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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11052_low_7 (Length: 408)

Name: NF11052_low_7
Description: NF11052
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11052_low_7
NF11052_low_7
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (162-377)||(10086121-10086336)
chr2 (14-161)||(25445070-25445218)
chr2 (14-164)||(25454728-25454879)
chr2 (14-161)||(19437548-19437696)
chr2 (14-161)||(19443123-19443271)
chr2 (14-166)||(43293147-43293302)
chr2 (13-161)||(24053296-24053447)
chr2 (14-161)||(43287402-43287552)
chr2 (14-161)||(24056633-24056782)
chr2 (40-161)||(31437151-31437273)
chr2 (40-161)||(31433045-31433167)
chr2 (40-80)||(8872322-8872362)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (1-166)||(37204230-37204395)
chr8 (1-161)||(37209712-37209872)
chr8 (1-161)||(21241172-21241330)
chr8 (1-161)||(21247676-21247834)
chr8 (1-161)||(27679625-27679783)
chr8 (1-162)||(27683407-27683566)
chr8 (14-161)||(30714226-30714374)
chr8 (14-161)||(30722003-30722151)
chr8 (14-162)||(30727611-30727760)
chr8 (56-161)||(26196896-26197002)
chr8 (8-152)||(24042863-24043004)
chr8 (69-165)||(26196996-26197093)
[»] chr7 (10 HSPs)
chr7 (1-161)||(22822537-22822697)
chr7 (1-161)||(22826840-22827000)
chr7 (14-163)||(29176542-29176692)
chr7 (14-152)||(29185532-29185671)
chr7 (8-166)||(346530-346691)
chr7 (8-161)||(340296-340452)
chr7 (5-161)||(8242541-8242698)
chr7 (5-161)||(8248110-8248267)
chr7 (8-161)||(25830394-25830547)
chr7 (105-166)||(2068826-2068887)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (1-162)||(42404642-42404801)
chr4 (1-161)||(12435347-12435505)
chr4 (1-161)||(42411107-42411265)
chr4 (14-161)||(910858-911005)
chr4 (1-161)||(29333637-29333795)
chr4 (14-161)||(30673710-30673858)
chr4 (14-162)||(30679803-30679952)
chr4 (8-174)||(18889989-18890156)
chr4 (1-161)||(917288-917447)
chr4 (14-162)||(1913742-1913893)
chr4 (14-161)||(23187963-23188111)
chr4 (14-161)||(25687569-25687717)
chr4 (14-161)||(12659200-12659350)
chr4 (14-159)||(25697337-25697483)
chr4 (12-161)||(16325725-16325877)
chr4 (12-161)||(16334769-16334921)
chr4 (14-161)||(1874003-1874151)
chr4 (14-161)||(23200526-23200674)
chr4 (42-159)||(12439331-12439449)
chr4 (42-161)||(12428922-12429042)
chr4 (14-157)||(12665718-12665859)
chr4 (10-161)||(48305348-48305499)
chr4 (7-162)||(55325478-55325636)
chr4 (40-161)||(4393790-4393912)
chr4 (101-161)||(42119835-42119895)
chr4 (38-162)||(33360217-33360342)
chr4 (130-165)||(29330087-29330122)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (1-161)||(38984912-38985070)
chr1 (1-161)||(38991099-38991257)
chr1 (1-161)||(28519275-28519433)
chr1 (1-167)||(28512806-28512968)
chr1 (14-163)||(18540716-18540866)
chr1 (14-161)||(18534990-18535138)
chr1 (14-164)||(27347176-27347329)
chr1 (14-161)||(31092958-31093106)
chr1 (14-161)||(31099564-31099712)
chr1 (14-161)||(11660177-11660325)
chr1 (10-162)||(7876090-7876243)
chr1 (14-162)||(11654019-11654168)
chr1 (14-162)||(35625261-35625412)
chr1 (14-161)||(37356742-37356892)
chr1 (14-161)||(37365160-37365310)
chr1 (14-162)||(38736038-38736189)
chr1 (14-162)||(39492739-39492888)
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (1-161)||(23427482-23427640)
chr6 (1-162)||(23421635-23421794)
chr6 (14-166)||(18738568-18738721)
chr6 (8-163)||(33660896-33661054)
[»] chr3 (12 HSPs)
chr3 (8-161)||(2978240-2978394)
chr3 (8-161)||(2982184-2982338)
chr3 (14-161)||(21453160-21453310)
chr3 (14-161)||(21458334-21458484)
chr3 (8-162)||(21877163-21877320)
chr3 (14-166)||(49491230-49491385)
chr3 (14-161)||(15752508-15752658)
chr3 (14-161)||(15758301-15758451)
chr3 (8-161)||(21883424-21883580)
chr3 (14-162)||(21473103-21473254)
chr3 (14-161)||(49486733-49486883)
chr3 (14-161)||(21477492-21477641)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (14-161)||(14025-14173)
[»] chr5 (9 HSPs)
chr5 (14-161)||(23053390-23053538)
chr5 (14-161)||(23058965-23059113)
chr5 (5-161)||(21171189-21171346)
chr5 (8-161)||(25365397-25365553)
chr5 (14-161)||(35264551-35264699)
chr5 (14-161)||(35270292-35270440)
chr5 (14-161)||(16675564-16675709)
chr5 (14-161)||(39653938-39654086)
chr5 (5-166)||(21178050-21178214)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (14-161)||(111875-112025)
scaffold0014 (105-161)||(106062-106118)
[»] scaffold0591 (1 HSPs)
scaffold0591 (8-161)||(9323-9478)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (12-161)||(57939-58091)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (12-159)||(6287-6435)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 162 - 377
Target Start/End: Original strand, 10086121 - 10086336
Alignment:
Q  162 attttgttattttttataatttatgctttgaacaaaaagttgtttggtagtttagtaaaagacataattcttgtttt-ttatatatcctttgctacatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10086121 attttgttattttttataatttgtgctttgaacaaaaagttgattggtagtttagtaaaagacataattcttgtttttttatatatcctttgctacatgt 10086220  T
Q  261 tttatccaatctaatcacttcctaaatcaaacaaaaaacaaaattgtcccgtttcaatcctctctgttttaacaaatcaaaggtacttcccttcggagat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10086221 tttatccaatctaatcacttcctaaatcaaacaaaatacaaaattgtcccg-ttcaatcctctcttttttaacaaatcaaaggtacttcccttcggggat 10086319  T
Q  361 atccgataaaattgtga 377  Q
    |||||||||||||||||    
T  10086320 atccgataaaattgtga 10086336  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 25445070 - 25445218
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||    
T  25445070 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaattaagcccaataacctagtagtatgg 25445169  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25445170 cccattaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 25445218  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 164
Target Start/End: Original strand, 25454728 - 25454879
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagc-cgagaacctagtagtatgg 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | | |||||||||||||||    
T  25454728 tattcttattcaatgatgtgtgtatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaattaagctcaataacctagtagtatgg 25454827  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaatt 164  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25454828 cccactaacacatttgctatttggacattcactattaatatttataacaatt 25454879  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 19437548 - 19437696
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||    
T  19437548 tattcttattcactaatgtgtgtctcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaattaagcccaataacctagtagtatgg 19437647  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19437648 cccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 19437696  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 19443123 - 19443271
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||    
T  19443123 tattcttattcactaatgtgtgtctcaatgttacaaatgagctctatttataggaaaatagagtagcttatgaattaagcccaataacctagtagtatgg 19443222  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19443223 cccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 19443271  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 43293147 - 43293302
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  43293147 tattcttattcactgatgtgtgtatcccaatgttacaaatgagctctatttataagaaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagtat 43293246  T
Q  111 ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaatttt 166  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  43293247 ggcccaataacacatttgctatttggacatccactattaatgtttataacattttt 43293302  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 161
Target Start/End: Original strand, 24053296 - 24053447
Alignment:
Q  13 atattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagta 109  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||    
T  24053296 atattcttattcactaatgtatgtatctcaatattacaaatgagctctatttataagaaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagta 24053395  T
Q  110 tggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24053396 tggcccaataacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 24053447  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 43287402 - 43287552
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtat 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  43287402 tattcttattcactaatgtgtgtatctcaatgttacaaatgagctctatttataagaaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagtat 43287501  T
Q  111 ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  43287502 ggcccaataacacatttgctatttggacatctactattaatgtttataaca 43287552  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 24056633 - 24056782
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtat 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||    
T  24056633 tattcttattcactaatgtgtgtatctcaatgttacaaatgagctctatttataagaaaatagagtagcttatgaactaagtccaataacctagtagtat 24056732  T
Q  111 ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24056733 gg-ccaataacacatttgctatctggacatccactattaatatttataaca 24056782  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31437273 - 31437151
Alignment:
Q  40 aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggac 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || | |||  |||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||    
T  31437273 aatgttacaaatgaactttatttataggaaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacacagtattatggtccattaactcatttgttgtttggac 31437174  T
Q  139 atccaatattaatatttataaca 161  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  31437173 atccactattaatatttataaca 31437151  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31433167 - 31433045
Alignment:
Q  40 aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagc-cgagaacctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggac 138  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||| | | || ||||| | |||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  31433167 aatgttacaaatgaacattatttatagggaaatagaatatcttatgaactaagctcaataaactagttgcatgctccattaactaatttgctatttggac 31433068  T
Q  139 atccaatattaatatttataaca 161  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  31433067 atccactattaatatttataaca 31433045  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 8872362 - 8872322
Alignment:
Q  40 aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagc 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8872362 aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatatagtagc 8872322  T

