View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11048_high_13 (Length: 417)

Name: NF11048_high_13
Description: NF11048
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11048_high_13
NF11048_high_13
[»] chr3 (92 HSPs)
chr3 (2-403)||(11188506-11188907)
chr3 (2-392)||(53057979-53058369)
chr3 (2-403)||(18122901-18123301)
chr3 (2-389)||(2559705-2560084)
chr3 (85-403)||(11221387-11221705)
chr3 (31-388)||(21639381-21639738)
chr3 (2-367)||(14907958-14908323)
chr3 (2-387)||(19886349-19886732)
chr3 (2-233)||(17244604-17244835)
chr3 (201-403)||(14954123-14954325)
chr3 (2-296)||(14078671-14078965)
chr3 (2-403)||(18696143-18696544)
chr3 (2-198)||(14952693-14952889)
chr3 (2-292)||(8997183-8997473)
chr3 (2-292)||(15847609-15847899)
chr3 (6-296)||(16029525-16029812)
chr3 (2-292)||(1062850-1063140)
chr3 (2-292)||(12754017-12754307)
chr3 (2-292)||(17016490-17016780)
chr3 (2-292)||(29934795-29935085)
chr3 (2-292)||(29983949-29984239)
chr3 (72-403)||(15960583-15960914)
chr3 (2-292)||(13262905-13263195)
chr3 (2-289)||(1785312-1785599)
chr3 (2-289)||(9381899-9382186)
chr3 (2-289)||(11207330-11207617)
chr3 (2-289)||(4432475-4432759)
chr3 (2-289)||(12288215-12288502)
chr3 (2-403)||(39381399-39381800)
chr3 (2-289)||(5538256-5538543)
chr3 (2-289)||(5580868-5581155)
chr3 (2-289)||(6183201-6183488)
chr3 (2-289)||(13373903-13374190)
chr3 (2-289)||(13384497-13384784)
chr3 (2-289)||(20674432-20674719)
chr3 (2-292)||(10628180-10628470)
chr3 (2-403)||(505291-505692)
chr3 (2-403)||(4753034-4753435)
chr3 (2-403)||(6491467-6491868)
chr3 (2-403)||(9983009-9983410)
chr3 (2-403)||(24384639-24385040)
chr3 (2-403)||(41692964-41693365)
chr3 (2-289)||(5866931-5867218)
chr3 (2-289)||(14474936-14475223)
chr3 (2-289)||(16392283-16392570)
chr3 (2-289)||(23766609-23766896)
chr3 (2-292)||(14312644-14312934)
chr3 (2-292)||(15652341-15652631)
chr3 (2-403)||(11273506-11273907)
chr3 (2-403)||(24669185-24669586)
chr3 (2-289)||(19787737-19788024)
chr3 (2-292)||(29462450-29462740)
chr3 (2-289)||(5519583-5519870)
chr3 (2-289)||(28315473-28315760)
chr3 (2-289)||(38203967-38204254)
chr3 (2-289)||(8783978-8784265)
chr3 (2-292)||(12238849-12239140)
chr3 (2-403)||(37884294-37884695)
chr3 (2-256)||(13130985-13131239)
chr3 (2-292)||(7795853-7796143)
chr3 (2-289)||(16397253-16397542)
chr3 (57-289)||(47541557-47541788)
chr3 (2-92)||(5211188-5211278)
chr3 (301-403)||(17244504-17244606)
chr3 (2-254)||(16306398-16306650)
chr3 (2-193)||(37875776-37875967)
chr3 (2-286)||(19658840-19659121)
chr3 (292-360)||(16031325-16031393)
chr3 (36-136)||(1462963-1463063)
chr3 (356-403)||(11222412-11222459)
chr3 (323-403)||(1463240-1463320)
chr3 (156-288)||(19631002-19631134)
chr3 (324-403)||(1063172-1063251)
chr3 (334-392)||(16881085-16881143)
chr3 (334-403)||(5519915-5519984)
chr3 (354-403)||(5580754-5580803)
chr3 (354-403)||(5866817-5866866)
chr3 (354-403)||(6183087-6183136)
chr3 (354-403)||(12288101-12288150)
chr3 (223-288)||(12411068-12411133)
chr3 (354-403)||(13373789-13373838)
chr3 (354-403)||(13384383-13384432)
chr3 (334-403)||(14078564-14078633)
chr3 (334-403)||(14475268-14475337)
chr3 (354-403)||(16392169-16392218)
chr3 (334-403)||(19788069-19788138)
chr3 (354-403)||(20674318-20674367)
chr3 (334-403)||(23766941-23767010)
chr3 (354-403)||(28315359-28315408)
chr3 (334-403)||(38204299-38204368)
chr3 (324-392)||(7795753-7795821)
chr3 (2-94)||(19631175-19631267)
[»] chr8 (51 HSPs)
chr8 (2-403)||(17287407-17287808)
chr8 (2-387)||(17015066-17015451)
chr8 (2-387)||(17541750-17542135)
chr8 (2-387)||(20256835-20257210)
chr8 (2-403)||(22462703-22463104)
chr8 (2-309)||(15976846-15977153)
chr8 (2-403)||(22672293-22672676)
chr8 (2-403)||(19941735-19942136)
chr8 (2-292)||(21297439-21297729)
chr8 (6-292)||(45569300-45569587)
chr8 (2-292)||(3842245-3842535)
chr8 (24-292)||(23791970-23792238)
chr8 (238-403)||(24834404-24834569)
chr8 (2-292)||(22148872-22149162)
chr8 (2-403)||(36302242-36302643)
chr8 (2-289)||(16745717-16746004)
chr8 (5-138)||(25164778-25164911)
chr8 (2-289)||(15781981-15782268)
chr8 (2-289)||(26119626-26119913)
chr8 (2-289)||(29075456-29075743)
chr8 (2-289)||(29085707-29085994)
chr8 (2-289)||(32078966-32079253)
chr8 (2-403)||(3349791-3350192)
chr8 (2-289)||(9367010-9367297)
chr8 (2-403)||(13689726-13690127)
chr8 (2-289)||(251124-251411)
chr8 (2-289)||(814225-814512)
chr8 (2-289)||(19137996-19138283)
chr8 (2-289)||(36087238-36087525)
chr8 (2-403)||(44490430-44490831)
chr8 (2-289)||(19234094-19234381)
chr8 (2-289)||(30315995-30316282)
chr8 (2-289)||(19427638-19427925)
chr8 (284-387)||(20375982-20376085)
chr8 (54-289)||(6159805-6160040)
chr8 (2-111)||(19940602-19940711)
chr8 (2-288)||(24666940-24667226)
chr8 (334-403)||(9367342-9367411)
chr8 (1-33)||(18152629-18152661)
chr8 (334-403)||(251456-251525)
chr8 (334-403)||(814557-814626)
chr8 (354-403)||(850131-850180)
chr8 (354-403)||(15781867-15781916)
chr8 (354-403)||(19138348-19138397)
chr8 (334-403)||(26119958-26120027)
chr8 (334-403)||(29075788-29075857)
chr8 (334-403)||(29086039-29086108)
chr8 (354-403)||(30315881-30315930)
chr8 (354-403)||(32078852-32078901)
chr8 (323-403)||(19427959-19428039)
chr8 (323-403)||(24679554-24679634)
[»] chr2 (54 HSPs)
chr2 (1-387)||(24574534-24574920)
chr2 (2-403)||(28702413-28702814)
chr2 (2-403)||(22782818-22783219)
chr2 (53-403)||(22256758-22257099)
chr2 (113-403)||(23185526-23185816)
chr2 (113-403)||(23596789-23597079)
chr2 (1-403)||(10899690-10900092)
chr2 (2-264)||(21137607-21137869)
chr2 (2-297)||(24842696-24842998)
chr2 (2-283)||(25119664-25119945)
chr2 (2-292)||(19303680-19303970)
chr2 (2-292)||(24802903-24803193)
chr2 (6-403)||(24303240-24303637)
chr2 (2-289)||(9764018-9764305)
chr2 (2-289)||(24416281-24416568)
chr2 (2-289)||(28722573-28722860)
chr2 (2-289)||(39171349-39171636)
chr2 (2-289)||(22916115-22916402)
chr2 (2-289)||(24329004-24329291)
chr2 (2-289)||(34791472-34791759)
chr2 (2-289)||(40249879-40250166)
chr2 (2-403)||(9898714-9899115)
chr2 (2-403)||(10276257-10276658)
chr2 (2-289)||(4219166-4219453)
chr2 (2-289)||(11396427-11396714)
chr2 (2-289)||(29253490-29253777)
chr2 (2-289)||(43091949-43092236)
chr2 (2-289)||(43353700-43353987)
chr2 (2-289)||(27230709-27230996)
chr2 (2-289)||(35262274-35262561)
chr2 (2-289)||(35272899-35273186)
chr2 (2-288)||(21919366-21919652)
chr2 (2-295)||(21163196-21163489)
chr2 (5-210)||(24723880-24724086)
chr2 (104-292)||(22773144-22773332)
chr2 (2-163)||(19301360-19301521)
chr2 (30-134)||(24567290-24567394)
chr2 (166-292)||(26878510-26878636)
chr2 (2-136)||(26876238-26876372)
chr2 (16-133)||(22682450-22682567)
chr2 (2-49)||(22254106-22254153)
chr2 (334-403)||(4219498-4219567)
chr2 (354-403)||(9763904-9763953)
chr2 (354-403)||(11396313-11396362)
chr2 (354-403)||(22916001-22916050)
chr2 (354-403)||(24328890-24328939)
chr2 (334-403)||(29253822-29253891)
chr2 (354-403)||(34791358-34791407)
chr2 (334-403)||(35262606-35262675)
chr2 (334-403)||(35273231-35273300)
chr2 (334-403)||(40250211-40250280)
chr2 (334-403)||(43092281-43092350)
chr2 (334-403)||(43354032-43354101)
chr2 (323-403)||(21163088-21163168)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (2-403)||(17246080-17246481)
chr4 (2-403)||(14905525-14905926)
chr4 (2-252)||(16852418-16852668)
chr4 (2-392)||(10662399-10662789)
chr4 (2-392)||(10876544-10876934)
chr4 (2-292)||(14712059-14712349)
chr4 (2-289)||(15195164-15195451)
chr4 (2-289)||(16316056-16316343)
chr4 (2-289)||(27816185-27816472)
chr4 (2-292)||(18065304-18065594)
chr4 (2-289)||(459892-460179)
chr4 (2-289)||(14837347-14837634)
chr4 (2-289)||(16265194-16265481)
chr4 (2-289)||(17927428-17927715)
chr4 (2-289)||(18131488-18131775)
chr4 (2-289)||(22005746-22006033)
chr4 (2-289)||(24649660-24649947)
chr4 (2-289)||(30927732-30928019)
chr4 (2-403)||(10741723-10742124)
chr4 (2-403)||(10955492-10955893)
chr4 (2-403)||(19945463-19945864)
chr4 (2-403)||(36027620-36028021)
chr4 (2-403)||(5021465-5021866)
chr4 (2-403)||(18753615-18754016)
chr4 (2-403)||(27665902-27666303)
chr4 (2-289)||(27175403-27175690)
chr4 (54-292)||(16820594-16820832)
chr4 (2-403)||(4988920-4989321)
chr4 (2-403)||(49516866-49517267)
chr4 (2-289)||(55746491-55746778)
chr4 (90-289)||(3389265-3389464)
chr4 (2-289)||(40455599-40455886)
chr4 (144-292)||(11470140-11470288)
chr4 (2-133)||(13694767-13694898)
chr4 (2-136)||(17527839-17527973)
chr4 (174-289)||(14844891-14845006)
chr4 (2-75)||(3380831-3380904)
chr4 (90-235)||(14903745-14903890)
chr4 (324-403)||(11470320-11470399)
chr4 (334-403)||(460224-460293)
chr4 (325-366)||(13695019-13695060)
chr4 (354-403)||(14844777-14844826)
chr4 (334-403)||(16265526-16265595)
chr4 (334-403)||(17927760-17927829)
chr4 (354-403)||(18131374-18131423)
chr4 (334-403)||(22006078-22006147)
chr4 (334-403)||(27175735-27175804)
chr4 (354-403)||(27816071-27816120)
chr4 (354-403)||(30927618-30927667)
chr4 (354-403)||(40455485-40455534)
chr4 (354-403)||(55746377-55746426)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (2-403)||(13878647-13879048)
chr7 (1-387)||(13028194-13028580)
chr7 (2-403)||(16311230-16311631)
chr7 (2-392)||(14172168-14172558)
chr7 (2-403)||(4413218-4413619)
chr7 (6-403)||(21211833-21212230)
chr7 (33-403)||(15466298-15466668)
chr7 (2-403)||(13680851-13681246)
chr7 (2-283)||(16547368-16547649)
chr7 (2-283)||(16618013-16618294)
chr7 (2-296)||(13173572-13173866)
chr7 (2-288)||(16408303-16408589)
chr7 (2-292)||(18439892-18440182)
chr7 (2-289)||(9168878-9169165)
chr7 (2-289)||(458305-458592)
chr7 (2-289)||(2706932-2707219)
chr7 (2-403)||(11003876-11004277)
chr7 (2-289)||(176187-176474)
chr7 (2-289)||(4221305-4221592)
chr7 (2-289)||(8626642-8626929)
chr7 (2-289)||(22098438-22098725)
chr7 (2-403)||(26391299-26391700)
chr7 (2-403)||(40043309-40043710)
chr7 (2-289)||(6868549-6868836)
chr7 (2-289)||(9442560-9442847)
chr7 (2-289)||(24743398-24743685)
chr7 (5-289)||(17951433-17951717)
chr7 (2-289)||(1996853-1997140)
chr7 (2-289)||(20988354-20988641)
chr7 (2-289)||(42875145-42875432)
chr7 (2-289)||(8003385-8003672)
chr7 (2-289)||(11014485-11014772)
chr7 (276-403)||(16546591-16546718)
chr7 (276-403)||(16618944-16619071)
chr7 (2-289)||(26654655-26654942)
chr7 (2-289)||(9093684-9093971)
chr7 (2-191)||(16309161-16309350)
chr7 (2-289)||(15879141-15879428)
chr7 (2-288)||(16106384-16106670)
chr7 (150-292)||(13175910-13176052)
chr7 (36-189)||(15087488-15087641)
chr7 (342-387)||(13173527-13173572)
chr7 (144-289)||(6879191-6879336)
chr7 (324-392)||(16308954-16309022)
chr7 (334-403)||(176519-176588)
chr7 (354-403)||(458191-458240)
chr7 (334-403)||(1997185-1997254)
chr7 (354-403)||(2706818-2706867)
chr7 (334-403)||(4221637-4221706)
chr7 (354-403)||(6868435-6868484)
chr7 (354-403)||(6879077-6879126)
chr7 (354-403)||(8003271-8003320)
chr7 (334-403)||(8626974-8627043)
chr7 (334-403)||(9094016-9094085)
chr7 (334-403)||(9442892-9442961)
chr7 (334-403)||(11014817-11014886)
chr7 (354-403)||(17951319-17951368)
chr7 (334-403)||(20988686-20988755)
chr7 (334-403)||(22098770-22098839)
chr7 (334-403)||(24743730-24743799)
chr7 (354-403)||(26654541-26654590)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (2-403)||(47821-48222)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (2-387)||(35941-36326)
scaffold0022 (2-387)||(134001-134386)
scaffold0022 (2-403)||(157643-158043)
scaffold0022 (2-289)||(45033-45320)
[»] chr1 (43 HSPs)
chr1 (2-403)||(23023374-23023775)
chr1 (2-340)||(21125612-21125950)
chr1 (18-387)||(20943278-20943647)
chr1 (2-389)||(21195892-21196279)
chr1 (2-299)||(22431253-22431550)
chr1 (2-341)||(21207056-21207399)
chr1 (2-234)||(25449611-25449844)
chr1 (2-295)||(9345284-9345574)
chr1 (2-403)||(51630355-51630756)
chr1 (2-289)||(12739785-12740072)
chr1 (54-292)||(20874499-20874737)
chr1 (2-403)||(36237593-36237994)
chr1 (2-289)||(4176559-4176846)
chr1 (2-289)||(12615600-12615887)
chr1 (2-289)||(19186462-19186749)
chr1 (2-292)||(22017820-22018111)
chr1 (2-289)||(35639315-35639603)
chr1 (2-289)||(5640987-5641274)
chr1 (2-403)||(21876405-21876806)
chr1 (2-289)||(3180858-3181145)
chr1 (2-289)||(5842461-5842748)
chr1 (2-289)||(47609213-47609500)
chr1 (2-289)||(38093716-38094003)
chr1 (2-289)||(38104342-38104629)
chr1 (63-289)||(7516602-7516828)
chr1 (2-289)||(7690746-7691035)
chr1 (2-288)||(27857293-27857580)
chr1 (2-77)||(18613673-18613748)
chr1 (61-286)||(22958653-22958878)
chr1 (61-136)||(23975894-23975969)
chr1 (2-49)||(7516531-7516578)
chr1 (334-403)||(4176891-4176960)
chr1 (354-403)||(5640873-5640922)
chr1 (334-403)||(5842793-5842862)
chr1 (334-403)||(7516873-7516942)
chr1 (354-403)||(12615486-12615535)
chr1 (334-403)||(12740117-12740186)
chr1 (334-403)||(19186794-19186863)
chr1 (354-403)||(35639201-35639250)
chr1 (334-403)||(38094048-38094117)
chr1 (334-403)||(38104674-38104743)
chr1 (354-403)||(47609099-47609148)
chr1 (323-403)||(7690632-7690712)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (6-403)||(209915-210311)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (2-392)||(7173-7562)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (2-403)||(110800-111201)
[»] chr5 (73 HSPs)
chr5 (2-403)||(26763966-26764367)
chr5 (2-403)||(21200246-21200647)
chr5 (32-403)||(31144545-31144917)
chr5 (8-213)||(26782936-26783141)
chr5 (2-292)||(25113253-25113543)
chr5 (2-292)||(25172344-25172634)
chr5 (2-289)||(17455929-17456216)
chr5 (2-289)||(21704580-21704867)
chr5 (2-292)||(13532484-13532774)
chr5 (2-283)||(23487110-23487391)
chr5 (2-289)||(24982026-24982313)
chr5 (2-292)||(11209350-11209640)
chr5 (2-289)||(6977164-6977451)
chr5 (2-289)||(20553173-20553460)
chr5 (2-289)||(22677474-22677761)
chr5 (2-289)||(23297635-23297922)
chr5 (2-289)||(39500103-39500390)
chr5 (2-289)||(40391716-40392003)
chr5 (2-403)||(30236642-30237043)
chr5 (2-289)||(9337312-9337599)
chr5 (2-289)||(23393767-23394054)
chr5 (2-289)||(23698138-23698425)
chr5 (2-289)||(31834838-31835125)
chr5 (2-289)||(34053318-34053605)
chr5 (2-289)||(36591733-36592020)
chr5 (2-289)||(39353854-39354141)
chr5 (2-403)||(14031286-14031687)
chr5 (2-403)||(14567269-14567670)
chr5 (2-403)||(16002512-16002913)
chr5 (2-403)||(19465216-19465617)
chr5 (2-403)||(24568332-24568733)
chr5 (2-403)||(27461406-27461807)
chr5 (2-289)||(5299758-5300045)
chr5 (2-289)||(24826091-24826378)
chr5 (2-289)||(42044138-42044425)
chr5 (2-292)||(34773264-34773554)
chr5 (2-289)||(1120518-1120805)
chr5 (2-289)||(14456228-14456515)
chr5 (2-289)||(15741327-15741614)
chr5 (2-289)||(22147874-22148161)
chr5 (2-289)||(27621388-27621675)
chr5 (2-289)||(35216861-35217148)
chr5 (2-403)||(17608306-17608707)
chr5 (2-403)||(17720162-17720563)
chr5 (2-403)||(27051453-27051854)
chr5 (2-403)||(31349778-31350179)
chr5 (2-403)||(36688942-36689343)
chr5 (2-289)||(24809274-24809561)
chr5 (2-289)||(31420023-31420310)
chr5 (2-289)||(37739183-37739470)
chr5 (246-392)||(26783140-26783286)
chr5 (2-289)||(23363468-23363741)
chr5 (2-289)||(43620510-43620797)
chr5 (324-403)||(23698024-23698103)
chr5 (328-403)||(42044024-42044099)
chr5 (334-403)||(1120850-1120919)
chr5 (354-403)||(6977050-6977099)
chr5 (354-403)||(9337198-9337247)
chr5 (334-403)||(14456560-14456629)
chr5 (354-403)||(15741213-15741262)
chr5 (354-403)||(22147760-22147809)
chr5 (354-403)||(22677360-22677409)
chr5 (354-403)||(23297521-23297570)
chr5 (354-403)||(23363354-23363403)
chr5 (334-403)||(24826423-24826492)
chr5 (354-403)||(31834724-31834773)
chr5 (354-403)||(35216747-35216796)
chr5 (334-403)||(36592065-36592134)
chr5 (334-403)||(37739515-37739584)
chr5 (354-403)||(39353740-39353789)
chr5 (334-403)||(39500435-39500504)
chr5 (354-403)||(40391602-40391651)
chr5 (323-403)||(43620831-43620911)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (2-403)||(26849-27250)
[»] scaffold0047 (4 HSPs)
scaffold0047 (2-403)||(7162-7563)
scaffold0047 (2-289)||(34181-34468)
scaffold0047 (174-289)||(41726-41841)
scaffold0047 (354-403)||(41612-41661)
[»] scaffold0217 (2 HSPs)
scaffold0217 (103-403)||(17669-17969)
scaffold0217 (2-45)||(17625-17668)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (11-403)||(1717-2101)
[»] chr6 (51 HSPs)
chr6 (28-403)||(26940937-26941312)
chr6 (5-402)||(17926294-17926691)
chr6 (2-297)||(17446991-17447286)
chr6 (205-403)||(18434222-18434420)
chr6 (2-292)||(17062890-17063180)
chr6 (2-292)||(11204633-11204923)
chr6 (2-292)||(17609836-17610126)
chr6 (2-292)||(22385277-22385567)
chr6 (99-328)||(19469214-19469442)
chr6 (2-292)||(22307462-22307752)
chr6 (2-292)||(27502973-27503263)
chr6 (2-289)||(25804337-25804624)
chr6 (2-289)||(12864200-12864487)
chr6 (2-289)||(25984746-25985033)
chr6 (2-292)||(18553958-18554248)
chr6 (2-403)||(26034689-26035090)
chr6 (2-289)||(9113738-9114025)
chr6 (2-289)||(26874071-26874358)
chr6 (2-289)||(32963191-32963478)
chr6 (2-289)||(34808407-34808694)
chr6 (2-403)||(3670713-3671114)
chr6 (243-403)||(14054619-14054779)
chr6 (2-289)||(12718081-12718368)
chr6 (2-292)||(27383406-27383696)
chr6 (2-292)||(27473790-27474080)
chr6 (2-292)||(28252810-28253100)
chr6 (2-403)||(27411754-27412155)
chr6 (2-403)||(32302177-32302578)
chr6 (24-390)||(19874404-19874762)
chr6 (2-289)||(16958277-16958564)
chr6 (2-292)||(26042864-26043155)
chr6 (2-289)||(20031166-20031453)
chr6 (2-193)||(27351014-27351205)
chr6 (2-193)||(28331658-28331849)
chr6 (2-104)||(19448582-19448684)
chr6 (2-104)||(19450576-19450678)
chr6 (150-292)||(25725744-25725886)
chr6 (36-116)||(13137903-13137983)
chr6 (2-138)||(14054790-14054926)
chr6 (124-403)||(6156933-6157212)
chr6 (358-403)||(19469475-19469520)
chr6 (354-403)||(9113624-9113673)
chr6 (354-403)||(12717967-12718016)
chr6 (334-403)||(12864532-12864601)
chr6 (334-403)||(16958609-16958678)
chr6 (334-403)||(22307794-22307863)
chr6 (334-403)||(25985078-25985147)
chr6 (334-403)||(26874403-26874472)
chr6 (354-403)||(32963077-32963126)
chr6 (354-403)||(34808293-34808342)
chr6 (323-403)||(27503294-27503374)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (104-403)||(43026-43325)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (133-403)||(98767-99037)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (2-387)||(22153-22538)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (103-388)||(66632-66917)
scaffold0011 (6-292)||(165977-166263)
scaffold0011 (2-67)||(66917-66982)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (123-403)||(11243-11522)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (24-403)||(1391-1770)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (135-403)||(42-310)
scaffold0439 (135-403)||(7902-8170)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (145-403)||(6923-7181)
scaffold0359 (2-97)||(7191-7286)
[»] scaffold1820 (1 HSPs)
scaffold1820 (2-292)||(134-424)
[»] scaffold0382 (1 HSPs)
scaffold0382 (2-289)||(2568-2855)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (2-292)||(3989-4279)
[»] scaffold1507 (1 HSPs)
scaffold1507 (2-292)||(655-945)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (2-292)||(821-1109)
scaffold0211 (2-101)||(1156-1255)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (2-289)||(9043-9330)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (2-266)||(2312-2577)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (2-292)||(44462-44752)
scaffold0017 (2-292)||(54765-55055)
scaffold0017 (40-294)||(9404-9659)
[»] scaffold0272 (1 HSPs)
scaffold0272 (2-289)||(23939-24226)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (8-387)||(75776-76148)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (2-403)||(38119-38520)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (2-292)||(53010-53300)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (2-235)||(31793-32026)
[»] scaffold0161 (4 HSPs)
scaffold0161 (2-235)||(11438-11671)
scaffold0161 (2-235)||(16111-16344)
scaffold0161 (273-392)||(11320-11439)
scaffold0161 (273-392)||(15993-16112)
[»] scaffold0925 (1 HSPs)
scaffold0925 (2-196)||(3598-3792)
[»] scaffold0758 (1 HSPs)
scaffold0758 (2-286)||(2858-3142)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (87-403)||(11494-11810)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (36-295)||(6728-6986)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (2-288)||(3028-3314)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (6-286)||(190317-190597)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (305-403)||(19853-19939)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 92)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 11188506 - 11188907
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11188506 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttaaaggtaagcttctaagtatctttctcacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttga 11188605  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11188606 tgtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacattttctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagaggtt 11188705  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11188706 ttgcttctctgactttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 11188805  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  11188806 aggtatagctttcacaagttctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaataacagctccttct 11188905  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  11188906 tc 11188907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 53058369 - 53057979
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53058369 ttcctcaatagcagttacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttactcacatgatcagaggctacataacttttcttcagtatttga 53058270  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53058269 agtccaaaaactagagtctgaaatctttagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaataagcataagagttt 53058170  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  53058169 ttgcttctctgactttcttactaccttcatagttagcacagagagaggcagacattgacttaacagtggatttgttactcatcttcatatactcttcttt 53058070  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagca 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  53058069 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtagaatttcttctgagcagaagtatgttttctcctatcaatagca 53057979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18123301 - 18122901
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18123301 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcagatgatcagagactacataacttttcttcagtatttga 18123202  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18123201 agtccagaaactagagtttgaaatctttagtacatttgctcaatattttcatcgtctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagctt 18123102  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18123101 ttgcttctctgactttcttactaccttcacagttagcacaaagaaacgcaaacattgacatagcagtggatttgtcactcatcttcatacactcttcttt 18123002  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18123001 aggtattgctttgactagtgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtagaa-ttcttctgagcaggaatatgttttcttctatcaatagcaaatccttct 18122903  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  18122902 tc 18122901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 2 - 389
Target Start/End: Original strand, 2559705 - 2560084
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  2559705 ttcctcaatagcagtcacctttgatctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttcttcagtatttaa 2559804  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||       || ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2559805 agtccaga-------gtatgaaatcttgagtgcatttgctcaatactt-catcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagctt 2559896  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2559897 ttgtttctctgactttcttactaccttcatagttagcacagagagaagaaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 2559996  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaata 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2559997 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgttgctttttgtagaatttcttatgagcaagaatatgttttcttctatcaata 2560084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 85 - 403
Target Start/End: Original strand, 11221387 - 11221705
Alignment:
Q  85 ttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatg 184  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11221387 ttttctttagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatg 11221486  T
Q  185 aacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatc 284  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11221487 aacaagtataagagcttttgcttctctgactttcttactaccttcatagttagcatagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcattcatc 11221586  T
Q  285 ttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctat 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11221587 ttcatatactctgctttaggtatagctttaacaagtgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctat 11221686  T
Q  385 caatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||| | | ||||||||    
T  11221687 caatagtagctccttcttc 11221705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 31 - 388
Target Start/End: Original strand, 21639381 - 21639738
Alignment:
Q  31 atcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttga 130  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639381 atctagcaggtaggcttttaagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttga 21639480  T
Q  131 gtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttca 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21639481 gtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacagctcatactgatgaacaagcataagagcctttgcttctctgactttcttactgccttca 21639580  T
Q  231 tagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctga 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  21639581 tagttagcacagagagaagcaaacattgatctagtagtagatttgtcactcatctttatatactatgctttaggtataactttgacaagtgctcctttga 21639680  T
Q  331 ttgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaat 388  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  21639681 ttatgtgatgcttcttgtagagtttcttctgatcaggagtatgctttctcctatcaat 21639738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 2 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14908323 - 14907958
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14908323 ttcctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttaagtatttga 14908224  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  14908223 agtccagaaactagagtatgaaatcttgagtacatttcctcaatacttccatcatctttcattttgaacaactcacactgatgaacaagcataagagctt 14908124  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14908123 ttgcttctttgactttcttgctaccttcatagtttgcacagatagaagcaaacatttccttagcattagatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 14908024  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcagg 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||    
T  14908023 aggtatagctttgacaagtgatcctctgatcgtgtgatgcttcatgtagagtttcttctaagcagg 14907958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 2 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 19886732 - 19886349
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19886732 ttcctcaatagcagtaaccttcggtcgccgtcttgcaggtaagtttcttagtatcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttcttcagtatttga 19886633  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19886632 agtccaaaaactagagtctgaaatcttaagtacatttgctcaatactttcttcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagctt 19886533  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19886532 ttggttctctaactttcttactaccttcatagtttgcatagagagaagcaaacatttccttagcaatagatttgtcactcatcttcatatactgtgcttt 19886433  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaa 387  Q
    || |||| |||||||||  ||  ||    |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  19886432 agctataactttgacaa--gcatcttcatttgtgtgatgcttcttgtagagtttcttctgatcaggaatatcttttcttctatcaa 19886349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17244835 - 17244604
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17244835 ttcctcaataacagtaacctttgttctccatcttgcaggtaagcttcttactatcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttcttcagtatttga 17244736  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17244735 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttaattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagctt 17244636  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatag 233  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17244635 ttgcttctctgactttcttactaccttcatag 17244604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 201 - 403
Target Start/End: Original strand, 14954123 - 14954325
Alignment:
Q  201 tttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctt 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954123 tttgcttctctgactttcttactactttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacctagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctt 14954222  T
Q  301 taggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||    
T  14954223 taggtatagctttgacaagtgctcctctgattatgtgatgcttcttttagagtttcttctgagcaggagtatgctttcttctatcaataggagctccttc 14954322  T
Q  401 ttc 403  Q
    |||    
T  14954323 ttc 14954325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 14078965 - 14078671
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||| |||| ||  | ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14078965 ttcctcaataacagtaactgtaggtctccatctagaaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcaatatttga 14078866  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||  |    
T  14078865 agtccaaagactagagtttgaaatcttgagtacattacctcaatactttcatcttctttcatcttgaacaactcatactaatgaacaagcatgatagcgt 14078766  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactct 296  Q
    |||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  14078765 ttgcctctctaaccttcttactaccttcatagtttgcacaaagtgaagcaaacattgcctatgcagtagatttgtcactcatcttcatgtactct 14078671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18696544 - 18696143
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||| ||| || ||  |||||||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18696544 ttcctcaatagtagtaactttaagtctccatctagtaggtaagcttcttagaatcttgcttacatgatcagaagctacatcacttttcttcagtatttga 18696445  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   || ||    
T  18696444 agtccatagactaaagtctgaaatcttgagtacatagcctcaattctttcatcatctttcatcttaaacaactcatactgatgaacaagcattgtagctt 18696345  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||  |     
T  18696344 ttgcttctctgaccttcttgctaccttcatagtttgcacaaagtgaagtaaacattgctttagcattagatttttcactcatctttagatactctgtgtg 18696245  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||| | |||    |||||   |||||||||  |||||||||||||||| || ||  ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| | ||||||    
T  18696244 aggcaaagcagcaacaagaattcctctgatcttgtgatgtttcttgtacaactttgtctgagcaggactatgcttctttctatcaatagcagctccttct 18696145  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  18696144 tc 18696143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 14952693 - 14952889
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||| |    
T  14952693 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatctaacaggtaagcttctaagtatcttgttcacatgatcaaaagctaaatagcttttctttaatatttaa 14952792  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14952793 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaatagctcatactgatgaacaagcataagag 14952889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8997473 - 8997183
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||     
T  8997473 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctaacatgatcagaagcaacatagctcttcttcagtatttgc 8997374  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |  |    
T  8997373 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctgctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattaatgcct 8997274  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8997273 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 8997183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 15847609 - 15847899
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  15847609 ttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaaacttctcaaaatcttgctcacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgc 15847708  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  15847709 attccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgcct 15847808  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15847809 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 15847899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 296
Target Start/End: Original strand, 16029525 - 16029812
Alignment:
Q  6 tcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtc 105  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  16029525 tcaatagcagtaaccttaggtctccatctagcatgcaagcttcttagtatcttcctcacatgatcagaagcaacatagcttattttcagtatttgtagtc 16029624  T
Q  106 cagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgc 205  Q
     ||| ||||  || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||    
T  16029625 tagagactaaggtttgaaatcttgagtacatttcctcaatactttcatca---ttcatcttcaacaactcatactgatgaacaagcacgagagcctttgc 16029721  T
Q  206 ttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactct 296  Q
    |||||||| ||||||  | ||||||||||   |||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16029722 ttctctgaatttcttgttgccttcatagtatacacatagagaagcaaacattgccttagcattagatttgtcactcatcttcatatactct 16029812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 1062850 - 1063140
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  1062850 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctaacgtgatcagaagcaacataacttttcttcagtatttgc 1062949  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  1062950 agtccagatactaaagtttgaaatcttaagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcct 1063049  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1063050 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagtagtggatttatcactcatcttcatata 1063140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12754307 - 12754017
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  12754307 ttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggaaagcttctcaatatctggctcacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgc 12754208  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |   | ||||| ||| |||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |    
T  12754207 agtccagatactaaagtttgaaatcttaagtacatctcttctatactctcaccatccttcatcttgaatagctcatactgatgaactagcataagtgtct 12754108  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12754107 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcatagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagtagtggatttatcactcatcttcatata 12754017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 17016490 - 17016780
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||| |  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||     
T  17016490 ttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggaaagcttctcaaaatctagctcacatgatcagaagcaacataactcttcttcaatagttgc 17016589  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  17016590 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgaat 17016689  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  17016690 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcatagttagcacagagtgaagcaaacattgccttagcaatggatttatcactcattttcatata 17016780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 29935085 - 29934795
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  29935085 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgc 29934986  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  29934985 agtccagatactcaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttcaacagctcatactgatgaactagcattagtgcct 29934886  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29934885 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 29934795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 29984239 - 29983949
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  29984239 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgc 29984140  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  29984139 agtccagatactcaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttcaacagctcatactgatgaactagcattagtgcct 29984040  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29984039 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 29983949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15960914 - 15960583
Alignment:
Q  72 gaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaaca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  15960914 gaagctacatagcttttcttcaatatttgaattccagagaatagagtctgaaatgttgagtacatatcctcaatactttcatcatatttcatcttaaaca 15960815  T
Q  172 actcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtgga 271  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||     
T  15960814 actcatattgatgaacaagcataataacttttgcttctctaaccttcttactaccttcatagtttgcacaaagtgaagcaaacattgcctttgcagtggg 15960715  T
Q  272 tttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagta 371  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||     |||||   |||||||||  |||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| |    
T  15960714 tttgtcactaatcttcatgtactctgtgctaggtatagaagcaacaaggattcctctgatcttgtgatgtttcttgtaaagcttcttatgaccaggagaa 15960615  T
Q  372 tgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    || ||  ||||||||||| || | ||||||||    
T  15960614 tgcttctttctatcaataacagctccttcttc 15960583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13263195 - 13262905
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||     
T  13263195 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctaacatgatcagaagtaacatagctcttctttagtatttgc 13263096  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  13263095 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcattagagcct 13262996  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    || ||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13262995 ttacttctctaaccttctttcttccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 13262905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1785599 - 1785312
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  1785599 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgc 1785500  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  1785499 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcct 1785400  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||||| || || |||||||| || |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1785399 ttgcttctctgaccttcttgcttccttcgtaatttgcacagagtgatgcaaacattgcctgagcagtggatttatcactcatcttcat 1785312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9382186 - 9381899
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  9382186 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtgacatagctcttcttcagtatttgc 9382087  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  9382086 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcct 9381987  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    |||||||||||   ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9381986 ttgcttctctggccttcttgcttccttcgtagttggcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcagtcatcttcat 9381899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11207617 - 11207330
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  11207617 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgattagaagtgacatagctcttcttcagtatttgc 11207518  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| || | ||    
