View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11061_low_8 (Length: 456)

Name: NF11061_low_8
Description: NF11061
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11061_low_8
NF11061_low_8
[»] chr6 (149 HSPs)
chr6 (8-456)||(27283300-27283748)
chr6 (73-456)||(27209712-27210096)
chr6 (73-456)||(27239132-27239516)
chr6 (13-456)||(16936948-16937392)
chr6 (8-456)||(27014537-27014985)
chr6 (73-456)||(27025955-27026338)
chr6 (73-456)||(15405533-15405917)
chr6 (73-456)||(15417320-15417704)
chr6 (73-456)||(13291947-13292331)
chr6 (73-456)||(26927565-26927952)
chr6 (22-456)||(22927803-22928241)
chr6 (73-456)||(16756634-16757017)
chr6 (73-456)||(29508234-29508618)
chr6 (73-456)||(26792629-26793009)
chr6 (73-456)||(29556369-29556754)
chr6 (73-454)||(29579849-29580229)
chr6 (73-456)||(13517195-13517580)
chr6 (73-456)||(27031834-27032218)
chr6 (73-456)||(27201010-27201393)
chr6 (73-456)||(27247840-27248223)
chr6 (73-456)||(28167307-28167692)
chr6 (89-456)||(33369443-33369816)
chr6 (73-456)||(24298765-24299147)
chr6 (96-456)||(27491952-27492311)
chr6 (74-456)||(26665640-26666023)
chr6 (74-456)||(26771611-26771994)
chr6 (38-456)||(24870521-24870941)
chr6 (73-456)||(16680972-16681356)
chr6 (73-456)||(8898675-8899063)
chr6 (96-456)||(4532107-4532466)
chr6 (73-456)||(26109402-26109787)
chr6 (73-456)||(4538760-4539145)
chr6 (96-456)||(30551007-30551366)
chr6 (73-456)||(28214281-28214666)
chr6 (112-456)||(27355124-27355469)
chr6 (69-456)||(22201161-22201537)
chr6 (79-456)||(4779724-4780099)
chr6 (73-456)||(14138408-14138787)
chr6 (82-456)||(20131333-20131696)
chr6 (69-456)||(4764575-4764952)
chr6 (153-456)||(27064314-27064606)
chr6 (82-401)||(20175423-20175737)
chr6 (82-401)||(22160254-22160568)
chr6 (73-216)||(34457546-34457690)
chr6 (268-456)||(34457685-34457872)
chr6 (15-124)||(26109228-26109336)
chr6 (8-124)||(8898494-8898609)
chr6 (8-124)||(28167758-28167873)
chr6 (8-124)||(28214732-28214847)
chr6 (8-124)||(33369246-33369361)
chr6 (13-124)||(16681422-16681532)
chr6 (13-124)||(29508684-29508794)
chr6 (13-124)||(29556820-29556930)
chr6 (8-124)||(4538579-4538694)
chr6 (8-124)||(14138227-14138342)
chr6 (13-124)||(26665463-26665573)
chr6 (13-124)||(26771434-26771544)
chr6 (13-106)||(4532515-4532608)
chr6 (13-106)||(13517076-13517169)
chr6 (89-237)||(27622490-27622641)
chr6 (282-456)||(27622919-27623093)
chr6 (13-135)||(15405177-15405300)
chr6 (13-135)||(15416964-15417087)
chr6 (13-106)||(30550866-30550958)
chr6 (17-135)||(24871080-24871200)
chr6 (8-135)||(22927020-22927148)
chr6 (15-124)||(27064781-27064889)
chr6 (8-135)||(13291585-13291714)
chr6 (8-135)||(16757251-16757380)
chr6 (8-135)||(27032450-27032579)
chr6 (13-135)||(4764944-4765068)
chr6 (13-135)||(8898199-8898323)
chr6 (13-135)||(24298408-24298532)
chr6 (13-135)||(26793064-26793188)
chr6 (13-135)||(27015156-27015280)
chr6 (13-135)||(27201505-27201629)
chr6 (13-135)||(27247604-27247728)
chr6 (13-135)||(27354549-27354673)
chr6 (13-124)||(34457370-34457480)
chr6 (13-138)||(14137932-14138059)
chr6 (8-106)||(27354844-27354942)
chr6 (8-69)||(16757440-16757501)
chr6 (73-158)||(27064630-27064715)
chr6 (79-211)||(4755693-4755824)
chr6 (13-135)||(26928185-26928309)
chr6 (13-135)||(27026571-27026695)
chr6 (13-135)||(33368950-33369075)
chr6 (22-127)||(4755576-4755683)
chr6 (22-127)||(4780109-4780216)
chr6 (13-134)||(29580342-29580465)
chr6 (13-133)||(28168046-28168168)
chr6 (36-138)||(22201068-22201172)
chr6 (36-135)||(22927522-22927623)
chr6 (13-135)||(27210329-27210454)
chr6 (13-135)||(27238774-27238899)
chr6 (69-124)||(14138048-14138103)
chr6 (36-124)||(20131712-20131802)
chr6 (12-67)||(22927378-22927433)
chr6 (24-123)||(20175755-20175855)
chr6 (24-123)||(22160136-22160236)
chr6 (79-135)||(22927210-22927266)
chr6 (64-124)||(24871033-24871093)
chr6 (69-124)||(8898315-8898370)
chr6 (69-124)||(15405292-15405347)
chr6 (69-124)||(15417079-15417134)
chr6 (69-124)||(22927140-22927195)
chr6 (73-124)||(22927678-22927729)
chr6 (69-124)||(26928138-26928193)
chr6 (69-124)||(27210282-27210337)
chr6 (69-124)||(27238891-27238946)
chr6 (69-124)||(27354665-27354720)
chr6 (69-124)||(33369067-33369122)
chr6 (79-124)||(27015109-27015154)
chr6 (79-124)||(28167997-28168042)
chr6 (82-125)||(4538303-4538346)
chr6 (82-125)||(4755219-4755262)
chr6 (82-125)||(4765374-4765417)
chr6 (82-125)||(4780530-4780573)
chr6 (82-125)||(8897708-8897751)
chr6 (89-124)||(13291726-13291761)
chr6 (82-125)||(13516788-13516831)
chr6 (82-125)||(14137522-14137565)
chr6 (82-125)||(16681778-16681821)
chr6 (69-124)||(16757204-16757259)
chr6 (82-125)||(16757624-16757667)
chr6 (82-125)||(16936660-16936703)
chr6 (89-124)||(24298544-24298579)
chr6 (82-125)||(26108938-26108981)
chr6 (82-125)||(26665176-26665219)
chr6 (82-125)||(26771147-26771190)
chr6 (82-125)||(26793433-26793476)
chr6 (79-126)||(26928076-26928123)
chr6 (82-125)||(27015587-27015630)
chr6 (69-124)||(27026524-27026579)
chr6 (89-124)||(27032403-27032438)
chr6 (82-125)||(27065138-27065181)
chr6 (82-125)||(27201934-27201977)
chr6 (82-125)||(27247256-27247299)
chr6 (82-125)||(27283134-27283177)
chr6 (82-125)||(27354084-27354127)
chr6 (43-106)||(27492360-27492423)
chr6 (82-125)||(27492699-27492742)
chr6 (82-125)||(28168535-28168578)
chr6 (82-125)||(28215080-28215123)
chr6 (82-125)||(29509039-29509082)
chr6 (82-125)||(29557236-29557279)
chr6 (82-125)||(33368540-33368583)
chr6 (38-106)||(13291853-13291921)
chr6 (38-106)||(24298671-24298739)
[»] chr7 (118 HSPs)
chr7 (64-456)||(26508618-26509011)
chr7 (73-456)||(2161384-2161768)
chr7 (11-456)||(16048146-16048592)
chr7 (73-456)||(11417723-11418105)
chr7 (89-456)||(5154896-5155261)
chr7 (64-456)||(16442915-16443307)
chr7 (13-456)||(11447722-11448165)
chr7 (89-456)||(5165197-5165562)
chr7 (73-456)||(26678024-26678406)
chr7 (22-456)||(2780057-2780493)
chr7 (73-456)||(26662832-26663214)
chr7 (73-456)||(26596490-26596872)
chr7 (22-456)||(10909812-10910252)
chr7 (73-456)||(26442078-26442460)
chr7 (73-456)||(31557321-31557706)
chr7 (44-456)||(45394053-45394463)
chr7 (73-456)||(5140254-5140639)
chr7 (73-456)||(45738114-45738502)
chr7 (73-456)||(22148701-22149084)
chr7 (38-449)||(16511327-16511744)
chr7 (73-456)||(26519641-26520023)
chr7 (96-456)||(31130730-31131089)
chr7 (73-456)||(26312783-26313165)
chr7 (89-456)||(24585470-24585838)
chr7 (73-456)||(31083542-31083925)
chr7 (96-456)||(4206209-4206570)
chr7 (117-456)||(10848418-10848750)
chr7 (268-456)||(4138360-4138547)
chr7 (268-456)||(39206279-39206466)
chr7 (8-135)||(26508504-26508631)
chr7 (69-216)||(16744492-16744640)
chr7 (268-456)||(16744635-16744822)
chr7 (69-216)||(4138217-4138365)
chr7 (11-138)||(10848774-10848903)
chr7 (73-216)||(39206140-39206284)
chr7 (8-135)||(16442799-16442928)
chr7 (13-126)||(31131119-31131231)
chr7 (8-124)||(26507856-26507971)
chr7 (8-124)||(39205124-39205239)
chr7 (8-124)||(39205959-39206074)
chr7 (8-124)||(45738568-45738683)
chr7 (13-124)||(31557145-31557255)
chr7 (13-135)||(16744379-16744500)
chr7 (13-106)||(4206619-4206712)
chr7 (13-135)||(5165798-5165921)
chr7 (8-124)||(26442643-26442758)
chr7 (13-124)||(22149150-22149260)
chr7 (13-124)||(26596938-26597048)
chr7 (13-106)||(26267707-26267800)
chr7 (8-135)||(2162001-2162130)
chr7 (13-124)||(26662656-26662766)
chr7 (13-124)||(26677848-26677958)
chr7 (287-456)||(26268219-26268388)
chr7 (13-106)||(5140135-5140228)
chr7 (22-135)||(24585287-24585399)
chr7 (13-106)||(26312607-26312700)
chr7 (13-135)||(31083245-31083369)
chr7 (13-135)||(45738854-45738978)
chr7 (8-135)||(16511060-16511188)
chr7 (13-135)||(2780558-2780682)
chr7 (282-456)||(3452064-3452238)
chr7 (13-135)||(4138101-4138225)
chr7 (13-127)||(5155505-5155621)
chr7 (10-69)||(11417483-11417542)
chr7 (13-135)||(26520135-26520259)
chr7 (8-135)||(10909266-10909394)
chr7 (13-134)||(26507261-26507384)
chr7 (13-134)||(39204529-39204652)
chr7 (89-151)||(26267899-26267961)
chr7 (25-135)||(39205675-39205787)
chr7 (13-62)||(31131303-31131352)
chr7 (73-125)||(39205305-39205357)
chr7 (73-135)||(26442515-26442577)
chr7 (64-124)||(5165751-5165811)
chr7 (69-124)||(2780511-2780566)
chr7 (82-125)||(4137814-4137857)
chr7 (69-124)||(10909386-10909441)
chr7 (69-124)||(11417602-11417657)
chr7 (82-125)||(26662430-26662473)
chr7 (82-125)||(26677622-26677665)
chr7 (69-124)||(39205779-39205834)
chr7 (82-125)||(45394801-45394844)
chr7 (69-124)||(45738807-45738862)
chr7 (79-125)||(26507387-26507433)
chr7 (73-135)||(26508037-26508099)
chr7 (64-126)||(31083356-31083418)
chr7 (73-135)||(31083425-31083487)
chr7 (79-125)||(39204655-39204701)
chr7 (79-124)||(5155450-5155495)
chr7 (24-65)||(5155689-5155729)
chr7 (24-65)||(5165989-5166029)
chr7 (12-68)||(16442683-16442738)
chr7 (89-125)||(26267365-26267401)
chr7 (89-125)||(26312326-26312362)
chr7 (38-106)||(26508237-26508305)
chr7 (89-124)||(2161954-2161989)
chr7 (82-125)||(2780988-2781031)
chr7 (77-120)||(3452622-3452664)
chr7 (82-125)||(3453041-3453084)
chr7 (39-106)||(5165591-5165658)
chr7 (82-125)||(11448410-11448453)
chr7 (69-124)||(16511180-16511235)
chr7 (421-456)||(22152928-22152963)
chr7 (421-456)||(22208843-22208878)
chr7 (82-125)||(24585052-24585095)
chr7 (82-125)||(26443059-26443102)
chr7 (82-125)||(26520442-26520485)
chr7 (82-125)||(26597354-26597397)
chr7 (82-125)||(31131597-31131640)
chr7 (82-125)||(31556857-31556900)
chr7 (82-125)||(45739161-45739204)
chr7 (24-69)||(26507152-26507196)
chr7 (24-69)||(39204420-39204464)
chr7 (38-106)||(2161794-2161862)
chr7 (38-106)||(5155290-5155358)
chr7 (64-104)||(10848750-10848790)
chr7 (38-106)||(10909533-10909601)
chr7 (22-62)||(26508398-26508437)
[»] chr3 (202 HSPs)
chr3 (64-456)||(16617558-16617950)
chr3 (73-456)||(5658911-5659295)
chr3 (64-456)||(22041207-22041599)
chr3 (64-456)||(19701194-19701587)
chr3 (73-456)||(29141851-29142237)
chr3 (73-456)||(11103461-11103844)
chr3 (73-456)||(18058045-18058429)
chr3 (89-456)||(35887537-35887902)
chr3 (73-456)||(22380680-22381063)
chr3 (13-456)||(22863881-22864324)
chr3 (13-456)||(22878940-22879383)
chr3 (73-456)||(15734215-15734599)
chr3 (73-456)||(16422984-16423366)
chr3 (73-456)||(18249517-18249899)
chr3 (73-456)||(32297430-32297816)
chr3 (73-456)||(4339777-4340159)
chr3 (73-456)||(21681519-21681903)
chr3 (73-456)||(28109039-28109423)
chr3 (73-456)||(5602389-5602773)
chr3 (38-456)||(8282525-8282943)
chr3 (38-456)||(4789693-4790114)
chr3 (22-456)||(4690452-4690894)
chr3 (89-456)||(4728403-4728769)
chr3 (73-456)||(5020510-5020900)
chr3 (73-456)||(16599412-16599795)
chr3 (73-456)||(48472709-48473094)
chr3 (38-456)||(18337401-18337816)
chr3 (89-456)||(6208672-6209038)
chr3 (73-456)||(7080028-7080411)
chr3 (73-456)||(20072812-20073197)
chr3 (73-456)||(20569933-20570316)
chr3 (73-456)||(31029340-31029726)
chr3 (89-456)||(31957550-31957916)
chr3 (73-456)||(17978028-17978411)
chr3 (73-456)||(4423695-4424079)
chr3 (73-456)||(4630558-4630943)
chr3 (73-456)||(18231991-18232373)
chr3 (73-456)||(18285454-18285839)
chr3 (96-456)||(24334975-24335334)
chr3 (73-456)||(51788821-51789204)
chr3 (73-456)||(17969954-17970340)
chr3 (73-456)||(18300754-18301140)
chr3 (64-401)||(35221712-35222046)
chr3 (73-456)||(28345970-28346346)
chr3 (153-456)||(15885897-15886200)
chr3 (38-456)||(32445929-32446349)
chr3 (112-456)||(16403907-16404252)
chr3 (73-456)||(10649869-10650250)
chr3 (73-456)||(5473766-5474138)
chr3 (73-456)||(8218424-8218826)
chr3 (73-456)||(28028070-28028456)
chr3 (73-456)||(6535821-6536203)
chr3 (64-456)||(15368043-15368430)
chr3 (220-456)||(10402951-10403186)
chr3 (13-216)||(29658042-29658245)
chr3 (268-456)||(5717854-5718041)
chr3 (268-456)||(5728764-5728951)
chr3 (268-456)||(5763417-5763604)
chr3 (73-216)||(5718036-5718180)
chr3 (73-216)||(5728946-5729090)
chr3 (73-216)||(5763278-5763422)
chr3 (8-138)||(19701571-19701703)
chr3 (268-456)||(29658240-29658427)
chr3 (282-452)||(5589643-5589812)
chr3 (268-456)||(47030255-47030442)
chr3 (6-138)||(16617440-16617574)
chr3 (13-127)||(28108863-28108976)
chr3 (8-135)||(35222091-35222220)
chr3 (73-224)||(5589493-5589644)
chr3 (13-124)||(10403340-10403450)
chr3 (6-138)||(22041583-22041717)
chr3 (13-124)||(28028522-28028632)
chr3 (13-135)||(7080466-7080587)
chr3 (8-135)||(15885494-15885622)
chr3 (8-124)||(48473160-48473275)
chr3 (13-124)||(8218892-8219002)
chr3 (8-135)||(17969655-17969781)
chr3 (13-124)||(20569757-20569867)
chr3 (13-124)||(21681969-21682079)
chr3 (13-124)||(51789270-51789380)
chr3 (8-124)||(4631009-4631124)
chr3 (8-124)||(20073263-20073378)
chr3 (8-124)||(22380499-22380614)
chr3 (8-124)||(31029159-31029274)
chr3 (13-124)||(5020966-5021076)
chr3 (8-134)||(16423602-16423729)
chr3 (13-106)||(18285278-18285371)
chr3 (13-106)||(18300578-18300671)
chr3 (69-216)||(47030437-47030584)
chr3 (13-135)||(32446485-32446609)
chr3 (8-106)||(5589369-5589467)
chr3 (13-135)||(4691312-4691435)
chr3 (8-135)||(9527182-9527311)
chr3 (13-124)||(5718246-5718356)
chr3 (13-124)||(5729156-5729266)
chr3 (13-124)||(5763102-5763212)
chr3 (22-158)||(9526981-9527118)
chr3 (11-135)||(15368460-15368586)
chr3 (13-135)||(4789431-4789554)
chr3 (13-135)||(8282263-8282386)
chr3 (13-106)||(16599878-16599971)
chr3 (13-106)||(32297899-32297992)
chr3 (13-135)||(35888138-35888261)
chr3 (13-105)||(11103285-11103377)
chr3 (8-135)||(15733853-15733982)
chr3 (8-135)||(18058662-18058791)
chr3 (8-135)||(29141489-29141618)
chr3 (13-135)||(4424192-4424316)
chr3 (13-135)||(4631295-4631419)
chr3 (13-135)||(6535585-6535709)
chr3 (13-135)||(16403332-16403456)
chr3 (13-135)||(20073549-20073673)
chr3 (13-124)||(24335423-24335533)
chr3 (13-135)||(48473446-48473570)
chr3 (8-127)||(5659536-5659656)
chr3 (8-106)||(16403627-16403725)
chr3 (13-135)||(18337955-18338079)
chr3 (13-127)||(5474258-5474374)
chr3 (13-135)||(5589074-5589198)
chr3 (13-135)||(6209287-6209411)
chr3 (13-135)||(47030576-47030700)
chr3 (73-155)||(10403192-10403274)
chr3 (22-135)||(18250011-18250126)
chr3 (13-135)||(17977790-17977915)
chr3 (13-127)||(5602210-5602326)
chr3 (13-127)||(31957355-31957471)
chr3 (22-135)||(4690957-4691071)
chr3 (13-69)||(4729086-4729142)
chr3 (44-124)||(10650316-10650395)
chr3 (13-69)||(28346469-28346525)
chr3 (12-66)||(16617385-16617439)
chr3 (12-66)||(22041718-22041772)
chr3 (13-69)||(22380205-22380261)
chr3 (64-138)||(35222030-35222104)
chr3 (64-124)||(4691265-4691325)
chr3 (64-124)||(4789541-4789601)
chr3 (79-135)||(16423543-16423599)
chr3 (36-135)||(17969384-17969485)
chr3 (64-124)||(22380317-22380377)
chr3 (38-150)||(15885761-15885874)
chr3 (69-126)||(17969773-17969830)
chr3 (36-135)||(4339564-4339665)
chr3 (13-57)||(31029043-31029087)
chr3 (64-124)||(35888091-35888151)
chr3 (69-124)||(4424145-4424200)
chr3 (69-124)||(4631248-4631303)
chr3 (69-124)||(4728971-4729026)
chr3 (82-125)||(5601930-5601973)
chr3 (69-124)||(6209240-6209295)
chr3 (69-124)||(8282378-8282433)
chr3 (69-124)||(15733974-15734029)
chr3 (69-124)||(15885614-15885669)
chr3 (69-124)||(16403448-16403503)
chr3 (82-125)||(16600216-16600259)
chr3 (82-125)||(17977255-17977298)
chr3 (69-124)||(18058615-18058670)
chr3 (69-124)||(18337908-18337963)
chr3 (22-65)||(19701767-19701809)
chr3 (69-124)||(20073502-20073557)
chr3 (82-125)||(24335839-24335882)
chr3 (82-125)||(28346762-28346805)
chr3 (82-125)||(31957075-31957118)
chr3 (69-124)||(48473399-48473454)
chr3 (82-125)||(51789625-51789668)
chr3 (82-124)||(32446855-32446897)
chr3 (79-124)||(5659481-5659526)
chr3 (82-126)||(6535297-6535341)
chr3 (89-125)||(17969081-17969117)
chr3 (38-106)||(35887931-35887999)
chr3 (82-125)||(4631725-4631768)
chr3 (82-125)||(5588786-5588829)
chr3 (69-124)||(5589190-5589245)
chr3 (82-125)||(5718661-5718704)
chr3 (82-125)||(5729564-5729607)
chr3 (82-125)||(5762761-5762804)
chr3 (69-124)||(9527135-9527190)
chr3 (82-125)||(10403764-10403807)
chr3 (82-125)||(10650672-10650715)
chr3 (82-125)||(11102998-11103041)
chr3 (82-125)||(16402983-16403026)
chr3 (69-124)||(17969477-17969532)
chr3 (82-125)||(18232857-18232900)
chr3 (82-125)||(18250325-18250368)
chr3 (82-125)||(20074040-20074083)
chr3 (82-125)||(20569409-20569452)
chr3 (82-125)||(22863470-22863513)
chr3 (82-125)||(22878529-22878572)
chr3 (82-125)||(28028938-28028981)
chr3 (82-125)||(29141261-29141304)
chr3 (82-125)||(31028633-31028676)
chr3 (82-125)||(32298237-32298280)
chr3 (82-125)||(48473999-48474042)
chr3 (36-106)||(5659321-5659391)
chr3 (24-69)||(8282155-8282199)
chr3 (64-124)||(16423495-16423556)
chr3 (38-106)||(4728811-4728879)
chr3 (89-125)||(5021322-5021358)
chr3 (38-106)||(6209080-6209148)
chr3 (38-106)||(15734121-15734189)
chr3 (38-106)||(18058455-18058523)
chr3 (89-125)||(28108582-28108618)
chr3 (38-106)||(29141757-29141825)
[»] chr5 (158 HSPs)
chr5 (13-456)||(43085089-43085533)
chr5 (64-456)||(23898718-23899110)
chr5 (64-456)||(22895249-22895643)
chr5 (71-456)||(25207131-25207516)
chr5 (71-456)||(25271287-25271672)
chr5 (73-456)||(11556176-11556558)
chr5 (17-456)||(18121310-18121753)
chr5 (90-456)||(33784304-33784671)
chr5 (73-456)||(23727059-23727444)
chr5 (73-456)||(28952732-28953114)
chr5 (73-456)||(33299358-33299749)
chr5 (73-456)||(13179751-13180136)
chr5 (73-456)||(32589211-32589594)
chr5 (73-456)||(2517887-2518269)
chr5 (73-456)||(9543662-9544047)
chr5 (73-456)||(8658430-8658812)
chr5 (38-456)||(23632792-23633210)
chr5 (36-456)||(24976666-24977087)
chr5 (73-456)||(34623341-34623723)
chr5 (73-456)||(6881135-6881518)
chr5 (73-456)||(37664441-37664823)
chr5 (73-456)||(18368463-18368849)
chr5 (73-456)||(33881948-33882333)
chr5 (73-456)||(37761816-37762198)
chr5 (38-456)||(22992043-22992460)
chr5 (13-456)||(31819296-31819740)
chr5 (73-456)||(18493704-18494087)
chr5 (73-456)||(30036268-30036650)
chr5 (73-456)||(28656087-28656473)
chr5 (96-456)||(15751818-15752177)
chr5 (96-456)||(30158862-30159221)
chr5 (73-456)||(31438279-31438661)
chr5 (68-456)||(37745279-37745668)
chr5 (73-456)||(3796375-3796759)
chr5 (90-456)||(30941452-30941819)
chr5 (73-454)||(24730793-24731175)
chr5 (96-456)||(33523226-33523585)
chr5 (96-456)||(15651719-15652080)
chr5 (73-456)||(30175310-30175692)
chr5 (38-456)||(24609067-24609487)
chr5 (89-456)||(13435617-13435988)
chr5 (73-456)||(26487216-26487598)
chr5 (73-456)||(9324306-9324688)
chr5 (73-456)||(12139004-12139386)
chr5 (73-456)||(37351598-37351983)
chr5 (69-456)||(41681529-41681913)
chr5 (89-456)||(13317779-13318145)
chr5 (268-456)||(40466681-40466868)
chr5 (73-224)||(5644814-5644965)
chr5 (73-216)||(40466542-40466686)
chr5 (282-456)||(5644642-5644815)
chr5 (73-229)||(11330640-11330798)
chr5 (286-456)||(11330476-11330645)
chr5 (8-135)||(22895630-22895759)
chr5 (13-124)||(37745108-37745218)
chr5 (13-127)||(28952556-28952669)
chr5 (13-142)||(28656521-28656649)
chr5 (8-124)||(13179276-13179391)
chr5 (11-138)||(25207565-25207693)
chr5 (11-138)||(25271721-25271849)
chr5 (13-124)||(15751619-15751729)
chr5 (13-124)||(18493528-18493638)
chr5 (13-124)||(30036716-30036826)
chr5 (11-106)||(31438744-31438839)
chr5 (13-135)||(32589035-32589156)
chr5 (13-124)||(6881584-6881694)
chr5 (11-135)||(23899097-23899222)
chr5 (13-124)||(34623789-34623899)
chr5 (13-124)||(40466366-40466476)
chr5 (8-135)||(22991776-22991904)
chr5 (8-135)||(24977224-24977352)
chr5 (13-135)||(23727678-23727801)
chr5 (13-135)||(30942012-30942135)
chr5 (13-106)||(33882359-33882452)
chr5 (8-135)||(33299982-33300111)
chr5 (13-124)||(9543486-9543596)
chr5 (282-456)||(13178644-13178818)
chr5 (11-106)||(37351420-37351515)
chr5 (11-106)||(37762281-37762376)
chr5 (13-135)||(24609626-24609749)
chr5 (13-106)||(33523634-33523726)
chr5 (8-135)||(13178977-13179106)
chr5 (13-124)||(30175758-30175868)
chr5 (11-106)||(37664263-37664358)
chr5 (8-135)||(23633349-23633477)
chr5 (13-106)||(9324771-9324864)
chr5 (13-106)||(11330881-11330974)
chr5 (13-106)||(12139469-12139562)
chr5 (13-106)||(26487681-26487774)
chr5 (13-135)||(13317584-13317708)
chr5 (13-135)||(24731287-24731411)
chr5 (13-135)||(41681905-41682029)
chr5 (13-124)||(2518335-2518448)
chr5 (13-127)||(8658251-8658367)
chr5 (8-122)||(11556744-11556860)
chr5 (13-139)||(18368284-18368412)
chr5 (13-135)||(13435421-13435545)
chr5 (69-138)||(25207507-25207576)
chr5 (69-138)||(25271663-25271732)
chr5 (13-87)||(31438822-31438898)
chr5 (8-135)||(3796871-3797000)
chr5 (13-69)||(5645088-5645144)
chr5 (13-69)||(37351361-37351417)
chr5 (13-69)||(37664204-37664260)
chr5 (43-124)||(30159310-30159390)
chr5 (13-69)||(37762379-37762435)
chr5 (22-106)||(11556584-11556667)
chr5 (64-124)||(30941965-30942025)
chr5 (69-124)||(24977177-24977232)
chr5 (73-135)||(13179457-13179519)
chr5 (12-119)||(22895767-22895875)
chr5 (36-135)||(18121150-18121251)
chr5 (64-124)||(22991891-22991951)
chr5 (64-124)||(23727631-23727691)
chr5 (64-124)||(24609579-24609639)
chr5 (82-126)||(37744759-37744803)
chr5 (82-125)||(13317234-13317277)
chr5 (69-124)||(18121243-18121298)
chr5 (69-124)||(23633302-23633357)
chr5 (82-125)||(30037071-30037114)
chr5 (13-67)||(33784813-33784867)
chr5 (79-124)||(11556684-11556729)
chr5 (24-65)||(23727869-23727909)
chr5 (84-125)||(30176183-30176224)
chr5 (89-125)||(6881939-6881975)
chr5 (89-125)||(9325109-9325145)
chr5 (89-125)||(12139807-12139843)
chr5 (89-125)||(26488019-26488055)
chr5 (82-125)||(2518693-2518736)
chr5 (82-125)||(3797300-3797343)
chr5 (82-125)||(8657971-8658014)
chr5 (82-125)||(9543198-9543241)
chr5 (82-125)||(11331280-11331323)
chr5 (82-125)||(13177733-13177776)
chr5 (77-120)||(13178024-13178066)
chr5 (69-124)||(13179098-13179153)
chr5 (82-125)||(13435073-13435116)
chr5 (82-125)||(15651229-15651272)
chr5 (82-125)||(15751393-15751436)
chr5 (82-125)||(18120963-18121006)
chr5 (82-125)||(18368004-18368047)
chr5 (82-125)||(18493178-18493221)
chr5 (82-125)||(28656955-28656998)
chr5 (82-125)||(30159613-30159656)
chr5 (82-125)||(31818886-31818929)
chr5 (82-125)||(32588747-32588790)
chr5 (69-124)||(33299935-33299990)
chr5 (82-125)||(33882697-33882740)
chr5 (82-125)||(37351081-37351124)
chr5 (82-125)||(37663916-37663959)
chr5 (82-125)||(40466078-40466121)
chr5 (82-125)||(41682335-41682378)
chr5 (82-125)||(43085900-43085943)
chr5 (69-126)||(13435537-13435594)
chr5 (84-125)||(33300283-33300324)
chr5 (89-125)||(28952215-28952251)
chr5 (38-106)||(33299775-33299843)
chr5 (38-106)||(33784714-33784782)
[»] chr4 (86 HSPs)
chr4 (69-456)||(24585403-24585790)
chr4 (79-456)||(15234665-15235041)
chr4 (73-456)||(5701375-5701758)
chr4 (89-456)||(14105390-14105756)
chr4 (79-456)||(24119488-24119866)
chr4 (73-456)||(36323374-36323756)
chr4 (73-456)||(36337583-36337965)
chr4 (75-456)||(54840237-54840616)
chr4 (73-456)||(18793676-18794062)
chr4 (73-456)||(40098669-40099052)
chr4 (17-456)||(34181936-34182376)
chr4 (73-456)||(39857461-39857844)
chr4 (73-456)||(14752551-14752935)
chr4 (36-456)||(14671836-14672260)
chr4 (73-456)||(30760610-30760993)
chr4 (73-456)||(33666837-33667220)
chr4 (96-456)||(31119570-31119929)
chr4 (73-456)||(6576683-6577071)
chr4 (96-456)||(21976550-21976909)
chr4 (73-456)||(17019875-17020248)
chr4 (73-456)||(5012727-5013111)
chr4 (73-456)||(24814337-24814720)
chr4 (64-298)||(1907228-1907462)
chr4 (64-456)||(15275661-15276045)
chr4 (64-456)||(15379273-15379657)
chr4 (224-456)||(27156515-27156745)
chr4 (268-456)||(20331667-20331854)
chr4 (73-216)||(20331528-20331672)
chr4 (15-138)||(15379164-15379289)
chr4 (8-138)||(1907446-1907578)
chr4 (341-456)||(1907114-1907229)
chr4 (8-124)||(54840684-54840799)
chr4 (13-124)||(14105838-14105948)
chr4 (13-124)||(20331352-20331462)
chr4 (13-124)||(30761059-30761169)
chr4 (8-133)||(15235045-15235172)
chr4 (13-124)||(14752375-14752485)
chr4 (13-124)||(18793500-18793610)
chr4 (11-138)||(15275548-15275677)
chr4 (8-135)||(17020481-17020609)
chr4 (13-124)||(5013177-5013287)
chr4 (13-124)||(33666661-33666771)
chr4 (13-135)||(14672397-14672520)
chr4 (13-135)||(15399038-15399161)
chr4 (13-106)||(21976958-21977050)
chr4 (13-106)||(39857927-39858020)
chr4 (8-125)||(15235234-15235353)
chr4 (8-135)||(24813975-24814104)
chr4 (282-456)||(24813642-24813816)
chr4 (8-106)||(24119896-24119994)
chr4 (15-124)||(6577137-6577245)
chr4 (18-106)||(31119434-31119521)
chr4 (13-135)||(24585053-24585177)
chr4 (13-138)||(5701810-5701937)
chr4 (13-135)||(36323137-36323261)
chr4 (13-135)||(36337346-36337470)
chr4 (13-124)||(40098493-40098603)
chr4 (15-67)||(15379103-15379155)
chr4 (64-124)||(17020434-17020494)
chr4 (69-124)||(15399153-15399208)
chr4 (13-62)||(18793440-18793489)
chr4 (69-126)||(24585169-24585226)
chr4 (38-175)||(15399300-15399442)
chr4 (82-125)||(21977356-21977399)
chr4 (82-125)||(31119141-31119184)
chr4 (69-124)||(34181869-34181924)
chr4 (69-124)||(36323253-36323308)
chr4 (69-124)||(36337462-36337517)
chr4 (82-125)||(39858265-39858308)
chr4 (64-124)||(14672350-14672410)
chr4 (82-125)||(5702183-5702226)
chr4 (82-125)||(6577492-6577535)
chr4 (82-125)||(14106256-14106299)
chr4 (82-125)||(14752026-14752069)
chr4 (82-125)||(18793153-18793196)
chr4 (82-125)||(24120235-24120278)
chr4 (82-125)||(24812407-24812450)
chr4 (77-120)||(24813069-24813111)
chr4 (82-125)||(30761475-30761518)
chr4 (82-125)||(33666312-33666355)
chr4 (82-125)||(34181588-34181631)
chr4 (82-125)||(36322841-36322884)
chr4 (82-125)||(36337050-36337093)
chr4 (79-112)||(15399223-15399256)
chr4 (38-106)||(17020274-17020342)
chr4 (38-106)||(24585256-24585324)
[»] chr2 (131 HSPs)
chr2 (37-456)||(34267908-34268330)
chr2 (64-456)||(21696205-21696596)
chr2 (89-456)||(37678939-37679305)
chr2 (89-456)||(37694204-37694570)
chr2 (8-456)||(3789278-3789726)
chr2 (73-456)||(28889067-28889449)
chr2 (73-456)||(23117609-23117991)
chr2 (73-456)||(21670198-21670580)
chr2 (75-456)||(34161676-34162058)
chr2 (89-456)||(37384490-37384857)
chr2 (73-456)||(37932212-37932592)
chr2 (73-456)||(39896904-39897286)
chr2 (73-456)||(27123335-27123719)
chr2 (89-456)||(253692-254059)
chr2 (111-456)||(31867874-31868216)
chr2 (89-456)||(19409525-19409891)
chr2 (73-456)||(34297984-34298367)
chr2 (73-456)||(34868469-34868852)
chr2 (89-456)||(22921185-22921551)
chr2 (73-456)||(31883106-31883488)
chr2 (73-454)||(12709647-12710029)
chr2 (96-456)||(16822386-16822745)
chr2 (96-456)||(16898735-16899094)
chr2 (96-456)||(32056587-32056946)
chr2 (73-456)||(12593649-12594034)
chr2 (96-456)||(13929657-13930018)
chr2 (153-456)||(27427577-27427880)
chr2 (89-456)||(37944905-37945272)
chr2 (73-456)||(11628210-11628592)
chr2 (73-456)||(40240358-40240743)
chr2 (38-456)||(12662304-12662723)
chr2 (38-456)||(20844728-20845153)
chr2 (64-456)||(27397170-27397554)
chr2 (64-456)||(19449433-19449819)
chr2 (268-456)||(16168313-16168500)
chr2 (268-456)||(27783058-27783245)
chr2 (268-456)||(27810538-27810725)
chr2 (268-456)||(39045101-39045289)
chr2 (73-216)||(9343068-9343212)
chr2 (268-452)||(9343207-9343390)
chr2 (73-216)||(16168495-16168639)
chr2 (73-216)||(27783240-27783384)
chr2 (73-216)||(27810720-27810864)
chr2 (73-216)||(39044962-39045106)
chr2 (13-127)||(11628034-11628147)
chr2 (8-135)||(28889682-28889810)
chr2 (8-126)||(31867182-31867299)
chr2 (8-124)||(3789905-3790020)
chr2 (13-124)||(16168705-16168815)
chr2 (13-124)||(27810930-27811040)
chr2 (13-124)||(34868913-34869023)
chr2 (13-124)||(37678747-37678857)
chr2 (13-124)||(37694012-37694122)
chr2 (8-124)||(34267003-34267118)
chr2 (8-124)||(39897352-39897467)
chr2 (13-124)||(9342892-9343002)
chr2 (13-124)||(19409333-19409443)
chr2 (13-124)||(39044786-39044896)
chr2 (11-138)||(19449320-19449449)
chr2 (13-135)||(12662863-12662986)
chr2 (8-138)||(21696089-21696221)
chr2 (282-456)||(3790479-3790653)
chr2 (13-124)||(37384939-37385049)
chr2 (13-106)||(16822245-16822337)
chr2 (13-106)||(16899143-16899235)
chr2 (13-106)||(27123745-27123838)
chr2 (13-106)||(32056995-32057087)
chr2 (8-135)||(3790191-3790320)
chr2 (13-124)||(253500-253610)
chr2 (13-124)||(27783507-27783617)
chr2 (13-124)||(37944713-37944823)
chr2 (13-124)||(40240809-40240919)
chr2 (13-124)||(12594100-12594210)
chr2 (13-135)||(12709411-12709535)
chr2 (13-135)||(23118224-23118348)
chr2 (11-138)||(27397538-27397664)
chr2 (13-135)||(39897638-39897762)
chr2 (13-138)||(31883540-31883667)
chr2 (8-69)||(27427182-27427243)
chr2 (13-127)||(21670019-21670135)
chr2 (13-105)||(34266768-34266862)
chr2 (13-138)||(22920990-22921117)
chr2 (22-138)||(27397596-27397713)
chr2 (13-62)||(34162249-34162298)
chr2 (64-124)||(12662816-12662876)
chr2 (36-135)||(31866911-31867012)
chr2 (73-135)||(34267418-34267480)
chr2 (73-135)||(34267535-34267597)
chr2 (79-124)||(27427313-27427358)
chr2 (44-124)||(13929489-13929568)
chr2 (69-124)||(20845245-20845300)
chr2 (82-125)||(21669739-21669782)
chr2 (69-124)||(28889635-28889690)
chr2 (82-125)||(34298726-34298769)
chr2 (82-125)||(40241224-40241267)
chr2 (83-125)||(27124144-27124186)
chr2 (73-135)||(31867426-31867488)
chr2 (73-135)||(31867543-31867605)
chr2 (73-135)||(34267184-34267246)
chr2 (73-135)||(34267301-34267363)
chr2 (73-139)||(34267769-34267835)
chr2 (22-87)||(19449270-19449337)
chr2 (82-125)||(253091-253134)
chr2 (69-124)||(3790144-3790199)
chr2 (77-120)||(3791161-3791203)
chr2 (82-125)||(3791635-3791678)
chr2 (82-125)||(12594455-12594498)
chr2 (82-125)||(12709123-12709166)
chr2 (82-125)||(13929170-13929213)
chr2 (82-125)||(16169059-16169102)
chr2 (82-125)||(16821896-16821939)
chr2 (82-125)||(22920710-22920753)
chr2 (69-120)||(23118181-23118232)
chr2 (82-125)||(27811285-27811328)
chr2 (82-125)||(31866602-31866645)
chr2 (69-124)||(31867004-31867059)
chr2 (82-125)||(34162603-34162646)
chr2 (82-125)||(37385355-37385398)
chr2 (82-125)||(37678459-37678502)
chr2 (82-125)||(37693724-37693767)
chr2 (82-125)||(37944426-37944469)
chr2 (82-125)||(39044437-39044480)
chr2 (69-124)||(39897591-39897646)
chr2 (82-125)||(39898129-39898172)
chr2 (73-139)||(34267652-34267718)
chr2 (90-151)||(27427504-27427564)
chr2 (89-125)||(19409051-19409087)
chr2 (12-68)||(19449200-19449255)
chr2 (89-125)||(27783862-27783898)
chr2 (38-106)||(31867743-31867811)
chr2 (89-125)||(31883850-31883886)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (13-456)||(51645061-51645507)
chr1 (17-456)||(16201010-16201450)
chr1 (64-456)||(20333443-20333836)
chr1 (8-456)||(28591920-28592369)
chr1 (8-456)||(28156544-28156993)
chr1 (73-456)||(14691955-14692336)
chr1 (73-456)||(14694637-14695018)
chr1 (73-456)||(14697321-14697702)
chr1 (73-456)||(14700002-14700383)
chr1 (13-456)||(41786311-41786753)
chr1 (64-456)||(20467623-20468020)
chr1 (73-452)||(10969486-10969865)
chr1 (37-456)||(21890749-21891169)
chr1 (73-456)||(3647986-3648376)
chr1 (73-456)||(10951931-10952314)
chr1 (8-138)||(20468004-20468136)
chr1 (8-135)||(20333329-20333456)
chr1 (11-138)||(16200944-16201072)
chr1 (8-124)||(28592429-28592544)
chr1 (13-135)||(14691599-14691722)
chr1 (13-135)||(14694281-14694404)
chr1 (13-135)||(14696965-14697088)
chr1 (13-135)||(14699646-14699769)
chr1 (13-135)||(14702337-14702460)
chr1 (13-135)||(21890077-21890200)
chr1 (13-124)||(3648442-3648552)
chr1 (13-106)||(10952397-10952490)
chr1 (13-135)||(10969977-10970101)
chr1 (13-135)||(28157164-28157288)
chr1 (13-124)||(28592604-28592714)
chr1 (22-135)||(21890264-21890378)
chr1 (64-124)||(21890187-21890247)
chr1 (8-135)||(20333033-20333160)
chr1 (12-106)||(20332977-20333072)
chr1 (64-124)||(14691709-14691769)
chr1 (64-124)||(14694391-14694451)
chr1 (64-124)||(14697075-14697135)
chr1 (64-124)||(14699756-14699816)
chr1 (64-124)||(14702447-14702507)
chr1 (73-124)||(21890550-21890601)
chr1 (69-124)||(28157117-28157172)
chr1 (82-125)||(3648858-3648901)
chr1 (82-125)||(10952735-10952778)
chr1 (82-125)||(10970347-10970390)
chr1 (22-106)||(20332811-20332896)
chr1 (82-125)||(28157655-28157698)
chr1 (82-125)||(41785908-41785951)
chr1 (82-125)||(51645744-51645787)
chr1 (36-106)||(20331945-20332015)
chr1 (38-106)||(14691861-14691929)
chr1 (38-106)||(14694543-14694611)
chr1 (38-106)||(14697227-14697295)
chr1 (38-106)||(14699908-14699976)
chr1 (72-124)||(16200706-16200758)
chr1 (12-68)||(20333213-20333268)
chr1 (12-68)||(20468197-20468252)
[»] chr8 (89 HSPs)
chr8 (73-456)||(21341186-21341568)
chr8 (73-456)||(14569969-14570353)
chr8 (73-456)||(2130283-2130666)
chr8 (73-456)||(31361369-31361752)
chr8 (64-456)||(19654328-19654724)
chr8 (38-456)||(16260752-16261173)
chr8 (90-456)||(27601946-27602311)
chr8 (12-456)||(33249177-33249625)
chr8 (90-456)||(22139728-22140102)
chr8 (73-456)||(15774388-15774773)
chr8 (73-456)||(9361443-9361828)
chr8 (38-456)||(19910144-19910565)
chr8 (73-456)||(18716296-18716681)
chr8 (38-456)||(18797523-18797944)
chr8 (73-456)||(44567821-44568204)
chr8 (73-456)||(29836163-29836547)
chr8 (73-456)||(12085725-12086110)
chr8 (73-456)||(19681296-19681679)
chr8 (89-456)||(31482889-31483253)
chr8 (90-456)||(19694930-19695299)
chr8 (73-456)||(33265560-33265950)
chr8 (73-380)||(22388878-22389190)
chr8 (64-456)||(22073926-22074310)
chr8 (268-456)||(19201578-19201765)
chr8 (268-456)||(28355147-28355334)
chr8 (73-216)||(19201439-19201583)
chr8 (73-216)||(28355008-28355152)
chr8 (8-124)||(19653440-19653558)
chr8 (15-138)||(22073817-22073942)
chr8 (8-124)||(9361894-9362009)
chr8 (13-138)||(19909883-19910009)
chr8 (13-124)||(19681745-19681855)
chr8 (13-124)||(31482697-31482807)
chr8 (8-135)||(15775006-15775135)
chr8 (8-135)||(2129922-2130050)
chr8 (8-138)||(19653860-19653992)
chr8 (8-135)||(27601628-27601757)
chr8 (282-456)||(15775294-15775468)
chr8 (13-124)||(18716747-18716857)
chr8 (8-135)||(14570586-14570714)
chr8 (8-127)||(16261319-16261439)
chr8 (13-106)||(12085549-12085642)
chr8 (28-135)||(22388537-22388645)
chr8 (13-135)||(18798083-18798206)
chr8 (13-135)||(29836663-29836787)
chr8 (13-135)||(33249914-33250038)
chr8 (22-124)||(28354841-28354942)
chr8 (13-135)||(9362180-9362304)
chr8 (13-135)||(19695492-19695611)
chr8 (64-127)||(19653976-19654039)
chr8 (22-135)||(21341017-21341131)
chr8 (13-135)||(21340355-21340479)
chr8 (22-124)||(19654110-19654213)
chr8 (22-135)||(21340781-21340895)
chr8 (8-135)||(22140235-22140361)
chr8 (69-135)||(33249856-33249922)
chr8 (73-138)||(19654279-19654344)
chr8 (64-124)||(15774959-15775019)
chr8 (64-124)||(18798036-18798096)
chr8 (8-68)||(19653620-19653680)
chr8 (64-124)||(19695445-19695505)
chr8 (64-124)||(22140188-22140248)
chr8 (79-124)||(16261265-16261310)
chr8 (22-124)||(33249689-33249792)
chr8 (15-69)||(33266131-33266187)
chr8 (64-124)||(33249809-33249869)
chr8 (69-124)||(2130042-2130097)
chr8 (69-124)||(9362133-9362188)
chr8 (69-124)||(14570539-14570594)
chr8 (69-124)||(21340471-21340526)
chr8 (82-125)||(28354605-28354648)
chr8 (69-124)||(29836616-29836671)
chr8 (82-125)||(31362116-31362159)
chr8 (82-125)||(31482346-31482389)
chr8 (75-124)||(19653749-19653798)
chr8 (89-125)||(19200983-19201019)
chr8 (64-124)||(19909993-19910052)
chr8 (64-124)||(22388632-22388692)
chr8 (82-125)||(9362596-9362639)
chr8 (82-125)||(12085269-12085312)
chr8 (82-125)||(18717102-18717145)
chr8 (82-125)||(19682161-19682204)
chr8 (82-125)||(29837092-29837135)
chr8 (82-125)||(44568628-44568671)
chr8 (12-62)||(22073694-22073743)
chr8 (38-106)||(2130189-2130257)
chr8 (38-106)||(14570379-14570447)
chr8 (38-106)||(15774799-15774867)
chr8 (73-124)||(21340712-21340764)
[»] scaffold0322 (5 HSPs)
scaffold0322 (11-456)||(12888-13339)
scaffold0322 (268-456)||(2494-2681)
scaffold0322 (73-216)||(2676-2820)
scaffold0322 (13-124)||(2886-2996)
scaffold0322 (82-125)||(3302-3345)
[»] scaffold0792 (3 HSPs)
scaffold0792 (73-456)||(3648-4035)
scaffold0792 (13-124)||(3472-3582)
scaffold0792 (82-125)||(3184-3227)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (73-456)||(12853-13238)
[»] scaffold0237 (3 HSPs)
scaffold0237 (73-456)||(7978-8360)
scaffold0237 (13-138)||(7799-7926)
scaffold0237 (82-125)||(7511-7554)
[»] scaffold0547 (4 HSPs)
scaffold0547 (89-456)||(8710-9080)
scaffold0547 (8-134)||(8345-8473)
scaffold0547 (79-124)||(8476-8521)
scaffold0547 (38-106)||(8613-8681)
[»] scaffold0159 (5 HSPs)
scaffold0159 (89-456)||(2229-2596)
scaffold0159 (89-374)||(23649-23935)
scaffold0159 (17-127)||(2038-2150)
scaffold0159 (13-127)||(23454-23570)
scaffold0159 (82-125)||(1746-1789)
[»] scaffold0143 (7 HSPs)
scaffold0143 (73-456)||(34109-34497)
scaffold0143 (73-456)||(10756-11140)
scaffold0143 (13-124)||(11206-11316)
scaffold0143 (8-135)||(34730-34856)
scaffold0143 (64-124)||(34683-34743)
scaffold0143 (82-125)||(11561-11604)
scaffold0143 (38-106)||(34523-34591)
[»] scaffold0685 (3 HSPs)
scaffold0685 (96-385)||(1123-1412)
scaffold0685 (82-125)||(693-736)
scaffold0685 (43-106)||(1011-1074)
[»] scaffold0240 (4 HSPs)
scaffold0240 (38-456)||(23970-24393)
scaffold0240 (13-135)||(23708-23831)
scaffold0240 (69-124)||(23823-23878)
scaffold0240 (79-112)||(23893-23926)
[»] scaffold0038 (3 HSPs)
scaffold0038 (73-456)||(14779-15164)
scaffold0038 (8-124)||(15230-15345)
scaffold0038 (82-125)||(15578-15621)
[»] scaffold0336 (5 HSPs)
scaffold0336 (73-456)||(16413-16801)
scaffold0336 (8-135)||(16856-16982)
scaffold0336 (13-135)||(17153-17277)
scaffold0336 (69-124)||(17106-17161)
scaffold0336 (82-125)||(17644-17687)
[»] scaffold0477 (3 HSPs)
scaffold0477 (73-385)||(13009-13324)
scaffold0477 (8-124)||(12828-12943)
scaffold0477 (82-125)||(12552-12595)
[»] scaffold0109 (4 HSPs)
scaffold0109 (64-456)||(28129-28513)
scaffold0109 (11-138)||(28555-28684)
scaffold0109 (64-138)||(28497-28571)
scaffold0109 (15-67)||(28689-28741)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (245-452)||(613-820)
[»] scaffold0241 (3 HSPs)
scaffold0241 (64-456)||(25605-25989)
scaffold0241 (69-138)||(25552-25621)
scaffold0241 (97-138)||(25522-25563)
[»] scaffold0099 (3 HSPs)
scaffold0099 (153-430)||(39724-40011)
scaffold0099 (8-135)||(39329-39459)
scaffold0099 (69-124)||(39451-39507)
[»] scaffold0089 (4 HSPs)
scaffold0089 (36-288)||(6807-7061)
scaffold0089 (17-69)||(7266-7318)
scaffold0089 (17-69)||(14630-14682)
scaffold0089 (69-124)||(7151-7206)
[»] scaffold0489 (6 HSPs)
scaffold0489 (8-135)||(2077-2203)
scaffold0489 (13-135)||(4901-5025)
scaffold0489 (13-67)||(2021-2075)
scaffold0489 (69-124)||(5017-5072)
scaffold0489 (82-125)||(4489-4532)
scaffold0489 (89-122)||(2274-2307)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 149)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 456
Target Start/End: Original strand, 27283300 - 27283748
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27283300 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacaaatagacagatacaagctgttcttggattt 27283399  T
Q  108 gaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27283400 gaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattagttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggt 27283499  T
Q  208 agaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatg 307  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283500 agaaattgaccaatattattgactcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagattgatgttgacattggaaatgcaatatgtatg 27283599  T
Q  308 gatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacaca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27283600 gatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacaca 27283699  T
Q  408 gtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27283700 gttttgaagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 27283748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 27210096 - 27209712
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt-gacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27210096 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattagtttttttgacaaaatataga 27209997  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  27209996 ttgaaactgacttgacgtcgattcaatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcataaggttttgacagagaacatgacataagtattgaatt 27209897  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| || ||| |||    
T  27209896 gagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatg 27209797  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27209796 cttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 27209712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 27239132 - 27239516
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt-ttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27239132 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattagtttttttgacaaaatataga 27239231  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  27239232 ttgaaactgacttgacgtcgattcaatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcataaggttttgacagagaacatgacataagtattgaatt 27239331  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| || ||| |||    
T  27239332 gagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatg 27239431  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27239432 cttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 27239516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 456
Target Start/End: Original strand, 16936948 - 16937392
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||| ||||||||| || ||    
T  16936948 aaggcaaatagataggtgcgagcttgttcttggatgtgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtgcaagctgctcttggatt-gagct 16937046  T
Q  113 agccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttt---tgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtag 209  Q
    |||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16937047 agccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgatttgaaaggtag 16937146  T
Q  210 aaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatgga 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16937147 aaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatgga 16937246  T
Q  310 tgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagt 409  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||       
T  16937247 tgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgac 16937346  T
Q  410 ttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16937347 ttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 16937392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 8 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 27014985 - 27014537
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||     
T  27014985 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt- 27014887  T
Q  108 gaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt--tttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaag 205  Q
    || |||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||    
T  27014886 gagctagccacttgaccaaacagaaacatattcacgggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttaacgtcgattcgaattgaaag 27014787  T
Q  206 gtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgta 305  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  27014786 gcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcagtatgca 27014687  T
Q  306 tggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 405  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||    
T  27014686 cggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggca 27014587  T
Q  406 cagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27014586 cgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 27014537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 27026338 - 27025955
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27026338 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttgacaaaatataggt 27026239  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27026238 tgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattg 27026139  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||    
T  27026138 agactaatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgc 27026039  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27026038 ttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacaaagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 27025955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 15405533 - 15405917
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt-ttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  15405533 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatatagg 15405632  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15405633 ttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagtt 15405732  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  15405733 gagactgttgttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 15405832  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15405833 cttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 15405917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 15417320 - 15417704
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt-ttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  15417320 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatatagg 15417419  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15417420 ttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagtt 15417519  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  15417520 gagactgttgttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 15417619  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15417620 cttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 15417704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 13291947 - 13292331
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt-ttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  13291947 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatatagg 13292046  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13292047 ttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaacattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaatt 13292146  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| |||    
T  13292147 gagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatg 13292246  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13292247 cttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacaatttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 13292331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 26927952 - 26927565
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt-----gacaaaata 167  Q
    ||||||||||  |||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||     |||||||||    
T  26927952 aagcaaataggtaggttcaagctgctcttggatt-gagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattggtttttttttttgacaaaata 26927854  T
Q  168 tagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattg 267  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26927853 tagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattg 26927754  T
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  26927753 aattgagactgatgttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatg 26927654  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26927653 aatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 26927565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 22 - 456
Target Start/End: Original strand, 22927803 - 22928241
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccact 119  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||| |||| | ||   ||| |||||||  || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22927803 agacaggtacgagct-gctcttggattcgaactggtaactcgatcgataacataagcaaactgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccact 22927901  T
Q  120 tgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttg---acaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 216  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22927902 tgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttacaaaatataggttgaaattgacttgatgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 22928001  T
Q  217 ccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatata 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22928002 ccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatata 22928101  T
Q  317 acagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcgg 416  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||  ||||||  |||||||||||| || ||| |    
T  22928102 acagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtgatgcatgactgttggcgatttgtagacacaattccgcag 22928201  T
Q  417 agacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  22928202 agacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctc 22928241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 16757017 - 16756634
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt-gacaaaatataga 171  Q
    ||||||||||  |||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16757017 aagcaaataggtaggttcaagctgctcttggatt-gagctagccacttgaccaagcagaaacagattcactggggattagtttttttgacaaaatataga 16756919  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacag-agaacctgacatgaggattgaat 270  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16756918 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaacgtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttt-gacaggagaacctgacatgagtattgaat 16756820  T
Q  271 tgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggat 370  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||    
T  16756819 tgagactgatgtcgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaat 16756720  T
Q  371 gcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16756719 gcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 16756634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 29508618 - 29508234
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt--tttgacaaaatatag 170  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29508618 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatag 29508519  T
Q  171 attgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaat 270  Q
    ||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  29508518 attgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaat 29508419  T
Q  271 tgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggat 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| ||    
T  29508418 tgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcataattatgcatgtatgaat 29508319  T
Q  371 gcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29508318 gcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 29508234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 26793009 - 26792629
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26793009 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagtcacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttt--gacaaaatatagat 26792912  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26792911 tgagattgacttgacgtcgattcgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggcttacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 26792812  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  26792811 agactgatgttgacattggaaatgcaatattcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 26792712  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26792711 ttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 26792629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 29556754 - 29556369
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttt---tgacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||   |||| |||||||    
T  29556754 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatata 29556655  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | ||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29556654 gattgagattgacttgacatcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaa 29556555  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  29556554 ttgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 29556455  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29556454 tgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 29556369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 29580229 - 29579849
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29580229 aagcaaattgataggtacaagctgctcttggacttgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatacagat 29580130  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29580129 tgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattg 29580030  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  29580029 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 29579930  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggc 454  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29579929 ttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggc 29579849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 13517195 - 13517580
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttt---tgacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   |||| |||||||    
T  13517195 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatata 13517294  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  |||||    
T  13517295 gattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaa 13517394  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  13517395 ttgagactgatattgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 13517494  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13517495 tgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctc 13517580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 27032218 - 27031834
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt-gacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  27032218 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgagctagccacttgaccgaacagaaacaaattcagaggggattagtttttttgacaaaatatagg 27032119  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27032118 ttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgagtt 27032019  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  27032018 gagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 27031919  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||| |||||||||  ||||||  |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||    
T  27031918 tttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagcattgggcacgtaatggctc 27031834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 27201393 - 27201010
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt-gacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27201393 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcaccggggattggtttttttgacaaaatataga 27201294  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||| | |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27201293 ttgagattgacctgacatcgatttgatttgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaatt 27201194  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  27201193 gagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 27201094  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27201093 cttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 27201010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 27247840 - 27248223
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt-ttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27247840 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcaccggggattggtttttttgacaaaatataga 27247939  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||| | |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27247940 ttgagattgacctgacatcgatttgatttgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaatt 27248039  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  27248040 gagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 27248139  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27248140 cttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 27248223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 28167692 - 28167307
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt---gacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||    
T  28167692 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattggtttttttttgacaaaatata 28167593  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  28167592 gattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaa 28167493  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  28167492 ttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 28167393  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28167392 tgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 28167307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Original strand, 33369443 - 33369816
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt-------ttgacaaaatatagattgaaactga 181  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| | |||    
T  33369443 acaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttttttgacaaaatatagattgagattga 33369542  T
Q  182 cttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatg 281  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  33369543 cttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatg 33369642  T
Q  282 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 381  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  33369643 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33369742  T
Q  382 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33369743 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 33369816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 24298765 - 24299147
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  24298765 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacaaattcacaggggattagtttt--gacaaaatatagat 24298862  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagg-attgaatt 271  Q
    ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||    
T  24298863 tgagattgacttgacgtcggtttgatttgaaaggtagaaattaaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagttattgagtt 24298962  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  24298963 gagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 24299062  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  24299063 cttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctc 24299147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 96 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 27492311 - 27491952
Alignment:
Q  96 gttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattc 195  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  27492311 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattt 27492212  T
Q  196 gatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaat 295  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27492211 gaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatgttgacattggaaat 27492112  T
Q  296 gcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 395  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  27492111 gcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 27492012  T
Q  396 tttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  27492011 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctc 27491952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 74 - 456
Target Start/End: Original strand, 26665640 - 26666023
Alignment:
Q  74 agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt--gacaaaatataga 171  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  26665640 agcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacctgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttctgacaaaatataga 26665739  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||| | |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26665740 ttgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagttagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaatt 26665839  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  26665840 gagactgatgttgacgttggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 26665939  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||| ||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26665940 cttgtaatgtatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 26666023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 74 - 456
Target Start/End: Original strand, 26771611 - 26771994
Alignment:
Q  74 agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt--gacaaaatataga 171  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  26771611 agcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacctgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttctgacaaaatataga 26771710  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||| | |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26771711 ttgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagttagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaatt 26771810  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  26771811 gagactgatgttgacgttggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 26771910  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||| ||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26771911 cttgtaatgtatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 26771994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 38 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 24870941 - 24870521
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaat--agaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||  || || ||||||   |||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||   |||||    
T  24870941 gttcttggatgcgaactggtaactcgaccggaaacataaacaaataagtaggttcaagctgctcttggatt-gagctagccacttgaccaaaatcagaaa 24870843  T
Q  134 caaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctca 233  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24870842 cagattcactggggattg-ttttttgacaaagtatagattgaaattgacttgacgttgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgacattattggctca 24870744  T
Q  234 caaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgc 333  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24870743 caaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgc 24870644  T
Q  334 atgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacattt 433  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  | ||||  |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |     
T  24870643 atgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactg 24870544  T
Q  434 gagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  24870543 gagtattgggcacgtaatggctc 24870521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 16681356 - 16680972
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt--tttgacaaaatatag 170  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16681356 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatag 16681257  T
Q  171 attgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaat 270  Q
    ||||| | ||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  16681256 attgagattgacttgacatcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgatatgagtatcgaat 16681157  T
Q  271 tgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggat 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||    
T  16681156 tgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaat 16681057  T
Q  371 gcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  16681056 gcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctc 16680972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 8898675 - 8899063
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt----gacaaaatat 168  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  8898675 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggttttttatttgacaaaatat 8898774  T
Q  169 agattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt--gaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggatt 266  Q
    || |||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  8898775 aggttgagattgacttgacatcgatttggtttgaaaggtagaaattaagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatc 8898874  T
Q  267 gaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcat 366  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  8898875 gaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtat 8898974  T
Q  367 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8898975 gaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 8899063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 96 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 4532466 - 4532107
Alignment:
Q  96 gttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattc 195  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  4532466 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccgaacaaaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattt 4532367  T
Q  196 gatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaat 295  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4532366 gaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtgttgaattgagactgatgttgacattggaaat 4532267  T
Q  296 gcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 395  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  4532266 gcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 4532167  T
Q  396 tttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4532166 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 4532107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 26109402 - 26109787
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt---gacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  26109402 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttgttctgacaaaatata 26109501  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  26109502 gattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaa 26109601  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  26109602 ttgagactgatgttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacgatttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 26109701  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26109702 tgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 26109787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 4538760 - 4539145
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattg-gtttt--ttgacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  4538760 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaatata 4538859  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4538860 gattgagattgacttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgattgatattattggatcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaa 4538959  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  4538960 ttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 4539059  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4539060 tgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 4539145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 96 - 456
Target Start/End: Original strand, 30551007 - 30551366
Alignment:
Q  96 gttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattc 195  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  30551007 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattt 30551106  T
Q  196 gatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaat 295  Q
    || ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30551107 gaattgaaagataaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaat 30551206  T
