View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11045_high_1 (Length: 539)

Name: NF11045_high_1
Description: NF11045
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11045_high_1
NF11045_high_1
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (20-526)||(4617287-4617793)
chr6 (23-528)||(4602057-4602562)
chr6 (20-527)||(4563976-4564483)
chr6 (28-521)||(4592504-4592997)
chr6 (20-518)||(4514493-4514988)
chr6 (35-518)||(4299193-4299673)
chr6 (20-497)||(4266559-4267033)
chr6 (20-383)||(4506122-4506485)
chr6 (23-384)||(4461391-4461752)
chr6 (20-384)||(4503900-4504264)
chr6 (20-374)||(4613231-4613585)
chr6 (20-369)||(4560771-4561118)
chr6 (20-384)||(4574573-4574937)
chr6 (20-497)||(4585901-4586375)
chr6 (26-429)||(4622413-4622811)
chr6 (20-369)||(4480958-4481307)
chr6 (20-384)||(3172006-3172370)
chr6 (20-497)||(4457859-4458334)
chr6 (20-384)||(4470068-4470432)
chr6 (20-498)||(4598436-4598911)
chr6 (20-384)||(4626216-4626580)
chr6 (38-497)||(4259547-4260003)
chr6 (20-384)||(4489858-4490222)
chr6 (20-368)||(4579697-4580045)
chr6 (20-374)||(4557390-4557744)
chr6 (20-438)||(4256076-4256478)
chr6 (56-518)||(4516622-4517081)
chr6 (36-374)||(4571253-4571591)
chr6 (56-251)||(4568357-4568552)
chr6 (20-146)||(4493220-4493346)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (20-528)||(1281379-1281887)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (20-529)||(1674491-1675001)
chr8 (20-518)||(20863215-20863710)
chr8 (20-369)||(16685785-16686134)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (20-429)||(3179-3586)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (20-497)||(24103264-24103738)
chr5 (20-241)||(27999745-27999966)
chr5 (50-93)||(20155247-20155290)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (20-519)||(4060-4553)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (20-384)||(3086685-3087049)
chr7 (50-96)||(48532780-48532826)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (293-529)||(1-238)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (20-107)||(3465-3551)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 475; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 4617287 - 4617793
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4617287 attggcactccagcgcatatactttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgtcttgtggac 4617386  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4617387 accaacttgctattaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgagaaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 4617486  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4617487 aaatgatttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccc 4617586  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaata 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4617587 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaata 4617686  T
Q  420 atgaaggtaaggggccaatcggataaatagaaggaattatggaggagagagcatttattacatcactctcaagttcattgaaagtattcaaaagaatagt 519  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4617687 atgaaggtaaagggccaatcggataaatagaaggaattgtggaggagagagcatttattacatcactctcaagttcattgaaagtattcaaaagaatagt 4617786  T
Q  520 agtgtct 526  Q
    |||||||    
T  4617787 agtgtct 4617793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 23 - 528
Target Start/End: Original strand, 4602057 - 4602562
Alignment:
Q  23 ggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggacacc 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4602057 ggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaagaatccgccgatcgaagggtggttcaacactttctcttgtggacacc 4602156  T
Q  123 aacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaaaaa 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4602157 aacttgctattaggcctctatctgaaatttcatttgtaaactcagatgacaaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaa 4602256  T
Q  223 tggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccgggc 322  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4602257 tggtttatggcaattggccaaaccccaagcgaattctaataattgatggggtgtcataactgtaatgctgccaaaattcacataaacaacggatcccggc 4602356  T
Q  323 tccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaataatg 422  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4602357 tccttggattcaagccattcaagacactcagtatcttctttccagaggttggaacctaaacagtccaattgatgaatttgtggagtttgatttaataatg 4602456  T
Q  423 aaggtaaggggccaatcggataaatagaaggaattatggaggagagagcatttattacatcactctcaagttcattgaaagtattcaaaagaatagtagt 522  Q
    || | || || || || | ||| | |||||| |  || ||  | || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  4602457 aatgcaaaggtccgatagtatataaagaagggaacatagaatatagtgcattcattacatcactctcaagttcattgtaagtattcaaaagaatagtaga 4602556  T
Q  523 gtctct 528  Q
    ||||||    
T  4602557 gtctct 4602562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 20 - 527
Target Start/End: Original strand, 4563976 - 4564483
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | |||||||    
T  4563976 attggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccgccaattgaagggtggttcaatactttctcctgtggac 4564075  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    |||||||||| || | ||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4564076 accaacttgcaattaagcctctatctgaaatttcattcacaaactcagatgacaaaacgactgagccaccaatgacaaggtcaggcctaatgatccacaa 4564175  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||     
T  4564176 aaagggtttattgcaattggccaacccccaagcaaattccaacagttgttttggtgtcataactgtaatgcttccaaaattcacataaacaacggatccc 4564275  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaata 419  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4564276 ggctccttggattcaagccattcaagacacttagtatcttctttccaaaggttggaacctaaagaatccaattgatgaatttgtggagtttggtttaata 4564375  T
Q  420 atgaaggtaaggggccaatcggataaatagaaggaattatggaggagagagcatttattacatcactctcaagttcattgaaagtattcaaaagaatagt 519  Q
    |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  4564376 atgaaggtaaagggccaatggggtaaagagaaggaaacatagaggagagagcatttattacatcactctaaagttcatggaaagtattcaaaacaattgt 4564475  T
Q  520 agtgtctc 527  Q
    || |||||    
T  4564476 agagtctc 4564483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 28 - 521
Target Start/End: Original strand, 4592504 - 4592997
Alignment:
Q  28 tccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggacaccaactt 127  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||   |||| |||||||| ||     
