View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1102_low_7 (Length: 362)

Name: NF1102_low_7
Description: NF1102
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1102_low_7
NF1102_low_7
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (1-345)||(30174516-30174861)
chr5 (1-345)||(18369298-18369642)
chr5 (1-345)||(33881177-33881521)
chr5 (1-345)||(3795589-3795934)
chr5 (1-345)||(11555405-11555748)
chr5 (1-345)||(37761033-37761378)
chr5 (1-345)||(37352410-37352754)
chr5 (1-345)||(43084309-43084653)
chr5 (1-345)||(18494534-18494877)
chr5 (1-345)||(8659238-8659582)
chr5 (1-345)||(41680755-41681100)
chr5 (1-345)||(30158085-30158429)
chr5 (1-345)||(33298584-33298932)
chr5 (1-345)||(40467319-40467663)
chr5 (1-345)||(28655293-28655638)
chr5 (1-345)||(9544473-9544819)
chr5 (1-345)||(37746088-37746438)
chr5 (1-345)||(6880355-6880699)
chr5 (1-345)||(28953546-28953890)
chr5 (1-345)||(13180559-13180899)
chr5 (1-345)||(32590042-32590385)
chr5 (1-345)||(11329688-11330034)
chr5 (1-345)||(13318594-13318937)
chr5 (1-345)||(9323529-9323871)
chr5 (1-345)||(12138228-12138570)
chr5 (1-345)||(23632020-23632366)
chr5 (1-345)||(13436440-13436790)
chr5 (1-345)||(2517116-2517461)
chr5 (1-345)||(22894467-22894810)
chr5 (1-345)||(24730021-24730365)
chr5 (1-345)||(33522433-33522778)
chr5 (1-345)||(31820176-31820518)
chr5 (1-345)||(15752624-15752962)
chr5 (1-345)||(37665252-37665596)
chr5 (1-345)||(5643851-5644193)
chr5 (1-345)||(34622569-34622914)
chr5 (1-345)||(30035477-30035820)
chr5 (1-345)||(18122182-18122526)
chr5 (1-345)||(26486448-26486780)
chr5 (1-345)||(31437515-31437852)
chr5 (1-345)||(25206328-25206679)
chr5 (1-345)||(25270484-25270835)
chr5 (1-345)||(22992890-22993226)
chr5 (1-345)||(15652526-15652868)
chr5 (1-345)||(23897925-23898263)
chr5 (1-345)||(33783538-33783877)
chr5 (1-345)||(24975900-24976238)
chr5 (1-345)||(24608296-24608636)
chr5 (1-345)||(30940687-30941025)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (1-345)||(5717075-5717420)
chr3 (1-345)||(5727985-5728330)
chr3 (1-345)||(5764038-5764383)
chr3 (1-345)||(47029460-47029805)
chr3 (1-345)||(32296636-32296981)
chr3 (1-345)||(10649078-10649422)
chr3 (1-345)||(29658877-29659221)
chr3 (1-345)||(31958364-31958710)
chr3 (1-345)||(5603222-5603568)
chr3 (1-345)||(24334180-24334526)
chr3 (1-345)||(5472995-5473338)
chr3 (1-345)||(28109860-28110208)
chr3 (1-345)||(4340585-4340929)
chr3 (1-345)||(51788029-51788373)
chr3 (1-345)||(8217639-8217985)
chr3 (1-345)||(4790542-4790887)
chr3 (1-345)||(18248745-18249089)
chr3 (1-345)||(29142663-29143010)
chr3 (1-345)||(4422925-4423269)
chr3 (1-345)||(4629792-4630135)
chr3 (1-345)||(21680708-21681051)
chr3 (1-345)||(10402156-10402499)
chr3 (5-345)||(17970775-17971113)
chr3 (1-345)||(28027298-28027640)
chr3 (1-345)||(5590270-5590614)
chr3 (1-345)||(22381490-22381833)
chr3 (1-345)||(16422189-16422534)
chr3 (1-345)||(20072040-20072386)
chr3 (1-345)||(18231200-18231544)
chr3 (1-345)||(20570755-20571099)
chr3 (1-345)||(48471934-48472282)
chr3 (1-345)||(18286264-18286607)
chr3 (1-345)||(18301565-18301908)
chr3 (1-345)||(5019720-5020063)
chr3 (1-345)||(28345178-28345521)
chr3 (1-345)||(11104270-11104615)
chr3 (1-345)||(22864757-22865099)
chr3 (1-345)||(22879816-22880158)
chr3 (1-345)||(17978859-17979204)
chr3 (1-345)||(6536652-6536996)
chr3 (1-345)||(7079229-7079578)
chr3 (1-344)||(16618399-16618746)
chr3 (1-345)||(31030154-31030491)
chr3 (1-345)||(18057267-18057614)
chr3 (1-345)||(6207907-6208247)
chr3 (1-345)||(18336635-18336973)
chr3 (1-345)||(4727640-4727978)
chr3 (1-345)||(32445161-32445496)
chr3 (1-345)||(19700493-19700849)
chr3 (1-345)||(15735009-15735348)
chr3 (1-345)||(35886771-35887111)
chr3 (1-345)||(8283367-8283722)
chr3 (1-345)||(4689658-4689996)
chr3 (5-345)||(5658145-5658482)
chr3 (94-345)||(15886650-15886895)
chr3 (1-65)||(15886894-15886960)
chr3 (1-41)||(8002567-8002607)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (1-345)||(27623520-27623866)
chr6 (1-345)||(13518007-13518351)
chr6 (1-345)||(27284175-27284519)
chr6 (1-345)||(27355924-27356268)
chr6 (1-345)||(8899512-8899856)
chr6 (1-345)||(34458321-34458663)
chr6 (1-345)||(4763804-4764148)
chr6 (1-345)||(33370244-33370588)
chr6 (1-345)||(16755861-16756206)
chr6 (1-345)||(27491174-27491518)
chr6 (1-345)||(28166535-28166880)
chr6 (1-345)||(27063523-27063866)
chr6 (1-345)||(26110224-26110567)
chr6 (1-345)||(4539571-4539916)
chr6 (1-345)||(16680180-16680525)
chr6 (1-345)||(26772442-26772785)
chr6 (1-345)||(29507457-29507803)
chr6 (1-345)||(26791857-26792201)
chr6 (1-345)||(29579056-29579399)
chr6 (1-345)||(30551813-30552157)
chr6 (1-345)||(28213495-28213840)
chr6 (1-345)||(29555599-29555943)
chr6 (1-345)||(22928694-22929040)
chr6 (1-345)||(13292764-13293102)
chr6 (1-345)||(4778921-4779266)
chr6 (1-345)||(27200227-27200571)
chr6 (1-345)||(27248662-27249006)
chr6 (1-345)||(16937838-16938181)
chr6 (1-345)||(4531329-4531673)
chr6 (1-345)||(14139213-14139551)
chr6 (1-345)||(27013774-27014111)
chr6 (41-345)||(26666471-26666774)
chr6 (1-345)||(26926809-26927137)
chr6 (1-345)||(27031064-27031405)
chr6 (1-345)||(27208945-27209285)
chr6 (1-345)||(27239943-27240283)
chr6 (1-345)||(24869751-24870089)
chr6 (1-345)||(27025186-27025526)
chr6 (1-345)||(24299573-24299912)
chr6 (1-345)||(15406346-15406686)
chr6 (1-345)||(15418133-15418473)
chr6 (1-331)||(20174590-20174930)
chr6 (1-331)||(22161061-22161401)
chr6 (1-36)||(23851450-23851485)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (1-345)||(20332288-20332633)
chr4 (1-345)||(40099502-40099847)
chr4 (1-345)||(39856692-39857034)
chr4 (1-345)||(27157178-27157524)
chr4 (1-345)||(24586227-24586572)
chr4 (1-345)||(14104598-14104941)
chr4 (1-345)||(18794483-18794827)
chr4 (1-345)||(30759819-30760161)
chr4 (1-345)||(33667669-33668011)
chr4 (1-345)||(54839446-54839789)
chr4 (1-345)||(5700595-5700939)
chr4 (1-345)||(14753360-14753703)
chr4 (1-345)||(34182830-34183172)
chr4 (1-345)||(5011932-5012277)
chr4 (1-345)||(21975759-21976103)
chr4 (1-345)||(31120376-31120721)
chr4 (1-345)||(36338392-36338728)
chr4 (1-345)||(24118718-24119061)
chr4 (1-345)||(1906307-1906656)
chr4 (1-345)||(15233871-15234219)
chr4 (1-344)||(15380105-15380448)
chr4 (1-345)||(6575917-6576253)
chr4 (1-345)||(15276495-15276842)
chr4 (36-345)||(36324183-36324484)
chr4 (1-345)||(1673915-1674260)
chr4 (1-345)||(17019107-17019447)
chr4 (1-345)||(14671071-14671412)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-345)||(12080-12423)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (1-345)||(9360666-9361009)
chr8 (1-345)||(28355778-28356124)
chr8 (1-345)||(31360572-31360916)
chr8 (1-345)||(31483698-31484044)
chr8 (1-345)||(33248410-33248753)
chr8 (1-345)||(18796750-18797095)
chr8 (1-345)||(19680493-19680835)
chr8 (1-345)||(29835367-29835710)
chr8 (1-345)||(44567025-44567371)
chr8 (1-345)||(15773618-15773962)
chr8 (1-345)||(18715524-18715870)
chr8 (1-345)||(12086551-12086896)
chr8 (1-345)||(21341998-21342343)
chr8 (1-306)||(33264775-33265079)
chr8 (1-345)||(19910990-19911336)
chr8 (1-345)||(19202203-19202535)
chr8 (1-344)||(22074758-22075102)
chr8 (1-345)||(27602742-27603079)
chr8 (1-215)||(16260267-16260480)
chr8 (1-345)||(19655175-19655516)
chr8 (1-345)||(2131096-2131434)
chr8 (1-345)||(22138950-22139288)
chr8 (1-345)||(19694139-19694479)
chr8 (1-345)||(14569200-14569542)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (1-345)||(27809743-27810089)
chr2 (1-345)||(254508-254852)
chr2 (1-345)||(37945721-37946066)
chr2 (1-345)||(12592852-12593200)
chr2 (1-345)||(16167520-16167864)
chr2 (1-345)||(12661581-12661924)
chr2 (1-345)||(22921999-22922345)
chr2 (1-345)||(13930400-13930746)
chr2 (1-345)||(3788536-3788879)
chr2 (1-345)||(39896111-39896454)
chr2 (1-345)||(19410340-19410686)
chr2 (1-345)||(37383719-37384063)
chr2 (1-345)||(37931414-37931765)
chr2 (1-345)||(27122567-27122909)
chr2 (1-345)||(34867725-34868068)
chr2 (1-345)||(40239551-40239894)
chr2 (1-345)||(9343843-9344187)
chr2 (1-345)||(27782274-27782618)
chr2 (1-345)||(39045678-39046022)
chr2 (1-345)||(12710457-12710801)
chr2 (1-345)||(34160886-34161232)
chr2 (1-345)||(37679747-37680093)
chr2 (1-345)||(37695012-37695358)
chr2 (7-345)||(31868642-31868979)
chr2 (1-345)||(16823193-16823537)
chr2 (1-345)||(16897943-16898287)
chr2 (1-345)||(21671026-21671373)
chr2 (1-345)||(31882329-31882672)
chr2 (1-345)||(32055844-32056187)
chr2 (1-345)||(11629041-11629384)
chr2 (1-345)||(21697029-21697376)
chr2 (1-345)||(34297198-34297535)
chr2 (1-344)||(27396365-27396718)
chr2 (1-345)||(34268782-34269121)
chr2 (1-345)||(19450274-19450627)
chr2 (1-345)||(28888321-28888660)
chr2 (1-345)||(27428309-27428646)
chr2 (1-345)||(23122434-23122773)
chr2 (1-345)||(20843954-20844298)
chr2 (156-345)||(23116993-23117182)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (1-345)||(10968711-10969056)
chr1 (1-345)||(3647192-3647536)
chr1 (1-345)||(10951137-10951482)
chr1 (1-345)||(28591129-28591472)
chr1 (1-321)||(51644266-51644588)
chr1 (1-345)||(28155772-28156118)
chr1 (1-345)||(41787175-41787521)
chr1 (1-345)||(20334281-20334627)
chr1 (1-345)||(16201893-16202245)
chr1 (1-345)||(20466823-20467175)
chr1 (1-345)||(21891628-21891958)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (1-345)||(26678856-26679201)
chr7 (1-345)||(26441294-26441639)
chr7 (1-345)||(26663664-26664009)
chr7 (1-345)||(4138997-4139343)
chr7 (1-345)||(5141086-5141431)
chr7 (1-345)||(24586287-24586630)
chr7 (1-345)||(39206891-39207235)
chr7 (1-345)||(16745272-16745617)
chr7 (1-345)||(5164425-5164769)
chr7 (1-345)||(31558146-31558490)
chr7 (1-345)||(5154125-5154468)
chr7 (1-345)||(26518834-26519176)
chr7 (1-345)||(45737342-45737688)
chr7 (1-321)||(26509471-26509793)
chr7 (1-345)||(4205431-4205774)
chr7 (42-345)||(26595750-26596055)
chr7 (1-345)||(26268837-26269185)
chr7 (1-345)||(11418531-11418875)
chr7 (1-345)||(45393260-45393604)
chr7 (1-345)||(26313601-26313943)
chr7 (1-345)||(16443755-16444100)
chr7 (1-345)||(11446929-11447273)
chr7 (1-345)||(3451359-3451704)
chr7 (1-345)||(2160611-2160957)
chr7 (1-345)||(31084374-31084719)
chr7 (1-345)||(16047356-16047697)
chr7 (1-345)||(2779293-2779631)
chr7 (1-345)||(31129946-31130284)
chr7 (1-345)||(10847624-10847970)
chr7 (1-345)||(10910678-10911016)
chr7 (1-343)||(16512194-16512530)
chr7 (1-41)||(26531926-26531966)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-345)||(3045-3391)
scaffold0159 (100-345)||(17949-18196)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (1-345)||(9508-9851)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-345)||(8795-9138)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (1-345)||(4469-4816)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-345)||(18629-18975)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-345)||(15613-15964)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (1-345)||(9958-10301)
scaffold0143 (1-345)||(33341-33682)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-345)||(13993-14338)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (1-345)||(1701-2045)
scaffold0322 (1-345)||(12090-12445)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-344)||(25159-25510)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-345)||(6110-6451)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (1-345)||(24772-25112)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (171-345)||(1-175)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (1-117)||(421-537)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (1-101)||(26243-26343)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (236-345)||(40495-40606)
scaffold0099 (4-122)||(40729-40855)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 30174516 - 30174861
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174516 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 30174615  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174616 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 30174715  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30174716 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 30174815  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  30174816 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30174861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18369642 - 18369298
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18369642 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaacc 18369543  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18369542 ttcgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacatt 18369443  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369442 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 18369343  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18369342 tcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18369298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 33881177 - 33881521
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881177 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 33881276  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881277 tttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 33881376  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881377 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 33881476  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  33881477 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggt 33881521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 3795589 - 3795934
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795589 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 3795688  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795689 tttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 3795788  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795789 tttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 3795888  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  3795889 ttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 3795934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 11555405 - 11555748
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11555405 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 11555504  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555505 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 11555603  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555604 ttgaaaattgaaaacttcttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 11555703  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  11555704 tcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtcggtggt 11555748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 37761033 - 37761378
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761033 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 37761132  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-t 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  37761133 tttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatt 37761231  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761232 tttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggcacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 37761331  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  37761332 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagactgtggt 37761378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37352754 - 37352410
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37352754 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 37352655  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37352654 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 37352556  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37352555 tttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctat 37352456  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  37352455 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtggt 37352410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 43084309 - 43084653
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43084309 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcc 43084408  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084409 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctattttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 43084507  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43084508 tttgaaagttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctat 43084607  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||| | || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  43084608 ttcaatgtatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 43084653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18494877 - 18494534
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18494877 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccaccactctcatacatcaatttgagcc 18494778  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494777 tttgcttttgtttgaaaactccatttt-cttctactttcaaagctatatacaatttactttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 18494679  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494678 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 18494579  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  18494578 tcaatatgtgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 18494534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8659582 - 8659238
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8659582 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattcgccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 8659483  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659482 tttgtttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 8659384  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8659383 tttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctat 8659284  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  8659283 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 8659238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 41680755 - 41681100
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680755 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcgtgcccttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 41680854  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680855 tttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 41680954  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  41680955 tttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 41681053  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  41681054 tttcaatttatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 41681100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 30158085 - 30158429
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  30158085 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagct 30158184  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158185 tgtgcttttgttt-aaaactctacctttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 30158283  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  30158284 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctat 30158383  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  30158384 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30158429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 33298584 - 33298932
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298584 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 33298683  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298684 tttgcttttgtttgaaaactccatttttttttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 33298783  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  33298784 ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 33298883  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  33298884 tatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33298932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 40467663 - 40467319
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40467663 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 40467564  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40467563 tgtgcttttgttt-aaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatt 40467465  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467464 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 40467365  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  40467364 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 40467319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 28655293 - 28655638
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28655293 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcc 28655392  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28655393 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttaataatgacaatgctcgaaacaaacatt 28655490  T
Q  201 tt--gaaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655491 ttttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 28655590  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28655591 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28655638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9544819 - 9544473
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9544819 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 9544720  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544719 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 9544622  T
Q  201 tt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544621 ttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 9544522  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  9544521 tatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggt 9544473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37746438 - 37746088
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746438 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 37746339  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37746338 tttgcttttgtttgaaaactctattttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatt 37746239  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta------tgttgatg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      |||| |||    
T  37746238 ttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttaatgttaatg 37746139  T
Q  295 tctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37746138 tctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 37746088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 6880355 - 6880699
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6880355 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 6880454  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880455 tgtgcttttgttt-aagactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 6880553  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  6880554 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 6880653  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  6880654 ttcaatgtgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 6880699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28953890 - 28953546
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953890 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 28953791  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-t 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28953790 tttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 28953692  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  28953691 tttgggaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 28953593  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28953592 tttcaatttatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28953546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13180899 - 13180559
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180899 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 13180800  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13180799 ctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacat 13180700  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
     ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180699 cttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 13180605  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  13180604 ttcaatatgtgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtggt 13180559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 32590385 - 32590042
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  32590385 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaattcgtggggtcatgcctttggccgactaccactcttatacatcaaattgagcc 32590286  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  32590285 tgtgcttttgttt-aaaactctacttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttctttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatt 32590188  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590187 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 32590088  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  32590087 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 32590042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 11329688 - 11330034
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11329688 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcc 11329787  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagcta--tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11329788 tttgcttttgttttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctaaatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaaca 11329886  T
Q  199 ttttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329887 tttttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 11329986  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  11329987 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 11330034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13318937 - 13318594
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13318937 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 13318838  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318837 tgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 13318739  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13318738 ttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatt 13318639  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  13318638 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 13318594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 9323529 - 9323871
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9323529 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 9323628  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323629 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 9323726  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9323727 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatt 9323826  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  9323827 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 9323871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 12138228 - 12138570