Q  296 gcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 395  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  30551207 gcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 30551306  T
Q  396 tttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||   ||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  30551307 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctc 30551366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 28214666 - 28214281
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattg-gtttt--ttgacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||    
T  28214666 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaacata 28214567  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28214566 gattgagattgacttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgattgatattattggatcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaa 28214467  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  28214466 ttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 28214367  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28214366 tgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 28214281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 112 - 456
Target Start/End: Original strand, 27355124 - 27355469
Alignment:
Q  112 tagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt--ttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtag 209  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| |     
T  27355124 tagccacttgaccaagtagaaacagattcactggggattagttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcaa 27355223  T
Q  210 aaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatgga 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27355224 aaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacgga 27355323  T
Q  310 tgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagt 409  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||       
T  27355324 tgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgac 27355423  T
Q  410 ttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27355424 ttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 27355469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 69 - 456
Target Start/End: Original strand, 22201161 - 22201537
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaa-ttcactggggattggttttttgacaaaata 167  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||      || ||||||||    
T  22201161 acagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgactaaacagaaacatagttcactggggatt------ttaacaaaata 22201254  T
Q  168 tagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt-gaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggatt 266  Q
     ||||||| | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||    
T  22201255 cagattgatattgacttgacattgatttgatttgaaaggtagaaatttgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaacttgacataagcatt 22201354  T
Q  267 gaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcat 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||    
T  22201355 gaattgagacagatgttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtat 22201454  T
Q  367 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||       ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  22201455 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcaatttgta-agacagtttc------tcagacaagacatcggagtgttgggcacgtagtggctc 22201537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 79 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 4780099 - 4779724
Alignment:
Q  79 atagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaac 178  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||| || |||| ||||||||| ||  |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  4780099 atagacgggtacaagctgctcttggatt-gagctagtcacttgaccaaacggaaacatattcaccggggattggtttgttgacaaaatatagattgaggt 4780001  T
Q  179 tgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacag 278  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |    
T  4780000 tgacttgacgtcgacttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtatcgaattgagactg 4779901  T
Q  279 atgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  4779900 atgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacggtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 4779801  T
Q  379 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  4779800 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaattttgggcacgtagtggctc 4779724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 14138408 - 14138787
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt-------ttgacaaaa 165  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||    
T  14138408 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttttttgacaaaa 14138507  T
Q  166 tatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggat 265  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14138508 tatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtat 14138607  T
Q  266 tgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgca 365  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||          || |    
T  14138608 cgaattgagactgatgttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgca----------tgta 14138697  T
Q  366 tggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    || ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14138698 tgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 14138787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 82 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 20131696 - 20131333
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaa-ttcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactg 180  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||      || |||||||| ||||||| | ||    
T  20131696 gacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgactaaacagaaacatagttcactggggatt------ttaacaaaatacagattgatattg 20131603  T
Q  181 acttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt-gaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacaga 279  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  20131602 acttgacattgatttgatttgaaaggtagaaatttgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaacttgacataagcattgaattgagacaga 20131503  T
Q  280 tgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaat 379  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20131502 tgttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatggatgcttgaaat 20131403  T
Q  380 gcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||       ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  20131402 gcatgatggttggcaatttgta-agacagtttc------tcagacaagacatcggagtgttgggcacgtagtggctc 20131333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 4764952 - 4764575
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt--tttgacaaaat 166  Q
    |||||| || |||||| || |||||||| ||||||||| || |||| ||||||||| ||  |||||| ||| || ||||||||||||  |||||||||||    
T  4764952 acagaaacagatagacgggtacaagctgctcttggatt-gagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggggattggtttgttttgacaaaat 4764854  T
Q  167 atagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggatt 266  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  4764853 atagattgagattgacttaacgtcgattcgaattgaaaggcagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatc 4764754  T
Q  267 gaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcat 366  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||          || ||    
T  4764753 gaattgagactgatgttgacattgaaaatgcaatatacacggaggatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgca----------tgtat 4764664  T
Q  367 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4764663 gaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 4764575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 153 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 27064606 - 27064314
Alignment:
Q  153 ttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaac 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27064606 ttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaactgaaaggcagaaattgaccgataacattggctcacaaggttttgacagagaac 27064507  T
Q  253 ctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcat 352  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||     
T  27064506 ctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcatgtaatatgca- 27064408  T
Q  353 gattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtg 452  Q
             || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27064407 ---------tgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtg 27064318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 82 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 20175737 - 20175423
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaa-ttcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactg 180  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||        |||| |||||||| ||||||||| ||    
T  20175737 gacaggtacaagctgttcttggatt-gaactagccacttgaccaaacagaaacaaagttcattggga-------ttttaacaaaatacagattgaaattg 20175646  T
Q  181 acttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt--gaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacag 278  Q
    ||||||| | |||  |||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  || |||    |||||||||||| ||    
T  20175645 acttgacattgatctgatttggaaggtagaaattttgaccaataacattggctcacaaggctttgacagagaaattgtcatagacattgaattgagatag 20175546  T
Q  279 atgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 378  Q
    || |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | | ||||||||||    
T  20175545 atattgacattgggaatgcaaaatgcatggatgatataatagttttattaaatgcatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtacgaatgcttgaaa 20175446  T
Q  379 tgcatgatggttggcagtttgta 401  Q
    |||| ||||||||| | ||||||    
T  20175445 tgcacgatggttggtaatttgta 20175423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 82 - 401
Target Start/End: Original strand, 22160254 - 22160568
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaa-ttcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactg 180  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||        |||| |||||||| ||||||||| ||    
T  22160254 gacaggtacaagctgttcttggatt-gaactagccacttgaccaaacagaaacaaagttcattggga-------ttttaacaaaatacagattgaaattg 22160345  T
Q  181 acttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt--gaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacag 278  Q
    ||||||| | |||  |||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  || |||    |||||||||||| ||    
T  22160346 acttgacattgatctgatttggaaggtagaaattttgaccaataacattggctcacaaggctttgacagagaaattgtcatagacattgaattgagatag 22160445  T
Q  279 atgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 378  Q
    || |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | | ||||||||||    
T  22160446 atattgacattgggaatgcaaaatgcatggatgatataatagttttattaaatgcatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtacgaatgcttgaaa 22160545  T
Q  379 tgcatgatggttggcagtttgta 401  Q
    |||| ||||||||| | ||||||    
T  22160546 tgcacgatggttggtaatttgta 22160568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Original strand, 34457546 - 34457690
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34457546 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatataga 34457645  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 216  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34457646 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 34457690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 268 - 456
Target Start/End: Original strand, 34457685 - 34457872
Alignment:
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||    
T  34457685 aattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatg 34457784  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||| || ||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  34457785 aatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacatagtggctc 34457872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 26109228 - 26109336
Alignment:
Q  15 ggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  26109228 ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctag 26109326  T
Q  115 ccacttgacc 124  Q
    ||||||||||    
T  26109327 ccacttgacc 26109336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 8898494 - 8898609
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  8898494 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 8898592  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  8898593 gagctagccacttgacc 8898609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 28167873 - 28167758
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  28167873 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 28167775  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  28167774 gagctagccacttgacc 28167758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 28214847 - 28214732
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  28214847 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 28214749  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  28214748 gagctagccacttgacc 28214732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 33369246 - 33369361
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  33369246 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 33369344  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  33369345 gagctagccacttgacc 33369361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16681532 - 16681422
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  16681532 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 16681434  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  16681433 agtcacttgacc 16681422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 29508794 - 29508684
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  29508794 aaggcaaatagacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 29508696  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  29508695 agccacttgacc 29508684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 29556930 - 29556820
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  29556930 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 29556832  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  29556831 agtcacttgacc 29556820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 4538579 - 4538694
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  4538579 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaatagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 4538677  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  4538678 gagctagccacttgacc 4538694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 14138227 - 14138342
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  14138227 aagcaaagacaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 14138325  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  14138326 gagctagccacttgacc 14138342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 26665463 - 26665573
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| | || ||    
T  26665463 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgggcagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tcgagct 26665561  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  26665562 agccacttgacc 26665573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 26771434 - 26771544
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| | || ||    
T  26771434 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgggcagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tcgagct 26771532  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  26771533 agccacttgacc 26771544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 4532608 - 4532515
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4532608 aaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacaaatagacaggtacaagctgctcttggatt 4532515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 13517076 - 13517169
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13517076 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggacgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt 13517169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Original strand, 27622490 - 27622641
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcact-ggggattggttt--tttgacaaaatatagattgaaactgacttg 185  Q
    ||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||  | ||||| ||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27622490 acaagctgttctttggatcgaacttgccacttgaccagaaagaaagaaattgacgaggggattggtttgttttgacaaaatatatattgaaagtgacttg 27622589  T
Q  186 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaag 237  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622590 acgtcgatttaatttgaaaagtagaaattgaccaatattattggctcacaag 27622641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 282 - 456
Target Start/End: Original strand, 27622919 - 27623093
Alignment:
Q  282 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 380  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| || ||| ||| ||||||||    
T  27622919 ttgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 27623018  T
Q  381 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27623019 catgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 27623093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 15405177 - 15405300
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||     
T  15405177 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagtcaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgag 15405275  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||||||| |||| |||||||    
T  15405276 ctagccacttgagcgaacagaaaca 15405300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 15416964 - 15417087
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||     
T  15416964 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagtcaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgag 15417062  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||||||| |||| |||||||    
T  15417063 ctagccacttgagcgaacagaaaca 15417087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 30550866 - 30550958
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  30550866 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc-gacagaaacagatagccaggtacaagctgctcttggatt 30550958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24871200 - 24871080
Alignment:
Q  17 caaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga---cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaacta 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |  |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||    
T  24871200 caaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagaccaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagcta 24871102  T
Q  114 gccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  24871101 gccacttgaccgaacagaaaca 24871080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 22927020 - 22927148
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||  ||||| | |||||||     
T  22927020 aagcaaaggcaaatagacgggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaaggcaaatagacaggtgcaagccgctcttgga- 22927118  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    | || |||||||||||| |||| |||||||    
T  22927119 tcgagctagccacttgagcgaacagaaaca 22927148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27064889 - 27064781
Alignment:
Q  15 ggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactag 114  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  27064889 ggcaaatagataggtgcgagcttgtttttggatgtgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctag 27064791  T
Q  115 ccacttgacc 124  Q
     |||||||||    
T  27064790 tcacttgacc 27064781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 13291585 - 13291714
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttgga 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13291585 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga 13291684  T
Q  105 tttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |  | |||||||||||| |||| |||||||    
T  13291685 -tcaagctagccacttgagcgaacagaaaca 13291714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16757380 - 16757251
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttgga 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16757380 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga 16757281  T
Q  105 tttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     | || |||| ||||||| |||| |||||||    
T  16757280 -tcgagctagtcacttgagcgaacagaaaca 16757251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27032579 - 27032450
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttgga 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27032579 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatacgaactggttactccaccggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga 27032480  T
Q  105 tttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     | || |||||||||||| |||| |||||||    
T  27032479 -tcgagctagccacttgagcgaacagaaaca 27032450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 4765068 - 4764944
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  4765068 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcccaagctgctcttgga-tcga 4764970  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  4764969 gctagccacttgagcgaacagaaaca 4764944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 8898199 - 8898323
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  8898199 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 8898297  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  8898298 gctagccacttgagcgaacagaaaca 8898323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 24298408 - 24298532
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  24298408 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 24298506  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  24298507 gctagccacttgagcgaacagaaaca 24298532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 26793188 - 26793064
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  26793188 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 26793090  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  26793089 gctagccacttgagcgaacagaaaca 26793064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27015280 - 27015156
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  27015280 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 27015182  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||    
T  27015181 gctagccacttgagcgaatggaaaca 27015156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27201629 - 27201505
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  27201629 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 27201531  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  27201530 gctagccacttgagcgaacagaaaca 27201505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 27247604 - 27247728
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  27247604 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 27247702  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  27247703 gctagccacttgagcgaacagaaaca 27247728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 27354549 - 27354673
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  27354549 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 27354647  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  27354648 gctagccacttgagcgaacagaaaca 27354673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 34457370 - 34457480
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  34457370 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccactggagacaaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagct 34457468  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  34457469 agtcacttgacc 34457480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 14137932 - 14138059
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| |||| || | ||    
T  14137932 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttaga-tcga 14138030  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14138031 gctagccacttgagcgaacagaaacaaat 14138059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 27354844 - 27354942
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27354844 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactaggtactccactggacagaaacatatagacaggtacaagctgctcttggatt 27354942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16757501 - 16757440
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 69  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16757501 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 16757440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 27064715 - 27064630
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt 158  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27064715 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttt 27064630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 211
Target Start/End: Original strand, 4755693 - 4755824
Alignment:
Q  79 atagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaac 178  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||| || |||| ||||||||| ||  |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  4755693 atagacgggtacaagctgctcttggatt-gagctagtcacttgaccaaacggaaacatattcaccggggattggtttgttgacaaaatatagattgaggt 4755791  T
Q  179 tgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaa 211  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  4755792 tgacttgacgtcgacttgaattgaaaggtagaa 4755824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 26928309 - 26928185
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  26928309 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 26928211  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||| ||| |||| |||||||    
T  26928210 gctagccacctgagcgaacagaaaca 26928185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27026695 - 27026571
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  27026695 aaggcaaatagacaggtgcgagcttattcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 27026597  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  27026596 gctagccacttgagcgaacagaaaca 27026571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 33368950 - 33369075
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaa----gcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      |||||||||||| ||||||| ||||||| | |    
T  33368950 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcg 33369048  T
Q  109 aactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |  ||||||||||| |||| |||||||    
T  33369049 agttagccacttgagcgaacagaaaca 33369075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 127
Target Start/End: Original strand, 4755576 - 4755683
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | || ||||||||    
T  4755576 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccac 4755674  T
Q  119 ttgaccgaa 127  Q
    |||| ||||    
T  4755675 ttgagcgaa 4755683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 4780216 - 4780109
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | || ||||||||    
T  4780216 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccac 4780118  T
Q  119 ttgaccgaa 127  Q
    |||| ||||    
T  4780117 ttgagcgaa 4780109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 29580465 - 29580342
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||| | ||||||| ||||||| | ||    
T  29580465 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttctaggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacagacgcaagctgctcttgga-tcga 29580367  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaac 134  Q
     |||||||||||| |||| ||||||    
T  29580366 gctagccacttgagcgaacagaaac 29580342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 28168168 - 28168046
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc--ggacaga-agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||||||| | ||||||| ||||||| | ||    
T  28168168 aaggcaaatagacaggtgcgagcatgttcttggatgcgaactggttactccaccggggacaaatacaaaatagacagacgcaagctgctcttgga-tcga 28168070  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaa 133  Q
     |||||||||||| |||| |||||    
T  28168069 gctagccacttgagcgaacagaaa 28168046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 138
Target Start/End: Original strand, 22201068 - 22201172
Alignment:
Q  36 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaa 133  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||   ||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  22201068 ttgttcttgaatttgaactggttactcgaccgataacagaaataaattgacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaa 22201167  T
Q  134 caaat 138  Q
    |||||    
T  22201168 caaat 22201172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 135
Target Start/End: Original strand, 22927522 - 22927623
Alignment:
Q  36 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaa 133  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||   ||| |||||||  || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  22927522 ttgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaactgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaa 22927621  T
Q  134 ca 135  Q
    ||    
T  22927622 ca 22927623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27210454 - 27210329
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg----acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttg 108  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    | |||   |||||||||||| ||||||| ||||||| | |    
T  27210454 aaggcaaatagacacgcgcgagcttgttcttggatgcgaactggttagtccaccggggacaaagatcaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcg 27210356  T
Q  109 aactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    | |||||||||||| | || |||||||    
T  27210355 agctagccacttgagcaaacagaaaca 27210329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 27238774 - 27238899
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg----acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttg 108  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    | |||   |||||||||||| ||||||| ||||||| | |    
T  27238774 aaggcaaatagacacgcgcgagcttgttcttggatgcgaactggttagtccaccggggacaaagatcaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcg 27238872  T
Q  109 aactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    | |||||||||||| | || |||||||    
T  27238873 agctagccacttgagcaaacagaaaca 27238899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 14138048 - 14138103
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14138048 acagaaacaaatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 14138103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 20131802 - 20131712
Alignment:
Q  36 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||   ||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20131802 ttgttcttgaatttgaactggttactcgaccgataacagaaataaattgacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 20131712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 67
Target Start/End: Original strand, 22927378 - 22927433
Alignment:
Q  12 aaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg 67  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22927378 aaaggcagacagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggtaactcgaccg 22927433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20175855 - 20175755
Alignment:
Q  24 acaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttg 121  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||| |||| |  |||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20175855 acaggtacgagct-gttctaggatttgaactggttactcgaccgaaaacagaaataaattgacaagcacaagctgttcttggatttgaactggccacttg 20175757  T
Q  122 ac 123  Q
    ||    
T  20175756 ac 20175755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 123
Target Start/End: Original strand, 22160136 - 22160236
Alignment:
Q  24 acaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttg 121  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||| |||| |  |||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22160136 acaggtacgagct-gttctaggatttgaactggttactcgaccgaaaacagaaataaattgacaagcacaagctgttcttggatttgaactggccacttg 22160234  T
Q  122 ac 123  Q
    ||    
T  22160235 ac 22160236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 135
Target Start/End: Original strand, 22927210 - 22927266
Alignment:
Q  79 atagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22927210 atagacaggtacgagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 22927266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24871093 - 24871033
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24871093 accgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 24871033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 8898315 - 8898370
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8898315 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 8898370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 15405292 - 15405347
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15405292 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 15405347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 15417079 - 15417134
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15417079 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 15417134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 22927140 - 22927195
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22927140 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 22927195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Original strand, 22927678 - 22927729
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22927678 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 22927729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 26928193 - 26928138
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26928193 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 26928138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27210337 - 27210282
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27210337 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 27210282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 27238891 - 27238946
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27238891 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 27238946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 27354665 - 27354720
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27354665 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 27354720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 33369067 - 33369122
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33369067 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 33369122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27015154 - 27015109
Alignment:
Q  79 atagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27015154 atagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 27015109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 28168042 - 28167997
Alignment:
Q  79 atagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28168042 atagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 28167997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 4538303 - 4538346
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4538303 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 4538346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 4755219 - 4755262
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4755219 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 4755262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 4765417 - 4765374
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4765417 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 4765374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 4780573 - 4780530
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4780573 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 4780530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 8897708 - 8897751
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8897708 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 8897751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 124
Target Start/End: Original strand, 13291726 - 13291761
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13291726 acaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 13291761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 13516788 - 13516831
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13516788 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 13516831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 14137522 - 14137565
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14137522 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 14137565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16681821 - 16681778
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16681821 gacaggtacaagctgctcttggattcgaactagccacttgaccg 16681778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16757259 - 16757204
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16757259 acagaaacagatagacgggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 16757204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16757667 - 16757624
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16757667 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 16757624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 16936660 - 16936703
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16936660 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 16936703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 124
Target Start/End: Original strand, 24298544 - 24298579
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24298544 acaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 24298579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 26108938 - 26108981
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26108938 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 26108981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 26665176 - 26665219
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26665176 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 26665219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 26771147 - 26771190
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26771147 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 26771190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 26793476 - 26793433
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26793476 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 26793433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 26928123 - 26928076
Alignment:
Q  79 atagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccga 126  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26928123 atagacaggtacgagctgttcttggatttgaacgagccactcgaccga 26928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 27015630 - 27015587
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27015630 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 27015587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27026579 - 27026524
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27026579 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagtcacttgacc 27026524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27032438 - 27032403
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27032438 acaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 27032403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 27065181 - 27065138
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27065181 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 27065138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 27201977 - 27201934
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27201977 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 27201934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 27247256 - 27247299
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27247256 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 27247299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 27283134 - 27283177
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27283134 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 27283177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 27354084 - 27354127
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27354084 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 27354127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 27492423 - 27492360
Alignment:
Q  43 tggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  27492423 tggattcgaactggttactcgactggacagaaacaaatggataggtacaagctgctcttggatt 27492360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 27492742 - 27492699
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27492742 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 27492699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 28168578 - 28168535
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28168578 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 28168535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 28215123 - 28215080
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28215123 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 28215080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 29509082 - 29509039
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29509082 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 29509039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 29557279 - 29557236
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29557279 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 29557236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 33368540 - 33368583
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33368540 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 33368583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Original strand, 13291853 - 13291921
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  13291853 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 13291921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Original strand, 24298671 - 24298739
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  24298671 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 24298739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 118)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 64 - 456
Target Start/End: Original strand, 26508618 - 26509011
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgaca 162  Q
    |||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26508618 accgaacagaaacagatagacaggtgcaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttgtttgaca 26508717  T
Q  163 aaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgag 262  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26508718 aaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgag 26508817  T
Q  263 gattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgt 362  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  26508818 tattgaattgagactgatgttgacattgggaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcat 26508917  T
Q  363 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | ||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26508918 gtatgaatggttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 26509011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 2161768 - 2161384
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt-gacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  2161768 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattggtttttttgacaaaatatagg 2161669  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2161668 ttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaatt 2161569  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  2161568 gagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 2161469  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2161468 cttgtaatgcatgattgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 2161384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 16048592 - 16048146
Alignment:
Q  11 caaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttg 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||  || || |||| |||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  16048592 caaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcgtggattcgaactagttactccactagagacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggattcg 16048493  T
Q  109 aactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggta 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16048492 aactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggattaggtttt-gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaaggta 16048394  T
Q  209 gaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatgg 308  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16048393 gaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaacctaacataagtattgaattgagactgatgttggcattggaaatgcaatatgcatgg 16048294  T
Q  309 atgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacag 408  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| | || ||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16048293 atgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatacatgtatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacag 16048194  T
Q  409 tttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16048193 tttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 16048146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 11417723 - 11418105
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    ||||||||||  |||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  11417723 aagcaaataggtaggttcaagctgctcttggatt-gagctagccacttgaccgaacataaacaaattcacaggggattagttttttgacaaaatataggt 11417821  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11417822 tgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 11417921  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  11417922 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 11418021  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11418022 ttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 11418105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 5155261 - 5154896
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacg 188  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5155261 acaagctgttcttggactcgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacg 5155164  T
Q  189 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacat 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  5155163 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacat 5155064  T
Q  289 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatgg 388  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |    
T  5155063 tggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactg 5154964  T
Q  389 ttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5154963 ttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 5154896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 64 - 456
Target Start/End: Original strand, 16442915 - 16443307
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaa 163  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16442915 accgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcaatggggattagttttttgacaa 16443014  T
Q  164 aatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  16443015 aatatagattgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattaaccaacgttgttggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagt 16443114  T
Q  264 attgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtg 363  Q
    |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||    
T  16443115 attgaattgagactaatgctgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataaaagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatg 16443214  T
Q  364 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  16443215 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcatgtagtggctc 16443307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 11448165 - 11447722
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  11448165 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaaaaacagatagacaggtacaagctgctcttggacttgaact 11448066  T
Q  113 agccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaa 212  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11448065 agccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttggcaaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 11447966  T
Q  213 ttgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatga 312  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11447965 ttgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgtcatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatga 11447866  T
Q  313 tataacagttttattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagttt 411  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| ||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||    
T  11447865 tataacagattcattaatatgcatgggcacgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgactt 11447766  T
Q  412 cgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | ||| || |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  11447765 cacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctc 11447722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 5165562 - 5165197
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacg 188  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5165562 acaagctgttcttggactcgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacg 5165465  T
Q  189 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacat 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  5165464 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgatatgagtattaaattgagactgatattgacat 5165365  T
Q  289 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatgg 388  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |    
T  5165364 tggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactg 5165265  T
Q  389 ttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5165264 ttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 5165197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 26678024 - 26678406
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  26678024 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttggcaaaatatagat 26678123  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26678124 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 26678223  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||    
T  26678224 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 26678323  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26678324 ttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 26678406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 22 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 2780493 - 2780057
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccact 119  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||   | | |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2780493 agacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggtcactcgaccgataatataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccact 2780395  T
Q  120 tgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt--tttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgac 217  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  2780394 tgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgac 2780295  T
Q  218 caatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataa 317  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2780294 cgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataa 2780195  T
Q  318 cagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcgga 417  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| |||     
T  2780194 cagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggg 2780095  T
Q  418 gacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2780094 ga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 2780057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 26662832 - 26663214
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  26662832 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttggcaaaatatagat 26662931  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26662932 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 26663031  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||    
T  26663032 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 26663131  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26663132 ttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 26663214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 26596872 - 26596490
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26596872 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagttttttgacaaaatatagat 26596773  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26596772 tgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 26596673  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||  || ||| ||||    
T  26596672 agactgatgttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgc 26596573  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26596572 ttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 26596490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 456
Target Start/End: Original strand, 10909812 - 10910252
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccact 119  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||   ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10909812 agacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccact 10909910  T
Q  120 tgaccgaatagaaacaaattcactggggattg-----gttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt 214  Q
    ||||| ||  |||||| |||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10909911 tgaccaaacggaaacatattcactggggattgttttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt 10910010  T
Q  215 gaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgata 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10910011 gaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgtatgaatgata 10910110  T
Q  315 taacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgc 414  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||  ||||||  |||||||||||||||  ||    
T  10910111 taacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgatttgtagacacagttcagc 10910210  T
Q  415 ggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  10910211 agagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctc 10910252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 26442460 - 26442078
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26442460 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 26442361  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26442360 tgagattgacttgacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaagttttgacagagaacctgatatgagtattgaattg 26442261  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||    
T  26442260 agactgatgttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgc 26442161  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26442160 ttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 26442078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 31557321 - 31557706
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt---gacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  31557321 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttgttctgacaaaatata 31557420  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  31557421 gattgagattgacttgacgtcgattcgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaa 31557520  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| |    
T  31557521 ttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaa 31557620  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  31557621 tgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctc 31557706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 44 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 45394463 - 45394053
Alignment:
Q  44 ggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcact 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||| |||||||    
T  45394463 ggattcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt-gagctagccacttgaccaaacggaaacatattcact 45394365  T
Q  144 ggggattggttt--tttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttt 241  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45394364 ggggattggtttgttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaagatagaaattgaccgatattattggctcacaaggttt 45394265  T
Q  242 tgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcac 341  Q
    |||||||  |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45394264 tgacaga--acctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcac 45394167  T
Q  342 ataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattg 441  Q
     |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  || |||||    
T  45394166 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattg 45394068  T
Q  442 ggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||||||||    
T  45394067 ggcacgtagtggctc 45394053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 5140254 - 5140639
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5140254 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatataga 5140353  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga--ccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5140354 ttgagattgatttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaa 5140453  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| |    
T  5140454 ttgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 5140553  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5140554 tgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 5140639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 45738502 - 45738114
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt------gacaaaat 166  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||      ||||||||    
T  45738502 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgttgacaaaat 45738403  T
Q  167 atagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggatt 266  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  45738402 atagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatc 45738303  T
Q  267 gaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcat 366  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  45738302 gaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtat 45738203  T
Q  367 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  45738202 gaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 45738114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 22149084 - 22148701
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22149084 aagcaaattgataggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 22148985  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | ||||||||| |||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22148984 tgagattgacttgacatcgatttgaattgaaaggcagaaatcgaccgatattatcggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 22148885  T
Q  273 agacagatg-ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| |||    
T  22148884 agactgatgtttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataatagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgtatgaatg 22148785  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22148784 cttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 22148701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 38 - 449
Target Start/End: Original strand, 16511327 - 16511744
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| || |||  || || |||||||  |||  ||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  16511327 gttcttggaggcgaactggtaactcgactggaaacataaacaaataggtaggttcaaactgctcttggatt-gagctagccacttgaccaaacagaaaca 16511425  T
Q  136 aattcactggggattg-----gttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggc 230  Q
     |||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16511426 gattcactggggattgttttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggc 16511525  T
Q  231 tcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaa 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16511526 tcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaa 16511625  T
Q  331 tgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagaca 430  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16511626 tgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagaca 16511725  T
Q  431 tttgagtattgggcacgta 449  Q
     | ||||||||||||||||    
T  16511726 ctggagtattgggcacgta 16511744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 26520023 - 26519641
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26520023 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagat 26519924  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26519923 tgagattgacctgacatcgatttgatttgaaaggtagaaactgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattg 26519824  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
     ||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  26519823 ggactgatgttgacattggaactgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 26519724  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  26519723 ttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctc 26519641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 96 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 31131089 - 31130730
Alignment:
Q  96 gttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattc 195  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  31131089 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattt 31130990  T
Q  196 gatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaat 295  Q
    | ||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||  |||||||||    
T  31130989 ggtttgaaaggtaaaatttgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatattgttattggaaat 31130890  T
Q  296 gcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 395  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  31130889 gcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcag 31130790  T
Q  396 tttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31130789 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 31130730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 26312783 - 26313165
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  26312783 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatataaat 26312882  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26312883 tgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatcgaattg 26312982  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  26312983 agactgatgttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 26313082  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||   |||||| ||||||| ||    ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26313083 ttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcaagacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 26313165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Original strand, 24585470 - 24585838
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatatagattgaaactgacttgac 187  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24585470 acaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgac 24585569  T
Q  188 gtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgaca 287  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||| |    
T  24585570 gtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatattgata 24585669  T
Q  288 ttggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatg 387  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||      
T  24585670 ttggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgact 24585769  T
Q  388 gttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacattt-gagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||||||||||| |||   ||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24585770 gttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacatttagagtattgggcacgtagtggctc 24585838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 31083542 - 31083925
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt-ttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  31083542 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacctgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggaggttggtttggttgacaaaatataga 31083641  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||| | ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  31083642 ttgagattgatttgacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgataacattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtgttgaatt 31083741  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  31083742 gagactgatgttgtcattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 31083841  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||   |||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31083842 cttgtaatgcatgactattggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 31083925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 96 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 4206570 - 4206209
Alignment:
Q  96 gttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt--tttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgat 193  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4206570 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgat 4206471  T
Q  194 tcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaa 293  Q
    | |  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4206470 ttgtattgaaaggcagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgatattggaa 4206371  T
Q  294 atgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggc 393  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||    
T  4206370 atgcaatatgcatggatgatataacagattcactaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggc 4206271  T
