View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11005_low_8 (Length: 318)

Name: NF11005_low_8
Description: NF11005
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11005_low_8
NF11005_low_8
[»] chr2 (94 HSPs)
chr2 (1-318)||(723645-723964)
chr2 (1-318)||(42362300-42362615)
chr2 (3-318)||(11690449-11690765)
chr2 (1-318)||(34139671-34139991)
chr2 (1-318)||(14633726-14634046)
chr2 (1-318)||(11067253-11067570)
chr2 (1-318)||(11151494-11151811)
chr2 (1-318)||(36317912-36318229)
chr2 (1-318)||(33162353-33162670)
chr2 (1-318)||(36773510-36773827)
chr2 (1-318)||(29867817-29868138)
chr2 (3-318)||(17057270-17057589)
chr2 (3-318)||(17085253-17085572)
chr2 (3-318)||(38312188-38312507)
chr2 (1-318)||(14202322-14202627)
chr2 (1-318)||(2334316-2334637)
chr2 (3-318)||(36987976-36988295)
chr2 (3-318)||(5723157-5723474)
chr2 (3-318)||(6594905-6595226)
chr2 (3-318)||(45099703-45100021)
chr2 (3-318)||(4503034-4503352)
chr2 (100-312)||(45726884-45727096)
chr2 (3-318)||(36205566-36205883)
chr2 (111-312)||(1631744-1631945)
chr2 (100-312)||(35446885-35447097)
chr2 (3-318)||(4484229-4484550)
chr2 (1-173)||(39284930-39285104)
chr2 (3-311)||(13121724-13122027)
chr2 (102-312)||(42288114-42288323)
chr2 (3-318)||(30833294-30833615)
chr2 (165-318)||(24885609-24885763)
chr2 (12-311)||(11049505-11049808)
chr2 (29-315)||(26353140-26353420)
chr2 (48-316)||(17490098-17490360)
chr2 (89-307)||(17450550-17450755)
chr2 (98-312)||(24398008-24398228)
chr2 (3-318)||(32289521-32289835)
chr2 (14-311)||(7815190-7815486)
chr2 (4-95)||(24885761-24885852)
chr2 (3-143)||(1345590-1345730)
chr2 (100-307)||(33648129-33648340)
chr2 (236-318)||(39284833-39284915)
chr2 (3-143)||(2838079-2838213)
chr2 (35-176)||(28672022-28672163)
chr2 (6-226)||(6266732-6266958)
chr2 (115-219)||(7451166-7451270)
chr2 (3-308)||(12123492-12123794)
chr2 (44-246)||(42019816-42020021)
chr2 (96-164)||(34388859-34388926)
chr2 (85-164)||(13569319-13569396)
chr2 (96-212)||(13656028-13656146)
chr2 (85-143)||(14699056-14699113)
chr2 (85-143)||(20522211-20522268)
chr2 (89-307)||(30218033-30218254)
chr2 (85-138)||(36757816-36757870)
chr2 (96-212)||(12647382-12647501)
chr2 (85-164)||(28259206-28259285)
chr2 (85-164)||(8390179-8390256)
chr2 (85-164)||(10445473-10445550)
chr2 (85-144)||(16940257-16940315)
chr2 (85-144)||(17010922-17010980)
chr2 (85-164)||(34682363-34682440)
chr2 (85-143)||(31056034-31056092)
chr2 (184-261)||(41446144-41446222)
chr2 (95-164)||(8040060-8040128)
chr2 (138-245)||(42261524-42261633)
chr2 (96-164)||(10707281-10707348)
chr2 (146-260)||(41454241-41454356)
chr2 (85-143)||(39482922-39482979)
chr2 (135-168)||(42412117-42412150)
chr2 (255-311)||(5700279-5700335)
chr2 (95-143)||(17865203-17865251)
chr2 (85-137)||(21629935-21629986)
chr2 (85-164)||(23078499-23078578)
chr2 (85-136)||(33528677-33528727)
chr2 (94-164)||(25398495-25398563)
chr2 (85-143)||(33118127-33118184)
chr2 (94-143)||(42039718-42039767)
chr2 (99-143)||(3022383-3022427)
chr2 (85-164)||(3491740-3491818)
chr2 (99-143)||(5375346-5375390)
chr2 (99-143)||(6264148-6264192)
chr2 (99-143)||(11739559-11739603)
chr2 (99-143)||(13910045-13910089)
chr2 (99-143)||(19502011-19502055)
chr2 (99-143)||(23452237-23452281)
chr2 (99-143)||(24162223-24162267)
chr2 (99-143)||(27105008-27105052)
chr2 (99-143)||(35215586-35215630)
chr2 (99-143)||(35217963-35218007)
chr2 (99-143)||(36558864-36558908)
chr2 (99-143)||(36561141-36561185)
chr2 (49-81)||(41446325-41446357)
chr2 (99-143)||(45332181-45332225)
[»] chr8 (85 HSPs)
chr8 (1-318)||(6598920-6599238)
chr8 (1-318)||(6674373-6674691)
chr8 (3-318)||(4731606-4731925)
chr8 (1-318)||(5689219-5689536)
chr8 (3-316)||(27811228-27811545)
chr8 (3-318)||(41366518-41366834)
chr8 (3-318)||(15212734-15213053)
chr8 (1-318)||(40321028-40321345)
chr8 (3-318)||(33352098-33352417)
chr8 (1-318)||(43036371-43036692)
chr8 (1-318)||(1345274-1345591)
chr8 (1-318)||(3303569-3303890)
chr8 (3-318)||(30143290-30143607)
chr8 (1-311)||(18141776-18142083)
chr8 (3-318)||(42498142-42498462)
chr8 (3-318)||(4743119-4743423)
chr8 (1-318)||(12702532-12702858)
chr8 (3-318)||(19491603-19491918)
chr8 (9-311)||(30291561-30291865)
chr8 (3-318)||(1292369-1292683)
chr8 (3-318)||(34256408-34256725)
chr8 (3-318)||(17982601-17982920)
chr8 (89-312)||(40221700-40221923)
chr8 (3-318)||(44303802-44304122)
chr8 (3-314)||(34254232-34254545)
chr8 (3-318)||(31218205-31218524)
chr8 (3-318)||(19945260-19945580)
chr8 (85-318)||(9765697-9765926)
chr8 (100-312)||(42434992-42435204)
chr8 (3-318)||(1746120-1746438)
chr8 (3-318)||(18105976-18106298)
chr8 (100-312)||(4283479-4283691)
chr8 (89-312)||(18655355-18655578)
chr8 (48-311)||(8965641-8965904)
chr8 (98-312)||(10930198-10930412)
chr8 (125-312)||(40328734-40328922)
chr8 (100-316)||(4162450-4162663)
chr8 (134-312)||(44353747-44353926)
chr8 (89-312)||(11383941-11384163)
chr8 (3-181)||(4733792-4733973)
chr8 (1-227)||(10015121-10015344)
chr8 (114-298)||(3772160-3772345)
chr8 (178-318)||(41364926-41365067)
chr8 (148-315)||(10929750-10929907)
chr8 (85-311)||(8153717-8153940)
chr8 (135-276)||(1822282-1822425)
chr8 (135-276)||(1856727-1856870)
chr8 (48-207)||(3073824-3073981)
chr8 (3-179)||(2627824-2628005)
chr8 (15-222)||(7597659-7597866)
chr8 (12-222)||(11711911-11712124)
chr8 (96-263)||(25689958-25690126)
chr8 (96-212)||(3439558-3439675)
chr8 (85-164)||(26403259-26403336)
chr8 (86-219)||(29796307-29796442)
chr8 (122-217)||(32902196-32902292)
chr8 (85-143)||(4696645-4696702)
chr8 (85-143)||(5702532-5702589)
chr8 (94-164)||(19175783-19175852)
chr8 (94-164)||(31071258-31071327)
chr8 (1-65)||(3051026-3051090)
chr8 (147-222)||(30909413-30909487)
chr8 (98-164)||(7412344-7412409)
chr8 (85-143)||(23799626-23799683)
chr8 (85-164)||(4456017-4456096)
chr8 (99-143)||(22684653-22684697)
chr8 (140-176)||(38863949-38863985)
chr8 (96-212)||(42575320-42575439)
chr8 (85-164)||(6127211-6127289)
chr8 (105-212)||(15290577-15290687)
chr8 (105-212)||(15470946-15471056)
chr8 (158-227)||(10240194-10240264)
chr8 (85-143)||(19752443-19752500)
chr8 (12-69)||(32902096-32902152)
chr8 (102-143)||(33541413-33541454)
chr8 (99-143)||(3874301-3874345)
chr8 (3-51)||(4162684-4162732)
chr8 (99-143)||(4424309-4424353)
chr8 (99-143)||(14419190-14419234)
chr8 (99-143)||(14808052-14808096)
chr8 (99-143)||(18810998-18811042)
chr8 (99-143)||(27829587-27829631)
chr8 (99-143)||(30480503-30480547)
chr8 (99-143)||(43079893-43079937)
chr8 (99-143)||(43082264-43082308)
[»] chr3 (133 HSPs)
chr3 (3-318)||(22834907-22835222)
chr3 (1-318)||(39153263-39153581)
chr3 (11-318)||(29682307-29682616)
chr3 (11-318)||(760795-761104)
chr3 (1-311)||(29196289-29196600)
chr3 (1-318)||(23391811-23392129)
chr3 (3-318)||(40734446-40734764)
chr3 (3-318)||(29810816-29811135)
chr3 (1-311)||(44700382-44700691)
chr3 (1-311)||(9666369-9666680)
chr3 (1-318)||(31314393-31314710)
chr3 (3-318)||(29813011-29813328)
chr3 (3-317)||(16498979-16499291)
chr3 (3-318)||(51398762-51399081)
chr3 (3-318)||(9581231-9581550)
chr3 (3-318)||(19683789-19684109)
chr3 (5-316)||(23410234-23410547)
chr3 (3-318)||(40735331-40735649)
chr3 (13-318)||(5236368-5236676)
chr3 (6-318)||(32891051-32891364)
chr3 (3-318)||(7762214-7762533)
chr3 (17-316)||(53921422-53921721)
chr3 (95-318)||(44331493-44331717)
chr3 (4-318)||(32744349-32744646)
chr3 (3-318)||(37408407-37408726)
chr3 (3-318)||(5258045-5258364)
chr3 (3-318)||(5260224-5260543)
chr3 (85-312)||(34491168-34491394)
chr3 (3-318)||(45095113-45095430)
chr3 (3-318)||(7764416-7764732)
chr3 (98-312)||(30236080-30236294)
chr3 (9-318)||(23200043-23200356)
chr3 (89-312)||(46860427-46860653)
chr3 (9-318)||(23197844-23198157)
chr3 (98-308)||(47304210-47304420)
chr3 (3-318)||(9636025-9636346)
chr3 (96-312)||(49199465-49199683)
chr3 (100-312)||(4569906-4570120)
chr3 (111-312)||(6095611-6095812)
chr3 (100-312)||(54593659-54593871)
chr3 (96-312)||(43401797-43402015)
chr3 (96-312)||(43403740-43403958)
chr3 (98-312)||(46173321-46173526)
chr3 (100-312)||(41819523-41819737)
chr3 (96-208)||(40913352-40913464)
chr3 (132-312)||(36018806-36018987)
chr3 (166-312)||(31340268-31340414)
chr3 (35-173)||(2075012-2075149)
chr3 (175-312)||(5433952-5434091)
chr3 (215-318)||(26386597-26386701)
chr3 (111-206)||(55301983-55302079)
chr3 (96-263)||(7780000-7780168)
chr3 (140-307)||(35138746-35138915)
chr3 (133-252)||(20937670-20937790)
chr3 (96-263)||(801094-801264)
chr3 (12-166)||(27305625-27305777)
chr3 (148-299)||(5373198-5373353)
chr3 (96-212)||(6716554-6716671)
chr3 (3-112)||(21350908-21351017)
chr3 (96-212)||(54635179-54635296)
chr3 (85-143)||(25795771-25795829)
chr3 (138-286)||(51352150-51352298)
chr3 (48-222)||(33191877-33192049)
chr3 (85-164)||(8370505-8370584)
chr3 (85-164)||(27974971-27975050)
chr3 (85-164)||(27986465-27986544)
chr3 (85-143)||(30709829-30709888)
chr3 (3-86)||(51352040-51352121)
chr3 (85-143)||(1417529-1417586)
chr3 (85-143)||(21711214-21711271)
chr3 (89-307)||(26323059-26323283)
chr3 (96-212)||(45283037-45283158)
chr3 (96-212)||(3617503-3617622)
chr3 (105-208)||(4055769-4055874)
chr3 (105-208)||(4075476-4075581)
chr3 (95-143)||(18552922-18552970)
chr3 (85-164)||(32143310-32143389)
chr3 (85-164)||(33386685-33386764)
chr3 (85-143)||(1736344-1736401)
chr3 (94-164)||(16264349-16264418)
chr3 (85-143)||(37466282-37466339)
chr3 (85-143)||(40592821-40592878)
chr3 (200-303)||(39127510-39127614)
chr3 (96-212)||(25637480-25637599)
chr3 (85-164)||(27452947-27453026)
chr3 (85-164)||(39040011-39040090)
chr3 (85-143)||(3716041-3716098)
chr3 (85-143)||(26298979-26299036)
chr3 (85-143)||(47923945-47924002)
chr3 (85-143)||(48438205-48438262)
chr3 (150-261)||(54739004-54739116)
chr3 (190-308)||(2075150-2075266)
chr3 (184-254)||(4386866-4386936)
chr3 (96-141)||(36029094-36029139)
chr3 (99-143)||(458499-458543)
chr3 (147-311)||(1313852-1314018)
chr3 (96-212)||(4598519-4598638)
chr3 (96-212)||(4600740-4600859)
chr3 (96-212)||(10056272-10056391)
chr3 (96-212)||(10058494-10058613)
chr3 (96-212)||(10060716-10060835)
chr3 (96-212)||(10062938-10063057)
chr3 (96-212)||(10065160-10065279)
chr3 (96-212)||(10211448-10211567)
chr3 (146-244)||(25491014-25491114)
chr3 (85-164)||(26928620-26928698)
chr3 (85-164)||(6794732-6794809)
chr3 (3-69)||(9634722-9634787)
chr3 (85-143)||(24695203-24695260)
chr3 (99-143)||(456122-456166)
chr3 (99-143)||(746972-747016)
chr3 (99-143)||(1313624-1313668)
chr3 (99-143)||(1321694-1321738)
chr3 (99-143)||(3859742-3859786)
chr3 (99-143)||(5886413-5886457)
chr3 (99-143)||(5899886-5899930)
chr3 (99-143)||(6484575-6484619)
chr3 (99-143)||(7606586-7606630)
chr3 (275-311)||(8166635-8166671)
chr3 (123-212)||(10209228-10209319)
chr3 (99-143)||(10958321-10958365)
chr3 (99-143)||(25389120-25389164)
chr3 (99-143)||(27635656-27635700)
chr3 (99-143)||(28413030-28413074)
chr3 (99-143)||(35919113-35919157)
chr3 (85-136)||(35925472-35925524)
chr3 (99-143)||(41849274-41849318)
chr3 (99-143)||(42990519-42990563)
chr3 (99-143)||(42992485-42992529)
chr3 (99-143)||(43421413-43421457)
chr3 (99-143)||(50494214-50494258)
chr3 (99-143)||(53894055-53894099)
chr3 (99-143)||(53917662-53917706)
[»] chr5 (96 HSPs)
chr5 (1-318)||(8565849-8566166)
chr5 (1-317)||(32636773-32637093)
chr5 (1-318)||(42428329-42428650)
chr5 (11-316)||(33831630-33831938)
chr5 (1-318)||(537973-538290)
chr5 (1-318)||(28750554-28750875)
chr5 (1-316)||(13488153-13488470)
chr5 (20-318)||(533717-534015)
chr5 (1-318)||(42426134-42426455)
chr5 (1-318)||(31182921-31183243)
chr5 (3-318)||(39468450-39468769)
chr5 (3-318)||(13239700-13240019)
chr5 (3-317)||(30682824-30683139)
chr5 (3-318)||(16452029-16452346)
chr5 (1-318)||(37439082-37439411)
chr5 (3-318)||(25412710-25413027)
chr5 (1-318)||(5887333-5887636)
chr5 (1-318)||(19806332-19806632)
chr5 (3-318)||(13343009-13343327)
chr5 (85-312)||(28278271-28278498)
chr5 (3-318)||(30182537-30182855)
chr5 (72-318)||(3075632-3075878)
chr5 (100-312)||(213420-213633)
chr5 (100-312)||(40147216-40147428)
chr5 (35-311)||(9049285-9049554)
chr5 (3-318)||(36073944-36074264)
chr5 (95-312)||(38746960-38747177)
chr5 (100-312)||(5058002-5058212)
chr5 (3-318)||(16409431-16409746)
chr5 (4-318)||(26177839-26178152)
chr5 (93-316)||(42309929-42310153)
chr5 (40-311)||(13695632-13695904)
chr5 (105-312)||(27637618-27637827)
chr5 (86-312)||(27015487-27015704)
chr5 (100-311)||(16640941-16641153)
chr5 (96-318)||(9789220-9789436)
chr5 (1-132)||(16649733-16649863)
chr5 (96-318)||(18441644-18441860)
chr5 (4-318)||(26170730-26171032)
chr5 (3-193)||(42926965-42927160)
chr5 (98-247)||(316781-316933)
chr5 (83-226)||(29751142-29751287)
chr5 (96-226)||(29720405-29720536)
chr5 (96-226)||(29722565-29722696)
chr5 (254-318)||(42926841-42926905)
chr5 (96-212)||(10593312-10593430)
chr5 (96-212)||(22536286-22536403)
chr5 (98-222)||(33906028-33906154)
chr5 (133-251)||(10054850-10054969)
chr5 (85-164)||(10281741-10281819)
chr5 (85-164)||(9353361-9353440)
chr5 (85-164)||(36932379-36932458)
chr5 (48-254)||(3325925-3326130)
chr5 (85-143)||(17004009-17004066)
chr5 (85-164)||(15464521-15464600)
chr5 (96-212)||(25078174-25078293)
chr5 (96-212)||(25136143-25136262)
chr5 (96-212)||(40382355-40382474)
chr5 (159-307)||(35616129-35616278)
chr5 (85-143)||(28832250-28832307)
chr5 (96-176)||(40380181-40380263)
chr5 (85-254)||(30802841-30803010)
chr5 (166-223)||(42926911-42926968)
chr5 (105-164)||(4160702-4160762)
chr5 (96-164)||(11917001-11917068)
chr5 (85-143)||(14520219-14520278)
chr5 (85-143)||(31300645-31300702)
chr5 (85-143)||(42127459-42127516)
chr5 (96-212)||(16546684-16546803)
chr5 (99-143)||(27910685-27910729)
chr5 (193-254)||(33030889-33030950)
chr5 (136-218)||(8445764-8445847)
chr5 (96-176)||(16544499-16544581)
chr5 (93-143)||(19588744-19588794)
chr5 (85-143)||(24553555-24553612)
chr5 (99-164)||(4410237-4410301)
chr5 (94-143)||(35387662-35387710)
chr5 (99-143)||(2175153-2175197)
chr5 (99-143)||(2724128-2724172)
chr5 (99-143)||(3373137-3373181)
chr5 (99-143)||(10529099-10529143)
chr5 (99-143)||(10749935-10749979)
chr5 (85-164)||(12084204-12084283)
chr5 (99-143)||(15354575-15354619)
chr5 (99-143)||(15552480-15552524)
chr5 (99-143)||(18466919-18466963)
chr5 (99-143)||(21684452-21684496)
chr5 (99-143)||(24127091-24127135)
chr5 (99-143)||(25921473-25921517)
chr5 (99-143)||(27912771-27912815)
chr5 (99-143)||(31179371-31179415)
chr5 (99-143)||(31542969-31543013)
chr5 (99-143)||(31545315-31545359)
chr5 (99-143)||(34477053-34477097)
chr5 (99-143)||(34479418-34479462)
chr5 (99-143)||(40221758-40221802)
[»] chr4 (126 HSPs)
chr4 (1-316)||(36994474-36994788)
chr4 (1-318)||(26175535-26175856)
chr4 (1-318)||(5871768-5872087)
chr4 (1-311)||(52467257-52467567)
chr4 (1-318)||(36463294-36463609)
chr4 (1-318)||(12739449-12739770)
chr4 (3-318)||(47038316-47038629)
chr4 (3-318)||(5429627-5429946)
chr4 (3-318)||(34570315-34570634)
chr4 (3-318)||(48893543-48893862)
chr4 (3-318)||(9927360-9927677)
chr4 (1-318)||(29254442-29254763)
chr4 (3-318)||(54199809-54200126)
chr4 (3-318)||(37740574-37740892)
chr4 (3-318)||(56178537-56178856)
chr4 (1-318)||(45687086-45687403)
chr4 (1-282)||(46147294-46147575)
chr4 (3-318)||(48142990-48143315)
chr4 (3-318)||(52095263-52095582)
chr4 (1-252)||(12743824-12744079)
chr4 (3-318)||(31474098-31474414)
chr4 (3-318)||(6542084-6542401)
chr4 (3-318)||(4587906-4588222)
chr4 (3-318)||(5369983-5370306)
chr4 (98-312)||(54882975-54883189)
chr4 (89-294)||(27416955-27417160)
chr4 (64-318)||(13009409-13009651)
chr4 (100-312)||(6655911-6656123)
chr4 (12-311)||(5207755-5208055)
chr4 (12-311)||(37229636-37229935)
chr4 (111-312)||(50673859-50674059)
chr4 (54-252)||(12745266-12745468)
chr4 (100-312)||(46703454-46703669)
chr4 (3-318)||(52082564-52082877)
chr4 (111-312)||(379333-379537)
chr4 (135-318)||(12747792-12747976)
chr4 (96-312)||(2209668-2209886)
chr4 (86-306)||(3913408-3913628)
chr4 (100-312)||(40632400-40632612)
chr4 (105-312)||(41964369-41964578)
chr4 (131-318)||(12745468-12745656)
chr4 (11-318)||(29999719-30000025)
chr4 (114-312)||(8665362-8665561)
chr4 (111-312)||(12073347-12073549)
chr4 (141-311)||(24969067-24969238)
chr4 (98-279)||(26364223-26364405)
chr4 (111-312)||(41639381-41639582)
chr4 (48-316)||(51337014-51337282)
chr4 (98-308)||(21688207-21688418)
chr4 (96-312)||(50262697-50262911)
chr4 (100-310)||(8648095-8648306)
chr4 (111-312)||(35662395-35662597)
chr4 (3-318)||(13992192-13992505)
chr4 (98-312)||(12119492-12119709)
chr4 (184-312)||(55085450-55085578)
chr4 (131-246)||(12744079-12744195)
chr4 (105-312)||(26699447-26699659)
chr4 (14-307)||(29056317-29056610)
chr4 (35-308)||(48142313-48142588)
chr4 (96-263)||(31495312-31495482)
chr4 (35-253)||(5349923-5350140)
chr4 (113-307)||(33089837-33090034)
chr4 (184-312)||(41639218-41639346)
chr4 (35-221)||(21703772-21703958)
chr4 (98-261)||(34112821-34112986)
chr4 (96-212)||(8393448-8393566)
chr4 (96-212)||(8395657-8395775)
chr4 (122-218)||(33989893-33989990)
chr4 (10-145)||(24969787-24969924)
chr4 (35-222)||(44967763-44967952)
chr4 (111-254)||(22882763-22882907)
chr4 (111-254)||(22934427-22934571)
chr4 (145-296)||(53345187-53345340)
chr4 (85-143)||(3796568-3796626)
chr4 (85-143)||(10047370-10047427)
chr4 (85-143)||(39245985-39246042)
chr4 (85-164)||(5396700-5396779)
chr4 (140-222)||(6677514-6677597)
chr4 (85-164)||(36315258-36315335)
chr4 (85-164)||(36329467-36329544)
chr4 (85-164)||(38152468-38152545)
chr4 (146-246)||(16422653-16422755)
chr4 (85-137)||(31985688-31985741)
chr4 (95-143)||(5269240-5269288)
chr4 (96-143)||(5143260-5143307)
chr4 (85-164)||(16623322-16623399)
chr4 (161-246)||(44570427-44570514)
chr4 (85-143)||(42599623-42599680)
chr4 (96-164)||(3777550-3777617)
chr4 (96-212)||(5136118-5136237)
chr4 (96-212)||(5138343-5138462)
chr4 (96-140)||(5147678-5147722)
chr4 (85-137)||(54867175-54867226)
chr4 (85-164)||(24333800-24333877)
chr4 (6-69)||(31495209-31495271)
chr4 (18-72)||(3913775-3913829)
chr4 (123-176)||(7124992-7125046)
chr4 (85-142)||(8689533-8689591)
chr4 (85-143)||(25862071-25862128)
chr4 (186-215)||(5112317-5112346)
chr4 (184-252)||(39774255-39774324)
chr4 (99-143)||(4215595-4215639)
chr4 (267-311)||(5349861-5349905)
chr4 (99-143)||(5635476-5635520)
chr4 (99-143)||(6765133-6765177)
chr4 (99-143)||(7941612-7941656)
chr4 (99-143)||(8631419-8631463)
chr4 (99-143)||(9148541-9148585)
chr4 (99-143)||(14789428-14789472)
chr4 (99-143)||(16455531-16455575)
chr4 (99-143)||(16931789-16931833)
chr4 (99-143)||(16934143-16934187)
chr4 (99-143)||(17662245-17662289)
chr4 (99-143)||(18709164-18709208)
chr4 (99-143)||(22780373-22780417)
chr4 (99-143)||(22800862-22800906)
chr4 (99-143)||(24879279-24879323)
chr4 (99-143)||(24880741-24880785)
chr4 (99-143)||(24889085-24889129)
chr4 (85-164)||(28468558-28468636)
chr4 (99-143)||(37089372-37089416)
chr4 (133-173)||(37754994-37755034)
chr4 (98-172)||(38811189-38811262)
chr4 (99-143)||(38928177-38928221)
chr4 (99-143)||(40637363-40637407)
chr4 (99-143)||(44599838-44599882)
[»] chr7 (119 HSPs)
chr7 (1-318)||(41317337-41317654)
chr7 (11-318)||(41648922-41649230)
chr7 (3-318)||(1113605-1113920)
chr7 (3-318)||(27347765-27348084)
chr7 (1-315)||(14069732-14070050)
chr7 (1-315)||(14379760-14380078)
chr7 (1-311)||(36146311-36146621)
chr7 (1-318)||(8153290-8153607)
chr7 (1-318)||(47676035-47676356)
chr7 (15-318)||(31732882-31733189)
chr7 (1-316)||(47673843-47674161)
chr7 (1-318)||(38671123-38671442)
chr7 (3-318)||(4586109-4586428)
chr7 (3-318)||(43864192-43864511)
chr7 (3-318)||(48489379-48489698)
chr7 (3-318)||(18126592-18126913)
chr7 (3-318)||(48491527-48491843)
chr7 (3-318)||(495888-496203)
chr7 (3-317)||(31105297-31105612)
chr7 (3-318)||(23554988-23555308)
chr7 (3-318)||(26417264-26417583)
chr7 (1-318)||(19502126-19502448)
chr7 (20-318)||(12097789-12098079)
chr7 (3-316)||(25615813-25616122)
chr7 (84-316)||(30024717-30024950)
chr7 (3-318)||(29991003-29991320)
chr7 (3-318)||(35853863-35854183)
chr7 (87-312)||(2360960-2361185)
chr7 (1-193)||(24525405-24525596)
chr7 (89-312)||(34310705-34310929)
chr7 (3-318)||(4178723-4179040)
chr7 (100-308)||(22269931-22270140)
chr7 (3-311)||(23564966-23565274)
chr7 (105-312)||(6431926-6432133)
chr7 (100-312)||(8359316-8359530)
chr7 (3-318)||(25766858-25767177)
chr7 (111-312)||(2390237-2390438)
chr7 (100-312)||(3258949-3259162)
chr7 (100-312)||(4508707-4508919)
chr7 (3-318)||(39731325-39731638)
chr7 (12-311)||(4253443-4253742)
chr7 (100-312)||(48599335-48599547)
chr7 (32-227)||(2759127-2759325)
chr7 (111-312)||(29608691-29608893)
chr7 (1-258)||(31518911-31519160)
chr7 (157-316)||(31518745-31518905)
chr7 (3-307)||(23343934-23344236)
chr7 (100-227)||(32358055-32358182)
chr7 (100-312)||(4510549-4510761)
chr7 (100-312)||(4512391-4512603)
chr7 (3-318)||(48408751-48409074)
chr7 (15-311)||(36574434-36574728)
chr7 (98-224)||(6359951-6360077)
chr7 (186-318)||(4538627-4538760)
chr7 (188-318)||(24525985-24526117)
chr7 (105-312)||(22328395-22328611)
chr7 (85-173)||(30814530-30814617)
chr7 (9-263)||(43504058-43504320)
chr7 (236-318)||(2761440-2761522)
chr7 (96-212)||(20343951-20344068)
chr7 (203-311)||(5514113-5514222)
chr7 (249-318)||(24514912-24514980)
chr7 (1-60)||(30024655-30024714)
chr7 (111-311)||(3904628-3904830)
chr7 (96-226)||(24789882-24790013)
chr7 (85-143)||(2580381-2580438)
chr7 (133-218)||(5116653-5116739)
chr7 (85-143)||(20284080-20284137)
chr7 (96-212)||(18388756-18388875)
chr7 (96-212)||(18392192-18392311)
chr7 (96-164)||(21983285-21983352)
chr7 (96-181)||(1560662-1560749)
chr7 (85-164)||(29159794-29159871)
chr7 (85-143)||(9190057-9190114)
chr7 (85-143)||(46516359-46516416)
chr7 (85-142)||(47263667-47263725)
chr7 (100-176)||(18396409-18396486)
chr7 (95-143)||(2647745-2647793)
chr7 (85-141)||(4796718-4796773)
chr7 (96-212)||(6592336-6592455)
chr7 (96-212)||(6594554-6594673)
chr7 (47-173)||(26639419-26639545)
chr7 (96-142)||(21988909-21988955)
chr7 (96-176)||(32060318-32060400)
chr7 (85-143)||(33332499-33332556)
chr7 (85-143)||(35960807-35960864)
chr7 (94-164)||(44848713-44848782)
chr7 (95-140)||(23403065-23403110)
chr7 (184-254)||(28617174-28617244)
chr7 (85-137)||(55939-55990)
chr7 (85-137)||(5817324-5817376)
chr7 (95-143)||(9185214-9185262)
chr7 (35-142)||(40808712-40808819)
chr7 (99-143)||(42330997-42331041)
chr7 (85-142)||(2479326-2479385)
chr7 (85-143)||(28617274-28617331)
chr7 (95-164)||(49091661-49091729)
chr7 (99-143)||(1049296-1049340)
chr7 (99-143)||(2935513-2935557)
chr7 (99-143)||(3035969-3036013)
chr7 (99-143)||(7471980-7472024)
chr7 (99-143)||(9027194-9027238)
chr7 (99-143)||(11759372-11759416)
chr7 (99-143)||(13099474-13099518)
chr7 (99-143)||(20299705-20299749)
chr7 (99-143)||(20626283-20626327)
chr7 (99-143)||(20630174-20630218)
chr7 (99-143)||(20642593-20642637)
chr7 (99-143)||(22108311-22108355)
chr7 (99-143)||(22137322-22137366)
chr7 (255-311)||(30843389-30843445)
chr7 (99-143)||(31155911-31155955)
chr7 (99-143)||(38394231-38394275)
chr7 (99-143)||(40550071-40550115)
chr7 (99-143)||(40552349-40552393)
chr7 (99-143)||(40836743-40836787)
chr7 (99-143)||(40946573-40946617)
chr7 (99-143)||(44724824-44724868)
chr7 (99-143)||(48457898-48457942)
[»] chr1 (119 HSPs)
chr1 (1-318)||(28220125-28220446)
chr1 (1-318)||(3847022-3847341)
chr1 (1-318)||(28265457-28265774)
chr1 (1-318)||(28223320-28223641)
chr1 (1-318)||(50167078-50167395)
chr1 (3-318)||(834070-834387)
chr1 (1-318)||(50169113-50169430)
chr1 (1-318)||(40122099-40122418)
chr1 (1-318)||(196808-197128)
chr1 (3-317)||(8550685-8551006)
chr1 (3-318)||(3156814-3157132)
chr1 (3-318)||(31659186-31659505)
chr1 (3-318)||(44455108-44455427)
chr1 (1-318)||(13137879-13138194)
chr1 (3-318)||(10925171-10925489)
chr1 (1-317)||(4552547-4552856)
chr1 (1-316)||(46064868-46065182)
chr1 (1-316)||(45644257-45644573)
chr1 (3-317)||(13659242-13659555)
chr1 (3-307)||(49918309-49918617)
chr1 (3-312)||(37503458-37503768)
chr1 (3-316)||(37559766-37560087)
chr1 (1-318)||(1833470-1833778)
chr1 (1-318)||(3189279-3189600)
chr1 (1-318)||(3198096-3198417)
chr1 (1-318)||(3206935-3207256)
chr1 (3-318)||(41360863-41361178)
chr1 (3-318)||(23555171-23555485)
chr1 (1-318)||(30476345-30476668)
chr1 (86-318)||(19754442-19754676)
chr1 (1-303)||(16455585-16455886)
chr1 (100-312)||(13547090-13547302)
chr1 (6-318)||(15820255-15820567)
chr1 (111-312)||(11348653-11348854)
chr1 (100-312)||(37168252-37168465)
chr1 (100-312)||(47255340-47255553)
chr1 (100-312)||(13549001-13549213)
chr1 (35-318)||(20762620-20762908)
chr1 (96-312)||(42297971-42298188)
chr1 (111-311)||(31925719-31925919)
chr1 (89-309)||(19752643-19752864)
chr1 (111-312)||(29136202-29136404)
chr1 (100-312)||(47115126-47115340)
chr1 (6-311)||(927883-928190)
chr1 (111-312)||(34603530-34603733)
chr1 (96-312)||(37033068-37033286)
chr1 (3-263)||(13316253-13316517)
chr1 (111-312)||(7482242-7482445)
chr1 (100-312)||(193566-193778)
chr1 (3-318)||(51765343-51765666)
chr1 (122-261)||(22079322-22079462)
chr1 (54-262)||(36683694-36683892)
chr1 (194-312)||(37879006-37879124)
chr1 (34-311)||(44650101-44650376)
chr1 (3-308)||(37282597-37282901)
chr1 (83-263)||(9987205-9987387)
chr1 (96-226)||(40282418-40282549)
chr1 (108-311)||(8871071-8871259)
chr1 (18-224)||(2262895-2263100)
chr1 (100-190)||(28242382-28242472)
chr1 (125-222)||(6808497-6808595)
chr1 (85-143)||(19072918-19072976)
chr1 (85-143)||(19120808-19120866)
chr1 (96-263)||(20622233-20622403)
chr1 (100-198)||(37876767-37876865)
chr1 (48-246)||(3460715-3460914)
chr1 (95-163)||(775672-775739)
chr1 (96-212)||(9036471-9036588)
chr1 (85-164)||(37069759-37069838)
chr1 (84-164)||(47703965-47704043)
chr1 (85-143)||(26644946-26645005)
chr1 (85-143)||(13598389-13598446)
chr1 (89-291)||(2926488-2926689)
chr1 (48-176)||(5459997-5460125)
chr1 (139-219)||(9109459-9109540)
chr1 (96-226)||(21053999-21054130)
chr1 (96-212)||(44203685-44203804)
chr1 (85-164)||(9476252-9476329)
chr1 (12-70)||(8870637-8870695)
chr1 (122-208)||(13938195-13938282)
chr1 (85-143)||(16124565-16124622)
chr1 (85-143)||(29651802-29651859)
chr1 (85-143)||(47098873-47098930)
chr1 (85-143)||(47102890-47102947)
chr1 (94-143)||(3281707-3281756)
chr1 (85-164)||(21536598-21536677)
chr1 (85-164)||(27104401-27104478)
chr1 (196-311)||(44646881-44646997)
chr1 (99-143)||(12302507-12302551)
chr1 (85-164)||(13604652-13604731)
chr1 (99-143)||(16429193-16429237)
chr1 (159-251)||(16914234-16914329)
chr1 (159-312)||(25652040-25652195)
chr1 (284-318)||(777191-777225)
chr1 (184-246)||(35109494-35109556)
chr1 (99-143)||(2510327-2510371)
chr1 (99-143)||(6823249-6823293)
chr1 (99-143)||(9459419-9459463)
chr1 (99-143)||(9463246-9463290)
chr1 (99-143)||(10399830-10399874)
chr1 (99-143)||(13358808-13358852)
chr1 (99-143)||(15294836-15294880)
chr1 (99-143)||(16226402-16226446)
chr1 (99-143)||(17186129-17186173)
chr1 (99-143)||(17324638-17324682)
chr1 (85-164)||(19361461-19361539)
chr1 (85-164)||(19380101-19380179)
chr1 (99-143)||(23786074-23786118)
chr1 (99-143)||(27336942-27336986)
chr1 (99-143)||(28207070-28207114)
chr1 (272-312)||(28242343-28242383)
chr1 (99-143)||(28840914-28840958)
chr1 (99-143)||(28998255-28998299)
chr1 (99-143)||(29003971-29004015)
chr1 (99-143)||(31735523-31735567)
chr1 (99-143)||(39462754-39462798)
chr1 (99-143)||(50307548-50307592)
chr1 (99-143)||(51750274-51750318)
chr1 (99-143)||(51752598-51752642)
[»] chr6 (73 HSPs)
chr6 (3-318)||(9182932-9183251)
chr6 (3-318)||(28137311-28137628)
chr6 (3-318)||(33211090-33211405)
chr6 (3-318)||(26954191-26954505)
chr6 (11-318)||(5406109-5406418)
chr6 (11-318)||(5410434-5410743)
chr6 (3-318)||(5413296-5413612)
chr6 (3-316)||(31404576-31404891)
chr6 (5-318)||(33160253-33160573)
chr6 (11-318)||(16568991-16569279)
chr6 (1-318)||(3038826-3039123)
chr6 (100-312)||(21593619-21593831)
chr6 (3-317)||(30834435-30834755)
chr6 (3-318)||(2171428-2171750)
chr6 (3-317)||(16452229-16452548)
chr6 (111-312)||(2972951-2973152)
chr6 (96-312)||(3808704-3808922)
chr6 (100-281)||(21588916-21589098)
chr6 (100-312)||(5043582-5043795)
chr6 (100-312)||(26830124-26830337)
chr6 (96-312)||(603085-603293)
chr6 (100-312)||(22424826-22425041)
chr6 (140-294)||(17757995-17758150)
chr6 (111-312)||(17762944-17763147)
chr6 (3-197)||(5408971-5409167)
chr6 (12-311)||(4045378-4045671)
chr6 (96-318)||(6097447-6097652)
chr6 (111-224)||(26800630-26800744)
chr6 (96-263)||(3072755-3072925)
chr6 (96-263)||(412104-412274)
chr6 (199-318)||(16567154-16567265)
chr6 (138-307)||(25073528-25073698)
chr6 (1-143)||(14521580-14521722)
chr6 (96-212)||(16578514-16578632)
chr6 (96-212)||(16616748-16616866)
chr6 (96-212)||(16653166-16653284)
chr6 (85-143)||(10077214-10077271)
chr6 (96-212)||(27647915-27648032)
chr6 (85-164)||(5757507-5757586)
chr6 (96-212)||(16554923-16555041)
chr6 (96-212)||(16631479-16631597)
chr6 (85-143)||(5572290-5572347)
chr6 (85-164)||(21356025-21356104)
chr6 (96-212)||(25421359-25421478)
chr6 (85-143)||(18232836-18232893)
chr6 (85-143)||(31979504-31979561)
chr6 (96-212)||(6027300-6027419)
chr6 (85-143)||(5017518-5017575)
chr6 (99-143)||(2628886-2628930)
chr6 (96-212)||(13153968-13154087)
chr6 (96-212)||(33342101-33342220)
chr6 (96-212)||(34164911-34165030)
chr6 (96-167)||(34167180-34167252)
chr6 (85-164)||(31086502-31086579)
chr6 (85-143)||(4629944-4630002)
chr6 (139-177)||(9572681-9572719)
chr6 (85-143)||(31936578-31936635)
chr6 (99-143)||(1230249-1230293)
chr6 (140-176)||(2908550-2908586)
chr6 (99-143)||(4816231-4816275)
chr6 (99-143)||(5273216-5273260)
chr6 (99-143)||(11983029-11983073)
chr6 (99-143)||(12195515-12195559)
chr6 (99-143)||(14458767-14458811)
chr6 (99-143)||(14507176-14507220)
chr6 (99-143)||(19704567-19704611)
chr6 (99-143)||(20915356-20915400)
chr6 (85-164)||(22709007-22709086)
chr6 (85-137)||(22963691-22963742)
chr6 (85-137)||(23824651-23824702)
chr6 (99-143)||(26932562-26932606)
chr6 (99-143)||(29754709-29754753)
chr6 (99-143)||(33309126-33309170)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (3-314)||(20316-20631)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (3-317)||(149003-149316)
scaffold0006 (85-143)||(5674-5731)
scaffold0006 (85-141)||(2483-2538)
scaffold0006 (85-164)||(133309-133388)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (3-318)||(114551-114870)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (3-318)||(865-1183)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (3-316)||(434483-434801)
scaffold0002 (138-245)||(490359-490468)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (100-312)||(7282-7494)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (96-318)||(11506-11729)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (3-318)||(11060-11381)
scaffold0491 (3-318)||(8634-8955)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (123-312)||(18028-18216)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (35-245)||(27378-27591)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (154-312)||(80338-80496)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (100-288)||(10468-10656)
[»] scaffold1668 (1 HSPs)
scaffold1668 (4-103)||(1404-1502)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (85-164)||(8448-8527)
scaffold0140 (99-143)||(22359-22403)
scaffold0140 (99-143)||(24634-24678)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (94-212)||(2598-2719)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (96-212)||(3722-3841)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (85-164)||(45242-45321)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (85-164)||(43990-44069)
scaffold0087 (85-143)||(36881-36940)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (96-143)||(85684-85731)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (85-143)||(10720-10777)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (146-227)||(25093-25175)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (99-143)||(1453-1497)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (99-143)||(285-329)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (96-212)||(6326-6445)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (99-143)||(29414-29458)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (99-143)||(69292-69336)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 94)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 723645 - 723964
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||||||||||    
T  723645 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagat 723744  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  723745 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttac 723844  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  723845 aagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccagttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 723944  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  723945 aaggtgtttacaatgtttcc 723964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 42362615 - 42362300
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||||||||||    
T  42362615 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagat 42362516  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    ||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42362515 tgttgaccca----ggtccaacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttac 42362420  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42362419 aagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 42362320  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  42362319 aaggtgtttacaatgtttcc 42362300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11690765 - 11690449
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11690765 aataacaacacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaaacaaaacacaccaaagattgt 11690666  T
Q  103 tgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11690665 tgatccagttcggtccaacttgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactatcaacgatttcttacaaagggatacaaatgggttacaag 11690566  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaag 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11690565 aaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaag 11690466  T
Q  302 gtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  11690465 gtgtttacaatgtttcc 11690449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 34139671 - 34139991
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||||||||||    
T  34139671 ataataacaagacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagat 34139770  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatggatacaaatgggtta 198  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  34139771 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagggatacatatgggtta 34139870  T
Q  199 caagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34139871 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 34139970  T
Q  298 caaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34139971 caaggtgtttacaatgtttcc 34139991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 14633726 - 14634046
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaa--gagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||    
T  14633726 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaatcaaaagataaagagagaatagagaaacaaa-cacaccaaaga 14633824  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14633825 ttgttgactcagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatctatgagttcttacaaaagggatacaaatgggtt 14633924  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14633925 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccattttaccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 14634024  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14634025 ccaaggtgtttacaatgtttcc 14634046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11067570 - 11067253
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11067570 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagatt 11067472  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11067471 gttgaccgagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttaca 11067372  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11067371 agaaattagctttgacaagctcacaaagtacaacactaatttctacccatttttccaatttcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 11067272  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11067271 aggtgtttacaatgtttcc 11067253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 11151494 - 11151811
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11151494 ataataacaacagctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaaacaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagatt 11151592  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11151593 gttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttaca 11151692  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11151693 agaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagagactcaatgattttcactcaccca 11151792  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11151793 aggtgtttacaatgtttcc 11151811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 36317912 - 36318229
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||    
T  36317912 ataataacaacacctagatttaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagaaagaagataaacaaa-cacaccaaagatt 36318010  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36318011 gttgacccagttcggtccaacttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttaca 36318110  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    | ||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36318111 ataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccca 36318210  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  36318211 aggtgtttacaatatttcc 36318229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 33162353 - 33162670
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  33162353 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaatagagaagagaaacaaa-cacaccaaagatt 33162451  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  33162452 gttgacctagttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacagagagatacaaatgggttaca 33162551  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33162552 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcctaatttcaccaatgaacaagacactcgatgattttcaatcaccca 33162651  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33162652 aggtgtttacaatgtttcc 33162670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 36773827 - 36773510
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| |  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36773827 ataataacaacacctagatctaatctagtaataaaaaagaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagaaagaagagaaacaaa-cacaccaaagatt 36773729  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  36773728 gttgacccagttcggtccaacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttaca 36773629  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| | || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36773628 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttattcccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccca 36773529  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36773528 aggtgtttacaatgtttcc 36773510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29868138 - 29867817
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||    |||||| | ||||||| ||||    
T  29868138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcacaagataaacggagagaagagagaaac-aaacacatcaaa 29868040  T
Q  97 gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggt 196  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  29868039 gattattgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggt 29867940  T
Q  197 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactca 295  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29867939 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 29867840  T
Q  296 cccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  29867839 cccaaggtgtttacaatgtttcc 29867817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 17057270 - 17057589
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaa--gagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   |||| | | |||||||||||||||    
T  17057270 aataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagacgagaggaacaaacacaccaaagat 17057369  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  17057370 tgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 17057469  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    || |||||||||| ||||||||  |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17057470 aaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 17057569  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  17057570 aaggtgtttacaatatttcc 17057589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 17085253 - 17085572
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaa--gagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   |||| | | |||||||||||||||    
T  17085253 aataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagacgagaggaacaaacacaccaaagat 17085352  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  17085353 tgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 17085452  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    || |||||||||| ||||||||  |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17085453 aaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 17085552  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  17085553 aaggtgtttacaatatttcc 17085572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 38312507 - 38312188
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | ||||||| |||||||    
T  38312507 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacatcaaagat 38312408  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  38312407 tgttgacccagttcggtccaacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggttac 38312308  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  38312307 aagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacac 38312208  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  38312207 aaggtgtatacaatgtttcc 38312188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 14202322 - 14202627
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||||||||||    
T  14202322 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcttaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagataaacaaacacaccaaagat 14202421  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||| ||||||||         |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |       ||| |||||    
T  14202422 tgttgacccagttcggtcc---------taatcttggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagg-------atgagttac 14202505  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacac--tcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  14202506 aagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacccattttcccaatctcagaaatgaaaaagacacactcaataattttcactcac 14202605  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14202606 ccaaggtgtttacaatgtttcc 14202627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 2334316 - 2334637
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||    |||||| |||| |||||||||    
T  2334316 ataataacaacacctagatctaatctggtaatcaaagtgaaaacttcaaaaccacaagcacaagataaagggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaa 2334414  T
Q  97 gattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatggg 195  Q
    |||||||  |||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |    
T  2334415 gattgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagag 2334514  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactc 294  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2334515 ttactagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaacccttatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 2334614  T
Q  295 acccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  2334615 a-ccaaggtgtttacaatgtttcc 2334637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 36987976 - 36988295
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||||    
T  36987976 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaaga 36988074  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||    
T  36988075 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtt 36988174  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcaca-aaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| | |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  36988175 acaagaaattagttttgacaagctcacatagaacaaccctaatttctacccttttttccaatcccaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 36988273  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  36988274 ccaaggtgtttactatgtttcc 36988295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 5723157 - 5723474
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||    |||||| | ||||||||||||||    
T  5723157 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaaaagaaaagca-caaaccacaagcaaaagataaaaggagagaatagagaaac-aaacacaccaaaga 5723254  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtcc-aacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||    
T  5723255 ttgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaaggtt 5723354  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  ||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  5723355 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaagcctaatttctacc-cttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 5723452  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5723453 ccaaggtgtttacaatgtttcc 5723474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 6594905 - 6595226
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagat-aaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaag 97  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    |||||| | |||||||||||||    
T  6594905 aataacagcacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaagggagagaagagagaaac-aaacacaccaaag 6595003  T
Q  98 attgttgacccaattcggtcc-aacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggt 196  Q
    |||||| || || |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  6595004 attgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagattcaaaagggt 6595103  T
Q  197 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttcc-aatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactc 294  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  6595104 tacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcctaatctcaccaatgaacaagacacccaatgattctcactc 6595203  T
Q  295 acccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
      |||| ||||||||||| |||||    
T  6595204 -tccaaagtgtttacaatttttcc 6595226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 45100021 - 45099703
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| |||||    |||||| | ||||||||||||||    
T  45100021 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagca-caaatcacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaaga 45099924  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtcc-aacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| | |||    
T  45099923 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtt 45099825  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttcta-cctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactca 295  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45099824 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 45099725  T
Q  296 cccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  45099724 -ccaaggtgtttacaatgtttcc 45099703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 4503034 - 4503352
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||||    
T  4503034 aataacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaac-acaagcacaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaaga 4503131  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| | |||    
T  4503132 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtt 4503230  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacc-tatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactca 295  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| | |||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4503231 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctctccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 4503330  T
Q  296 cccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  4503331 -ccaaggtgtttacaatgtttcc 4503352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 45727096 - 45726884
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  45727096 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 45726997  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  45726996 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactc-atgattttcactctccc 45726898  T
Q  299 aaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||    
T  45726897 aaggtgtttacaat 45726884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 36205566 - 36205883
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||||    |||||| | ||||||||||||||    
T  36205566 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagca-gaaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaaga 36205663  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtcc-aacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||  |||||||| | |||    
T  36205664 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtt 36205762  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  36205763 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 36205861  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  36205862 ccaaggtgtttaccatgtttcc 36205883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 111 - 312
Target Start/End: Original strand, 1631744 - 1631945
Alignment:
Q  111 ttcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagc 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  1631744 ttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagatattagc 1631843  T
Q  211 ttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 309  Q
    || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1631844 ttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctctcaaggtgtttac 1631942  T
Q  310 aat 312  Q
    |||    
T  1631943 aat 1631945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Original strand, 35446885 - 35447097
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35446885 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 35446984  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  35446985 aagaaattagattcaacaagatcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttaccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 35447083  T
Q  299 aaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||    
T  35447084 aaggtgtttacaat 35447097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 4484229 - 4484550
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaag--agaagcaaa---acacaccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||| |||   | |||||||||    
T  4484229 aataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagca-aaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaaag 4484327  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatg-gatacaaatggg 195  Q
    |||||| ||||| ||| |||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  4484328 attgttcacccagttctgtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggg 4484427  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttcta-cctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcact 293  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| || | ||||| |||| || ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4484428 ttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatttcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacact 4484526  T
Q  294 cacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  4484527 ca-ccaaggtgtttacaatgtttcc 4484550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 39285104 - 39284930
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacacca---aag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||   |||    
T  39285104 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccattaaag 39285006  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 173  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39285005 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 39284930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13122027 - 13121724
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||  | |||    
T  13122027 aataacaa-acctagatgtaatctagaaatcaa-gtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaacaataaatgt 13121931  T
Q  103 tgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    | |||||||  | |||||| | || || | ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  |||||||||    
T  13121930 ttacccaataag-tccaacttaacatagtttggaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagtttctacaaagagatacaaa--ggttacaag 13121834  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaaca-taatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaa 300  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13121833 aaattatcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacc-attttcccagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaa 13121735  T
Q  301 ggtgtttacaa 311  Q
     ||||||||||    
T  13121734 tgtgtttacaa 13121724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 102 - 312
Target Start/End: Original strand, 42288114 - 42288323
Alignment:
Q  102 ttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaa 201  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||    
T  42288114 ttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg-agagattgatctctccaatccattatcaatgagctcttacaaagaaatacaaatgggttacaa 42288212  T
Q  202 gaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaa 300  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||| |||||    
T  42288213 taaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaatgcacaagacactc-gtgattttcactctcccaa 42288311  T
Q  301 ggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||    
T  42288312 ggtgtttacaat 42288323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30833615 - 30833294
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagaga-agcaaaaca----caccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||| |  | || ||||||    ||||||||    
T  30833615 aataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaag 30833517  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatg-gatacaaatggg 195  Q
    |||||| ||||| ||| |||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  30833516 attgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggg 30833417  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttcta-cctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcact 293  Q
    ||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| || | |||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30833416 ttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacact 30833318  T
Q  294 cacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    || |||| |||||||||||||||||    
T  30833317 ca-ccaaagtgtttacaatgtttcc 30833294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 165 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24885763 - 24885609
Alignment:
Q  165 caatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcac 263  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||| | ||    
T  24885763 caatgagttcttacagaggggtacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactcattttcccaattttac 24885664  T
Q  264 aaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24885663 aaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 24885609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11049808 - 11049505
Alignment:
Q  12 acctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaat 111  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||| ||  | |||| ||||| |    
T  11049808 acctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaac-aaacacacaaagaaatgtttacccagt 11049710  T
Q  112 tcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatac-aaatgggttacaagaaattagc 210  Q
    || ||||||  ||||||| | ||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  11049709 tcagtccaatttgacctattatgaaggagagattgatcttttcaatctactatcaatgagttcttacaaagagatactaaaagggttataagaaattagc 11049610  T
Q  211 ttaaacaagctcacaaa----aacaaa-cataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 305  Q
    || ||||||||||||||    |||||| | |||||| |||| ||||| | |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11049609 ttcaacaagctcacaaattagaacaaaccctaatttatacc-attttcctaatctcaccaaaaaacaagacactcaatgattttcacttacccaaggtgt 11049511  T
Q  306 ttacaa 311  Q
    ||||||    
T  11049510 ttacaa 11049505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26353420 - 26353140
Alignment:
Q  29 taatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacct 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||| ||| || ||| ||||  ||||||||||| ||||||    
T  26353420 taatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaggagaggagagaaacaaa-cacacaaaaaat-gtttacccggttcggtccaacttgacct 26353323  T
Q  129 aatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa- 227  Q
    | |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  26353322 actctaagggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagtacttacaaaaagatacaaaagtgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaag 26353223  T
Q  228 aacaaa-cataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtt 315  Q
    |||||| | ||||||||| |  ||||| ||||||||| || ||     ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  26353222 aacaaaccttaatttcta-cacttttttcaatctcaccaaaga-----acactcaataattttcactcaccgagagtgtttacaatgtt 26353140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 316
Target Start/End: Original strand, 17490098 - 17490360
Alignment:
Q  48 aaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattga 147  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| || |  ||  | |||| ||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  17490098 aaaaccacaagcaaatgataaagagagaagagaaacaaa-catattaagaaatgtttacccagttcggtccaaattgacctactctaggggagagattga 17490196  T
Q  148 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaaaacaaacataatttctacct 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    || | ||||||||||     
T  17490197 tctctacaatccactatcaatgagttcttacaaagagttacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa---gaataaaatttctacc- 17490292  T
Q  248 atttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttt 316  Q
      |||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||    
T  17490293 -attttccaatctcaacaatgaacaagacattcaatgattttcacccacccactgtgtttgcaatgttt 17490360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 17450755 - 17450550
Alignment:
Q  89 acaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatac 188  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||    
T  17450755 acaccaaagattgttcacctagttcggtccaacttgacctactctgtgg-agagattgatctctccaatccactatcaatgagttc------------ac 17450669  T
Q  189 aaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgatt 287  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17450668 aaatgggttacaa-aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaagcctaatctctacccatttttcaaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatt 17450570  T
Q  288 ttcactcacccaaggtgttt 307  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17450569 ttcactcacccaaggtgttt 17450550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24398228 - 24398008
Alignment:
Q  98 attgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatggg 195  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| |||    
T  24398228 attgttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggg 24398129  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaa-cataatttctacctatttttc-caatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcac 292  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| |||||||  || ||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24398128 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcac 24398029  T
Q  293 tc-acccaaggtgtttacaat 312  Q
    ||  || ||||||||||||||    