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12138228 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 12138327  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138328 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 12138425  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12138426 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatt 12138525  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  12138526 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 12138570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 23632020 - 23632366
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  23632020 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagcttcgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagct 23632119  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  23632120 tgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatc 23632218  T
Q  201 ttgaaaattgaaaa--ctttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23632219 ttgaaaattgaaaaagctttttgtctatttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtct 23632318  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  23632319 atttcaatatgtgttataagccggttctcctccaggatagtctgtggt 23632366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13436790 - 13436440
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436790 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 13436691  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacatttt-ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 197  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13436690 ttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatggcaacgcttgaaacaaac 13436592  T
Q  198 atttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgat 293  Q
    |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436591 attttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgat 13436492  T
Q  294 gtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  13436491 gtctatttcaatatatattacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 13436440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 2517116 - 2517461
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2517116 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccctcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 2517215  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2517216 tgtgcttttgtttgagat-tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatt 2517313  T
Q  201 tt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2517314 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtct 2517413  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  2517414 atttcaacgtgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 2517461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 22894467 - 22894810
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894467 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 22894566  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22894567 tttgcttttgtttg-aaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaatattttctttctattttgataatgaccatgcttgaaacaaacatc 22894665  T
Q  201 ttgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22894666 ttgaaaattgaaaaggtttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtatgttgatgtctat 22894764  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22894765 ttcgatatgtgttacaagcagactcttccccaggatagtctgtggt 22894810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 24730021 - 24730365
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24730021 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 24730120  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24730121 tgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 24730218  T
Q  201 tt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  24730219 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtcta 24730318  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  24730319 tttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 24730365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 33522433 - 33522778
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33522433 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagac 33522532  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    | ||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522533 tgtgcttttgtttgaaa-ctctgttttcttttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 33522631  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  33522632 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtcta 33522731  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  33522732 tttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33522778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31820518 - 31820176
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31820518 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 31820419  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820418 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 31820321  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  31820320 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaaggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatt 31820221  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  31820220 tcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 31820176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15752962 - 15752624
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15752962 caatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 15752863  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15752862 tgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttct----tgataatgacaatacttgaaacaaacatt 15752769  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15752768 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatt 15752669  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  15752668 tcaatatatgttaccagcaggttctcctccaagataatctgtggt 15752624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37665596 - 37665252
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37665596 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 37665497  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-t 199  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37665496 tgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 37665398  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  37665397 tttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 37665299  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37665298 tttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtggt 37665252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 5643851 - 5644193
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5643851 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 5643950  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-t 199  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5643951 tgtgcttttgtttg-aaactcta-ttttcttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatt 5644048  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5644049 tttgaaaatcgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctat 5644147  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  5644148 ttcaatatatgttaaaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 5644193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 34622569 - 34622914
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622569 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 34622668  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
     | ||||||||||||||| ||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  34622669 ttgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacat 34622767  T
Q  200 ttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622768 ttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 34622867  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  34622868 tttcaatatatgttacaagcaggttcttctcaaggatagtctgtggt 34622914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 30035477 - 30035820
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30035477 caatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 30035576  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30035577 tgtgcttttgttt-aaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatt 30035674  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30035675 tttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctat 30035774  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| |||||| |||||  ||| | ||| |||| ||||||||    
T  30035775 ttcaatatatgttaccagcagattctcctccaagataatctgtggt 30035820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18122526 - 18122182
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18122526 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 18122427  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca- 198  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18122426 tgtgcttttgttt-aaaactctatttttttttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 18122328  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  18122327 ttttgaaaattgagaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 18122229  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  18122228 tttcaatatatgttacaagcagtttctcctccaggatagtctgtggt 18122182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 26486448 - 26486780
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26486448 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 26486547  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||           |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486548 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----------caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 26486635  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26486636 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatt 26486735  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  26486736 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 26486780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 31437515 - 31437852
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  31437515 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagct 31437614  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  31437615 tgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatt 31437713  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437714 ttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 31437807  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  31437808 tcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggt 31437852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 25206328 - 25206679
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25206328 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 25206427  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaa 196  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25206428 ctgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaa 25206526  T
Q  197 cattttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttg 291  Q
    ||| ||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25206527 catcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttg 25206625  T
Q  292 atgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||  |||||||    
T  25206626 atgtctatttcaatatgtgttacaagcaaattcttccctaggataaactgtggt 25206679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 25270484 - 25270835
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25270484 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 25270583  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaa 196  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25270584 ctgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaa 25270682  T
Q  197 cattttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttg 291  Q
    ||| ||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25270683 catcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttg 25270781  T
Q  292 atgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||  |||||||    
T  25270782 atgtctatttcaatatgtgttacaagcaaattcttccctaggataaactgtggt 25270835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22993226 - 22992890
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22993226 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 22993127  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  22993126 tgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgatgatgctcgaaacaagcatt 22993028  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  22993027 ttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatt 22992935  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  22992934 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 22992890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15652868 - 15652526
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15652868 caatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 15652769  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15652768 tgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatt 15652670  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||  |||| | | |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  15652669 ttgaaaattgaaaaagttttttttttaaaaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatt 15652571  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  15652570 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15652526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 23897925 - 23898263
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23897925 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaattcatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 23898024  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaa 195  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23898025 tgtgcttttgttt-aaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaacattttctttctattttaataatgacaaatgcttgaaacaa 23898123  T
Q  196 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 295  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  23898124 acatcttgaaaattgaaaaagttttg----------aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgt 23898213  T
Q  296 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  23898214 ctatttcaatatatgttgcaagcagattcttctccaggatagtctgtggt 23898263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 33783538 - 33783877
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33783538 caatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 33783637  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta--ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaa 196  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  33783638 tgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctattttttaataatgacaaatgctcgaaacaaa 33783736  T
Q  197 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    ||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  33783737 catcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaaccggagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 33783828  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  33783829 tatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33783877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 24975900 - 24976238
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24975900 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtc 24975999  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaac 197  Q
    | |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  24976000 tgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaac 24976098  T
Q  198 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    || |||||||||| |||  |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  24976099 atcttgaaaattggaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 24976190  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  24976191 atttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtatgtggt 24976238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 24608296 - 24608636
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24608296 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 24608395  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaa 196  Q
     | ||||||||||||||| |||   |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||    
T  24608396 atgtgcttttgtttgaaa-ctccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaa 24608494  T
Q  197 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    ||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  24608495 catcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcaagtgtgtgttggtgtc 24608587  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24608588 tatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24608636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 30940687 - 30941025
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30940687 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagc 30940786  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaa 196  Q
    || |||||||||||||||  |||  |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||    
T  30940787 ctgtgcttttgtttgaaat-tctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaa 30940885  T
Q  197 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    ||| ||||||||||||||  |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |    
T  30940886 catcttgaaaattgaaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaaag-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcc 30940976  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  30940977 tatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30941025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 5717075 - 5717420
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717075 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 5717174  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717175 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 5717274  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5717275 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 5717374  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5717375 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5717420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 5727985 - 5728330
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5727985 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 5728084  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728085 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 5728184  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5728185 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 5728284  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5728285 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5728330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5764383 - 5764038
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764383 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 5764284  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764283 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 5764184  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5764183 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 5764084  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5764083 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5764038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 47029460 - 47029805
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029460 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 47029559  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029560 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 47029659  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47029660 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 47029759  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  47029760 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 47029805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 32296636 - 32296981
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296636 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 32296735  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296736 tttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 32296835  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32296836 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 32296935  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  32296936 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 32296981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 10649078 - 10649422
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649078 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 10649177  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649178 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 10649276  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10649277 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 10649376  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  10649377 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 10649422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 29659221 - 29658877
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29659221 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 29659122  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659121 tttgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagttatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 29659023  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659022 tttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 29658923  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  29658922 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 29658877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31958710 - 31958364
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958710 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 31958611  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958610 tttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 31958511  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958510 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 31958411  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31958410 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31958364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5603568 - 5603222
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603568 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 5603469  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603468 tttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 5603369  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603368 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaataaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 5603269  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5603268 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5603222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 24334180 - 24334526
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334180 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 24334279  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334280 tttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 24334379  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334380 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 24334479  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24334480 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24334526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 5472995 - 5473338
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5472995 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 5473094  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-t 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5473095 tttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 5473193  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473194 tttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 5473292  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5473293 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5473338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28110208 - 28109860
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110208 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttatgaatccgtggagtcatgccttgggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 28110109  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac--- 197  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  28110108 tttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacgtt 28110009  T
Q  198 -attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28110008 ttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtc 28109909  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  28109908 tatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 28109860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4340929 - 4340585
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4340929 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 4340830  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340829 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 4340731  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340730 tttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 4340631  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  4340630 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 4340585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 51788029 - 51788373
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51788029 caatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 51788128  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788129 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaatattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 51788227  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51788228 tttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctat 51788327  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  51788328 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 51788373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 8217639 - 8217985
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217639 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtggatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 8217738  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8217739 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacat 8217837  T
Q  200 ttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217838 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 8217937  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  8217938 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 8217985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4790887 - 4790542
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790887 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggattcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 4790788  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790787 ttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 4790689  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790688 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 4790589  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  4790588 tttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 4790542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 18248745 - 18249089