T  11207517 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgacctagcattagggctt 11207418  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||  ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11207417 ttgcttctctgaccttcttgcttccttcgtagttgccacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 11207330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 4432475 - 4432759
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | |||||||||||| || || ||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  4432475 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggtaagcttctcagaattttgctaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgc 4432574  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||   | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  4432575 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacat---ctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcct 4432671  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    |||||||||| | |||||| || ||||| ||||  |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4432672 ttgcttctctaactttcttgcttccttcgtagtaggcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 4432759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 12288502 - 12288215
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  12288502 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 12288403  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  12288402 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 12288303  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  12288302 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 12288215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 39381399 - 39381800
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  39381399 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 39381498  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  39381499 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 39381598  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  39381599 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 39381698  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  39381699 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttct 39381798  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  39381799 tc 39381800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5538543 - 5538256
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  5538543 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 5538444  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  5538443 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 5538344  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  5538343 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 5538256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5581155 - 5580868
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  5581155 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 5581056  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |   | ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  5581055 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatatcttctatactctcatcatctttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 5580956  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  5580955 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 5580868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6183488 - 6183201
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  6183488 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 6183389  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  6183388 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 6183289  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6183288 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 6183201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 13374190 - 13373903
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  13374190 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgagggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 13374091  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  13374090 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 13373991  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13373990 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 13373903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 13384784 - 13384497
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  13384784 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgagggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 13384685  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  13384684 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 13384585  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13384584 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 13384497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20674719 - 20674432
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  20674719 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 20674620  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  20674619 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 20674520  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  20674519 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 20674432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 10628470 - 10628180
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  10628470 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 10628371  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||||||||| | || ||    
T  10628370 aatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaacaagcatcaaagctt 10628271  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10628270 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagcctttgcagtagatttgtcactcatcttcatata 10628180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 505692 - 505291
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  505692 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 505593  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  505592 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 505493  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  505492 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 505393  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  505392 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtgatgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 505293  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  505292 tc 505291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 4753034 - 4753435
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  4753034 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 4753133  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  4753134 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 4753233  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  4753234 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 4753333  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  4753334 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtgatgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 4753433  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  4753434 tc 4753435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 6491868 - 6491467
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  6491868 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 6491769  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  6491768 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 6491669  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |        
T  6491668 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatgtattcagtgcg 6491569  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || |||| || |||||| | ||||||    
T  6491568 aggtatagaagccacaacaatccctctgattttgtgatgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctgtctatagcagctccttct 6491469  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  6491468 tc 6491467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 9983410 - 9983009
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  9983410 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctcgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 9983311  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  9983310 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 9983211  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |        
T  9983210 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgatgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatatattcagtgcg 9983111  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || |||| || |||||| | ||||||    
T  9983110 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtgatgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctgtctatagcagctccttct 9983011  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  9983010 tc 9983009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24385040 - 24384639
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  24385040 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgc 24384941  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  24384940 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagatt 24384841  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  24384840 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 24384741  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  24384740 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtgatgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 24384641  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  24384640 tc 24384639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 41692964 - 41693365
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  41692964 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 41693063  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  41693064 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 41693163  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  41693164 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 41693263  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  41693264 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtgatgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 41693363  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  41693364 tc 41693365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5867218 - 5866931
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  5867218 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgc 5867119  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  5867118 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 5867019  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  5867018 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 5866931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 14474936 - 14475223
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  14474936 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 14475035  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| | |||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  14475036 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatcctccattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 14475135  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  14475136 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 14475223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16392570 - 16392283
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  16392570 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 16392471  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  ||||||| |||||| ||||| | || ||    
T  16392470 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactaatgaactagcatcaaagctt 16392371  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  16392370 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 16392283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 23766609 - 23766896
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  23766609 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 23766708  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  23766709 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 23766808  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| ||||  |||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  23766809 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagttttcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 23766896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14312934 - 14312644
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  14312934 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaattttgctaacatgatcagaagtaacatagctattcttcagtatttgc 14312835  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | | | ||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  14312834 agtctagatactaaagtttgaaatcttgattacatctcctctatactctcatcatccttcatcttcaacagctcatactgatgaactagcattagtgcct 14312735  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14312734 ttgcttctttaaccttcttgcttccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 14312644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15652631 - 15652341
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| | ||| || || ||||||||||| | ||| || ||||| || ||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  15652631 ttcctcaatggtagttactttgggtctccatctagaaggaaaacttctcagaatcttgctttcgtgatcagaagcaacataactcttcttgagtatttgc 15652532  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  15652531 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacaactcatactgatgaactagcattagtgcct 15652432  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    | |||||| | |  ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15652431 tagcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgcattagcagtggatttatcactcatcttaatata 15652341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11273907 - 11273506
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  11273907 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 11273808  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  11273807 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 11273708  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  11273707 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 11273608  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  11273607 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttct 11273508  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  11273507 tc 11273506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 24669185 - 24669586
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  24669185 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgc 24669284  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  24669285 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 24669384  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | ||||||  | |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  24669385 tagcctcttttactttcttgttgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 24669484  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  24669485 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtgatgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 24669584  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  24669585 tc 24669586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 19787737 - 19788024
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||     
T  19787737 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaaacaacatagcttttcttcagtatttgc 19787836  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| || || | || ||    
T  19787837 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagtatcaaagctt 19787936  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19787937 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttagcagtagatttgtcactcatcttcat 19788024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 29462740 - 29462450
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| |  ||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  29462740 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcatactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 29462641  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  29462640 aatccagaaactagagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 29462541  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29462540 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgacgcaaacatagcctttgcagtagatttgtcactcatcttcatata 29462450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 5519583 - 5519870
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  5519583 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 5519682  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  5519683 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 5519782  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  ||  |||| |||||||||||||| |||||    
T  5519783 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagctttcacagtagatttgtcactcattttcat 5519870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28315760 - 28315473
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  28315760 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 28315661  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  28315660 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 28315561  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  28315560 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcat 28315473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 38203967 - 38204254
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  38203967 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 38204066  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  38204067 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 38204166  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  38204167 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcat 38204254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 8783978 - 8784265
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  8783978 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 8784077  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| | ||| | || ||    
T  8784078 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactaacatcaaagctt 8784177  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  8784178 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 8784265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12239140 - 12238849
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  12239140 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttattcagtatttgc 12239041  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  12239040 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 12238941  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtgga-tttgtcactcatcttcatata 292  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| | ||| || |||||||||||||||||||||    
T  12238940 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgtagtagattttgtcactcatcttcatata 12238849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 37884294 - 37884695
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||     
T  37884294 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggcaaacttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttctttagtatttgc 37884393  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | |||||  ||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  37884394 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactcccatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 37884493  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |        
T  37884494 tagcctcttttaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatgtactcggtgcg 37884593  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  37884594 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 37884693  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  37884694 tc 37884695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Original strand, 13130985 - 13131239
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  13130985 ttccttaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 13131084  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  13131085 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 13131184  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacat 256  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||    
T  13131185 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcagacat 13131239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 7796143 - 7795853
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||     
T  7796143 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttcttaaaatcttactaacatgatcagaaccaacatagcttttcttcagtatttgc 7796044  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| | |||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  7796043 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactcttatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 7795944  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| || || || || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7795943 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcgcatagtgatgcaaacatagccttcgcagtggatttgtcactcatcttcatata 7795853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16397542 - 16397253
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| || ||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  16397542 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaagttaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 16397443  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||| |||| |  ||||||| |||||| ||||| | || ||    
T  16397442 aatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactaatgaactagcatcaaagctt 16397343  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttag--cacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| |  |||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16397342 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttctcactcatcttcat 16397253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 289
Target Start/End: Original strand, 47541557 - 47541788
Alignment:
Q  57 ttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcat 156  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||    
T  47541557 ttgctaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgcagtcc-gatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcat 47541655  T
Q  157 ctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacat 256  Q
    | ||||| ||||||| | || |||||||||| ||||| || |  ||||||||||| |  ||||| || ||||| ||||| | |||||| || ||||||||    
T  47541656 ccttcatcttgaacagcacaaactgatgaactagcattagggaatttgcttctctaacattcttgcttccttcgtagttggaacagagtgatgcaaacat 47541755  T
Q  257 tgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47541756 tgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 47541788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 92
Target Start/End: Original strand, 5211188 - 5211278
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttc 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5211188 ttcctcaatagcagtcacctttggtctctatctagcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttc 5211278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 301 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 17244606 - 17244504
Alignment:
Q  301 taggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  17244606 taggtatagctttgacaagtgctcctcttattgtgtgatgcttcttgtagagtttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaacatcaactccttc 17244507  T
Q  401 ttc 403  Q
    |||    
T  17244506 ttc 17244504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16306650 - 16306398
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| ||||||| || |  |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||    
T  16306650 ttcctcaatagcagtctccttaggtctccacttagcaagtaagctccttataatcttgttcacatgatcataagctacatagtttttcttcagaatctga 16306551  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||   | ||||   |||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||| | |||   || ||    
T  16306550 agtccaaagactagagtctgaaaccttgagtacatagtctcaatgtcttcatcctccttcatcatgaacaactcatattgatgaaccaacatggtagctt 16306451  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaac 254  Q
    | |||||| ||| ||||||  | |||||||||||||  || ||||||||||||    
T  16306450 tagcttctttgaatttcttgtttccttcatagttagagcacagagaagcaaac 16306398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Original strand, 37875776 - 37875967
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||     
T  37875776 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggcaaacttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttctttagtatttgc 37875875  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcat 193  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | |||||  ||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| |||||    
T  37875876 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactcccatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcat 37875967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19659121 - 19658840
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||||  |||| ||| | ||||||  | ||||||||||| || || |||||  ||| ||||||||   ||||||| ||||||||||| || |||    
T  19659121 ttcctcaatagttgtcatcttagttctccacttagcaggtaagctccttagaatcttcttcagatgatcag---ctacatagcttttcttcagaatctga 19659025  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||   |||| ||||||| ||| |||||||   | ||||   |||||  |||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||  || ||    
T  19659024 agtccagatgttagattctgaaacctttagtacataatctcaatgtcttcattctctttcatcttgaacatttcatattgctgaacaagcatagtagctt 19658925  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatctt 286  Q
    |  ||||| ||| ||||||  |  |||||||||| | ||| ||||| |||||||| |  |||| ||| |||||||||||||||||    
T  19658924 tatcttctttgactttcttgttggcttcatagttggaacacagagatgcaaacatagctttagtagtagatttgtcactcatctt 19658840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 360
Target Start/End: Original strand, 16031325 - 16031393
Alignment:
Q  292 actctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttct 360  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  16031325 actctgctttaggtatagcagtgacaagtgatcctctgaatgtatgatgcttcttgtagagtttcttct 16031393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 136
Target Start/End: Original strand, 1462963 - 1463063
Alignment:
Q  36 gcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtaca 135  Q
    ||||||||||| || || || ||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||  || | |||||||||   |||||||||||| ||||||||||    
T  1462963 gcaggtaagctccttagaattttcttcacatgatcagcacctacataacttttcttcaaaatctaaagtccagatgttagagtctgaaaccttgagtaca 1463062  T
Q  136 t 136  Q
    |    
T  1463063 t 1463063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 403
Target Start/End: Original strand, 11222412 - 11222459
Alignment:
Q  356 cttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  11222412 cttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagtagctccttcttc 11222459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 403
Target Start/End: Original strand, 1463240 - 1463320
Alignment:
Q  323 tcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||| || ||||||||    
T  1463240 tcctctgatcttgtgatgtttcttgtagagcttcttctgagcaacattgtgtttctttctatcaatagctacaccttcttc 1463320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19631134 - 19631002
Alignment:
Q  156 tctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaaca 255  Q
    |||||||| |||||||  ||||  || ||||||||||||  || |||   |||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||| | ||| |||||||    
T  19631134 tctttcatcttgaacatttcattttgctgaacaagcatagtagctttatattctttgattttcttgttaccttcatagttggaacacaaagatgcaaaca 19631035  T
Q  256 ttgacttagcagtggatttgtcactcatcttca 288  Q
    |    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19631034 taactttagcagtagatttgtcactcatcttca 19631002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 403
Target Start/End: Original strand, 1063172 - 1063251
Alignment:
Q  324 cctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  1063172 cctctgatcttgtgatgctttttgtaaagtttcttctgagcaggagtgtgtatccttctgtcaatagcagctccttcttc 1063251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 392
Target Start/End: Original strand, 16881085 - 16881143
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagca 392  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  16881085 tgtgatgtttcttgtaaagcttcttctgagcagtagtgtgtttctttctatcaatagca 16881143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 5519915 - 5519984
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  5519915 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 5519984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5580803 - 5580754
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  5580803 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 5580754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5866866 - 5866817
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  5866866 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 5866817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 6183136 - 6183087
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  6183136 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 6183087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 12288150 - 12288101
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  12288150 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 12288101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12411133 - 12411068
Alignment:
Q  223 taccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttca 288  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||    
T  12411133 taccttcatagttagaacataaagatgcaaacatggctttagcagtagaattgtcactcatcttca 12411068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 13373838 - 13373789
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  13373838 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 13373789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 13384432 - 13384383
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  13384432 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 13384383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14078633 - 14078564
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||    
T  14078633 tgtgatgcttcttgtaaagcttcttctgagaaggggtatgtttctttctatcaataacaactccttcttc 14078564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 14475268 - 14475337
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  14475268 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 14475337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 16392218 - 16392169
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  16392218 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 16392169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 19788069 - 19788138
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  19788069 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 19788138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 20674367 - 20674318
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  20674367 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 20674318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 23766941 - 23767010
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  23766941 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 23767010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 28315408 - 28315359
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||    
T  28315408 ttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttcttc 28315359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 38204299 - 38204368
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  38204299 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 38204368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7795821 - 7795753
Alignment:
Q  324 cctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagca 392  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||   |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  7795821 cctctgatcttgtgatgctttttgtaagttttcttctgagcaggagtgtgtatttttctatcaatagca 7795753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19631267 - 19631175
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcag 94  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||  | ||||||||||| |  || |||||  | | |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19631267 ttcctcaatagctgccaccttaggtctccacttagcaggtaagctccgtagaatcttctttagatgatcagcagctacataccttttcttcag 19631175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 17287808 - 17287407
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  17287808 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatctttctcacatgatcagaggctacatagcttttcttcagtatttaa 17287709  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  17287708 agttcagaaactagagtatgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcatcagagctt 17287609  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287608 ttgcttctttgactttcttactaccttcatagttagcacaaagagaaggaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 17287509  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  17287508 aggtatagctttgacaggtgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagaagctccttct 17287409  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  17287408 tc 17287407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 2 - 387
Target Start/End: Original strand, 17015066 - 17015451
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17015066 ttcctcaatagcgttcatctttggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcagtatttaa 17015165  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  17015166 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactaatactgatgaacaagcataaaagctt 17015265  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17015266 ttgcttctcttactttcttactaccttcatagtttgcatagagagaagcaaacattgacttagcattagatttgtcactcatctttatatactctgcttt 17015365  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaa 387  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17015366 aggtataactttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttctcgtaaagtttcttctgagcagaagtatgttttcttctatcaa 17015451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 2 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 17542135 - 17541750
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17542135 ttcctcaatagcgttcatctttggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcagtatttaa 17542036  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  17542035 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactaatactgatgaacaagcataaaagctt 17541936  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17541935 ttgcttctcttactttcttactaccttcatagtttgcatagagagaagcaaacattgacttagcattagatttgtcactcatctttatatactctgcttt 17541836  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaa 387  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17541835 aggtataactttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttctcgtaaagtttcttctgagcagaagtatgttttcttctatcaa 17541750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 2 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 20257210 - 20256835
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20257210 ttcctcaatagcagtcacctttagtctccatcttgcaggaaagcttcttagtatctttctcacatgatcagaagctacacaacttttcttcagtatttga 20257111  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||          |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  20257110 agtctagaaactaaagtctgaaatcatgagtacattttcacaatactttcat----------tttgaacaactcatactgataatcaagcataagagctt 20257021  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20257020 ttgcttctctgactttcttactaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgacttagtagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 20256921  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaa 387  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20256920 aggtatagctttgacaggtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtaaaggttcttctgagtaggagtatgttttcttctatcaa 20256835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22463104 - 22462703
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22463104 ttcctcaatagcagtaaccttaagtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcttggtcacatgatcagatgctacatagcttttcttcagtacttga 22463005  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22463004 agtccagatagtagagtttgaaatcttaagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatcttgaataactcatactgatgaacaagcataagaactt 22462905  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22462904 ttgcttctctgactttcttgctaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattacctttgtagtagatttgtcactcattttcatatactctgcttt 22462805  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    |||||||||  | ||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||    
T  22462804 aggtatagcagtaacaagtgatcctttgatcgtgtgatgcttcttgtagagtttcttttgagcaggagtatgtttcctcctatcaatagcagctccttct 22462705  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  22462704 tc 22462703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 309
Target Start/End: Original strand, 15976846 - 15977153
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15976846 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttcttcagtatttga 15976945  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15976946 agtccataaactagagtatgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaaccataagagctt 15977045  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977046 ttgcttctcttactttcttactaccttcacagtttgcacagggagaagcaatcattgacttagtagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 15977145  T
Q  302 aggtatag 309  Q
     |||||||    
T  15977146 tggtatag 15977153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 22672293 - 22672676
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |    
T  22672293 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatctagcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagattttcttcggtatttaa 22672392  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||           
T  22672393 agcccagaaactagagtctgaaatcttaagtacatttgctcaatactttcatcatatttcattttaaacagctcatactgatgaacaagcata------- 22672485  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
                 ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22672486 -------------tttcttactgcctacatagttagcacagagagaagcaaacgttggtctagtagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 22672572  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatg--ttttcttctatcaatagcaacccctt 399  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||| | ||||    
T  22672573 aggtatagctttgacaagtactcctctgattatgtgatgcttcttgtagagtttcttctgatcaggagtatgctttttctcctatcaatggcagctcctt 22672672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 19941735 - 19942136
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||     
T  19941735 ttcctcaatagtagtaaccttagatctccatctagcaggcaagctccttagtatcttgctaacatgatcagaagcaacataactctttttcagtatttgt 19941834  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| | | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19941835 agtccagagactagggtttgaaaccttgagtacatctcctcaatagtttcatcatccttcatcttgaacaactcatactgatgaataagcataagagctt 19941934  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||   |||| ||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19941935 ttgctatcctgactttcttgatgccttcatagtttgcacaaagagaagcaaacattgccttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactatgcttt 19942034  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  19942035 aggtatagtagtgacaagtgctcctctgatagtatgatgcttcttgtagagtttcttctgagcaggagtgtgtttctttctatcaatagcatctccttct 19942134  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  19942135 tc 19942136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 21297439 - 21297729
