View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11061_high_2 (Length: 659)

Name: NF11061_high_2
Description: NF11061
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11061_high_2
NF11061_high_2
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (19-649)||(16661927-16662557)
chr2 (31-648)||(16657453-16658070)
chr2 (29-624)||(14703021-14703616)
chr2 (80-641)||(12234354-12234914)
chr2 (27-626)||(7541837-7542436)
chr2 (23-648)||(43625019-43625644)
chr2 (27-624)||(12258541-12259138)
chr2 (31-641)||(12245349-12245959)
chr2 (31-641)||(11999023-11999619)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (23-639)||(30774859-30775475)
chr4 (23-639)||(9335836-9336452)
chr4 (31-334)||(35132071-35132375)
chr4 (422-625)||(35132454-35132657)
chr4 (70-147)||(23597022-23597099)
chr4 (60-147)||(23588170-23588257)
chr4 (74-147)||(54396081-54396154)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (23-644)||(8585646-8586267)
chr7 (23-499)||(8616285-8616764)
chr7 (23-648)||(10494310-10494935)
chr7 (31-624)||(27830835-27831428)
chr7 (27-639)||(8658974-8659586)
chr7 (27-630)||(6789123-6789726)
chr7 (23-626)||(8667026-8667629)
chr7 (29-647)||(8654063-8654681)
chr7 (31-624)||(17267554-17268147)
chr7 (492-639)||(8628608-8628755)
chr7 (31-624)||(17259856-17260449)
chr7 (227-641)||(13333399-13333813)
chr7 (18-624)||(3146866-3147472)
chr7 (23-627)||(8545240-8545844)
chr7 (27-648)||(1301072-1301692)
chr7 (410-606)||(8646871-8647067)
chr7 (454-627)||(8559371-8559544)
chr7 (31-144)||(8575941-8576054)
chr7 (383-627)||(8570278-8570522)
chr7 (383-614)||(8590605-8590836)
chr7 (493-627)||(8636300-8636434)
chr7 (23-213)||(29578043-29578233)
chr7 (479-627)||(8602037-8602185)
chr7 (40-144)||(29582281-29582385)
chr7 (23-209)||(8609524-8609710)
chr7 (35-124)||(27846566-27846655)
chr7 (383-611)||(7877706-7877934)
chr7 (383-643)||(8576293-8576553)
chr7 (455-614)||(29581811-29581970)
chr7 (479-627)||(8382833-8382981)
chr7 (34-138)||(8581318-8581422)
chr7 (23-120)||(8537643-8537740)
chr7 (449-614)||(29577642-29577807)
chr7 (476-627)||(8609977-8610128)
chr7 (60-210)||(8102311-8102461)
chr7 (23-117)||(13333835-13333929)
chr7 (478-627)||(8581762-8581911)
chr7 (29-214)||(8590251-8590436)
chr7 (31-144)||(8646492-8646605)
chr7 (83-209)||(8636718-8636844)
chr7 (31-214)||(7878103-7878286)
chr7 (23-138)||(8569918-8570033)
chr7 (500-614)||(8538120-8538234)
chr7 (74-147)||(8017850-8017923)
chr7 (70-290)||(8383170-8383390)
chr7 (60-135)||(39985290-39985365)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (23-626)||(34466751-34467349)
chr1 (31-639)||(15594649-15595257)
chr1 (23-626)||(4678516-4679118)
chr1 (27-135)||(52549395-52549503)
chr1 (244-304)||(52549292-52549352)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (18-543)||(43744418-43744943)
chr8 (53-621)||(12528141-12528709)
chr8 (566-628)||(43744999-43745061)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (27-536)||(28219529-28220038)
chr5 (575-626)||(28220110-28220161)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (484-599)||(28910650-28910765)
chr6 (473-547)||(11133051-11133125)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 627; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 627; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 16662557 - 16661927
Alignment:
Q  19 aacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16662557 aacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatg 16662458  T
Q  119 ctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacacccc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16662457 ctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacacccc 16662358  T
Q  219 ccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtga 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16662357 ccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggcccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtga 16662258  T
Q  319 tgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaac 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16662257 tgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaac 16662158  T
Q  419 ctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16662157 ctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccc 16662058  T
Q  519 cgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaa 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16662057 cgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaa 16661958  T
Q  619 aatatttctttcaccatcacaattacttctt 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16661957 aatatttctttcaccatcacaattacttctt 16661927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 16658070 - 16657453
Alignment:
Q  31 caccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaac 130  Q
    |||||| | ||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||     
T  16658070 caccaaatctgggacattcttaaagccttcactcaaaatagcagcttgaacagctgcaccgtaagcaacagcttcatccgggttgatacttttgcataaa 16657971  T
Q  131 tccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatct 230  Q
    ||||| || ||||| ||||   ||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||  | | | ||  ||| |||||    
T  16657970 tccttgcccttgaaaaagtcttgcaatagatcctgcactttgggaatcctagatgagccacccacaagaacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatct 16657871  T
Q  231 ttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtc 330  Q
    |||||||   || |||| |||||||| | ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||    
T  16657870 ttgaatcacgaagacaattctcaacagttttcatacactcattgaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtc 16657771  T
Q  331 aatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggct 430  Q
    |||  |||   ||||| |||| | ||||| || |||||| ||    |||||||||||||| || ||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16657770 aattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggct 16657671  T
Q  431 cttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgt 530  Q
    ||||  |||| | | || ||||| || |||||| | | ||| || |  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16657670 cttgagttcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgt 16657571  T
Q  531 ttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttc 630  Q
    |||| | ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||     
T  16657570 ttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgttt 16657471  T
Q  631 accatcacaattacttct 648  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  16657470 accatcacaatcacttct 16657453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 624
Target Start/End: Original strand, 14703021 - 14703616
Alignment:
Q  29 agcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcaca 128  Q
    |||||||| || ||||||| ||| | | |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  14703021 agcaccaacttcggaacattcttgacgtcttcactcaacaaagcagcctgaacagctgccccataagctacagcttcatcagggttaatgctgttgcaca 14703120  T
Q  129 actccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccat 228  Q
    |||||||||| | ||| ||||   | ||||||| ||| ||||| ||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| ||| |  | |||||||||    
T  14703121 actccttcccctggaaaaagtcctgtaataattgctgtactttgggaatccgagaagacccaccgacaagaacaacatcatctactctactcttgtccat 14703220  T
Q  229 ctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaag 328  Q
    ||| | ||| | || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | | | |||  |||| ||| |||    
T  14703221 cttagcatcaataagacaactctcaacaatcttcacacactcattaaaaaagtccatattcatttcttcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaag 14703320  T
Q  329 tcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaagg 428  Q
    ||||||   |   |||||  ||| | |||||||| || ||| | || |||||| ||||| ||||| ||| | || ||||  |||||||| ||||| ||||    
T  14703321 tcaatgcattgaaataaagcatctacctcaatagtggcgacaacttggaaagaaagtgttctttttgccctctcgcaagcggttctcaagctccttaagg 14703420  T
Q  429 ctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagt 528  Q
    || ||||||| | | | || |||| | |||| || || || || ||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14703421 cttttggatttccactaatgtccaatctgttttttctcttgaactcttgaacaaagtagttcaccattctgttatcgaagtcctctcccccgaggtgagt 14703520  T
Q  529 gtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatt 624  Q
    |||||||| ||| || |||| ||  |||||    || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14703521 gtttccagcagtagccttaatttggaagacggtgcccttaattgttaggagagacacgtcaaaagtaccaccaccaagatcaaagacaaatatatt 14703616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 80 - 641
Target Start/End: Original strand, 12234354 - 12234914
Alignment:
Q  80 acagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcc 179  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| || |   |||||| || ||||||||| |||||||    
T  12234354 acagctgcctcataagcaaccgcctc-tcagggttaatactcttgcacagctccttccccttgaaaaaatcctgcaatagttgctgcactttgggaatcc 12234452  T
Q  180 tagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaag 279  Q
    |||| || || || | ||| ||||  ||||  || |  |  ||||||||||| | |||   || |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  12234453 tagaggacccgccaataaggacaacttcatccaccctacttttgtccatcttagcatcactaagacaactctcaacaatcttcatacactcaataagaag 12234552  T
Q  280 gtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaa 379  Q
     |||||||| ||||| ||||||||| | | | |||  |||| ||| || |||||| | ||  ||||| |||| | |||||| |  |  || |    ||||    
T  12234553 atccatattcatttcctcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaaatcaatgccttcaaataaagaatctacctcaatggttgcaacaacaaggaaa 12234652  T
Q  380 gagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttca 479  Q
    || | ||  ||||| ||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | | | || |||||||| ||||| ||||| || ||||       
T  12234653 gacaatgatctttttgccctctcacaagcagttcttaacctcctcaaggcttttggatttccactcatgtccacttttttctttctattgaactcttgag 12234752  T
Q  480 caaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggag 579  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| |||||    
T  12234753 caaggtagtttaccattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccggctgtggctttaacttggaagacattacctttgattgttaggag 12234852  T
Q  580 agacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttcaccatcacaat 641  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  12234853 agacacatcaaaagtgccaccgccgagatcaaaaacaaaaatatttcgttctccaacacaat 12234914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 626
Target Start/End: Original strand, 7541837 - 7542436
Alignment:
Q  27 gcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgca 126  Q
    |||||||||| |||||| | | ||||| |||| |||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7541837 gcagcaccaactttggagcgttcttaacgcctccactcaacaatgcagcctgaacagctgccccataagcaacagcctcatcaggattaatgctcttgca 7541936  T
Q  127 caactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtcc 226  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||     ||||  |  || ||| | |||||||| || || || |||||||| |||| ||||| ||     | |||||||    
T  7541937 caagtcctttccattgaaaaagtcctttaatagctgatgtactatgggaatcctcgaagacccgccgacaaggacaacatcatctatcatgctcttgtcc 7542036  T