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18248745 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccatcactcttatacatcaagttgagcc 18248844  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248845 tttgcttttgtttggaa-ctctatttttcttctactttcaaagctacatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 18248943  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248944 tttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 18249043  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18249044 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18249089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 29143010 - 29142663
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29143010 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 29142911  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142910 tttgcttttgtttgaaaactccattttttttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 29142811  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  29142810 tttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 29142711  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  29142710 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 29142663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 4422925 - 4423269
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4422925 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcc 4423024  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4423025 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatt 4423123  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423124 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 4423223  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  4423224 ttcaatatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 4423269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 4629792 - 4630135
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629792 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgttaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 4629891  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629892 tttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 4629990  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  4629991 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 4630089  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  4630090 ttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 4630135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 21680708 - 21681051
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680708 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 21680807  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680808 tttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 21680906  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  21680907 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 21681005  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  21681006 ttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 21681051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 10402156 - 10402499
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402156 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 10402255  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10402256 tgtgcttttgatt-aaaattctattttt-ttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatt 10402353  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402354 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 10402453  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  10402454 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 10402499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 5 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17971113 - 17970775
Alignment:
Q  5 gtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  17971113 gtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtg 17971014  T
Q  105 cttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971013 cttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttga 17970916  T
Q  205 aaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970915 aaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaa 17970816  T
Q  305 tatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  17970815 tatgcgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 17970775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 28027298 - 28027640
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28027298 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcaggcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 28027397  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28027398 tgtgcttttgttt-aaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatt 28027495  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027496 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 28027595  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28027596 tcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28027640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5590614 - 5590270
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590614 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 5590515  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590514 tgtgcttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 5590416  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5590415 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 5590316  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  5590315 ttcaataggtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctatggt 5590270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22381833 - 22381490
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22381833 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 22381734  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-t 199  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22381733 tgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 22381635  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  22381634 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagtgtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 22381536  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  22381535 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 22381490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 16422189 - 16422534
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422189 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 16422288  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422289 tttgcttttgtttgaaa-ctctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 16422387  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16422388 tcttgaaaattgaaaaagtttttgtgtattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtct 16422486  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422487 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 16422534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 20072040 - 20072386
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20072040 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcc 20072139  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072140 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 20072237  T
Q  201 tt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072238 ttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 20072337  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  20072338 tatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 20072386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 18231200 - 18231544
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231200 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagatttgcgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 18231299  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-t 199  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18231300 tttgcttttgttt-aaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 18231398  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  18231399 tttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacagtcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 18231498  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18231499 ttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18231544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20571099 - 20570755
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20571099 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 20571000  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-t 199  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20570999 gttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaataaacatt 20570901  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  20570900 tttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcaagtgtatgttggtgtctat 20570801  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  20570800 ttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtggt 20570755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 48471934 - 48472282
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  48471934 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcacgccctcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagct 48472033  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472034 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 48472132  T
Q  201 ttg-----aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 295  Q
    ||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472133 tttttttaaaaattgaaaactttctgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 48472232  T
Q  296 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  48472233 ctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 48472282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18286607 - 18286264
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286607 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 18286508  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-- 198  Q
    | |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18286507 tgtgcttttgatt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 18286410  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  18286409 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 18286311  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18286310 tttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18286264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18301908 - 18301565
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301908 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 18301809  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-- 198  Q
    | |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18301808 tgtgcttttgatt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 18301711  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  18301710 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 18301612  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18301611 tttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18301565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 5019720 - 5020063
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  5019720 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagct 5019819  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  5019820 tgtgcttttgttt-aaaactctacttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatt 5019917  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019918 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 5020017  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  5020018 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggt 5020063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 28345178 - 28345521
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28345178 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 28345277  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345278 tatgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 28345375  T
Q  201 ttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28345376 ttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttggtgtctat 28345475  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  28345476 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 28345521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11104615 - 11104270
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11104615 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagccacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcc 11104516  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagcta--tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||  |||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11104515 tgtgcttttgtttgaaa-ctctattttctttttactttcaaagctaaatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaaca 11104417  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104416 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 11104317  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  11104316 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 11104270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22865099 - 22864757
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  22865099 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagct 22865000  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatt-tttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    | |||||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864999 tgtgcttttgtttgaaa---ctatgctttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 22864903  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22864902 tttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctat 22864803  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| |||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||    
T  22864802 ttcaatatatgttacaagcgggttctcctccagggtagtctgtggt 22864757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22880158 - 22879816
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  22880158 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagct 22880059  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatt-tttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    | |||||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880058 tgtgcttttgtttgaaa---ctatgctttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 22879962  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22879961 tttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctat 22879862  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| |||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||    
T  22879861 ttcaatatatgttacaagcgggttctcctccagggtagtctgtggt 22879816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17979204 - 17978859
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17979204 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagac 17979105  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979104 tgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 17979006  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17979005 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaaggaaatatgcatgagcgagggtatgttgatgtcta 17978906  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  17978905 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 17978859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6536996 - 6536652
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6536996 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 6536897  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6536896 tgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatt 6536798  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536797 tttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 6536698  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  6536697 ttcaatatatgttacaagcaggttcttctcaaggatagtctgtggt 6536652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 7079229 - 7079578
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7079229 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 7079328  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatata----caaaacattttctttctatt-ttgataatgacaatgcttgaaacaa 195  Q
    | ||||||||| ||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7079329 tgtgcttttgtctgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagctatatatatacaaaacattttctttctattcttgataatgacaatgcttgaaacaa 7079427  T
Q  196 acattttgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 294  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079428 acattttgaaaattaaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 7079527  T
Q  295 tctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  7079528 tctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 7079578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16618746 - 16618399
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618746 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 16618647  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 197  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16618646 tgtgcttttgtttg-aaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaac 16618548  T
Q  198 attttgaaaattg---aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 294  Q
    || ||||||||||   |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16618547 atcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtccattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatg 16618449  T
Q  295 tctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16618448 tctatttcaatatgtgttacaaggaggctcttccccaggatagtctgtgg 16618399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31030491 - 31030154
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31030491 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcc 31030392  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  31030391 tgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatt 31030293  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  31030292 ttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatt 31030199  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31030198 tcaagatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31030154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 18057267 - 18057614
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057267 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 18057366  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaac 197  Q
    |  ||||||||||||||| ||||  |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18057367 ccgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttgataatgacaatgcttgaaacaaac 18057465  T
Q  198 attttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18057466 atcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 18057565  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057566 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 18057614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 6207907 - 6208247
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6207907 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagc 6208006  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaac 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||| |||||||||    
T  6208007 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctatttttaataatgacaaaggctcgaaacaaac 6208106  T
Q  198 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    || ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  6208107 atcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 6208199  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6208200 atttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatggtctgtggt 6208247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 18336635 - 18336973
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18336635 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagc 18336734  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  18336735 ttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattatgataatgataatgctcgaaacaaacat 18336833  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
     ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  18336834 cttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 18336927  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  18336928 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctatggt 18336973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 4727640 - 4727978
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4727640 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 4727739  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaaca 198  Q
    | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  4727740 tgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaaca 4727838  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    | ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  4727839 tcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 4727931  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4727932 tttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatggtctgtggt 4727978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 32445161 - 32445496
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32445161 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 32445260  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  32445261 tgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatatacaaaacattttctttctgttttgataatgataatgctcgaaacaaacatt 32445359  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  32445360 ttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatt 32445451  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  32445452 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 32445496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 19700493 - 19700849
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  19700493 caatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttaagcc 19700592  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-----------cattttctttctattttgataatgacaa-tgctt 188  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||| |||||||           |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19700593 tgtgcttttgtttgaaa-ctctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaaaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgctt 19700691  T
Q  189 gaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 286  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  19700692 gaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgta 19700790  T
Q  287 tgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19700791 tgttggtgtctatttcaatatgtgttacgagcagattcttccccaggatagtctgtggt 19700849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15735348 - 15735009
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735348 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 15735249  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaac 197  Q
    | |||||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| |    
T  15735248 tgtgcttttgtttg-aaactct-gctttcttttactttcaaagttatgtacaaaaacatttcccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagc 15735151  T
Q  198 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    || ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  15735150 atcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 15735057  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  15735056 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15735009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 35886771 - 35887111
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35886771 caatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 35886870  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaa 196  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  35886871 ctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaa 35886969  T
Q  197 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    ||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  35886970 catcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgtgtaacagggtacattcaaacg-aacatacatgagcgagtgtgtgttggtgtc 35887062  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  35887063 tatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 35887111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8283722 - 8283367
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8283722 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagca 8283623  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaac 197  Q
    | || |||||||||||| |||   |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| |    
T  8283622 tgtgtttttgtttgaaa-ctccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagc 8283524  T
Q  198 attttgaaaattgaaaa---------ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 288  Q
    || ||||||||||||||          ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  8283523 atcttgaaaattgaaaaagttttttttttttttttttttttggaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtg 8283424  T
Q  289 ttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  8283423 ttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 8283367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 4689658 - 4689996
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4689658 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 4689757  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaa 196  Q
    || |||||||||||| |||||||   |||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  4689758 ctgtgcttttgtttg-aaactct-gctttcttttactttctaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaa 4689855  T
Q  197 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    ||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |    
T  4689856 catcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcc 4689947  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  4689948 tatttcaatatatgttacaagcagattctcctccaggatagtctgtggt 4689996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 345
Target Start/End: Original strand, 5658145 - 5658482
Alignment:
Q  5 gtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatac--atcaatttgagcctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||     
T  5658145 gtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcaggccttcggctgaccaccactcttatacatatcattttgagcctg 5658244  T
Q  103 tgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5658245 tgcttttgtttg-aaactctattttccttttactttcaacgttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacat 5658343  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
