View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11039_low_18 (Length: 333)

Name: NF11039_low_18
Description: NF11039
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11039_low_18
NF11039_low_18
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (7-331)||(16041155-16041479)
chr7 (7-331)||(16449985-16450309)
chr7 (7-333)||(31088451-31088777)
chr7 (7-333)||(45733290-45733616)
chr7 (35-316)||(16503395-16503679)
chr7 (35-316)||(16518431-16518715)
chr7 (7-178)||(2108992-2109163)
chr7 (7-178)||(26484679-26484850)
chr7 (35-289)||(10916883-10917137)
chr7 (7-178)||(39211010-39211181)
chr7 (7-178)||(2775344-2775515)
chr7 (14-289)||(5127863-5128141)
chr7 (35-289)||(11424791-11425048)
chr7 (15-178)||(18540784-18540947)
chr7 (15-333)||(5159349-5159667)
chr7 (14-292)||(5147334-5147615)
chr7 (35-289)||(2154444-2154701)
chr7 (14-292)||(26435125-26435406)
chr7 (14-289)||(16736454-16736732)
chr7 (14-289)||(16751508-16751786)
chr7 (14-289)||(17529534-17529812)
chr7 (14-289)||(17523403-17523681)
chr7 (35-289)||(4145138-4145395)
chr7 (35-289)||(26319884-26320141)
chr7 (35-289)||(45387214-45387471)
chr7 (35-289)||(26275109-26275366)
chr7 (35-178)||(9618636-9618779)
chr7 (35-154)||(3445315-3445434)
chr7 (35-178)||(26669929-26670072)
chr7 (35-156)||(31564405-31564526)
chr7 (35-289)||(24592556-24592813)
chr7 (35-178)||(31124905-31125048)
chr7 (35-145)||(11441590-11441700)
chr7 (213-289)||(11441431-11441507)
chr7 (35-292)||(26537885-26538148)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (7-331)||(22888310-22888634)
chr5 (7-316)||(25198884-25199193)
chr5 (7-333)||(13184646-13184972)
chr5 (7-333)||(33877085-33877411)
chr5 (7-333)||(13440492-13440818)
chr5 (7-333)||(11325632-11325958)
chr5 (7-316)||(23892058-23892370)
chr5 (7-190)||(29889080-29889263)
chr5 (35-316)||(24969876-24970154)
chr5 (35-289)||(30934515-30934769)
chr5 (14-289)||(23752455-23752733)
chr5 (35-289)||(23718014-23718271)
chr5 (35-316)||(24688183-24688467)
chr5 (35-286)||(11549236-11549490)
chr5 (14-289)||(33777366-33777644)
chr5 (14-289)||(22999119-22999397)
chr5 (15-333)||(33292363-33292681)
chr5 (14-289)||(32599477-32599752)
chr5 (35-289)||(34616400-34616654)
chr5 (14-289)||(9548548-9548826)
chr5 (35-289)||(8665501-8665758)
chr5 (14-289)||(15658765-15659043)
chr5 (35-289)||(15758883-15759140)
chr5 (35-289)||(18375438-18375695)
chr5 (35-289)||(30168348-30168605)
chr5 (35-178)||(2511044-2511187)
chr5 (35-289)||(12132034-12132291)
chr5 (14-288)||(41674589-41674866)
chr5 (14-289)||(6874181-6874462)
chr5 (35-178)||(26480385-26480528)
chr5 (35-289)||(33516235-33516492)
chr5 (14-156)||(37671488-37671630)
chr5 (35-178)||(5637903-5638046)
chr5 (35-178)||(9317444-9317587)
chr5 (35-178)||(30152011-30152154)
chr5 (14-156)||(28649250-28649392)
chr5 (35-145)||(31431466-31431576)
chr5 (35-178)||(28959812-28959955)
chr5 (35-289)||(29967092-29967349)
chr5 (35-154)||(31826433-31826552)
chr5 (35-178)||(37358669-37358812)
chr5 (14-156)||(37770992-37771134)
chr5 (14-289)||(43078128-43078409)
chr5 (35-178)||(30029408-30029551)
chr5 (14-156)||(18500735-18500877)
chr5 (35-156)||(3789556-3789677)
chr5 (35-156)||(37754995-37755116)
chr5 (213-289)||(31431307-31431383)
chr5 (213-292)||(3789402-3789481)
chr5 (213-289)||(18500955-18501031)
chr5 (15-156)||(13324835-13324976)
chr5 (213-289)||(28649105-28649181)
chr5 (213-289)||(37358862-37358938)
chr5 (213-289)||(37671699-37671775)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (7-331)||(15227716-15228040)
chr4 (7-331)||(1900103-1900427)
chr4 (7-333)||(24460706-24461032)
chr4 (7-331)||(15285029-15285353)
chr4 (7-331)||(14235626-14235953)
chr4 (7-333)||(15391439-15391762)
chr4 (14-307)||(17013867-17014163)
chr4 (35-289)||(24592443-24592697)
chr4 (35-289)||(14664903-14665160)
chr4 (14-292)||(14763412-14763693)
chr4 (15-333)||(24112506-24112824)
chr4 (15-333)||(34189069-34189387)
chr4 (14-289)||(6569738-6570016)
chr4 (14-292)||(36344623-36344901)
chr4 (35-289)||(14098426-14098683)
chr4 (35-289)||(27163446-27163703)
chr4 (35-289)||(31126647-31126904)
chr4 (14-333)||(54833231-54833550)
chr4 (14-289)||(5005755-5006036)
chr4 (35-156)||(18800742-18800863)
chr4 (35-154)||(30753777-30753896)
chr4 (120-289)||(21969586-21969758)
chr4 (14-154)||(33673906-33674046)
chr4 (35-178)||(40105767-40105910)
chr4 (233-333)||(19373102-19373202)
chr4 (213-289)||(18800932-18801008)
chr4 (213-289)||(30753627-30753703)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (7-331)||(21703254-21703578)
chr2 (7-333)||(27118513-27118839)
chr2 (7-333)||(34303393-34303719)
chr2 (7-333)||(34156836-34157162)
chr2 (7-331)||(19456511-19456835)
chr2 (7-333)||(3784479-3784805)
chr2 (7-333)||(16163424-16163750)
chr2 (35-333)||(31891446-31891744)
chr2 (7-316)||(27434534-27434846)
chr2 (7-330)||(27392818-27393120)
chr2 (35-316)||(23128684-23128968)
chr2 (35-289)||(28882080-28882337)
chr2 (35-316)||(12655381-12655665)
chr2 (35-307)||(20837766-20838041)
chr2 (35-289)||(21677300-21677557)
chr2 (14-289)||(34279315-34279593)
chr2 (14-289)||(11635283-11635564)
chr2 (14-286)||(34286223-34286498)
chr2 (14-286)||(34291283-34291558)
chr2 (14-289)||(11641472-11641753)
chr2 (57-289)||(13936684-13936919)
chr2 (14-289)||(22926125-22926403)
chr2 (35-289)||(37925359-37925616)
chr2 (35-289)||(16829456-16829713)
chr2 (35-289)||(16891768-16892025)
chr2 (35-289)||(31876147-31876404)
chr2 (35-289)||(32049664-32049921)
chr2 (14-292)||(37375024-37375305)
chr2 (35-289)||(37686027-37686284)
chr2 (35-289)||(37701292-37701549)
chr2 (7-154)||(40233515-40233662)
chr2 (35-178)||(34861660-34861803)
chr2 (158-289)||(261009-261140)
chr2 (35-289)||(19416617-19416874)
chr2 (35-178)||(39890054-39890197)
chr2 (14-145)||(260850-260981)
chr2 (57-178)||(12716742-12716863)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (7-333)||(2759-3085)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (7-333)||(20340436-20340762)
chr1 (7-296)||(16208132-16208418)
chr1 (14-331)||(20460935-20461228)
chr1 (7-178)||(28151845-28152016)
chr1 (14-289)||(41793416-41793694)
chr1 (35-289)||(10962539-10962796)
chr1 (35-178)||(28584964-28585107)
chr1 (14-178)||(51638201-51638365)
[»] chr6 (55 HSPs)
chr6 (7-333)||(13522117-13522443)
chr6 (7-333)||(33374300-33374626)
chr6 (7-333)||(8892354-8892680)
chr6 (7-333)||(8903589-8903915)
chr6 (7-333)||(28162483-28162809)
chr6 (7-331)||(22477317-22477644)
chr6 (7-202)||(22456978-22457176)
chr6 (9-292)||(20160568-20160851)
chr6 (9-292)||(22171980-22172263)
chr6 (7-190)||(27290414-27290597)
chr6 (7-316)||(22934924-22935233)
chr6 (7-316)||(23857369-23857678)
chr6 (7-178)||(14143329-14143500)
chr6 (7-178)||(26787925-26788096)
chr6 (7-178)||(27196298-27196469)
chr6 (7-178)||(27252771-27252942)
chr6 (35-289)||(24304690-24304947)
chr6 (35-316)||(13299023-13299307)
chr6 (35-316)||(15424389-15424673)
chr6 (35-289)||(26988868-26989125)
chr6 (35-289)||(26999940-27000197)
chr6 (14-333)||(29549301-29549620)
chr6 (14-289)||(16749721-16749999)
chr6 (35-316)||(24863557-24863841)
chr6 (14-289)||(26918247-26918525)
chr6 (35-289)||(4525156-4525410)
chr6 (14-289)||(27044257-27044532)
chr6 (7-253)||(27272624-27272876)
chr6 (35-178)||(29572994-29573137)
chr6 (35-289)||(30558088-30558345)
chr6 (158-289)||(27629907-27630038)
chr6 (35-156)||(4773009-4773130)
chr6 (35-289)||(29501273-29501539)
chr6 (35-154)||(3696086-3696205)
chr6 (35-178)||(26777687-26777830)
chr6 (35-145)||(4545847-4545957)
chr6 (35-145)||(4724206-4724316)
chr6 (35-145)||(28207468-28207578)
chr6 (35-156)||(4757767-4757888)
chr6 (14-154)||(16674144-16674284)
chr6 (35-178)||(27485110-27485253)
chr6 (14-156)||(27007730-27007872)
chr6 (35-289)||(16944099-16944356)
chr6 (35-178)||(27360064-27360207)
chr6 (35-178)||(27450407-27450550)
chr6 (35-156)||(26116482-26116603)
chr6 (14-154)||(34463397-34463537)
chr6 (57-156)||(17025280-17025379)
chr6 (213-289)||(3695930-3696006)
chr6 (213-289)||(4546037-4546113)
chr6 (213-289)||(4724396-4724472)
chr6 (213-289)||(17025129-17025205)
chr6 (213-289)||(26777880-26777956)
chr6 (213-289)||(27007579-27007655)
chr6 (213-289)||(28207309-28207385)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (7-331)||(16626648-16626972)
chr3 (7-333)||(17993926-17994252)
chr3 (7-333)||(4625734-4626060)
chr3 (7-331)||(18530186-18530504)
chr3 (7-333)||(5652177-5652503)
chr3 (35-333)||(15892876-15893177)
chr3 (35-333)||(8301437-8301735)
chr3 (35-333)||(5713014-5713315)
chr3 (35-333)||(5723924-5724225)
chr3 (35-333)||(5757252-5757553)
chr3 (35-333)||(5768143-5768444)
chr3 (7-178)||(32292697-32292868)
chr3 (7-178)||(31034259-31034430)
chr3 (35-316)||(8295779-8296060)
chr3 (14-333)||(22387727-22388046)
chr3 (35-316)||(18051066-18051350)
chr3 (35-289)||(4796823-4797080)
chr3 (14-289)||(29148904-29149182)
chr3 (35-289)||(35880597-35880854)
chr3 (35-289)||(18330505-18330757)
chr3 (15-333)||(4893000-4893318)
chr3 (14-292)||(18277201-18277482)
chr3 (14-292)||(18292502-18292783)
chr3 (14-292)||(18307803-18308084)
chr3 (15-333)||(32438944-32439262)
chr3 (14-289)||(4721462-4721740)
chr3 (14-289)||(6192147-6192425)
chr3 (35-289)||(17985126-17985383)
chr3 (14-289)||(4346836-4347111)
chr3 (14-333)||(8211528-8211847)
chr3 (14-286)||(10395970-10396242)
chr3 (57-289)||(20065877-20066109)
chr3 (35-289)||(5466816-5467073)
chr3 (35-289)||(7996393-7996650)
chr3 (35-289)||(10642901-10643158)
chr3 (14-289)||(28021109-28021384)
chr3 (35-289)||(15741264-15741509)
chr3 (14-289)||(7073043-7073321)
chr3 (35-289)||(47023284-47023541)
chr3 (14-289)||(28116103-28116384)
chr3 (14-289)||(5609471-5609749)
chr3 (14-289)||(31964622-31964900)
chr3 (14-289)||(50134220-50134498)
chr3 (35-156)||(6542632-6542753)
chr3 (14-178)||(21674638-21674802)
chr3 (14-178)||(28339247-28339411)
chr3 (35-178)||(18225136-18225279)
chr3 (14-178)||(4416864-4417028)
chr3 (35-154)||(36997247-36997366)
chr3 (35-289)||(5596527-5596793)
chr3 (35-289)||(5013543-5013800)
chr3 (14-154)||(11110498-11110638)
chr3 (35-178)||(18242684-18242827)
chr3 (213-292)||(29665336-29665415)
chr3 (14-154)||(48465896-48466036)
chr3 (14-157)||(22871005-22871148)
chr3 (14-157)||(22886064-22886207)
chr3 (35-178)||(24328104-24328247)
chr3 (35-94)||(51782052-51782111)
chr3 (213-289)||(11110712-11110788)
chr3 (43-94)||(51797141-51797192)
chr3 (57-178)||(20577039-20577160)
chr3 (213-289)||(6542825-6542901)
chr3 (213-289)||(36997440-36997516)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (7-333)||(9354451-9354777)
chr8 (7-333)||(19659099-19659425)
chr8 (7-333)||(44562930-44563256)
chr8 (7-316)||(16283292-16283604)
chr8 (7-333)||(22080938-22081261)
chr8 (35-289)||(27608993-27609250)
chr8 (7-178)||(33244649-33244820)
chr8 (35-316)||(2137347-2137631)
chr8 (35-289)||(14557497-14557751)
chr8 (35-316)||(16277397-16277681)
chr8 (35-333)||(19687924-19688225)
chr8 (14-333)||(18710412-18710734)
chr8 (14-289)||(31354394-31354672)
chr8 (35-289)||(31489838-31490095)
chr8 (14-333)||(19286291-19286610)
chr8 (14-289)||(19674308-19674589)
chr8 (35-289)||(19208448-19208705)
chr8 (35-289)||(28362043-28362300)
chr8 (35-156)||(3329595-3329716)
chr8 (35-156)||(12092812-12092933)
chr8 (35-178)||(33258707-33258850)
chr8 (34-156)||(29829328-29829450)
chr8 (213-289)||(3329788-3329864)
chr8 (213-289)||(19518412-19518488)
chr8 (213-289)||(29829183-29829259)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (7-331)||(20240-20543)
scaffold0124 (35-316)||(30296-30579)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (7-190)||(129-312)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (7-333)||(21393-21716)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (35-308)||(29614-29890)
scaffold0089 (35-308)||(40198-40474)
scaffold0089 (35-289)||(47114-47371)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (35-316)||(27135-27419)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (35-289)||(258-516)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (7-92)||(2018-2103)
scaffold0415 (14-94)||(6080-6160)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (35-289)||(15059-15316)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (35-289)||(7368-7625)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (35-289)||(9195-9452)
scaffold0159 (35-178)||(19999-20142)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (42-178)||(26338-26474)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (14-186)||(9542-9714)
scaffold0336 (179-289)||(8102-8212)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (35-145)||(7966-8076)
scaffold0038 (213-289)||(7807-7883)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16041479 - 16041155
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041479 gatggaaatcacactttaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 16041380  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041379 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 16041280  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16041279 acgacggaattaacgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggt 16041180  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcatt 331  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  16041179 acgacggaggtaactgggcagcatt 16041155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 16449985 - 16450309
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449985 gatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 16450084  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16450085 cgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttgagctggtggctgttgttgcacttgctga 16450184  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16450185 acgacggcattaatgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcgtacgggt 16450284  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcatt 331  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  16450285 acgacggaggtaactgggcagcatt 16450309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Original strand, 31088451 - 31088777
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31088451 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 31088550  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  31088551 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 31088650  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31088651 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 31088750  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  31088751 acgacggaggtagctgagcagcattga 31088777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 45733616 - 45733290
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45733616 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 45733517  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
       |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  45733516 taagagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 45733417  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45733416 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 45733317  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  45733316 acgacggaggtagctgagcagcattga 45733290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 316
Target Start/End: Original strand, 16503395 - 16503679
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  16503395 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 16503494  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| || ||| | |  |||||||||||||||||||    
T  16503495 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgag 16503594  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 316  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||    
T  16503595 gttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggagg 16503679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 316
Target Start/End: Original strand, 16518431 - 16518715
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  16518431 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 16518530  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| || ||| | |  |||||||||||||||||||    
T  16518531 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgag 16518630  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 316  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||    
T  16518631 gttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggagg 16518715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 2108992 - 2109163
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2108992 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 2109091  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2109092 cgggagcaactcagcatatatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 2109163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26484850 - 26484679
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484850 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 26484751  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26484750 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 26484679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 10916883 - 10917137
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  10916883 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 10916982  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggtt 234  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||| ||||| |||||||    
T  10916983 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggtt 10917082  T
Q  235 gacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10917083 gacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgaga 10917137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 39211010 - 39211181
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39211010 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaagcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 39211109  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  39211110 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgcggtcgttgttg 39211181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2775515 - 2775344
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775515 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 2775416  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||||||  |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||    
T  2775415 cgggagctactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttg 2775344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5128141 - 5127863
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  5128141 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggattaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 5128042  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |    
T  5128041 aactcagcatacaacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 5127942  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  5127941 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 5127863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 11424791 - 11425048
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  11424791 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtgcaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 11424890  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  11424891 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 11424990  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11424991 gttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 11425048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18540947 - 18540784
Alignment:
Q  15 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 114  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18540947 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagca 18540848  T
Q  115 actcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18540847 actcagcatatagcattggtatcagaggaaaagtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 18540784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5159667 - 5159349
Alignment:
Q  15 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 114  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  5159667 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 5159568  T
Q  115 actcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggc 214  Q
     ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||    
T  5159567 gctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 5159468  T
Q  215 attaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacgga 314  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||     
T  5159467 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 5159368  T
Q  315 ggtagctgagcagcattga 333  Q
    || | ||||||||||||||    
T  5159367 ggaaactgagcagcattga 5159349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Original strand, 5147334 - 5147615
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  5147334 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 5147433  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||  ||   |||||||| ||| || ||  | |    
T  5147434 aactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgttgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 5147533  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 292  Q
      ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5147534 ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 5147615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2154701 - 2154444
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||    
T  2154701 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggt 2154602  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||| |||||||||| ||||  |||||||   |||||||  |   ||||||||  || || ||| | |  |||||||||| ||| ||||    
T  2154601 atcggagggaaagtatgtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccagcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattaacggatacttgag 2154502  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  2154501 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 2154444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 26435406 - 26435125
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  26435406 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 26435307  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    |  || |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| ||| || ||  | |    
T  26435306 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 26435207  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 292  Q
      ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26435206 ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 26435125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Original strand, 16736454 - 16736732