Q  227 atctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagaga 326  Q
    || || | ||| | || ||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| | | | |||  |||| ||| |    
T  7542037 atattagcatcaataagacagcttccaacaatcgtcatacactcgttaaaaagatccatattcatctcctcaaacttggccctattgatcgatgaagaaa 7542136  T
Q  327 agtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaa 426  Q
    |||||||| | |   ||||| |||| | |||||||| ||  || |    |||||| ||||  ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7542137 agtcaatgccttgaaataaagaatctacctcaatagtggcaacaacaaggaaagaaagtgatctttttgccctctcacaagcagttctcaacctcctcaa 7542236  T
Q  427 ggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtga 526  Q
    |||| ||||||||| | | || |||||||||||||| || || || ||||  ||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  7542237 ggcttttggattcccactaatgtccactttgttctttctcttgaactcttgtacaaagtagttcgccattctattatcaaagtcttctccaccaaggtga 7542336  T
Q  527 gtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttc 626  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||  |||   |  || ||||| || || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7542337 gtgttgccagcagtggccttaacttggaagttgttgcccttaatcgttagtaaagacacatcaaaagtgccaccgccaagatcaaaaacaaaaatatttc 7542436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 648
Target Start/End: Original strand, 43625019 - 43625644
Alignment:
Q  23 tctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctct 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  43625019 tctcgcagcaccaattttggaacattcttaatgcctttactcaaaatagcagcctggacagctgcaccataagcaacagcctcatcagggtttatgcttt 43625118  T
Q  123 tgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacacccccctt 222  Q
     |||  | |||||||| ||||| || |   |||| |  |  |  ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||| || | | | | |||    
T  43625119 cgcatgattccttccccttgaaaaactcctgcaacagctgttttacttttggaattctagaggagccgccaacaaggacaacatcgtggatagcactctt 43625218  T
Q  223 gtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgta 322  Q
    ||||| ||| | ||| | || |||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |    
T  43625219 gtccaacttggcatcaataagacaactcttaacagttttcaaacactcgttgaaaagatccatatttatttcatcaaatttggcacgagtgattgatgaa 43625318  T
Q  323 gagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcc 422  Q
     ||||||||||  |   | ||||| |||| | |||||||| | ||| | |    ||||| |||||||||||  |  | || || |  ||||||||||| |    
T  43625319 aagaagtcaataccacggaataaagaatctacctcaatagtgctgaacgaagcaaaagacagtgtcctttttcctctctcgcatgccgttctcaaccttc 43625418  T
Q  423 tcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgag 522  Q
    | | ||||||||  || | | | |||||||| ||||||||| | | ||||||||   |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| || ||    
T  43625419 ttatggctcttgagtttccaataatatccacattgttcttcttctcaaattcttctgcaaagtagttcaccattctatcatcaaagtcctctcctccaag 43625518  T
Q  523 gtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaata 622  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    ||||| |   | |||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||    
T  43625519 gtgagtgtttccagcagtggctttaacacggaagaccttgtccttaattgtaagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagatgaaaata 43625618  T
Q  623 tttctttcaccatcacaattacttct 648  Q
    |||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  43625619 tttcgttctccaacacaattaattct 43625644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 12259138 - 12258541
Alignment:
Q  27 gcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgca 126  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||  ||  ||||||| |||| |||||| || | ||| |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  12259138 gcagctccaactttggaacattctggatatcttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgca 12259039  T
Q  127 caactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtcc 226  Q
    |||||| ||||| ||||| || |   | ||||  | |||||||||  |||||||||| || || || ||||| |||| ||||| ||||   | |||||||    
T  12259038 caactctttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtcc 12258939  T
Q  227 atctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagaga 326  Q
     | || | ||||  || ||||||||||||| ||||||| || || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| ||| |    
T  12258938 gtgttagcatccgtaagacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccaaatttatttcctcaaacttggcacgattgattgatgcagaaa 12258839  T
Q  327 agtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttga-aagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctca 425  Q
    | |||||| | ||  ||||| |||| ||||||||||  |  || ||   || |||| ||||  ||||| ||  | |||||||  ||| |||| |||||||    
T  12258838 aatcaatgccatcacataaagaatctatctcaatagttgcaac-aacaagataagaaagtgatctttttgcactctcacaagctgttttcaatctcctca 12258740  T
Q  426 aggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtg 525  Q
    | ||||||||||| | | | ||||| ||||||||||| || || || ||||  ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  12258739 aagctcttggatttccacttatatctactttgttctttctcttgaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtg 12258640  T
Q  526 agtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatt 624  Q
     ||||||||||  || || ||||||| |||||||| | | ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12258639 cgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagacaaaaatatt 12258541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 12245959 - 12245349
Alignment:
Q  31 caccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaac 130  Q
    |||||| |||||||||| |||||   ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  12245959 caccaaatttggaacattcttaacatctttactcaacaaagcagcttgaacagctgccccataagcaacagcctcgtcagggttaatgctcttgcacaat 12245860  T
Q  131 tccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatct 230  Q
    |||||||| ||||| ||||   | ||||  |  || ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||| ||||| || |   | |||||||||||    
T  12245859 tccttcccgttgaaaaagtcctgtaatagctgttggactttgggaatcctagaagatccaccaacaagtacaaaatcatctatagtactcttgtccatct 12245760  T
Q  231 ttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtc 330  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||| |||| ||||| || |||| ||| || | ||| | ||| ||||||||  | ||| |||  |||| ||| || ||    
T  12245759 ttgcatccataatacaactctcaacagtctttatacaatcattaagaagatctaaattcaattcctcaaactttgcccgattgatggatgaagaaaaatc 12245660  T
Q  331 aatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaa-gagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggc 429  Q
    |||| | |   ||||| |||| | ||||||||  |  | |||   |||| || ||| | ||||| ||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12245659 aatgccttgaaataaagaatctacctcaatagttg-caacaacaagaaacgaaagtattctttttgccctctcacaagcagttctcaatctcctcaaggc 12245561  T
Q  430 tcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtg 529  Q
    | ||| | |   | | ||||||| ||||||||| || || || || |   |||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  12245560 ttttgaacttgcactaatatccaatttgttctttctcttgaactcctgtgcaaagtagtttaccattctattatcaaaatcctctcctccaaggtgagtg 12245461  T
Q  530 tttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttcttt 629  Q
    ||||||| |||||| |||||||  ||||  | | | ||||| || |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12245460 tttccagcagtggccttaacttggaagatgttatccttaatagttaggatagaaacgtcaaaagtgccaccaccaagatcaaacacaaaaatgtttcttt 12245361  T
Q  630 caccatcacaat 641  Q
    | ||| ||||||    
T  12245360 ctccaacacaat 12245349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 641
Target Start/End: Original strand, 11999023 - 11999619
Alignment:
Q  31 caccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaac 130  Q
    |||||| |||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11999023 caccaaatttggaacattcttaacatcttcactcaacaaagcagcttgaacagctgccccataagctacagcctcatcagggttaatgctcttgcacaac 11999122  T
Q  131 tccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatct 230  Q
    |||||||| ||||| |||| | | ||||  |  || || ||||| |||||||| || || || ||||| |||| ||||| || |   | |||||||||||    
T  11999123 tccttcccgttgaaaaagtcatgtaatagctgttggac-tttgggatcctagaagatccaccaacaagtacaacatcatctatagtactcttgtccatct 11999221  T
Q  231 ttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtc 330  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||| |||| ||||| || |||| ||| || | ||| | ||| ||||||||  | ||| |||  |||| ||| || ||    
T  11999222 ttgcatccataatacaactctcaacagtctttatacaatcattaagaagatctaaattcaattcctcaaactttgcccgattgatggatgaagaaaaatc 11999321  T
Q  331 aatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaa-gagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggc 429  Q
    |||| | |   ||||| |||| | ||||||||  |  | |||   |||| || ||| | ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11999322 aatgccttgaaataaagaatctacctcaatagttg-caacaacaagaaatgatagtattctttttgccctctcacaagcagttctcaacctcctcaaggc 11999420  T
Q  430 tcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtg 529  Q
    | ||| | | | | | |||||||||| ||||||  | || || ||||  ||||||||             |||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  11999421 ttttgaacttccactaatatccacttcgttctttatcttgaactcttgtacaaagta-------------ttatcaaaatcctctcctccgaagtgagtg 11999507  T
Q  530 tttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttcttt 629  Q
    |||||||  ||||| |||||||  |||||||   | |||||||| || | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11999508 tttccagctgtggccttaacttggaagacattgtccttaattgttagtatagacaaatcaaaagtgccaccgccaagatcaaagactaaaatgtttcttt 11999607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 23 - 639
Target Start/End: Original strand, 30774859 - 30775475
Alignment:
Q  23 tctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctct 122  Q
    |||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30774859 tctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagcaactgcctcatcaggattgatgctct 30774958  T
Q  123 tgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacacccccctt 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||  | |||    
T  30774959 tgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcatctacactactctt 30775058  T
Q  223 gtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgta 322  Q
    ||| | |||||||||   || ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  30775059 gtctacctttgaatcagtaagacaactctcaacagtctgtatacactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgagtgattgatgaa 30775158  T
Q  323 gagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcc 422  Q
    || ||||||||||| |   |||||| ||| ||||||| |   ||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||   |    
T  30775159 gaaaagtcaatgtcttgaaataaattatctatctcaacaaatgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtc 30775258  T
Q  423 tcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgag 522  Q
    |||| |||||||||||||  || || ||||| ||||||||| | |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30775259 tcaaagctcttggattcccggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtaattcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgat 30775358  T