T  24398028 tcttccaaaggtgtttacaat 24398008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 32289835 - 32289521
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagaga-agcaaaaca----caccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |  | || ||||||    ||||||||    
T  32289835 aataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaggacaccaaag 32289737  T
Q  98 a--ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatg-gatacaaatg 193  Q
    |  ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  32289736 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaag 32289637  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcac 292  Q
     ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||   ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||    
T  32289636 agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc--cttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcac 32289546  T
Q  293 tcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  32289545 tca-ccaaggtgtttaccatgtttcc 32289521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 7815190 - 7815486
Alignment:
Q  14 ctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaa-cataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaatt 112  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||  | | || ||||| ||    
T  7815190 ctagatctaatctaggaatcaa-gtgaaaaaacacaaaatcgcaagcaaaagataaagaaagaagagaaacaaa-cacaccaagaaatatttacccagtt 7815287  T
Q  113 cggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagctt 212  Q
    | ||||||  |||  || | || || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7815288 cagtccaatttgatatactatgtgg-agagattaatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 7815386  T
Q  213 aaacaagc-tcacaaaaacaaa-cataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttaca 310  Q
     ||||||| ||  || |||||| | ||||||| |||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7815387 caacaagcttctaaagaacaaaccctaatttcaacct-ttttctcaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcacccacctaaggtgtttaca 7815485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 24885852 - 24885761
Alignment:
Q  4 ataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24885852 ataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaaacaaaacacaccaa 24885761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1345730 - 1345590
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaa-agattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||| || ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| | ||||    
T  1345730 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaatcataagataaagtgagaagagaaac-aaacacaccaagaaattg 1345632  T
Q  102 ttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  1345631 ttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagaga 1345590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33648340 - 33648129
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||    
T  33648340 tgtttacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggtt 33648241  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaa-cataatttctacctatttttccaatct-cacaaatgaataagacactcaatgattttcactc 294  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| |||| |||||  |||||| | |  ||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  33648240 acaggaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttttacc-attttctcaatctcctctcatgtacaagacactcaattattttcactc 33648142  T
Q  295 acccaaggtgttt 307  Q
     |||||| |||||    
T  33648141 tcccaagatgttt 33648129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 236 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 39284915 - 39284833
Alignment:
Q  236 taatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39284915 taatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 39284833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2838213 - 2838079
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaa-agattg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||| | ||||    
T  2838213 aataacaacacctagatataatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagtgagaagagaa-------acaccaagaaattg 2838121  T
Q  102 ttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2838120 ttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagaga 2838079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28672163 - 28672022
Alignment:
Q  35 aagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagat-tgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatc 132  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| | || ||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  28672163 aagtgtaaaacacaaaatcacaagcaaaggataaagagagaagagaaacaaa-cacac-aaagatatatttacctaattcggtccaacaatgacctactc 28672066  T
Q  133 tgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 176  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28672065 tggaggagagattgatctctccaatccactgtcagtgagttctt 28672022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6266958 - 6266732
Alignment:
Q  6 aacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaag--agaag----caaaacacaccaa-aga 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  || |||||||||| || || ||||||| |||||||| ||||| |  |||||    ||||| ||||||| |||    
T  6266958 aacaacacctagatctaatctaggaaagaa-gtgaaaaacacaatac-acaagcacaagataaacggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagaga 6266861  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatggatacaaatgggt 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  6266860 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggt 6266762  T
Q  197 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaa 226  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  6266761 tacaagaaattagatttgacaagttcacaa 6266732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7451270 - 7451166
Alignment:
Q  115 gtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaa 214  Q
    ||||||| ||||||| | | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  7451270 gtccaacttgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgaattacaagaaattagcttca 7451171  T
Q  215 acaag 219  Q
    |||||    
T  7451170 acaag 7451166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 308
Target Start/End: Original strand, 12123492 - 12123794
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| ||||  | | |    
T  12123492 aataacaa-acctatatctaatctagaaatcaa-gtgaaaaatacaaaatcacaagcaaaagataaagagataagagaaacaaa-cacgccaagaaatat 12123588  T
Q  103 tgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    | || || |||||||||||| |||| || ||||| | | |||  ||| ||||   | |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| | ||||||    
T  12123589 ttactcagttcggtccaacaatgacttactctggagaaaaga--gatttctctgcttcactatcattgagttctttacaaaatgatacaaaagagttaca 12123686  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||||| ||||| |||||  ||| ||| |||||   |||||| |||  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  12123687 agaaataagcttcaacaaaatcataaagaacaactctaatttatactcatttt-ccaatctctcaaatgaacaagacactcgatgattttcactcatcca 12123785  T
Q  300 aggtgttta 308  Q
    |||||||||    
T  12123786 aggtgttta 12123794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Original strand, 42019816 - 42020021
Alignment:
Q  44 acataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagag 142  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||  | |||| | |||||| ||||||||| | ||||| | ||||| ||||    
T  42019816 acatcaaaccacaggcaaaa-ataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaagaagtgtttatccaatttggtccaacaataacctactatggggaagag 42019913  T
Q  143 attgatctctccaatccactatcaatgag---ttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagc-tcacaaaaacaaacataa 238  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||   || |||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| | | || |||||||||||    
T  42019914 attgatctctcaaattcactatcaatgagttttttttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttctacaagctttataagaacaaacataa 42020013  T
Q  239 tttctacc 246  Q
     |||||||    
T  42020014 attctacc 42020021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 164
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34388926
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagt-agctctccaatccactat 34388926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 13569319 - 13569396
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  13569319 aaacacaccaaa-attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 13569396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 13656028 - 13656146
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaatggatacaaat 192  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||     
T  13656028 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 13656126  T
Q  193 gggttacaagaaattagctt 212  Q
     |||||||||||||||||||    
T  13656127 aggttacaagaaattagctt 13656146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 14699113 - 14699056
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14699113 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 14699056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 20522211 - 20522268
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20522211 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 20522268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 307
Target Start/End: Original strand, 30218033 - 30218254
Alignment:
Q  89 acaccaaagattgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaatggat 186  Q
    |||||||| | |||| ||| | ||| |||||||| |||| || |||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||  |||||||  |||    
T  30218033 acaccaaaaaatgtttaccgagttcagtccaacaatgacttactctgggggagtgattgatcttttcaacccactatcaatgaattatttacaaagagat 30218132  T
Q  187 acaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctc-acaaaaacaaacataatttctacctatttttccaatct-cacaaatgaataagacactcaatg 284  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||| ||| ||||||| |||| | |||||| |    ||||| |||||||||||||    
T  30218133 acaaaatggttacaagaaattagcttcaataagctctccaagaacaaacctaacttctacccatttct-caatctccttccatgaacaagacactcaatg 30218231  T
Q  285 attttcactcacccaaggtgttt 307  Q
    |||| |||||   ||||||||||    
T  30218232 atttccactctgtcaaggtgttt 30218254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 36757870 - 36757816
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctggggg 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36757870 aaacacaccaaaagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctggggg 36757816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 12647382 - 12647501
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaatggatacaaa 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||    
T  12647382 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 12647480  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  12647481 gaggttacaagaaattagctt 12647501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 28259285 - 28259206
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  28259285 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagaga-gcagctctccaatccactat 28259206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8390256 - 8390179
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  8390256 aaacacaccaaa-attgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagaga-gcagctctccaatccactat 8390179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10445550 - 10445473
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  10445550 aaacacaccaa-gattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 10445473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16940315 - 16940257
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagat 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16940315 aaacacaccaa-gattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagat 16940257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17010980 - 17010922
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagat 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17010980 aaacacaccaa-gattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagat 17010922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 34682440 - 34682363
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  34682440 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 34682363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 31056034 - 31056092
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  31056034 aaacacaccaaagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagaga 31056092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 41446222 - 41446144
Alignment:
Q  184 gatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctc 261  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  41446222 gatacaaaagggttacttaaaattagcttcaacaagctctcaaagaacaaacataatttctacctttttttcgaatctc 41446144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 164
Target Start/End: Original strand, 8040060 - 8040128
Alignment:
Q  95 aagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  8040060 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 8040128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 245
Target Start/End: Original strand, 42261524 - 42261633
Alignment:
Q  138 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctc-acaaaaacaaaca 235  Q
    |||||| ||||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||   ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||     
T  42261524 gagagaatgatctctccgcttcactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaact 42261623  T
Q  236 taatttctac 245  Q
    ||||||||||    
T  42261624 taatttctac 42261633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707281
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-acaactctccaatccactat 10707281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41454356 - 41454241
Alignment:
Q  146 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcac-aaaaacaaacataatttct 243  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||  ||||||||    
T  41454356 gatctgtccacttcactatcaatgagttctttacaaatatatacaaaagagttgctagaaattagcttcaacaagctctcaaaaaacaaatctaatttct 41454257  T
Q  244 acctatttttccaatct 260  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  41454256 acc-atttttcgaatct 41454241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 39482922 - 39482979
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  39482922 aaacacaccaa-gattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 39482979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 42412150 - 42412117
Alignment:
Q  135 ggggagagattgatctctccaatccactatcaat 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42412150 ggggagagattgatctctccaatccactatcaat 42412117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Original strand, 5700279 - 5700335
Alignment:
Q  255 caatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 311  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  5700279 caatctctccaatgaacaagacactcaatgtttttcattcacccaaagtgtttacaa 5700335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 143
Target Start/End: Original strand, 17865203 - 17865251
Alignment:
Q  95 aagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17865203 aagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagaga 17865251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 137
Target Start/End: Original strand, 21629935 - 21629986
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggg 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21629935 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggg 21629986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23078578 - 23078499
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  23078578 aaacacaccaaaagaatgttgacccagttcgatccaatatgacctaatatgggggagaga-acaactctccaatccactat 23078499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 33528727 - 33528677
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctggg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  33528727 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatggg 33528677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 164
Target Start/End: Original strand, 25398495 - 25398563
Alignment:
Q  94 aaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  25398495 aaagattgttgacccagttcag-ccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 25398563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 33118127 - 33118184
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  33118127 aaacacaccaa-gattgttggctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagaga 33118184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 42039767 - 42039718
Alignment:
Q  94 aaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    |||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  42039767 aaagattgttgatctagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagaga 42039718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3022427 - 3022383
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  3022427 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 3022383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 3491740 - 3491818
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  3491740 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 3491818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 5375346 - 5375390
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  5375346 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 5375390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 6264148 - 6264192
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  6264148 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 6264192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 11739559 - 11739603
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  11739559 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 11739603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 13910045 - 13910089
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  13910045 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 13910089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 19502011 - 19502055
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  19502011 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 19502055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 23452237 - 23452281
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  23452237 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 23452281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 24162223 - 24162267
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  24162223 ttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtccgggggagaga 24162267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27105052 - 27105008
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  27105052 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 27105008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 35215586 - 35215630
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  35215586 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 35215630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 35217963 - 35218007
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  35217963 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 35218007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 36558864 - 36558908
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  36558864 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 36558908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 36561141 - 36561185
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  36561141 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 36561185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 41446357 - 41446325
Alignment:
Q  49 aaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaa 81  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41446357 aaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaa 41446325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 45332181 - 45332225
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  45332181 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 45332225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 85)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6599238 - 6598920
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6599238 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagaaaaagataaagggagaagagaaacaaaacacaccaaagatt 6599139  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6599138 gttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggttaca 6599039  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  6599038 agaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttcactcactca 6598939  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6598938 aggtgtttacaatgtttcc 6598920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6674691 - 6674373
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6674691 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagaaaaagataaagggagaagagaaacaaaacacaccaaagatt 6674592  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6674591 gttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggttaca 6674492  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  6674491 agaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttcactcactca 6674392  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6674391 aggtgtttacaatgtttcc 6674373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4731925 - 4731606
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||||    
T  4731925 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagat 4731826  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4731825 tgttgacccaattcggtccaacttgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 4731726  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4731725 aagaaattaggttcaacaagctcacaaagagcaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 4731626  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4731625 aaggtgtttacaatgtttcc 4731606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5689536 - 5689219
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  5689536 ataataacaacatctaaatctaatttagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagtaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacatcaaagatt 5689438  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5689437 gttgacccagttcggtccaacttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttaca 5689338  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  || | | ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5689337 agaaattagctttgacaagctcacaaagcaccaccttaatttctacccatttttccaatctcattaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccca 5689238  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5689237 aggtgtttacaatgtttcc 5689219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27811545 - 27811228
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaag--ggagaagagaag-caaaacacaccaaagat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  27811545 aataacaacacctagatctaatttaggaatcaaagtgaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaagcaagagaagaggggaaaaaacacaccaaagat 27811446  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27811445 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgggttcttacaaagagatacaaatgggttac 27811346  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27811345 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 27811246  T
Q  299 aaggtgtttacaatgttt 316  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27811245 aaggtgtttacaatgttt 27811228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 41366518 - 41366834
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaa-gggagaagagaagcaaaacacaccaaagattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41366518 aataacaacacctagatctaatataggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaatgggagaagagaaacaaaacacaccaaagattg 41366617  T
Q  102 ttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaa 201  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  41366618 ttgtcccagttcggtccaacttgacctaatctaggg-agagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagggatacaaataggttaaaa 41366716  T
Q  202 gaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41366717 gaaattagcttaaacaagcttacaaagaacaaacataatttctacccattttctcaatctcagtcttgaacaagacactcaatgattttcactcacccaa 41366816  T
Q  301 ggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41366817 ggtgtttacaatgtttcc 41366834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15213053 - 15212734
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||||    
T  15213053 aataacagcaccttgatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagat 15212954  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15212953 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 15212854  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15212853 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcactcaccc 15212754  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15212753 aaggtgtttacaatgtttcc 15212734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 40321345 - 40321028
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  40321345 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacatcaaagatt 40321247  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||||    
T  40321246 gttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagtttttacaaagagatactaatgggttaca 40321147  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  40321146 agaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacctatgaacaagacactcaatgattttcagtcactca 40321047  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40321046 aggtgtttacaatgtttcc 40321028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33352417 - 33352098
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||  ||||| | | ||||||| |||||||    
T  33352417 aataacaacacctaaatctaatctagaaatcaaagtgaaaaacacaaatccacaagcaaaagataaaaggagataagagaggaacaaacacatcaaagat 33352318  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33352317 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 33352218  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33352217 aagaaattaggttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaatcaccc 33352118  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  33352117 aaggtgtttacaatgtttcc 33352098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 43036692 - 43036371
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaag 97  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||    
T  43036692 ataacaacaccacctagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 43036593  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||    
T  43036592 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatt 43036493  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43036492 acaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 43036393  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43036392 ccaaggtgtttacaatgtttcc 43036371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 1345274 - 1345591
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1345274 ataataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaatctcaaaatcacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagatt 1345372  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  1345373 gttgacctagttcggtctaacttgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacatatgggttaca 1345472  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1345473 agaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccctaatttctacacattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcaccca 1345572  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  1345573 aggtgtttacaatatttcc 1345591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 3303569 - 3303890
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttag----taatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaa 96  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||     ||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  3303569 ataataactacacctagatctaatctaggaatcaatcaaagtgaaaagtacaaaatcacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaa 3303667  T
Q  97 gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggt 196  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  3303668 gattgtttacccagttcggtccaacttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagt 3303767  T
Q  197 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactca 295  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  3303768 tacaagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcaccaataaacaagatactcaatgattttcactca 3303867  T
Q  296 cccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  3303868 ctcaaggtgtttacaatgtttcc 3303890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30143607 - 30143290
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||||    
T  30143607 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagat 30143508  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    ||||||| || ||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30143507 tgttgactcagttcagttcaacttgaccttatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 30143408  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||  | |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  30143407 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctggccaatgaacaagaca--caatgattttcactcaccc 30143310  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    || |||||||||||||||||    
T  30143309 aatgtgtttacaatgtttcc 30143290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18142083 - 18141776
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||  |    
T  18142083 ataataacaacacctacatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagcagagaaacaag-cacaccaaag--t 18141987  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18141986 gttggcccagtttggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttaca 18141887  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaa 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18141886 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacctaatttctacccattttcacaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcgcccaa 18141787  T
Q  301 ggtgtttacaa 311  Q
    |||||||||||    
T  18141786 ggtgtttacaa 18141776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 42498462 - 42498142
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaa---acacaccaaagat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||   |||||||||||||    
T  42498462 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagggaaacaaacacaccaaagat 42498363  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtta 198  Q
    |||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  42498362 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaaagggtta 42498263  T
Q  199 caagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctattttt-ccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  42498262 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 42498164  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  42498163 ccaaggtgtttacaacgtttcc 42498142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 4743119 - 4743423
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4743119 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcgaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagattgt 4743217  T
Q  103 tgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  4743218 tgacccagttcggtccaacttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttct----------tacaaatgggttacaag 4743307  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaag 301  Q
    |  ||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4743308 attttagcttcaacaaacacacaaagaacaaacctaa-ttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcgctcacccaag 4743406  T
Q  302 gtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  4743407 gtgtttacaatgtttcc 4743423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 12702532 - 12702858
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaa-tcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaa 95  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    |||||| |||| || |||||    
T  12702532 ataacaacgacacctagatctaatctagaaaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcacaagataaagggagagaagagagaaacaaa-cataccaa 12702630  T
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatggg 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |||    
T  12702631 agattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagacacaaaaggg 12702730  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacc-----tatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgatttt 289  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||     | |||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  12702731 ttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacacttaatgatttt 12702830  T
Q  290 cactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12702831 cactca-ccaaggtgtttacaatgtttcc 12702858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 19491603 - 19491918
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaa-agattg 101  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| | ||||    
T  19491603 aataacaacacctatatctaatctaggaatcaaagtaaaaagctcaaaaccacaaacaaaagataaagtgagaaaagaaacaaa-cacaccaagatattg 19491701  T
Q  102 ttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaa 201  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19491702 ttgacctagttcggtccaatatgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaa 19491801  T
Q  202 gaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaa 300  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19491802 gaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaat-attttcactcacccaa 19491900  T
Q  301 ggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  19491901 gatgtttacgatgtttcc 19491918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30291865 - 30291561
Alignment:
Q  9 aacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgaccc 108  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |    
T  30291865 aacatctaaatctaatctagtaatcaaagtggaaagttcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagattgttgattc 30291767  T
Q  109 aattcggtccaacatgacctaatctgg-gggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaatt 207  Q
    | ||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  30291766 agttcggtccaacttggcataatctggagggagagattgatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagtgatacaaatgagttacaagaaatt 30291667  T
Q  208 agcttaaacaagctcacaaa-aac-aaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 305  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30291666 agcttcaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaatcacccaaggtgt 30291567  T
Q  306 ttacaa 311  Q
    ||||||    
T  30291566 ttacaa 30291561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 1292369 - 1292683
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||  | |||    
T  1292369 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacgagcaaaagataaggagagaagagaaacaaa-cacaccaagaaatgt 1292467  T
Q  103 tgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    |  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  1292468 ttgcccagttcggtccaacttgacctactctgggg-agagatttatttctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaag 1292566  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaag 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1292567 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacccattttctcaatctcaccaaagaacaagacactcaataattttcactcacccaag 1292666  T
Q  302 gtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  1292667 gtgttcacagtgtttcc 1292683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 34256408 - 34256725
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||||    
T  34256408 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaaga 34256505  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  34256506 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 34256605  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    ||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  34256606 acaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc-atttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacaca- 34256703  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34256704 ccaaggtgtttacaatgtttcc 34256725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17982920 - 17982601
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||||    |||||| | ||||||||||||||    
T  17982920 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagca-caaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaaga 17982823  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtcc-aacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  17982822 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtt 17982723  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttcta-cctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactca 295  Q
    ||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17982722 acaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 17982623  T
Q  296 cccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  17982622 -ccaaggtgtttacaatgtttcc 17982601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 89 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 40221923 - 40221700
Alignment:
Q  89 acaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatac 188  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  40221923 acaccaaagattattgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatac 40221824  T
Q  189 aaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgatt 287  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||| ||||||    
T  40221823 aaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttaccaatctcaccaaagaacaagacactc-atgatt 40221725  T
Q  288 ttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  40221724 ttcactctcccaaggtgtttacaat 40221700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 44304122 - 44303802
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||||    
T  44304122 aataacaacacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaaga 44304025  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||| | |||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| || ||    
T  44304024 ttgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaaggatt 44303925  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacc--tatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactc 294  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  | |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44303924 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 44303825  T
Q  295 acccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  44303824 a-ccaaggtgtttacaatgtttcc 44303802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 314
Target Start/End: Original strand, 34254232 - 34254545
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||||    
T  34254232 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaaga 34254329  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||    
T  34254330 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagggtt 34254429  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    ||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34254430 acaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 34254527  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgt 314  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34254528 ccaaggtgtttacaatgt 34254545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31218524 - 31218205
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||| || |||| || ||||| |||||||| |||||    |||||| | ||||||||||||||    
T  31218524 aataacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaa-cataagcacaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaaga 31218427  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtcc-aacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  31218426 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtt 31218327  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacc-tatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactca 295  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31218326 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 31218227  T
Q  296 cccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  31218226 -ccaaggtgtttacaatgtttcc 31218205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 19945260 - 19945580
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||||    |||||| | ||||||||||||||    
T  19945260 aataacagcacctagatctaatctaggaatcgaagtgaaaagca-caaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaaga 19945357  T
Q  99 ttgttgacccaattcgg-tccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatg-ggt 196  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| | |||    
T  19945358 ttgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagtggt 19945457  T
Q  197 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttcta-cctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactc 294  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19945458 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 19945557  T
Q  295 acccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  19945558 a-ccaaggtgtttacaatgtttcc 19945580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9765926 - 9765697
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatgg 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  9765926 aaacacaccaatgattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagc-agctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag 9765828  T
Q  185 atacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||     
T  9765827 atacaaatgggttacaagaaattagctttgccaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaa- 9765729  T
Q  284 gattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765728 ---tttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 9765697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Original strand, 42434992 - 42435204
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  42434992 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 42435091  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  42435092 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 42435190  T
Q  299 aaggtgtttacaat 312  Q
    || |||||||||||    
T  42435191 aaagtgtttacaat 42435204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 1746120 - 1746438
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |   ||||||||||||||| ||||| |||||    |||||| | ||||||||||| ||    
T  1746120 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtcaaaagc-gcaaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaacga 1746217  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtcc-aacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  1746218 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagggtt 1746316  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacc-tatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactca 295  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1746317 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 1746416  T
Q  296 cccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  1746417 -ccaaggtgtttacaatgtttcc 1746438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 18105976 - 18106298
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaa--------aacacacca 94  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||        || | || |    
T  18105976 aataacatcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaacttgaccaaagaaacaa 18106075  T
Q  95 a-agattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatg 193  Q
    | | |   |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18106076 acacaccattgacccagttcggtccaacttgacctattctgggg-agagattgatctctccaaac-actatcaatgagttcttacaaaag-atacaaatg 18106172  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcac 292  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||||    
T  18106173 agttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaacaactatagtttctatccatttttccaatctcaccgatgaacaagacactcaacaattttcac 18106272  T
Q  293 tcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18106273 tcacccaaggtgtttacaatgtttcc 18106298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4283691 - 4283479
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4283691 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 4283592  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcaca-aaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||     
T  4283591 aagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcct 4283493  T
Q  299 aaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||    
T  4283492 aaggtgtttacaat 4283479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 89 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18655578 - 18655355
Alignment:
Q  89 acaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatac 188  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  18655578 acaccaaaaaatgttcacccagttcggtccaacttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac 18655479  T
Q  189 aaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgatt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| || |||||| ||||||    
T  18655478 aaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaaaacactc-atgatt 18655380  T
Q  288 ttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  18655379 ttcactctcccaaggtgtttacaat 18655355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 311
Target Start/End: Original strand, 8965641 - 8965904
Alignment:
Q  48 aaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattga 147  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| |  | |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  8965641 aaaaccacaaacaaaagataaagagagaaaagaaacaaa-cacaccgataaatgtttacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattta 8965739  T
Q  148 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaa-cataatttctac 245  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||| | ||||||||||    
T  8965740 tctctccgatgcactatcaatgagttcttacaaagagatataaaagggttataagaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttctac 8965839  T
Q  246 ctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 311  Q
    || |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8965840 ct-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 8965904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 98 - 312
Target Start/End: Original strand, 10930198 - 10930412
Alignment:
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||    
T  10930198 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatataaatgggtt 10930297  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| | ||||||||| | ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  10930298 acaagaaattagcttcaacgagctcacaaagagcaaccctaatttctatccattttcccaatctcaccgatgaacaagacactc-atgattttcactctc 10930396  T
Q  297 ccaaggtgtttacaat 312  Q
    ||||  ||||||||||    
T  10930397 ccaaaatgtttacaat 10930412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 125 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 40328922 - 40328734
Alignment:
Q  125 acctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatac-aaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctca 223  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40328922 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagctca 40328823  T
Q  224 caaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40328822 caaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaagatgtttacaat 40328734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4162663 - 4162450
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  4162663 tgtttacccaattcggtccaacttgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 4162565  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |    
T  4162564 aagaaattagcttcaacaagttctcaaagaacaaacctaacttctacccattttcc---tctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcgctc 4162468  T
Q  299 aaggtgtttacaatgttt 316  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4162467 aaggtgtttacaatgttt 4162450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 134 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 44353926 - 44353747
Alignment:
Q  134 gggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaa 232  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  44353926 gggggagagattgatcttttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaa 44353827  T
Q  233 acataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
     | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  44353826 ccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagatactcaatgatttttactcacccaatgtgtttacaat 44353747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 11384163 - 11383941
Alignment:
Q  89 acaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatac 188  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||    
T  11384163 acaccaaaaaatgttcacccagttcggtccaacttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatcaatgggttcttacaaagagatac 11384064  T
Q  189 aaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgatt 287  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  11384063 aaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctca-taatgaacaagacactc-atgatt 11383966  T
Q  288 ttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  11383965 ttcactctcccaaggtgtttacaat 11383941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4733973 - 4733792
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagg--gagaagagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| || |||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||||     
T  4733973 aataacaacacctagatcaaatgtaggaaacaaaatgaaaagcacaaaaccacaaggaaaagataaaggtagagaagagaggaacaaacacaccaaagac 4733874  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 181  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4733873 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 4733792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10015344 - 10015121
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||||  | |    
T  10015344 ataataacaatacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaagttcaaaaccacaagcaaaagataaggagagaagagaaac-aaatacaccaagaaat 10015246  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    | | ||||| ||||||||||| ||||||| | | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||    
T  10015245 gattacccagttcggtccaacttgacctactat-ggagagagatttatctctccaatccactatcaatgagttccta-aaagagatacaaatgagttaca 10015148  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa 227  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10015147 agaaattagcttcaacaagcacacaaa 10015121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 114 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3772345 - 3772160
Alignment:
Q  114 ggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagctta 213  Q
    |||||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3772345 ggtccaacttgacctactctgagagatagattgatctctccaatccactatcaataaattcttacaaagatatacaaatgagttacaagaaattagctta 3772246  T
Q  214 aacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3772245 aataagctcacaaagaacaaacctaatttctatcaattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatcattttcactcaccc 3772160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 178 - 318
Target Start/End: Original strand, 41364926 - 41365067
Alignment:
Q  178 caaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagac 276  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    |||| |||||    
T  41364926 caaagggatacaaatgtgttacaagaaattagcttaaacaaactcacaaagaacaaacctaatttctaccaattttcccaatctcagtcttgaacaagac 41365025  T
Q  277 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41365026 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 41365067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 148 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10929907 - 10929750
Alignment:
Q  148 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||           | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10929907 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-----------gagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacc 10929819  T
Q  247 tatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtt 315  Q
     ||||| |  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10929818 cattttccatatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactaatccaaggtgtttacaatgtt 10929750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8153940 - 8153717
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatgg 184  Q
    |||||||||||| | | || | ||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       
T  8153940 aaacacaccaaaaaatatttatccatttcggtccaacttgacctactctgaggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagat 8153841  T
Q  185 atacaaatgggttacaagaaattagcttaaac-aagctcacaaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatga--ataagacactca 281  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||||| ||| ||||||| |     || | ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||  || | |||||||    
T  8153840 atacaaaagagttacacgaatttagcttcaacaaagctcaga-----aaccctaatttctacc-attttctcaatctcaccaatgaacatgacacactca 8153747  T
Q  282 atgattttcactcacccaaggtgtttacaa 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8153746 atgattttcactcatccaaggtgtatacaa 8153717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1822425 - 1822282
Alignment:
Q  135 ggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| || |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1822425 ggggagagattgatctctccaattcactattagtgagttatttacaaatagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa 1822326  T
Q  233 a-cataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagac 276  Q
    | ||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  1822325 accataatttctatc-ctttttgcaatctctcaaatgaacaagac 1822282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1856870 - 1856727
Alignment:
Q  135 ggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| || |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1856870 ggggagagattgatctctccaattcactattagtgagttatttacaaatagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa 1856771  T
Q  233 a-cataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagac 276  Q
    | ||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  1856770 accataatttctatc-ctttttgcaatctctcaaatgaacaagac 1856727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 207
Target Start/End: Original strand, 3073824 - 3073981
Alignment:
Q  48 aaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||  |  | |||| ||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||| |||||||||    
T  3073824 aaaaccacaagcaaaagataaagagataagagaaacaaa-cacacatagaaatgtttacccagttcggcccaacttgacctactatgggg-agagattga 3073921  T
Q  148 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaatt 207  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||    
T  3073922 tctctccaagccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaatt 3073981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2628005 - 2627824
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagaga-agcaaaaca----caccaa-a 96  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |  | || ||||||    |||||| |    
T  2628005 aataacaacacctagatctaatctaggaaacaa-gtgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaga 2627908  T
Q  97 gattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttaca 179  Q
    |||| || ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2627907 gattattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttaca 2627824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7597866 - 7597659
Alignment:
Q  15 tagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcg 114  Q
    |||||||||||||| || ||| ||| |||||| ||||| | || |||||||||||| |||||||||| ||   |||| |||  | | || | ||| ||||    
T  7597866 tagatctaatttaggaaccaa-gtgtaaaacacaaaacgataaacaaaagataaagagagaagagaaacacg-cacatcaataaatatttatccagttcg 7597769  T
Q  115 gtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagctt 212  Q
    ||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  7597768 gtctaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgcattctttacaaagagatacaaaaggattataagaaattagctt 7597669  T
Q  213 aaacaagctc 222  Q
     |||||||||    
T  7597668 caacaagctc 7597659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 11711911 - 11712124
Alignment:
Q  12 acctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaa--aacacaccaaagattgttgaccca 109  Q
    ||||||||||||| ||| ||| | |||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||   |  |||| | |||  | |||| |||||    
T  11711911 acctagatctaatataggaat-agagtgtaaagcataaaaccacaaacaaaggataaagagagaaaagaaattacaaacatatcaagaaatgtttaccca 11712009  T
Q  110 attcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaatggatacaaatgggttacaagaaatt 207  Q
    ||| || |||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||| ||||| |||||||||    
T  11712010 attaggaccaacaatgacctactttgagggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaagggtttcaagaaatt 11712109  T
Q  208 agcttaaacaagctc 222  Q
    ||||| |||||||||    
T  11712110 agcttcaacaagctc 11712124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25690126 - 25689958
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatggatacaaatg 193  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||      
T  25690126 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 25690028  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaa-cataatttctacctatttttccaatctcac 263  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25690027 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacct-ttttcccaatctcac 25689958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3439675 - 3439558
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatggatacaaatg 193  Q
    |||||||| | ||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||      
T  3439675 agattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 3439577  T
Q  194 ggttacaagaaattagctt 212  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3439576 ggttacaagaaattagctt 3439558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26403336 - 26403259
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  26403336 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 26403259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 219
Target Start/End: Original strand, 29796307 - 29796442
Alignment:
Q  86 aacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgag--ttcttacaaat 182  Q
    ||||||||||| || ||| ||| | |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||||||||    
T  29796307 aacacaccaaaaat-gtttaccaagttcggtccaacaatgacctacattgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagtttttttacaaat 29796405  T
Q  183 ggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaag 219  Q
     | ||||||   |||||||||||| ||||| ||||||    
T  29796406 aggtacaaaaatgttacaagaaatcagcttcaacaag 29796442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 217
Target Start/End: Original strand, 32902196 - 32902292
Alignment:
Q  122 atgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaaca 217  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  32902196 atgacctactcagggggagagattgatctctcaaattcactatcaatgaattctttagaaagagatacaaaaaagttacaagaaattagcttcaaca 32902292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 4696702 - 4696645
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4696702 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagaga 4696645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5702589 - 5702532
