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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11019_low_1 (Length: 536)

Name: NF11019_low_1
Description: NF11019
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11019_low_1
NF11019_low_1
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (9-525)||(17540342-17540851)
chr1 (52-298)||(37715986-37716234)
chr1 (297-518)||(50817413-50817633)
chr1 (103-489)||(12045206-12045596)
chr1 (381-518)||(43913888-43914026)
chr1 (104-329)||(32710668-32710895)
chr1 (417-489)||(3856274-3856346)
chr1 (247-518)||(42910229-42910501)
chr1 (425-492)||(32710504-32710571)
chr1 (255-329)||(15174938-15175012)
chr1 (399-518)||(15174751-15174871)
chr1 (127-328)||(2089308-2089511)
chr1 (418-492)||(4693053-4693126)
chr1 (416-501)||(11649740-11649825)
chr1 (167-262)||(50817673-50817770)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (56-489)||(33403349-33403784)
chr3 (127-491)||(462870-463236)
chr3 (52-495)||(41737231-41737676)
chr3 (282-518)||(30828040-30828276)
chr3 (381-492)||(35273629-35273740)
chr3 (425-495)||(14091686-14091756)
chr3 (425-523)||(30188376-30188474)
chr3 (6-251)||(33856687-33856936)
chr3 (214-332)||(11306902-11307021)
chr3 (258-329)||(14091850-14091921)
chr3 (396-498)||(20115446-20115547)
chr3 (214-328)||(30188163-30188278)
chr3 (410-492)||(7581664-7581746)
chr3 (416-492)||(28624315-28624391)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (52-495)||(248636-249081)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (170-487)||(10235692-10236012)
chr2 (60-518)||(32115388-32115848)
chr2 (381-516)||(3251160-3251296)
chr2 (130-331)||(9678359-9678552)
chr2 (247-348)||(33035934-33036035)
chr2 (380-491)||(32622860-32622972)
chr2 (385-516)||(42051734-42051866)
chr2 (425-518)||(21829344-21829436)
chr2 (98-332)||(3250902-3251137)
chr2 (256-348)||(21829509-21829601)
chr2 (379-453)||(23910371-23910446)
chr2 (417-492)||(45702325-45702400)
chr2 (369-489)||(25603544-25603665)
chr2 (440-489)||(33036128-33036177)
chr2 (440-492)||(22863913-22863965)
chr2 (443-495)||(37326344-37326396)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (127-517)||(235-622)
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (103-495)||(1010225-1010620)
chr8 (127-329)||(29977515-29977719)
chr8 (103-518)||(16683102-16683520)
chr8 (214-518)||(20694984-20695291)
chr8 (396-492)||(15014049-15014145)
chr8 (391-462)||(9741266-9741337)
chr8 (370-470)||(442396-442497)
chr8 (433-518)||(29977801-29977886)
chr8 (127-195)||(15013778-15013846)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (103-407)||(12463935-12464237)
chr7 (417-492)||(38431865-38431940)
chr7 (416-492)||(20367677-20367753)
chr7 (443-495)||(39465001-39465053)
chr7 (306-492)||(3942518-3942703)
chr7 (428-492)||(21416642-21416706)
chr7 (127-198)||(13848480-13848551)
chr7 (127-184)||(5846926-5846983)
chr7 (440-501)||(31396412-31396473)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (57-518)||(53100438-53100902)
chr4 (386-514)||(29002557-29002687)
chr4 (428-494)||(17402747-17402813)
chr4 (413-495)||(28067076-28067158)
chr4 (417-492)||(17188430-17188505)
[»] chr6 (8 HSPs)
chr6 (309-518)||(26586670-26586879)
chr6 (416-510)||(18588926-18589020)
chr6 (455-492)||(15472114-15472151)
chr6 (455-514)||(15161258-15161317)
chr6 (268-347)||(25740935-25741014)
chr6 (416-510)||(7956140-7956234)
chr6 (455-492)||(15171262-15171299)
chr6 (455-492)||(15180034-15180071)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (57-328)||(5598-5869)
[»] chr5 (6 HSPs)
chr5 (413-492)||(9195620-9195699)
chr5 (381-492)||(11979164-11979272)
chr5 (409-491)||(10460739-10460821)
chr5 (417-495)||(20252650-20252728)
chr5 (255-332)||(35414537-35414614)
chr5 (390-466)||(43464410-43464486)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (417-515)||(32743-32841)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (470-518)||(746-794)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 17540851 - 17540342
Alignment:
Q  9 aatagtcgttaatagggtcacggatccaccaccacatgtcataa---tgggcctgcaaaacaacattacgcaacattgacacacattcgaataccatctc 105  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||   ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||    
T  17540851 aatagccgttaatagggtcaagaatccaccacaacctgtcataaatatggacctggaaaacaacattacgcaacatagacacacattcagataccatttc 17540752  T
Q  106 ctcctcccacgccaacaaacacctcctccacacccaggctccaccgccatcaacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccatttgttgact 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17540751 ctcctcccacgccaacatacacctcctcaacacccatgctccaccgccatcaactcaccctctcctcaccatctcccgcaccgtcacccatttgttgact 17540652  T
Q  206 gttagatcaaaaggcgaggaaattgcacccgtaaaggcacacccccacgcaattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacac 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17540651 gttagatcaaaaggcgaggaaattgcaactgtaaaggcacacccccacccatttatctatctaaaaatatgtgttaccacctccactgaccagcctacac 17540552  T
Q  306 acattatcttcaaaccaactcccctccatcaaccccacaccacaatgaatgctagaaaccatgcgccatcacaaagaactatctctcccaccctccttca 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17540551 acattatcttcaaaccaactcccctccaccaaccccacaccgcgacgaatgctagaaaccatccgccatcacaaagaactatctctcccaccctccttca 17540452  T
Q  406 accacccccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaaaagagctgca 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  17540451 accacccccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaa----------ccaacatcacttccccaaaagagctaca 17540362  T
Q  506 ttaaattccctcagcttcat 525  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17540361 ttaaattccctcagcttcat 17540342  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37716234 - 37715986
Alignment:
Q  52 atgggcctgcaaaacaacattacgcaacattgacacacattcgaataccatctcctcctcccacgccaacaaacacctcctccacacccaggctccaccg 151  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  37716234 atgggcctgcaaaacaacattgtgcaatagagacacacactcggataccaactcctcctcccacgccagcaaacgcctcctccacacccaagcaccaccg 37716135  T
Q  152 ccatcaacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccatttgttgactgttagatcaaa-aggcgaggaaattgcacccgtaaaggcaca-ccc 249  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||   || |||||| ||||||| || ||||||| | || |||||| |||    
T  37716134 ccctcaaccgaccctctcctctccatctcctgcactgttacccttttgtcaacaactaaatcaaagaggcgagaaagttgcacctgaaatggcacacccc 37716035  T
Q  250 ccacgcaattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccac 298  Q
    |||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||| || ||||||||    
T  37716034 ccacccaattatctaaccaaaaaagtgtgctaccaccacctccgaccac 37715986  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 297 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 50817633 - 50817413
Alignment:
Q  297 accctacacacattatcttcaaaccaactcccctccatcaaccccacaccacaatgaatgctagaaaccatgcgccatcacaaagaactatctctcccac 396  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||   | | |||||||||||||| ||||| ||   | |||| || |||||||    
T  50817633 accctacgcaaattatcttcaaaccaactcccctccgacaatcccacaccgtgacggatgctagaaaccatccgccaccatgtaaaactgtccctcccac 50817534  T
Q  397 cctccttcaaccacccccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaaa 496  Q
    ||||||||| || |||| | ||||||| || || |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50817533 cctccttcagccgcccc-tacctccccgtaccttgcctttaaaactcgataccacagaccctccttgtcaactaacatacgccaacaccacttccccaat 50817435  T
Q  497 agagctgcattaaattccctca 518  Q
    |  ||  |||||||||||||||    
T  50817434 aacgccacattaaattccctca 50817413  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 103 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 12045596 - 12045206
Alignment:
Q  103 ctcctcctcccacgccaacaaacacctcctccacacccaggctccaccgccatcaacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccatttgttg 202  Q
    |||||||||||| ||||| |  | |||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||     
T  12045596 ctcctcctcccaagccaaaaggcgcctcctccactcccaggcaccaccaccatccacccatcctctactctccatctctttcactgtcacccacttgtta 12045497  T
Q  203 actgttagatcaaa-aggcgaggaaattgcacccgtaaaggcacacc-cccacgcaattatctatcc-aaaaatatgtgttaccacctccaccgaccacc 299  Q