T  4592504 tccagcacatatactttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggtttaatacttgctcttgaggacaccagctc 4592603  T
Q  128 gctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaaaaatggtt 227  Q
    || || | ||||||||||| |||||||||   |||||| ||||| ||||  | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4592604 gcgattacgcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaacaattgtgccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaaaggtt 4592703  T
Q  228 tcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccgggctcctt 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| || |  | || |||     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |  |||||    
T  4592704 tattgcaattggccaaaccccaagcaaactctaacattttctcttcattcataactgtaaggctgccgaaattcacataaacaacggaacccgattcctt 4592803  T
Q  328 ggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaataatgaaggt 427  Q
     ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4592804 cgattcaagccatttaagacactcagtatcttctttccatatgttggaaccaaaagaatccaattgatggatttgtggagtttggtttaataatgaaggt 4592903  T
Q  428 aaggggccaatcggataaatagaaggaattatggaggagagagcatttattacatcactctcaagttcattgaaagtattcaaaagaatagtag 521  Q
    || |||||||| || |||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4592904 aaagggccaatggggtaaagagaaggaaacatagaggagagagcatttattacatcactctcaagttcattgaaagtattcaaaataatagtag 4592997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 4514988 - 4514493
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  4514988 attggcactccagcgcatatgctctcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccgccaattgaagggtggttcaaaactttctcttgtggac 4514889  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  4514888 accaacttgctattaggcctctatctgcaatttcattcacaaactcagacgacaaaaccactgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccataa 4514789  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||| ||| || | |||||  || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||     
T  4514788 aaaggttttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacaatttctccggagacataatcgtgatgctaccaaaattaacataaacaacagatcct 4514689  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaata 419  Q
    |  || || ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||   |||||||| |||| || || |    
T  4514688 gattcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattggaacctaaagattccaagtgat---tttgtggactttgattcaaaa 4514592  T
Q  420 atgaaggtaaggggccaatcggataaatagaaggaattatggaggagagagcatttattacatcactctcaagttcattgaaagtattcaaaagaatag 518  Q
    | ||||  || |||||||| |  || | |||||| |  || ||  | |||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  4514591 acgaagcaaatgggccaatggtgtatagagaagggagcatagaataaagagcattcataacatcactctcaagatcattagaagtatttaaaaaaatag 4514493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 4299673 - 4299193
Alignment:
Q  35 catatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggacaccaacttgctatga 134  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| | |||||  | |    
T  4299673 catatgctttcaatggttgagttccatccacagtgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacactagcttgcggtta 4299574  T
Q  135 ggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaaaaatggtttcttgca 234  Q
    ||||||||| || |||||||||   |||||||||||| ||||| |   |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4299573 ggcctctatttgaaatttcattctcaaactcagatgacaaaataaacaagccgccaatgacaaggtctggcctaatgatccacaaaaatggtttcctgca 4299474  T
Q  235 attggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccgggctccttggattca 334  Q
    ||||||||||||||||||||  || |  | |||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4299473 attggccaaaccccaagcaatctctaacagttgctctggagtcataactgtaacgctgccaaaattcacataaacaaccgatcccggctccttggattca 4299374  T
Q  335 agccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaataatgaaggtaaggggc 434  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||   | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  4299373 agccattcaagacatttggtatcttctttccaaagattggaacctaaagattccaagtgat---tatgtggagtttgatttaataatgaaggtaaaggtc 4299277  T
Q  435 caatcggataaatagaaggaattatggaggagagagcatttattacatcactctcaagttcattgaaagtattcaaaagaatag 518  Q
    |||| | ||| | |||||| |  || ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||    
T  4299276 caatagtatataaagaagggaacatagaatagagagcattcattacatcactctcaagttcatcataagtattaaaaacaatag 4299193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 4267033 - 4266559
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4267033 attggcactccagcacatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggac 4266934  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||   ||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4266933 accaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttaaaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaa 4266834  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||| || |||||||  |||||||||||||||||||| || |  |  | |||  ||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||      
T  4266833 aaaagggttcttgctgttggccaaaccccaagcaaactctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagatctt 4266734  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaata 419  Q
    || || || ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||   |||||||| |||| ||||| |    
T  4266733 ggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatcttctttccaaagattggaatttaaagatgccaagtgat---tttgtggactttgatttaaaa 4266637  T
Q  420 atgaaggtaaggggccaatcggataaatagaaggaattatggaggagagagcatttattacatcactctcaagttcat 497  Q
    | ||||  || |||||||| |  || |||||||| |  || ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4266636 aagaagcaaatgggccaatggtgtatatagaagggaacatagagtagagagcattcataacatcactctcaagttcat 4266559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 383
Target Start/End: Original strand, 4506122 - 4506485
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||||| ||    
T  4506122 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtgatttaacactttctcttgtgaac 4506221  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||| || || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4506222 accagcttgctataaggcttctatctgaaatttcatttgcaaactctgaagacaaaaccactgagccaccaattacaagatcaggcctaatgatccacaa 4506321  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||| ||| || | ||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |     
T  4506322 aaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaaaaatttctccggagacataattgtgatgcttccaaaattcacataaacaacagaagcc 4506421  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaag 383  Q