Q  394 agtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4206270 attttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtgttgggcacgtagtggctc 4206209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 117 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 10848750 - 10848418
Alignment:
Q  117 acttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||    || |      |||| || |     
T  10848750 acttgaccaaatagaaacaaattcactagggattagttttttgacaaaatataaattgaaattgacttgacattgac---atgtcc----tagagatggg 10848658  T
Q  217 ccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatata 316  Q
    |||||   | |||||| | |||| |||||||||||  |||||  || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10848657 ccaatggcactggctccctaggtcttgacagagaatttgacaaaagtattggattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatata 10848558  T
Q  317 acagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcgg 416  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  10848557 acagttttatcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcag 10848458  T
Q  417 agacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10848457 agacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 10848418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 268 - 456
Target Start/End: Original strand, 4138360 - 4138547
Alignment:
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||    
T  4138360 aattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatg 4138459  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4138460 aatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 4138547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 268 - 456
Target Start/End: Original strand, 39206279 - 39206466
Alignment:
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  39206279 aattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatg 39206378  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39206379 aatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 39206466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 26508504 - 26508631
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  26508504 aagcaaaggcaaatagacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggatagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggactt 26508603  T
Q  108 gaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26508604 gaactagccacttgaccgaacagaaaca 26508631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 216
Target Start/End: Original strand, 16744492 - 16744640
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaata 167  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16744492 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaata 16744591  T
Q  168 tagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 216  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16744592 tagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 16744640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 268 - 456
Target Start/End: Original strand, 16744635 - 16744822
Alignment:
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||    
T  16744635 aattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatg 16744734  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16744735 aatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 16744822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 216
Target Start/End: Original strand, 4138217 - 4138365
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaata 167  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4138217 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattggtttgtttgacaaaata 4138316  T
Q  168 tagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 216  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4138317 tagattgagattgacttgacatcgatttgatttgaaaggtagaaattga 4138365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10848903 - 10848774
Alignment:
Q  11 caaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttg 108  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  10848903 caaaggcaaatagacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacataaacaaacagacaggtacaagctgttcttggacttg 10848804  T
Q  109 aactagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10848803 aactagccacttgaccgaacagaaacaaat 10848774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Original strand, 39206140 - 39206284
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt-ttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||    
T  39206140 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgggggttagtttgcttgacaaaatataga 39206239  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 216  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39206240 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 39206284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 16442799 - 16442928
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| || |||| |||||||  ||||||| ||||||||    
T  16442799 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccactggagacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggat 16442898  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16442899 ttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 16442928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 31131231 - 31131119
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  31131231 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 31131133  T
Q  113 agccacttgaccga 126  Q
    || |||||||||||    
T  31131132 agtcacttgaccga 31131119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 26507856 - 26507971
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  26507856 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 26507954  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  26507955 gagctagccacttgacc 26507971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 39205124 - 39205239
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  39205124 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 39205222  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  39205223 gagctagccacttgacc 39205239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 39205959 - 39206074
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  39205959 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 39206057  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  39206058 gagctagccacttgacc 39206074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 45738683 - 45738568
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  45738683 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 45738585  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  45738584 gagctagccacttgacc 45738568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 31557145 - 31557255
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| | || ||    
T  31557145 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tcgagct 31557243  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  31557244 agccacttgacc 31557255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 16744379 - 16744500
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  16744379 aaggcaaatagacatgtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaggaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 16744477  T
Q  113 agccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||||| |||| |||||||    
T  16744478 agccacttgagcgaacagaaaca 16744500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 4206712 - 4206619
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4206712 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt 4206619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 5165921 - 5165798
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||     
T  5165921 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgag 5165823  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  5165822 ctagccacttgaccgaacagaaaca 5165798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 26442758 - 26442643
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  26442758 aagcaaaggcaaataaacagatgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 26442660  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  26442659 gagctagccacttgacc 26442643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22149260 - 22149150
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  22149260 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggaccgaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 22149162  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  22149161 agtcacttgacc 22149150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 26597048 - 26596938
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||| ||||||| |||| ||    
T  26597048 aaggcaaatagacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacgggtacaagctgctcttgga-ttgagct 26596950  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  26596949 agccacttgacc 26596938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 26267707 - 26267800
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26267707 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactagttactccaccggagagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt 26267800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 2162130 - 2162001
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc--ggacaga-agcaaatagacaggcacaagctgttcttgga 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  2162130 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggggacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga 2162031  T
Q  105 tttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     | || |||||||||||| |||| |||||||    
T  2162030 -tcgagctagccacttgagcgaacagaaaca 2162001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 26662656 - 26662766
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  26662656 aaggcaaatagacaggtgtgagcttgttcttggatgcaaactggttactccaccggagagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 26662754  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  26662755 agtcacttgacc 26662766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 26677848 - 26677958
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  26677848 aaggcaaatagacaggtgtgagcttgttcttggatgcaaactggttactccaccggagagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 26677946  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  26677947 agtcacttgacc 26677958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 287 - 456
Target Start/End: Original strand, 26268219 - 26268388
Alignment:
Q  287 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 385  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  26268219 attggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatgcatga 26268318  T
Q  386 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26268319 tggttgacagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 26268388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 5140135 - 5140228
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  5140135 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaacaaataggtaggtacaagctgctcttggatt 5140228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 135
Target Start/End: Original strand, 24585287 - 24585399
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||| |||||||| ||||||| |||| |||| ||||||    
T  24585287 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttg 24585385  T
Q  122 accgaatagaaaca 135  Q
    ||| ||| ||||||    
T  24585386 accaaatggaaaca 24585399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 26312607 - 26312700
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  26312607 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaacagatagataggtacaagctgctcttggatt 26312700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 31083245 - 31083369
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| |||||||  |||||| | ||    
T  31083245 aaggcaaacagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgcccttgga-tcga 31083343  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     ||||||||||||||||| |||||||    
T  31083344 gctagccacttgaccgaacagaaaca 31083369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 45738978 - 45738854
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  45738978 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 45738880  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  45738879 gctagccacttgagcgaacagaaaca 45738854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 16511060 - 16511188
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| |  |||||| ||||||  |||||| |||||||     
T  16511060 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttattggatgcgaactggtcactccaccggagacaaagacaaataaacaggcgtaagctgctcttgga- 16511158  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  16511159 ttgagctagccacttgagcgaacagaaaca 16511188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 2780682 - 2780558
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  2780682 aaggcaaatagacaggtgcgggcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 2780584  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  2780583 gctagccacttgagcgaacagaaaca 2780558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 282 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 3452238 - 3452064
Alignment:
Q  282 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 380  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  3452238 ttgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatg 3452139  T
Q  381 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||| || || ||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  3452138 catgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agccaagacatcagatcattgggcacgtagtggctc 3452064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 4138101 - 4138225
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  4138101 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgctcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 4138199  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  4138200 gctagccacttgagcgaacagaaaca 4138225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 5155621 - 5155505
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  5155621 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacgaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 5155523  T
Q  110 actagccacttgaccgaa 127  Q
     |||||||||||| ||||    
T  5155522 gctagccacttgagcgaa 5155505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Original strand, 11417483 - 11417542
Alignment:
Q  10 gcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 69  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11417483 gcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 11417542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 26520259 - 26520135
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| | ||||| | ||    
T  26520259 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgcttttgga-tcga 26520161  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  26520160 gctagccacttgagcgaacagaaaca 26520135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 10909266 - 10909394
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||  |||| |  ||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  10909266 aagcaaaggcgaatagacaggtgtgagcttgttcttggatacgaactggttactcgatcggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga- 10909364  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  10909365 ttgagctagccacttgagcgaacagaaaca 10909394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 26507261 - 26507384
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||| | ||||||| ||||||| | ||    
T  26507261 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacagacgcaagctgctcttgga-tcga 26507359  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaac 134  Q
     |||||||||||| |||| ||||||    
T  26507360 gctagccacttgagcgaacagaaac 26507384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 39204529 - 39204652
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||| | ||||||| ||||||| | ||    
T  39204529 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacagacgcaagctgctcttgga-tcga 39204627  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaac 134  Q
     |||||||||||| |||| ||||||    
T  39204628 gctagccacttgagcgaacagaaac 39204652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Original strand, 26267899 - 26267961
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattg 151  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26267899 acaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattg 26267961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 135
Target Start/End: Original strand, 39205675 - 39205787
Alignment:
Q  25 caggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttg 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| | ||||| | || |||||||||||    
T  39205675 caggtacgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgcttttgga-tcgagctagccacttg 39205773  T
Q  122 accgaatagaaaca 135  Q
    | |||| |||||||    
T  39205774 agcgaacagaaaca 39205787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 31131352 - 31131303
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactc 62  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31131352 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggtgactc 31131303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 39205305 - 39205357
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39205305 aagcaaattgacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccg 39205357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 26442577 - 26442515
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26442577 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 26442515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 5165811 - 5165751
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5165811 accgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 5165751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 2780566 - 2780511
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2780566 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 2780511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 4137814 - 4137857
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4137814 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 4137857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 10909386 - 10909441
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10909386 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 10909441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 11417602 - 11417657
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11417602 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 11417657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 26662430 - 26662473
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26662430 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 26662473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 26677622 - 26677665
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26677622 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 26677665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 39205779 - 39205834
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39205779 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 39205834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 45394844 - 45394801
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45394844 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 45394801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 45738862 - 45738807
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45738862 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 45738807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 125
Target Start/End: Original strand, 26507387 - 26507433
Alignment:
Q  79 atagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26507387 atagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccg 26507433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 135
Target Start/End: Original strand, 26508037 - 26508099
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26508037 aagcaaattgataggtacaagctgttcttgggcttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 26508099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 126
Target Start/End: Original strand, 31083356 - 31083418
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccga 126  Q
    |||| |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31083356 accgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccactcgaccga 31083418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 135
Target Start/End: Original strand, 31083425 - 31083487
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31083425 aagcaaattgataggtacaagctgttctcggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 31083487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 125
Target Start/End: Original strand, 39204655 - 39204701
Alignment:
Q  79 atagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39204655 atagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccg 39204701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 5155495 - 5155450
Alignment:
Q  79 atagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5155495 atagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 5155450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 5155729 - 5155689
Alignment:
Q  24 acaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 65  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5155729 acaggtgcgag-ttgttcttggatgcgaactggttactccac 5155689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 5166029 - 5165989
Alignment:
Q  24 acaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 65  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5166029 acaggtgcgag-ttgttcttggatgcgaactggttactccac 5165989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 68
Target Start/End: Original strand, 16442683 - 16442738
Alignment:
Q  12 aaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg 68  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16442683 aaaggcagacagacaggtgcgag-ttgttcttggatgcgaactggtcactcgaccgg 16442738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 125
Target Start/End: Original strand, 26267365 - 26267401
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26267365 acaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 26267401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 125
Target Start/End: Original strand, 26312326 - 26312362
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26312326 acaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 26312362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Original strand, 26508237 - 26508305
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||| |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  26508237 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccgaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 26508305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 2161989 - 2161954
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2161989 acaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 2161954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 2781031 - 2780988
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2781031 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 2780988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 3452664 - 3452622
Alignment:
Q  77 aaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccactt 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3452664 aaatagacagggacaagctgttcttgga-ttgaactagccactt 3452622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3453084 - 3453041
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3453084 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 3453041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 5165658 - 5165591
Alignment:
Q  39 ttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| ||||||||||||||||||    
T  5165658 ttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgttcttggatt 5165591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11448453 - 11448410
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11448453 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 11448410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 16511180 - 16511235
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16511180 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacatgaactagccacttgacc 16511235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 22152963 - 22152928
Alignment:
Q  421 agacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22152963 agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 22152928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 22208878 - 22208843
Alignment:
Q  421 agacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22208878 agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 22208843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 24585052 - 24585095
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24585052 gacaggtacaagctgttctcggattcgaactagccacttgaccg 24585095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 26443102 - 26443059
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26443102 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 26443059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 26520485 - 26520442
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26520485 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 26520442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 26597397 - 26597354
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26597397 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 26597354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 31131640 - 31131597
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31131640 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 31131597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 31556857 - 31556900
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31556857 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 31556900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 45739204 - 45739161
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45739204 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 45739161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 69
Target Start/End: Original strand, 26507152 - 26507196
Alignment:
Q  24 acaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26507152 acaggtgcgag-ttgttcttggattcgaactggttactcgaccgga 26507196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 69
Target Start/End: Original strand, 39204420 - 39204464
Alignment:
Q  24 acaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39204420 acaggtgcgag-ttgttcttggattcgaactggttactcgaccgga 39204464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 2161862 - 2161794
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  2161862 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 2161794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 5155358 - 5155290
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  5155358 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 5155290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 10848790 - 10848750
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttgga 104  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10848790 accgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttgga 10848750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Original strand, 10909533 - 10909601
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| || || || ||| |||||||| |||||||||    
T  10909533 gttcttggatgcgaactggttacttgaccaaacagaaacatattgataggtacaagctgctcttggatt 10909601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Original strand, 26508398 - 26508437
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactc 62  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  26508398 agacaggtgcgag-tcgttcttggatgcgaactggttactc 26508437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 202)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 64 - 456
Target Start/End: Original strand, 16617558 - 16617950
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaa 163  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16617558 accgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggattagttttttgacaa 16617657  T
Q  164 aatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||     
T  16617658 aatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagagtttgacagagaacctgacataagt 16617757  T
Q  264 attgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtg 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||||||||| ||    
T  16617758 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttatcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatg 16617857  T
Q  364 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16617858 tatgaatgcttgaaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctc 16617950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 5659295 - 5658911
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt-gacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  5659295 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatatagg 5659196  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5659195 ttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaatt 5659096  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  5659095 gagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 5658996  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5658995 cttgtaatgcatgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 5658911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 64 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 22041599 - 22041207
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaa 163  Q
    |||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22041599 accgaacagaaacaaatagacaagaacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggattagttttttgacaa 22041500  T
Q  164 aatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||     
T  22041499 aatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagaatttgacagagaacctgacataagt 22041400  T
Q  264 attgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtg 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||||||||| ||    
T  22041399 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttatcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatg 22041300  T
Q  364 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22041299 tatgaatgcttgaaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctc 22041207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 64 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 19701587 - 19701194
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttt-tgaca 162  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  19701587 accgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggaatagtttttatgaca 19701488  T
Q  163 aaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgag 262  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19701487 aaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgag 19701388  T
Q  263 gattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgt 362  Q
     || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||||||||||||| |    
T  19701387 tatagaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcatcaaatgcatgggcttgtaatatgcatgattatgcat 19701288  T
Q  363 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | ||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19701287 gtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcatagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 19701194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 29141851 - 29142237
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt---ttgacaaaatata 169  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||||    
T  29141851 aagcaaataggtaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttttgacaaaatata 29141950  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  29141951 gattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgag 29142050  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  29142051 ttgagactgatgttgacattggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 29142150  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29142151 tgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 29142237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 11103461 - 11103844
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt-ttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11103461 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatataga 11103560  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11103561 ttgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaatt 11103660  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  11103661 gagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 11103760  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11103761 cttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 11103844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 18058429 - 18058045
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt-gacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  18058429 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatatagg 18058330  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18058329 ttgaaattgacttgacgtcaatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggtttggacagagaacccgacatgagtattgaatt 18058230  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  18058229 gagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 18058130  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18058129 cttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 18058045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 35887902 - 35887537
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacg 188  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  35887902 acaagctgttcttggactcgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttt--gacaaaatgtagattgagattgacttgacg 35887805  T
Q  189 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacat 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  35887804 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgagttgagactgatgttgacat 35887705  T
Q  289 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatgg 388  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |    
T  35887704 tggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactg 35887605  T
Q  389 ttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  35887604 ttgacagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcacgtagtggctc 35887537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 22380680 - 22381063
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||    
T  22380680 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacagggggttagttttttgacaaagtatagat 22380779  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  22380780 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttg 22380879  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  22380880 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatacaacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 22380979  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | | |||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22380980 tcgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattgggcacgtagtggctc 22381063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 456
Target Start/End: Original strand, 22863881 - 22864324
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||    
T  22863881 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaattggttactccaccgggcagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt-gagct 22863979  T
Q  113 agccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt--ttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtaga 210  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22863980 agccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaga 22864079  T
Q  211 aattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggat 310  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22864080 aattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctaacacgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggat 22864179  T
Q  311 gatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtt 410  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   |    
T  22864180 gatataacaggttcatcaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgact 22864279  T
Q  411 tcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||  || || ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  22864280 tcatgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctc 22864324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 456
Target Start/End: Original strand, 22878940 - 22879383
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||    
T  22878940 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaattggttactccaccgggcagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt-gagct 22879038  T
Q  113 agccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt--ttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtaga 210  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22879039 agccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaga 22879138  T
Q  211 aattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggat 310  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22879139 aattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctaacacgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggat 22879238  T
Q  311 gatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtt 410  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   |    
T  22879239 gatataacaggttcatcaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgact 22879338  T
Q  411 tcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||  || || ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  22879339 tcatgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctc 22879383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 15734215 - 15734599
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt-ttgacaaaatataga 171  Q
    ||||||||||  |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  15734215 aagcaaataggtaggttcaagctattcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatatagg 15734314  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15734315 ttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaatt 15734414  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| ||     
T  15734415 gagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcataggcacataatatgcatgactatgcatgtatgaatt 15734514  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15734515 cttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 15734599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 16423366 - 16422984
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16423366 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggatt-gagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattagttttttgacaaaatatagat 16423268  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16423267 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattg 16423168  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  16423167 agactgatgttgatatcggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 16423068  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||    
T  16423067 ttgtaatgcatgactgttggcggtttgtagacacagttccgcagagacagacaaggcactggagtattgggtacgtagtggctc 16422984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 18249899 - 18249517
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18249899 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcaccggggattggttttttgacaaaatatagat 18249800  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18249799 tgagattgacctgacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgaaattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtactgaattg 18249700  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  18249699 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 18249600  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18249599 ttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 18249517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 32297816 - 32297430
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt---gacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  32297816 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgatcgaacagaaacatattcactggggattgttttttttttgacaaaatata 32297717  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  32297716 gattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaa 32297617  T
Q  270 ttgagacagatg-ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgg 368  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||     
T  32297616 ttgagacggatgtttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatga 32297517  T
Q  369 atgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32297516 atgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 32297430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 4339777 - 4340159
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  4339777 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactagggattggtttgttaacaaaatatagat 4339876  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4339877 tgaggttgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 4339976  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  4339977 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacataatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 4340076  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4340077 ttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 4340159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 21681903 - 21681519
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt--tttgacaaaatatag 170  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21681903 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatag 21681804  T
Q  171 attgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaat 270  Q
    ||||| | ||||||||| | |||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21681803 attgagattgacttgacattgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaat 21681704  T
Q  271 tgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggat 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||    
T  21681703 tgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaat 21681604  T
Q  371 gcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21681603 gcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 21681519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 28109039 - 28109423
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt--tttgacaaaatatag 170  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  28109039 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgggggttggtttgttttgacaaaatatag 28109138  T
Q  171 attgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaat 270  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28109139 attgaaattgacttgacgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaat 28109238  T
Q  271 tgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggat 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||| ||    
T  28109239 tgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatggttatgcatgtatgaat 28109338  T
Q  371 gcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||  ||||||||  ||| ||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28109339 gcttgtgatgcatgactgttagcagtttgtaggcacgacttcaccggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 28109423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 5602389 - 5602773
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5602389 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatataga 5602488  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5602489 ttgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaatt 5602588  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggat 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||    
T  5602589 gagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaat 5602688  T
Q  371 gcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5602689 gcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 5602773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 38 - 456
Target Start/End: Original strand, 8282525 - 8282943
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacag--aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||| |   || |||||||  |||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  8282525 gttcttggaggcgaactggtaactcgaccggaaacgtaaacaaataggtaggttcaagctgctcttggatt-gagctagccacttgaccgaacagaaaca 8282623  T
Q  136 aattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcaca 235  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8282624 gattcagtggggattg-ttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcaca 8282722  T
Q  236 aggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcat 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  8282723 aggttttgacagagaacccgacatgagtattgaactgcgactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcat 8282822  T
Q  336 gggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttga 435  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||    
T  8282823 gggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactgga 8282922  T
Q  436 gtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    || ||||||||| ||||||||    
T  8282923 gtgttgggcacgcagtggctc 8282943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 38 - 456
Target Start/End: Original strand, 4789693 - 4790114
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg--aatagaaaca 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| ||||||||| || || | |||| |||||  || | |||||    
T  4789693 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt-gagctgggcactcgaccggtaacataaaca 4789791  T
Q  136 aattcactggggattggtttt--ttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctca 233  Q
    ||| |||  |||||| |||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4789792 aatgcacaagggattagttttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctca 4789891  T
Q  234 caaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgc 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4789892 caaggttttgacagagaacccgacataagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttcattaaatgc 4789991  T
Q  334 atgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacattt 433  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  4789992 atgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattg 4790091  T
Q  434 gagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  4790092 gagtattgggcacgtaatggctc 4790114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 22 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 4690894 - 4690452
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccact 119  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||   ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4690894 agacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccact 4690796  T
Q  120 tgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt-------gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaa 212  Q
    ||||| ||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||       ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4690795 tgaccaaacggaaacatattcactagggattgttttttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtggaaa 4690696  T
Q  213 ttgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatga 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  4690695 ttgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaacatgcatgaatga 4690596  T
Q  313 tataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |    
T  4690595 tataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttcc 4690496  T
Q  413 gcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    || ||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  4690495 gcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctc 4690452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 4728769 - 4728403
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt-gacaaaatatagattgaaactgacttgac 187  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||  | |||||| ||||||| |    
T  4728769 acaagctgttcttggacttgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaacata--ggttgaaattgacttggc 4728672  T
Q  188 gtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgaca 287  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4728671 gtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattataggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgttgaca 4728572  T
Q  288 ttggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatg 387  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||      
T  4728571 ttggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgact 4728472  T
Q  388 gttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4728471 gttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 4728403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 5020900 - 5020510
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttt-------tgacaaaa 165  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||       ||||||||    
T  5020900 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcacaggggattggtttttatttttttgacaaaa 5020801  T
Q  166 tatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggat 265  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5020800 tatagattgagattgacttgacgccgatttaaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtat 5020701  T
Q  266 tgaattgagacagatgtt-gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgc 364  Q
    |||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  5020700 tgaaatgagacggatgtttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgt 5020601  T
Q  365 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5020600 atgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 5020510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 16599795 - 16599412
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16599795 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatataga 16599696  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16599695 ttgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaatt 16599596  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  16599595 gagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 16599496  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16599495 cttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 16599412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 48473094 - 48472709
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt---gacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  48473094 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgacaaaatata 48472995  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  48472994 gattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaa 48472895  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  48472894 ttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 48472795  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  48472794 tgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 48472709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 38 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 18337816 - 18337401
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaa 137  Q
    ||||||||||||||||| || |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| ||||||||| || || | |||| |||| || |||||||||    
T  18337816 gttcttggatgcgaacttgtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt-gagctgggcactcgaccaaacagaaacaaa 18337718  T
Q  138 ttcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaag 237  Q
    ||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18337717 ttcacaggggattagtttt--gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaag 18337620  T
Q  238 gttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  18337619 gttttgacagagaacctgacatgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatacaacaatttcattaaatgcatgg 18337520  T
Q  338 gcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagt 437  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  18337519 gcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagt 18337420  T
Q  438 attgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18337419 attgggcacgtagtggctc 18337401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 6209038 - 6208672
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt-gacaaaatatagattgaaactgacttgac 187  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||  | |||||| ||||||| |    
T  6209038 acaagctgttcttggacttgaactagtcacttgaccgaacaaaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaacata--ggttgaaattgacttggc 6208941  T
Q  188 gtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgaca 287  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6208940 gtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattataggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgttgaca 6208841  T
Q  288 ttggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatg 387  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||      
T  6208840 ttggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgact 6208741  T
Q  388 gttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6208740 gttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 6208672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 7080411 - 7080028
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt-gacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7080411 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatataga 7080312  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  7080311 ttgaaattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaatt 7080212  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||    
T  7080211 gagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaataggcatgattatgcatgtatgaatg 7080112  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||| || |||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7080111 cttgtaatgcatgaccgttggcaattcgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 7080028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 20073197 - 20072812
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt---gacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  20073197 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgacaaaatata 20073098  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  20073097 gattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaa 20072998  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  20072997 ttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 20072898  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||    || ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20072897 tgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacatcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 20072812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 20569933 - 20570316
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20569933 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatataga 20570032  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||| | |||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20570033 ttgagattgacttaacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaatt 20570132  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  20570133 gagactgatgttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 20570232  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20570233 cttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgg-gggagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 20570316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 31029340 - 31029726
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt----ttgacaaaatat 168  Q
    |||||||| || ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  31029340 aagcaaattgataggtacaagctgtccttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttgacaaaatat 31029439  T
Q  169 agattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattga 268  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31029440 agattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattga 31029539  T
Q  269 attgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgg 368  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||     
T  31029540 attgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatga 31029639  T
Q  369 atgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||  ||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31029640 atgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggtacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 31029726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Original strand, 31957550 - 31957916
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacg 188  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31957550 acaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacg 31957649  T
Q  189 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacat 288  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  31957650 tcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatattgacat 31957749  T
Q  289 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatgg 388  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |    
T  31957750 tggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactg 31957849  T
Q  389 ttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31957850 ttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 31957916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 17978028 - 17978411
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17978028 aagcaaatcgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttacaaaatataga 17978127  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||| | ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17978128 ttgagattgacttgacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcgcaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaatt 17978227  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  17978228 gagactgatgttgacattggaactgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 17978327  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || | |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17978328 cttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-aaacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 17978411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 4424079 - 4423695
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttt--tgacaaaatatag 170  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4424079 aagcaaattgacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattggtttttattgacaaaatatag 4423980  T
Q  171 attgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaat 270  Q
    ||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  4423979 attgagattgacttaacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaat 4423880  T
Q  271 tgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggat 370  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||    
T  4423879 tgagactgatgtcgacattggacatgcagtatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaat 4423780  T
Q  371 gcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||| ||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4423779 gcttgtaatgcatgactgttggcattttataggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 4423695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 4630943 - 4630558
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttt---tgacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||   |||| |||||||    
T  4630943 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaatcagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatata 4630844  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | ||||||||| | |||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  4630843 gattgagattgacttgacattgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaa 4630744  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  4630743 ttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 4630644  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4630643 tgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 4630558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 18232373 - 18231991
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18232373 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacgggaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagat 18232274  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    |||   |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18232273 tgaggttgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtactgaattg 18232174  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  18232173 agactgacgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 18232074  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18232073 ttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 18231991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 18285454 - 18285839
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt---ttgacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||    
T  18285454 aagcaaattgataggtacaagctgttcttgaacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgttttttttttgacaagatata 18285553  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18285554 gattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaa 18285653  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| |    
T  18285654 ttgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaa 18285753  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18285754 tgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 18285839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 96 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 24335334 - 24334975
Alignment:
Q  96 gttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattc 195  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||     
T  24335334 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcaatggggattggtttgttgacaaaatatagattgaggttgacttgacgttgattt 24335235  T
Q  196 gatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaat 295  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24335234 gaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaat 24335135  T
Q  296 gcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 395  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  24335134 gcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgaccgttggcat 24335035  T
Q  396 tttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24335034 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 24334975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 51789204 - 51788821
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  51789204 aagcaaattgataggtacaagctgctcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttggcaaaatgtagat 51789105  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51789104 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 51789005  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttatta-aatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| |||    
T  51789004 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattagtatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatg 51788905  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  51788904 cttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctc 51788821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 17969954 - 17970340
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt----ttgacaaaatat 168  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  17969954 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttgacaaaatat 17970053  T
Q  169 agattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattga 268  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  17970054 agattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttga 17970153  T
Q  269 attgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgg 368  Q
    |||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| || |||     
T  17970154 attgagactgatattgttattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaagtgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatga 17970253  T
Q  369 atgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17970254 atgcttgtaatgcatgactattggcactttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 17970340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 18300754 - 18301140
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattg----gttttttgacaaaatat 168  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||     ||||||||||| ||||    
T  18300754 aagcaaattgataggtacaagctgttcttgaacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgtttttttttttgacaagatat 18300853  T
Q  169 agattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattga 268  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18300854 agattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattga 18300953  T
Q  269 attgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgg 368  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||     
T  18300954 attgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatga 18301053  T
Q  369 atgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18301054 atgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 18301140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 64 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 35222046 - 35221712
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt-gaca 162  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  35222046 accgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactaaccacttgaccgaacagaaacaaattcactggagattagtttttttgaca 35221947  T
Q  163 aaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgag 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35221946 aaatatagattgaaactgacttgacgtcgatt----ttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcataagattttgacagagaacctgacatgag 35221851  T
Q  263 gattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgt 362  Q
     ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |    