    || | || |||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||| |||||||   ||| ||||| ||||| || ||||||  || ||||||    
T  12045496 acggctaaatcaaataagcgagggaattgcacccttaaagacactcctcccacccaattataagtccaaaaaaaatgtgctatcacctctgcctaccacc 12045397  T
Q  300 ctacacacattatcttcaaaccaactcccctccatc-aaccccacaccacaatgaatgctagaaaccatgcgccatcacaaagaactatctctcccaccc 398  Q
    ||||||||||||||  |||||| | |||||  || | ||  | || ||   | |||||| ||| | ||| |||||  ||||  |||| || || || ||     
T  12045396 ctacacacattatcaccaaacc-agtcccccacacctaaatcgacgccctgacgaatgccagacatcatccgccacaacaacaaactctccctaccccct 12045298  T
Q  399 tccttcaaccaccc-ccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccactt 489  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  || |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12045297 tccttcaaccacccaccctcctccccgtacctagcctttaggacccggtaccataaatcctctttatcaaccaacatacgccaacaccactt 12045206  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 518
Target Start/End: Original strand, 43913888 - 43914026
Alignment:
Q  381 gaactatctctcccaccctccttcaacc-acccccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgcc 479  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| ||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  43913888 gaactatctctcctcccttccttcaaccgacctccctcctccccgtacctagcctttaagactcgatatcataacccttccttatctactaacatacgcc 43913987  T
Q  480 aacaccacttccccaaaagagctgcattaaattccctca 518  Q
    ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||    
T  43913988 aacaccacttccctaataatgctgcattaaattccctca 43914026  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 32710895 - 32710668
Alignment:
Q  104 tcctcctcccacgccaacaaacacctcctccacacccaggctccaccgccatcaacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccatttgttga 203  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||| |  ||||||||||| || ||||||||  ||| ||| ||| ||||||      
T  32710895 tcctcttcccacgccaacaaacgcctccgccactcccaagctccgccgccaactccccaccctctcttcgccatctccctcaccgtcgcccctttgtttt 32710796  T
Q  204 ctgttagat-caaaaggcgaggaaattgcacccgtaaaggcac-acccccacgcaattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccct 301  Q
      |  ||||  |||||||| ||||||||||  ||||| ||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||     
T  32710795 tagccagataaaaaaggcggggaaattgcatgcgtaagggcgctccccccacccaattatctaaccaaaaatacgtggtacctcctccaccaaccacccg 32710696  T
Q  302 acacacattatcttcaaaccaactcccc 329  Q
    ||  |||||||| ||||||||| |||||    
T  32710695 accgacattatcctcaaaccaagtcccc 32710668  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 417 - 489
Target Start/End: Original strand, 3856274 - 3856346
Alignment:
Q  417 cctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccactt 489  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3856274 cctccccgtacctagcctttaagactcgataccataacccctccttatccactaacatacgccaacaccactt 3856346  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 247 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 42910501 - 42910229
Alignment:
Q  247 cccccacgcaattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattatcttcaaaccaactcccctccatcaaccccacacc 346  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||| ||||  ||||| || |||||||||| || ||||  ||| || |||||    
T  42910501 cccccacccaattgtccatccaaaaataagtactactccctccaccaaccactctacgaacattctcctcaaaccaacccctctcccccaatccgacacc 42910402  T
Q  347 acaatgaatgctagaaaccatgcgccatcacaaagaactatctctcccaccctccttcaaccaccc-ccttcctccccatatctagcctttaatactcgg 445  Q
    || | ||||    || | ||| | ||| ||||  |||||||| ||||  || |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||     
T  42910401 actacgaatatcggacaacatcctccaccacaccgaactatcactcctcccttccttcaaccgccctccttcctccccgtacctagcatttaagactcga 42910302  T
Q  446 taccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaaaagagctgcattaaattccctca 518  Q
    |||||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |  | |||  |||||||||||||||    
T  42910301 taccataacccttccgtatccactaacatacgccagcaccacttccctagtaaagcaacattaaattccctca 42910229  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 425 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 32710571 - 32710504
Alignment:
Q  425 tatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccc 492  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32710571 tatctagcctttaagactcgatatcataacccctccttatcaaccaacatacgccaacaccacttccc 32710504  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15175012 - 15174938
Alignment:
Q  255 caattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattatcttcaaaccaactcccc 329  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  15175012 caattatctaacaaaaaataagtgttactccctcctccgaccaccctacggacattatcctcaatccaactcccc 15174938  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 15174871 - 15174751
Alignment:
Q  399 tccttcaaccaccc-ccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaaaa 497  Q
    |||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||  |  | ||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| || |    
T  15174871 tccttcaaccgccctccctcctctccatatctcgcctttaggactcggtaccatagtctgttcttgtcaacaagcatacaccaacaccacttccctaaca 15174772  T
Q  498 gagctgcattaaattccctca 518  Q
    ||||  ||||||| |||||||    
T  15174771 gagcaacattaaactccctca 15174751  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2089511 - 2089308
Alignment:
Q  127 cctcctccacacccaggctccaccgccatcaacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccatttgttgactgttagatc-aaaaggcgagga 225  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||  |||| || | |||| |||| ||||  || ||  |||||||||  |  |||| ||| ||||||||||||    
T  2089511 cctcctccacacccaggcaccctcgccatcctcccaaccccgcctcaccatatcctctacagttgcccatttgtcaatggttaaatcaaaaaggcgagga 2089412  T
Q  226 aattgcacccgtaaaggcacacc-cccacgcaattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattatcttcaaaccaac 324  Q
    |||   ||||||||||||||||| ||||| || |||| | |||||||  | ||| |||| || || || ||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  2089411 aatcttacccgtaaaggcacacctcccacccagttatttgtccaaaagaaagtgatacctcccccgccaaccacgcgacattcattatcttcaaaccaac 2089312  T
Q  325 tccc 328  Q
    ||||    
T  2089311 tccc 2089308  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 418 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 4693126 - 4693053
Alignment:
Q  418 ctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccc 492  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||| || |||||  | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4693126 ctccccgtacctagcctttaagactcgatatcataactcttccttatccactaacatacgccaa-accacttccc 4693053  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 501
Target Start/End: Original strand, 11649740 - 11649825
Alignment:
Q  416 tcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaaaagagc 501  Q
    |||||||||||   ||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||    
T  11649740 tcctccccatactgagcttttaagacacgataccacaaaccatccttatcaaccaacatcctccaacaccacttccctaacagagc 11649825  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 50817770 - 50817673
Alignment:
Q  167 ctcctctccatctcctgcactgtcacccatttgttgactgttagatc-aaaaggcgaggaaattgcacccgtaaaggcacaccccc-acgcaattatc 262  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||  | | || ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||| || ||||||||    
T  50817770 ctcctctccatatcccgcactgttacccatttgttttccgctaaatcaaaaaggcgagggaattgcacccttaaaggcgcgccccctacccaattatc 50817673  T

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Target: chr3 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 56 - 489
Target Start/End: Original strand, 33403349 - 33403784
Alignment:
Q  56 gcctgcaaaacaacattacgcaacattgacacacattcgaataccatctcctcctcccacgccaacaaacacctcctccacacccaggctccaccgccat 155  Q
    |||||||||||||||||| | || |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  33403349 gcctgcaaaacaacattatgtaatagagacacacattcggataccaactcctcctcccaattcaacagacgcctcctccacacccaagctccaccgccct 33403448  T