    || || || ||||| ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  4506422 ggttcttttgattccagccattcgagacatttagtatcctctttccaaagatttgaatctaaag 4506485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Original strand, 4461391 - 4461752
Alignment:
Q  23 ggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggacacc 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||   |||| |||||||    
T  4461391 ggcactccagcacatatgctttcagtggttgaattccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacacc 4461490  T
Q  123 aacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaaaaa 222  Q
    | |||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4461491 agcttgctattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactcagatgacaaaataaacgagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccataaaaa 4461590  T
Q  223 tggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccgggc 322  Q
     |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |  | ||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||     
T  4461591 gggtttcttgctatcagccaaaccccaagcaaactctaacagttgatcaggagtcataactgtgatgctgccaaaatttacatagacaacagatcctggt 4461690  T
Q  323 tccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaaga 384  Q
    || || ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4461691 tcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattggaatttaaaga 4461752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4504264 - 4503900
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4504264 attggcactccagcacaaacactttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttatcttgtggac 4504165  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    ||||||||||||  || |||||||  | | |||||||   ||| |||||||| || | | ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  4504164 accaacttgctacaagtcctctattagaagtttcattcacaaaatcagatgacaacacctctgagccaccaataacaagatcaggcctaataatccacaa 4504065  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||  ||    | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  4504064 aaaaggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacaatttatcttaagacataactgtaatgctgccaaaatttacataaacaacagatcct 4503965  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaaga 384  Q
    || || ||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  4503964 ggttcttttaattcaagccaatcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaaga 4503900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4613585 - 4613231
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||   |||| ||||    
T  4613585 attggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaagaatccgccaattgaagggtggtttaatacttgctcttgaggac 4613486  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    |||| || || || ||||||||||||| |||||||||   |||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4613485 accagctcgcgattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactctgatgacaaaacaactgagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaa 4613386  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || | || ||  || |  |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||        
T  4613385 aaagggttgcttgctattcgccaaaccccaagcaaactctaatagtttttctgcagtcataacggtcatgctcccaaaattcacataaacaacggacttc 4613286  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttgg 374  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  4613285 ggttccttggattcaagccaatcaagacacttggtatcttctttccaaagattgg 4613231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 4560771 - 4561118
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  4560771 attggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgatgggtggttcaatactttctcttgtggac 4560870  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||  ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  4560871 accaacttgctattagtcctctatctgaaatttc-tttcaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccataa 4560969  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |    || |||  | | | |||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  4560970 aaatggtttcttgctgttggccaaaccccaagcaaactctaaggctt-ctcttgagacttaacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatcct 4561068  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaag 369  Q
    || || || ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  4561069 ggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaag 4561118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 384
Target Start/End: Original strand, 4574573 - 4574937
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||  |||||||||    
T  4574573 attggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtggac 4574672  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||   ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4574673 accaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaa 4574772  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |  |  | |||  | | |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||      
T  4574773 aaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatctt 4574872  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaaga 384  Q
    || || || ||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  4574873 ggttcttttgattcaatccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaaga 4574937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 497
Target Start/End: Original strand, 4585901 - 4586375
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||   |||| || |    
T  4585901 attggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccacagtgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcaatacttgctcttgcgggc 4586000  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    ||||||  || || ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  4586001 accaacccgcgattaggcctctatctgaaatttcattcttaaactcagatgacaaaaccaaggaaccaccaatgacaagatcaggtctaatgatccataa 4586100  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | || ||  || |  |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| || |      
T  4586101 aaaatgttgcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaatagtttttctgtagtcataactgttgtgctcccaaaattcacataaacaacggacctc 4586200  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaata 419  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || | |  ||||||  | || || |   |||||||| |||| ||||| |    