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Target: chr8 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 37204395 - 37204230
Alignment:
Q  1 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  37204395 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagcccaaaac 37204296  T
Q  101 ctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaatttt 166  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37204295 ctagtagtatggcccactaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacactttt 37204230  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 37209872 - 37209712
Alignment:
Q  1 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  37209872 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagcccaaaac 37209773  T
Q  101 ctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37209772 ctagtagtatggcccactaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 37209712  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21241330 - 21241172
Alignment:
Q  1 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  21241330 aagaagagagaaatattcttattcacta--gtctgtatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagcccaaaac 21241233  T
Q  101 ctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21241232 ctagtagtatggtccactaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 21241172  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21247834 - 21247676
Alignment:
Q  1 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  21247834 aagaagagagaaatattcttattcacta--gtctgtatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagcccaaaac 21247737  T
Q  101 ctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21247736 ctagtagtatggtccactaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 21247676  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 27679625 - 27679783
Alignment:
Q  1 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  27679625 aagaagagagaaatattcttattcacta--gtccatatcaatgttacaaattagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagcccaaaac 27679722  T
Q  101 ctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679723 ctagtagtatggcccactaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 27679783  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 27683407 - 27683566
Alignment:
Q  1 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || | |||    
T  27683407 aagaagagagaaatattcttattcacta--gtccatatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtaacttatgaactaaacccaaaac 27683504  T
Q  101 ctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaa 162  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27683505 ctagtagtatggcccactaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaa 27683566  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 30714226 - 30714374
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||    
T  30714226 tattcttattcactgatgtgtatatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaattaagcccaataacctagtagtatgg 30714325  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30714326 cccactaacacaattgctatttggacatccactattaatatttataaca 30714374  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 30722003 - 30722151
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||    
T  30722003 tattcttattcactgatgtgtatatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaattaagcccaataacctagtagtatgg 30722102  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30722103 cccactaacacaattgctatttggacatccactattaatatttataaca 30722151  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 162
Target Start/End: Original strand, 30727611 - 30727760
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||    
T  30727611 tattcttattcactgatgtgtatatcaatgttacaaatgagctctatttttaggaaaatatagtagcttatgaattaagcccaataacctagtagtatgg 30727710  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaa 162  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30727711 cccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataacaa 30727760  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 26197002 - 26196896
Alignment:
Q  56 tctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26197002 tctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctattagtatggcccataaacctatttgctatttgaacatccactattaatatt 26196903  T
Q  155 tataaca 161  Q
    |||||||    
T  26196902 tataaca 26196896  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 152
Target Start/End: Original strand, 24042863 - 24043004
Alignment:
Q  8 gagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagta 106  Q
    ||||||||||||||||||    ||||| | | ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || | || ||| ||    
T  24042863 gagaaatattcttattca----tgtgtattttaatgttacatatgagctctatttatagagaaatagagtagcttatgaactaagcccaataatctaata 24042958  T
Q  107 gtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaata 152  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||    
T  24042959 ttatggcccattaacacatttgttatttggacacccacaattaata 24043004  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 165
Target Start/End: Original strand, 26196996 - 26197093
Alignment:
Q  69 aaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaattt 165  Q
    |||||||  |||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||| || |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26196996 aaatagaaaagcttatgaactaagcccaataacctattagtatggcctataaacctatttgctatttggacatccactattaatatttataacaattt 26197093  T

