View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11058_low_1 (Length: 1010)

Name: NF11058_low_1
Description: NF11058
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11058_low_1
NF11058_low_1
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (18-1000)||(49274476-49275457)
chr4 (18-210)||(41884925-41885117)
chr4 (17-211)||(31359150-31359345)
chr4 (17-210)||(31354678-31354871)
chr4 (59-211)||(53722006-53722160)
chr4 (33-211)||(8892599-8892779)
chr4 (33-210)||(10317042-10317220)
chr4 (59-211)||(31670089-31670244)
chr4 (59-211)||(44151557-44151715)
chr4 (59-210)||(3770842-3770999)
chr4 (59-210)||(44147023-44147180)
chr4 (54-164)||(53785892-53786004)
chr4 (102-210)||(27186142-27186255)
chr4 (129-212)||(43683739-43683821)
chr4 (897-980)||(49278835-49278932)
chr4 (59-128)||(50627946-50628016)
[»] chr3 (12 HSPs)
chr3 (17-210)||(39399085-39399279)
chr3 (20-166)||(38175751-38175898)
chr3 (54-210)||(9105275-9105433)
chr3 (56-210)||(11004404-11004560)
chr3 (59-211)||(21847108-21847264)
chr3 (59-211)||(21850198-21850354)
chr3 (59-211)||(54171924-54172082)
chr3 (59-211)||(54167344-54167502)
chr3 (102-210)||(9697586-9697697)
chr3 (59-211)||(43547722-43547878)
chr3 (148-211)||(43554291-43554355)
chr3 (33-141)||(755899-756009)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (17-211)||(10504435-10504630)
chr1 (108-210)||(16588532-16588635)
chr1 (59-210)||(39793831-39793984)
chr1 (149-211)||(26316012-26316074)
chr1 (59-211)||(43591825-43591979)
chr1 (149-210)||(26311522-26311583)
chr1 (54-141)||(17459040-17459127)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (17-211)||(10277203-10277398)
chr5 (17-210)||(10274546-10274740)
chr5 (59-210)||(30695293-30695446)
chr5 (59-211)||(7099374-7099532)
chr5 (59-211)||(12023288-12023446)
chr5 (59-211)||(16798668-16798826)
chr5 (59-210)||(7103943-7104100)
chr5 (59-210)||(12018731-12018888)
chr5 (59-210)||(16794108-16794265)
chr5 (64-210)||(32485994-32486143)
chr5 (108-210)||(40371789-40371892)
chr5 (59-190)||(43384972-43385105)
chr5 (33-210)||(19502307-19502487)
chr5 (33-162)||(20830307-20830437)
chr5 (133-211)||(40367680-40367758)
chr5 (33-211)||(26336784-26336965)
chr5 (133-210)||(36632314-36632391)
chr5 (151-211)||(37682035-37682096)
chr5 (151-210)||(37658732-37658792)
chr5 (108-162)||(20808694-20808749)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (19-211)||(35950403-35950596)
chr2 (17-210)||(41093824-41094018)
chr2 (56-210)||(8050839-8050995)
chr2 (59-211)||(8055391-8055545)
chr2 (59-211)||(36670502-36670660)
chr2 (59-211)||(36675050-36675208)
chr2 (59-210)||(12999468-12999622)
chr2 (133-210)||(6463506-6463583)
chr2 (55-141)||(34590284-34590370)
chr2 (113-210)||(13271033-13271131)
chr2 (164-197)||(29767953-29767986)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (21-168)||(6440827-6440975)
chr6 (59-210)||(17096278-17096431)
chr6 (59-211)||(27552114-27552268)
chr6 (59-211)||(8315507-8315662)
chr6 (63-210)||(8320050-8320199)
chr6 (129-213)||(27574803-27574887)
chr6 (59-210)||(17895727-17895881)
chr6 (59-210)||(17779914-17780068)
chr6 (59-210)||(14531791-14531945)
chr6 (132-211)||(17886921-17887001)
chr6 (26-166)||(2933205-2933346)
[»] chr7 (12 HSPs)
chr7 (272-510)||(32132994-32133231)
chr7 (59-211)||(27761396-27761550)
chr7 (58-211)||(35705633-35705789)
chr7 (59-210)||(27756846-27756999)
chr7 (59-211)||(7940083-7940241)
chr7 (59-210)||(7944636-7944793)
chr7 (102-204)||(47419626-47419729)
chr7 (59-210)||(22901154-22901309)
chr7 (54-198)||(13828101-13828248)
chr7 (133-210)||(7466591-7466669)
chr7 (63-198)||(37355573-37355710)
chr7 (59-197)||(733670-733811)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (59-210)||(28644562-28644715)
chr8 (18-92)||(11032659-11032733)
chr8 (59-211)||(43807485-43807641)
chr8 (59-210)||(42234698-42234851)
chr8 (59-210)||(43812044-43812199)
chr8 (56-210)||(30410330-30410486)
chr8 (59-213)||(202202-202362)
chr8 (59-213)||(317039-317199)
chr8 (59-210)||(33071918-33072071)
chr8 (59-211)||(197684-197842)
chr8 (59-211)||(312521-312679)
chr8 (149-210)||(38757003-38757064)
chr8 (116-210)||(41945339-41945433)
chr8 (111-211)||(41949801-41949902)
chr8 (170-211)||(30405920-30405961)
chr8 (23-182)||(27435159-27435314)
chr8 (54-140)||(38007764-38007850)
chr8 (59-92)||(1286739-1286772)
[»] scaffold0440 (2 HSPs)
scaffold0440 (59-211)||(2979-3137)
scaffold0440 (59-211)||(7505-7662)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (59-211)||(44865-45023)
scaffold0044 (59-210)||(49445-49602)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (80-208)||(60171-60302)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 919; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 919; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 1000
Target Start/End: Original strand, 49274476 - 49275457
Alignment:
Q  18 atatgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaactaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49274476 atatgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaactaa 49274575  T
Q  118 cttgtaacaaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacattacaga 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49274576 cttgtaacaaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgatcatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacattacaga 49274675  T
Q  218 cgctagaatgagactaattttattattttctgtcttaaatttcagttggtaattcaactttttctacatgttaaactggcacagattgaaaaattacgat 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49274676 cgttagaatgagactaattttattattttctgtcttaaatttcagttggtaattcaactttttctacatgttaaactggcacagattgaaaaattacgat 49274775  T
Q  318 ctataaataatggcttgcatttcctgatagaatatcatcaccaactgttgagcagttcatattttgcacatcttgcaatgattttggaatcaataaggaa 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49274776 ctataaataatggcttgcatttcctgatagaatatcatcaccaactgttgagcagttcatattttgcacatcttgcaatgattttggaatcaataaggaa 49274875  T
Q  418 acttcttttacaccatcatatgtcatatctcttgattccttttaattgaaaaaccaagaccggcacaaacgtagaaacacaaattatagcatacatctaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49274876 acttcttttacaccatcatatgtcatatctcttgattccttttaattgaaaaaccaagaccggcacaaacgtagaaacacaaattatagcatacatctaa 49274975  T
Q  518 accaacttacaaatatcaggatggctgaaccaatacaccatatatagcgaattcaattaatggaaagtgaaaagttcaatggccttatggccctaactta 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49274976 accaacttacaaatatcaggatggctgaaccaatacaccatatatagcgaattcaattaatggaaagtgaaaagttcaatgggcttatggccctaactta 49275075  T
Q  618 ggacagttaaaaatattcaaaaacaggtaaaaggctgaattttcttcaatcatttagtcacaaagctgcaagtaagatggttatcgaagtttgcaaattt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49275076 ggacagttaaaaatattcaaaaacaggtacaaggctgaattttcttcaatcatttagtcacaaagctgcaagtaagatggttatcgaagtttgcaaattt 49275175  T
Q  718 tacttatgagtttaaagctacatattcatgtcttcttgatttggtacgtacttgcattagtacttgtcaattttataagaaaatttatagttgaattgat 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49275176 tacttatgagtttaaagctacatattcatgtcttcttgatttggtacgtacttgcattagtacttgtcaattttataagaaaatttatagttgaactgat 49275275  T
Q  818 ttaataattacatacaaaacatgannnnnnnnnagtttcaaattaaacatgtaactcactgaaatagtagttagaagcaaatgtacaatcaataatttac 917  Q
