View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1102_low_8 (Length: 361)

Name: NF1102_low_8
Description: NF1102
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1102_low_8
NF1102_low_8
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (1-344)||(27284175-27284519)
chr6 (1-344)||(16755861-16756206)
chr6 (1-344)||(27491174-27491518)
chr6 (1-344)||(27355924-27356268)
chr6 (1-344)||(27623520-27623866)
chr6 (1-344)||(13518007-13518351)
chr6 (1-344)||(28166535-28166880)
chr6 (1-344)||(27063523-27063866)
chr6 (1-344)||(26110224-26110567)
chr6 (1-344)||(16680180-16680525)
chr6 (1-344)||(29507457-29507803)
chr6 (1-344)||(4763804-4764148)
chr6 (1-344)||(4539571-4539916)
chr6 (1-344)||(26772442-26772785)
chr6 (1-344)||(29555599-29555943)
chr6 (1-344)||(34458321-34458663)
chr6 (1-344)||(8899512-8899856)
chr6 (1-344)||(22928694-22929040)
chr6 (1-344)||(28213495-28213840)
chr6 (1-344)||(13292764-13293102)
chr6 (1-344)||(4778921-4779266)
chr6 (1-344)||(33370244-33370588)
chr6 (1-344)||(29579056-29579399)
chr6 (1-344)||(30551813-30552157)
chr6 (1-344)||(27200227-27200571)
chr6 (1-344)||(27248662-27249006)
chr6 (1-344)||(26791857-26792201)
chr6 (1-344)||(14139213-14139551)
chr6 (1-344)||(4531329-4531673)
chr6 (1-344)||(16937838-16938181)
chr6 (1-344)||(27013774-27014111)
chr6 (41-344)||(26666471-26666774)
chr6 (1-344)||(26926809-26927137)
chr6 (1-344)||(27208945-27209285)
chr6 (1-344)||(27239943-27240283)
chr6 (1-344)||(27031064-27031405)
chr6 (1-344)||(24869751-24870089)
chr6 (1-344)||(27025186-27025526)
chr6 (1-344)||(24299573-24299912)
chr6 (1-344)||(15406346-15406686)
chr6 (1-344)||(15418133-15418473)
chr6 (1-330)||(20174590-20174930)
chr6 (1-330)||(22161061-22161401)
chr6 (1-33)||(23851453-23851485)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (1-344)||(11555405-11555748)
chr5 (1-344)||(18369298-18369642)
chr5 (1-344)||(30174516-30174861)
chr5 (1-344)||(33881177-33881521)
chr5 (1-344)||(40467319-40467663)
chr5 (1-344)||(13318594-13318937)
chr5 (1-344)||(3795589-3795934)
chr5 (1-344)||(30158085-30158429)
chr5 (1-344)||(23632020-23632366)
chr5 (1-344)||(28655293-28655638)
chr5 (1-344)||(9544473-9544819)
chr5 (1-344)||(13436440-13436790)
chr5 (1-344)||(6880355-6880699)
chr5 (1-344)||(37665252-37665596)
chr5 (1-344)||(2517116-2517461)
chr5 (1-344)||(18494534-18494877)
chr5 (1-344)||(9323529-9323871)
chr5 (1-344)||(12138228-12138570)
chr5 (1-344)||(24730021-24730365)
chr5 (1-344)||(34622569-34622914)
chr5 (1-344)||(15752624-15752962)
chr5 (1-344)||(37352410-37352754)
chr5 (1-344)||(5643851-5644193)
chr5 (1-344)||(22894467-22894810)
chr5 (1-344)||(31820176-31820518)
chr5 (1-344)||(37746088-37746438)
chr5 (1-344)||(37761033-37761378)
chr5 (1-344)||(8659238-8659582)
chr5 (1-344)||(33522433-33522778)
chr5 (1-344)||(32590042-32590385)
chr5 (1-344)||(13180559-13180899)
chr5 (1-344)||(18122182-18122526)
chr5 (1-344)||(43084309-43084653)
chr5 (1-344)||(11329688-11330034)
chr5 (1-344)||(30035477-30035820)
chr5 (1-344)||(31437515-31437852)
chr5 (1-344)||(41680755-41681100)
chr5 (1-344)||(33298584-33298932)
chr5 (1-344)||(26486448-26486780)
chr5 (1-344)||(28953546-28953890)
chr5 (1-344)||(22992890-22993226)
chr5 (1-344)||(15652526-15652868)
chr5 (1-344)||(25206328-25206679)
chr5 (1-344)||(25270484-25270835)
chr5 (1-344)||(23897925-23898263)
chr5 (1-344)||(33783538-33783877)
chr5 (1-344)||(24608296-24608636)
chr5 (1-344)||(24975900-24976238)
chr5 (1-344)||(30940687-30941025)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (1-344)||(12661581-12661924)
chr2 (1-344)||(39896111-39896454)
chr2 (1-344)||(37383719-37384063)
chr2 (1-344)||(9343843-9344187)
chr2 (1-344)||(22921999-22922345)
chr2 (1-344)||(27809743-27810089)
chr2 (1-344)||(254508-254852)
chr2 (1-344)||(37945721-37946066)
chr2 (1-344)||(34867725-34868068)
chr2 (1-344)||(39045678-39046022)
chr2 (1-344)||(27122567-27122909)
chr2 (1-344)||(34160886-34161232)
chr2 (1-344)||(19410340-19410686)
chr2 (1-344)||(12592852-12593200)
chr2 (7-344)||(31868642-31868979)
chr2 (1-344)||(16167520-16167864)
chr2 (1-344)||(12710457-12710801)
chr2 (1-344)||(13930400-13930746)
chr2 (1-344)||(3788536-3788879)
chr2 (1-344)||(31882329-31882672)
chr2 (1-344)||(16823193-16823537)
chr2 (1-344)||(16897943-16898287)
chr2 (1-344)||(37679747-37680093)
chr2 (1-344)||(37695012-37695358)
chr2 (1-344)||(37931414-37931765)
chr2 (1-344)||(32055844-32056187)
chr2 (1-344)||(11629041-11629384)
chr2 (1-344)||(21671026-21671373)
chr2 (1-344)||(34297198-34297535)
chr2 (1-344)||(21697029-21697376)
chr2 (1-344)||(40239551-40239894)
chr2 (1-344)||(27782274-27782618)
chr2 (1-343)||(27396365-27396718)
chr2 (1-344)||(19450274-19450627)
chr2 (1-344)||(34268782-34269121)
chr2 (1-344)||(28888321-28888660)
chr2 (1-344)||(27428309-27428646)
chr2 (1-344)||(23122434-23122773)
chr2 (1-344)||(20843954-20844298)
chr2 (206-344)||(23117044-23117182)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (1-344)||(5164425-5164769)
chr7 (1-344)||(24586287-24586630)
chr7 (1-344)||(5154125-5154468)
chr7 (1-344)||(4138997-4139343)
chr7 (1-344)||(26518834-26519176)
chr7 (1-344)||(26268837-26269185)
chr7 (1-344)||(45737342-45737688)
chr7 (1-344)||(26678856-26679201)
chr7 (1-344)||(4205431-4205774)
chr7 (1-344)||(11418531-11418875)
chr7 (1-344)||(26441294-26441639)
chr7 (1-344)||(26663664-26664009)
chr7 (1-344)||(31084374-31084719)
chr7 (1-344)||(45393260-45393604)
chr7 (1-344)||(26313601-26313943)
chr7 (1-344)||(5141086-5141431)
chr7 (1-344)||(11446929-11447273)
chr7 (1-344)||(31558146-31558490)
chr7 (1-320)||(26509471-26509793)
chr7 (1-344)||(39206891-39207235)
chr7 (1-344)||(2160611-2160957)
chr7 (1-344)||(16745272-16745617)
chr7 (1-344)||(3451359-3451704)
chr7 (1-344)||(2779293-2779631)
chr7 (1-344)||(16443755-16444100)
chr7 (1-344)||(31129946-31130284)
chr7 (1-344)||(16047356-16047697)
chr7 (42-344)||(26595750-26596055)
chr7 (1-344)||(10847624-10847970)
chr7 (1-344)||(10910678-10911016)
chr7 (1-342)||(16512194-16512530)
chr7 (1-41)||(26531926-26531966)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (1-344)||(9508-9851)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (1-344)||(18796750-18797095)
chr8 (1-344)||(33248410-33248753)
chr8 (1-344)||(9360666-9361009)
chr8 (1-344)||(28355778-28356124)
chr8 (1-344)||(19680493-19680835)
chr8 (1-344)||(15773618-15773962)
chr8 (1-344)||(31483698-31484044)
chr8 (1-344)||(31360572-31360916)
chr8 (1-344)||(44567025-44567371)
chr8 (1-344)||(12086551-12086896)
chr8 (1-344)||(29835367-29835710)
chr8 (1-344)||(18715524-18715870)
chr8 (1-344)||(21341998-21342343)
chr8 (1-305)||(33264775-33265079)
chr8 (1-344)||(19910990-19911336)
chr8 (1-344)||(19202203-19202535)
chr8 (1-343)||(22074758-22075102)
chr8 (1-344)||(19655175-19655516)
chr8 (1-344)||(22138950-22139288)
chr8 (1-344)||(27602742-27603079)
chr8 (1-344)||(2131096-2131434)
chr8 (1-344)||(19694139-19694479)
chr8 (1-344)||(14569200-14569542)
chr8 (1-214)||(16260267-16260480)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (1-344)||(4790542-4790887)
chr3 (1-344)||(5717075-5717420)
chr3 (1-344)||(5727985-5728330)
chr3 (1-344)||(5764038-5764383)
chr3 (1-344)||(47029460-47029805)
chr3 (1-344)||(48471934-48472282)
chr3 (1-344)||(22381490-22381833)
chr3 (1-344)||(29658877-29659221)
chr3 (1-344)||(31958364-31958710)
chr3 (1-344)||(5603222-5603568)
chr3 (1-344)||(24334180-24334526)
chr3 (1-344)||(32296636-32296981)
chr3 (1-344)||(5590270-5590614)
chr3 (1-344)||(10402156-10402499)
chr3 (5-344)||(17970775-17971113)
chr3 (1-344)||(10649078-10649422)
chr3 (1-344)||(22864757-22865099)
chr3 (1-344)||(22879816-22880158)
chr3 (1-344)||(28027298-28027640)
chr3 (1-344)||(20072040-20072386)
chr3 (1-344)||(6536652-6536996)
chr3 (1-344)||(18248745-18249089)
chr3 (1-344)||(16422189-16422534)
chr3 (1-344)||(11104270-11104615)
chr3 (1-344)||(18286264-18286607)
chr3 (1-344)||(18301565-18301908)
chr3 (1-344)||(4340585-4340929)
chr3 (1-344)||(5019720-5020063)
chr3 (1-344)||(7079229-7079578)
chr3 (1-344)||(28109860-28110208)
chr3 (1-344)||(4422925-4423269)
chr3 (1-344)||(5472995-5473338)
chr3 (1-344)||(28345178-28345521)
chr3 (1-344)||(17978859-17979204)
chr3 (1-344)||(51788029-51788373)
chr3 (1-344)||(8217639-8217985)
chr3 (1-343)||(16618399-16618746)
chr3 (1-344)||(29142663-29143010)
chr3 (1-344)||(31030154-31030491)
chr3 (1-344)||(4629792-4630135)
chr3 (1-344)||(21680708-21681051)
chr3 (1-344)||(18231200-18231544)
chr3 (1-344)||(18057267-18057614)
chr3 (1-344)||(18336635-18336973)
chr3 (1-344)||(20570755-20571099)
chr3 (1-344)||(4727640-4727978)
chr3 (1-344)||(32445161-32445496)
chr3 (1-344)||(19700493-19700849)
chr3 (1-344)||(6207907-6208247)
chr3 (1-344)||(15735009-15735348)
chr3 (1-344)||(8283367-8283722)
chr3 (1-344)||(35886771-35887111)
chr3 (1-344)||(4689658-4689996)
chr3 (5-344)||(5658145-5658482)
chr3 (94-344)||(15886650-15886895)
chr3 (1-65)||(15886894-15886960)
chr3 (1-41)||(8002567-8002607)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (1-344)||(14104598-14104941)
chr4 (1-344)||(39856692-39857034)
chr4 (1-344)||(20332288-20332633)
chr4 (1-344)||(40099502-40099847)
chr4 (1-344)||(54839446-54839789)
chr4 (1-344)||(30759819-30760161)
chr4 (1-344)||(33667669-33668011)
chr4 (1-344)||(27157178-27157524)
chr4 (1-344)||(5700595-5700939)
chr4 (1-344)||(24586227-24586572)
chr4 (1-344)||(34182830-34183172)
chr4 (1-344)||(14753360-14753703)
chr4 (1-344)||(18794483-18794827)
chr4 (1-344)||(5011932-5012277)
chr4 (1-344)||(31120376-31120721)
chr4 (1-344)||(36338392-36338728)
chr4 (1-344)||(21975759-21976103)
chr4 (1-344)||(24118718-24119061)
chr4 (1-344)||(1906307-1906656)
chr4 (1-344)||(6575917-6576253)
chr4 (1-343)||(15380105-15380448)
chr4 (1-344)||(15233871-15234219)
chr4 (36-344)||(36324183-36324484)
chr4 (1-344)||(1673915-1674260)
chr4 (1-344)||(15276495-15276842)
chr4 (1-344)||(14671071-14671412)
chr4 (1-344)||(17019107-17019447)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (1-344)||(3647192-3647536)
chr1 (1-344)||(28591129-28591472)
chr1 (1-344)||(10968711-10969056)
chr1 (1-344)||(41787175-41787521)
chr1 (1-344)||(28155772-28156118)
chr1 (1-344)||(20334281-20334627)
chr1 (1-320)||(51644266-51644588)
chr1 (1-344)||(10951137-10951482)
chr1 (1-344)||(16201893-16202245)
chr1 (1-344)||(20466823-20467175)
chr1 (1-344)||(21891628-21891958)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (1-344)||(4469-4816)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-344)||(12080-12423)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-344)||(8795-9138)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (1-344)||(9958-10301)
scaffold0143 (1-344)||(33341-33682)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-344)||(18629-18975)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-344)||(3045-3391)
scaffold0159 (103-344)||(17952-18196)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-344)||(13993-14338)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (1-344)||(1701-2045)
scaffold0322 (1-344)||(12090-12445)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-344)||(15613-15964)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-343)||(25159-25510)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-344)||(6110-6451)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (1-344)||(24772-25112)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (170-344)||(1-175)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (1-120)||(421-540)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (1-99)||(26245-26343)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (235-344)||(40495-40606)
scaffold0099 (4-95)||(40759-40855)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27284519 - 27284175
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284519 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 27284420  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctattttt-cttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27284419 tgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 27284320  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284319 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 27284220  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284219 tcaatatgtgttacaaacaggctcttccccaggatagtctgtggt 27284175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 16755861 - 16756206
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16755861 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagct 16755960  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaac--at 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  16755961 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatat 16756060  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756061 tttgacaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 16756160  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16756161 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 16756206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 27491174 - 27491518
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491174 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 27491273  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27491274 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 27491373  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491374 ttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 27491473  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||    
T  27491474 tcaatatatgttacaagcaagttctcctccaggatagtctgtggt 27491518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27356268 - 27355924
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  27356268 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 27356169  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27356168 tttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 27356069  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356068 ttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 27355969  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27355968 tcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27355924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27623866 - 27623520
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27623866 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 27623767  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagccatatacaaaacatttt-ctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27623766 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 27623667  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27623666 ttttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtcta 27623567  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623566 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 27623520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13518351 - 13518007
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13518351 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 13518252  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13518251 tttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 13518152  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518151 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 13518052  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  13518051 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggt 13518007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 28166535 - 28166880
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  28166535 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcc 28166634  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca--t 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  28166635 tttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 28166734  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166735 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 28166834  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28166835 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28166880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 27063523 - 27063866
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27063523 caatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 27063622  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27063623 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 27063721  T
Q  201 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063722 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 27063821  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27063822 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27063866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26110567 - 26110224
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110567 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 26110468  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26110467 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 26110368  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26110367 tgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctattt 26110268  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    | |||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  26110267 ccatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 26110224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 16680180 - 16680525
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16680180 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgaaaatccgtggagtcacgccgtcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagct 16680279  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctattttt-cttctactttcaaagccatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16680280 tgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 16680379  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680380 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 16680479  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  16680480 ttcaatatgtgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 16680525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 29507457 - 29507803
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507457 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 29507556  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttt--tcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29507557 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 29507656  T
Q  199 ttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507657 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatggaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 29507756  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  29507757 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 29507803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 4763804 - 4764148
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  4763804 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcc 4763903  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4763904 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 4764002  T
Q  200 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764003 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 4764102  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  4764103 ttcaatatgtgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 4764148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4539916 - 4539571
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4539916 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 4539817  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttct-actttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4539816 ttgtgctgttgtttgaaactctatttttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 4539717  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4539716 tttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctat 4539617  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  4539616 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 4539571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26772785 - 26772442
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772785 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 26772686  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  26772685 tgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 26772587  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  26772586 ttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatt 26772487  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  26772486 tcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 26772442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 29555599 - 29555943
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555599 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 29555698  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29555699 tgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 29555798  T
Q  201 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555799 tagaaaattaaaagctttttgtctattttgaaaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 29555898  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  29555899 tcaatatatgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtggt 29555943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 34458663 - 34458321
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  34458663 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 34458564  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34458563 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctattttctaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatggttgaaacaaacatt 34458465  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34458464 ttgaaaattgaaaactttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatt 34458366  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  34458365 tcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 34458321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 8899856 - 8899512
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8899856 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 8899757  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8899756 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 8899658  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8899657 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctat 8899558  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  8899557 ttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtggt 8899512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22929040 - 22928694
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  22929040 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 22928941  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22928940 tatgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 22928841  T
Q  199 tttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22928840 cttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaatagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtcta 22928741  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22928740 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 22928694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 28213495 - 28213840
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28213495 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 28213594  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-t 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  28213595 ttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 28213694  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28213695 tttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctat 28213794  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  28213795 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 28213840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13293102 - 13292764
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293102 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 13293003  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |    
T  13293002 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatct 13292903  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||    
T  13292902 tgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagcgtgtgttggtgtctattt 13292808  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  13292807 caatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 13292764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 4778921 - 4779266
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778921 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 4779020  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc-aaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca- 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  4779021 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaaagctgtatacgaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 4779120  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  4779121 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 4779219  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  4779220 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 4779266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 33370588 - 33370244
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  33370588 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 33370489  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33370488 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaagcattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 33370390  T
Q  200 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33370389 tttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcgaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 33370290  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  33370289 ttcaatatatgttacaagcaggctctcctccaggatagtctgtggt 33370244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 29579056 - 29579399
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29579056 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 29579155  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29579156 tgtgcttttgtttgaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 29579254  T
Q  201 tg-aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  29579255 tgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatt 29579354  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  29579355 tcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 29579399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30552157 - 30551813
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  30552157 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagac 30552058  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30552057 tgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 30551958  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  30551957 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatt 30551858  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  30551857 tcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30551813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 27200227 - 27200571
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27200227 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagc 27200326  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27200327 ttgtgcttttgattaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 27200425  T