T  4586201 ggttcctttgattcaagccaatcaagacacttggtatcctctttccaaagatttgtacttaaagatgctaagtggt---tttgtggactttgatttaaaa 4586297  T
Q  420 atgaaggtaaggggccaatcggataaatagaaggaattatggaggagagagcatttattacatcactctcaagttcat 497  Q
    |||| | ||| |||||||| | |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  4586298 atgatgataaagggccaatggcataaatagaagggaacttagtggagagaacatttattacatccttctcaagttcat 4586375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Original strand, 4622413 - 4622811
Alignment:
Q  26 actccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggacaccaac 125  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |  ||||   |||||||||||||||    
T  4622413 actccagcacatatgctttcggtggttgaattccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgcagggtggttaagtacttcctcttgtggacaccaac 4622512  T
Q  126 ttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaaaaatgg 225  Q
     ||| || ||||||||| ||| |||||||||   |||||||||||| ||||| |  ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  4622513 ctgcgattaggcctctacctgaaatttcattctcaaactcagatgacaaaataaacgagccgcccatgacaaggtcaggcctaatgatccacaaaaaggg 4622612  T
Q  226 tttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccgggctcc 325  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| || | || ||| ||  | ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||  | || |||    
T  4622613 tttcttgctatcagccaaaccccaagcaaactctaatagttgatctcgagtcatcactgtaatgctgccaaaattcacgtaaacaa--gagtcaggttcc 4622710  T
Q  326 ttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaataatgaag 425  Q
    |||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||| |||||| ||| |||  |||| ||||   | ||||||||||| |||||||||||||    
T  4622711 ttggattcaagccactcaagacacttgatatcttctttccaaagattggaacctagagatgccaagtgat---tatgtggagtttgatttaataatgaag 4622807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 4480958 - 4481307
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  4480958 attggcactccagcacatacactttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccgccgattgaagggtggttcaaaactttctcttgtggac 4481057  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||   | |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||    
T  4481058 accaacttgctattaggcctctatttgaaatttctttcaaatactcagatgacaacaccactgagccaccaatgacaagattagacctaataatccacaa 4481157  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    |||   ||| |||| |||||| |||||||||||||| || |  | || |||  | | ||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  4481158 aaagttttttttgctattggcaaaaccccaagcaaactctaagagtttctcttgagacataattgtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatcct 4481257  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaag 369  Q
    || || || ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  4481258 ggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaag 4481307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 384
Target Start/End: Original strand, 3172006 - 3172370
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    ||||||| |||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||    
T  3172006 attggcattccagcacatacactttccgtggttgagttccatccgcagtgagtcaagaatccgccaattgaaggatggttcaacactttctcttgcggac 3172105  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3172106 accaacttgctattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaacaaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaataatccacaa 3172205  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || | ||||| |||  | | ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| |||       
T  3172206 aaagggtttcttgctgttggctaaaccccaagcaaactctaataatttctcttgagacataactatgatgctgccaaaatttacataaacaacagatttt 3172305  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaaga 384  Q
    |  || || | ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3172306 gattcttttgtttcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagaatctaaaga 3172370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 497
Target Start/End: Original strand, 4457859 - 4458334
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4457859 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagtttcatccacaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttatcttgtggac 4457958  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| | | |||||||   ||| || ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  4457959 accaacttgctattaagcctctatcagaagtttcattcacaaaatccgatgacaaaacaaccgagccaccaatgacaagatcaggcctagttatccacaa 4458058  T
Q  220 aaatgg-tttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatcc 318  Q
    ||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |  |  | |||  | | ||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||       
T  4458059 aaaaggttttcttgctgttggccaaaacccaagcaaattctaagagcttctcttgagacataactgtgatgcttccaaaatttacataaataacagactt 4458158  T
Q  319 gggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaat 418  Q
     || || || ||||||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||   |||||||| |||| ||||      
T  4458159 tggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatattctttccaaagattggaatttaaagatgccaagtgat---tttgtggactttgatttata 4458255  T
Q  419 aatgaaggtaaggggccaatcggataaatagaaggaattatggaggagagagcatttattacatcactctcaagttcat 497  Q
    || ||||  || |||||||| |  || |||||||| |  || ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  4458256 aaagaagcaaatgggccaatggtgtatatagaagggaacatagagtagagagtattcataacatcactctcaagttcat 4458334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 384
Target Start/End: Original strand, 4470068 - 4470432
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||   |||| ||||    
T  4470068 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgattgaagggtggttcagtacttgctcttgaggac 4470167  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    ||||  |  | || ||||||||||||| |||| |||||  || ||| ||||| ||||  || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4470168 accagttcacgattaggcctctatctgaaattccatttacaatctctgatgagaaaactaccgagccgccaatgacaagatcgggcctaatgatccacaa 4470267  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || |  | || ||| || | ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||     
T  4470268 aaagggttgcttgctatttgccaaaccccaagcaaactctaacagtttctctggagacataactgtgacgctgccgaaatttacatagacaacagatcct 4470367  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaaga 384  Q
    || || || ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  4470368 ggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatcttctttccaaagattgaaatttaaaga 4470432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 498