    ||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49275276 ttaataattacatacaaaacatga-ttttttttagtttcaaattaaacatgtaactcactgaaagagtagttataagcaaatgtacaatcaataatttac 49275374  T
Q  918 tttcggtaaacttaaacactgctttactaaaatcacaatttacaatgttaggaaagcagatgtttctcaaaggcacgtctctg 1000  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49275375 tttcggtaaacttaaacactgctttactaaaatcacaatttacaatgttaggaaagcagatgttcctcaaaggcacgtctctg 49275457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 41885117 - 41884925
Alignment:
Q  18 atatgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaactaa 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41885117 atatgtacaagagtttagtttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaatcttatgagctaatctctaactaa 41885018  T
Q  118 cttgtaacaaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41885017 cttgtaacaaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaaccaaca 41884925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31359345 - 31359150
Alignment:
Q  17 aatatgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaacta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359345 aatatgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaacta 31359246  T
Q  117 acttgtaac-aaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359245 acttgtaacaaaattcatagcaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattgtgattatcattaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 31359150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31354871 - 31354678
Alignment:
Q  17 aatatgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaacta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  31354871 aatatgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgacgtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatccctaagta 31354772  T
Q  117 acttgtaac-aaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31354771 acttgtaacaaaattcataac-aactgaatctaaatgtgattaaccactaattgtaattatcactaaactaaacttaaattaaaacaaactaaca 31354678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 53722160 - 53722006
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||    
T  53722160 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctagcctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgat 53722061  T
Q  157 taaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53722060 taaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 53722006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 211
Target Start/End: Original strand, 8892599 - 8892779
Alignment:
Q  33 tagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-tt 130  Q
    ||||||||||||| | || | |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  8892599 tagcttatataca-atgtctagttaagttgcttgaagcacaagcgatgtaacaaactctatatcttatttgctaatctctaacaaatttgtaacaaactt 8892697  T
Q  131 cataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892698 cataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 8892779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Original strand, 10317042 - 10317220
Alignment:
Q  33 tagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-tt 130  Q
    ||||||||||||| | || | |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  10317042 tagcttatataca-atgtctagttaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaactt 10317140  T
Q  131 cataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    |||||||||||  | | || ||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10317141 cataacaaactacaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattataactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 10317220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31670244 - 31670089
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    ||||||||||| | |||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || ||||||    
T  31670244 gttgcttgaagcagaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaactgtgat 31670145  T
Q  157 taaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31670144 taaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 31670089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 44151715 - 44151557
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  44151715 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44151616  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44151615 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 44151557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3770999 - 3770842
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  3770999 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 3770900  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3770899 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 3770842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44147180 - 44147023
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  44147180 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44147081  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44147080 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 44147023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 53786004 - 53785892
Alignment:
Q  54 gttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaattcataacaaactgaa--tctaaat 151  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||   ||||||    
T  53786004 gttaggttgcttgaagcacaagctatgtaacaaaccctaactatataagctagtttctaacaaacttgtaacaaattcttaacaaacaaaaacactaaat 53785905  T
Q  152 gtgattaaccact 164  Q
    |||||||||||||    
T  53785904 gtgattaaccact 53785892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27186255 - 27186142
Alignment:
Q  102 gctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaa-ctgaat--ctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaatt 196  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||   | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27186255 gctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaaactaaaaaacaaaatgtgattaatcactaattgtgattatcactaaaactaaacttgaatt 27186156  T
Q  197 aaaacaaactaaca 210  Q
    ||||||||||||||    
T  27186155 aaaacaaactaaca 27186142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 212
Target Start/End: Original strand, 43683739 - 43683821
Alignment:
Q  129 ttcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 212  Q
    ||||||||||||| || | || ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43683739 ttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaataaacttgaattaaaac-aactaacatt 43683821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 897 - 980
Target Start/End: Original strand, 49278835 - 49278932
Alignment:
Q  897 aatgtacaatcaataatttactttcggtaaacttaaaca---ctgctttactaaa-----------atcacaatttacaatgttaggaaagcagatgt 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||| ||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49278835 aatgtacaatcaataatttactttcggtaaccttaaacagttctgctttaataaatattgattaaaatcacaatttacaatgttaggaaagcagatgt 49278932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 128
Target Start/End: Original strand, 50627946 - 50628016