Q  523 gtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaata 622  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30775359 gtgagtgtttccagcagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaata 30775458  T
Q  623 tttctttcaccatcaca 639  Q
    || || ||| |||||||    
T  30775459 ttcctctcagcatcaca 30775475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 9336452 - 9335836
Alignment:
Q  23 tctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctct 122  Q
    ||||| ||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |     
T  9336452 tctcgtagcaccaagttgggcgcattcttaaagccttcactcaaaatagcagcttgaacagctgcaccataagcaacagcctcatctgggttgataccca 9336353  T
Q  123 tgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacacccccctt 222  Q
    || | || |||||||| ||||| || |   |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  | |   | |||    
T  9336352 tgaataattccttccccttgaaaaattctagcaatagttcttgcactttcggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatcatcaatattactctt 9336253  T
Q  223 gtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgta 322  Q
    ||  ||||||||||||   | |||  | |||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || | ||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |    
T  9336252 gtatatctttgaatccctgagacaggtgtcaacaatattcatacactcattgaaaaagtccatgttaagttcctcaaatttggcacgagtgattgatgaa 9336153  T
Q  323 gagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcc 422  Q
    || ||||| ||  ||    |||||  ||| | ||||| || ||| || ||    ||||| ||| ||||||| ||| | ||||| | ||||||||||||||    
T  9336152 gaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtaacaaaagcaaaagacagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctcc 9336053  T
Q  423 tcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgag 522  Q
    | |||| | |||| |||    |||| |||||||| |||||| | || || |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||    
T  9336052 ttaaggattttgggttctgcttgatgtccactttattcttcttttttaactcttccacaaaatagttaaccattctgttatcaaagtcctcgcctccaag 9335953  T
Q  523 gtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaata 622  Q
    ||| |||||||| |  |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  9335952 gtgcgtgtttcctgcggtggcttttacttcaaatagatcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtaccgccacccagatcaaagacaaaaata 9335853  T
Q  623 tttctttcaccatcaca 639  Q
    ||||  | |||||||||    
T  9335852 tttcggttaccatcaca 9335836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Original strand, 35132071 - 35132375
Alignment:
Q  31 caccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaac 130  Q
    |||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  35132071 caccaactttggaacattttttatgcctttactcaacaaagcagcctgaactgctgccccataagctacagcctcatcggggttaatgctcttgcacaac 35132170  T
Q  131 tccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacac-cccccttgtccatc 229  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||  | ||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||| ||||| ||| |   | ||||||||||    
T  35132171 tccttccctttgaaaaagttttgcaatagctgctgcactttgggaatcctagaagaccctccaacaagaacaacatcatctacccttgctcttgtccatc 35132270  T
Q  230 tttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagt 329  Q
    || | ||| |  | ||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||   ||| ||||| ||||||||| | ||| ||| ||||| ||| || |    
T  35132271 ttagcatcaatgagacaactctctacggtattcatacactcattaaaaaggtctgcattcatttcctcaaacttggcgcgattgattgatgaagaaaaat 35132370  T
Q  330 caatg 334  Q
    |||||    
T  35132371 caatg 35132375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 422 - 625
Target Start/End: Original strand, 35132454 - 35132657
Alignment:
Q  422 ctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccga 521  Q
    ||||||||| ||| ||||| | | || || ||||||||||| || || || ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35132454 ctcaaggcttttgaattcccactaatgtctactttgttctttctcttgaactcttgtacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccaccga 35132553  T
Q  522 ggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaat 621  Q
    | ||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||| | | ||||| || || |  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  35132554 gatgagtgtttccggcagtggccttaacttggaagacattatccttaatagtaagtattgaaacatcaaaagtgccaccaccaagatcgaagacaaaaat 35132653  T
Q  622 attt 625  Q
    ||||    
T  35132654 attt 35132657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23597099 - 23597022
Alignment:
Q  70 agcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaa 147  Q
    ||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||    
T  23597099 agcagcttggactgcagcgccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttacaaagttccttcccattgaagaa 23597022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23588257 - 23588170
Alignment:
Q  60 cactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaa 147  Q
    ||||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| |||||||||||    
T  23588257 cactcaaaatagcagcttggacggctgccccatatgcaacagcttcatcggggttgatgctcttacaaagctcctttccattgaagaa 23588170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Original strand, 54396081 - 54396154
Alignment:
Q  74 gcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaa 147  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  54396081 gcttgaacagcagcaccataagcaacagcttcatcagggttaatactcttgcaaagctctttcccattgaagaa 54396154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 23 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 8586267 - 8585646
Alignment:
Q  23 tctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctct 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| || || || || ||| || || || ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  8586267 tctcgcagcaccaagtttggaactttcttaaagtctttacacagcaaagaagcctgaactgcagccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttct 8586168  T
Q  123 tgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacacccccctt 222  Q
    |||| || || |||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||   |||    
T  8586167 tgcataaatctttcccattgaagaagtcactcaatagttcctgtactttgggaattctggacgagccaccgacaaggacaatatcgtctacaccattctt 8586068  T
Q  223 gtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgta 322  Q
     || ||||| |||||   || ||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |    
T  8586067 ctctatcttagaatcggtaagacaactctcaacagtatttatacactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgcgtgattgatgaa 8585968  T
Q  323 gagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcc 422  Q
    ||||| || | | ||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||| ||    
T  8585967 gagaaatcgacgccctcacataaataatcaatttcaatagtagtgaccaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgccgttcttaaccgcc 8585868  T
Q  423 tcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgag 522  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8585867 tcaaagctcttgggttcttagtaatatccacattgttctttctcttaaattcctcaacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcccctcccccaag 8585768  T
Q  523 gtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaata 622  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8585767 gtgagtatttccagcggttgctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaata 8585668  T
Q  623 tttctttcaccatcacaattac 644  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  8585667 tttcgttcaccatcacagttac 8585646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 23 - 499
Target Start/End: Original strand, 8616285 - 8616764
Alignment:
Q  23 tctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcact---caacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgc 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||  | |   ||||| |||||| || || |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||     
T  8616285 tctcgcagcgccaagtttggaacattcttaaagtctgtagtacccaacaaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgt 8616384  T
Q  120 tcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccc 219  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |     
T  8616385 tcttgcacaaatccttcccatcgaaaaagtcactcaatagttcctgcactttaggaatcctagacgagccaccgacaagaacaatatcatctacactact 8616484  T
Q  220 cttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgat 319  Q
    ||| || ||||| |||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  8616485 cttctctatcttagaatcattaaaacaactctcaacagtctttatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttaacacgagtgattgat 8616584  T
Q  320 gtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacc 419  Q
    | |||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||  ||| |||||||||||| || | |||| ||||||    
T  8616585 gaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtgaccaatttgaatgaaagcatccgtttcgccttttcgcatgcagttttcaacc 8616684  T
Q  420 tcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctg 499  Q
     |||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  8616685 gcctcaacgatcttgggttcctagtaatatccacattgttcttcctcttaaaatcctcaacaaagtagttcaacattctg 8616764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 10494935 - 10494310
Alignment:
Q  23 tctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctct 122  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |     
T  10494935 tctcgtagcaccaagttcgggacattcttaaagccttcactcaaaatagcagcctgaacagctgcaccataagcaacagcctcatctgggttgatacgca 10494836  T
Q  123 tgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacacccccctt 222  Q
    || | || |||||||| ||||| || |   ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  | | |   |||    
T  10494835 tgaataattccttccccttgaaaaattctagcaatagatcctgcactttgggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatcatcaatatcattctt 10494736  T
Q  223 gtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgta 322  Q
    ||  ||||||||||||   | |||||| |||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |    
T  10494735 gtatatctttgaatccctgagacaactgtcaacaatattcatacactcgatgaaaaagtctatattaatttcctcaaatttggcacgagtgattgatgaa 10494636  T
Q  323 gagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcc 422  Q
    || ||||| ||  ||    |||||  ||| | |||||  | |||||| ||    ||||||||| ||||||| ||| | ||||| | ||||||||||||||    
T  10494635 gaaaagtcgattcccataaataaagcatcgacctcaacggtggtgacaaaagaaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctcc 10494536  T
Q  423 tcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgag 522  Q
    | |||| | ||||||||| | |||| ||||| || |||||| | || || || |  ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  10494535 ttaaggattttggattcccactgatgtccacgttattcttctttttgaactcctcaacaaaataattcaccattctgttatcgaagtcctctcccccaag 10494436  T
Q  523 gtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaata 622  Q
    ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10494435 gtgagtgttacctgcagtggcttttacttcaaagacatcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtaccaccacccagatcaaagacaaaaata 10494336  T
Q  623 tttctttcaccatcacaattacttct 648  Q
    ||||  | ||| ||||||| ||||||    