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  21297439 ttcctcaatggcagtcaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatcttgctcacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgc 21297538  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |   | ||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  21297539 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcttctatactctcatcatccttcatcttcaacagctcatactgatgaactagcataagtgctt 21297638  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21297639 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcatagagtgaagcaaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 21297729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 45569587 - 45569300
Alignment:
Q  6 tcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtc 105  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  45569587 tcaatggcagtaaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatcttgctcgcatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtc 45569488  T
Q  106 cagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgc 205  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  45569487 cagatactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgtctttgc 45569388  T
Q  206 ttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtgga-tttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||| | || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  45569387 ttctttaatcttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagcagtggattttttcactcattttcatata 45569300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 3842245 - 3842535
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  3842245 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgc 3842344  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  3842345 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcct 3842444  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3842445 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 3842535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 292
Target Start/End: Original strand, 23791970 - 23792238
Alignment:
Q  24 ggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaa 123  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||| ||| ||||    
T  23791970 ggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtacagatactaaagtttgaa 23792069  T
Q  124 atcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttact 223  Q
    |||||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||| | |  ||||| ||    
T  23792070 atcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcatgagtgcctttgcttctttaaccttcttgct 23792169  T
Q  224 accttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23792170 accttcatagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 23792238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 238 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24834569 - 24834404
Alignment:
Q  238 cacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtg 337  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24834569 cacagagagaggcaaacatagacttagtagtggatttatcactcatcttcatatactcttctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtg 24834470  T
Q  338 atgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  24834469 atgcttcttgtagagtttcttctgagcaggagtatgctttcttctttcaatagcagctccttcttc 24834404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22149162 - 22148872
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||| |||| ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||      
T  22149162 ttccacaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttctttagtatttcc 22149063  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  22149062 agtccagacactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcct 22148963  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22148962 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagccgtggatttatcactcatcttcatata 22148872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 36302242 - 36302643
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  36302242 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 36302341  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  36302342 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 36302441  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  36302442 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 36302541  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  36302542 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtgatgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 36302641  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  36302642 tc 36302643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 16745717 - 16746004
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  16745717 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgc 16745816  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  16745817 agtccaaatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcct 16745916  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||||| || ||  ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16745917 ttgcttctctgaccttcttgcttccttcgtaatttacacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 16746004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Original strand, 25164778 - 25164911
Alignment:
Q  5 ctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagt 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25164778 ctcaatagcagtaacctttggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaaactacatagcttttcttcagtatttaaagt 25164877  T
Q  105 ccagaaactagagtctgaaatcttgagtacattt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25164878 ccagaaactagagtctgaaatcttgagtacattt 25164911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15782268 - 15781981
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  15782268 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 15782169  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  15782168 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 15782069  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15782068 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 15781981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 26119626 - 26119913
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  26119626 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 26119725  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  26119726 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaatttcatactgatgaactagcatcaaagctt 26119825  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26119826 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 26119913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 29075456 - 29075743
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  29075456 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 29075555  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  29075556 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 29075655  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  29075656 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 29075743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 29085707 - 29085994
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  29085707 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 29085806  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  29085807 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 29085906  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  29085907 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 29085994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 32079253 - 32078966
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  32079253 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 32079154  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  32079153 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 32079054  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  32079053 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 32078966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 3350192 - 3349791
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  3350192 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgc 3350093  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  3350092 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 3349993  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  3349992 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 3349893  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  3349892 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtgatgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 3349793  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  3349792 tc 3349791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 9367010 - 9367297
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  9367010 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgc 9367109  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  9367110 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 9367209  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  9367210 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 9367297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 13690127 - 13689726
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  13690127 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 13690028  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  13690027 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 13689928  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  13689927 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 13689828  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  13689827 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttct 13689728  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  13689727 tc 13689726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 251124 - 251411
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  251124 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 251223  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  251224 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 251323  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  251324 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcat 251411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 814225 - 814512
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  814225 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 814324  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  814325 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 814424  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  814425 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcat 814512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 19137996 - 19138283
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  19137996 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 19138095  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  19138096 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 19138195  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |   |||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19138196 tagcctctttcaccatcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 19138283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 36087238 - 36087525
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  36087238 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 36087337  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| | ||| | || ||    
T  36087338 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactaacatcaaagctt 36087437  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  36087438 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 36087525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 44490430 - 44490831
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  44490430 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 44490529  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  44490530 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 44490629  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |        
T  44490630 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatgtattcagtgcg 44490729  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  44490730 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttct 44490829  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  44490830 tc 44490831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 19234094 - 19234381
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  19234094 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 19234193  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  19234194 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcattaaagctt 19234293  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | |  ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19234294 tagtctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgaagcaaacatagccttcgcagtggatttgtcactcatcttcat 19234381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30316282 - 30315995
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  30316282 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 30316183  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| |||||   || ||    
T  30316182 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatccaagctt 30316083  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30316082 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 30315995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 19427638 - 19427925
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  19427638 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatatcttttcttcagtatttgc 19427737  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  19427738 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 19427837  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| || || || || |||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19427838 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcgcatagtgacgcaaacatagctttcgcagtggatttgtcactcatcttcat 19427925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 284 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 20376085 - 20375982
Alignment:
Q  284 cttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttcta 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20376085 cttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtatagttttttctgagcaggagtatgttttcttcta 20375986  T
Q  384 tcaa 387  Q
    ||||    
T  20375985 tcaa 20375982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 289
Target Start/End: Original strand, 6159805 - 6160040
Alignment:
Q  54 atcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcat 153  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||    
T  6159805 atcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttctttagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcat 6159904  T
Q  154 catctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaa 253  Q
    |||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||| || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  6159905 catccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaa 6160004  T
Q  254 cattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    ||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  6160005 catagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 6160040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 111
Target Start/End: Original strand, 19940602 - 19940711
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19940602 ttcctcaatatcagtcacctttggtctccatctaacaggtaagcttctgagtatcttgctcacatgattagaagctacatagcttttcttcagtatttga 19940701  T
Q  102 agtccagaaa 111  Q
    |||| |||||    
T  19940702 agtctagaaa 19940711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Original strand, 24666940 - 24667226
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||  | | ||||||||| || || |||||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| || |||    
T  24666940 ttcctcaatagatgtcaccttaggtctccacatagtaggtaagctccttagaatcttgttcaaatgattaggagctacatagcttttcttcagaatctga 24667039  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | || | | |||||| |||||||  ||||||||||   | ||||   |||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||||| | ||||| || ||    
T  24667040 actcgaaagactagattctgaaacgttgagtacatagtctcaatgtcttcatcctctttccttttgaaaaattcatattgatgaaccaacataatagctt 24667139  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttca 288  Q
    | |||| | ||| ||||||  | ||||||||||| |  || | ||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24667140 tagcttttttgactttcttgttgccttcatagtttgagcacaaagaagcaaacattgttttagcagtagatttatcactcatcttca 24667226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 9367342 - 9367411
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  9367342 tgtgatgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 9367411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 18152661 - 18152629
Alignment:
Q  1 tttcctcaatagcagtcacctttggtctccatc 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18152661 tttcctcaatagcagtcacctttggtctccatc 18152629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 251456 - 251525
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  251456 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 251525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 814557 - 814626
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  814557 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 814626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 850180 - 850131
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  850180 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 850131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15781916 - 15781867
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  15781916 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 15781867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Original strand, 19138348 - 19138397
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  19138348 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 19138397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 26119958 - 26120027
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  26119958 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 26120027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 29075788 - 29075857
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  29075788 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 29075857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 29086039 - 29086108
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  29086039 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 29086108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 30315930 - 30315881
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  30315930 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 30315881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 32078901 - 32078852
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  32078901 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 32078852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 403
Target Start/End: Original strand, 19427959 - 19428039
Alignment:
Q  323 tcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||||||  |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||| | ||||||||    
T  19427959 tcctctgatcttgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtccacagcagctccttcttc 19428039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24679634 - 24679554
Alignment:
Q  323 tcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| || || || ||| ||| | |||||||  |||||||||||||| | ||||||||    
T  24679634 tcctctgatcttgtgatgtttcttgtacaactttttttgaccagcaatatgtttctttctatcaatagcagctccttcttc 24679554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 387
Target Start/End: Original strand, 24574534 - 24574920
Alignment:
Q  1 tttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24574534 tttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagctacacagcttttcttcagtatttg 24574633  T
Q  101 aagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24574634 aagtccagaaactagagtgtgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcaccatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagct 24574733  T
Q  201 tttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctt 300  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24574734 tttgcttctcttactttcttactaccttcatagtttgcacaaagagaagcaaacattgacttagcagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctt 24574833  T
Q  301 taggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaa 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24574834 taggtatagctttgacaagggctcctctgattgtgtgatgtttcttgtaaagtttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaa 24574920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 28702814 - 28702413
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  28702814 ttcctcaatagcagtcacctttgatctccatcttgcaggtaagcttctaagtatctttctcacatgatcagaggctacatagcctttctttagtatttga 28702715  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  28702714 agtccagaaactagagtctgaaatcttaagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgataaacaagcataagagctt 28702615  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28702614 ttgcatctctgactttcttactaccttcatagttagcacagagagaagtaaacattgacttagcagtgaatttgtcactcatcttcatatactttgcttt 28702515  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  28702514 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtagaatttcttatgagcaggagtatgttttcttctatcaataccagctccttct 28702415  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  28702414 tc 28702413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22783219 - 22782818
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22783219 ttcctcaatagcagtcaccttaggtctccatctagcaagtaggcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcagtatttga 22783120  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  22783119 actccagaaactagagtcagaaatcttgagtacatttgctcaatactttgatcatctttcattttgaacagctcatactgatgaacaagcataagagcct 22783020  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22783019 ttgcttctctaactttcttacagccttcatagttagcacaaagagaagcaaacattgatctagcagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 22782920  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  22782919 agatatagctttgagaagtactcctctgattatgtgatgcttcttgtagagtttcttctaatcaggagtatgctttctcctatcaatggcagctccttct 22782820  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  22782819 tc 22782818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 53 - 403
Target Start/End: Original strand, 22256758 - 22257099
Alignment:
Q  53 tatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttca 152  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  22256758 tatcttgctcacatgatcagaaactacatatcttttcttcagtatttggcatccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgttcaatattttca 22256857  T
Q  153 tcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaa 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22256858 tcatctttcattttgaaaaactcatattgatgaacaagcataagagcttttgcttctctgactttctgactaccttcatagtttgcacggagagaagcaa 22256957  T
Q  253 acattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaa 352  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22256958 acattgccttagcagtagatttttcacttttcttcatatactc---------tatagctttgacaagcgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagag 22257048  T
Q  353 tttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||| | |||| ||||||||    
T  22257049 tttcttatgagtaggagtatgtttccttttatcaacaacaactccttcttc 22257099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 113 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 23185816 - 23185526
Alignment:
Q  113 tagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23185816 tagagtctgaaatcttgagtacatttcctcaatactttcatcatctttcagtttgaacaactcatactaatgaacaagcataagagcttttgtttctctg 23185717  T
Q  213 attttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctt 312  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  23185716 actttcttgctaccttcatagtttgcacaaagagaagcaaacatttccttagcagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagcag 23185617  T
Q  313 tgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  23185616 tgacaagtgctcctctaattgtgtgatgcttcgtgtagattttcttctgagcaggagtatgttttcttctctcaatagcagctccttcttc 23185526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 113 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 23597079 - 23596789
Alignment:
Q  113 tagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23597079 tagagtctgaaatcttgagtacatttcctcaatactttcatcatctttcagtttgaacaactcatactaatgaacaagcataagagcttttgtttctctg 23596980  T
Q  213 attttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctt 312  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  23596979 actttcttgctaccttcatagtttgcacaaagagaagcaaacatttccttagcagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagcag 23596880  T
Q  313 tgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  23596879 tgacaagtgctcctctaattgtgtgatgcttcgtgtagattttcttctgagcaggagtatgttttcttctctcaatagcagctccttcttc 23596789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 10900092 - 10899690
Alignment:
Q  1 tttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttg 100  Q
    |||||||||||||| | || || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10900092 tttcctcaatagcaataactttaggtctccatctagcaggtaagcttcttagaatcttgctcacatgatcaaaagctacataacctttcttcaatatttg 10899993  T
Q  101 aagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtt 200  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  10899992 aagtccagagacaagagtctgaaatcttgagtacatttcctcaatactttcatcatatttcatcttgaacaactcatactgatgaaaaagcataataact 10899893  T
Q  201 tttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctt 300  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||| ||||||        
T  10899892 tttgcttctctaaccttcttactaccttcatagtttgcacaaagtgaagcaaacattgccattgcaatagatttgtcactcatcttcatgtactctatgc 10899793  T
Q  301 taggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttc 400  Q
     |||||||      |||||   |||||||||  |||||||||||||||| |  ||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||||    
T  10899792 aaggtatataagcaacaaggattcctctgatattgtgatgtttcttgtaaagcttcttatgagtaggagtatgtttctttctatcaatagcagctccttc 10899693  T
Q  401 ttc 403  Q
    |||    
T  10899692 ttc 10899690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 264
Target Start/End: Original strand, 21137607 - 21137869
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  21137607 ttcctcaatagcagtcacctttggtctctatcttgcaggtgagcttcttagtatcttgctcacatgatcaaaagttacatagtttttcttcagtatttga 21137706  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  21137707 agtccataaactaaagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcacatgtcattttgaacaactcatactaatgaacaagcataaaagctt 21137806  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttag 264  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21137807 ttgcttctcttacattcttactacctttatagtttgcacagagaaaagcaaatattgacttag 21137869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 297
Target Start/End: Original strand, 24842696 - 24842998
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24842696 ttcctcaatagcagtaaccttaggtctttatctagcaggtaaacttcttagtatcttgctcatatgattagaagctacgtaacttttcttcaatatttga 24842795  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttca-------tcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcata 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  24842796 agtccagagactagagtctgaaatcttgtgtacatttcctcaatactttcatcatctttcatctttcatcttgaacaactcatactgatgaacaagcatg 24842895  T
Q  195 agagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatact 294  Q
    ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| ||| ||| |  |||| || ||||||||||| ||||    
T  24842896 agagcctttgcctctctaacattcttactaccttcatagtttgcaaaaagtgaagcaaacattgcctttgcaataaatttttccctcatcttcatgtact 24842995  T
Q  295 ctg 297  Q
    |||    
T  24842996 ctg 24842998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25119945 - 25119664
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||| ||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25119945 ttcctcaatagtagtaactttaggtctccacctagcaggtaagcttcttaggatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcagaatttga 25119846  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||   || ||    
T  25119845 agtccagagactagagtctgaaaccttgagtacatagcctcaatgctttcatcatctttcattctgaacaattcatactaatgaacaagcatggtagctt 25119746  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcat 283  Q
    | |||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  25119745 tagcttctctgactttcttgtttccttcatagtttgcacacaaggaagcaaacattgctttagcagtagatttatcactcat 25119664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19303970 - 19303680
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  19303970 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgc 19303871  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || || || |  |    
T  19303870 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagtatgagtgcct 19303771  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19303770 ttgcttctttaaccttcttgctatcttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 19303680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24803193 - 24802903
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| ||||||| | ||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  24803193 ttcctcaatggcagtcactttaggtttccatctagaaggcaaacttctcaaaatcttgctcacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgc 24803094  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  24803093 agtccagatactaaagtttgaaatctcgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgcct 24802994  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24802993 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgcctcagcagtggatttatcactcattttcatata 24802903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24303637 - 24303240
Alignment:
Q  6 tcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtc 105  Q
    |||||| |||| || || |||||||| || |||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||    
T  24303637 tcaataacagtaactttaggtctccacctagcaggtaagcttctcataagcttgctcacataatcagaagcaacatagtttttcttcagtatttgaggtc 24303538  T
Q  106 cagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgc 205  Q
     ||| |  |||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| || |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24303537 tagagaaaagagtctgaaatcttgagtacatagcctcaatactttcataatatttcatcttgaataattcatactgatgaacaagcataatagcttttgc 24303438  T
Q  206 ttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggt 305  Q
    |||||||| ||||||  | ||||||||||||||| | |  |||||||||||||  |||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| ||   ||||    
T  24303437 ttctctgactttcttgtttccttcatagttagcatacaatgaagcaaacattgctttagcagtagatttattactcatcttcaaatactcagcacgaggt 24303338  T
Q  306 atagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    | |||    |||||   |||||| ||  |||||||||||||||| | |||||| | ||||||||| |||||  ||||||| |||||| | ||||||||    
T  24303337 aaagcagcaacaagaattcctctcatcttgtgatgtttcttgtacattttcttttaagcaggagtgtgtttctttctatcgatagcagctccttcttc 24303240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9764305 - 9764018
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  9764305 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 9764206  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  9764205 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 9764106  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | |||||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  9764105 tagcttcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 9764018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24416568 - 24416281
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||  ||||| || |||||||  |||||     
T  24416568 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcaaaatttgc 24416469  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  24416468 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcct 24416369  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||||| || || |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24416368 ttgcttctctgaccttcttgcttccttcgtaatttgcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 24416281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28722860 - 28722573
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  28722860 ttcctcaatagtagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctgagaatcttgctaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgc 28722761  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  28722760 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcct 28722661  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    |||||||||| |  ||||| || ||||  ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28722660 ttgcttctctaaccttcttgcttcctttgtagttggcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 28722573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 39171636 - 39171349
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  39171636 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 39171537  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  39171536 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 39171437  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  39171436 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 39171349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22916402 - 22916115
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  22916402 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 22916303  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  22916302 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 22916203  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  22916202 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 22916115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24329291 - 24329004
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  24329291 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 24329192  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  24329191 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 24329092  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24329091 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 24329004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34791759 - 34791472
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  34791759 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 34791660  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  34791659 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 34791560  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34791559 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 34791472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 40249879 - 40250166
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  40249879 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 40249978  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  40249979 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactttcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 40250078  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| ||  ||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  40250079 tagcctcttttactttcttgctgtcttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 40250166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 9899115 - 9898714
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  9899115 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 9899016  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||| | |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  9899015 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatagtctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 9898916  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |        
T  9898915 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatgtattcggtgcg 9898816  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||   ||||||| ||  |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  9898815 aggtatagaagccacaatgactcctcttatcttgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 9898716  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  9898715 tc 9898714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 10276257 - 10276658
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  10276257 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 10276356  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  10276357 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 10276456  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  10276457 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 10276556  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  10276557 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtgatgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 10276656  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  10276657 tc 10276658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 4219166 - 4219453
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  4219166 ttcctcaatagcagttactttgggtcttcatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 4219265  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  4219266 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 4219365  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  4219366 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 4219453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11396714 - 11396427
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  11396714 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgc 11396615  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  11396614 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 11396515  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  11396514 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 11396427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 29253490 - 29253777
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  29253490 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 29253589  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  29253590 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 29253689  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29253690 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 29253777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 43091949 - 43092236
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  43091949 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 43092048  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  43092049 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 43092148  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  43092149 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttagcagtagatttgtcactcattttcat 43092236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 43353700 - 43353987