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa 128  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  50627946 gttgcttgaagtacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaa 50628016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 183; Significance: 2e-98; HSPs: 12)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 39399085 - 39399279
Alignment:
Q  17 aatatgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaacta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39399085 aatatgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaacta 39399184  T
Q  117 acttgtaac-aaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39399185 acttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 39399279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 38175751 - 38175898
Alignment:
Q  20 atgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaactaact 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38175751 atgtacaagagtttagcttatatatacaaacttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaatcttatgagctaatctctaactaact 38175850  T
Q  120 tgtaac-aaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38175851 tgtaacaaaattcataacaaactgaaactaaatgtgattaaccactaa 38175898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9105433 - 9105275
Alignment:
Q  54 gttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat 151  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  | ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| || | ||||    
T  9105433 gttaggttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtaacatacttcataacaaactaaagcaaaat 9105334  T
Q  152 gtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9105333 gtgattaatcattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 9105275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 11004404 - 11004560
Alignment:
Q  56 taggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgt 153  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| || || | ||||||    
T  11004404 taggttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaatcttcataacaagctaaaacaaaatgt 11004503  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11004504 gattattcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 11004560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21847264 - 21847108
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || ||||||    
T  21847264 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaactgtgat 21847165  T
Q  157 taaccactaattatgattatcact-aaactaaacttgaatt-aaaacaaactaacat 211  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21847164 taaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaaacaaactaacat 21847108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21850354 - 21850198
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || ||||||    
T  21850354 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaactgtgat 21850255  T
Q  157 taaccactaattatgattatcact-aaactaaacttgaatt-aaaacaaactaacat 211  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21850254 taaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaaacaaactaacat 21850198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Original strand, 54171924 - 54172082
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  54171924 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 54172023  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54172024 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 54172082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Original strand, 54167344 - 54167502
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  | ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  54167344 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacacccttatttggtaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 54167443  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54167444 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 54167502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9697697 - 9697586
Alignment:
Q  102 gctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaat-ctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaa 198  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9697697 gctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaacaaaatgtgattaatcactaattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaa 9697598  T
Q  199 aacaaactaaca 210  Q
    ||||||||||||    
T  9697597 aacaaactaaca 9697586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 43547878 - 43547722
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaat-ctaaatgtga 155  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  | ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||| |    
T  43547878 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaacaaaatgtaa 43547779  T
Q  156 ttaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  43547778 ttaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaagctaacat 43547722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 43554355 - 43554291
Alignment:
Q  148 aaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    |||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43554355 aaatgtgactaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 43554291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 756009 - 755899
Alignment:
Q  33 tagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaacc--ttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-t 129  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||| || ||  ||||||| ||||||||||||| |    
T  756009 tagcttatatacacca-tctagttaggtagcttgaagcacaagcaatgtaacaaaccctaaccttttattagttacactctaacaaacttgtaacaaact 755911  T
Q  130 tcataacaaact 141  Q
    ||| ||||||||    
T  755910 tcaaaacaaact 755899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 180; Significance: 1e-96; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10504630 - 10504435
Alignment:
Q  17 aatatgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaacta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10504630 aatatgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaacta 10504531  T
Q  117 acttgtaac-aaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10504530 acttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaatcactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 10504435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 210
Target Start/End: Original strand, 16588532 - 16588635
Alignment:
Q  108 ctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaact 206  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16588532 ctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccacttattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaact 16588631  T
Q  207 aaca 210  Q
    ||||    
T  16588632 aaca 16588635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39793984 - 39793831
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |  |||| |||    
T  39793984 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgagat 39793885  T
Q  157 taaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39793884 taaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 39793831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26316074 - 26316012
Alignment:
Q  149 aatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26316074 aatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 26316012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Original strand, 43591825 - 43591979
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |  ||||  ||||| ||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||   || || |||    
T  43591825 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagattttatttgctaacctctaacaatattgtaacaaacttcataacaaactaaaataaagtgcgat 43591924  T
Q  157 taaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43591925 taatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 43591979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26311583 - 26311522
Alignment:
Q  149 aatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26311583 aatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 26311522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 141
Target Start/End: Original strand, 17459040 - 17459127
Alignment:
Q  54 gttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaattcataacaaact 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||   || ||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  17459040 gttaggttgcttgaagcacaagctatgtaacaaaccctaactaaataagctattctccaacaaacttgtaactaattcaaaacaaact 17459127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 176; Significance: 3e-94; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10277398 - 10277203
Alignment:
Q  17 aatatgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaacta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10277398 aatatgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttaaaatacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaacta 10277299  T
Q  117 acttgtaac-aaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10277298 acttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 10277203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10274740 - 10274546
Alignment:
Q  17 aatatgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaacta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10274740 aatatgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaaataacaaaccctaaccttatgagctaatctctaacta 10274641  T
Q  117 acttgtaac-aaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10274640 acttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccattaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 10274546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 30695446 - 30695293
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||    
T  30695446 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatatactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgat 30695347  T
Q  157 taaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30695346 taaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 30695293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Original strand, 7099374 - 7099532
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  7099374 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7099473  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7099474 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 7099532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12023446 - 12023288
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  12023446 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 12023347  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12023346 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 12023288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16798826 - 16798668
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  16798826 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 16798727  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16798726 gattaaccacttattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 16798668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Original strand, 7103943 - 7104100
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  7103943 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7104042  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7104043 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7104100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12018888 - 12018731
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  12018888 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 12018789  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12018788 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 12018731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16794265 - 16794108
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  16794265 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 16794166  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16794165 gattaaccacttattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 16794108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 210
Target Start/End: Original strand, 32485994 - 32486143
Alignment:
Q  64 ttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgattaacc 161  Q
    |||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |    
T  32485994 ttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatc 32486093  T
Q  162 actaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    | | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32486094 attgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 32486143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 210
Target Start/End: Original strand, 40371789 - 40371892
Alignment:
Q  108 ctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaact 206  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| || | |||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40371789 ctctaacaaacttgtaacaatcttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatctctgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaact 40371888  T
Q  207 aaca 210  Q
    ||||    
T  40371889 aaca 40371892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43385105 - 43384972
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    ||||||||||| |||| | | ||||||||||||| |  ||||  |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||    
T  43385105 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaaccctagattttatttgctaacttctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaagcaaatgtgat 43385006  T
Q  157 taaccactaattatgattatcactaaactaaact 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43385005 taaccactaattatgattatcactaaactaaact 43384972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19502487 - 19502307
Alignment:
Q  33 tagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-tt 130  Q
    ||||||||||||| | |||| | || ||||||||||| |||| | | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  19502487 tagcttatataca-atgtttagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctatatcttattttctaacctctaacaaacttgtaacaaactt 19502389  T
Q  131 cataacaaactgaatctaaatgtgatt-aaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||||||||||| || | |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19502388 cataacaaactaaaacaaaatgtgatttaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttaaattaaaacaaactaaca 19502307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Original strand, 20830307 - 20830437