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  16736454 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 16736553  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |    
T  16736554 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 16736653  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16736654 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 16736732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Original strand, 16751508 - 16751786
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  16751508 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 16751607  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |    
T  16751608 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 16751707  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16751708 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 16751786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Original strand, 17529534 - 17529812
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  17529534 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 17529633  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |    
T  17529634 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 17529733  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17529734 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 17529812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17523681 - 17523403
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  17523681 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 17523582  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |    
T  17523581 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 17523482  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17523481 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 17523403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 4145138 - 4145395
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  4145138 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 4145237  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  | || ||||| |  || ||| ||| |||||| || || |||||||    
T  4145238 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgag 4145337  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    |||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4145338 gttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4145395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 26319884 - 26320141
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  26319884 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 26319983  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| || | |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  26319984 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 26320083  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  26320084 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 26320141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 45387471 - 45387214
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  45387471 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 45387372  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  45387371 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 45387272  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  45387271 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 45387214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 26275109 - 26275366
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  26275109 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 26275208  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  26275209 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 26275308  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  26275309 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 26275366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9618779 - 9618636
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  9618779 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 9618680  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  9618679 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 9618636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3445434 - 3445315
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||    
T  3445434 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 3445335  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtct 154  Q
    ||  ||||||| || |||||    
T  3445334 ataggaggaaaagttggtct 3445315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Original strand, 26669929 - 26670072
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  26669929 gaaccttgggggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 26670028  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  26670029 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 26670072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 156
Target Start/End: Original strand, 31564405 - 31564526
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  31564405 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 31564504  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    ||  ||||||| || |||||||    
T  31564505 ataggaggaaaagttggtctag 31564526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 24592556 - 24592813
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||||||||| |||    
T  24592556 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggt 24592655  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||  |||| ||||| || || ||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  24592656 ataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 24592755  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  24592756 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 24592813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31125048 - 31124905
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || |||||||||||||||    
T  31125048 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggt 31124949  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||  ||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  31124948 ataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 31124905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11441700 - 11441590
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || ||||||||||||    
T  11441700 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcgtacaacattggt 11441601  T
Q  135 atcagaggaaa 145  Q
    ||  |||||||    
T  11441600 ataggaggaaa 11441590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11441507 - 11441431
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  11441507 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 11441431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 292
Target Start/End: Original strand, 26537885 - 26538148
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  26537885 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgcacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 26537984  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgc------tgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacct 228  Q
    ||  ||||||| || ||||| |  | ||| |||      |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || |    
T  26537985 ataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcactt 26538084  T
Q  229 gaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 292  Q
    |||||||||||| |||||  || || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26538085 gaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 26538148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22888634 - 22888310
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22888634 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaaatagagt 22888535  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888534 cgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 22888435  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22888434 acgacggcattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggt 22888335  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcatt 331  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  22888334 acgacggaggtaactgggcagcatt 22888310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25199193 - 25198884
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199193 gatggaaatcacacttgagatcagaacggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 25199094  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199093 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagaaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 25198994  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  25198993 acgacggcgttaacgagtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggt 25198894  T
Q  307 acaacggagg 316  Q
    || |||||||    
T  25198893 acgacggagg 25198884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Original strand, 13184646 - 13184972
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13184646 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 13184745  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  13184746 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 13184845  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13184846 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13184945  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  13184946 acgacggaggtagctgagcagcattga 13184972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33877411 - 33877085
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33877411 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 33877312  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  33877311 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 33877212  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33877211 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 33877112  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  33877111 acgacggaggtagctgagcagcattga 33877085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Original strand, 13440492 - 13440818
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13440492 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 13440591  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  13440592 cgggagtaatttagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 13440691  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13440692 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13440791  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  13440792 acgacggaggtagctgagcagcattga 13440818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 11325958 - 11325632
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11325958 gatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 11325859  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  11325858 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctga 11325759  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11325758 acgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 11325659  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  11325658 acgacggaggtagctgagcagcattga 11325632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23892370 - 23892058
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892370 gatggaaatcacatttgaggtcggaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 23892271  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgc 203  Q
    ||| || |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23892270 cggaagcaactcggcatacatgattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggtggctgttgttgcatttgc 23892171  T
Q  204 tgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacg 303  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |    
T  23892170 tgaacgatggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatg 23892071  T
Q  304 ggtacaacggagg 316  Q
    ||||| |||||||    
T  23892070 ggtacgacggagg 23892058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Original strand, 29889080 - 29889263
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29889080 gatggaaatcacatatgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtggtgcagtgccctctgagaagtagagt 29889179  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctg 190  Q
     ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||    
T  29889180 tgggagtagctcagcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctg 29889263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24970154 - 24969876
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  24970154 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 24970055  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggtt 234  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| || ||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  24970054 atcggagggaaagtaggtctagcttgttga---tgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggtt 24969958  T
Q  235 gacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 316  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||    
T  24969957 gacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacgacggagg 24969876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30934769 - 30934515
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |||    
T  30934769 gaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggt 30934670  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggtt 234  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||    
T  30934669 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggtt 30934570  T
Q  235 gacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    |||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30934569 gacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgaga 30934515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Original strand, 23752455 - 23752733
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| ||     
T  23752455 atcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagc 23752554  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||    
T  23752555 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcga 23752654  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23752655 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 23752733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 23718014 - 23718271
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |||    
T  23718014 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggt 23718113  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  23718114 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 23718213  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23718214 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 23718271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 316
Target Start/End: Original strand, 24688183 - 24688467
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| |||||||| || |||    
T  24688183 gaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaatatcggt 24688282  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| | |  | |||||||||||| ||||    
T  24688283 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgtattaacgggtacttgag 24688382  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 316  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  24688383 gttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 24688467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11549490 - 11549236
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |||    
T  11549490 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggt 11549391  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  11549390 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 11549291  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 286  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11549290 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggtggaaagaaaggatgctg 11549236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33777644 - 33777366
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  33777644 atcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 33777545  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| |||    
T  33777544 aactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcga 33777445  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  33777444 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 33777366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Original strand, 22999119 - 22999397
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || ||     
T  22999119 atcacacttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagc 22999218  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||    
T  22999219 aactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcga 22999318  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22999319 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 22999397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33292681 - 33292363
Alignment:
Q  15 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 114  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  33292681 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 33292582  T
Q  115 actcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggc 214  Q
     ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||    
T  33292581 gctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 33292482  T
Q  215 attaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacgga 314  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||     
T  33292481 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 33292382  T
Q  315 ggtagctgagcagcattga 333  Q
    || | ||||||||||||||    
T  33292381 ggaaactgagcagcattga 33292363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Original strand, 32599477 - 32599752
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  32599477 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 32599576  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacgg 213  Q
    |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  |||||| ||| ||    
T  32599577 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgctgagcgatgg 32599676  T
Q  214 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    |||| || || ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  32599677 cattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 32599752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34616654 - 34616400
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  34616654 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggt 34616555  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggtt 234  Q
    ||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||    
T  34616554 ataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggtt 34616455  T
Q  235 gacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  34616454 agccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 34616400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Original strand, 9548548 - 9548826
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  9548548 atcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 9548647  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    || || ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||  ||   |||||||| ||| || ||| | |    
T  9548648 aattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgtttcatctgttgagcaa 9548747  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  9548748 ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 9548826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 8665501 - 8665758
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  8665501 gaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 8665600  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  8665601 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 8665700  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| || || ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8665701 gttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 8665758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Original strand, 15658765 - 15659043
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  15658765 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 15658864  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |    
T  15658865 aactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 15658964  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  15658965 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaaaggatgctgaga 15659043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 15758883 - 15759140
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  15758883 gaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 15758982  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  15758983 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 15759082  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  15759083 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 15759140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 18375438 - 18375695
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || |||||||||||||||    
T  18375438 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggt 18375537  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  18375538 ataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 18375637  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  18375638 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 18375695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30168605 - 30168348
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  30168605 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 30168506  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  30168505 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 30168406  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  30168405 gttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 30168348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2511187 - 2511044
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  2511187 gaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 2511088  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  2511087 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 2511044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 12132291 - 12132034