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  5702589 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 5702532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 19175852 - 19175783
Alignment:
Q  94 aaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  19175852 aaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcaactctccaatccactat 19175783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31071327 - 31071258
Alignment:
Q  94 aaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  31071327 aaagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 31071258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 3051026 - 3051090
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaaga 65  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |  ||||||||||||| ||||    
T  3051026 ataataacaacacctagatctaatctagaaattaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcataaga 3051090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30909487 - 30909413
Alignment:
Q  147 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctc 222  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||  |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30909487 atctctccaattcactatcaacgagtcattacaaagagatacaaa-gagttacaagaaattagtttaaacaagctc 30909413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 164
Target Start/End: Original strand, 7412344 - 7412409
Alignment:
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  7412344 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 7412409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23799683 - 23799626
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  23799683 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagaga 23799626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 4456017 - 4456096
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  4456017 aaacacaccaaaagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 4456096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 22684653 - 22684697
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22684653 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagaga 22684697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38863985 - 38863949
Alignment:
Q  140 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38863985 gagattgatctctccaatccactatcaacgagttctt 38863949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 42575320 - 42575439
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatgg-atacaaa 191  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||    
T  42575320 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 42575418  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  42575419 gaggttacaagaaattagctt 42575439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 6127211 - 6127289
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||||| |||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| |||||   | ||||||||||||||||    
T  6127211 aaacacatcaaatattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagc-agctctccaatccactat 6127289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15290687 - 15290577
Alignment:
Q  105 acccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatgg-atacaaatgggttaca 200  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||  |||||||    
T  15290687 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 15290589  T
Q  201 agaaattagctt 212  Q
    ||||||||||||    
T  15290588 agaaattagctt 15290577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15471056 - 15470946
Alignment:
Q  105 acccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatgg-atacaaatgggttaca 200  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||  |||||||    
T  15471056 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 15470958  T
Q  201 agaaattagctt 212  Q
    ||||||||||||    
T  15470957 agaaattagctt 15470946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10240264 - 10240194
Alignment:
Q  158 ccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||   |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10240264 ccactatcaatgagttctttacaaagagatccaacatggttacaagaaattagattcaacaagctcacaaa 10240194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19752500 - 19752443
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  19752500 aaacacaccaa-gattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagaga 19752443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Original strand, 32902096 - 32902152
Alignment:
Q  12 acctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaa 69  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  32902096 acctagatctaatctaggaaccaa-gtgaaaaacacaaaaccaaaagcaaaagataaa 32902152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 143
Target Start/End: Original strand, 33541413 - 33541454
Alignment:
Q  102 ttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  33541413 ttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 33541454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3874345 - 3874301
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  3874345 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 3874301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 4162732 - 4162684
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaa 51  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4162732 aataataaaacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaa 4162684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 4424353 - 4424309
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  4424353 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 4424309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 14419190 - 14419234
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  14419190 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 14419234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 14808096 - 14808052
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  14808096 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 14808052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18811042 - 18810998
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  18811042 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagaga 18810998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27829631 - 27829587
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  27829631 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 27829587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 30480503 - 30480547
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  30480503 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 30480547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 43079937 - 43079893
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  43079937 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 43079893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 43082308 - 43082264
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  43082308 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 43082264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 133)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 22834907 - 22835222
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  22834907 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaggaagaagagaaagaaaacacaccaaatattgt 22835006  T
Q  103 tgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22835007 tgacc-agttcggtccaacttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaag 22835105  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaag 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22835106 aaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaag 22835205  T
Q  302 gtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||| |||||||||||||    
T  22835206 gtgattacaatgtttcc 22835222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 39153263 - 39153581
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  39153263 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagatt 39153362  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  39153363 gttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttataaagggatacaaatgagttaca 39153462  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39153463 agaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacacatgaacaagacactcaatgattttcattcaccca 39153562  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39153563 aggtgtttacaatgtttcc 39153581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29682616 - 29682307
Alignment:
Q  11 cacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaa-acacaccaaagattgttgaccca 109  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||    
T  29682616 cacctagatctaacctaggaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagagaaacatacacaccaaagattgttgaccca 29682517  T
Q  110 attcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattag 209  Q
     ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  29682516 gttcggtccaacttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtgacaagaaattag 29682417  T
Q  210 cttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29682416 cttaaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacccattttcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 29682317  T
Q  309 caatgtttcc 318  Q
    ||||||||||    
T  29682316 caatgtttcc 29682307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 761104 - 760795
Alignment:
Q  11 cacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagca-aaacacaccaaagattgttgaccca 109  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||    
T  761104 cacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttaaccca 761005  T
Q  110 attcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattag 209  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  761004 tttcagtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattag 760905  T
Q  210 cttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 308  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  760904 cttaaacaagctcacaaagaacagacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcatccaaggtgttta 760805  T
Q  309 caatgtttcc 318  Q
     |||||||||    
T  760804 taatgtttcc 760795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 29196289 - 29196600
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29196289 ataataacaacacctagatctaatctggtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagatt 29196387  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  29196388 gttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttcca 29196487  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaa-cataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29196488 agaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 29196587  T
Q  299 aaggtgtttacaa 311  Q
    |||||||||||||    
T  29196588 aaggtgtttacaa 29196600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 23391811 - 23392129
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaa-cataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23391811 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagat 23391909  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  23391910 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgatacaaatgggttac 23392009  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23392010 aagaaattatcttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctactcattttcccaaactcaccaatgaaaaagacactaaatgattttcactcaccc 23392109  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23392110 aaggtgtttacaatgtttcc 23392129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 40734764 - 40734446
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagg-gagaagagaagca-aaacacaccaaagatt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| |||||||||    
T  40734764 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgcaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaggagagaagagaggaacaaacactccaaagatt 40734665  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  40734664 gttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgtgttaca 40734565  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40734564 agaaattaggttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccca 40734465  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40734464 aggtgtttacaatgtttcc 40734446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29811135 - 29810816
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||||    
T  29811135 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagatgaacaaacacaccaaagat 29811036  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29811035 tgttgacccaattcggtttaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 29810936  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||   |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29810935 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaactctaatttctacatattttcctaatctcaccaatgaataagacattcaatgattttcactcaccc 29810836  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29810835 aaggtgtttacaatgtttcc 29810816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 44700382 - 44700691
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  44700382 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaggataaagagagaagagaaacaaa-cacacgaaagatt 44700480  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  44700481 gttgacctagttcggtccaacttgacctaatgtgggg-agagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaataggttaca 44700579  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44700580 agaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccca 44700679  T
Q  300 aggtgtttacaa 311  Q
    ||||||||||||    
T  44700680 aggtgtttacaa 44700691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 9666369 - 9666680
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||    
T  9666369 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagataagagaaacaaa-cacaccaaagatt 9666467  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | || ||||| ||||||    
T  9666468 gttgacccagttcggtccaactttacctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagaggtataaatgagttaca 9666567  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aac-aaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9666568 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 9666667  T
Q  299 aaggtgtttacaa 311  Q
    |||||||||||||    
T  9666668 aaggtgtttacaa 9666680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31314710 - 31314393
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31314710 ataataacaacacctaaatataatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagatt 31314612  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31314611 gttgactcagttcggtccaacttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaagatacaaatgggttaca 31314512  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | ||||||||||| |||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31314511 agaaattagcttcaacaagatcacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcacctatgaacaagacactcaatgattttcactcaccca 31314412  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    | |||||||||||||||||    
T  31314411 aagtgtttacaatgtttcc 31314393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29813328 - 29813011
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagca-aaacacaccaaagattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||    
T  29813328 aataacagcacctagatctaatctaagaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaaccaaaagataaagggagaagagaggaacaaacacatcaaagattg 29813229  T
Q  102 ttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaa 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  29813228 ttgacccagttcggtccaacatgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatgcaaatgggttacaa 29813129  T
Q  202 gaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaa 300  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29813128 gaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctatttttccaatctcaccaattaacaagcccctcaatgattttcactcacccaa 29813029  T
Q  301 ggtgtttacaatgtttcc 318  Q
     |||||||||||| ||||    
T  29813028 tgtgtttacaatgcttcc 29813011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16499291 - 16498979
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  16499291 aataacaacacctaaatctaatctaggaatcaaa-tgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaat-acaccaaagattgt 16499194  T
Q  103 tgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  16499193 tgacccagttcggtccaacttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaacaag 16499094  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaagg 302  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16499093 aaattagcttcaacaagcttacaaaaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaagg 16498994  T
Q  303 tgtttacaatgtttc 317  Q
    |||||||||||||||    
T  16498993 tgtttacaatgtttc 16498979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 51399081 - 51398762
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||||    
T  51399081 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagat 51398982  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  51398981 tgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 51398882  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcac-aaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  51398881 aagaaattagcttcaacaagttcactaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattttcactcatcc 51398782  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  51398781 aaggtgtttacaatatttcc 51398762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9581550 - 9581231
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||    |||||| |||| |||| ||||||    
T  9581550 aataacagcacctagatctaatctatgaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcacaaaataaagggagagaagagagaaacaaa-cacatcaaaga 9581452  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9581451 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtt 9581352  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9581351 aaaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccca-tttccgaatcccacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 9581253  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9581252 ccaaggtgtttacaatgtttcc 9581231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 19683789 - 19684109
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||||    
T  19683789 aataacagcacctagatctaatctaggaataaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaaga 19683887  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  19683888 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 19683987  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19683988 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcac 19684087  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19684088 ccaaggtgtttacaatgtttcc 19684109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Original strand, 23410234 - 23410547
Alignment:
Q  5 taacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacat--aaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| |||||||||||||||    
T  23410234 taacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtaaaaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaatataaacaaa-cacaccaaagattgt 23410332  T
Q  103 tgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| | |    
T  23410333 tgacccaattcgttccaacttgacctaatttgggggagagatttatctctccaatccattatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttatacg 23410432  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaag 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23410433 aaattagcttaaacaagctcacaaagaataaacataatttctacccattttccaaatttcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcactcaag 23410532  T
Q  302 gtgtttacaatgttt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  23410533 gtgtttacaatgttt 23410547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 40735649 - 40735331
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagg-gagaagagaagca-aaacacaccaaagatt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||| ||||||||||||    
T  40735649 aataacagcacctagatctaatataggaaccaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaggagagaagagaggaacaaatacaccaaagatt 40735550  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||    
T  40735549 gctgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaactggttaca 40735450  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||    
T  40735449 ataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacttttcca 40735350  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40735349 aggtgtttacaatgtttcc 40735331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 318
Target Start/End: Original strand, 5236368 - 5236676
Alignment:
Q  13 cctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagattgttgaccca 109  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||  ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  5236368 cctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgaccca 5236467  T
Q  110 attcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattag 209  Q
     || |||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5236468 gtttggtccaaattgacctaatctggggaa-agattgatctctcgaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattag 5236566  T
Q  210 cttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 308  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5236567 cttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 5236666  T
Q  309 caatgtttcc 318  Q
    ||||||||||    
T  5236667 caatgtttcc 5236676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 32891364 - 32891051
Alignment:
Q  6 aacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttga 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||  | || | |    
T  32891364 aacaacacctagatctaatataggaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaggagagaagagaaacaaa-cacaccaagaaatgatta 32891266  T
Q  106 cccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaa 205  Q
     ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  32891265 tccagttcggtccaacatgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaa 32891166  T
Q  206 ttagcttaaacaagctcacaaa-aac-aaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggt 303  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32891165 ttagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacccattttctcaatctcaccgaagaacaagacactcaatgatttttactcacccaaggt 32891066  T
Q  304 gtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||    
T  32891065 gtttacaatgtttcc 32891051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7762533 - 7762214
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    |||||| |||| |||| || |||    
T  7762533 aataacaacacctagatctaatttaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacatcataga 7762435  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||    
T  7762434 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtt 7762335  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7762334 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactca- 7762236  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||| ||||| |||||    
T  7762235 ccaaggtgttcacaatatttcc 7762214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 316
Target Start/End: Original strand, 53921422 - 53921721
Alignment:
Q  17 gatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggt 116  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| ||  | |||| | ||| ||||||    
T  53921422 gatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaaacaaaatataaagagagaagagaaacaaa-cacactaagaaatgtttatccagttcggt 53921520  T
Q  117 ccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaac 216  Q
    | ||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  53921521 caaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatgagttacaagaaattagctttaac 53921620  T
Q  217 aagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtt 315  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53921621 aagctcacaaacaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtttttacaatgtt 53921720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 95 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 44331717 - 44331493
Alignment:
Q  95 aagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgg 194  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  44331717 aagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatgg 44331618  T
Q  195 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcact 293  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44331617 cttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 44331518  T
Q  294 cacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  44331517 cacccaaggtgtttacaatgtttcc 44331493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Original strand, 32744349 - 32744646
Alignment:
Q  4 ataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgtt 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||       |||||||||||||||||| || | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32744349 ataacaacacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaaac-------cacaagcaaaagataaagagatatgagaaacaaa-cacaccaaagattgtt 32744440  T
Q  104 gacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaaga 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  32744441 gacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgagttacaaga 32744540  T
Q  204 aattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaagg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||        | ||||||||||||||||||| |||| |    
T  32744541 aattagcttaaacaagctcacaaagaacaaac-taatttctacccattttttcaatctcacaaa--------atactcaatgattttcactca-ccaatg 32744630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37408726 - 37408407
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||||    
T  37408726 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcactaaatcacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaaga 37408628  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  37408627 ttgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 37408528  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  37408527 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactca- 37408429  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  37408428 ctaaggtgtttacaatgtttcc 37408407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 5258045 - 5258364
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||||    |||||| | ||||||||||||||    
T  5258045 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagca-caaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaaga 5258142  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtcc-aacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  5258143 ttgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtt 5258242  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttcta-cctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactca 295  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5258243 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 5258342  T
Q  296 cccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  5258343 -ccaaggtgtttacaatgtttcc 5258364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 5260224 - 5260543
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||||    |||||| | ||||||||||||||    
T  5260224 aataacaacacctagatctaatttaggaatcaaagtgaaaagca-caaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaaga 5260321  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtcc-aacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||||| | ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  5260322 ttgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactttggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtt 5260421  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttcta-cctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactca 295  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5260422 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactca 5260521  T
Q  296 cccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  5260522 -ccaaggtgtttacaatgtttcc 5260543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34491394 - 34491168
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatgg 184  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  34491394 aaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag 34491295  T
Q  185 atacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaat 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||      
T  34491294 atacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataacacactca-- 34491197  T
Q  284 gattttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||    
T  34491196 gaatttcactctcccaaggtgtttacaat 34491168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 45095430 - 45095113
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||  |||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    |||||| ||||  || |||||||    
T  45095430 aataacagcacatagatctaatctatgaatcaaagagtaaaacacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaatagagaaacaaat-acgccaaaga 45095333  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  45095332 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 45095233  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  45095232 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 45095135  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  45095134 ccaaggtgtttacaatgtttcc 45095113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7764732 - 7764416
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||||    
T  7764732 aataacagcacctagatctaatcttggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaaga 7764634  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacat-gacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||  | |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||    
T  7764633 ttgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtt 7764534  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||   ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  7764533 acaagaaattagctttaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc--cttttcc-ctctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 7764438  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7764437 ccaaggtgtttacaatgtttcc 7764416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 98 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30236294 - 30236080
Alignment:
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  30236294 attgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtt 30236195  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||  |    
T  30236194 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcatcaatgaacaagacactc-atgattttcactatc 30236096  T
Q  297 ccaaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||||    
T  30236095 ccaaggtgtttacaat 30236080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 318
Target Start/End: Original strand, 23200043 - 23200356
Alignment:
Q  9 aacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaag--agaagcaaa---acacaccaaagattgtt 103  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |  ||||| |||   | |||||||||||||||    
T  23200043 aacacctagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaa-ccacaagcataagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaaagattgtt 23200141  T
Q  104 gacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
     ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  23200142 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggttacaag 23200241  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaag 301  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||| |||||   |||||||||||  |||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23200242 aaattagctttgacaagttcacaaagaacaactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcactca-ccaag 23200339  T
Q  302 gtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  23200340 gtgtttacaatgtttcc 23200356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 89 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 46860653 - 46860427
Alignment:
Q  89 acaccaaagattgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggata 187  Q
    |||||||| | |||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  46860653 acaccaaaaaatgttcatccaattcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagata 46860554  T
Q  188 caaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatg-a 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| |||||||||| || |    
T  46860553 caaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgaa 46860454  T
Q  286 ttttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  46860453 ttttcactctcccaaggtgtttacaat 46860427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 318
Target Start/End: Original strand, 23197844 - 23198157
Alignment:
Q  9 aacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga-agagaagcaaaaca----caccaaagattgtt 103  Q
    ||||| |||||||||| ||| || |||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||  || ||||||    ||||||||||||||    
T  23197844 aacacatagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaa-ccacaagcacaagataaaaggagagagaagaggaaaacaaagacaccaaagattgtt 23197942  T
Q  104 gacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
     ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  23197943 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggttacaag 23198042  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcac-aaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaag 301  Q
    ||||||||||  ||||| |||| ||||||||   |||||||||||  |||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23198043 aaattagctttgacaagttcacaaaaaacaactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcactca-ccaag 23198140  T
Q  302 gtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  23198141 gtgtttacaatgtttcc 23198157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 98 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 47304420 - 47304210
Alignment:
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||    
T  47304420 attgttgacccagttcggtcaaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacagatgggtt 47304321  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  47304320 acaagatattaacttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 47304222  T
Q  297 ccaaggtgttta 308  Q
    ||| ||||||||    
T  47304221 ccagggtgttta 47304210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 9636025 - 9636346
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagat-aaagggaga----agagaagcaaaacacaccaa-a 96  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||||||    |||||| | ||||||||||| |    
T  9636025 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcat-aaatcacaagcacaagataaaagggagagcagagagaaac-aaacacaccaaga 9636122  T
Q  97 gattgttgacccaattcgg-tccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatggg 195  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  9636123 gattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaaggg 9636222  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttcta-cctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcact 293  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| || | |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9636223 ttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcact 9636322  T
Q  294 cacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    || |||||||||||||||| |||||    
T  9636323 ca-ccaaggtgtttacaatatttcc 9636346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 96 - 312
Target Start/End: Original strand, 49199465 - 49199683
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaac-atgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatac-aaatg 193  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  49199465 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatg 49199564  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcac 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||    
T  49199565 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaacgaacaagacactc-atgattttcac 49199663  T
Q  293 tcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  49199664 tctcccaaagtgtttacaat 49199683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4570120 - 4569906
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtta 198  Q
    |||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  4570120 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 4570021  T
Q  199 caagaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 297  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4570020 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 4569921  T
Q  298 caaggtgtttacaat 312  Q
    |||||||||||||||    
T  4569920 caaggtgtttacaat 4569906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 111 - 312
Target Start/End: Original strand, 6095611 - 6095812
Alignment:
Q  111 ttcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagc 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  6095611 ttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattaac 6095710  T
Q  211 ttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 309  Q
    || || ||| | ||||| ||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6095711 ttcaagaagtttacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaataagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttac 6095809  T
Q  310 aat 312  Q
    |||    
T  6095810 aat 6095812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 54593871 - 54593659
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  54593871 tgttcacccagtttggtccaacttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 54593772  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  54593771 aataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctgcacattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 54593673  T
Q  299 aaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||    
T  54593672 aaggtgtttacaat 54593659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 312
Target Start/End: Original strand, 43401797 - 43402015
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaac-atgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggat-acaaatg 193  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||    
T  43401797 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatg 43401896  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcac 292  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  43401897 cgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcac 43401995  T
Q  293 tcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    || |||||||||||||||||    
T  43401996 tctcccaaggtgtttacaat 43402015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 312
Target Start/End: Original strand, 43403740 - 43403958
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaac-atgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaa-atg 193  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||    
T  43403740 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaacatg 43403839  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcac 292  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  43403840 agttacaagaaatgagcttcaacaagctcacaaagaacaagcctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcac 43403938  T
Q  293 tcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  43403939 tctcccaaagtgtttacaat 43403958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 46173526 - 46173321
Alignment:
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  46173526 attgttgatctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaatgggtt 46173427  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||         || |||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  46173426 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaatttt---------accaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 46173337  T
Q  297 ccaaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||||    
T  46173336 ccaaggtgtttacaat 46173321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Original strand, 41819523 - 41819737
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaa-tgggtt 197  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  41819523 tgttcacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 41819621  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaaaa-caaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||| |    
T  41819622 acaagaaattagcttagacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctc 41819721  T
Q  297 ccaaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||||    
T  41819722 ccaaggtgtttacaat 41819737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 96 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 40913464 - 40913352
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatggg 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |    
T  40913464 agattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttacaaagagatacaaatgag 40913365  T
Q  196 ttacaagaaatta 208  Q
    |||||||||||||    
T  40913364 ttacaagaaatta 40913352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 132 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36018987 - 36018806
Alignment:
Q  132 ctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaa-tgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aa 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  36018987 ctgggggagagattgacctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattaacttcaacaagctcacaaagaa 36018889  T
Q  230 caaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    ||| | ||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36018888 caaccctaatttcaacccattttcccaatttcaccaatgaacaagtcactcgttaattttcactctcccaaggtgtttacaat 36018806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 312
Target Start/End: Original strand, 31340268 - 31340414
Alignment:
Q  166 aatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcaca 264  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||||     
T  31340268 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacctcaatttctaccaattttcccaatctcacc 31340367  T
Q  265 aatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31340368 aatgaacaaaacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 31340414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Original strand, 2075012 - 2075149
Alignment:
Q  35 aagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctg 134  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||| |  | |||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||     
T  2075012 aagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaataaa-cacacccagaaatgtttacccagttcgatccaacttgacctactctc 2075110  T
Q  135 ggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 173  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2075111 ggggagagattgatctctcaaatccactatcaattagtt 2075149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 175 - 312
Target Start/End: Original strand, 5433952 - 5434091
Alignment:
Q  175 ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaaca-taatttctacctatttttcc-aatctcacaaatgaat 271  Q
    |||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||     
T  5433952 ttacaaagagatataaaagggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaatgaac 5434051  T
Q  272 aagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5434052 aagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaat 5434091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 215 - 318
Target Start/End: Original strand, 26386597 - 26386701
Alignment:
Q  215 acaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatg 313  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||    
T  26386597 acaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtatttaccctg 26386696  T
Q  314 tttcc 318  Q
    |||||    
T  26386697 tttcc 26386701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 206
Target Start/End: Original strand, 55301983 - 55302079
Alignment:
Q  111 ttcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaat 206  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  55301983 ttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaataggttacaagaaat 55302079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Original strand, 7780000 - 7780168
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatg-gatacaaatg 193  Q
    |||||||| ||||| || ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||      
T  7780000 agattgttcacccactttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaa-a 7780098  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcac 263  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||||| | |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  7780099 ggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac 7780168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 307
Target Start/End: Original strand, 35138746 - 35138915
Alignment:
Q  140 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctca-caaaaacaaacata 237  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | ||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||| ||||||||||    
T  35138746 gagattgttctcttccatccactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttgcaagaaattaacttcaacaaactcaccaagaacaaacata 35138845  T
Q  238 atttctacctatttttccaatctc-acaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 307  Q
    ||||||||| |||| | |||||||     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35138846 atttctacccatttct-caatctctttccatgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgttt 35138915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20937790 - 20937670
Alignment:
Q  133 tgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta-caaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcac-aaaaac 230  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  20937790 tgggggaacgattgatctctccaatcta-tatcaatgagttcttttcaaagagatacaaaagggttacaagaaattaacttcaacaagctctccaaaaac 20937692  T
Q  231 aaacataatttctacctatttt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20937691 aaacataatttctacctatttt 20937670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 801264 - 801094
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatg-gatac-aaat 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||     
T  801264 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaa 801165  T
Q  193 gggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcac 263  Q
    | ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||||| | |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  801164 gagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac 801094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Original strand, 27305625 - 27305777
Alignment:
Q  12 acctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaat 111  Q
    ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||| ||||| ||  | |||  || || |    
T  27305625 acctagatctaatctaggagt-aaagtgaaaaacacaaaaccacaaacaaaagataaatagagaagagaaacaaa-cacacaaagaaatgtatacacagt 27305722  T
Q  112 tcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatca 166  Q
    |||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27305723 tcggtccaaattgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5373353 - 5373198
Alignment:
Q  148 tctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaa-cataatttcta 244  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| |||||||  |||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||| | |||||||||    
T  5373353 tctctccaatccattggcaatgagttccttacaaagagatataaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcaaaaagaacaaagcctaatttcta 5373254  T
Q  245 cctatttttcc-aatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    ||  ||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5373253 cccttttttcccaatctcttcaatgaacaagacactcaatgattttccctcaccca 5373198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6716671 - 6716554
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatggatacaaatg 193  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||      
T  6716671 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 6716573  T
Q  194 ggttacaagaaattagctt 212  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6716572 ggttacaagaaattagctt 6716554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 112
Target Start/End: Original strand, 21350908 - 21351017
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaa-agattg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| | ||||    
T  21350908 aataacaacacttagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcataaccacaagcataagataaagtgagaagagaaac-aaacacaccaagaaattg 21351006  T
Q  102 ttgacccaatt 112  Q
    |||||||||||    
T  21351007 ttgacccaatt 21351017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 54635296 - 54635179
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatggatacaaatg 193  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||      
T  54635296 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 54635198  T
Q  194 ggttacaagaaattagctt 212  Q
    |||||||||||||||||||    
T  54635197 ggttacaagaaattagctt 54635179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 25795771 - 25795829
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25795771 aaacacaccaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 25795829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 286
Target Start/End: Original strand, 51352150 - 51352298
Alignment:
Q  138 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaa-ca 235  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||   |||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| |     
T  51352150 gagagattgatctctcaaatccactctcaatgagttattacaaagaaatacaaat-ggttacaagaaattaactttaaaaagctcacaatgaacaaaccc 51352248  T
Q  236 taatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgat 286  Q
    ||| ||||| | ||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  51352249 taacttctatc-attttcctaatctcaccaataaacaagacactcaatgat 51352298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33192049 - 33191877
Alignment:
Q  48 aaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattg 146  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||| |||| |||| ||||||||| | |||| ||| | ||  |||||||| ||||||  ||||| | ||||||||    
T  33192049 aaaaccacaaacaaaagataaatcgagaaaagaaacaaa-cacaccaaaaaatgtttaccaagttttgtccaacaatgacctcctctggag-agagattg 33191952  T
Q  147 atctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctc 222  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  || | |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33191951 atctctctaatccactatcaatgagttctttacaaa--gacataaaatggttacaagaacttagcttcaacaagctc 33191877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8370584 - 8370505
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  8370584 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 8370505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 27975050 - 27974971
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  27975050 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 27974971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 27986544 - 27986465
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  27986544 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 27986465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 30709888 - 30709829
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30709888 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 30709829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 86
Target Start/End: Original strand, 51352040 - 51352121
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaa 86  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  51352040 aataacaa-acctagatctaatctaggaatcaaa-tgaaaaacacaaaaccacaagtaaaagataaagagagaagagaaacaaa 51352121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1417586 - 1417529
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1417586 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 1417529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 21711214 - 21711271
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21711214 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 21711271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 307
Target Start/End: Original strand, 26323059 - 26323283
Alignment:
Q  89 acaccaaaga-ttgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatct-gggggagagatt-gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatg 183  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||| | ||  ||| |||||| | ||||||||||||||| || || ||      
T  26323059 acaccaaagaattgtttacccacttcggtccaacaatgacctactctagggggataaataagatatctccacttcactatcaatgagttttttaccaaga 26323158  T
Q  184 gatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctc-acaaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctca-caaatgaataagacactca 281  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||  ||||  |||||||| |  ||||| |||||||| |    
T  26323159 tatacaaaaaggttacaagaaattagcttcaacaaactcttcaaaaacaaacctaatttttacc-cttttctcaatctcatcccatgaacaagacactta 26323257  T
Q  282 atgattttcactcacccaaggtgttt 307  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26323258 atgatgttcactcactcaaggtgttt 26323283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45283158 - 45283037
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaat----ggataca 189  Q
    |||||||| || || |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     |||||||    
T  45283158 agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggataca 45283059  T
Q  190 aatgggttacaagaaattagctt 212  Q
    || || |||||||||||||||||    
T  45283058 aaagg-ttacaagaaattagctt 45283037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3617622 - 3617503
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaatggatacaaa 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||    
T  3617622 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 3617524  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  3617523 gaggttacaagaaattagctt 3617503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Original strand, 4055769 - 4055874
Alignment:
Q  105 acccaattcggtccaaca-tgaccta-atctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaatggatacaaatg-ggttaca 200  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||    
T  4055769 acccagttcggcccaacaatgacctacatctgggggagaga--gatctcttcaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagaggttaca 4055866  T
Q  201 agaaatta 208  Q
    ||||||||    
T  4055867 agaaatta 4055874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Original strand, 4075476 - 4075581
Alignment:
Q  105 acccaattcggtccaaca-tgaccta-atctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaatggatacaaatg-ggttaca 200  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| | |||||||    
T  4075476 acccagttcggcccaacaatgacctacatctgggggagag--tgatctctccaatccactatcaaagagtttcttacaaagtgatacaaaagaggttaca 4075573  T
Q  201 agaaatta 208  Q
    ||||||||    
T  4075574 agaaatta 4075581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18552970 - 18552922
Alignment:
Q  95 aagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18552970 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 18552922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 32143310 - 32143389
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  32143310 aaacacaccaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 32143389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 33386764 - 33386685
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  33386764 aaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 33386685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1736401 - 1736344
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1736401 aaacacaccaat-attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 1736344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 164
Target Start/End: Original strand, 16264349 - 16264418
Alignment:
Q  94 aaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  16264349 aaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 16264418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 37466282 - 37466339
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37466282 aaacacaccaa-gattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 37466339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40592878 - 40592821
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  40592878 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagaga 40592821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 39127614 - 39127510
Alignment:
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctca-caaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctc-acaaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 297  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  39127614 aagaaattagcttcaacaagctcaccaagaacaaacataatttatacttatttct-caatctcttctcatgaataagacgctcaatgattttcactcttc 39127516  T
Q  298 caaggt 303  Q
    ||||||    
T  39127515 caaggt 39127510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25637599 - 25637480
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaatggatacaaa 191  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||    
T  25637599 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 25637501  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  25637500 gaggttacaagaaattagctt 25637480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 27452947 - 27453026
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  27452947 aaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagaga-gcagctctccaatccactat 27453026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 39040090 - 39040011
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||    
T  39040090 aaacacaccaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagaga-acaactctccaatccactat 39040011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3716098 - 3716041
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  3716098 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagaga 3716041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 26298979 - 26299036
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26298979 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagaga 26299036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 47924002 - 47923945
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  47924002 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagaga 47923945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 48438205 - 48438262
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48438205 aaacacaccaa-gattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 48438262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 261
Target Start/End: Original strand, 54739004 - 54739116
Alignment:
Q  150 tctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaaca-taatttctacc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||| ||| | ||||||  ||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  54739004 tctccaatccactatcaatgagttctttacagagagatataaaagagttacat-aaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctacc 54739102  T
Q  247 tatttttccaatctc 261  Q
     |||||| |||||||    
T  54739103 -attttttcaatctc 54739116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 308
Target Start/End: Original strand, 2075150 - 2075266
Alignment:
Q  190 aatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaaca-taatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgatt 287  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||| ||| |||  ||||| |||||  |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2075150 aatgggt-acaataaattagcttaaa--agctcacaaagaaccaactctaattactaccatttttcccaatatcaccaatgaacaagacactcaatgatt 2075246  T