T  10494335 tttcggttaccctcacaatcacttct 10494310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 27831428 - 27830835
Alignment:
Q  31 caccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaac 130  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  27831428 caccaagtttggaacattcataatgtcatcactcaacaaagcagcctgcacagctgcaccaaaagcaacagcctcatcaggattgatgctcttgcacaaa 27831329  T
Q  131 tccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatct 230  Q
    ||||| || ||||| ||||    |||||  | ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||| ||||| || ||  | |||||||||||    
T  27831328 tcctttcccttgaaaaagtccgccaatagctgctgcactttgggaatccttgaagagccaccaacaaggacaacatcatctatactactcttgtccatct 27831229  T
Q  231 ttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtc 330  Q
    | || ||    | ||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    || | |||||||    
T  27831228 tagagtcagtgagacaactctcaacagtctccatacattcattgaaaaggtccatattgatttcctcaaactttgcacgagtgatcattgaaaagaagtc 27831129  T
Q  331 aatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggct 430  Q
    |||| ||||  ||||   ||| ||||||||||  ||| | |     ||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  27831128 aatgccctcaaataaggcatctatctcaatagtagtgtcaacagaaaaagagagtgtcctttttgccttctcacattaggttctcagcctcctcaaggct 27831029  T
Q  431 cttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgt 530  Q
    ||||| |||| | | || |||||| | |||||| | || ||  | | |||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27831028 cttgggttcccactaatgtccactcttttcttcttcttgaacacctccacaaaatagttcaccatcctattatcaaagtcctctccaccaaggtgagtgt 27830929  T
Q  531 ttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatt 624  Q
    |||||| ||| || |||||||  ||||| | | | |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27830928 ttccagcagttgccttaacttggaagaccttatccttaattgtaacaagagacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaacacaaaaatatt 27830835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 639
Target Start/End: Original strand, 8658974 - 8659586
Alignment:
Q  27 gcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgca 126  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||  || || ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  8658974 gcagcaccaagtttgggacattcttaaagcctttgcttaaaacagcagcttgaagagctgcaccataagcaacagcctcatctgggttgatactcttgta 8659073  T
Q  127 caactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtcc 226  Q
     ||  |||||     ||| | ||   ||||||  || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |  | | | | | | |      
T  8659074 taaaaccttctttgggaaaaggtcttgcaatagatcttgcactttgggaatcctagacgaaccacccacaagaacaatatcgtcaatatcactcatctgt 8659173  T
Q  227 atctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagaga 326  Q
    || ||||||||   || ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | ||| | |||    
T  8659174 atttttgaatcgctaagacaactctcaacagttttcatacactcattaaaaagatccatattcatttcctcaaacctggcacgagtgattaatgaacaga 8659273  T
Q  327 agtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaa 426  Q
    |||| ||  |||   ||||| |||| | ||||| || |||||| ||    |||||||||||||| || ||| | ||||| | ||||||||||||||| ||    
T  8659274 agtctattccctgaaataaagaatcgacctcaacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaa 8659373  T
Q  427 ggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtga 526  Q
    || | |||| || | | | || |||||||| |||||| | || || || |  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  8659374 ggattttgggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgctatcaaagtcctctcctccaaggtga 8659473  T
Q  527 gtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttc 626  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  8659474 gtgtttccagaagtggcttttacttcaaagacatcacccttcattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaagaccaaaatatttt 8659573  T
Q  627 tttcaccatcaca 639  Q
     || |||||||||    
T  8659574 gtttaccatcaca 8659586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 630
Target Start/End: Original strand, 6789123 - 6789726
Alignment:
Q  27 gcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgca 126  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||| |||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6789123 gcagcaccaagtttggaacactcttagagccttcgctcaacaaagcagcctggacagctgcaccgtaagcaacagcctcatcagggttgatgctcatgca 6789222  T
Q  127 caactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtcc 226  Q
    ||| ||||| ||  |||| |  |   |||||| ||  |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||| ||||| ||||   | |||||||    
T  6789223 caaatcctttcccatgaaaacttcttgcaatagttgttgcactttgggaattctagaagacccaccaacaaggacaacatcatttacaatactcttgtcc 6789322  T
Q  227 atctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagaga 326  Q
    ||||| |  || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||| |  ||    
T  6789323 atcttagcgtcaacaagacaactctcaacggtcttcatacactcattaaaaatatccatattgatttcctcaaacttggcccgagtaagtgatgaaatga 6789422  T
Q  327 agtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaa 426  Q
    |||| ||| |||   ||||| | || | ||||||||  ||||| |     |||||||||  |||||| ||| ||||||| | |||||||||||| || ||    
T  6789423 agtcgatgccctgaaataaagagtctacctcaatagtagtgacgacaacaaaagagagtacccttttggccctttcacacgcagttctcaaccttcttaa 6789522  T
Q  427 ggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtga 526  Q
    ||| ||||  || | ||| |||||||||||||||||||| ||||| || |   |||||||||| | || || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6789523 ggcccttgagtttccagtaatatccactttgttcttcctcttaaactcctctgcaaagtagtttaccaatcggttatcaaagtcctctcctccgaggtga 6789622  T
Q  527 gtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttc 626  Q
    |||||||||   ||||| |||||||  ||||| | | |||| ||||| | || ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||     
T  6789623 gtgtttccaccggtggccttaacttggaagaccttatctttgattgttaagatagacacatcgaaagtgccaccaccaaggtcgaagacgaaaatatttt 6789722  T
Q  627 tttc 630  Q
    ||||    
T  6789723 tttc 6789726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 626
Target Start/End: Original strand, 8667026 - 8667629
Alignment:
Q  23 tctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctct 122  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| ||||  |||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| | |     
T  8667026 tctcgtagcaccaagttggggacattcttacagccttcactcaaaatagcagcctgaacagctgcaccataagcaacagcctcgtctgggttgataccca 8667125  T
Q  123 tgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacacccccctt 222  Q
    || | || |||||||| |||||  | |   |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  | | |   |||    
T  8667126 tgaataattccttccccttgaaatattctagcaattgttcctgcactttgggaatcctagacgagccaccgacaagtacaacatcatcaatatcattctt 8667225  T
Q  223 gtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgta 322  Q
    ||  ||||||||||||   | |||  | ||||| || ||||||||||| || |||| |||||| || | ||| ||||| ||  ||||||| | ||||| |    
T  8667226 gtatatctttgaatccctgagacaggtgtcaactatattcatacactcattgaaaaagtccatgttaagttcctcaaatttagcacgagtaattgatgaa 8667325  T
Q  323 gagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcc 422  Q
     | ||||| ||  ||    |||||  ||| | ||||| || ||| || ||    ||||||||| ||||||| ||| | ||||| | ||||||||||||||    
T  8667326 caaaagtcgattcccgtaaataaagcatctacctcaacagtggtaacaaaagcaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctcc 8667425  T
Q  423 tcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgag 522  Q
    | |||| | |||| |||  | |||| |||||||| |||||| | || || || |  ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  8667426 ttaaggattttgggttctgactgatgtccactttattcttcttttttaactcctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcctcgcccccaag 8667525  T
Q  523 gtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaata 622  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8667526 gtgagtgtttcctgcagtggctttcacttcaaagacatcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtcccgccacccagatcaaagacaaaaata 8667625  T
Q  623 tttc 626  Q
    ||||    
T  8667626 tttc 8667629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 647
Target Start/End: Original strand, 8654063 - 8654681
Alignment:
Q  29 agcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcaca 128  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| | |||||||||| | |||||| || ||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||||  || |  |||    
T  8654063 agcaccaagttggggacattcttaaagtcttcactcaaaatagcagcctgaacagcagcgccatatgcaatagcctcatctgggttgatattcataaaca 8654162  T
Q  129 actccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccat 228  Q
    |  ||||||| ||||| || |   ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||| |||||  | | |   |||||  ||    
T  8654163 aagccttccccttgaaaaactctagcaatagatcctgcactttgggaatcctagacgagccacccacgagtacaacatcatcaatatcattcttgtatat 8654262  T
Q  229 ctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaag 328  Q
    |||||||||    | |||||| |||||||| || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||| ||||| ||| |||    
T  8654263 ctttgaatctctgagacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaag 8654362  T
Q  329 tcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaagg 428  Q
    || ||  ||    |||||  ||| | ||||| || |||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  8654363 tcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaagg 8654462  T
Q  429 ctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagt 528  Q
     | |||| || |   | || |||||||| |||||| | || || || |  |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  8654463 attttgggttaccgctaatttccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgt 8654562  T
Q  529 gtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctt 628  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| | |    
T  8654563 gtttccagcagtggcttttacgtcaaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgt 8654662  T
Q  629 tcaccatcacaattacttc 647  Q
    | ||||||| | |||||||    
T  8654663 ttaccatcatagttacttc 8654681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 624
Target Start/End: Original strand, 17267554 - 17268147
Alignment:
Q  31 caccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaac 130  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || | |||| |||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||     
T  17267554 caccaagtttggaacattcttgacgcttccacttaacaaagcagcctgaacagcagcaccataagcaacagcctcatcagggttgatacttttgcataat 17267653  T
Q  131 tccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatct 230  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||| |||||  || |  | |||||| ||||    
T  17267654 tccttccccttgaagaagttctgcaatagttgctgcactttcggaatcctagaagacccaccaacaaggacaacatcatcaactctgctcttgtcaatct 17267753  T
Q  231 ttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtc 330  Q
    | | |||   || |||  |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | ||| || ||    
T  17267754 tagcatcactaagacacttctcaacaatctccatgcactcatcaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgacgaagaaaaatc 17267853  T
Q  331 aatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggct 430  Q