Target Start/End: Original strand, 4598436 - 4598911
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||   ||||  |||    
T  4598436 attggcactccggcacatatactttcagtggttgagttccatccgcaatgagttaagaatccaccaattgaaggatggtttaatacttgctcttgcagac 4598535  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    |||| ||||| |  | ||||||||||| |||||||||   |||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4598536 accagcttgcaactaagcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaacaaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaa 4598635  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  || |  || |  ||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || |      
T  4598636 aaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaagtctaacaacttttctgcagtcatcaccgttatgctcccaaaattcacataaacaacagacctt 4598735  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaata 419  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||||  ||||   |||  ||||| || |||| ||||| |    
T  4598736 ggttcattggattcaagccagtcaagacacttggtatcttctttccaaagattggtacctaaagatgccaa---atgcttttgttgactttgatttaaaa 4598832  T
Q  420 atgaaggtaaggggccaatcggataaatagaaggaattatggaggagagagcatttattacatcactctcaagttcatt 498  Q
    | |||| ||| |||||||| | ||||||| |||| |  ||   ||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  4598833 acgaagataaagggccaatggcataaatacaagggaacatactggagagaacattcaatacatcattctcaagttcatt 4598911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 384
Target Start/End: Original strand, 4626216 - 4626580
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||    
T  4626216 attggaactccagcgcatatgctttcaatggttgagttccatccacaatgagttaagaatccaccaattgaaggatggttcagtactttctcttgcggac 4626315  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||   |||||| |||||  |||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4626316 accagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattctcaaactcggatgacgaaataaatgagccaccaatcacaagatcaggcctaatgatccacaa 4626415  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |  | || ||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| ||        
T  4626416 aaagggtttcttgctatcagccaaaccccaagcaaactctaacagtttctgtggagtcataactataacgctgccaaagttcacataaacaacagacttt 4626515  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaaga 384  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4626516 ggttccttgaattcaagccattcaagacaattggtgtcttctttccaaagattggaacctaaaga 4626580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 4260003 - 4259547
Alignment:
Q  38 atgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggacaccaacttgctatgaggc 137  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||| ||||||||  ||||   |||| |||||||| || || || ||||    
T  4260003 atgctttcaatggttgagttccatccgcaatgagttaagaatccaccaactgaagagtggttcagtacttgctcttgcggacaccagctcgcgattaggc 4259904  T
Q  138 ctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaaaaatggtttcttgcaatt 237  Q
    ||||||| | ||||||| |   |||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4259903 ctctatccgaaatttcactctcaaactcagatgacaaaataaaggagccaccaataatgaggtcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctatt 4259804  T
Q  238 ggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccgggctccttggattcaagc 337  Q
    |||||| ||||||||||| || |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | || |||||  ||||||||    
T  4259803 ggccaatccccaagcaaactctaaaaattgatctggagtcataactgtaatgctgccaaaattcacgtaaacaacagactcaggttccttaaattcaagc 4259704  T
Q  338 caatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaataatgaaggtaaggggccaa 437  Q
    || |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||   | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  4259703 cattcaagacatttggtatcttctttccaaagattggaacctaacgatgcca---ggtgattatgtggagtttgatttaataatgaaggtaaaggtccaa 4259607  T
Q  438 tcggataaatagaaggaattatggaggagagagcatttattacatcactctcaagttcat 497  Q
    | | ||| | |||||| |  || ||  ||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4259606 tagcatataaagaagggaacatagaatagagcacattcattacatcactctcaagttcat 4259547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4490222 - 4489858
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||  || |||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||    
T  4490222 attggcactccagcacatatactctccatgattgagttccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtgattcaataccttctcttgtggac 4490123  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||   ||| |||||||| || | |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4490122 accaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgacaacacctgtgagccaccaataacaagatcaggcctaatgatccacaa 4490023  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| || | ||  | |||  | | |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  4490022 aaagggtttcttgctgttggccaaaccccatgcaaactctaatagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatcct 4489923  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaaga 384  Q
    || || || ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  4489922 ggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaaga 4489858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 368
Target Start/End: Original strand, 4579697 - 4580045
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||   |||| ||||    
T  4579697 attggaactccagcagatatgctttcagtgattgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggac 4579796  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    |||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||   |||||| ||||| ||||   ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4579797 accagctcgttattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaacagctgagccgccgatgacaagatcgggcctaatgatccacaa 4579896  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||| |||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || |  | ||  || |  ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| || |      
T  4579897 aaagggttgcttgctatttgctaaaccccatgcaaactctaacagtttttctgcagtcataactgtcaagctcccaaaattcacataaacaacagaccta 4579996  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaa 368  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  4579997 ggttccttggattcaagccaataaagacacttggtatcttctttccaaa 4580045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 374
Target Start/End: Original strand, 4557390 - 4557744