T  35221850 tattgaattgagactgatgctgatattggaaatgcactatgcacggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcat 35221751  T
Q  363 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgta 401  Q
    | ||| ||||||| || ||||||  ||||||||||||||    
T  35221750 gtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgta 35221712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 28346346 - 28345970
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||      || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28346346 aagcaaattgataggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgaccgaa------catattcacaggggattggtttgttgacaaaatatagat 28346253  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||    
T  28346252 tgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattg 28346153  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  28346152 agactgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 28346053  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28346052 ttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 28345970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 153 - 456
Target Start/End: Original strand, 15885897 - 15886200
Alignment:
Q  153 ttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaac 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15885897 ttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaac 15885996  T
Q  253 ctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcat 352  Q
    | |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15885997 ccgacatgagtattgaactgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcat 15886096  T
Q  353 gattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtg 452  Q
    |||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  15886097 gattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacatagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatg 15886196  T
Q  453 gctc 456  Q
    ||||    
T  15886197 gctc 15886200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 38 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 32446349 - 32445929
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaa 137  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| ||||||||| || || | |||||||||||| |||||||||    
T  32446349 gttcttggatgcgaaccggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt-gagctgggcacttgaccgaacagaaacaaa 32446251  T
Q  138 ttcactggggattggtttttt----gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctca 233  Q
    ||||| ||||||| |||||||    |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||    
T  32446250 ttcacaggggattagttttttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgttgatttgatttgaaaggtagaaatcgaccgatactaatggctca 32446151  T
Q  234 caaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgc 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  32446150 caaggttttgatagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatagatgacataacagttttattaaatgc 32446051  T
Q  334 atgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacattt 433  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||      
T  32446050 gtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatca 32445952  T
Q  434 gagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32445951 gagtattgggcacgtagtggctc 32445929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 112 - 456
Target Start/End: Original strand, 16403907 - 16404252
Alignment:
Q  112 tagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt--ttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtag 209  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| |     
T  16403907 tagccacttgaccaagtagaaacagattcactggggattagttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcaa 16404006  T
Q  210 aaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatgga 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16404007 aaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacgga 16404106  T
Q  310 tgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagt 409  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||       
T  16404107 tgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgac 16404206  T
Q  410 ttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16404207 ttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 16404252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 10650250 - 10649869
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10650250 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttggccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatataga 10650151  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga--ccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    ||||    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10650150 ttga----gatttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgagactgatgttattggcttacaaggttttgacagagaacctgacacgagtattgaa 10650055  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  10650054 ttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 10649955  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10649954 tgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 10649869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 5474138 - 5473766
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5474138 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacataaacatattcacaggggattggtttgttgacaaaatatagat 5474039  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5474038 tgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacagatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattg 5473939  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||          || ||| ||||    
T  5473938 agactgatgttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgca----------tgtatgaatgc 5473849  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5473848 ttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 5473766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 8218826 - 8218424
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt----------------- 155  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||                     
T  8218826 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgtttttttttttt 8218727  T
Q  156 ---tttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaac 252  Q
       |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8218726 ttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaac 8218627  T
Q  253 ctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcat 352  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8218626 ctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcat 8218527  T
Q  353 gattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtg 452  Q
    |||||||| || ||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || ||||||| | || ||||||||||||||| |||    
T  8218526 gattatgcatgtatgaacgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaaggcgttagagtattgggcacgtggtg 8218428  T
Q  453 gctc 456  Q
    ||||    
T  8218427 gctc 8218424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 28028456 - 28028070
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattgg-----------ttttttgac 161  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||           |||||||||    
T  28028456 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgggttttttttttttttttgac 28028357  T
Q  162 aaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatga 261  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28028356 aaaatatagattgagatcgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatga 28028257  T
Q  262 ggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcg 361  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||       ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  28028256 gtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatg-------taacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgca 28028164  T
Q  362 tgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    ||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  28028163 tgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagacattagagtaatgggcaagtagtggctc 28028070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 6535821 - 6536203
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  6535821 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttattggcacaatatagat 6535920  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt--gaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaat 270  Q
    |||   ||||||||||||||||   ||||||| |   |||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6535921 tgaggttgacttgacgtcgatttagtttgaaatg---aaattaagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaat 6536017  T
Q  271 tgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| |    
T  6536018 tgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 6536117  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  6536118 tgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctc 6536203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 64 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 15368430 - 15368043
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt--gac 161  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||  |||    
T  15368430 accgaacagaaacacatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactaaccacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagttttttttgac 15368331  T
Q  162 aaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatga 261  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||    || |      |||| || |||||||   | |||||| | || | |||||||||||  |||||| |    
T  15368330 aaaatatagattgaaattgacttgacattgac---atgtcc----tagagatggaccaatggcactggctccccagatcttgacagagaatttgacataa 15368238  T
Q  262 ggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcg 361  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||||     
T  15368237 gtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgca 15368138  T
Q  362 tgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15368137 tgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacatagtttcccagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 15368043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 220 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 10403186 - 10402951
Alignment:
Q  220 atattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataaca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10403186 atattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataaca 10403087  T
Q  320 gttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggaga 419  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| ||    
T  10403086 gtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga 10402987  T
Q  420 cagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10402986 -agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 10402951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Original strand, 29658042 - 29658245
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  29658042 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgggcagaaatagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 29658140  T
Q  113 agccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaa 211  Q
    || ||||||||| ||  ||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29658141 agtcacttgaccaaacggaagcatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaa 29658240  T
Q  212 attga 216  Q
    |||||    
T  29658241 attga 29658245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 268 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 5718041 - 5717854
Alignment:
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||    
T  5718041 aattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatg 5717942  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5717941 aatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 5717854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 268 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 5728951 - 5728764
Alignment:
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||    
T  5728951 aattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatg 5728852  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5728851 aatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 5728764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 268 - 456
Target Start/End: Original strand, 5763417 - 5763604
Alignment:
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||    
T  5763417 aattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatg 5763516  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5763517 aatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 5763604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5718180 - 5718036
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5718180 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatataga 5718081  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 216  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5718080 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 5718036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5729090 - 5728946
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5729090 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatataga 5728991  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 216  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5728990 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 5728946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Original strand, 5763278 - 5763422
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5763278 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatataga 5763377  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 216  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5763378 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 5763422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19701703 - 19701571
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| |||||||  ||||||| ||||||||    
T  19701703 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggat 19701604  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19701603 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaat 19701571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 268 - 456
Target Start/End: Original strand, 29658240 - 29658427
Alignment:
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||    
T  29658240 aattgaggctgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatgtaacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatg 29658339  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | |   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29658340 aatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcgcgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 29658427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 282 - 452
Target Start/End: Original strand, 5589643 - 5589812
Alignment:
Q  282 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 381  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5589643 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5589742  T
Q  382 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtg 452  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5589743 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtg 5589812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 268 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 47030442 - 47030255
Alignment:
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||    
T  47030442 aattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatatagcagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatg 47030343  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  47030342 aatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctc 47030255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 138
Target Start/End: Original strand, 16617440 - 16617574
Alignment:
Q  6 agaagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttgg 103  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  16617440 agaaacaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttgg 16617539  T
Q  104 atttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16617540 acttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaat 16617574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 28108863 - 28108976
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  28108863 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 28108961  T
Q  113 agccacttgaccgaa 127  Q
    |||||||||||||||    
T  28108962 agccacttgaccgaa 28108976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 35222220 - 35222091
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| || |||| |||||||  ||||||| ||||||||    
T  35222220 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccactggagacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggat 35222121  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35222120 ttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 35222091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 224
Target Start/End: Original strand, 5589493 - 5589644
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  5589493 aagcaaattgataggtgcaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcattggggattagtttgttgaaaaaatatagat 5589592  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatatt 224  Q
    ||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  5589593 tgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatatt 5589644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 10403450 - 10403340
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  10403450 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 10403352  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  10403351 agccacttgacc 10403340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22041717 - 22041583
Alignment:
Q  6 agaagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc--ggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttgg 103  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  22041717 agaaacaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccagagacataaacaaaaagacaggtgcaagctgctcttgg 22041618  T
Q  104 atttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22041617 acttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaat 22041583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 28028632 - 28028522
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  28028632 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 28028534  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  28028533 agccacttgacc 28028522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 7080587 - 7080466
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||    
T  7080587 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacagatacaagctgctcttgga-ttgagct 7080489  T
Q  113 agccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  7080488 agccactcgaccgaacagaaaca 7080466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 15885494 - 15885622
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  15885494 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaaggcaaatagacaggcgcaagctgctcttgga- 15885592  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  15885593 ttgagctagccacttgagcgaacagaaaca 15885622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 48473275 - 48473160
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  48473275 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 48473177  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  48473176 gagctagccacttgacc 48473160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 8219002 - 8218892
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  8219002 aaggcaaacagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccagacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 8218904  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  8218903 agccacttgacc 8218892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 17969655 - 17969781
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||  |    
T  17969655 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ct 17969753  T
Q  108 gaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    || |||||||||||| |||| |||||||    
T  17969754 gagctagccacttgagcgaacagaaaca 17969781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 20569757 - 20569867
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  20569757 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 20569855  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  20569856 agtcacttgacc 20569867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21682079 - 21681969
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  21682079 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 21681981  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  21681980 agtcacttgacc 21681969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 51789380 - 51789270
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| | || ||    
T  51789380 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tcgagct 51789282  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  51789281 agccacttgacc 51789270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4631124 - 4631009
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  4631124 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactagttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 4631026  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  4631025 gagctagccacttgacc 4631009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 20073378 - 20073263
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||| ||||||| ||    
T  20073378 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaagtacaagctgctcttgga-tt 20073280  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  20073279 gagctagccacttgacc 20073263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 22380499 - 22380614
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  22380499 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacggaaacatatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 22380597  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  22380598 gagctagccacttgacc 22380614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 31029159 - 31029274
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  31029159 aagcaaaggcaaataagcaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 31029257  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  31029258 gagctagccacttgacc 31029274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 5021076 - 5020966
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  5021076 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 5020978  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  5020977 agtcacttgacc 5020966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16423729 - 16423602
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||  ||||||| |||||||     
T  16423729 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggtgcaagctgctcttgga- 16423631  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaac 134  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  16423630 ttgagctagccacttgactgaacagaaac 16423602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 18285278 - 18285371
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18285278 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaaaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt 18285371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 18300578 - 18300671
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18300578 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaaaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt 18300671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47030584 - 47030437
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaata 167  Q
    |||||| || |||||| || | |||||| ||||||||| || |||| |||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47030584 acagaaacagatagacgggtataagctgctcttggatt-gagctagtcacttgactgaacggaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaata 47030486  T
Q  168 tagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 216  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  47030485 tagattgagattgacttgacatcgatttgatttgaaaggtagaaattga 47030437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 32446609 - 32446485
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagc---aaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |   |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  32446609 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaacacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 32446511  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| ||||||||||||    
T  32446510 gctagccacttgagcgaatagaaaca 32446485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 5589369 - 5589467
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  5589369 aagcaaaggcaaataaacagatgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt 5589467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 4691435 - 4691312
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||  ||||||| ||||||| | ||     
T  4691435 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggtgcaagctgctcttgga-tggag 4691337  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  4691336 ctagccacttgaccgaacagaaaca 4691312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 9527311 - 9527182
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttgga 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||  ||||||| ||||||     
T  9527311 aagcaaaggcaaacagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaaatagacaggtgcaagctgctcttgg- 9527213  T
Q  105 tttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  9527212 tttgagctagccacttgagcgaacagaaaca 9527182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 5718356 - 5718246
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  5718356 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagct 5718258  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  5718257 agtcacttgacc 5718246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 5729266 - 5729156
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  5729266 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagct 5729168  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  5729167 agtcacttgacc 5729156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 5763102 - 5763212
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  5763102 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagct 5763200  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  5763201 agtcacttgacc 5763212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9527118 - 9526981
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccact 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||   ||| |||||||  || ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9527118 agacaggtgcgagct-gttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaactgatagatacaagctgttcttggacttgaactagccact 9527020  T
Q  120 tgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt 158  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9527019 tgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttt 9526981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15368586 - 15368460
Alignment:
Q  11 caaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc--ggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttg 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||  | | |||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  15368586 caaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggacgcgaactggttactccaccagagacataaaaatacagacaggtgcaagctgctcttggacttg 15368487  T
Q  109 aactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15368486 aactagccacttgaccgaacagaaaca 15368460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 4789431 - 4789554
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc--ggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |  | |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||     
T  4789431 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccagagacaaagaccaatagataggcgcaagctgctcttgga-ttgag 4789529  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  4789530 ctagccacttgaccgaacagaaaca 4789554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 8282263 - 8282386
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |  ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||     
T  8282263 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactagttactccaccggagacaaagacaaatagacaggtgcaagctgctcttgga-ttgag 8282361  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||||||| |||| |||||||    
T  8282362 ctagccacttgaacgaacagaaaca 8282386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16599971 - 16599878
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16599971 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttgaatgcgaactagttactccaccggagagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt 16599878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 32297992 - 32297899
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  32297992 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaacagatagataggtacaagctgctcttggatt 32297899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 35888261 - 35888138
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |  ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||     
T  35888261 aaggtaaatagacgggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccgccggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgag 35888163  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  35888162 ctagccacttgaccgaacagaaaca 35888138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 11103285 - 11103377
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  11103285 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaacagatagataggtacaagctgctcttggat 11103377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 15733853 - 15733982
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttgga 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||  ||||||| |||||||    
T  15733853 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaaatagacaggtgcaagctgctcttgga 15733952  T
Q  105 tttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     | || |||||||||||| |||| |||||||    
T  15733953 -tcgagctagccacttgagcgaacagaaaca 15733982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18058791 - 18058662
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttgga 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18058791 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaattggttactccaccggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga 18058692  T
Q  105 tttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     | || |||||||||||| |||| |||||||    
T  18058691 -tcgagctagccacttgagcgaacagaaaca 18058662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 29141489 - 29141618
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttgga 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  29141489 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttcgatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga 29141588  T
Q  105 tttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     | || |||||||||||| |||| |||||||    
T  29141589 -tcgagctagccacttgagcgaacagaaaca 29141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 4424316 - 4424192
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  4424316 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 4424218  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  4424217 gctagccacttgagcgaacagaaaca 4424192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 4631419 - 4631295
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  4631419 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 4631321  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  4631320 gctagccacttgagcgaacagaaaca 4631295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 6535585 - 6535709
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  6535585 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 6535683  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  6535684 gctagccacttgagcgaacagaaaca 6535709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 16403332 - 16403456
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  16403332 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 16403430  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  16403431 gctagccacttgagcgaacagaaaca 16403456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 20073673 - 20073549
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  20073673 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 20073575  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  20073574 gctagccacttgagcgaacagaaaca 20073549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24335533 - 24335423
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||| || |||||||| ||||||| |||| ||    
T  24335533 aaggcaaatagacaggagcgagcttgttcttggatgcgaactggttactctaccggagagaaacagatagacgggtacaagctgctcttgga-ttgagct 24335435  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  24335434 agtcacttgacc 24335423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 48473570 - 48473446
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  48473570 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 48473472  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  48473471 gctagccacttgagcgaacagaaaca 48473446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 5659656 - 5659536
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  || |  ||||||||||||  ||||||| |||||||     
T  5659656 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgtgaactagttactctaccggagtcaaagacaaatagacaggtgcaagctgctcttgga- 5659558  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaa 127  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  5659557 ttgagctagccacttgaccgaa 5659536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 16403627 - 16403725
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16403627 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactaggtactccactggacagaaacatatagacaggtacaagctgctcttggatt 16403725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18338079 - 18337955
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacaga-agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  18338079 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgaagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 18337981  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  18337980 gctagccacttgagcgaacagaaaca 18337955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 5474374 - 5474258
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  5474374 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 5474276  T
Q  110 actagccacttgaccgaa 127  Q
     |||||||||||| ||||    
T  5474275 gctagccacttgagcgaa 5474258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 5589074 - 5589198
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  5589074 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttaccccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 5589172  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  5589173 gctagccacttgagcgaacagaaaca 5589198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 6209411 - 6209287
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  6209411 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 6209313  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     ||| |||||||| |||| |||||||    
T  6209312 gctaaccacttgagcgaacagaaaca 6209287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 47030700 - 47030576
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  47030700 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccactggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 47030602  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  47030601 gctagccacttgagcgaacagaaaca 47030576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10403274 - 10403192
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt 155  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  10403274 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttt 10403192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18250126 - 18250011
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | || ||||||||    
T  18250126 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccac 18250028  T
Q  119 ttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||| |||| |||||||    
T  18250027 ttgagcgaacagaaaca 18250011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 17977790 - 17977915
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaa----gcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||      |||||||||||| ||||||| ||||||| | |    
T  17977790 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgtgaactggttactccaccggagacaaataccaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcg 17977888  T
Q  109 aactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||    
T  17977889 agctagccacttgagcgaacagaaaca 17977915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 5602210 - 5602326
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  5602210 aaggcaaatagacaggtgcgagcttattcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 5602308  T
Q  110 actagccacttgaccgaa 127  Q
     |||||||||||| ||||    
T  5602309 gctagccacttgagcgaa 5602326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 31957355 - 31957471
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  31957355 aaggcaaatagacaggtgcgagcttattcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 31957453  T
Q  110 actagccacttgaccgaa 127  Q
     |||||||||||| ||||    
T  31957454 gctagccacttgagcgaa 31957471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 4691071 - 4690957
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccact 119  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||   ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4691071 agacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccact 4690973  T
Q  120 tgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||| || |||||||    
T  4690972 tgaccaaacagaaaca 4690957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 4729142 - 4729086
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4729142 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgtgaactggttactccaccgga 4729086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 10650395 - 10650316
Alignment:
Q  44 ggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10650395 ggattcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgacc 10650316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 28346525 - 28346469
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28346525 aaggcaaatagacaggtgcgagcttattcttggatgcgaactggttactccaccgga 28346469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 66
Target Start/End: Original strand, 16617385 - 16617439
Alignment:
Q  12 aaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc 66  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16617385 aaaggcaaatagacaggtacgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc 16617439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 22041772 - 22041718
Alignment:
Q  12 aaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc 66  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22041772 aaaggcaaatagacaggtacgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc 22041718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 22380205 - 22380261
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 69  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22380205 aaggtaaatagacgggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 22380261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 35222104 - 35222030
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  35222104 accgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggtcttgaactaaccacttgaccgaacagaaacaaat 35222030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4691325 - 4691265
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4691325 accgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 4691265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Original strand, 4789541 - 4789601
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4789541 accgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 4789601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16423599 - 16423543
Alignment:
Q  79 atagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16423599 atagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 16423543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 135
Target Start/End: Original strand, 17969384 - 17969485
Alignment:
Q  36 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagca---aatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaa 132  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  |   ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||    
T  17969384 ttgttcttggattcgaactggttactccaccggagacaacgacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgagcgaacagaa 17969482  T
Q  133 aca 135  Q
    |||    
T  17969483 aca 17969485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Original strand, 22380317 - 22380377
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22380317 accgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 22380377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 150
Target Start/End: Original strand, 15885761 - 15885874
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||  || || |||||||  |||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  15885761 gttcttggaggcgaactggtaactcgaccggaaacataaacaaataggtaggttcaagctgctcttggatt-gagctagccacttgaccaaacagaaaca 15885859  T
Q  136 aattcactggggatt 150  Q
     ||||||||||||||    
T  15885860 gattcactggggatt 15885874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 126
Target Start/End: Original strand, 17969773 - 17969830
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccga 126  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17969773 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccga 17969830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 135
Target Start/End: Original strand, 4339564 - 4339665
Alignment:
Q  36 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaa 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||| ||||||| ||||||| ||||||| | || |||||||||||| |||| ||||    
T  4339564 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatggacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaa 4339662  T
Q  133 aca 135  Q
    |||    
T  4339663 aca 4339665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Original strand, 31029043 - 31029087
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggt 57  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31029043 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggattcgaactggt 31029087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 35888151 - 35888091
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35888151 accgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 35888091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4424200 - 4424145
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4424200 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 4424145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4631303 - 4631248
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4631303 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 4631248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4729026 - 4728971
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4729026 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 4728971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 5601930 - 5601973
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5601930 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 5601973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 6209295 - 6209240
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6209295 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 6209240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 8282378 - 8282433
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8282378 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 8282433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 15733974 - 15734029
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15733974 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 15734029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 15885614 - 15885669
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15885614 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 15885669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 16403448 - 16403503
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16403448 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 16403503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16600259 - 16600216
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16600259 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 16600216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 17977255 - 17977298
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17977255 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 17977298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18058670 - 18058615
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18058670 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 18058615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18337963 - 18337908
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18337963 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 18337908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 19701809 - 19701767
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 65  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19701809 agacaggtgcgag-ttgttcttggatgcgaactggttactccac 19701767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 20073557 - 20073502
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20073557 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 20073502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 24335882 - 24335839
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24335882 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 24335839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 28346805 - 28346762
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28346805 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 28346762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 31957075 - 31957118
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31957075 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 31957118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 48473454 - 48473399
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48473454 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 48473399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 51789668 - 51789625
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51789668 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 51789625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 32446897 - 32446855
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32446897 gacaggtacaagctgttcttggatttaaactagccacttgacc 32446855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 5659526 - 5659481
Alignment:
Q  79 atagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5659526 atagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 5659481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Original strand, 6535297 - 6535341
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccga 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6535297 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccga 6535341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 125
Target Start/End: Original strand, 17969081 - 17969117
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17969081 acaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 17969117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 35887999 - 35887931
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  35887999 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccagacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 35887931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 4631768 - 4631725
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4631768 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 4631725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 5588786 - 5588829
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5588786 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 5588829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 5589190 - 5589245
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5589190 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttgggcttgaactagccacttgacc 5589245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 5718704 - 5718661
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5718704 gacaggtacaagctgctcttggattcgaactagccacttgaccg 5718661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 5729607 - 5729564
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5729607 gacaggtacaagctgctcttggattcgaactagccacttgaccg 5729564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 5762761 - 5762804
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5762761 gacaggtacaagctgctcttggattcgaactagccacttgaccg 5762804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 9527190 - 9527135
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9527190 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagtcacttgacc 9527135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 10403807 - 10403764
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10403807 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 10403764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 10650715 - 10650672
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10650715 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 10650672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 11102998 - 11103041
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11102998 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 11103041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 16402983 - 16403026
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16402983 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 16403026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 17969477 - 17969532
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17969477 acagaaacagatagacgggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 17969532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18232900 - 18232857
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18232900 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttaaccg 18232857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18250368 - 18250325
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18250368 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 18250325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 20074083 - 20074040
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20074083 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 20074040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 20569409 - 20569452
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20569409 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 20569452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 22863470 - 22863513
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22863470 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 22863513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 22878529 - 22878572
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22878529 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 22878572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 28028981 - 28028938
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28028981 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 28028938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 29141261 - 29141304
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29141261 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 29141304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 31028633 - 31028676
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31028633 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 31028676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 32298280 - 32298237
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32298280 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 32298237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 48474042 - 48473999
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48474042 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 48473999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 5659391 - 5659321
Alignment:
Q  36 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  5659391 ttgttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 5659321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 69
Target Start/End: Original strand, 8282155 - 8282199
Alignment:
Q  24 acaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 69  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  8282155 acaggtgcgag-ttgttcttgaattcgaactggttactccaccgga 8282199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16423556 - 16423495
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttctt-ggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16423556 accgaacagaaacagatagacaggtacaaactgttctttggacttgaactagccacttgacc 16423495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 4728879 - 4728811
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  4728879 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 4728811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 5021358 - 5021322
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5021358 acaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 5021322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 6209148 - 6209080
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  6209148 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 6209080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Original strand, 15734121 - 15734189
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  15734121 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 15734189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18058523 - 18058455
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  18058523 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 18058455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 125
Target Start/End: Original strand, 28108582 - 28108618
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28108582 acaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 28108618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Original strand, 29141757 - 29141825
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  29141757 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 29141825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 158)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 43085533 - 43085089
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||    
T  43085533 aaggcaaatagacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt-gagct 43085435  T
Q  113 agccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt---gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtag 209  Q
    |||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  43085434 agccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattggttttttcctgacaaaatatagattgagattgacttggcgtcgatttgatttgaaaggtag 43085335  T
Q  210 aaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatgga 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43085334 aaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatgga 43085235  T
Q  310 tgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagt 409  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||       
T  43085234 tgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgac 43085135  T
Q  410 ttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  43085134 ttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtaatggctc 43085089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 64 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 23899110 - 23898718
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaa 163  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23899110 accgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttgacaa 23899011  T
Q  164 aatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagg 263  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23899010 aatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagt 23898911  T
Q  264 attgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtg 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  23898910 attgaattgagactgatgttgacattgaaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatg 23898811  T
Q  364 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     | | ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  23898810 tacgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctc 23898718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 64 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 22895643 - 22895249
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt--gac 161  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||  |||    
T  22895643 accgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacagattcactggggattagttttttttgac 22895544  T
Q  162 aaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatga 261  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22895543 aaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagagattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgacatga 22895444  T
Q  262 ggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcg 361  Q
    | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||     
T  22895443 gtattgaattgagactgatgctgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgca 22895344  T
Q  362 tgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22895343 tgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagtcattggagtattgggcacgtagtggctc 22895249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 71 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 25207516 - 25207131
Alignment:
Q  71 agaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatag 170  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25207516 agaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaaccagccacttgaccgaacagaaacaaattcactagggattagttttttgacaaaatatag 25207417  T
Q  171 attgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaat 270  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25207416 attgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaat 25207317  T
Q  271 tgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggat 370  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||    
T  25207316 tgagactgatgctgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaat 25207217  T
Q  371 gcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25207216 gcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 25207131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 71 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 25271672 - 25271287
Alignment:
Q  71 agaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatag 170  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25271672 agaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaaccagccacttgaccgaacagaaacaaattcactagggattagttttttgacaaaatatag 25271573  T
Q  171 attgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaat 270  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25271572 attgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaat 25271473  T
Q  271 tgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggat 370  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||    
T  25271472 tgagactgatgctgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaat 25271373  T
Q  371 gcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25271372 gcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 25271287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 11556558 - 11556176
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt-gacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |     
T  11556558 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacctgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaata--gg 11556461  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11556460 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaatt 11556361  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  11556360 gagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 11556261  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11556260 cttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 11556176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 456
Target Start/End: Original strand, 18121310 - 18121753
Alignment:
Q  17 caaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18121310 caaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactag 18121409  T
Q  115 ccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt--ttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaa 212  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18121410 ccacttgaccaaacagaaacaggttcactggggattggttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 18121509  T
Q  213 ttgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatga 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18121510 ttgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagcattgaattgagactgatgttgccattggaaatgcaatatgcatggatga 18121609  T
Q  313 tataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   |||    
T  18121610 tataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttc 18121709  T
Q  413 gcggagacagacaagacattt-gagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     | | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18121710 accggga-agacaagacatttagagtattgggcacgtagtggctc 18121753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 90 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 33784671 - 33784304
Alignment:
Q  90 caagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt--gacaaaatatagattgaaactgacttgac 187  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33784671 caagctgctcttggatt-gagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgac 33784573  T
Q  188 gtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgaca 287  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  33784572 gtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgaca 33784473  T
Q  288 ttggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatg 387  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||      
T  33784472 ttggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgact 33784373  T
Q  388 gttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33784372 gttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 33784304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 23727444 - 23727059
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt---gacaaaatata 169  Q
    ||||||||||  |||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||| ||||    
T  23727444 aagcaaataggtaggttcaagctgctcttggatt-gagctagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttttgacaaagtata 23727346  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  23727345 gattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgag 23727246  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  23727245 ttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 23727146  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23727145 tgcttgtaatgcatgactgtcggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 23727059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 28952732 - 28953114
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28952732 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagat 28952831  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28952832 tgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagatagaaattgaccgataacattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 28952931  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  28952932 agactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 28953031  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28953032 ttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 28953114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 33299749 - 33299358
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt--------gacaaa 164  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||        ||||||    
T  33299749 aagcaaataggtaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttttttttttgacaaa 33299650  T
Q  165 atatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagga 264  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  33299649 atatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagta 33299550  T
Q  265 ttgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgc 364  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  33299549 ttgagttgagactgatgttgacatcggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgt 33299450  T
Q  365 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33299449 atgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 33299358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 13179751 - 13180136
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattgg---ttttttgacaaaatata 169  Q
    ||||||||||  |||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||  || |   |||||||||||||||||    
T  13179751 aagcaaataggtaggttcaagctgctcttggatt-gagctagccacttgaccaagcagaaacagattcactgggatttagtttttttttgacaaaatata 13179849  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13179850 gattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaa 13179949  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  13179950 ttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 13180049  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13180050 tgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctc 13180136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 32589211 - 32589594