    ||   |||   |||||   || | ||||| |  ||| ||  |   |||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  17267854 aacacccttaaataaagcgtctacctcaacattggtcacagaggcgaaagaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaacctcctcatggct 17267953  T
Q  431 cttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgt 530  Q
     |||| |||| |   || | || ||| || ||||| || | ||| |  ||||| ||||  | |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  17267954 tttgggttcccaacaattttcaatttttttttccttttgatttcctcaacaaaatagtataccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgt 17268053  T
Q  531 ttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatt 624  Q
     ||||   ||||| |||||||| ||||| | | | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17268054 ctccaccggtggccttaacttcgaagaccttatccttaattgtaacgagagacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaagacaaaaatatt 17268147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 492 - 639
Target Start/End: Original strand, 8628608 - 8628755
Alignment:
Q  492 acattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaa 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8628608 acattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaa 8628707  T
Q  592 agtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttcaccatcaca 639  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8628708 agtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcaca 8628755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 624
Target Start/End: Original strand, 17259856 - 17260449
Alignment:
Q  31 caccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaac 130  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || | |||| |||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  17259856 caccaagtttggaacattcttgacgcttccacttaacaaagcagcctgaacagcagcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcataat 17259955  T
Q  131 tccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatct 230  Q
    ||||| || |||||||| |   |||||| || ||||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||| |||||  |  |  | |||||| ||||    
T  17259956 tccttacccttgaagaaatcctgcaatagttgctgcactttcggaatcctagaagatccaccaacaaggacaacatcatcaattctgctcttgtcaatct 17260055  T
Q  231 ttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtc 330  Q
    |   |||   || |||  |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| || |     
T  17260056 taccatcactaagacacttctcaacaatctccatgcactcataaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttggcacgagtgattgacgaagaaaaatt 17260155  T
Q  331 aatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggct 430  Q
    ||   |||   |||||   || | ||||| |  ||| ||  |    ||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  17260156 aacacccttaaataaagcgtctacctcaacattggtcacagaggcaaaagaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaacctccttaaggct 17260255  T
Q  431 cttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgt 530  Q
     |||| |||| | | || |||| ||| ||| | || || |  || |  ||||| |||| || |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  17260256 tttgggttcccaataatgtccaattttttcgttcttttgatctcctctacaaaatagtacaccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgt 17260355  T
Q  531 ttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatt 624  Q
     ||||   ||||| |||||||| ||||| | | | |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  17260356 ctccaccggtggccttaacttcgaagaccttatccttaattgtaacgagagacacatcaaaagtccccccaccaaggtcaaagacaaaaatatt 17260449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 227 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 13333813 - 13333399
Alignment:
Q  227 atctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagaga 326  Q
    ||||||||||||   | |||||| |||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||| |    
T  13333813 atctttgaatccctgagacaactgtcaacaatattcatacactcgatgaaaaagtctatattaatttcctcaaatttggcacgagtgattgatgaagaaa 13333714  T
Q  327 agtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaa 426  Q
    |||| ||  ||    |||||  ||| |  |||| || |||||| ||    || |||||| |||||||  || | ||||| | ||||||||||||||| ||    
T  13333713 agtcgattcccataaataaagcatctacttcaacagtggtgacaaaagaaaaggagagtatccttttttccctctcacaggcagttctcaacctccttaa 13333614  T
Q  427 ggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtga 526  Q
    || | |||| |||| | ||||||| || || |||||| | || || || |  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  13333613 ggattttgggttcccactgatatcgacgttattcttctttttgaactcctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcttctcccccaaggtga 13333514  T
Q  527 gtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttc 626  Q
    |||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13333513 gtgtttcctgcggtggcttttacttcaaagacatcacccataattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccacccagatcaaagacaaaaatatttc 13333414  T
Q  627 tttcaccatcacaat 641  Q
      | |||||||||||    
T  13333413 gcttaccatcacaat 13333399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 624
Target Start/End: Original strand, 3146866 - 3147472
Alignment:
Q  18 caacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgat 117  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3146866 caacatcttgcaccaccaagtttggaacatttttaaagtcttcactcaacaaagcagcttgcacagctgcaccataagcaacggcctcatcagggttgat 3146965  T
Q  118 gctcttgcacaactccttcccattgaagaagttac-gcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacacc 216  Q
    ||| || ||||  | |||||| |  || || || | |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||||| | |    
T  3146966 gctgttacacagatgcttccc-tgcaaaaaattcctgcaatagttgttgcacttttggaattctagacgagccaccgacaaggacgacatcatgtatagc 3147064  T
Q  217 ccccttgtccatctttga-atccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgag 315  Q
     |  |||||||| || || |||  | |||||||||| |||| | | || ||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  3147065 acttttgtccat-ttcgacatcagcgaaacaactcttaacagtttccaaacactcagtgaaaagatccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgat 3147163  T
Q  316 tgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctc 415  Q
    ||||| | | |||||||   |||   ||||| |||| |||||||| | |||||  |     ||||| ||| | | ||| ||  ||||||| |  ||| ||    
T  3147164 tgatgaaaataagtcaaatccctgaaataaagaatctatctcaatggtggtgatgacagcaaaagatagtattcgttttgctctttcacacgccgttttc 3147263  T
Q  416 aacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctc 515  Q
    |||||||| ||||||||||  |||  | | || || || ||||||||| | ||||| ||     |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  3147264 aacctccttaaggctcttgagttctcactaatgtctaccttgttcttcttcttaaactcccgtgcaaagtagttcaccatcctattatcaaagtcctctc 3147363  T
Q  516 ccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagac 615  Q
    |||| ||||| |||||||| |   |||| ||||||| |||||| | | | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||     
T  3147364 ccccaaggtgggtgtttcctgcgatggccttaacttgaaagaccttatccttaattgtaagaagagacacatcaaaagtcccaccacccaagtcaaagat 3147463  T
Q  616 aaaaatatt 624  Q
    |||||||||    
T  3147464 aaaaatatt 3147472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 627
Target Start/End: Original strand, 8545240 - 8545844
Alignment:
Q  23 tctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctct 122  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| |||| || ||||||||| || |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8545240 tctcgtagcaccatgtttgggacattcttattgtcttcactcagcaaagcagcctggacagctgcaccataagcaacagcctcatcagggttaatgctct 8545339  T
Q  123 tgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacacccccctt 222  Q
    |||| || |||||||| || || || |   | ||||  |    |||||| ||||||||||| || || || ||||| |||| ||||| |||||  |||||    
T  8545340 tgcataattccttccccttaaaaaactcctgtaatagctgtctcactttaggaatcctagaagaaccgccaacaaggacaacatcatctacactaccctt 8545439  T
Q  223 gtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgta 322  Q
    ||||||||| | ||| |||| |||||  | |||| | | ||||||||  | ||| ||||||||||| | ||  ||||||||| | |||||||   ||| |    
T  8545440 gtccatcttagcatcaacaagacaacaattaacagtgtccatacacttttcaaagaggtccatattcaattgctcaaacttggcccgagtgatgcatgaa 8545539  T
Q  323 gagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcc 422  Q
     | ||||||||  | |  ||||||  ||| |  ||||| | ||   |    | | | || ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  8545540 caaaagtcaataccttgatataaagcatctaggtcaattgtggcctcagtgtcgtatgaaagtgtcctttttgccttctcacaggcagttctcaacctcc 8545639  T
Q  423 tcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgag 522  Q
    ||||||||  ||| |||| | | |||||| | ||||||||||| || || || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || || ||    
T  8545640 tcaaggcttctgggttccgactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcacaaagtaattcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctag 8545739  T
Q  523 gtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaata 622  Q
    || ||||| ||||| |||||| || || |||||||| | |  ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  8545740 gtaagtgtctccagcagtggccttgacatcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaata 8545839  T
Q  623 tttct 627  Q
    |||||    
T  8545840 tttct 8545844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 648
Target Start/End: Original strand, 1301072 - 1301692
Alignment:
Q  27 gcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgca 126  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |  ||||  || || | ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |    
T  1301072 gcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagcaacagcctcgtc-gggttgatactcttgta 1301170  T
Q  127 caactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtcc 226  Q
     ||  | ||| |   ||| | ||   ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  | | | | | ||       
T  1301171 taaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatcatcgatatcactcatgcat 1301270  T
Q  227 atctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagaga 326  Q
    || ||||||||   || ||||||||||||  | ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | ||| | |||    
T  1301271 atttttgaatcgctaagacaactctcaacggtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacaga 1301370  T
Q  327 agtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaa 426  Q
    |||| ||  |||   ||||| |||| | |||||  | |||||| ||    ||||||||||||||||| ||| | ||||| | | ||||||||||||| ||    
T  1301371 agtcgattccctgaaataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcacacgcaattctcaacctccttaa 1301470  T
Q  427 ggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtga 526  Q
    || | |  | || | | | || |||||||| |||||| |  | || || |  ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  1301471 ggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttctgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtga 1301570  T
Q  527 gtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttc 626  Q
    || ||||||  ||||||||| |||||||||||||| || || || || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |    
T  1301571 gtatttccaccagtggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaatattcc 1301670  T
Q  627 tttcaccatcacaattacttct 648  Q
     || ||||||||| | ||||||    