Q  199 t-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27200426 tcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgta 27200525  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  27200526 tttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccagg-tagtctgtggt 27200571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27249006 - 27248662
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27249006 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagc 27248907  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27248906 ttgtgcttttgattaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 27248808  T
Q  199 t-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27248807 tcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgta 27248708  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  27248707 tttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccagg-tagtctgtggt 27248662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 26791857 - 26792201
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26791857 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggaatcacgcctttggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagct 26791956  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26791957 tgtgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 26792055  T
Q  200 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  26792056 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 26792155  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  26792156 ttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 26792201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14139551 - 14139213
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14139551 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagct 14139452  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  14139451 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 14139352  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139351 tgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacatggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 14139257  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  14139256 caatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggt 14139213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 4531329 - 4531673
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4531329 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcgtgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagct 4531428  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  4531429 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattctctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 4531528  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat- 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | |||||||     
T  4531529 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtgggtgtctatc 4531627  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  4531628 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 4531673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16938181 - 16937838
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||     
T  16938181 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 16938082  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16938081 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaattattttccttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacattt 16937983  T
Q  201 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16937982 ttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatt 16937883  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  16937882 tcaatatatgttaccagcaggttctcctccaagataatctgtggt 16937838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 27013774 - 27014111
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27013774 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagct 27013873  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  27013874 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 27013973  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013974 tgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 27014067  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
     ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  27014068 taatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggt 27014111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 41 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26666774 - 26666471
Alignment:
Q  41 ttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaa 140  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26666774 ttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaa 26666676  T
Q  141 agccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 239  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26666675 agctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaac 26666576  T
Q  240 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 339  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  26666575 ctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtct 26666476  T
Q  340 gtggt 344  Q
    |||||    
T  26666475 gtggt 26666471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 26926809 - 26927137
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  26926809 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 26926908  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  26926909 tgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 26927007  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||    
T  26927008 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaat---------------gagagtatgttgatgtctatt 26927092  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||    
T  26927093 tcaatatatgttacaagcaggttctcctctaggatagtctgtggt 26927137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 27208945 - 27209285
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27208945 caatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcg 27209044  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta---ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||   |||| |||||||| |||| | ||||||||    
T  27209045 tgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaa 27209144  T
Q  196 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 295  Q
    ||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27209145 catcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtc 27209236  T
Q  296 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27209237 tatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 27209285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27240283 - 27239943
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27240283 caatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcg 27240184  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta---ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||   |||| |||||||| |||| | ||||||||    
T  27240183 tgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaa 27240084  T
Q  196 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 295  Q
    ||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27240083 catcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtc 27239992  T
Q  296 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27239991 tatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 27239943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 27031064 - 27031405
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27031064 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 27031163  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgtttgaaacaaaca 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||  || |||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  27031164 tgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaaca 27031263  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    | ||||||||||||||  |||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  27031264 tcttgaaaattgaaaaagttt----ttttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 27031358  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27031359 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27031405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 24869751 - 24870089
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24869751 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 24869850  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaaca 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  24869851 tgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaaca 24869950  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    | ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  24869951 tcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 24870042  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  24870043 tttcaatatatgttacaagcagtttctcctccaggatagtctgtggt 24870089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 27025186 - 27025526
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27025186 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 27025285  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac--aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaac 196  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||  || |||  ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||| |    
T  27025286 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagc 27025385  T
Q  197 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    || ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || || ||||| |||||    
T  27025386 atcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgagacatgcatgagctagtgtgtgttggtgtct 27025478  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27025479 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27025526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24299912 - 24299573
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24299912 caatgtatcaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 24299813  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgtttgaaacaaacat 198  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||| ||||||  || ||| ||||| ||| | |||| |||| |||||||| |||| | | |||||||||    
T  24299812 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactctcaaagttatgtacaaaaacgtttcccttcttttttaataatgacaaatgctcggaacaaacat 24299713  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
     ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| |||||||    
T  24299712 cttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagtaacagggtacattcaaatg-aacatgcataagcgagtgtgtgttggtgtctat 24299619  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24299618 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24299573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15406686 - 15406346
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15406686 caatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 15406587  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaac 196  Q
     |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  15406586 ctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaac 15406487  T
Q  197 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    || | |||||||| |||   ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15406486 atctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtct 15406394  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||  | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  15406393 atttcaacgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15406346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15418473 - 15418133
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15418473 caatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 15418374  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaac 196  Q
     |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  15418373 ctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaac 15418274  T
Q  197 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    || | |||||||| |||   ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15418273 atctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtct 15418181  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||  | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  15418180 atttcaacgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15418133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 20174590 - 20174930
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20174590 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtc 20174689  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttc--tactttcaaagccatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttg-aaacaaac 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  20174690 tgtgcttttgtttgaaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaaac 20174789  T
Q  197 attttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtt 289  Q
    ||| | |||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    |     
T  20174790 attctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtgcgcatc 20174889  T
Q  290 gatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 330  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20174890 aatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttcccca 20174930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22161401 - 22161061
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22161401 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtc 22161302  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttc--tactttcaaagccatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttg-aaacaaac 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  22161301 tgtgcttttgtttgaaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaaac 22161202  T
Q  197 attttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtt 289  Q
    ||| | |||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    |     
T  22161201 attctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtgcgcatc 22161102  T
Q  290 gatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 330  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22161101 aatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttcccca 22161061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 23851485 - 23851453
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23851485 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 23851453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 11555405 - 11555748
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555405 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 11555504  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11555505 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 11555604  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555605 tgaaaattgaaaacttcttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 11555704  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  11555705 caatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtcggtggt 11555748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18369642 - 18369298
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  18369642 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaacc 18369543  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18369542 ttcgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacatt 18369443  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369442 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 18369343  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18369342 tcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18369298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 30174516 - 30174861
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30174516 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 30174615  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-tcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30174616 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 30174715  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30174716 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 30174815  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  30174816 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30174861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 33881177 - 33881521
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33881177 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 33881276  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33881277 tttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 33881376  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881377 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 33881476  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  33881477 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggt 33881521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 40467663 - 40467319
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467663 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 40467564  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  40467563 tgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacattt 40467464  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467463 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 40467364  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  40467363 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 40467319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13318937 - 13318594
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318937 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 13318838  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13318837 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 13318738  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13318737 tgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctattt 13318638  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  13318637 caatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 13318594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 3795589 - 3795934
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3795589 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 3795688  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaact-ctatttt-tcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3795689 tttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 3795788  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795789 tttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 3795888  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  3795889 ttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 3795934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 30158085 - 30158429
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30158085 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagct 30158184  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  30158185 tgtgcttttgtttaaaactctacctttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 30158284  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30158285 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatt 30158384  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  30158385 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30158429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 23632020 - 23632366
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23632020 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagcttcgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagct 23632119  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  23632120 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatct 23632219  T
Q  201 tgaaaattgaaaa--ctttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23632220 tgaaaattgaaaaagctttttgtctatttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtcta 23632319  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  23632320 tttcaatatgtgttataagccggttctcctccaggatagtctgtggt 23632366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 28655293 - 28655638
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  28655293 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcc 28655392  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  28655393 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttaataatgacaatgctcgaaacaaacattt 28655491  T
Q  201 t--gaaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655492 tttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 28655591  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28655592 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28655638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9544819 - 9544473
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  9544819 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 9544720  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9544719 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 9544621  T
Q  201 t----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544620 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 9544521  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  9544520 atttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggt 9544473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13436790 - 13436440
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436790 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 13436691  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctattttt-cttctactttcaaagccatatacaaaacatttt-ctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  13436690 ttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatggcaacgcttgaaacaaaca 13436591  T
Q  198 tttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 293  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436590 ttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 13436491  T
Q  294 tctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  13436490 tctatttcaatatatattacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 13436440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 6880355 - 6880699
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  6880355 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 6880454  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  6880455 tgtgcttttgtttaagactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 6880554  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  6880555 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatt 6880654  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  6880655 tcaatgtgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 6880699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37665596 - 37665252
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37665596 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 37665497  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  37665496 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 37665397  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  37665396 ttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 37665298  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37665297 ttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtggt 37665252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 2517116 - 2517461
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517116 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccctcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 2517215  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2517216 tgtgcttttgtttgagattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattt 2517314  T
Q  201 t---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2517315 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtcta 2517414  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  2517415 tttcaacgtgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 2517461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18494877 - 18494534
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  18494877 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccaccactctcatacatcaatttgagcc 18494778  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18494777 tttgcttttgtttgaaaactccatttt-cttctactttcaaagctatatacaatttactttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 18494679  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494678 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 18494579  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  18494578 tcaatatgtgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 18494534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 9323529 - 9323871
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  9323529 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 9323628  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9323629 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 9323727  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  9323728 tgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctattt 9323827  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  9323828 caatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 9323871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 12138228 - 12138570
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12138228 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 12138327  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12138328 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 12138426  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12138427 tgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctattt 12138526  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  12138527 caatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 12138570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 24730021 - 24730365
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  24730021 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 24730120  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24730121 tgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 24730219  T
Q  201 t--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  24730220 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 24730319  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  24730320 ttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 24730365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 34622569 - 34622914
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622569 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 34622668  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-t 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |    
T  34622669 ttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatt 34622768  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622769 tttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 34622868  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  34622869 ttcaatatatgttacaagcaggttcttctcaaggatagtctgtggt 34622914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15752962 - 15752624