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Target: chr7 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 10)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22822697 - 22822537
Alignment:
Q  1 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22822697 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagcccaaaac 22822598  T
Q  101 ctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22822597 ctagtagtatggcccactaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 22822537  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22827000 - 22826840
Alignment:
Q  1 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22827000 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagcccaaaac 22826901  T
Q  101 ctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22826900 ctagtagtatggcccactaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 22826840  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 29176692 - 29176542
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||     
T  29176692 tattcttattcactaatgtgtgtatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagtatga 29176593  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaat 163  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29176592 cccactaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaat 29176542  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 29185671 - 29185532
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||    
T  29185671 tattcttattcactaatgtgtgtatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagtatgg 29185572  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaata 152  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29185571 cccactaacacattttctatttggacatccaatattaata 29185532  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Original strand, 346530 - 346691
Alignment:
Q  8 gagaaatattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagc-cgagaacctag 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||    
T  346530 gagaaatattcctattcactgatgtgtgtatcccaatgttacaaatgagctctatttataagaaaatagagtagcttatgaactaagctcaataacctag 346629  T
Q  105 tagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaatttt 166  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  346630 tagtatggctcaataacacatttgctatttggacatccgctattaatatttataacaatttt 346691  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Original strand, 340296 - 340452
Alignment:
Q  8 gagaaatattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctag 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||    
T  340296 gagaaatattcctattcactgatgtgtgtatcccaatgttacaaatgagctctatttataagaaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctag 340395  T
Q  105 tagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  340396 tagtatggctcaataacacatttgttatttggacatccgctattaatatttataaca 340452  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8242698 - 8242541
Alignment:
Q  5 agagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aaccta 103  Q
    ||||| || |||||||||||||| |  |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  || |||    
T  8242698 agagaaaagtattcttattcacttagatgtaactcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaattaagcctaataatcta 8242599  T
Q  104 gtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8242598 gtaatatgacccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 8242541  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8248267 - 8248110
Alignment:
Q  5 agagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aaccta 103  Q
    ||||| || |||||||||||||| |  |||   |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |  || |||    
T  8248267 agagaaaagtattcttattcacttagatgtaactcaatgttacaaatgagctctatttataggaaaatagagtagcttatgaattaagcctaataatcta 8248168  T
Q  104 gtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8248167 gtaatatggcccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 8248110  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Original strand, 25830394 - 25830547
Alignment:
Q  8 gagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagta 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||   |||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| || | || ||||||    
T  25830394 gagaagtattcttattcactggtgtgtccctcaatgctacaaaggagctctatttatagggaaatataatagcttatggactaagcccaacaatctagta 25830493  T
Q  107 gtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    | || ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25830494 g-atagcccattaaccaatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 25830547  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 2068826 - 2068887
Alignment:
Q  105 tagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaatttt 166  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2068826 tagtatagcctattaactcatttgctatttggacatccactattaatatttataacagtttt 2068887  T

