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19767684 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 19767740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 22370102 - 22370158
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22370102 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22370158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 228
Target Start/End: Original strand, 20002279 - 20002330
Alignment:
Q  177 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002279 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20002330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22033611 - 22033555
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22033611 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22033555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22099711 - 22099655
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099711 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22099655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 22102552 - 22102608
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22102552 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggagtttgatg 22102608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 228
Target Start/End: Original strand, 21831181 - 21831232
Alignment:
Q  177 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831181 tatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21831232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 20712470 - 20712539
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtga 89  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20712470 cacacacacactcatttgagacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgattgagtttgtga 20712539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 228
Target Start/End: Original strand, 22817755 - 22817806
Alignment:
Q  177 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22817755 tatgtcttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22817806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18573025 - 18572977
Alignment:
Q  179 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 227  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18573025 tgccttttgcttaaggacaagaaaaaattcaagtatgggggagtttgat 18572977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19902216 - 19902174
Alignment:
Q  185 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 227  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  19902216 ttgcttgaggacaagcaacggttcaagtgtaggggagtttgat 19902174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 101
Target Start/End: Original strand, 22102403 - 22102482
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 101  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | || |||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22102403 cacacacgcactcacttgaaatttgtt-gtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacatt 22102482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 831 - 615
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaa-cttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  831 tggacttcacacacacactcacttaaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 732  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  731 tcccttgaggagacttgtgctttaatcgaattgtgatttgataaaattgtttgtgctaccatatttatgctttttgctttaggacaagcaaagattcaag 632  T
Q  212 tgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  631 tgtgggggagtttgatg 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 1038 - 1253
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1038 tggacttcacacatacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 1137  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1138 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgctgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagt 1237  T
Q  213 gtgggggagtttgatg 228  Q
     |||||||||||||||    
T  1238 atgggggagtttgatg 1253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 228
Target Start/End: Original strand, 3460 - 3524
Alignment:
Q  164 atgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3460 atgctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 220 - 428
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||   ||| ||||||||||    
T  220 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttcagtttgtgattagtgtacgctttaaattaaagcccttga 319  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  320 ggagacatgtattttaattaaattgtcatacgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggg 419  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  420 agtttgatg 428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Original strand, 11064 - 11264
Alignment:
Q  28 cactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacat 127  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||| ||||||||||||||||||    
T  11064 cactcacttgaaacttaatttttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttaaaattaaagcccttgaggagacat 11163  T
Q  128 gtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 227  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11164 gtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 11263  T
Q  228 g 228  Q
    |    
T  11264 g 11264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3058 - 2852
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||| ||||    
T  3058 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacacatgaaattaaagcccttaagga 2959  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactg-tttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2958 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgtgggag 2859  T
Q  222 tttgatg 228  Q
    |||||||    
T  2858 tttgatg 2852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2496 - 2287
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  2496 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttga 2397  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgttt-atgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2396 ggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 2297  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  2296 gagtttgatg 2287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 831 - 1041
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  831 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 930  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactg-tttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  931 aggagacatgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttaatttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 1030  T
Q  218 ggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||    
T  1031 ggagtttgatg 1041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 252079 - 251870
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  252079 cacacacacactcacttggaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgactagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 251980  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactg-tttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| | || ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  251979 ggagacatgtgttttaattaaattgtcaaatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccatttgcttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggg 251880  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  251879 gagtttgatg 251870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14869 - 14662
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||  ||| |||||||||||    
T  14869 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggtttcataaggtttacaagaaatgcttgagtttatgaataatgtacgcttgaaattaaagcccttgag 14770  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14769 gagacatgtgttttaattaaattttcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggga 14670  T
Q  221 gtttgatg 228  Q
    ||||||||    
T  14669 gtttgatg 14662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0773
Description:

Target: scaffold0773; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 482 - 687