Q  156 caacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccatttgttgactgttagatc-aaaaggcgaggaaattgcacccgtaaaggcacacccccacg 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||   |||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||      
T  33403449 caacctaccctctcctctccatctcctgcaccgtcacccatttgtcaaccactagatcaaaaaggcgaggaaattgcacctgaagtggcacacccccatc 33403548  T
Q  255 caattatctatcc-aaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattatcttcaaaccaactcccctccatcaaccccacaccacaatga 353  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |  |   ||    
T  33403549 caattatctatccaaaaaaaatgtgataccacctccaccaaccgccctacgcacattatcttcaaaccatcccccctccaacaaccccactctgcggcga 33403648  T
Q  354 atgctagaaaccatgcgccatcacaaagaactatctctcccaccctccttcaaccacccccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataa 453  Q
    |||||||||  ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  33403649 atgctagaagtcatccgccgccacgaagaactatctctcccaccctccttcagccgcccccttcctccccatatctagcctttaaaacccggtaccataa 33403748  T
Q  454 accctccttatcaactaacatacgccaacaccactt 489  Q
    ||| || | || ||| ||||||||||||||||||||    
T  33403749 accatcatgattaaccaacatacgccaacaccactt 33403784  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 127 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 463236 - 462870
Alignment:
Q  127 cctcctccacacccaggctccaccgccatcaacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccatttgttgactgttagatcaaaa-ggcgagga 225  Q
    ||||||||||| |||||| || || ||| |  |||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||  | | || ||||||| |||||||     
T  463236 cctcctccacatccaggcacctccaccaacttcccagccactcctctccatatcccgcactgttacccatttgttttccgctaaatcaaaaaggcgaggg 463137  T
Q  226 aattgcacccgtaaaggcacacccccacgcaattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattatcttcaaaccaact 325  Q
    |||||||||| ||||||||| || | || ||||||||   ||||||| ||||  |||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  463136 aattgcacccttaaaggcacgcctctacccaattatcggaccaaaaaaatgtactaccaccgtcaccaaccaccctacacaaattatcttcaaaccaact 463037  T
Q  326 cccctccatcaaccccacaccacaatgaatgctagaaaccatgcgccatcacaaagaactatctctcccaccctccttcaacc-acccccttcctcccca 424  Q
    |||||||  ||| ||||||||   | | |||||||||||||| ||||| ||   |||||| || |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||     
T  463036 cccctccgacaatcccacaccgtgacggatgctagaaaccatccgccaccatgtagaactgtccctcccaccctccttcagccgccccccttcctccccg 462937  T
Q  425 tatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttcc 491  Q
    || || |||||||| ||| | ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  462936 taccttgcctttaaaactagataccagagaccctccttgtcaactaacatacgccaacaccacttcc 462870  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 495
Target Start/End: Original strand, 41737231 - 41737676
Alignment:
Q  52 atgggcctgcaaaacaacattacgcaacattgacacacattcgaataccatctcctcctcccacgccaacaaacacctcctccacacccaggctccaccg 151  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||  |||| ||  | ||  ||||||||||||||| ||| | ||  ||||||||| |||| ||||| ||     
T  41737231 atggtcctgcaaaacaacattatgcaacaaagatgcacactcagacactgtctcctcctcccacgtcaagagacgtctcctccacccccaagctcctcca 41737330  T
Q  152 ccatcaacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccatttgttgactgttagatcaaaa-ggcgaggaaattgcacccgtaaaggcacaccc- 249  Q
    ||||   |||| || || ||||| |||| |||||| || |||||||| |  || |  | ||||||| || || | ||||  ||||||||||||||| ||     
T  41737331 ccatttgcccatcccctactctctatctgctgcaccgttacccatttatcaaccgccaaatcaaaaaggtgatggaattttacccgtaaaggcacatcct 41737430  T
Q  250 ccacgcaattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattatcttcaaaccaactcccctccatcaaccccacaccaca 349  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||| |||  |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||     
T  41737431 ccacccaattatctgaccaaaaaaatgtgctact-cctccacctacaaccctacgcacattatcttcaaaccaactcccttcccacaaccctacaccacg 41737529  T
Q  350 atgaatgctagaaaccatgcgccatcacaaagaactatctctcccaccctccttca-accacccccttcctccccatatctagcctttaatactcggtac 448  Q
    | ||||||||| || ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |  |||||||||||||| || |||||||  || ||||| ||     
T  41737530 acgaatgctagtaatcatccgccaccacaaagagctatctctcccaccctcctttaggcgccccccttcctccccgtacctagcctgcaagactcgatag 41737629  T
Q  449 cataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaa 495  Q
    ||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  41737630 cataacccctccttattgaccaacatacgccaacaccacttccccaa 41737676  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 282 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 30828276 - 30828040
Alignment:
Q  282 ccacctccaccgaccaccctacacacattatcttcaaaccaactcccctccatcaaccccacaccacaatgaatgctagaaaccatgcgccatcacaaag 381  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||   |  |||||||| | | |||| ||||||||||| ||||| ||   ||    
T  30828276 ccacctccacctaccaccctacacaaattatattcaaaccaactcccttccgatagtcccacaccgcgacgaatactagaaaccatccgccaccatgtag 30828177  T
Q  382 aactatctctcccaccctccttcaaccacccccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaa 481  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  30828176 aactatccctcccgccctccttcaaccgcccccttcctccccgtatcttgcctttaaaacgcgataccaaagaccctccttgtcaactaacatgcgccga 30828077  T
Q  482 caccacttccccaaaagagctgcattaaattccctca 518  Q
    |||||||||||||| | |||  | |||||||||||||    
T  30828076 caccacttccccaataaagccacgttaaattccctca 30828040  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 381 - 492
Target Start/End: Original strand, 35273629 - 35273740
Alignment:
Q  381 gaactatctctcccaccctccttcaaccacccccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgcca 480  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||| || |  || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||   |||    
T  35273629 gaactatatctaccaccctccttcaatcgcccccttcctccccgtaacgtgcttttaatacacggtaccacaacccctccttatcaaccaacatcttcca 35273728  T
Q  481 acaccacttccc 492  Q
    ||||||||||||    
T  35273729 acaccacttccc 35273740  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 425 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 14091756 - 14091686
Alignment:
Q  425 tatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaa 495  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  14091756 tatcttgcctttaagactcgataccataacccctccttatccaccaacatacgccaacaccactttcccaa 14091686  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 425 - 523
Target Start/End: Original strand, 30188376 - 30188474
Alignment:
Q  425 tatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaaaagagctgcattaaattccctcagcttc 523  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || || |  ||| ||||||| ||||||| ||||    
T  30188376 tatctagcctttaagactcgataccataatccttccttatccaccaacatacgccaacaccactttcctaacaacgctacattaaactccctcaacttc 30188474  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 251
Target Start/End: Original strand, 33856687 - 33856936
Alignment:
Q  6 cggaatagtcgttaatagggtcacggatccaccaccacatgtca-taat--gggcctgcaaaacaacattacgcaacattgacacacattcgaataccat 102  Q
    |||||||| | | |||||||||| | ||||||| |||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||  ||  |||| ||  | ||  |    
T  33856687 cggaatagccatgaatagggtcaagaatccaccgccacctgtcaataatatggtcctgcaaaacaacattatgcaacagagatgcacactcagacactgt 33856786  T
Q  103 ctcctcctcccacgccaacaaacacctcctccacacccaggctccaccgccatcaacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccatttgttg 202  Q
    ||| |||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||| || | |||||||| |||||  ||||||||||| |      
T  33856787 ctcttcctcccatgccaagagacgcctcctccacgcccaggcaccaccaccatcggcccaccccctaccctccatctgctgcatcgtcacccatttatca 33856886  T
Q  203 actgttagatc-aaaaggcgaggaaattgcacccgtaaaggcacaccccc 251  Q
    || |  | ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  33856887 accgccaaatcaaaaaggcgaggaaatcgcacccgtagaggcacgccccc 33856936  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 332
Target Start/End: Original strand, 11306902 - 11307021
Alignment:
Q  214 aaaaggcgaggaaattgcacccgtaaaggcaca-cccccacgcaattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattat 312  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||  ||||||  | ||| ||||||||||||| || | || ||| |||||||    