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Target: chr4 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 42404801 - 42404642
Alignment:
Q  1 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  42404801 aagaagagagaaatattcttattcacta--gtgtgtatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagcccaaaac 42404704  T
Q  101 ctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaa 162  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42404703 ctagtagtatggcccactaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaa 42404642  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 12435347 - 12435505
Alignment:
Q  1 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  12435347 aagaagagagaaatattcttattcacta--gtgtgtatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagcccaaaac 12435444  T
Q  101 ctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12435445 ctagtagtatggcccactaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 12435505  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 42411265 - 42411107
Alignment:
Q  1 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  42411265 aagaagagagaaatattcttattcacta--gtttgtatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagcccaaaac 42411168  T
Q  101 ctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42411167 ctagtagtatggcccactaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 42411107  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 910858 - 911005
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaacctagtagtatggc 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  910858 tattcttattcactgatctgtgtatcaatgttacaaatgagctctatttataggaaaatagagtagcttatgaactaagcccaaaacctagtagtatggc 910957  T
Q  114 ccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  910958 ccactaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 911005  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29333795 - 29333637
Alignment:
Q  1 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||    
T  29333795 aagaagagagaaatattcttattcacta--gtgtgtatcaatgttacaaatgagctttatttatagggaaatagagtaggttatgaactaagcccaaaac 29333698  T
Q  101 ctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29333697 ctagtagtatggcccactaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 29333637  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 30673710 - 30673858
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||    
T  30673710 tattcttattcactaatgtatttatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagtatgg 30673809  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30673810 cccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 30673858  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 162
Target Start/End: Original strand, 30679803 - 30679952
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||    
T  30679803 tattcttattcactaatgtatttatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagtatgg 30679902  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaa 162  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30679903 cccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataacaa 30679952  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18890156 - 18889989
Alignment:
Q  8 gagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagta 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||| ||    
T  18890156 gagaaatattcttattcactaatgtgtatatcaatgttacaaatgagttctatttatagggaaatagagtagcttatgaattaagcccaataacctaata 18890057  T
Q  107 gtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaattttgttatttt 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||    
T  18890056 gtatggcccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataacacttatcttatttt 18889989  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 917288 - 917447
Alignment:
Q  1 aagaagagag-aaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaa 99  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||    
T  917288 aagaagagaggaaatatttttattcacta--gtgtgtatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagcccgaaa 917385  T
Q  100 cctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  917386 cctagtagtatagcccactaacatatttgctatttagacatccaatattaatatttataaca 917447  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 162
Target Start/End: Original strand, 1913742 - 1913893
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |  |||||| ||||||    
T  1913742 tattcttattcactgatgtgtgtatctcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcctatgaattaagcccaataacctaatagtat 1913841  T
Q  111 ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaa 162  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1913842 ggcccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataacaa 1913893  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23188111 - 23187963
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagc-cgagaacctagtagtatgg 112  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||||    
T  23188111 tattcttattcacttatctgtctatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagctcaataaactagtagtatgg 23188012  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23188011 tccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 23187963  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 25687569 - 25687717
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | || ||||||||||||    
T  25687569 tattcttattcactgatctatatatcaatgttacaaatgagctctgtttatagggaaatagagtagcttatgaattaagcccaataaactagtagtatgg 25687668  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25687669 cccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 25687717  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 12659200 - 12659350
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtat 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  12659200 tattcttattcactaatgtgtgtatctcagtgttacaaatgagctctatttataagaaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagtat 12659299  T
Q  111 ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12659300 ggcccaataacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 12659350  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Original strand, 25697337 - 25697483
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | || ||||||||||||    
T  25697337 tattcttattcactgatctatatatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaattaagtccaataaactagtagtatgg 25697436  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataa 159  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25697437 cccactaacacatttgctatttggatatccactattaatatttataa 25697483  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 16325725 - 16325877
Alignment:
Q  12 aatattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagt 108  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  16325725 aatattcttattcaataatgtgtgtatctcaatgttacaaatgagctctatttataagaaaatatagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagt 16325824  T
Q  109 atggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16325825 atggcccaataacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 16325877  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 16334769 - 16334921
Alignment:
Q  12 aatattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagt 108  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  16334769 aatattcttattcaataatgtgtgtatctcaatgttacaaatgagctctatttataagaaaatatagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagt 16334868  T
Q  109 atggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16334869 atggcccaataacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 16334921  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 1874003 - 1874151
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| |||| || | ||| || ||||||||    
T  1874003 tattcttattcactgatgtgtatctcaatgttacaaatgagctatatttatagggaaatagagtagcctatgaattaagcccaataacataatagtatgg 1874102  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1874103 cccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 1874151  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23200674 - 23200526
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtatgg 112  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |  || ||||||||||||    
T  23200674 tattcgtattcgctgatctgtctatcaatgttacaaatgagttctatttatagggaagtagagtaacttatgaactaagcccaataaactagtagtatgg 23200575  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23200574 cccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 23200526  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 159
Target Start/End: Original strand, 12439331 - 12439449
Alignment:
Q  42 tgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacat 140  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  12439331 tgttacaaatgagttctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctattagtatggcccataaacctatttgctatttggacat 12439430  T
Q  141 ccaatattaatatttataa 159  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  12439431 ccactattaatatttataa 12439449  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 161
Target Start/End: Original strand, 12428922 - 12429042
Alignment:
Q  42 tgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacat 140  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||    
T  12428922 tgttacaaatgagttctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctattagtatggcccataaacctatttgctctttggacat 12429021  T
Q  141 ccaatattaatatttataaca 161  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  12429022 ccactattaatatttataaca 12429042  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 12665718 - 12665859
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaacctagtagtatggc 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||     ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12665718 tattcttattcactaatgtgtgtatc-----tacaaatgagctctatttataagaaaatagagtagcttatgaactaagccaataacctagtagtatggc 12665812  T
Q  114 ccattaacacatttgctatttgg---acatccaatattaatatttat 157  Q
    ||| ||||||||||  |||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  12665813 ccaataacacatttattatttggacaacatccactattaatatttat 12665859  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 161
Target Start/End: Original strand, 48305348 - 48305499
Alignment:
Q  10 gaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagc-cgagaacctagtagt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||     | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| | | || ||||| ||    
T  48305348 gaaatattcttattcactgatgtactactgaatgttacaa-tgaactctatttatagggaaatagagtagcatataaactaagctcaataatctagtggt 48305446  T
Q  109 atggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  48305447 atggcccattaacgcgtttgctatttggacatccacttttaatatttataaca 48305499  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 55325636 - 55325478
Alignment:
Q  7 agagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagc-cgagaacctagt 105  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||  | | |||||| |    
T  55325636 agagaagtattattattcactgatgttt-tctcaatgtaacaaatgagctttatttatagggaaataaagtagtttatgaactaagttcaataacctaat 55325538  T
Q  106 agtat---ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaa 162  Q
    |||||   | |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  55325537 agtattatgacccactaacacatttgctatttggacatctattattaatatttataacaa 55325478  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 161
Target Start/End: Original strand, 4393790 - 4393912
Alignment:
Q  40 aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggac 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || |  || ||||||||||| | | ||||| |||||| ||||| |||    
T  4393790 aatgttacaaatgagctttatttatagggaaataaagtagcttatgaattaaacctaataatctagtagtatgactcgttaacccatttgttatttagac 4393889  T
Q  139 atccaatattaatatttataaca 161  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  4393890 atccactattaatatttataaca 4393912  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 161
Target Start/End: Original strand, 42119835 - 42119895
Alignment:
Q  101 ctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42119835 ctagtagtatgacccattaatccatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 42119895  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 162
Target Start/End: Original strand, 33360217 - 33360342
Alignment:
Q  38 tcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagc-cgagaacctagtagtatggcccattaacacatttgctatttgg 136  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| || |||||| | | | ||| || |||||| | | | ||||||||||||||||||     
T  33360217 tcaatgttacgaatgagctctatttataagaaaatagagtagcttataaactaaactcaataacttaatagtatagtcaactaacacatttgctatttgt 33360316  T
Q  137 acatccaatattaatatttataacaa 162  Q
    |||| || | ||||||||||||||||    
T  33360317 acattcactcttaatatttataacaa 33360342  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29330122 - 29330087
Alignment:
Q  130 tatttggacatccaatattaatatttataacaattt 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330122 tatttggacatccaatattaatatttataacaattt 29330087  T