Q  288 ttcactcacccaaggtgttta 308  Q
    ||||||||  |||||||||||    
T  2075247 ttcactca-gcaaggtgttta 2075266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4386936 - 4386866
Alignment:
Q  184 gatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aac-aaacataatttctacctatttttc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| ||||||||||  |||||||    
T  4386936 gatacaaatgggttacaagaaattagcttaa--aagctcacaaagaacaaaacctaatttctactcatttttc 4386866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 141
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029139
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggaga 141  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggaga 36029139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 458543 - 458499
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  458543 ttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagaga 458499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 311
Target Start/End: Original strand, 1313852 - 1314018
Alignment:
Q  147 atctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctc-acaaaaac-aaacataatttct 243  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||   ||||||| || || |||||||||||||| |||||||||  ||| ||| ||||||||||| |    
T  1313852 atctctctaatccaatatcaatgagttcttttcaaagatatacaaaaggcttgcaagaaattagctttaacaagctctccaagaacaaaacataattttt 1313951  T
Q  244 acctatttttccaatctc-acaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 311  Q
    |||  ||||  |||||||  |  | |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1313952 acc-cttttctcaatctcttctcaagaataagagactcaat-aatttcactcacccaaggtgtttacaa 1314018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 4598519 - 4598638
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatgg-atacaaa 191  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||    
T  4598519 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 4598617  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  4598618 gaggttacaagaaattagctt 4598638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 4600740 - 4600859
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatgg-atacaaa 191  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  4600740 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaa 4600839  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  4600840 -aggttacaagaaattagctt 4600859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10056391 - 10056272
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatgg-atacaaa 191  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||    
T  10056391 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 10056293  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  10056292 gaggttacaagaaattagctt 10056272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10058613 - 10058494
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatgg-atacaaa 191  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||    
T  10058613 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 10058515  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  10058514 gaggttacaagaaattagctt 10058494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10060835 - 10060716
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatgg-atacaaa 191  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||    
T  10060835 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 10060737  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  10060736 gaggttacaagaaattagctt 10060716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10063057 - 10062938
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatgg-atacaaa 191  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||    
T  10063057 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 10062959  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  10062958 gaggttacaagaaattagctt 10062938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10065279 - 10065160
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatgg-atacaaa 191  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||    
T  10065279 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 10065181  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  10065180 gaggttacaagaaattagctt 10065160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10211567 - 10211448
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatgg-atacaaa 191  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||    
T  10211567 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 10211469  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  10211468 gaggttacaagaaattagctt 10211448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 244
Target Start/End: Original strand, 25491014 - 25491114
Alignment:
Q  146 gatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttct 243  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  |||||||| ||  || ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  25491014 gatctctccacttcactatcaatgatttctttacaaagagatacaaaaggagtataagaaatcagcttcaacaagctctcaaagaacaaacctaatttct 25491113  T
Q  244 a 244  Q
    |    
T  25491114 a 25491114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26928698 - 26928620
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  26928698 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatgacctaatctgggggagaga-gcaactctccaatccactat 26928620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 6794809 - 6794732
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  || ||||||| |||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  6794809 aaacacaccaa-gattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 6794732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 69
Target Start/End: Original strand, 9634722 - 9634787
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaa 69  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | | |||||||| ||||||||    
T  9634722 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcat-agatcacaagcacaagataaa 9634787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24695260 - 24695203
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  24695260 aaacacaccaa-gattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctacgggagaga 24695203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 456166 - 456122
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  456166 ttgttgacccagttcggtccaacccgacctagtctgggggagaga 456122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 747016 - 746972
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  747016 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 746972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1313668 - 1313624
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  1313668 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 1313624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1321738 - 1321694
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  1321738 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 1321694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3859786 - 3859742
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  3859786 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 3859742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5886457 - 5886413
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  5886457 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 5886413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5899930 - 5899886
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  5899930 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 5899886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6484619 - 6484575
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  6484619 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 6484575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 7606586 - 7606630
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  7606586 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 7606630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 311
Target Start/End: Original strand, 8166635 - 8166671
Alignment:
Q  275 acactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8166635 acactcaatgattttcacccacccaatgtgtttacaa 8166671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10209319 - 10209228
Alignment:
Q  123 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatgga-tacaaatgggttacaagaaattagctt 212  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  10209319 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggactac-aagaggttacaagaaattagctt 10209228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 10958321 - 10958365
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  10958321 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 10958365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25389164 - 25389120
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  25389164 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 25389120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 27635656 - 27635700
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  27635656 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 27635700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 28413030 - 28413074
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  28413030 ttgttgacctaattcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 28413074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 35919113 - 35919157
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  35919113 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 35919157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 136
Target Start/End: Original strand, 35925472 - 35925524
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctggg 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||    
T  35925472 aaacacaccaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatttggg 35925524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 41849318 - 41849274
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  41849318 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 41849274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 42990563 - 42990519
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  42990563 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 42990519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 42992529 - 42992485
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  42992529 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 42992485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 43421413 - 43421457
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  43421413 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 43421457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 50494258 - 50494214
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  50494258 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 50494214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 53894055 - 53894099
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  53894055 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 53894099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 53917662 - 53917706
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  53917662 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 53917706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 96)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 8565849 - 8566166
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  8565849 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaaacaaacacaccaa-gatt 8565947  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  8565948 gttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacagagggatacaaatgggttaca 8566047  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8566048 agaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaagttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccca 8566147  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8566148 aggtgtttacaatgtttcc 8566166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32637093 - 32636773
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggag--aagagaagca-aaacacaccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||   | |||||||||||||    
T  32637093 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaatcacaagcacaagataaagggagggaagagagaaacaaacacaccaaag 32636994  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  32636993 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggtt 32636894  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32636893 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcac 32636794  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttc 317  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32636793 ccaaggtgtttacaatgtttc 32636773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 42428329 - 42428650
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | |||||||| ||||    
T  42428329 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaaaagaagaacaaacacactaaag 42428428  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42428429 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 42428528  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42428529 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 42428628  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  42428629 ccaaggtgtttacaatatttcc 42428650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33831938 - 33831630
Alignment:
Q  11 cacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaa-ccacaagcaaaagataaagggagaagaga--agcaaaacacaccaaagattgttgacc 107  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||    
T  33831938 cacctaaatctaatctaggaatcaaagtgaaaaagctcaaagccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaaa-acaccaaagattgttgacc 33831840  T
Q  108 caattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaatt 207  Q
    || ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33831839 cagttcagtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatt 33831740  T
Q  208 agcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33831739 agcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 33831640  T
Q  307 tacaatgttt 316  Q
    ||||||||||    
T  33831639 tacaatgttt 33831630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 538290 - 537973
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  538290 ataataacaacatctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaagaaa-cacaccaaagatt 538192  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  538191 gttgatccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttaca 538092  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  538091 agaaattagcttcaacaagctcacaaagagcaaccttaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacacgcaatgattttcactcaccca 537992  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  537991 aggtgtttacgatgtttcc 537973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 28750554 - 28750875
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| | | |||||||||||||    
T  28750554 ataataacaacacctagatctaatctagtaatccaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaatataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 28750653  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28750654 attattgacccaattcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgggtt 28750753  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    ||| ||||||| ||| |||||  ||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28750754 acaggaaattaacttcaacaatttcataaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 28750853  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  28750854 ccaaggtgttttcaatgtttcc 28750875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13488470 - 13488153
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |  | ||||||||| | | ||| |||| ||||||    
T  13488470 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagaaagggagagaagagaggaacaaagacacaaaagat 13488371  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13488370 tattgacccagttcggtccaacttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 13488271  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13488270 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaatgaacaagacactcaataattttcactcaccc 13488171  T
Q  299 aaggtgtttacaatgttt 316  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13488170 aaggtgtttacaatgttt 13488153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 20 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 534015 - 533717
Alignment:
Q  20 ctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtcca 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  534015 ctaatctagtaatcaaagtgaaaatctcaaaaccacaagcaaaagataaaaagagaagagaagcaaag-acaccaaagattgttgacccagttcggtcca 533917  T
Q  120 acatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaag 219  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  533916 acttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaag 533817  T
Q  220 ctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  533816 ctcacaaagaccaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 533717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 42426134 - 42426455
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||||| ||||    
T  42426134 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacaaaag 42426233  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42426234 attgttgacctagttcagtccaacttgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 42426333  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
     |||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42426334 gcaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactcac 42426433  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42426434 ccaaggtgtttacaatgtttcc 42426455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31183243 - 31182921
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaa-----aagataaagggagaagagaagca-aaacacacca 94  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||     ||||||||| |||||||||   | ||||||||||    
T  31183243 ataataacaacacctatatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaattcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacacca 31183144  T
Q  95 aagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgg 194  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  31183143 aagaatgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagggatacaaat-g 31183045  T
Q  195 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcact 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31183044 gttacaagaaattaacttaaacaaactcacaaagaacaatcctaatttctaccca-ttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcact 31182946  T
Q  294 cacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  31182945 cacctaaggtgtttacaatgtttcc 31182921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 39468450 - 39468769
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| | | |||||||| ||||||    
T  39468450 aataacagcacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacgagcacaagataaagggagagaagagaggaacaaacacactaaagat 39468549  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||| ||| ||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39468550 tgttgacccagttcagtccaatttaacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 39468649  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  39468650 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcactc 39468749  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39468750 aaggtgtttacaatgtttcc 39468769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13240019 - 13239700
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    |||||| |||| ||||||||| |    
T  13240019 aataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaaaa 13239921  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacat-gacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||    
T  13239920 ttgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtt 13239821  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| || || | |||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13239820 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccctaatttctaccattttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 13239722  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13239721 ccaaggtgtttacaatgtttcc 13239700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 317
Target Start/End: Original strand, 30682824 - 30683139
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||| |||||  ||||| | | |||||||||||||||    
T  30682824 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaattcacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaagat 30682923  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgag--ttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||| |||||    
T  30682924 tgttgacc-agttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtattcttacaaagaaatacaaaagggtt 30683022  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 297  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||  ||| || | |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  30683023 acaagaaattagcttcaacaagttcac--aaagaaccctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 30683119  T
Q  298 caaggtgtttacaatgtttc 317  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30683120 caaggtgtttacaatgtttc 30683139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16452346 - 16452029
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaaga-taaagg--gagaagagaagcaaaacacaccaaagat 99  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||| | ||||||  ||||||| || |||| ||||||||  |     
T  16452346 aataacaacagttagatctaatctaggaatcaaattgaaaagctcaaaaccacaagcaaaaaaataaaggaagagaagataaacaaa-cacaccaagaaa 16452248  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16452247 tgtttacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 16452148  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| | ||    
T  16452147 aagaaattagcttcaacaagctcagaaagaacaaacttaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattgtcactta-cc 16452049  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16452048 aaggtgtttacaatgtttcc 16452029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37439411 - 37439082
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaa 96  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    |||||| |||| |||||||||    
T  37439411 ataataacaacacctaggtctaatctagtaatcaaaatgaaaagcacaaaaccacaagcataagataaagggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaa 37439313  T
Q  97 gattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatggg 195  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |    
T  37439312 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagag 37439213  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacc---tattttt-----ccaatctcacaaatgaataagacactcaatgat 286  Q
    ||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||   |||||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37439212 ttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccttttatttttccttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgat 37439113  T
Q  287 tttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  37439112 tttcactca-ccaaagtgtttacaatgtttcc 37439082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25413027 - 25412710
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||||    
T  25413027 aataacagcacctatatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaaga 25412930  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  25412929 ttgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 25412830  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25412829 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 25412732  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25412731 ccaaggtgtttacaatgtttcc 25412710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 5887333 - 5887636
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaa--gcaaaagataaagggagaagagaagca-aaacacaccaaag 97  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||   | |||||||||||||    
T  5887333 ataataacaacacctaaatctaatctagtaatcaaaatgaaaaacttaaaaccacaaaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaag 5887432  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||                  ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5887433 attgttgatccaattcggtccaacttgacctaatctgggggagagatagatctc------------------agttcttacaaagtgatacaaatgggtt 5887514  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5887515 gcaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctatccattttctcaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcac 5887614  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5887615 ccaaggtgtttacaatgtttcc 5887636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19806632 - 19806332
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaag 97  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||| ||||||    
T  19806632 ataataacaacacctaaatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctaaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacaccccaaag 19806533  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                   ||    
T  19806532 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaggagttctt-------------------tt 19806452  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 297  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19806451 agaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaacctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatga-tttcactcacc 19806353  T
Q  298 caaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19806352 caaggtgtttacaatgtttcc 19806332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13343327 - 13343009
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||||    |||||| | ||||||| ||||||    
T  13343327 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagca-caaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaacacatcaaaga 13343230  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtcc-aacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || ||    
T  13343229 ttgttcacccagttcggtccaaacatgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaaggatt 13343131  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttcta-cctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactca 295  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13343130 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 13343031  T
Q  296 cccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  13343030 -ccaaggtgtttacaatgtttcc 13343009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28278498 - 28278271
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatgg 184  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  28278498 aaacacaccaagaattgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagag 28278399  T
Q  185 atacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  28278398 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-at 28278300  T
Q  284 gattttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28278299 gattttcactctcccaatgtgtttacaat 28278271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30182855 - 30182537
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||||    
T  30182855 aataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaac-acaagcacaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaaga 30182758  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| | ||| |||||||||| | |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||||    
T  30182757 ttgttcatccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatagaaaagggtt 30182658  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  30182657 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 30182559  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  30182558 ccaaggtgtttgcaatgtttcc 30182537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 72 - 318
Target Start/End: Original strand, 3075632 - 3075878
Alignment:
Q  72 gagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgag 171  Q
    |||||||||| |||| ||||||||  | |||| |||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  3075632 gagaagagaaacaaa-cacaccaagaaatgttcacccaatttggtccaacttgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatcaacgaa 3075730  T
Q  172 ttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaa 270  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3075731 ttcttacaaaaagatacaaatgggttacaagaaattagattcagcaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttctcaatctcacaaatgaa 3075830  T
Q  271 taagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
      ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3075831 cgagacactcaatgattttcactcatcaaaggtgtttacaatgtttcc 3075878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 213633 - 213420
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtta 198  Q
    |||| ||||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  213633 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 213534  T
Q  199 caagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 297  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  213533 caagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 213435  T
Q  298 caaggtgtttacaat 312  Q
    |||||||||||||||    
T  213434 caaggtgtttacaat 213420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 40147428 - 40147216
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  40147428 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 40147329  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcac-aaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  40147328 aagaaattagcttcaacaagctcacgaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttccactctccc 40147230  T
Q  299 aaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||    
T  40147229 aaggtgtttacaat 40147216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Original strand, 9049285 - 9049554
Alignment:
Q  35 aagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctg 134  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||      |||||||| |||| ||||||||| | |||| | ||| ||||||||||| | ||||| | ||    
T  9049285 aagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagata------gaagagaaacaaa-cacaccaaaaaatgtttatccatttcggtccaacttcacctactttg 9049377  T
Q  135 ggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaaaacaaac 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9049378 ggggagatattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaacaaac 9049477  T
Q  235 a-taatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 311  Q
    | ||||||||| | ||||| |||| ||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9049478 actaatttctatc-attttcccaaactcactaatcaacaagacactcagtgatttttactcacccaaagtgtttacaa 9049554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 36073944 - 36074264
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| |||||    |||||| | ||||||||||||||    
T  36073944 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagca-caaatcacaagcaaaacataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaaga 36074041  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtcc-aacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| | ||| |||||||| ||| ||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| | |||    
T  36074042 ttgttcatccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtt 36074140  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacc---tatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcact 293  Q
    |||||||||||||||  ||||| || |||| ||||| | |||||||||||   | |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36074141 acaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 36074240  T
Q  294 cacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  36074241 ca-ccaaggtgtttacaatgtttcc 36074264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 95 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 38747177 - 38746960
Alignment:
Q  95 aagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgg 194  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||  |||||||||||    
T  38747177 aagattattgacccagtttggtccaacttgacctgatctgagggagagattgatctctccaatcctctatcaatgagtttttccaaagagatacaaatgg 38747078  T
Q  195 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcact 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  38747077 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcattaatgaacaagatactc-atgattttcact 38746979  T
Q  294 cacccaaggtgtttacaat 312  Q
    | |||||||||||||||||    
T  38746978 ctcccaaggtgtttacaat 38746960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5058212 - 5058002
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  5058212 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggatac 5058113  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  |||    
T  5058112 aagaaaatagcttcaacaagctcac-agaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactcttcca 5058015  T
Q  300 aggtgtttacaat 312  Q
    |||||||||||||    
T  5058014 aggtgtttacaat 5058002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16409746 - 16409431
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagaga-agcaaaaca----caccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |  | || ||||||    ||||||||    
T  16409746 aataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaag 16409648  T
Q  98 a--ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatg-gatacaaatg 193  Q
    |  ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  16409647 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaag 16409548  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcac 292  Q
     ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||    
T  16409547 agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc-ctttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcac 16409456  T
Q  293 tcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16409455 tca-ccaaggtgtttaccatgtttcc 16409431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26178152 - 26177839
Alignment:
Q  4 ataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagaga-agcaaaaca----caccaaaga 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |  | || ||||||    |||||||||    
T  26178152 ataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga 26178054  T
Q  99 --ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatg-gatacaaatgg 194  Q
      ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |     
T  26178053 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaga 26177954  T
Q  195 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcact 293  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||   ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||    
T  26177953 gttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc--cttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcact 26177863  T
Q  294 cacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    || ||||||||||||| ||||||||    
T  26177862 ca-ccaaggtgtttaccatgtttcc 26177839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 316
Target Start/End: Original strand, 42309929 - 42310153
Alignment:
Q  93 caaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaat 192  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||| | | ||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||     
T  42309929 caaagattgtttatccaattcggtcaaacttaatctactatgggggagagattgatctcgctaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaa 42310028  T
Q  193 gggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttca 291  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| | ||||||||| | |||  ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  42310029 gagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagatcaaacttgatttctacccaatttctcaatctcaccaatgagcaagacactcaatgattttca 42310128  T
Q  292 ctcacccaaggtgtttacaatgttt 316  Q
    || ||||||  ||||||||||||||    
T  42310129 cttacccaaaatgtttacaatgttt 42310153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 311
Target Start/End: Original strand, 13695632 - 13695904
Alignment:
Q  40 aaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctggggga 139  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||  | |||| ||| | || |||||||  ||||||| | ||| |||    
T  13695632 aaaaacacaaaacaacaagcaaaggataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaagaaatgtttacctagtttggtccaagttgacctactatggagga 13695730  T
Q  140 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaa-cat 236  Q
    |||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |    
T  13695731 gagaataatctctctaatccactattaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccct 13695830  T
Q  237 aatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 311  Q
    ||||| ||||  |||| |||||||| | || ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13695831 aatttgtacc-cttttcccaatctctccaaagaaaaagatactcaatgattttcactcacacaaggtgtttacaa 13695904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 312
Target Start/End: Original strand, 27637618 - 27637827
Alignment:
Q  105 acccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaa-tgggttacaag 202  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  27637618 acccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaag 27637716  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaag 301  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||||  |||||    
T  27637717 aaattagtttaaacaagctcataaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttccaag 27637816  T
Q  302 gtgtttacaat 312  Q
    ||||| |||||    
T  27637817 gtgttcacaat 27637827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27015704 - 27015487
Alignment:
Q  86 aacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatgga 185  Q
    ||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27015704 aacacaccaaaaaatgttcacccagttcggtccaacttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatcaatgagttcttacaaagaga 27015605  T
Q  186 tacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatg 284  Q
    |||||||||||        |||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||| |||    
T  27015604 tacaaatgggt--------attagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaccaa-acactc-atg 27015515  T
Q  285 attttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27015514 attttcactctcccaagatgtttacaat 27015487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 311
Target Start/End: Original strand, 16640941 - 16641153
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||| || || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||||||| | ||||     
T  16640941 tgtttacccagttcggccctacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatca---agttcttacaaagagatacaaaagagttat 16641037  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaaca-taatttctacc-tatttttc-caatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactca 295  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  16641038 cagaaatcagcttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctaccatttttttctcaatctcgccaatgaacaagacacttaatgaatttcactca 16641137  T
Q  296 cccaaggtgtttacaa 311  Q
    | ||||||||||||||    
T  16641138 ctcaaggtgtttacaa 16641153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 318
Target Start/End: Original strand, 9789220 - 9789436
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatg-gatacaaatg 193  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  9789220 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaag 9789319  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcac 292  Q
     ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||||| | |||||||||||  |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||    
T  9789320 agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaacaaccttaatttctacc-ctttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcac 9789411  T
Q  293 tcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  9789412 tca-ccaaggtgtttcccatgtttcc 9789436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 16649733 - 16649863
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  16649733 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaacggaaaagagaaac-aaacacaccaaggatt 16649831  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatc 132  Q
    ||||||| | || |||||||| ||| ||||||    
T  16649832 gttgacctagtttggtccaacttgatctaatc 16649863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 318
Target Start/End: Original strand, 18441644 - 18441860
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatg-gatacaaatg 193  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  18441644 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaag 18441743  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcac 292  Q
     ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||||| | |||||||||||  |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||    
T  18441744 agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaacaaccctaatttctacc-ctttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcac 18441835  T
Q  293 tcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  18441836 tca-ccaaggtgtttcccatgtttcc 18441860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26171032 - 26170730
Alignment:
Q  4 ataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagaga-agcaaaaca----caccaaaga 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |  | || ||||||    |||||||||    
T  26171032 ataacaacacctagatctaatctaggaatcaaaatgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga 26170934  T
Q  99 --ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatggg 195  Q
      ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||          |||| | |    
T  26170933 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctta----------caaaagag 26170844  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactc 294  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||   ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  26170843 ttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaatcctaatttctacc--cttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactc 26170753  T
Q  295 acccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    | ||||||||||||| ||||||||    
T  26170752 a-ccaaggtgtttaccatgtttcc 26170730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42927160 - 42926965
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaag------ataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||      |||| | || ||||||| |||| ||||||||     
T  42927160 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagcaaaagataaggagataagagaaacaaa-cacaccaag 42927062  T
Q  97 gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatg 193  Q
     | |||| ||||| ||||||||||| ||||||| | || | |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42927061 aaatgtttacccagttcggtccaacttgacctactatgagagagagatttatttcttcaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 42926965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 316933 - 316781
Alignment:
Q  98 attgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatggg 195  Q
    |||||| ||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| ||     
T  316933 attgtttaccaagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagga 316834  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctc-acaaaaacaaacataatttctacct 247  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||    
T  316833 ttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaacctaatttctacct 316781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 226
Target Start/End: Original strand, 29751142 - 29751287
Alignment:
Q  83 caaaacacaccaa-agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 179  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  29751142 caaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 29751241  T
Q  180 aatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa 226  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  29751242 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagatttgacaagttcacaa 29751287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29720536 - 29720405
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatggatacaaatg 193  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||      
T  29720536 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 29720438  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa 226  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  29720437 ggttacaagaaattagattagacaagttcacaa 29720405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29722696 - 29722565
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaacat-gacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatggatacaaatg 193  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||      
T  29722696 agattgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 29722598  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa 226  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  29722597 ggttacaagaaattagattagacaagttcacaa 29722565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 254 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 42926905 - 42926841
Alignment:
Q  254 ccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42926905 ccaatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 42926841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10593430 - 10593312
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaatggatacaaat 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||     
T  10593430 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa- 10593332  T
Q  193 gggttacaagaaattagctt 212  Q
     |||||||||||||||||||    
T  10593331 aggttacaagaaattagctt 10593312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 22536286 - 22536403
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatggatacaaatg 193  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||      
T  22536286 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 22536384  T
Q  194 ggttacaagaaattagctt 212  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22536385 ggttacaagaaattagctt 22536403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 222
Target Start/End: Original strand, 33906028 - 33906154
Alignment:
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacat-gacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatggg 195  Q
    |||||| |||||  |||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||     
T  33906028 attgtttacccagctcggtccaacattgacctactctagggaagagattgatctttccaatctactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagga 33906127  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctc 222  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||    
T  33906128 ttacaagaagttagcttcgacaagctc 33906154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 251
Target Start/End: Original strand, 10054850 - 10054969
Alignment:
Q  133 tgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctc-acaaaaac 230  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| |||  ||| |||    
T  10054850 tgggggagatattgatatctccaatacactatcaatgagttcattacaaagagatacaaa-aggttataagaaattagcttcaacaaactcttcaagaac 10054948  T
Q  231 aaacataatttctacctattt 251  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  10054949 aaacataatttctacccattt 10054969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 10281741 - 10281819
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  10281741 aaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 10281819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 9353440 - 9353361
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  9353440 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 9353361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 36932458 - 36932379
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  36932458 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 36932379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3326130 - 3325925
Alignment:
Q  48 aaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattg 146  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | |||||||||   |||||||||||| | | || ||||| |||||   |||| ||||||| | || | |||| ||||    
T  3326130 aaaatcacaaacaaaagataaaag-agaagagaa---aaacacaccaaaaaatatttacccagttcggcgaaacaatgacctactatgtgagagatattg 3326035  T
Q  147 atctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctc-acaaaaacaaacataatttcta 244  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||  |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||  |||||||||    
T  3326034 atctctctaatccaccatcattgagttctttacaaagagatacacaatggttacaagaaattagcttcaacaagctcttcaagaacaaaactaatttcta 3325935  T
Q  245 cctatttttc 254  Q
    ||| ||||||    
T  3325934 cctttttttc 3325925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17004066 - 17004009
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17004066 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 17004009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 15464521 - 15464600
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  15464521 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 15464600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25078293 - 25078174
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaatggatacaaa 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||    
T  25078293 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 25078195  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  25078194 gaggttacaagaaattagctt 25078174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25136262 - 25136143
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaatggatacaaa 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||    
T  25136262 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 25136164  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  25136163 gaggttacaagaaattagctt 25136143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40382474 - 40382355
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaatggatacaaa 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||    
T  40382474 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 40382376  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  40382375 gaggttacaagaaattagctt 40382355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 35616278 - 35616129
Alignment:
Q  159 cactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctc-acaaaaacaaacataatttctacctatttttcca 256  Q
    |||||||||||||||||| |||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||    
T  35616278 cactatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaattaacttaaacgagctctccaagaacaaacctaatttctactcatttct-ca 35616180  T
Q  257 atctc-acaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 307  Q
    |||||  |   |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35616179 atctcttcccgtgaacaagagactcaatga-tttcactcacccaaggtgttt 35616129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 28832250 - 28832307
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28832250 aaacacaccaa-gattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 28832307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40380263 - 40380181
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 176  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40380263 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctt 40380181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30803010 - 30802841
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaat 182  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||  |||||||||||| ||||||| | || ||||||||  ||||||||   | || |||||| |||||||| ||||||    
T  30803010 aaacacacaaaaaaatgttaaccctgttcggtccaacaatgacctattgtgcgggagaga--gatctctctgcttcattatcaacgagttctttacaaat 30802913  T
Q  183 ggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttc 254  Q
     |||||||| || |||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  30802912 agatacaaaaggattacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaa-ttctacccatttttc 30802841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42926968 - 42926911
Alignment:
Q  166 aatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctca 223  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  42926968 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaatctca 42926911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 4160762 - 4160702
Alignment:
Q  105 acccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4160762 acccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11917001
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 11917001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 14520219 - 14520278
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  14520219 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggaga 14520278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31300702 - 31300645
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  31300702 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagaga 31300645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 42127516 - 42127459
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  42127516 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagaga 42127459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16546803 - 16546684
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaatggatacaaa 191  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||    
T  16546803 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 16546705  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  16546704 gaggttacaagaaattagctt 16546684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27910729 - 27910685
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27910729 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagaga 27910685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33030950 - 33030889
Alignment:
Q  193 gggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aac-aaacataatttctacctatttttc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33030950 gggttacaagaaattagcttaa--aagctcacaaagaacaaaacataatttctacccatttttc 33030889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8445847 - 8445764
Alignment:
Q  136 gggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaa 218  Q
    |||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||||| | |||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  8445847 gggagagattcatctttctaatctactatcaattagttctttataaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaa 8445764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16544581 - 16544499
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 176  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16544581 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 16544499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 19588744 - 19588794
Alignment:
Q  93 caaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||  ||||||||    
T  19588744 caaagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagaga 19588794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24553612 - 24553555
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  24553612 aaacacaccaa-gattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctatgggagaga 24553555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 4410301 - 4410237
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  4410301 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 4410237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 143
Target Start/End: Original strand, 35387662 - 35387710
Alignment:
Q  94 aaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  35387662 aaagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagaga 35387710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2175197 - 2175153
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  2175197 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 2175153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2724172 - 2724128
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  2724172 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 2724128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 3373137 - 3373181
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  3373137 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 3373181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 10529099 - 10529143
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  10529099 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 10529143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10749979 - 10749935
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  10749979 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 10749935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12084283 - 12084204
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaag-attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||| |||||   | ||||||||||||||||    
T  12084283 aaacacaccaaaatattgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagaga-gcagctctccaatccactat 12084204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 15354575 - 15354619
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  15354575 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 15354619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15552524 - 15552480
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  15552524 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 15552480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18466963 - 18466919
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  18466963 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 18466919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 21684452 - 21684496
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  21684452 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 21684496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24127135 - 24127091
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  24127135 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 24127091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 25921473 - 25921517
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  25921473 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 25921517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27912815 - 27912771
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  27912815 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 27912771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 31179371 - 31179415
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  31179371 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 31179415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31543013 - 31542969
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  31543013 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 31542969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31545359 - 31545315
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  31545359 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 31545315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 34477053 - 34477097
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  34477053 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 34477097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 34479418 - 34479462
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  34479418 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 34479462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40221802 - 40221758
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  40221802 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 40221758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 126)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 36994788 - 36994474
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||    