Alignment:
Q  33 tagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-tt 130  Q
    ||||||||||||| | || | |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||  | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  20830307 tagcttatataca-atgtctagttaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaacacttgatcttatttgctaatctctaacaaacttgtaacaaactt 20830405  T
Q  131 cataacaaactgaatctaaatgtgattaacca 162  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20830406 cataacaaactgaaactaaatgtgattaacca 20830437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 211
Target Start/End: Original strand, 40367680 - 40367758
Alignment:
Q  133 taacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40367680 taacaaactaaaacaaaatgtgattaatctctgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 40367758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 211
Target Start/End: Original strand, 26336784 - 26336965
Alignment:
Q  33 tagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaat-t 130  Q
    ||||||||||||| | || | |||| ||||||||||| |||| | | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||| |||||||||  |    
T  26336784 tagcttatataca-atgtctagttaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaacatgtaacaaacat 26336882  T
Q  131 cataacaaactgaat-ctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaact-aaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26336883 cataacaaactaaaaacaaaatgtgattaatcaccgattgtgattatcactaaaattaaacttgaattaaaacaaactaacat 26336965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 36632391 - 36632314
Alignment:
Q  133 taacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||||||||| || | || ||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36632391 taacaaactaaaacaaagtgtgattattcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 36632314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 37682096 - 37682035
Alignment:
Q  151 tgtgattaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682096 tgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 37682035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37658792 - 37658732
Alignment:
Q  151 tgtgattaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37658792 tgtgattaaccactgattatgattatgactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 37658732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 162
Target Start/End: Original strand, 20808694 - 20808749
Alignment:
Q  108 ctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgattaacca 162  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20808694 ctctaacaaacttgtaactaacttcataacaaactgaaactaaatgtgattaacca 20808749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 174; Significance: 4e-93; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 211
Target Start/End: Original strand, 35950403 - 35950596
Alignment:
Q  19 tatgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaactaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35950403 tatgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttacgagctaatctctaactaac 35950502  T
Q  119 ttgtaac-aaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35950503 ttgtaacaaaattcataacaaactgaacctaaatgtgattaaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 35950596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 41094018 - 41093824
Alignment:
Q  17 aatatgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaacta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41094018 aatatgtacaagagtttagcttatatacacaaacttgattaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaacta 41093919  T
Q  117 acttgtaac-aaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  41093918 atttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatatgattaatcactaattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaaccaaca 41093824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8050995 - 8050839
Alignment:
Q  56 taggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgt 153  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||    |||||    
T  8050995 taggttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaatagaatgt 8050896  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050895 gattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 8050839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8055545 - 8055391
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||    ||||||||    
T  8055545 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgcaacaaacttcataacaaactaaaatagaatgtgat 8055446  T
Q  157 taaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055445 taaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 8055391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 36670660 - 36670502
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  36670660 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 36670561  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36670560 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 36670502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 36675208 - 36675050
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  36675208 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 36675109  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36675108 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 36675050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Original strand, 12999468 - 12999622
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    ||||||||||| |||||  | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||    
T  12999468 gttgcttgaagcacaagtaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgat 12999567  T
Q  157 taaccactaattatgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12999568 taaccactgattgttattatcactaaaactaaacttaaattaaaacaaactaaca 12999622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 210
Target Start/End: Original strand, 6463506 - 6463583
Alignment:
Q  133 taacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6463506 taacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaagacaaactaaca 6463583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 34590370 - 34590284
Alignment:
Q  55 ttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaattcataacaaact 141  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34590370 ttaggttgcttaaagcacaagctatataacaaaccctaactctatatgctaatctctaacaaacttgtaacaaattcataacaaact 34590284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 210
Target Start/End: Original strand, 13271033 - 13271131
Alignment:
Q  113 actaacttgtaacaaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    |||||| | ||||||| | |||||||||| ||   || ||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13271033 actaacctctaacaaacttataacaaactaaaataaagtgtaattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 13271131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29767986 - 29767953
Alignment:
Q  164 taattatgattatcactaaactaaacttgaatta 197  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29767986 taatcatgattatcactaaactaaacttgaatta 29767953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Original strand, 6440827 - 6440975