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||   |||| || |    
T  4557390 attggaactccagcagatatgctttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaaggatggtttaatacttgctcttgcgggc 4557489  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    |||| |  || || ||||||||||||| |||||||||   |||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4557490 accagcccgcgattaggcctctatctgaaatttcattgacaaactccgatgacaaaacaactgagccaccgatgacaagatcgggcctaatgatccacaa 4557589  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||| |||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || |  | ||  || |  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |      
T  4557590 aaagggttgcttgctatttgctaaaccccatgcaaactctaacagtttttctgccgtcataactgtcatgctcccaaaattcacataaacaacggacctc 4557689  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttgg 374  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  4557690 ggttccttggattcaagccaaccaagacacttgttatcttctttccaaagattgg 4557744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 4256478 - 4256076
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||  ||||   |||| ||||    
T  4256478 attggaactccggcacaaatgctttcaatggttgagttccatcctcaatgagtcaagaatccaccaactgaagagtggttcagtacttgctcttgcggac 4256379  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    |||||||  | || || |||||||| |             |||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  4256378 accaactctcgattagtcctctatccg-------------aaactcagatgacaaaataaaggagccaccaatgacgaggtcaggcctaatgatacacaa 4256292  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |  | ||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  |     
T  4256291 aaatggtttcttgctattggccaatccccaagcaaactctaacagttgatctggagtcataactgtaatgctgccaaaattcacgtaaacaacagactca 4256192  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaata 419  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||    ||| | ||||||||||| |||||||    
T  4256191 ggttccttggattcaagccattcaagacacttggtatcttctttccaaagattggaacctaacgatgccaa---gtgactatgtggagtttgatttaata 4256095  T
Q  420 atgaaggtaaggggccaat 438  Q
    |||||||||| || |||||    
T  4256094 atgaaggtaaaggtccaat 4256076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 56 - 518
Target Start/End: Original strand, 4516622 - 4517081
Alignment:
Q  56 ttccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggacaccaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcat 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| | ||||||||| | | ||||||    
T  4516622 ttccatccacaatgagtcaagaatcctccaactgaaggatggttcaacactttctcttgcggacaccagcttgctattacgcctctatccgaagtttcat 4516721  T
Q  156 ttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaaaaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaa 255  Q
    |   ||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  4516722 tcacaaaatcggatgacaaaataaccgagccaccaatgacaaggtcaggcctaataatccacaaaaaaggtttcttgctgttggccaaaccccaagcgaa 4516821  T
Q  256 ttccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccgggctccttggattcaagccaatcaagacactctgta 355  Q
     || |  | ||| || || ||||| || || ||||| || |||||||||||||| || || ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| |   ||    
T  4516822 ctctaacagttgatctggagtcatgaccgtgatgcttccaaaattcacataaactacagaaccttgttccttagattcaagccattcaagacatttcata 4516921  T
Q  356 tcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaataatgaaggtaaggggccaatcggataaatagaaggaa 455  Q
    |||||||||||||| || ||| ||| |||  |||| | ||   |||| ||| |||| || || ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||| |    
T  4516922 tcttctttccaaagattagaacctatagaagccaagttat---tttgcggactttgattcaaaaatgaagttaaagggccaatggcataaatagaaggga 4517018  T
Q  456 ttatggaggagagagcatttattacatcactctcaagttcattgaaagtattcaaaagaatag 518  Q
    |  |    || |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| |||| |||||    
T  4517019 tcttaatagatagagcatttattacatcattctcaagttcatcagaagtattgaaaacaatag 4517081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 374
Target Start/End: Original strand, 4571253 - 4571591
Alignment:
Q  36 atatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggacaccaacttgctatgag 135  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||  |||| |  |||||||  || || ||    
T  4571253 atatgctttcggtcgttgagttccatccacagtgagtcaagaaaccaccaattgaaggatggttcaatactttctcttgcgagcaccaaccagcaattag 4571352  T
Q  136 gcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaaaaatggtttcttgcaa 235  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||| |    
T  4571353 gcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaacaactgagccaccaatgacaagatcgggcctaatgatccacaaaaagagttgcttgcta 4571452  T
Q  236 ttggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccgggctccttggattcaa 335  Q
    || || |||||||| ||||| || |  | ||  || |  |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||| |||||||    
T  4571453 tttgctaaaccccatgcaaactctaacagtttttctgaagtcataactgtcctgctcccaaaattcacataaacaacggacctcggttcctttgattcaa 4571552  T
Q  336 gccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttgg 374  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  4571553 gccaatcaagacacttgttatcttctttccaaagattgg 4571591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 251
Target Start/End: Original strand, 4568357 - 4568552
Alignment:
Q  56 ttccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggacaccaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcat 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||   |||| |||||||| ||||||||  |||||||||| | | || |||    
T  4568357 ttccatccacaatgagtcaagaatcgtccaactgaagggtggttcaacacttgctcttgcggacaccagcttgctatttggcctctatccgaagttccat 4568456  T
Q  156 ttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaaaaatggtttcttgcaattggccaaaccccaag 251  Q
    |   |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  4568457 tcacaaactcggatgacaaaataactgagccaccaatgacaagctaaggcctaatgatccacaaaaaaggtttcttgctgttggcaaaacctcaag 4568552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 146
Target Start/End: Original strand, 4493220 - 4493346
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    ||||||||||| || |||||| |||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| || |||  |||||||||    
T  4493220 attggcactccggcacatatgtttttggtagttgagttccatccacaatgagtcaagaatccaccaatcgaatggtggttcagcagtttctcttgtggac 4493319  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctg 146  Q
    ||||||| || || |||||||||||||    
T  4493320 accaactagcaattaggcctctatctg 4493346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 528