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32589211 aagcaaattgacaggtacaagccgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatataga 32589310  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  32589311 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaatatcgaatt 32589410  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  32589411 gggactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcacgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 32589510  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32589511 cttgtaatgcatgatcgttggcagtttgtaggcacgacttcgcgg-gaaagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 32589594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 2518269 - 2517887
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt-ttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  2518269 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgcttgacaaaatataga 2518170  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2518169 ttgagattgacttgacgtcgatttgatt-gaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaatt 2518071  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  2518070 gagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 2517971  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2517970 cttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 2517887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 9543662 - 9544047
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttt---tgacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||   |||| |||||||    
T  9543662 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatata 9543761  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9543762 gattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaa 9543861  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  9543862 ttgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 9543961  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9543962 tgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 9544047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 8658430 - 8658812
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8658430 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgttgacaaaatatagat 8658529  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8658530 tgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 8658629  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  8658630 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 8658729  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  8658730 ttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtgttgggcacgtagtggctc 8658812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 38 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 23633210 - 23632792
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaa 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| ||||||||  || || | ||||||| |||| |||||||||    
T  23633210 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatc-gagctgggcacttgagcgaacagaaacaaa 23633112  T
Q  138 ttcactggggattggtttttt-gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaa 236  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23633111 ttcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaa 23633012  T
Q  237 ggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23633011 ggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatg 23632912  T
Q  337 ggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgag 436  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| | |||    
T  23632911 ggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggag 23632812  T
Q  437 tattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | |||||||||  |||||||    
T  23632811 tgttgggcacgcggtggctc 23632792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 36 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 24977087 - 24976666
Alignment:
Q  36 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaa 133  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||  || || |||||||  |||  |||| || ||||||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  24977087 ttgttcttggaggcgaactggtaactcgaccggaaacataaacaaataggtaggttcaagatgctcttggatt-gagctagccacttgaccaaacagaaa 24976989  T
Q  134 caaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctca 233  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24976988 cagattcactggggattgtttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctca 24976889  T
Q  234 caaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgc 333  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24976888 caaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgc 24976789  T
Q  334 atgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacattt 433  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||  || ||||||||||||||| |     
T  24976788 atgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttctgcagagacagacaagacactg 24976689  T
Q  434 gagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  24976688 gagtgttgggcacgcagtggctc 24976666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 34623723 - 34623341
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34623723 aagcaaattgataggtacaagctgttcctggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagttttttgacaaaatatagat 34623624  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  34623623 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgggtattgaattg 34623524  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  34623523 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 34623424  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34623423 ttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 34623341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 6881518 - 6881135
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt-gacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6881518 aagcaaattgataggtacaagctgttctcggactcgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatataaa 6881419  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6881418 ttgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaatt 6881319  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  6881318 gagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 6881219  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6881218 cttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 6881135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 37664441 - 37664823
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37664441 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagat 37664540  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  37664541 tgagattgacttgacgtcgattcgaattgaaaggtagagattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaatta 37664640  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  37664641 agactgatgttgacattggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 37664740  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37664741 ttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctc 37664823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 18368463 - 18368849
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt----ttgacaaaatat 168  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  18368463 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgtccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttgacaaaatat 18368562  T
Q  169 agattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattga 268  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18368563 agattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattga 18368662  T
Q  269 attgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgg 368  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||     
T  18368663 attgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatga 18368762  T
Q  369 atgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18368763 atgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 18368849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 33882333 - 33881948
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttt---tgacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   |||| |||||||    
T  33882333 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatata 33882234  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  |||||    
T  33882233 gattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaa 33882134  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  33882133 ttgagactgatattgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 33882034  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33882033 tgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctc 33881948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 37762198 - 37761816
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37762198 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgttgacaaaatatagat 37762099  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  37762098 tgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgataatattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattg 37761999  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  37761998 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 37761899  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||| ||  || ||||||||||||||||||||    
T  37761898 ttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagaatattgggcacgtagtggctc 37761816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 38 - 456
Target Start/End: Original strand, 22992043 - 22992460
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaa 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| ||||||||| || || | |||| |||| || |||||||||    
T  22992043 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt-gagctgggcactcgaccaaacagaaacaaa 22992141  T
Q  138 ttcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaag 237  Q
    ||||| ||||||| |||||||   | || |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22992142 ttcacaggggattagttttttttgacaacataggttgaaattgacttggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattataggctcacaag 22992241  T
Q  238 gttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgg 337  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22992242 gttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgg 22992341  T
Q  338 gcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagt 437  Q
    |||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22992342 gcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagt 22992441  T
Q  438 attgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22992442 attgggcacgtagtggctc 22992460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 456
Target Start/End: Original strand, 31819296 - 31819740
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaa--tagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |   |||  || || ||  ||||  ||||||||||  |||    
T  31819296 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcgaccgataatattgaaaagtaaacgggtgcaagtcgttcttggatgcgaa 31819395  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtaga 210  Q
    ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31819396 ctagtaacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacctgacgtcgatttgatttgaaaggtaga 31819495  T
Q  211 aattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggat 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31819496 aattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgggactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggat 31819595  T
Q  311 gatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtt 410  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   |    
T  31819596 gatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgact 31819695  T
Q  411 tcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    || ||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  31819696 tcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctc 31819740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 18493704 - 18494087
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18493704 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatataga 18493803  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||    
T  18493804 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgatagagaacccgatatgagtatcgaatt 18493903  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  18493904 gagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 18494003  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  18494004 cttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctc 18494087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 30036650 - 30036268
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30036650 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagtcacttgaccaaatagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagat 30036551  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    |||   ||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30036550 tgaggttgacttgacatcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 30036451  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  30036450 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 30036351  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30036350 ttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 30036268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 28656473 - 28656087
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt--tttgacaaaatatag 170  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28656473 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatag 28656374  T
Q  171 attgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt--gaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattga 268  Q
    ||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28656373 attgagattgacttgacgtcgatttggtttgaaaggtagaaattaagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattga 28656274  T
Q  269 attgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgg 368  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||     
T  28656273 attgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatga 28656174  T
Q  369 atgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28656173 atgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 28656087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 96 - 456
Target Start/End: Original strand, 15751818 - 15752177
Alignment:
Q  96 gttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattc 195  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||     
T  15751818 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgattt 15751917  T
Q  196 gatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaat 295  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15751918 gaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaat 15752017  T
Q  296 gcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 395  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  15752018 gcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgaccgttggcat 15752117  T
Q  396 tttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15752118 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 15752177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 96 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 30159221 - 30158862
Alignment:
Q  96 gttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattc 195  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||     
T  30159221 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgattt 30159122  T
Q  196 gatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaat 295  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30159121 gaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaat 30159022  T
Q  296 gcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 395  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  30159021 gcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 30158922  T
Q  396 tttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||   ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30158921 tttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 30158862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 31438661 - 31438279
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31438661 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagat 31438562  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    |||   |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  31438561 tgaggttgacttgacgtcgacttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacaaagaacctgacatgagtatcgaattg 31438462  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  31438461 agactgatgttgacattggaaatgcagcatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 31438362  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31438361 ttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 31438279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 68 - 456
Target Start/End: Original strand, 37745279 - 37745668
Alignment:
Q  68 gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt--tttgacaaaa 165  Q
    |||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  37745279 gacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgctttgacagaa 37745378  T
Q  166 tatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggat 265  Q
    || ||||||| | |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37745379 tagagattgagattgacttgacgtcgacttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtat 37745478  T
Q  266 tgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgca 365  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |    
T  37745479 tgaattgagaccgatgttgacattggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgta 37745578  T
Q  366 tggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    || ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || | |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37745579 tgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-aaacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 37745668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 3796759 - 3796375
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt--gacaaaatatag 170  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  3796759 aagcaaattgataggtacaagctgttcctggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttattctgacaaaatatag 3796660  T
Q  171 attgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaat 270  Q
    ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3796659 attgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaagtttcgacagagaacctgacatgagtattgaat 3796560  T
Q  271 tgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggat 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||| ||    
T  3796559 tgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggacgatataacagattcattaaatgcatggatacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaat 3796460  T
Q  371 gcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3796459 gcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagcattgggcacgtagtggctc 3796375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 90 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 30941819 - 30941452
Alignment:
Q  90 caagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattg--gttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgac 187  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  30941819 caagctgctcttggatt-gagctagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattattgttttttgacaaaatatagattgagattgacttgac 30941721  T
Q  188 gtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgaca 287  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||| |    
T  30941720 gtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgttgttgata 30941621  T
Q  288 ttggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatg 387  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||      
T  30941620 ttggaaatgtaatatgcatgaatgatagaacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgact 30941521  T
Q  388 gttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  30941520 gttggcgatttgtagacacagttccgcggagacagacaagacactggagtattgggcacacagtggctc 30941452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 73 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 24731175 - 24730793
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt--tttgacaaaatatag 170  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24731175 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatag 24731076  T
Q  171 attgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaat 270  Q
    ||| | | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24731075 attaagattgacttaacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgaccggtattattggcttacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaat 24730976  T
Q  271 tgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggat 370  Q
    |||||| ||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||    
T  24730975 tgagactgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaat 24730876  T
Q  371 gcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggc 454  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24730875 gcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggc 24730793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 96 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 33523585 - 33523226
Alignment:
Q  96 gttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattc 195  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  33523585 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattt 33523486  T
Q  196 gatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaat 295  Q
    || |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33523485 gaattgaaaggtaaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaat 33523386  T
Q  296 gcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 395  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  33523385 gcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 33523286  T
Q  396 tttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33523285 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 33523226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 96 - 456
Target Start/End: Original strand, 15651719 - 15652080
Alignment:
Q  96 gttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt--ttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgat 193  Q
    ||||||||||  ||||| |  |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  15651719 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacaggttcactggggattggttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgat 15651818  T
Q  194 tcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaa 293  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15651819 ttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtgttgaattgagactgatgttgacattggaa 15651918  T
Q  294 atgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggc 393  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||    
T  15651919 atgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggc 15652018  T
Q  394 agtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15652019 agtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 15652080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 30175692 - 30175310
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30175692 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttggcaaaatatagat 30175593  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||    
T  30175592 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattg 30175493  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| || ||| ||||    
T  30175492 agactgatattgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtattacgcatgattgtgcatgtatgaatgc 30175393  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||  ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30175392 ttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 30175310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 38 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 24609487 - 24609067
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||  || |  |||||||  |||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  24609487 gttcttggaggcgaactggtaactcgaccggaaacatagacaaataggtaggttcaagctgctcttggatt-gagctagccacttgaccaaacagaaaca 24609389  T
Q  136 aattcactggggattggtttttt-gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcac 234  Q
     ||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  24609388 gattcactggggattgttttttttgaaaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacctatattattggcacac 24609289  T
Q  235 aaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgca 334  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24609288 aaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagacttgtattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgca 24609189  T
Q  335 tgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttg 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||  ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |    
T  24609188 tgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactgg 24609089  T
Q  435 agtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  24609088 agtattgggcacgtaatggctc 24609067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Original strand, 13435617 - 13435988
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-----tttgacaaaatatagattgaaactgact 183  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| || |  |||| |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| | |||||    
T  13435617 acaagctggtcttggacgtgaactagccacttgaccaaacatgaacatattcactggggattggtttgttcttttgacaaaatatagattgagattgact 13435716  T
Q  184 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgtt 283  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  13435717 tgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgtt 13435816  T
Q  284 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcat 383  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||    
T  13435817 gacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 13435916  T
Q  384 gatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13435917 gactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 13435988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 26487598 - 26487216
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  26487598 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatataaat 26487499  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26487498 tgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatcgaattg 26487399  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  26487398 agactgatgttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 26487299  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26487298 ttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 26487216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 9324688 - 9324306
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  9324688 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggagattggtttgttgacaaaatataaat 9324589  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  9324588 tgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatcgaattg 9324489  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  9324488 agactgatgttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 9324389  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9324388 ttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 9324306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 12139386 - 12139004
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  12139386 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatataaat 12139287  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12139286 tgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatcgaattg 12139187  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  12139186 agactgatgttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtatgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 12139087  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12139086 ttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 12139004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 37351598 - 37351983
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattg-gtttt--ttgacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  37351598 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaatata 37351697  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37351698 gattgagattgacttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgattgatattattggctcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaa 37351797  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  37351798 ttgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcatggatgttataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 37351897  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| || |||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37351898 tgcttgtaatgcatgactgttggcatttggtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 37351983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 69 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 41681913 - 41681529
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaa-ttcactggggattggttt-tttgacaaaat 166  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41681913 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaaattcactggggattggtttgtttgacaaaat 41681814  T
Q  167 atagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggatt 266  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  41681813 atagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagacattgaccgatattattggctcacaaggtttggacagagaacctgacatgagtttt 41681714  T
Q  267 gaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcat 366  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||    
T  41681713 gaattgagactgatgttggtattggaaatacgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcgtgattatgcatgtat 41681614  T
Q  367 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | |||     || ||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41681613 gaatgt----aacgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagtcattagagtattgggcacgtagtggctc 41681529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Original strand, 13317779 - 13318145
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacg 188  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  13317779 acaagctgttcttggacgtgaactagccacttgaccaaacatgaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgaggttgacttgacg 13317878  T
Q  189 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacat 288  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||  ||    
T  13317879 tcgacttgaattgaaaggtagaaattgaccggtattattggctcacaaggtttcgacagagaacctgacatgagttttgaactgagactgatattgttat 13317978  T
Q  289 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatgg 388  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |    
T  13317979 tggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactg 13318078  T
Q  389 ttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  13318079 ttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctc 13318145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 268 - 456
Target Start/End: Original strand, 40466681 - 40466868
Alignment:
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||    
T  40466681 aattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatg 40466780  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40466781 aatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 40466868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5644965 - 5644814
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5644965 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgctgacaaaatatagat 5644866  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatatt 224  Q
    ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  5644865 tgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatatt 5644814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Original strand, 40466542 - 40466686
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40466542 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatataga 40466641  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 216  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40466642 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 40466686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 282 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 5644815 - 5644642
Alignment:
Q  282 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 381  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5644815 ttgacattggaaatgcgatgtgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5644716  T
Q  382 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5644715 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 5644642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11330798 - 11330640
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtt--ttttgacaaaatatag 170  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  11330798 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttttgacaaaatatag 11330699  T
Q  171 attgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattgg 229  Q
    ||||| | |||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  11330698 attgagattgacttaacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatatcattgg 11330640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 286 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 11330645 - 11330476
Alignment:
Q  286 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 385  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  11330645 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 11330546  T
Q  386 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
      ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11330545 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagcggctc 11330476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 22895759 - 22895630
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| || |||| |||||||  ||||||| ||||||||    
T  22895759 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccactggagacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggat 22895660  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22895659 ttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 22895630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 37745108 - 37745218
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  37745108 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 37745206  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  37745207 agccacttgacc 37745218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 28952556 - 28952669
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  28952556 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacggatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 28952654  T
Q  113 agccacttgaccgaa 127  Q
    |||||||||||||||    
T  28952655 agccacttgaccgaa 28952669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 28656649 - 28656521
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  28656649 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 28656551  T
Q  113 agccacttgaccgaatagaaacaaattcac 142  Q
    || ||||||||| ||  |||||| ||||||    
T  28656550 agtcacttgaccaaacggaaacatattcac 28656521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 13179276 - 13179391
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  13179276 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 13179374  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  13179375 gagctagccacttgacc 13179391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 25207693 - 25207565
Alignment:
Q  11 caaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggaca-gaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  25207693 caaaggcaaatagacaggtgcgagcttgctcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaaacaaacagacaggtgcaagctgttcttgaatttga 25207594  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25207593 actagccacttgactgaacagaaacaaat 25207565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 25271849 - 25271721
Alignment:
Q  11 caaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggaca-gaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  25271849 caaaggcaaatagacaggtgcgagcttgctcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaaacaaacagacaggtgcaagctgttcttgaatttga 25271750  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25271749 actagccacttgactgaacagaaacaaat 25271721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 15751619 - 15751729
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  15751619 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 15751717  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  15751718 agtcacttgacc 15751729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 18493528 - 18493638
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  18493528 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 18493626  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  18493627 agtcacttgacc 18493638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 30036826 - 30036716
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  30036826 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgggcagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 30036728  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  30036727 agccacttgacc 30036716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 31438839 - 31438744
Alignment:
Q  11 caaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31438839 caaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt 31438744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 32589035 - 32589156
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||    
T  32589035 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacagatacaagctgctcttgga-ttgagct 32589133  T
Q  113 agccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    || ||||||||| || |||||||    
T  32589134 agtcacttgaccaaacagaaaca 32589156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 6881694 - 6881584
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  6881694 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaggaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 6881596  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  6881595 agtcacttgacc 6881584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 23899222 - 23899097
Alignment:
Q  11 caaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttg 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| |||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  23899222 caaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaaaacaaacagacaggtgcaagctgctcttgga-ttg 23899124  T
Q  109 aactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||    
T  23899123 agctagccacttgaccgaacagaaaca 23899097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 34623899 - 34623789
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||| ||||||| |||| ||    
T  34623899 aaggcaaatagacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacgggtacaagctgctcttgga-ttgagct 34623801  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  34623800 agccacttgacc 34623789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 40466366 - 40466476
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  40466366 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 40466464  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  40466465 agtcacttgacc 40466476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 22991776 - 22991904
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagca--aatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |  ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  22991776 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagaccaatagacaggtgcaagctgctcttggat 22991875  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  22991876 t-gagctagccacttgaccgaacagaaaca 22991904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24977352 - 24977224
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  24977352 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga- 24977254  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||| ||||||||| || |||| |||||||    
T  24977253 ttgagctagccactcgagcgaacagaaaca 24977224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 23727801 - 23727678
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||     
T  23727801 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaagcgcaagctgctcttgga-ttgag 23727703  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  23727702 ctagccacttgaccgaacagaaaca 23727678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 30942135 - 30942012
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||     
T  30942135 aaggcaaataaacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgag 30942037  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  30942036 ctagccacttgaccgaacagaaaca 30942012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 33882452 - 33882359
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  33882452 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggacgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt 33882359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 33300111 - 33299982
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttgga 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33300111 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgttcttgga 33300012  T
Q  105 tttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     | || |||||||||||| |||| |||||||    
T  33300011 -tcgagctagccacttgagcgaacagaaaca 33299982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 9543486 - 9543596
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| | |||||| ||||||| |||| ||    
T  9543486 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggaccgaaacagatagacaggtataagctgctcttgga-ttgagct 9543584  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  9543585 agtcacttgacc 9543596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 282 - 456
Target Start/End: Original strand, 13178644 - 13178818
Alignment:
Q  282 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 380  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  13178644 ttgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatg 13178743  T
Q  381 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  13178744 catgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctc 13178818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 37351420 - 37351515
Alignment:
Q  11 caaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  37351420 caaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt 37351515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 37762376 - 37762281
Alignment:
Q  11 caaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  37762376 caaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt 37762281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24609749 - 24609626
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaa--gcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   | ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||     
T  24609749 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagataaagaccaatagacaggtgcaagctgctcttgga-ttgag 24609651  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  24609650 ctagccacttgaccgaacagaaaca 24609626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 33523726 - 33523634
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  33523726 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc-gacagaaacagatagccaggtacaagctgctcttggatt 33523634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 13178977 - 13179106
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttgga 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13178977 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga 13179076  T
Q  105 tttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     | || |||||||||||| |||| |||||||    
T  13179077 -tcgagctagccacttgagcgaacagaaaca 13179106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 30175868 - 30175758
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |  ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  30175868 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactagttactccaccggagagaaacggatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 30175770  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  30175769 agtcacttgacc 30175758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 37664263 - 37664358
Alignment:
Q  11 caaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  37664263 caaaggcaaataaacaggtatgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt 37664358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 23633477 - 23633349
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||| | ||||| |||||||     
T  23633477 aagcaaaggcagatagacaggtgcgaggttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggcgccagctgctcttgga- 23633379  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  23633378 ttgagctagccacttgagcgaacagaaaca 23633349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 9324864 - 9324771
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  9324864 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaacagatagataggtacaagctgctcttggatt 9324771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 11330974 - 11330881
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  11330974 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaacatatagataggtacaagctgctcttggatt 11330881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12139562 - 12139469
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  12139562 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaacagatagataggtacaagctgctcttggatt 12139469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 26487774 - 26487681
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  26487774 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaacagatagataggtacaagctgctcttggatt 26487681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 13317584 - 13317708
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  13317584 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 13317682  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  13317683 gctagccacttgagcgaacagaaaca 13317708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24731411 - 24731287
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  24731411 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 24731313  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  24731312 gctagccacttgagcgaacagaaaca 24731287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 41682029 - 41681905
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  41682029 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 41681931  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  41681930 gctagccacttgagcgaacagaaaca 41681905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 2518448 - 2518335
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  2518448 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttctcggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttga 2518350  T
Q  110 actagccacttgacc 124  Q
     ||||||||||||||    
T  2518349 gctagccacttgacc 2518335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 8658251 - 8658367
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  8658251 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 8658349  T
Q  110 actagccacttgaccgaa 127  Q
     |||||||||||| ||||    
T  8658350 gctagccacttgagcgaa 8658367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11556860 - 11556744
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttgga 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11556860 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcctccggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga 11556761  T
Q  105 tttgaactagccacttga 122  Q
     | || ||||||||||||    
T  11556760 -tcgagctagccacttga 11556744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Original strand, 18368284 - 18368412
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  18368284 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 18368382  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaacaaatt 139  Q
     |||||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  18368383 gctagccgcttgagcgaacggaaacaaatt 18368412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 13435421 - 13435545
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc--ggacaga-agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |  ||||| |||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  13435421 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggggacaaatacaaaataaacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 13435519  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  13435520 gctagccacttgagcgaacagaaaca 13435545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 25207576 - 25207507
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25207576 acagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaatagaaacaaat 25207507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 25271732 - 25271663
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25271732 acagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaatagaaacaaat 25271663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 31438898 - 31438822
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacagg 87  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||    
T  31438898 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaaggcaaatagacagg 31438822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 3797000 - 3796871
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttgga 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  3797000 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaaatggacaggcgcaagctgctcttgga 3796901  T
Q  105 tttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     | || |||||||||||| |||| |||||||    
T  3796900 -tcgagctagccacttgagcgaacagaaaca 3796871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 5645144 - 5645088
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5645144 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 5645088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 37351361 - 37351417
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37351361 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 37351417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 37664204 - 37664260
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37664204 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 37664260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 30159390 - 30159310
Alignment:
Q  43 tggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  30159390 tggattcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgacc 30159310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 37762435 - 37762379
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 69  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37762435 aaggcaaatagacaggtgtgagcttgttcttggctgcgaactggttactccaccgga 37762379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 11556667 - 11556584
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  11556667 agacaggtgcgagct-gttcttggattcgaactggtaactcgaccgaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 11556584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 30942025 - 30941965
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30942025 accgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 30941965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24977232 - 24977177
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24977232 acagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 24977177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 135
Target Start/End: Original strand, 13179457 - 13179519
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13179457 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 13179519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 22895875 - 22895767
Alignment:
Q  12 aaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||  |  || |  || ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22895875 aaaggcagacagacaggtgcgag-ttgttcttggattcgaactggtcactcgaccaaaatcatagacacatagacaggtacgagctgttcttggatttga 22895777  T
Q  110 actagccact 119  Q
    ||||||||||    
T  22895776 actagccact 22895767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 135
Target Start/End: Original strand, 18121150 - 18121251
Alignment:
Q  36 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaa 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | || |||||||||||| |||| ||||    
T  18121150 ttgttcttagatgcgaactggttactccaccggagataaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaa 18121248  T
Q  133 aca 135  Q
    |||    
T  18121249 aca 18121251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Original strand, 22991891 - 22991951
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22991891 accgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 22991951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 23727691 - 23727631
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23727691 accgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 23727631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24609639 - 24609579
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24609639 accgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 24609579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Original strand, 37744759 - 37744803
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccga 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37744759 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccga 37744803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 13317234 - 13317277
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13317234 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 13317277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 18121243 - 18121298
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18121243 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 18121298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 23633357 - 23633302
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23633357 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 23633302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 30037114 - 30037071
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30037114 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 30037071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 33784867 - 33784813
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg 67  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  33784867 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatttgaactggtaactcgaccg 33784813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11556729 - 11556684
Alignment:
Q  79 atagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11556729 atagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 11556684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 23727909 - 23727869
Alignment:
Q  24 acaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 65  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23727909 acaggtgcgag-ttgttcttggatgcgaactggttactccac 23727869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 30176224 - 30176183
Alignment:
Q  84 caggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30176224 caggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 30176183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 6881975 - 6881939
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6881975 acaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 6881939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 9325145 - 9325109
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9325145 acaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 9325109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 12139843 - 12139807
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12139843 acaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 12139807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 26488055 - 26488019
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26488055 acaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 26488019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 2518736 - 2518693
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2518736 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 2518693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3797343 - 3797300
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3797343 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 3797300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 8657971 - 8658014
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8657971 gacaggtacaaactgttcttggattcgaactagccacttgaccg 8658014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 9543198 - 9543241
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9543198 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 9543241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11331323 - 11331280
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11331323 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 11331280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 13177733 - 13177776
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13177733 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 13177776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 120
Target Start/End: Original strand, 13178024 - 13178066
Alignment:
Q  77 aaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccactt 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13178024 aaatagacagggacaagctgttcttgga-ttgaactagccactt 13178066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 13179098 - 13179153
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13179098 acagaaacagatagacgggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 13179153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 13435073 - 13435116
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13435073 gacaggtacaagctgttcctggattcgaactagccacttgaccg 13435116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 15651229 - 15651272
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15651229 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 15651272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 15751393 - 15751436
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15751393 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 15751436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 18120963 - 18121006
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18120963 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 18121006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 18368004 - 18368047
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18368004 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 18368047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 18493178 - 18493221
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18493178 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 18493221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 28656998 - 28656955
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28656998 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 28656955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 30159656 - 30159613
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30159656 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 30159613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 31818886 - 31818929
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31818886 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 31818929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 32588747 - 32588790
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32588747 gacaggtacaagctgtttttggattcgaactagccacttgaccg 32588790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 33299990 - 33299935
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33299990 acagaaacagatagacgggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 33299935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 33882740 - 33882697
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33882740 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 33882697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 37351081 - 37351124
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37351081 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 37351124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 37663916 - 37663959
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37663916 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 37663959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 40466078 - 40466121
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40466078 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 40466121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 41682378 - 41682335
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41682378 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 41682335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 43085943 - 43085900
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43085943 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 43085900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 126
Target Start/End: Original strand, 13435537 - 13435594
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccga 126  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  13435537 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactaggcactcgaccga 13435594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 33300324 - 33300283
Alignment:
Q  84 caggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33300324 caggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 33300283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 125
Target Start/End: Original strand, 28952215 - 28952251
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28952215 acaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 28952251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 33299843 - 33299775
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  33299843 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 33299775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 33784782 - 33784714
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  33784782 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 33784714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 86)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 69 - 456
Target Start/End: Original strand, 24585403 - 24585790
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaata 167  Q
    |||||| || || |||||| |||||||| ||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24585403 acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt-gagctgggcacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttgtttgacaaaata 24585501  T
Q  168 tagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattg 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24585502 tagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaaatgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattg 24585601  T
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  24585602 aattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatg 24585701  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24585702 aatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 24585790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 79 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 15235041 - 15234665
Alignment:
Q  79 atagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaac 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  15235041 atagacaggtacaagctgttcttggacttgaacaaaccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggattagttttt-gacaaaatgtagattgaaac 15234943  T
Q  179 tgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacag 278  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  15234942 tgacttgacgtcgatttgatttgaaaggcagagattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacatgacatgagtattgaattgagactg 15234843  T
Q  279 atgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 378  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  15234842 atgctgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatggtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 15234743  T
Q  379 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15234742 tgcatgattgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 15234665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 5701758 - 5701375
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5701758 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatataga 5701659  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5701658 ttgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaatt 5701559  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  5701558 gagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 5701459  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5701458 cttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 5701375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 14105756 - 14105390
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacg 188  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14105756 acaagctattcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacg 14105657  T
Q  189 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacat 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  14105656 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacat 14105557  T
Q  289 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatgg 388  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |    
T  14105556 tggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactg 14105457  T