T  11306902 aaaaggcgagggaatttaacccgtaaaggtacgtcccccacccaattatctgaccaaaagaaagtgctaccacctccacctacaatccaacaaacattat 11307001  T
Q  313 cttcaaaccaactcccctcc 332  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  11307002 cttcaaaccaactcctctcc 11307021  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14091921 - 14091850
Alignment:
Q  258 ttatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattatcttcaaaccaactcccc 329  Q
    |||||||| |||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  14091921 ttatctatacaaaaataagtgtgaacacctccgccgaccaccctacgaacgttatcctcaaaccaactcccc 14091850  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 498
Target Start/End: Original strand, 20115446 - 20115547
Alignment:
Q  396 ccctccttcaaccacccccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaa 495  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||    
T  20115446 ccctccttcaatcaccccc-tcctcgccgtatctagcttttaacactcgataccacaacccttccttctcaaccaacatcctccaacaccatttccctaa 20115544  T
Q  496 aag 498  Q
    |||    
T  20115545 aag 20115547  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 328
Target Start/End: Original strand, 30188163 - 30188278
Alignment:
Q  214 aaaaggcgaggaaattgcacccgtaaaggcacacc-cccacgcaattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattat 312  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||| |  ||||||||| |||| ||| |  || || |    
T  30188163 aaaaggcgaggcaattgcacgcgtaaaggtgcacctcccacccaattatccaaccaaaaataagtgtcaatacctccaccaaccatccttcgtacgtttt 30188262  T
Q  313 cttcaaaccaactccc 328  Q
    | ||||||||||||||    
T  30188263 cctcaaaccaactccc 30188278  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 7581746 - 7581664
Alignment:
Q  410 cccccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccc 492  Q
    |||||||||||| | || |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  7581746 cccccttcctcctcgtacctagccttcaagactcgataccacaacccctccttgtcaaccaacatcctccaactccacttccc 7581664  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 492
Target Start/End: Original strand, 28624315 - 28624391
Alignment:
Q  416 tcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccc 492  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||| ||||  | ||| | |||||||||||||||    
T  28624315 tcctcgccatatctagcctgtaagactcgataccatatgccctccttgtcaataatcatcctccaacaccacttccc 28624391  T

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Target: scaffold0011 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 249081 - 248636
Alignment:
Q  52 atgggcctgcaaaacaacattacgcaacattgacacacattcgaataccatctcctcctcccacgccaacaaacacctcctccacacccaggctccaccg 151  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||  |||| ||  | ||| ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||| || || ||     
T  249081 atggtcctgcaaaacaacattatgcaacaaagatgcacactcagacaccgtctcctcctcccacgccaagagacgtctcctccactcccaagcacctcca 248982  T
Q  152 ccatcaacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccatttgttgactgttagatc-aaaaggcgaggaaattgcacccgtaaaggcaca-ccc 249  Q
    |||||  |||| || || |||||||||| |||||| || |||||||| |  ||||  | ||| ||||||||||| ||||  |||| ||| | |||| |||    
T  248981 ccatccgcccatcccctactctccatctgctgcaccgttacccatttatcaactgccaaatcaaaaaggcgagggaatttaacccataatgacacatccc 248882  T
Q  250 ccacgcaattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattatcttcaaaccaactcccctccatcaaccccacaccaca 349  Q
    |||| |||||||||  ||||||  ||||| ||    ||||||| || | |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  248881 ccacccaattatctgaccaaaagaatgtgctagaggctccacctacaatcctacgtacattatcttcaaaccaactcccctcccacaaccccacaccaca 248782  T
Q  350 atgaatgctagaaaccatgcgccatcacaaagaactatctctcccaccctccttcaaccacccccttcctccccatatctagcctttaatactcggtacc 449  Q
    | | || ||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  248781 acggatactagaaatcatccgccaccacgaagaactctctctcccaccctcctttagcctcccccttcctccccatacctagccttcaaaactcgatacc 248682  T
Q  450 ataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaa 495  Q
    |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  248681 ataacccctccttattgaccaacatacgccaacaccacttccccaa 248636  T

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Target: chr2 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 170 - 487
Target Start/End: Original strand, 10235692 - 10236012
Alignment:
Q  170 ctctccatctcctgcactgtcacccatttgttgactgttagatcaaa-aggcgaggaaattgcacccgtaaaggcacaccccc-acgcaattatctatcc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |  | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||    
T  10235692 ctctccatctcctgcactgtcacccatttattaaccgccaaatcaaagaggtgaggaaattgcacccgtaaaggcacaccccccaaccaattatctgacc 10235791  T
Q  268 aaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattatcttcaaaccaactcccctccatcaaccccacaccacaatgaatgctagaaaccat 367  Q
    ||||  ||||| |||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||| |||||||   |||| ||||||| |||    
T  10235792 aaaagaatgtgctacctcctccacctacaaccctacacacatgatcttcaaaccaactcccctctcacaccccaacaccacggcgaatactagaaatcat 10235891  T
Q  368 gcgccatcacaaagaactatctctcccaccctccttcaaccacc-cccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatca 466  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  ||  ||||| | || ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10235892 ccgccaccacaaagagctatctctcccaccctccttcaaacgccttccaacctcctcgtacctagcctttagaactcgataccataaaccctccttatca 10235991  T
Q  467 actaacatacgccaacaccac 487  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  10235992 accaacatacgccaacaccac 10236012  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 32115848 - 32115388
Alignment:
Q  60 gcaaaacaacattacgcaacattgacacacattcgaataccatctcctcctcccacgccaacaaacacctcctccacacccaggctccaccgccatcaac 159  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||  |||| ||  | ||| ||||||||||||||||||| | || || ||||||| ||||||| ||||| |||||  |    
T  32115848 gcaaaacaacattatgcaacaaagatgcacactctgaaaccgtctcctcctcccacgccaagagacgccgcctccactcccaggcaccaccaccatcgtc 32115749  T
Q  160 ccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccatttgttgactgttagatcaaaa-ggcgaggaaattgcacccgtaaaggcacaccccc-acgcaa 257  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| || || |  | || |||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||    
T  32115748 ccaccccctattctccatctcctgcaccgttacccatttattaaccgccaaataaaaaaggcgaggaaattgcacccgaagaggcgcaccccccacccaa 32115649  T
Q  258 ttatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattatcttcaaaccaactcccctccatcaaccccacaccacaatgaatgc 357  Q
    ||||||  |||||||  |||| |||| |||||| | || ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||  || ||||||| | |   ||||||    
T  32115648 ttatctgaccaaaaaattgtgctacctcctccatcaacaaccctgcgcacat-atcttcaaaccagctcccctcccacacccccacatcgcggcgaatgc 32115550  T
Q  358 tagaaaccatgcgccatcacaaagaactatctctcccaccctccttcaaccaccccc-ttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaacc 456  Q
    |||| | ||| ||||| |||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||  ||||| | |||||| ||    
T  32115549 tagagatcatccgccaccacaaagagccatcacacccaccctccttcaaccgccccccttcctccccgtacctagactttaggactcgatgccataagcc 32115450  T
Q  457 ctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaaaagagctgcattaaattccctca 518  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||| |||||||    
T  32115449 ctccttataaaccaacatacgccaacaccacttcctcaatagagaaacattaaactccctca 32115388  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 381 - 516
Target Start/End: Original strand, 3251160 - 3251296
Alignment:
Q  381 gaactatctctcccaccctccttcaacc-acccccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgcc 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| |||    
T  3251160 gaactatccctcccaccctccttcaaacgacccccctcctctccgtacctagcctttaagactcgataccataacccctccttatccaccaacatatgcc 3251259  T
Q  480 aacaccacttccccaaaagagctgcattaaattccct 516  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  3251260 aacaccacttccctaaaaaagcaacattaaattccct 3251296  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 331