T  1301671 gtttaccatcacagtcacttct 1301692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 410 - 606
Target Start/End: Original strand, 8646871 - 8647067
Alignment:
Q  410 gttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagt 509  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||   |||||| || || ||||||  |||||||||    
T  8646871 gttctcaacctccttaaggctcttgagtttccagtaatgtccaccttgttcttcttgttaaattcttgtgcaaagtggtccaccattctactatcaaagt 8646970  T
Q  510 cctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaag 606  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| | | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8646971 cctctcctccgaggtgagtgtttccagcggtggctttaacatgaaagaccttatccttaattgtaaggagagacacatcaaaagttccaccaccaag 8647067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 454 - 627
Target Start/End: Original strand, 8559371 - 8559544
Alignment:
Q  454 tttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttca 553  Q
    |||||||||||| | ||| ||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| || ||||||    
T  8559371 tttgttcttcctctcaaactcttttacaaagtgtttcaccattctgttatcaaagtcctctcctccgaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttca 8559470  T
Q  554 aagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttct 627  Q
    |||| || |   ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  8559471 aagagattattcttaattgtgagaagagaaacatcaaaagttccaccaccgagatcaaagatgaaaatatttct 8559544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Original strand, 8575941 - 8576054
Alignment:
Q  31 caccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaac 130  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  8575941 caccaagtttggaacattcttactgccttcactcaacaaagcagcttggacaacagcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttacataat 8576040  T
Q  131 tccttcccattgaa 144  Q
    |||||||| |||||    
T  8576041 tccttccccttgaa 8576054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 383 - 627
Target Start/End: Original strand, 8570278 - 8570522
Alignment:
Q  383 agtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaa 482  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| | |||||| | ||||||||| | || || |  |||||||    
T  8570278 agtgtcctttttgccctctcacaagctgttcttaacctcctcaaggcttttgggttcctactaatatcctcgttgttcttcttcttgaacttcttcacaa 8570377  T
Q  483 agtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagaga 582  Q
    |||   ||||||||||||||||||| || || || || |||||||||| ||||| |||||| || |||||| ||   | | | |||| |||||| | |||    
T  8570378 agtgagtcaacattctgttatcaaaatcttcacctcccaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcatagttgttatccttaactgtgagaataga 8570477  T
Q  583 cacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttct 627  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  8570478 cacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttct 8570522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 383 - 614
Target Start/End: Original strand, 8590605 - 8590836
Alignment:
Q  383 agtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaa 482  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||  ||| |||||||||| |  || ||||  |||| | | | ||||||||| ||||||||  |||| || ||||| |    
T  8590605 agtgtccttttagccctctcacaagctgttttcaacctcctaagagcccttgcgttcccacttaaatccactttattcttcctcctaaactccttcacca 8590704  T
Q  483 agtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagaga 582  Q
    | | ||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||| ||||||||||| || ||||||  ||||||||| | |||||| |||||    
T  8590705 aatggtgaaccattctgttatcaaagtcctctcctcctaggtgggtatctccggaagtggcttttacatcaaagctatcacctttgagtgtgagaagaga 8590804  T
Q  583 cacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaaga 614  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8590805 cacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaaga 8590836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 493 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 8636434 - 8636300
Alignment:
Q  493 cattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaa 592  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||| || ||     
T  8636434 cattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggcagtggctttaacttcaaagacttcacctttaattttgagtatagacacgtcgaat 8636335  T
Q  593 gtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttct 627  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  8636334 gtaccaccaccaagatcaaatacgaaaatgtttct 8636300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29578233 - 29578043
Alignment:
Q  23 tctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctct 122  Q
    |||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  29578233 tctcgcaagaccaaatttggaacattcttaatgccatcaatcaacaaagcagcctgcacagctgcaccataagcaacagcctcgtcagggtttatgctca 29578134  T
Q  123 tgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtac 213  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||||   |||||| || | ||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  29578133 tgcacaaatccctacccttgaaaaagtcttgcaatagtttccgcactttgggaattctagatgaacctccaacaaggacaatttcatgtac 29578043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 479 - 627
Target Start/End: Original strand, 8602037 - 8602185
Alignment:
Q  479 acaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgagga 578  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||| || |||||||||| || |   ||||||||||| |    
T  8602037 acaaagtggttcaccattcggttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttcaaagagattattcttaattgtgagaa 8602136  T
Q  579 gagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttct 627  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  8602137 gagaaacatcaaaagttccaccaccaagatcaaatatgaaaatatttct 8602185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29582385 - 29582281
Alignment:
Q  40 tggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttccca 139  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  29582385 tggaacattctcaatgccttcaatcagcaaagcagcctgcacagctgcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcatgcacaaatccttcccc 29582286  T
Q  140 ttgaa 144  Q
    |||||    
T  29582285 ttgaa 29582281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 8609524 - 8609710
Alignment:
Q  23 tctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctct 122  Q
    |||||||||||||||||||||||    || |||||||||| ||||| |||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  8609524 tctcgcagcaccaagtttggaactgatttgatgccttcacccaacaaagcagcctggacagcagcaccataagcaaccgcctcatcagggttgatgctca 8609623  T
Q  123 tgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcat 209  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||   ||| ||  | || |||||| ||||||||||| || || || |||||||||| |||||    
T  8609624 tacacaaatcctttccattgaaaaagtcttgcagtagctgcttcactttcggaatcctagaagaacctccaacaagaacaacatcat 8609710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27846655 - 27846566
Alignment:
Q  35 aagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttg 124  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27846655 aagtttggaacattcttaatgtcatcactcaacaaagcagcctgcacagctgctccaaaagcaacagcctcatcagggttgatgctcttg 27846566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 383 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 7877934 - 7877706
Alignment:
Q  383 agtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaa 482  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||||||||| | ||| || || || | |   || |||||||| |||||||| ||||| ||  |||| |    
T  7877934 agtgtccttttagccctctcacatgcagttctcaacctcctaagggccctcgggtttccaccaatgtccactttattcttcctcttaaactccatcacta 7877835  T
Q  483 agtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagaga 582  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| | ||| ||| | || ||||||  |||| |||| | |||||| |||||    
T  7877834 aatggttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgagtatctccggcagtagctattacatcaaagctatcatcttttagtgtgagaagaga 7877735  T
Q  583 cacatcaaaagtcccaccaccaagatcaa 611  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7877734 cacatcgaaagtgccaccaccaagatcaa 7877706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 383 - 643
Target Start/End: Original strand, 8576293 - 8576553
Alignment:
Q  383 agtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaa 482  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||  | | |||||| |||||| |||  |  | || || || ||||    
T  8576293 agtgtcctttttgccttttcacaagcagttctcaacctccttaaggcttttgaattctcactaatatcctctttgtacttgttcctgaactccttaacaa 8576392  T
Q  483 agtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagaga 582  Q
    |||  | || |||| ||||||||||||| |  || || |||||||||| ||| | |||||| || ||||| |||||||     |||| |||||| | |||    
T  8576393 agtgatccaccattatgttatcaaagtcttggcctcctaggtgagtgtctccggcagtggccttgacttcgaagacattgttcttaactgtgagaataga 8576492  T
Q  583 cacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttcaccatcacaatta 643  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||||||    
T  8576493 cacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttcttttatcaacacaatta 8576553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 455 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 29581970 - 29581811
Alignment:
Q  455 ttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaa 554  Q
    ||||||||||| || || || ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |  |||| |||||| || |||||||    
T  29581970 ttgttcttcctcttcaactcattcgcaaagtaattcaccattcggttatcaaagtcctctcctcctaggtgagtatcgccagcagtggccttcacttcaa 29581871  T
Q  555 agacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaaga 614  Q
    |   |||| | || | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29581870 acttatcatccttgagtgtgagaagagacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaaga 29581811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 479 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 8382981 - 8382833
Alignment:
Q  479 acaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgagga 578  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||||||| ||| | |||||| || ||  ||||||||| |   |||||||||||||    
T  8382981 acaaagtacttcacgattctgttatctaagtcttcacctcctagatgagtgtctccggcagtggccttcacaacaaagacattattcttaattgtgagga 8382882  T
Q  579 gagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttct 627  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8382881 gagacacatcaaaagttccaccaccaagatcaaagatgaaaatatttct 8382833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 138
Target Start/End: Original strand, 8581318 - 8581422
Alignment:
Q  34 caagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactcc 133  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| | || |||||| || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  8581318 caagtttggaacactcttaatgccttcactaaccaaagcagcctgaatagcagcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcataattcc 8581417  T
Q  134 ttccc 138  Q
    |||||    
T  8581418 ttccc 8581422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 120
Target Start/End: Original strand, 8537643 - 8537740