     || |||||||||||  |||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5658344 cttaaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctaagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctat 5658436  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||    ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||    
T  5658437 ttcaacgcatgttacaagcaggttctcctcaaggatagtctgtggt 5658482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15886895 - 15886650
Alignment:
Q  94 ttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttga-taatgacaa-tgcttga 190  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||| ||| |||||||  | |||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||    
T  15886895 ttgagcctgtgtttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaatactttccttctatttttaataatgacaaatgctcga 15886797  T
Q  191 aacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtt 290  Q
    | ||||||| ||||||||||||||  ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  15886796 agcaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtatgtt 15886705  T
Q  291 gatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  15886704 ggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcccggatagtctgtggt 15886650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 15886960 - 15886894
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgt-gaatccgtggagtcatgcctt 65  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  15886960 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaaatccgtggagtcacgcctt 15886894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 8002567 - 8002607
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002567 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 8002607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27623866 - 27623520
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623866 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 27623767  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacatttt-ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623766 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 27623667  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27623666 ttttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtcta 27623567  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623566 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 27623520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13518351 - 13518007
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518351 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 13518252  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518251 tttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 13518152  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518151 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 13518052  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  13518051 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggt 13518007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27284519 - 27284175
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27284519 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 27284420  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284419 tgtgcttttgtttgaaa-ctctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 27284321  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284320 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 27284221  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284220 ttcaatatgtgttacaaacaggctcttccccaggatagtctgtggt 27284175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27356268 - 27355924
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27356268 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 27356169  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356168 tttgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 27356070  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356069 tttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 27355970  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27355969 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27355924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8899856 - 8899512
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899856 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 8899757  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899756 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 8899658  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8899657 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctat 8899558  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  8899557 ttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtggt 8899512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 34458663 - 34458321
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34458663 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 34458564  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34458563 tttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctattttctaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatggttgaaacaaacatt 34458465  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34458464 ttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatt 34458366  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  34458365 tcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 34458321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 4763804 - 4764148
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4763804 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcc 4763903  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763904 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 4764002  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764003 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 4764102  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  4764103 ttcaatatgtgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 4764148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33370588 - 33370244
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33370588 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 33370489  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-t 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33370488 tttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaagcattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 33370390  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33370389 tttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcgaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 33370290  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  33370289 ttcaatatatgttacaagcaggctctcctccaggatagtctgtggt 33370244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 16755861 - 16756206
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  16755861 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagct 16755960  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat- 199  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16755961 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacata 16756059  T
Q  200 -tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756060 ttttgacaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 16756159  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16756160 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 16756206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 27491174 - 27491518
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27491174 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 27491273  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491274 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 27491372  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491373 tttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 27491472  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||    
T  27491473 ttcaatatatgttacaagcaagttctcctccaggatagtctgtggt 27491518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 28166535 - 28166880
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28166535 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcc 28166634  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166635 tttgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 28166733  T
Q  201 tt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166734 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 28166833  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28166834 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28166880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 27063523 - 27063866
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063523 caatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 27063622  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063623 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 27063720  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063721 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 27063820  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27063821 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27063866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26110567 - 26110224
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26110567 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 26110468  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110467 tgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 26110369  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26110368 ttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatt 26110269  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    || |||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  26110268 tccatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 26110224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4539916 - 4539571
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4539916 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 4539817  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct-actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
     | |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539816 ttgtgctgttgtttgaaa-ctctatttttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 4539718  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4539717 ttttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtcta 4539618  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  4539617 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 4539571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 16680180 - 16680525
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  16680180 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgaaaatccgtggagtcacgccgtcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagct 16680279  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680280 tgtgcttttgtttgaaa-ctctattttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 16680378  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680379 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 16680478  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  16680479 tttcaatatgtgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 16680525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26772785 - 26772442
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26772785 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 26772686  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-t 199  Q
    | |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26772685 tgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 26772588  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  26772587 tttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 26772488  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  26772487 ttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 26772442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 29507457 - 29507803
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29507457 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 29507556  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507557 tgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 29507655  T
Q  199 tttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507656 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatggaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 29507755  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  29507756 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 29507803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 26791857 - 26792201
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  26791857 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggaatcacgcctttggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagct 26791956  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791957 tgtgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 26792055  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  26792056 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 26792155  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  26792156 ttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 26792201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 29579056 - 29579399
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579056 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 29579155  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579156 tgtgcttttgtttg-aaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 29579253  T
Q  201 ttg-aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  29579254 ttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 29579353  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  29579354 ttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 29579399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30552157 - 30551813
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30552157 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagac 30552058  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552057 tgtgcttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 30551959  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  30551958 tttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 30551859  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  30551858 ttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30551813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 28213495 - 28213840
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28213495 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 28213594  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
     | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28213595 ttgtgctgttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 28213693  T
Q  200 ttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28213694 ttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtcta 28213793  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  28213794 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 28213840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 29555599 - 29555943
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29555599 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 29555698  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||| ||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555699 tgtgcttttgtctgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 29555797  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555798 ttagaaaattaaaagctttttgtctattttgaaaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 29555897  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  29555898 ttcaatatatgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtggt 29555943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22929040 - 22928694
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22929040 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 22928941  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22928940 tatgcttttgtttgaaa-ctctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 22928842  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22928841 tcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaatagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtct 22928742  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22928741 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 22928694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13293102 - 13292764
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13293102 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 13293003  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  13293002 tgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatc 13292904  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  13292903 ttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagcgtgtgttggtgtctatt 13292809  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  13292808 tcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 13292764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 4778921 - 4779266
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778921 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 4779020  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttc-aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4779021 ttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaaagctgtatacgaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 4779119  T
Q  199 -ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  4779120 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 4779218  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  4779219 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 4779266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 27200227 - 27200571
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27200227 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagc 27200326  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
     | |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200327 ttgtgcttttgatt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 27200424  T
Q  199 tt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27200425 ttcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgt 27200524  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  27200525 atttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccagg-tagtctgtggt 27200571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27249006 - 27248662
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27249006 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagc 27248907  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
     | |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248906 ttgtgcttttgatt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 27248809  T
Q  199 tt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27248808 ttcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgt 27248709  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  27248708 atttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccagg-tagtctgtggt 27248662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16938181 - 16937838
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16938181 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 16938082  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16938081 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaattattttccttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatt 16937984  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16937983 tttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctat 16937884  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  16937883 ttcaatatatgttaccagcaggttctcctccaagataatctgtggt 16937838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 4531329 - 4531673
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  4531329 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcgtgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagct 4531428  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-t 199  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4531429 tgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattctctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 4531527  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | |||||||    
T  4531528 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtgggtgtctat 4531626  T
Q  300 -ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
     |||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  4531627 cttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 4531673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14139551 - 14139213
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  14139551 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagct 14139452  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  14139451 tgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatt 14139353  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139352 ttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacatggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 14139258  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  14139257 tcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggt 14139213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 27013774 - 27014111
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  27013774 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagct 27013873  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27013874 tgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatt 27013972  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013973 ttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 27014066  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  27014067 ttaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggt 27014111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 41 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26666774 - 26666471
Alignment:
Q  41 ttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttca 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  26666774 ttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-cttctactttca 26666677  T
Q  141 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26666676 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaa 26666577  T
Q  240 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 339  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  26666576 cctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtc 26666477  T
Q  340 tgtggt 345  Q
    ||||||    
T  26666476 tgtggt 26666471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 26926809 - 26927137
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26926809 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 26926908  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-t 199  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26926909 tgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 26927006  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||    
T  26927007 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaat---------------gagagtatgttgatgtctat 26927091  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||    
T  26927092 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctctaggatagtctgtggt 26927137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 27031064 - 27031405
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27031064 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 27031163  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaac 197  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  27031164 tgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaac 27031262  T
Q  198 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    || ||||||||||||||  |||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  27031263 atcttgaaaattgaaaaagttt----ttttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 27031357  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27031358 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27031405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 27208945 - 27209285
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27208945 caatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcg 27209044  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaa 195  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| |||||||    
T  27209045 tgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaa 27209143  T
Q  196 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 295  Q
    |||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27209144 acatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgt 27209235  T
Q  296 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27209236 ctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 27209285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27240283 - 27239943
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27240283 caatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcg 27240184  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaa 195  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| |||||||    
T  27240183 tgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaa 27240085  T
Q  196 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 295  Q
    |||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27240084 acatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgt 27239993  T
Q  296 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27239992 ctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 27239943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 24869751 - 24870089
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869751 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 24869850  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaac 197  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  24869851 tgtgcttttgtttg-aaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaac 24869949  T
Q  198 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    || ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  24869950 atcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 24870041  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  24870042 atttcaatatatgttacaagcagtttctcctccaggatagtctgtggt 24870089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 27025186 - 27025526
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025186 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 27025285  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaa 196  Q
    | |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||     
T  27025286 tgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaag 27025384  T
Q  197 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    ||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || || ||||| ||||    
T  27025385 catcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgagacatgcatgagctagtgtgtgttggtgtc 27025477  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27025478 tatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27025526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24299912 - 24299573