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752962 caatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 15752863  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15752862 tgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttct----tgataatgacaatacttgaaacaaacattt 15752768  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15752767 tgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctattt 15752668  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  15752667 caatatatgttaccagcaggttctcctccaagataatctgtggt 15752624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37352754 - 37352410
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  37352754 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 37352655  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  37352654 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 37352556  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37352555 tttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctat 37352456  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  37352455 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtggt 37352410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 5643851 - 5644193
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5643851 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 5643950  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  5643951 tgtgcttttgtttgaaactcta-ttttcttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacattt 5644049  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5644050 ttgaaaatcgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctatt 5644148  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  5644149 tcaatatatgttaaaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 5644193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 22894467 - 22894810
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22894467 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 22894566  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  22894567 tttgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaatattttctttctattttgataatgaccatgcttgaaacaaacatct 22894666  T
Q  201 tgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22894667 tgaaaattgaaaaggtttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtatgttgatgtctatt 22894765  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22894766 tcgatatgtgttacaagcagactcttccccaggatagtctgtggt 22894810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31820518 - 31820176
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  31820518 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 31820419  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31820418 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 31820320  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  31820319 tgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaaggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctattt 31820220  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  31820219 caatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 31820176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37746438 - 37746088
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37746438 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 37746339  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  37746338 tttgcttttgtttgaaaactctattttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatt 37746239  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta------tgttgatg 293  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      |||| |||    
T  37746238 ttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttaatgttaatg 37746139  T
Q  294 tctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37746138 tctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 37746088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 37761033 - 37761378
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37761033 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 37761132  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  37761133 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatt 37761231  T
Q  200 tt-gaaaattgaaaactttttgtctatttt-gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761232 tttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggcacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 37761331  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  37761332 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagactgtggt 37761378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 8659582 - 8659238
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  8659582 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattcgccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 8659483  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8659482 tttgtttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 8659384  T
Q  200 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8659383 tttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctat 8659284  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  8659283 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 8659238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 33522433 - 33522778
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  33522433 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagac 33522532  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttt-tcttctactttcaaagccatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33522533 tgtgcttttgtttgaaactctgttttcttttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 33522632  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  33522633 tttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 33522732  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  33522733 ttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33522778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 32590385 - 32590042
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  32590385 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaattcgtggggtcatgcctttggccgactaccactcttatacatcaaattgagcc 32590286  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  32590285 tgtgcttttgtttaaaactctacttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttctttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacattt 32590187  T
Q  201 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590186 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 32590087  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  32590086 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 32590042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13180899 - 13180559
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180899 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 13180800  T
Q  100 ttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
     | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  13180799 ctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacat 13180700  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
     ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180699 cttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 13180605  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  13180604 ttcaatatgtgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtggt 13180559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18122526 - 18122182
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122526 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 18122427  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctat-ttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-t 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  18122426 tgtgcttttgtttaaaactctatttttttttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 18122327  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  18122326 tttgaaaattgagaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 18122228  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  18122227 ttcaatatatgttacaagcagtttctcctccaggatagtctgtggt 18122182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 43084309 - 43084653
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  43084309 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcc 43084408  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43084409 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctattttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 43084507  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43084508 tttgaaagttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctat 43084607  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| | || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  43084608 ttcaatgtatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 43084653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 11329688 - 11330034
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  11329688 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcc 11329787  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagcca--tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11329788 tttgcttttgttttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctaaatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaaca 11329886  T
Q  198 ttttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329887 tttttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 11329986  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  11329987 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 11330034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 30035477 - 30035820
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  30035477 caatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 30035576  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  30035577 tgtgcttttgtttaaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacattt 30035675  T
Q  201 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30035676 ttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatt 30035775  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| |||||| |||||  ||| | ||| |||| ||||||||    
T  30035776 tcaatatatgttaccagcagattctcctccaagataatctgtggt 30035820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 31437515 - 31437852
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31437515 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagct 31437614  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  31437615 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 31437714  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437715 tgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 31437808  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  31437809 caatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggt 31437852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 41680755 - 41681100
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41680755 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcgtgcccttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 41680854  T
Q  101 tgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41680855 tttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 41680954  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  41680955 tttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 41681053  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  41681054 tttcaatttatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 41681100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 33298584 - 33298932
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33298584 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 33298683  T
Q  101 tgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    | |||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33298684 tttgcttttgtttgaaaactccatttttttttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 33298783  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  33298784 ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 33298883  T
Q  296 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  33298884 tatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33298932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 26486448 - 26486780
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  26486448 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 26486547  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||           |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26486548 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-----------caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 26486636  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  26486637 tgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctattt 26486736  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  26486737 caatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 26486780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28953890 - 28953546
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28953890 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 28953791  T
Q  101 tgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-t 198  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  28953790 tttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 28953692  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  28953691 tttgggaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 28953593  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28953592 tttcaatttatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28953546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22993226 - 22992890
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22993226 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 22993127  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||    
T  22993126 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgatgatgctcgaaacaagcattt 22993027  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  22993026 tgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 22992934  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  22992933 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 22992890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15652868 - 15652526
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15652868 caatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 15652769  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  15652768 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 15652669  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||  |||| | | |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  15652668 tgaaaattgaaaaagttttttttttaaaaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 15652570  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  15652569 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15652526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 25206328 - 25206679
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25206328 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 25206427  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgtttgaaacaaac 196  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25206428 ctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaac 25206527  T
Q  197 attttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttga 291  Q
    || ||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25206528 atcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttga 25206626  T
Q  292 tgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||  |||||||    
T  25206627 tgtctatttcaatatgtgttacaagcaaattcttccctaggataaactgtggt 25206679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 25270484 - 25270835
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25270484 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 25270583  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgtttgaaacaaac 196  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25270584 ctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaac 25270683  T
Q  197 attttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttga 291  Q
    || ||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25270684 atcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttga 25270782  T
Q  292 tgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||  |||||||    
T  25270783 tgtctatttcaatatgtgttacaagcaaattcttccctaggataaactgtggt 25270835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 23897925 - 23898263
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23897925 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaattcatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 23898024  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac----aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgtttgaaacaaa 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||| || |||    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  23898025 tgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaacattttctttctattttaataatgacaaatgcttgaaacaaa 23898124  T
Q  196 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 295  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23898125 catcttgaaaattgaaaaagttttg----------aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtc 23898214  T
Q  296 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  23898215 tatttcaatatatgttgcaagcagattcttctccaggatagtctgtggt 23898263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 33783538 - 33783877
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33783538 caatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 33783637  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta--ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaac 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  33783638 tgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctattttttaataatgacaaatgctcgaaacaaac 33783737  T
Q  197 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    || ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  33783738 atcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaaccggagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 33783829  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  33783830 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33783877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 24608296 - 24608636
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24608296 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 24608395  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaac 196  Q
     ||||||||||||||||||||   |||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  24608396 atgtgcttttgtttgaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaac 24608495  T
Q  197 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    || ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || || ||||| |||||    
T  24608496 atcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcaagtgtgtgttggtgtct 24608588  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24608589 atttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24608636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 24975900 - 24976238
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  24975900 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtc 24975999  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaaca 197  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  24976000 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaaca 24976099  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    | |||||||||| |||  |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  24976100 tcttgaaaattggaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 24976191  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  24976192 tttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtatgtggt 24976238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 30940687 - 30941025
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30940687 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagc 30940786  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaac 196  Q
     ||||||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  30940787 ctgtgcttttgtttgaaattctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaac 30940886  T
Q  197 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    || ||||||||||||||  |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  30940887 atcttgaaaattgaaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaaag-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcct 30940977  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  30940978 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30941025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 12661581 - 12661924
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661581 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 12661680  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12661681 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattt 12661780  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661781 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 12661880  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  12661881 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 12661924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 39896111 - 39896454
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896111 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 39896210  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39896211 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 39896310  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896311 tgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 39896410  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  39896411 caatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 39896454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 37383719 - 37384063
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383719 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 37383818  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37383819 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 37383918  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383919 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 37384018  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37384019 tcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 37384063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9344187 - 9343843
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344187 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 9344088  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  9344087 tgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacattt 9343988  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343987 ttgaaaattgaaaactttttgtccattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 9343888  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  9343887 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 9343843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22922345 - 22921999
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22922345 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 22922246  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22922245 tttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 22922146  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922145 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 22922046  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  22922045 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 22921999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 27809743 - 27810089
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27809743 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 27809842  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt--tcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27809843 tttgcttttgtttgaaaactctatttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 27809942  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27809943 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggttacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtcta 27810042  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27810043 tttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27810089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 254852 - 254508
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  254852 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 254753  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  254752 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 254653  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  254652 tttgaaaattgaaaactttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 254554  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  254553 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 254508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37946066 - 37945721
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37946066 caatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 37945967  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37945966 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 37945867  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37945866 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtaagagtatgttgatgtctat 37945767  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37945766 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 37945721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 34867725 - 34868068
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  34867725 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtagagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 34867824  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34867825 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 34867923  T
Q  201 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867924 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 34868023  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  34868024 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 34868068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 39046022 - 39045678
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39046022 caatgtaccactaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 39045923  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||| ||    
T  39045922 tgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttccattttaataatgacaatacttgaaacaaacattt 39045823  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045822 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 39045723  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  39045722 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 39045678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 27122567 - 27122909