Q  389 ttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | |||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14105456 tgggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 14105390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 79 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 24119866 - 24119488
Alignment:
Q  79 atagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaa-ttcactggggattggttt-tttgacaaaatatagattgaa 176  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24119866 atagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaaattcactggggattggtttgtttgacaaaatataggttgaa 24119767  T
Q  177 actgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagac 276  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24119766 attgacttgacgttgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggtcttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagac 24119667  T
Q  277 agatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 376  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  24119666 tgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 24119567  T
Q  377 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24119566 aatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 24119488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 36323374 - 36323756
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  36323374 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattagttttttgacaaaatatagat 36323473  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36323474 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggtcttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 36323573  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  36323574 agactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgc 36323673  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  36323674 ttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctc 36323756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 36337583 - 36337965
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  36337583 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattagttttttgacaaaatatagat 36337682  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36337683 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggtcttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 36337782  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  36337783 agactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgc 36337882  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  36337883 ttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctc 36337965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 75 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 54840616 - 54840237
Alignment:
Q  75 gcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattg 174  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54840616 gcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttt-gacaaaatatagattg 54840518  T
Q  175 aaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgag 274  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  54840517 agattgacttgacgtcaattcgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgag 54840418  T
Q  275 acagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgctt 374  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  54840417 actgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 54840318  T
Q  375 gaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  54840317 gtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggattattgggcacgtagtggctc 54840237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 18793676 - 18794062
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaa-tagaaacaaattcactggggattggtttttt---gacaaaatat 168  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  18793676 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaaatagaaacatattcactggggattggttttttcctgacaaaatat 18793775  T
Q  169 agattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattga 268  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18793776 agattgagattgacttggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattga 18793875  T
Q  269 attgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgg 368  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||     
T  18793876 attgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatga 18793975  T
Q  369 atgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18793976 atgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 18794062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 40098669 - 40099052
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40098669 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatataga 40098768  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40098769 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcataaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaatt 40098868  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  40098869 gagactgatgttgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 40098968  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||| | ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40098969 cttgtaatgcatgactgttggtattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 40099052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 456
Target Start/End: Original strand, 34181936 - 34182376
Alignment:
Q  17 caaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  34181936 caaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactag 34182035  T
Q  115 ccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt----ttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtaga 210  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34182036 ccacttgaccaaacagaaacaggttcactggggattggttttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtaga 34182135  T
Q  211 aattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatg-ttgacattggaaatgcaatatgtatgga 309  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||     |||||| |||||    
T  34182136 aattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtgttgaattgagactgatgtttgacattgga-----aatatgcatgga 34182230  T
Q  310 tgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagt 409  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| || |||| |||       
T  34182231 tgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcaattcgtaggcacgac 34182330  T
Q  410 ttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  34182331 ttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacatagtggctc 34182376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 39857844 - 39857461
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39857844 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatataga 39857745  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  39857744 ttgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaatt 39857645  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  39857644 gagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 39857545  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39857544 cttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 39857461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 14752551 - 14752935
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt--ttgacaaaatatag 170  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14752551 aagcaaattgataggtacaagctgttcttgaacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttgacaaaatatag 14752650  T
Q  171 attgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaat 270  Q
    ||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14752651 attgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaat 14752750  T
Q  271 tgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggat 370  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||    
T  14752751 tgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaat 14752850  T
Q  371 gcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14752851 gcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 14752935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 36 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 14672260 - 14671836
Alignment:
Q  36 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaa 133  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||   ||| ||||||||||  |||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  14672260 ttgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaataggtaggttcaagctgctcttggatt-gagctagccacttgaccaaacagaaa 14672162  T
Q  134 caaattcactggggattggtttttt---gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggc 230  Q
    || ||||||||||||||| ||||||   |||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14672161 cagattcactggggattgttttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggc 14672062  T
Q  231 tcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaa 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14672061 tcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaa 14671962  T
Q  331 tgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagaca 430  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14671961 tgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgatttgtggacacagttccgcagagacagacaagaca 14671862  T
Q  431 tttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     | |||||||||||||||| ||||||    
T  14671861 ctggagtattgggcacgtaatggctc 14671836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 30760993 - 30760610
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  30760993 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttggcaaaatgtagat 30760894  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30760893 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 30760794  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| |||    
T  30760793 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatg 30760694  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  30760693 cttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctc 30760610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 33666837 - 33667220
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  33666837 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttggcaaaatgtagat 33666936  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33666937 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 33667036  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| |||    
T  33667037 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatg 33667136  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  33667137 cttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctc 33667220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 96 - 456
Target Start/End: Original strand, 31119570 - 31119929
Alignment:
Q  96 gttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattc 195  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  31119570 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattt 31119669  T
Q  196 gatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaat 295  Q
    || |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31119670 gaattgaaaggtaaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaat 31119769  T
Q  296 gcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 395  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  31119770 gcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 31119869  T
Q  396 tttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31119870 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 31119929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 6577071 - 6576683
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt------gacaaaat 166  Q
    |||||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||      ||| ||||    
T  6577071 aagcaaattgataggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttttgaccaaat 6576972  T
Q  167 atagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggatt 266  Q
    || |||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6576971 atggattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatactaatggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatt 6576872  T
Q  267 gaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcat 366  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  6576871 gaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtat 6576772  T
Q  367 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   |||  || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6576771 gaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 6576683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 96 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 21976909 - 21976550
Alignment:
Q  96 gttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattc 195  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  21976909 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattt 21976810  T
Q  196 gatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaat 295  Q
    || ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21976809 gaattgaaagataaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaat 21976710  T
Q  296 gcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 395  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  21976709 gcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 21976610  T
Q  396 tttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||   ||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  21976609 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctc 21976550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 17020248 - 17019875
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt-gacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  17020248 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatatagg 17020149  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  17020148 ttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagtt 17020049  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| ||||||||           ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  17020048 gagactgatgttga-----------caacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 17019960  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  17019959 cttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctc 17019875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 5013111 - 5012727
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5013111 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacctgaccaaacagaaacatgttcactagggattggtttgttgaccaaatatagat 5013012  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  5013011 tgaaattgacttgacgtcgatttgatttaaaaggtagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagaggacctgacatgagtattgaattg 5012912  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttta-ttaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  5012911 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcatttaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 5012812  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtatt-gggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| ||||| |||   |||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  5012811 cttgtaatgcgtgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtgttggggcacgtagtggctc 5012727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 24814337 - 24814720
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt--ttgacaaaatatag 170  Q
    ||||||||||  |||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||  || |||||  ||||||||||||||    
T  24814337 aagcaaataggtaggttcaagctgctcttggatt-gagctagccacttgaccaagcagaaacagaatcactgggatttagttttttttgacaaaatatag 24814435  T
Q  171 attgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaat 270  Q
    ||||| | ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  24814436 attgagattgacttgacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctgacaaggttttaacagggaacctgacatgagtattgaat 24814535  T
Q  271 tgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggat 370  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||    
T  24814536 ggagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaat 24814635  T
Q  371 gcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||  ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24814636 gcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 24814720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 64 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1907462 - 1907228
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaa 163  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1907462 accggacagaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactagggattagttttttgacaa 1907363  T
Q  164 aatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagg 263  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||     
T  1907362 aatatagattcaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgatagagaacctgacataagt 1907263  T
Q  264 attgaattgagacagatgttgacattggaaatgca 298  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1907262 attgaattgagattgatgttgacattggaaatgca 1907228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 64 - 456
Target Start/End: Original strand, 15275661 - 15276045
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaa 163  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  15275661 accgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagttttt-gacaa 15275759  T
Q  164 aatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagg 263  Q
    |||||| ||||||| ||||||| | | ||    || |      |||| || | |||||   | |||||||| |||| |||||||||||  ||||||  |     
T  15275760 aatataaattgaaattgacttggcattgac---atatcc----tagagatgggccaatggcactggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggt 15275852  T
Q  264 attgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtg 363  Q
    || |||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||    
T  15275853 atcgaattgagactgaaattgacattggaaatgcaacatgtataggtggtataatagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatg 15275952  T
Q  364 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15275953 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 15276045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 64 - 456
Target Start/End: Original strand, 15379273 - 15379657
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaa 163  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||    
T  15379273 accgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcattggggattagttttt-gacaa 15379371  T
Q  164 aatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagg 263  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| | ||    || |      |||| || | |||||   | |||||||| |||| |||||||||||  ||||||  |     
T  15379372 aatataaattgaaattgacttgacattgac---atatcc----tagagatgggccaatggcactggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggt 15379464  T
Q  264 attgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtg 363  Q
    ||||||| |||||     |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  15379465 attgaatcgagactataattgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagttttattaaatgtatggacacgtaatatgcatgattatgcatg 15379564  T
Q  364 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15379565 tatgaacgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggaatattgggcacgtagtggctc 15379657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 224 - 456
Target Start/End: Original strand, 27156515 - 27156745
Alignment:
Q  224 tattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttt 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  27156515 tattggctcaca-ggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagatt 27156613  T
Q  324 tattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacaga 423  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| |||||| |||    
T  27156614 cattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-aga 27156712  T
Q  424 caagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27156713 caagacattagagtattgggcacgtagtggctc 27156745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 268 - 456
Target Start/End: Original strand, 20331667 - 20331854
Alignment:
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||    
T  20331667 aattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatg 20331766  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20331767 aatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 20331854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Original strand, 20331528 - 20331672
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20331528 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttaaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatataga 20331627  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 216  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20331628 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 20331672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 15379164 - 15379289
Alignment:
Q  15 ggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  15379164 ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacataaacaaacagacaggtgcaagctgttcttggacttgaact 15379263  T
Q  113 agccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15379264 agccacttgaccgaacagaaacaaat 15379289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 1907578 - 1907446
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| | |||||  ||||||| ||||||||    
T  1907578 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacataaacaaacaaacaggtgcaagctgctcttggat 1907479  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1907478 ttgaactagccacttgaccggacagaaacaaat 1907446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 341 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 1907229 - 1907114
Alignment:
Q  341 cataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtatt 440  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  1907229 cataatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggtagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 1907130  T
Q  441 gggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||||||||||||    
T  1907129 gggcacgtagtggctc 1907114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 54840799 - 54840684
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  54840799 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 54840701  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  54840700 gagctagccacttgacc 54840684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14105948 - 14105838
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  14105948 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaagagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 14105850  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  14105849 agccacttgacc 14105838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 20331352 - 20331462
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  20331352 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 20331450  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  20331451 aggcacttgacc 20331462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 30761169 - 30761059
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| | || ||    
T  30761169 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tcgagct 30761071  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  30761070 agccacttgacc 30761059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15235172 - 15235045
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  15235172 aagcaaaggcaaataaacaggtgcgagctcgtttttggatgcgaactggttactccaccggaaacataaacaaataaacaggtgcaagctgctcttggat 15235073  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15235072 ttgaactagccacttgaccgaacagaaa 15235045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 14752375 - 14752485
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  14752375 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaaaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 14752473  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  14752474 agtcacttgacc 14752485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 18793500 - 18793610
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  18793500 aaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 18793598  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  18793599 agccacttgacc 18793610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 138
Target Start/End: Original strand, 15275548 - 15275677
Alignment:
Q  11 caaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc--ggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttg 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||   |||| || |||| |||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  15275548 caaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggacgtgaactggttactccaccagagacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggagttg 15275647  T
Q  109 aactagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15275648 aactagccacttgaccgaacagaaacaaat 15275677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17020609 - 17020481
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  17020609 aagcaaagacaaatagacaagtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga- 17020511  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17020510 ttgagctagccacttgaccgaacagaaaca 17020481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 5013287 - 5013177
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  5013287 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggaagcgaactggttactccaccgggcagaaatagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 5013189  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  5013188 agccacttgacc 5013177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 33666661 - 33666771
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||  ||||||| ||||||| | || ||    
T  33666661 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagataggcaggtgcaagctgctcttgga-tcgagct 33666759  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  33666760 agccacttgacc 33666771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 14672520 - 14672397
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagca--aatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |  ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||     
T  14672520 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagaccaatagacaggtgcaagctgctcttggatt-gag 14672422  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  14672421 ctagccacttgaccgaacagaaaca 14672397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 15399038 - 15399161
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||     
T  15399038 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgag 15399136  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||| || |||| |||||||    
T  15399137 ctagccactcgagcgaacagaaaca 15399161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 21977050 - 21976958
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  21977050 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc-gacagaaacagatagccaggtacaagctgctcttggatt 21976958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 39858020 - 39857927
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  39858020 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttgaatgcgaactggttactccaccggagagaaacatatagacaggtacaagctgctcttggatt 39857927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15235353 - 15235234
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| | ||||| |||||||  ||||||| ||||||||    
T  15235353 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatacgaactggttactcccccggagacaaaggcaaacagacaggtgcaagctgctcttggat 15235254  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccg 125  Q
    | |||||||||||| |||||    
T  15235253 tcgaactagccactcgaccg 15235234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 24813975 - 24814104
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttgga 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24813975 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga 24814074  T
Q  105 tttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     | || |||||||||||| |||| |||||||    
T  24814075 -tcgagctagccacttgagcgaacagaaaca 24814104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 282 - 456
Target Start/End: Original strand, 24813642 - 24813816
Alignment:
Q  282 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 380  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  24813642 ttgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatg 24813741  T
Q  381 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   |||  || || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24813742 catgatggttgacagtttgtagacacgacttcatgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctc 24813816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 24119994 - 24119896
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24119994 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactagttactccactggacagaaacatatagacaggtacaagctgctcttggatt 24119896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 6577245 - 6577137
Alignment:
Q  15 ggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  6577245 ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaattggttactccaccggagacaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctag 6577147  T
Q  115 ccacttgacc 124  Q
     |||||||||    
T  6577146 tcacttgacc 6577137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 106
Target Start/End: Original strand, 31119434 - 31119521
Alignment:
Q  18 aaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  31119434 aaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc-gacagaaacagatagccaggtacaagctgctcttggatt 31119521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 24585053 - 24585177
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  24585053 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaacttgttactccaccggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttga 24585151  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  24585152 gctagccacttgagcgaacagaaaca 24585177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 5701937 - 5701810
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  5701937 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 5701839  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
     |||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  5701838 gctagccacttgagcgaacagagacaaat 5701810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 36323137 - 36323261
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  36323137 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactagttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 36323235  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  36323236 gctagccacttgagcgaacagaaaca 36323261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 36337346 - 36337470
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  36337346 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactagttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 36337444  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  36337445 gctagccacttgagcgaacagaaaca 36337470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 40098493 - 40098603
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |  ||||||||| |||||||| |||| || |||| ||    
T  40098493 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgctcttggatgcgaactagttactccaccggagagaaacggatagacaggtacaagctgctcttaga-ttgagct 40098591  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  40098592 agtcacttgacc 40098603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 67
Target Start/End: Original strand, 15379103 - 15379155
Alignment:
Q  15 ggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg 67  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15379103 ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggtcactcgaccg 15379155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 17020494 - 17020434
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17020494 accgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 17020434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 15399153 - 15399208
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15399153 acagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 15399208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 18793440 - 18793489
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactc 62  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18793440 aaggcaaatggacaggtgcgagtttgttcttggatgcgaactggttactc 18793489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 126
Target Start/End: Original strand, 24585169 - 24585226
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccga 126  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24585169 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccga 24585226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 175
Target Start/End: Original strand, 15399300 - 15399442
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||| || ||||||| |||| ||||||  || || |||||||  |||  ||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  15399300 gttcttggaggcaaactggtaactcgaccggaaacataaacaaataggtaggttcaaactgctcttggatt-gagctagccacttgaccaaacagaaaca 15399398  T
Q  136 aattcactggggattgg----ttttttgacaaaatatagattga 175  Q
     ||||||| |||||| |    |||||||||||||||||||||||    
T  15399399 gattcactagggatttgttttttttttgacaaaatatagattga 15399442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21977399 - 21977356
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21977399 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 21977356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 31119141 - 31119184
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31119141 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 31119184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 34181869 - 34181924
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34181869 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 34181924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 36323253 - 36323308
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36323253 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 36323308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 36337462 - 36337517
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36337462 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 36337517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 39858308 - 39858265
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39858308 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 39858265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14672410 - 14672350
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || |||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14672410 accgaacagaaacagatagacgggtacaagcggttcttggacttgaactagccacttgacc 14672350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 5702226 - 5702183
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5702226 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 5702183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 6577535 - 6577492
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6577535 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 6577492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 14106299 - 14106256
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14106299 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 14106256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 14752026 - 14752069
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14752026 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 14752069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 18793153 - 18793196
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18793153 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 18793196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 24120278 - 24120235
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24120278 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 24120235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 24812407 - 24812450
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24812407 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 24812450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 120
Target Start/End: Original strand, 24813069 - 24813111
Alignment:
Q  77 aaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccactt 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24813069 aaatagacagggacaagctgttcttgga-ttgaactagccactt 24813111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 30761518 - 30761475
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30761518 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 30761475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 33666312 - 33666355
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33666312 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 33666355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 34181588 - 34181631
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34181588 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 34181631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 36322841 - 36322884
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36322841 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 36322884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 36337050 - 36337093
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36337050 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 36337093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 112
Target Start/End: Original strand, 15399223 - 15399256
Alignment:
Q  79 atagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15399223 atagacaggtacaagctgttcttggatttgaact 15399256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 17020342 - 17020274
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  17020342 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 17020274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Original strand, 24585256 - 24585324
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  |||  |||||| || || ||||||||||||||| |||||||||    
T  24585256 gttcttggacgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggcacaagctgctcttggatt 24585324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 131)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 37 - 456
Target Start/End: Original strand, 34267908 - 34268330
Alignment:
Q  37 tgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaac 134  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||   ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  34267908 tgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaac 34268007  T
Q  135 aaattcactggggattggtttt-ttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctca 233  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34268008 aaattcacagggtattagtttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctca 34268107  T
Q  234 caaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgc 333  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34268108 caaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgc 34268207  T
Q  334 atgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacattt 433  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  34268208 atgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattg 34268307  T
Q  434 gagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  34268308 gagtattgggcacgtagtggctc 34268330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 64 - 456
Target Start/End: Original strand, 21696205 - 21696596
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaa 163  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| | |||| |||||    
T  21696205 accgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacaaattcgctggggattagctttt-gacaa 21696303  T
Q  164 aatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  21696304 aatatagattgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagt 21696403  T
Q  264 attgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtg 363  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  21696404 attgatttgagactgatgctgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 21696503  T
Q  364 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21696504 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 21696596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Original strand, 37678939 - 37679305
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacg 188  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37678939 acaagctattcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacg 37679038  T
Q  189 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacat 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  37679039 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacat 37679138  T
Q  289 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatgg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |    
T  37679139 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactg 37679238  T
Q  389 ttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37679239 ttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 37679305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Original strand, 37694204 - 37694570
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacg 188  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37694204 acaagctattcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacg 37694303  T
Q  189 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacat 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  37694304 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacat 37694403  T
Q  289 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatgg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |    
T  37694404 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactg 37694503  T
Q  389 ttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37694504 ttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 37694570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 8 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 3789726 - 3789278
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||     
T  3789726 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggacgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt- 3789628  T
Q  108 gaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaagg 206  Q
    || |||||||||||||| ||  |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3789627 gagctagccacttgaccaaacggaaacatattcaccggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 3789528  T
Q  207 tagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtat 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3789527 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 3789428  T
Q  307 ggatgatataacagttttatta-aatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 405  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||    
T  3789427 ggatgatataacagattcattagtatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggca 3789328  T
Q  406 cagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3789327 cgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 3789278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 28889449 - 28889067
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28889449 aagcaaattgataggtacaagctgtttttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattg-ttttttgacaaaatatagat 28889351  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28889350 tgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaactgaccaaaattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattg 28889251  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  28889250 agattgatgttaacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggtgtgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 28889151  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||  ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||    
T  28889150 ttgttatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagatgttggagtattgggcatgtagtggctc 28889067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 23117991 - 23117609
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    ||||||||||  |||  ||||| | ||||||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  23117991 aagcaaataggtaggttcaagccgctcttggatt-gagctagctgcttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttgacaaaatataggt 23117893  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23117892 tgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcccaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 23117793  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||     
T  23117792 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgt 23117693  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23117692 ttgtaatgcatgactgtttgcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 23117609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 21670198 - 21670580
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21670198 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgttgacaaaatatagat 21670297  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  21670298 tgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaatta 21670397  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| || ||| ||||    
T  21670398 agactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgcttatgcatgtatgaatgc 21670497  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21670498 ttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 21670580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 75 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 34162058 - 34161676
Alignment:
Q  75 gcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt--tttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34162058 gcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagat 34161959  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34161958 tgagattgacttaacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 34161859  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||     
T  34161858 agactgatgttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgt 34161759  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34161758 ttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 34161676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 37384857 - 37384490
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt-gacaaaatatagattgaaactgacttgac 187  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  37384857 acaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgatttttttgacaaagtatagattgagattgacttgac 37384758  T
Q  188 gtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgaca 287  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||    
T  37384757 gtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcggattgagactgatgttgaca 37384658  T
Q  288 ttggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatg 387  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||      
T  37384657 ttggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgact 37384558  T
Q  388 gttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37384557 gttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 37384490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 37932592 - 37932212
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37932592 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttt--gacaaaatatagat 37932495  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37932494 tgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 37932395  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  37932394 agactgatgttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 37932295  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  37932294 ttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagcattgggcacgtagtggctc 37932212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 39897286 - 39896904
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39897286 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgttgacaaaatatagat 39897187  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39897186 tgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 39897087  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  39897086 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 39896987  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | | |||||||||  ||||||| ||||||| | |   ||| ||| || |||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  39896986 tcgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcgcgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctc 39896904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 27123719 - 27123335
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt--gacaaaatatag 170  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27123719 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgactaaacagaaacatattcactggggattggttttttttgacaaaatatag 27123620  T
Q  171 attgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaat 270  Q
    ||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27123619 attgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaat 27123520  T
Q  271 tgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggat 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||    
T  27123519 tgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaat 27123420  T
Q  371 gcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27123419 gcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 27123335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Original strand, 253692 - 254059
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatatagattgaaactgacttgac 187  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  253692 acaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgac 253791  T
Q  188 gtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgaca 287  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  253792 gtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgaca 253891  T
Q  288 ttggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatg 387  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||      
T  253892 ttggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgact 253991  T
Q  388 gttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  253992 gttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 254059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 111 - 456
Target Start/End: Original strand, 31867874 - 31868216
Alignment:
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt--ttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggta 208  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31867874 ctagccacttgaccaagtagaaacagattcactggggattagttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggaa 31867973  T
Q  209 gaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatgg 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     |||||| ||||    
T  31867974 gaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattgga-----aatatgcatgg 31868068  T
Q  309 atgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacag 408  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  31868069 atgatataacagtctcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagacacag 31868168  T
Q  409 tttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31868169 tttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 31868216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Original strand, 19409525 - 19409891
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacg 188  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  19409525 acaagctgttcttggacctgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttgacaaaatatagattgaggttgacttgacg 19409624  T
Q  189 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacat 288  Q
    | |||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19409625 ttgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacat 19409724  T
Q  289 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatgg 388  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |    
T  19409725 tggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgaccg 19409824  T
Q  389 ttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19409825 ttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 19409891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 34298367 - 34297984
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt-ttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34298367 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccactagaccaaatagaaacatattcactggggattggtttgcttgacaaaatataga 34298268  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34298267 ttgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatactattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaatt 34298168  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| |||    
T  34298167 gagattgatgtcgacattggaaatgcaaaatgaatggatgatataacagtttcactaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatg 34298068  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34298067 cttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 34297984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 34868852 - 34868469
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||  |||||    
T  34868852 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttggcaaaaagtagat 34868753  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34868752 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 34868653  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  34868652 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 34868553  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||   ||| ||| || |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  34868552 cttgtaatgcatgactgttggcattttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctc 34868469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Original strand, 22921185 - 22921551
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacg 188  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22921185 acaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacg 22921284  T
Q  189 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacat 288  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  22921285 tcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaatgacctgtcatgagttttgaattgagactgatattgacat 22921384  T
Q  289 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatgg 388  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |    
T  22921385 tggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactg 22921484  T
Q  389 ttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22921485 ttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 22921551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 31883488 - 31883106
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31883488 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgttgacaaaatatagat 31883389  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||    
T  31883388 tgagattgatttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattg 31883289  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  31883288 agactgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 31883189  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31883188 ttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 31883106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 73 - 454
Target Start/End: Original strand, 12709647 - 12710029
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt--tttgacaaaatatag 170  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  12709647 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgaggattggtttgttttgacaaaatatag 12709746  T
Q  171 attgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaat 270  Q
    ||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  12709747 attgagattgacttaacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgaccggtattattggcttacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaat 12709846  T
Q  271 tgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggat 370  Q
    |||||| ||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||    
T  12709847 tgagactgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaat 12709946  T
Q  371 gcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggc 454  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12709947 gcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggc 12710029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 96 - 456
Target Start/End: Original strand, 16822386 - 16822745
Alignment:
Q  96 gttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattc 195  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  16822386 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattt 16822485  T
Q  196 gatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaat 295  Q
    || |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16822486 gaattgaaaggtaaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaat 16822585  T
Q  296 gcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 395  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  16822586 gcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 16822685  T
Q  396 tttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16822686 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 16822745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 96 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 16899094 - 16898735
Alignment:
Q  96 gttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattc 195  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  16899094 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattt 16898995  T
Q  196 gatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaat 295  Q
    || |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16898994 gaattgaaaggtaaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaat 16898895  T
Q  296 gcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 395  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  16898894 gcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 16898795  T
Q  396 tttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16898794 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 16898735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 96 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 32056946 - 32056587
Alignment:
Q  96 gttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattc 195  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  32056946 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattt 32056847  T
Q  196 gatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaat 295  Q
    || |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32056846 gaattgaaaggtaaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaat 32056747  T
Q  296 gcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 395  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  32056746 gcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 32056647  T
Q  396 tttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32056646 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 32056587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 12594034 - 12593649
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  12594034 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgggggttagtttgtttgacaaaatataga 12593935  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga--ccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    ||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12593934 ttgagtttgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaa 12593835  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| |    
T  12593834 ttgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttactaaatgcatgggcacgtaatacgcatgattatgcatgtatgaa 12593735  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| || |||||||||  |||| |||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12593734 tgcctgtaatgcatgactgttgacagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 12593649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 96 - 456
Target Start/End: Original strand, 13929657 - 13930018
Alignment:
Q  96 gttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt--tttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgat 193  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13929657 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgat 13929756  T
Q  194 tcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaa 293  Q
    | |  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13929757 ttgtattgaaaggcagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaa 13929856  T
Q  294 atgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggc 393  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||    
T  13929857 atgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggc 13929956  T
Q  394 agtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13929957 attttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 13930018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 153 - 456
Target Start/End: Original strand, 27427577 - 27427880
Alignment:
Q  153 ttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaac 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27427577 ttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaac 27427676  T
Q  253 ctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcat 352  Q
    | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27427677 ccgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcctgaatgatataacagtttcattaaatgcatggacacgtaatatgcat 27427776  T
Q  353 gattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtg 452  Q
    |||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  27427777 gattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatg 27427876  T
Q  453 gctc 456  Q
    ||||    
T  27427877 gctc 27427880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Original strand, 37944905 - 37945272
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt-ttgacaaaatatagattgaaactgacttgac 187  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  37944905 acaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgactcgac 37945004  T
Q  188 gtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgaca 287  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  37945005 gtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgatatgagtatcgaattgagactgatgttgaca 37945104  T
Q  288 ttggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatg 387  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||      
T  37945105 ttggaaacgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctggtaatgcatgact 37945204  T
Q  388 gttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     |||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37945205 attggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 37945272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 11628210 - 11628592
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |     
T  11628210 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgggggttggtttgttgacaaaatataaac 11628309  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11628310 tgagattgacttgacgtcgatttgtattgaaaggcagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaatattgaattg 11628409  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||| |||||||||| || ||| ||||    
T  11628410 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcactaaatgcatgggtacgtaatatgtatgattatgcatgtatgaatgc 11628509  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11628510 ttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 11628592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 40240743 - 40240358
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40240743 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattagtttgtttgacaaaatataga 40240644  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga--ccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    ||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40240643 ttgagcttgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaa 40240544  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  || ||| |    
T  40240543 ttgagactgatattgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaaggcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaa 40240444  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40240443 tgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctc 40240358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 38 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 12662723 - 12662304
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||  || || |||| ||  |||  ||||||| |||||| || || |||||||||||||| || |||||||    
T  12662723 gttcttggaggcgaactggtaactcgaccggaaacataaacaaacaggtaggttcaagctgctcttgggtt-gagctagccacttgaccaaacagaaaca 12662625  T
Q  136 aattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcaca 235  Q
     ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12662624 tattcactggggattattgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcaca 12662525  T
Q  236 aggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcat 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  12662524 aggttttgacagagaacccgacatgaatattgagttgagactgttgttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcag 12662425  T
Q  336 gggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttga 435  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||| |||||||| | | ||||||||||||||| | ||    
T  12662424 gggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtaaacacagttccacagagacagacaagacactgga 12662325  T
Q  436 gtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    || ||||||||| ||||||||    
T  12662324 gtgttgggcacgcagtggctc 12662304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 38 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 20845153 - 20844728
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||  || || |||||||  |||  ||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  20845153 gttcttggaggcgaactggtaactcgaccggaaacataaacaaataggtaggttcaaactgctcttggatt-gagctagccacttgaccaaatagaaaca 20845055  T
Q  136 aattcactggggattggtttttt------gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattgg 229  Q