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24299912 caatgtatcaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 24299813  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaaca 198  Q
    | |||||||||||| |||||||  |||  || |||| |||||| ||| ||| ||||| ||| | |||| |||| |||||||| |||||| | ||||||||    
T  24299812 tgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactctcaaagttatgtacaaaaacgtttcccttcttttttaataatgacaaatgctcggaacaaaca 24299714  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    | ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||||||    
T  24299713 tcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagtaacagggtacattcaaatg-aacatgcataagcgagtgtgtgttggtgtcta 24299620  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24299619 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24299573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15406686 - 15406346
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15406686 caatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 15406587  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaa 196  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  15406586 ctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaa 15406488  T
Q  197 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    ||| | |||||||| |||   ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15406487 catctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtc 15406395  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||  | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  15406394 tatttcaacgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15406346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15418473 - 15418133
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15418473 caatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 15418374  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaa 196  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  15418373 ctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaa 15418275  T
Q  197 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    ||| | |||||||| |||   ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15418274 catctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtc 15418182  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||  | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  15418181 tatttcaacgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15418133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 20174590 - 20174930
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20174590 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtc 20174689  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc--tactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaacaaa 196  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  20174690 tgtgcttttgtttg-aaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaaa 20174788  T
Q  197 cattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 289  Q
    |||| | |||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    |    
T  20174789 cattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtgcgcat 20174888  T
Q  290 tgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 331  Q
      |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20174889 caatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttcccca 20174930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22161401 - 22161061
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22161401 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtc 22161302  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc--tactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaacaaa 196  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22161301 tgtgcttttgtttg-aaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaaa 22161203  T
Q  197 cattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 289  Q
    |||| | |||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    |    
T  22161202 cattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtgcgcat 22161103  T
Q  290 tgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 331  Q
      |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22161102 caatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttcccca 22161061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 23851485 - 23851450
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23851485 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 23851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20332633 - 20332288
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332633 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 20332534  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332533 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 20332434  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20332433 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 20332334  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  20332333 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 20332288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 40099847 - 40099502
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099847 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 40099748  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099747 tttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 40099648  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40099647 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 40099548  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  40099547 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 40099502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 39856692 - 39857034
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856692 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 39856791  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856792 tttgcttttgttt-aaaactct-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 39856889  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856890 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 39856989  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  39856990 tcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 39857034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27157524 - 27157178
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157524 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 27157425  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157424 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 27157325  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27157324 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtcta 27157225  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27157224 tttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27157178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24586572 - 24586227
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586572 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 24586473  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24586472 ctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataaggacaatgctcgaaacaaacat 24586373  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586372 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaatagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 24586273  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24586272 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24586227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 14104598 - 14104941
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14104598 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 14104697  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14104698 tgtgcttttgttt-aaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacatt 14104796  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14104797 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatt 14104896  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  14104897 tcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 14104941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18794827 - 18794483
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18794827 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 18794728  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794727 tttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 18794629  T
Q  201 -ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18794628 cttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctat 18794529  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18794528 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18794483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 30759819 - 30760161
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30759819 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 30759918  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759919 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 30760016  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30760017 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 30760116  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  30760117 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30760161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33668011 - 33667669
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33668011 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 33667912  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667911 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 33667814  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667813 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 33667714  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  33667713 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33667669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 54839446 - 54839789
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839446 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 54839545  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839546 tgtgcttttgcttgaaa-ctctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 54839643  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839644 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 54839743  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  54839744 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 54839789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 5700595 - 5700939
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700595 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 5700694  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
     | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5700695 ttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacat 5700792  T
Q  200 ttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700793 ttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 5700892  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5700893 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5700939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14753703 - 14753360
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753703 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 14753604  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-- 198  Q
    | |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  14753603 tgtgcttttgatt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 14753506  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  14753505 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 14753407  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  14753406 tttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 14753360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 34183172 - 34182830
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  34183172 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagct 34183073  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-t 199  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34183072 tgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 34182974  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  34182973 tttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 34182876  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  34182875 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtggt 34182830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 5011932 - 5012277
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5011932 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 5012031  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  5012032 ctgtgcttttgttt-aaaactctacttttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttctttctacttggataatggcaatgcttgaaacaaacat 5012130  T
Q  200 ttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5012131 ttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggcacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtcta 5012230  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5012231 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5012277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 21975759 - 21976103
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21975759 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagac 21975858  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    |  |||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975859 tgcgcttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 21975957  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  21975958 tttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 21976057  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  21976058 ttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctatggt 21976103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31120721 - 31120376
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31120721 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagac 31120622  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31120621 tgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 31120523  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  31120522 tttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtcta 31120423  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31120422 tttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31120376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 36338728 - 36338392
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36338728 caatgtaccgccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 36338629  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  36338628 tgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatt 36338530  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  36338529 ttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatt 36338437  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  36338436 tcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 36338392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 24118718 - 24119061
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24118718 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 24118817  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-t 199  Q
    | ||||||||| || ||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24118818 tgtgcttttgtctg-aaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 24118916  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || || |||||||    
T  24118917 tttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaaccggagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgctggtgtctat 24119015  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  24119016 ttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtccgtggt 24119061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 1906307 - 1906656
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1906307 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtatatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtc 1906406  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaa 195  Q
    | ||||||||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||| || |||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1906407 tgtgcttttgtttgaaa-ctctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaagaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaa 1906505  T
Q  196 acattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgat 293  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1906506 acatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgat 1906604  T
Q  294 gtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1906605 gtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccaggatagtctgtggt 1906656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 15233871 - 15234219
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233871 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtagagtcacgccttcggctaaccaccactcttatacatcaatttgagcc 15233970  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15233971 tttgcttttgtttg-aaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaatttctttttatcttgataatgacaatgcttgaagcaaacatc 15234069  T
Q  201 ttgaaaattgaaaa------ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 294  Q
    |||||| |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15234070 ttgaaacttgaaaaagttttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgggcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatg 15234168  T
Q  295 tctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15234169 tctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccaggatagtctgtggt 15234219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15380448 - 15380105
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15380448 caatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcc 15380349  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15380348 tgtgcttttgtttg-aaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 15380250  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    | |||||| |  |||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||     
T  15380249 tcttgaaattaaaaaagtttttgtctgttttg-aaagcaagcctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctt 15380151  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15380150 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 15380105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 6575917 - 6576253
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6575917 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 6576016  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6576017 tgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatt 6576115  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||  |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  6576116 ttgaaaattgaaaaagttt------ctttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatt 6576208  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  6576209 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 6576253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15276842 - 15276495
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15276842 caatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcc 15276743  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15276742 tgtgcttttgtttg-aaactctattttctctctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 15276644  T
Q  199 ttttgaaaattg---aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 295  Q
    | ||||||||||   |||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  15276643 tcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtctgttttg-aaagtaaacttgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgt 15276545  T
Q  296 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15276544 ctatttcaatatgtgttacaaacaggctcttccccaggatagtctgtggt 15276495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 36 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 36324484 - 36324183
Alignment:
Q  36 aagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36324484 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctac 36324386  T
Q  136 tttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      ||||||||||    
T  36324385 tttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaag 36324292  T
Q  236 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggat 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||    
T  36324291 caaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggat 36324193  T
Q  336 agtctgtggt 345  Q
    ||||||||||    
T  36324192 agtctgtggt 36324183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 1673915 - 1674260
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1673915 caatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggtgtcactccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 1674014  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaac 197  Q
    | |||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1674015 tgtgcttttgtttg-aaactctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaaaatattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaac 1674113  T
Q  198 attttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 295  Q
    || ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1674114 atcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttgatgt 1674212  T
Q  296 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1674213 ctatttca--atgtgttacaagcaggttcttccctaggatagtctgtggt 1674260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 17019107 - 17019447
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17019107 caatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 17019206  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttc-aaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaa 196  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  17019207 ctatgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaaagctatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaa 17019305  T
Q  197 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    ||| |||| |||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  17019306 catcttgagaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 17019398  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  17019399 tatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 17019447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 14671071 - 14671412
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14671071 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagttacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 14671170  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaa-aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaa 196  Q
    |  |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  14671171 ccgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaagaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaa 14671269  T
Q  197 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    ||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  14671270 catcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 14671363  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||    
T  14671364 tatttcaatatatgttacaagcaggttctcctctaggatagtctgtggt 14671412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 12080 - 12423
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12080 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 12179  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12180 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatataaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 12278  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12279 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 12378  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  12379 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 12423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 9360666 - 9361009
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9360666 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 9360765  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360766 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 9360864  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360865 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 9360964  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  9360965 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 9361009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28356124 - 28355778
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356124 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 28356025  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctattttt--cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356024 tttgcttttgtttgaaaattctatttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 28355925  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28355924 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtcta 28355825  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28355824 tttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28355778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 31360572 - 31360916
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360572 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 31360671  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360672 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 31360770  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31360771 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 31360870  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31360871 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31360916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31484044 - 31483698
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31484044 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 31483945  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483944 tttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 31483845  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483844 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaaggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 31483745  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31483744 tttcaatatatgttacgagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31483698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 33248410 - 33248753
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33248410 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 33248509  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248510 tgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 33248608  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  33248609 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatt 33248708  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  33248709 tcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33248753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 18796750 - 18797095