Target Start/End: Original strand, 9678359 - 9678552
Alignment:
Q  130 cctccacacccaggctccaccgccatcaacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccatttgttgactgttagatcaaaa-ggcgaggaaat 228  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| || |   | | |  || |||| |||||||||||    
T  9678359 cctccacacccagacaccaccaccaactacccaccctctcctttccatctcctgcatcgtcacccacttatcttccgatgtataaaaaaggcgaggaaat 9678458  T
Q  229 tgcacccgtaaaggcacacccccacgcaattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattatcttcaaaccaactccc 328  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||          ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  9678459 tgcacccttaatggcgcacccccacccaattatctatccaaaaatatgt---------accaccaaccacactacgcacattatcttcaaaccaactctc 9678549  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 348
Target Start/End: Original strand, 33035934 - 33036035
Alignment:
Q  247 cccccacgcaattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattatcttcaaaccaactcccctccatcaaccccacacc 346  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||| |||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||    
T  33035934 cccccacccaattatcaaaccaaaaataagtgtcaacacctccaccaaccaccttacgcacattatcctcaaaccaactccccacccccaaccccactcc 33036033  T
Q  347 ac 348  Q
    ||    
T  33036034 ac 33036035  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 32622972 - 32622860
Alignment:
Q  380 agaactatctctcccaccctccttcaaccac-ccccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgc 478  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||  | |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||  ||||| |||    
T  32622972 agaactatctctccctccctcccttaactgctccccttcctccccatacctcgcctttaagactcgataccatagtccctccttgtcaatcaacatccgc 32622873  T
Q  479 caacaccacttcc 491  Q
    |||||||||||||    
T  32622872 caacaccacttcc 32622860  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 385 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 42051866 - 42051734
Alignment:
Q  385 tatctctcccaccctccttcaaccaccccc-ttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaaca 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  || |||||||| ||| | |||||| |||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  42051866 tatctctcccaccctccttcaacctccccccttcctcccaattcctcgcctttaagacttgataccattaaccctccttgtctaccaacatccgccaaca 42051767  T
Q  484 ccacttccccaaaagagctgcattaaattccct 516  Q
    ||| || || || || ||  |||||||||||||    
T  42051766 ccatttacctaacagggcaacattaaattccct 42051734  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 425 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 21829436 - 21829344
Alignment:
Q  425 tatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaaaagagctgcattaaattccctca 518  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||    
T  21829436 tatctcgcctttaaaactcgataccataacccctccttatcaacaaacatac-ccaccaccacttccctaacaacgctacattaaattccctca 21829344  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 332
Target Start/End: Original strand, 3250902 - 3251137
Alignment:
Q  98 accatctcctcctcccacgccaacaaacacctcctccacacccaggctccaccgccatcaacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccatt 197  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||  ||||| | ||  |||||||||| ||  ||||||||  ||| ||||||| ||    
T  3250902 accaactcctcttcccacgccaacaaacgcctccgcgacacccaagcatcaccgtcgtcctcccaccctcttctagccatctccctcaccgtcacccgtt 3251001  T
Q  198 tgttgactgttagatcaaa-aggcgaggaaattgcacccgtaaaggcacacccccacgcaattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgacc 296  Q
    | ||    |  | |||||| | |||||||||  |||||||||||||  | ||||||| || || ||   |||||||||||| ||||  |||||||| |||    
T  3251002 tattttaagccaaatcaaataagcgaggaaaacgcacccgtaaaggggcgcccccacccagttgtcgtgccaaaaatatgtattactccctccaccaacc 3251101  T
Q  297 accctacacacattatcttcaaaccaactcccctcc 332  Q
    |||||||| | |||  | ||||||||||||||||||    
T  3251102 accctacagatattcccctcaaaccaactcccctcc 3251137  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21829601 - 21829509
Alignment:
Q  256 aattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattatcttcaaaccaactcccctccatcaaccccacaccac 348  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||| || |||||||||||  ||  || |||||||||||    
T  21829601 aattacctaaccaaaaataagtgttacttcctccaccgaccatcctacggacattatcctcgaaccaactccctacccccagccccacaccac 21829509  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 23910446 - 23910371
Alignment:
Q  379 aagaactatctctcccaccctccttcaaccaccc-ccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataa 453  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23910446 aagaactatgcctaccaccctccttcaaacgccctccctcctccccgtatctagcctttaagactcgataccataa 23910371  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 417 - 492
Target Start/End: Original strand, 45702325 - 45702400
Alignment:
Q  417 cctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccc 492  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||  | |||||||||||||||    
T  45702325 cctccccatacctagcctttaaaacacgataccacaacccttccttatcaaccaacagtctccaacaccacttccc 45702400  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 489
Target Start/End: Original strand, 25603544 - 25603665
Alignment:
Q  369 cgccatcacaaagaactatctctcccaccctccttcaaccaccc-ccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaa 467  Q
    ||||| ||||||||||| |  || |||| |||||||||||  || || |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||      
T  25603544 cgccaccacaaagaactctacctaccactctccttcaaccttcctccctcctccccgtacctagcctttaagactcgataccataatctatccttctctt 25603643  T
Q  468 ctaacatacgccaacaccactt 489  Q
    ||||||| | ||||||||||||    
T  25603644 ctaacatcctccaacaccactt 25603665  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 489
Target Start/End: Original strand, 33036128 - 33036177
Alignment:
Q  440 actcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccactt 489  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  33036128 actcgataccataacccctccttatccaccaacatatgccaacaccactt 33036177  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 440 - 492
Target Start/End: Original strand, 22863913 - 22863965
Alignment:
Q  440 actcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccc 492  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||    
T  22863913 actcggtaccacaacccctccttatcacccaacatcctccaacaccacttccc 22863965  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 443 - 495
Target Start/End: Original strand, 37326344 - 37326396
Alignment:
Q  443 cggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaa 495  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  37326344 cggtaccacaacccctccttctcaaccaacatcctccaacaccacttccccaa 37326396  T

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Target: scaffold0533 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 517
Target Start/End: Original strand, 235 - 622
Alignment:
Q  127 cctcctccacacccaggctccaccgccatcaacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccatttgttgactgttagatcaaaa-ggcgagga 225  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| |  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    |  ||||||||| ||||||||    
T  235 cctcctccacacccagacaccacctccaacctcccaccctctcctctccatctcatgcacagacacccatttgtttttagccagatcaaaaaggcgagga 334  T
Q  226 aattgcacccgtaaaggcacaccccc-acgcaattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattatcttcaaaccaac 324  Q
    ||||||||| |||| |||||  |||| || |||||||| |||||||| |||| |||||  |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  335 aattgcacc-gtaatggcacttcccctacccaattatccatccaaaagtatgagttacttcctccaccaaccaccctacgcacattatcctcaaaccaac 433  T
Q  325 tcccctccatcaaccccacaccacaatgaatgctagaaaccatgcgccatcacaaagaactatctctcccaccctccttcaaccacccccttcctcccca 424  Q
    ||||| ||  || ||| ||||||| | |||||| ||| |  || | ||| ||||  || ||||| |||||  | |||||||||| |||||| |||| ||     
T  434 tccccacccccagcccaacaccactacgaatgccagacaatatcctccaccacaccgagctatc-ctccc--cttccttcaaccgccccct-cctctccg 529  T