Target Start/End: Original strand, 1281379 - 1281887
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1281379 attggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgattgaagggtggttcaacactttctcttgtggac 1281478  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1281479 accaacttgctattaggcctctatctgaaatttcattcgcaaagtcagatgacaaaatcactgagccgccaatgacaagatcaggcctagtgatccacaa 1281578  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| | | |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||      
T  1281579 aaatggtttcttgctattagccagaccccaagcaaattcctgaagttgctctggagtcataactgtaatgcttccgaaattcacataaacaacagatctc 1281678  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaata 419  Q
    || ||||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1281679 ggttccttcgattcaagccattgaagacactcgatatcttctttccaaaggttggaatctaaagaatccaattgatgaatttgtggagtttggtttaata 1281778  T
Q  420 atgaaggtaaggggccaatcggataaatagaaggaattatggaggagagagcatttattacatcactctcaagttcattgaaagtattcaaaagaatagt 519  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1281779 atgaaggtaaagggccaatcgggtaaacagaaggaattatagaggagagagcatttattacatcactctcaagttcattgaaagtattcaaaagaatagt 1281878  T
Q  520 agtgtctct 528  Q
    || ||||||    
T  1281879 agagtctct 1281887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 20 - 529
Target Start/End: Original strand, 1674491 - 1675001
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1674491 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagttccatccgcagtgtgtcaagaatccgccgattgaagggtggttcaacactttctcttgtggac 1674590  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1674591 accaatttgatattaggcctctatctgaaatttctttcataaactcagatgacaaaaccactgagccaccaatgacaagatcaggcctagtgatccacaa 1674690  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| || || ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  1674691 aaaaggtttcttgcaatcggccaaaccccaagcaaactccaatagttgatctggagtcataacaataatgctaccgaaattcacataaacaaccgatccc 1674790  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaata 419  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1674791 ggttcgttggattcaagccattcaagacactcagtatcttctttccaaaggttggaacctaaagattctaattgatgaatttgtggagtttggtttaata 1674890  T
Q  420 atgaaggtaaggggccaatcggataaatagaaggaattatggagga-gagagcatttattacatcactctcaagttcattgaaagtattcaaaagaatag 518  Q
    |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||  |  ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  1674891 atgaaggtaaagggccaatggggtaaagagaaggaaacaaagaggaggagagcggttattacatcactctcaagttcattgaaagtattcaaaataattg 1674990  T
Q  519 tagtgtctctg 529  Q
    ||| |||||||    
T  1674991 tagagtctctg 1675001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 20863710 - 20863215
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  20863710 attggcactccagcacatatgctctcaatggttgagttccatccacaatgagttagaaatccaccaattgaaggatggttcaacaccttctcttgtggac 20863611  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    ||||||| || || ||||||||||||| |||||||||   |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20863610 accaactcgcgattaggcctctatctgaaatttcattcacaaacgcagatgaaaaaatcaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaa 20863511  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |  ||||  ||    | ||| |||||  | ||||| ||||| ||||| ||||  |||||     
T  20863510 aaagggtttcttgctgttggccaaaccccatgcaaactctaacaatttttctacagacatgactgtggtactgccaaaatttacatatacaatagatccc 20863411  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaata 419  Q
    || || || |||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| ||||   | |||||| |||| ||||| |    
T  20863410 ggttctttcgattcaagccatgcaagacattcagtgtcttctttccaaagacttgaatctaaagacgccaagtgat---tctgtggactttgatttaaaa 20863314  T
Q  420 atgaaggtaaggggccaatcggataaatagaaggaattatggaggagagagcatttattacatcactctcaagttcattgaaagtattcaaaagaatag 518  Q
    | |||   || |||||||| |  || | |||||| |  || ||  ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  20863313 aagaaacaaaagggccaatggtgtatagagaagggaacatagaatagagaacattcataacatcactctcaagctcattgaaagtattgaaaacaatag 20863215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16686134 - 16685785
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||   |||| || |    
T  16686134 attggaactccagcatatatactttcagtggttgagttccatccacaatgagttaagaatccaccgattgaaggatggtttaatacttgctcttgcgggc 16686035  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    |||| || || || |||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||| ||| || || | |||||||||||||| ||| ||||||||       
T  16686034 accagctcgcgattaggcttctatctgagatttcattcttaaactcagatgacaaaaccacggaaccgcaaatgacaagatcagacctaatgatccattg 16685935  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    |||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || | || ||  || |  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |      
T  16685934 aaaatgttgcttgctattggtcaaaccccaagcaaactctaatagtttttctgcagtcataactgtcatgctcccaaaattcacataaacaacggaactc 16685835  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaag 369  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  16685834 ggttccttggattcaagccaatcaagacacttggtatcttatttccaaag 16685785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3586 - 3179
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||||   |||||||||    
T  3586 attggtactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggatcagtacttgctcttgtggac 3487  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    |||| ||||  || ||||||||||||| |||||||||   ||| || ||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3486 accagcttgtgattaggcctctatctgaaatttcattctcaaattctgatgacaaaataaacgagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaa 3387  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |  | ||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |     
T  3386 aaacggtttcttgctatcggccaaaccccaagcaaattctaacagttgatttggagtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaacagactca 3287  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatct-aaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaat 418  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||   | |||||||||||  |||||    
T  3286 ggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatcttctttccaaagattggaacctaaaagattccaagtgat---tatgtggagtttgacttaat 3190  T
Q  419 aatgaaggtaa 429  Q
    |||||||||||    
T  3189 aatgaaggtaa 3179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 497