T  36994788 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacgccaaa-att 36994691  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36994690 gttgacccagttcggtccaacttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttaca 36994591  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36994590 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccca 36994491  T
Q  300 aggtgtttacaatgttt 316  Q
    |||||||||||||||||    
T  36994490 aggtgtttacaatgttt 36994474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 26175535 - 26175856
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||    
T  26175535 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 26175634  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26175635 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 26175734  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||||| || ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26175735 acaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctccccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 26175834  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26175835 ccaaggtgtttacaatgtttcc 26175856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5872087 - 5871768
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagaga-agcaaaacacaccaaagat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| || ||||||||| |   |||||||||||||||    
T  5872087 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccaaaagcaaaagatagagagagaagagagaatcaaacacaccaaagat 5871988  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  5871987 tgttgacccagttcggtcaaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgataaaaatgggttac 5871888  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5871887 aagaaatttgcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 5871788  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5871787 aaggtgtttacaatgtttcc 5871768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 52467257 - 52467567
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  52467257 ataataacaacacatagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagatt 52467355  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  52467356 gttgacccagttcggtccaacttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaaaagttattacaaagtgatacaaatgggttaca 52467455  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52467456 agatattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaacctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccca 52467555  T
Q  300 aggtgtttacaa 311  Q
    ||||||||||||    
T  52467556 aggtgtttacaa 52467567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 36463294 - 36463609
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||    
T  36463294 ataataacaacacctagatctaatttggtaatcaaagcgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa---caccaaagatt 36463390  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36463391 gttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttaca 36463490  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||  | ||||||||| | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  36463491 agaaattagcttcaacaagctcacaatgaacagccctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgaatttcactcaccca 36463590  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36463591 aggtgtttacaatgtttcc 36463609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 12739449 - 12739770
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | | |||||||||||||    
T  12739449 ataataacaacacctagatctaatcaagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 12739548  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  12739549 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggtt 12739648  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||| | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12739649 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcac 12739748  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  12739749 ctaaggtgtttacaatgtttcc 12739770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 47038316 - 47038629
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  47038316 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagattgt 47038414  T
Q  103 tgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | |||||||    
T  47038415 tgacccagttcggtccaacttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtccttacaaacagatacaaat-gattacaag 47038513  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaag 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47038514 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccca-ttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaag 47038612  T
Q  302 gtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||| |||||||||    
T  47038613 gtgtttataatgtttcc 47038629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5429946 - 5429627
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | | ||||||| |||||||    
T  5429946 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagtaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacatcaaagat 5429847  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5429846 tgttgacccagttcggtccaacttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgggttac 5429747  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcac-aaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || || | ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5429746 aagaaattagcttcaacaagctcacgaagaataaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 5429647  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5429646 aaggtgtttacaatgtttcc 5429627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 34570315 - 34570634
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | | |||||||||||||||    
T  34570315 aataacaacacctagatctaatctaagaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaagat 34570414  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  34570415 tgttgacccagttcgatccaacttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaattgggttac 34570514  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34570515 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 34570614  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||| ||||| ||||||||||    
T  34570615 aagatgttttcaatgtttcc 34570634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 48893543 - 48893862
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  48893543 aataacagcacctagatctaatccaagaatcaaagtgaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagattgt 48893641  T
Q  103 tgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  48893642 tgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttacaag 48893741  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-----aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||||     ||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48893742 aaattagcttcaacaagctcacaaacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 48893841  T
Q  298 caaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  48893842 caaggtgtttacaatgtttcc 48893862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 9927360 - 9927677
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagg-gagaagagaagca-aaacacaccaaagatt 100  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||    
T  9927360 aataacagcacctagatttaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaggagagaatagaggaacaaacacaccaaagatt 9927459  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9927460 gttgactcagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttaca 9927559  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  9927560 agaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcagtgattttcactca-cca 9927658  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9927659 aggtgtttacaatgtttcc 9927677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29254763 - 29254442
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | ||| | | |||||||||||||    
T  29254763 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaatggagagaatagaggaacaaacacaccaaag 29254664  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||    
T  29254663 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagacacaaatgggtt 29254564  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctca-caaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||   ||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  29254563 gcaagaaattaacttcaacaagctcataaaaaacaactctaatttctacccaatttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcattcac 29254464  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  29254463 ccaatgtgtttacaatgtttcc 29254442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 54199809 - 54200126
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagg-gagaagagaagca-aaacacaccaaagatt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||||||||||| |||    
T  54199809 aataacatcacctagatctaatctaagaatcaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaatataaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaaaatt 54199908  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54199909 gttgacccagttcg-tccaacttgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttaca 54200007  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54200008 agaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccca 54200107  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    | |||||||||||||||||    
T  54200108 atgtgtttacaatgtttcc 54200126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37740892 - 37740574
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||||| ||| ||    
T  37740892 aataacagcacctagatctaatgtaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacaaaaaat 37740793  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  37740792 tgttgacacagttcggtccaacttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 37740693  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||  |||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  37740692 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactca-cc 37740594  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  37740593 aaggtgtttacaatgtttcc 37740574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 56178537 - 56178856
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||||    
T  56178537 aataacaacacctagatctaatctaggaatgaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaaga 56178635  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  56178636 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 56178735  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  56178736 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 56178834  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  56178835 ccaaggtgtttacaatgtttcc 56178856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 45687086 - 45687403
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  45687086 ataataacaacacctagatc-aatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaaaagaaacaaa-cacaccaaagatt 45687183  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  45687184 gttgacccagttcggtccaacttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgagttata 45687283  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aac-aaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||  | ||||||||||||    
T  45687284 agaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaatgaacaagacaatcaaaaaatttcactcaccc 45687383  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  45687384 aaggtgtttacaatgtttcc 45687403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 46147294 - 46147575
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  46147294 ataataacaatacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagatt 46147392  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  46147393 gttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttaca 46147492  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaa 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  46147493 agaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccgatgaacaagacaatcaa 46147575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 48143315 - 48142990
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaa----cataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacacca 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    || |||| ||||||||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||    
T  48143315 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacacca 48143217  T
Q  95 aagattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatg 193  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| |    
T  48143216 aagattgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttatgaagagatacaaaag 48143117  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctattttt-ccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttca 291  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  48143116 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 48143017  T
Q  292 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  48143016 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcc 48142990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 52095263 - 52095582
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||    |||||| |||| ||||||||| |    
T  52095263 aataacaacacctagatctaatctaggagtcaaagagaaaagcacaaaaccacaaggaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaaaa 52095361  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtta 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  |  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  52095362 ttgttcacccagttcggtccaaacttgcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggtta 52095461  T
Q  199 caagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 297  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52095462 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 52095561  T
Q  298 caaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  52095562 caaggtgtttacaatgtttcc 52095582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 12743824 - 12744079
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagaga-agcaa--aacacaccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||| || ||  ||||||||||||    
T  12743824 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaactacaagcaaaagataaaaggagaaaagagaggaacaaacacaccaaag 12743923  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12743924 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 12744023  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttt 252  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  12744024 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctatttt 12744079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31474414 - 31474098
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagat-tg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||    
T  31474414 aataacaacacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaatcaaaagctaaagataaagggagaagagaaacaaa-cacaccaa-gatatg 31474317  T
Q  102 ttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaa 201  Q
    || ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  31474316 tttacccagttcggtccaacttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaa 31474217  T
Q  202 gaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaa-acataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31474216 gaaattagcttcaacaaactcaaaaagaacaagacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccca 31474117  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    | |||||||||||||||||    
T  31474116 aagtgtttacaatgtttcc 31474098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 6542084 - 6542401
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||  | |||    
T  6542084 aataacaaaacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaaacacaaaatcacaagaaaaagataaagagataagagaaacaaa-cacaccaagaaatgt 6542182  T
Q  103 tgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| || | |||||    
T  6542183 ttacccagttcggtccaacttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaaaggctaacaag 6542282  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaa-cataatttctacc-tatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| | |||| |||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6542283 aaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctaccattttttcccaatctccccaatgaacaagacactcaataattttcactcaccca 6542382  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6542383 aggtgtttacaatgtttcc 6542401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4588222 - 4587906
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    |||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||   | |||    
T  4588222 aataacaaaaccaatatctaatataggaatcaaagtgaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaagagagaggagaaacaaa-cacaccatgaaatgt 4588124  T
Q  103 tgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    | ||||| || |||||||| | ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  4588123 ttacccagtttggtccaacttcacctattatgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaag 4588024  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaa-cataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaa 300  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4588023 aaattagcttcaacaagcttacaaagaacaaatcttaatttctaccttttttcccaatttcaccaatgaacatgacactcaatgattttcactcacccaa 4587924  T
Q  301 ggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4587923 ggtgtttacaatgtttcc 4587906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 5369983 - 5370306
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||  |||||   | ||||||| |||||||    
T  5369983 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagataaacaaacacatcaaagat 5370082  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtta 198  Q
    |||| || || |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  5370083 tgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 5370182  T
Q  199 caagaaattagc-ttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacc---tatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcact 293  Q
    |||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||   | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5370183 caagaaattagcttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctcttttttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 5370282  T
Q  294 cacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    || |||| |||||||||||||||||    
T  5370283 ca-ccaaagtgtttacaatgtttcc 5370306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 98 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 54883189 - 54882975
Alignment:
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  54883189 attgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 54883090  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcaca-aaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  54883089 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 54882991  T
Q  297 ccaaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||||    
T  54882990 ccaaggtgtttacaat 54882975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 89 - 294
Target Start/End: Original strand, 27416955 - 27417160
Alignment:
Q  89 acaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatac 188  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  27416955 acaccaaagattgttgactcagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatac 27417054  T
Q  189 aaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgatt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  27417055 aaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacacattttaccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatt 27417153  T
Q  288 ttcactc 294  Q
    |||||||    
T  27417154 ttcactc 27417160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 64 - 318
Target Start/End: Original strand, 13009409 - 13009651
Alignment:
Q  64 gataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccacta 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13009409 gataaagggagaagagaaacaaaacacgccaaagattgttgacacagttcggtctaacttgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccacta 13009508  T
Q  164 tcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcac-aaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctca 262  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||             |||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||    
T  13009509 tcaatgagttcttacaaagggatacaaatgttttacaaga-------------aagctcacgaagaacaaacctaatttctacccattttcacaatctca 13009595  T
Q  263 caaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13009596 caaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 13009651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6656123 - 6655911
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  6656123 tgttcacccaattcggtccaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 6656024  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  6656023 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccttaatttctacccattttttcaatctcacaagtgaacaagacactc-atgattttcactctccc 6655925  T
Q  299 aaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||    
T  6655924 aaggtgtttacaat 6655911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 5207755 - 5208055
Alignment:
Q  12 acctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaa-acacaccaaagattgttgacccaa 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||  | |||| ||||||    
T  5207755 acctagatctaatttaggaatcaa-gtgaaaagcacaaaaccacatgcaacagataaatagagaagagaaacaaatacacaccaataaatgtttacccaa 5207853  T
Q  111 ttcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagc 210  Q
    ||| ||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||| ||||||||    
T  5207854 ttcagtccaaattgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatatacaagggttgcaataaattagc 5207953  T
Q  211 ttaaacaagctcacaaa-aacaaa-cataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 308  Q
    || |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5207954 ttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctacc-ctttttccaatcactccaatgaacaagtcactaaatgattttcactcacccaaggtgttta 5208052  T
Q  309 caa 311  Q
    |||    
T  5208053 caa 5208055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 37229636 - 37229935
Alignment:
Q  12 acctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaat 111  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||  | |||| ||| | |    
T  37229636 acctagatctaatttaggaat-aaagtgaaaagcacaaaaccataagtaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacgccaagaaatgtttacctagt 37229733  T
Q  112 tcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggata-caaatgggttacaagaaattagc 210  Q
    |||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||| ||||| ||    
T  37229734 tcggtccaacttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatataaaaagggttacaacaaatttgc 37229833  T
Q  211 ttaaacaagctcacaaa-aaca-aacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 308  Q
    || |||||||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37229834 tttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttctacc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactcacccaaggtgttta 37229932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 111 - 312
Target Start/End: Original strand, 50673859 - 50674059
Alignment:
Q  111 ttcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagc 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  50673859 ttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagc 50673958  T
Q  211 ttaaacaagctcacaaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttaca 310  Q
    || |||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||  |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50673959 ttcaacaagctcacaaagacaatcctaatttctactcattttctcaatctcacaaatgaacacgacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttaca 50674057  T
Q  311 at 312  Q
    ||    
T  50674058 at 50674059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 252
Target Start/End: Original strand, 12745266 - 12745468
Alignment:
Q  54 acaagcaaaagataaagggagaagaga-agcaa--aacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatct 150  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12745266 acaagcaaaagataaaaggagaaaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatct 12745365  T
Q  151 ctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  12745366 ctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctat 12745465  T
Q  250 ttt 252  Q
    |||    
T  12745466 ttt 12745468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 46703669 - 46703454
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatac-aaatgggtt 197  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  46703669 tgttcacccaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 46703570  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||| |    
T  46703569 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctc 46703470  T
Q  297 ccaaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||||    
T  46703469 ccaaggtgtttacaat 46703454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 52082564 - 52082877
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||   | |||||||||||||||    
T  52082564 aataacagcacctagatcttatctaggaatcaaaaagaaaagcataaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagataaacaaacacaccaaagat 52082663  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtta 198  Q
    |||| |||||| |||||| || | ||||||| ||||| ||||||| |||||||       ||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  52082664 tgttcacccaaatcggtctaaacttgacctactctggaggagagaatgatctc-------cactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggtta 52082756  T
Q  199 caagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 297  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||| | || |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  52082757 caagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacagtcaatgattttcactcacc 52082856  T
Q  298 caaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  52082857 caaggtgtttacaatgtttcc 52082877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 111 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 379537 - 379333
Alignment:
Q  111 ttcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattag 209  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  379537 ttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaattagttcttacaaagcgatacaaatgggttacaagaaattag 379438  T
Q  210 cttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatg-attttcactcacccaaggtgttt 307  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||| ||| | || |||||||||| ||||||||||||    
T  379437 cttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagatactaattgaattttcactctcccaaggtgttt 379338  T
Q  308 acaat 312  Q
    |||||    
T  379337 acaat 379333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 135 - 318
Target Start/End: Original strand, 12747792 - 12747976
Alignment:
Q  135 ggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||     
T  12747792 ggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaac 12747891  T
Q  234 cataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    | ||||||||| | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12747892 cctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacctaaggtgtttacaatgtttcc 12747976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 96 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2209886 - 2209668
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaac-atgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatac-aaatg 193  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  2209886 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatg 2209787  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcac 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  2209786 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaacaatgaacaagacactc-atgattttcac 2209688  T
Q  293 tcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    || |||||||||||||||||    
T  2209687 tctcccaaggtgtttacaat 2209668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 86 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3913628 - 3913408
Alignment:
Q  86 aacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatgga 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||| | || || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  3913628 aacacaccaaagattgttgacccagttcgatacaactttacatactctaggg-agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagata 3913530  T
Q  186 tacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatg 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3913529 tacaaatgggttaaaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacagctctaatttctactcattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatg 3913430  T
Q  285 attttcactcacccaaggtgtt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3913429 attttcactcacccaaggtgtt 3913408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 40632612 - 40632400
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| || | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  40632612 tgtttacccagttcggtccaacttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 40632513  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  40632512 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 40632414  T
Q  299 aaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||    
T  40632413 aaggtgtttacaat 40632400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 105 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 41964578 - 41964369
Alignment:
Q  105 acccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatac-aaatgggttacaaga 203  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  41964578 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaaatgggttacaata 41964479  T
Q  204 aattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaagg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| || ||| ||||||||||   |||||||||  |||||||    
T  41964478 aattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatttcaccaacgaacaagacactcatgaattttcactttcccaagg 41964379  T
Q  303 tgtttacaat 312  Q
    ||||||||||    
T  41964378 tgtttacaat 41964369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 131 - 318
Target Start/End: Original strand, 12745468 - 12745656
Alignment:
Q  131 tctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aa 229  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||    
T  12745468 tctggggaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaa 12745567  T
Q  230 caaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||| | ||||||||||| ||||| | |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12745568 caaccctaatttctacccattttcctaatctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacattgtttcc 12745656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 318
Target Start/End: Original strand, 29999719 - 30000025
Alignment:
Q  11 cacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaagattgttgac 106  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||    |||||| |||| ||||||||    |||| ||    
T  29999719 cacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaaacacaaa-ccacaagcaaaagacaaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaa----tgttcac 29999812  T
Q  107 ccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatggatacaaatgggttacaagaa 204  Q
    ||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | ||||||||||    
T  29999813 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaaagatacaaaagagttacaagaa 29999912  T
Q  205 attagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggt 303  Q
    ||||||||  ||| | ||||||| ||||| | |||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  29999913 attagctttgacatgttcacaaagaacaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactca-ccaaggt 30000010  T
Q  304 gtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||    
T  30000011 gtttacaatgtttcc 30000025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 114 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8665561 - 8665362
Alignment:
Q  114 ggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagctta 213  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8665561 ggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttc 8665462  T
Q  214 aacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8665461 aacaagctctcaaagaacaaccctaatttctacccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttccaaggtgtttacaat 8665362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 111 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12073549 - 12073347
Alignment:
Q  111 ttcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattag 209  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||    
T  12073549 ttcggtccaacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaataaattag 12073450  T
Q  210 cttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 308  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  12073449 cttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaataagcaagacactc-atgattttcacactcccaaggtgttta 12073351  T
Q  309 caat 312  Q
    ||||    
T  12073350 caat 12073347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 141 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24969238 - 24969067
Alignment:
Q  141 agattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataat 239  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||    
T  24969238 agatttatctctccaatccactatcaattagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaatctaat 24969139  T
Q  240 ttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24969138 ttctacccatttttccaatctcaccaaagaacaagactctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 24969067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26364405 - 26364223
Alignment:
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  26364405 attgttgacccagttcagtcaaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactattaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 26364306  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacact 279  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  26364305 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacact 26364223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 111 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 41639582 - 41639381
Alignment:
Q  111 ttcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagc 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41639582 ttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagc 41639483  T
Q  211 ttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 309  Q
    || || ||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| || ||| || |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||    
T  41639482 ttcaaaaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaataaacaagacactc-gtgattttcactctcctaaggtgtttac 41639384  T
Q  310 aat 312  Q
    |||    
T  41639383 aat 41639381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 51337282 - 51337014
Alignment:
Q  48 aaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattga 147  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||| |||||||   | |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  51337282 aaaatcacaagcaaaagataaaaagagaagataaacaaa-cacaccacgaaatgtttacccagttcggtccaacttgacctaatgtgtgggagagattga 51337184  T
Q  148 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaa--cataatttcta 244  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| || |||||| |||||  ||||||||||| ||||||  | |||||||||    
T  51337183 tctctctaatacactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaagggttataataaattatcttaa--aagctcacaaagaacaaatccgtaatttcta 51337086  T
Q  245 cctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttt 316  Q
    ||  ||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51337085 ccctttttctcaatctcaccaatgaacaggacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttt 51337014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 98 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21688418 - 21688207
Alignment:
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||  |||||||||| |||    
T  21688418 attgttgactcaattcggtctaacttgacctaatctaggggagggattgatctctccaattcattatcaatgagttcttccgaagagatacaaatgagtt 21688319  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttc-caatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactca 295  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  21688318 acaaaaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccgatgaacaagacactc-atgattttcactcc 21688220  T
Q  296 cccaaggtgttta 308  Q
    |||||||||||||    
T  21688219 cccaaggtgttta 21688207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 312
Target Start/End: Original strand, 50262697 - 50262911
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgg 194  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  50262697 agattgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 50262796  T
Q  195 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcact 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| | | ||||| ||||||||   ||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  50262797 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccgtaatttcgatccattttcccaatctc---aataaacaagacactc-atgattttcact 50262892  T
Q  294 cacccaaggtgtttacaat 312  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  50262893 ctcccaaggtatttacaat 50262911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8648306 - 8648095
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  8648306 tgttcacccagtttggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttat 8648207  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| | ||||||||| | ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||   ||||||||||  ||    
T  8648206 aagaaattagcttcaacaaactcacaatgaacaaccctaatttctatccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttcc 8648107  T
Q  299 aaggtgtttaca 310  Q
    ||||||||||||    
T  8648106 aaggtgtttaca 8648095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 111 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35662597 - 35662395
Alignment:
Q  111 ttcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagc 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  35662597 ttcggtccaacttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagc 35662498  T
Q  211 ttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatga-ttttcactcacccaaggtgttta 308  Q
    || ||||| |||| ||| ||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| | | |||||||||||    
T  35662497 ttcaacaaactcataaagaacaaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttttcacactctcaaggtgttta 35662399  T
Q  309 caat 312  Q
    ||||    
T  35662398 caat 35662395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 13992192 - 13992505
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagc-aaaagat-aaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaa 96  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||    |||||| | ||||||||||||    
T  13992192 aataacagcacctagatctaatctaggtatcaaagtgaaaagca-caaatcacaagcaaaaagataaaagggagagaagagagaaac-aaacacaccaaa 13992289  T
Q  97 gattgttgacccaattcggtcc-aacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatggg 195  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |    
T  13992290 gattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aagagatacaaaagag 13992388  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttcta-cctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcact 293  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||    
T  13992389 ttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttcact 13992481  T
Q  294 cacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  13992482 ca-ccaaggtgtttacaatgtttcc 13992505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 98 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12119709 - 12119492
Alignment:
Q  98 attgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatggg 195  Q
    |||||| ||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| |||    
T  12119709 attgttcacctagttcggtccaacaatgacctactcttggg-agagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaaggg 12119611  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaac-ataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcact 293  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12119610 ttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctactcttttttccaatctcacctatgaacaagacactcattgattttcact 12119511  T
Q  294 cacccaaggtgtttacaat 312  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  12119510 ctcccaaggtatttacaat 12119492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 184 - 312
Target Start/End: Original strand, 55085450 - 55085578
Alignment:
Q  184 gatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaa 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  55085450 gatacaaatggtttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacctatttt-ccaatctcaccaatgaacaagacagtcaa 55085548  T
Q  283 tgattttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55085549 tgattttcactcacccaaggtgtttacaat 55085578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 246
Target Start/End: Original strand, 12744079 - 12744195
Alignment:
Q  131 tctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aa 229  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||    
T  12744079 tctggggaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaa 12744178  T
Q  230 caaacataatttctacc 246  Q
    ||| | |||||||||||    
T  12744179 caaccctaatttctacc 12744195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 312
Target Start/End: Original strand, 26699447 - 26699659
Alignment:
Q  105 acccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||    
T  26699447 acccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaag 26699546  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaa-cataatttctacctatttttc-caatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||| | ||||  || |||  |||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26699547 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatctataccctttcttctgaatctctctaataaacaagacattcaatgattttcactcaccca 26699646  T
Q  300 aggtgtttacaat 312  Q
    | |||||||||||    
T  26699647 aagtgtttacaat 26699659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29056610 - 29056317
Alignment:
Q  14 ctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattc 113  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||  | |||| || || |||    
T  29056610 ctagatctaatctaggaatcaa-gtgaaaaacacaaaaccacaaacaaaagataaagagaaaagagaaacaaa-cacaccaagaagtgtttacacagttc 29056513  T
Q  114 ggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagctt 212  Q
    |||| ||   ||||||  ||||| ||||||| | |||||| |||||| |||||||||| || |||||||  |||| ||| || || ||||||||||| |     
T  29056512 ggtcaaaatggacctacactgggtgagagataggtctctctaatccattatcaatgaggttgttacaaagagatataaaaggattgcaagaaattagttc 29056413  T
Q  213 aaacaagctcacaaa-aacaaaca-taatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 307  Q
     ||||||| |||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29056412 taacaagcacacaaagaacaaactctaattcctacc-attttcccaatctctctaatgaacaaaacactcaatgatttttactcacccaaggtgttt 29056317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 308
Target Start/End: Original strand, 48142313 - 48142588
Alignment:
Q  35 aagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctg 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| | |||| ||| |  ||  |||||  ||||||| | |     
T  48142313 aagtgaaaaacattaaaccacaatcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaaaaatgtttacctagctctctccaaattgacctactgta 48142411  T
Q  135 ggggagagattgatctctccaatccactat--caatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aac 230  Q
    ||| |||||||||||| || |||| |||||  |||||||||||| |||||  |||| | | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  48142412 ggg-agagattgatctttcaaatctactatatcaatgagttctttacaaagagatatacaagggttacaagaaactagcttcaacaagctcacaaagaac 48142510  T
Q  231 aaaca-taatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 308  Q
    ||||  ||||||||| | || || |||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  48142511 aaaccctaatttctatc-atgttcccaatctcatcaatgggcaagacactcaatgattttcactcacccgaagtgttta 48142588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Original strand, 31495312 - 31495482
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatg-gatac-aaat 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||     
T  31495312 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaa 31495411  T
Q  193 gggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcac 263  Q
    | ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||||| | |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  31495412 gagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaatcctaatttctacc-cttttcccaatctcac 31495482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5350140 - 5349923
Alignment:
Q  35 aagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaac-atgacctaatct 133  Q
    |||||||||||| || || |||| |||||||||| | |||||||||| | |||||||||||  | |||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  5350140 aagtgaaaaacacaagactacaaacaaaagataacgagagaagagaaac-aaacacaccaataaatgtttacccaattcagtccaacaatgacctactct 5350042  T
Q  134 gggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aaca 231  Q
     |||||||||  |||||||||  | || |||||| |||||| |||||||  |||||||| | | |||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  5350041 -ggggagaga--gatctctccgcttcattatcaacgagttctttacaaagagatacaaacgagctacaaggaattagcttcgacaagttcacaaagaaca 5349945  T
Q  232 aacataatttctacctattttt 253  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  5349944 aacctaatttctacccattttt 5349923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33090034 - 33089837
Alignment:
Q  113 cggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagc 210  Q
    |||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||  ||||| || ||||||||    
T  33090034 cggtccaacaataacctactctagaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttctttacagagagatacaaaatggttataataaattagc 33089935  T
Q  211 ttaaacaagctc-acaaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctc-acaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 307  Q
    || |||||||||  ||| |||||||||||||||||   || | | |||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33089934 ttcaacaagctctccaagaacaaacataatttctattcatctct-caatctcttcccatgaacaagacactcaatgattttcactcttccaaggtgttt 33089837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 41639346 - 41639218
Alignment:
Q  184 gatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaa 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| || ||| || |||||||||      
T  41639346 gatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagtttacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaataaacaagacactc-g 41639248  T
Q  283 tgattttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  41639247 tgattttcactctcctaaggtgtttacaat 41639218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Original strand, 21703772 - 21703958
Alignment:
Q  35 aagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatct 133  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| |||  | |||| ||||| ||||||| |||| ||||||| | |    
T  21703772 aagtgtaaaacacaaaatcacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaa-cacatcaagaaatgtttacccagttcggtcaaacaatgacctactat 21703870  T
Q  134 gggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagct 221  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||  || |||||||||| | ||| ||||||||    
T  21703871 gggg-atagattgatatctccaatccactgtcaatgagttctttacaaaaagatacaaaaagggtacaagaaatcatcttcaacaagct 21703958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34112986 - 34112821
Alignment:
Q  98 attgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatggg 195  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||| |||| |||    
T  34112986 attgtttaccaaattcggtccaacaatgacctactataggggagaga--gatctctccacttcactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaaggg 34112889  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctc-acaaaaacaaacataatttctac-ctatttttccaatctc 261  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||  | | ||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  34112888 ttacatgaaattagcttcaacaagctctcctagaacaaacataatttctactttttttttccaatctc 34112821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8393566 - 8393448
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaatggatacaaat 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||     
T  8393566 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa- 8393468  T
Q  193 gggttacaagaaattagctt 212  Q
     |||||||||||||||||||    
T  8393467 aggttacaagaaattagctt 8393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8395775 - 8395657
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaatggatacaaat 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||     
T  8395775 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa- 8395677  T
Q  193 gggttacaagaaattagctt 212  Q
     |||||||||||||||||||    
T  8395676 aggttacaagaaattagctt 8395657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33989990 - 33989893
Alignment:
Q  122 atgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaa 218  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  33989990 atgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactattaacgagttatttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagcttcaacaa 33989893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24969924 - 24969787
Alignment:
Q  10 acacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacat---aaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgac 106  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||  | |||| ||    
T  24969924 acacctagatctaatctactaatctaagtgaaaaaaaactcaaaaccataagcaaacgataaagtgagaagagaaacaaa-cacaccaagaaatgtttac 24969826  T
Q  107 ccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagatt 145  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  24969825 ccagttcggtccaacttgacctactctgggggatagatt 24969787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 222
Target Start/End: Original strand, 44967763 - 44967952
Alignment:
Q  35 aagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaag-ataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatc 132  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| ||||| ||||| |||| ||  | |||| |||||  ||||||||||| |||| || ||    
T  44967763 aagtgtaaaacacaaaaccacaatcaaaattataaagagagaggagaaacaaaatacacaaagaaatgtttacccaggtcggtccaacagtgacttattc 44967862  T
Q  133 tgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctc 222  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  44967863 tgggggagagattgatccctctaatctactctcaacgagttttttacaaagagatacaaat-ggttacaagaaattggcttcagcaagctc 44967952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 254
Target Start/End: Original strand, 22882763 - 22882907
Alignment:
Q  111 ttcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaatta 208  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  22882763 ttcggtccaacaatgacctactccgggggaga--ttgatttctctaatccactaccaatgagttctttacgaagagatacaaaagggttacaagaaatta 22882860  T
Q  209 gcttaaacaagctc-acaaaaacaaacataatttctacctatttttc 254  Q
    |||| ||||| |||  ||| ||||||| |||||| || | |||||||    
T  22882861 gcttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttttatccatttttc 22882907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 254
Target Start/End: Original strand, 22934427 - 22934571
Alignment:
Q  111 ttcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaatta 208  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  22934427 ttcggtccaacaatgacctactccgggggaga--ttgatttctctaatccactaccaatgagttctttacgaagagatacaaaagggttacaagaaatta 22934524  T
Q  209 gcttaaacaagctc-acaaaaacaaacataatttctacctatttttc 254  Q
    |||| ||||| |||  ||| ||||||| |||||| || | |||||||    
T  22934525 gcttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttttatccatttttc 22934571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 53345340 - 53345187
Alignment:
Q  145 tgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa--aaacaaacataattt 241  Q
    ||||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||  || ||| | ||||||    
T  53345340 tgatccctacaatccaatattaatgagttctttacaaaaagatataaaagggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaatcaaccttaattt 53345241  T
Q  242 ctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    ||| | |||||  ||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||||    
T  53345240 ctatc-attttctcaatctctccgataaacaagacactcaatgattttcactcac 53345187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3796626 - 3796568
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3796626 aaacacaccaaagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagaga 3796568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 10047370 - 10047427
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10047370 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 10047427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 39245985 - 39246042
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39245985 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 39246042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 5396779 - 5396700
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  5396779 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagaga-gcagctctccaatccactat 5396700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6677597 - 6677514
Alignment:
Q  140 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctc 222  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| || ||||| |||||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6677597 gagattgatctctcaaatccattatcaaagacttctttacaaagatatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctc 6677514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 36315335 - 36315258
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  36315335 aaacacaccaa-gaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 36315258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 36329544 - 36329467
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  36329544 aaacacaccaa-gaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 36329467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 38152545 - 38152468
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  38152545 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 38152468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 246
Target Start/End: Original strand, 16422653 - 16422755
Alignment:
Q  146 gatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaaa-acaaacataatttct 243  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||   ||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16422653 gatctctccacttcactatccatgagttcattacaaagatatacaaaagggtttctagaaattagcttcaaaaagctctcaaaaaacaaacataatttct 16422752  T
Q  244 acc 246  Q
    |||    
T  16422753 acc 16422755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 31985741 - 31985688
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggg 137  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31985741 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg 31985688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5269288 - 5269240
Alignment:
Q  95 aagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5269288 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 5269240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 143
Target Start/End: Original strand, 5143260 - 5143307
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5143260 agattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 5143307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16623399 - 16623322
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  16623399 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagaga-gcagctctccaatccactat 16623322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 246
Target Start/End: Original strand, 44570427 - 44570514
Alignment:
Q  161 ctatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctc-acaaaaacaaacataatttctacc 246  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||   ||||||||||||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  44570427 ctatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattagtttcaacaagctctccaacaacaaacataatttctacc 44570514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 42599680 - 42599623
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  42599680 aaacacaccaa-gattgttgacccaattcagtccaatatgacataatatgggggagaga 42599623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 164
Target Start/End: Original strand, 3777550 - 3777617
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  3777550 agattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagt-agctctccaatccactat 3777617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5136237 - 5136118
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatgg-atacaaa 191  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||    
T  5136237 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 5136139  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  5136138 gaggttacaagaaattagctt 5136118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5138462 - 5138343
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatgg-atacaaa 191  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||    
T  5138462 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 5138364  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  5138363 gaggttacaagaaattagctt 5138343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 5147678 - 5147722
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggag 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  5147678 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggag 5147722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 137
Target Start/End: Original strand, 54867175 - 54867226
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggg 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  54867175 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggg 54867226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 24333800 - 24333877
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  24333800 aaacacaccaa-gattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagaga-gcagctctccaatccactat 24333877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 69
Target Start/End: Original strand, 31495209 - 31495271
Alignment:
Q  6 aacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaa 69  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  31495209 aacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaa-cacaagcacaagataaa 31495271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3913829 - 3913775
Alignment:
Q  18 atctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaaggg 72  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  3913829 atctaatctaggaatcaaagtgaaaagtataaaaccacaagtaaaagaaaaaggg 3913775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7125046 - 7124992
Alignment:
Q  123 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 176  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7125046 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 7124992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 8689591 - 8689533
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagag 142  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  8689591 aaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgatctaatatgggggagag 8689533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25862128 - 25862071