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  43353700 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 43353799  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  43353800 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 43353899  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  43353900 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcat 43353987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 27230709 - 27230996
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  27230709 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 27230808  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  27230809 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 27230908  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  27230909 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcat 27230996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 35262274 - 35262561
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  35262274 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 35262373  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  35262374 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 35262473  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  35262474 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcat 35262561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 35272899 - 35273186
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  35272899 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 35272998  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  35272999 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 35273098  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  35273099 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcat 35273186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21919652 - 21919366
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||| || |||| || ||||||||| | |||||||| ||| | |  |||||| |||||||||| |||| ||||||   ||||||||| || |||    
T  21919652 ttcctcaataacaatcactttaggtctccatttggcaggtaaacttgtcaaaatcttgttcacatgatcggaagttacataggctttcttcagaatctga 21919553  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||   |  ||    
T  21919552 agtccagagactagagtctgaaatcttgagtacatagcctcaatgctttcatcctcttttattccgaacaactcatactgatcaacaagcattgtatatt 21919453  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttca 288  Q
    | |||||||||| ||||||| | ||||||||||| | ||| |  |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21919452 tagcttctctgactttcttattgccttcatagtttgaacacaaggaagcaaacattgctttagcagtagatttatcactcatcttca 21919366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21163489 - 21163196
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| |   |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  21163489 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaactcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 21163390  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  21163389 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 21163290  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactc 295  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| || || || || |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21163289 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcgcatagtgacgcaaacatagctttcgcagtggatttgtcactcatcttcatgtactc 21163196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 210
Target Start/End: Original strand, 24723880 - 24724086
Alignment:
Q  5 ctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagt 104  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  24723880 ctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagtaggcaagcttcttaatatcttactcacatgatcagaagcaacctagcttttcttcagtatttgtagt 24723979  T
Q  105 ccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatact-gatgaacaagcataagagttttt 203  Q
    | ||   |||  |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||  |||    
T  24723980 ctaggggctatggtctgaaatcttcagtacatttcctcaatactttcatcatccttcatcttgaagaattcatactggatgaacaagcatgagagccttt 24724079  T
Q  204 gcttctc 210  Q
    |||||||    
T  24724080 gcttctc 24724086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 292
Target Start/End: Original strand, 22773144 - 22773332
Alignment:
Q  104 tccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttttt 203  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| || |  |||    
T  22773144 tccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactggcattagtgccttt 22773243  T
Q  204 gcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||| | |  ||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22773244 gcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcatagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 22773332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19301521 - 19301360
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||| |||| ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  19301521 ttccacaatggcagtaactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgc 19301422  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcat 163  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| |||||    
T  19301421 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcat 19301360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 134
Target Start/End: Original strand, 24567290 - 24567394
Alignment:
Q  30 catcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttg 129  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  24567290 catctagcaggtaagcttcttagaatcttgttcacacaatcagaagttacataacttttcttcagtatttgaagtctagagactagagtctgaaaccttg 24567389  T
Q  130 agtac 134  Q
    |||||    
T  24567390 agtac 24567394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 292
Target Start/End: Original strand, 26878510 - 26878636
Alignment:
Q  166 tgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagc 265  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||| |  ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||    
T  26878510 tgaacagctcatactgatgaactagcattaaagcctttgcttctctaaccttcttgcttccttcgtagttggcacagagtgatgcaaacattgccttagc 26878609  T
Q  266 agtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26878610 agtggatttatcactcatcttcatata 26878636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Original strand, 26876238 - 26876372
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||||     
T  26876238 ttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctaacatgatcagatgtaacatagctcttcttcagtatttgt 26876337  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacat 136  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  26876338 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacat 26876372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Original strand, 22682450 - 22682567
Alignment:
Q  16 tcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactag 115  Q
    ||||||| ||||||||  | ||||||||||| || || |||||  ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| |  ||||||| | | |||||    
T  22682450 tcaccttaggtctccacttagcaggtaagctccttagaatctttttcagatgatcagatgctacatagtttttcttcagaaactgaagtctaaagactag 22682549  T
Q  116 agtctgaaatcttgagta 133  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  22682550 agtctgaaaccttgagta 22682567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 49
Target Start/End: Original strand, 22254106 - 22254153
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttct 49  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22254106 ttccccaatagcagtcacctttggtcttcatcttgcaagtaagcttct 22254153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 4219498 - 4219567
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  4219498 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 4219567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 9763953 - 9763904
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  9763953 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 9763904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11396362 - 11396313
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  11396362 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 11396313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22916050 - 22916001
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  22916050 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 22916001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24328939 - 24328890
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  24328939 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 24328890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 29253822 - 29253891
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  29253822 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 29253891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 34791407 - 34791358
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  34791407 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 34791358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 35262606 - 35262675
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||    
T  35262606 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttcttc 35262675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 35273231 - 35273300
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||    
T  35273231 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttcttc 35273300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 40250211 - 40250280
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  40250211 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 40250280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 43092281 - 43092350
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  43092281 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 43092350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 43354032 - 43354101
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  43354032 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 43354101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 21163168 - 21163088
Alignment:
Q  323 tcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||||||  |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || | | |||| ||||||||    
T  21163168 tcctctgatcttgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtccacaacaactccttcttc 21163088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 17246080 - 17246481
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17246080 ttcctcaatagcagtcacctttgatctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttcttcggtatttga 17246179  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  17246180 agtccagaaactagagtctgaaatcttaagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagaat 17246279  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17246280 ttgcttctctgactttcttactaccttcatagttagcacagagagaagaaaacattgaattagaagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 17246379  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17246380 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgcgtgatgcttcttctataatttcttctgagaaggagtgtgttttcttctatcaatagcaactcctcct 17246479  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  17246480 tc 17246481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14905926 - 14905525
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14905926 ttccgcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaaccttctaagtattttgctcacatgatcagaagctacatagcctttcttcagtatttga 14905827  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||    
T  14905826 agtccataaactagattctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactaataaacaagcataagatctt 14905727  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14905726 ttgcttctctgattttcttactacctttatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatattttctgcttt 14905627  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14905626 aggtatagctttgacaagtgctccccagattgtgtgacgcttcttgtagaacttcttctgagtaggagtatgttttcttctatcaatagcagctccttct 14905527  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  14905526 tc 14905525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 252
Target Start/End: Original strand, 16852418 - 16852668
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16852418 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatctagtaggtaagcttctgagtatcttgctcacatgatcaaaagctacatagcttttcttcggtatttga 16852517  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16852518 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcct 16852617  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaa 252  Q
    |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16852618 ttgcttctctgactttcttgttgccttcatagttagcacaaagagaagcaa 16852668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10662789 - 10662399
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||| |||||||| ||||  ||||||||||| | | | || ||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  10662789 ttcctccatagcagtaacctaaggtctccatctagaatgaaaacttctcaatatcttgctcacatgattagaagcaacatagattttcttcagtatttga 10662690  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  10662689 agtccagagactagggtttgaaatcttgagtacatttccacaatactttcatcatcatttatcttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcct 10662590  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||| ||||| |  ||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| ||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||        
T  10662589 ttgcctctctaaccttcatactgccttcacagtttgcacaaagtgaaacaaacattacctttgcagtagatttgtcactcatcttcatgtactctgtgcg 10662490  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagca 392  Q
    |||||||| |   |||||   |||||| ||  ||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||||    
T  10662489 aggtatagatgcaacaaggattcctctcatcttgtgatgcttcttgtaaagttttttctgagcaggggtgtgtttctttctatcaatagca 10662399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10876934 - 10876544
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||| |||||||| ||||  ||||||||||| | | | || ||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  10876934 ttcctccatagcagtaacctaaggtctccatctagaatgaaaacttctcaatatcttgctcacatgattagaagcaacatagattttcttcagtatttga 10876835  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  10876834 agtccagagactagggtttgaaatcttgagtacatttccacaatactttcatcatcatttatcttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcct 10876735  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||| ||||| |  ||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| ||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||        
T  10876734 ttgcctctctaaccttcatactgccttcacagtttgcacaaagtgaaacaaacattacctttgcagtagatttgtcactcatcttcatgtactctgtgcg 10876635  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagca 392  Q
    |||||||| |   |||||   |||||| ||  ||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||||    
T  10876634 aggtatagatgcaacaaggattcctctcatcttgtgatgcttcttgtaaagttttttctgagcaggggtgtgtttctttctatcaatagca 10876544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14712349 - 14712059
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  14712349 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctcacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgc 14712250  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |  |    
T  14712249 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatattgatgaactagcataagtgcct 14712150  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    || ||||| | |  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14712149 ttacttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgaagcaaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 14712059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15195451 - 15195164
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  15195451 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctcgaaggcaagcttctcagaatcttgctaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgc 15195352  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||| |||| |||| ||| ||||||||| ||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  15195351 agttcagatactaaagtttgaaatcttaagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcattagagcct 15195252  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    |||||||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15195251 ttgcttctctaaccttcttgcttccttcgtagttggcacaaagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 15195164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 16316056 - 16316343
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || ||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  16316056 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacaagatcagaagtgacatagctcttcttcagtatttgc 16316155  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  16316156 agtccggatactaaagtttgaaatctagagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcct 16316255  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16316256 ttgcttctctgaccttcttgcttccttcgtagttggcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 16316343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27816472 - 27816185
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  27816472 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 27816373  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  27816372 agtccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 27816273  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27816272 tagcctctttcaacttcttgctaccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttagcagtagatttgtcactcatcttcat 27816185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 18065304 - 18065594
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  18065304 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagaatttgc 18065403  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| | || ||    
T  18065404 aatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaataattcatactgatgaacaagcatcaaagctt 18065503  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    | || ||| | |  |||||||| |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18065504 tagcctctttcaccttcttactgccttcaaagttggcacatagtgatgcaaacatagcctttgcagtagatttgtcactcatcttcatata 18065594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 459892 - 460179
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  459892 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgattagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 459991  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  459992 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 460091  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  460092 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 460179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14837634 - 14837347
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || ||||  || |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  14837634 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagtttctcagaatctaactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgc 14837535  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  14837534 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcct 14837435  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||||| || || |||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14837434 ttgcttctctgacattcttgcttccttcgtaatttgcacagagtgatgcaaacattaccttagcagtggatttatcactcatcttcat 14837347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 16265194 - 16265481
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  16265194 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 16265293  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  16265294 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 16265393  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  16265394 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 16265481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 17927428 - 17927715
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  17927428 ttcctcaatagcagttactttgggtctccaccttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 17927527  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  17927528 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 17927627  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17927628 tagcctctttcactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 17927715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18131775 - 18131488
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  18131775 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 18131676  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  18131675 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 18131576  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  18131575 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 18131488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 22005746 - 22006033
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  22005746 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 22005845  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  22005846 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 22005945  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22005946 tagcctcttttacattcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 22006033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 24649660 - 24649947
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  24649660 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 24649759  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  24649760 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 24649859  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  24649860 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 24649947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30928019 - 30927732
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  30928019 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaaacttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 30927920  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  30927919 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 30927820  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30927819 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 30927732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 10742124 - 10741723
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  10742124 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgc 10742025  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  10742024 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 10741925  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  10741924 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 10741825  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  10741824 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtgatgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 10741725  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  10741724 tc 10741723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 10955893 - 10955492
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  10955893 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgc 10955794  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  10955793 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 10955694  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  10955693 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 10955594  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  10955593 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtgatgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 10955494  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  10955493 tc 10955492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 19945864 - 19945463
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||     
T  19945864 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaaacaacatagcttttcttcagtatttgc 19945765  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  19945764 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 19945665  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |        
T  19945664 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatgtattcggtgcg 19945565  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  19945564 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctatctatagcagctccttct 19945465  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  19945464 tc 19945463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 36027620 - 36028021
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  36027620 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 36027719  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  36027720 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 36027819  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  36027820 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 36027919  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  36027920 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtgatgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 36028019  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  36028020 tc 36028021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 5021465 - 5021866
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  5021465 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctcgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 5021564  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | |  ||    
T  5021565 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaactagcatcaaaactt 5021664  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |        
T  5021665 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgatgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatatattcagtgcg 5021764  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || |||| || |||||| | ||||||    
T  5021765 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtgatgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctgtctatagcagctccttct 5021864  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  5021865 tc 5021866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18754016 - 18753615
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  18754016 ttcctcaatagcagttactttgggtctccaccttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 18753917  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  18753916 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 18753817  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || ||||| || | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |        
T  18753816 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaagatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatgtattcagtgcg 18753717  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  18753716 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtgatgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttct 18753617  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  18753616 tc 18753615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 27665902 - 27666303
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  27665902 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 27666001  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  27666002 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 27666101  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  27666102 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 27666201  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  27666202 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttct 27666301  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  27666302 tc 27666303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 27175403 - 27175690
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  27175403 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 27175502  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  27175503 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 27175602  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  27175603 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgtagtagatttgtcactcatcttcat 27175690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16820832 - 16820594
Alignment:
Q  54 atcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcat 153  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| ||||    
T  16820832 atcttgcttacatgatcaaaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatatcctctatactctcat 16820733  T
Q  154 catctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaa 253  Q
    |||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| || ||||| |  ||||||||| | |  ||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  16820732 catccttcatcttgaacagcacatactgatgaactagaataagtgcctttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcaaagagtgatgcaaa 16820633  T
Q  254 cattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16820632 cattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 16820594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 4989321 - 4988920
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||| |||||||||| || || ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  4989321 ttccccaatagcagttactttgggtctccatctcgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 4989222  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | |  ||    
T  4989221 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaactagcatcaaaactt 4989122  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |        
T  4989121 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgatgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatatattcagtgcg 4989022  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || |||| || |||||| | ||||||    
T  4989021 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtgatgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctgtctatagcagctccttct 4988922  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  4988921 tc 4988920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 49516866 - 49517267
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  49516866 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 49516965  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  49516966 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 49517065  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |        
T  49517066 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatgtattcagtgcg 49517165  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  49517166 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttct 49517265  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  49517266 tc 49517267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 55746778 - 55746491
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  55746778 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 55746679  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  55746678 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 55746579  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  55746578 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 55746491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 90 - 289
Target Start/End: Original strand, 3389265 - 3389464
Alignment:
Q  90 ttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaa 189  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  3389265 ttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaacta 3389364  T
Q  190 gcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    |||| | ||  ||||||||||| |   |||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3389365 gcattaaagcctttgcttctctaaccgtcttgcttccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 3389464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 40455886 - 40455599
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  40455886 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 40455787  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  40455786 aatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttctttaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 40455687  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || || ||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  40455686 tagcctctttcaccttcttgctgccctcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 40455599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 292
Target Start/End: Original strand, 11470140 - 11470288
Alignment:
Q  144 atactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacaga 243  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |  ||||||||| | |  ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  11470140 atactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattaatgcctttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacaaa 11470239  T
Q  244 gagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    | || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11470240 gtgatgcaaacattgccttagcagtagatttatcactcatcttcatata 11470288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 13694767 - 13694898
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||  |  || ||||||| || || |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||    
T  13694767 ttcctcaatagttgtcaccttaggtctccacttaacatgtaagctccttagaatcttcttcacatgatcagaagctacacaacttttcttcagaatatga 13694866  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagta 133  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  13694867 agtccagagactagagtctgaagccttgagta 13694898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17527973 - 17527839
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||  |||||||||||  | ||| |||  |||||||||  ||||||    
T  17527973 ttcctcaatagttgtcaacttaggtctccatctagcaggtaagctccttagaatcttcatcacatgatcatcaactatatagattttcttcaaaatttga 17527874  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacat 136  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  17527873 agtccagatactatagtctgaaaccttgagtacat 17527839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14845006 - 14844891
Alignment:
Q  174 tcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatt 273  Q
    |||||||||||||| ||||| | || ||| || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  14845006 tcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatt 14844907  T
Q  274 tgtcactcatcttcat 289  Q
    ||||||||||||||||    
T  14844906 tgtcactcatcttcat 14844891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 75
Target Start/End: Original strand, 3380831 - 3380904
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaag 75  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  3380831 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctaacatgatcagaag 3380904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14903890 - 14903745
Alignment:
Q  90 ttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaa 189  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    | | ||    ||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  14903890 ttcagaatctgaagtccagatactagagtctgaaaccttgagtacaaagtctcgatgtcctcatcatatttcatcatgaacaactcatactaatgaacaa 14903791  T
Q  190 gcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagtt 235  Q
     ||||  || |||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  14903790 tcatagtagctttaacttctctgattttattgttaccttcatagtt 14903745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 403
Target Start/End: Original strand, 11470320 - 11470399
Alignment:
Q  324 cctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  11470320 cctctgatcttgtgatgctttttgtaaagtttcttctgagcaggagtgtgtatccttctgtcaatagcagctccttcttc 11470399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 460224 - 460293
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  460224 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 460293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 366
Target Start/End: Original strand, 13695019 - 13695060
Alignment:
Q  325 ctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcag 366  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13695019 ctctgatcttgtgatgtttcttgtagagtttcttctgagcag 13695060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14844826 - 14844777
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  14844826 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 14844777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 16265526 - 16265595
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  16265526 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 16265595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 17927760 - 17927829
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  17927760 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 17927829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18131423 - 18131374
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  18131423 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 18131374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 22006078 - 22006147
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  22006078 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 22006147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 27175735 - 27175804
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  27175735 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 27175804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 27816120 - 27816071
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  27816120 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 27816071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 30927667 - 30927618
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  30927667 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 30927618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 40455534 - 40455485
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  40455534 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 40455485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 55746426 - 55746377
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  55746426 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 55746377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 13878647 - 13879048
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13878647 ttcctcaatagtagtcaccattggtctccatcttgcaagtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaggcttcatagcttttcttcagtatttga 13878746  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  13878747 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatacagatgaacaagcataagagctt 13878846  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13878847 ttgtttctcttactttcttactaccttcatagtttgcacagagagaagccaacattgacttagcagtagatttttcactcatcttcatatactctgcttt 13878946  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  13878947 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtaaaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaacaacaactccttct 13879046  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  13879047 tc 13879048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 13028580 - 13028194
Alignment:
Q  1 tttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttg 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  13028580 tttcctcgatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcctgctcacatgatcagaggctacatagctcttattcagtatttg 13028481  T