Target Start/End: Original strand, 24103264 - 24103738
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  24103264 attggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggtttaacactttatcttgtggac 24103363  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| || ||| ||   ||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24103364 accaacttgctattagtcctctatctgaaacttctttaaaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaa 24103463  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |  | |||  ||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||      
T  24103464 aaaagggttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaactgatctt 24103563  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaata 419  Q
    || || || ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||   |||||||| |||| ||||| |    
T  24103564 ggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatcttctttccaaagattggaatttaaagatgccaagtgat---tttgtggactttgatttaaaa 24103660  T
Q  420 atgaaggtaaggggccaatcggataaatagaaggaattatggaggagagagcatttattacatcactctcaagttcat 497  Q
    | ||||  || |||||||| |  || |||||||| |  || ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24103661 aagaagcaaatgggccaatggtgtatatagaagggaacatagagtagagagcattcataacatcactctcaagttcat 24103738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27999966 - 27999745
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  27999966 attggcactccagcgcatatgctttcggtggttgagttccatccgcagtgagtcaagaacccgctgattgaagggtggttcaaaactttctcttgtggac 27999867  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  27999866 accaatttgatattaggcctctatctgaaatttctttcctaaactcagatgacaaaaccactgagccaccaatgacaagattaggcctagtgatccacaa 27999767  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggcc 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  27999766 aaaaggtttcttgcaattggcc 27999745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 20155290 - 20155247
Alignment:
Q  50 gttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagg 93  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20155290 gttgaattccatccacaatgtgtcaagaatcctccaattgaagg 20155247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 4553 - 4060
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||   |||||||||    
T  4553 attggcactcctacacatatgctttcaatggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgtggac 4454  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    |||| || || || ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4453 accagctcgcaattaggcctctatctgaaatttcattctcaaactcagatgacaaaataaacgagccgccaatgacaaggtcaggcctaatgatccacaa 4354  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    ||| | |||||| ||||||| |||| |||||||||| || |  | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |     
T  4353 aaaggatttcttacaattggtcaaaacccaagcaaactctaacagttgatctggagtcataactgtaatgcttccaaaattcacataaacaaccgactca 4254  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttgtggagtttgttttaata 419  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||      |||  ||| | ||||||||||| |||||||    
T  4253 ggttccttggatgcaagccactcaagacacttggtatcttctttccaaagattggaacctaaag------attagtgattatgtggagtttgatttaata 4160  T
Q  420 atgaaggtaaggggccaatcggataaatagaaggaattatggaggagagagcatttattacatcactctcaagttcattgaaagtattcaaaagaatagt 519  Q
    |||||| ||| || ||||| | ||| | |||||| |  || ||  |||||||||| | |||| | ||||||||||||| | |||| || |||| ||||||    
T  4159 atgaagttaaaggtccaatggtatataaagaagggaacatagaatagagagcattcaatacaccgctctcaagttcatcgtaagtgttgaaaacaatagt 4060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 384
Target Start/End: Original strand, 3086685 - 3087049
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgacttgtggac 119  Q
    ||||||||||||||   || |||||||   ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||    
T  3086685 attggcactccagcaagtacgctttcaaccgttgagttccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtgattcaatacttgctcttgcggac 3086784  T
Q  120 accaacttgctatgaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgataaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaa 219  Q
    |||| ||||| || || |||||||||| |||||| ||   |||||||||||| | ||| |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3086785 accagcttgcgattagacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaa 3086884  T
Q  220 aaatggtttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatccg 319  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | || ||||||  | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |     
T  3086885 aaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaatagttgctcttgagtcataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagactca 3086984  T
Q  320 ggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaaga 384  Q
     |  |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  3086985 agtccctttgattcaagccattcaagacacttggtatcttctttccaaagattggaacctaaaga 3087049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 48532826 - 48532780
Alignment:
Q  50 gttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtg 96  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  48532826 gttgaattccatccacaatgtgttaagaatcctccaattgaagggtg 48532780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 293 - 529
Target Start/End: Original strand, 1 - 238
Alignment:
Q  293 ccgaaattcacataaacaactgatccgggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaatt 392  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  1 ccgaaattcacataaacaaccgatcccggttcgttggattcaagccattcaagacactcagtatcttctttccaaaggttggaacctaaagattctaatt 100  T
Q  393 gatgaatttgtggagtttgttttaataatgaaggtaaggggccaatcggataaatagaaggaattatggagga-gagagcatttattacatcactctcaa 491  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||  |  ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  101 gatgaatttgtggagtttggtttaataatgaaggtaaagggccaatggggtaaagagaaggaaacaaagaggaggagagcggttattacatcactctcaa 200  T
Q  492 gttcattgaaagtattcaaaagaatagtagtgtctctg 529  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  201 gttcattgaaagtattcaaaataattgtagagtctctg 238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 3551 - 3465
Alignment:
Q  20 attggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactt 107  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || | | ||||||||||||||||||    
T  3551 attggaactccagaacaaatgctttcaatggttgagttccatccacaatgagttaagaatccaccaact-aagggtggttcaacactt 3465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University