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  25862128 aaacacaccaa-gattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatatggggaagaga 25862071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 215
Target Start/End: Original strand, 5112317 - 5112346
Alignment:
Q  186 tacaaatgggttacaagaaattagcttaaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5112317 tacaaatgggttacaagaaattagcttaaa 5112346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 39774324 - 39774255
Alignment:
Q  184 gatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa--aaacaa-acataatttctacctatttt 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||||||||||| |||||    
T  39774324 gatacaaataggttacaagaaattagcttaa--aagctcacaaagaaacaagacctaatttctaccaatttt 39774255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 4215639 - 4215595
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  4215639 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 4215595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5349905 - 5349861
Alignment:
Q  267 tgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 311  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5349905 tgaacaagacactcaaagattttcaatcatccaaggtgtttacaa 5349861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 5635476 - 5635520
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  5635476 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 5635520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6765177 - 6765133
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  6765177 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 6765133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 7941656 - 7941612
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  7941656 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 7941612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 8631419 - 8631463
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  8631419 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 8631463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 9148585 - 9148541
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  9148585 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 9148541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 14789428 - 14789472
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  14789428 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 14789472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16455575 - 16455531
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  16455575 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 16455531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 16931789 - 16931833
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  16931789 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 16931833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 16934143 - 16934187
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  16934143 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 16934187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 17662245 - 17662289
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  17662245 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 17662289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 18709164 - 18709208
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  18709164 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 18709208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 22780373 - 22780417
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  22780373 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 22780417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 22800862 - 22800906
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  22800862 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 22800906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24879323 - 24879279
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  24879323 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 24879279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24880785 - 24880741
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  24880785 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 24880741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24889129 - 24889085
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  24889129 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 24889085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 28468636 - 28468558
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  28468636 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatgacctaatctggaggagaga-gcagctctccaatccactat 28468558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 37089372 - 37089416
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  37089372 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 37089416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 173
Target Start/End: Original strand, 37754994 - 37755034
Alignment:
Q  133 tgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 173  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  37754994 tgggggagagattgatctcttcaaaccattatcaatgagtt 37755034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 172
Target Start/End: Original strand, 38811189 - 38811262
Alignment:
Q  98 attgttgacccaattcggtccaac-atgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagt 172  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  |||||||||  | ||||||||||||||    
T  38811189 attgtttacccagttcggtccaacaatgacctactcttggggagaga--gatctctccgcttcactatcaatgagt 38811262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 38928177 - 38928221
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  38928177 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 38928221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40637407 - 40637363
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  40637407 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 40637363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 44599838 - 44599882
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  44599838 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 44599882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 119)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 41317337 - 41317654
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  41317337 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaggagaaacaaa-cacaccaaagatt 41317435  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41317436 gttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatggattaca 41317535  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  41317536 agaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagagactcaatgattttcactcatcca 41317635  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41317636 aggtgtttacaatgtttcc 41317654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 318
Target Start/End: Original strand, 41648922 - 41649230
Alignment:
Q  11 cacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagca-aaacacaccaaagattgttgaccca 109  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  41648922 cacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttgaccca 41649021  T
Q  110 attcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattag 209  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41649022 gttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattag 41649121  T
Q  210 cttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 308  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41649122 c-taaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccaatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcacttacccaaggtgttta 41649220  T
Q  309 caatgtttcc 318  Q
    ||||||||||    
T  41649221 caatgtttcc 41649230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1113920 - 1113605
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1113920 aataataacacctagatctaatctaggaatcaaaatgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaaacaaa-cacaccaaagattgt 1113822  T
Q  103 tgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  1113821 tgactcaattcggtcaaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttataag 1113722  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaag 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1113721 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaag 1113622  T
Q  302 gtgtttacaatgtttcc 318  Q
     ||||||||||||||||    
T  1113621 ttgtttacaatgtttcc 1113605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27348084 - 27347765
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | |||||||||||||||    
T  27348084 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagtgagagaagagaggaacaaacacaccaaagat 27347985  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27347984 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 27347885  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27347884 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 27347785  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    || |||||||||||||||||    
T  27347784 aatgtgtttacaatgtttcc 27347765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 14069732 - 14070050
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||    
T  14069732 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaag 14069831  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14069832 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 14069931  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14069932 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 14070031  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtt 315  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14070032 ccaaggtgtttacaatgtt 14070050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 14379760 - 14380078
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||    
T  14379760 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaag 14379859  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14379860 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 14379959  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14379960 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 14380059  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtt 315  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14380060 ccaaggtgtttacaatgtt 14380078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 36146311 - 36146621
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36146311 ataataacaacatctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctaaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagatt 36146409  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  36146410 gttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac- 36146508  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaac-ataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36146509 agaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 36146608  T
Q  299 aaggtgtttacaa 311  Q
    |||||||||||||    
T  36146609 aaggtgtttacaa 36146621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 8153607 - 8153290
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  8153607 ataataacaacacctagatctgatctaataatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaataaa-cacaccaaagatt 8153509  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  8153508 gttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagttaca 8153409  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||| ||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8153408 agaaattagctttgacaatctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccca 8153309  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    | |||||||||||||||||    
T  8153308 atgtgtttacaatgtttcc 8153290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 47676035 - 47676356
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | | |||||||||||||    
T  47676035 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaatggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 47676134  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  47676135 attgttgatccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatcattgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 47676234  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  47676235 acaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactcac 47676334  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  47676335 ccaaggtgtttacaatgtttcc 47676356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 318
Target Start/End: Original strand, 31732882 - 31733189
Alignment:
Q  15 tagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagattgttgacccaat 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |    
T  31732882 tagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaactcaccaaagattgttgacccagt 31732981  T
Q  112 tcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagct 211  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31732982 tcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagct 31733081  T
Q  212 taaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttaca 310  Q
    | | |||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31733082 tcaccaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttaca 31733181  T
Q  311 atgtttcc 318  Q
    ||||||||    
T  31733182 atgtttcc 31733189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 47673843 - 47674161
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||    
T  47673843 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 47673942  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||||||  || ||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  47673943 attgttgattcagttcggtccaacttgacttaatatgggg-agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 47674041  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47674042 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 47674141  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgttt 316  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  47674142 ccaaggtgtttacaatgttt 47674161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 38671123 - 38671442
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | |||||||||   | |||||||||||||||    
T  38671123 ataatgacaacacctagatcaaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagat 38671222  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  38671223 tgttgacccagttcggtccaacttgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagtgatacaaatgtgttac 38671322  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  38671323 aataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcgctcaccc 38671422  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  38671423 aaggtgtttacaatgtttcc 38671442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4586428 - 4586109
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| | | |||||||| ||||||    
T  4586428 aataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacgaaagat 4586329  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    ||| |||||| ||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  4586328 tgtcgacccagttcggtccaagttgacataatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaatgggttac 4586229  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    || |||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4586228 aaaaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttacactcaccc 4586129  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4586128 aaggtgtttacaatgtttcc 4586109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 43864511 - 43864192
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | ||||||||||   ||    
T  43864511 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccatctat 43864412  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  43864411 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaattagtttttacaaagagatacaaatgggttac 43864312  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43864311 aggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 43864212  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43864211 aaggtgtttacaatgtttcc 43864192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 48489698 - 48489379
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaaggg--agaagagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||    
T  48489698 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggcgagaagagaggaacaaacacaccaaagat 48489599  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  48489598 tgtttacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttattgcaaagagatacaaatgggttac 48489499  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  48489498 aagaaattagcttcaacaagttttcaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacatttaatgattttcactcaccc 48489399  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  48489398 aaggtgtttacaatgtttcc 48489379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18126913 - 18126592
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagca-aaacacaccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    | ||| | | |||||||||||||    
T  18126913 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaaaatagaggaacaaacacaccaaag 18126814  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18126813 attgttgacccaggtcggtcaaacttgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 18126714  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18126713 acaagaaattagcttgaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacacatttttccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttcactcac 18126614  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  18126613 ccaagttgtttacaatgtttcc 18126592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 48491843 - 48491527
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagca-aaacacaccaaagattg 101  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||| |||||||||    
T  48491843 aataacaacgcctagatctaatataggaatcaaaatgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagaggaacaaacacatcaaagattg 48491744  T
Q  102 ttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaa 201  Q
    || ||| | || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  48491743 tttaccaagtttgg-ccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacaaatgggttacaa 48491645  T
Q  202 gaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaa 300  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48491644 gaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaa 48491545  T
Q  301 ggtgtttacaatgtttcc 318  Q
     |||||||||||||||||    
T  48491544 agtgtttacaatgtttcc 48491527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 495888 - 496203
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  495888 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaatagaaaatcacaagcaagagataaagagagaaaagaaacaaa-cacaccaaagattgt 495986  T
Q  103 tgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    ||||||  ||| ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  495987 tgacccggttctgtccaacttgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttgcaag 496086  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaag 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  496087 aaattagcttcaacaagctcacaaagaactaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaattaacaaaacactaaatgattttcactcacccaag 496186  T
Q  302 gtgtttacaatgtttcc 318  Q
    || ||||||||||||||    
T  496187 gtttttacaatgtttcc 496203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 317
Target Start/End: Original strand, 31105297 - 31105612
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaa-gataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattg 101  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| || |||||  | ||    
T  31105297 aataacaacaccaagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaaagataaggagagaagagaaacaaa-cagaccaagaaatg 31105395  T
Q  102 ttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaa 201  Q
    || ||||| ||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31105396 tttacccagttcggtccaacttgatctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttacaa 31105495  T
Q  202 gaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaa 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31105496 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaatctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaa 31105595  T
Q  301 ggtgtttacaatgtttc 317  Q
    |||||||||||||||||    
T  31105596 ggtgtttacaatgtttc 31105612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23555308 - 23554988
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    |||||| |||| |||| ||||||    
T  23555308 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtaaaaaacacaataccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacatcaaaga 23555210  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | |||    
T  23555209 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaggtacaaaagtgtt 23555110  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacc-tatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactca 295  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23555109 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 23555010  T
Q  296 cccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  23555009 -ccaaggtgtttacaatgtttcc 23554988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26417583 - 26417264
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaa-aga 98  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | ||||||||||| | |    
T  26417583 aataacagcacctagatataatctatgaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaagaaa 26417484  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtta 198  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26417483 ttgttgacccagtttggtccaatttgacctaacctgggg-agagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 26417385  T
Q  199 caagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 297  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |     
T  26417384 caagaaattatcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacccgct 26417285  T
Q  298 caaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26417284 caaggtgtttacaatgtttcc 26417264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19502448 - 19502126
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||    |||||| |||| |||||||||    
T  19502448 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcacaaaataaagggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaa 19502350  T
Q  97 gattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatggg 195  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||| | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |    
T  19502349 gattgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagag 19502250  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctcaca-aaaacaaacataatttct-acctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcact 293  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  19502249 ttacaagaaattagctttgacaagctcacaaaaaacaaccttaatttctaaccttttttcgcaatctcaccactgaacaagacactcaatgattctcact 19502150  T
Q  294 cacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  19502149 ca-ccaaggtgtttacaatgtttcc 19502126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 318
Target Start/End: Original strand, 12097789 - 12098079
Alignment:
Q  20 ctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtcca 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12097789 ctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagattgttgacctagttcggtcca 12097887  T
Q  120 acatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaag 219  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||       |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12097888 acttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta-caaagagtt-------agagatacaaatgggttacaagaaattaacttcaacaag 12097979  T
Q  220 ctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12097980 ctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctaaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagatgtttacaatgtttcc 12098079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25616122 - 25615813
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaaga-----gaagcaaaacacaccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||     ||| |||| ||||||||||    
T  25616122 aataacaacacctagatctaatctaggaatcgaagtgaaaagcacaaaaccacaagcacaagataaagagagaagaagagagaaacaaa-cacaccaaag 25616024  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggt 196  Q
    ||||||  |||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25616023 attgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatgggt 25615924  T
Q  197 tacaagaaattagcttaaacaagctcaca-aaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactca 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||          ||||||||||||||||||| ||||    
T  25615923 tacaagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctc----------aagacactcaatgattttctctca 25615834  T
Q  296 cccaaggtgtttacaatgttt 316  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25615833 cccaaggtgtttacaatgttt 25615813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 30024717 - 30024950
Alignment:
Q  84 aaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatg 183  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  30024717 aaaacacactaaagattgttgatccagttcggtccaacttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaga 30024816  T
Q  184 gatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaa 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  30024817 gatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaa 30024916  T
Q  283 tgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30024917 tgattttcactcacccaaggtgtttacaacgttt 30024950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29991320 - 29991003
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||||    
T  29991320 aataacaacacctagatctaatataggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaaga 29991223  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| |||||    
T  29991222 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattagaaagagatacaaaagggtt 29991123  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||| |  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  29991122 acaagaaattagctttgacaagttcacaaataacaaccctaatttctatc-cttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 29991025  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29991024 ccaaggtgtttacaatgtttcc 29991003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 35854183 - 35853863
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagat-aaagggaga----agagaagcaaaacacaccaa-a 96  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||    |||||| | ||||||||||| |    
T  35854183 aataacagcacctagatctaatctaggaagcaaagtgaaaagcataaaa-cacaagcacaagataaaagggagagaagagagaaac-aaacacaccaaga 35854086  T
Q  97 gattgttgacccaattcggtcc-aacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatggg 195  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  35854085 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaggg 35853986  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactc 294  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35853985 ttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 35853886  T
Q  295 acccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  35853885 a-ccaaggtgtttacaatgtttcc 35853863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 87 - 312
Target Start/End: Original strand, 2360960 - 2361185
Alignment:
Q  87 acacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggat 186  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  2360960 acacaccaaaggttattgacccagttcggttcaacttgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagat 2361059  T
Q  187 acaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatga 285  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  2361060 acaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atga 2361158  T
Q  286 ttttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2361159 ttttcactctcccaaggtgtttacaat 2361185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 24525405 - 24525596
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24525405 ataataacaacacctagatcaaatttagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagatt 24525503  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatg 193  Q
     |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24525504 attgacccagttccgtccaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 24525596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 89 - 312
Target Start/End: Original strand, 34310705 - 34310929
Alignment:
Q  89 acaccaaagattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggata 187  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  34310705 acaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagata 34310804  T
Q  188 caaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgat 286  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  34310805 caaatgtgttacaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgat 34310903  T
Q  287 tttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  34310904 tttcactctcccaaggtgtttacaat 34310929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4179040 - 4178723
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||    |||||| | ||||||||||||||    
T  4179040 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaaca-caaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaaga 4178943  T
Q  99 ttgttgacccaattcgg-tccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||| | || || || ||| ||||||  ||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  4178942 ttgttcacctagtttggttcaaacttgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagggtt 4178844  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||   |||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  4178843 acaagaaattagctttcccaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 4178745  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4178744 ccaaggtgtttacaatgtttcc 4178723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 100 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22270140 - 22269931
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22270140 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatcagttcttacaaagagatacaaatgggttac 22270041  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||| |||    
T  22270040 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctccc 22269941  T
Q  299 aaggtgttta 308  Q
    ||||||||||    
T  22269940 aaggtgttta 22269931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 311
Target Start/End: Original strand, 23564966 - 23565274
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaa-ccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattg 101  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||  | ||    
T  23564966 aataacaaaacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaatcacaaaaaccacaagcaaaagataaatagagaagagaaacaaa-cacaccaagaaatg 23565064  T
Q  102 ttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaa 201  Q
     | ||| | ||| ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||    
T  23565065 attacc-agttcagtccaacttgacctactctaggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaa 23565163  T
Q  202 gaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaa-acataatttctacctattttt--ccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 297  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||| |||||| ||||||||   | || ||||||||||    
T  23565164 gaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaagacctaatttctacctattttttcctaatctcaccaatgaacaagacact---tcatgttcactcacc 23565260  T
Q  298 caaggtgtttacaa 311  Q
    ||||||||||||||    
T  23565261 caaggtgtttacaa 23565274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 105 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6432133 - 6431926
Alignment:
Q  105 acccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaa 204  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6432133 acccagttcggtccaacttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 6432034  T
Q  205 attagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggt 303  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  6432033 attagcttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccattttcccaatctaaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaatgt 6431935  T
Q  304 gtttacaat 312  Q
    |||||||||    
T  6431934 gtttacaat 6431926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Original strand, 8359316 - 8359530
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatac-aaatgggtt 197  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  8359316 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 8359415  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  8359416 acaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaaaaaccctaatttctacccattttcccaatctccccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 8359514  T
Q  297 ccaaggtgtttacaat 312  Q
     |||||||||||||||    
T  8359515 tcaaggtgtttacaat 8359530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 25766858 - 25767177
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagc-aaaagat-aaagggaga----agagaagcaaaacacaccaa- 95  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||    |||||| | |||||||||||     
T  25766858 aataacagcacctagatctaatctaggtatcaaagtgaaaaaca-caaatcacaagcaaaaagataaaagggagagaatagagaaac-aaacacaccaag 25766955  T
Q  96 agattgttgacccaattcggtc-caacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatac-aaatg 193  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||| ||| |    
T  25766956 agattgttcacccagttcggtctaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttcaaaagagatacaaaagg 25767055  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcac 292  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  |||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25767056 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttccaatctc---aatgaacaagacactcaatgattttcac 25767152  T
Q  293 tcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25767153 tca-ccaaggtgtttacaatgtttcc 25767177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 111 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2390438 - 2390237
Alignment:
Q  111 ttcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagc 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2390438 ttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatatatgagttattacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 2390339  T
Q  211 ttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 309  Q
    || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2390338 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttcgaatttcaccaatgaacaagacact-tatgattttcgctctcccaaggtgtttac 2390240  T
Q  310 aat 312  Q
    |||    
T  2390239 aat 2390237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3259162 - 3258949
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  3259162 tgttcacccagttcggttcaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaatgagttac 3259063  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||  |||    
T  3259062 aataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactttccc 3258963  T
Q  299 aaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||    
T  3258962 aaggtgtttacaat 3258949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Original strand, 4508707 - 4508919
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4508707 tgttcacccagttcggtccaacttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 4508806  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  4508807 aagaaattagcttcaataagctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatcaacaagacactc-atgattttcactctccc 4508905  T
Q  299 aaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||    
T  4508906 aaggtgtttacaat 4508919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 39731638 - 39731325
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagaga-agcaaaaca----caccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||| |  | || ||||||    ||||||||    
T  39731638 aataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaag 39731540  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatg-gatacaaatggg 195  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |    
T  39731539 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagag 39731440  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactc 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  39731439 ttacaagaaattagatctgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc-ctttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactc 39731348  T
Q  295 acccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  39731347 a-ccaaggtgtttacaatgtttcc 39731325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 4253443 - 4253742
Alignment:
Q  12 acctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaat 111  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| | |||||  | |||| |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||||||||  | |||| ||| | |    
T  4253443 acctagatctaatatagaaatcaa-gcgaaaagtacaaaagcacaagcaaacgataaagagtgaagagaaacaaa-cacaccaagaaatgtttacctagt 4253540  T
Q  112 tcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagc 210  Q
    |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||  |||| ||| |||||||| |||||||||    
T  4253541 tcggtccaaattgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaatgagttctttccaaagagatataaaagggttacatgaaattagc 4253640  T
Q  211 ttaaacaagctcacaaa-aacaaa-cataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 308  Q
    || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4253641 ttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacc-attttaccaatttcaccaatgaacaagaaactcaatgattttcactcacctaaggtgttta 4253739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Original strand, 48599335 - 48599547
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||    
T  48599335 tgttcacccagttcggtccaacttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagctcttccaaagagatacaaatgagttac 48599434  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||| || |||||||||||||  ||    
T  48599435 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaatgaacaagacaatc-atgattttcactcctcc 48599533  T
Q  299 aaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||    
T  48599534 aaggtgtttacaat 48599547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 227
Target Start/End: Original strand, 2759127 - 2759325
Alignment:
Q  32 tcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagaga-agcaa--aacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacct 128  Q
    ||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| || ||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  2759127 tcaaagttaaaagcacaaaaccataagcaaaagataaagggagagaagagagaaagaaacacaccaatgattgttgaccaagttcggtccaacttgacct 2759226  T
Q  129 aatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa 227  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2759227 aatctggggaagagattgatatctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaa 2759325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 111 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29608893 - 29608691
Alignment:
Q  111 ttcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagc 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29608893 ttcggtccaacttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagc 29608794  T
Q  211 ttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 309  Q
    || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||   | |||| ||| | ||||||||||||    
T  29608793 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaagacactcatgaagtttcgctctctcaaggtgtttac 29608694  T
Q  310 aat 312  Q
    |||    
T  29608693 aat 29608691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31519160 - 31518911
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||        ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||  | |    
T  31519160 ataataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagca--------caagcaaaagataaagaaagaagagaaacaaa-cacaccaagaaat 31519070  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggg-gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    ||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  31519069 gtttatccagttcggtccaacttgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 31518970  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcaca-aaaacaaacataatttctacctatttttccaat 258  Q
    ||| || |||||| || ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  31518969 aag-aactagcttcaataagctcacagagaacaaacctaatttctacctattttcccaat 31518911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 157 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31518905 - 31518745
Alignment:
Q  157 tccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttcc 255  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  31518905 tccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaactagcttcaataagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttccc 31518806  T
Q  256 aatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttt 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31518805 aatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaaggtgtttacgatgttt 31518745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23344236 - 23343934
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||||||| || | ||||||||  | |||    
T  23344236 aataacaaaacctagatttaatctacgaatcaaagtgaaaaacacaaaaccgcaagaaagagataaagagagaagagaaacata-cacaccaagaaatgt 23344138  T
Q  103 tgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    | |||   ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| |||||   |||| || ||||||||||    
T  23344137 ttaccttgttcggtccaacttgacctactctggg--agagattaatttctccaatctattatcaatgagttctcacaaagatatactaaagggttacaag 23344040  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaa-cataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaa 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||  |||| | |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23344039 aaattagcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctacc-cttttccaaatctcaccaatgaactagacattcaatgattttcactcacccaa 23343941  T
Q  301 ggtgttt 307  Q
    |||||||    
T  23343940 ggtgttt 23343934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 227
Target Start/End: Original strand, 32358055 - 32358182
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32358055 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 32358154  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa 227  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32358155 aagaaattagcttcaacaagctcacaaa 32358182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Original strand, 4510549 - 4510761
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  4510549 tgttcacccagtacggtccaacttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttac 4510648  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| | |||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  4510649 aagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaatcaacaaggcactc-atgattttcactctccc 4510747  T
Q  299 aaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||    
T  4510748 aaggtgtttacaat 4510761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Original strand, 4512391 - 4512603
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  4512391 tgttcacccagtacggtccaacttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttac 4512490  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| | |||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  4512491 aagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaatcaacaaggcactc-atgattttcactctccc 4512589  T
Q  299 aaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||    
T  4512590 aaggtgtttacaat 4512603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 48409074 - 48408751
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaa-gataaa-gggaga----agagaagcaaaacacaccaa- 95  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||| || ||| | |||||||||| |||||| ||||||    |||||| |||| ||||||||     
T  48409074 aataacagcacctagatctaatctaggtatcaaagtgaaaagcacaaatc-acaagcaaaaagataaaagggagagaagagagaaacaaa-cacaccaag 48408977  T
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatg-gatacaaatg 193  Q
    | |||||| ||||| ||||||| || | |||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||| |    
T  48408976 aaattgttcacccagttcggtctaaacttgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatcaatgagttatttcaaaagagatacaaaag 48408877  T
Q  194 gg-ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaaaacaaacat-aatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttca 291  Q
    || |||||||||||||||||  ||||| | ||||| |  ||||| ||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  48408876 gggttacaagaaattagctttgacaagtttacaaagaacaacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 48408777  T
Q  292 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  48408776 ctca-ccaaggtgtttacaatgtttcc 48408751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Original strand, 36574434 - 36574728
Alignment:
Q  15 tagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcg 114  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | ||||||| |||  | |||| ||||| || |    
T  36574434 tagatctaatctaggaatcaa-gtgaaaaacacaaaaccacaagaaaaagataaagagagaagaaaaac-aaacacatcaagaaatgtttacccagtttg 36574531  T
Q  115 gtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagctta 213  Q
    ||||||  ||||||| |||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  36574532 gtccaaattgacctactct-agggatggattgatctctccaaaccactatcaatgagttctttacaaagagatataaaagggttacaagaaattagcttc 36574630  T
Q  214 aacaagctcacaaa-aacaaa-cataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 311  Q
    ||||| |||||||| |||||| | |||||||||||  |||  |||||||| | ||| || ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36574631 aacaaactcacaaagaacaaatcttaatttctacc--tttccccaatctctccaataaacaagacactcgataattttcactcacctaaggtgtttacaa 36574728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 224
Target Start/End: Original strand, 6359951 - 6360077
Alignment:
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6359951 attgttgacccagttcgatccaacttgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 6360050  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcac 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  6360051 acaagaaattagcttcaacaagctcac 6360077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 318
Target Start/End: Original strand, 4538627 - 4538760
Alignment:
Q  186 tacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatg 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4538627 tacaaatgggttacaagaaattagcttaaaaaatttcataaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatg 4538726  T
Q  285 attttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4538727 attttcactcacccaaggtgtttacaatttttcc 4538760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 188 - 318
Target Start/End: Original strand, 24525985 - 24526117
Alignment:
Q  188 caaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaa-cataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatga 285  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  24525985 caaatgagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagacactcaatga 24526084  T
Q  286 ttttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24526085 ttttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 24526117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 312
Target Start/End: Original strand, 22328395 - 22328611
Alignment:
Q  105 acccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||| ||||  |||||||| | ||||||||    
T  22328395 acccagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactattaatgacttccttgcaaagagatacaaaagagttacaag 22328494  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaac-ataatttct-acctatttttccaatctcacaaatg----aataagacactcaatgattttcactca 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| |||| | || |||||||| | ||||    || |||||||||||||||||||| ||     
T  22328495 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctaacctttcttcccaatctctctaatgaacaaacaagacactcaatgattttcattcc 22328594  T
Q  296 cccaaggtgtttacaat 312  Q
    | |||||||||||||||    
T  22328595 ctcaaggtgtttacaat 22328611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 30814617 - 30814530
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 173  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30814617 aaacacaccaaa-attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 30814530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 263
Target Start/End: Original strand, 43504058 - 43504320
Alignment:
Q  9 aacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagaga-agcaaaaca----caccaa-agattgt 102  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |  | || ||||||    |||||| |||||||    
T  43504058 aacagctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgt 43504156  T
Q  103 tgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatg-gatac-aaatgggttac 199  Q
    | ||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||    
T  43504157 tcacccagttcgatccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttac 43504256  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcac 263  Q
    |||||||||| ||  ||||| ||||||  ||||| | |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  43504257 aagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac 43504320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 236 - 318
Target Start/End: Original strand, 2761440 - 2761522
Alignment:
Q  236 taatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2761440 taatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaatgtgtttacaatgtttcc 2761522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20344068 - 20343951
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaatggatacaaatg 193  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||      
T  20344068 agattgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-a 20343970  T
Q  194 ggttacaagaaattagctt 212  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20343969 ggttacaagaaattagctt 20343951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 311
Target Start/End: Original strand, 5514113 - 5514222
Alignment:
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaa-cataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaa 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  5514113 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacataatttctac-tcttttttcaatctctcaaatgaacaagaaactcaatgattttcactcatcgaa 5514211  T
Q  301 ggtgtttacaa 311  Q
    |||||||||||    
T  5514212 ggtgtttacaa 5514222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 318
Target Start/End: Original strand, 24514912 - 24514980
Alignment:
Q  249 tttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24514912 ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaatgtttcc 24514980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 30024655 - 30024714
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagca 60  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  30024655 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagca 30024714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 311
Target Start/End: Original strand, 3904628 - 3904830
Alignment:
Q  111 ttcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaatta 208  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||  ||| |||| | ||||||||||||||    
T  3904628 ttcggtccaacaatgacctactctgagggagagattgatctctctgat-cactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagtgttacaagaaatta 3904726  T
Q  209 gcttaaacaagctcacaaa-aac-aaacataatttctacctatttttccaatctc-acaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 305  Q
      || || | |||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |  | ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3904727 cattcaataggctctcaaagaacaaaacctaatttctacc-attttcccaatctcttcctaagaacaagagactcaatga-tttcactcgcccaaggtgt 3904824  T
Q  306 ttacaa 311  Q
    ||||||    
T  3904825 ttacaa 3904830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24790013 - 24789882
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatggatacaaatg 193  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||      
T  24790013 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatagtactctccaatccactatcaaagagtttttacaaaagggatacaaa-a 24789915  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa 226  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  24789914 tgttacaagaaattagctttgacaagttcacaa 24789882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 2580381 - 2580438
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2580381 aaacacaccaa-gattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagaga 2580438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5116739 - 5116653
Alignment:
Q  133 tgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaa 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||| || |||||| |||||| ||| |||||    
T  5116739 tgggggagagatttatctctccaattcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggtttacaataaattatcttcaacaa 5116653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 20284080 - 20284137
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20284080 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 20284137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 18388756 - 18388875
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaatggatacaaa 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||    
T  18388756 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 18388854  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  18388855 gaggttacaagaaattagctt 18388875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 18392192 - 18392311
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaatggatacaaa 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||    
T  18392192 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 18392290  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  18392291 gaggttacaagaaattagctt 18392311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 164
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983352
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 21983352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 181
Target Start/End: Original strand, 1560662 - 1560749
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 181  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1560662 agattggttacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 1560749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 29159794 - 29159871
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||||    
T  29159794 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagaga-gcagctctccaatccactat 29159871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 9190114 - 9190057
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  9190114 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagaga 9190057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 46516416 - 46516359
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  46516416 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagaga 46516359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 142
Target Start/End: Original strand, 47263667 - 47263725
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagag 142  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  47263667 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagag 47263725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18396486 - 18396409
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacat-gacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 176  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18396486 tgtttacccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaatgaattctt 18396409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2647793 - 2647745
Alignment:
Q  95 aagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  2647793 aagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagaga 2647745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 4796773 - 4796718
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggaga 141  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4796773 aaacacaccaa-gattgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggaga 4796718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 6592336 - 6592455
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaatggatacaaa 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||    
T  6592336 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 6592434  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  6592435 gaggttacaagaaattagctt 6592455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 6594554 - 6594673
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaatggatacaaa 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||    
T  6594554 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 6594652  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  6594653 gaggttacaagaaattagctt 6594673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26639545 - 26639419
Alignment:
Q  47 taaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagatt 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||| | ||||||  ||| || | ||| |||||| ||||| |||| || | ||| |||||||||    
T  26639545 taaaaccacaagcaaaaggtaaagagataagagaaacaaa-cgcaccaagaattttttagccagttcggtacaacaatgacatactatggaggagagatt 26639447  T
Q  146 gatctctccaatccactatcaatgagtt 173  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||    
T  26639446 gatctctctaatccattatcaaagagtt 26639419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 142
Target Start/End: Original strand, 21988909 - 21988955
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagag 142  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21988909 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagag 21988955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Original strand, 32060318 - 32060400
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 176  Q
    |||||||| ||| | |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32060318 agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 32060400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 33332556 - 33332499
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  33332556 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagaga 33332499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 35960807 - 35960864
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  35960807 aaacacaccaa-gattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagaga 35960864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 44848782 - 44848713
Alignment:
Q  94 aaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  44848782 aaagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 44848713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23403110 - 23403065
Alignment:
Q  95 aagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggag 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  23403110 aagattgttgacccaattcggtctaatatgacctaatctgagggag 23403065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28617244 - 28617174
Alignment:
Q  184 gatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aac-aaacataatttctacctatttttc 254  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  28617244 gatacaatggggttacaagaaattagcttaa--aagctcacaaagaacaaaacctaatttctacctatttttc 28617174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 137
Target Start/End: Original strand, 55939 - 55990