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Target: chr1 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 38985070 - 38984912
Alignment:
Q  1 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  38985070 aagaagagagaaatattcttattcacta--gtgtgtatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagcccaaaac 38984973  T
Q  101 ctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38984972 ctagtagtatggcccactaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 38984912  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 38991257 - 38991099
Alignment:
Q  1 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  38991257 aagaagagagaaatattcttattcacta--gtgtgtatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagcccaaaac 38991160  T
Q  101 ctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38991159 ctagtagtatggcccactaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 38991099  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28519433 - 28519275
Alignment:
Q  1 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  28519433 aagaagagagaaatatttttattcacta--gtgtgtctcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagcccaaaac 28519336  T
Q  101 ctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28519335 ctagtagtatggcccactaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 28519275  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28512968 - 28512806
Alignment:
Q  1 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  28512968 aagaagagagaaatattcttattcacta--gtgtgtctcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagcccaaaac 28512871  T
Q  101 ctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaattttg 167  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28512870 ctagtagtatggcccactaacacatttgc--tttggacatccaatattaatatttataacacttttg 28512806  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Original strand, 18540716 - 18540866
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||    
T  18540716 tattcttattcactgatctgtatatcaatgttacaaatgagctctatttataggaaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagtatgg 18540815  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaat 163  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18540816 cccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataacaat 18540866  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 18534990 - 18535138
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||    
T  18534990 tattcttattcactgatctgtatatcaatgttacaaatgagctctatttataggaaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagtatgg 18535089  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18535090 cccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 18535138  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 164
Target Start/End: Original strand, 27347176 - 27347329
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  27347176 tattcttattcactgatgtgtgtatctcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaattaagcccaataacctagtagtat 27347275  T
Q  111 ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaatt 164  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27347276 ggctcaataacacatttgctatttggacatccactattaatatttataacaatt 27347329  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 31092958 - 31093106
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||    
T  31092958 tatttttattcactgatgtatatatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaattaagcccaataacctagtagtatgg 31093057  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31093058 cccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 31093106  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 31099564 - 31099712
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||    
T  31099564 tatttttattcactgatgtatatatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaattaagcccaataacctagtagtatgg 31099663  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31099664 cccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 31099712  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11660325 - 11660177
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | ||| |||||||||||    
T  11660325 tattcttattcactgatgtgtatatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaattaagcccaataacatagtagtatgg 11660226  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11660225 cccactaacacatttgttacttggacatccactattaatatttataaca 11660177  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7876243 - 7876090
Alignment:
Q  10 gaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagcc-gagaacctagtagt 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  | |||||||||||    
T  7876243 gaaatattcttattcactaatgtgtatctcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatatagtagcttacgaactaagcctaataacctagtagt 7876144  T
Q  109 atggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaa 162  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  7876143 atggtccactaacacatttgttatttggacattcactattaatatttataacaa 7876090  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11654168 - 11654019
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || | ||| ||||||||||     
T  11654168 tattcttattcattgatgtgtatatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagaatagcttatgaattaagcccaataacatagtagtatga 11654069  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaa 162  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11654068 tccactaacacatttgctatttggatatccactattaatatttataacaa 11654019  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 162
Target Start/End: Original strand, 35625261 - 35625412
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtat 110  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||    
T  35625261 tattcttattcaataatgtgtgtatctcaatgttacaaatgagctctatttataagaaaatatagtagcttatgaactaagcccaataatctagtagtat 35625360  T
Q  111 ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaa 162  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35625361 ggcccaataacacatttgctatttggacatccactattaatatttataacaa 35625412  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 37356742 - 37356892
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtat 110  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  37356742 tattcttattcaataatgtgtgtatctcaatgttataaatgagctctatttataagaaaatatagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagtat 37356841  T
Q  111 ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37356842 ggcccaataacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 37356892  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 37365160 - 37365310
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtat 110  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  37365160 tattcttattcaataatgtgtgtatctcaatgttacaaatgagctctatttataagaaaatatagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagtat 37365259  T
Q  111 ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37365260 ggtccaataacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 37365310  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 38736189 - 38736038
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtat 110  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||||    
T  38736189 tattattattcactgatgtatgtatctgaatgttacaaatgaactctatttataagaaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctaatagtat 38736090  T
Q  111 ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaa 162  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38736089 ggcccaataacatattttctatttggacaaccactattaatatttataacaa 38736038  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 39492888 - 39492739
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtatgg 112  Q
    ||||||||||||||||| | | | ||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| | ||  |||||||| |  || ||| ||||||||    
T  39492888 tattcttattcactgatatatatctcactcttacaaatgaattttatttatagagaaatagagtagtttatagactaagcccaataatctattagtatgg 39492789  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaa 162  Q
    | ||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39492788 ctcataaacctatttgctatttggacatccactattaatatttataacaa 39492739  T