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  12132291 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 12132192  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| || | |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  12132191 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 12132092  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  12132091 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 12132034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 41674866 - 41674589
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  41674866 atcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 41674767  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    || || ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |    
T  41674766 aattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaa 41674667  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgag 288  Q
      ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  41674666 ttgcattgacgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgag 41674589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6874462 - 6874181
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  6874462 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 6874363  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat------gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaa 207  Q
    | ||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||      | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||      
T  6874362 agctcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttggg 6874263  T
Q  208 cgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | |  ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  6874262 caattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 6874181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26480528 - 26480385
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  26480528 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 26480429  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  26480428 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 26480385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33516492 - 33516235
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || |||||||||||||||    
T  33516492 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggt 33516393  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||  ||||||| ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  33516392 ataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 33516293  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  33516292 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 33516235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 156
Target Start/End: Original strand, 37671488 - 37671630
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  37671488 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagc 37671587  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  37671588 aactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37671630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5638046 - 5637903
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  5638046 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 5637947  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  5637946 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 5637903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9317587 - 9317444
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  9317587 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 9317488  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  9317487 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 9317444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 30152154 - 30152011
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  30152154 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 30152055  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  30152054 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 30152011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28649392 - 28649250
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  28649392 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 28649293  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  28649292 aactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 28649250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31431576 - 31431466
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  31431576 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggt 31431477  T
Q  135 atcagaggaaa 145  Q
    ||  |||||||    
T  31431476 ataggaggaaa 31431466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Original strand, 28959812 - 28959955
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||    
T  28959812 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 28959911  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || |||||    
T  28959912 ataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttg 28959955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 29967092 - 29967349
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||    
T  29967092 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 29967191  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||  |||| ||||| || || ||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  29967192 ataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 29967291  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  29967292 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 29967349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 154
Target Start/End: Original strand, 31826433 - 31826552
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||    
T  31826433 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 31826532  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtct 154  Q
    ||  ||||||| || |||||    
T  31826533 ataggaggaaaagttggtct 31826552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Original strand, 37358669 - 37358812
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||    
T  37358669 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggt 37358768  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||  ||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  37358769 ataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 37358812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 156
Target Start/End: Original strand, 37770992 - 37771134
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |||| ||| || ||     
T  37770992 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagc 37771091  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  37771092 aactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 43078409 - 43078128
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  43078409 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 43078310  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgc------tgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaa 207  Q
    |  || |||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |  | ||| |||      |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||      
T  43078309 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttggg 43078210  T
Q  208 cgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  43078209 caattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 43078128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 30029551 - 30029408
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||    
T  30029551 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 30029452  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||  |||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||||||    
T  30029451 ataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttg 30029408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 156
Target Start/End: Original strand, 18500735 - 18500877
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  18500735 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 18500834  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||||    
T  18500835 aactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctag 18500877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3789677 - 3789556
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || |||||||||||||||    
T  3789677 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggt 3789578  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    ||  ||||||| || |||||||    
T  3789577 ataggaggaaaagttggtctag 3789556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 37755116 - 37754995
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  37755116 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 37755017  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    ||  ||||||| || |||||||    
T  37755016 ataggaggaaaagttggtctag 37754995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31431383 - 31431307
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31431383 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 31431307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3789481 - 3789402
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 292  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3789481 gcattgacgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 3789402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Original strand, 18500955 - 18501031
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  18500955 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 18501031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 156
Target Start/End: Original strand, 13324835 - 13324976
Alignment:
Q  15 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 114  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  13324835 tcacatttgagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 13324934  T
Q  115 actcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
      || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  13324935 gttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 13324976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28649181 - 28649105
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  28649181 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 28649105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Original strand, 37358862 - 37358938
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37358862 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37358938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Original strand, 37671699 - 37671775
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37671699 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37671775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15228040 - 15227716
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15228040 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaatggatcaggtggaggcttaccctgtctggttgtacagtgccctctgagaagtagagt 15227941  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15227940 cgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctga 15227841  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227840 acgacagcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 15227741  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcatt 331  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  15227740 acgacggaggtaactgggcagcatt 15227716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1900427 - 1900103
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900427 gatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcaggtggaggcttaccatgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 1900328  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900327 cgggagtaactcggcatacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgctgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 1900228  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1900227 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggt 1900128  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcatt 331  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  1900127 acgacggaggtaactgggcagcatt 1900103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Original strand, 24460706 - 24461032
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24460706 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 24460805  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  24460806 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 24460905  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24460906 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 24461005  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  24461006 acgacggaggtagctgagcagcattga 24461032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 15285029 - 15285353
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15285029 gatggaaatcacacttgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 15285128  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    |||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15285129 cgggagtaactcgaaatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagttggtggctgttgttgcatttgctga 15285228  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15285229 acgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatatgggt 15285328  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcatt 331  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||    
T  15285329 acaatggaggtaactgggcagcatt 15285353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 14235626 - 14235953
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  14235626 gatggaaatcacatttgaggtcgaaatggaacctgggaggcaaagggttaggtggaggcttgccctgtctggttgtacagtgccctttaagaagcagagt 14235725  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgc 203  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||    
T  14235726 cgggagcagctcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgttgctgctgttgttgctgagccggcggctgttgttgcatttgc 14235825  T
Q  204 tgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacg 303  Q
    ||| | | |||||||||||||||||  || ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||     
T  14235826 tgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatatact 14235925  T
Q  304 ggtacaacggaggtagctgagcagcatt 331  Q
    |||||  | |||||| ||||||||||||    
T  14235926 ggtacggcagaggtaactgagcagcatt 14235953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Original strand, 15391439 - 15391762
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  15391439 gatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttcccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagt 15391538  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||   | |  | |||||||| ||||||||||||    
T  15391539 cgggagcaactcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgctgctgttgttg---agccagcggctgttgctgcatttgctga 15391635  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacg 303  Q
     | | |||||| | ||||||||||||||||||||   |||||   ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||     
T  15391636 gcaatggcattgatgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 15391732  T
Q  304 ggtacaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    | |||  |||||||||||||||| ||||||    
T  15391733 gatacggcggaggtagctgagcaacattga 15391762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 17014163 - 17013867
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| ||     
T  17014163 atcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctttggagtaaagtcggaagc 17014064  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| | |    
T  17014063 aactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 17013964  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggta 307  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  17013963 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggta 17013867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 24592443 - 24592697
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||    
T  24592443 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggt 24592542  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggtt 234  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||    
T  24592543 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggtt 24592642  T
Q  235 gacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    |||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24592643 gacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 24592697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14665160 - 14664903
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||    
T  14665160 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggt 14665061  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  14665060 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 14664961  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14664960 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 14664903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Original strand, 14763412 - 14763693
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  14763412 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 14763511  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||  | || |||||||  || ||| |||    
T  14763512 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcga 14763611  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 292  Q
     |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14763612 tggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 14763693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24112824 - 24112506
Alignment:
Q  15 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 114  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  24112824 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 24112725  T
Q  115 actcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggc 214  Q
     ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||    
T  24112724 gctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 24112625  T
Q  215 attaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacgga 314  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||     
T  24112624 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 24112525  T
Q  315 ggtagctgagcagcattga 333  Q
    || | ||||||||||||||    
T  24112524 ggaaactgagcagcattga 24112506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 333
Target Start/End: Original strand, 34189069 - 34189387
Alignment:
Q  15 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 114  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  34189069 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 34189168  T
Q  115 actcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggc 214  Q
     ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||    
T  34189169 gctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 34189268  T
Q  215 attaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacgga 314  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||     
T  34189269 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 34189368  T
Q  315 ggtagctgagcagcattga 333  Q
    || | ||||||||||||||    
T  34189369 ggaaactgagcagcattga 34189387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6570016 - 6569738
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  6570016 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 6569917  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    |  || |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||   || ||||| |||||||||||   |||||||| ||| || ||  | |    
T  6569916 agttctgcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgctgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 6569817  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6569816 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 6569738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Original strand, 36344623 - 36344901
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  36344623 atcacatttgagatcagacctgaacctcggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 36344722  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacgg 213  Q
    | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| ||    
T  36344723 agctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatgg 36344822  T
Q  214 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 292  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  36344823 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagta 36344901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14098683 - 14098426
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||    
T  14098683 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 14098584  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  14098583 ataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 14098484  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  14098483 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 14098426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 27163446 - 27163703
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  27163446 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 27163545  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||| || ||||    
T  27163546 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgag 27163645  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  27163646 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 27163703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 31126647 - 31126904
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| |||||||||||||||    
T  31126647 gaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggt 31126746  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||  ||||||| ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  31126747 ataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 31126846  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31126847 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 31126904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 54833550 - 54833231
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  54833550 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaaga 54833451  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacgg 213  Q
    | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| | | ||    
T  54833450 agctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcaatgg 54833351  T
Q  214 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacgg 313  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||    