Q  425 tatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaaaagagctgcattaaattccctc 517  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  530 tacctagcctttaagactcgataccataaaccctccttatcaaccaacatacgccaacaccacttccccaacaaagctacattaaattccctc 622  T

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Target: chr8 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 103 - 495
Target Start/End: Original strand, 1010225 - 1010620
Alignment:
Q  103 ctcctcctcccacgccaacaaacacctcctccacacccaggctccaccgccatcaacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccatttgttg 202  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||| || || ||| |  ||||||| || | |||||| | || |||||||||||||||||      
T  1010225 ctcctcctcccacgtcaagagacatctcctccactcccaggcacctccaccaacggcccaccccctaccctccatttgctacactgtcacccatttgtca 1010324  T
Q  203 actgttagatcaaaa-ggcgaggaaattgcacccgtaaaggcaca-cccccacgcaattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccc 300  Q
    ||    | || |||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |  || || ||||    
T  1010325 accaccaaataaaaaaggcgagggaattttacctgtaaaggcacttcccccacccaattatctgtccaaaaaaatgtgctaccatcacttcctacaaccc 1010424  T
Q  301 tacacacattatcttcaaaccaactcccctccatcaaccccacaccacaatgaatgctagaaaccatgcgccatcacaaagaactatctctcccaccctc 400  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||   |||| ||||  | ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1010425 tacaaacattaccttcgaaccaactcccctccgacaaccccacaccacgtcgaatactagtgatcatcctccaccacgaagaactatctctcccaccctc 1010524  T
Q  401 cttcaaccacc-cccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaa 495  Q
    ||||||||||| |||||||||| | || |||||||   | ||||| |||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||    
T  1010525 cttcaaccacctcccttcctcctcgtacctagcctgcgagactcgataccataacccctccttatcgatcagcatacgccaacaccacttccccaa 1010620  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 127 - 329
Target Start/End: Original strand, 29977515 - 29977719
Alignment:
Q  127 cctcctccacacccaggctccaccgccatcaacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccatttgttgactgttagat-caaaaggcgagga 225  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  | |  ||||  ||||||||||||    
T  29977515 cctcctccacaccgaggcaccacctccatccacccaccctctcctctccatcttctgcaccgtcacccctttgttttcagccagataaaaaaggcgagga 29977614  T
Q  226 aattgcacccgtaaaggcac-acccccacgcaattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattatcttcaaaccaac 324  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  29977615 aattgcacccgtaaaggtactccccccacccaattatccaaccaaaagtatgtgttacttcctccaccaaccaccctacgaacattatcctcaaaccaac 29977714  T
Q  325 tcccc 329  Q
    |||||    
T  29977715 tcccc 29977719  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16683520 - 16683102
Alignment:
Q  103 ctcctcctcccacgccaacaaacacctcctccacacccaggctccaccgccatcaacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccatttgttg 202  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||||||||| |||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||   |||| ||||||||||| |      
T  16683520 ctcctcctcccacgccaaaatgcgcctcctccactcccaagcaccaccaccatcaccgcaccccctactctccatctgacgcaccgtcacccatttatca 16683421  T
Q  203 actgttagatcaaaa-ggcgaggaaattgcacccgtaaaggcacacccccacgcaattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccct 301  Q
    || |  | ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| | || |   |||| || |||||    
T  16683420 accgccaaatcaaaaaggcgaggaaattgtacctgcaaaggcacacccccacccaattatctgaccaaaaatatgtgctgcctctgtcaccaactaccct 16683321  T
Q  302 acacacattatcttcaaaccaactcccctccatcaaccccacaccacaatgaatgctagaaaccatgcgccatcacaaa-gaactatctctcccaccctc 400  Q
     |||| ||||||||  ||||||||||||| |  |   |||||||| |   |||||||||||| ||| | ||| |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16683320 tcacaaattatctttgaaccaactccccttccactctcccacaccgcggcgaatgctagaaatcatccaccaccacaaaagagatatctctcccaccctc 16683221  T
Q  401 cttcaaccacc-cccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaaaaga 499  Q
    ||||| |  || |||||||||||| || |||||||  || ||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  16683220 cttcagctgcctcccttcctccccgtacctagcctgcaagacttgatatcataaaccttccttatcaaccaacatacgccagcaccacttccctaataga 16683121  T
Q  500 gctgcattaaattccctca 518  Q
    |   ||||||| |||||||    
T  16683120 gacacattaaactccctca 16683102  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 214 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 20695291 - 20694984
Alignment:
Q  214 aaaaggcgaggaaattgcacccgtaaaggcacaccccc-acgcaattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattat 312  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| || |||||||||  | ||||||||||| ||||    |||||| | ||||| | || |||||    
T  20695291 aaaaggcgaggaaattgcacctgcaaaaacacaccccccacccaattatctgactaaaaatatgtgctacctttgccaccgtctacccttcgcaaattat 20695192  T
Q  313 cttcaaaccaactcccctccatcaaccccacaccacaatgaatgctagaaaccatgcgccatcacaaagaactatctctcccaccctccttcaaccacc- 411  Q
    |||| ||||| |||||||||  |   |||||||  |   |||| ||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  20695191 cttcgaaccagctcccctcccactcacccacactgcggggaatactagaaatcatcctccaccacaaagagctatctctcccaccctccttcaaccgcct 20695092  T
Q  412 cccttcctccccatatctagccttt-aatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaaaagagctgcattaaa 510  Q
    |||||||||||| || ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||   |||||||    
T  20695091 cccttcctccccgtacctagcctttcaagactcgataccataaaccctccttattaaccaacatacgccagcaccatctccccaacagagaaacattaaa 20694992  T
Q  511 ttccctca 518  Q
     |||||||    
T  20694991 ctccctca 20694984  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 396 - 492
Target Start/End: Original strand, 15014049 - 15014145
Alignment:
Q  396 ccctccttcaaccacccccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccc 492  Q
    |||||| ||||||  |||| |||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  15014049 ccctccctcaaccgaccccctcctccccgtacctagcctttaaaactttataccataaaccctccttatctactaacattctccaacaccacttccc 15014145  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 391 - 462
Target Start/End: Original strand, 9741266 - 9741337
Alignment:
Q  391 tcccaccctccttcaaccacccccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctcctt 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  9741266 tcccaccctccttcaaccaccccctttctccccgtacctcgcctttaagacttgataccataaactctcctt 9741337  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 442497 - 442396
Alignment:
Q  370 gccatcacaaagaactatctctcccaccctccttcaaccaccc-ccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaac 468  Q
    |||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  442497 gccaccacaacgaactgtcccttcctccctccttcaaccaaccaccctcctcccgatacctagcctttaagactcgataccataacccctccttatctac 442398  T
Q  469 ta 470  Q
    ||    
T  442397 ta 442396  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Original strand, 29977801 - 29977886
Alignment:
Q  433 ctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaaaagagctgcattaaattccctca 518  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||| || | |||| | |||||||||||||    
T  29977801 ctttaagacacgataccataaaccctccttatctaccagcatacgacaacaccacttccctaacaaagctacgttaaattccctca 29977886  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 195
Target Start/End: Original strand, 15013778 - 15013846
Alignment:
Q  127 cctcctccacacccaggctccaccgccatcaacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcaccca 195  Q
    ||||||||||||||| || || || || ||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  15013778 cctcctccacacccatgcgcctcccccttcatctcaccctctcctctccatctcctccaccgtcgccca 15013846  T

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Target: chr7 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 12464237 - 12463935
Alignment:
Q  103 ctcctcctcccacgccaacaaacacctcctccacacccaggctccaccgccatcaacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccatttgttg 202  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| || || |  || | ||| || || |||||||| |||||||||| |  |||||| ||     
T  12464237 ctcctcttcccacgccaacagacgcctcctccacacccaggcaccgcccc--tccatccaacccctactctccatatcctgcactgacggccatttatta 12464140  T