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Target: chr6 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23427640 - 23427482
Alignment:
Q  1 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  23427640 aagaagagagaaatattcttattaacta--gtgtgtatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagcccaaaac 23427543  T
Q  101 ctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23427542 ctagtagtatggtccactaacacatttgctatttggacatcaaatattaatatttataaca 23427482  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23421794 - 23421635
Alignment:
Q  1 aagaagagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||    
T  23421794 aagaagagagaaatattcttattaacta--gtgtgtatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtaacttatgaactaagcccaaaac 23421697  T
Q  101 ctagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaa 162  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23421696 ctagtagtatagtccactaacacatttgctatttggacatcaaatattaatatttataacaa 23421635  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18738721 - 18738568
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtatgg 112  Q
    |||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  18738721 tattcttatttactgacgtgtctctcaatgttacaaatgagctctatttataggtaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagtatgg 18738622  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaatttt 166  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18738621 cccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataacaatttt 18738568  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 33660896 - 33661054
Alignment:
Q  8 gagaaatattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctag 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||    
T  33660896 gagaaatattcttattcaccgatgtgtgtatctcaatgttacaaatgaactctatttataagaaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctag 33660995  T
Q  105 tagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaat 163  Q
    || |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33660996 taatatggcccataaacctatttgctatttggacatccactattaatatttataacaat 33661054  T