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggg 137  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  55939 aaacacaccaa-gattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg 55990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 5817376 - 5817324
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggg 137  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||| |||||||    
T  5817376 aaacacaccaaagattgttaactcagttcggtccaatatgacctactctgggg 5817324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 9185262 - 9185214
Alignment:
Q  95 aagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  9185262 aagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagaga 9185214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 40808819 - 40808712
Alignment:
Q  35 aagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaac-atgacctaatct 133  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||| | | || || || ||||||||||| ||||| || |||    
T  40808819 aagtgtaaaacacaaaaccacaagcaaaagatatagagagaaaagaaac-aaacacaccaaaaaatatttactcagttcggtccaacaatgacatactct 40808721  T
Q  134 gggggagag 142  Q
     ||||||||    
T  40808720 aggggagag 40808712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 42330997 - 42331041
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  42330997 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagaga 42331041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 142
Target Start/End: Original strand, 2479326 - 2479385
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatct-gggggagag 142  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  2479326 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctagggggagag 2479385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 28617331 - 28617274
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28617331 aaacacaccaat-attgtttacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagaga 28617274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 164
Target Start/End: Original strand, 49091661 - 49091729
Alignment:
Q  95 aagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||    
T  49091661 aagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagaga-gcaactctccaatccactat 49091729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 1049296 - 1049340
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  1049296 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 1049340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2935557 - 2935513
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  2935557 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 2935513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3036013 - 3035969
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  3036013 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 3035969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 7471980 - 7472024
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  7471980 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 7472024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 9027194 - 9027238
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  9027194 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 9027238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11759416 - 11759372
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  11759416 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 11759372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 13099474 - 13099518
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  13099474 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 13099518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 20299749 - 20299705
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  20299749 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 20299705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 20626327 - 20626283
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  20626327 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 20626283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 20630218 - 20630174
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  20630218 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 20630174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 20642637 - 20642593
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  20642637 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 20642593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22108355 - 22108311
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  22108355 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 22108311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22137366 - 22137322
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  22137366 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 22137322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Original strand, 30843389 - 30843445
Alignment:
Q  255 caatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 311  Q
    ||||||| | |||||| |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  30843389 caatctctccaatgaacaagatactcaatgattttaactcatctaaggtgtttacaa 30843445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 31155911 - 31155955
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  31155911 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 31155955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 38394275 - 38394231
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  38394275 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 38394231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40550115 - 40550071
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  40550115 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 40550071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40552393 - 40552349
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  40552393 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 40552349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 40836743 - 40836787
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  40836743 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 40836787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40946617 - 40946573
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  40946617 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 40946573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 44724868 - 44724824
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  44724868 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 44724824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 48457942 - 48457898
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  48457942 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 48457898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 119)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 28220125 - 28220446
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||    
T  28220125 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaag 28220224  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28220225 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 28220324  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28220325 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcac 28220424  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  28220425 ccaaggtgttttcaatgcttcc 28220446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 3847022 - 3847341
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||||||||||    
T  3847022 ataataacaacacctagatctaatatagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagat 3847121  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3847122 tgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttac 3847221  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    || || ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3847222 aaaaatttagcttaaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 3847321  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3847322 aaggtgtttacaatgtttcc 3847341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 28265457 - 28265774
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28265457 ataataacaacatctagatctaatctagtaatcaaagtaaaaagctcaaaaccacaaccaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagatt 28265555  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28265556 gttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttaca 28265655  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28265656 agaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccca 28265755  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28265756 aggtgtttacaatgtttcc 28265774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 28223320 - 28223641
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||    
T  28223320 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcaaaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaag 28223419  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28223420 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 28223519  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28223520 acaagaaattagcttcaacaagttcagaaagatcaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 28223619  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||| | ||||||||||    
T  28223620 ccaaggtgtcttcaatgtttcc 28223641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 50167078 - 50167395
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  50167078 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagttcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagatt 50167176  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  50167177 gttgacctagttcggtccaacttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttaca 50167276  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50167277 agaaattagctttgacaagctcacaaataacaaccctaatttctactaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccca 50167376  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  50167377 aggtgtttacaatgtttcc 50167395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 834070 - 834387
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagca-aaacacaccaaagattg 101  Q
    |||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||||||||||||    
T  834070 aataacaacaccaagatctaatctgggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagattg 834169  T
Q  102 ttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaa 201  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  834170 ttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaa 834269  T
Q  202 gaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  834270 gaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcacgcacccaa 834369  T
Q  301 ggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  834370 ggtgtttacaatgtttcc 834387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 50169113 - 50169430
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  50169113 ataataacaacacctatatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagatt 50169211  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||    
T  50169212 gttgatccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagtacttacaaagagatacaaatgagttaca 50169311  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50169312 agaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccca 50169411  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  50169412 aggtatttacaatgtttcc 50169430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 40122099 - 40122418
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  40122099 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagatt 40122197  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccac--tatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtta 198  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  40122198 gttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgagtta 40122297  T
Q  199 caagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  40122298 taagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttcgacccatttttccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgatttttactcacc 40122397  T
Q  298 caaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40122398 caaggtgtttacaatgtttcc 40122418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 196808 - 197128
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagaga-agcaaaacacaccaaagat 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  196808 ataataacaacacctacatctaatctagtaatcaaagtgagaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaaaaaacacaccaaagat 196907  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggg-gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtta 198  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  196908 tgttgatccagttcggtccaacttgacctaatctggggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagtta 197007  T
Q  199 caagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 297  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  197008 caagaaattaacttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 197107  T
Q  298 caaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  197108 caaggtgtttacaatgtttcc 197128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 317
Target Start/End: Original strand, 8550685 - 8551006
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaaga-----gaagcaaaacacaccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||     |||   |||||||||||||    
T  8550685 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcacaagataaagagagaagaagagagaaaacaaacacaccaaag 8550784  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggt 196  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8550785 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagt 8550884  T
Q  197 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactca 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8550885 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactca 8550984  T
Q  296 cccaaggtgtttacaatgtttc 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  8550985 cccaatgtgtttacaatgtttc 8551006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3157132 - 3156814
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||||    
T  3157132 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagat 3157033  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3157032 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 3156933  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  3156932 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-cc 3156834  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  3156833 agggtgtttacaatgtttcc 3156814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31659505 - 31659186
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |||||  | ||| | | |||||||||||||||    
T  31659505 aataacaacaccttgatctaatctaggaatcaaagtaaaaagcacaaaaccataagcaaaagataaaaggagagaaaagaggaataaacacaccaaagat 31659406  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31659405 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatgggttac 31659306  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||  | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31659305 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacagccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 31659206  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31659205 aaggtgtttacaatgtttcc 31659186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 44455427 - 44455108
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagg--gagaagagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||||||||||||    
T  44455427 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccaaaagcaaaagataaaggaagagaagagaggaacaaacacaccaaagat 44455328  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
     ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  44455327 cgttgacccagttcggtcaaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgagttac 44455228  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44455227 aagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatggttttcactcaccc 44455128  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  44455127 aaggtgtttacaatgtttcc 44455108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 13137879 - 13138194
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  13137879 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaacctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacatcaaagatt 13137977  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  13137978 gttgacccagttcggtccaatatgacctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatgcaaatgggttaca 13138077  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaa 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13138078 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaacgacctaatttctatccattttt-caatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaa 13138176  T
Q  301 ggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13138177 ggtgtttacaatgtttcc 13138194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 10925489 - 10925171
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||||    
T  10925489 aataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagggaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagataaacaaa-cacatcaaagattgt 10925391  T
Q  103 tgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt---acaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    ||||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   |||||  |||||||||| |||||    
T  10925390 tgacccagttcgatccaactttacctaatctaggggagagattgatttctccaatccactatcaatgaattcttcttacaaagagatacaaatgagttac 10925291  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10925290 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctatccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 10925191  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10925190 aaggtgtttacaatgtttcc 10925171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 4552547 - 4552856
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||    
T  4552547 ataataacaacacatagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaag-------agaaacaaa-cacaccaaagatt 4552638  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4552639 gttgacccagttcggtccaacttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagggatacaaaggggttaca 4552738  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4552739 agaaattagcttcaacaagctcacaaaggacaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttccctcaccca 4552838  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttc 317  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4552839 aggtgtttacaatgtttc 4552856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 46065182 - 46064868
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||  |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  46065182 ataataacaacacctagatctaatctactaat-aatgtgaaaggctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagatt 46065085  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||    
T  46065084 gtttacccagttcgatccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagatacacatgagttaca 46064985  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| || | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46064984 agaaattagcttcaacgagctcacaaagaacaaacctaatttttatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccca 46064885  T
Q  300 aggtgtttacaatgttt 316  Q
    |||||||||||||||||    
T  46064884 aggtgtttacaatgttt 46064868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 45644257 - 45644573
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  45644257 ataataacaacatctagatctaatctagcaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaaacaaaagataaagagagaagagaaacaag-cacaccaaagatt 45644355  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||    
T  45644356 gttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttgca 45644455  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aac-aaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| | |||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  45644456 agaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctcaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttcactcaccc 45644555  T
Q  299 aaggtgtttacaatgttt 316  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  45644556 aagatgtttacaatgttt 45644573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 317
Target Start/End: Original strand, 13659242 - 13659555
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  13659242 aataacaacacctaaatctaatctaggaatcaaa-tgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaat-acaccaaagattgt 13659339  T
Q  103 tgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  13659340 tgacccagttcggtccaacttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaacaag 13659439  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcac-aaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaag 301  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  13659440 aaattagcttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaag 13659539  T
Q  302 gtgtttacaatgtttc 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  13659540 gtgtttacaatgtttc 13659555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 49918617 - 49918309
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||  ||||| | | |||||||||||||||    
T  49918617 aataacagcacctatatctaatctaggaatcaaaatgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaagat 49918518  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49918517 tgttgacctagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 49918418  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49918417 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 49918318  T
Q  299 aaggtgttt 307  Q
    |||||||||    
T  49918317 aaggtgttt 49918309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 312
Target Start/End: Original strand, 37503458 - 37503768
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||||    
T  37503458 aatatcaacacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccgcaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagat 37503557  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||| | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||    
T  37503558 tgttgacctagttcgatccaacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa---ggttac 37503654  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37503655 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 37503754  T
Q  299 aaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||    
T  37503755 aaggtgtttacaat 37503768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 37559766 - 37560087
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatt-tagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaaggg---agaagagaagca-aaacacaccaaag 97  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||   |||||||| | | |||||||||||||    
T  37559766 aataacagcacctagatctaaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaggggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 37559865  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatct-gggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggt 196  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  37559866 attgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctagggggagagattgatctctccaattcactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggt 37559965  T
Q  197 tacaagaaattagc-ttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactc 294  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||   ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37559966 tacaagaaattagctttcaacaagttcacaaagaacaactctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 37560065  T
Q  295 acccaaggtgtttacaatgttt 316  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  37560066 acctaatgtgtttacaatgttt 37560087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1833778 - 1833470
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| | || |||| |||||||||||||    
T  1833778 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaactacaagcaaaagataaagagagaaaataaacaaa-cacaccaaagatt 1833680  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    |||          |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  1833679 gttt---------ggtccaatttgacctaatctggtggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttaca 1833589  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||| ||||||| || |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1833588 agaatttagcttcaatagattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccca 1833489  T
Q  300 aggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1833488 aggtgtttacaatgtttcc 1833470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3189600 - 3189279
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaa 96  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||    
T  3189600 ataataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaa 3189502  T
Q  97 gattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatggg 195  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |    
T  3189501 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagag 3189402  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactc 294  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||  |||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3189401 ttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactc 3189302  T
Q  295 acccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  3189301 a-ccaaggtgtttacaatgtttcc 3189279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3198417 - 3198096
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaa 96  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||    
T  3198417 ataataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaa 3198319  T
Q  97 gattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatggg 195  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |    
T  3198318 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagag 3198219  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactc 294  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||  |||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3198218 ttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactc 3198119  T
Q  295 acccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  3198118 a-ccaaggtgtttacaatgtttcc 3198096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3207256 - 3206935
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaa 96  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||    
T  3207256 ataataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaa 3207158  T
Q  97 gattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatggg 195  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |    
T  3207157 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagag 3207058  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactc 294  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||  |||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3207057 ttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactc 3206958  T
Q  295 acccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  3206957 a-ccaaggtgtttacaatgtttcc 3206935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41361178 - 41360863
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaa-agattg 101  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| | ||||    
T  41361178 aataacaacacctatatctaatctaggaatcaaagtaaaaagctcaaaaccacaaacaaaagataaagtgagaaaagaaacaaa-cacaccaagatattg 41361080  T
Q  102 ttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaa 201  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41361079 ttgacctagttcggtccaatatgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaa 41360980  T
Q  202 gaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaa 300  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41360979 gaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaat-attttcactcacccaa 41360881  T
Q  301 ggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  41360880 gatgtttacgatgtttcc 41360863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 23555171 - 23555485
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | ||||||  | |||    
T  23555171 aataacaacacctagatctaatttaggaatcatagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaacataaagagagaagagaaacaaa-cgcaccaagaaatgt 23555269  T
Q  103 tgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    | || || |||| |||||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||    
T  23555270 ttactcagttcgatccaacttgacctactatgggg-agagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttataag 23555368  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaag 301  Q
    ||||||| || |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23555369 aaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaaagaataagacactcaataattttcattcacccaag 23555468  T
Q  302 gtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  23555469 gtgtttacaatgtttcc 23555485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 30476345 - 30476668
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaag 97  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| | | |||||||||||||    
T  30476345 ataataacaacacttagacctaatctaataatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagtaaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaag 30476444  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30476445 attgttgacccagttcggtccaacttaacctcatatggggtagagattgatctgtccaatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 30476544  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaa---tgaataagacactcaatgattttcact 293  Q
    |||| |||||| ||| |||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| |||| ||||||||||||||||     
T  30476545 acaataaattatcttcaacaagttcataaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatattgaacaaga-actcaatgattttcacc 30476643  T
Q  294 cacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30476644 cacccaaggtgtttacaatgtttcc 30476668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 86 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19754676 - 19754442
Alignment:
Q  86 aacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatgga 185  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19754676 aacacaccaaaaattgttgacccacttcggtccaacttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaga 19754577  T
Q  186 tacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttc-caatctcacaaatgaataagacactcaat 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  19754576 tacaaatcggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccaatgaacaagacactc-at 19754478  T
Q  284 gattttcactcacccaaggtgtttac-aatgtttcc 318  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  19754477 gattttcactctctcaaggtgtttacgaatgtttcc 19754442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16455886 - 16455585
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||  | |    
T  16455886 ataataacaacatatagatctaatctggtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagtaaaagataaagagagaagagaaacaaat-acaccaagaaat 16455788  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||| || || || |||||||  ||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  16455787 gtttacacagtttggtccaatttgaccgactatgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacacagagatacaaatgggttaca 16455688  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaa 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | || |||  ||||||||  | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455687 agaaattagcttcaacaagctcactagaaaaaatctaatttctcaccattttaccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaa 16455588  T
Q  301 ggt 303  Q
    |||    
T  16455587 ggt 16455585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Original strand, 13547090 - 13547302
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13547090 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 13547189  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13547190 aagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 13547288  T
Q  299 aaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||    
T  13547289 aaggtgtttacaat 13547302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15820567 - 15820255
Alignment:
Q  6 aacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttga 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |  | || |||||||||  ||||| | |||||||||| |||| ||||||||  | |||| |    
T  15820567 aacaacacctagatctaatataggaatcaaatagaaaagctcataaacacaagcaatggataaggagagaagagaaacaaa-cacaccaataaatgttta 15820469  T
Q  106 cccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaa 205  Q
    || | |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||    
T  15820468 cctagttcgatccaacttgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaatgtgttacaagaaa 15820369  T
Q  206 ttagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtg 304  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15820368 ttagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttttacccatctttccaatatcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtg 15820269  T
Q  305 tttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||    
T  15820268 tttacaatgtttcc 15820255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 111 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 11348854 - 11348653
Alignment:
Q  111 ttcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagc 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  11348854 ttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttagaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 11348755  T
Q  211 ttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 309  Q
    || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11348754 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttac 11348656  T
Q  310 aat 312  Q
    |||    
T  11348655 aat 11348653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 37168465 - 37168252
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatac-aaatgggtta 198  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  37168465 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtta 37168366  T
Q  199 caagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |     
T  37168365 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctct 37168267  T
Q  298 caaggtgtttacaat 312  Q
    |||||||||||||||    
T  37168266 caaggtgtttacaat 37168252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Original strand, 47255340 - 47255553
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtta 198  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  47255340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 47255439  T
Q  199 caagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 297  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  47255440 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 47255538  T
Q  298 caaggtgtttacaat 312  Q
    |||||  ||||||||    
T  47255539 caaggcatttacaat 47255553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Original strand, 13549001 - 13549213
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13549001 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 13549100  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    | |||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13549101 atgaaattaggtttaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 13549199  T
Q  299 aaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||    
T  13549200 aaggtgtttacaat 13549213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20762908 - 20762620
Alignment:
Q  35 aagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaa-catgaccta 129  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||||||| | ||| | |||||||||| | |||||||    
T  20762908 aagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaagattggtcacctagttcggtccaaacttgaccta 20762810  T
Q  130 atctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-a 228  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |    
T  20762809 ctctgtaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaga 20762710  T
Q  229 acaaacataatttctacctatttttc-caatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||| | |||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20762709 acaaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaatgtttcc 20762620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 312
Target Start/End: Original strand, 42297971 - 42298188
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaac-atgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgg 194  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  42297971 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 42298070  T
Q  195 gttacaagaaattagcttaaacaagctcac-aaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcact 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  42298071 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttttact 42298169  T
Q  294 cacccaaggtgtttacaat 312  Q
    | |||||||||||||||||    
T  42298170 ctcccaaggtgtttacaat 42298188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 111 - 311
Target Start/End: Original strand, 31925719 - 31925919
Alignment:
Q  111 ttcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagc 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31925719 ttcggtccaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 31925818  T
Q  211 ttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 309  Q
    || |||||||||||||  ||||  | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31925819 ttcaacaagctcacaatgaacatccctaatttctacccatttttccactctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttac 31925917  T
Q  310 aa 311  Q
    ||    
T  31925918 aa 31925919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 89 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19752864 - 19752643
Alignment:
Q  89 acaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatac 188  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  19752864 acacaaaagattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatcaatgagttcttacaaagagatac 19752765  T
Q  189 aaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttc-caatctcacaaatgaataagacactcaatgat 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  19752764 aaatcggttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaacaaccctaatttctacccattttactcaatctcaccaatgaacaagacactc-atgat 19752666  T
Q  287 tttcactcacccaaggtgtttac 309  Q
    |||||||| | ||||||||||||    
T  19752665 tttcactctctcaaggtgtttac 19752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 111 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29136404 - 29136202
Alignment:
Q  111 ttcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattag 209  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||    
T  29136404 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatcaatgagttcttacaaagaaatacaaatgggttccaagaaattag 29136305  T
Q  210 cttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 308  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29136304 cttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgttta 29136206  T
Q  309 caat 312  Q
    ||||    
T  29136205 caat 29136202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 47115340 - 47115126
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatac-aaatgggtt 197  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  47115340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaaatgggtt 47115241  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  47115240 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 47115142  T
Q  297 ccaaggtgtttacaat 312  Q
    ||||| ||||||||||    
T  47115141 ccaagatgtttacaat 47115126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 311
Target Start/End: Original strand, 927883 - 928190
Alignment:
Q  6 aacaacacctagatctaatttag-taatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttg 104  Q
    ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||  | ||||     
T  927883 aacaaaacttagatctaatatagataatcaaagtgaaaagttcaaaaccacaaacaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacacaaagaaatgttt 927981  T
Q  105 acccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaa 204  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||   ||||| |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||    
T  927982 acccagttcggtctaacttgacctaccttggggaagaggttggtctctctaatccactattaatgagtttttacaaagagatccaaaagggttacaagaa 928081  T
Q  205 attagcttaaacaagctcacaaa-aacaaa-cataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaagg 302  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||| |  |||||||||| |||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  928082 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctatcattttttccaatatcaccaaagaacaagacactcattgattttcactcacccaagg 928181  T
Q  303 tgtttacaa 311  Q
    |||||||||    
T  928182 tgtttacaa 928190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 111 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34603733 - 34603530
Alignment:
Q  111 ttcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggat-acaaatgggttacaagaaattag 209  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||    
T  34603733 ttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatgggttacaagaaattag 34603634  T
Q  210 cttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||  |||||||||||||    
T  34603633 cttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactttcccaaggtgttta 34603534  T
Q  309 caat 312  Q
    ||||    
T  34603533 caat 34603530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 312
Target Start/End: Original strand, 37033068 - 37033286
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaac-atgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatac-aaatg 193  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||    
T  37033068 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatgcaaaatg 37033167  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcac 292  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  37033168 gattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcac 37033266  T
Q  293 tcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    || |||||||||||||||||    
T  37033267 tctcccaaggtgtttacaat 37033286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 263
Target Start/End: Original strand, 13316253 - 13316517
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||    |||||| | |||| ||| |||||    
T  13316253 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaaca-caaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaactcactaaaga 13316350  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtcc-aacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  13316351 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtt 13316450  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcac 263  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  13316451 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcac 13316517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 111 - 312
Target Start/End: Original strand, 7482242 - 7482445
Alignment:
Q  111 ttcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatac-aaatgggttacaagaaattag 209  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7482242 ttcggtccaacttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattag 7482341  T
Q  210 cttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| || |||||||   |||||||||  |||||||||||||    
T  7482342 cttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaatgaacaatacactcatgaattttcactttcccaaggtgttta 7482441  T
Q  309 caat 312  Q
    ||||    
T  7482442 caat 7482445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 193778 - 193566
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  193778 tgttcacccagttcggtccaacttgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagttac 193679  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | |||    
T  193678 aagaaattagcttcaacaagctaataaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcaccctccc 193580  T
Q  299 aaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||    
T  193579 aaggtgtttacaat 193566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 51765666 - 51765343
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagaga-agcaaaaca----caccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||| |  | || ||||||    ||||||||    
T  51765666 aataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaag 51765568  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatg-gatac-aaatgg 194  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||    
T  51765567 attgttcacccagttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggg 51765468  T
Q  195 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa--aacaaacataatttcta-cctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttca 291  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||   |||| | ||||||||| ||| || | ||||||  || || ||| ||||||||||||||||| ||    
T  51765467 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatcaaaccaa-gaacaagacactcaatgatttaca 51765369  T
Q  292 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  51765368 ctca-ccaaggtgtttacaatgtttcc 51765343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 122 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22079462 - 22079322
Alignment:
Q  122 atgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagc 220  Q
    |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22079462 atgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatcaatgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagc 22079363  T
Q  221 tcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctc 261  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22079362 tcacaaagaacaaacataatttctacc-atttttccaatctc 22079322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 36683892 - 36683694
Alignment:
Q  54 acaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaa-agattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctct 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||| |||| ||| || || ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  36683892 acaagcaaaagataaagagagaagacaaacaaa-cacaccaagagat-gtttactcagttcggtctaacttgacctactctgggggagagattgatttct 36683795  T
Q  153 ccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctattt 251  Q
     ||||||||||||||||||||||||||          |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  36683794 acaatccactatcaatgagttcttaca----------aatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaataaacctaatttctacctattt 36683705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 312
Target Start/End: Original strand, 37879006 - 37879124
Alignment:
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcac 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  37879006 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcac 37879104  T
Q  293 tcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    || |||||||||||||||||    
T  37879105 tctcccaaggtgtttacaat 37879124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 311
Target Start/End: Original strand, 44650101 - 44650376
Alignment:
Q  34 aaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatct 133  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    ||||||| |||| | ||||||| | | || ||| | ||||||||||  ||||||| | |    
T  44650101 aaagtgaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaaga---aagagaaacaaa-cgcaccaaaaaatatttacctagttcggtccaaattgacctacttt 44650196  T
Q  134 gggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aaca 231  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||  |||| ||| |  |||||| |||||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  44650197 tgggaagagattgatctcttcaatccactattaatgaattatttacaaagagatataaaagatttacaataaattagcgttaacaaactcacaaagaaca 44650296  T
Q  232 aac-ataatttctacctatttttc-caatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 311  Q
    ||| ||||||| |||  ||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44650297 aaccataatttttac--atttttctcaatctctccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaagtgtttacaa 44650376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 308
Target Start/End: Original strand, 37282597 - 37282901
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaa-gataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattg 101  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||  |||||||||  ||||||||||| |||| || |||  |||||||||| |||| | ||||||| | ||    
T  37282597 aataacaa-acctagatctaatctagaaatcag-gtgaaaaacgcaaaaccacaagaaaaaagagaaatagagaagagaaacaaa-cgcaccaaaaaatg 37282693  T
Q  102 ttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    || | | | ||| ||||||  ||||||| ||    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||  ||| |||| |||||||     
T  37282694 tttatctagttcagtccaaattgacctactccaaaggagagatttatctctccaatccactactaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttacc 37282793  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaaca-taatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    | |||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||| |||| ||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||  |    
T  37282794 ataaattagcttcaacaagctcacaaggaacaaaccctaatttatacc-atttttc-aatctctccaatgaacaagacactcaatggttttcactcatac 37282891  T
Q  299 aaggtgttta 308  Q
    ||||||||||    
T  37282892 aaggtgttta 37282901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9987387 - 9987205
Alignment:
Q  83 caaaacacaccaa-agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 179  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  9987387 caaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttgcaa 9987288  T
Q  180 aatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcac 263  Q
    || |||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||| | |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  9987287 aagggatacaaa-aggttgcaagaaattagattagacaagttcacaatgaacaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac 9987205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40282549 - 40282418
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatggatacaaatg 193  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||      
T  40282549 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 40282451  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa 226  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  40282450 ggttacaagaaattagattagacaagttcacaa 40282418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 311
Target Start/End: Original strand, 8871071 - 8871259
Alignment:
Q  108 caattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaatt 207  Q
    |||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||             |||||  ||||||||||||||    
T  8871071 caattcggtccaacttggcctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-gagtt-------------acaaaatggttacaagaaatt 8871156  T
Q  208 agcttaaacaagctcacaaa-aacaaa-cataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 305  Q
    ||||| ||| | |||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  8871157 agcttcaacgaactcacaaagaacaaaccctaatttctacc-attttccaaatctcacaaaagaacaagacact--atgattttcgctcatccaaggtgt 8871253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 2262895 - 2263100
Alignment:
Q  18 atctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtc 117  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||  ||| |||||| |||||| ||||| ||||||| || |||| || |||||  | |||| || || ||||| |    
T  2262895 atctaatttaggaatcaa-gtgaaaaacccaaatccacaaacaaaag-taaagagagaagaaaaacaaa-cataccaagaaatgtttactcagttcggac 2262991  T
Q  118 caaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaa 215  Q
    ||||| |||||||  ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  2262992 caacaatgacctaccctaagggaaagattgatctcttcaatccactatcaataagttctttacaaaaagatataaaagggttacaagaaattatcttcaa 2263091  T
Q  216 caagctcac 224  Q
    |||||||||    
T  2263092 caagctcac 2263100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28242472 - 28242382
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaa 190  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  28242472 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaa 28242382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6808595 - 6808497
Alignment:
Q  125 acctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctc 222  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6808595 acctactctgaggaagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaagttagcttcaacaagctc 6808497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 19072918 - 19072976
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19072918 aaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 19072976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 19120808 - 19120866
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19120808 aaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 19120866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Original strand, 20622233 - 20622403
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac---aaatggatacaaa 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||    
T  20622233 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaaagggatacaaa 20622332  T
Q  192 tgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcac 263  Q
      |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||||| | |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  20622333 -aggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac 20622403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 198
Target Start/End: Original strand, 37876767 - 37876865
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtta 198  Q
    |||| ||||| |||||| |||| |||  || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  37876767 tgttcacccagttcggttcaacttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgggtta 37876865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3460914 - 3460715
Alignment:
Q  48 aaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattga 147  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||  ||  | |||| ||| |||| |||| ||  ||||||| ||| ||  ||| |||||    
T  3460914 aaaaccacaaacaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacattaagaaatgtttacctaatttggtctaaattgacctactctagga-agatattga 3460817  T
Q  148 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaac-ataatttcta 244  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||| |||||   ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  3460816 tctctccaatcgactatcaatatgttctttacaaagatatacaaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttcta 3460717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 163
Target Start/End: Original strand, 775672 - 775739
Alignment:
Q  95 aagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccacta 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  775672 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagt-agctctccaatccacta 775739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9036588 - 9036471
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatggatacaaatg 193  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||      
T  9036588 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 9036490  T
Q  194 ggttacaagaaattagctt 212  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9036489 ggttacaagaaattagctt 9036471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 37069759 - 37069838
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  37069759 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccgatccactat 37069838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 47704043 - 47703965
Alignment:
Q  84 aaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  47704043 aaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 47703965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26645005 - 26644946
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26645005 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 26644946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 13598389 - 13598446
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13598389 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 13598446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 2926689 - 2926488
Alignment:
Q  89 acaccaaaga-ttgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatgga 185  Q
    |||||||||| ||||| ||| | |||||| ||||| ||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||  ||    
T  2926689 acaccaaagaattgtttacctagttcggtgcaacaatgacctactctgcagaagagattgatctctccaatccactaccaatgaattcgtttcaaagaga 2926590  T
Q  186 tacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctc-acaaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatg 284  Q
    | ||||  |||||||| |||||| ||| |||||| ||  |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |    || |||||||||||||||     
T  2926589 tgcaaaaaggttacaataaattaactttaacaagttcttcaagcacaaacctaatttctacc-atttttccaatccc----ataaataagacactcaata 2926495  T
Q  285 attttca 291  Q
    |||||||    
T  2926494 attttca 2926488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5460125 - 5459997
Alignment:
Q  48 aaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||  | |||| ||| | ||| | |||||| ||| ||| ||| |  |||||||||    
T  5460125 aaaaccacaagcaaaagataaagagagaatagaaacaaa-cacaacaagaaatgtttacctagttcagcccaacaatgatctactctagatgagagattg 5460027  T
Q  147 atctctccaatccactatcaatgagttctt 176  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5460026 atctctccaatctactatcaatgagttctt 5459997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 219
Target Start/End: Original strand, 9109459 - 9109540
Alignment:
Q  139 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaag 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9109459 agagattgatctctccaatacactatcaacgtgttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattaacttcaacaag 9109540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21054130 - 21053999
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatggatacaaatg 193  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||      
T  21054130 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 21054032  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa 226  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  21054031 ggttgcaagaaattagatttgacaagttcacaa 21053999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 44203804 - 44203685
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaatggatacaaa 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||    
T  44203804 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 44203706  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  44203705 gaggttacaagaaattagctt 44203685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 9476252 - 9476329
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||||    
T  9476252 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagaga-gcagctctccaatccactat 9476329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 70
Target Start/End: Original strand, 8870637 - 8870695
Alignment:
Q  12 acctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaag 70  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8870637 acctagatcaaatctaggaatcaaagtgaaaaatacaaaaccacaagcaaaagataaag 8870695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13938282 - 13938195
Alignment:
Q  122 atgaccta-atctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaatggatac-aaatgggttacaagaaatta 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||    
T  13938282 atgacctacatctgggggagaga--gatctctccaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaaaaggttacaagaaatta 13938195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16124622 - 16124565