Q  203 actgttagatcaaaaggcgaggaaattgcacccgtaaaggcacacccccacgcaattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccacccta 302  Q
    || |  || |||||| |||||| ||||||| || ||| ||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| || ||||||| ||||| ||||||    
T  12464139 accgcgaggtcaaaatgcgagggaattgcatccttaagggcgcacccccacccaattgtctaaccaaaaaaatgtgctaacacctccgccgacaacccta 12464040  T
Q  303 cacacattatcttcaaaccaactcccctccatcaaccccacaccacaatgaatgctagaaaccatgcgccatcacaaagaactatctctcccaccctcct 402  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| || |     |||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12464039 cgcacattatcttcaaaccaactcccctccgacatccccactccgcggcagatgctagagatcatccgccaccacaaagagctatccctcccaccctcct 12463940  T
Q  403 tcaac 407  Q
    |||||    
T  12463939 tcaac 12463935  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 417 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 38431940 - 38431865
Alignment:
Q  417 cctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccc 492  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38431940 cctccccgtacctagcctttaagactcgataccataatccctccttatccactaacatacgccaacaccacttccc 38431865  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 492
Target Start/End: Original strand, 20367677 - 20367753
Alignment:
Q  416 tcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccc 492  Q
    |||||||| | || ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  20367677 tcctccccgtgtcgagcctttaagacttgataccataacccctccttatcaactaacatcttccaacaccacttccc 20367753  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 495
Target Start/End: Original strand, 39465001 - 39465053
Alignment:
Q  443 cggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaa 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||    
T  39465001 cggtaccataaaccctccttatcaaccaacatcctccaacaccacttacccaa 39465053  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 492
Target Start/End: Original strand, 3942518 - 3942703
Alignment:
Q  306 acattatcttcaaaccaactcccctccatcaaccccacaccacaatgaatgctagaaaccatgcgccatcacaaagaactatctctcccaccctccttca 405  Q
    |||||||||||||||||||| || |||  | |||| ||||||| | ||||||  ||   ||| ||||| || |||||||| || | |||  |||||||||    
T  3942518 acattatcttcaaaccaacttccatccccccaccctacaccaccacgaatgcgtgactgcatccgccaccataaagaactgtcacgccc--cctccttca 3942615  T
Q  406 accaccc-ccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccc 492  Q
      | ||| ||||||||||| || |||||||| |  ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  3942616 ggcgcccaccttcctccccgtacctagccttcaggactcgataccacaacccctccttatcaaccaacatcctccaactccacttccc 3942703  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 428 - 492
Target Start/End: Original strand, 21416642 - 21416706
Alignment:
Q  428 ctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccc 492  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||||    
T  21416642 ctagcatttaagactcgataccataaaccctctttatctactagcattctccaacaccacttccc 21416706  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13848551 - 13848480
Alignment:
Q  127 cctcctccacacccaggctccaccgccatcaacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccattt 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   | |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  13848551 cctcctccacacccaggcaccaccaccatcaactcaccacttactctccgtctcctgcaccgtcaccgattt 13848480  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 184
Target Start/End: Original strand, 5846926 - 5846983
Alignment:
Q  127 cctcctccacacccaggctccaccgccatcaacccaccctctcctctccatctcctgc 184  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||    
T  5846926 cctcctccacatccaggcaccaccaccatctccccatcctctcctctccatatcctgc 5846983  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 501
Target Start/End: Original strand, 31396412 - 31396473
Alignment:
Q  440 actcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaaaagagc 501  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||    
T  31396412 actcggtaccacagaccatccttatcaaccaacatcctccaacaccacttccctaatagagc 31396473  T

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Target: chr4 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 53100902 - 53100438
Alignment:
Q  57 cctgcaaaacaacattacgcaacattgacacacattcgaataccatctcctcctcccacgccaacaaacacctcctccacacccaggctccaccgccatc 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  ||  |||| ||| | ||| |||| |||||||| ||||| |  | ||||||||||| |||||  || || ||| |    
T  53100902 cctgcaaaacaacattatgcaataaagatgcacactcggacaccgtctcttcctcccaagccaaaaggcgcctcctccacatccaggtacctccaccacc 53100803  T
Q  157 aacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccatttgttgactgttagat-caaaaggcgaggaaattgcacccgtaaaggcacaccccc-acg 254  Q
      |||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||  | | || ||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||| ||     
T  53100802 tccccagccactcctctccatatcccgcactgttacccatttgttttccgctaaataaaaaaggcgagggaattgcacccttaaaggcgcgccccctacc 53100703  T
Q  255 caattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattatcttcaaaccaactcccctccatcaaccccacaccacaatgaa 354  Q
    ||||||||   ||||||| || |  |||||||  | || |||||||||  || ||||||||||||| | ||||||| |  ||| ||||||||   | | |    
T  53100702 caattatcggaccaaaaaaatttactaccaccgtccccaaccaccctaggcaaattatcttcaaacgatctccccttcgacaatcccacaccgtgacgga 53100603  T
Q  355 tgctagaaaccatgcgccatcacaaagaactatctctcccaccctccttcaacc-acccccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataa 453  Q
    ||||||||||||| | ||| ||   |||| | || |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |     
T  53100602 tgctagaaaccatccaccaccatgtagaattgtccctcccaccctccttcagccgccccccttcatccccgtaccttgcctttaaaactcgataccacag 53100503  T
Q  454 accctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaaaagagctgcattaaattccctca 518  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  53100502 accctccttgtcaactaacatacgccaacaccacttccccaataacgccacattaaattccctca 53100438  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 386 - 514
Target Start/End: Original strand, 29002557 - 29002687
Alignment:
Q  386 atctctcccaccctccttcaaccacccc--cttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaaca 483  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||  |||||||    
T  29002557 atctctccctccctccttcaaccgcccccccttcctccccgtacctcgcctttaagactcgataccataaaacttccttgtcaaccaacatctgccaaca 29002656  T
Q  484 ccacttccccaaaagagctgcattaaattcc 514  Q
    ||| ||||  | ||| ||| |||||||||||    
T  29002657 ccatttccttagaagggctacattaaattcc 29002687  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 428 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 17402813 - 17402747
Alignment:
Q  428 ctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttcccca 494  Q
    |||||| |||| ||||  |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17402813 ctagccattaagactcaataccataaccattccttatccactaacatacgccaacaccacttcccca 17402747  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 413 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 28067158 - 28067076
Alignment:
Q  413 ccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaa 495  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  || || ||||| || || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  28067158 ccttcctccccatacctagccttaaggacacgataccacaacccttccttatcaaccaacatcctccaacaccacttccccaa 28067076  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 417 - 492
Target Start/End: Original strand, 17188430 - 17188505
Alignment:
Q  417 cctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccc 492  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||  | |||||||||||||||    
T  17188430 cctccccatacctagcctttaaaacacgataccacaacccttccttatcaaccaacaacctccaacaccacttccc 17188505  T

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Target: chr6 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 8)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 309 - 518
Target Start/End: Original strand, 26586670 - 26586879
Alignment:
Q  309 ttatcttcaaaccaactcccctccatcaaccccacaccacaatgaatgctagaaaccatgcgccatcacaaagaactatctctcccaccctccttcaacc 408  Q