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796750 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttataaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 18796849  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796850 ttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 18796948  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796949 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 18797048  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18797049 tttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18797095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 19680493 - 19680835
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19680493 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 19680592  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680593 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 19680690  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19680691 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatt 19680790  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  19680791 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 19680835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 29835367 - 29835710
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29835367 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 29835466  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835467 tgtgcttttgtttgaaaactccatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 29835565  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29835566 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatt 29835665  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  29835666 tcaatatgtgttacgagcaggttctcctccaagataatctgtggt 29835710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 44567025 - 44567371
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44567025 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcc 44567124  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567125 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 44567222  T
Q  201 tt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44567223 ttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtc 44567322  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  44567323 tatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 44567371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 15773618 - 15773962
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  15773618 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagct 15773717  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773718 tgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcagagctatatacaaaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 15773816  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773817 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 15773916  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  15773917 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15773962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 18715524 - 18715870
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18715524 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcc 18715623  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715624 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 18715721  T
Q  201 ttg----aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18715722 tttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgac 18715821  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  18715822 tatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 18715870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12086896 - 12086551
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12086896 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 12086797  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
     | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12086796 ttgtgctgttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 12086698  T
Q  200 ttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12086697 ttttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtcta 12086598  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  12086597 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 12086551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21342343 - 21341998
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21342343 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagc 21342244  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    || ||||| ||||||||| ||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21342243 ctgtgcttctgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaagcat 21342145  T
Q  200 ttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342144 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 21342045  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||    
T  21342044 tttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagaatagtctgtggt 21341998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 33264775 - 33265079
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33264775 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 33264874  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-t 199  Q
    | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  33264875 tgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacgaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatt 33264972  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33264973 tttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcaatgtctat 33265072  T
Q  300 ttcaata 306  Q
    |||||||    
T  33265073 ttcaata 33265079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19911336 - 19910990
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19911336 caatgtaccaccaaccaataaaattacctttttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 19911237  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911236 tgtgcttttgttt-aaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 19911138  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19911137 tcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtct 19911038  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  19911037 atttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagatagtctgtggt 19910990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19202535 - 19202203
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19202535 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 19202436  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||           |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202435 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----------caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 19202348  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  19202347 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctgtt 19202248  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  19202247 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 19202203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22075102 - 22074758
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22075102 caatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcc 22075003  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 197  Q
    |  ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22075002 taggcttttgtttg-aaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 22074904  T
Q  198 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
     | ||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  22074903 ttcttgaaaataaaaaagtttttgtctgttttg-aaagcaagcatgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtct 22074805  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22074804 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccctaggatagtctgtgg 22074758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27603079 - 27602742
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27603079 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttagacatcaatttgagcc 27602980  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaac 197  Q
    | |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  27602979 tgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaac 27602881  T
Q  198 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    || |||||||||||||| ||        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  27602880 atcttgaaaattgaaaagtt--------ttttgaaaagcaaacctgtgcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 27602790  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27602789 atttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27602742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 16260267 - 16260480
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260267 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 16260366  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16260367 tttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatt 16260465  T
Q  201 ttgaaaattgaaaac 215  Q
    |||||||| ||||||    
T  16260466 ttgaaaatcgaaaac 16260480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19655516 - 19655175
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa--ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19655516 caatgtaccaccaaccaataaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtctcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgag 19655417  T
Q  99 cctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaa 195  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19655416 cctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaa 19655318  T
Q  196 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 295  Q
    |||| |||||||||||||| ||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  19655317 acatcttgaaaattgaaaagtttt------ttttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgt 19655225  T
Q  296 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19655224 ctatttcaatatatgttacaagcagactcttccccaggatagtctttggt 19655175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2131434 - 2131096
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2131434 caatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 2131335  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaac 197  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  2131334 tgtgcttttgtttg-aaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaac 2131236  T
Q  198 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    || ||||||||||||||  ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  2131235 atcttgaaaattgaaaaagtt-------ctttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 2131144  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  2131143 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 2131096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 22138950 - 22139288
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22138950 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 22139049  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaa 196  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22139050 ttgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaa 22139148  T
Q  197 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    | | ||||||||||||||  |        ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  22139149 cgtcttgaaaattgaaaaagt--------ttttg-aaagcaaacttgagcaacagggtacattgaaatgaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtc 22139239  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  22139240 tatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 22139288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 19694139 - 19694479
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19694139 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 19694238  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaa 196  Q
    || ||||||||||| |||||||   |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||     
T  19694239 ctgtgcttttgttt-aaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaag 19694337  T
Q  197 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    ||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19694338 catcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 19694430  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||    
T  19694431 tatttcaatatatgttacaagcaagttctcctccaggatagtctgtggt 19694479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 14569200 - 14569542
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569200 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 14569299  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctat-----atacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaac 193  Q
    | |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| |||     | | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||    
T  14569300 tgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaac 14569398  T
Q  194 aaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgat 293  Q
    || ||| ||||||||||||||  ||       ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| |    
T  14569399 aagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaagacaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggt 14569490  T
Q  294 gtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  14569491 gtctatttcaatacatgttacaagcaggttctcctccaggatattctgtggt 14569542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 27809743 - 27810089
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809743 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 27809842  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809843 tttgcttttgtttgaaaactctatttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 27809942  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27809943 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggttacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtcta 27810042  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27810043 tttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27810089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 254852 - 254508
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254852 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 254753  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctat-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254752 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 254653  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  254652 tttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 254554  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  254553 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 254508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37946066 - 37945721
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946066 caatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 37945967  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945966 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 37945867  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37945866 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtaagagtatgttgatgtctat 37945767  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37945766 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 37945721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 12592852 - 12593200
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592852 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 12592951  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-- 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  12592952 tttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 12593051  T
Q  199 --ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12593052 ttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttggaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 12593151  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  12593152 tatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 12593200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 16167520 - 16167864
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167520 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 16167619  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167620 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 16167718  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16167719 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagggtatgttgatgtctat 16167818  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16167819 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 16167864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 12661581 - 12661924
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12661581 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 12661680  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12661681 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatt 12661779  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661780 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 12661879  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  12661880 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 12661924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22922345 - 22921999
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922345 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 22922246  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922245 tttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 22922146  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922145 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 22922046  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  22922045 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 22921999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13930746 - 13930400
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930746 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 13930647  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca- 198  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13930646 tttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 13930547  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13930546 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtcta 13930447  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  13930446 tttcaatatgtgttacgagcaggttctcctccaagatagtctgtggt 13930400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 3788536 - 3788879
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788536 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 3788635  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3788636 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatt 3788734  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3788735 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatt 3788834  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  3788835 tcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 3788879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 39896111 - 39896454
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39896111 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 39896210  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896211 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 39896309  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896310 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 39896409  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  39896410 tcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 39896454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19410686 - 19410340
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410686 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 19410587  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410586 tttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 19410487  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410486 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggataccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 19410387  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  19410386 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 19410340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 37383719 - 37384063
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383719 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 37383818  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383819 ttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 37383917  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383918 tttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 37384017  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37384018 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 37384063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 37931414 - 37931765
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931414 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 37931513  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctattttt------cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaaca 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931514 tttgcttttgtttgaaaactctatttttttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaaca 37931613  T
Q  195 aacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgat 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37931614 aacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaat 37931713  T
Q  294 gtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  37931714 gtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggt 37931765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 27122567 - 27122909
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27122567 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcc 27122666  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122667 tttgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 27122764  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122765 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgagaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 27122864  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27122865 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27122909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 34867725 - 34868068
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34867725 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtagagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 34867824  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867825 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 34867922  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867923 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 34868022  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  34868023 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 34868068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 40239551 - 40239894
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239551 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 40239650  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239651 tttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 40239749  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  40239750 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 40239848  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  40239849 ttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 40239894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9344187 - 9343843
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9344187 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 9344088  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9344087 tgtgcttttgttt-aaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatt 9343989  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343988 tttgaaaattgaaaactttttgtccattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 9343889  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  9343888 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 9343843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 27782274 - 27782618
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27782274 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 27782373  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-t 199  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27782374 gttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 27782472  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27782473 tttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctat 27782572  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27782573 ttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtggt 27782618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39046022 - 39045678
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39046022 caatgtaccactaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 39045923  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39045922 tgtgcttttgttt-aaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttccattttaataatgacaatacttgaaacaaacatt 39045824  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045823 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 39045724  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  39045723 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 39045678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12710801 - 12710457
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12710801 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 12710702  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-- 198  Q
    | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  12710701 tgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 12710604  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  12710603 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtcta 12710504  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  12710503 tttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 12710457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 34160886 - 34161232
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34160886 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 34160985  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34160986 tgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatt 34161084  T
Q  201 tt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161085 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 34161184  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  34161185 atttcaatatatgtcacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 34161232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37680093 - 37679747
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37680093 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 37679994  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37679993 ctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaaca 37679896  T