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16124622 aaacacaccaa-gattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 16124565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 29651802 - 29651859
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29651802 aaacacaccaa-gatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 29651859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 47098930 - 47098873
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  47098930 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagaga 47098873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 47102947 - 47102890
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  47102947 aaacacaccaaa-attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagaga 47102890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 143
Target Start/End: Original strand, 3281707 - 3281756
Alignment:
Q  94 aaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3281707 aaagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 3281756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 21536677 - 21536598
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  21536677 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 21536598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 27104478 - 27104401
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  27104478 aaacacaccaa-gattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 27104401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 311
Target Start/End: Original strand, 44646881 - 44646997
Alignment:
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaac-ataatttctacctatttttc-caatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcac 292  Q
    |||||| |||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||  ||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  44646881 ttacaataaattagcgttaacaaactcacaaagaacaaaccataatttttac--atttttctcaatctctccaatgaacaagacactcaataattttcac 44646978  T
Q  293 tcacccaaggtgtttacaa 311  Q
    ||| |||| || |||||||    
T  44646979 tcatccaaagtatttacaa 44646997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 12302507 - 12302551
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12302507 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagaga 12302551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13604731 - 13604652
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| |||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  13604731 aaacacaccaaaagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 13604652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16429237 - 16429193
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  16429237 ttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 16429193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 251
Target Start/End: Original strand, 16914234 - 16914329
Alignment:
Q  159 cactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaa-ttagcttaaacaagctc-acaaaaacaaacataatttctacctattt 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  16914234 cactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttagaagaaacttagcttcaacaggctctccaagaacaaacataatttttacccattt 16914329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25652195 - 25652040
Alignment:
Q  159 cactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttcca 256  Q
    ||||||||| |||||||| |||||  |||||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| || ||||||||||| |||| || |    
T  25652195 cactatcaaagagttctttacaaagagatacaagagagttacaagaaattagcttcaacaaactctcaaataacacacttaatttctaccaatttctcaa 25652096  T
Q  257 atctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
       |  |  ||||| || | |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  25652095 tattttctcatgaacaaaatactcaatgattttcacacacttaaggtgtttacaat 25652040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 777225 - 777191
Alignment:
Q  284 gattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  777225 gattttcactcacccaaagtgtttacaatgtttcc 777191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35109556 - 35109494
Alignment:
Q  184 gatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaa-cataatttctacc 246  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  35109556 gatacaaataggttacaagaaattagcttaa--aagctcacaaagaacaaaccttaatttctacc 35109494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 2510327 - 2510371
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  2510327 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 2510371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6823293 - 6823249
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  6823293 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 6823249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 9459419 - 9459463
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  9459419 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 9459463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 9463246 - 9463290
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  9463246 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 9463290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 10399830 - 10399874
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  10399830 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 10399874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13358852 - 13358808
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  13358852 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 13358808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 15294836 - 15294880
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  15294836 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 15294880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16226446 - 16226402
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  16226446 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 16226402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 17186129 - 17186173
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  17186129 ttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 17186173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 17324638 - 17324682
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  17324638 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 17324682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 19361539 - 19361461
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  19361539 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcagtc-aatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 19361461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 19380179 - 19380101
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  19380179 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcagtc-aatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 19380101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23786118 - 23786074
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  23786118 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 23786074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 27336942 - 27336986
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  27336942 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 27336986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 28207070 - 28207114
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  28207070 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 28207114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28242383 - 28242343
Alignment:
Q  272 aagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  28242383 aagacactcaagaattttcactctcccaaggtgtttacaat 28242343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 28840958 - 28840914
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  28840958 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 28840914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 28998255 - 28998299
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  28998255 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 28998299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 29003971 - 29004015
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  29003971 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 29004015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 31735523 - 31735567
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  31735523 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 31735567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39462798 - 39462754
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  39462798 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 39462754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 50307548 - 50307592
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  50307548 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 50307592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 51750318 - 51750274
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  51750318 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 51750274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 51752642 - 51752598
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  51752642 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 51752598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 73)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 9182932 - 9183251
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||||    
T  9182932 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaagat 9183031  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9183032 tgttgacccagttcggtccaacttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 9183131  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9183132 aagaaattagcttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 9183231  T
Q  299 aaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9183232 aaggtgtttacaatgtttcc 9183251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 28137311 - 28137628
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaag-caaaacacaccaaagattg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||  | ||    
T  28137311 aataacaacacatagatctaatataggaatcaaagtgaaaagcacataaccacaagcaaaagataaagggagaagataaaacaaaacataccaagaaatg 28137410  T
Q  102 ttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaa 201  Q
    || || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  28137411 ttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaatgggttacaa 28137510  T
Q  202 gaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28137511 gaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaa 28137610  T
Q  301 ggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28137611 ggtgtttacaatgtttcc 28137628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 33211090 - 33211405
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  33211090 aataataacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaatcacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cataccaaagattgt 33211188  T
Q  103 tgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||    
T  33211189 tgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaatgagctacaag 33211288  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaag 301  Q
    |||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  33211289 aaattaacttcatcaagctcacaaagaacaaccataatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttcagtgacccaag 33211388  T
Q  302 gtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  33211389 gtgtttacaatgtttcc 33211405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 26954191 - 26954505
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  26954191 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagaaaaatgtaaagagagaagagaaacaaagt-caccaaagattgt 26954289  T
Q  103 tgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  26954290 tgacctagttcggtccaacttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacagatgagttacaag 26954389  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaag 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| |||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  26954390 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttatacc-aatttcccaatctcacatatgaacaagacactcaatgattttcactccccaaag 26954488  T
Q  302 gtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  26954489 gtgtttacaatgtttcc 26954505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 318
Target Start/End: Original strand, 5406109 - 5406418
Alignment:
Q  11 cacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaagattgttgac 106  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  5406109 cacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaaacaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaagattgttcac 5406206  T
Q  107 ccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaa 205  Q
    ||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  5406207 ccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaa 5406306  T
Q  206 ttagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtg 304  Q
    |||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5406307 ttagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtg 5406404  T
Q  305 tttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||    
T  5406405 tttacaatgtttcc 5406418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 318
Target Start/End: Original strand, 5410434 - 5410743
Alignment:
Q  11 cacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaagattgttgac 106  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  5410434 cacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaaacaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaagattgttcac 5410531  T
Q  107 ccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaa 205  Q
    ||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  5410532 ccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaa 5410631  T
Q  206 ttagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtg 304  Q
    |||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5410632 ttagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtg 5410729  T
Q  305 tttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||    
T  5410730 tttacaatgtttcc 5410743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 5413296 - 5413612
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||||    
T  5413296 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaaga 5413393  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||| | |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  5413394 ttgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 5413492  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||  ||||| || |||| ||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  5413493 acaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttctacct-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 5413590  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  5413591 ccaatgtgtttacaatgtttcc 5413612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 31404576 - 31404891
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||||    
T  31404576 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagaggaaagcacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaaga 31404673  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  31404674 ttgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 31404773  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  31404774 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc-attttcccaatctcactgatgaacaagacactcaatgattttcactca- 31404871  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgttt 316  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31404872 ccaaggtgtttacaatgttt 31404891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 318
Target Start/End: Original strand, 33160253 - 33160573
Alignment:
Q  5 taacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaa---gggagaagagaagca-aaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||   | |||||||||   | ||||||||||||||||    
T  33160253 taacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagatt 33160352  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    ||| ||||| || ||||||| | |||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||    
T  33160353 gttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttac 33160452  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctattttt-ccaatctcacaaatgaataagacactcaatga-ttttcactcac 296  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||   |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  33160453 aagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgatttttcactca- 33160551  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33160552 ccaaggtgtttacaatgtttcc 33160573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16569279 - 16568991
Alignment:
Q  11 cacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagca-aaacacaccaaagattgttgaccca 109  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  16569279 cacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttgaccca 16569180  T
Q  110 attcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattag 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||    
T  16569179 gttcggtccaacttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa------------ggttacaagaaattag 16569092  T
Q  210 cttaaacaagctcacaaa-aac-aaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 307  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16569091 cttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatctc----------aagacactcaatgattttcacttacccaaggtgttt 16569002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 3038826 - 3039123
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  3038826 ataataacaacacctagatctaatatagtaatcaaagtgaaaagttcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaaaagaaacaaa-cacaccaaagatt 3038924  T
Q  101 gttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttaca 200  Q
    ||||||                    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3038925 gttgac--------------------ctaatctgggggagagattaatctctccaatccactattaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttaca 3039004  T
Q  201 agaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccca 299  Q
    |||||||||||| || ||||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  3039005 agaaattagcttcaaaaagctcacaatgaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcactcactca 3039104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21593831 - 21593619
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21593831 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 21593732  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  21593731 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 21593633  T
Q  299 aaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||    
T  21593632 aaggtgtttacaat 21593619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 317
Target Start/End: Original strand, 30834435 - 30834755
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacata-aaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||   | ||||||||||||||    
T  30834435 aataacagcacctagatctaatctatgaatcaaagtgaaaaaaacacaaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagataaacaaacacaccaaaga 30834534  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    || || ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  30834535 ttattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtt 30834634  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttcta-cctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactca 295  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30834635 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 30834734  T
Q  296 cccaaggtgtttacaatgtttc 317  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  30834735 -ccgaggtgtttacaatgtttc 30834755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 2171428 - 2171750
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaa---cataaaaccacaagcaaaagataaaggg---agaagagaagca-aaacacaccaa 95  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||| ||   ||||||||   | ||| |||||||    
T  2171428 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaaaaacataaaac-acaagcacaagataaaagggagagaagagataaacaaatacaccaa 2171526  T
Q  96 -agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatg 193  Q
     |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  2171527 gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-g 2171625  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcac 292  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2171626 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 2171725  T
Q  293 tcacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2171726 tca-ccaaggtgtttacaatgtttcc 2171750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 317
Target Start/End: Original strand, 16452229 - 16452548
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaag-ataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaag 97  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||  ||||| |||||    |||||| |||| ||||||||||    
T  16452229 aataacatcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcaaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaag 16452326  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggt 196  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  || ||||    
T  16452327 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatatgaaagggt 16452426  T
Q  197 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttcta-cctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactc 294  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16452427 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 16452526  T
Q  295 acccaaggtgtttacaatgtttc 317  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  16452527 a-ccaaggtgtttacaatgtttc 16452548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 111 - 312
Target Start/End: Original strand, 2972951 - 2973152
Alignment:
Q  111 ttcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagc 210  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2972951 ttcggtcgaacttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 2973050  T
Q  211 ttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 309  Q
    || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2973051 ttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacacgacact-tatgattttcactctcccaaggtgtttac 2973149  T
Q  310 aat 312  Q
    |||    
T  2973150 aat 2973152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 96 - 312
Target Start/End: Original strand, 3808704 - 3808922
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatac-aaatg 193  Q
    |||||||| ||| | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  3808704 agattgttcacctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatg 3808803  T
Q  194 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcac 292  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||    
T  3808804 ggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacact-tgtgattttcac 3808902  T
Q  293 tcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    || |||||||||||||||||    
T  3808903 tctcccaaggtgtttacaat 3808922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 21589098 - 21588916
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21589098 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 21588999  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactca 281  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21588998 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca 21588916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5043795 - 5043582
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtta 198  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  5043795 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 5043696  T
Q  199 caagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 297  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |     
T  5043695 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactcattttctcaatctcacgaatgaacaagacactc-atgattttcactctca 5043597  T
Q  298 caaggtgtttacaat 312  Q
    |||||||||||||||    
T  5043596 caaggtgtttacaat 5043582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Original strand, 26830124 - 26830337
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||| ||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  26830124 tgttcacccagttcagtcaaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatggattac 26830223  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctca-caaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 297  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  26830224 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccatttttccaatctcacccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 26830322  T
Q  298 caaggtgtttacaat 312  Q
    |||||||||||||||    
T  26830323 caaggtgtttacaat 26830337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 96 - 312
Target Start/End: Original strand, 603085 - 603293
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatggg 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  603085 agattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatggg 603184  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaa-acataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcact 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||        |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  603185 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacaca-aatttctac--------ccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcact 603274  T
Q  294 cacccaaggtgtttacaat 312  Q
      |||||||||||||||||    
T  603275 atcccaaggtgtttacaat 603293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Original strand, 22424826 - 22425041
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaa--tgggt 196  Q
    |||| ||||| | |||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  |||||    
T  22424826 tgttcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaaatgggt 22424924  T
Q  197 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactca 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||   ||||||||||     
T  22424925 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaacgaacaagacactcatgaattttcactct 22425024  T
Q  296 cccaaggtgtttacaat 312  Q
    ||||| |||||||||||    
T  22425025 cccaaagtgtttacaat 22425041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 140 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17758150 - 17757995
Alignment:
Q  140 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataa 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||    
T  17758150 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaa 17758051  T
Q  239 tttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactc 294  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  17758050 tttctacccattttcccaatctcacaaatgaagaagacactcatgaattttcactc 17757995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 111 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17763147 - 17762944
Alignment:
Q  111 ttcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattag 209  Q
    |||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  17763147 ttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatcaatgagttcttccaaaaagatacaaatgagttacaagaaattag 17763048  T
Q  210 cttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 308  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||| | ||| |||||||    
T  17763047 cttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctctcaaagtgttta 17762948  T
Q  309 caat 312  Q
    ||||    
T  17762947 caat 17762944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 5408971 - 5409167
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||||    
T  5408971 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaa-cacaccaaaga 5409068  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||| | |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  5409069 ttgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 5409167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4045671 - 4045378
Alignment:
Q  12 acctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaat 111  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| |||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  | || | ||| | |    
T  4045671 acctagatctaatctaagaatcaa-gtgaaaaaaacaaaaccacgagtaaaagataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaagaaatgcttacctagt 4045574  T
Q  112 tcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagc 210  Q
    ||||||||      |||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| |||  | |||||||||||||||    
T  4045573 tcggtcca------cctactttggggtagaaattgatctctccaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaatgattacaagaaattagc 4045480  T
Q  211 ttaaacaagctcacaaa-aacaaaca-taatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 308  Q
    || |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4045479 ttcaacaagctcataaagaacaaaccctaatttctacc-attttcccaatctctccaataaacaagacactcaatgattttcactcaccctaggtgttta 4045381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 318
Target Start/End: Original strand, 6097447 - 6097652
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgg 194  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||          |||||| |     
T  6097447 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttct----------tacaaaaga 6097536  T
Q  195 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcact 293  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||        || |||||||||||||||||||    
T  6097537 gttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaatcctaatttctacc-atttttccaatctcac-------caaaacactcaatgattttcact 6097628  T
Q  294 cacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    || ||||||||||||| ||||||||    
T  6097629 ca-ccaaggtgtttaccatgtttcc 6097652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26800744 - 26800630
Alignment:
Q  111 ttcggtccaaca-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatac-aaatgggttacaagaaatta 208  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  26800744 ttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaattagttacaagaaatta 26800646  T
Q  209 gcttaaacaagctcac 224  Q
    |||| |||||||||||    
T  26800645 gcttcaacaagctcac 26800630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Original strand, 3072755 - 3072925
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatg-gatac-aaat 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||     
T  3072755 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaa 3072854  T
Q  193 gggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcac 263  Q
    | ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3072855 gagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctacc-attttcccaatctcac 3072925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 412274 - 412104
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatg-gatac-aaat 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||     
T  412274 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaa 412175  T
Q  193 gggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcac 263  Q
    | ||||||||||||||| ||  | ||| ||||||  ||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  412174 gagttacaagaaattagatttgataagttcacaatgaacaaccctaatttctacct-ttttcccaatctcac 412104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 199 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16567265 - 16567154
Alignment:
Q  199 caagaaattagcttaaacaagctcacaaaaac--aaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| | ||||| |||||||||          ||||||||||||||||||||||||    
T  16567265 caagaaattagcttaaacaagctcacaaaaaacaaaacctaatttctaaccattttcccaatctca----------agacactcaatgattttcactcac 16567176  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16567175 ccaaggtgtttacaatgtttcc 16567154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25073698 - 25073528
Alignment:
Q  138 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcac-aaaaacaaaca 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| || || |||      
T  25073698 gagagattgatttctctaatccactatcaatgagttctttacatagagatacaaaagggttacaataaaatagctttaacaagctcacgaagaataaatc 25073599  T
Q  236 taatttctacctatttttccaatct-cacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 307  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| | |  ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25073598 taatttctacc-attttttcaatctcctcccatgaacaagatactcaatga-tttcactcacccaagatgttt 25073528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 14521580 - 14521722
Alignment:
Q  1 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaa-agat 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||   ||||||||||| | |     
T  14521580 ataacaacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcataagataaagtgagaaaagaa-ataaacacaccaagaaaa 14521678  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  14521679 tgttgacctagttcggtccaatatgacctactctcgaggagaga 14521722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 16578514 - 16578632
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaatggatacaaat 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||     
T  16578514 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa- 16578612  T
Q  193 gggttacaagaaattagctt 212  Q
     |||||||||||||||||||    
T  16578613 aggttacaagaaattagctt 16578632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16616866 - 16616748
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaatggatacaaat 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||     
T  16616866 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa- 16616768  T
Q  193 gggttacaagaaattagctt 212  Q
     |||||||||||||||||||    
T  16616767 aggttacaagaaattagctt 16616748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16653284 - 16653166
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaatggatacaaat 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||     
T  16653284 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa- 16653186  T
Q  193 gggttacaagaaattagctt 212  Q
     |||||||||||||||||||    
T  16653185 aggttacaagaaattagctt 16653166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10077271 - 10077214
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10077271 aaacacaccaa-gattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 10077214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27648032 - 27647915
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatggatacaaatg 193  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||      
T  27648032 agattgttcacccagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 27647934  T
Q  194 ggttacaagaaattagctt 212  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27647933 ggttacaagaaattagctt 27647915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 5757586 - 5757507
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  5757586 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 5757507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16555041 - 16554923
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaatggatacaaat 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||     
T  16555041 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa- 16554943  T
Q  193 gggttacaagaaattagctt 212  Q
     |||||||||||||||||||    
T  16554942 aggttacaagaaattagctt 16554923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16631597 - 16631479
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaatggatacaaat 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||     
T  16631597 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa- 16631499  T
Q  193 gggttacaagaaattagctt 212  Q
     |||||||||||||||||||    
T  16631498 aggttacaagaaattagctt 16631479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5572347 - 5572290
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  5572347 aaacacaccaa-gattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagaga 5572290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 21356025 - 21356104
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  21356025 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagaga-gcagctctccaatccactat 21356104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25421478 - 25421359
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaatggatacaaa 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||    
T  25421478 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 25421380  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  25421379 gaggttacaagaaattagctt 25421359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 18232836 - 18232893
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18232836 aaacacaccaa-gattgttgactcaaatcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 18232893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 31979504 - 31979561
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31979504 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagaga 31979561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6027419 - 6027300
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaatggatacaaa 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | |||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||    
T  6027419 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 6027321  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  6027320 gaggttacaagaaattagctt 6027300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5017575 - 5017518
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  5017575 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagaga 5017518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 2628886 - 2628930
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  2628886 ttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 2628930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13154087 - 13153968
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatgg-atacaaa 191  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||    
T  13154087 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 13153989  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  13153988 gaggttacaagaaattagctt 13153968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 33342101 - 33342220
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatgga-tacaaa 191  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| ||    
T  33342101 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggagtac-aa 33342199  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  33342200 gaggttacaagaaattagctt 33342220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34165030 - 34164911
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatgg-atacaaa 191  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||    
T  34165030 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 34164932  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  34164931 gaggttacaagaaattagctt 34164911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 34167252 - 34167180
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 167  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  34167252 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 34167180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31086579 - 31086502
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||| |||||||||   | ||||||||||||||||    
T  31086579 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagaga-gcaactctccaatccactat 31086502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 4629944 - 4630002
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  4629944 aaacacatcaaagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagaga 4630002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9572719 - 9572681
Alignment:
Q  139 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta 177  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9572719 agagattgatctctgcaatccactatcaatgggttctta 9572681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 31936578 - 31936635
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  31936578 aaacacaccaa-gattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagaga 31936635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 1230249 - 1230293
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  1230249 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 1230293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2908586 - 2908550
Alignment:
Q  140 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 176  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2908586 gagattgatttcttcaatccactatcaatgagttctt 2908550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 4816231 - 4816275
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  4816231 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 4816275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 5273216 - 5273260
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  5273216 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 5273260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 11983029 - 11983073
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  11983029 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 11983073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 12195515 - 12195559
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  12195515 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 12195559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 14458767 - 14458811
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  14458767 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 14458811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 14507176 - 14507220
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  14507176 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 14507220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 19704567 - 19704611
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  19704567 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 19704611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 20915356 - 20915400
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  20915356 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 20915400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 22709007 - 22709086
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaaga-ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  22709007 aaacacaccaaaaaattgttgacctagttcggttcaatatgatctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 22709086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 137
Target Start/End: Original strand, 22963691 - 22963742
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggg 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||    
T  22963691 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg 22963742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23824702 - 23824651
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggg 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||    
T  23824702 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg 23824651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 26932562 - 26932606
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  26932562 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 26932606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 29754709 - 29754753
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  29754709 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 29754753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 33309170 - 33309126
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  33309170 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 33309126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 314
Target Start/End: Original strand, 20316 - 20631
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga--agagaagca-aaacacaccaaagat 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||| ||    
T  20316 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaaat 20415  T
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20416 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttac 20515  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcac-aaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20516 aagaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaacctaatttctgctcattttcccaatctcaccaatgaataataaactcaatgattttcactcaccc 20615  T
Q  299 aaggtgtttacaatgt 314  Q
    ||||||||||||||||    
T  20616 aaggtgtttacaatgt 20631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 317
Target Start/End: Original strand, 149003 - 149316
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgt 102  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  149003 aataacaacacctaaatctaatctaggaatcaaa-tgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaat-acaccaaagattgt 149100  T
Q  103 tgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaag 202  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  149101 tgacccagttcggtccaacttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaacaag 149200  T
Q  203 aaattagcttaaacaagctcac-aaaaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaag 301  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  149201 aaattagcttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaag 149300  T
Q  302 gtgtttacaatgtttc 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  149301 gtgtttacaatgtttc 149316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 5674 - 5731
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5674 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 5731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 141
Target Start/End: Original strand, 2483 - 2538
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggaga 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2483 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggaga 2538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 133388 - 133309
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| |||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  133388 aaacacaccaaaagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 133309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 114870 - 114551
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||    |||||| |||  |||||||||||    
T  114870 aataacaacacctatatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaacaacaagaaaaagataaaaggagagaagagagaaacaag-cacaccaaaga 114772  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| | ||| ||||||| || | | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||    
T  114771 ttgttcatccagttcggtctaaacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagcgtt 114672  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcac 296  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  114671 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 114573  T
Q  297 ccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  114572 ccaaggtgtttacaatgtttcc 114551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1183 - 865
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaaga 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||  ||||| |||||    |||||| ||||||||||||||||    
T  1183 aataacaccacctagatctaatctaggtatcaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcaaagtataaaaggagagaagagagaaacaaaacacaccaaaga 1085  T
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggtt 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||    
T  1084 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttgtt-caaagagatacaaaagggtt 986  T
Q  198 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttcta-cctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactca 295  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  985 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcactca 887  T
Q  296 cccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  886 -ccaaggtgtttacaatgtttcc 865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 434801 - 434483
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagat-aaagggaga----agagaagcaaaacacaccaaag 97  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| |||||||| ||||| |||||||||    |||||| | ||||||||||||     
T  434801 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaa-cacaagcacaagataaaagggagagaagagagaaac-aaacacaccaaat 434704  T
Q  98 attgttgacccaattcggtcc-aacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggt 196  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  434703 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggt 434604  T
Q  197 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttcta-cctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactc 294  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  434603 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 434504  T
Q  295 acccaaggtgtttacaatgttt 316  Q
    | ||||||| ||||| ||||||    
T  434503 a-ccaaggtatttaccatgttt 434483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 245
Target Start/End: Original strand, 490359 - 490468
Alignment:
Q  138 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctc-acaaaaacaaaca 235  Q
    |||||| ||||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||   ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||     
T  490359 gagagaatgatctctccgcttcactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaact 490458  T
Q  236 taatttctac 245  Q
    ||||||||||    
T  490459 taatttctac 490468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 7494 - 7282
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7494 tgttcacccagttcggtccaacttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 7395  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  7394 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 7296  T
Q  299 aaggtgtttacaat 312  Q
    ||||||||||||||    
T  7295 aaggtgtttacaat 7282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 96 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11729 - 11506
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgg 194  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  11729 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 11630  T
Q  195 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcact 293  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11629 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 11530  T
Q  294 cacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  11529 ca-ccaaggtgtttacaatgtttcc 11506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 11060 - 11381
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagaga-agcaaaaca----caccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |  | || ||||||    ||||||||    
T  11060 aataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaaacacaaa-ccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaag 11158  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatg-gatacaaatggg 195  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||    
T  11159 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaaggg 11258  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttcta-cctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcact 293  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| || | |||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11259 ttacaagaaattagattttacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacact 11357  T
Q  294 cacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  11358 ca-ccaaggtgtttacaatgtttcc 11381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 8634 - 8955
Alignment:
Q  3 aataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagaga-agcaaaaca----caccaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||| | ||| |  | || ||||||    ||||||||    
T  8634 aataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcacaagataaaagaagagggaagaggaaaacaaagacaccaaag 8732  T
Q  98 attgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatg-gatacaaatggg 195  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||    
T  8733 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaaggg 8832  T
Q  196 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttcta-cctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcact 293  Q
    |||||||||||||| ||  | ||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| || | |||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  8833 ttacaagaaattagattttataagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatggtttacact 8931  T
Q  294 cacccaaggtgtttacaatgtttcc 318  Q
    || ||||||| ||||||||||||||    
T  8932 ca-ccaaggtctttacaatgtttcc 8955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 312
Target Start/End: Original strand, 18028 - 18216
Alignment:
Q  123 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctc 222  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18028 tgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctc 18126  T
Q  223 acaa-aaacaaacataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
    ||||  ||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18127 acaatgaacaaccctaatttctaccaattttcccactctcaccaatgaacaaaacactc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaat 18216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 245
Target Start/End: Original strand, 27378 - 27591
Alignment:
Q  35 aagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaaca-tgacctaatct 133  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||| |||| |||  | |||| ||| |||||||||||||| ||||||| | |    
T  27378 aagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaaggtaaagagagaagagaaataaa-cacatcaataaatgtttacctaattcggtccaacaatgacctactat 27476  T
Q  134 gggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctc-acaaaaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||    
T  27477 gggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttatttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcttcaagaaca 27576  T
Q  232 a-acataatttctac 245  Q
    | |||||||||||||    
T  27577 atacataatttctac 27591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 154 - 312
Target Start/End: Original strand, 80338 - 80496
Alignment:
Q  154 caatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaacataatttctacctatttt 252  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||    
T  80338 caattcactatctatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 80437  T
Q  253 tccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 312  Q
     |||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  80438 cccaatctcagcaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgttcacaat 80496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10656 - 10468
Alignment:
Q  100 tgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatggatacaaatgggttac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||    
T  10656 tgtttacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaaatggttac 10557  T
Q  200 aagaaattagcttaaacaagctcacaaa-aacaaa-cataatttctacctatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattt 288  Q
    || ||||||||  | |  |||||||||| |||||| | |||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10556 aataaattagc--acaagagctcacaaagaacaaaccctaatttatatctttttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaaagattt 10468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1668 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1668
Description:

Target: scaffold1668; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 103
Target Start/End: Original strand, 1404 - 1502
Alignment:
Q  4 ataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaagcaaaacacaccaaagattgtt 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1404 ataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagattgtt 1502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8527 - 8448
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  8527 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 8448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22403 - 22359
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  22403 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 22359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24678 - 24634
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  24678 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 24634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 212
Target Start/End: Original strand, 2598 - 2719
Alignment:
Q  94 aaagattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaatggataca 189  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||     
T  2598 aaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac- 2696  T
Q  190 aatgggttacaagaaattagctt 212  Q
    ||  |||||||||||||||||||    
T  2697 aagaggttacaagaaattagctt 2719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 3722 - 3841
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatgg-atacaaa 191  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||    
T  3722 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 3820  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
      |||||||||||||||||||    
T  3821 gaggttacaagaaattagctt 3841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Original strand, 45242 - 45321
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  45242 aaacacaccaaaagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 45321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 44069 - 43990
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  44069 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 43990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 36940 - 36881
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  36940 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagaga 36881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 143
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85731
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagaga 85731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 10720 - 10777
Alignment:
Q  85 aaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10720 aaacacaccaa-gattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagaga 10777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25175 - 25093
Alignment:
Q  146 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaatggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa 227  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||| |||||  ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  25175 gatctctctacttcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaaggttacaagaaattaccttcaacaaactctcaaa 25093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 1453 - 1497
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  1453 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 1497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 285
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  329 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6445 - 6326
Alignment:
Q  96 agattgttgacccaattcggtccaa-catgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaatggatacaaa 191  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||    
T  6445 agattggtcacccagttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 6347  T
Q  192 tgggttacaagaaattagctt 212  Q
     || |||||||||||||||||    
T  6346 gggcttacaagaaattagctt 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 29458 - 29414
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  29458 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 29414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 69292 - 69336
Alignment:
Q  99 ttgttgacccaattcggtccaacatgacctaatctgggggagaga 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  69292 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 69336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University