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  27122567 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcc 27122666  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27122667 tttgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 27122765  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122766 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgagaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 27122865  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27122866 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27122909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 34160886 - 34161232
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34160886 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 34160985  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca--- 197  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||       
T  34160986 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattt 34161085  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161086 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 34161185  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  34161186 tttcaatatatgtcacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 34161232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19410686 - 19410340
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19410686 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 19410587  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19410586 tttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 19410487  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410486 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggataccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 19410387  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  19410386 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 19410340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 12592852 - 12593200
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12592852 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 12592951  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12592952 tttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 12593051  T
Q  200 tt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 295  Q
    ||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12593052 ttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttggaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 12593151  T
Q  296 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  12593152 tatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 12593200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31868979 - 31868642
Alignment:
Q  7 accaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31868979 accaccaaccaataaaattaccatttttcaagcattgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgct 31868880  T
Q  107 tttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatttt-gaaa 205  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31868879 tttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaa 31868781  T
Q  206 attgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaata 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31868780 attgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctatttcaata 31868681  T
Q  306 tgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31868680 tatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31868642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 16167520 - 16167864
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16167520 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 16167619  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16167620 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 16167718  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16167719 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagggtatgttgatgtctat 16167818  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16167819 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 16167864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12710801 - 12710457
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710801 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 12710702  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12710701 tgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 12710603  T
Q  201 t--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  12710602 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 12710503  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  12710502 ttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 12710457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13930746 - 13930400
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13930746 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 13930647  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13930646 tttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 13930547  T
Q  199 ttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13930546 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtcta 13930447  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  13930446 tttcaatatgtgttacgagcaggttctcctccaagatagtctgtggt 13930400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 3788536 - 3788879
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3788536 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 3788635  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3788636 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatt 3788734  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3788735 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatt 3788834  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  3788835 tcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 3788879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 31882329 - 31882672
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882329 caatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 31882428  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31882429 tgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacattt 31882527  T
Q  201 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31882528 ttgaaaattaaaaactttttttctattttgaaaagcaaacttgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatt 31882627  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31882628 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31882672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16823537 - 16823193
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16823537 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagac 16823438  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16823437 tgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 16823338  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  16823337 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatt 16823238  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16823237 tcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 16823193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 16897943 - 16898287
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16897943 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagac 16898042  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16898043 tgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 16898142  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  16898143 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatt 16898242  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16898243 tcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 16898287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37680093 - 37679747
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37680093 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 37679994  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37679993 ctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacat 37679895  T
Q  199 ttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    |||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37679894 tttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 37679795  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37679794 atttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 37679747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37695358 - 37695012
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37695358 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 37695259  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37695258 ctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacat 37695160  T
Q  199 ttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    |||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695159 tttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 37695060  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37695059 atttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 37695012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 37931414 - 37931765
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37931414 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 37931513  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt------cttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaaca 193  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37931514 tttgcttttgtttgaaaactctatttttttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaaca 37931613  T
Q  194 aacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgat 292  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37931614 aacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaat 37931713  T
Q  293 gtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  37931714 gtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggt 37931765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 32055844 - 32056187
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  32055844 caatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaaattgagcc 32055943  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32055944 tgtgcttttgtttaaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 32056042  T
Q  201 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32056043 ttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatt 32056142  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  32056143 tcaatatatgttaccagcaggttctcctccaagataatctgtggt 32056187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11629384 - 11629041
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11629384 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 11629285  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-t 198  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  11629284 tgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttttattttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatt 11629186  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  11629185 tttgaaaattgaaaactctttgtctattttgaaaaacaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 11629087  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  11629086 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 11629041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21671373 - 21671026
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21671373 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 21671274  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21671273 ctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacat 21671175  T
Q  199 ttt--gaaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 295  Q
    |||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671174 tttttgaaaattgaaattttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 21671075  T
Q  296 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  21671074 tatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 21671026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 34297198 - 34297535
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297198 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 34297297  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  34297298 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 34297397  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
     ||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297398 cgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 34297491  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  34297492 caatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 34297535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21697376 - 21697029
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21697376 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 21697277  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgtttgaaacaaaca 197  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21697276 tgtgcttttgtttgaaactctactatcttcctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaaca 21697177  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 295  Q
    | ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21697176 tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 21697078  T
Q  296 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21697077 tatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccaggatagtctgtggt 21697029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 40239551 - 40239894
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40239551 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 40239650  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40239651 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 40239749  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  40239750 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 40239848  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  40239849 ttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 40239894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 27782274 - 27782618
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  27782274 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 27782373  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
      ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27782374 gttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 27782472  T
Q  200 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27782473 tttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctat 27782572  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27782573 ttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtggt 27782618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 27396365 - 27396718
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27396365 caatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 27396464  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  27396465 tgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatctttataatgacaatgcttgaaacaaacat 27396564  T
Q  199 tttgaaaattgaaaa----------ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 288  Q
     ||||||||||||||           ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  27396565 cttgaaaattgaaaaaaaaaaaaagttttttgtcctttttg-aaagcaaacctaagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgt 27396663  T
Q  289 tgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 343  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27396664 cgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 27396718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19450627 - 19450274
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  19450627 caatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggaatcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaattcgagca 19450528  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  || |||     |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19450527 tgtgcttttgtttgaaactctattttctctctactttcaaaggtatgtacaaaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaa 19450428  T
Q  196 cattttgaaaattg------aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtt 289  Q
    ||| ||||||||||      |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||| ||| ||||||     
T  19450427 catcttgaaaattgaaaaaaaaaagtttttgtctgttttg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaatgtgcatgagtgagcgtatgtc 19450329  T
Q  290 gatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19450328 gatgtctatttcaatatgtgttataagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 19450274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 34269121 - 34268782
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  34269121 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattctccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagca 34269022  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaaca 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  34269021 tgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaaca 34268922  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    | || |||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34268921 tcttaaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtcta 34268829  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||    
T  34268828 tttcaatatatgttacaagcagattcttctctaggatagtctgtggt 34268782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 28888321 - 28888660
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28888321 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 28888420  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaaca 197  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  28888421 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaaca 28888520  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    | ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  28888521 tcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 28888613  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28888614 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28888660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27428646 - 27428309
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27428646 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 27428547  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaaca 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||  || | | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  27428546 tgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagttatgtgcaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgttcgaaacaaaca 27428447  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    | |||||||||| |||  |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27428446 tcttgaaaattgcaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtcta 27428356  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  27428355 tttcaatatatgttacaagcaggttctcccccaggatagtccgtggt 27428309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 23122773 - 23122434
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23122773 caatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgcaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 23122674  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgtttgaaacaaaca 197  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  23122673 ctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaaca 23122574  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    | ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  23122573 tcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 23122481  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  23122480 tttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 23122434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 20843954 - 20844298
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20843954 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctggacaccactcttatacatcaatttgagc 20844053  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc-aaagccatat--acaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaa 194  Q
     |||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||| ||||  || |  | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | |||||||    
T  20844054 ctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttaccttcaaaagttatgttcaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaa 20844153  T
Q  195 acattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 294  Q
     ||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  20844154 gcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgt 20844248  T
Q  295 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  20844249 ctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 20844298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 206 - 344
Target Start/End: Original strand, 23117044 - 23117182
Alignment:
Q  206 attgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaata 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117044 attgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgggcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaata 23117143  T
Q  306 tgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  23117144 tgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 23117182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 5164425 - 5164769
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164425 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 5164524  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagcc-atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5164525 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagcctatatacaaaacattttctttctattttgataataacaatgcttgaaacaaacatt 5164624  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164625 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 5164724  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5164725 tcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5164769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24586630 - 24586287
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  24586630 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 24586531  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24586530 tgtgctttcgtttaagactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 24586431  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24586430 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctattt 24586331  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24586330 caatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24586287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 5154125 - 5154468
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154125 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 5154224  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5154225 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 5154324  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154325 tgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 5154424  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5154425 caatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5154468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4139343 - 4138997
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4139343 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 4139244  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4139243 tttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 4139144  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4139143 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtcta 4139044  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  4139043 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 4138997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 26518834 - 26519176
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  26518834 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 26518933  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26518934 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 26519032  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26519033 tgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctattt 26519132  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  26519133 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 26519176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26269185 - 26268837
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26269185 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 26269086  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26269085 tgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 26268986  T
Q  200 tt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 295  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26268985 ttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 26268886  T
Q  296 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  26268885 tatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 26268837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 45737342 - 45737688
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  45737342 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcc 45737441  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45737442 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 45737540  T
Q  201 t----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45737541 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatatct 45737640  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  45737641 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 45737688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26679201 - 26678856
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26679201 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 26679102  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  26679101 tttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacat 26679002  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26679001 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 26678902  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  26678901 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 26678856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 4205431 - 4205774
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  4205431 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 4205530  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4205531 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 4205629  T
Q  201 tgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4205630 tgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatt 4205729  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  4205730 tcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 4205774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11418875 - 11418531
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  11418875 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcc 11418776  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  11418775 tgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 11418676  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11418675 ttgaaaattgaaaactttctgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatt 11418576  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  11418575 tcaatatgtgttacaagcaggtcctcctccaggatagtctgtggt 11418531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 26441294 - 26441639