Alignment:
Q  21 tgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaactaactt 120  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6440827 tgtactagattttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaactaactt 6440926  T
Q  121 gtaac-aaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaatt 168  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6440927 gtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaatt 6440975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Original strand, 17096278 - 17096431
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||  || | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||    
T  17096278 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactatagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgat 17096377  T
Q  157 taaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17096378 taatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 17096431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Original strand, 27552114 - 27552268
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  |||||  | |||| ||| ||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||    
T  27552114 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacgtttaacaaacctgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgat 27552213  T
Q  157 taaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27552214 taaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 27552268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Original strand, 8315507 - 8315662
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gtga 155  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||||    
T  8315507 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtga 8315606  T
Q  156 ttaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8315607 ttaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 8315662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 210
Target Start/End: Original strand, 8320050 - 8320199
Alignment:
Q  63 cttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgattaac 160  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |  | ||||||||||    
T  8320050 cttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacatattgtgattaac 8320149  T
Q  161 cactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8320150 cactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 8320199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 213
Target Start/End: Original strand, 27574803 - 27574887
Alignment:
Q  129 ttcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatta 213  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27574803 ttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatta 27574887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Original strand, 17895727 - 17895881
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||  ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||   |||||||||    
T  17895727 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaattctagatcttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcagaacaaactaaaataaaatgtgat 17895826  T
Q  157 taaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17895827 taatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 17895881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17780068 - 17779914
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac-cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||  |||||   |||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || | |||||||||    
T  17780068 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaaatcttatctactagcctctaacaaacttttaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgat 17779969  T
Q  157 taaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaatt-aaaacaaactaaca 210  Q
    ||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17779968 taatctctgattgtgattatcactaaactaaacttgaattcaaaacaaactaaca 17779914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Original strand, 14531791 - 14531945
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    ||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||| || | |||||||||    
T  14531791 gttgcttcaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaacctgtaacaaacttcataacgaactaaaacaaaatgtgat 14531890  T
Q  157 taaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||| || | ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14531891 taatcattgattgtgattataactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 14531945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 211
Target Start/End: Original strand, 17886921 - 17887001
Alignment:
Q  132 ataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    |||||||||| || | |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17886921 ataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 17887001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 2933346 - 2933205
Alignment:
Q  26 aagagtttagcttatatac-acaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaactaacttgtaa 124  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  || ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||| | ||| | ||| || |||||||||    
T  2933346 aagagtttagcttatatactagaa--ttagttagattgcttgaagcacaagctatgtaacaaaccttaactctataaactagtttcttacaaacttgtaa 2933249  T
Q  125 caaattcataacaaactgaa--tctaaatgtgattaaccactaa 166  Q
    ||||||||||||||||  ||   || ||||||||||||||||||    
T  2933248 caaattcataacaaacacaaacacttaatgtgattaaccactaa 2933205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 107; Significance: 4e-53; HSPs: 12)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 272 - 510
Target Start/End: Original strand, 32132994 - 32133231
Alignment:
Q  272 caactttttctacatgttaaactggcacagattgaaaaattacgatctataaataatggcttgcatttcctgatagaatatcatcaccaactgttgagca 371  Q
    |||||||||||| ||  |||| | ||||  ||||||||| ||| ||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32132994 caactttttctatattataaattagcacgaattgaaaaactactatctacaaagaatggcttacatttcttgatagaatatcatcaccaagtgttgagca 32133093  T
Q  372 gttcatattttgcacatcttgcaatgattttggaatcaataaggaaacttcttttacaccatcatatgtcatatctcttgattccttttaattgaaaaac 471  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |    
T  32133094 attcatattgtgcacatcttgtaatgattttggaatcgataaggaagcattttctacaccatcatatgtcatatctcttgatttc-tgtaattgaaaatc 32133192  T
Q  472 caagaccggcacaaacgtagaaacacaaattatagcata 510  Q
    | ||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||    
T  32133193 ccagacctgcacaaacgtacaaagactaattataacata 32133231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27761550 - 27761396
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   | || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |  ||||||||    
T  27761550 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctacaaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgtgat 27761451  T
Q  157 taaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27761450 taaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 27761396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 35705789 - 35705633