T  54833350 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 54833251  T
Q  314 aggtagctgagcagcattga 333  Q
    ||| |  ||||| |||||||    
T  54833250 aggcatttgagctgcattga 54833231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5006036 - 5005755
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  5006036 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 5005937  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt------gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaa 207  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||      ||||||| ||   |||||||| ||| || ||      
T  5005936 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttggg 5005837  T
Q  208 cgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  5005836 caattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 5005755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 156
Target Start/End: Original strand, 18800742 - 18800863
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  18800742 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 18800841  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    ||  ||||||| || |||||||    
T  18800842 ataggaggaaaagttggtctag 18800863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 30753896 - 30753777
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||    
T  30753896 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 30753797  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtct 154  Q
    ||  ||||||| || |||||    
T  30753796 ataggaggaaaagttggtct 30753777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21969758 - 21969586
Alignment:
Q  120 gcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 216  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||    
T  21969758 gcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcat 21969659  T
Q  217 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  21969658 tgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggcgggaagaaaggatgctgaga 21969586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 33673906 - 33674046
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  33673906 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagc 33674005  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  33674006 aactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 33674046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Original strand, 40105767 - 40105910
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| ||||| |||    
T  40105767 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttcagcatataacatcggt 40105866  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  40105867 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 40105910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19373202 - 19373102
Alignment:
Q  233 ttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattg 332  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||    
T  19373202 ttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattg 19373103  T
Q  333 a 333  Q
    |    
T  19373102 a 19373102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Original strand, 18800932 - 18801008
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  18800932 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 18801008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30753703 - 30753627
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||  |||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  30753703 gcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 30753627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 21703254 - 21703578
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703254 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgtcctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 21703353  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21703354 cgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgttga 21703453  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21703454 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggt 21703553  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcatt 331  Q
    || ||||||||| ||  ||||||||    
T  21703554 acgacggaggtaactaggcagcatt 21703578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27118839 - 27118513
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27118839 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 27118740  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  27118739 cgggagtaattcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctga 27118640  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27118639 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatgcgggt 27118540  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  27118539 acgacggaggtagctgagcagcattga 27118513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Original strand, 34303393 - 34303719
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34303393 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 34303492  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  34303493 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 34303592  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34303593 acgacgacattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 34303692  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  34303693 acgacggaggtagctgagcagcattga 34303719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 34157162 - 34156836
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34157162 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 34157063  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  34157062 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 34156963  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34156962 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 34156863  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  34156862 acgacggaggtagctgagcagcattga 34156836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 19456511 - 19456835
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19456511 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctatgagaagtagagt 19456610  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  19456611 cgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaa 19456710  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19456711 acgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgcgcatatgggt 19456810  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcatt 331  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  19456811 acgacggaggtaactgggcagcatt 19456835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3784805 - 3784479
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3784805 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 3784706  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  3784705 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 3784606  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3784605 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 3784506  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  3784505 acgacggaggtagctgagcagcattga 3784479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16163750 - 16163424
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16163750 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 16163651  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  16163650 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 16163551  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16163550 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 16163451  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  16163450 acgacggaggtagctgagcagcattga 16163424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Original strand, 31891446 - 31891744
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  31891446 gaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggt 31891545  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggtt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891546 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggtt 31891645  T
Q  235 gacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31891646 gtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 31891744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Original strand, 27434534 - 27434846
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||   |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||     
T  27434534 gatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacttgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagc 27434633  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgc 203  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| ||     
T  27434634 cggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgt 27434733  T
Q  204 tgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacg 303  Q
    ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |    
T  27434734 tgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatg 27434833  T
Q  304 ggtacaacggagg 316  Q
    ||||| |||||||    
T  27434834 ggtacgacggagg 27434846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27393120 - 27392818
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  27393120 gatggaaatcgcacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagt 27393021  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||                     |||||||||||||    
T  27393020 cgggagcagctcggcatacatcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgttgctgttg---------------------ttgcatttgctga 27392942  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
     | | |||||| ||||||||||||||||||||||  ||    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||    
T  27392941 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactggt 27392842  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcat 330  Q
    ||   |||||||||||||||||||    
T  27392841 acggtggaggtagctgagcagcat 27392818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 316
Target Start/End: Original strand, 23128684 - 23128968
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  23128684 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 23128783  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  23128784 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 23128883  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 316  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  23128884 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 23128968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28882337 - 28882080
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  28882337 gaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 28882238  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  28882237 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 28882138  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  28882137 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 28882080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12655665 - 12655381
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  12655665 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 12655566  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  12655565 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 12655466  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 316  Q
    ||||||||| |||||  || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  12655465 gttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggagg 12655381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20838041 - 20837766
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  20838041 gaacctgggaggcaacagatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 20837942  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  20837941 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 20837842  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggta 307  Q
    ||||||||| |||||  || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  20837841 gttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggta 20837766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 21677300 - 21677557
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  21677300 gaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 21677399  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  21677400 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 21677499  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21677500 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 21677557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34279593 - 34279315
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  34279593 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 34279494  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |    
T  34279493 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 34279394  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  34279393 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 34279315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Original strand, 11635283 - 11635564
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  11635283 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 11635382  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaa 207  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||||||||      ||| || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||      
T  11635383 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttggg 11635482  T
Q  208 cgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  11635483 caattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 11635564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 34286498 - 34286223
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  34286498 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 34286399  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |    
T  34286398 aactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaa 34286299  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 286  Q
    | ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  34286298 ctgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctg 34286223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 34291558 - 34291283
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  34291558 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 34291459  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |    
T  34291458 aactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaa 34291359  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 286  Q
    | ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  34291358 ctgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctg 34291283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Original strand, 11641472 - 11641753
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  11641472 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 11641571  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaa 207  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||| |||| || ||||||||||||||      ||| || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||      
T  11641572 aactcagcatataacatctgtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttggg 11641671  T
Q  208 cgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  11641672 caattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 11641753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 289
Target Start/End: Original strand, 13936684 - 13936919
Alignment:
Q  57 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||| |    
T  13936684 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctgg 13936783  T
Q  157 cttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggata 253  Q
    |||| |||   ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  13936784 cttgctgactttgctgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggta 13936883  T
Q  254 ttgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
     ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13936884 ctgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 13936919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Original strand, 22926125 - 22926403
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  22926125 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 22926224  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |    
T  22926225 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 22926324  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  22926325 ttgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 22926403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 37925616 - 37925359
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| |||||||||    
T  37925616 gaaccttggaggcaacgggtcgggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggt 37925517  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  37925516 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 37925417  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37925416 gttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37925359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 16829456 - 16829713
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || |||||||||||||||    
T  16829456 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggt 16829555  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||  ||||||| ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  16829556 ataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 16829655  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  16829656 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 16829713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16892025 - 16891768
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || |||||||||||||||    
T  16892025 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggt 16891926  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||  ||||||| ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  16891925 ataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 16891826  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  16891825 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 16891768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31876404 - 31876147
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || ||||||||||||    
T  31876404 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggt 31876305  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||  ||||||| ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  31876304 ataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 31876205  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31876204 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 31876147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 32049921 - 32049664
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||| |  ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  32049921 gaaccttggaggcaacgggtccggtgggggtttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 32049822  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||| || ||||    
T  32049821 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgag 32049722  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  32049721 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 32049664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 37375305 - 37375024
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  37375305 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 37375206  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag---cttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||    ||| || ||||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||| |||    
T  37375205 agctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgctgttgaacgggcggttgatgttgtacctgttgagcga 37375106  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 292  Q
     | |||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  37375105 tgacattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagta 37375024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 37686027 - 37686284
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  37686027 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 37686126  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  37686127 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 37686226  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37686227 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37686284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 37701292 - 37701549
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  37701292 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 37701391  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  37701392 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 37701491  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37701492 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37701549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40233662 - 40233515
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| |||    
T  40233662 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagt 40233563  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 154  Q
     || || | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  40233562 tggaagaagctcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 40233515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 34861803 - 34861660
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  34861803 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 34861704  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  34861703 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 34861660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 289
Target Start/End: Original strand, 261009 - 261140
Alignment:
Q  158 ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattga 257  Q
    |||||| || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||    
T  261009 ttgttgttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactga 261108  T
Q  258 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  261109 tgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 261140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 19416617 - 19416874
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||||||||| |||    