Q  101 aagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  13028480 aagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaacccatactgatgaacaagcataagagct 13028381  T
Q  201 tttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctt 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13028380 tttgcttctctaattttcttactaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgccttagcagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctt 13028281  T
Q  301 taggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaa 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13028280 taggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtagagtttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaa 13028194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 16311631 - 16311230
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16311631 ttcctcaatggcagtaacctttggtctccatcttgcaggtaaacttcttagtatcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttcttcagtatttga 16311532  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16311531 agtctagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttaatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagatt 16311432  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16311431 ttgcttctctgactttcttactaccttcatagtttgcacagatagaagcaaatattgccttagcagtatatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 16311332  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||    
T  16311331 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtagagtttcttctgagcaggagtatgtttccttctatcaacagcagctccttct 16311232  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  16311231 tc 16311230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 392
Target Start/End: Original strand, 14172168 - 14172558
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14172168 ttcctcaatagtagtcacctttggtctccatctagcaggtaagcttttaagtatctttctcacatgatcataggctacatagcttttcttcagtatttga 14172267  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14172268 agtctagaaactagagtctgaaattttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatcttgaacaactcatactgatgaacgagcataagagctt 14172367  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14172368 ttgcttctctgaccttcttaatgccttcatagttatcacaaagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatattatgcttt 14172467  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagca 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14172468 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtagaatttcttctgagcaagagtatgttttcttctatcaatagca 14172558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 4413619 - 4413218
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4413619 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatctggcaggtaggcttctgagtatcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttcttcggtatttga 4413520  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  4413519 agtccagaaaccagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatattttcatcatctttcattttgaacaactcatactaatgaacaagcataaaagctt 4413420  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4413419 ttgcttctctgactttcttgttgccttcgtagttagcacagagagaagcaaacatagatttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 4413320  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||| || || |||||||||||| | ||||||    
T  4413319 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtagaatctcttttgatcaggagtatgcttcctcctatcaatagcagctccttct 4413220  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  4413219 tc 4413218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 6 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 21212230 - 21211833
Alignment:
Q  6 tcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtc 105  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  21212230 tcaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggtaaacttcttagtatcttactcacttgatcagaagctacatagcttttcttcaatatttgaagtc 21212131  T
Q  106 cagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21212130 cagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcacactgatgaacatgcataagagtttttgc 21212031  T
Q  206 ttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggt 305  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21212030 ttctctaactttcttactaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacaatgccttaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttttggt 21211931  T
Q  306 atagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21211930 atagctttgacaaatgctcctctcatcgtgtgatgcttcttgtagagtttattctaagcaggagtatgttttcttctatcaatagcagctccttcttc 21211833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 33 - 403
Target Start/End: Original strand, 15466298 - 15466668
Alignment:
Q  33 cttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15466298 cttgcaggtaagcttctaagtatctttctcacatgatcagaggctacatagcttttctttagtatttgaagtccataaattagagtctgaaatcttgagt 15466397  T
Q  133 acatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcata 232  Q
    |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15466398 acatgtgctaaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcttttgcttctctggctttcttactaccttcata 15466497  T
Q  233 gttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgatt 332  Q
    |||||||||  ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15466498 gttagcacaaggagaagcaagcttgtacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactatgctttaggtatagctttgacaagtgctcctatgatt 15466597  T
Q  333 gtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15466598 gtgtgatgcttcttgtagaatttcttctgaacaggagtatgttttcttctatcaatagcagctccttcttc 15466668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 13680851 - 13681246
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||      |||| ||||||||||||||||||    
T  13680851 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggcaagcttcttagtatcctgctcacatgatcag------catagcttttcttcagtatttga 13680944  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13680945 agtccagaaactagagtatgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaataactcatactgatgaacaagcataagagctt 13681044  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||    
T  13681045 ttgcttctcttactttcttactacctttatagtttgcacagagagaagcaaacattgacttagtagtagatttttcactcatctttatgtactctacttt 13681144  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  13681145 acgtatagctttgtcaagtgctcctatgattttgtgatgtttcttgtaaagtttcttctgagcagaagtatgttttcttctatcaacagcagctccttct 13681244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 2 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16547649 - 16547368
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  16547649 ttcctcaatagcagtcacctttagtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttctttagtatttga 16547550  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16547549 agtccagaaacttgagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagctt 16547450  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcat 283  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  16547449 ttgcttctctgactttcttactaccttcatagtttgcacagagagaagaaaacattgatttagcaatgaatttgtcactcat 16547368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 2 - 283
Target Start/End: Original strand, 16618013 - 16618294
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  16618013 ttcctcaatagcagtcacctttagtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttctttagtatttga 16618112  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16618113 agtccagaaacttgagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagctt 16618212  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcat 283  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  16618213 ttgcttctctgactttcttactaccttcatagtttgcacagagagaagaaaacattgatttagcaatgaatttgtcactcat 16618294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13173866 - 13173572
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13173866 ttcctcaataacagtaaccttaggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcagtatttga 13173767  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  13173766 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacattttctcaatactttcatcatctttcattttgaaaaactcatacagatgaacaagcttaagagctt 13173667  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactct 296  Q
     ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13173666 ctgcttctatgactttcttactaccttcatagtttacacagagagaagcaaacattgccttaacagtagatttgtcactcatcttcatatactct 13173572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Original strand, 16408303 - 16408589
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||| || ||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| |    
T  16408303 ttcctcaaaagtagtaaccttaggtcaccatctagcaggtaagcttctcagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagattttctttaatatttaa 16408402  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  || ||    
T  16408403 agtccagagactaaagtctaaaatcttgagtacatttcctcaatactttcatcatctttcatcttgaacaactcatattgatgaacaagcatagtaggtt 16408502  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttca 288  Q
    |||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  16408503 ttgcttctttaaccttcttactaccttcatagtttgcacaaagtgaagcaaacattgcctttgcagtagatttgtcactcatattca 16408589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 18439892 - 18440182
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  18439892 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctaacgtgatcagaagcaacataacttttcttcagtatttgc 18439991  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | |   ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  18439992 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctatatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcct 18440091  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18440092 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 18440182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 9168878 - 9169165
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  9168878 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtgacatagctcttcttcagtatttgc 9168977  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  9168978 agtccggatactaaagtttgaaatctagagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcct 9169077  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9169078 ttgcttctctgaccttcttgcttccttcgtagttggcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 9169165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 458592 - 458305
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  458592 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 458493  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  458492 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 458393  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  458392 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 458305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2707219 - 2706932
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  2707219 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 2707120  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  2707119 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 2707020  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2707019 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 2706932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 11003876 - 11004277
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  11003876 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 11003975  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  11003976 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 11004075  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  11004076 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 11004175  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  11004176 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttct 11004275  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  11004276 tc 11004277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 176187 - 176474
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  176187 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 176286  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  176287 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 176386  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  176387 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 176474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 4221305 - 4221592
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  4221305 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttcttaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 4221404  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  4221405 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 4221504  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  4221505 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 4221592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 8626642 - 8626929
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  8626642 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 8626741  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  8626742 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 8626841  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  8626842 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 8626929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 22098438 - 22098725
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  22098438 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 22098537  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  22098538 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 22098637  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  22098638 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 22098725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26391700 - 26391299
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  26391700 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgc 26391601  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  26391600 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 26391501  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  26391500 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 26391401  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  26391400 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtgatgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 26391301  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  26391300 tc 26391299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 40043710 - 40043309
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  40043710 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 40043611  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  40043610 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 40043511  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  40043510 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 40043411  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  40043410 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtgatgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 40043311  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  40043310 tc 40043309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6868836 - 6868549
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  6868836 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 6868737  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  6868736 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 6868637  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  |||||  | |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6868636 tagcctctttcaccttcttgttgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 6868549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 9442560 - 9442847
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||     
T  9442560 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcaatatttgc 9442659  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  9442660 agtccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 9442759  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9442760 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttagcagtagatttgtcactcatcttcat 9442847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 24743398 - 24743685
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  24743398 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 24743497  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  24743498 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 24743597  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  24743598 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 24743685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17951717 - 17951433
Alignment:
Q  5 ctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagt 104  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |    
T  17951717 ctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaat 17951618  T
Q  105 ccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttg 204  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||| |    
T  17951617 ccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttag 17951518  T
Q  205 cttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | ||| | | |||||| || |||| | |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  17951517 cctcttttactttcttgctgcctttaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 17951433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 1996853 - 1997140
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  1996853 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 1996952  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  1996953 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 1997052  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  1997053 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcat 1997140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 20988354 - 20988641
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  20988354 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 20988453  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  20988454 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 20988553  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20988554 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 20988641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 42875145 - 42875432
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  42875145 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 42875244  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| | ||| | || ||    
T  42875245 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactaacatcaaagctt 42875344  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  42875345 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 42875432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8003672 - 8003385
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  8003672 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 8003573  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  8003572 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 8003473  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  8003472 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 8003385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 11014485 - 11014772
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  11014485 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 11014584  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  11014585 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 11014684  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  11014685 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcat 11014772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 276 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 16546718 - 16546591
Alignment:
Q  276 tcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgtt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16546718 tcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcatctgattgtgtgatgcttcttgtagaatatcttctgagcagaagtatgtt 16546619  T
Q  376 ttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||    
T  16546618 ttcttctatcaataacagctccttcttc 16546591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 276 - 403
Target Start/End: Original strand, 16618944 - 16619071
Alignment:
Q  276 tcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgtt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16618944 tcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcatctgattgtgtgatgcttcttgtagaatatcttctgagcagaagtatgtt 16619043  T
Q  376 ttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||    
T  16619044 ttcttctatcaataacagctccttcttc 16619071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26654942 - 26654655
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||  || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  26654942 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatctaactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 26654843  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  26654842 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 26654743  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  26654742 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcat 26654655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 9093684 - 9093971
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  9093684 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 9093783  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  9093784 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 9093883  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  9093884 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcat 9093971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16309350 - 16309161
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | | |||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| |||    
T  16309350 ttcctcaatagcagtaactttaggtctccatctaggatgtaagcttcttagaatcttgttcacatgattagaagctacatattttttctttagtatctga 16309251  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagc 191  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||   | |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16309250 agtccagagactagagtctaaaaccttaagtacatagcctcaatgctttcatcatctttcatcttgaacaattcatactgatgaacaagc 16309161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15879428 - 15879141
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  15879428 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 15879329  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  15879328 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 15879229  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| || || || || |||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||    
T  15879228 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcgcatagtgacgcaaacatagcttttgcggtggatttgtcactcatcttcat 15879141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16106670 - 16106384
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||  |||||| || |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  16106670 ttcctcaattgcattcaccttaggtctccatttagcatataagctccttagtatccttttcacatgatcagaagctacataacttttcttcagaatctga 16106571  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||   | ||||    ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  16106570 agtccagagactagagtctgaaaccatgagtacatagtctcaatgtcctcatcctccttcatcctgaacaactcatactgatgaacaagcatagtagctt 16106471  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttca 288  Q
    | |||||| ||| ||||||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||||| |   ||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  16106470 tggcttctatgaatttcttgttaccttcatagtttgaacacaaggaaacaaacactactttaacagttgatttatcactcatcttca 16106384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13176052 - 13175910
Alignment:
Q  150 tcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaag 249  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| | |  ||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  13176052 tcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgtctttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatg 13175953  T
Q  250 caaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13175952 caaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 13175910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 189
Target Start/End: Original strand, 15087488 - 15087641
Alignment:
Q  36 gcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtaca 135  Q
    ||||||||||| || || |||||  |||||||||||  | ||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15087488 gcaggtaagctccttagaatcttcttcacatgatcaacaactacatagcttttctttagaatttgaagtccagagactagagtctgaaaccttgagtaca 15087587  T
Q  136 tttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaa 189  Q
    |   | |||| |||||||  ||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||    
T  15087588 tagcctcaatgctttcattctctttcatcatgaacatttcatattgatgaacaa 15087641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 13173572 - 13173527
Alignment:
Q  342 ttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaa 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13173572 ttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaa 13173527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6879336 - 6879191
Alignment:
Q  144 atactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacaga 243  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||| || ||| | |  |||||  | |||||| |||| ||||| |    
T  6879336 atactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgttgccttcaaagtttgcacata 6879237  T
Q  244 gagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6879236 gagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 6879191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16309022 - 16308954
Alignment:
Q  324 cctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagca 392  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||  ||||||||||||||    
T  16309022 cctctgatcttgtgatgtttcttgtacaacttcttctgagcagcagtgtatttatttctatcaatagca 16308954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 176519 - 176588
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  176519 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 176588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 458240 - 458191
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  458240 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 458191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 1997185 - 1997254
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  1997185 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 1997254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 2706867 - 2706818
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||    
T  2706867 ttcttctgagcaggagtatgtattgttctatctatagcagctccttcttc 2706818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 4221637 - 4221706
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  4221637 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 4221706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 6868484 - 6868435
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  6868484 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 6868435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 6879126 - 6879077
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  6879126 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 6879077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8003320 - 8003271
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  8003320 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 8003271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 8626974 - 8627043
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  8626974 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 8627043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 9094016 - 9094085
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  9094016 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 9094085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 9442892 - 9442961
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  9442892 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 9442961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 11014817 - 11014886
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||    
T  11014817 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttcttc 11014886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 17951368 - 17951319
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  17951368 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 17951319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 20988686 - 20988755
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  20988686 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 20988755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 22098770 - 22098839
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  22098770 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 22098839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 24743730 - 24743799
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  24743730 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 24743799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26654590 - 26654541
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  26654590 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 26654541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 47821 - 48222
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  47821 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaaacttcttagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcaatatttga 47920  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47921 agtccagaaactagagtcttaaatcttaagtacatttgctcaatacttttatcatctttcatattgaacaactcatactgatgaacaagcataagagctt 48020  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  48021 ttgcttctcttactttcttactaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacactaacttagtagtagatttctcactcatcttcatatactctggttt 48120  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  48121 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtaaagtttcttctgggcaggagtatgttttcttctatcaacagcagctccttct 48220  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  48221 tc 48222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 387
Target Start/End: Original strand, 35941 - 36326
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  35941 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctcagtatcttgctcacaagatcagaggctgcatagcttttcttcagtatttga 36040  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  36041 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacattttctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaaaaagcataagagctt 36140  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36141 ttgcttctcttactttcttactaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgactaagtagttgatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 36240  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaa 387  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  36241 aggtataactttgacaagtgctcatctgattgtgtgatgcttgttgtagaatttcttctgagcagaagtatgttttcttcaatcaa 36326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 387
Target Start/End: Original strand, 134001 - 134386
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  134001 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctcagtatcttgctcacaagatcagaggctgcatagcttttcttcagtatttga 134100  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  134101 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacattttctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaaaaagcataagagctt 134200  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134201 ttgcttctcttactttcttactaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgactaagtagttgatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 134300  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaa 387  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  134301 aggtataactttgacaagtgctcatctgattgtgtgatgcttgttgtagaatttcttctgagcagaagtatgttttcttcaatcaa 134386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 157643 - 158043
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  157643 ttcctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcaaaagctacatagcttttctttagtatttca 157742  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  157743 agtccagaaactagagtgtgaaatcttgagtacatttcctcgatactttcattatctttcattttgaaaaactcatactaatgaacaagcataagagctt 157842  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  157843 ttgcttctctgactttctcgctaccttcatagtttgcacagagagaagcaaaccttg-cctagtagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 157941  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  157942 aggtatagcattgacaagtgctcctctgatcgtgtgatgcttcttgtagagtttcttatgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcagctccttct 158041  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  158042 tc 158043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 45320 - 45033
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| |  || || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  45320 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatgttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 45221  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  45220 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 45121  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45120 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 45033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 43)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 23023374 - 23023775
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23023374 ttcctcaatagcagtcaccttaggtctccatctagtaggtaagcttctgagtatcttgcttacatgatcagaagctacatagcttttcttcagtatttga 23023473  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  23023474 attcctgaaactagagtttgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcct 23023573  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23023574 ttgcttctctgactttcttgctgccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgatctagtagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 23023673  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  23023674 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattatgtgatgcttcttgtaaagtttcttctgagcaggagtatgctttcttctatcaatagcagctccttct 23023773  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  23023774 tc 23023775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21125950 - 21125612
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21125950 ttcctcaatagcaatcacctttggtctccatctagcaggtaggcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 21125851  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21125850 agtccagaaactagagtctgaaatcttcagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactaatgaacaagcataagagctt 21125751  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21125750 ttgcttctctgactttcttactgccttcatagttagcacagagagaagaaaacattgatctagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 21125651  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21125650 aggtatagctttgacaagtgctcttctgattatgtgatg 21125612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 387
Target Start/End: Original strand, 20943278 - 20943647
Alignment:
Q  18 acctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagag 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20943278 accttaggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagtttcttagcttttcttcagtatttgaagtccagaaactagag 20943377  T
Q  118 tctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgatttt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||    
T  20943378 tctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttccttttgaacaactcatactaatgaacaagcataagagcttttgcttttctaacttt 20943477  T
Q  218 cttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgaca 317  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20943478 cttactacctttatagtttgcacagagagaagcaaacattgccttagcattagatttttcactcatcttcatatactctgctttaggtataactttgaca 20943577  T
Q  318 agtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaa 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20943578 agtgctcctctaattgtgtgatgcttcttgtagagtttcttcttagtaggagtatgttttcttctatcaa 20943647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 2 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 21196279 - 21195892
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21196279 ttcctcaatagcagtgaccttacgtctccatctagaaggtaagtttcttagtatcttgctcacgtgatcaaaagctacatagcatttcttcagtatttga 21196180  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21196179 agtccaggaactagagtctaaaatcttgagtacatttcctcaatactttcaacatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagctt 21196080  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21196079 ttgcttctctaactttcttgctaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacatttcgttagcagtagatttgttactcatcttcatatactctacttt 21195980  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaata 389  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21195979 aggtatagctttgacaagtgctcatctgatcgtgtgatgcttcttgtagagtttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaata 21195892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 2 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22431550 - 22431253
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  22431550 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtctcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttcttcagtatttaa 22431451  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  22431450 agtccaggaactagagtctaaaatcttgagtacatttgctcaatactttgatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataaaagctt 22431351  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgct 299  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22431350 ttgcttctctaactttcttactgccttcatagttagcactgagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgct 22431253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21207399 - 21207056
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21207399 ttcctcaatagcaatcacctttggtctccatctagcaggtaggcttatgagtatcttgctcacatgatcagaagctacatatcttttcttcagtatttga 21207300  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  21207299 agtccagaaactagagtctgaaatcttgaatacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacagctcatattgatgaacaagcataaaagctt 21207200  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattg-ac---ttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctg 297  Q
    |||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21207199 ttgcttctctgactttgttattgccttcaaagttagcacagagagaagcaaacattgtacgttctagcagtagatttgtcactcatcttcatatactctg 21207100  T
Q  298 ctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgt 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21207099 ctttaggtataactttgacaagtgctcctctgattatgtgatgt 21207056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25449844 - 25449611
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgca-ggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttg 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25449844 ttcctcaatggcagtcacttttggtctccatctagaaaggcaagcttctcagaatcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttcttcagtatttg 25449745  T