Alignment:
Q  23 tctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgct 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8537643 tctcgcagcaccaagttcggaacagtcttaatgcctccgctcaacaaagcagcctggacagcagcaccataagcaacagcttcatcagggttgatgct 8537740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 449 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 29577807 - 29577642
Alignment:
Q  449 tccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaa 548  Q
    ||||| ||||||||||| || || || |||||||||| | ||| |||| | ||||| ||||||||||| || |||||||| |  |||| |||||| || |    
T  29577807 tccacattgttcttcctcttcaactcattcacaaagtggctcaccattttattatcgaagtcctctcctcctaggtgagtatcaccagcagtggccttta 29577708  T
Q  549 cttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaaga 614  Q
    |||||||   |||| | |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  29577707 cttcaaaactatcatccttaagtgtgagaagagacacatcaaaggtgccaccaccaagatcaaaga 29577642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 476 - 627
Target Start/End: Original strand, 8609977 - 8610128
Alignment:
Q  476 ttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtga 575  Q
    ||||||||||  || | |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| || || || || ||  |||    |||||||||||    
T  8609977 ttcacaaagtgattaaccattctgtgatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatctccagcagtagccttgacatcgaaagcattgtttttaattgtga 8610076  T
Q  576 ggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttct 627  Q
    | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8610077 gaacagacacatcgaaagtcccaccaccaagatcaaagataaaaatatttct 8610128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Original strand, 8102311 - 8102461
Alignment:
Q  60 cactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataa 159  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||   |||| |     
T  8102311 cactcaagatagcagcttgaacagcggcaccataagcaacagcctcgtcggggttgatgcttttgcatagctccttaccattgaagaagtcttgcaacag 8102410  T
Q  160 ttcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatg 210  Q
    || ||| ||||| ||||||||||  || || || |||||||||| ||||||    
T  8102411 ttgctgaactttgggaatcctagttgaaccaccaacaagaacaacatcatg 8102461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 13333929 - 13333835
Alignment:
Q  23 tctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgat 117  Q
    ||||| ||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13333929 tctcgtagcaccaagttcgggacagtcttaaagccttcactcaaaatagcagcctgaacagctgcaccataagcaacagcctcatctgggttgat 13333835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 478 - 627
Target Start/End: Original strand, 8581762 - 8581911
Alignment:
Q  478 cacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgagg 577  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||| || || || || |||||||||| ||||| |||||| || |||||| || | | |   |||| ||||||     
T  8581762 cacaaagtgattcaccattctgttatcaaaatcttcccctcccaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcatagtcgttattcttaactgtgaga 8581861  T
Q  578 agagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttct 627  Q
    | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  8581862 atagacacatcaaaagttccacctccaaggtcaaagataaaaatatttct 8581911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Original strand, 8590251 - 8590436
Alignment:
Q  29 agcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcaca 128  Q
    |||||||| || ||||||| |||||| || ||||  | || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |    
T  8590251 agcaccaaattaggaacattcttaatcccatcacaaagcaaagcagcttgaacagctgcaccataagcaacagcctcatctggattgatgctattgtaaa 8590350  T
Q  129 actccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtaca 214  Q
      ||||||||  | || ||||   ||||||  | ||||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||| ||||| ||||    
T  8590351 gatccttccccataaaaaagtcttgcaatagctgctgcactttgggaatcctagaagaaccaccaacaagtacaacatcatctaca 8590436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Original strand, 8646492 - 8646605
Alignment:
Q  31 caccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaac 130  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||  || | |||||| || || ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||     
T  8646492 caccaagtttggagcattcttaaagccatcacataataaagcagcctgaacggctgcgccataagcaacggccacatcagggttgatgctctcgcataat 8646591  T
Q  131 tccttcccattgaa 144  Q
    |||||| |||||||    
T  8646592 tccttctcattgaa 8646605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8636844 - 8636718
Alignment:
Q  83 gctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctag 182  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| | || || | ||   | |||| || |||||| |||||||||||||    
T  8636844 gctgctccataagcaacagcctcatcagcgttgatgctcttacacagttccttcgccttaaaaatgtcctgtaatagttgctgcacctttggaatcctag 8636745  T
Q  183 acgagcccccgacaagaacaatatcat 209  Q
    | ||||| || ||||| |||| |||||    
T  8636744 aggagccaccaacaaggacaacatcat 8636718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7878286 - 7878103
Alignment:
Q  31 caccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaac 130  Q
    |||||| || ||||||| |||||| || ||||  | || |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| |      
T  7878286 caccaaattaggaacattcttaataccatcacaaagcagagcagcctgaacagctgcaccataagcaacagcttcatccgggttgatgctactgcaaata 7878187  T
Q  131 tccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtaca 214  Q
    |||||||| || || ||||   ||||||  | |||||||||  |||||||||| || || || ||||| |||| ||||| ||||    
T  7878186 tccttccccttaaaaaagtcctgcaatagctgctgcactttgagaatcctagatgatccaccaacaagtacaacatcatctaca 7878103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 138
Target Start/End: Original strand, 8569918 - 8570033
Alignment:
Q  23 tctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctct 122  Q
    |||||||  |||||||||||||||  ||||| || ||||||   || | |||| || | |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  8569918 tctcgcaaaaccaagtttggaacactcttaacgctttcactatgcaaaacagcctgaatagctgcaccgtaagcaacagcctcatcagggttaatgctgt 8570017  T
Q  123 tgcacaactccttccc 138  Q
    |||| || ||||||||    
T  8570018 tgcataattccttccc 8570033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 614
Target Start/End: Original strand, 8538120 - 8538234
Alignment:
Q  500 ttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccac 599  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| | ||| | |||||| || |||  |||| ||| |   || | ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  8538120 ttatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatctccggcagtggccttgactgtaaaggcattattcttcaatgtaaggagagatacatcaaaagttccac 8538219  T
Q  600 caccaagatcaaaga 614  Q
    |||||||||||||||    
T  8538220 caccaagatcaaaga 8538234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8017923 - 8017850
Alignment:
Q  74 gcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaa 147  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||    
T  8017923 gcttgtacagcggcaccataagcaacagcctcgtctgggttgatactcttgcaaagctctttaccattgaagaa 8017850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8383390 - 8383170
Alignment:
Q  70 agcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcact 169  Q
    ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || |  ||||||| |||||| ||||   ||||||  || ||||||    
T  8383390 agcagctttaactgctgcaccataagcaacagcctcgtcaggatttatgctcacacaaaggtccttccaattgaaaaagtgttgcaatagctcttgcact 8383291  T
Q  170 tttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacact 269  Q
    || |||||||| || || || ||||  ||||||| ||||| |||||  | ||||| |||||| | |||   || ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  8383290 ttgggaatcctcgaagaaccaccgatgagaacaacatcatctacactactcttgttcatcttagcatcagtaagacagctctcaacagtctccatacact 8383191  T
Q  270 cgttaaaaaggtccatattga 290  Q
      | ||| |||||||||||||    
T  8383190 tttcaaataggtccatattga 8383170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 135
Target Start/End: Original strand, 39985290 - 39985365
Alignment:
Q  60 cactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactcctt 135  Q
    ||||||| | |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||    
T  39985290 cactcaagatagcagcctgaacagcagcaccatatgcaacagcctcatcaggatttatgctcttgcatagctcctt 39985365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 34467349 - 34466751
Alignment:
Q  23 tctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctct 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  34467349 tctcgcagcaccaagtttggaacattgttaaagcctttactcaacaaagcagcttgcacagctgcgacataagcgacagcctcatcagggttgatgctat 34467250  T
Q  123 tgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacacccccctt 222  Q
    |||| |  ||||| |||||||| ||||  |||||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||  | | |    
T  34467249 tgcatagatccttaccattgaaaaagtcccgcaatagctgctgcactttgggaatcctagaagagcccccgacaaggacagcatcatgcacactactcgt 34467150  T
Q  223 gtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatac---actcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgat 319  Q
    ||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||||| |||| |   | || ||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||     
T  34467149 gtccatcttagcatcaacaagacaactcacaacaatcctcatgcattaatctttaaagaagtccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgac 34467050  T
Q  320 gtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacc 419  Q
    | |  |||||||||  |||| |||||| |||| || |||| ||  | |||        || |||||||||| || || || || || | |||||||||||    
T  34467049 gaatggaagtcaattacctcatataaagaatctatttcaacagtagcgac--------aaaagagtgtcctctttgcattctcgcacgcagttctcaacc 34466958  T
Q  420 tcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccccc 519  Q
    ||||||| ||||| || || | | | ||||||   || | |||||| || || || ||  |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||  ||    
T  34466957 tcctcaaagctctagggtttccactaatatccttattatgcttcctcttgaactcctttgcaaagtggttcgccattctattatcaaagtcctctcgtcc 34466858  T
Q  520 gaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaa 619  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  34466857 gaggtgagtgttaccagaagtggccttaacttcaaagacattatccttaattgtaaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaagacgaaa 34466758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 31 - 639
Target Start/End: Original strand, 15594649 - 15595257
Alignment:
Q  31 caccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaac 130  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15594649 caccaagtttggaacatttttaaaaccttcactcaacaaagcagcctggacagctgcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcatgcacaat 15594748  T
Q  131 tccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatct 230  Q
    ||||| || | ||| || |    ||||| ||  |||||||| ||||||||||| || || || ||||  |||||||||| |||||  | ||| | |||||    
T  15594749 tcctttccctcgaaaaaatccttcaatagttgttgcactttgggaatcctagaagacccaccaacaatgacaatatcatttacactactcttattcatct 15594848  T
Q  231 ttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtc 330  Q
    | | |||  ||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| |  |||| | |||||||    