T  19416617 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggt 19416716  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||  |||| || || || || ||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  19416717 ataggagggaaagttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 19416816  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19416817 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 19416874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 39890197 - 39890054
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || |||||||||||||||    
T  39890197 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggt 39890098  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || |||||    
T  39890097 ataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttg 39890054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 145
Target Start/End: Original strand, 260850 - 260981
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  260850 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacagatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 260949  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaa 145  Q
    |  || |||||||||||||||||  |||||||    
T  260950 agttctgcatacaacattggtataggaggaaa 260981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 178
Target Start/End: Original strand, 12716742 - 12716863
Alignment:
Q  57 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || ||||| |    
T  12716742 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctgg 12716841  T
Q  157 cttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
      | ||| ||||||||||||||    
T  12716842 tatattgctgctgttgttgttg 12716863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Original strand, 2759 - 3085
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2759 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagt 2858  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
     ||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  2859 tgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctgatgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcatttgttga 2958  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2959 acgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgtacgggt 3058  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  3059 acgacggaggtagctgagcagcattga 3085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Original strand, 20340436 - 20340762
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20340436 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagt 20340535  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
     ||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  20340536 tgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctgatgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcatttgttga 20340635  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20340636 acgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgtacgggt 20340735  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  20340736 acgacggaggtagctgagcagcattga 20340762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 296
Target Start/End: Original strand, 16208132 - 16208418
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208132 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggttttccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 16208231  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208232 cgggagtaactcggtatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 16208328  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 296  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16208329 acgatggcattaatgggtacctgaggctgacccgatggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 16208418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20461228 - 20460935
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461228 atcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 20461129  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacgg 213  Q
    ||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||                     |||||||||||||| ||    
T  20461128 aactcggcatatagcattagtatcggaggaaaggtaggtctagcttgt---tgctgttgttg---------------------catttgctgaacgatgg 20461053  T
Q  214 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacgg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  20461052 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacggcgg 20460953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28152016 - 28151845
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28152016 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 28151917  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28151916 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 28151845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Original strand, 41793416 - 41793694
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  41793416 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 41793515  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| ||  || | |    
T  41793516 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgtggagcaa 41793615  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  41793616 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgttgaga 41793694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10962796 - 10962539
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | || | ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  10962796 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagcaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 10962697  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  10962696 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 10962597  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  10962596 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 10962539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28585107 - 28584964
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  28585107 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 28585008  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  28585007 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 28584964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 51638365 - 51638201
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  51638365 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 51638266  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    |  || ||||||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  51638265 agttctgcatacaacattggtatcgaagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 51638201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 55)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Original strand, 13522117 - 13522443
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13522117 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 13522216  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  13522217 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 13522316  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13522317 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13522416  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  13522417 acgacggaggtagctgagcagcattga 13522443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Original strand, 33374300 - 33374626
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33374300 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 33374399  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  33374400 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 33374499  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33374500 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 33374599  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  33374600 acgacggaggtagctgagcagcattga 33374626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Original strand, 8892354 - 8892680
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8892354 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 8892453  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  8892454 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctga 8892553  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8892554 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 8892653  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  8892654 acgacggaggtagctgagcagcattga 8892680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Original strand, 8903589 - 8903915
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8903589 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 8903688  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  8903689 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctga 8903788  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  8903789 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgagagtattgcgcatacgtgt 8903888  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  8903889 acgacggaggtagctgagcagcattga 8903915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 28162809 - 28162483
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28162809 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaagtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 28162710  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  28162709 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctga 28162610  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162609 acgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 28162510  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || | ||||||||||||||||||||||    
T  28162509 acgatggaggtagctgagcagcattga 28162483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 22477317 - 22477644
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22477317 gatggaaatcacacttgaggttagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccatatgagaagtagagt 22477416  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  22477417 cgggagtaactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttgttgaaccggtgactgttgttgcatttgt 22477516  T
Q  204 tgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacg 303  Q
    ||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22477517 tgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcatacg 22477616  T
Q  304 ggtacaacggaggtagctgagcagcatt 331  Q
    ||||| || ||||||  || ||||||||    
T  22477617 ggtacgacagaggtaattgggcagcatt 22477644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Original strand, 22456978 - 22457176
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22456978 gatggaaatcacacttgaggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccttatgagaagtagagt 22457077  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22457078 cgggagtaactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttgttgaaccggtgactgttgttgcatttg 22457176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20160851 - 20160568
Alignment:
Q  9 tggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcg 108  Q
    |||| |||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |    
T  20160851 tggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttg 20160752  T
Q  109 ggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaac 208  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |    
T  20160751 ggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgttgagctggtggctgttgctgtttttgctgagc 20160652  T
Q  209 gacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 292  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  20160651 aatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagta 20160568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 292
Target Start/End: Original strand, 22171980 - 22172263
Alignment:
Q  9 tggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcg 108  Q
    |||| |||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |    
T  22171980 tggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttg 22172079  T
Q  109 ggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaac 208  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |    
T  22172080 ggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgttgagctggtggctgttgctgtttttgctgagc 22172179  T
Q  209 gacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 292  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  22172180 aatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagta 22172263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Original strand, 27290414 - 27290597
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27290414 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacttgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagt 27290513  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctg 190  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||    
T  27290514 cgggagcaactcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttattgctgctgtcgttgttgagccggtggctg 27290597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Original strand, 22934924 - 22935233
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||    
T  22934924 gatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagt 22935023  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || |||    
T  22935024 cggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttga 22935123  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
     | |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||    
T  22935124 gcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggt 22935223  T
Q  307 acaacggagg 316  Q
    |  |||||||    
T  22935224 atgacggagg 22935233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Original strand, 23857369 - 23857678
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||    
T  23857369 gatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagt 23857468  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || |||    
T  23857469 cggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttga 23857568  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
     | |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||    
T  23857569 gcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggt 23857668  T
Q  307 acaacggagg 316  Q
    |  |||||||    
T  23857669 atgacggagg 23857678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 14143329 - 14143500
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14143329 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagt 14143428  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14143429 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 14143500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26788096 - 26787925
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26788096 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagt 26787997  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26787996 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 26787925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27196469 - 27196298
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27196469 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagt 27196370  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27196369 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 27196298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 27252771 - 27252942
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27252771 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagt 27252870  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27252871 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 27252942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 24304690 - 24304947
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  24304690 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 24304789  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  24304790 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggaaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 24304889  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24304890 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgaga 24304947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 316
Target Start/End: Original strand, 13299023 - 13299307
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  13299023 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 13299122  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  13299123 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 13299222  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 316  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  13299223 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 13299307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 316
Target Start/End: Original strand, 15424389 - 15424673
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  15424389 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 15424488  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||| ||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  15424489 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttcaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 15424588  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 316  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  15424589 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 15424673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26989125 - 26988868
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |||    
T  26989125 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggt 26989026  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| |||   || || ||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  26989025 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgatgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 26988926  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26988925 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 26988868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27000197 - 26999940
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||    
T  27000197 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggt 27000098  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||||||| ||||    
T  27000097 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgag 26999998  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26999997 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 26999940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 29549620 - 29549301
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  29549620 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 29549521  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacgg 213  Q
    | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| ||    
T  29549520 agctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcgtattgctgctgctgttgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatgg 29549421  T
Q  214 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacgg 313  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||    
T  29549420 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 29549321  T
Q  314 aggtagctgagcagcattga 333  Q
    ||| |  ||||| |||||||    
T  29549320 aggcatttgagctgcattga 29549301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16749999 - 16749721
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  16749999 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 16749900  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| |||    
T  16749899 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcga 16749800  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16749799 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 16749721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24863841 - 24863557
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||    
T  24863841 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggt 24863742  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||||||| || |    
T  24863741 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttggg 24863642  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 316  Q
    |||||| || ||| | ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  24863641 gttgactcggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggagg 24863557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26918525 - 26918247
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| ||     
T  26918525 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagc 26918426  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| | | || ||| | |    
T  26918425 aactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcgtctgttgagcaa 26918326  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26918325 ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 26918247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4525410 - 4525156
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  4525410 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 4525311  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggtt 234  Q
    ||  ||||||| || |||||||  |  || ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||    
T  4525310 ataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggtt 4525211  T
Q  235 gacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4525210 ggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4525156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27044532 - 27044257
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  27044532 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaaga 27044433  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacgg 213  Q
    | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| ||    
T  27044432 agctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatgg 27044333  T
Q  214 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27044332 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 27044257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 253
Target Start/End: Original strand, 27272624 - 27272876
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||   ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||    
T  27272624 gatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcgacggatcaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctctggagtagagt 27272723  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgt------tgaactggtggctgttgttgcatt 200  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||  |||| |||| ||||||||||      ||||||||||| |||||| || |     
T  27272724 cggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctgacttgctgattctgttgttgttgttgctgaactggtggttgttgtggcttc 27272823  T