Alignment:
Q  58 ggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaattc-ataa-caaactgaatctaaatgtg 154  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| |||||| || | |||||||    
T  35705789 ggttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaactccataaacaaactaaaacaaaatgtg 35705690  T
Q  155 attaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35705689 attaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 35705633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27756999 - 27756846
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   | || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |  |||| |||    
T  27756999 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctacaaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgcgat 27756900  T
Q  157 taaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27756899 taaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 27756846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Original strand, 7940083 - 7940241
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  7940083 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7940182  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940183 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 7940241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Original strand, 7944636 - 7944793
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  7944636 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7944735  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7944736 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7944793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 204
Target Start/End: Original strand, 47419626 - 47419729
Alignment:
Q  102 gctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaa 200  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47419626 gctaacctctaagaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaa 47419725  T
Q  201 caaa 204  Q
    ||||    
T  47419726 caaa 47419729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22901309 - 22901154
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gtga 155  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||||    
T  22901309 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtga 22901210  T
Q  156 ttaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22901209 ttaaccactgattgtgattatcactaaaactaaactttaattaaaacaaactaaca 22901154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 198
Target Start/End: Original strand, 13828101 - 13828248
Alignment:
Q  54 gttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaacc-ttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat 151  Q
    ||||||| |||||||| |||||| | |||||| ||||||||  |||| || ||  ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  |||  ||||    
T  13828101 gttaggtagcttgaagcacaagcaatgtaacagaccctaactattattagatacactctaacaaacttgtaacaaacttcagaacaaacaaaatgaaaat 13828200  T
Q  152 gtgattaacca-ctaattatgattatcactaaactaaacttgaattaa 198  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13828201 gtgattaaccaactaaacatgattatcactaaggtaaacttgaattaa 13828248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 210
Target Start/End: Original strand, 7466591 - 7466669
Alignment:
Q  133 taacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7466591 taacaaactaaaacaaaatgtgattaatcattgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7466669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 37355710 - 37355573
Alignment:
Q  63 cttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaacct-tatgagctaatctctaactaacttgtaacaaatt-cataacaaactgaatcta-aatgtgattaa 159  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||   ||  |||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| || | | ||| |||||||    
T  37355710 cttgaagtacaagtaaagtaacaaaccctaacaaatacaagctaatctctaagaaacttgtaacaactttcataacaaactaaagcaataatatgattaa 37355611  T
Q  160 ccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaa 198  Q
    ||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  37355610 ccactaagtgtgattatcact-aggtaaacttgaattaa 37355573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 197
Target Start/End: Original strand, 733670 - 733811
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaatt-cataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    |||||| |||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| | |  | |||||||    
T  733670 gttgctcgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaaattgtaacaaatttcataacaaactaactgaatatgtgat 733769  T
Q  157 taaccact-aattatgattatcactaaactaaacttgaatta 197  Q
    |||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  733770 taaccatttaaacatgattatcactaatctaaacttgaatta 733811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28644715 - 28644562
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||    
T  28644715 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgat 28644616  T
Q  157 taaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28644615 taaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 28644562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 11032733 - 11032659
Alignment:
Q  18 atatgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032733 atatgtacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta 11032659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Original strand, 43807485 - 43807641
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtg 154  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |  ||||||    
T  43807485 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgtg 43807584  T
Q  155 attaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43807585 attaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaagctaacat 43807641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Original strand, 42234698 - 42234851
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || ||||||    
T  42234698 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgat 42234797  T
Q  157 taaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42234798 taatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 42234851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Original strand, 43812044 - 43812199
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtg 154  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |  ||||||    
T  43812044 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgtg 43812143  T
Q  155 attaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43812144 attaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaagctaaca 43812199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 30410330 - 30410486
Alignment:
Q  56 taggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgt 153  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || |  |||||    
T  30410330 taggttgcttgaagtacaagcaatgtaacaaaatctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaattaaaacagaatgt 30410429  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30410430 gattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 30410486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 59 - 213