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  26441294 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccgccactcttatacatcaatttgagcc 26441393  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26441394 tttgcttttgtttaaaaactccattttttcttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 26441493  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26441494 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctat 26441593  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  26441594 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 26441639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26664009 - 26663664
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26664009 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 26663910  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  26663909 tttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacat 26663810  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26663809 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 26663710  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  26663709 ttcaatatgtgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtggt 26663664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31084719 - 31084374
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31084719 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggttgaccaccactcttatacatcaatttgagc 31084620  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-t 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  31084619 ttgtgcttttgtttgaaattctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatt 31084520  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31084519 tttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctat 31084420  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  31084419 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 31084374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 45393260 - 45393604
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45393260 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagct 45393359  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  45393360 tgtgcttttgtttaaaactctacttttcttctactttcaaagctatacacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacattt 45393459  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  45393460 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatggtgatgtccatt 45393559  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  45393560 tcagtatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 45393604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26313943 - 26313601
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  26313943 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 26313844  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26313843 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 26313745  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  26313744 tgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctattt 26313645  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  26313644 caatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 26313601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5141431 - 5141086
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5141431 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 5141332  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5141331 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 5141233  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5141232 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtcta 5141133  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5141132 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5141086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 11446929 - 11447273
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446929 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 11447028  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11447029 tgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 11447127  T
Q  201 t--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  11447128 ttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaagtgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 11447227  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  11447228 ttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 11447273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31558490 - 31558146
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  31558490 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcc 31558391  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31558390 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatacttgaaacaaacatt 31558292  T
Q  200 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558291 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 31558192  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  31558191 ttcaatatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 31558146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26509793 - 26509471
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509793 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 26509694  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26509693 ctgtgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacat 26509594  T
Q  199 tttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26509593 tttgaaaattgaaaacctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtcta 26509494  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcagg 320  Q
    ||||||||  ||| |||||||||    
T  26509493 tttcaatacatgtcacaagcagg 26509471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 39207235 - 39206891
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  39207235 caatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 39207136  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39207135 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaatattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 39207037  T
Q  200 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39207036 tttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctat 39206937  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  39206936 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 39206891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 2160611 - 2160957
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  2160611 caatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 2160710  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2160711 tgtgcttttgtttaaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 2160810  T
Q  199 tttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2160811 cttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtcta 2160910  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160911 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 2160957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16745617 - 16745272
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  16745617 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 16745518  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16745517 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 16745419  T
Q  200 tt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16745418 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtatattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtcta 16745319  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||    
T  16745318 tttcaatatgtgttacaagcaagttctccttcaggatagtctgtggt 16745272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 3451359 - 3451704
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451359 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 3451458  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
     |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3451459 ggtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 3451557  T
Q  201 t---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  3451558 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatggaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtcta 3451657  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  3451658 ttccaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtatgtggt 3451704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 2779293 - 2779631
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2779293 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagct 2779392  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  2779393 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 2779492  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779493 tgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 2779587  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  2779588 caatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggt 2779631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16444100 - 16443755
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16444100 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcgcctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 16444001  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16444000 tttgcttttgtttaaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 16443901  T
Q  199 tttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16443900 cttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcatatgttgatgtcta 16443802  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16443801 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 16443755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 31129946 - 31130284
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31129946 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagct 31130045  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  31130046 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 31130145  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130146 tgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 31130240  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  31130241 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtggt 31130284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 16047356 - 16047697
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16047356 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 16047455  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||      
T  16047456 tttgcttttgtttgaaactctactttctttctactgtcaaagctatgtacaaaa-attttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcc 16047554  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16047555 tgaaaattgaaaagtttttgtctattttg-aaagcaagcctgagcaacaggatacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctattt 16047653  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16047654 caatatgtgttacaagcaggttcttccccgggatagtctgtggt 16047697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 42 - 344
Target Start/End: Original strand, 26595750 - 26596055
Alignment:
Q  42 tgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttca 139  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26595750 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttca 26595849  T
Q  140 aagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 238  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595850 aagctatatacaacacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 26595949  T
Q  239 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  26595950 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtc 26596049  T
Q  339 tgtggt 344  Q
    ||||||    
T  26596050 tgtggt 26596055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 10847624 - 10847970
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  10847624 caatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcc 10847723  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10847724 tgtgcttttgtctgaaactctattttctctctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 10847823  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaa---ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 294  Q
    | ||||||||||||||    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  10847824 tcttgaaaattgaaaaaagttttttgtctgttttg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgt 10847922  T
Q  295 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10847923 ctatttca--atgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 10847970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10911016 - 10910678
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10911016 caatgtatcactaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 10910917  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaaca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||| ||    
T  10910916 tgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagca 10910817  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    | ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10910816 tcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacatggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtcta 10910725  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  10910724 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 10910678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16512530 - 16512194
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16512530 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttaagcc 16512431  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaaca 197  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  16512430 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaaca 16512331  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    | |||| ||||| |||  |        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  16512330 tcttgataattggaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 16512239  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 342  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16512238 tttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16512194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 26531966 - 26531926
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctt 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26531966 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 26531926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9851 - 9508
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9851 caatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 9752  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9751 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 9652  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9651 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 9552  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  9551 caatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 9508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 18796750 - 18797095
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796750 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttataaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 18796849  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18796850 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 18796949  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796950 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 18797049  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18797050 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18797095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 33248410 - 33248753
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248410 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 33248509  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33248510 tgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 33248609  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  33248610 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctattt 33248709  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  33248710 caatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33248753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 9360666 - 9361009
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  9360666 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 9360765  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9360766 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 9360864  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360865 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 9360964  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  9360965 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 9361009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28356124 - 28355778
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28356124 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 28356025  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa---ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    | |||||||||||||||   || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28356024 tttgcttttgtttgaaaattctatttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 28355925  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28355924 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtcta 28355825  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28355824 tttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28355778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 19680493 - 19680835
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  19680493 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 19680592  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19680593 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 19680691  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19680692 tgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctattt 19680791  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  19680792 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 19680835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 15773618 - 15773962
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15773618 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagct 15773717  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15773718 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcagagctatatacaaaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 15773817  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773818 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 15773917  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  15773918 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15773962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31484044 - 31483698
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31484044 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 31483945  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31483944 tttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 31483845  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483844 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaaggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 31483745  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31483744 tttcaatatatgttacgagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31483698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 31360572 - 31360916
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31360572 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 31360671  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31360672 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 31360770  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31360771 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 31360870  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31360871 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31360916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 44567025 - 44567371
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  44567025 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcc 44567124  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44567125 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 44567223  T
Q  201 t----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44567224 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtct 44567323  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  44567324 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 44567371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12086896 - 12086551
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12086896 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 12086797  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-t 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12086796 ttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 12086697  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12086696 tttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctat 12086597  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  12086596 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 12086551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 29835367 - 29835710
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  29835367 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 29835466  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29835467 tgtgcttttgtttgaaaactccatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 29835565  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29835566 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatt 29835665  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  29835666 tcaatatgtgttacgagcaggttctcctccaagataatctgtggt 29835710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 18715524 - 18715870
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  18715524 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcc 18715623  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18715624 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 18715722  T
Q  201 tg----aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18715723 ttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgact 18715822  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  18715823 atttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 18715870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21342343 - 21341998
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21342343 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagc 21342244  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
     ||||||| |||||||||||||  |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21342243 ctgtgcttctgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaagcatt 21342144  T
Q  200 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342143 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 21342044  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||    
T  21342043 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagaatagtctgtggt 21341998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 33264775 - 33265079
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264775 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 33264874  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  33264875 tgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacgaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacattt 33264973  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33264974 ttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcaatgtctatt 33265073  T
Q  300 tcaata 305  Q
    ||||||    
T  33265074 tcaata 33265079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19911336 - 19910990
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  19911336 caatgtaccaccaaccaataaaattacctttttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 19911237  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19911236 tgtgcttttgtttaaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 19911137  T
Q  199 tttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19911136 cttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtcta 19911037  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  19911036 tttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagatagtctgtggt 19910990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19202535 - 19202203
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  19202535 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 19202436  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||           |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19202435 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-----------caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 19202347  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||    
T  19202346 tgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctgttt 19202247  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  19202246 caatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 19202203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22075102 - 22074758
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  22075102 caatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcc 22075003  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  22075002 taggcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaact 22074903  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    | ||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22074902 tcttgaaaataaaaaagtttttgtctgttttg-aaagcaagcatgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtcta 22074804  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22074803 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccctaggatagtctgtgg 22074758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19655516 - 19655175
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa--ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19655516 caatgtaccaccaaccaataaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtctcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgag 19655417  T
Q  99 cttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaa 195  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  19655416 cctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaa 19655317  T
Q  196 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 295  Q
    ||| |||||||||||||| ||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  19655316 catcttgaaaattgaaaagtttt------ttttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtc 19655224  T
Q  296 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19655223 tatttcaatatatgttacaagcagactcttccccaggatagtctttggt 19655175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 22138950 - 22139288
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22138950 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 22139049  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaac 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  22139050 ttgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaac 22139149  T
Q  197 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