     ||||||||||||||| ||||||      ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20845054 gattcactggggattgtttttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaagtagaaattgaccgatattattgg 20844955  T
Q  230 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 329  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  20844954 ctcacaaggttttgacagagaacccgtcatgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaa 20844855  T
Q  330 atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagac 429  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||  ||||||  |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  20844854 atgcataggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgatttgtaaacatagttccgcagagacagacaagac 20844755  T
Q  430 atttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | | ||||||| |||||||| ||||||    
T  20844754 actggagtattaggcacgtaatggctc 20844728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 64 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 27397554 - 27397170
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaa 163  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  27397554 accgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcactggggaatagttttt-gacaa 27397456  T
Q  164 aatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||    || |      |||| || | |||||   | |||||||| |||| |||||||||||  ||||||  |     
T  27397455 aatatagattgaaattgacttgacattgac---atgtcc----tagagatgggccaatggcactggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggt 27397363  T
Q  264 attgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtg 363  Q
    || |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||    
T  27397362 atcgaattgagactgaaattgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatg 27397263  T
Q  364 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27397262 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 27397170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 64 - 456
Target Start/End: Original strand, 19449433 - 19449819
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt-gaca 162  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19449433 accgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactaggcacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagtttttttgaca 19449532  T
Q  163 aaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgag 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||    || |      |||| || | |||||   | |||||| | |||| |||| ||||||  ||||||  |    
T  19449533 aaatatagattgaaattgacttgacattgac---atgtcc----tagagatgggccaatggcactggctccccaggtcttgatagagaatttgacatagg 19449625  T
Q  263 gattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgt 362  Q
     ||  ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| |    
T  19449626 tatcaaattgagactgaaattgacattgaaaatgcaatatacatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcat 19449725  T
Q  363 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | ||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19449726 gtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 19449819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 268 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 16168500 - 16168313
Alignment:
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||    
T  16168500 aattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgtatggatgatataacattttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatg 16168401  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16168400 aatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 16168313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 268 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 27783245 - 27783058
Alignment:
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||    
T  27783245 aattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatg 27783146  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27783145 aatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 27783058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 268 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 27810725 - 27810538
Alignment:
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| || |||    
T  27810725 aattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaataggcatgattatgcatgtatg 27810626  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27810625 aatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 27810538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 268 - 456
Target Start/End: Original strand, 39045101 - 39045289
Alignment:
Q  268 aattgagacagatgtt-gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcat 366  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||    
T  39045101 aattgagactgatgtttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtat 39045200  T
Q  367 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39045201 gaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 39045289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Original strand, 9343068 - 9343212
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  9343068 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatataga 9343167  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 216  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9343168 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 9343212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 268 - 452
Target Start/End: Original strand, 9343207 - 9343390
Alignment:
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||    
T  9343207 aattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatg 9343306  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtg 452  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9343307 aatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtg 9343390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16168639 - 16168495
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16168639 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatataga 16168540  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 216  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16168539 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 16168495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27783384 - 27783240
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27783384 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatataga 27783285  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 216  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27783284 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 27783240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27810864 - 27810720
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27810864 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatataga 27810765  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 216  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27810764 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 27810720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Original strand, 39044962 - 39045106
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  39044962 aagcaaattgacaggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttcgacaaaatataga 39045061  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 216  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39045062 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 39045106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 11628034 - 11628147
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  11628034 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 11628132  T
Q  113 agccacttgaccgaa 127  Q
    |||||||||||||||    
T  11628133 agccacttgaccgaa 11628147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 28889810 - 28889682
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  28889810 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga- 28889712  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  28889711 ttgaactagccacttgagcgaacagaaaca 28889682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 126
Target Start/End: Original strand, 31867182 - 31867299
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  31867182 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 31867280  T
Q  108 gaactagccacttgaccga 126  Q
    || ||||||||||||||||    
T  31867281 gagctagccacttgaccga 31867299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3790020 - 3789905
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  3790020 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 3789922  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  3789921 gagctagccacttgacc 3789905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16168815 - 16168705
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  16168815 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 16168717  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  16168716 agtcacttgacc 16168705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27811040 - 27810930
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  27811040 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 27810942  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  27810941 agtcacttgacc 27810930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 34869023 - 34868913
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  34869023 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 34868925  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  34868924 agtcacttgacc 34868913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 37678747 - 37678857
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  37678747 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaagagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 37678845  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  37678846 agccacttgacc 37678857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 37694012 - 37694122
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  37694012 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaagagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 37694110  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  37694111 agccacttgacc 37694122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 34267003 - 34267118
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  34267003 aagcaaaggaaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacatatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 34267101  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  34267102 gagctagccacttgacc 34267118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 39897467 - 39897352
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  39897467 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 39897369  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || |||| |||||||||    
T  39897368 gagctagtcacttgacc 39897352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 9342892 - 9343002
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  9342892 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 9342990  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  9342991 agtcacttgacc 9343002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 19409333 - 19409443
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  19409333 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 19409431  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  19409432 agtcacttgacc 19409443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 39044786 - 39044896
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||    
T  39044786 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacagatacaagctgctcttgga-ttgagct 39044884  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  39044885 agtcacttgacc 39044896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 138
Target Start/End: Original strand, 19449320 - 19449449
Alignment:
Q  11 caaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc--ggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttg 108  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| || |||| |||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  19449320 caaaagcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggacgcgaactggttactccaccagagacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttg 19449419  T
Q  109 aactagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19449420 aactagccacttgaccgaacagaaacaaat 19449449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 12662986 - 12662863
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||     
T  12662986 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatacacaggcgcaagctgctcttgga-ttgag 12662888  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  12662887 ctagccacttgaccgaacagaaaca 12662863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 138
Target Start/End: Original strand, 21696089 - 21696221
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  |||| || |||| |||||||  ||||||| ||||||||    
T  21696089 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggattcaaactggttactccactggagacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggat 21696188  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21696189 tcaaactagccacttgaccgaacagaaacaaat 21696221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 282 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 3790653 - 3790479
Alignment:
Q  282 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 380  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  3790653 ttgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatg 3790554  T
Q  381 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  3790553 catgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctc 3790479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 37385049 - 37384939
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| |     
T  37385049 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactagttactctaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagcc 37384951  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  37384950 agccacttgacc 37384939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 16822245 - 16822337
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  16822245 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc-gacagaaacagatagccaggtacaagctgctcttggatt 16822337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16899235 - 16899143
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  16899235 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc-gacagaaacagatagccaggtacaagctgctcttggatt 16899143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 27123838 - 27123745
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  27123838 aaggcaaatagacaggtgcgagctggttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagataggtacaagctgctcttggatt 27123745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 32057087 - 32056995
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  32057087 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc-gacagaaacagatagccaggtacaagctgctcttggatt 32056995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 3790320 - 3790191
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttgga 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3790320 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggaaacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga 3790221  T
Q  105 tttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     | || |||||||||||| |||| |||||||    
T  3790220 -tcgagctagccacttgagcgaacagaaaca 3790191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 253500 - 253610
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  253500 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagct 253598  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  253599 agtcacttgacc 253610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27783617 - 27783507
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  27783617 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagct 27783519  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  27783518 agtcacttgacc 27783507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 37944713 - 37944823
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  37944713 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagct 37944811  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  37944812 agtcacttgacc 37944823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 40240919 - 40240809
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  40240919 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagct 40240821  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  40240820 agtcacttgacc 40240809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12594210 - 12594100
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || ||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  12594210 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgaagacaaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagct 12594112  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  12594111 agtcacttgacc 12594100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 12709411 - 12709535
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  12709411 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 12709509  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  12709510 gctagccacttgagcgaacagaaaca 12709535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 23118348 - 23118224
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |   | ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  23118348 aaggcaaatagacaggtgcgagctcgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagaccaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 23118250  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  23118249 gctagccacttgagcgaacagaaaca 23118224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27397664 - 27397538
Alignment:
Q  11 caaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||   ||||| |  |||  |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27397664 caaaggcaaatagacaggtgcgagct-gctcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaa 27397566  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27397565 ctagccacttgaccgaacagaaacaaat 27397538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 39897762 - 39897638
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  39897762 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 39897664  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  39897663 gctagccacttgagcgaacagaaaca 39897638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 31883667 - 31883540
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  31883667 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 31883569  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
     |||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  31883568 gctagccacttgagcgaacagagacaaat 31883540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Original strand, 27427182 - 27427243
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 69  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27427182 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 27427243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 21670019 - 21670135
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  21670019 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 21670117  T
Q  110 actagccacttgaccgaa 127  Q
     |||||||||||| ||||    
T  21670118 gctagccacttgagcgaa 21670135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 34266768 - 34266862
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  34266768 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcctggat 34266862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 22920990 - 22921117
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  22920990 aaggcaaatagacaggtgcgagcttattcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 22921088  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
     |||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  22921089 gctagccacttgagcgaacagagacaaat 22921117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27397713 - 27397596
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaa--gcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccact 119  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||| | | ||  |||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27397713 agacaggtacgag-ttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcgagctgctcttggacttgaactagccact 27397615  T
Q  120 tgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  27397614 tgaccgaacagaaacaaat 27397596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 34162298 - 34162249
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactc 62  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34162298 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactc 34162249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12662876 - 12662816
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12662876 accgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 12662816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 135
Target Start/End: Original strand, 31866911 - 31867012
Alignment:
Q  36 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagca---aatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaa 132  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  |   ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||    
T  31866911 ttgttcttggattcgaactggttactccaccggagacaacgacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgagcgaacagaa 31867009  T
Q  133 aca 135  Q
    |||    
T  31867010 aca 31867012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 135
Target Start/End: Original strand, 34267418 - 34267480
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  34267418 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 34267480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 135
Target Start/End: Original strand, 34267535 - 34267597
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  34267535 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 34267597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Original strand, 27427313 - 27427358
Alignment:
Q  79 atagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27427313 atagacaggtacaagctgctcttggatttgaactagccacttgacc 27427358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 124
Target Start/End: Original strand, 13929489 - 13929568
Alignment:
Q  44 ggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||    
T  13929489 ggattcgaactggttactcgactggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagttagccacttgacc 13929568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 20845300 - 20845245
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20845300 acagaaacagatagacaggtacaagctgttcttgaacttgaactagccacttgacc 20845245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 21669739 - 21669782
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21669739 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 21669782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 28889690 - 28889635
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28889690 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 28889635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 34298769 - 34298726
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34298769 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 34298726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 40241267 - 40241224
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40241267 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 40241224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 27124186 - 27124144
Alignment:
Q  83 acaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27124186 acaggtacaaactgttcttggatttgaactagccacttgaccg 27124144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 135
Target Start/End: Original strand, 31867426 - 31867488
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31867426 aagcaaattgataggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 31867488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 135
Target Start/End: Original strand, 31867543 - 31867605
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31867543 aagcaaattgataggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 31867605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 135
Target Start/End: Original strand, 34267184 - 34267246
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||    
T  34267184 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccactcgaccaaacagaaaca 34267246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 135
Target Start/End: Original strand, 34267301 - 34267363
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||    
T  34267301 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccactcgaccaaacagaaaca 34267363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 139
Target Start/End: Original strand, 34267769 - 34267835
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaatt 139  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  34267769 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactgggcacttgaccaaacagaaacaaatt 34267835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Original strand, 19449270 - 19449337
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacagg 87  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||   ||| |||||||||||||||    
T  19449270 agacaggtacgagcttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaaacaaaagcaaatagacagg 19449337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 253091 - 253134
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  253091 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 253134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3790199 - 3790144
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3790199 acagaaacagatagacgggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 3790144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 3791203 - 3791161
Alignment:
Q  77 aaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccactt 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3791203 aaatagacagggacaagctgttcttgga-ttgaactagccactt 3791161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3791678 - 3791635
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3791678 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 3791635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 12594498 - 12594455
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12594498 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 12594455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 12709123 - 12709166
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12709123 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 12709166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 13929170 - 13929213
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13929170 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 13929213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16169102 - 16169059
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16169102 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 16169059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 16821896 - 16821939
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16821896 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttaaccg 16821939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 22920710 - 22920753
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22920710 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 22920753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 23118232 - 23118181
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccactt 120  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23118232 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccactt 23118181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 27811328 - 27811285
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27811328 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 27811285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 31866602 - 31866645
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31866602 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 31866645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 31867004 - 31867059
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31867004 acagaaacagatagacgggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 31867059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 34162646 - 34162603
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34162646 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 34162603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 37385398 - 37385355
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37385398 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 37385355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 37678459 - 37678502
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37678459 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 37678502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 37693724 - 37693767
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37693724 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 37693767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 37944426 - 37944469
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37944426 gacaggtacaagctgctcttggattcgaactagccacttgaccg 37944469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 39044437 - 39044480
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  39044437 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 39044480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 39897646 - 39897591
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39897646 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggtcttgaactagccacttgacc 39897591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 39898172 - 39898129
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  39898172 gacaggtacaagctgttcttggattaaaactagccacttgaccg 39898129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 139
Target Start/End: Original strand, 34267652 - 34267718
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaatt 139  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| || | |||||||||    
T  34267652 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactgggcacttgaccaaacataaacaaatt 34267718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 151
Target Start/End: Original strand, 27427504 - 27427564
Alignment:
Q  90 caagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattg 151  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||    
T  27427504 caagctgctcttggatt-gagctagccacttgaccaaacagaaacagattcattggggattg 27427564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 125
Target Start/End: Original strand, 19409051 - 19409087
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19409051 acaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 19409087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 68
Target Start/End: Original strand, 19449200 - 19449255
Alignment:
Q  12 aaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg 68  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19449200 aaaggcagacagacaggtgcgag-tcgttctttgatgcgaactggttactcgaccgg 19449255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 27783898 - 27783862
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27783898 acaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 27783862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Original strand, 31867743 - 31867811
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  31867743 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 31867811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 31883886 - 31883850
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31883886 acaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 31883850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 51645507 - 51645061
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagca---aatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  51645507 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgctcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgttcttggacttga 51645408  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggta 208  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  51645407 actagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgatttgaaaggca 51645308  T
Q  209 gaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatgg 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51645307 gaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcaatatgtatgg 51645208  T
Q  309 atgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacag 408  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||      
T  51645207 atgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacga 51645108  T
Q  409 tttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  51645107 cttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 51645061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 456
Target Start/End: Original strand, 16201010 - 16201450
Alignment:
Q  17 caaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagcc 116  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |  |||  |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16201010 caaacagacaggtgcaagct-gttcttggatttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagcc 16201108  T
Q  117 acttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt--ttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16201109 acttgaccgaacagaaacaaattcactagggattagttttttttgacaaaatatagattgaagttgactggacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt 16201208  T
Q  215 gaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgata 314  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16201209 gatcaatattattggctcacaagattttgatagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgata 16201308  T
Q  315 taacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgc 414  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16201309 taacagttttatcaaatgtatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgc 16201408  T
Q  415 ggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16201409 agagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 16201450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 64 - 456
Target Start/End: Original strand, 20333443 - 20333836
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt-ttgaca 162  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  20333443 accgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccactagaccgaacagaaacaaattcattggggattagtttttttgaca 20333542  T
Q  163 aaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgag 262  Q
    |||| |||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  20333543 aaatgtagattgagattgacttgaagtcgatttggtttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgacatggg 20333642  T
Q  263 gattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgt 362  Q
     |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  20333643 tattgaattcagactgatgctgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcat 20333742  T
Q  363 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20333743 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 20333836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 8 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 28592369 - 28591920
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||     
T  28592369 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt- 28592271  T
Q  108 gaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttt---tgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaa 204  Q
    || |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||    
T  28592270 gagctagccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgacttaacattgattcgatttgaaa 28592171  T
Q  205 ggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgt 304  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28592170 ggtagaaattgaccgatactattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgc 28592071  T
Q  305 atggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 404  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |    
T  28592070 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggc 28591971  T
Q  405 acagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||   ||| ||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28591970 acgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctc 28591920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 28156993 - 28156544
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||     
T  28156993 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt- 28156895  T
Q  108 gaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt---gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaa 204  Q
    || |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||    
T  28156894 gagctagccacttgaccaaacggaaacatattgactggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaa 28156795  T
Q  205 ggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgt 304  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28156794 ggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgc 28156695  T
Q  305 atggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 404  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  28156694 acggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggc 28156595  T
Q  405 acagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28156594 acgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 28156544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 14691955 - 14692336
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  14691955 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatc--ttttttgacaaaatatagat 14692052  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  14692053 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtaggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttg 14692152  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  14692153 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 14692252  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14692253 ttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 14692336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 14694637 - 14695018
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  14694637 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatc--ttttttgacaaaatatagat 14694734  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  14694735 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtaggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttg 14694834  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  14694835 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 14694934  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14694935 ttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 14695018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 14697321 - 14697702
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  14697321 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatc--ttttttgacaaaatatagat 14697418  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  14697419 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtaggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttg 14697518  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  14697519 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 14697618  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14697619 ttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 14697702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 14700002 - 14700383
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  14700002 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatc--ttttttgacaaaatatagat 14700099  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  14700100 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtaggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttg 14700199  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  14700200 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 14700299  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14700300 ttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 14700383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 456
Target Start/End: Original strand, 41786311 - 41786753
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||    
T  41786311 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggacgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt-gagct 41786409  T
Q  113 agccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaa 211  Q
    |||||||||||| ||  |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  41786410 agccacttgaccaaacggaaacatattcaccggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattggcttgacgtcgatttgatttgaaaggcggaa 41786509  T
Q  212 attgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatg 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  41786510 attgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatg 41786609  T
Q  312 atataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagttt 411  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||    
T  41786610 atataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgactt 41786709  T
Q  412 cgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | ||| || ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  41786710 cacgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctc 41786753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 64 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 20468020 - 20467623
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttg---- 159  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||         
T  20468020 accgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagttttttttttg 20467921  T
Q  160 -acaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 258  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20467920 tacaaaatatagattgaaactgacttgacgtggatttgatttgaaaggtagaaattgaccagtattattggctcacaagattttgacagagaacctgaca 20467821  T
Q  259 tgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattat 358  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  20467820 tgagtattgaattgagactgatgctgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattat 20467721  T
Q  359 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20467720 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagcttgtagacaccgtttcgtagagacagacaaggcattggagtattggccacgtagtggctc 20467623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 73 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 10969865 - 10969486
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  10969865 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccagacagaaacatattcactggggattggtttgttggcaaaatgtagat 10969766  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10969765 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattg 10969666  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| |||    
T  10969665 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 10969566  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtg 452  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10969565 cttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtg 10969486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 37 - 456
Target Start/End: Original strand, 21890749 - 21891169
Alignment:
Q  37 tgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaac 134  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||   ||| || |||||||  |||   |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||    
T  21890749 tgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataaacaaataggtaggttgaagctgctcttggatt-gagttagccacttgaccaaacagaaac 21890847  T
Q  135 aaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcac 234  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  21890848 agattcactggggattgtttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggcacac 21890947  T
Q  235 aaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgca 334  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21890948 aaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgtcgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgca 21891047  T
Q  335 tgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttg 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || |||||| ||  ||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |    
T  21891048 tgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcctgtaatgcacgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacatacaagacactgg 21891147  T
Q  435 agtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  21891148 agtattgggcacgtaatggctc 21891169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 3648376 - 3647986
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3648376 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgaggattagtttgtttgacaaaatataga 3648277  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga--ccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3648276 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaa 3648177  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgc-----aatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgc 364  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||     
T  3648176 ttgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgt 3648077  T
Q  365 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3648076 atgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 3647986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 10952314 - 10951931
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  10952314 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccagacagaaacatattcactggggattggtttgttggcaaaatgtagat 10952215  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
T  10952214 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaagttgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaagaacctgtcatgagttttgaattg 10952115  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  10952114 agactgatattgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 10952015  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||  ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10952014 cttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 10951931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 20468136 - 20468004
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc--ggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  20468136 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggggacataaacaaatagacaggtgcaagctgctcttggat 20468037  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20468036 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaat 20468004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 20333329 - 20333456
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20333329 aagcaaaggcaaatagacatgtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggaaacaaacagatagacaggtacaagctgttcttggattt 20333428  T
Q  108 gaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20333429 gaactagccacttaaccgaacagaaaca 20333456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 138
Target Start/End: Original strand, 16200944 - 16201072
Alignment:
Q  11 caaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggaca-gaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16200944 caaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaaacaaacagacaggtgcaagctgttcttggatttga 16201043  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16201044 actagccacttgaccgaacagaaacaaat 16201072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 28592544 - 28592429
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  28592544 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 28592446  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  28592445 gagctagccacttgacc 28592429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 14691599 - 14691722
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||     
T  14691599 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgag 14691697  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  14691698 ctagccacttgaccgaacagaaaca 14691722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 14694281 - 14694404
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||     
T  14694281 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgag 14694379  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  14694380 ctagccacttgaccgaacagaaaca 14694404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 14696965 - 14697088
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||     
T  14696965 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgag 14697063  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  14697064 ctagccacttgaccgaacagaaaca 14697088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 14699646 - 14699769
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||     
T  14699646 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgag 14699744  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  14699745 ctagccacttgaccgaacagaaaca 14699769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 14702337 - 14702460
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||     
T  14702337 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgag 14702435  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  14702436 ctagccacttgaccgaacagaaaca 14702460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 21890077 - 21890200
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||  ||||||| ||||||| | ||     
T  21890077 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggtgcaagctgctcttgga-tggag 21890175  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  21890176 ctagccacttgaccgaacagaaaca 21890200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3648552 - 3648442
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  3648552 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagct 3648454  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  3648453 agtcacttgacc 3648442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 10952490 - 10952397
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  10952490 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaacagatagataggtacaagctgctcttggatt 10952397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 10970101 - 10969977
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  10970101 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 10970003  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  10970002 gctagccacttgagcgaacagaaaca 10969977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 28157288 - 28157164
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  28157288 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 28157190  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  28157189 gctagccacttgagcgaacagaaaca 28157164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 28592714 - 28592604
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || || ||||| ||| |||||| | ||||||| |||| ||    
T  28592714 aaggcaaatagataggtgcgagcttgttcttggatgtgaactggttactccaccggagacaaacagatagataggtacaagccgctcttgga-ttgagct 28592616  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  28592615 aggcacttgacc 28592604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 135
Target Start/End: Original strand, 21890264 - 21890378
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccact 119  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||   ||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21890264 agacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgtttttggacttgaactagccact 21890362  T
Q  120 tgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||| || |||||||    
T  21890363 tgaccaaacagaaaca 21890378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Original strand, 21890187 - 21890247
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21890187 accgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 21890247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 20333033 - 20333160
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| |||| ||||   ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||     
T  20333033 aagcaaaggcaaatagacaggtacgagc-tgttcttggattcaaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgacaggtacaagctgctcttgga- 20333130  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||| || | ||||||||| || |||||||    
T  20333131 ttgagctgggcacttgaccaaacagaaaca 20333160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 106
Target Start/End: Original strand, 20332977 - 20333072
Alignment:
Q  12 aaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||| |  || | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20332977 aaaggcagacagacaggtgcgag-ttgttcttggattcgaactggtaactcgaccgaaagcaaaggcaaatagacaggtacgagctgttcttggatt 20333072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Original strand, 14691709 - 14691769
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14691709 accgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 14691769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Original strand, 14694391 - 14694451
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14694391 accgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 14694451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Original strand, 14697075 - 14697135
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14697075 accgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 14697135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Original strand, 14699756 - 14699816
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14699756 accgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 14699816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Original strand, 14702447 - 14702507
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14702447 accgaacagaaacatatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 14702507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Original strand, 21890550 - 21890601
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21890550 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 21890601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 28157172 - 28157117
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28157172 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 28157117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3648901 - 3648858
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3648901 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 3648858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 10952778 - 10952735
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10952778 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 10952735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 10970390 - 10970347
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10970390 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 10970347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Original strand, 20332811 - 20332896
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||   ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  20332811 agacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgacaggtacaagctgctcttggatt 20332896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 28157698 - 28157655
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28157698 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 28157655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 41785908 - 41785951
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41785908 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 41785951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 51645787 - 51645744
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  51645787 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 51645744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 106
Target Start/End: Original strand, 20331945 - 20332015
Alignment:
Q  36 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||  ||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  20331945 ttgttcttggattcgaactggttacttgaccaaacataagcaaattgataggtacaagctgctcttggatt 20332015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Original strand, 14691861 - 14691929
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  14691861 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 14691929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Original strand, 14694543 - 14694611
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  14694543 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 14694611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Original strand, 14697227 - 14697295
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  14697227 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 14697295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Original strand, 14699908 - 14699976
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  14699908 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 14699976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 124
Target Start/End: Original strand, 16200706 - 16200758
Alignment:
Q  72 gaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  16200706 gaagcaaattgacgggtacaagctgttcttggacttgaactgggcacttgacc 16200758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 68
Target Start/End: Original strand, 20333213 - 20333268
Alignment:
Q  12 aaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg 68  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  20333213 aaaggcagacagacaggtgcgag-ttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgg 20333268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 20468252 - 20468197
Alignment:
Q  12 aaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg 68  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  20468252 aaaggcaaatagacaggtacgag-ttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgg 20468197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 89)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 21341186 - 21341568
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    ||||||||||  |||  ||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21341186 aagcaaataggtaggttcaagctgctcttggatt-gcgctagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttgacaaaatataggt 21341284  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21341285 tgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtactgaattg 21341384  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  21341385 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 21341484  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21341485 ttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 21341568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 14570353 - 14569969
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt-gacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  14570353 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatatagg 14570254  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14570253 ttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagtt 14570154  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  14570153 gagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 14570054  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  14570053 cttgtaatgcatgattgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacacagtggctc 14569969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 2130283 - 2130666
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  2130283 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttgacaaagtataggt 2130382  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  2130383 tgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgacattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattg 2130482  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  2130483 agactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 2130582  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  | ||||  |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2130583 ttgtaatgcatgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctc 2130666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 31361752 - 31361369
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31361752 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggatcggtttgttgacaaaatatagat 31361653  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31361652 tgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaaatg 31361553  T
Q  273 agacagatg-ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  31361552 agacggatgtttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 31361453  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31361452 cttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 31361369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 64 - 456
Target Start/End: Original strand, 19654328 - 19654724
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt----ttg 159  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    |||    
T  19654328 accggacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttttttg 19654427  T
Q  160 acaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacat 259  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  19654428 acaaaatataggttgaaattgacttgacgtcggtttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgatagagaacctaacat 19654527  T
Q  260 gaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatg 359  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19654528 gagtattgaattgagactgatgttgacattggaaattcaatatgcatggatgatatgacagtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatg 19654627  T
Q  360 cgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | || ||| ||||||| |||| ||||  |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  19654628 catgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttgacagttggtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctc 19654724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 38 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 16261173 - 16260752
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||  || || |||||||  |||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  16261173 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccggaaacataaacaaataggtaggttcaagctgctcttggatt-gagctagccacttgaccaaacagaaaca 16261075  T
Q  136 aattcactggggattggtttttt--gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctca 233  Q
     ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16261074 gattcattggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgactaatgttattggctca 16260975  T
Q  234 caaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgc 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  16260974 caaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacggtttcatcaaatgc 16260875  T
Q  334 atgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacattt 433  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |     
T  16260874 atgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactg 16260775  T
Q  434 gagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  16260774 gagtattgggcacgtaatggctc 16260752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 90 - 456
Target Start/End: Original strand, 27601946 - 27602311
Alignment:
Q  90 caagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgt 189  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27601946 caagctgctcttggatt-gagctagccacttgaccgaacagaaacaaaatcacaggggattagttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgt 27602044  T
Q  190 cgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacatt 289  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27602045 cgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacatt 27602144  T
Q  290 ggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggt 389  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||    
T  27602145 ggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgt 27602244  T
Q  390 tggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||    
T  27602245 tggcgatttgtagacgcagtttcgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcggtggctc 27602311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 33249625 - 33249177
Alignment:
Q  12 aaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||  ||| |   || ||||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  33249625 aaaggcagacagacaggtgcgag-ttgttcttggat-cgaactggtcactcgaccgggaacatagaaaagtagacaggtgcaagctgctcttggatt-ga 33249529  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt-----gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaa 204  Q
     |||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  33249528 gctagccacttgaccaaacagaaacaggttcactggggattggtttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 33249429  T
Q  205 ggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgt 304  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  33249428 ggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaactgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgc 33249329  T
Q  305 atggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 404  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||    
T  33249328 atgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagac 33249229  T
Q  405 acagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33249228 acagtttcgcagagacaaacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 33249177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 90 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 22140102 - 22139728
Alignment:
Q  90 caagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt--------gacaaaatatagattgaaactga 181  Q
    |||| |||||||||||  ||||| |  |||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||        ||||||||||||||||| | |||    
T  22140102 caagttgttcttggatgcgaactggttacttgaccaaacagaaacatattcactgaggattggttttttttttttttgacaaaatatagattgagattga 22140003  T