Target Start/End: Original strand, 202202 - 202362
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  202202 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 202301  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacatta 213  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  202302 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatta 202362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 59 - 213
Target Start/End: Original strand, 317039 - 317199
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  317039 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 317138  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacatta 213  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  317139 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatta 317199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33072071 - 33071918
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 156  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||   || ||||||    
T  33072071 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctccaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaagaaagtgtgat 33071972  T
Q  157 taaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33071971 taatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 33071918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Original strand, 197684 - 197842
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  197684 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 197783  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  197784 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 197842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Original strand, 312521 - 312679
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  312521 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 312620  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  312621 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 312679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38757064 - 38757003
Alignment:
Q  149 aatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38757064 aatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 38757003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 41945433 - 41945339
Alignment:
Q  116 aacttgtaacaaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    |||||||||| || |  ||||||||| || | || ||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41945433 aacttgtaaccaacttgtaacaaactaaaacaaagtgtgattaatcattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 41945339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 41949902 - 41949801
Alignment:
Q  111 taactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaac 209  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||| || |  | ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41949902 taaccaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacagagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaagcttgaattaaaagaaactaac 41949803  T
Q  210 at 211  Q
    ||    
T  41949802 at 41949801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 211
Target Start/End: Original strand, 30405920 - 30405961
Alignment:
Q  170 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30405920 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 30405961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 182
Target Start/End: Original strand, 27435159 - 27435314
Alignment:
Q  23 tacaagagtttagcttatatacacaagtttggttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaactaacttgt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||  | | |  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||      | |||||||    
T  27435159 tacaagagtttagcttatatacaata-tctacttaggttgcttgaagcacaagctatgtaacaaaccctaactctatgtgctaat------caaacttgt 27435251  T
Q  123 aaca--aattcataacaaactgaatcta-aatgtgattaaccactaattatgattatcactaa 182  Q
    ||||  || |||||||||||| || | | |||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  27435252 aacaataactcataacaaactaaaacaataatgtgattaaccactaagtgagattatcactaa 27435314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 140
Target Start/End: Original strand, 38007764 - 38007850
Alignment:
Q  54 gttaggttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaaccttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaattcataacaaac 140  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| ||| |  || | ||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  38007764 gttaggttgcttgaagcataagctatgtaacaaacactaaccatataaattagtttctgacaaacttgtaactaattcataacaaac 38007850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 1286772 - 1286739
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1286772 gttgcttgaagtacaagcaaagtaacaaacccta 1286739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 65; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3137 - 2979
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  3137 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 3038  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3037 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 2979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7662 - 7505
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtg 154  Q
    ||||||||||  |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || ||||    
T  7662 gttgcttgaaacacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaattgtg 7563  T
Q  155 attaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7562 attaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 7505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 65; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Original strand, 44865 - 45023
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  44865 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44964  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 211  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44965 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 45023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Original strand, 49445 - 49602
Alignment:
Q  59 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaaccctaac---cttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gt 153  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||    
T  49445 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 49544  T
Q  154 gattaaccactaattatgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 210  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49545 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 49602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 208
Target Start/End: Original strand, 60171 - 60302
Alignment:
Q  80 gtaacaaaccctaac-cttatgagctaatctctaactaacttgtaac-aaattcataacaaact-gaatctaaatgtgattaaccactaattatgattat 176  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  60171 gtaacaaaccctgactcttatgagctaatttctaacaaactggtaacaaaatttataacaaactaaaaattaaatgtgattaatcactaattgtgattat 60270  T
Q  177 cactaaactaaacttgaattaaaacaaactaa 208  Q
      |  ||   ||||||||||||||||||||||    
T  60271 atcacaaagtaacttgaattaaaacaaactaa 60302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University