     | ||||||||||||||  |        ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  22139150 gtcttgaaaattgaaaaagt--------ttttg-aaagcaaacttgagcaacagggtacattgaaatgaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtct 22139240  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  22139241 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 22139288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27603079 - 27602742
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  27603079 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttagacatcaatttgagcc 27602980  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaaca 197  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  27602979 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaaca 27602880  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    | |||||||||||||| ||        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  27602879 tcttgaaaattgaaaagtt--------ttttgaaaagcaaacctgtgcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 27602789  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27602788 tttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27602742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 2131434 - 2131096
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2131434 caatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 2131335  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaaca 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  2131334 tgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaaca 2131235  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    | ||||||||||||||  ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  2131234 tcttgaaaattgaaaaagtt-------ctttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 2131143  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  2131142 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 2131096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 19694139 - 19694479
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19694139 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 19694238  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaac 196  Q
     ||||||||||||| ||||||   |||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||| |    
T  19694239 ctgtgcttttgtttaaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagc 19694338  T
Q  197 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    || ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  19694339 atcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 19694431  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||    
T  19694432 atttcaatatatgttacaagcaagttctcctccaggatagtctgtggt 19694479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 14569200 - 14569542
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14569200 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 14569299  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccat-----atacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaaca 193  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||  ||     | | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||    
T  14569300 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaaca 14569399  T
Q  194 aacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 293  Q
    | ||| ||||||||||||||  ||       ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||    
T  14569400 agcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaagacaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtg 14569491  T
Q  294 tctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  14569492 tctatttcaatacatgttacaagcaggttctcctccaggatattctgtggt 14569542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16260267 - 16260480
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16260267 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 16260366  T
Q  101 tgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16260367 tttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatt 16260465  T
Q  200 ttgaaaattgaaaac 214  Q
    |||||||| ||||||    
T  16260466 ttgaaaatcgaaaac 16260480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4790887 - 4790542
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790887 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggattcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 4790788  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4790787 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 4790688  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790687 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 4790588  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  4790587 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 4790542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 5717075 - 5717420
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5717075 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 5717174  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-tcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5717175 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 5717274  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5717275 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 5717374  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5717375 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5717420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 5727985 - 5728330
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5727985 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 5728084  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-tcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5728085 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 5728184  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5728185 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 5728284  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5728285 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5728330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5764383 - 5764038
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5764383 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 5764284  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5764283 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 5764184  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5764183 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 5764084  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5764083 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5764038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 47029460 - 47029805
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47029460 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 47029559  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-tcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47029560 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 47029659  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47029660 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 47029759  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  47029760 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 47029805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 48471934 - 48472282
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48471934 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcacgccctcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagct 48472033  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48472034 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 48472133  T
Q  201 tg-----aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 295  Q
    |      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472134 ttttttaaaaattgaaaactttctgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 48472233  T
Q  296 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  48472234 tatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 48472282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22381833 - 22381490
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381833 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 22381734  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22381733 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 22381634  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  22381633 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagtgtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatt 22381535  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  22381534 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 22381490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29659221 - 29658877
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  29659221 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 29659122  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  29659121 tttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagttatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 29659022  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659021 ttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 29658922  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  29658921 tcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 29658877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31958710 - 31958364
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31958710 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 31958611  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31958610 tttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 31958511  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958510 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 31958411  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31958410 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31958364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5603568 - 5603222
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5603568 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 5603469  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5603468 tttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 5603369  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603368 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaataaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 5603269  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5603268 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5603222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 24334180 - 24334526
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24334180 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 24334279  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24334280 tttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 24334379  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334380 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 24334479  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24334480 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24334526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 32296636 - 32296981
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32296636 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 32296735  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaact-ctatttt-tcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32296736 tttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 32296835  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32296836 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 32296935  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  32296936 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 32296981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5590614 - 5590270
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5590614 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 5590515  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5590514 tgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 5590415  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5590414 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatt 5590315  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  5590314 tcaataggtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctatggt 5590270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 10402156 - 10402499
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10402156 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 10402255  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10402256 tgtgcttttgattaaaattctattttt-ttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattt 10402354  T
Q  201 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402355 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 10402454  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  10402455 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 10402499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 5 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17971113 - 17970775
Alignment:
Q  5 gtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17971113 gtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtg 17971014  T
Q  105 cttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattttgaa 204  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17971013 cttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaa 17970915  T
Q  205 aattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaat 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970914 aattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaat 17970815  T
Q  305 atgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  17970814 atgcgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 17970775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 10649078 - 10649422
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10649078 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 10649177  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10649178 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 10649276  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10649277 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 10649376  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  10649377 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 10649422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22865099 - 22864757
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22865099 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagct 22865000  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22864999 tgtgcttttgtttgaaactatgcttt-cttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 22864901  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22864900 tgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctattt 22864801  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| |||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||    
T  22864800 caatatatgttacaagcgggttctcctccagggtagtctgtggt 22864757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22880158 - 22879816
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22880158 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagct 22880059  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22880058 tgtgcttttgtttgaaactatgcttt-cttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 22879960  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22879959 tgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctattt 22879860  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| |||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||    
T  22879859 caatatatgttacaagcgggttctcctccagggtagtctgtggt 22879816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 28027298 - 28027640
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027298 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcaggcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 28027397  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  28027398 tgtgcttttgtttaaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattt 28027496  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027497 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 28027596  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28027597 caatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28027640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 20072040 - 20072386
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  20072040 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcc 20072139  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20072140 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 20072238  T
Q  201 t----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072239 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 20072338  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  20072339 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 20072386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6536996 - 6536652
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536996 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 6536897  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||    
T  6536896 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 6536797  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536796 ttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 6536697  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  6536696 tcaatatatgttacaagcaggttcttctcaaggatagtctgtggt 6536652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 18248745 - 18249089
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  18248745 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccatcactcttatacatcaagttgagcc 18248844  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  18248845 tttgcttttgtttggaactctatttttcttctactttcaaagctacatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 18248944  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248945 ttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 18249044  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18249045 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18249089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 16422189 - 16422534
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16422189 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 16422288  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16422289 tttgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 16422388  T
Q  199 tttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
     |||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16422389 cttgaaaattgaaaaagtttttgtgtattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtcta 16422487  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422488 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 16422534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11104615 - 11104270
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  11104615 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagccacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcc 11104516  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagcca--tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |  |||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11104515 tgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctaaatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacat 11104416  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104415 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 11104316  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  11104315 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 11104270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18286607 - 18286264
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18286607 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 18286508  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca--t 198  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  18286507 tgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 18286409  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  18286408 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 18286310  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18286309 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18286264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18301908 - 18301565
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18301908 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 18301809  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca--t 198  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  18301808 tgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 18301710  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  18301709 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 18301611  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18301610 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18301565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4340929 - 4340585
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  4340929 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 4340830  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4340829 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 4340731  T
Q  200 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340730 tttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 4340631  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  4340630 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 4340585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 5019720 - 5020063
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5019720 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagct 5019819  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  5019820 tgtgcttttgtttaaaactctacttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacattt 5019918  T
Q  201 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019919 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 5020018  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  5020019 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggt 5020063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 7079229 - 7079578
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079229 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 7079328  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagc----catatacaaaacattttctttctatt-ttgataatgacaatgtttgaaacaaa 195  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7079329 tgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatatatacaaaacattttctttctattcttgataatgacaatgcttgaaacaaa 7079428  T
Q  196 cattttgaaaatt-gaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 294  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079429 cattttgaaaattaaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 7079528  T
Q  295 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  7079529 ctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 7079578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28110208 - 28109860
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28110208 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttatgaatccgtggagtcatgccttgggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 28110109  T
Q  101 tgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaac--- 196  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||       
T  28110108 tttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacgtt 28110009  T
Q  197 -attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 295  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28110008 ttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtc 28109909  T
Q  296 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  28109908 tatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 28109860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 4422925 - 4423269
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  4422925 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcc 4423024  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4423025 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatt 4423123  T
Q  200 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423124 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 4423223  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  4423224 ttcaatatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 4423269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 5472995 - 5473338
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  5472995 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 5473094  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5473095 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 5473193  T
Q  200 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473194 tttgaaaattgaaaactttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 5473292  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5473293 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5473338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 28345178 - 28345521
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  28345178 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 28345277  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28345278 tatgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 28345376  T
Q  201 tgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28345377 tgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttggtgtctatt 28345476  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  28345477 tcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 28345521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17979204 - 17978859
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  17979204 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagac 17979105  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17979104 tgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 17979005  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17979004 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaaggaaatatgcatgagcgagggtatgttgatgtctat 17978905  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  17978904 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 17978859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 51788029 - 51788373
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  51788029 caatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 51788128  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51788129 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaatattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 51788227  T
Q  200 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51788228 tttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctat 51788327  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  51788328 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 51788373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 8217639 - 8217985
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8217639 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtggatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 8217738  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8217739 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacat 8217837  T