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||  |||||||    
T  482 acacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaaaaaatggttgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcttttgagga 581  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagt 222  Q
    |||||    ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  582 gacattaattttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctgctatgtttatacattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagt 681  T
Q  223 ttgatg 228  Q
    ||||||    
T  682 ttgatg 687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 7941 - 8149
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  7941 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgctcgagtttgtgattagtgtacatttgaaattaaagcctttga 8040  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
     |||||||||| |||| || || |||||| | || |   ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8041 agagacatgtgttttagttaaaatgtcatgtaatgatcttgtttatgctaccgtgtttatgccttttgcttgaagacaagcaaagattcaagtgtggggg 8140  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  8141 agtttgatg 8149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Original strand, 120954 - 121162
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  120954 acacacacacacacttggaacttggttgttgggttgaataaggtttacaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgag 121053  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaact-gtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||| | | || | |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121054 gagacatgtgtttcaattaaattgtcatataaaaatattattttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 121153  T
Q  220 agtttgatg 228  Q
    |||||||||    
T  121154 agtttgatg 121162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 1108 - 1318
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  1108 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattaatgtactctttgaaataaaagcctttg 1207  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgttt-atgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    ||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||   | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1208 aggggacatgtgccttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 1307  T
Q  218 ggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||    
T  1308 ggagtttgatg 1318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 58838 - 58628
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||  |||    
T  58838 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatggttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttg 58739  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaact-gtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||   |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58738 aggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 58639  T
Q  218 ggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||    
T  58638 ggagtttgatg 58628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 97936 - 97726
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||  |||    
T  97936 cacacacatactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttg 97837  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaact-gtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||   |  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  97836 aggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtggg 97737  T
Q  218 ggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||    
T  97736 ggagtttgatg 97726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 718 - 510
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  718 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaaggttacaagaaatgtttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 619  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactg-tttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||| ||  | ||| ||||||||||||| || |||   || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  618 ggagatataagttttgattgaattgtcatatg-taatcttgttttatgctactatatttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgggg 520  T
Q  219 gagtttgatg 228  Q
    ||||||||||    
T  519 gagtttgatg 510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 164562 - 164403
Alignment:
Q  70 agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgttta-tgct 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | |||||  ||||    
T  164562 agaaatgcttgagtttgtgattagtgtgcgctttaaattgaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgct 164463  T
Q  169 actatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164462 accatgtttatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 164403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Original strand, 172248 - 172316
Alignment:
Q  159 tgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172248 tgtttatgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 172316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 161995 - 162058
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161995 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 162058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13207 - 13002
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||   ||  ||  ||||| ||||| |    
T  13207 acacgcactcacttgaaacttgattcttgggtttaataaagattacaagaaatgcttgagtatggtattagtgtacgcatgaaataaaagcctttgagaa 13108  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagt 222  Q
    |||||  | |||||||||||| | || ||||||   || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13107 gacataagttttaattgaattattatatgataatcttggttatgctactatgtttatgcctcttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggcggagt 13008  T
Q  223 ttgatg 228  Q
    ||||||    
T  13007 ttgatg 13002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 8720 - 8869
Alignment:
Q  81 agtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgttt-atgctactatgttta 178  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||||||    
T  8720 agtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgttta 8819  T
Q  179 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8820 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 8869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10325 - 10206
Alignment:
Q  110 aagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgt-ttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattc 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10325 aagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattc 10226  T
Q  209 aagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  10225 aagtttgggggagtttgatg 10206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35307 - 35104
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa------ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 116  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||      |||| |  |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| |    
T  35307 acacacactcatttgaaacttcattgttgggttgaaaaaaaaaaaagattaccaagaatgcttgagtttgtgattactgtacacttgaaattaaagcctt 35208  T
Q  117 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 216  Q
      |||||||||||| |||| |||||||||||| |        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35207 aaaggagacatgtgttttagttgaattgtcatct--------tgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaaggaaagattcaagtgtgg 35116  T
Q  217 gggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||    
T  35115 gggagtttgatg 35104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 226
Target Start/End: Original strand, 12450 - 12609
Alignment:
Q  67 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttat- 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||| | |||||||||||||   ||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||     
T  12450 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagtctttgaggagacatgaattttgattgaattgtcatat-ataatcctgtttatt 12548  T