Q  101 aagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25449744 aagtccagaaactagagtttgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagct 25449645  T
Q  201 tttgcttctctgattttcttactaccttcatagt 234  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25449644 tttgcttctctgactttcttgctaccttcatagt 25449611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 295
Target Start/End: Original strand, 9345284 - 9345574
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||| ||| || || ||||||||||  |||||||||||||| || |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9345284 ttcctcaatagtagtaactttaggtctccatcaagcaggtaagcttcttagaatcttgttcacatga---gaagctacataacttttcttcagtatctga 9345380  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||   | |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||    
T  9345381 agtccagagactatggtctgaaaccttgagtacatagcctcaatgctttcatcatcattcatcttgaacaacttatactgatgagcaagcataatagctt 9345480  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactc 295  Q
    |||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9345481 ttgcttctttgactttcttgttaccttcatagttagcacacaaggaagcaaacattgctttagaagtagatttgtcactcatcttcatatactc 9345574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 51630756 - 51630355
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  51630756 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 51630657  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  51630656 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 51630557  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  51630556 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 51630457  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  51630456 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttct 51630357  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  51630356 tc 51630355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 12739785 - 12740072
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  12739785 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 12739884  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  12739885 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 12739984  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12739985 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 12740072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20874737 - 20874499
Alignment:
Q  54 atcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcat 153  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| ||||    
T  20874737 atcttgcttacatgatcagaagcaacatgactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcat 20874638  T
Q  154 catctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaa 253  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||| | |  ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  20874637 catccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttctttaaccttcttgctaccctcgtagttagcacagagtgatgcaaa 20874538  T
Q  254 cattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20874537 cattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 20874499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 36237994 - 36237593
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  36237994 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 36237895  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  36237894 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 36237795  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  36237794 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 36237695  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  36237694 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttct 36237595  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  36237594 tc 36237593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 4176559 - 4176846
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  4176559 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 4176658  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  4176659 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 4176758  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4176759 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttagcagtagatttgtcactcatcttcat 4176846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 12615887 - 12615600
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  12615887 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 12615788  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  12615787 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 12615688  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  12615687 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 12615600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 19186462 - 19186749
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  19186462 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 19186561  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||    
T  19186562 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagttt 19186661  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19186662 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 19186749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 22017820 - 22018111
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  22017820 ttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacataatcagaagcaacataactcttcttaagtatttgc 22017919  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||  |  |    
T  22017920 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatattgaacagctcataatgatgaactagcataaatgcct 22018019  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagag-agaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  22018020 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagttgaagcaaacattgccttagcagtggatttatcactctttttcatata 22018111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 35639603 - 35639315
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  35639603 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 35639504  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  35639503 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 35639404  T
Q  202 ttg-cttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | | ||||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  35639403 tagccttcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 35639315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5641274 - 5640987
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||     
T  5641274 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacatgatcagaagcaacatagcttttctttagtatttgc 5641175  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  5641174 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 5641075  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5641074 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 5640987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 21876405 - 21876806
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  21876405 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 21876504  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  21876505 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 21876604  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |        
T  21876605 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatgtattcagtgcg 21876704  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  21876705 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttct 21876804  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  21876805 tc 21876806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 3180858 - 3181145
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  3180858 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 3180957  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| | ||| | || ||    
T  3180958 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactaacatcaaagctt 3181057  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  3181058 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 3181145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 5842461 - 5842748
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  5842461 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 5842560  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| | ||| | || ||    
T  5842561 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactaacatcaaagctt 5842660  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  5842661 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 5842748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 47609500 - 47609213
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  47609500 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 47609401  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  47609400 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 47609301  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  47609300 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 47609213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 38093716 - 38094003
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  38093716 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 38093815  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  38093816 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 38093915  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  38093916 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcat 38094003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 38104342 - 38104629
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  38104342 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 38104441  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  38104442 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 38104541  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  38104542 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcat 38104629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 289
Target Start/End: Original strand, 7516602 - 7516828
Alignment:
Q  63 acatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttca 162  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||    
T  7516602 acatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttca 7516701  T
Q  163 ttttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgactt 262  Q
    || |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||| || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||    
T  7516702 ttctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagcctt 7516801  T
Q  263 agcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||    
T  7516802 cgcagtagatttgtcactcattttcat 7516828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 7691035 - 7690746
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| |  ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  7691035 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatggtcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 7690936  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaag--cataagagt 199  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||  ||| | ||     
T  7690935 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcacatcaaagc 7690836  T
Q  200 ttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    ||| || ||| | |  ||||| || |||||| |||| || || || ||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7690835 tttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcgcatagtgacacaaacatagccttcgcagtggatttgtcactcatcttcat 7690746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Original strand, 27857293 - 27857580
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagct-acataacttttcttcagtatttg 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||   |||| |||||||| |||||||  | || |||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |  ||    
T  27857293 ttcctcaatagaagtcactttaaatctctatcttgcatgtaagctcttgagaatcttgttcacataatcagaaacttacataacttttcttcagaacctg 27857392  T
Q  101 aagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   | ||||   |||||| | ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||  || |    
T  27857393 aagtccagagactagagtctgaaaccttgagtacatagactcaatgtcttcatcttatttcattctaaaaaactcgtactgatgaacaagcatagtagct 27857492  T
Q  201 tttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttca 288  Q
    ||  ||| ||||| ||||||  ||||||||||||| | ||| |  |||||||||||||  || ||||| ||||| ||| | |||||||    
T  27857493 ttaccttatctgactttcttgttaccttcatagtttgaacacaaggaagcaaacattgcttttgcagtagatttatcatttatcttca 27857580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Original strand, 18613673 - 18613748
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagct 77  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18613673 ttcctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagtaggtaagcttctcagtatcttgctcacatgatcagaagct 18613748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 286
Target Start/End: Original strand, 22958653 - 22958878
Alignment:
Q  61 tcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatcttt 160  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||  | || |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||     ||||   ||||||||||||    
T  22958653 tcacatgatcagcaactacatagcttttcttttgaatctgaagttcagaaactagattcttaaaccttgagtacatagtttcaatgtcttcatcatcttt 22958752  T
Q  161 cattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgac 260  Q
    |||| || |||  ||||| || |||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||   |||||||||||| | ||| | ||||||||||||||      
T  22958753 cattctggacagttcataatgctgaacaagcatggtagtttttgtttctctgactttcttgtcaccttcatagtttgaacacaaagaagcaaacattgct 22958852  T
Q  261 ttagcagtggatttgtcactcatctt 286  Q
    | |||||| ||||| |||||| ||||    
T  22958853 taagcagtagatttatcactcgtctt 22958878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23975969 - 23975894
Alignment:
Q  61 tcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacat 136  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  23975969 tcacgtgatcagaagctacatagcttttcttcagaatctgaagtccatacactagagtctgaaaccctgagtacat 23975894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 49
Target Start/End: Original strand, 7516531 - 7516578
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttct 49  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  7516531 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttct 7516578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 4176891 - 4176960
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  4176891 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 4176960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5640922 - 5640873
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  5640922 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 5640873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 5842793 - 5842862
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  5842793 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 5842862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 7516873 - 7516942
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  7516873 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 7516942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 12615535 - 12615486
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  12615535 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 12615486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 12740117 - 12740186
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  12740117 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 12740186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 19186794 - 19186863
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  19186794 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 19186863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 35639250 - 35639201
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||    
T  35639250 ttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttcttc 35639201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 38094048 - 38094117
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  38094048 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 38094117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 38104674 - 38104743
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  38104674 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 38104743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 47609148 - 47609099
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  47609148 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 47609099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7690712 - 7690632
Alignment:
Q  323 tcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||||||  |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||| | ||||||||    
T  7690712 tcctctgatcttgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctaaagcagctccttcttc 7690632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 6 - 403
Target Start/End: Original strand, 209915 - 210311
Alignment:
Q  6 tcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  209915 tcaatagcagtcacctttggtctccaactagcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttct-cagtatttgaagtc 210013  T
Q  106 cagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgc 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  210014 cagaaactagagcctgaaatcttgagtacatttgctcaatgctttcatcatctttcattttgaacagctcataatgatgaacaagcataagagcctttgc 210113  T
Q  206 ttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggt 305  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  210114 ttctctgactttcttactgccttcatagtaagcacagagagaagcaaacattgatctagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggt 210213  T
Q  306 atagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  210214 atagctttgacaagtgctcctctgattatgtgatgcttcttgtagagtttcttctgatcaggagtatgctttctcctatcaatagcagctccttcttc 210311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 2 - 392
Target Start/End: Original strand, 7173 - 7562
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7173 ttcctcaatagcagtaaccttaggtctccatcttgtaggtaaacttcttagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttctttagtatttga 7272  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7273 cgtccagaaact-gagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagctt 7371  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7372 ttgcttctctgactttcttactaccttcatagtttgcacagagagaagcaaatattgtcttagtagtagatttatcactcatcttcatatactctgcttt 7471  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagca 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7472 aggtatagctttgacaagtgctcctctgatcgtgtgatgcttcttgaagagtttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaacagca 7562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 111201 - 110800
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  111201 ttcctcaatagcagtcacctttggtcttcatctagcaggtaagcttctaagtatcttgttcacatgatcagaagctacatagattttcttcagtatttga 111102  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  111101 agtccataaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatattgtcatcatctttcattttgaacagctcatactgatgaacaagcataagagcct 111002  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111001 ttgcttctctgactttcttactgccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgatctagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 110902  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  110901 aggtatagctttgacaagtgctcatctgattatgtgatgcttcttgtagagtttcttttgatcaggagtatgctttctcctatcaatggcagctccttct 110802  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  110801 tc 110800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 73)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 26763966 - 26764367
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  26763966 ttcctcaatagcaatcacctttggtctccatctagcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcagtatttaa 26764065  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26764066 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatgctttcatcatctttcattttgaacagctcatactgatgaacaagcataagagtct 26764165  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26764166 ttgcttctttgactttcttactgccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgatctaacaatagatttatcactcatcttcatatactctgcttt 26764265  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  26764266 aggtatagctttaacaagtgctcctctgattatgtgatgcttcttgtagagtttcttttgatcaggagtatgctttttcctatcaatagcaactccttct 26764365  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  26764366 tc 26764367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 21200647 - 21200246
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21200647 ttcctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagtaggtaagctttatagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcagtatttga 21200548  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  21200547 agtctagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgttcaatactttcatcatatttcattttgaacaactcatactgatcaacaagcataagagatt 21200448  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21200447 ttgtttctctgactttcttactaccttcataatttgcacaaagagaagcaaacattgccttagtagtagatttgtcattcatcttcatatactctgcttt 21200348  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
     ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21200347 tggtatagctttgaaaagcgctcctttgatcgtgtgatgcttcttgtagagtttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcattagcaactccttct 21200248  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  21200247 tc 21200246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 31144917 - 31144545
Alignment:
Q  32 tcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgag 131  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31144917 tcttgaaggtaggcttctgagtatcttgctcacatgatcagaagctacagaacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtttgaaatcttgag 31144818  T
Q  132 tacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactca-tactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttca 230  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31144817 tacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacagctcaatactgatgaacaagcataagagcttttgcttctctgactttcttactaccttca 31144718  T
Q  231 tagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctga 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  31144717 tagttagcatagagagaagcaaacattgatctagcagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgttcctttga 31144618  T
Q  331 ttgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||    
T  31144617 ttatgtgatgcttcttgtagagtttcttctgatcaggagtatgctttctcctatcaatggcagctccttcttc 31144545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 213
Target Start/End: Original strand, 26782936 - 26783141
Alignment:
Q  8 aatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtcca 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  26782936 aataacagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacttgatcagaggctacatagcttttcattagtatttgaagtcca 26783035  T
Q  108 gaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgctt 207  Q
    | |  |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26783036 gtacttagagtttgaaatcttgagtaaatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcttttgctt 26783135  T
Q  208 ctctga 213  Q
    ||||||    
T  26783136 ctctga 26783141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25113543 - 25113253
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  25113543 ttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatcttgctcacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgt 25113444  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |   | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    |    
T  25113443 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcttctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcataagtacct 25113344  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25113343 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagcagtagatttatcactcatcttcatata 25113253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25172634 - 25172344
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  25172634 ttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatcttgctcacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgt 25172535  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |   | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    |    
T  25172534 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcttctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcataagtacct 25172435  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25172434 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagcagtagatttatcactcatcttcatata 25172344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 17455929 - 17456216
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | |||||||||||| || || ||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  17455929 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggtaagcttcttagaattttgctaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgc 17456028  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  17456029 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcct 17456128  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    |||||||||| | |||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17456129 ttgcttctctaactttcttgcttccttcgtagttggcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 17456216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 21704580 - 21704867
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| | ||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  21704580 ttcctcaatggtagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgc 21704679  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  21704680 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcct 21704779  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21704780 ttgcttctctgaccttcttgcttccttcgtagtttgcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 21704867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 13532484 - 13532774
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||  |||| || || ||||||||| | | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  13532484 ttcctcaatgacagttactttgggtctccatttagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgc 13532583  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  13532584 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcatgagtgcct 13532683  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13532684 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcatagatagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 13532774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 283
Target Start/End: Original strand, 23487110 - 23487391
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  23487110 ttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttactcacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgc 23487209  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |  |    
T  23487210 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatattgatgaactagcataagtgcct 23487309  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcat 283  Q
    || ||||| | |  ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23487310 tttcttctttaaccttcttcctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagcagtggatttatcactcat 23487391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 24982026 - 24982313
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  24982026 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtgacatagctcttcttcagtatttgc 24982125  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  24982126 agtccggatactaaagtttgaaatctagagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcatcagggcct 24982225  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24982226 ttgcttctctgaccttcttgcttccttcgtagttggcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 24982313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11209640 - 11209350
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||     
T  11209640 ttcctcaatggcagtcaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatattttgctcacatgatcagaagcaacatagctcttctttagtatttgc 11209541  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||| ||| |||| ||| |||||||||||| |||| |   | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  11209540 agtctagatactaaagtttgaaatcttgagcacatctcttctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgcct 11209441  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||||| |  ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11209440 ttgcttctctaaccttctttctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacagtaccttagcagtggatttatcactcattttcatata 11209350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6977451 - 6977164
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  6977451 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 6977352  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  6977351 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 6977252  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  6977251 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 6977164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20553460 - 20553173
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||     
T  20553460 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctgagaatcttgctaacatgatcaaaagtaacatagctcttcttcagtatttgt 20553361  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  20553360 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcct 20553261  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    |||||||||| |  ||||| || ||||| ||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20553260 ttgcttctctaaccttcttgcttccttcgtagttggaacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 20553173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22677761 - 22677474
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  22677761 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 22677662  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  22677661 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 22677562  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  22677561 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 22677474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23297922 - 23297635
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  23297922 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 23297823  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  23297822 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 23297723  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  23297722 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 23297635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 39500103 - 39500390
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  39500103 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 39500202  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  39500203 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 39500302  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  39500303 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 39500390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 40392003 - 40391716
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  40392003 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 40391904  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  40391903 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 40391804  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  40391803 tagcctctttcactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 40391716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 30236642 - 30237043
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  30236642 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 30236741  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  30236742 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 30236841  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  30236842 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 30236941  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  30236942 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttct 30237041  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  30237042 tc 30237043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9337599 - 9337312
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  9337599 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 9337500  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  9337499 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 9337400  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  9337399 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 9337312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23394054 - 23393767
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  23394054 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgc 23393955  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  23393954 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcct 23393855  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    ||||||||||||   |||| || ||||| || || |||||||| || |||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  23393854 ttgcttctctgaccatcttgcttccttcgtaatttgcacagagtgatgcaaacattgtcttagtagtggacttatcactcatcttcat 23393767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23698425 - 23698138
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  23698425 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 23698326  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  23698325 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 23698226  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  23698225 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 23698138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31835125 - 31834838
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  31835125 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 31835026  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  31835025 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 31834926  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  31834925 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 31834838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34053605 - 34053318
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||| ||| | ||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  34053605 ttcctcaatagcagttactttgggtctccgtctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtgacatagctcttcttcagtatttgc 34053506  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| ||||  || || |||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  34053505 agtccagatactaaggtttggaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatttagaacagctcatactgatgaactagcattagggcct 34053406  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34053405 ttgcttctctgaacttcttgcttccttcgtagttggcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 34053318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 36591733 - 36592020
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  36591733 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 36591832  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  36591833 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 36591932  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  36591933 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 36592020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 39354141 - 39353854
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  39354141 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 39354042  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  39354041 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 39353942  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39353941 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 39353854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14031687 - 14031286
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  14031687 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 14031588  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  ||||||| |||||| ||||| | || ||    
T  14031587 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactaatgaactagcatcaaagctt 14031488  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  14031487 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 14031388  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  14031387 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtgatgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 14031288  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  14031287 tc 14031286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 14567269 - 14567670
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  14567269 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgc 14567368  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  14567369 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 14567468  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  14567469 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 14567568  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  14567569 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtgatgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 14567668  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  14567669 tc 14567670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 16002512 - 16002913
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||     
T  16002512 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagtttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagtttttcttcagtatttgc 16002611  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  16002612 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 16002711  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |  |     
T  16002712 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatgtattcggtgtg 16002811  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  16002812 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 16002911  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  16002912 tc 16002913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 19465617 - 19465216
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| | |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  19465617 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggtaaacttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacataacttttcttcagtatttgc 19465518  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | || |||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  19465517 aatctagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 19465418  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| || ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |        
T  19465417 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcgcagagtgacgcaaacatagccttcgcagtggatttgtcactcatcttcatatattcggtgcg 19465318  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||| | ||||||    
T  19465317 aggtatagaagccacaatgattcctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctacagcagctccttct 19465218  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  19465217 tc 19465216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24568733 - 24568332