Q  199 ttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217838 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 8217937  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  8217938 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 8217985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16618746 - 16618399
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16618746 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 16618647  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16618646 tgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 16618547  T
Q  198 ttttgaaaattg---aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 294  Q
    | ||||||||||   |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16618546 tcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtccattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgt 16618448  T
Q  295 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 343  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16618447 ctatttcaatatgtgttacaaggaggctcttccccaggatagtctgtgg 16618399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29143010 - 29142663
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29143010 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 29142911  T
Q  101 tgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29142910 tttgcttttgtttgaaaactccattttttttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 29142811  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  29142810 tttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 29142711  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  29142710 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 29142663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31030491 - 31030154
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  31030491 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcc 31030392  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  31030391 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 31030292  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  31030291 tgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 31030198  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31030197 caagatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31030154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 4629792 - 4630135
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4629792 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgttaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 4629891  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4629892 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 4629990  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  4629991 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 4630089  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  4630090 ttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 4630135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 21680708 - 21681051
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21680708 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 21680807  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21680808 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 21680906  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  21680907 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 21681005  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  21681006 ttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 21681051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 18231200 - 18231544
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18231200 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagatttgcgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 18231299  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  18231300 tttgcttttgtttaaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 18231399  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  18231400 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacagtcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatt 18231499  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18231500 tcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18231544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 18057267 - 18057614
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057267 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 18057366  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaa-cattttctttctatttt-gataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
      ||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18057367 ccgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 18057466  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18057467 tcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtct 18057566  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057567 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 18057614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 18336635 - 18336973
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18336635 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagc 18336734  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||     
T  18336735 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattatgataatgataatgctcgaaacaaacatc 18336834  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  18336835 ttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatt 18336928  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  18336929 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctatggt 18336973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20571099 - 20570755
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20571099 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 20571000  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
      ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20570999 gttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaataaacatt 20570901  T
Q  200 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  20570900 tttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcaagtgtatgttggtgtctat 20570801  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  20570800 ttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtggt 20570755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 4727640 - 4727978
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4727640 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 4727739  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaacat 198  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||||    
T  4727740 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacat 4727839  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
     ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  4727840 cttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 4727932  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4727933 ttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatggtctgtggt 4727978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 32445161 - 32445496
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445161 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 32445260  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  32445261 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatatacaaaacattttctttctgttttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 32445360  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  32445361 tgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 32445452  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  32445453 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 32445496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 19700493 - 19700849
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||     
T  19700493 caatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttaagcc 19700592  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaa-----------cattttctttctattttgataatgacaa-tgtttg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||||||           |||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  19700593 tgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaaaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttg 19700692  T
Q  189 aaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 286  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19700693 aaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtat 19700791  T
Q  287 gttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19700792 gttggtgtctatttcaatatgtgttacgagcagattcttccccaggatagtctgtggt 19700849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 6207907 - 6208247
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6207907 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagc 6208006  T
Q  100 ttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaac 196  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || | | |||||||||    
T  6208007 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctatttttaataatgacaaaggctcgaaacaaac 6208106  T
Q  197 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    || ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  6208107 atcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 6208199  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6208200 atttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatggtctgtggt 6208247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15735348 - 15735009
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15735348 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 15735249  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaaca 197  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||  || ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||| ||    
T  15735248 tgtgcttttgtttgaaactct-gctttcttttactttcaaagttatgtacaaaaacatttcccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagca 15735150  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    | ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  15735149 tcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtcta 15735056  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  15735055 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15735009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 8283722 - 8283367
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8283722 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagca 8283623  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaaca 197  Q
    |||| |||||||||||||||   |||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||| ||    
T  8283622 tgtgtttttgtttgaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagca 8283523  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaa---------ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 288  Q
    | ||||||||||||||          ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||    
T  8283522 tcttgaaaattgaaaaagttttttttttttttttttttttggaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgt 8283423  T
Q  289 tgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  8283422 tggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 8283367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 35886771 - 35887111
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35886771 caatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 35886870  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaac 196  Q
     |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  35886871 ctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaac 35886970  T
Q  197 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    || ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| || ||||| |||||    
T  35886971 atcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgtgtaacagggtacattcaaacg-aacatacatgagcgagtgtgtgttggtgtct 35887063  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  35887064 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 35887111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 4689658 - 4689996
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4689658 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 4689757  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaac 196  Q
     |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  4689758 ctgtgcttttgtttgaaactct-gctttcttttactttctaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaac 4689856  T
Q  197 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    || ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  4689857 atcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcct 4689948  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  4689949 atttcaatatatgttacaagcagattctcctccaggatagtctgtggt 4689996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 344
Target Start/End: Original strand, 5658145 - 5658482
Alignment:
Q  5 gtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac--atcaatttgagcttg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||    
T  5658145 gtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcaggccttcggctgaccaccactcttatacatatcattttgagcctg 5658244  T
Q  103 tgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |  || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||     
T  5658245 tgcttttgtttgaaactctattttccttttactttcaacgttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatc 5658344  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    || |||||||||||  |||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  5658345 ttaaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctaagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatt 5658437  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||    ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||    
T  5658438 tcaacgcatgttacaagcaggttctcctcaaggatagtctgtggt 5658482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15886895 - 15886650
Alignment:
Q  94 ttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaac-attttctttctattttga-taatgacaa-tgtttgaa 190  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||  || |||||||||||  || |||||||  | |||| ||||||||| | ||||||||| || | |||    
T  15886895 ttgagcctgtgtttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaatactttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaa 15886796  T
Q  191 acaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttg 290  Q
     ||||||| ||||||||||||||  ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15886795 gcaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtatgttg 15886704  T
Q  291 atgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  15886703 gtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcccggatagtctgtggt 15886650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 15886960 - 15886894
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaat-aaaattaccatttttcaagctttgt-gaatccatggagtcacgcctt 65  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15886960 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaaatccgtggagtcacgcctt 15886894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 8002567 - 8002607
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctt 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8002567 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 8002607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 14104598 - 14104941
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104598 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 14104697  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14104698 tgtgcttttgtttaaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattt 14104797  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14104798 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctattt 14104897  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  14104898 caatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 14104941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 39856692 - 39857034
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39856692 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 39856791  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39856792 tttgcttttgtttaaaactct-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 39856890  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856891 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 39856990  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  39856991 caatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 39857034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20332633 - 20332288
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20332633 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 20332534  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20332533 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 20332434  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20332433 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 20332334  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  20332333 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 20332288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 40099847 - 40099502
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40099847 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 40099748  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40099747 tttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 40099648  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40099647 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctat 40099548  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  40099547 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 40099502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 54839446 - 54839789
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54839446 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 54839545  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54839546 tgtgcttttgcttgaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 54839644  T
Q  201 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839645 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 54839744  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  54839745 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 54839789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 30759819 - 30760161
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  30759819 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 30759918  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30759919 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 30760017  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30760018 tgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 30760117  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  30760118 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30760161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 33668011 - 33667669
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  33668011 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 33667912  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33667911 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 33667813  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667812 tgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 33667713  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  33667712 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33667669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27157524 - 27157178
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27157524 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 27157425  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagccatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27157424 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 27157325  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27157324 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtcta 27157225  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27157224 tttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27157178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 5700595 - 5700939
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700595 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 5700694  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5700695 ttgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatt 5700793  T
Q  200 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700794 tttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 5700893  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5700894 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5700939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24586572 - 24586227
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586572 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 24586473  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
     | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  24586472 ctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataaggacaatgctcgaaacaaacat 24586373  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586372 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaatagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 24586273  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24586272 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24586227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 34183172 - 34182830
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34183172 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagct 34183073  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  34183072 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 34182973  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  34182972 ttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatt 34182875  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  34182874 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtggt 34182830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14753703 - 14753360
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14753703 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 14753604  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca--t 198  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  14753603 tgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 14753505  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  14753504 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctat 14753406  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  14753405 ttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 14753360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18794827 - 18794483
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  18794827 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 18794728  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18794727 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 18794629  T
Q  200 -ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18794628 cttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctat 18794529  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18794528 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18794483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 5011932 - 5012277
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5011932 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 5012031  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-t 198  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  5012032 ctgtgcttttgtttaaaactctacttttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttctttctacttggataatggcaatgcttgaaacaaacatt 5012131  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5012132 tttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggcacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctat 5012231  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5012232 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5012277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31120721 - 31120376
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  31120721 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagac 31120622  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31120621 tgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 31120522  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  31120521 ttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctat 31120422  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31120421 ttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31120376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 36338728 - 36338392
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338728 caatgtaccgccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 36338629  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  36338628 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattt 36338529  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  36338528 tgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 36338436  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  36338435 caatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 36338392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 21975759 - 21976103
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  21975759 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagac 21975858  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    || |||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21975859 tgcgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 21975958  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  21975959 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatt 21976058  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  21976059 tcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctatggt 21976103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 24118718 - 24119061
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24118718 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 24118817  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-tt 199  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  24118818 tgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 24118917  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  24118918 ttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaaccggagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgctggtgtctatt 24119016  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  24119017 tcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtccgtggt 24119061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 1906307 - 1906656
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1906307 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtatatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtc 1906406  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatataca----aaacattttctttctattttgataatgac-aatgtttgaaacaaa 195  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1906407 tgtgcttttgtttgaaactctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaagaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaa 1906506  T