T  15594849 tagcatcatcaagacaactctcaactatcttcatacaatccttaaaaaagtccatgttgatttcttcaaacttggaacgagtaaccgatgaaaagaagtc 15594948  T
Q  331 aatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggct 430  Q
    |||  | |   ||||| |||| | |||||| |  |||||     | |||||||||  |||||| ||| |||| || | ||||||||| |||||||||||     
T  15594949 aataccgttaaataaacaatctacctcaatggtagtgacagtagtaaaagagagtaccctttttgccctttcgcacgcagttctcaatctcctcaaggcc 15595048  T
Q  431 cttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgt 530  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | || ||||| | | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15595049 cttgggttcccagtaatatccactttgttcttcgtcttgaattcctgcgcaaagtagttgaccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgt 15595148  T
Q  531 ttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttc 630  Q
    ||||    ||||| |||||||  ||||| |   | |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15595149 ttccgcctgtggccttaacttggaagaccttgtccttaattgttaggatagacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttc 15595248  T
Q  631 accatcaca 639  Q
     ||| ||||    
T  15595249 tccaacaca 15595257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 4679118 - 4678516
Alignment:
Q  23 tctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctct 122  Q
    ||||||||||| || || || |||| |||||  ||||| ||||| | ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4679118 tctcgcagcacaaaattcgggacattcttaaaaccttcgctcaaaatagcagcttggatagctgcaccataagcaacagcctcatctgggttgatactct 4679019  T
Q  123 tgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacacccccctt 222  Q
    ||||||| |||||||  || || ||||   ||||||  ||||||||||| |||||||| || || || || |||||||||| |||||  | |   | |      
T  4679018 tgcacaaatccttccgcttaaaaaagtcttgcaatagatcctgcactttgggaatcctcgatgaaccacccacaagaacaacatcatcaatattactccc 4678919  T
Q  223 gtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgta 322  Q
    |  ||||||||||||   || |||||||| |||| | | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  |||| |    
T  4678918 gcgcatctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaa 4678819  T
Q  323 gagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcc 422  Q
    || ||||| ||  |||   ||||| |||| | ||||| || |||||| ||   ||||||||||||||| || ||| | || || | ||||||||||||||    
T  4678818 gaaaagtctattccctgaaataaagaatcta-ctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctcc 4678720  T
Q  423 tcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgag 522  Q
    | |||| | |||  ||| || | || ||||| || |||||| | || || || |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4678719 ttaagggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctag 4678620  T
Q  523 gtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaata 622  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| || ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  4678619 gtgagtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatata 4678520  T
Q  623 tttc 626  Q
    ||||    
T  4678519 tttc 4678516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 52549503 - 52549395
Alignment:
Q  27 gcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgca 126  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||| ||||||    
T  52549503 gcagcaccaactttggaacattctgaatgccttcactcaacaatgcagcctgaacagctgcgccataagctacaacctcatcaggattaatgcccttgca 52549404  T
Q  127 caactcctt 135  Q
    |||||||||    
T  52549403 caactcctt 52549395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 52549352 - 52549292
Alignment:
Q  244 acaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttg 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  52549352 acaactttcaacaatcttcatacactccttaaaaaggtccatattcatttcctcaaacttg 52549292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 123; Significance: 7e-63; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 543
Target Start/End: Original strand, 43744418 - 43744943
Alignment:
Q  18 caacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgat 117  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| |  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| ||    
T  43744418 caacatcttgcagcaccacgtttggaacttttttaaagccttcactcaacaaagcagcctgcacagctgcaccaatagcaactgcctcatcagggttaat 43744517  T
Q  118 gctcttgcacaactccttcccattgaagaagttac-gcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacacc 216  Q
    | |||| ||||| |||||||| |  || || || | |||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||| | |    
T  43744518 gttcttacacaaatccttccc-tgcaaaaaattcctgcaatagttgttgtacttttggaatcctagaggagccaccaacaagaacaacatcatgtatagc 43744616  T
Q  217 ccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagt 316  Q
     | |||||||||||| | |||   || ||||||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||   |||||||| |    
T  43744617 gctcttgtccatcttggcatcagtaagacaactctcaacaattttcaaacactcgttgaagagatccatattgatttcctcaaacttagtacgagtgatt 43744716  T
Q  317 gatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctca 416  Q
    | |||| |||| |||||| ||||  ||||| |||| | |||||||| |||||| |     ||||| | ||||||||| ||  |||| || |  |||||||    
T  43744717 gttgtaaagaaatcaatgccctcaaataaagaatctacctcaatagtggtgacaacagcaaaagataatgtcctttttgctctttcgcatgctgttctca 43744816  T
Q  417 acctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcc 516  Q
    ||||||| || |||||||| || | ||| || ||||| ||||||||| | ||||| || |   | |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  43744817 acctccttaatgctcttgggtttccagtaatgtccaccttgttcttcttcttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcctattatcaaaatcctctcc 43744916  T
Q  517 cccgaggtgagtgtttccagaagtggc 543  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  43744917 tccgaggtgagtgtttccagaggtggc 43744943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 621
Target Start/End: Original strand, 12528141 - 12528709
Alignment:
Q  53 atgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttac 152  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| || |       
T  12528141 atgccttcactcaacaaagcagcctgaacagcggcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgtataactccttgcccttgaaaaactcct 12528240  T
Q  153 gcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctc 252  Q
    ||||||  | || |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||  | |||||||||||| | |||    |||||||| ||    
T  12528241 gcaatagctgcttcactttgggaatcctagacgagccaccaacaagtacaatatcatctacactactcttgtccatcttagcatcggtcaaacaactttc 12528340  T
Q  253 aacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatca 352  Q
    |||  ||| ||||||||  | ||| ||||||||||| | ||  || |||||| | ||||||| |||||   ||||||||||| ||||  ||| |  |||     
T  12528341 aacggtctccatacacttttcaaagaggtccatattcagttgctcgaacttggctcgagtgattgatgagcagaagtcaatgccctcacatatagcatct 12528440  T
Q  353 atctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatcca 452  Q
    || ||||| |  |   |    | | | || ||||||||||||||||| || ||   ||||||||| ||||| | |||| |||  |||| | | || || |    
T  12528441 atgtcaattgtagcctctgtatcgtatgaaagtgtccttttcgccttctcgcagttagttctcaatctccttagggcttttgagttcccaataatgtcaa 12528540  T
Q  453 ctttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttc 552  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||| || |||||    
T  12528541 ctttgttcttcctcttaaactctttcacaaagtgattcaccattcgattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtctccggcagtggccttgacttc 12528640  T
Q  553 aaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaat 621  Q
     ||||||| |   || | ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  12528641 gaagacattattctttactgtaagaagagacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaaaataaaaat 12528709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 566 - 628
Target Start/End: Original strand, 43744999 - 43745061
Alignment:
Q  566 ttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctt 628  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||    
T  43744999 ttaattgtaaggagagacacatcaaaagtcccaccacccaggtcaaagatgaaaatatttctt 43745061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 536
Target Start/End: Original strand, 28219529 - 28220038
Alignment:
Q  27 gcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgca 126  Q
    |||||||||| || ||||| |  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  28219529 gcagcaccaacttcggaacttttttaaagccttcactcaacaaagcagcctgcacagctgcaccataagcaacagcctcatcagggttaatgctcttaca 28219628  T
Q  127 caactccttcccattgaagaagttac-gcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtc 225  Q
    ||| |||||||| |  || || || | ||| || ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||    
T  28219629 caattccttccc-tccaaaaaattcctgcagtagttgttgtacttttggaattctagaggagcctccaacaagaacaacatcgtgtacagccctcttgtc 28219727  T
Q  226 catctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagag 325  Q
    ||| || | |||    | ||| ||||||||| | |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||| | ||    
T  28219728 catattggcatcagtgagacacctctcaacagttttcaaacactcattgaaaagatccatattgatttcctcaaacttagcacgagtaattgatgaaaag 28219827  T
Q  326 aagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctca 425  Q
    || |||||| | ||  ||||| |||| | |||||| | || ||| |     ||||| ||||||||||| ||  | |  || |  |||||||||||||| |    
T  28219828 aaatcaatgccttcaaataaagaatctacctcaatggtggcgacaacagcaaaagatagtgtcctttttgctctcttgcacgctgttctcaacctcctta 28219927  T
Q  426 aggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtg 525  Q
    |||||||||  || | ||| || ||||| ||||||||| | ||||| || |   | |||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28219928 aggctcttgagtttccagtaatgtccaccttgttcttcttcttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcctactatcaaagtcctctcccccgaggtg 28220027  T
Q  526 agtgtttccag 536  Q
    |||||||||||    
T  28220028 agtgtttccag 28220038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 575 - 626
Target Start/End: Original strand, 28220110 - 28220161
Alignment:
Q  575 aggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttc 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||    
T  28220110 aggagagacacatcaaaagtcccaccacccaggtcaaagatgaaaatatttc 28220161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 599
Target Start/End: Original strand, 28910650 - 28910765
Alignment:
Q  484 gtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagac 583  Q
    |||||||| ||| || ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||| | | | | |||||| ||||||||     
T  28910650 gtagttcaccatcctattatcaatgtcctcgaccccgaggtgagtgtttccagcggtggccttaacttggaagaccttatcctgaattgtaaggagagaa 28910749  T
Q  584 acatcaaaagtcccac 599  Q
    ||||||||||||||||    
T  28910750 acatcaaaagtcccac 28910765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 473 - 547
Target Start/End: Original strand, 11133051 - 11133125
Alignment:
Q  473 tctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggcttta 547  Q
    |||||||| || | ||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  11133051 tctttcacgaaatggttcaccattgtgttatcaaagtcttgtcccccgaggtgagtatctccagcagtggcttta 11133125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University