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  24568733 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 24568634  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  24568633 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 24568534  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  24568533 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 24568434  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  24568433 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtgatgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 24568334  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  24568333 tc 24568332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 27461807 - 27461406
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  27461807 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaacatagcttttcttcagtatttgc 27461708  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  27461707 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 27461608  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  27461607 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcagtgcg 27461508  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  27461507 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtgatgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 27461408  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  27461407 tc 27461406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 5299758 - 5300045
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  5299758 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 5299857  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  5299858 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 5299957  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5299958 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttagcagtagatttgtcactcatcttcat 5300045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 24826091 - 24826378
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  24826091 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 24826190  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  24826191 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttattctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 24826290  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  24826291 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 24826378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 42044425 - 42044138
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  42044425 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaatatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 42044326  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  42044325 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 42044226  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  42044225 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 42044138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34773554 - 34773264
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  34773554 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 34773455  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  34773454 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 34773355  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34773354 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatata 34773264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 1120518 - 1120805
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  1120518 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 1120617  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  1120618 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 1120717  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1120718 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 1120805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 14456228 - 14456515
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  14456228 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 14456327  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  14456328 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 14456427  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  14456428 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 14456515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15741614 - 15741327
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  15741614 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 15741515  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  15741514 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 15741415  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  15741414 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcat 15741327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22148161 - 22147874
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  22148161 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 22148062  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  22148061 aatccaaaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 22147962  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||| |||||    
T  22147961 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgtagtagatttgtcactcattttcat 22147874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 27621388 - 27621675
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||  |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  27621388 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaagacaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 27621487  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  27621488 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 27621587  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27621588 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 27621675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 35217148 - 35216861
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  35217148 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 35217049  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| | ||| | || ||    
T  35217048 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactaacatcaaagctt 35216949  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  35216948 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 35216861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 17608707 - 17608306
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  17608707 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 17608608  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  17608607 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 17608508  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |        
T  17608507 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatgtattcagtgcg 17608408  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  17608407 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttct 17608308  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  17608307 tc 17608306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 17720563 - 17720162
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  17720563 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 17720464  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  17720463 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 17720364  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |        
T  17720363 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatgtattcagtgcg 17720264  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  17720263 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttct 17720164  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  17720163 tc 17720162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 27051453 - 27051854
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  27051453 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 27051552  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  27051553 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 27051652  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |        
T  27051653 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatgtattcagtgcg 27051752  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  27051753 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttct 27051852  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  27051853 tc 27051854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 31350179 - 31349778
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  31350179 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 31350080  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  31350079 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 31349980  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |        
T  31349979 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatgtattcagtgcg 31349880  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  31349879 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttct 31349780  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  31349779 tc 31349778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 36689343 - 36688942
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  36689343 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 36689244  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  36689243 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 36689144  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |        
T  36689143 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatgtattcagtgcg 36689044  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  36689043 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttct 36688944  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  36688943 tc 36688942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24809561 - 24809274
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  24809561 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 24809462  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  24809461 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 24809362  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  24809361 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcat 24809274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31420310 - 31420023
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  31420310 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 31420211  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | || |||||| | ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  31420210 aatcaagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 31420111  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31420110 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 31420023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 37739183 - 37739470
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  37739183 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 37739282  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  37739283 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 37739382  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  37739383 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcat 37739470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 246 - 392
Target Start/End: Original strand, 26783140 - 26783286
Alignment:
Q  246 gaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttct 345  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| ||||    
T  26783140 gaagaaaacattgccttagcagtggatttttcagccatcttcatatattatgctttagctatagctttaacaagttctcctctaactgtgtgatgcttct 26783239  T
Q  346 tgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagca 392  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26783240 tgtagagtttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaacagca 26783286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23363741 - 23363468
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  23363741 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 23363642  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |              |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  23363641 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatcct--------------tcatactgatgaactagcatcaaagctt 23363556  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  23363555 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 23363468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 43620510 - 43620797
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||| |||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  43620510 ttcctcgatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 43620609  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | || |||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  43620610 aatctagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 43620709  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| |  || || ||  ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43620710 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggtgcatagtgacacaaacatagctttcgcagtggatttgtcactcatcttcat 43620797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 23698103 - 23698024
Alignment:
Q  324 cctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||    
T  23698103 cctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctaagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttcttc 23698024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 328 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 42044099 - 42044024
Alignment:
Q  328 tgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||    
T  42044099 tgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttcttc 42044024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 1120850 - 1120919
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  1120850 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 1120919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 6977099 - 6977050
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  6977099 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 6977050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 9337247 - 9337198
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  9337247 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 9337198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 14456560 - 14456629
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  14456560 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 14456629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15741262 - 15741213
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  15741262 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 15741213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22147809 - 22147760
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  22147809 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 22147760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22677409 - 22677360
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  22677409 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 22677360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 23297570 - 23297521
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  23297570 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 23297521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 23363403 - 23363354
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  23363403 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 23363354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 24826423 - 24826492
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||| || |  || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  24826423 tgtgatgtttcttataaagcttgttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 24826492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 31834773 - 31834724
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  31834773 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 31834724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 35216796 - 35216747
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  35216796 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 35216747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 36592065 - 36592134
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  36592065 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 36592134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 37739515 - 37739584
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  37739515 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 37739584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 39353789 - 39353740
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  39353789 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 39353740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 39500435 - 39500504
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  39500435 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 39500504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 40391651 - 40391602
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  40391651 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 40391602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 403
Target Start/End: Original strand, 43620831 - 43620911
Alignment:
Q  323 tcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||||||  |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||| | ||||||||    
T  43620831 tcctctgatcttgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtccacagcagctccttcttc 43620911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 27250 - 26849
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27250 ttcctcaatagtagtcacctttggtctccatctagcaggtaggcttctgagtatcttgctcacatgatcagaatctacataacttttcttcagtatttga 27151  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27150 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacagctcatactaatgaacaagcataagagctt 27051  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27050 ttgcttctttgactttcttactgccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgatctagcaatagatttttcactcatcttcatatactctgcttt 26951  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  26950 aggtatagctttgacaagcgctcctctgattatgtgatgcttcttgtagagtttcatctgatcaggagtatgctttctcctatcaatggcagctccttct 26851  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  26850 tc 26849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 4)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 7162 - 7563
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7162 ttcctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcttgctcacaggatcagaagctacatagcttttcttcagtatttga 7261  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  7262 agtccaaaaactagagtctgaaatcttgagtacatttcctcaatactttcatcatcttttattttgaacaactcatactgatcaacaagcatgagagctt 7361  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7362 ttgcttctctaactttcttgctaccttcgtagtttgcacatagagaagcaaacatttccttagcagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 7461  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || | ||||||    
T  7462 aggtatagctttgacaagtgctcctctgatcgtgtgatgcttcttctagagtttcttctgagcagaagtatgttttcttctaccaataacagctccttct 7561  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  7562 tc 7563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34468 - 34181
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || ||||  || |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  34468 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagtttctcagaatctaactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgc 34369  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  34368 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcct 34269  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||||| || || |||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34268 ttgcttctctgacattcttgcttccttcgtaatttgcacagagtgatgcaaacattaccttagcagtggatttatcactcatcttcat 34181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 41841 - 41726
Alignment:
Q  174 tcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatt 273  Q
    |||||||||||||| ||||| | || ||| || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  41841 tcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatt 41742  T
Q  274 tgtcactcatcttcat 289  Q
    ||||||||||||||||    
T  41741 tgtcactcatcttcat 41726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 41661 - 41612
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  41661 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 41612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 103 - 403
Target Start/End: Original strand, 17669 - 17969
Alignment:
Q  103 gtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17669 gtccagaaactagagtttgaaatcttgagtacatttactcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttt 17768  T
Q  203 tgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 302  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17769 tgcttctctgactttcttactaccttcatagttcgcacagagagaagcaaacattgacttagcagaggatttttcactcatcttcatatactctgcttta 17868  T
Q  303 ggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttctt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  17869 ggtatagctttgacaagtgctccactgattgtgtgatgtttcttgtagaacttcttcggagcaggagtatgttttcttctatcaatagaagctccttctt 17968  T
Q  403 c 403  Q
    |    
T  17969 c 17969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 45
Target Start/End: Original strand, 17625 - 17668
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagc 45  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17625 ttcctcaatagaagtcacctttgatctccatcttgcaggtaagc 17668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 403
Target Start/End: Original strand, 1717 - 2101
Alignment:
Q  11 agcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaa 110  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  1717 agcagtaaccttaggtttccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagctcttcttcggtatttgaagtccagaa 1816  T
Q  111 actagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1817 actagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattgtgaacaacttatgctgatgaacaagcataagagcttttgcttctc 1916  T
Q  211 tgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  1917 tgactttcttactaccttcatagttttcatagagaaaagcaaacattgccttagcagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaagtataac 2016  T
Q  311 tttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||         ||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  2017 tttgacaagtgctc--------ttgtgatgcttcttgtggagttttttctgagcaggagtatgtttctttctatcaatagcaactacttcttc 2101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 51)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 28 - 403
Target Start/End: Original strand, 26940937 - 26941312
Alignment:
Q  28 tccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatct 127  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26940937 tccatctagcaggtaagcttcttaatatcttgctcaaatgatctaaagctacatacttgttcttcagtatttgaagttcataaactagagtctgaaatct 26941036  T
Q  128 tgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactacct 227  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26941037 tgagtacatttgctcaatactttcatcctctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcttttgcttctctgactttcttactacct 26941136  T
Q  228 tcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctc 327  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  26941137 tcatagtttgcacagggagaagcaaacattgccttagcaatagatttatcactcatcagcatatactctgctttaggtatagcagtgacaagtgcccctc 26941236  T
Q  328 tgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  26941237 tgattgtgtgatgcttcttgtagagtttcttctgagcaggagtgtgtttccttttatcaatagcagctccttcttc 26941312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 402
Target Start/End: Original strand, 17926294 - 17926691
Alignment:
Q  5 ctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagt 104  Q
    |||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17926294 ctcaatagaagtaaacttaggtctccatctagcaggaaaacttctcaatatcttgctcaaatgatcagaagcaacataacttttcttcagtatttgaagt 17926393  T
Q  105 ccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttg 204  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  ||||    
T  17926394 ccagagactagggtctgaaatcttgagtacatttcctcaatactttcatcatccttcatcttgaataactcatactaatgaataagcataagagcctttg 17926493  T
Q  205 cttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttagg 304  Q
    | ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||  |||||||    |||    
T  17926494 cctctctaaacttcttactaccttcatagtttgcacaaagtgaagcaaacattgcctttgcagtaaatttgtcactcatcttcacgtactctgtgcgagg 17926593  T
Q  305 tatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttctt 402  Q
    |||||     ||||| | |||||| ||  ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| || |||||  || ||||||||||| | |||||||    
T  17926594 tatagaagcaacaagggttcctctcatcttgtgatgcttcttgtaaagtttcttctgagcaggggtgtgtttctttttatcaatagcagctccttctt 17926691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17447286 - 17446991
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| | |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17447286 ttcctcaatagcagtaactttaggtctccatctagcaggtaagcttatcataatcttactcacatgataagaagctacataacttttcttccatatttga 17447187  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||   | |||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  17447186 agtccagagactatagtctgaaatcttgagtacatagcctcaatactttcgtcatttttcttcttgaacaactcatactgatgaacaagcatagtagtct 17447087  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctg 297  Q
    ||| |||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17447086 ttggttctctaaccttcttactaccttcatagtttgcacaaagtgaagcaaacattacctttggagtagatttgtcactcatcttcagatactctg 17446991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 205 - 403
Target Start/End: Original strand, 18434222 - 18434420
Alignment:
Q  205 cttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttagg 304  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18434222 cttctccgactttcttactgccttcatagttagcacagagagaagaaaacattgacctagcagtggatttgtcactcaacttcatatactctactttagg 18434321  T
Q  305 tatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18434322 tatagatttgacaagtgctcctctacttgtgtgatgcttcttgtagaatttcttatgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcagctccttcttc 18434420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 17062890 - 17063180
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17062890 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctcacatgatcagaagcaacataacttttcttcagtatttga 17062989  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17062990 agtccagatactaaggtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacaactcatactgatgatcaagcataagagttt 17063089  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||  | |  ||||| |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||  ||  |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17063090 ttgcttccttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagattgatgcaaacattgctttctcagtggatttatcactcattttcatata 17063180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 11204633 - 11204923
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  11204633 ttcctcaatggcagtcactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgc 11204732  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| | || ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  11204733 agtccagatattaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcatgagtgcct 11204832  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    || ||||| | |  ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11204833 tttcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 11204923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 17610126 - 17609836
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  17610126 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgc 17610027  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  17610026 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcct 17609927  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17609926 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgaagcaaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 17609836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 22385277 - 22385567
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  22385277 ttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatctttctcacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgc 22385376  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |   | ||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  22385377 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcttctatactctcatcacccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgcct 22385476  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22385477 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 22385567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 99 - 328
Target Start/End: Original strand, 19469214 - 19469442
Alignment:
Q  99 tgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagag 198  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19469214 tgaagtccataaactagagtcttaaatcctgagtacatttgctcattactttcatcaacttttattttgaacaactcatactgataaactagcataagag 19469313  T
Q  199 tttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgc 298  Q
     |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19469314 cttttgcttatctaactttcttactaccttcatagtttgcatagagagaagcaaacattgccttagaggtggatttgtcactcatcttcatatactatgc 19469413  T
Q  299 tttaggtatagctttgacaagtgctcctct 328  Q
    |||| |||||||  |||||| |||||||||    
T  19469414 ttta-gtatagcagtgacaaatgctcctct 19469442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 22307462 - 22307752
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||| ||||||| | | | |||||||| || ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  22307462 ttcctcaatggcagttactttgggtgtccatctagaatgcaagcttctcagaatcctgctaacgtgatcagaagcaacataacttttcttcagtatttgc 22307561  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || |    
T  22307562 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacaactcatactgatgaactagaattagtgtct 22307661  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22307662 ttgcttctttaaccttcttgctatcttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 22307752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 27502973 - 27503263
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  27502973 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagaatttgc 27503072  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| | || ||    
T  27503073 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaataattcatactgatgaacaagcatcaaagctt 27503172  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    | || ||| | |  |||||||| |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27503173 tagcctctttcaccttcttactgccttcaaagttggcacatagtgatgcaaacatagcctttgcagtagatttgtcactcatcttcatata 27503263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 25804337 - 25804624
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||| | || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  25804337 ttcctcaatagcaattactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtgacatagctcttcttcagtatttgc 25804436  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| | |   ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |  |    
T  25804437 agtccagatactaaggtttgaaatcttgagtacatctcctatatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgataaactagcataagggcct 25804536  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25804537 ttgcttctctgaccttcttgcttccttcgtagttagcacaaagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 25804624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 12864200 - 12864487
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  12864200 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 12864299  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  12864300 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 12864399  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  12864400 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 12864487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 25984746 - 25985033
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  25984746 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 25984845  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  25984846 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 25984945  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  25984946 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 25985033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 18553958 - 18554248
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  18553958 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcataatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgc 18554057  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| || |  |    
T  18554058 attccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagcttatactgatgaactagcatgagtgcct 18554157  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |   |||| |||||||| |||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18554158 ttgcttctttaaccgtcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgtaaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 18554248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 26034689 - 26035090
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  26034689 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 26034788  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  26034789 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 26034888  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  26034889 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 26034988  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  26034989 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtgatgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 26035088  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  26035089 tc 26035090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9114025 - 9113738
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  9114025 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 9113926  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  9113925 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 9113826  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9113825 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttagcagtagatttgtcactcatcttcat 9113738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 26874071 - 26874358
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || ||  |||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  26874071 ttcctcaatagcagttactttgagtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 26874170  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  26874171 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 26874270  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  26874271 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 26874358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 32963478 - 32963191
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  32963478 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 32963379  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  32963378 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 32963279  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  32963278 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtacatttgtcactcattttcat 32963191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34808694 - 34808407
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  34808694 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttggaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 34808595  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  ||||||||| |||| ||||| | || ||    
T  34808594 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactgtcatcatccttcattctgaaaagttcatactgacgaactagcatcaaagctt 34808495  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  34808494 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 34808407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 3670713 - 3671114
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||     
T  3670713 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttctttagtatttgc 3670812  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  3670813 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 3670912  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  3670913 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 3671012  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  3671013 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcaactccttct 3671112  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  3671113 tc 3671114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 243 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14054779 - 14054619
Alignment:
Q  243 agagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtt 342  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  14054779 agagaagcaaacattgatttagcagtagatttgtcactcatcttcatgtactcagccttaggtataactttgacaagtgcacctctgattgtgtgatgct 14054680  T
Q  343 tcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14054679 tcttgtagagtttcttttgagcaggagtatgacttcttctatcaatagcagctccttcttc 14054619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 12718368 - 12718081
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  12718368 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 12718269  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  12718268 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 12718169  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  12718168 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 12718081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 27383406 - 27383696
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  27383406 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 27383505  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||||||||| | || ||    
T  27383506 aatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaacaagcatcaaagctt 27383605  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  27383606 tagcctctttcaacttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagcctttgcagtagatttttcacccatcttcatata 27383696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 27473790 - 27474080
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  27473790 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 27473889  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||||||||| | || ||    
T  27473890 aatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaacaagcatcaaagctt 27473989  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  27473990 tagcctctttcaacttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagcctttgcagtagatttttcacccatcttcatata 27474080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28253100 - 28252810
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||     
T  28253100 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacatgatcagaagcagcatagcttttctttagaatttgc 28253001  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| | || ||    
T  28253000 aatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaataattcatactgatgaacaagcatcaaagctt 28252901  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28252900 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagcctttgcagtagatttgtcactcatcttcatata 28252810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 27411754 - 27412155