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Target: chr3 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 12)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Original strand, 2978240 - 2978394
Alignment:
Q  8 gagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagta 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||    
T  2978240 gagaaatattcttattcactgatgtgtatatcaatgttacaaatgagctctatttataggaaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctagta 2978339  T
Q  107 gtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2978340 gtatggcccactaacacatttgttatttggacatccactattaatatttataaca 2978394  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Original strand, 2982184 - 2982338
Alignment:
Q  8 gagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagta 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||    
T  2982184 gagaaatattcttattcacttatgtgtatatcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctagta 2982283  T
Q  107 gtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2982284 gtatagcccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 2982338  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21453310 - 21453160
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  21453310 tattcttattcactgatgtgtgtatcccaatgttacaaatgagctctatttataagaaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagtat 21453211  T
Q  111 ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21453210 ggcccaataacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 21453160  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21458484 - 21458334
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  21458484 tattcttattcactgatgtgtgtatcccaatgttacaaatgagctctatttataagaaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagtat 21458385  T
Q  111 ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21458384 ggcccaataacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 21458334  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21877320 - 21877163
Alignment:
Q  8 gagaaatattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctag 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||    
T  21877320 gagaaatattcctattcactgatgtgtgtatcccaatgttacaaatgagctccatttataagaaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctag 21877221  T
Q  105 tagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaa 162  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21877220 tagtatggcccaataacacatttgctatttggacatccactattaatatttataacaa 21877163  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 49491230 - 49491385
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagc-cgagaacctagtagtat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| | | |||||| ||||||    
T  49491230 tattcttattcactgatgtgtgtatctcaatgttacaaatgagctctatttatagagaaatagagtagcctatgaattaagctcaataacctaatagtat 49491329  T
Q  111 ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaatttt 166  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49491330 ggcccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataacaatttt 49491385  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 15752508 - 15752658
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtat 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  15752508 tattcttattcactaatgtgtgtatctcaatgttacaaatgagctctatttataagaaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagtat 15752607  T
Q  111 ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15752608 ggcccaataacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 15752658  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 15758301 - 15758451
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtat 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  15758301 tattcttattcactaatgtgtgtatctcaatgttacaaatgagctctatttataagaaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagtat 15758400  T
Q  111 ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15758401 ggcccaataacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 15758451  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21883580 - 21883424
Alignment:
Q  8 gagaaatattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctag 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||    
T  21883580 gagaaatattcctattcactgatgtgtgtatcccaatgttacaaatgagctctatttataagaaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctag 21883481  T
Q  105 tagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21883480 tagtatggctcaataacacatttgctatttggacatccgctattaatatttataaca 21883424  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21473254 - 21473103
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| || | || ||| ||||||    
T  21473254 tattcttattcactgatgtgtgtatctcaatgttacaaatgagctctatttataagaaaatagagtagcttatgaactaagtccaataagctaatagtat 21473155  T
Q  111 ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaa 162  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21473154 ggcccaataacacatttgctatttggacatccactattaatatttataacaa 21473103  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 49486733 - 49486883
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagc-cgagaacctagtagtat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| | | |||||| ||||||    
T  49486733 tattcttattcactgatgtgtgtatctcaatgttacaaatgagctctatttatagagaaatagagtagcctatgaattaagctcaataacctaatagtat 49486832  T
Q  111 ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49486833 ggcccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 49486883  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21477641 - 21477492
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtat 110  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||   ||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  21477641 tattcttatttaccgatgtgtgtatctcaatgttacaaatgagccctatttataaaaaaataaagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagtat 21477542  T
Q  111 ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21477541 ggcccaataacacatt-gctatttggacatccactattaatatttataaca 21477492  T

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Target: scaffold0102 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14173 - 14025
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagc-cgagaacctagtagtatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  14173 tattcttattcactgatgtgtctctcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaactaagctcaataacctagtagtatgg 14074  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14073 ctcactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 14025  T