Q  199 tttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37679895 ttttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 37679796  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37679795 tatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 37679747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37695358 - 37695012
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37695358 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 37695259  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37695258 ctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaaca 37695161  T
Q  199 tttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695160 ttttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 37695061  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37695060 tatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 37695012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 7 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31868979 - 31868642
Alignment:
Q  7 accaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31868979 accaccaaccaataaaattaccatttttcaagcattgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgct 31868880  T
Q  107 tttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaa 205  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31868879 tttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaa 31868782  T
Q  206 aattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31868781 aattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctatttcaat 31868682  T
Q  306 atgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31868681 atatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31868642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16823537 - 16823193
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16823537 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagac 16823438  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823437 tgtgcttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 16823339  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  16823338 tttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 16823239  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16823238 ttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 16823193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 16897943 - 16898287
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16897943 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagac 16898042  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16898043 tgtgcttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 16898141  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  16898142 tttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 16898241  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16898242 ttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 16898287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21671373 - 21671026
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21671373 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 21671274  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21671273 ctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaaca 21671176  T
Q  199 tttt--gaaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 295  Q
    ||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671175 ttttttgaaaattgaaattttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 21671076  T
Q  296 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  21671075 ctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 21671026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 31882329 - 31882672
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31882329 caatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 31882428  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31882429 tgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatt 31882526  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31882527 tttgaaaattaaaaactttttttctattttgaaaagcaaacttgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctat 31882626  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31882627 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31882672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 32055844 - 32056187
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  32055844 caatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaaattgagcc 32055943  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055944 tgtgcttttgttt-aaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 32056041  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32056042 tttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctat 32056141  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  32056142 ttcaatatatgttaccagcaggttctcctccaagataatctgtggt 32056187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11629384 - 11629041
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629384 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 11629285  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca- 198  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  11629284 tgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttttattttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacat 11629187  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  11629186 ttttgaaaattgaaaactctttgtctattttgaaaaacaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 11629088  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  11629087 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 11629041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21697376 - 21697029
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21697376 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 21697277  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaac 197  Q
    | |||||||||||| |||||||| | |  | |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21697276 tgtgcttttgtttg-aaactctactatcttcctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaac 21697178  T
Q  198 attttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 295  Q
    || ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21697177 atcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgt 21697079  T
Q  296 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21697078 ctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccaggatagtctgtggt 21697029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 34297198 - 34297535
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34297198 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 34297297  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34297298 tgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatt 34297396  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    | ||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297397 tcgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 34297490  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  34297491 tcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 34297535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 27396365 - 27396718
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27396365 caatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 27396464  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27396465 tgtgcttttgtttg-aaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatctttataatgacaatgcttgaaacaaaca 27396563  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaa----------ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 288  Q
    | ||||||||||||||           ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27396564 tcttgaaaattgaaaaaaaaaaaaagttttttgtcctttttg-aaagcaaacctaagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatg 27396662  T
Q  289 ttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 344  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27396663 tcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 27396718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 34269121 - 34268782
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  34269121 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattctccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagca 34269022  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaac 197  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  34269021 tgtgcttttgttt-aaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaac 34268923  T
Q  198 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    || || |||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34268922 atcttaaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtct 34268830  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||    
T  34268829 atttcaatatatgttacaagcagattcttctctaggatagtctgtggt 34268782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19450627 - 19450274
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  19450627 caatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggaatcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaattcgagca 19450528  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaa 195  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19450527 tgtgcttttgtttg-aaactctattttctctctactttcaaaggtatgtacaaaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaa 19450429  T
Q  196 acattttgaaaattg------aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 289  Q
    |||| ||||||||||      |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||| ||| ||||||    
T  19450428 acatcttgaaaattgaaaaaaaaaagtttttgtctgttttg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaatgtgcatgagtgagcgtatgt 19450330  T
Q  290 tgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19450329 cgatgtctatttcaatatgtgttataagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 19450274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 28888321 - 28888660
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888321 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 28888420  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaac 197  Q
    | |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  28888421 tgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaac 28888519  T
Q  198 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    || ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  28888520 atcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 28888612  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28888613 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28888660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27428646 - 27428309
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27428646 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 27428547  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaac 197  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  27428546 tgtgcttttgttt-aaaactctattttctttttactttcaaagttatgtgcaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgttcgaaacaaac 27428448  T
Q  198 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    || |||||||||| |||  |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  27428447 atcttgaaaattgcaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtct 27428357  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  27428356 atttcaatatatgttacaagcaggttctcccccaggatagtccgtggt 27428309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23122773 - 23122434
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23122773 caatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgcaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 23122674  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaac 197  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  23122673 ctgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaac 23122575  T
Q  198 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    || ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  23122574 atcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 23122482  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  23122481 atttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 23122434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 20843954 - 20844298
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20843954 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctggacaccactcttatacatcaatttgagc 20844053  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttc-aaagctatat--acaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaaca 194  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||  || ||| ||| |||| ||| |  | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||    
T  20844054 ctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttttaccttcaaaagttatgttcaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaaca 20844152  T
Q  195 aacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 294  Q
    | ||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  20844153 agcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtg 20844247  T
Q  295 tctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  20844248 tctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 20844298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 156 - 345
Target Start/End: Original strand, 23116993 - 23117182
Alignment:
Q  156 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 255  Q
    ||||||| | |||| || || |||||||||||||||  ||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23116993 cattttcctcctatcttcatcatgacaatgcttgaactaacgtttttgaccattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgggcaacagggta 23117092  T
Q  256 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  23117093 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 23117182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 10968711 - 10969056
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968711 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 10968810  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968811 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 10968910  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968911 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 10969010  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||||    
T  10969011 ttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatggtctgtggt 10969056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 3647192 - 3647536
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647192 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 3647291  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647292 tttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 3647391  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647392 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 3647491  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  3647492 tcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 3647536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 10951137 - 10951482
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951137 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 10951236  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951237 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 10951336  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10951337 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctat 10951436  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  10951437 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 10951482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 28591129 - 28591472
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28591129 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 28591228  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591229 tgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 28591327  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28591328 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctatt 28591427  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28591428 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28591472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 51644266 - 51644588
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51644266 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcc 51644365  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644366 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 51644465  T
Q  200 tttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  51644466 tttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtcta 51644565  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcagg 321  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  51644566 tttcaatatatgttacaagcagg 51644588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 28155772 - 28156118
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28155772 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcc 28155871  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155872 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 28155969  T
Q  201 tt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155970 ttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 28156069  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28156070 tatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28156118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 41787521 - 41787175
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787521 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 41787422  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41787421 ttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacat 41787324  T
Q  200 ttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787323 ttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 41787224  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  41787223 tatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 41787175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20334627 - 20334281
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       
T  20334627 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagccttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaat 20334528  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 197  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334527 tgtgcttttgtttgaaa-ctctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 20334429  T
Q  198 attttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20334428 atcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 20334330  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334329 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 20334281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16202245 - 16201893
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16202245 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 16202146  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-----aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaac 193  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||| || |||     ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16202145 tgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagccatgtacaaaaaaaaacattttctttctatttttgataatgacaaatgcttgaaac 16202047  T
Q  194 aaacattttgaaaattgaaaa---ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtt 290  Q
    |||||| ||||||||||||||    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16202046 aaacatcttgaaaattgaaaaagttttttcgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtt 16201948  T
Q  291 gatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16201947 gatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctccaggatagtctgtggt 16201893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 20466823 - 20467175
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466823 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 20466922  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20466923 tgtgcttttgtttg-aaactctactttctttccactttcaaagctatgtacaaaaaccattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaaca 20467021  T
Q  199 ttttgaaaatt--------gaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtt 290  Q
    | || ||||||         |||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  20467022 tcttcaaaattagaaaaaaaaaaagttcctgtctattttg-aaagcaaacctgagcagcaaggtacattcaaacgaaacatgcgtgagcgagtgtatgtt 20467120  T
Q  291 gatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20467121 gatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccatgatagtctgtggt 20467175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21891958 - 21891628
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21891958 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 21891859  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaac 197  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||| | || ||  ||||           ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| |    
T  21891858 tgtgcttttgtttg-aaactctactttcttttttatgttca-----------aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagc 21891771  T
Q  198 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    || ||||||||||||||      || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21891770 atcttgaaaattgaaaa----aagttttttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtcgatgtct 21891676  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  21891675 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 21891628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26679201 - 26678856
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679201 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 26679102  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26679101 tttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacat 26679002  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26679001 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 26678902  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  26678901 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 26678856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 26441294 - 26441639
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26441294 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccgccactcttatacatcaatttgagcc 26441393  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441394 tttgcttttgtttaaaaactccattttttcttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 26441493  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26441494 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctat 26441593  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  26441594 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 26441639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26664009 - 26663664
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26664009 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 26663910  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26663909 tttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacat 26663810  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26663809 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 26663710  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  26663709 ttcaatatgtgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtggt 26663664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4139343 - 4138997
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139343 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 4139244  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139243 tttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 4139144  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4139143 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtcta 4139044  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  4139043 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 4138997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5141431 - 5141086
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141431 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 5141332  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141331 tttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 5141233  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5141232 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtcta 5141133  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5141132 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5141086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24586630 - 24586287
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24586630 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 24586531  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586530 tgtgctttcgttt-aagactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 24586432  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24586431 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatt 24586332  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24586331 tcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24586287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39207235 - 39206891
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39207235 caatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 39207136  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207135 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaatattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 39207037  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39207036 tttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctat 39206937  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  39206936 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 39206891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16745617 - 16745272
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16745617 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 16745518  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-- 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16745517 tttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 16745419  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16745418 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtatattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtcta 16745319  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||    
T  16745318 tttcaatatgtgttacaagcaagttctccttcaggatagtctgtggt 16745272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 5164425 - 5164769
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5164425 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 5164524  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagc-tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5164525 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagcctatatacaaaacattttctttctattttgataataacaatgcttgaaacaaacat 5164623  T
Q  200 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164624 tttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 5164723  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5164724 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5164769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31558490 - 31558146