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  27411754 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 27411853  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  27411854 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 27411953  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |        
T  27411954 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatgtattcagtgcg 27412053  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  27412054 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttct 27412153  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  27412154 tc 27412155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 32302578 - 32302177
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  32302578 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 32302479  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  32302478 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 32302379  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |        
T  32302378 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatgtattcagtgcg 32302279  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||     ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    
T  32302278 aggtatagaagccacaataatccctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttct 32302179  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  32302178 tc 32302177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 390
Target Start/End: Original strand, 19874404 - 19874762
Alignment:
Q  24 ggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaa 123  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||| |  ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19874404 ggtctctatctagcaggtaagattctcaaaatctttctcacattatcagaagcaatataacttttcttcaatatttgaagtccatagactagagtctgaa 19874503  T
Q  124 atcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttact 223  Q
    |||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||| |||||||  ||  ||| ||||||| |  ||||||||    
T  19874504 atcttgagtacatagccttaatactttcatcatctttca-cttgaacaactcatagtaatgaagaagcatagtagccttttcttctctaaccttcttact 19874602  T
Q  224 accttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgct 323  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||      ||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| |    |||||   |    
T  19874603 accttcatagtttgcacatagagaggcaaacattg-ctta------gatttgtcactcatcttcagatactctgttcgaggtataacaacaacaagaatt 19874695  T
Q  324 cctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatag 390  Q
    ||| ||||  ||| |||||||||||| |  |||||||||||| ||||||  ||  ||||||||||||    
T  19874696 cctttgatcttgttatgtttcttgtaaagcttcttctgagcaagagtatacttctttctatcaatag 19874762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 16958277 - 16958564
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  16958277 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 16958376  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  16958377 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 16958476  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  16958477 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcat 16958564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 26042864 - 26043155
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  26042864 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 26042963  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  26042964 aatccagaaaccaaagtttgaaatcctgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaacaagcattagagctt 26043063  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgac-ttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    | || ||| | |  ||||| |  |||||| |||| ||||| || ||  ||||||| | | || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26043064 tagcctctttcaccttcttgcggccttcaaagttggcacatagtgacacaaacatagcctttggcagtagatttgtcactcatcttcatata 26043155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20031453 - 20031166
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  20031453 ttcctcaatagtagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgc 20031354  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  20031353 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 20031254  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    | || ||| | |  ||||| || |||||| |||| || || || || |||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20031253 tagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcgcatagtgacgcaaacatagctttcgcagtggatttgtcactcatcttcat 20031166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Original strand, 27351014 - 27351205
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  27351014 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatctgc 27351113  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcat 193  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| |||||    
T  27351114 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcat 27351205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28331849 - 28331658
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||     
T  28331849 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacatgatcagaagcagcatagcttttctttagaatttgc 28331750  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcat 193  Q
    | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  28331749 aatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaataattcatactgatgaacaagcat 28331658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 104
Target Start/End: Original strand, 19448582 - 19448684
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  19448582 ttcctgaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagcgacatagcgtatcttcagtatttga 19448681  T
Q  102 agt 104  Q
    |||    
T  19448682 agt 19448684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 104
Target Start/End: Original strand, 19450576 - 19450678
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  19450576 ttcctgaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagcgacatagcgtatcttcagtatttga 19450675  T
Q  102 agt 104  Q
    |||    
T  19450676 agt 19450678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 150 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25725886 - 25725744
Alignment:
Q  150 tcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaag 249  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||| | |  ||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  25725886 tcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatg 25725787  T
Q  250 caaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  25725786 caaacattgccttagcagtgaatttatcactcatcttcatata 25725744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 13137983 - 13137903
Alignment:
Q  36 gcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactaga 116  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13137983 gcaggtaagcttcttagaatcttgctcacatgatcagaaactgcataacttttcttcagtaattgaagtccagagactaga 13137903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 14054926 - 14054790
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||     
T  14054926 ttcctcaatagcagttacctttggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaattttgctgacatgatcagaagcaacataactctttttcagtatttgt 14054827  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacattt 138  Q
    |||| ||| ||||  || | ||| |||||||||||||    
T  14054826 agtctagagactaaggtttaaaaccttgagtacattt 14054790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 403
Target Start/End: Original strand, 6156933 - 6157212
Alignment:
Q  124 atcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttact 223  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| |   |||| || ||| | |  ||||| ||    
T  6156933 atcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaactagcatcaattttttagcctctttcaccttcttgct 6157032  T
Q  224 accttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgct 323  Q
     || ||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |    ||||||||     ||||         
T  6157033 gccctcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatatattcggtgcgaggtatagaagccacaataatc 6157132  T
Q  324 cctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||| | ||||||||    
T  6157133 cctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctacagcagctccttcttc 6157212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 403
Target Start/End: Original strand, 19469475 - 19469520
Alignment:
Q  358 tctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  19469475 tctgagcaggagtatgttttcttctatcaataacatctccttcttc 19469520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 9113673 - 9113624
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  9113673 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 9113624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 12718016 - 12717967
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  12718016 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 12717967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 12864532 - 12864601
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  12864532 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 12864601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 16958609 - 16958678
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  16958609 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 16958678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 22307794 - 22307863
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||| || ||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  22307794 tgtgatgctttttgtaaagcttcttctgagcaggagtgtgtatccttctatcaatagcagctccttcttc 22307863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 25985078 - 25985147
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  25985078 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 25985147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 403
Target Start/End: Original strand, 26874403 - 26874472
Alignment:
Q  334 tgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  26874403 tgtggtgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 26874472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 32963126 - 32963077
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  32963126 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 32963077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 34808342 - 34808293
Alignment:
Q  354 ttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||    
T  34808342 ttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttcttc 34808293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 403
Target Start/End: Original strand, 27503294 - 27503374
Alignment:
Q  323 tcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||||||| |||| || |||||||| |  || |||||||||||||||||| ||||||| || || ||| | ||||||||    
T  27503294 tcctctgattttgtggtgcttcttgtaaagctttttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatggcagctccttcttc 27503374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 104 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 43325 - 43026
Alignment:
Q  104 tccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttttt 203  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  43325 tccagaaactagagtatgaaaacttgagtacatttgctcaatactttcatcacctttcattttgaacaactcatactgatcaacaagcataagagctttt 43226  T
Q  204 gcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttag 303  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43225 gcttctcttactttcttactaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgatttagcagtagatttgttactcatcttcatatactctgctttag 43126  T
Q  304 gtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  43125 gtatagctttgacaagtgttcctctgattgtgtgatgtttcttgtaaagtttattctgagtaggagtatgttttcttctatcaacaacaactccttcttc 43026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 133 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 99037 - 98767
Alignment:
Q  133 acatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcata 232  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  99037 acattttctcaatactttcatcatctttcattttgaacacctcatactgatgaacaagcataagtgcttttgcttctcagactttcttactaccttcata 98938  T
Q  233 gttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgatt 332  Q
    ||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  98937 gttagcacatagggaaataaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtgtagctttgacaagtgctcctctgatt 98838  T
Q  333 gtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  98837 gtgtgatgcttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcagctccttcttc 98767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 22538 - 22153
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||| || | |||||||  ||||||||||||||     
T  22538 ttccttaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggcaagcttcttagtatcttgctaagatgatcataaacaacataacacttcttcagtatttgt 22439  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22438 agtccagagactaggatttgaaaccttgagtacatttcctcaatagtttcatcatccttcatcttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagctt 22339  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    |||||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22338 ttgcttctctgactttcttgttgccttcatagtttgcacaaagagaagcaaacattgccttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactttgcttt 22239  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaa 387  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22238 aggcatagcagtgacaagtgctcctctgataatatgatgcttcttgtaaattttcttctgagcaggagtatgtttctttctatcaa 22153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 103 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 66917 - 66632
Alignment:
Q  103 gtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  66917 gtccagaaactagagtctgaaatcttgattacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacagttcatactgatgaacaagcataagagcctt 66818  T
Q  203 tgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 302  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  66817 tgcttctctgactttcttacttccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgatctagcagtagatttgtcactcatcttcatataatctgcttta 66718  T
Q  303 ggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaat 388  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  66717 ggtatagctttgacaattgctcctctgattatgtgatgcttcttgtagagtttcttctgattaggagtatgctttctcctatcaat 66632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 166263 - 165977
Alignment:
Q  6 tcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtc 105  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  166263 tcaatggcagtaaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatctttctctcatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtc 166164  T
Q  106 cagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgc 205  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |  |||||    
T  166163 cagatactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatattgatgaactagcataagtgcctttgc 166064  T
Q  206 ttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||| | |  ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  166063 ttctttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagtagtggatttatcactcattttcatata 165977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 66982 - 66917
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatg 67  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  66982 ttcctcaatagcaatcacctttggtctccatctagtaggtcggcttctaagtatcttgctcacatg 66917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 123 - 403
Target Start/End: Original strand, 11243 - 11522
Alignment:
Q  123 aatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttac 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  11243 aatcttgagtacatttggtcaatattttcatcatctttcattttgaacaactcatattaatgaacaagcataagagcttttgcttctcttactttcttac 11342  T
Q  223 taccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgc 322  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11343 taccttcataatttgcacagagagaagcaaacattgacttagcaatagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgc 11442  T
Q  323 tcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  11443 tcctctgattgtgtgatgtttcttgtaaagtttcttctgagca-gagtatgttttcttctatcaacagcagctccttcttc 11522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 1770 - 1391
Alignment:
Q  24 ggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaa 123  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1770 ggtctccatctagcaagtaagcttctcagtatcttactcacatgatcagaagctacatagctcttcttcagtatttgaagttcaaaaactagagtctgaa 1671  T
Q  124 atcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttact 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||||| |||||||||||    
T  1670 atcttgagtacatttgctcaatagtttcatcatctttcattttgaacaactcatacttatgaacaagcataagagcctttgactctctaattttcttact 1571  T
Q  224 accttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgct 323  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||    ||||||| |    
T  1570 accttcatagtttacacagagagaagcaaacattgcctttgcagtagatttgtcactcattatcatatactctgcacgaggtatagcaagaacaagtgat 1471  T
Q  324 cctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||  ||||| ||| |||| | ||||||||    
T  1470 cctttgatcttgtgatgcttcttgtagattttcttccgagcaggagtatttttctttctaccaacagcagctccttcttc 1391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 135 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 310 - 42
Alignment:
Q  135 atttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagt 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  310 atttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacagctcatactaatgaacaagcataagagcctttgcttctctgactttcttgctgccttcatagt 211  T
Q  235 tagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgt 334  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  210 tagcacaaagagaagcaaacattgatctagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaaatgctcttctgattat 111  T
Q  335 gtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  110 gtgatgcttcttgtagagtttcttctgagcaggagtatgctttcttctatcaatagcagctccttcttc 42  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 135 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8170 - 7902
Alignment:
Q  135 atttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagt 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  8170 atttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacagctcatactaatgaacaagcataagagcctttgcttctctgactttcttgctgccttcatagt 8071  T
Q  235 tagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgt 334  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  8070 tagcacaaagagaagcaaacattgatctagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaaatgctcttctgattat 7971  T
Q  335 gtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  7970 gtgatgcttcttgtagagtttcttctgagcaggagtatgctttcttctatcaatagcagctccttcttc 7902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 145 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7181 - 6923
Alignment:
Q  145 tactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagag 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7181 tactttcatcatctttcattttgaacaactcatactaatgagcaagcataagagcttttgcttcccttactttcttactaccttcatagttagcacatag 7082  T
Q  245 agaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttc 344  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  7081 agaagcaaacattgacttaacagtagatttgtcactaatctttatatactctactttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattggatgatgcttc 6982  T
Q  345 ttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6981 ttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcagctccttcttc 6923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 7286 - 7191
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7286 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcagtat 7191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1820 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1820
Description:

Target: scaffold1820; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 134 - 424
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  134 ttcctcaatggcagtcaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatcttgctcacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgc 233  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |   | ||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  234 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcttctatactctcatcatccttcatcttcaacagctcatactgatgaactagcataagtgctt 333  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  334 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcatagagtgaagcaaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2855 - 2568
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  2855 ttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctcacatgattagaagcaacataactcttcttcagtatttgc 2756  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | |||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |    
T  2755 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactcacatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgtct 2656  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2655 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcat 2568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 3989 - 4279
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  3989 ttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgc 4088  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  4089 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcct 4188  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4189 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 4279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1507 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1507
Description:

Target: scaffold1507; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 945 - 655
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||  |||||||| || |||||||||||     
T  945 ttcctcaatagcagttactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagaaacataactcttattcagtatttgc 846  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || |    
T  845 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgattaactagcataagtgtct 746  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  745 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1109 - 821
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  1109 ttcctcaatggcagtcaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatcttactcacatgatcagacgctacataactcttcttcagtatttgc 1010  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||  ||||||||   | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  1009 agtccagatactaaagtttgaaatctt--gtacatttcttctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgcct 912  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| ||||||||    
T  911 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagtagtgtatttatcactcattttcatata 821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 1255 - 1156
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1255 ttcctcaatggcagtcaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatcttactcacatgatcagacgctacatgactcttcttcagtatttga 1156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9330 - 9043
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| | ||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  9330 ttcctcaatggtagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtatttgc 9231  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  9230 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcct 9131  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9130 ttgcttctctgaccttcttgcttccttcgtagtttgcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 9043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2577 - 2312
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgca-ggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttg 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| | | || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2577 ttcctcaatggcagtcacttttggtctccatctagaaaggcaagcttctcagaatcttgctcacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttg 2478  T
Q  101 aagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtt 200  Q
     |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |      
T  2477 cagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcacccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgcc 2378  T
Q  201 tttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagca 266  Q
    ||||||||| | |  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2377 tttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgaagcaaacattgccttagca 2312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 44752 - 44462
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||     
T  44752 ttccttaatggcagtcacttaaggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagtaacataactctttttcattatttgc 44653  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |    
T  44652 agtccagatattaaagtttgaaatcttgagtacatttcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgtct 44553  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    || ||||| | |  ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  44552 tttcttctttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagtagtggatttatcactcattttcatata 44462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 55055 - 54765
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||     
T  55055 ttccttaatggcagtcacttaaggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagtaacataactctttttcattatttgc 54956  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |    
T  54955 agtccagatattaaagtttgaaatcttgagtacatttcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgtct 54856  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    || ||||| | |  ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  54855 tttcttctttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagtagtggatttatcactcattttcatata 54765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 9404 - 9659
Alignment:
Q  40 gtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttg 139  Q
    |||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||     
T  9404 gtaagcttcttataatcttgttcacatgatcataagctaggtaacttttctttaatatttgaagtccagagactagagtctgatatcttgagtacatttc 9503  T
Q  140 cccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagca 239  Q
    | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||  | ||||| |  || ||||||||||||||||| |||    
T  9504 ctcaatacattcatcatctttcatcttgaacaactcatactgatgaacaagaatgatagccttgacctctctaacctttttactaccttcatagtttgca 9603  T
Q  240 -cagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatact 294  Q
      | || |||||||||| || ||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  9604 ttaaagtgaagcaaacaatgtctttgcagtagatttgtcatttatcttcatatact 9659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 23939 - 24226
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  23939 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtgacatagctcttcttcagtatttgc 24038  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  24039 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggcct 24138  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcat 289  Q
    |||||| ||| |  ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24139 ttgcttatctaacattcttgcttccttcgtagttggcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcaatcatcttcat 24226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 387
Target Start/End: Original strand, 75776 - 76148
Alignment:
Q  8 aatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtcca 107  Q
    ||||||||| || ||  |||||||||  |||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  75776 aatagcagtaactttatgtctccatcaagcaggtaagcttatcagaatcttgttcacatgatcataagcaacatagattttcttcagtatttgaagtcaa 75875  T
Q  108 gaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgctt 207  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |    
T  75876 gagactagagtctgaaatcatgagtacatttacttaatactttcatcatc-------ttgaacaactcatactgatgaacaagcgtaagatcctttgcct 75968  T
Q  208 ctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtat 307  Q
    |||  |  ||||| ||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||    
T  75969 ctccaaccttcttgctaccttcaaagtttgcacacaatgaagcaaacattacctttgcagtggatttgtcactcatcttcatatactatgtgcgaggtat 76068  T
Q  308 agctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaa 387  Q
    || |   |||||   |||| | ||  ||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  76069 agatgcaacaaggattcctattatcctgtgatgcttcttgtaaagcttcttctgagcagaagtatgtttctttctatcaa 76148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 38520 - 38119
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  38520 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgc 38421  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||| | || ||    
T  38420 aatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctt 38321  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 301  Q
    | || ||| | | |||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |        
T  38320 tagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcatgtattcggtgcg 38221  T
Q  302 aggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttct 401  Q
    ||||||||     ||||    |||||| ||  ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  38220 aggtatagaagccacaatgattcctcttatcttgtgatgtttcttataaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctatagcagctccttct 38121  T
Q  402 tc 403  Q
    ||    
T  38120 tc 38119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 53300 - 53010
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||     
T  53300 ttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacatgatcagaagcagcatagcttttctttagaatttgc 53201  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| | || ||    
T  53200 aatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaataattcatactgatgaacaagcatcaaagctt 53101  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatata 292  Q
    | || ||| | |  |||||| | |||||| |||| ||||| |  ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53100 tagcctctttcaccttcttaatgccttcaaagttggcacataatgaagcaaacatagcctttgcagtagatttgtcactcatcttcatata 53010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Original strand, 31793 - 32026
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||     
T  31793 ttcctcaatggcagtcactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctaacatgatcagaagcaacataactcttcttcaataattgc 31892  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  31893 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatatcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgcct 31992  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagtt 235  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||||| |||||    
T  31993 ttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagtt 32026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11671 - 11438
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||| | ||||||||| |||| |  ||||| |||||| |||||||     
T  11671 ttcctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggcaagatccttagtatcttgttaacatgatcataagcaaagtaactcttcttcggtatttgt 11572  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| ||||| || |||||  |||||||||| | | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  11571 agtccagacactagggtttgaaacgttgagtacatctcctcaatagtttcatcatccttcatcttgaacaactcatactgatgaacaagcataacaactt 11472  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagtt 235  Q
    ||||||| |||| ||||||  | |||||||||||    
T  11471 ttgcttccctgactttcttgttgccttcatagtt 11438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16344 - 16111
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||| | ||||||||| |||| |  ||||| |||||| |||||||     
T  16344 ttcctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggcaagatccttagtatcttgttaacatgatcataagcaaagtaactcttcttcggtatttgt 16245  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| ||||| || |||||  |||||||||| | | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  16244 agtccagacactagggtttgaaacgttgagtacatctcctcaatagtttcatcatccttcatcttgaacaactcatactgatgaacaagcataacaactt 16145  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagtt 235  Q
    ||||||| |||| ||||||  | |||||||||||    
T  16144 ttgcttccctgactttcttgttgccttcatagtt 16111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 273 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11439 - 11320
Alignment:
Q  273 ttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtat 372  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  11439 ttgtcacttatcttcatatattctgctttaggtataacagtgacaagtgctcctctgatagtatcatgcttcttgtagagtttcttctgagtaggagtgt 11340  T
Q  373 gttttcttctatcaatagca 392  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  11339 gtttctttctatcaatagca 11320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 273 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16112 - 15993
Alignment:
Q  273 ttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtat 372  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  16112 ttgtcacttatcttcatatattctgctttaggtataacagtgacaagtgctcctctgatagtatcatgcttcttgtagagtttcttctgagtaggagtgt 16013  T
Q  373 gttttcttctatcaatagca 392  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  16012 gtttctttctatcaatagca 15993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0925 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0925
Description:

Target: scaffold0925; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 3792 - 3598
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  3792 ttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatctttctcacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgc 3693  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataag 196  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |   | ||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3692 agtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcttctatactctcatcacccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataag 3598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0758
Description:

Target: scaffold0758; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 286
Target Start/End: Original strand, 2858 - 3142
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| | ||| ||||||| || || |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |    
T  2858 ttcctcaatagcagtcactttaggtcaccatttagcacgtaagctccttagaatcttgttcacatgatcaaaaactacataacttttcttcagtatttaa 2957  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||   | ||||    | ||| || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  2958 agtccagatactagagtctaaaaccttaagtacatagtctcaatgtcctgatcctccttcatcctgaacaactcataccgatgaacaagcataatagctt 3057  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatctt 286  Q
    || ||||||||| ||||||  ||||||||||||| |  || |  |||||||||||||  ||| || | ||||| |||||||||||    
T  3058 tttcttctctgactttcttgttaccttcatagtttgttcacaaggaagcaaacattgctttaacaattgatttatcactcatctt 3142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11810 - 11494
Alignment:
Q  87 ttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaa 186  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  11810 ttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatatcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaa 11711  T
Q  187 caagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatctt 286  Q
    | |||||||| |  ||||||||| | |  ||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |    
T  11710 ctagcataagtgcctttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtaatttgcacagagtgaagcaaacattgccttagcagtggatttatcactcactgt 11611  T
Q  287 catatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatca 386  Q
    |||||| || |  | ||||||||     ||||    |||||||||  ||||||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||| |  |||| |||    
T  11610 catatattcagtgtgaggtatagaagcaacaatgattcctctgatcttgtgatgctttttgtatagcttcttctgagcaggagtatgtatctttctgtca 11511  T
Q  387 atagcaaccccttcttc 403  Q
    |||||| | ||||||||    
T  11510 atagcagctccttcttc 11494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6986 - 6728
Alignment:
Q  36 gcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtaca 135  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||| ||  |||||||||  ||||||||||    
T  6986 gcaggtaagcttcttagaatcttgttcacataatcagaagctacataactttccttcagaatctgaagtcaagagaccggagtctgaacccttgagtaca 6887  T
Q  136 tttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgcttctctgattttcttactaccttcatagtt 235  Q
    |  |  ||||   |||||  || |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||  || ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  6886 ta-gttcaatgtcttcattctccttcatcctgaacaactcatactgaagaacaaacatagtagctttagcttatctgattttcttgttaccttcatagtt 6788  T
Q  236 agcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactc 295  Q
     | ||  |  |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6787 tgaactcaaggaagcaaacattgctttagcagttgatttatcactcatcttcaaatactc 6728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 3314 - 3028
Alignment:
Q  2 ttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttga 101  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || |||    
T  3314 ttcctcaatagaagtcaccttaggtctccacttagcaagtaaacttcttagaatcttgttcacatgatcataagctacatagcttttcttcaaaatctga 3215  T
Q  102 agtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagttt 201  Q
    |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||   | ||||   |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||   || ||    
T  3214 agtccaaagactagagtttgaaaccttgagtacatagactcaatgtcttcatcttttttcatcatgaacaactcatactgatgaaccagcatggtagctt 3115  T
Q  202 ttgcttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttca 288  Q
    | |||||| ||| ||||||  | ||||| |||||||  || | ||||||||||||||  || | ||| | ||| |||||||||||||    
T  3114 tagcttctttgactttcttgtttccttcttagttagagcacaaagaagcaaacattgctttcgtagttgttttatcactcatcttca 3028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 190597 - 190317
Alignment:
Q  6 tcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtc 105  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||  |  ||||||| || || || |||||  |||||||||||| | ||||||| ||||||||  | || ||||||     
T  190597 tcaatagttgtcaccttaggtctccacttaacaggtaaactccttagaatcttcttcacatgatcagcaactacatagcttttcttttgaatctgaagtt 190498  T
Q  106 cagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgcccaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttttgc 205  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||     ||||   |||||||||||||||| || |||  ||||| || |||||||||||   ||||||||     
T  190497 cagaaactagattcttaaaccttgagtacatagtttcaatgtcttcatcatctttcattctggacagttcataatgctgaacaagcatggtagtttttgt 190398  T
Q  206 ttctctgattttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatctt 286  Q
    |||||||| ||||||   |||||||||||| | ||| | ||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  190397 ttctctgactttcttgtcaccttcatagtttgaacacaaagaagcaaacattgctttagcagtagatttatcactcttctt 190317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 19939 - 19853
Alignment:
Q  305 tatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcaaccccttcttc 403  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19939 tatagctttcacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttctt------------ctgagcagaagtatgttttcttctatcaataacaactccttcttc 19853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University