Q  196 cattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 293  Q
    ||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1906507 catcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatg 1906605  T
Q  294 tctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1906606 tctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccaggatagtctgtggt 1906656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 6575917 - 6576253
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6575917 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 6576016  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6576017 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattt 6576116  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||  |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  6576117 tgaaaattgaaaaagttt------ctttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctattt 6576209  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  6576210 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 6576253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15380448 - 15380105
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  15380448 caatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcc 15380349  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15380348 tgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 15380249  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
     |||||| |  |||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  15380248 cttgaaattaaaaaagtttttgtctgttttg-aaagcaagcctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtcttt 15380150  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15380149 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 15380105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 15233871 - 15234219
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15233871 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtagagtcacgccttcggctaaccaccactcttatacatcaatttgagcc 15233970  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  15233971 tttgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaatttctttttatcttgataatgacaatgcttgaagcaaacatct 15234070  T
Q  201 tgaaaattgaaaa------ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 294  Q
    ||||| |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15234071 tgaaacttgaaaaagttttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgggcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgt 15234169  T
Q  295 ctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15234170 ctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccaggatagtctgtggt 15234219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 36 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 36324484 - 36324183
Alignment:
Q  36 aagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctact 135  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36324484 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctact 36324385  T
Q  136 ttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||||||||||    
T  36324384 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagc 36324291  T
Q  236 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||||||||    
T  36324290 aaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggata 36324192  T
Q  336 gtctgtggt 344  Q
    |||||||||    
T  36324191 gtctgtggt 36324183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 1673915 - 1674260
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1673915 caatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggtgtcactccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 1674014  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgtttgaaacaaaca 197  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1674015 tgtgcttttgtttgaaactctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaaaatattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaaca 1674114  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 295  Q
    | ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1674115 tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttgatgtc 1674213  T
Q  296 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1674214 tatttca--atgtgttacaagcaggttcttccctaggatagtctgtggt 1674260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15276842 - 15276495
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  15276842 caatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcc 15276743  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15276742 tgtgcttttgtttgaaactctattttctctctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 15276643  T
Q  199 tttgaaaattg---aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 295  Q
     ||||||||||   |||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  15276642 cttgaaaattgaaaaaaagtttttgtctgttttg-aaagtaaacttgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtc 15276544  T
Q  296 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15276543 tatttcaatatgtgttacaaacaggctcttccccaggatagtctgtggt 15276495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 14671071 - 14671412
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14671071 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagttacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 14671170  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaa-aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaac 196  Q
      ||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||  || ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  14671171 ccgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaagaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaac 14671270  T
Q  197 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    || ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  14671271 atcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 14671364  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||    
T  14671365 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctctaggatagtctgtggt 14671412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 17019107 - 17019447
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17019107 caatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 17019206  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc-aaagccatatac-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgtttgaaacaaac 196  Q
     | |||||||||||||||||||  |||  || ||||||| ||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  17019207 ctatgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaaagctatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaac 17019306  T
Q  197 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    || |||| |||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  17019307 atcttgagaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 17019399  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  17019400 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 17019447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 3647192 - 3647536
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3647192 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 3647291  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3647292 tttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 3647391  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647392 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 3647491  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  3647492 tcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 3647536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 28591129 - 28591472
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591129 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 28591228  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28591229 tgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 28591328  T
Q  201 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28591329 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctattt 28591428  T
Q  301 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28591429 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28591472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 10968711 - 10969056
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10968711 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 10968810  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-tcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10968811 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 10968910  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968911 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 10969010  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||||    
T  10969011 ttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatggtctgtggt 10969056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41787521 - 41787175
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787521 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 41787422  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  41787421 ttgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatt 41787323  T
Q  200 tt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787322 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 41787223  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  41787222 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 41787175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 28155772 - 28156118
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  28155772 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcc 28155871  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28155872 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattt 28155970  T
Q  201 t----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155971 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 28156070  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28156071 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28156118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20334627 - 20334281
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  20334627 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagccttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaat 20334528  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20334527 tgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 20334428  T
Q  198 ttttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20334427 tcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtct 20334329  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334328 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 20334281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 51644266 - 51644588
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  51644266 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcc 51644365  T
Q  101 tgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51644366 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 51644465  T
Q  199 tttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  51644466 tttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtcta 51644565  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcagg 320  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  51644566 tttcaatatatgttacaagcagg 51644588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 10951137 - 10951482
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10951137 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 10951236  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-tcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10951237 tttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat 10951336  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10951337 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctat 10951436  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  10951437 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 10951482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16202245 - 16201893
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16202245 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 16202146  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-----aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaaca 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||     ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16202145 tgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagccatgtacaaaaaaaaacattttctttctatttttgataatgacaaatgcttgaaaca 16202046  T
Q  194 aacattttgaaaattgaaaa---ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttg 290  Q
    ||||| ||||||||||||||    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16202045 aacatcttgaaaattgaaaaagttttttcgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttg 16201947  T
Q  291 atgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16201946 atgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctccaggatagtctgtggt 16201893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 20466823 - 20467175
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20466823 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 20466922  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  20466923 tgtgcttttgtttgaaactctactttctttccactttcaaagctatgtacaaaaaccattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacat 20467022  T
Q  199 tttgaaaatt--------gaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttg 290  Q
     || ||||||         |||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20467023 cttcaaaattagaaaaaaaaaaagttcctgtctattttg-aaagcaaacctgagcagcaaggtacattcaaacgaaacatgcgtgagcgagtgtatgttg 20467121  T
Q  291 atgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20467122 atgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccatgatagtctgtggt 20467175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21891958 - 21891628
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21891958 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 21891859  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactcta-tttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaaca 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | || ||  ||||           ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||| ||    
T  21891858 tgtgcttttgtttgaaactctactttcttttttatgttca-----------aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagca 21891770  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    | ||||||||||||||      || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  21891769 tcttgaaaattgaaaa----aagttttttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtcgatgtcta 21891675  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  21891674 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 21891628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4816 - 4469
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaa-ccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgag 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816 caatgtaccaccaaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgag 4717  T
Q  99 cttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4716 cttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 4617  T
Q  198 ttttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4616 tcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtct 4517  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4516 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 4469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 12080 - 12423
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12080 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 12179  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12180 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatataaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 12278  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12279 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 12378  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  12379 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 12423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9138 - 8795
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9138 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 9039  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  9038 tgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacattt 8940  T
Q  201 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8939 ttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 8840  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  8839 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 8795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 9958 - 10301
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  9958 caatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcc 10057  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058 tgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacattt 10156  T
Q  201 t-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10157 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtctatt 10256  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  10257 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 10301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 33341 - 33682
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33341 caatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 33440  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgtttgaaacaaaca 197  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  33441 ctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaaca 33540  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    | ||||||||||||||  ||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  33541 tcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgtaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 33634  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  33635 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 18629 - 18975
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18629 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 18728  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18729 ttgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatt 18827  T
Q  200 tt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18828 tttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 18927  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18928 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3391 - 3045
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3391 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 3292  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3291 tttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 3192  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3191 ttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtcta 3092  T
Q  298 tttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  3091 tttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 3045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 103 - 344
Target Start/End: Original strand, 17952 - 18196
Alignment:
Q  103 tgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17952 tgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 18051  T
Q  200 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18052 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 18151  T
Q  300 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18152 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 13993 - 14338
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13993 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagc 14092  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca-t 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  14093 ttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 14192  T
Q  199 tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14193 tttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctat 14292  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  14293 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 14338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 1701 - 2045
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1701 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 1800  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatt 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1801 ctgtgcttttgtttgaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 1899  T
Q  200 tt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat 298  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1900 tttgaaaattgaaaactttttgtttactttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctat 1999  T
Q  299 ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  2000 ttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggt 2045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 12090 - 12445
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt-gagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12090 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattttgagc 12189  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaa-----------cattttctttctattttgataatgacaatgtttg 188  Q
     |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| || || ||||           ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  12190 ctgtgcttttgtttgaaactctactatctttctactttcaaagctatgtaaaaaaaaaaaaaaaaacatttgctttctattttgataatgacaatgcttg 12289  T
Q  189 aaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 287  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12290 aaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagggtatg 12388  T
Q  288 ttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12389 ttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttctccaggatagtctgtggt 12445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 15613 - 15964
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  15613 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcc 15712  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagccatatacaaaacattttctttctattttgata-atgacaatgtttgaaacaaacat 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||| | |||||||||||    
T  15713 tttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttaaacgatgacaatgctcgaaacaaacat 15811  T
Q  199 ttt------gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttga 291  Q
    |||      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15812 tttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttga 15911  T
Q  292 tgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  15912 tgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 25159 - 25510
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25159 caatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcc 25258  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaaca 197  Q
    || ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25259 tgcgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacgaaaaaacattatctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca 25358  T
Q  198 ttttgaaaattgaaaa-------ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttg 290  Q
    | ||||||||||||||        ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  25359 tcttgaaaattgaaaaaaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcg 25457  T
Q  291 atgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25458 atgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 25510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 6110 - 6451
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  6110 caatgtaccaccaaccagtaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcatattgagc 6209  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatat--acaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaa 195  Q
     |||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||  || |  | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  6210 ctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaa 6309  T
Q  196 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 295  Q
    ||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  6310 catcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 6402  T
Q  296 tatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  6403 tatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 6451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 25112 - 24772
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25112 caatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 25013  T
Q  100 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagccatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgtttgaaacaaac 196  Q
     |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  25012 ctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaac 24913  T
Q  197 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 296  Q
    || |||||||||||||| ||||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  24912 atcttgaaaattgaaaattttt------ttttgaaaagaaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtct 24820  T
Q  297 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24819 gtttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 170 - 344
Target Start/End: Original strand, 1 - 175
Alignment:
Q  170 ttgataatgacaatgtttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaac 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaac 99  T
Q  269 atgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 344  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  100 atgcatgagcaagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccctaggatagtctgtggt 175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 421 - 540
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  421 caatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagct 520  T
Q  101 tgtgcttttgtttgaaactc 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  521 tgtgcttttgtttgaaactc 540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 26343 - 26245
Alignment:
Q  1 caatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26343 caatgtaccaccaacaaataaaatttccatttttcaagctttgtaaatctgtgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagc 26245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 235 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 40606 - 40495
Alignment:
Q  235 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaa-catgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatat-gtgttacaagcaggctcttccccagg 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | |||||    
T  40606 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaataatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacataatgttacaagcaggttctcctccagg 40507  T
Q  333 atagtctgtggt 344  Q
    ||||| ||||||    
T  40506 atagtatgtggt 40495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 40855 - 40759
Alignment:
Q  4 tgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttttc-aagcttt-gtgaatccat-ggagtcacgccttcggct-gaccaccactcttatacatcaattt 95  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40855 tgtaccaccaaccaataaaaattaccatttttccaagcttttgtaaatccgttggagtcacgccttcggcttgaccaccactcttatacatcaattt 40759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University