Q  201 tgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggata 253  Q
    ||||| || |  ||||| || ||||| |||||| | || ||||||||||||||    
T  27272824 tgctgcacaatagcattcacaggtacttgaggtggtcctgatggcaaaggata 27272876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 29573137 - 29572994
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  29573137 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 29573038  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||  ||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  29573037 ataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttg 29572994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 30558088 - 30558345
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || |||||||||||||||    
T  30558088 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggt 30558187  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||  ||||||| ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  30558188 ataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 30558287  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  30558288 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 30558345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 289
Target Start/End: Original strand, 27629907 - 27630038
Alignment:
Q  158 ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattga 257  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| || | || || || |  ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  27629907 ttgttgctgttgttgttgctgaactggtggttgttgtggcttctgttgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattga 27630006  T
Q  258 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    || || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27630007 tggtaaaacggtgggaagaatggatgctgaga 27630038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4773130 - 4773009
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  4773130 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 4773031  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    ||  ||||||| || |||||||    
T  4773030 ataggaggaaaagttggtctag 4773009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 29501539 - 29501273
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||    
T  29501539 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 29501440  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctag----ct--------tgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 222  Q
    ||  |||| ||||| |||||||    ||        ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||    |||||| ||| |||||| || |    
T  29501439 ataggagggaaggttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgttgttgaattggcggttgatgttgtgcctgctgagcgatggcattgacag 29501340  T
Q  223 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  29501339 gaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgaga 29501273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3696205 - 3696086
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  3696205 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 3696106  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtct 154  Q
    ||  ||||||| || |||||    
T  3696105 ataggaggaaaagttggtct 3696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Original strand, 26777687 - 26777830
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  |||||||||||||| |||    
T  26777687 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttcggcatacaacatcggt 26777786  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||  |||| ||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||    
T  26777787 ataggagggaaggttggtctagcatattgctgctgctgctgttg 26777830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Original strand, 4545847 - 4545957
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  4545847 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggt 4545946  T
Q  135 atcagaggaaa 145  Q
    ||  |||||||    
T  4545947 ataggaggaaa 4545957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Original strand, 4724206 - 4724316
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  4724206 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggt 4724305  T
Q  135 atcagaggaaa 145  Q
    ||  |||||||    
T  4724306 ataggaggaaa 4724316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 28207578 - 28207468
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  28207578 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggt 28207479  T
Q  135 atcagaggaaa 145  Q
    ||  |||||||    
T  28207478 ataggaggaaa 28207468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4757888 - 4757767
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  4757888 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 4757789  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    ||  ||||||| || |||||||    
T  4757788 ataggaggaaaagttggtctag 4757767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16674284 - 16674144
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  16674284 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 16674185  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 154  Q
    | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  16674184 agctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 16674144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27485253 - 27485110
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || |||||||||||||||    
T  27485253 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggt 27485154  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||  ||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  27485153 ataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 27485110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27007872 - 27007730
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  27007872 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 27007773  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  27007772 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 27007730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 16944099 - 16944356
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||||||||| |||    
T  16944099 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggt 16944198  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||  |||| ||||| || || ||||| |||   || ||||| |||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  16944199 ataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgctgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 16944298  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  16944299 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 16944356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Original strand, 27360064 - 27360207
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||||||||| |||    
T  27360064 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggt 27360163  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||  ||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  27360164 ataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 27360207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Original strand, 27450407 - 27450550
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||||||||| |||    
T  27450407 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggt 27450506  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||  ||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  27450507 ataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 27450550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 156
Target Start/End: Original strand, 26116482 - 26116603
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |||| |||||| || |  || ||||||||||| |||    
T  26116482 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagtcggaagaagttctgcatacaacatcggt 26116581  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    ||  ||||||| || |||||||    
T  26116582 ataggaggaaaagttggtctag 26116603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 34463397 - 34463537
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  34463397 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggctttccttgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagc 34463496  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 154  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  34463497 aactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 34463537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17025379 - 17025280
Alignment:
Q  57 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  17025379 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 17025280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3696006 - 3695930
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  3696006 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 3695930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Original strand, 4546037 - 4546113
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4546037 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4546113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Original strand, 4724396 - 4724472
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4724396 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4724472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17025205 - 17025129
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  17025205 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 17025129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Original strand, 26777880 - 26777956
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  26777880 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 26777956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27007655 - 27007579
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27007655 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgaga 27007579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28207385 - 28207309
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28207385 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 28207309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 16626648 - 16626972
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16626648 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctaagaagtagagt 16626747  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
     |||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16626748 agggagtaactcgacatatatcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctga 16626847  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16626848 acgatggcattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgtgcatacgggt 16626947  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcatt 331  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  16626948 acgacggaggtaactgggcagcatt 16626972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Original strand, 17993926 - 17994252
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17993926 gatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 17994025  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  17994026 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 17994125  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17994126 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 17994225  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  17994226 acgacggaggtagctgagcagcattga 17994252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4626060 - 4625734
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4626060 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 4625961  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  4625960 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 4625861  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4625860 acgacgacattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 4625761  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  4625760 acgacggaggtagctgagcagcattga 4625734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18530504 - 18530186
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530504 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 18530405  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||      |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18530404 caggagtaactcagcatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgc------tgttgagctggtggctgttgttgcatttgctga 18530311  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530310 acgacggcattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 18530211  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcatt 331  Q
    || | ||||||| ||| ||||||||    
T  18530210 acgatggaggtaactgggcagcatt 18530186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5652503 - 5652177
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5652503 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcaggtgaaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagt 5652404  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  5652403 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 5652304  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5652303 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 5652204  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  5652203 acgacggaggtagctgagcagcattga 5652177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Original strand, 15892876 - 15893177
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  15892876 gaacctgggaggcaaaggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacattggt 15892975  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||||||| ||||    
T  15892976 atcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgag 15893075  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 331  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |  || ||||||||    
T  15893076 gttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcatt 15893175  T
Q  332 ga 333  Q
    ||    
T  15893176 ga 15893177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Original strand, 8301437 - 8301735
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  8301437 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 8301536  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggtt 234  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||||||| |||||||    
T  8301537 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggtt 8301636  T
Q  235 gacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| | |||| ||||||| |  || ||||||||||    
T  8301637 gacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgagtacgacggaggcatttgggcagcattga 8301735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5713315 - 5713014
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  5713315 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 5713216  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  |||  ||||| ||||| || ||||    
T  5713215 atcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgag 5713116  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 331  Q
    ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5713115 gttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 5713016  T
Q  332 ga 333  Q
    ||    
T  5713015 ga 5713014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5724225 - 5723924
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  5724225 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 5724126  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  |||  ||||| ||||| || ||||    
T  5724125 atcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgag 5724026  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 331  Q
    ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5724025 gttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 5723926  T
Q  332 ga 333  Q
    ||    
T  5723925 ga 5723924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Original strand, 5757252 - 5757553
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  5757252 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 5757351  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  |||  ||||| ||||| || ||||    
T  5757352 atcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgag 5757451  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 331  Q
    ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5757452 gttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 5757551  T
Q  332 ga 333  Q
    ||    
T  5757552 ga 5757553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Original strand, 5768143 - 5768444
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  5768143 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 5768242  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  |||  ||||| ||||| || ||||    
T  5768243 atcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgag 5768342  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 331  Q
    ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5768343 gttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 5768442  T
Q  332 ga 333  Q
    ||    
T  5768443 ga 5768444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32292868 - 32292697
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292868 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggagacttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 32292769  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32292768 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 32292697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 31034259 - 31034430
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31034259 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 31034358  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  31034359 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 31034430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 8296060 - 8295779
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  8296060 gaacctgggaggcaacagatcaggtaggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctgtggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 8295961  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggtt 234  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||| ||||| |||||||    
T  8295960 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaattggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggtt 8295861  T
Q  235 gacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 316  Q
    |||||| || || ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  8295860 gacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 8295779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Original strand, 22387727 - 22388046
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  22387727 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 22387826  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacgg 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| ||    
T  22387827 aactctgcatacaacattggtataggaggaaaagtcggtctagcatattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatgg 22387926  T
Q  214 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacgg 313  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||    
T  22387927 cattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgcataagggtaggacgg 22388026  T
Q  314 aggtagctgagcagcattga 333  Q
     || | ||||||||||||||    
T  22388027 gggaaactgagcagcattga 22388046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18051350 - 18051066
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  18051350 gaacctgggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 18051251  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  18051250 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 18051151  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 316  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  18051150 gttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 18051066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 4796823 - 4797080
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||    
T  4796823 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggt 4796922  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||||||| ||||    
T  4796923 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgag 4797022  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  4797023 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 4797080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Original strand, 29148904 - 29149182
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  29148904 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 29149003  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| |||    
T  29149004 aactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcga 29149103  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  29149104 ttgcattaacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 29149182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 35880854 - 35880597
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  35880854 gaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtttggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 35880755  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  35880754 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 35880655  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  35880654 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 35880597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18330757 - 18330505
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||  ||||| || ||||| ||||| ||||| |||    
T  18330757 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaggtcggaagcaactcagcatataacatcggt 18330658  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  18330657 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 18330558  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||| |||     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18330557 gttgacccggtggcagagg-----gatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgaga 18330505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4893318 - 4893000
Alignment:
Q  15 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 114  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |  |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  4893318 tcacacttaagatcagagtggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 4893219  T
Q  115 actcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggc 214  Q
     ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||    