Q  166 gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 226  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12549 gctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 12609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 232948 - 232789
Alignment:
Q  67 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttat- 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||| | |||||||||||||   ||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||     
T  232948 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagtctttgaggagacatgaattttgattgaattgtcatat-ataatcctgtttatt 232850  T
Q  166 gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 226  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  232849 gctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 232789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 224
Target Start/End: Original strand, 37722 - 37922
Alignment:
Q  22 cacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    |  |||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||||    
T  37722 cacacacactcacttgaaacttgtt-gttgggttgaataggt-tcgcaaggaatacttgatgttgtgattagtgtacacttgaaatt-aagcctttgagg 37818  T
Q  122 agacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgataaaactgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    ||||||  | ||| |||||||||||||| |  |||   |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  37819 agacataagattttaattgaattgtcatattttaattttgtttatgttgctatgtttatggcttttgcttgagggcaagaaaagattcaagtgtggggga 37918  T
Q  221 gttt 224  Q
    ||||    
T  37919 gttt 37922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38610 - 38508
Alignment:
Q  127 tgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgttta-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 225  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||| | | |||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38610 tgtgttttaattaaattgtcatatgataatatttttttgtgctaccatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 38511  T
Q  226 atg 228  Q
    |||    
T  38510 atg 38508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 38675 - 38625
Alignment:
Q  48 gttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 98  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38675 gttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattaatgtac 38625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 5232 - 5295
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5232 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 5295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 42237 - 42300
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42237 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 42300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 50569 - 50506
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50569 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 50506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 88403 - 88361
Alignment:
Q  185 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 227  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  88403 ttgcttgaggacaagcaatggttcaagtgtaggggagtttgat 88361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Original strand, 912 - 970
Alignment:
Q  170 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  912 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1225 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1225
Description:

Target: scaffold1225; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Original strand, 1834 - 1902
Alignment:
Q  160 gtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1834 gtttatgctgctatatttatgccttttgcttgagaacaatcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 1902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 2762 - 2818
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2762 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 2818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 101
Target Start/End: Original strand, 2612 - 2692
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 101  Q
    ||||||||||||||||| | || || | |||||||||||||||  | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  2612 cacacacacactcacttaagacatgtt-gttgggttgaataaagttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 2692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 2859 - 2926
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgt 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  2859 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgt 2926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 228
Target Start/End: Original strand, 12743 - 12794
Alignment:
Q  177 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12743 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 12794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22218 - 22159
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 224  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22218 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 22159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 10720 - 10776
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10720 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattaaagtgtgggggagtttgatg 10776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54905 - 54849
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54905 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcgtgggggagtttgatg 54849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37806 - 37743
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37806 tgctgctatgtctattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggaatttgatg 37743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 37948 - 37869
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 101  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  37948 acacacacactcacttaagacttgat-gttgggttgaataaagttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 37869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 227
Target Start/End: Original strand, 1193 - 1248
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 227  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1193 atgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 1248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 1041 - 1080
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1041 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 1080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 22756 - 22818
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22756 tgctgctatgtctatgccttt-gcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45291 - 45228
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45291 tgctgctatgtctatgtcttttgcttgagaacaagcaaagattcaggtgtgggggagtttgatg 45228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 72622 - 72572
Alignment:
Q  178 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  72622 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 72572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 84812 - 84762
Alignment:
Q  178 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  84812 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 84762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 228
Target Start/End: Original strand, 18218 - 18263
Alignment:
Q  183 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18218 tttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 83214 - 83174
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  83214 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagt 83174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 225
Target Start/End: Original strand, 3251 - 3291
Alignment:
Q  185 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 225  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  3251 ttgcttgaggacaagcaacggttcaagtgtaggggagtttg 3291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 5869 - 5830
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  5869 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 5830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University