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Target: chr5 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 9)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 23053390 - 23053538
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagc-cgagaacctagtagtatgg 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | | |||||||||||||||    
T  23053390 tattcttattcactaatgtgtgtctcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaattaagctcaataacctagtagtatgg 23053489  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23053490 cccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 23053538  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 23058965 - 23059113
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||    
T  23058965 tattcttattcactaatgtgtgtctcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaattaagcccaataacctagtagtatgg 23059064  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23059065 cccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 23059113  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 161
Target Start/End: Original strand, 21171189 - 21171346
Alignment:
Q  5 agagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaaccta 103  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | ||||||    
T  21171189 agagaaaagtattcttattcacttatgtgtatctcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcttatgaattaagcccaataaccta 21171288  T
Q  104 gtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21171289 gtagtatggcccactaacacatttgccatttggacatccactattaatatttataaca 21171346  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Original strand, 25365397 - 25365553
Alignment:
Q  8 gagaaatattcttattcactgatgtgtgtat--caatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctag 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||    
T  25365397 gagaaatattcttattcactaatgtgtgttttacaatgttacaaatgagctctatttataggaaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctag 25365496  T
Q  105 tagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25365497 tagtatggcccaataacacatttgctatttgaacatccactattaatatttataaca 25365553  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 35264551 - 35264699
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| || | |||||| ||||||||    
T  35264551 tattcttattcactgatgtgtatctcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcctatgaattaagcccaataacctaatagtatgg 35264650  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35264651 cccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 35264699  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 35270292 - 35270440
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| || | |||||| ||||||||    
T  35270292 tattcttattcactgatgtgtatctcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatagagtagcctatgaattaagcccaataacctaatagtatgg 35270391  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35270392 cccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 35270440  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16675709 - 16675564
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgagaacctagtagtatggc 113  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  16675709 tattcttattcacttatgtgtatctcaatgttacaaatgagctctatttatagggaaatatagtagcttatgaattaagcc--caacctagtagtatggc 16675612  T
Q  114 ccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16675611 ccactaacacatttgctatttggacattcactattaatatttataaca 16675564  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 39653938 - 39654086
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||    
T  39653938 tattcttattcactgatgtgtatatcaatgttataaatgagctctatttataaggaaatatagtagcttatgaattaagcccaataacctagtagtatgg 39654037  T
Q  113 cccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39654038 tccactaacacatttgttatttggacatccactattaatatttataaca 39654086  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 166
Target Start/End: Original strand, 21178050 - 21178214
Alignment:
Q  5 agagagaaatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaata--gagtagctaatgaactaagccgag-aacc 101  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||||| |  ||||    
T  21178050 agagaaaagtattcttattcacttatgtgtatctcaatgttacaaatgagctctatttataggaaaatatagagtagcttatgaattaagcccaataacc 21178149  T
Q  102 tagtagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataacaatttt 166  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21178150 tagtagtatggcccactaacacatttgccatttgaacatccactattaatatttataacactttt 21178214  T

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Target: scaffold0014 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 112025 - 111875
Alignment:
Q  14 tattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagtat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |  |||||| ||||||    
T  112025 tattcttattcactgatgtgtgtatctcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagcctatgaattaagcccaataacctaatagtat 111926  T
Q  111 ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  111925 ggcccactaacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 111875  T

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Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 106118 - 106062
Alignment:
Q  105 tagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  106118 tagtatagcccactaacacatttgctatttggacatccgctgttaatatttataaca 106062  T

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Target: scaffold0591 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0591
Description:

Target: scaffold0591; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 9478 - 9323
Alignment:
Q  8 gagaaatattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctag 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||    
T  9478 gagaaatattcttattca-tgatgtgtgtatcccaatgttacaaatgagctctatttataagaaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctag 9380  T
Q  105 tagtatggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9379 tagtatggcccaataatacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 9323  T

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Target: scaffold0079 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 58091 - 57939
Alignment:
Q  12 aatattcttattcactgatgtgtgtatc--aatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaagccgag-aacctagtagt 108  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  58091 aatattcttattcaataatgtgtgtatctcaatgttacaaatgagctctatttataagaaaatatagtagcttatgaactaagcccaataacctagtagt 57992  T
Q  109 atggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataaca 161  Q
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T  57991 atggcccaataacacatttgctatttggacatccactattaatatttataaca 57939  T

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Target: scaffold0258 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Original strand, 6287 - 6435
Alignment:
Q  12 aatattcttattcactgatgtgtgtatcaatgttacaaatgaactctatttatagggaaatagagtagctaatgaactaag-ccgagaacctagtagtat 110  Q
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T  6287 aatattcttattcactgatgcatcactcactgttacaattgagttctatttacagggaaatagagtagcttatgaactaagcccaataacctattcgtat 6386  T
Q  111 ggcccattaacacatttgctatttggacatccaatattaatatttataa 159  Q
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T  6387 agcccataaatttatttgctatttggacatccactgttaatatttataa 6435  T

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