T  4893218 gctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 4893119  T
Q  215 attaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacgga 314  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||     
T  4893118 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 4893019  T
Q  315 ggtagctgagcagcattga 333  Q
    || | ||||||||||||||    
T  4893018 ggaaactgagcagcattga 4893000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Original strand, 18277201 - 18277482
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  18277201 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 18277300  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||  | || |||||||  || ||| |||    
T  18277301 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcga 18277400  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 292  Q
     |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18277401 tggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 18277482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Original strand, 18292502 - 18292783
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  18292502 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 18292601  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||  | || |||||||  || ||| |||    
T  18292602 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcga 18292701  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 292  Q
     |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18292702 tggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 18292783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Original strand, 18307803 - 18308084
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  18307803 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 18307902  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||  | || |||||||  || ||| |||    
T  18307903 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcga 18308002  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 292  Q
     |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18308003 tggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 18308084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 32439262 - 32438944
Alignment:
Q  15 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 114  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  32439262 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 32439163  T
Q  115 actcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggc 214  Q
      || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||    
T  32439162 gttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 32439063  T
Q  215 attaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacgga 314  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||     
T  32439062 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 32438963  T
Q  315 ggtagctgagcagcattga 333  Q
    || | ||||||||||||||    
T  32438962 ggaaactgagcagcattga 32438944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4721740 - 4721462
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| |||||||| ||   |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  4721740 atcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 4721641  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   ||||||||  || || ||| | |    
T  4721640 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgttttatctgttgagcaa 4721541  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  4721540 ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaagatgctgaga 4721462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6192425 - 6192147
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| |||||||| ||   |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  6192425 atcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcagatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 6192326  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| | |    
T  6192325 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 6192226  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || | |||||| ||||| | |||||| |||||||||||    
T  6192225 ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaaaggatgctgaga 6192147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 17985126 - 17985383
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| |||||||||||||||    
T  17985126 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggt 17985225  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  17985226 ataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 17985325  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  17985326 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 17985383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Original strand, 4346836 - 4347111
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  4346836 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 4346935  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacgg 213  Q
    |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| ||    
T  4346936 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatgg 4347035  T
Q  214 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    |||| || || ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4347036 cattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4347111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8211847 - 8211528
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  8211847 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 8211748  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacgg 213  Q
    |  || |||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| ||    
T  8211747 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttagtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatgg 8211648  T
Q  214 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacgg 313  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||    
T  8211647 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacgg 8211548  T
Q  314 aggtagctgagcagcattga 333  Q
    ||| |  ||||| |||||||    
T  8211547 aggcatttgagctgcattga 8211528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10396242 - 10395970
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  10396242 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 10396143  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    | ||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||   |  || ||| |||    
T  10396142 agctctgcatacaacataggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgt---acctgttgagcga 10396046  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 286  Q
     |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  10396045 tggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctg 10395970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20066109 - 20065877
Alignment:
Q  57 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  20066109 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 20066010  T
Q  157 cttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattg 256  Q
      | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || ||    
T  20066009 tatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactg 20065910  T
Q  257 atgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20065909 atgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 20065877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5467073 - 5466816
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||||||||| |||    
T  5467073 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaggagttctgcatacaacataggt 5466974  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagc---ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    || |||||||| || |||||| |   ||| || ||||| || ||||||||||| || ||  |||| |  || ||| ||| |||||| || || |||||||    
T  5466973 ataagaggaaaagttggtctatcatattgctgctgctgctgctgttgaactggcggttgacgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgag 5466874  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    |||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  5466873 gttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgaga 5466816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 7996650 - 7996393
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  7996650 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 7996551  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||| || ||||    
T  7996550 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgag 7996451  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  7996450 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 7996393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10643158 - 10642901
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  10643158 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 10643059  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||| || ||||    
T  10643058 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgag 10642959  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  10642958 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 10642901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28021384 - 28021109
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  28021384 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaatggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtatagttggaaga 28021285  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacgg 213  Q
    |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| ||    
T  28021284 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatgg 28021185  T
Q  214 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    |||| || || ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28021184 cattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 28021109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 15741264 - 15741509
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  15741264 gaaccttggaggcaacgaatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 15741363  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| |||   || ||||||||||||||||            |||  || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  15741364 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg------------gcaactgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 15741451  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15741452 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 15741509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 7073321 - 7073043
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  7073321 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgggggcttaccttgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 7073222  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |    
T  7073221 aactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 7073122  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  7073121 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 7073043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 47023541 - 47023284
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  47023541 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 47023442  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| |||||||    
T  47023441 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgag 47023342  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  47023341 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 47023284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Original strand, 28116103 - 28116384
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  28116103 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaagtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 28116202  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaa 207  Q
    || || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||||||||      ||| || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||      
T  28116203 aattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttggg 28116302  T
Q  208 cgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  28116303 caattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 28116384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Original strand, 5609471 - 5609749
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  5609471 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 5609570  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |    
T  5609571 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 5609670  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  5609671 ttgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 5609749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Original strand, 31964622 - 31964900
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  31964622 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 31964721  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |    
T  31964722 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 31964821  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31964822 ttgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 31964900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Original strand, 50134220 - 50134498
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  50134220 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 50134319  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |    
T  50134320 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 50134419  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
      ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  50134420 ttgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 50134498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 156
Target Start/End: Original strand, 6542632 - 6542753
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  6542632 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 6542731  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    ||  ||||||| || |||||||    
T  6542732 ataggaggaaaagttggtctag 6542753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21674802 - 21674638
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  21674802 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtagagttggaaga 21674703  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    |  || |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  21674702 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttg 21674638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28339411 - 28339247
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  28339411 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 28339312  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  28339311 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 28339247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18225279 - 18225136
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||    
T  18225279 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 18225180  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||  |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  18225179 ataggagggaaggtaggcctagcttgttgattttgttgttgttg 18225136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4417028 - 4416864
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  4417028 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 4416929  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  4416928 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 4416864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 154
Target Start/End: Original strand, 36997247 - 36997366
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| |||||||||||||||    
T  36997247 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggt 36997346  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtct 154  Q
    ||  ||||||| || |||||    
T  36997347 ataggaggaaaagttggtct 36997366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 5596527 - 5596793
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||    
T  5596527 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 5596626  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctag----ct--------tgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 222  Q
    ||  |||| ||||| |||||||    ||        ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||    |||||| ||| |||||| || |    
T  5596627 ataggagggaaggttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgttgttgaattggcggttggtgttgtgcctgctgagcgatggcattgacag 5596726  T
Q  223 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  5596727 gaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgaga 5596793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5013800 - 5013543
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || ||||||||||||    
T  5013800 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggt 5013701  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||  ||||||| || || || ||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  5013700 ataggaggaaaagttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 5013601  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  5013600 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 5013543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 11110498 - 11110638
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  11110498 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 11110597  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 154  Q
    |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  11110598 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 11110638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18242827 - 18242684
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || |||||||||||||||    
T  18242827 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggt 18242728  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||  ||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  18242727 ataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 18242684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 292
Target Start/End: Original strand, 29665336 - 29665415
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 292  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29665336 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 29665415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 48466036 - 48465896
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  48466036 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctttggagtaaagttggaaga 48465937  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 154  Q
    |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  48465936 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 48465896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 22871005 - 22871148
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  22871005 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 22871104  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 157  Q
    |  || |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  22871105 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22871148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 22886064 - 22886207
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  22886064 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 22886163  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 157  Q
    |  || |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  22886164 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22886207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24328247 - 24328104
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||||||||| |||    
T  24328247 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggt 24328148  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||  |||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||||||    
T  24328147 ataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttg 24328104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 51782111 - 51782052
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 94  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51782111 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51782052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Original strand, 11110712 - 11110788
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  11110712 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 11110788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 51797192 - 51797141
Alignment:
Q  43 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 94  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51797192 gaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51797141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 178
Target Start/End: Original strand, 20577039 - 20577160
Alignment:
Q  57 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || ||||| |    
T  20577039 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctgg 20577138  T
Q  157 cttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
      | ||||||||| ||||||||    
T  20577139 tatattgatgctgctgttgttg 20577160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Original strand, 6542825 - 6542901
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  6542825 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 6542901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Original strand, 36997440 - 36997516
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  36997440 gcattgacgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 36997516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9354777 - 9354451
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9354777 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagt 9354678  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  9354677 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 9354578  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9354577 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 9354478  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  9354477 acgacggaggtagctgagcagcattga 9354451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Original strand, 19659099 - 19659425
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19659099 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagt 19659198  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||| ||||     