Q  182 cttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatg 281  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22140002 cttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgtcagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatg 22139903  T
Q  282 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 381  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  22139902 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgacataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcgtgtatgaatgcttgtaatgc 22139803  T
Q  382 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22139802 atgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctc 22139728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 15774773 - 15774388
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattgg---ttttttgacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||  || |   |||||||||||||||||    
T  15774773 aagcaaattgataggtacaagctgctctaggatt-gagctagccacttgaccaagcagaaacagattcactgggatttagtttttttttgacaaaatata 15774675  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15774674 gattgaaattgacttgacgtcaattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaa 15774575  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  15774574 ttgagactgatgttgacattggaaatgcgacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 15774475  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15774474 tgcttgtaatgcatgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 15774388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 9361828 - 9361443
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt---gacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  9361828 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgacaaaatata 9361729  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  9361728 gattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaa 9361629  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  9361628 ttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 9361529  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9361528 tgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 9361443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 38 - 456
Target Start/End: Original strand, 19910144 - 19910565
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||  || || |||||||  |||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  19910144 gttcttggatgcgaactggtaactcgaccggaaacataaacaaataggtaggttcaagctgctcttggatt-gagctagccacttgaccaaacagaaaca 19910242  T
Q  136 aattcactggggattg--gttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctca 233  Q
     ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19910243 tattcactggggattattgttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgatcgatattattggctca 19910342  T
Q  234 caaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgc 333  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19910343 caaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgc 19910442  T
Q  334 atgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacattt 433  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |     
T  19910443 atgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactg 19910542  T
Q  434 gagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||||||  ||||||||    
T  19910543 gagtattgggcacacagtggctc 19910565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 18716681 - 18716296
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt---gacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  18716681 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgacaaaatata 18716582  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18716581 gattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaa 18716482  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  18716481 ttgagactgatgttgacattggaagtgcgatatgcgtggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 18716382  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18716381 tgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 18716296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 38 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 18797944 - 18797523
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg--aatagaaaca 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| ||||||||| || || | |||| |||||  || | |||||    
T  18797944 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt-gagctgggcactcgaccggtaacataaaca 18797846  T
Q  136 aattcactggggattggtttttt--gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctca 233  Q
    |||||||  |||||| |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  18797845 aattcacaagggattagttttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcaatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctta 18797746  T
Q  234 caaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgc 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18797745 caaggttttgacagagaacctgacataagtattgaattgaaactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttcattaaatgc 18797646  T
Q  334 atgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacattt 433  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  18797645 atgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattg 18797546  T
Q  434 gagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18797545 gagtattgggcacgtagtggctc 18797523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 44568204 - 44567821
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  44568204 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttggcataatatagat 44568105  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44568104 tgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 44568005  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  44568004 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 44567905  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  44567904 cttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagcggctc 44567821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 29836547 - 29836163
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt--tttgacaaaatatag 170  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  29836547 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaagtatag 29836448  T
Q  171 attgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaat 270  Q
    ||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  29836447 attgagattgacttaacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaat 29836348  T
Q  271 tgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggat 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||    
T  29836347 tgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaat 29836248  T
Q  371 gcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29836247 gcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 29836163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 12085725 - 12086110
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt---gacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  12085725 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttgttctgacaaaatata 12085824  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||    
T  12085825 gattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaagaacctgacatgagtttcgaa 12085924  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  12085925 ttgagactgatgttgatgttggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 12086024  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12086025 tgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 12086110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 19681679 - 19681296
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  19681679 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttggcaaaatgtagat 19681580  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19681579 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 19681480  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 371  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| |||    
T  19681479 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatg 19681380  T
Q  372 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  19681379 cttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctc 19681296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Original strand, 31482889 - 31483253
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacg 188  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31482889 acaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatgggtttt--gacaaaatatagattgagattgacttgacg 31482986  T
Q  189 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacat 288  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  31482987 tcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaagttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacat 31483086  T
Q  289 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatgg 388  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |    
T  31483087 tggaaatgcactgtgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactg 31483186  T
Q  389 ttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | |||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31483187 tcggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 31483253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 90 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 19695299 - 19694930
Alignment:
Q  90 caagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattg----gttttttgacaaaatatagattgaaactgacttg 185  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19695299 caagctgctcttggatt-gagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgttgttttttttgacaaaatatagattgagattgacttg 19695201  T
Q  186 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttga 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  19695200 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatattga 19695101  T
Q  286 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 385  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  19695100 cattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 19695001  T
Q  386 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
      ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  19695000 ctgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctc 19694930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 33265950 - 33265560
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttt--------tgacaaa 164  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||        |||||||    
T  33265950 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgttttttattttttttgacaaa 33265851  T
Q  165 atatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagga 264  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33265850 atatagattgagattgacttgacgccgatttaaattgaaaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagta 33265751  T
Q  265 ttgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgc 364  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||     
T  33265750 ttgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatggatggacacgtaatatgcatgattatgcatgt 33265651  T
Q  365 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33265650 atgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 33265560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 73 - 380
Target Start/End: Original strand, 22388878 - 22389190
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattg-----gttttttgacaaaata 167  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||    
T  22388878 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggatttgaactagtcacttgaccaaacggaaacatattcactggggattgttttttttttttgacaaaata 22388977  T
Q  168 tagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattg 267  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22388978 tagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattg 22389077  T
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  22389078 aattgagactgatgtcgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatg 22389177  T
Q  368 gatgcttgaaatg 380  Q
     ||||||| ||||    
T  22389178 aatgcttgtaatg 22389190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 64 - 456
Target Start/End: Original strand, 22073926 - 22074310
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaa 163  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| |||||| | |||    
T  22073926 accgaacagaaacaaatagacaggtacaaggtgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcattggggattagtttttgg-caa 22074024  T
Q  164 aatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagg 263  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| | ||    || |      |||| || | |||||   | |||||||| |||| |||||||||||  ||||||  |     
T  22074025 aatataaattgaaattgacttgacattgac---atatcc----tagagatgggccaatggcactggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggt 22074117  T
Q  264 attgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtg 363  Q
    || |||| ||||| |   |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  22074118 atcgaatcgagactgtaattgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagttttattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 22074217  T
Q  364 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22074218 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggaatattgggcacgtagtggctc 22074310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 268 - 456
Target Start/End: Original strand, 19201578 - 19201765
Alignment:
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||    
T  19201578 aattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatg 19201677  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||  ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19201678 aatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaagcacaacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 19201765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 268 - 456
Target Start/End: Original strand, 28355147 - 28355334
Alignment:
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||    
T  28355147 aattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaacgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatg 28355246  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28355247 aatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 28355334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Original strand, 19201439 - 19201583
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19201439 aagcaaattgataggtacaagctgtccttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatataga 19201538  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 216  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19201539 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 19201583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Original strand, 28355008 - 28355152
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28355008 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatataga 28355107  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 216  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28355108 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 28355152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 19653440 - 19653558
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaa--gcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  19653440 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagataaaggcaaatagacaggtgcaagctgctcttggat 19653539  T
Q  106 ttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19653540 ttgaactagccacttgacc 19653558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 22073817 - 22073942
Alignment:
Q  15 ggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  22073817 ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacataaacaaacagacaggtgcaagctgttcttggacttgaact 22073916  T
Q  113 agccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22073917 agccacttgaccgaacagaaacaaat 22073942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 9362009 - 9361894
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  9362009 aagcaaaggcaaatagacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 9361911  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  9361910 gagctagccacttgacc 9361894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 19909883 - 19910009
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||     
T  19909883 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgag 19909981  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19909982 ctagccacttgaccgaacagaaacaaat 19910009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 19681855 - 19681745
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| | || ||    
T  19681855 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tcgagct 19681757  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  19681756 agccacttgacc 19681745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 31482697 - 31482807
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  31482697 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 31482795  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  31482796 agtcacttgacc 31482807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15775135 - 15775006
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcca-ccggacagaag--caaatagacaggcacaagctgttcttgga 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||   ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15775135 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacccggagacaagacaaaatagacaggtacaagctgctcttgga 15775036  T
Q  105 tttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15775035 -ttgagctagccacttgaccgaacagaaaca 15775006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 2129922 - 2130050
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||  ||||||| |||||||     
T  2129922 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggtgcaagctgctcttgga- 2130020  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  2130021 ttgagctagccacttgagcgaacagaaaca 2130050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 138
Target Start/End: Original strand, 19653860 - 19653992
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||     
T  19653860 aagcaaaggaaaataggcaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagttgttcttggac 19653959  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19653960 ttgaactagccacttgaccggacagaaacaaat 19653992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 27601628 - 27601757
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttgga 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   | ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27601628 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagaccaaatagacaggcgcaagctgctcttgga 27601727  T
Q  105 tttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     | || |||||||||||| |||| |||||||    
T  27601728 -tcgagctagccacttgagcgaacagaaaca 27601757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 282 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 15775468 - 15775294
Alignment:
Q  282 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 380  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  15775468 ttgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatg 15775369  T
Q  381 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15775368 catgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctc 15775294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18716857 - 18716747
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  18716857 aaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggaccgaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 18716759  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  18716758 agtcacttgacc 18716747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 14570714 - 14570586
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  14570714 aagcaaaggcagatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaattggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga- 14570616  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  14570615 ttgagctagccacttgagcgaacagaaaca 14570586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16261439 - 16261319
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||  ||||||  |||||||     
T  16261439 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggtgcaagctactcttgga- 16261341  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaa 127  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  16261340 ttgagctagccacttgaccgaa 16261319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 12085549 - 12085642
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12085549 aaggcaaatggacaggtgcgagattgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatt 12085642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 135
Target Start/End: Original strand, 22388537 - 22388645
Alignment:
Q  28 gtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22388537 gtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccg 22388635  T
Q  126 aatagaaaca 135  Q
    || |||||||    
T  22388636 aacagaaaca 22388645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18798206 - 18798083
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc--ggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||| |  | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||     
T  18798206 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttcgatgcgaactggttactccaccagagacaaagaccaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgag 18798108  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  18798107 ctagccacttgaccgaacagaaaca 18798083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 29836787 - 29836663
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  29836787 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 29836689  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  29836688 gctagccacttgagcgaacagaaaca 29836663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 33250038 - 33249914
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  33250038 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 33249940  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  33249939 gctagccacttgagcgaacagaaaca 33249914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 124
Target Start/End: Original strand, 28354841 - 28354942
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||| |||||||| ||||||| |||| |||| ||||||    
T  28354841 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttg 28354939  T
Q  122 acc 124  Q
    |||    
T  28354940 acc 28354942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 9362304 - 9362180
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  9362304 aaggcaaatagacacgtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 9362206  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  9362205 gctagccacttgagcgaacagaaaca 9362180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 19695611 - 19695492
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  | ||||||||||  ||||||| |||||     ||     
T  19695611 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgaagacaaagaccaatagacaggtgcaagctgctcttg-----gag 19695517  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  19695516 ctagccacttgaccgaacagaaaca 19695492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 127
Target Start/End: Original strand, 19653976 - 19654039
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaa 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19653976 accggacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaa 19654039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 135
Target Start/End: Original strand, 21341017 - 21341131
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccact 119  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||   ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21341017 agacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccact 21341115  T
Q  120 tgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||| || |||||||    
T  21341116 tgaccaaacagaaaca 21341131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 21340355 - 21340479
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  21340355 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggattcgaactggtaactccaccggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 21340453  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| | || |||||||    
T  21340454 gctagccacttgagcaaacagaaaca 21340479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 124
Target Start/End: Original strand, 19654110 - 19654213
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccact 119  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||   ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19654110 agacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccact 19654208  T
Q  120 tgacc 124  Q
    |||||    
T  19654209 tgacc 19654213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 135
Target Start/End: Original strand, 21340781 - 21340895
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccact 119  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||   ||| |||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21340781 agacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgatagatacaagctgttcttggacttgaactagccact 21340879  T
Q  120 tgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||| || |||||||    
T  21340880 tgaccaaacagaaaca 21340895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 22140361 - 22140235
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaag--caaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  22140361 aagcaaaggcaaatagacaggtgcaagct-gctcttggatt-gagctggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggtgcaagctgctcttggat 22140264  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  22140263 t-gagctagccacttgaccgaacagaaaca 22140235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 33249922 - 33249856
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33249922 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 33249856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 19654279 - 19654344
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19654279 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccggacagaaacaaat 19654344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 15775019 - 15774959
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15775019 accgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 15774959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18798096 - 18798036
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18798096 accgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 18798036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Original strand, 19653620 - 19653680
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg 68  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||    
T  19653620 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttgaattcgaactggtcactcgaccgg 19653680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 19695505 - 19695445
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19695505 accgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 19695445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22140248 - 22140188
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22140248 accgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 22140188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16261310 - 16261265
Alignment:
Q  79 atagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16261310 atagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 16261265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 33249792 - 33249689
Alignment:
Q  22 agacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg--acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccact 119  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| |||| ||||   ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33249792 agacaggtacgagct-gttcttagattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccact 33249694  T
Q  120 tgacc 124  Q
     ||||    
T  33249693 cgacc 33249689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 33266187 - 33266131
Alignment:
Q  15 ggcaaaaagacaggtgcgagcttgttctt--ggatgcgaactggttactccaccgga 69  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  33266187 ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttaaggattcgaactggttactccaccgga 33266131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 33249869 - 33249809
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33249869 accgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 33249809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 2130042 - 2130097
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2130042 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 2130097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 9362188 - 9362133
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9362188 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 9362133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14570594 - 14570539
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14570594 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 14570539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 21340471 - 21340526
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21340471 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 21340526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 28354605 - 28354648
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28354605 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 28354648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 29836671 - 29836616
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29836671 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 29836616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 31362159 - 31362116
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31362159 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 31362116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 31482346 - 31482389
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31482346 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 31482389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 124
Target Start/End: Original strand, 19653749 - 19653798
Alignment:
Q  75 gcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19653749 gcaaatagacaggtgcgagctgctcttggatttgaactagccacttgacc 19653798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 125
Target Start/End: Original strand, 19200983 - 19201019
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19200983 acaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 19201019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Original strand, 19909993 - 19910052
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19909993 accgaacagaaacaaatagacgggtacaagctgttcttggacttgaacta-ccacttgacc 19910052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Original strand, 22388632 - 22388692
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || |||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22388632 accgaacagaaacatatagattggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 22388692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 9362639 - 9362596
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9362639 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 9362596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 12085269 - 12085312
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12085269 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 12085312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18717145 - 18717102
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18717145 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 18717102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19682204 - 19682161
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19682204 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 19682161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 29837135 - 29837092
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29837135 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 29837092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 44568671 - 44568628
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44568671 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 44568628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Original strand, 22073694 - 22073743
Alignment:
Q  12 aaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactc 62  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22073694 aaaggcagacagacaggtgcgag-tcgttcttggatgcgaactggttactc 22073743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Original strand, 2130189 - 2130257
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  2130189 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 2130257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 14570447 - 14570379
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  14570447 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 14570379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 15774867 - 15774799
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  15774867 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 15774799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Original strand, 21340712 - 21340764
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttctt-ggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21340712 aagcaaattgataggtacaagctgttctttggacttgaactagccacttgacc 21340764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 5)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 13339 - 12888
Alignment:
Q  11 caaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga--agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttg 108  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  | | || |||||||  |||||||||||||||||||    
T  13339 caaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccactggaaatataaacgaacagacaggtgcaagctgttcttggatttg 13240  T
Q  109 aactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt----gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13239 aactagccacttgaccgaacagaaacacattcacttgggattagttttttttttgacaaaatgtaaattgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaa 13140  T
Q  205 ggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgt 304  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  13139 gataaaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgggttgaaactgatgttgacattggaaatgcaatatgc 13040  T
Q  305 atggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 404  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  13039 atgggtgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagttagtagac 12940  T
Q  405 acagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12939 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 12888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 268 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 2681 - 2494
Alignment:
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| || |||    
T  2681 aattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggttgatataacagtttcattaaatgcatggatacgtaatatgcatgattatgcatgtatg 2582  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2581 aatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagcattgggcacgtagtggctc 2494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2820 - 2676
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2820 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacaggaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatataga 2721  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 216  Q
    |||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2720 ttgagattgacttgacgtcgatttggtttgaaaggtagaaattga 2676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 2996 - 2886
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  2996 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgggcagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 2898  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  2897 agccacttgacc 2886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3345 - 3302
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3345 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 3302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 3)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 3648 - 4035
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt----gacaaaatat 168  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  3648 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttatttgacaaaatat 3747  T
Q  169 agattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattga 268  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3748 agattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttggcagagaacctgacatgagtattga 3847  T
Q  269 attgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgg 368  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||     
T  3848 attgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcgtggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatga 3947  T
Q  369 atgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3948 atgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgcagtggctc 4035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 3472 - 3582
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  3472 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggaccgaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 3570  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    || |||||||||    
T  3571 agtcacttgacc 3582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 3184 - 3227
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3184 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 3227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 13238 - 12853
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt---tttgacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  13238 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttttgacaaaatata 13139  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13138 gattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaa 13039  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  13038 ttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 12939  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12938 tgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 12853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 3)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Original strand, 7978 - 8360
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagat 172  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7978 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgttgacaaaatatagat 8077  T
Q  173 tgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattg 272  Q
    ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8078 tgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattg 8177  T
Q  273 agacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  8178 agactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 8277  T
Q  373 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8278 ttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 8360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 7799 - 7926
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  7799 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 7897  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
     |||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  7898 gctagccacttgagcgaacagagacaaat 7926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 7511 - 7554
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7511 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 7554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 4)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Original strand, 8710 - 9080
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttt---ttgacaaaatatagattgaaactgacttg 185  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||| |||| ||||| | ||| |||    
T  8710 acaagctgttcttggactcgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttttgacaaagtataaattgagattgaattg 8809  T
Q  186 acgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttga 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| ||||    
T  8810 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattaaattgagactgatattga 8909  T
Q  286 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 385  Q
    |||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  8910 cattgatgatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 9009  T
Q  386 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
      ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9010 ctgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 9080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Original strand, 8345 - 8473
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttgga 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8345 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatatgaactggttactccaccggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga 8444  T
Q  105 tttgaactagccacttgaccgaatagaaac 134  Q
     | || |||||||||||| |||| ||||||    
T  8445 -tcgagctagccacttgagcgaacagaaac 8473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Original strand, 8476 - 8521
Alignment:
Q  79 atagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8476 atagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 8521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Original strand, 8613 - 8681
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  8613 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 8681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 5)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 89 - 456
Target Start/End: Original strand, 2229 - 2596
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacg 188  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2229 acaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacagaggatcggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacg 2328  T
Q  189 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacat 288  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2329 tcgattcgatttgaaagatagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacat 2428  T
Q  289 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatg 387  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||      
T  2429 tggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgact 2528  T
Q  388 gttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2529 gttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 2596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 89 - 374
Target Start/End: Original strand, 23649 - 23935
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacg 188  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23649 acaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcaaaggggatcggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacg 23748  T
Q  189 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacat 288  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  23749 tcgattcgatttgaaagatagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacat 23848  T
Q  289 tggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgctt 374  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  23849 tggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 23935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Original strand, 2038 - 2150
Alignment:
Q  17 caaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagc-aaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaacta 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| ||||||| ||||||| | || |||    
T  2038 caaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaaggcaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagcta 2136  T
Q  114 gccacttgaccgaa 127  Q
    ||||||||| ||||    
T  2137 gccacttgagcgaa 2150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 23454 - 23570
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  23454 aaggcaaatagacaggtgcgagcttattcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 23552  T
Q  110 actagccacttgaccgaa 127  Q
     |||||||||||| ||||    
T  23553 gctagccacttgagcgaa 23570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 1746 - 1789
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1746 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 1789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 7)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 34497 - 34109
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttg-----acaaaata 167  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||      ||||||||    
T  34497 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccgtttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttttttgtacaaaata 34398  T
Q  168 tagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattg 267  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  34397 taggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattg 34298  T
Q  268 aattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatg 367  Q
    | ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  34297 agttgagactgttgttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatg 34198  T
Q  368 gatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  34197 aatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctc 34109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 11140 - 10756
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttt-tttgacaaaatataga 171  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11140 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatataga 11041  T
Q  172 ttgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaatt 271  Q
    |||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11040 ttgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaatt 10941  T
Q  272 gagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggat 370  Q
    ||||| ||| |||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||    
T  10940 gagactgatattgttattggaaatgtaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaat 10841  T
Q  371 gcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||   ||| | | || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10840 gcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaagcacgacttcacaggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctc 10756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11316 - 11206
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  11316 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagct 11218  T
Q  113 agccacttgacc 124  Q
    ||||||||||||    
T  11217 agccacttgacc 11206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 34856 - 34730
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggat 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||  || |  ||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  34856 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagc-tgctcttggat-tgagctggttactccaccggagtcaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga- 34760  T
Q  106 ttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  34759 ttgagctagccacttgaccgaacagaaaca 34730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 34743 - 34683
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34743 accgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttgtacttgaactagccacttgacc 34683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11604 - 11561
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11604 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 11561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 34591 - 34523
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  34591 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttggatt 34523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0685 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: scaffold0685
Description:

Target: scaffold0685; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 1123 - 1412
Alignment:
Q  96 gttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattc 195  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  1123 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattt 1222  T
Q  196 gatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaat 295  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1223 gaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatgttgacattggaaat 1322  T
Q  296 gcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  1323 gcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 1412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0685; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 693 - 736
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  693 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0685; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 1011 - 1074
Alignment:
Q  43 tggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatt 106  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  1011 tggattcgaactggttactcgactggacagaaacaaatggataggtacaagctgctcttggatt 1074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 4)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 38 - 456
Target Start/End: Original strand, 23970 - 24393
Alignment:
Q  38 gttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||| || ||||||| |||| ||||||  || || |||||||  |||  ||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  23970 gttcttggaggcaaactggtaactcgaccggaaacataaacaaataggtaggttcaaactgctcttggatt-gagctagccacttgaccaaacagaaaca 24068  T
Q  136 aattcactggggattg----gttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggct 231  Q
     ||||||| |||||||     ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  24069 gattcactagggattgtttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaagtagaaattgaccgatgttattggct 24168  T
Q  232 cacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24169 cacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagttttattaaat 24268  T
Q  332 gcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacat 431  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||  | ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  24269 gcatgggcatgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgctggcgatttgtagacgcagttccgcggagacagacaagacac 24368  T
Q  432 ttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | |||||||||||||||| ||||||    
T  24369 tggagtattgggcacgtaatggctc 24393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 23708 - 23831
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaa 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||     
T  23708 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgag 23806  T
Q  111 ctagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    ||||||||| || |||| |||||||    
T  23807 ctagccactcgagcgaacagaaaca 23831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 23823 - 23878
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23823 acagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 23878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 112
Target Start/End: Original strand, 23893 - 23926
Alignment:
Q  79 atagacaggcacaagctgttcttggatttgaact 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23893 atagacaggtacaagctgttcttggatttgaact 23926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 15164 - 14779
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattg-gtttt--ttgacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||    
T  15164 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaacata 15065  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15064 gattgagattgacttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgattgatattattggatcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaa 14965  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  14964 ttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 14865  T
Q  370 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14864 tgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 14779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 15345 - 15230
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  15345 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 15247  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  15246 gagctagccacttgacc 15230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15621 - 15578
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15621 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 15578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 5)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 73 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 16801 - 16413
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttttt------gacaaaat 166  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||| ||||||      ||||||||    
T  16801 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacaaaaacatattcactggggattgtttttttttttttgacaaaat 16702  T
Q  167 atagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggatt 266  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  16701 atagattgagattgacttggcgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatc 16602  T
Q  267 gaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcat 366  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||    
T  16601 gaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattgtgcatgtat 16502  T
Q  367 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
    | ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16501 gaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaaaacatcagagtattgggcacgtagtggctc 16413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16982 - 16856
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  16982 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 16884  T
Q  108 gaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    || |||||||||||||| || |||||||    
T  16883 gagctagccacttgaccaaacagaaaca 16856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17277 - 17153
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  17277 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 17179  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  17178 gctagccacttgagcgaacagaaaca 17153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 17161 - 17106
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17161 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 17106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 17687 - 17644
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17687 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 17644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 73 - 385
Target Start/End: Original strand, 13009 - 13324
Alignment:
Q  73 aagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattg-gtttt--ttgacaaaatata 169  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  13009 aagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaatata 13108  T
Q  170 gattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaa 269  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13109 gattgagattgacttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgattgatattattggattacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaa 13208  T
Q  270 ttgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgga 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  13209 ttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 13308  T
Q  370 tgcttgaaatgcatga 385  Q
    |||||| |||||||||    
T  13309 tgcttgtaatgcatga 13324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 12828 - 12943
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  12828 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 12926  T
Q  108 gaactagccacttgacc 124  Q
    || ||||||||||||||    
T  12927 gagctagccacttgacc 12943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 12552 - 12595
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12552 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 12595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 4)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 64 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 28513 - 28129
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaa 163  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  28513 accgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagttttt-gacaa 28415  T
Q  164 aatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||    || |      |||| || | |||||   | |||||||| |||| |||||||||||  |||||   |     
T  28414 aatatagattgaaattgacttgacattgac---atgtcc----tagagatgggccaatggcactggctcaccaggtcttgacagagaatttgacacaggt 28322  T
Q  264 attgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtg 363  Q
    || |||||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||    
T  28321 atcgaattgagactgaaattgacatgggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatg 28222  T
Q  364 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28221 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgctgagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 28129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28684 - 28555
Alignment:
Q  11 caaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttg 108  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| |||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  28684 caaaggcaaatagacaagtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttg 28585  T
Q  109 aactagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28584 aactagccacttgaccgaacagaaacaaat 28555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28571 - 28497
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    |||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28571 accgaacagaaacaaatagacaagtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaat 28497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 28741 - 28689
Alignment:
Q  15 ggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg 67  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28741 ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg 28689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 245 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 820 - 613
Alignment:
Q  245 cagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacata 344  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  820 cagagaacctgacatgattattgaattgagactgatgctgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacttt 721  T
Q  345 atatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggc 444  Q
     ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  720 gtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgattgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggc 621  T
Q  445 acgtagtg 452  Q
    ||||||||    
T  620 acgtagtg 613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 64 - 456
Target Start/End: Original strand, 25605 - 25989
Alignment:
Q  64 accggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggttttttgacaa 163  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  25605 accgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagttttt-gacaa 25703  T
Q  164 aatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagg 263  Q
    |||||| ||||||| | ||||| | | ||    || |      |||| || | |||||   | || ||||| |||| |||||||||||  ||||||  |     
T  25704 aatataaattgaaattaacttggcattgac---atatcc----tagagatgggccaatggcactgactcaccaggtcttgacagagaatttgacataggt 25796  T
Q  264 attgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtg 363  Q
    || |||||||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  25797 atcgaattgagactgaaattgacattggaaatgaaagatgtatgggtggtataatagttttatcaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgcatg 25896  T
Q  364 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagacatttgagtattgggcacgtagtggctc 456  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25897 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacacacaaaacattggactattgggcacgtagtggctc 25989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 138
Target Start/End: Original strand, 25552 - 25621
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25552 acagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaat 25621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 138
Target Start/End: Original strand, 25522 - 25563
Alignment:
Q  97 ttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaat 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  25522 ttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacaaat 25563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 153 - 430
Target Start/End: Original strand, 39724 - 40011
Alignment:
Q  153 ttttttgacaaaa-tatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaagg-tagaaa-ttgaccaatattattgg-ctcacaaggttttgacaga 248  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39724 ttttttgacaaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggttagaaatttgaccgatattattggtctcacaaggttttgacaga 39823  T
Q  249 gaacctgacatgag-gattgaattgagacagatgttgacattggaaat-gcaatatgtatgg-atgatataacagttt-tattaaatgca-tgggcacat 343  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |    
T  39824 gaacccgacatgagtaattgaattgagactgatgttgacattggaaatagcaacatgcatggaatgatataacagtttcaattaaatgcattgggcacgt 39923  T
Q  344 aatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggc-agtttgtagacacagtttcgcggagacagacaagaca 430  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||   |||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  39924 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgtatttgtagacacagttctgcagagacagacaagaca 40011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 39329 - 39459
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttctt--ggatgcgaactggttactccaccg--gacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttgg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39329 aagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttctttgggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgg 39428  T
Q  104 atttgaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    | |||| ||||||||| || |||| |||||||    
T  39429 a-ttgagctagccactcgagcgaacagaaaca 39459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 39451 - 39507
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaag-ctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39451 acagaaacagatagacaggtacaagactgttcttggacttgaactagccacttgacc 39507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 7061 - 6807
Alignment:
Q  36 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga--cagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaa 133  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||  || |  |||||||  |||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  7061 ttgttcttggaggcgaactggtaactcgaccggaaacatagacaaataggtaggttcaagctgctcttggatt-gagctagccacttgaccaaacagaaa 6963  T
Q  134 caaattcactggggattggtttttt-gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctc 232  Q
    || ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6962 cagattcactggggattgttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgctgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctc 6863  T
Q  233 acaaggttttgacagagaacctgacatgaggattgaattgagacagatgttgacat 288  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||    
T  6862 acaaggttttgacgaagaacctgacatgagtaatgaatcgagactgatgttgacat 6807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 7318 - 7266
Alignment:
Q  17 caaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 69  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7318 caaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Original strand, 14630 - 14682
Alignment:
Q  17 caaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 69  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14630 caaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 14682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7206 - 7151
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7206 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 7151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0489 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 6)
Name: scaffold0489
Description:

Target: scaffold0489; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 2077 - 2203
Alignment:
Q  8 aagcaaaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggattt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  2077 aagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccatcggacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tt 2175  T
Q  108 gaactagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||    
T  2176 gagctagccacttgaccaaatggaaaca 2203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0489; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 4901 - 5025
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggacaga---agcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  4901 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 4999  T
Q  110 actagccacttgaccgaatagaaaca 135  Q
     |||||||||||| |||| |||||||    
T  5000 gctagccacttgagcgaacagaaaca 5025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0489; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Original strand, 2021 - 2075
Alignment:
Q  13 aaggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg 67  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  2021 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 2075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0489; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 5017 - 5072
Alignment:
Q  69 acagaagcaaatagacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgacc 124  Q
    |||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5017 acagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 5072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0489; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 4489 - 4532
Alignment:
Q  82 gacaggcacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4489 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccg 4532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0489; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 122
Target Start/End: Original strand, 2274 - 2307
Alignment:
Q  89 acaagctgttcttggatttgaactagccacttga 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2274 acaagctgttcttggacttgaactagccacttga 2307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University