    |||||||||||||||||| || ||  ||| || |||||||| ||||||  ||| | ||| | ||| || | ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  26586670 ttatcttcaaaccaactctccacccccaaaccaacaccacattgaatgtcagataacattctccaccaaacagagctatctctccctccctccctcaacc 26586769  T
Q  409 acccccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaaaagagctgcatta 508  Q
     |||||||||||||  || || |||||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |  ||  |||||    
T  26586770 gcccccttcctccctgtacctcgcctttaagactcggtgccaaagtccctccttatcaaccaacatccaccaacaccacttccctaacaatgcaacatta 26586869  T
Q  509 aattccctca 518  Q
    ||||||||||    
T  26586870 aattccctca 26586879  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 510
Target Start/End: Original strand, 18588926 - 18589020
Alignment:
Q  416 tcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaaaagagctgcattaaa 510  Q
    ||||| ||||||||||||   || ||||| |||||||| || ||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  18588926 tcctcaccatatctagccaccaacactcgataccataacccgtctctatcaactaacaaacgccaacaccacttacccaatagagcctcattaaa 18589020  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 455 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 15472151 - 15472114
Alignment:
Q  455 ccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccc 492  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15472151 ccctccttatcaaccaacatacgccaacaccacttccc 15472114  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 514
Target Start/End: Original strand, 15161258 - 15161317
Alignment:
Q  455 ccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaaaagagctgcattaaattcc 514  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||||||||||    
T  15161258 ccctacttatcaaccaacatacgccaacaccacttccctaacaaagctatattaaattcc 15161317  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 347
Target Start/End: Original strand, 25740935 - 25741014
Alignment:
Q  268 aaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattatcttcaaaccaactcccctccatcaaccccacacca 347  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||| ||||||    
T  25740935 aaaaaaatgtgttactaccaccaccaaccaccctccatacattatcctcaaaccaacttcccacccccaacccaacacca 25741014  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 7956234 - 7956140
Alignment:
Q  416 tcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaaaagagctgcattaaa 510  Q
    ||||| ||||||||||||   || ||||| ||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||    
T  7956234 tcctcaccatatctagccaccaacactcgataccaaagaccatctctatcaactaacatacgccaacatcacttacccaacagagcctcattaaa 7956140  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 492
Target Start/End: Original strand, 15171262 - 15171299
Alignment:
Q  455 ccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccc 492  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15171262 ccctccttatcaactaatatacaccaacaccacttccc 15171299  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 492
Target Start/End: Original strand, 15180034 - 15180071
Alignment:
Q  455 ccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccc 492  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15180034 ccctccttatcaactaatatacaccaacaccacttccc 15180071  T

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Target: scaffold0015 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 328
Target Start/End: Original strand, 5598 - 5869
Alignment:
Q  57 cctgcaaaacaacattacgcaacattgacacacattcgaataccatctcctcctcccacgccaacaaacacctcctccacacccaggctccaccgccatc 156  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||  |||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || || ||| |    
T  5598 cctgcaaaacaacattatacaacagagatgcacactcggacaccgtctcctcctgccacgccaagagacgtctcctccactcccaggcacctccaccaac 5697  T
Q  157 aacccaccctctcctctccatctcctgcactgtcacccatttgttgactgttagatcaaaa-ggcgaggaaattgcacccgtaaaggcaca-cccccacg 254  Q
      ||||||| | ||||||||||| ||||||  |||||||||| |  || |  | ||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||  |||||||     
T  5698 ggcccaccccc-cctctccatctgctgcaccatcacccatttatcaaccgccaaatcaaaaaggcgagggaattttacccgcaaaggcacttcccccacc 5796  T
Q  255 caattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattatcttcaaaccaactccc 328  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| || || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5797 caattatctatccaaaaaaatgtgctacctccacctcctacaaccct-cacacattatcctcaaaccaactccc 5869  T

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Target: chr5 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 413 - 492
Target Start/End: Original strand, 9195620 - 9195699
Alignment:
Q  413 ccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccc 492  Q
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T  9195620 ccttcctccccatacctagcctttaaaactcggtaccacaacccttccttatcaaccaacaacctccatcaccacttccc 9195699  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 11979272 - 11979164
Alignment:
Q  381 gaactatctctcccaccctccttcaaccacccccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgcca 480  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||  ||| || ||||  | |||    
T  11979272 gaactatccctccc-ccttccttcaaccgcccc--tcctccccatacctagcctttaagactcgataccgtaaactctccgcatccaccaacaatctcca 11979176  T
Q  481 acaccacttccc 492  Q
    ||||||||||||    
T  11979175 acaccacttccc 11979164  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 409 - 491
Target Start/End: Original strand, 10460739 - 10460821
Alignment:
Q  409 acccccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttcc 491  Q
    |||||| ||||| ||||| |  |||||||  || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  10460739 acccccctcctcaccataacgtgcctttagcacgcggtaccacaacccctccttatccactaacatccgccaacaccatttcc 10460821  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 417 - 495
Target Start/End: Original strand, 20252650 - 20252728
Alignment:
Q  417 cctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaa 495  Q
    |||||||||| ||||||||||  || || ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||    
T  20252650 cctccccatacctagcctttaggacacgataccacaacccttccttatctaccaacatcctccaacaccacttccccaa 20252728  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 332
Target Start/End: Original strand, 35414537 - 35414614
Alignment:
Q  255 caattatctatccaaaaatatgtgttaccacctccaccgaccaccctacacacattatcttcaaaccaactcccctcc 332  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||   |||| ||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  35414537 caattatctaaccaaaaataagtgctagtccctctaccaaccacccgacggacattatcctcaaaccaactcccctcc 35414614  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 43464486 - 43464410
Alignment:
Q  390 ctcccaccctccttcaaccacccccttcctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatca 466  Q
    ||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||||| | ||| || | |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  43464486 ctccctccctcttgcaaccatcccctacctccccataccgagctttgagtactcgataccataacccctccttatca 43464410  T

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Target: scaffold0155 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 417 - 515
Target Start/End: Original strand, 32743 - 32841
Alignment:
Q  417 cctccccatatctagcctttaatactcggtaccataaaccctccttatcaactaacatacgccaacaccacttccccaaaagagctgcattaaattccc 515  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || || || || || ||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| || | ||||  |||||||||||    
T  32743 cctccccatacctagcctttaaaacacgatatcacaacccttccttatcaaccaacaacctccaacaccacttccctaataaagctaaattaaattccc 32841  T

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Target: scaffold0309 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 470 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 794 - 746
Alignment:
Q  470 aacatacgccaacaccacttccccaaaagagctgcattaaattccctca 518  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||    
T  794 aacatacgccaacaccacttccctaatagagcaacattaaactccctca 746  T

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