T  19659199 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggttgttgttgcattcgctgg 19659298  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659299 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 19659398  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  19659399 acgacggaggtagctgagcagcattga 19659425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44563256 - 44562930
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44563256 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 44563157  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  44563156 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctga 44563057  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563056 acggcggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 44562957  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  44562956 acgacggaggtagctgagcagcattga 44562930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16283604 - 16283292
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||    
T  16283604 gatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctaaggagtaaagt 16283505  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgttgcatttgc 203  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||   |||||||| ||| ||     
T  16283504 cggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgt 16283405  T
Q  204 tgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacg 303  Q
    ||| | |  ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |    
T  16283404 tgagcaattgcattaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatg 16283305  T
Q  304 ggtacaacggagg 316  Q
    ||||| |||||||    
T  16283304 ggtacgacggagg 16283292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Original strand, 22080938 - 22081261
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  22080938 gatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggctttccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagt 22081037  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    |||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||   ||||| || |||||| |    |||||||| ||||||||||||    
T  22081038 cgggagcagctcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgt---tgctgctgctgttgagccaacggctgttgctgcatttgctga 22081134  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacc---cgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacg 303  Q
     | | |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||   ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||     
T  22081135 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 22081231  T
Q  304 ggtacaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  22081232 gatacggcggaggtagctgagcagcattga 22081261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 27608993 - 27609250
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  27608993 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 27609092  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  27609093 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 27609192  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27609193 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 27609250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33244820 - 33244649
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33244820 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttaggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagt 33244721  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  33244720 cgggagtaattcaacatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 33244649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 316
Target Start/End: Original strand, 2137347 - 2137631
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  2137347 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 2137446  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  2137447 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 2137546  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 316  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  2137547 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 2137631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14557751 - 14557497
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| |||||||||    
T  14557751 gaaccttggaggcaacggatcaggcgagggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggt 14557652  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggtt 234  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||| ||||| |||||||    
T  14557651 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggtt 14557552  T
Q  235 gacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    |||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14557551 gacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgaga 14557497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16277681 - 16277397
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  16277681 gaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 16277582  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  16277581 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 16277482  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 316  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  16277481 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 16277397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19688225 - 19687924
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  19688225 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 19688126  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||| |    |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||||||| ||||    
T  19688125 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccgacaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgag 19688026  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 331  Q
    ||||||||| ||||| ||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||  ||||||| |||||  ||||||| |  || ||||||||    
T  19688025 gttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcatt 19687926  T
Q  332 ga 333  Q
    ||    
T  19687925 ga 19687924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 18710734 - 18710412
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||||||||| |||||   |||||| ||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  18710734 atcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgagggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 18710635  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||   ||| || ||||| ||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |    
T  18710634 aactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 18710535  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaa 310  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  |    
T  18710534 ctgcattgacgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatga 18710435  T
Q  311 cggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    |||||| |  ||||| |||||||    
T  18710434 cggaggcatttgagctgcattga 18710412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31354672 - 31354394
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  31354672 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 31354573  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 210  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  | || ||||| |  || ||| |||    
T  31354572 aactcggcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgtacctgttgagcga 31354473  T
Q  211 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
     |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31354472 tggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 31354394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 31489838 - 31490095
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  31489838 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 31489937  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||| |||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  31489938 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgctgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 31490037  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31490038 gttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 31490095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19286610 - 19286291
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  19286610 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaaga 19286511  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacgg 213  Q
    | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| | | ||    
T  19286510 agctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcaatgg 19286411  T
Q  214 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacgg 313  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||    
T  19286410 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 19286311  T
Q  314 aggtagctgagcagcattga 333  Q
    ||| |  ||||| |||||||    
T  19286310 aggcatttgagctgcattga 19286291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19674589 - 19674308
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  19674589 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 19674490  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt------gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaa 207  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||      ||||||| ||   |||||||| ||| || ||      
T  19674489 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttggg 19674390  T
Q  208 cgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19674389 caattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 19674308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 19208448 - 19208705
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  19208448 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 19208547  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  19208548 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 19208647  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19208648 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 19208705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 28362043 - 28362300
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  28362043 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 28362142  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  28362143 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 28362242  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28362243 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 28362300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 156
Target Start/End: Original strand, 3329595 - 3329716
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  3329595 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 3329694  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    ||  ||||||| || |||||||    
T  3329695 ataggaggaaaagttggtctag 3329716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 156
Target Start/End: Original strand, 12092812 - 12092933
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||    
T  12092812 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggt 12092911  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    ||  ||||||| || |||||||    
T  12092912 ataggaggaaaagttggtctag 12092933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33258850 - 33258707
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||||||||| |||    
T  33258850 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggt 33258751  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||  |||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||||||    
T  33258750 ataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttg 33258707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 29829450 - 29829328
Alignment:
Q  34 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattgg 133  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||  | |||| ||| || || |  || || |||||||||||    
T  29829450 ggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctggtggtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttctgcgtacaacattgg 29829351  T
Q  134 tatcagaggaaaggtaggtctag 156  Q
    |||  ||||||| || |||||||    
T  29829350 tataggaggaaaagttggtctag 29829328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Original strand, 3329788 - 3329864
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  3329788 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgaga 3329864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Original strand, 19518412 - 19518488
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  19518412 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 19518488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 29829259 - 29829183
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  29829259 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 29829183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20543 - 20240
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20543 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 20444  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||                     |||||||||||||    
T  20443 cgggagtaactcagcatacaacattggtatcgggggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttg---------------------ttgcatttgctga 20365  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20364 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggt 20265  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcatt 331  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  20264 acgacggaggtaactgggcagcatt 20240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30579 - 30296
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || |||||||||||||||    
T  30579 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggt 30480  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  30479 ataggaggaaag-taggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 30381  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 316  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  30380 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 30296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Original strand, 129 - 312
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  129 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctggttgagcagtgccctctgagaagtagagt 228  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctg 190  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  229 cgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttgagctggtggctg 312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21716 - 21393
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 106  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | |||    
T  21716 gatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgtcctttgagaagcaaagt 21617  T
Q  107 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 206  Q
    |||||| | ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||   || |||| | |  |  ||||||||||||||||||||    
T  21616 cgggagcagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgttgc---tgctgttaagccagcagctgttgttgcatttgctga 21520  T
Q  207 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 306  Q
     | | |||||| ||||||||||||||||||||||  ||    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||    
T  21519 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactggt 21420  T
Q  307 acaacggaggtagctgagcagcattga 333  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  21419 acggcggaggtagctgagaagcattga 21393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29890 - 29614
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  29890 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 29791  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||||||| ||||    
T  29790 atcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagctattgcattaacgggtacttgag 29691  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtac 308  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  29690 gttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatacgggtac 29614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 308
Target Start/End: Original strand, 40198 - 40474
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  40198 gaacctggggggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 40297  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| |||||||||||||    
T  40298 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatttacgggtacctgag 40397  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtac 308  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  40398 gttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtac 40474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 47114 - 47371
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  47114 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 47213  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  47214 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 47313  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||||||| |||||  || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  47314 gttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 47371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27419 - 27135
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |||    
T  27419 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggt 27320  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  27319 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 27220  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 316  Q
    ||||||||| ||| | ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  27219 gttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 27135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 258 - 516
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcg-gcatacaacattgg 133  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||   ||||| ||||| ||    
T  258 gaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactaaagcatataacatcgg 357  T
Q  134 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctga 230  Q
    |||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||||||| |||    
T  358 tatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttga 457  T
Q  231 ggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    |||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  458 ggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 2018 - 2103
Alignment:
Q  7 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 92  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2018 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 6160 - 6080
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 94  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  6160 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 15059 - 15316
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || |||||||||||||||    
T  15059 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggt 15158  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  15159 ataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 15258  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  15259 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 15316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 7368 - 7625
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  7368 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 7467  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| || | |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  7468 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 7567  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  7568 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 7625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 9195 - 9452
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  9195 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 9294  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 231  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||    
T  9295 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 9394  T
Q  232 gttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    | || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  9395 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 9452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20142 - 19999
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  20142 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 20043  T
Q  135 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  20042 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 19999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 178
Target Start/End: Original strand, 26338 - 26474
Alignment:
Q  42 ggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 141  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| |||||||||||||||||  |||    
T  26338 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggag 26437  T
Q  142 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 178  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  26438 gaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 26474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 9714 - 9542
Alignment:
Q  14 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 113  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  9714 atcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 9615  T
Q  114 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtg 186  Q
    |  || ||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||    
T  9614 agttctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggtg 9542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8212 - 8102
Alignment:
Q  179 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 278  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||| || ||||| |||||     
T  8212 aactggcggctgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaac 8113  T
Q  279 ggatgctgaga 289  Q
    |||||||||||    
T  8112 ggatgctgaga 8102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8076 - 7966
Alignment:
Q  35 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  8076 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggt 7977  T
Q  135 atcagaggaaa 145  Q
    ||  |||||||    
T  7976 ataggaggaaa 7966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 7883 - 7807
Alignment:
Q  213 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 289  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  7883 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 7807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University