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31558490 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcc 31558391  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31558390 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatacttgaaacaaacatt 31558292  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558291 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 31558192  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  31558191 ttcaatatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 31558146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 5154125 - 5154468
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5154125 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 5154224  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154225 tgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 5154323  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154324 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 5154423  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5154424 tcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5154468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 26518834 - 26519176
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26518834 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 26518933  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518934 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 26519031  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26519032 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatt 26519131  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  26519132 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 26519176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 45737342 - 45737688
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45737342 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcc 45737441  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737442 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 45737539  T
Q  201 tt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45737540 ttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatatc 45737639  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  45737640 tatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 45737688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26509793 - 26509471
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509793 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 26509694  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26509693 ctgtgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacat 26509594  T
Q  200 tttgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26509593 tttgaaaattgaaaacctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtcta 26509494  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcagg 321  Q
    ||||||||  ||| |||||||||    
T  26509493 tttcaatacatgtcacaagcagg 26509471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 4205431 - 4205774
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4205431 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 4205530  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205531 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 4205628  T
Q  201 ttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4205629 ttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctat 4205728  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  4205729 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 4205774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 42 - 345
Target Start/End: Original strand, 26595750 - 26596055
Alignment:
Q  42 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26595750 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttca 26595849  T
Q  141 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 239  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595850 aagctatatacaacacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 26595949  T
Q  240 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  26595950 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtc 26596049  T
Q  340 tgtggt 345  Q
    ||||||    
T  26596050 tgtggt 26596055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26269185 - 26268837
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269185 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 26269086  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269085 tgtgcttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 26268987  T
Q  200 ttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 295  Q
    |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26268986 tttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 26268887  T
Q  296 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  26268886 ctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 26268837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11418875 - 11418531
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11418875 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcc 11418776  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418775 tgtgcttttgtttgaaa-ctctactttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 11418677  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11418676 tttgaaaattgaaaactttctgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctat 11418577  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  11418576 ttcaatatgtgttacaagcaggtcctcctccaggatagtctgtggt 11418531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 45393260 - 45393604
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  45393260 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagct 45393359  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45393360 tgtgcttttgttt-aaaactctacttttcttctactttcaaagctatacacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatt 45393458  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  45393459 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatggtgatgtccat 45393558  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  45393559 ttcagtatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 45393604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26313943 - 26313601
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26313943 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 26313844  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313843 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 26313746  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26313745 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatt 26313646  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  26313645 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 26313601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16444100 - 16443755
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16444100 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcgcctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 16444001  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16444000 tttgcttttgttt-aaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 16443902  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16443901 tcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcatatgttgatgtct 16443803  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16443802 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 16443755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 11446929 - 11447273
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11446929 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 11447028  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447029 tgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 11447126  T
Q  201 tt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  11447127 tttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaagtgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtcta 11447226  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  11447227 tttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 11447273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 3451359 - 3451704
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3451359 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 3451458  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
      |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451459 ggtgcttttgtttgaaat-tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 3451556  T
Q  201 tt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  3451557 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatggaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtct 3451656  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  3451657 attccaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtatgtggt 3451704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 2160611 - 2160957
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2160611 caatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 2160710  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160711 tgtgcttttgttt-aaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 2160809  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2160810 tcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtct 2160909  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160910 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 2160957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31084719 - 31084374
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31084719 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggttgaccaccactcttatacatcaatttgagc 31084620  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
     | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31084619 ttgtgcttttgtttgaaat-tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacat 31084521  T
Q  200 ttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31084520 ttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtcta 31084421  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  31084420 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 31084374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 16047356 - 16047697
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047356 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 16047455  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16047456 tttgcttttgtttg-aaactctactttctttctactgtcaaagctatgtacaaaa-attttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatc 16047553  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16047554 ctgaaaattgaaaagtttttgtctattttg-aaagcaagcctgagcaacaggatacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatt 16047652  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16047653 tcaatatgtgttacaagcaggttcttccccgggatagtctgtggt 16047697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 2779293 - 2779631
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  2779293 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagct 2779392  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2779393 tgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatt 2779491  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779492 ttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 2779586  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  2779587 tcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggt 2779631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 31129946 - 31130284
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  31129946 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagct 31130045  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  31130046 tgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatt 31130144  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130145 ttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 31130239  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  31130240 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtggt 31130284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 10847624 - 10847970
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10847624 caatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcc 10847723  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 197  Q
    | ||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10847724 tgtgcttttgtctg-aaactctattttctctctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaac 10847822  T
Q  198 attttgaaaattgaaaa---ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 294  Q
    || ||||||||||||||    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  10847823 atcttgaaaattgaaaaaagttttttgtctgttttg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatg 10847921  T
Q  295 tctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10847922 tctatttca--atgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 10847970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10911016 - 10910678
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10911016 caatgtatcactaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 10910917  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaac 197  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| |    
T  10910916 tgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagc 10910818  T
Q  198 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    || ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10910817 atcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacatggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtct 10910726  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  10910725 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 10910678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16512530 - 16512194
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16512530 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttaagcc 16512431  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaac 197  Q
    | |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  16512430 tgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaac 16512332  T
Q  198 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    || |||| ||||| |||  |        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  16512331 atcttgataattggaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 16512240  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 343  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16512239 atttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16512194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 26531966 - 26531926
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26531966 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 26531926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3391 - 3045
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3391 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 3292  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3291 tttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 3192  T
Q  199 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3191 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 3092  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  3091 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 3045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 100 - 345
Target Start/End: Original strand, 17949 - 18196
Alignment:
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17949 ctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 18048  T
Q  198 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18049 attttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 18148  T
Q  298 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18149 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9851 - 9508
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9851 caatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 9752  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9751 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 9653  T
Q  201 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 9553  T
Q  301 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  9552 tcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 9508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9138 - 8795
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9138 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 9039  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9038 tgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatt 8941  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940 tttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 8841  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  8840 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 8795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4816 - 4469
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaa-ccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgag 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816 caatgtaccaccaaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgag 4717  T
Q  99 cctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 197  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4716 cttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 4618  T
Q  198 attttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4617 atcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 4518  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4517 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 4469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 18629 - 18975
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18629 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 18728  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18729 ttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacat 18826  T
Q  200 ttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18827 ttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 18926  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18927 tatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 15613 - 15964
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15613 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 15712  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaaca- 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||     
T  15713 tttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttaaacgatgacaatgctcgaaacaaacat 15811  T
Q  199 -----ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttga 292  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15812 tttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttga 15911  T
Q  293 tgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  15912 tgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 9958 - 10301
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9958 caatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 10057  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10058 tgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 10155  T
Q  201 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10156 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtctat 10255  T
Q  300 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  10256 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 10301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 33341 - 33682
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33341 caatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 33440  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaac 197  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  33441 ctgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaac 33539  T
Q  198 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    || ||||||||||||||  ||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  33540 atcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgtaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 33633  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  33634 tatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 13993 - 14338
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13993 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 14092  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
     | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14093 ttgtgctgttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 14191  T
Q  200 ttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14192 ttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtcta 14291  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  14292 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 14338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 1701 - 2045
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1701 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 1800  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 199  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1801 ctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 1898  T
Q  200 ttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 298  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1899 ttttgaaaattgaaaactttttgtttactttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtcta 1998  T
Q  299 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  1999 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggt 2045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 12090 - 12445
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaattt-gagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12090 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattttgagc 12189  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-----------cattttctttctattttgataatgacaatgctt 188  Q
    || ||||||||||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||| || ||||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12190 ctgtgcttttgtttgaaa-ctctactatctttctactttcaaagctatgtaaaaaaaaaaaaaaaaacatttgctttctattttgataatgacaatgctt 12288  T
Q  189 gaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 287  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12289 gaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagggtat 12387  T
Q  288 gttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12388 gttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttctccaggatagtctgtggt 12445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 25159 - 25510
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25159 caatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 25258  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 197  Q
    |  ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25259 tgcgcttttgtttg-aaactctactttctttctactttcaaagctatgtacgaaaaaacattatctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaac 25357  T
Q  198 attttgaaaattgaaaa-------ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtt 290  Q
    || ||||||||||||||        ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  25358 atcttgaaaattgaaaaaaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtc 25456  T
Q  291 gatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25457 gatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 25510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 6110 - 6451
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  6110 caatgtaccaccaaccagtaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcatattgagc 6209  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatat--acaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaa 195  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||  || ||||||||||| ||| |  | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6210 ctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaa 6308  T
Q  196 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 295  Q
    |||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  6309 acatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgt 6401  T
Q  296 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  6402 ctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 6451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25112 - 24772
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25112 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 25013  T
Q  100 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaa 196  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  25012 ctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaa 24914  T
Q  197 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 296  Q
    ||| |||||||||||||| ||||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  24913 catcttgaaaattgaaaattttt------ttttgaaaagaaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 24821  T
Q  297 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24820 tgtttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 171 - 345
Target Start/End: Original strand, 1 - 175
Alignment:
Q  171 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaac 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaac 99  T
Q  270 atgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 345  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  100 atgcatgagcaagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccctaggatagtctgtggt 175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 421 - 537
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  421 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagct 520  T
Q  101 tttgcttttgtttgaaa 117  Q
    | |||||||||||||||    
T  521 tgtgcttttgtttgaaa 537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 26343 - 26243
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26343 caatgtaccaccaacaaataaaatttccatttttcaagctttgtaaatctgtgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcc 26244  T
Q  101 t 101  Q
    |    
T  26243 t 26243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 40606 - 40495
Alignment:
Q  236 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaa-catgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatat-gtgttacaagcaggctcttccccagg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | |||||    
T  40606 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaataatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacataatgttacaagcaggttctcctccagg 40507  T
Q  334 atagtctgtggt 345  Q
    ||||| ||||||    
T  40506 atagtatgtggt 40495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 40855 - 40729
Alignment:
Q  4 tgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttt-ccaagcttt-gtgaatccgt-ggagtcatgcctttggct-gaccaccactcttatacatcaa-tttga 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  40855 tgtaccaccaaccaataaaaattaccatttttccaagcttttgtaaatccgttggagtcacgccttcggcttgaccaccactcttatacatcaattttga 40756  T
Q  98 gcctttgctttt--gtttgaaaactct 122  Q
    | || |||||||   ||||||||||||    
T  40755 gtctgtgctttttgttttgaaaactct 40729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University